FLEX Opentrons Flex Open Source Робот для обробки рідин

Opentrons Flex

Технічні характеристики:

  • Загальні характеристики: Lorem ipsum dolor sit
    amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
    ut labore et dolore magna aliqua.
  • Екологічні характеристики: Lorem ipsum
    dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
    incididunt ut labore et dolore magna aliqua.
  • Сертифікати: Lorem ipsum dolor sit amet,
    consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
    labore et dolore magna aliqua.
  • Серійний номер: ХХХ-ХХХХ-ХХХХ

Інструкція з використання продукту:

1. Встановлення приладу та калібрування:

Виконайте кроки, описані в посібнику для піпетки та захвату
установка.

2. Переїзд:

Для коротких ходів зверніться до розділу 2.5 посібника. для
переміщення на далекі відстані, дотримуйтесь наведених інструкцій. Загальний переїзд
також доступна консультація.

3. Підключення:

Переконайтеся, що підключення живлення належне, як описано в посібнику.
За потреби підключіть USB та допоміжні пристрої. Мережеві підключення
слід встановити, дотримуючись інструкцій.

4. Конструктор протоколів:

Зрозумійте вимоги до Protocol Designer і дізнайтеся, як це зробити
розробити нові протоколи або змінити існуючі відповідно до вашої лабораторії
вимоги.

5. API протоколу Python:

Досліджуйте написання та виконання сценаріїв за допомогою API протоколу Python.
Відкрийте для себе ексклюзивні функції Python для покращеної функціональності.

6. Протоколи OT-2:

Дізнайтеся про протоколи OT-2 Python, протоколи OT-2 JSON і
Протоколи магнітного модуля для різних типів експериментів.

Часті запитання (FAQ):

З: Як усунути неполадки, якщо робот не рухається як
очікуваний?

A: Перевірте підключення живлення, переконайтеся, що калібрування належне
інструментів і переконайтеся, що в них немає перешкод
шлях робота.

З: Чи можу я використовувати спеціальні піпетки з Opentrons Flex?

A: Opentrons рекомендує використовувати сумісні піпетки для оптимального використання
продуктивність і точність.

“`

Opentrons Flex
Інструкція з експлуатації
Opentrons Labworks Inc.
грудень 2023 р

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Зареєстровані назви, товарні знаки тощо, що використовуються в цьому документі, навіть якщо вони спеціально не позначені як такі, не вважаються незахищеними законом.

Зміст
Передмова . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Структура цього посібника . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Примітки та попередження . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Розділ 1: Вступ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Ласкаво просимо до Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Що нового у Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Робочі станції Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Інформація про безпеку . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Символи безпеки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Попередження щодо електричної безпеки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Додаткові застереження щодо безпеки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Застереження щодо безпеки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Біологічна безпека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Токсичні пари . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Легкозаймисті рідини . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Відповідність нормативним вимогам . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Безпека . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Електромагнітна сумісність . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Попередження та примітки FCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Відповідність Канаді ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Екологічне попередження . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Попередня сертифікація Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Розділ 2: Встановлення та переміщення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Вимоги до техніки безпеки та експлуатації . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Де розмістити Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Споживання електроенергії . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Умови навколишнього середовища . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Розпакування . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Необхідні зусилля та час . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Ящик і пакувальний матеріал . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Елементи продукту . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Частина 1: Зніміть ящик . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Частина 2: Відпустіть Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Частина 3: Остаточне складання та ввімкнення . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 Перший запуск . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Увімкнення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Підключення до мережі або комп’ютера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Інсталяція оновлень програмного забезпечення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Прикріплення підвіски аварійної зупинки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Дайте своєму роботу ім'я . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Установка та калібрування приладу . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Установка піпетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Установка захвату . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Переїзд . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Короткі ходи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Переїзди на далекі відстані . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Загальні поради щодо переїзду . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Останні думки про переїзд. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Розділ 3: Опис системи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Фізичні компоненти . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Рама та корпус . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Палуба та робоча зона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagплоща . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Пристосування для палуби. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Сміттєпровід. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging області слотів. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Система руху . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Сенсорні та світлодіодні дисплеї . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Піпетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Технічні характеристики піпетки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Калібрування піпетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Адаптер підставки для наконечників піпетки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Часткове захоплення наконечника . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Датчики піпеток. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Оновлення мікропрограми піпетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Захват . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Характеристики захвату . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Калібрування захвату . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Оновлення мікропрограми Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Підвіска аварійної зупинки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Коли використовувати E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Увімкнення та відпускання кнопки E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Підключення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Підключення живлення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB та допоміжні підключення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Мережеві підключення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Специфікації системи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Загальні характеристики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Екологічні характеристики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Сертифікати. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Серійний номер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Розділ 4: Модулі . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Підтримувані модулі . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Модульна система кедді . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Калібрування модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Коли калібрувати модулі. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Як калібрувати модулі . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Модуль нагрівача-шейкера GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Функції нагрівача-шейкера. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Технічні характеристики нагрівача-шейкера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Магнітний блок GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Функції магнітного блоку. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Характеристики магнітного блоку . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Температурний модуль GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Функції температурного модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Характеристики модуля температури . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Модуль термоциклера GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Функції термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Технічні характеристики термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Розділ 5: Лабораторне обладнання. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Поняття про лабораторне забезпечення. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторне забезпечення як обладнання . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторне обладнання як дані . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Спеціальне лабораторне обладнання . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Резервуари . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Односвердловинні резервуари . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Багатосвердловинні резервуари. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Резервуари та визначення API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Спеціальне лабораторне обладнання резервуарів. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Лункові планшети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

6-лункові планшети. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-лункові планшети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-лункові планшети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-лункові планшети. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-лункові планшети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-лункові планшети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Адаптери для колодязних пластин. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Лункові планшети та визначення API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Лабораторне обладнання для лункових планшетів. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Наконечники та підставки для наконечників . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Стійки для наконечників . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Сумісність наконечників . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Адаптер стійки для наконечників . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Пробірки та підставки для пробірок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Комбінації труб і рейки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Стелажі 6-трубні . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Стелажі на 10 труб. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Стелажі 15-трубні . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Стелажі на 24 труби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Визначення API стойки труб . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Лабораторне обладнання зі штативом для пробірок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Алюмінієві блоки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Плата з плоским дном . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-лунковий алюмінієвий блок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-лунковий алюмінієвий блок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Автономні адаптери . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Комбінації лабораторного обладнання з алюмінієвих блоків . . . . . . . . . . . . . . . .94 Комбінації лабораторного обладнання з 24-лунковими алюмінієвими блоками . . . . . . . . .95 Комбінації лабораторного обладнання з 96-лунковими алюмінієвими блоками . . . . . . . . .95 5.7 Лабораторне обладнання та Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Спеціальні визначення лабораторного програмного забезпечення . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Створення настроюваних визначень лабораторного програмного забезпечення . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Схема лабораторного забезпечення JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Визначення лабораторного програмного забезпечення JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Розділ 6: Розробка протоколу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Готові протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Бібліотека протоколів . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Послуга розробки власного протоколу . . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Конструктор протоколів. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Вимоги до дизайнера протоколу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Проектування протоколу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Зміна існуючих протоколів . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API протоколу Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Написання та виконання сценаріїв . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Ексклюзивні функції Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Протоколи ОТ-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 Протоколи OT-2 Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 Протоколи OT-2 JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Протоколи магнітного модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Розділ 7: Програмне забезпечення та експлуатація. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Робота з сенсорним екраном. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Приладова панель робота . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Керування протоколом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Реквізити протоколу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Запустіть налаштування . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Перевірка положення лабораторного обладнання . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Прогрес виконання. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Завершення прогону . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Керування приладами. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Налаштування робота. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Конфігурація колоди . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Додаток Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Встановлення програми . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Передача протоколів у Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Статус модуля та елементи керування . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Останні запуски протоколу . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Розширені операції . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Зошит Юпітер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Операції командного рядка через SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Розділ 8: Технічне обслуговування та обслуговування . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Очищення Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Перш ніж почати . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Що можна почистити . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Чистячі розчини. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Очищення рам та віконних панелей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Чистка палуби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Очищення порталу. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Очищення сміттєпроводу. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Чищення піпеток і наконечників . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Дезактивація піпетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Очищення наконечників піпеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Очищення захвату . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Очищення модулів. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Загальне очищення модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Ущільнення термоциклера. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Лабораторне обладнання, безпечне для використання в автоклаві . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Обслуговування Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Сервіси Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Кваліфікація монтажу та кваліфікація експлуатації . . . 155 Профілактичне обслуговування . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Гарантія . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Додаток А: Глосарій . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Додаток B: Додаткова документація . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Центр знань Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Документація API протоколу Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Посилання на Opentrons HTTP API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Документація розробника . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Додаток C: програмне забезпечення з відкритим кодом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons на GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Інші сховища . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Додаток D: Підтримка та контактна інформація . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Продажі . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Підтримка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Ділова інформація . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Передмова
Ласкаво просимо до посібника з експлуатації робота для роботи з рідинами Opentrons Flex. У цьому посібнику описано майже все, що вам потрібно знати, щоб налаштувати та використовувати Flex, зосереджуючись на темах, які є найбільш актуальними для повсякденних користувачів Flex у лабораторному середовищі.
Структура цього посібника
Opentrons Flex — це складна система, тому існує багато різних шляхів вивчення всього, що вона може робити. Не соромтеся відразу переходити до розділу, який стосується будь-якої теми, яка вас цікавить! наприкладample, якщо у вашій лабораторії вже налаштовано Flex, ви можете пропустити главу «Встановлення та переміщення».
Якщо ви віддаєте перевагу керованому підходу, цей посібник структурований таким чином, що ви можете слідувати йому від початку до кінця.
Дізнайтеся про Flex. Відмінні риси Flex перераховані в розділі 1: Вступ. Вступ також містить важливу інформацію про безпеку та нормативну інформацію.
Почніть роботу з Flex. Якщо вам потрібно налаштувати Flex, дотримуйтесь детальних інструкцій у розділі 2: Встановлення та переміщення. Потім ознайомтеся з компонентами Flex у розділі 3: Опис системи.
Налаштуйте колоду. Налаштування колоди дозволяє використовувати різні наукові програми на Flex. Розділ 4: Модулі описує периферійні пристрої Opentrons, які ви можете встановити на колоду або на неї для виконання конкретних наукових завдань. Розділ 5: Лабораторне забезпечення пояснює, як працювати з обладнанням для зберігання рідин.
Запустіть протокол. Основним використанням Flex є виконання стандартизованих наукових процедур, відомих як протоколи. Розділ 6: Розробка протоколів пропонує кілька способів отримати готові протоколи або розробити їх самостійно. Щоб запустити свій протокол, дотримуйтесь інструкцій у Розділі 7: Програмне забезпечення та робота, де також містяться вказівки щодо виконання інших завдань і налаштування налаштувань робота.
Підтримуйте роботу Flex. Дотримуйтесь порад у Розділі 8: Технічне обслуговування та обслуговування, щоб ваш Flex був чистим і працював оптимально. Або зареєструйтеся в одній із перелічених там послуг Opentrons і дозвольте нам подбати про Flex замість вас.
Дізнайтеся ще більше. Ще щось потрібно? Зверніться до додатків. Додаток A: Глосарій визначає терміни, пов’язані з Flex. Додаток B: додаткова документація вказує на ще більше ресурсів для продуктів Opentrons і написання коду для керування Flex.

OPENTRONS FLEX

9

ПЕРЕДМОВА
Додаток C: програмне забезпечення з відкритим вихідним кодом пояснює, як програмне забезпечення Opentrons розміщується на GitHub як ресурс як для розробників, так і для не розробників.
У Додатку D: Підтримка та контактна інформація перелічено, як зв’язатися з Opentrons, якщо вам потрібна допомога, що не надається в нашій документації.
Примітки та попередження
У цьому посібнику ви знайдете спеціально відформатовані блоки приміток і попереджень. Примітки містять корисну інформацію, яка може бути неочевидною під час звичайного використання Flex. Зверніть особливу увагу на попередження – вони використовуються лише в ситуаціях, коли ви ризикуєте отримати тілесні ушкодження, пошкодити обладнання, втрату або псуванняampфайлів або реагентів, втрата даних або інша шкода. Примітки та попередження виглядають так:
Sample Примітка: це те, що ви повинні знати, але це не становить жодної небезпеки.
Sample Попередження: це те, що вам потрібно знати, оскільки це пов’язано з ризиком.

10

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 1
вступ

Цей розділ знайомить вас з екосистемою Opentrons Flex, включаючи загальний дизайн системи та доступні конфігурації робочих станцій. Він також містить важливу інформацію щодо відповідності та безпеки, яку ви повинні переглянутиview перед налаштуванням робота Opentrons Flex. Додаткову інформацію про функції Opentrons Flex див. у розділі «Опис системи».

1.1 Ласкаво просимо до Opentrons Flex
Opentrons Flex — це робот для обробки рідин, розроблений для високої продуктивності та складних робочих процесів. Робот Flex є основою модульної системи, яка включає піпетки, захват для лабораторного обладнання, кріплення для настилу, модулі на палубі та лабораторне обладнання — усе, що ви можете замінити самостійно. Flex розроблений із сенсорним екраном, тож ви можете працювати з ним безпосередньо на лабораторному столі або керувати ним з усієї лабораторії за допомогою програми Opentrons або наших API з відкритим кодом.
Робочі станції Flex постачаються з усім необхідним обладнанням — роботом, обладнанням і лабораторним забезпеченням — для того, щоб почати автоматизувати стандартні лабораторні завдання. Для інших додатків Opentrons Flex працює на повністю відкритому програмному забезпеченні та мікропрограмі та не залежить від реагентів і лабораторного програмного забезпечення, що дає вам можливість контролювати, як ви розробляєте та запускаєте свої протоколи.

Що нового у Flex
Opentrons Flex є частиною серії роботів для обробки рідин Opentrons. Користувачі Opentrons Flex можуть бути знайомі з Opentrons OT-2, нашим персональним роботом-піпетатором. Flex виходить за межі можливостей OT-2 у кількох ключових областях, забезпечуючи більшу пропускну здатність і час переходу.

Характеристика Пропускна здатність піпетки
Ємності для піпеток і наконечників

опис
Гнучкі піпетки мають 1, 8 або 96 каналів. 96-канальна піпетка працює на 12 разів більше лунок одночасно, ніж найбільша піпетка OT-2.
Піпетки Flex мають більший діапазон об’єму (1 мкл, 50 мкл) і можуть працювати з будь-яким об’ємом наконечників Opentrons Flex. Це покращення порівняно з піпетками OT-5, які мають менший діапазон і повинні використовувати наконечники з відповідним діапазоном об’єму.

OPENTRONS FLEX

11

ГЛАВА 1: ВСТУП

Захват Автоматичне калібрування Сенсорний екран Модуль кедді Координати слота на палубі Пересувний кошик для сміття Розмір і вага

Захват Opentrons Flex захоплює та переміщує лабораторне обладнання по деку автоматично, без втручання користувача. Захоплювач дозволяє виконувати більш складні робочі процеси в рамках одного запуску протоколу.
Позиційне калібрування піпеток Flex і захвату повністю автоматизовано. Натисніть одну кнопку, і інструмент переміститься до точно оброблених точок на деці, щоб визначити своє точне положення, зберігаючи ці дані для використання у ваших протоколах.
Flex має власний інтерфейс сенсорного екрану, який дозволяє керувати ним напряму, на додаток до використання програми Opentrons. Використовуйте сенсорний екран, щоб запускати протоколи, перевіряти статус завдання та змінювати параметри прямо на роботі.
Модулі Flex встановлюються в кедді, які займають простір під палубою. Caddies розміщують лабораторне обладнання ближче до поверхні палуби та дозволяють прокласти кабелі під палубою. Caddies дають можливість ще більше конфігурацій модулів і лабораторного обладнання на палубі.
Слоти дек на Flex пронумеровані за допомогою системи координат (A1D4), яка подібна до нумерації лунок на лабораторному обладнанні.
Кошик для сміття можна поставити на кілька колод Flex. Розташування за замовчуванням (гніздо A3) є рекомендованим положенням. Ви також можете використовувати захват для утилізації сміття в додатковий сміттєпровід.
Flex трохи більший і набагато важчий, ніж OT-2. Завдання встановлення на Flex вимагають допомоги партнера з лабораторії.

Детальне порівняння технічних характеристик роботів доступне на Opentrons webсайт.
Роботи Flex і OT-2 працюють на нашому програмному забезпеченні з відкритим кодом, а програма Opentrons App може керувати обома типами роботів одночасно. Хоча протоколи OT-2 не можна запускати безпосередньо на Flex, їх легко адаптувати (додаткову інформацію див. у розділі «Протоколи OT-2» у розділі «Розробка протоколу»).

Робочі станції Flex
Робочі станції Opentrons Flex включають робота Flex, аксесуари, піпетки та захвати, модулі на палубі та лабораторне обладнання, необхідне для автоматизації певної програми. Усі компоненти робочої станції є модульними. Якщо вам потрібно змінити програми, ви можете додати або замінити інше обладнання Flex і сумісні витратні матеріали.

12

OPENTRONS FLEX

ГЛАВА 1: ВСТУП
РОБОЧА СТАНЦІЯ NGS
Opentrons Flex NGS Workstation автоматизує підготовку бібліотеки NGS. Він може автоматизувати робочі процеси попереднього секвенування, використовуючи будь-яку провідну систему реагентів, включаючи фрагментацію та tagментальна бібліотека підготов.
Окрім робота Flex, робоча станція NGS містить:
Захват Вибір конфігурації піпетки
Дві 8-канальні піпетки (1 мкл і 50 мкл) 5-канальна піпетка (1000 мкл) Сміттєвий жолоб Магнітний блок Температурний модуль Модуль термоциклера Набір лабораторного обладнання з наконечниками для фільтрів, мікроцентрифужними пробірками, резервуарами та планшетами для ПЛР
ПЛР АРМ
Робоча станція Opentrons Flex PCR автоматизує налаштування ПЛР і робочі процеси термоциклування до 96 сampлес. Він може аликвотувати охолоджені реагенти та sampв 96-лунковий планшет для ПЛР. З додаванням автоматизованого модуля Thermocycler використовуйте захват, щоб завантажити планшет у Thermocycler, а потім запустіть вибрану програму ПЛР.
Окрім робота Flex, до складу PCR Workstation входять:
Захват Вибір конфігурації піпетки
1-канальна піпетка (1 мкл) і 50-канальна піпетка (8 мкл) 1-канальна піпетка (50 мкл) Модуль температури лотка для відходів, набір лабораторного обладнання з наконечниками фільтрів, мікроцентрифужними пробірками, резервуарами та планшетами для ПЛР

OPENTRONS FLEX

13

ГЛАВА 1: ВСТУП
РОБОЧА СТАНЦІЯ ДЛЯ ЕКСТРАКЦІЇ НУКЛЕЇНОВИХ КИСЛОТ
Робоча станція Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation автоматизує виділення та очищення ДНК/РНК. Він використовує магнітний блок для розділення магнітних кульок і нагрівач-шейкер дляampлізис і ресуспендування магнітних кульок.
На додаток до робота Flex робоча станція для екстракції нуклеїнових кислот включає:
Захват Вибір конфігурації піпетки
1-канальна піпетка (5 мкл) і 1000-канальна піпетка (8 мкл) 5-канальна піпетка (1000 мкл) Жолоб для відходів Магнітний блок Нагрівач-шейкер Модуль Лабораторне обладнання з наконечниками для фільтрів, резервуарами, планшетами для ПЛР і пластинами з глибокими лунками
РОБОЧА СТАНЦІЯ ДЛЯ ОЧИЩЕННЯ БІЛКІВ МАГНІТНИМИ НАМИСТИНАМИ
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation автоматизує дрібномасштабне очищення білків і протеоміку.ampпідготовка до 96 сampлес. Він сумісний з багатьма популярними реагентами на основі магнітних кульок.
Окрім робота Flex, Workstation Protein Purification Workstation включає:
Захват Вибір конфігурації піпетки
1-канальна піпетка (5 мкл) і 1000-канальна піпетка (8 мкл) 5-канальна піпетка (1000 мкл) Жолоб для відходів Магнітний блок Нагрівач-шейкер Модуль Лабораторне обладнання з наконечниками для фільтрів, резервуарами, планшетами для ПЛР і пластинами з глибокими лунками
РОБОЧА СТАНЦІЯ FLEX PREP
Opentrons Flex Prep Workstation автоматизує прості робочі процеси дозування. Налаштуйте робочу станцію з 1-канальними та 8-канальними піпетками для виконання таких завдань, як sample transfer, sample дублювання, і

14

OPENTRONS FLEX

ГЛАВА 1: ВСТУП
аліквотування реагентів. Налаштуйте робочу станцію за допомогою 96-канальної піпетки для високопродуктивного аліквотування реагентів і планшетів.ampінж.
На додаток до робота Flex робоча станція Flex Prep включає:
Вибір конфігурації піпетки: 1-канальна піпетка (5 мкл) і 1000-канальна піпетка (8 мкл) 5-канальна піпетка (1000 мкл)
Набір лабораторного обладнання з фільтруючими наконечниками, мікроцентрифужними пробірками та резервуарами
РОБОЧА СТАНЦІЯ ПІДГОТОВКИ ПЛАЗМІД
Робоча станція Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation автоматизує вилучення та очищення плазмід на основі магнітних кульок. Ця робоча станція оснащена піпетками великого об’єму, модулем нагрівача-шейкера та магнітним блоком для більшості хімікатів на основі кульок.
На додаток до робота Flex робоча станція Plasmid Prep включає:
Захват 1-канальна піпетка (5 мкл) і 1000-канальна піпетка (8 мкл) Жолоб для відходів Магнітний блок Нагрівач-шейкер Модуль Лабораторне обладнання з наконечниками для фільтрів, мікроцентрифужними пробірками, резервуарами, планшетами для ПЛР і пластинами з глибокими лунками
РОБОЧА СТАНЦІЯ SYNBIO
Робоча станція Opentrons Flex SynBio автоматизує різноманітні робочі процеси синтетичної біології, такі як синтез і клонування ДНК. Він використовує магнітний блок і температурний модуль для підтримки більшості хімікатів на основі бісеру. Додайте модуль Thermocycler Module для проведення інкубації з нагрітою кришкою та ampліфікації.
Окрім робота Flex, робоча станція SynBio включає:
Gripper 1-канальна піпетка (5 мкл) і 1000-канальна піпетка (8 мкл) Магнітний блок Температурний модуль

OPENTRONS FLEX

15

ГЛАВА 1: ВСТУП

Набір лабораторного обладнання зі звичайними та фільтруючими наконечниками, мікроцентрифужними пробірками, резервуарами, планшетами для ПЛР та планшетами з глибокими лунками

1.2 Інформація про безпеку
Робот для обробки рідини Opentrons Flex був розроблений для безпечної роботи. Перегляньте специфікації та вказівки щодо відповідності в цьому розділі, щоб забезпечити безпечне використання вашого Flex. Ці вказівки стосуються безпечного використання вхідних і вихідних з’єднань для продукту, включно з з’єднаннями живлення та передачі даних, а також попереджувальними етикетками на роботі Flex і пов’язаному обладнанні. Використання пристрою способом, відмінним від зазначеного в цьому посібнику, може поставити під загрозу користувача та обладнання.

Символи безпеки
Різноманітні написи на Flex і в цьому посібнику попереджають про джерела потенційної травми чи шкоди.

символ

опис
Попередження: попереджає користувачів про потенційно небезпечні умови. Дії, які можуть призвести до тілесних ушкоджень або смерті.
Увага: застерігає користувачів від пошкодження обладнання. Втрачені або пошкоджені дані. Невідновне переривання виконуваної операції.
Ураження електричним струмом: визначає компоненти приладу, які можуть становити ризик ураження електричним струмом у разі неправильного поводження з інструментом.

Гаряча поверхня: позначає компоненти інструменту, які становлять ризик травмування через високу температуру/температуру в разі неправильного поводження з інструментом.

Точка защемлення: Визначає компоненти інструменту, які можуть становити ризик отримання травм під час руху.

16

OPENTRONS FLEX

ГЛАВА 1: ВСТУП

На Flex ви знайдете такі мітки:
Етикетки інтелектуальної власності Етикетки відповідності нормативним вимогам (наприклад, ETL) Етикетки про небезпеку електричного струму Етикетки загального попередження Етикетки продуктів Етикетки точки защемлення Висока гучністьtagЕтикетки з номінальною потужністю

Попередження щодо електробезпеки
Завжди дотримуйтесь наступних попереджень щодо електробезпеки:

символ

опис
Підключіть робота до заземленої мережі класу 1. Див. розділ Підключення живлення в розділі Опис системи.

Не підключайте (вставляйте), не від’єднуйте (від’єднуйте) і не використовуйте кабелі живлення змінного струму, якщо: Кабель потертий або пошкоджений. Інші приєднані кабелі, шнури або розетки потерті або пошкоджені.
Використання пошкоджених шнурів живлення може призвести до ураження електричним струмом, що призведе до серйозних травм або пошкодження робота.
Не замінюйте кабель живлення змінного струму, окрім як за вказівкою служби підтримки Opentrons.

Додаткову інформацію про вимоги до електрики див. у розділі «Енергоспоживання» глави «Встановлення та переміщення».

OPENTRONS FLEX

17

ГЛАВА 1: ВСТУП

Додаткові застереження щодо безпеки
Завжди дотримуйтесь наступних додаткових попереджень щодо безпеки:

символ

опис
Opentrons Flex не сертифіковано для використання з вибухонебезпечними або легкозаймистими рідинами. Не завантажуйте в робот пластини, пробірки або флакони, що містять вибухові або легкозаймисті рідини, і не використовуйте інструмент іншим чином, якщо в корпусі є вибухові або легкозаймисті рідини.
Використовуйте належну лабораторну практику та дотримуйтеся запобіжних заходів виробника під час роботи з хімікатами. Opentrons не несе відповідальності за будь-які збитки через або в результаті використання небезпечних хімікатів.

Flex важить 88.5 кг (195 фунтів). Як наслідок, для безпечного підйому та переміщення потрібні дві людини. Див. розділ «Переміщення» в розділі «Встановлення та переміщення».

Flex слід розташувати на поверхні, здатній витримати його вагу 88.5 кг (195 фунтів), з достатньою площею для розміщення робота та його мінімальною дистанцією (20 см/8 дюймів). Див. розділ «Вимоги безпеки та експлуатації» в розділі «Встановлення та переміщення».
Flex може видавати вібрацію під час роботи. Розмістіть робота на міцній, рівній і водостійкій поверхні з поперечними або зварними з’єднаннями. Див. розділ «Вимоги безпеки та експлуатації» в розділі «Встановлення та переміщення».

Застереження щодо безпеки
Щоб захистити Flex від пошкодження, дотримуйтеся таких заходів безпеки:

18

OPENTRONS FLEX

ГЛАВА 1: ВСТУП

символ

опис
Використовуйте лабораторне обладнання, яке відповідає ANSI/SLAS або схвалено Opentrons. Див. розділ «Лабораторне програмне забезпечення».
Тримайте корозійні матеріали, агенти чи інші шкідливі матеріали подалі від робота.

Біологічна безпека
Поводьтеся зі зразками та реагентами, що містять матеріали, взяті від людей, як із потенційно інфекційними агентами. Opentrons рекомендує використовувати безпечні лабораторні процедури, як описано в Біологічній безпеці в мікробіологічних і біомедичних лабораторіях (BMBL), 6-е видання.
За звичайних обставин Flex не створює видимих ​​аерозолів із вихідних рідин. Однак за певних умов можливе утворення аерозолів із вихідних рідин. Під час роботи з вихідними рідинами рівня біобезпеки 2 або вище вживайте запобіжних заходів проти впливу аерозолів відповідно до місцевих регуляторних органів. Щоб мінімізувати потенційний ризик впливу аерозолю від робота, переконайтеся, що ви:
Виконуйте технічне обслуговування, як описано в розділі «Технічне обслуговування та обслуговування». Правильно встановіть і закріпіть усі кришки інструментів, піпетки, модулі та лабораторне обладнання. Використовуйте правильну техніку піпетування, щоб допомогти зменшити кількість аерозолів.
Токсичні пари
Якщо ви працюєте з леткими розчинниками або токсичними речовинами, використовуйте ефективну систему вентиляції лабораторії, щоб видалити будь-які випари, які можуть утворюватися.
Легкозаймисті рідини
Flex не було оцінено для використання з легкозаймистими рідинами, тому його не можна використовувати з легкозаймистими рідинами.

OPENTRONS FLEX

19

ГЛАВА 1: ВСТУП

1.3 Відповідність нормативним вимогам
Opentrons Flex відповідає всім чинним вимогам наведених нижче стандартів безпеки та електромагнітних стандартів.

Безпека
Ідентифікатор правила IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Назва
Вимоги безпеки до електричного обладнання для вимірювання, контролю та лабораторного використання. Частина 1: Загальні вимоги
Особливі вимоги до лабораторного обладнання для змішування та перемішування

Електромагнітна сумісність

Ідентифікатор правила EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR, частина 15, підрозділ B, клас A IC ICES-003

Назва
Електричне обладнання для вимірювання, контролю та використання в лабораторіях. Вимоги щодо електромагнітної сумісності. Частина 1: Загальні вимоги. Ненавмисні радіатори
Управління спектром і телекомунікаційне обладнання, що створює перешкоди Стандартне інформаційно-технологічне обладнання (включаючи цифрові пристрої)

Попередження та примітки FCC
Попередження: зміни або модифікації цього пристрою, не схвалені компанією Opentrons, можуть позбавити користувача прав на використання обладнання.
Цей пристрій відповідає частині 15 правил FCC. Експлуатація залежить від наступного:

20

OPENTRONS FLEX

ГЛАВА 1: ВСТУП
Цей пристрій не може створювати шкідливих перешкод. Цей пристрій має сприймати будь-які отримані перешкоди, включно з перешкодами, які можуть викликати небажані перешкоди
операція.
Примітка. Це обладнання було перевірено та визнано таким, що відповідає обмеженням для цифрових пристроїв класу A відповідно до частини 15 правил FCC. Ці обмеження розроблено для забезпечення розумного захисту від шкідливих перешкод, коли обладнання використовується в комерційному середовищі. Це обладнання генерує, використовує та може випромінювати радіочастотну енергію та, якщо його встановити та використовувати не відповідно до інструкції з експлуатації, може створювати шкідливі перешкоди радіозв’язку. Експлуатація цього обладнання в житловій зоні може спричинити шкідливі перешкоди, і в цьому випадку користувач повинен буде усунути перешкоди за власний рахунок.
Відповідність Канаді ISED
Канада ICES-003(A) / NMB-003(A)
Цей продукт відповідає відповідним технічним характеристикам Міністерства інновацій, науки та економічного розвитку Канади.
Le pésent produit est conforme aux pécifications techniques applys d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Екологічне попередження
Попередження: рак і репродуктивна шкода www.P65Warnings.ca.gov
Попередня сертифікація Wi-Fi
Модуль Wi-Fi попередньо сертифікований для використання в багатьох регіонах:
Сполучені Штати (FCC): Ідентифікатор FCC UAY-W8997-M1216 Європейська економічна зона (CE): Відсутній публічний ідентифікатор (самодекларація) Канада (IC): Ідентифікаційний номер апаратної версії W8997-M1216 Японія (TELEC): Сертифікований номер 020-170034 Індія (WPC): реєстраційний номер ETA-SD-20191005525 (самодекларація)

OPENTRONS FLEX

21

РОЗДІЛ 2
Монтаж і переїзд
У цьому розділі описано, як підготувати вашу лабораторію до Opentrons Flex, як налаштувати робота та як його перемістити, якщо необхідно. Перш ніж отримати Flex, переконайтеся, що ваша лабораторія чи підприємство відповідає всім критеріям у розділі «Вимоги безпеки та експлуатації». Коли прийде час запустити ваш Flex, дотримуйтесь детальних інструкцій у розділах «Розпакування», «Перший запуск» і «Встановлення та калібрування приладу» або скористайтеся послугою налаштування на місці підтримки Opentrons. І якщо вам колись знадобиться перемістити ваш Flex на нове місце, ближче чи дальше, виконайте дії, наведені в розділі «Переміщення».
2.1 Вимоги до техніки безпеки та експлуатації
Де розмістити Opentrons Flex
Майже в кожній лабораторії простір є цінним товаром. Вашому Flex знадобиться трохи, але не надто багато, оскільки він розрахований на половину стандартного лабораторного столу. Переконайтеся, що у вас є місце, яке відповідає наступним критеріям.
Поверхня лави: Стаціонарна, міцна, рівна, водостійка поверхня. Столи чи лавки з колесами (навіть із фіксацією) не рекомендується. Flex рухається швидко та має велику масу, яка може трясти або порушувати баланс легких або рухомих столів.
Вагова опора: сам робот важить 88.5 кг (195 фунтів), і його повинні піднімати лише дві людини, які працюють разом. Розмістіть робота на поверхні, яка може легко витримати його вагу, а також вагу будь-яких модулів, лабораторного обладнання, рідин або іншого лабораторного обладнання, яке буде використовуватися у ваших програмах.
Робочий простір: базові розміри робота становлять 87 см Ш x 69 см Г x 84 см В (приблизно 34 x 27 x 33 дюйми). Flex потребує 20 см (8 дюймів) вільного простору збоку та ззаду для кабелів, USB-з’єднань і для розсіювання вихлопу від модулів, які нагрівають і охолоджують.
Попередження: не розміщуйте бічні або задню частину Flex впритул до стіни.

22

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ

84 см 33 дюймів

87 см 34 дюймів
Розміри бази Opentrons Flex.

69 см 27 дюймів

20 см 8 дюймів

20 см 8 дюймів

20 см 8 дюймів

Топ view Opentrons Flex із мінімальним боковим і заднім зазором.

OPENTRONS FLEX

23

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ

Споживана потужність
Opentrons Flex слід підключити до настінної розетки на місці, де ви його встановлюєте, або поблизу нього. Підключайте Flex лише до ланцюгів, які можуть забезпечити його максимальне споживання потужності:
Вхідна потужність: 36 В постійного струму, 6.1 A Споживання в режимі очікування: 30 Вт Типове споживання: 40 Вт (під час виконання протоколу) Максимальне споживання: приблизно 50 Вт
Точне споживання електроенергії залежить від:
Кількість і тип руху, виконаного під час протоколу. Кількість часу, який робот проводить бездіяльно. Стан індикаторів на роботі. Скільки інструментів прикріплено.
Не забудьте врахувати іншу електроніку, яка споживає електроенергію в тій самій схемі, включаючи модулі Flex з власними джерелами живлення. наприкладampТаким чином, модуль Thermocycler має максимальне споживання електроенергії (630 Вт), що набагато більше, ніж сам робот Flex. Якщо необхідно, проконсультуйтеся з менеджером вашого закладу, щоб переконатися, що воно відповідає вимогам до потужності вашого обладнання.

Екологічні умови
Умови навколишнього середовища для рекомендованого використання, прийнятного використання та зберігання відрізняються:

Рекомендовано для системної експлуатації

Прийнятний для роботи системи

Температура навколишнього середовища від +20 до +25 °C

від +2 до +40 °C

Відносна вологість Висота

40%, без конденсації
Приблизно 500 м над рівнем моря

30%, без конденсації (нижче 80 °C)
До 2000 м над рівнем моря

Зберігання та транспортування
від -10 до +60 °C
10%, без конденсації (нижче 85 °C)
До 2000 м над рівнем моря

24

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Компанія Opentrons перевірила продуктивність Opentrons Flex в умовах, рекомендованих для роботи системи, і робота в цих умовах повинна забезпечити оптимальні результати. Flex безпечно використовувати в умовах, прийнятних для роботи системи, але результати можуть відрізнятися. Не вмикайте та не використовуйте Flex в умовах, що виходять за межі цих обмежень. Умови зберігання та транспортування застосовуються лише тоді, коли робот повністю відключений від електроживлення та іншого обладнання.
2.2 Розпакування
Щиро вітаю! Ваш Opentrons Flex прибув, і ви підготували місце для нього у своїй лабораторії. Давайте відкриємо скриньку з монстрами, виймемо робота та підготуємо його до роботи. Інформація в цьому розділі містить перелік деталей та інструкції, які допоможуть вам виконати кроки, необхідні для розпакування, налаштування та готовності Flex до використання. Ми розділили процедуру налаштування на три частини:
У частині 1 розповідається про розбирання ящика. У частині 2 йдеться про від’єднання Flex від ящика та переміщення його до місця остаточного складання. Частина 3 охоплює остаточне складання та перше ввімкнення робота.
Потрібні зусилля і час
Ви захочете попросити партнера з лабораторії допомогти з процесом розпакування, підйому, переміщення та складання. Для цього вам знадобиться від 30 хвилин до години.
Примітка. Щоб правильно підняти Flex, потрібні дві людини. Крім того, підняття та перенесення Flex за ручки є найкращим способом переміщення робота.
Ящик і пакувальний матеріал
Розпакувавши Flex, ви отримаєте чудового робота, але у вас також залишиться кілька великих панелей ящиків разом із різними компонентами для транспортування та оббивкою. Хоча ви можете відмовитися від цього матеріалу, ми радимо вам зберегти ці елементи, якщо є місце для зберігання. Упаковка придатна для багаторазового використання, що допомагає підготувати ваш Flex до транспортування, якщо вам коли-небудь знадобиться надіслати його кудись (наприклад, на конференцію чи новий заклад) у майбутньому.

OPENTRONS FLEX

25

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Елементи продукту
Flex поставляється з компонентами, переліченими нижче. Піпетки, захват і модулі поставляються в окремій упаковці від основного ящика Flex, навіть якщо ви придбали їх разом як робочу станцію.

(1) Робот Opentrons Flex

(1) Кабель USB

(1) Кабель живлення

(1) Кабель Ethernet

(5) L-подібні ключі (шестигранний 12 мм, шестигранний 1.5 мм, шестигранний 2.5 мм, шестигранний 3 мм,
T10 Torx)

(1) Кулон аварійної зупинки

(1) Слот для деки з кліпсами для лабораторного обладнання

(4) Запасні кліпси для лабораторного обладнання

(1) Зонд для калібрування піпетки

(4) Ручки для перенесення та кришки

(1) Верхня панель вікна

(4) Панелі бічних вікон

(1) шестигранна викрутка на 2.5 мм

(1) гайковий ключ на 19 мм

(16 + запчастини) Віконні гвинти (M4x8 мм з плоскою головкою)
26

(10) Запасні гвинти з пазом для палуби (M4x10 мм з торцевою головкою)

(12) Запасні гвинти для палубного затиску (головка M3x6 мм з головним торцем)

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Частина 1: Зніміть ящик
Opentrons доставляє ваш Flex у міцному фанерному ящику. Транспортний ящик використовує гачок і засув клamps для з’єднання верхньої, бічної та нижньої панелей. Використання засувок замість цвяхів чи шурупів означає, що вам не знадобиться лом (або багато сили), щоб розібрати ящик, і ви зможете зібрати його пізніше, якщо це буде потрібно.
Примітка. Краї ящика можуть пошарпатися під час транспортування. Ви можете використовувати робочі рукавички, щоб захистити руки від дерев’яних осколків.
Щоб звільнити засувки, переверніть язичок засувки вгору та поверніть його ліворуч (проти годинникової стрілки). Ця дія переміщує клamp витягніть руку з відповідного кріпильного кронштейна. Потім ви можете відкинути фіксатор від ящика.
1 Розблокуйте вісім засувів, які тримають верхню частину з боків.

2 Зніміть верхню панель, відпустивши засувки.

OPENTRONS FLEX

27

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ 3 Розріжте синю транспортну сумку, вийміть ці предмети з підкладки та відкладіть їх:
Комплект користувача Кабелі живлення, Ethernet і USB. Підвіска для аварійної зупинки
4 Зніміть верхній шматок пінопласту, щоб відкрити віконні панелі. Набивка захищає бічні та верхні панелі.
5 Зніміть віконні панелі та відкладіть їх. Ви прикріпите їх пізніше.

28

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
6 Розблокуйте решту 16 засувів, які тримають бічні панелі одна до одної та до основи ящика. 7 Зніміть бічні панелі та відкладіть їх.
Частина 2: Відпустіть Flex
Після виконання кроків у Частині 1 ви маєте побачити робота в захисному пакеті та прикріпленого до помаранчевих сталевих монтажних компонентів. Сумка огортає робота та захищає його від зовнішнього середовища. Сталеві скоби кріплять робота до дна ящика. Дві рами для транспортування підтримують робота, рівномірно розподіляючи його вагу та утримуючи його жорстким, щоб він не деформувався під час транспортування. Продовжуйте розпаковувати Flex і знімати його з основи ящика.
8 Використовуючи гайковий ключ на 19 мм із набору користувача, відкрутіть кронштейни від дна ящика. Ви можете викинути дужки або зберегти їх для майбутнього використання.

OPENTRONS FLEX

29

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ 9 Потягніть або закатайте транспортувальну сумку до упору, щоб відкрити весь робот.
10 За допомогою партнера з лабораторії візьміться за ручки в помаранчевих транспортувальних рамах з обох боків основи робота, підніміть Flex з основи ящика та поставте його на підлогу. Збережіть або викиньте основу ящика та раму для транспортування.

30

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ 11 За допомогою шестигранного L-подібного ключа на 12 мм із набору користувача відкрутіть чотири болти, що тримають транспортувальні рами.
Flex. Збережіть або викиньте рами та болти.
12 Зніміть чотири алюмінієві ручки з набору користувача. Прикрутіть ручки до тих самих місць, де трималися болти транспортувальної рами 12 мм.

OPENTRONS FLEX

31

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
13 За допомогою партнера з лабораторії підніміть Flex за ручки для перенесення та перенесіть його на робочий стіл для остаточного складання.

Частина 3: Остаточне складання та ввімкнення
Після переміщення Flex у тимчасову робочу зону або його постійне місце проживання настав час завершити роботу над вашим новим роботом.
14 Якщо ви перемістили робота на його кінцеве робоче місце, зніміть ручки для перенесення та замініть їх захисними кришками. Ковпачки закривають отвори ручок у рамі та надають роботу чистого вигляду. Поверніть ручки до комплекту користувача для зберігання.

32

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
15 Вийміть верхню та бічні панелі з пакувальної піни, яку ви відклали після зняття верхньої частини ящика.
16 Встановіть віконні панелі на Flex, дотримуючись інформації про маркування на передній захисній плівці. Потім зніміть захисну плівку.
17 Використовуючи скошені віконні гвинти та викрутку 2.5 мм із набору користувача, прикріпіть віконні панелі до Flex. Переконайтеся, що скошені (V-подібні) отвори у віконних панелях спрямовані назовні (до вас). Це дозволяє шурупам прилягати врівень з поверхнею вікна.

Попередження: Неправильна орієнтація панелей може призвести до пошкодження. Надмірний момент затягування гвинтів може призвести до тріщин на панелях. Затягніть гвинти вручну, доки віконні панелі не будуть належним чином закріплені. Це не випробування сил.

OPENTRONS FLEX

33

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ 18 За допомогою викрутки на 2.5 мм із набору користувача зніміть фіксуючі гвинти з порталу. Ці
гвинти запобігають переміщенню порталу під час транспортування. Стопорні гвинти порталу розташовані: На лівій бічній рейці біля передньої частини робота. Під вертикальним плечем порталу. На правій бічній рейці біля передньої частини робота в помаранчевій дужці. Тут є два гвинти.
Портал легко рухається вручну після видалення всіх транспортувальних гвинтів. 19 Відріжте та зніміть дві гумки, які утримують сміттєвий бак на місці під час транспортування.

34

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
20 Приєднайте шнур живлення до Flex і вставте його в розетку. Переконайтеся, що на палубі немає перешкод. Поверніть перемикач живлення на задній лівій частині робота. Після ввімкнення гентрі переміщується у вихідне місце, а на сенсорному екрані відображаються додаткові інструкції з налаштування.

Тепер, коли ваш Flex готовий до роботи, перейдіть до розділу «Перший запуск» нижче.
2.3 Перший запуск
Виконайте основні налаштування на сенсорному екрані, перш ніж підключати будь-яке інше обладнання до вашого Flex. Робот допоможе вам підключитися до вашої лабораторної мережі, оновити програмне забезпечення до останньої версії та персоналізувати Flex, давши йому назву.
Увімкніть живлення
Коли ви вмикаєте Flex, на сенсорному екрані з’являється логотип Opentrons. Через кілька секунд з’явиться екран «Ласкаво просимо до вашого Opentrons Flex».
Екран привітання Opentrons Flex. Ви побачите цей екран лише під час першого запуску Flex.

OPENTRONS FLEX

35

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Підключіться до мережі або комп’ютера
Дотримуйтеся вказівок на сенсорному екрані, щоб підключити свого робота, щоб він міг перевірити наявність оновлень програмного забезпечення та отримати протокол fileс. Є три способи підключення: Wi-Fi, Ethernet і USB.

Варіанти підключення до мережі. Щоб налаштувати Flex, потрібно мати підключення до Інтернету. Wi-Fi: використовуйте сенсорний екран для підключення до мереж Wi-Fi, захищених персональною автентифікацією WPA2 (більшість мереж, для приєднання яких потрібен лише пароль, підпадають під цю категорію).
Примітка: Flex не підтримує адаптивні портали (мережі, які не мають пароля, але завантажують a webдля автентифікації користувачів після підключення).
Ви також можете підключитися до відкритої мережі Wi-Fi, але це не рекомендується.
Попередження: підключення до відкритої мережі Wi-Fi дозволить будь-кому в зоні дії сигналу мережі керувати вашим роботом Opentrons Flex без автентифікації.

Якщо вам потрібно підключитися до мережі Wi-Fi, яка використовує автентифікацію підприємства (включно з «eduroam» та подібними академічними мережами, які потребують імені користувача та пароля), спочатку підключіться до програми Opentrons через Ethernet або USB, щоб завершити початкове налаштування. Потім підключіться до корпоративної мережі Wi-Fi у налаштуваннях мережі для вашого Flex. Щоб отримати доступ до налаштувань мережі:

36

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
1. Натисніть «Пристрої» на лівій бічній панелі програми Opentrons. 2. Клацніть меню з трьома крапками () для свого Flex і виберіть «Налаштування робота». 3. Натисніть вкладку Мережа.
Виберіть свою мережу зі спадного меню або виберіть «Приєднатися до іншої мережі…» та введіть її SSID. Виберіть корпоративний метод автентифікації, який використовує ваша мережа. Підтримувані методи:
EAP-TTLS з TLS EAP-TTLS з MS-CHAP v2 EAP-TTLS з MD5 EAP-PEAP з MS-CHAP v2 EAP-TLS
Кожен із цих методів потребує імені користувача та пароля, і залежно від вашої точної конфігурації мережі може знадобитися сертифікат files або інші варіанти. Зверніться до ІТ-документації вашого закладу або зв’яжіться зі своїм ІТ-менеджером, щоб дізнатися більше про налаштування мережі.
Ethernet: підключіть робота до мережевого комутатора або концентратора за допомогою кабелю Ethernet. Ви також можете підключатися безпосередньо до порту Ethernet на вашому комп’ютері, починаючи з версії робототехнічної системи 7.1.0.
USB: під’єднайте наданий кабель USB A-B до порту USB-B робота та відкритого порту комп’ютера. Використовуйте кабель USB B-to-C або адаптер USB A-to-C, якщо ваш комп’ютер не має порту USB-A.
Щоб продовжити налаштування, на підключеному комп’ютері має бути встановлено та запущено додаток Opentrons. Докладніше про встановлення програми Opentrons див. у розділі «Встановлення програми» глави «Програмне забезпечення та експлуатація».
Встановіть оновлення програмного забезпечення
Тепер, коли ви підключилися до мережі або комп’ютера, робот може перевірити наявність оновлень програмного забезпечення та мікропрограми та за потреби їх завантажити. Якщо є оновлення, інсталяція може зайняти кілька хвилин. Після завершення оновлення робот перезавантажиться.

OPENTRONS FLEX

37

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Прикріпіть кулон аварійної зупинки
Підключіть підвіску аварійної зупинки (E-stop), що входить до комплекту, до додаткового порту (AUX-1 або AUX-2) на задній панелі робота.

До і після підключення кулона аварійної зупинки.
Під’єднання та ввімкнення E-stop є обов’язковим для під’єднання інструментів і запуску протоколів на Flex. Щоб отримати додаткові відомості про використання функції E-stop під час роботи робота, див. розділ «Підвіска аварійної зупинки» в розділі «Опис системи».
Дайте своєму роботу назву
Назва вашого робота дозволить вам легко ідентифікувати його в лабораторних умовах. Якщо у вашій мережі є кілька роботів Opentrons, обов’язково дайте їм унікальні імена. Коли ви підтвердите ім’я свого робота, ви перейдете на панель інструментів Opentrons Flex. Ймовірно, наступним кроком, який ви захочете зробити, є підключення інструментів, про що йдеться в наступному розділі.
2.4 Установка та калібрування приладу
Після початкового налаштування робота наступним кроком є ​​приєднання приладів до робота та їх калібрування.
Щоб установити інструмент, спочатку натисніть «Інструменти» на сенсорному екрані або перейдіть до розділу «Піпетки та модулі» на екрані інформації про пристрій у додатку Opentrons. Виберіть порожнє кріплення та виберіть «Приєднати піпетку» або «Приєднати захват». Якщо кріплення, яке ви бажаєте використати, уже зайняте, спершу потрібно від’єднати піпетку або захват.

38

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Примітка. Загальний процес встановлення однаковий незалежно від того, чи використовуєте ви сенсорний екран чи додаток Opentrons. Будь-який пристрій, на якому ви почали, контролюватиме процес встановлення, доки ви не завершите або не скасуєте його.
Якщо ви починаєте з сенсорного екрану, програма покаже, що робот «зайнятий». Якщо ви починаєте в додатку, на сенсорному екрані з’явиться модальне повідомлення, яке вказує на те, що інсталяція приладу триває.
Точний процес встановлення залежить від приладу, який ви підключаєте, як зазначено в розділах нижче. Усі прилади мають автоматичну процедуру калібрування, яку слід виконати одразу після встановлення.
Установка піпетки
Коли ви встановлюєте піпетку, ви будете керуватися наступними кроками на сенсорному екрані або в додатку Opentrons.
1. ОБЕРІТЬ ТИП ПІПЕТКИ Виберіть між 1- або 8-канальною піпеткою або 96-канальною піпеткою. Прикріплення 96-канальної піпетки вимагає кількох додаткових кроків, оскільки вона кріпиться до спеціальної монтажної пластини, яка охоплює обидва кріплення піпетки.
2. ПІДГОТУЙТЕСЯ ДО ВСТАНОВЛЕННЯ Зніміть лабораторне обладнання з палуби та очистіть робочу зону, щоб полегшити кріплення та калібрування. Також зберіть необхідне обладнання, наприклад калібрувальний зонд, шестигранну викрутку та монтажну пластину (для 96-канальної піпетки).
3. ПІДКЛЮЧІТЬ ТА ЗАКРІПНІТЬ ПІПЕТКУ Портал переміститься до передньої частини робота, щоб ви могли приєднати піпетку.
1- та 8-канальні піпетки підключаються безпосередньо до кріплення для піпетки. Для 96-канальної піпетки потрібна монтажна пластина. Щоб прикріпити монтажну пластину, потрібно спочатку від’єднати каретку осі z для правого кріплення піпетки.

OPENTRONS FLEX

39

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Приєднайте піпетку до вибраного кріплення для піпетки та закріпіть її гвинти.
4. ЗАПУСІТЬ АВТОМАТИЧНЕ КАЛІБРУВАННЯ Щоб відкалібрувати піпетку, приєднайте калібрувальний зонд до відповідного сопла піпетки. Піпетка автоматично рухатиметься, торкаючись певних точок на деці, і збереже ці значення калібрування для майбутнього використання. Після завершення калібрування та вилучення зонда піпетка буде готова до використання в протоколах.
Установка захвату
Коли ви встановлюєте захват, ви будете керуватися наступними кроками на сенсорному екрані або в додатку Opentrons.
1. ПІДГОТУЙТЕСЯ ДО ВСТАНОВЛЕННЯ Зніміть лабораторне обладнання з деки та очистіть робочу зону, щоб полегшити кріплення та калібрування. Також візьміть необхідну шестигранну викрутку та переконайтеся, що калібрувальний штифт знаходиться в місці зберігання на захваті.
2. ПІДКЛЮЧІТЬ ТА ЗАКРІПЛІТЬ ЗАХВАТ. Портал переміститься до передньої частини робота, щоб ви могли приєднати захват. Під’єднайте захват до подовжувача та закріпіть його гвинти.
3. ЗАПУСІТЬ АВТОМАТИЧНЕ КАЛІБРУВАННЯ Щоб відкалібрувати захват, вставте калібрувальний штифт у передню губку. Захват автоматично переміститься, щоб торкнутися певних точок на деці, і збереже ці значення калібрування для майбутнього використання. Потім повторіть той самий процес з калібрувальним штифтом у задній щелепі. Після завершення калібрування та повернення шпильки в місце зберігання захват буде готовий до використання в протоколах.
2.5 Переїзд
У цьому розділі надано поради та інструкції щодо переміщення робота Opentrons Flex на короткі та великі відстані.

40

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Короткі ходи
Коротке переміщення охоплює діапазон відстаней від «давайте просто трохи перемістимося» до лабораторії, коридору або іншого поверху у вашій будівлі. У цих випадках ви можете пересувати Flex вручну. Транспортування на ручному візку також є хорошим варіантом.
Попередження: Flex важить 88.5 кг. Як наслідок, для безпечного підйому та переміщення потрібні дві людини.
Знову приєднайте підйомні ручки, щоб перемістити Flex на нове місце поблизу. Піднімання та перенесення Flex за ручки – це правильний спосіб переміщення робота на короткі відстані. Зніміть ручки та зберігайте їх у комплекті користувача після завершення переміщення. Щоб запобігти пошкодженню робота, завжди використовуйте підйомні ручки, щоб підняти його та перемістити. Не хапайтеся за раму, щоб підняти або перемістити робота.
Переїзди на великі відстані
Переїзд на велику відстань транспортує ваш Flex за межі вашого університету, закладу чи установи. Через місто, у нове місто, штат, провінцію чи країну – усе це ексampле переїзду на великі відстані. У цьому випадку вам потрібно буде упакувати Flex, щоб захистити його від стихії, ударів і грубих рухів, які можуть виникнути під час транспортування.
Якщо ви зберегли транспортувальний ящик і внутрішні опори, які постачалися разом із вашим Flex, ви можете запакувати їх у ці матеріали для переміщення на великі відстані. Виконайте кроки розпакування у зворотному порядку, щоб підготувати Flex до переїзду на великі відстані. В основному, ви повинні:
Від’єднайте кабель живлення та мережевий кабель, якщо він підключений. Видаліть усе приєднане апаратне та лабораторне обладнання. Знову прикріпіть пластини палуби. Заблокуйте портал (див. розділ Загальні поради щодо переміщення нижче). Зніміть і зберігайте віконні панелі.
Якщо ви зберегли оригінальний ящик:
Знову прикріпіть транспортувальну раму до Flex і закріпіть її на основі піддону за допомогою L-подібних кронштейнів. Додайте прокладку та знову зберіть ящик для транспортування.

OPENTRONS FLEX

41

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Якщо у вас немає оригінального ящика та супутніх матеріалів, зверніться до авторитетної транспортної компанії. Вони можуть керувати процесом пакування, транспортування та доставки за вас.
Загальні поради щодо переїзду
ВІД'ЄДНАЙТЕ КАБЕЛІ ЖИВЛЕННЯ ТА МЕРЕЖЕВІ КАБЕЛІ Перш ніж переміщати Flex, не забудьте: Вимкнути живлення та від'єднати його від джерела живлення. Від'єднайте кабель Ethernet або USB, якщо він використовується.
ЗАБЛОКУЙТЕ ГАНТРІ Перш ніж переміщати Flex, знову вставте фіксуючі гвинти, щоб утримати портал на місці. Точки блокування порталу розташовані: На лівій бічній рейці біля передньої частини робота. Під вертикальним плечем порталу. На правій бічній рейці біля передньої частини робота. Замок цієї частини порталу вимагає малого
помаранчевий кронштейн і два фіксуючі гвинти.

42

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
ПОВІДОМЛЕННЯ КОМПОЗИЦІЇ Можливо, вам не захочеться блокувати платформу, якщо ви лише пересуваєте робота в ближче місце. Якщо ви вирішите не блокувати його, скористайтеся принаймні сенсорним екраном або додатком Opentrons, щоб відправити портал у вихідне положення, перш ніж вимкнути його. Щоб повернути платформу через сенсорний екран, торкніться меню з трьома крапками (), а потім торкніть «Початок платформи». Щоб розмістити портал через програму Opentrons: натисніть «Пристрої». Натисніть свій Flex у списку пристроїв. Клацніть меню з трьома крапками (), а потім клацніть «Домашній портал».
ВИДАЛИТИ МОДУЛІ Внутрішні модулі та інші пристосування додають додаткової ваги вашому Flex. Вони також впливають на центр ваги робота, через що він може відчувати себе «напідпитку», коли піднімає його. Щоб полегшити й збалансувати робота, зніміть усі приєднані інструменти та лабораторне обладнання, перш ніж брати його.
ПЕРЕВСТАНОВЛЕННЯ ГНІЗДІВ ДЕКИ Ми рекомендуємо знову приєднати слоти деки для переміщення на велику відстань. Закріплення слотів на їх початковому місці допоможе запобігти випадковій втраті. Повторне кріплення слотів деки для коротких переміщень по лабораторії необов’язкове.
ПОВТОРНЕ КАЛІБРУВАННЯ ПІСЛЯ ПЕРЕМІЩЕННЯ Ви повинні повторно відкалібрувати будь-які інструменти та модулі після їх повторного встановлення. Докладніше про калібрування модуля див. у розділі «Модулі».

OPENTRONS FLEX

43

РОЗДІЛ 2: ВСТАНОВЛЕННЯ ТА ПЕРЕМІЩЕННЯ
Останні думки про переїзд
Ваш Flex — це міцна та добре побудована машина, але це також точний науковий інструмент, розроблений із строгими допусками. Тому вам слід обережно поводитися з ним, переміщуючи його в межах вашої місцевої роботи або надсилаючи по країні. Це означає дотримання наведених тут вказівок і використання власного здорового глузду щодо транспортування дорогого лабораторного обладнання. Підсумок: переміщаючи Flex, будьте обережні та використовуйте додаткову підкладку.
Якщо у вас є запитання чи сумніви щодо переміщення вашого Flex, зв’яжіться з нами за адресою support@opentrons.com.

44

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3
Опис системи

У цьому розділі описано апаратні системи Opentrons Flex, які лежать в основі його основних функцій автоматизації лабораторії. Палуба, портал і кріплення для інструментів Opentrons Flex дозволяють використовувати прецизійні компоненти для роботи з рідинами та лабораторним обладнанням. Сенсорний екран пристрою дозволяє запускати протоколи та перевіряти стан робота без необхідності підносити комп’ютер до лабораторного столу. Дротове та бездротове підключення дає змогу додатково керувати за допомогою додатка Opentrons (додаткову інформацію див. у розділі «Програмне забезпечення та експлуатація») і розширювати можливості системи шляхом підключення периферійних пристроїв (див. розділ «Модулі»).

3.1 Фізичні компоненти

Камера

Індикатор стану

Сенсорний екран

рамка

Козлова палуба
Вхідні двері
Розташування фізичних компонентів Opentrons Flex.

Ковпачки для ручок бокових вікон

OPENTRONS FLEX

45

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Каркас і корпус
Каркас робота Opentrons Flex забезпечує жорсткість і структурну підтримку його палуби та порталу. Усі механічні підсистеми розташовані на основній рамі та змонтовані на ній. Рама виготовлена ​​в основному з листового металу та алюмінію.
Металевий каркас має отвори для бічних вікон і передніх дверей з прозорого полікарбонату, які дозволяють бачити, що відбувається всередині Flex. Петлі передніх дверей відкриваються для доступу до внутрішньої частини системи. Відкривши передні дверцята, ви можете прикріпити інструменти, модулі та деки; підготувати колоду перед протоколом; або маніпулювати станом колоди під час протоколу.
Білі світлодіодні смуги на внутрішніх верхніх краях рами забезпечують освітлення, кероване програмним забезпеченням. 2-мегапіксельна камера може фотографувати деку та робочу зону для запису та відстеження виконання протоколу.

Палуба та робоча зона
Дека — це оброблена алюмінієва поверхня, на якій виконуються автоматизовані наукові протоколи. Колода має 12 основних слотів у форматі ANSI/SLAS, які можна переконфігурувати для розміщення лабораторного обладнання, модулів і витратних матеріалів. Слоти колоди ідентифікуються системою координат: слот A1 ззаду ліворуч і слот D3 спереду справа.

Слот розширення (для термоциклера). Робоча зона

StagПлоща ін

Області колоди в Flex.

46

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
Робоча зона — це фізичний простір над декою, доступний для піпетування. Лабораторне обладнання, розміщене в слотах від A1 до D3, знаходиться в робочій зоні.
Opentrons Flex поставляється зі знімними слотами для всіх 12 позицій у робочій зоні. Кожен слот деки має кутові затискачі для лабораторного приладдя для надійного розміщення лабораторного приладдя на деці.
Ви можете змінити конфігурацію колоди, замінивши слоти іншими пристосуваннями колоди, включаючи рухомий сміттєвий бак, сміттєвий жолоб і модулі. Слот розширення за A1 використовується лише для того, щоб звільнити додаткове місце для модуля Thermocycler, який займає слоти A1 і B1.
Примітка: слоти колоди взаємозамінні всередині колони (1, 2 або 3), але не між колонами; слоти стовпця 1 і стовпця 3 є різними частинами, незважаючи на їхній подібний розмір. Ви можете визначити, до якого стовпця йде гніздо, орієнтувавши синій затискач для лабораторного обладнання ззаду зліва.
Вам слід залишити слоти для колод у місцях, де ви хочете розмістити автономне лабораторне обладнання. Дека та предмети, розміщені на ній, залишаються статичними, якщо їх не перемістити за допомогою захвату або ручного втручання.
Stagмісцевості
Staging area — додатковий простір уздовж правого боку колоди. Ви можете зберігати лабораторне обладнання в цьому місці після встановлення stagслотів області. Лабораторне обладнання, розміщене в слотах від A4 до D4, знаходиться в stagплощі. Гнучкі піпетки не можуть досягти stagале захват може брати та переміщати лабораторне обладнання до та з цього місця. Додавання додаткових слотів допомагає зберегти робочу область доступною для обладнання, що використовується у ваших автоматизованих протоколах.
StagСлоти для робочих станцій включені в певні конфігурації робочих станцій, а також доступні для придбання на сайті https://shop.opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

47

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Stagобласть із встановленими слотами

Палубні світильники
Пристосування - це апаратні елементи, які замінюють стандартні слоти колоди. Вони дозволяють налаштувати макет колоди та додати функціональність до вашого Flex. В даний час палубні світильники включають stagщілини, внутрішній відро для сміття та зовнішній сміттєпровід. Ви можете встановлювати світильники лише в кілька конкретних слотів колоди. У наступній таблиці наведено розташування колод для кожного світильника.

Пристосування StagСміттєвий бак Сміттєпровід Сміттєпровід із stagслот області

Слоти A3D3 A1D1 і A3-D3 D3 тільки D3 тільки

Світильники знеструмлені. Вони не містять електронних або механічних компонентів, які повідомляють роботу про їхній поточний стан і розташування на палубі. Це означає, що ви повинні використовувати функцію конфігурації колоди, щоб дозволити Flex знати, які прилади прикріплені до колоди та де вони розташовані.

48

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Ви можете отримати доступ до налаштувань конфігурації колоди з сенсорного екрану через меню з трьома крапками () і з програми Opentrons. Див. розділ «Конфігурація деки» глави «Програмне забезпечення та експлуатація», щоб дізнатися, як налаштувати деку за допомогою сенсорного екрану.

Сміттєпровід
Сміттєвий жолоб Opentrons Flex передає рідини, наконечники, підставки для наконечників і пластини з лунками з корпусу Flex у контейнер для сміття, розміщений під зовнішнім отвором. Жолоб для сміття приєднується до адаптера настилу, який підходить до слота D3. Він також поставляється зі спеціальною віконною напівпанеллю, яка дозволяє жолобу виходити з передньої частини робота.
Компоненти сміттєпроводу.

Адаптер пластини кришки

Сміттєпровід
Адаптер для палубної плити з StagПлоща ін

Stagслотів області
Staging area slots — сумісні з ANSI/SLAS частини колоди, які замінюють стандартні слоти в колонці 3 і додають нові слоти доtaging area — все без втрати місця в робочій зоні. Ви можете встановити один слот або максимум чотири слоти, щоб створити нову колонку (від A4 до D4) уздовж правого боку колоди. Зауважте, однак, що для заміни слота колоди A3 потрібно перемістити сміттєвий бак. Додавши stagДодавши слотів до деки, ваш робот Flex може зберігати більше лабораторного обладнання та працювати ефективніше.

OPENTRONS FLEX

Flex stagслот області.
49

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
ВСТАНОВЛЕННЯ СЛОТА
Щоб встановити, видаліть гвинти, які прикріплюють стандартний слот до колоди, і замініть його на stagслот області. Після встановлення використовуйте сенсорний екран або додаток Opentrons, щоб повідомити робота, якого ви додалиtagслот області до колоди.
Встановлення якtagслот області.

СУМІСНІСТЬ СЛОТОВ StagРоз’єми сумісні з інструментами, модулями та лабораторним обладнанням Flex, переліченими нижче.

Модулі піпеток з гнучким захватом
лабораторне обладнання

Stagсумісність зон
Flex Gripper може переміщувати лабораторне обладнання до або з stagслотів області.
Гнучкі піпетки не досягають stagплощі. Використовуйте захват, щоб перемістити підставки для наконечників і лабораторне обладнання з stagдо робочої зони перед піпетуванням.
Магнітний блок GEN1 можна розмістити в колонці 3 поверх astagслот області. Модулі не підтримуються в стовпці 4.
Модулі з живленням, такі як нагрівач-шейкер і температурний модуль, поміщаються в кеди, які можна розмістити в колонці 3. Ви не можете додати якtagперемістіть слот області в положення, зайняте модульним кедді.
Stagслоти для зони мають ті самі розміри ANSI/SLAS, що й стандартні слоти колоди. Використовуйте лабораторне обладнання, сумісне із захопленнями, у stagабо вручну додавати та видаляти лабораторне обладнання з цього місця.

50

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
Система руху
До рами прикріплено портал, який є системою руху та позиціонування робота. Портал рухається окремо вздовж осей x і y, щоб розмістити піпетки та захват у точних місцях для виконання протоколу. Переміщення вздовж цих осей відбувається з точністю до 0.1 мм. Гентрі управляється гібридними біполярними кроковими двигунами на 36 В постійного струму. У свою чергу, до гентрі прикріплені кріплення для піпетки та кріплення подовжувача. Вони рухаються вздовж осі z, щоб розмістити піпетки та захват у точних місцях для виконання протоколу. Рух уздовж цієї осі контролюється гібридними біполярними кроковими двигунами 36 В постійного струму. Електроніка, що міститься в порталі, забезпечує живлення 36 В постійного струму та зв’язок із дозаторами та захватом, коли вони прикріплені.
Портальний

Кріплення для піпеток

Кріплення розширення

Розташування кріплень інструментів на Flex.

Сенсорні та світлодіодні дисплеї
Основним інтерфейсом користувача є 7-дюймовий сенсорний РК-екран, розташований у передній правій частині робота. Сенсорний екран покритий Gorilla Glass 3 для захисту від подряпин і пошкоджень. Отримайте доступ до багатьох функцій Flex прямо на сенсорному екрані, зокрема:

OPENTRONS FLEX

51

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Керування протоколом Налаштування, виконання та моніторинг протоколу Керування лабораторним програмним забезпеченням Параметри робота Оновлення програмного та мікропрограмного забезпечення системи Журнали операцій і повідомлення про помилки
Щоб отримати додаткові відомості про використання Flex через сенсорний екран, див.
Індикатор стану — це світлодіодна смужка вздовж верхньої передньої частини робота, яка надає швидку інформацію про робота. Різні кольори та шаблони підсвічування можуть повідомляти про різні стани успіху, невдачі чи простою:

Колір світлодіода Білий Нейтральні стани
Зелений Нормальні стани
Синій Обов'язкові стани Жовтий Аномальні стани Червоний Надзвичайні стани

Світлодіодний шаблон Постійно пульсує
Двічі моргає
Суцільно пульсує Пульсує

Статус робота
Робот увімкнено та не виконує протокол. Робот зайнятий (наприклад, оновленням програмного забезпечення або мікропрограми, налаштуванням запуску протоколу, скасуванням запуску протоколу) Дія завершена (наприклад, протокол збережено, програмне забезпечення оновлено, прилад під’єднано або від’єднано) Протокол запущено Протокол виконано Протокол призупинено

Твердий

Помилка програмного забезпечення

Бморгає тричі, неодноразово

Фізична помилка (наприклад, збій приладу)

Індикатор стану також можна вимкнути в налаштуваннях робота.

52

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
3.2 Піпетки
Піпетки Opentrons — це конфігуровані пристрої, які використовуються для переміщення рідин по всій робочій зоні під час виконання протоколів. Існує кілька піпеток Opentrons Flex, які можуть обробляти об’єми від 1 мкл до 1000 мкл в 1, 8 або 96 каналах:
1-канальна піпетка Opentrons Flex (1 мкл) 50-канальна піпетка Opentrons Flex (1 мкл) 5-канальна піпетка Opentrons Flex (1000 мкл) 8-канальна піпетка Opentrons Flex (1 мкл) 50-канальна піпетка Opentrons Flex (8 мкл)
Піпетки прикріплюються до гентрі за допомогою фіксуючих гвинтів на передній частині дозатора. 1-канальна та 8-канальна піпетки займають одне кріплення для піпетки (ліворуч або праворуч); 96-канальна піпетка займає обидва кріплення. Докладніше про встановлення піпеток див. у розділі Встановлення приладу та калібрування.

Закріплене прикріплення
гвинти

Невипадаючі кріпильні гвинти

Ежектор

Насадки (змінні ущільнювальні кільця)

Насадки (фіксовані ущільнювальні кільця)

Розташування компонентів 1-, 8- і 96-канальних піпеток.

Ежектор

OPENTRONS FLEX

53

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Піпетки беруть одноразові пластикові наконечники, натискаючи їх на сопла піпетки, а потім використовують наконечники для аспірації та дозування рідини. Загальна сила, необхідна для підхоплення, збільшується, оскільки одночасно підхоплюється більше наконечників. Для меншої кількості наконечників піпетка приєднує наконечники, штовхаючи кожне сопло піпетки вниз у наконечник. Щоб досягти необхідної сили для збору повної стійки наконечників, 96-канальна піпетка також тягне наконечники вгору на сопла. Ця дія витягування вимагає розміщення стійки для наконечників у адаптер стійки для наконечників, а не безпосередньо в гніздо деки. Щоб викинути наконечники (або повернути їх у штатив), механізм виштовхування піпетки відштовхує наконечники від сопел.

Характеристики піпетки
Піпетки Opentrons Flex розроблені для обробки широкого діапазону об’ємів. Завдяки широкому асортименту вони можуть використовувати різні розміри наконечників, що впливає на їхні характеристики обробки рідиною. Компанія Opentrons протестувала піпетки Flex на точність і точність у низці комбінацій наконечників і об’єму рідини:

Піпетка
Flex 1-канальний
50 мкл
Flex 1-канальний
1000 мкл
Flex 8-канальний
50 мкл
Flex 8-канальний
1000 мкл

Ємність наконечника 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл

Випробуваний об’єм 1 мкл 10 мкл 50 мкл 5 мкл 50 мкл
200 мкл 1000 мкл
1 мкл 10 мкл 50 мкл 5 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл

Точність %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%

Точність %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%

54

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Flex 96-канальний
1000 мкл

50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл

5 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Пам’ятайте про цю точність, вибираючи наконечники для піпетки. Загалом, для досягнення найкращих результатів слід використовувати найменші наконечники, які відповідають потребам вашого протоколу.

Примітка: Opentrons проводить об’ємне тестування піпеток Flex, щоб переконатися, що вони відповідають вимогам точності та точності, наведеним вище. Вам не потрібно калібрувати об’єм, який дозують ваші піпетки перед використанням. Вам потрібно лише виконати позиційне калібрування. Подробиці див. у наступному розділі, а також у розділі «Встановлення піпетки» глави «Встановлення та переміщення».
Послуги Opentrons Care і Opentrons Care Plus включають щорічну заміну піпетки та сертифікати калібрування. Додаткову інформацію див. у розділі «Обслуговування Flex» у розділі «Технічне обслуговування та обслуговування».

Калібрування піпетки
У набір користувача входить калібрувальний зонд металевої піпетки, який ви використовуєте під час позиційного калібрування. Під час виконання протоколу безпечно зберігайте зонд на магнітному тримачі на передній стійці робота. Під час процесу калібрування приєднайте зонд до відповідної насадки та зафіксуйте його на місці. Робот переміщує зонд до точок калібрування на палубі, щоб виміряти точне положення піпетки.
Адаптер стійки для наконечників піпетки
96-канальна піпетка Opentrons Flex постачається з чотирма адаптерами для наконечників. Це точно сформовані алюмінієві кронштейни, які ви розміщуєте на палубі. Адаптери містять підставки для наконечників Flex 50 л, 200 л і 1000 мкл.

OPENTRONS FLEX

55

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
Через прикладене зусилля 96-канальна піпетка потребує адаптера, щоб належним чином приєднати повний штатив для наконечників. Під час процедури приєднання піпетка переміщається над адаптером, опускається на кріпильні штифти та натягує наконечники на піпетки, піднімаючи адаптер і підставку для наконечників. Витягування наконечників, а не штовхання, забезпечує важіль, необхідний для закріплення наконечників на піпетках і запобігає викривленню поверхні деки. Після завершення 96-канальна піпетка опускає адаптер і порожню підставку для наконечників на деку. Додаткову інформацію див. у розділі «Поради та підставки для наконечників» у розділі «Лабораторне забезпечення».
Часткове підбирання наконечників
96-канальна піпетка може забрати повну стійку наконечників або меншу кількість наконечників. Це збільшує кількість застосувань, які можна виконати за допомогою 96-канальної дозатора, оскільки він займає обидва кріплення для дозатора.
Наразі 96-канальна піпетка підтримує часткове захоплення наконечників для 8 наконечників у схемі колонки. У цій конфігурації дозатор використовує свої крайні ліві сопла, щоб забирати наконечники справа наліво від підставки для наконечників, або крайні праві насадки, щоб забирати наконечники зліва направо з підставки для наконечників.
Якщо ви берете менше ніж 96 наконечників із підставки для наконечників, її слід розміщувати безпосередньо на деці, а не в адаптері підставки для наконечників.
Піпеткові датчики
Піпетки Opentrons Flex мають ряд датчиків, які виявляють і записують дані про стан піпетки та будь-які наконечники, які вона зібрала.
ДАТЧИКИ ЄМНОСТІ
У поєднанні з металевим зондом або провідним наконечником датчики ємності виявляють, коли піпетка контактує з чимось. Виявлення контакту між металевим зондом і декою використовується в процесах автоматизованого калібрування піпетки та калібрування модуля.
1-канальні піпетки мають один ємнісний датчик, а багатоканальні два: на каналах 1 і 8 у 8-канальних піпеток і на каналах 1 і 96 (позиції A1 і H12) у 96-канальних.

56

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

ОПТИЧНІ ДАТЧИКИ НАЯВНОСТІ
Перемикач фотопереривника визначає положення механізму виштовхування наконечників піпетки, підтверджуючи, чи було успішно піднято чи впущено наконечник. 1-канальні, 8-канальні та 96-канальні піпетки мають єдиний оптичний датчик, який контролює кріплення наконечників по всіх каналах.
Оновлення прошивки піпетки
Opentrons Flex автоматично оновлює мікропрограму піпетки, щоб підтримувати її в синхронізації з версією програмного забезпечення робота. Оновлення мікропрограми піпетки зазвичай швидке та відбувається щоразу, коли:
Приєднуєте піпетку. Робот перезавантажується.
Якщо з будь-якої причини версії мікропрограми піпетки та програмного забезпечення робота не синхронізуються, ви можете вручну оновити мікропрограму в додатку Opentrons.
1. Натисніть «Пристрої». 2. Натисніть свій Flex у списку пристроїв. 3. У розділі «Інструменти та модулі» розсинхронізована піпетка покаже попереджувальний банер
«Доступне оновлення мікропрограми». Натисніть Оновити зараз, щоб почати оновлення.
Ви можете view поточну встановлену версію мікропрограми будь-якої підключеної піпетки. На сенсорному екрані перейдіть до інструментів і торкніться назви піпетки. У додатку Opentrons знайдіть картку піпетки в розділі «Інструменти та модулі», клацніть меню з трьома крапками (), а потім клацніть «Про піпетку».

3.3 Захват
Захват переміщує лабораторне приладдя по робочій зоні та stagпід час оформлення протоколів. Захват кріпиться до кріплення подовжувача, яке є окремим від кріплень піпетки; захват можна використовувати з будь-якою конфігурацією піпетки. Докладніше про встановлення захвату див. у розділі Встановлення та калібрування приладу.
Захват може переміщувати лабораторне обладнання по палубі, на модулі або з них. Захоплювач може маніпулювати певними пластинами для лунок із повністю закритою стінкою, пластинами з глибокими лунками та стійками для наконечників. Для отримання додаткової інформації про те, яке лабораторне обладнання може переміщати захоплення, перегляньте розділ Labware і Opentrons Flex Gripper у розділі Labware або зверніться до Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

57

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Характеристики захоплення
Щелепи виконують основний рух захвату, який полягає у відкриванні або закриванні двох паралельних лопатей для застосування або зняття сили з боків лабораторного посуду. Рух губок контролюється щітковим двигуном на 36 В постійного струму, з’єднаним із зубчастою рейкою.
Щоб перемістити шматок лабораторного посуду, який був захоплений губками, портал піднімає захват уздовж осі z, переміщує його вбік, а потім опускає в нове положення лабораторного посуду.
Розташування компонентів захвату.

Кріпильні гвинти
Калібрувальний штифт Jaws Paddles

Калібрування захвату
Захват містить металевий калібрувальний штифт. Калібрувальний штифт розташований у ніші для зберігання в нижній частині захвату. Магніт утримує шпильку на місці. Щоб вийняти калібрувальний штифт, візьміть його пальцями й обережно потягніть. Щоб замінити штифт, вставте його назад у слот для зберігання. Ви дізнаєтеся, що він безпечний, коли він стане на місце.
Під час калібрування захвату прикріпіть штифт до кожної щелепи по черзі. Робот переміщує штифт до точок калібрування на палубі, щоб виміряти точне положення захвату.
Під час виконання протоколу помістіть пін-код у зону зберігання для безпечного зберігання. Зв’яжіться з нами за адресою support@opentrons.com, якщо ви загубите калібрувальний штифт.

Оновлення мікропрограми Gripper
Opentrons Flex автоматично оновлює прошивку захвату, щоб синхронізувати її з версією програмного забезпечення робота. Оновлення мікропрограми Gripper зазвичай відбувається швидко та відбувається щоразу, коли:

58

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
Ви прикріплюєте захват. Робот перезавантажується.
Якщо з будь-якої причини ваш захват і версії програмного забезпечення робота не синхронізуються, ви можете вручну оновити мікропрограму в додатку Opentrons.
1. Натисніть «Пристрої». 2. Натисніть свій Flex у списку пристроїв. 3. У розділі «Інструменти та модулі» несинхронізований захват покаже попереджувальний банер
«Доступне оновлення мікропрограми». Натисніть Оновити зараз, щоб почати оновлення.
Ви можете view поточну встановлену версію мікропрограми захвату. На сенсорному екрані перейдіть до інструментів і торкніться ручки. У додатку Opentrons знайдіть картку захвату в розділі «Інструменти та модулі», клацніть меню з трьома крапками (), а потім натисніть «Про захват».
3.4 Кулон аварійної зупинки
Підвіска аварійної зупинки (E-stop) — це спеціальна апаратна кнопка для швидкої зупинки руху робота. Opentrons Flex вимагає постійного прикріплення функціонального, відключеного E-stop. Коли ви натискаєте кнопку зупинки, Flex якнайшвидше скасовує будь-який запущений протокол або робочий процес налаштування та запобігає більшості рухів робота.
Коли використовувати E-stop
Вам може знадобитися натиснути E-stop:
Коли існує неминучий ризик травми або шкоди користувачеві. Коли існує неминучий ризик пошкодження робота чи іншого обладнання. Коли сampфайли або реагенти знаходяться під загрозою зараження. Після апаратного зіткнення.
В ідеалі вам ніколи не доведеться натискати кнопку E-stop (за винятком рідкісних перевірок якості апаратного забезпечення).
Не використовуйте E-stop для скасування звичайних очікуваних операцій. Замість цього використовуйте програмну кнопку на сенсорному екрані або в додатку Opentrons. Пауза за допомогою програмного забезпечення дозволить вам відновити або скасувати свій протокол, тоді як натискання кнопки E-stop завжди негайно скасовує протокол.

OPENTRONS FLEX

59

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Вмикання та відпускання E-stop
E-stop має механізм натискання для зачеплення, обертання для відпускання.
Зачеплення: сильно натисніть на червону кнопку. Flex перейде в зупинений стан. Вирішення: після зупинки безпечно вирішуйте будь-які проблеми в робочій зоні, наприклад, видалення розливів,
видалення лабораторного обладнання або переміщення порталу (він повинен рухатися вільно та легко вручну). Відпускання: поверніть кнопку за годинниковою стрілкою. Він підніметься до свого роз’єднаного положення. Скидання: на сенсорному екрані або в додатку Opentrons підтвердьте, що ви готові до відновлення Flex
руху. Портал повернеться у вихідне положення, і робота модуля відновиться.
У зупиненому стані Flex і підключене обладнання поводитимуться таким чином:

Апаратні портальні піпетки
Захват
Модуль нагрівача-шейкера
Модуль температури Модуль термоциклера Індикатор стану Сенсорний екран

Поведінка
Автоматичний горизонтальний рух зупинено. Допускається горизонтальний рух вручну.
Вертикальний рух піпеток припинено. Гальма двигуна на вертикальних осях задіяні для запобігання
піпетки від падіння. Рух поршня та підйом наконечника зупинено.
Вертикальний рух захвату припинено. Гальмо двигуна на вертикальній осі включено, щоб запобігти
захоплення від падіння. Двигуни щелепи, які стискають силу, залишаються ввімкненими, тому
захоплення не впустить лабораторне обладнання, яке воно може носити.
Шейкер зупиняється і повертається додому. Відкривається засувка лабораторного обладнання. Опалення відключено.
Нагрівання або охолодження вимкнено.
Нагрівання або охолодження вимкнено.
Світло стає червоним.
На екрані з’являється повідомлення про скасування. Індикатор на екрані показує, коли ви успішно це зробили
відключив кнопку зупинки.

60

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
3.5 Підключення

Перемикач увімк./вимк

Бічні чохли

Порти USB-A

Вхід живлення IEC

Порти AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Підключення живлення
Opentrons Flex підключається до джерела живлення через стандартний вхід IEC-C14. Робот містить внутрішнє повнодіапазонне джерело живлення змінного/постійного струму, яке приймає 100 В змінного струму, 240/50 Гц і перетворює його на 60 В постійного струму. Вся інша внутрішня електроніка живиться від джерела постійного струму 36 В.

Попередження: використовуйте лише шнур живлення, що постачається разом із роботом. Не використовуйте шнур живлення з недостатньою силою струму або потужністюtage рейтинги.
Тримайте шнур живлення вільним від перешкод, щоб ви могли від’єднати його за потреби.

Існує також батарея типу CR1220 для живлення годинника реального часу робота, коли він не підключений до електромережі. Батарея розташована всередині сенсорного корпусу. Якщо ви вважаєте, що батарею потрібно замінити, зверніться до служби підтримки Opentrons для отримання додаткової інформації.

OPENTRONS FLEX

61

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ
USB і допоміжні з'єднання
Opentrons Flex має 10 USB-портів, розташованих у різних областях робота, які служать різним цілям.
8 задніх портів USB-A (пронумеровані від USB-1 до USB-8) і 2 допоміжні порти (роз’єми M12 під номерами AUX-1 і AUX-2) призначені для підключення модулів і аксесуарів Opentrons. Перегляньте розділ «Модулі», щоб дізнатися більше про підключення цих пристроїв і їх використання у ваших протоколах. Задній порт USB-B призначений для підключення робота до ноутбука або настільного комп’ютера для встановлення зв’язку з додатком Opentrons, який працює на підключеному комп’ютері. Передній порт USB-A (USB-9), розташований під сенсорним дисплеєм, має ті ж функції, що й задні порти USB-A.
Примітка. Потужність USB-портів обмежена для захисту робота та підключених пристроїв. Подача живлення внутрішньо розділена на три групи портів: ліві задні порти USB-A (USB-1 - USB-4), праві задні порти USB-A (USB-5 - USB-8) і передній USB-A порт. Кожна з цих груп подаватиме максимум 500 мА на підключені пристрої, сумісні з USB 2.0.
Мережеві підключення
Opentrons Flex може підключатися до локальної мережі через дротове (Ethernet) або бездротове (Wi-Fi) з’єднання.
Порт Ethernet розташований на задній панелі робота. Підключіть його до концентратора Ethernet або увімкніть мережу. Або, починаючи з версії роботизованої системи 7.1.0, підключіть її безпосередньо до порту Ethernet на вашому комп’ютері. Внутрішній модуль Wi-Fi підтримує мережі 802.11 ac/a/b/g/n з дводіапазонною антеною 2.4/5 ГГц.

62

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

3.6 Специфікації системи

Загальні характеристики

Розміри Вага Слоти колоди
Сенсорний екран
Wi-Fi Ethernet USB
Потужність Camera Robot
Об'єм мережі живленняtage коливання Коливання частоти мережі живлення Система розподілу Струм живлення короткого замикання Склад рами Склад вікон Вимоги до вентиляції

87 × 69 × 84 см / 34.25 × 27 × 33 дюймів (Ш, Г, В)
88.5 кг / 195 фунтів 12 ANSI/SLAS-сумісних слотів у робочій зоні
(доступні для піпеток) 4 додаткові слоти для stagпідказки та лабораторне обладнання
(доступно лише для захоплення) 7-дюймовий РК-сенсорний екран зі стійким до подряпин і пошкоджень Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n дводіапазонний (2.4/5 ГГц)
100 Мбіт/с 9 портів USB-A 1 порт USB-B Швидкість USB 2.0
2 МП, фото та відео 100 В змінного струму, 240 Гц, 50 60 A/1 В змінного струму, 4.0 A/115 В змінного струму
±10%
±5%
TN-S
6.3 А
Жорстка конструкція зі сталі та алюмінію з ЧПК
Знімні полікарбонатні бічні вікна та передні двері Між блоком і стіною щонайменше 20 см / 8

OPENTRONS FLEX

63

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Вимоги до підключеного ПК

Програма Opentrons працює на: Windows 10 або новішій версії macOS 10.10 або новішій версії Ubuntu 12.04 або новішій версії

Екологічні характеристики

Умови навколишнього середовища Температура навколишнього середовища Відносна вологість Ступінь забруднення

Лише для використання в приміщенні від +20 до +25 °C (рекомендовано) 40%, без утворення конденсату (рекомендовано) 60 (тільки неелектропровідне забруднення)

Додаткову інформацію про прийнятні умови навколишнього середовища для використання та транспортування див. у розділі «Умови навколишнього середовища» глави «Встановлення та переміщення».

Сертифікати

Сертифікації завершено Не сертифіковано/підтверджено

CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP

Коротку інформацію про сертифікацію надруковано на наклейці на задній панелі Flex, біля вимикача. Щоб отримати детальну інформацію про сертифікацію та відповідність, див. розділ «Відповідність нормативним вимогам» у Вступі.

Серійний номер
Кожен Flex має унікальний серійний номер. Формат серійного номера надає додаткову інформацію, зокрема дату виробництва робота. наприкладample, серійний номер FLXA1020231007001 вказуватиме:

64

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 3: ОПИС СИСТЕМИ

Символи FLX A10 2023 10 07 001

Категорія Модель Версія Рік Місяць День Одиниця

Значення Робот є Opentrons Flex. Код для робочої версії робота. Робот виготовлений у 2023 році. Робот зроблений у жовтні. Робот був виготовлений на 7 число місяця. Унікальний номер для роботів, зроблених у певний день.

Ви можете знайти серійний номер свого Flex:
На сертифікаційній наклейці на задній панелі Flex, біля вимикача. Зі зворотного боку тачскрін (у бік робочої зони). У додатку Opentrons у розділі «Пристрої» > «Flex» > «Налаштування робота» > «Додатково».

OPENTRONS FLEX

65

РОЗДІЛ 4
Модулі
Opentrons Flex інтегрується з низкою апаратних модулів Opentrons. Усі модулі є периферійними пристроями, які займають слоти на деках, і більшістю з них керує робот через USB-з’єднання.
У цьому розділі описано функції та фізичні характеристики модулів, сумісних із системою Opentrons Flex, а також способи їх підключення та калібрування. Щоб отримати додаткові відомості про налаштування та використання модуля, зверніться до посібників для окремих модулів. Докладніше про інтеграцію модулів у ваші протоколи див. у розділі «Протокол-конструктор» у розділі «Розробка протоколу» або в онлайн-документації Python Protocol API.
4.1 Підтримувані модулі
Opentrons Flex сумісний із чотирма типами вбудованих модулів Opentrons:
Модуль Heater-Shaker забезпечує нагрівання на палубі та орбітальне струшування. Модуль можна нагрівати до 95 °C і струшуватиampвід 200 до 3000 об/хв.
Магнітний блок — це пасивний пристрій, який утримує лабораторне обладнання поблизу високоміцних неодимових магнітів. Магнітні модулі OT-2 GEN1 і GEN2, які активно переміщують свої магніти вгору та вниз відносно лабораторного обладнання, не підтримуються на Opentrons Flex.
Температурний модуль — це модуль гарячої та холодної плити, здатний підтримувати постійну температуру від 4 до 95 °C.
Модуль Thermocycler забезпечує повністю автоматизований термоцикл на палубі, забезпечуючи автоматизацію етапів робочого процесу вгорі та внизу. Термоциклер GEN2 повністю сумісний із захватом. Thermocycler GEN1 не можна використовувати з захватом, і тому він не підтримується Opentrons Flex.
Деякі модулі, спочатку розроблені для OT-2, сумісні з Flex, як підсумовано в таблиці нижче. Позначка вказує на сумісність, а X вказує на несумісність.

66

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ

Тип і покоління пристрою Модуль нагрівача-шейкера GEN1 Магнітний модуль GEN1 Магнітний модуль GEN2 Магнітний блок GEN1 Температурний модуль GEN1 Температурний модуль GEN2 Модуль термоциклера GEN1 Модуль термоциклера GEN2 Модуль HEPA

ОТ-2

Flex

×

×

×

×

×

×

4.2 Модульна система кедді
Сумісні модулі призначені для розміщення в кедді, які займають простір під палубою. Ця система дозволяє лабораторному обладнанню на верхній частині модулів залишатися ближче до поверхні палуби, а також дозволяє прокладати кабелі під палубою, щоб палуба залишалася акуратною під час виконання протоколу.

Підставки для модулів нагрівача-шейкера, температури та термоциклера.

OPENTRONS FLEX

67

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
Щоб встановити модуль на поверхню палуби, його потрібно спочатку помістити у відповідну коробку модуля. Кожен тип сумісного модуля має власну конструкцію кедді, яка точно вирівнює модуль і лабораторне обладнання з навколишньою палубою. (Винятком є ​​магнітний блок, який не потребує прокладки кабелю живлення або кабелю USB і, таким чином, розташований безпосередньо на поверхні палуби.) Кеди для модулів, які займають один слот, можна розмістити будь-де в колонці 1 або 3; Thermocycler можна встановлювати лише в слоти A1 і B1 одночасно.
Загалом, щоб встановити модуль Caddy:
1. Видаліть будь-які слоти колоди з місця, куди буде встановлено модуль. 2. Встановіть модуль у тримач і затягніть його анкери. 3. Протягніть кабель живлення модуля та кабель USB через бічні кришки вгору через порожній слот на деці та
приєднайте їх до модуля. 4. Встановіть модульну коробку в гніздо та прикрутіть її на місце.
Для отримання точних інструкцій зі встановлення зверніться до короткого посібника або інструкції з експлуатації конкретного модуля. Кабельні з’єднання та спосіб кріплення до кедді залежать від модуля.
4.3 Калібрування модуля
Коли ви вперше встановлюєте модуль на Flex, вам потрібно запустити автоматичне позиційне калібрування. Цей процес подібний до позиційного калібрування для інструментів і гарантує, що Flex переміщується в точні правильні місця для оптимальної роботи протоколу. Під час калібрування Flex переміститься до місць на адаптері калібрування модуля, який виглядає подібно до калібрувальних квадратів, які є частиною слотів знімної деки.

Калібрувальні адаптери для модулів нагрівача-шейкера, температури та термоциклера.
Калібрування модуля необхідне для всіх модулів, які встановлюються через caddy: модулі нагрівача-шейкера, температури та термоциклера. Магнітний блок не потребує калібрування та готовий до використання, як тільки ви покладете його на колоду.

68

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
Коли калібрувати модулі
Flex автоматично запропонує вам виконати калібрування, коли ви підключаєте та вмикаєте модуль, який не має збережених даних калібрування. (Ви можете відхилити цей запит, але ви не зможете запускати протоколи з модулем, доки не відкалібруєте його.)
Після завершення калібрування Flex зберігає дані калібрування та серійний номер модуля для подальшого використання. Flex не запропонує виконати повторне калібрування, якщо ви не видалите дані калібрування для цього модуля в налаштуваннях робота. Ви можете вільно вмикати та вимикати свій модуль або навіть переміщувати його в інший слот без необхідності повторного калібрування. Якщо ви хочете повторно відкалібрувати, ви можете почати процес у будь-який час із картки модуля в додатку Opentrons. (Повторне калібрування недоступне на сенсорному екрані.)
Як відкалібрувати модулі
Інструкції на сенсорному екрані або в додатку Opentrons допоможуть вам виконати процедуру калібрування. Загалом кроки такі:
1. Зберіть необхідне обладнання, включно з адаптером для калібрування модуля та зондом для калібрування піпетки. 2. Помістіть калібрувальний адаптер на поверхню модуля та переконайтеся, що він повністю вирівняний.
Для деяких модулів може знадобитися прикріпити адаптер до модуля. 3. Приєднайте калібрувальний зонд до піпетки. 4. Flex автоматично переміститься до певних точок калібрувального адаптера та збереже їх
значення калібрування для майбутнього використання.
Після завершення калібрування та видалення адаптера та зонда модуль буде готовий до використання в протоколах.
Ви можете в будь-який час view і керуйте своїми даними калібрування модуля в додатку Opentrons. Перейдіть до налаштувань робота для свого Flex і натисніть на вкладку Калібрування.

OPENTRONS FLEX

69

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
4.4 Модуль нагрівача-шейкера GEN1

Функції нагрівача-шейкера
НАГРІВАННЯ ТА СТРУШУВАННЯ
Нагрівач-шейкер забезпечує нагрівання на палубі та орбітальне струшування. Модуль можна нагрівати до 95 °C з наступною температуроюfile:
Температурний діапазон: 37 °C Точність температури: ±95 °C при 0.5 °C Однорідність температури: ±55 °C при 0.5 °CRamp швидкість: 10 °C/хв
Модуль може трясти sampвід 200 до 3000 обертів на хвилину, з наступним струшуванням проfile:
Орбітальний діаметр: 2.0 мм Орбітальний напрямок: за годинниковою стрілкою Діапазон швидкості: 200 об/хв Точність швидкості: ±3000 об/хв
Модуль має засувку лабораторного обладнання з живленням для кріплення пластин до модуля перед струшуванням.

70

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
ТЕРМОАДАПТЕРИ Для додавання лабораторного обладнання до нагрівача-шейкера потрібен сумісний термоадаптер. Адаптери можна придбати безпосередньо в Opentrons за адресою https://shop.opentrons.com. Наразі доступні термоадаптери включають:

Універсальний плоский адаптер

ПЛР-адаптер

Перехідник для глибокої свердловини

96 Перехідник з плоским дном

ПРОГРАМНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Heater-Shaker повністю програмується в Protocol Designer та Python Protocol API. API Python додатково дозволяє виконувати інші кроки протоколу паралельно, поки Heater-Shaker активний. Перегляньте розділ «Неблокуючі команди» в документації API, щоб дізнатися більше про додавання паралельних кроків до ваших протоколів.
Крім протоколів, програма Opentrons може відображати поточний стан нагрівача-шейкера та безпосередньо керувати нагрівачем, шейкером і засувкою лабораторного обладнання.

OPENTRONS FLEX

71

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ

Технічні характеристики нагрівача-шейкера

Розміри Вага Вхідна потужність модуля Вхід адаптера живлення Мережа живлення обtage флуктуація Overvoltage Споживання електроенергії

152 × 90 × 82 мм (Д/Ш/В) 1.34 кг 36 В постійного струму, 6.1 A 100 В змінного струму, 240/50 Гц ±60% Категорія II в режимі очікування: 10 Вт

Типова: струшування: 4 Вт Нагрівання: 11 Вт Нагрівання та струшування: 10 Вт

Умови навколишнього середовища Температура навколишнього середовища Відносна вологість Висота Ступінь забруднення

Максимум: 125 Вт Лише для використання в приміщенні 130 °C До 20%, без конденсації До 25 м над рівнем моря 80

72

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
4.5 Магнітний блок GEN1

Особливості магнітного блоку
Opentrons Magnetic Block GEN1 — це магнітний тримач для 96-лункових планшетів. Магнітні блоки використовуються в протоколах, які покладаються на магнетизм, щоб витягувати частинки із суспензії та утримувати їх у лункових планшетах під час промивання, промивання чи інших процедур елюювання. наприкладample, автоматизована підготовка NGS; очищення геномної та мітохондріальної ДНК, РНК або білків; та інші процедури вилучення є випадками використання, які можуть включати магнітні блоки.
МАГНІТНІ КОМПОНЕНТИ
Магнітний блок не живиться, не містить електронних компонентів і не переміщує магнітні кульки вгору або вниз у розчині. Лунки складаються з 96 високоміцних неодимових кільцевих магнітів, закріплених на пружинному ліжку, що допомагає підтримувати допуски між блоком і піпетками під час виконання автоматизованих протоколів.
ПРОГРАМНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Магнітний блок GEN1 повністю програмується в Protocol Designer та Python Protocol API.

OPENTRONS FLEX

73

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ

Однак поза межами протоколів сенсорний екран і додаток Opentrons не знають і не можуть відобразити поточний статус магнітного блоку GEN1. Це модуль без живлення. Він не містить електронних або механічних компонентів, які можуть спілкуватися з роботом Flex. Ви «керуєте» магнітним блоком за допомогою протоколів, які використовують Opentrons Flex Gripper для додавання та видалення лабораторного обладнання з цього модуля.

Технічні характеристики магнітного блоку

Розміри Вага Потужність модуля Рівень магніту Умови навколишнього середовища Температура навколишнього середовища Відносна вологість Висота Ступінь забруднення

136 × 94 × 45 мм (Д/Ш/В) 1.13 кг Немає, модуль не живиться, неодим N52 Лише для використання в приміщенні 20 °C 25%, без конденсації До 30 м над рівнем моря 80

74

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
4.6 Температурний модуль GEN2

Функції температурного модуля
ОПАЛІВ ТА ОХОЛОДЖЕННЯ
Температурний модуль Opentrons GEN2 — це модуль гарячої та холодної пластини. Він часто використовується в протоколах, які вимагають нагрівання, охолодження або зміни температури. Модуль може досягати та підтримувати температуру в діапазоні від 4 °C до 95 °C протягом декількох хвилин, залежно від конфігурації модуля та вмісту.
ТЕРМОБЛОКИ
Для підтримки температури лабораторного посуду в модулі використовуються алюмінієві термоблоки. Модуль поставляється з термоблоками на 24 і 96 лунок. Кедді з температурним модулем постачається з блоком із глибоким колодязем і блоком з плоским дном, розробленим для використання з Flex Gripper. Блоки містять пробірки на 1.5 мл та 2.0 мл, 96-лункові планшети для ПЛР, стрипи для ПЛР, планшети з глибокими лунками та планшети з плоским дном.

OPENTRONS FLEX

75

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
Примітка: модуль також постачається з плоским нижнім блоком для OT-2. Не використовуйте блок OT-2 з Flex. Плаский нижній блок для Flex має напис «Opentrons Flex» на верхній поверхні. Для ОТ-2 немає.

24-лунковий термоблок

96-лунковий термоблок

Глибокий колодязний термоблок

Термоблок з плоским дном для Flex

ВОДЯНІ БАНІ ТА ГРІВАННЯ
Оскільки повітря є хорошим теплоізолятором, проміжки між лабораторним обладнанням і термоблоком можуть впливати на температурні характеристики температурного модуля. Додавання невеликої кількості води в 24- або 96-лункові термоблоки усуває повітряні проміжки та покращує ефективність обігріву. Ідеальна кількість води залежить від термоблока та лабораторного обладнання. Подальші рекомендації дивіться в документі Температурний модуль.

ПРОГРАМНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Температурний модуль повністю програмується в Protocol Designer і Python Protocol API.
За межами протоколів додаток Opentrons може відображати поточний статус температурного модуля та безпосередньо контролювати температуру поверхні пластини.

76

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ

Характеристики температурного модуля

Розміри Вага Потужність модуля
Умови навколишнього середовища Температура навколишнього середовища Відносна вологість Висота Ступінь забруднення

194 × 90 × 84 мм (Д/Ш/В) 1.5 кг Вхід: 100 В змінного струму, 240/50 Гц, 60 А Вихід: 4.0 В постійного струму, 36 А, 6.1 Вт макс. Лише для використання в приміщенні <219.6 °C (рекомендовано для оптимального охолодження) ) До 22%, без конденсації До 60 м над рівнем моря 2000

4.7 Модуль термоциклера GEN2

OPENTRONS FLEX

77

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ
Характеристики термоциклера
Модуль Opentrons Thermocycler Module GEN2 — це повністю автоматизований бортовий термоциклер, який забезпечує ПЛР без рук у форматі 96-лункового планшета. Його кришка з підігрівом і одноразовий ущільнювач щільно прилягають до пластини, забезпечуючи ефективну роботуample нагрівання та мінімальне випаровування.
НАГРІВ ТА ОХОЛОДЖЕННЯ Блок Thermocycler може нагрівати та охолоджувати, а його кришка може нагріватися за таких температурних параметрів:file: Діапазон температур термоблока: 4 °C Максимальний нагрів термоблока ramp швидкість: 4.25 °C/с від навколишнього середовища GEN2 до 95 °C Максимальне охолодження термоблока ramp швидкість: 2.0 °C/с від 95 °C до температури навколишнього середовища Діапазон температур кришки: 37 °C Точність температури кришки: ±110 °C Автоматичну кришку можна відкривати або закривати за потреби під час виконання протоколу.
ТЕРМОЦИКЛЕР ПРОFILES Thermocycler може виконувати проfiles: автоматичне перемикання через послідовність блочних температур для виконання термочутливих реакцій.
ГУМОВІ АВТОМАТИЧНІ УЩІЛЬНЕННЯ Thermocycler постачається з гумовими автоматичними ущільненнями, які допомагають зменшити випаровування. Кожна пломба повинна бути стерилізована перед використанням і може бути використана для кількох циклів. Додаткові пломби можна придбати безпосередньо в Opentrons за адресою https://shop.opentrons.com.
КЕРУВАННЯ ПРОГРАМНИМ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯМ Thermocycler можна повністю програмувати в Protocol Designer та Python Protocol API. За межами протоколів додаток Opentrons може відображати поточний стан Thermocycler і безпосередньо контролювати температуру блоку, температуру кришки та положення кришки.

78

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 4: МОДУЛІ

Технічні характеристики термоциклера

Розміри (кришка відкрита) Розміри (кришка закрита) Вага (включаючи задній канал) Об’єм адаптера живленняtage Перевищення струму адаптера живленняtage Умови навколишнього середовища Температура навколишнього середовища Відносна вологість Висота над рівнем моря Вимоги до вентиляції

244.95 × 172 × 310.1 мм (Д/Ш/В) 244.95 × 172 × 170.35 мм (Д/Ш/В) 8.4 кг 100 В при 240/50 Гц 60 A Категорія II Лише для використання в приміщенні 8.5 °C (ідеально); 5 °C (прийнятно) 20%, без конденсації До 25 м над рівнем моря Між пристроєм і стіною щонайменше 2 см / 40

OPENTRONS FLEX

79

РОЗДІЛ 5
лабораторне обладнання
У цьому розділі розглядаються елементи бібліотеки Opentrons Labware, які можна використовувати з Opentrons Flex і Opentrons Flex Gripper. Він також охоплює спеціальне лабораторне програмне забезпечення та, для наших досвідчених користувачів, пов’язує компоненти лабораторного програмного забезпечення з їхнім відповідним JSON file визначення.
Ви можете придбати лабораторне обладнання у виробників оригінального обладнання або в магазині Opentrons за адресою https://shop.opentrons.com. Крім того, Opentrons постійно працює над перевіркою нових визначень лабораторного обладнання. Перегляньте Labware Library (за посиланням вище) для отримання останніх списків.
5.1 Поняття лабораторного обладнання
Лабораторне забезпечення охоплює більше, ніж просто об’єкти, розміщені на колоді та використані в протоколі. Щоб допомогти вам зрозуміти лабораторне забезпечення Opentrons, давайте розглянемо цю тему з трьох різних точок зору. Для Opentrons Flex лабораторне обладнання включає в себе елементи в нашій бібліотеці лабораторного обладнання, дані, які визначають кожну частину лабораторного обладнання, і спеціальне лабораторне обладнання.
Лабораторне забезпечення як обладнання
Бібліотека Labware містить усе, що можна використовувати за замовчуванням із Opentrons Flex. Це довговічні компоненти та витратні матеріали, з якими ви працюєте, повторно використовуєте або викидаєте під час виконання протоколу. Щоб працювати з елементами бібліотеки Labware, вам не потрібно виконувати жодних особливих дій. Робот Flex вміє автоматично працювати з усім у бібліотеці.
Лабораторне обладнання як дані
Інформація про лабораторне забезпечення зберігається в нотації об’єктів Javascript (JSON) files з .json file розширення. JSON file містить просторові розміри (довжину, ширину, висоту), об’ємну ємність (л, мл) та інші показники, які визначають особливості поверхні, їх форми та розташування. Під час запуску протоколу Flex читає ці .json files знати, яке лабораторне обладнання знаходиться на палубі та як з ним працювати.

80

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Лабораторне обладнання на замовлення
Спеціальне лабораторне програмне забезпечення – це лабораторне програмне забезпечення, яке не входить до бібліотеки лабораторного програмного забезпечення, або є лабораторним програмним забезпеченням, створеним Творцем спеціального лабораторного програмного забезпечення. Однак іноді ідея спеціального лабораторного обладнання обтяжується поняттями складності, витрат або труднощів. Але нестандартне лабораторне обладнання не повинно бути складним для розуміння або створення. Давайте трохи розкриємо концепцію спеціального лабораторного обладнання.
Як колишнійampБібліотека лабораторного програмного забезпечення Opentrons включає 96-лункові планшети (200 л) від Corning і BioRad, але інші виробники також виготовляють ці лункові планшети. І, завдяки загальноприйнятим галузевим стандартам, відмінності між цими всюдисущими лабораторними предметами незначні. Однак звичайний 200-лунковий планшет об’ємом 96 л від Stellar Scientific, Oxford Lab або Krackeler Scientific (або будь-якого іншого постачальника) є «спеціальним лабораторним обладнанням» для Flex, оскільки воно не визначено заздалегідь у нашій бібліотеці лабораторного обладнання. . Крім того, незначні відмінності в розмірах лабораторного обладнання можуть суттєво вплинути на успіх виконання вашого протоколу. З цієї причини важливо мати точне визначення лабораторного обладнання для кожного лабораторного обладнання, яке ви хочете використовувати у своєму протоколі.
Крім того, незважаючи на те, що спеціальний лабораторний посуд може бути езотеричним, одноразовим набором, здебільшого це просто наконечники, пластини, пробірки та стійки, які щодня використовуються в лабораторіях по всьому світу. Знову ж таки, єдина відмінність між лабораторним програмним забезпеченням Opentrons і спеціальним лабораторним програмним забезпеченням полягає в тому, що новий елемент не визначено заздалегідь у програмному забезпеченні, яке працює на роботі. Flex може працювати й працює з іншими елементами базового лабораторного програмного забезпечення чи чимось унікальним, але вам потрібно записати характеристики цього елемента у визначенні лабораторного програмного забезпечення JSON file та імпортуйте ці дані в додаток Opentrons. Для отримання додаткової інформації перегляньте розділ «Визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення» нижче.
Підсумовуючи, лабораторне обладнання включає:
Усе в Opentrons Labware Library. Визначення лабораторного програмного забезпечення: дані в JSON file що визначає форми, розміри та можливості окремих елементів
як-от пластини для лунок, наконечники, резервуари тощо. Спеціальне лабораторне обладнання, яке не входить до бібліотеки лабораторного обладнання.
Після повторногоviewРозглянувши ці важливі поняття, давайте розглянемо категорії та елементи бібліотеки Opentrons Labware. Після цього ми завершимо розділview компонентів даних лабораторного обладнання file і підсумуйте функції та послуги Opentrons, які допомагають вам створювати власне лабораторне обладнання.

OPENTRONS FLEX

81

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

5.2 Водойми
Opentrons Flex за замовчуванням працює з одно- та багатолунковими резервуарами, переліченими нижче. Використання цих резервуарів допомагає зменшити навантаження на підготовчу роботу, оскільки вони готові до автоматизації прямо з коробки. Інформація про резервуар також доступна в Opentrons Labware Library.

Односвердловинні водойми

Технічні характеристики виробника

Agilent

290 мл V дно

Оксиген

90 мл з плоским дном

ГНІЗДО

195 мл з плоским дном

290 мл V дно

Назва завантаження API
agilient_1_ резервуар_290мл
кисень_1_ резервуар_90мл
гніздо_1_ резервуар_195мл
гніздо_1_ резервуар_290мл

Багатосвердловинні резервуари

Технічні характеристики виробника

ГНІЗДО

12 лунок 15 мл/лунка V дно

США Scientific

12 лунок 22 мл/лунка V дно

Назва завантаження API nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ резервуар_22 мл

82

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Резервуари та визначення API
Бібліотека Opentrons Labware визначає характеристики резервуарів, перерахованих вище, в окремому JSON fileс. Робот і API Opentrons Python покладаються на ці визначення JSON для роботи з лабораторним програмним забезпеченням, яке використовується вашими протоколами. наприкладample, під час роботи з API функція ProtocolContext.load_labware приймає ці назви лабораторних програм як дійсні параметри у вашому коді. Пов’язані назви завантажень API з’єднуються з визначеннями резервуарного лабораторного програмного забезпечення в репозиторії Opentrons GitHub.
Індивідуальне резервуарне лабораторне обладнання
Спробуйте створити спеціальне визначення лабораторного обладнання за допомогою Opentrons Labware Creator, якщо резервуар, який ви хочете використовувати, не вказано тут. Спеціальне визначення поєднує всі розміри, метадані, форми, об’ємну ємність та іншу інформацію в JSON file. Ця інформація потрібна Opentrons Flex, щоб зрозуміти, як працювати з вашим спеціальним лабораторним обладнанням. Додаткову інформацію див. у розділі «Визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення».
5.3 Лункові пластини
Opentrons Flex за замовчуванням працює з планшетами з лунками, переліченими нижче. Використання цих планшетів для лунок допомагає зменшити навантаження на підготовчу роботу, оскільки вони готові до автоматизації прямо з коробки. Інформація про планшет також доступна в Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

83

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

6-лункові планшети
Виробник Corning

Технічні характеристики
6 лунок 16.8 мл/лунка Круглі лунки з плоским дном

Назва завантаження API corning_6_wellplate_16.8ml_flat

12-лункові планшети
Виробник Corning

Технічні характеристики
12 лунок 6.9 мл/лунка Круглі лунки з плоским дном

Назва завантаження API corning_12_wellplate_6.9ml_flat

24-лункові планшети
Виробник Corning

Технічні характеристики
24 лунок 3.4 мл/лунка Круглі лунки з плоским дном

Назва завантаження API corning_24_wellplate_3.4ml_flat

48-лункові планшети
Виробник Corning

Технічні характеристики
48 лунок 1.6 мл/лунка Круглі лунки з плоским дном

Назва завантаження API corning_48_wellplate_1.6ml_flat

84

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

96-лункові планшети
Виробник Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
США Scientific

Технічні характеристики
96 лунок 200 мкл/лунка Круглі лунки, V дно
96 лунок 360 мкл/лунка Круглі лунки, плоске дно
96 лунок 100 мкл/лунка Кругові лунки, V нижня ПЛР повна спідниця
96 лунок 200 мкл/лунка Круглі лунки, плоске дно
96 глибоких лунок 2000 мкл/лунка Квадратні лунки, V дно
Жорсткі 96 лунок 200 мкл/лунка Круглі лунки, V нижня ПЛР повна спідниця
Nunc 96 глибоких лунок 1300 мкл/лунка Круглі лунки, U дно
Nunc 96 глибоких лунок 2000 мкл/лунка Круглі лунки, U дно
96 глибоких лунок 2.4 мл/лунка Квадратні лунки, U дно

Назва завантаження API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ спідниця
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300 мкл thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000 мкл США ascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

OPENTRONS FLEX

85

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

384-лункові планшети

Виробник Applied Biosystems Bio-Rad
Corning

Технічні характеристики
384 лунок 40 мкл/лунка Круглі лунки, V дно
384 лунок 50 мкл/лунка Круглі лунки, V дно
384 лунки 112 мкл/лунка Квадратні лунки, плоске дно

Назва завантаження API applybiosystemsmicroamp_384_ лунковий планшет_40ul biorad_384_лунковий планшет_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Перехідники колодязних пластин
Перелічені нижче алюмінієві пластини є термоадаптерами для модуля Opentrons Heater-Shaker GEN1. Ви можете використовувати ці автономні визначення адаптера для завантаження перевіреного Opentrons або спеціального лабораторного обладнання на поверхню нагрівача-шейкера.

Тип адаптера Opentrons Універсальний плоский адаптер нагрівача-шейкера Opentrons 96 Адаптер нагрівача-шейкера PCR Opentrons 96 Адаптер нагрівача-шейкера з глибокими лунками Opentrons 96 Адаптер нагрівача-шейкера з плоским дном

Назва завантаження API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Ви також можете завантажити як адаптер, так і лабораторне програмне забезпечення з одним визначенням. Наша бібліотека лабораторного обладнання містить кілька попередньо налаштованих термоадаптерів і комбінацій лабораторного обладнання, які роблять нагрівач-шейкер готовим до використання одразу після вилучення.

86

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

Примітка: не використовуйте комбіноване визначення, якщо вам потрібно перемістити лабораторне обладнання на нагрівач-шейкер або з нього під час вашого протоколу за допомогою захвату або вручну. Натомість використовуйте автономне визначення адаптера.

Комбінація адаптер/лабораторне обладнання

Назва завантаження API

Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter with NEST Deep Well Plate 2 мл

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep

Адаптер нагрівача-шейкера Opentrons 96 з плоским дном і лунковим планшетом NEST 96 200 мкл плоский

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat

Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter з лунковим планшетом NEST 100 мкл

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt

Універсальний плоский нагрівач-шейкер-адаптер Opentrons з лунковою пластиною Corning 384 112 мкл плоский

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat

Адаптери можна придбати безпосередньо в Opentrons за адресою https://shop.opentrons.com.

Пластини для колодязів і визначення API
Бібліотека Opentrons Labware визначає характеристики лункових планшетів, перераховані вище, в окремому JSON fileс. Робот Flex і Opentrons Python API покладаються на ці визначення JSON для роботи з лабораторним програмним забезпеченням, яке використовується вашими протоколами. наприкладample, під час роботи з API функція ProtocolContext.load_labware приймає ці назви лабораторних програм як дійсні параметри у вашому коді. Пов’язані назви завантажень API з’єднуються з визначеннями лабораторного програмного забезпечення планшетів у репозиторії Opentrons GitHub.

Лабораторне обладнання для лунок на замовлення
Спробуйте скористатися програмою Opentrons Labware Creator, щоб створити спеціальне визначення лабораторного обладнання, якщо планка для лунок, яку ви хотіли б використовувати, не вказана тут. Спеціальне визначення поєднує всі розміри, метадані, форми, об’ємну ємність та іншу інформацію в JSON file. Opentrons Flex зчитує цю інформацію, щоб зрозуміти, як працювати з вашим спеціальним лабораторним обладнанням. Додаткову інформацію див. у розділі Визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення.

OPENTRONS FLEX

87

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

5.4 Наконечники та стійки для наконечників
Наконечники Opentrons Flex доступні в розмірах 50 мкл, 200 мкл і 1000 мкл. Це прозорі, непровідні поліпропіленові наконечники, доступні з фільтрами або без них. Вони стерильно упаковані в полиці, які містять 96 наконечників і не містять ДНКази, РНКази, протеази, пірогенів, ДНК людини, ендотоксинів та інгібіторів ПЛР. Стелажі також містять номери партій і терміни придатності.
Гнучкі наконечники піпеток працюють з піпетками Opentrons Flex 50 мкл і 1000 мкл в 1-, 8- і 96-канальних конфігураціях. Хоча ви можете встановити будь-які наконечники Flex на піпетки 50 л і 1000 л, спробуйте підібрати наконечник до номінальної ємності піпетки. наприкладample, може бути дивним поставити наконечник об’ємом 1000 л на піпетку об’ємом 50 л. Для піпетки на 1000 л ви, звичайно, можете використовувати наконечник на 50 л, 200 л або 1000 л.

Стійки для наконечників
Нефільтровані та відфільтровані наконечники змонтовані в підставку, яка складається з багаторазової базової пластини, середньої пластини, яка вміщує 96 наконечників, і кришки.

Підставка для наконечників за об’ємом 50 мкл 200 мкл 1000 мкл

Назва завантаження API
Нефільтрований: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Відфільтрований: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Нефільтрований: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Відфільтрований: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Нефільтрований: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Відфільтрований: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

Щоб полегшити ідентифікацію, середні пластини стійки наконечників позначені кольором відповідно до розміру наконечника:
50 мкл: пурпуровий 200 л: жовтий 1000 мкл: синій

88

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

Під час замовлення або повторного замовлення наконечники та стійки поставляються в двох різних упакованих конфігураціях:
Решітки: складаються з окремо загорнутих в термоусадочну упаковку решіток для наконечників (основна пластина, середня пластина з наконечниками та кришка). Конфігурації зі стійкою найкраще підходять, коли чистота має першорядне значення, щоб уникнути перехресного забруднення або коли ваші протоколи не дозволяють повторне використання базової пластини чи компонентів.
Заправки: складаються з однієї повної підставки для наконечників (основна пластина, середня пластина з наконечниками та кришка) та окремих контейнерів для наконечників. Конфігурації заправки найкращі, якщо ваші протоколи дозволяють повторне використання базової пластини або компонента.
Сумісність з наконечниками
Гнучкі наконечники піпеток призначені для піпеток Opentrons Flex. Гнучкі наконечники не сумісні з піпетками Opentrons OT-2, а також не можна використовувати наконечники OT-2 на піпетках Flex.
Інші стандартні наконечники можуть працювати з піпетками Flex, але це не рекомендується. Щоб забезпечити оптимальну продуктивність, ви повинні використовувати лише наконечники Opentrons Flex із піпетками Flex.
Наконечник стійки адаптер
До 96-канальної піпетки потрібен адаптер, щоб належним чином прикріпити повну стійку наконечників. Під час процедури прикріплення піпетка рухається над адаптером, опускається на кріпильні штифти та натягує наконечники на піпетки, піднімаючи адаптер і підставку для наконечників.

OPENTRONS FLEX

89

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

Примітка. Використовуйте адаптер підставки для наконечників, лише коли збираєте повну підставку наконечників одночасно. Якщо збираєте менше чайових, розмістіть підставки для чайових безпосередньо на колоді.
Попередження: небезпека защемлення. Тримайте руки подалі від адаптера підставки для наконечників, поки дозатор приєднує наконечники.

Тип адаптера Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter

Назва завантаження API opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Адаптер стійки для наконечників сумісний із Opentrons Flex Gripper. Ви можете використовувати захват, щоб поставити свіжі підставки для наконечників на адаптер або забрати та перемістити використані підставки для наконечників у жолоб для відходів.

5.5 Пробірки та штативи для пробірок

Система Opentrons 4-in-1 Tube Rack працює з Opentrons Flex за замовчуванням. Використання штатива для пробірок 4-в-1 допомагає зменшити навантаження на підготовчу роботу, оскільки комбінації, які він надає, готові до автоматизації прямо з коробки. Більше інформації також доступно в Opentrons Labware Library.

90

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Комбінації труб і рейки
Стійка для труб Opentrons 4-в-1 підтримує різні розміри трубок, окремо або в різних комбінаціях розмірів (об’ємів). До них входять: штатив із 6 пробірками для пробірок об’ємом 50 мл (6 x 50 мл). Комбінований штатив із 10 пробірками для чотирьох пробірок по 50 мл і шести пробірок по 15 мл (4 x 50 мл, 6 x 15 мл). Штатив для 15 пробірок на 15 мл (15 x 15 мл). Штатив на 24 пробірки для пробірок об’ємом 0.5 мл, 1.5 мл або 2 мл (24 x 0.5 мл, 1.5 мл, 2 мл).
Примітка: якщо не вказано інше, усі трубки мають форму циліндра з V-подібним (конічним) дном.

6-трубні стійки
Тип трубки 6 Falcon 50 мл 6 NEST 50 мл
10-трубні стійки
Тип трубки 4 Falcon 50 мл 6 Falcon 15 мл 4 NEST 50 мл 6 NEST 15 мл

Назва завантаження API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

OPENTRONS FLEX

91

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

15-трубні стійки
Тип трубки 15 Falcon 15 мл 15 NEST 15 мл

Назва завантаження API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

24-трубні стійки

Тип труби
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 мл 24 Eppendorf Safe-Lock 2 мл, U-подібне дно 24 універсальний 2 мл кришка, що загвинчується 24 NEST 0.5 мл кришка, що закручується 24 NEST 1.5 мл кришка, що закручується 24 NEST 1.5 мл кришка, що закручується 24 NEST 2 мл кришка, що закручується 24 Кришка NEST 2 мл, U-подібне дно

Назва завантаження API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

Визначення API стійки для труб
Бібліотека Opentrons Labware визначає характеристики стелажів для трубок, перелічені вище, в окремому JSON fileс. Робот Flex і Opentrons Python API покладаються на ці визначення JSON для роботи з лабораторним програмним забезпеченням, яке використовується вашими протоколами. наприкладample, під час роботи з API функція ProtocolContext.load_labware приймає ці назви лабораторних програм як дійсні параметри у вашому коді. Пов’язані назви завантажень API з’єднуються з визначеннями лабораторного програмного забезпечення трубної стійки в репозиторії Opentrons GitHub.

92

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Спеціальна стійка для пробірок лабораторне обладнання
Спробуйте створити спеціальне визначення лабораторного обладнання за допомогою Opentrons Labware Creator, якщо комбінації трубки та стійки, яку ви бажаєте використати, немає тут у списку. Спеціальне визначення поєднує всі розміри, метадані, форми, об’ємну ємність та іншу інформацію в JSON file. Opentrons Flex зчитує цю інформацію, щоб зрозуміти, як працювати з вашим спеціальним лабораторним обладнанням. Додаткову інформацію див. у розділі «Визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення».
5.6 Алюмінієві блоки
Алюмінієві блоки постачаються з модулем температури GEN2 і можуть бути придбані окремо як набір із трьох частин. Набір включає планшет з плоским дном, 24-лунковий блок і 96-лунковий блок.
Opentrons Flex використовує алюмінієві блоки для утримання sampпробірки та пластини з лунками на температурному модулі або безпосередньо на палубі. При використанні з температурним модулем алюмінієві блоки можуть зберегти вашу температуруample пробірки, ПЛР-смужки або планшети при постійній температурі від 4 °C до 95 °C.
Плата з плоским дном
Плоскодонна пластина для Flex постачається з тримачем температурного модуля та сумісна з різними стандартними пластинами ANSI/SLAS. Ця плоска тарілка відрізняється від тарілки, яка постачається з самим температурним модулем або окремим набором із трьох частин. Він має ширшу робочу поверхню та скошені кутові затискачі. Ці функції допомагають покращити продуктивність Opentrons Flex Gripper під час переміщення лабораторного обладнання на пластину або з неї.
Ви можете визначити, яка пластина з плоским дном у вас є, тому що пластина для Flex має напис «Opentrons Flex» на верхній поверхні. Для ОТ-2 немає.

OPENTRONS FLEX

93

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

24-лунковий алюмінієвий блок
24-лунковий блок використовується з індивідуальними sampле флакони. наприкладample, він приймає sample флакони, які:
Мають V-подібне або U-подібне дно. Закріпіть вміст кришкою-засувкою або кришкою, що закручується. Зберігайте рідину в ємності 0.5 мл, 1.5 мл і 2 мл.

96-лунковий алюмінієвий блок
96-лунковий блок підтримує широкий спектр типів лункових планшетів. наприкладample, він добре приймає пластини, які:
Від великих виробників планшетів, таких як Bio-Rad і NEST.
Розроблено з V-подібним дном, U-подібним дном або плоским дном.
Розроблено з лунками об’ємом 100 мкл або 200 мкл.
Він також сумісний із загальними ПЛР-смужками.

Автономні адаптери
Термоблок Планшет з плоским дном Flex 24-лунковий алюмінієвий блок 96-лунковий алюмінієвий блок

Назва завантаження API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Дивіться комбінації лабораторного обладнання нижче. opentrons_96_well_aluminium_block

Комбінації лабораторного обладнання з алюмінієвих блоків
Бібліотека лабораторного програмного забезпечення Opentrons підтримує наступні комбінації блоків, флаконів і лункових планшетів, які також визначені в окремому визначенні лабораторного програмного забезпечення JSON fileс. Робот Flex і Opentrons Python API

94

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
покладайтеся на ці визначення JSON для роботи з лабораторним програмним забезпеченням, яке використовується вашими протоколами. наприкладample, під час роботи з API функція ProtocolContext.load_labware приймає ці назви лабораторних програм як дійсні параметри у вашому коді. У таблицях нижче наведено комбінації блоків/контейнерів за замовчуванням і відповідні імена завантажень API. Посилання підключаються до відповідних визначень JSON у репозиторії Opentrons GitHub.
Примітка: усі пробірки мають V-подібне дно, якщо не вказано інше.

24-лункові алюмінієві блокові комбінації лабораторного обладнання

Вміст 24-лункового блоку Generic 2 мл, що загвинчується, NEST, 0.5 мл, закручується, NEST, 1.5 мл, закручується, NEST, 1.5 мл, закручується, NEST, 2 мл, закручується, U-подібне дно

Назва завантаження API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml _screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_snapcap

96-лункові алюмінієві блокові комбінації лабораторного обладнання

Вміст 96-лункового блоку Лунковий планшет Bio-Rad 200 мкл Generic PCR strip 200 мкл Лунковий планшет NEST 100 мкл

Назва завантаження API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL

OPENTRONS FLEX

95

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

5.7 Лабораторне обладнання та Opentrons Flex Gripper
Хоча Opentrons Flex працює з усім інвентарем у Labware Library, Opentrons Flex Gripper сумісний лише з окремими елементами лабораторного обладнання. Наразі Gripper оптимізовано для використання з наступними предметами лабораторного обладнання.

Категорія лабораторного обладнання Планшети з глибокими лунками, 96-лункові планшети з повним покриттям
Стійки для наконечників (нефільтровані та відфільтровані наконечники)

Бренди
Планшет з глибокими лунками NEST 96 2 мл
Opentrons Tough 96-лунковий планшет 200 мкл PCR Full Skirt NEST 96-лунковий планшет 200 мкл плоский
Стійка для наконечників Opentrons Flex 96 50 мкл Стійка для наконечників Opentrons Flex 96 200 мкл Стійка для наконечників Opentrons Flex 96 1000 мкл

Примітка: для досягнення найкращих результатів використовуйте Flex Gripper лише з лабораторним обладнанням, перерахованим вище. Flex Gripper може працювати з іншим лабораторним обладнанням, сумісним з автоматизацією ANSI/SLAS, але це не рекомендується.

5.8 Спеціальні визначення лабораторного обладнання
Як обговорювалося на початку цієї глави, нестандартне лабораторне програмне забезпечення — це лабораторне програмне забезпечення, яке не вказано в бібліотеці лабораторного програмного забезпечення Opentrons. Ви можете використовувати інші звичайні або унікальні елементи лабораторного обладнання з Flex, точно вимірюючи та записуючи характеристики цього об’єкта та зберігаючи ці дані в JSON file. Під час імпортування в програму Flex і API використовують дані JSON для взаємодії з вашим лабораторним обладнанням. Opentrons надає інструменти та послуги, які ми розглянемо нижче, щоб допомогти вам використовувати Flex із спеціальним лабораторним обладнанням.

96

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

Створення настроюваних визначень лабораторного обладнання
Інструменти та послуги Opentrons допомагають зробити індивідуальне лабораторне обладнання доступним для вас. Ці функції відповідають різним рівням кваліфікації та способам роботи. Створення власного лабораторного обладнання та використання його з Opentrons Flex допоможе зробити робота універсальним і потужним доповненням до вашої лабораторії.

КОРИСТУВАЧ ЛАБОРАТОРНОГО ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Custom Labware Creator не містить коду, webінструмент, який використовує графічний інтерфейс, щоб допомогти вам створити визначення лабораторного програмного забезпечення file. Labware Creator створює визначення лабораторного програмного забезпечення JSON file які ви імпортуєте в програму Opentrons. Після цього ваше спеціальне лабораторне забезпечення стане доступним для робота Flex і API Python.

СЕРВІС ЛАБОРАТОРНОГО ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ НА ЗАМОВЛЕННЯ
Зв’яжіться з нами, якщо лабораторне обладнання, яке ви хотіли б використати, недоступне в бібліотеці, якщо ви не можете створити власні визначення або тому, що нестандартний предмет містить різні форми, розміри чи інші відхилення, описані нижче.

Лабораторне програмне забезпечення, яке можна визначити в Labware Creator
; Лунки та пробірки однорідні та ідентичні. ; Усі ряди розташовані рівномірно
(відстань між рядами рівна).
; Усі колонки розташовані рівномірно (відстань між колонками однакова).
; Ідеально поміщається в один слот колоди.

Labware Opentrons має визначити ; Колодки та трубки мають різну форму. ; Ряди розташовані нерівномірно.
; Стовпці розташовані нерівномірно.
; Менше одного слота колоди (потрібен адаптер) або охоплює кілька слотів колоди.

OPENTRONS FLEX

97

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ
Ось кілька схем, які допоможуть вам уявити колишньогоampописані вище. Звичайний Усі стовпці рівномірно розподілені, а всі рядки рівномірно розташовані. Стовпці не обов’язково мають такий же інтервал, як і рядки.
Звичайна Сітка не обов’язково повинна бути в центрі лабораторного обладнання.
Нерегулярні рядки розташовані рівномірно, але стовпці нерівномірно.
Нерегулярні стовпці/ряди розташовані рівномірно, але лунки не ідентичні.
Нерегулярна Існує більше однієї сітки.
Наша команда лабораторного обладнання працюватиме над тим, щоб зрозуміти ваші потреби та розробити для вас індивідуальні визначення лабораторного обладнання. Додаткову інформацію див. у статтях служби підтримки Запит на визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення та у формі запиту спеціального лабораторного програмного забезпечення. Це платна послуга.

98

OPENTRONS FLEX

РОЗДІЛ 5: ЛАБОРАТОРНЕ ЗАБЕЗПЕЧЕННЯ

API PYTHON
Хоча ви не можете створити спеціальне лабораторне програмне забезпечення за допомогою нашого API, ви можете використовувати спеціальне лабораторне програмне забезпечення з доступними методами API. Однак вам потрібно спочатку визначити власне лабораторне обладнання та імпортувати його в додаток Opentrons. Щойно ви додасте своє лабораторне обладнання до програми Opentrons, воно стане доступним для API Python і робота. Щоб отримати додаткові відомості, перегляньте розділ «Визначення спеціального лабораторного програмного забезпечення» документації Python API. Інформацію про написання сценаріїв протоколу за допомогою API див. у розділі Python Protocol API у розділі «Розробка протоколу».
Схема лабораторного забезпечення JSON
JSON file це схема для стандартного та спеціального лабораторного обладнання Opentrons. Це file містить і організовує дані лабораторного обладнання відповідно до специфікацій дизайну, встановлених схемою за замовчуванням.
Схема — це рамка

Документи / Ресурси

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot [pdfІнструкція з експлуатації
FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, FLEX, Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, Flex Open Source Liquid Handling Robot, Open Source Liquid Handling Robot, Source Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, Робот

Список літератури

Залиште коментар

Ваша електронна адреса не буде опублікована. Обов'язкові поля позначені *