Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka FLEX Opentrons Flex
“
Opentrons Flex
Spesifikasi:
- Spesifikasi Umum: Lorem ipsum dolor duduk
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut laboure et dolore magna aliqua. - Spesifikasi Alam Sekitar: Lorem ipsum
dolor duduk amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Pensijilan: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
laboure et dolore magna aliqua. - Nombor Siri: XXX-XXXX-XXXX
Arahan Penggunaan Produk:
1. Pemasangan dan Penentukuran Instrumen:
Ikuti langkah-langkah yang digariskan dalam manual untuk pipet dan pencengkam
pemasangan.
2. Penempatan semula:
Untuk pergerakan pendek, rujuk bahagian 2.5 dalam manual. Untuk
bergerak jarak jauh, ikut garis panduan yang disediakan. Umum bergerak
nasihat juga ada.
3. Sambungan:
Pastikan sambungan kuasa yang betul seperti yang diperincikan dalam manual.
Sambungkan USB dan peranti tambahan mengikut keperluan. Jaringan rangkaian
hendaklah ditubuhkan mengikut arahan.
4. Pereka Protokol:
Fahami keperluan untuk Pereka Protokol dan pelajari caranya
untuk mereka bentuk protokol baharu atau mengubah suai yang sedia ada mengikut makmal anda
keperluan.
5. API Protokol Python:
Terokai menulis dan menjalankan skrip menggunakan Python Protocol API.
Temui ciri eksklusif Python untuk kefungsian yang dipertingkatkan.
6. Protokol OT-2:
Ketahui tentang protokol Python OT-2, protokol JSON OT-2 dan
Protokol Modul Magnetik untuk pelbagai jenis eksperimen.
Soalan Lazim (FAQ):
S: Bagaimanakah saya boleh menyelesaikan masalah jika robot tidak bergerak seperti
dijangka?
A: Periksa sambungan kuasa, pastikan penentukuran yang betul
instrumen, dan sahkan bahawa tiada halangan dalam
laluan robot.
S: Bolehkah saya menggunakan pipet tersuai dengan Opentrons Flex?
J: Opentrons mengesyorkan menggunakan pipet yang serasi untuk optimum
prestasi dan ketepatan.
“`
Opentrons Flex
Manual Arahan
Opentrons Labworks Inc.
Disember 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Nama berdaftar, tanda dagangan, dsb. yang digunakan dalam dokumen ini, walaupun tidak ditandakan secara khusus, tidak boleh dianggap tidak dilindungi oleh undang-undang.
Jadual Kandungan
Mukadimah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktur manual ini. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Nota dan amaran. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Bab 1 Pengenalan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Selamat datang ke Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Apa yang baharu dalam Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Stesen kerja Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Maklumat keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Simbol keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Amaran keselamatan elektrik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Amaran keselamatan tambahan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Amaran keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Keselamatan biologi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Asap toksik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Cecair mudah terbakar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Pematuhan kawal selia. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Keserasian elektromagnet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Amaran dan nota FCC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Pematuhan ISED Kanada. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Amaran alam sekitar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 pensijilan Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Bab 2: Pemasangan dan Penempatan Semula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Keperluan keselamatan dan operasi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Di mana untuk meletakkan Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Penggunaan kuasa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Keadaan persekitaran. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Membuka kotak. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Usaha dan masa yang diperlukan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Peti dan bahan pembungkusan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elemen produk. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Bahagian 1: Keluarkan peti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Bahagian 2: Lepaskan Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Bahagian 3: Perhimpunan akhir dan hidupkan . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Larian pertama . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Hidupkan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Sambung ke rangkaian atau komputer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Pasang kemas kini perisian. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Pasang Loket Berhenti Kecemasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Beri nama robot anda. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Pemasangan dan penentukuran instrumen . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pemasangan pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Pemasangan Gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Penempatan semula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Pergerakan pendek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Pergerakan jarak jauh . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Nasihat bergerak am. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Pemikiran terakhir tentang bergerak. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Bab 3: Penerangan Sistem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Komponen fizikal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Bingkai dan kepungan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Dek dan kawasan kerja. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagkawasan ing. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Lekapan dek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Pelongsor buangan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagslot kawasan ing. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sistem pergerakan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Skrin sentuh dan paparan LED. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Spesifikasi pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Penentukuran pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Penyesuai rak hujung pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pengambilan sebahagian hujung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Penderia pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Kemas kini perisian tegar Pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Penggenggam. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Spesifikasi Gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Penentukuran Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kemas kini perisian tegar Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Loket Berhenti Kecemasan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Bila hendak menggunakan E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Melibatkan dan melepaskan E-stop. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Sambungan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Sambungan kuasa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Sambungan USB dan tambahan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Sambungan rangkaian. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Spesifikasi sistem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Spesifikasi am. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Spesifikasi alam sekitar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Pensijilan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Nombor siri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Bab 4: Modul . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Modul yang disokong . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Sistem kedi modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Penentukuran modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Bila hendak menentukur modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Cara menentukur modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul Pemanas-Gegar GEN1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Ciri Pemanas-Shaker. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Spesifikasi Heater-Shaker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Blok Magnet GEN1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Ciri Blok Magnet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Spesifikasi Blok Magnetik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Modul Suhu GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Ciri-ciri Modul Suhu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Spesifikasi Modul Suhu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modul Termosikal GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Ciri-ciri Termosikal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Spesifikasi termocycler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Bab 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Konsep perisian makmal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware sebagai perkakasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware sebagai data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Perisian makmal tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Takungan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Takungan telaga tunggal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Takungan berbilang perigi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Takungan dan takrifan API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Perisian makmal takungan tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Pinggan perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-plat perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-plat perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-plat perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 plat 48-telaga. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-plat perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-plat perigi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Penyesuai plat perigi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Plat perigi dan definisi API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Perisian makmal plat perigi tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Petua dan rak hujung. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Rak hujung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Keserasian tippipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Penyesuai rak hujung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Tiub dan rak tiub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Gabungan tiub dan rak. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rak 6 tiub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rak 10 tiub. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rak 15 tiub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Rak 24 tiub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Takrifan API rak tiub. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Perisian makmal rak tiub tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Blok aluminium. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Plat bawah rata. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Blok aluminium 24 telaga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Blok aluminium 96 telaga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Penyesuai kendiri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinasi perkakas makmal blok aluminium. . . . . . . . . . . . . . . .94 Gabungan makmal blok aluminium 24 perigi. . . . . . . . .95 Gabungan makmal blok aluminium 96 perigi. . . . . . . . .95 5.7 Labware dan Opentrons Flex Gripper. . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Takrifan perisian makmal tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Mencipta definisi perisian makmal tersuai. . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Skema perisian makmal JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 definisi perisian makmal JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Bab 6: Pembangunan Protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Protokol pra-dibuat. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Perpustakaan Protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Perkhidmatan Pembangunan Protokol Tersuai . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Pereka Protokol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Keperluan Pereka Protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Mereka bentuk protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Mengubah suai protokol sedia ada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API Protokol Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Menulis dan menjalankan skrip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Ciri eksklusif Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Protokol OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 protokol Python OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 protokol JSON OT-2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protokol Modul Magnetik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Bab 7: Perisian dan Operasi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Operasi skrin sentuh. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Papan pemuka robot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Pengurusan protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Butiran protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Jalankan persediaan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Semakan Kedudukan Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Jalankan kemajuan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Selesai larian . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Pengurusan instrumen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Tetapan robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfigurasi dek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Apl Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Pemasangan apl . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Memindahkan protokol kepada Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Status dan kawalan modul . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Protokol terkini dijalankan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Operasi lanjutan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operasi baris perintah melalui SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Bab 8: Penyelenggaraan dan Servis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Membersihkan Flex anda. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Sebelum anda mula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Apa yang anda boleh bersihkan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Penyelesaian pembersihan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Pembersihan bingkai dan panel tingkap . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Pembersihan dek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Pembersihan gantri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pembersihan pelongsor sisa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Membersihkan pipet dan petua . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminasi pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Petua pipet pembersihan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Membersihkan penggenggam . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Modul pembersihan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Pembersihan modul am . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Pengedap termosikal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Perisian makmal selamat autoklaf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Servis Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Perkhidmatan Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kelayakan pemasangan dan kelayakan operasi. . . 155 Penyelenggaraan pencegahan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Waranti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Lampiran A: Glosari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Lampiran B: Dokumentasi Tambahan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Hab Pengetahuan Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentasi API Protokol Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 rujukan Opentrons HTTP API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentasi pembangun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Lampiran C: Perisian Sumber Terbuka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons pada GitHub. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Repositori lain . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Lampiran D: Sokongan dan Maklumat Hubungan . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Jualan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Sokongan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Maklumat perniagaan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Mukadimah
Selamat datang ke manual arahan untuk robot pengendalian cecair Opentrons Flex. Manual ini membimbing anda melalui hampir semua perkara yang anda perlu tahu untuk menyediakan dan menggunakan Flex, memfokuskan pada topik yang paling berkaitan dengan pengguna harian Flex dalam persekitaran makmal.
Struktur manual ini
Opentrons Flex ialah sistem yang kompleks, jadi terdapat banyak laluan berbeza untuk mempelajari semua yang boleh dilakukannya. Jangan ragu untuk terus ke bab yang membincangkan topik yang anda ingin tahu! Untuk exampOleh itu, jika anda sudah mempunyai persediaan Flex dalam makmal anda, anda boleh melangkau melepasi bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
Jika anda lebih suka pendekatan berpandu, manual ini disusun supaya anda boleh mengikutinya dari awal hingga akhir.
Ketahui tentang Flex. Ciri-ciri yang membezakan Flex disenaraikan dalam Bab 1: Pengenalan. Pengenalan juga termasuk maklumat keselamatan dan kawal selia yang penting.
Mulakan dengan Flex. Jika anda perlu menyediakan Flex anda, ikut arahan terperinci dalam Bab 2: Pemasangan dan Penempatan Semula. Kemudian biasakan diri anda dengan komponen Flex dalam Bab 3: Penerangan Sistem.
Sediakan dek anda. Mengkonfigurasi dek membolehkan aplikasi saintifik yang berbeza pada Flex. Bab 4: Modul menerangkan peranti Opentrons yang boleh anda pasang ke dalam atau di atas dek untuk melaksanakan tugas saintifik tertentu. Bab 5: Labware menerangkan cara bekerja dengan peralatan untuk memegang cecair.
Jalankan protokol. Penggunaan teras Flex menjalankan prosedur saintifik piawai, yang dikenali sebagai protokol. Bab 6: Pembangunan Protokol menawarkan beberapa cara untuk mendapatkan protokol siap sedia atau mereka bentuknya sendiri. Untuk menjalankan protokol anda, ikut arahan dalam Bab 7: Perisian dan Operasi, yang juga mempunyai arahan untuk melaksanakan tugas lain dan menyesuaikan tetapan robot anda.
Teruskan Flex berjalan. Ikuti nasihat dalam Bab 8: Penyelenggaraan dan Servis untuk memastikan Flex anda bersih dan berjalan secara optimum. Atau daftar untuk salah satu perkhidmatan Opentrons yang disenaraikan di sana dan biarkan kami menjaga Flex untuk anda.
Ketahui lebih lanjut. Masih perlukan sesuatu yang lain? Rujuk lampiran. Lampiran A: Glosari mentakrifkan istilah berkaitan Flex. Lampiran B: Dokumentasi Tambahan menunjukkan anda kepada lebih banyak sumber untuk produk Opentrons dan menulis kod untuk mengawal Flex.
OPENRONS FLEX
9
PRAKATA
Lampiran C: Perisian Sumber Terbuka menerangkan cara perisian Opentrons dihoskan pada GitHub sebagai sumber untuk kedua-dua pembangun dan bukan pembangun.
Lampiran D: Sokongan dan Maklumat Hubungan menyenaraikan cara untuk berhubung dengan Opentrons jika anda memerlukan bantuan melebihi apa yang disediakan oleh dokumentasi kami.
Nota dan amaran
Sepanjang manual ini, anda akan menemui nota dan blok amaran yang diformat khas. Nota menyediakan maklumat berguna yang mungkin tidak jelas dalam perjalanan biasa menggunakan Flex. Beri perhatian khusus kepada amaran–ia hanya digunakan dalam situasi di mana anda menghadapi risiko kecederaan diri, kerosakan pada peralatan, kehilangan atau kerosakan samples atau reagen, kehilangan data atau bahaya lain. Nota dan amaran kelihatan seperti ini:
Sample Nota: Ini adalah sesuatu yang anda patut tahu, tetapi ia tidak mendatangkan sebarang bahaya.
Sample Amaran: Ini adalah sesuatu yang anda perlu tahu kerana terdapat risiko yang berkaitan dengannya.
10
OPENRONS FLEX
BAB 1
pengenalan
Bab ini memperkenalkan anda kepada ekosistem Opentrons Flex, termasuk reka bentuk sistem keseluruhan dan konfigurasi stesen kerja yang tersedia. Ia juga termasuk maklumat pematuhan dan keselamatan yang penting, yang perlu anda semulaview sebelum menyediakan robot Opentrons Flex anda. Untuk butiran lanjut tentang ciri Opentrons Flex, lihat bab Penerangan Sistem.
1.1 Selamat datang ke Opentrons Flex
Opentrons Flex ialah robot pengendalian cecair yang direka untuk aliran kerja yang tinggi dan rumit. Robot Flex ialah asas sistem modular yang merangkumi pipet, pencengkam labware, lekapan dek, modul atas dek dan perisian makmal — semuanya boleh anda tukar sendiri. Flex direka bentuk dengan skrin sentuh supaya anda boleh bekerja dengannya terus di bangku makmal, atau anda boleh mengawalnya dari seluruh makmal anda dengan Apl Opentrons atau API sumber terbuka kami.
Stesen kerja Flex disertakan dengan semua peralatan — robot, perkakasan dan perisian makmal — yang anda perlukan untuk mula mengautomasikan tugas makmal biasa. Untuk aplikasi lain, Opentrons Flex berjalan pada perisian dan perisian tegar sumber terbuka sepenuhnya, dan merupakan reagen dan perisian makmal agnostik, memberikan anda kawalan ke atas cara anda mereka bentuk dan menjalankan protokol anda.
Apa yang baharu dalam Flex
Opentrons Flex ialah sebahagian daripada siri robot pengendali cecair Opentrons. Pengguna Opentrons Flex mungkin biasa dengan Opentrons OT-2, robot paip peribadi kami. Flex melangkaui keupayaan OT-2 dalam beberapa bidang utama, memberikan daya pemprosesan yang lebih tinggi dan masa berjalan kaki.
Keluaran Pipet Ciri
Kapasiti pipet dan hujung
Penerangan
Pipet fleksibel mempunyai 1, 8, atau 96 saluran. Pipet 96 saluran beroperasi pada 12 kali lebih banyak telaga sekaligus berbanding pipet OT-2 terbesar.
Pipet fleksibel mempunyai julat volum yang lebih besar (1 µL, 50 µL) dan semuanya boleh berfungsi dengan mana-mana volum petua Opentrons Flex. Ini adalah peningkatan berbanding pipet OT-5, yang mempunyai julat yang lebih kecil dan mesti menggunakan petua dengan julat volum yang sepadan.
OPENRONS FLEX
11
BAB 1 PENGENALAN
Gripper Penentukuran automatik Skrin sentuh Modul caddy Koordinat slot dek Sampah boleh alih Saiz dan berat
Opentrons Flex Gripper mengambil dan menggerakkan perisian makmal di sekeliling dek secara automatik, tanpa campur tangan pengguna. Gripper membolehkan aliran kerja yang lebih kompleks dalam satu larian protokol.
Penentukuran kedudukan pipet Flex dan pencengkam adalah automatik sepenuhnya. Tekan satu butang, dan instrumen akan beralih ke titik pemesinan ketepatan pada dek untuk menentukan kedudukan tepatnya, menyimpan data tersebut untuk digunakan dalam protokol anda.
Flex mempunyai antara muka skrin sentuh sendiri yang membolehkan anda mengawalnya secara langsung, selain menggunakan Apl Opentrons. Gunakan skrin sentuh untuk memulakan larian protokol, menyemak status kerja dan menukar tetapan terus pada robot.
Modul fleksibel sesuai dengan kedi yang menempati ruang di bawah dek. Caddies meletakkan peralatan makmal anda lebih dekat dengan permukaan geladak dan membenarkan penghalaan kabel di bawah geladak. Caddies membolehkan lebih banyak konfigurasi modul dan perisian makmal pada dek.
Slot dek pada Flex dinomborkan dengan sistem koordinat (A1D4) yang serupa dengan cara telaga dinomborkan pada perisian makmal.
Tong sampah boleh pergi di beberapa lokasi dek di Flex. Lokasi lalai (slot A3) ialah kedudukan yang disyorkan. Anda juga boleh menggunakan pencengkam untuk membuang sampah ke dalam pelongsor sisa pilihan.
Flex sedikit lebih besar dan lebih berat daripada OT-2. Tugas pemasangan pada Flex memerlukan bantuan rakan kongsi makmal.
Perbandingan terperinci spesifikasi teknikal robot tersedia pada Opentrons webtapak.
Kedua-dua robot Flex dan OT-2 dijalankan pada perisian sumber terbuka kami, dan Apl Opentrons boleh mengawal kedua-dua jenis robot sekaligus. Walaupun protokol OT-2 tidak boleh dijalankan secara langsung pada Flex, ia adalah mudah untuk menyesuaikannya (lihat bahagian Protokol OT-2 dalam bab Pembangunan Protokol untuk mendapatkan butiran).
Stesen kerja fleksibel
Stesen kerja Opentrons Flex termasuk robot Flex, aksesori, pipet dan pencengkam, modul atas dek dan perisian makmal yang diperlukan untuk mengautomasikan aplikasi tertentu. Semua komponen stesen kerja adalah modular. Jika anda perlu menukar aplikasi, anda boleh menambah atau menukar perkakasan Flex lain dan bahan habis pakai yang serasi.
12
OPENRONS FLEX
BAB 1 PENGENALAN
STESEN KERJA NGS
Opentrons Flex NGS Workstation mengautomasikan persediaan perpustakaan NGS. Ia boleh mengautomasikan aliran kerja pra-jujukan menggunakan mana-mana sistem reagen terkemuka, termasuk pemecahan dan tagpersediaan perpustakaan berasaskan mentasi.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja NGS termasuk:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
Dua Pipet 8-Saluran (1 µL dan 50 µL) Pipet 5-Saluran (1000 µL) Sisa Chute Modul Suhu Blok Magnetik Modul Termosikal Kit Labware dengan hujung penapis, tiub mikrosentrifuge, takungan dan plat PCR
STESEN KERJA PCR
Stesen Kerja PCR Opentrons Flex mengautomasikan persediaan PCR dan aliran kerja kitar termos sehingga 96 saatamples. Ia boleh aliquot reagen sejuk dan samples ke dalam plat PCR 96-telaga. Dengan penambahan Modul Thermocycler automatik, gunakan gripper untuk memuatkan plat ke dalam Thermocycler, dan kemudian jalankan program PCR pilihan anda.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja PCR termasuk:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
1-Saluran Pipet (1 µL) dan 50-Saluran Pipet (8 µL) 1-Saluran Pipet (50 µL) Sisa Chute Temperature Modul Kit Labware dengan hujung penapis, tiub mikrosentrifuge, takungan dan plat PCR
OPENRONS FLEX
13
BAB 1 PENGENALAN
STESEN KERJA EKSTRAKSI ASID NUKLEIK
Stesen Kerja Pengekstrakan Asid Nukleik Opentrons Flex mengautomasikan pengasingan dan penulenan DNA/RNA. Ia menggunakan Blok Magnetik untuk pengasingan manik magnet, dan Pemanas-Shaker untuk samplisis dan penggantungan semula manik magnetik.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja Pengekstrakan Asid Nukleik termasuk:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
1-Saluran Pipet (5 µL) dan 1000-Saluran Pipet (8 µL) 5-Saluran Pipet (1000 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Kit Labware dengan hujung penapis, takungan, plat PCR dan plat perigi dalam
TEMPAT KERJA PURIFIKASI PROTEIN MANIK MAGNET
Stesen Kerja Pemurnian Protein Manik Magnetik Flex Opentrons mengautomasikan penulenan protein dan proteomik berskala kecilamppersediaan sehingga 96 saatamples. Ia serasi dengan banyak reagen berasaskan manik magnetik yang popular.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja Pemurnian Protein termasuk:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
1-Saluran Pipet (5 µL) dan 1000-Saluran Pipet (8 µL) 5-Saluran Pipet (1000 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Kit Labware dengan hujung penapis, takungan, plat PCR dan plat perigi dalam
STESEN KERJA PERSEDIAAN FLEX
Stesen Kerja Opentrons Flex Prep mengautomasikan aliran kerja paip mudah. Konfigurasi stesen kerja dengan Pipet 1-Saluran dan 8-Saluran untuk melaksanakan tugas seperti sample pemindahan, sample duplikasi, dan
14
OPENRONS FLEX
BAB 1 PENGENALAN
pengasingan reagen. Konfigurasikan stesen kerja dengan Pipet 96-Saluran untuk melaksanakan pengasingan reagen pemprosesan tinggi dan plat stamping.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja Flex Prep termasuk:
Pilihan konfigurasi pipet: 1-Channel Pipette (5 µL) dan 1000-Channel Pipette (8 µL) 5-Channel Pipette (1000 µL)
Kit Labware dengan petua penapis, tiub microcentrifuge dan takungan
TEMPAT KERJA PERSEDIAAN PLSMID
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation mengautomasikan pengekstrakan plasmid dan aliran kerja penulenan berasaskan manik magnetik. Stesen kerja ini dilengkapi dengan pipet volum tinggi, Modul Pemanas-Shaker, dan Blok Magnetik untuk menampung kebanyakan kimia berasaskan manik.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Plasmid Prep Workstation termasuk:
Gripper 1-Channel Pipette (5 µL) dan 1000-Channel Pipette (8 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Kit Labware dengan hujung penapis, tiub microcentrifuge, takungan, plat PCR dan plat telaga dalam
SYNBIO WORKSTATION
Opentrons Flex SynBio Workstation mengautomasikan pelbagai aliran kerja biologi sintetik seperti sintesis DNA dan pengklonan. Ia menggunakan Blok Magnetik dan Modul Suhu untuk menyokong kebanyakan kimia berasaskan manik. Tambah Modul Thermocycler untuk melakukan inkubasi penutup yang dipanaskan dan amplifikasi.
Sebagai tambahan kepada robot Flex, Stesen Kerja SynBio termasuk:
Pipet 1 Saluran Gripper (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Modul Suhu Blok Magnet
OPENRONS FLEX
15
BAB 1 PENGENALAN
Kit perisian makmal dengan petua biasa dan penapis, tiub mikrosentrifuge, takungan, plat PCR dan plat perigi dalam
1.2 Maklumat keselamatan
Robot pengendalian cecair Opentrons Flex telah direka untuk operasi yang selamat. Rujuk kepada spesifikasi dan garis panduan pematuhan dalam bahagian ini untuk memastikan penggunaan Flex anda dengan selamat. Garis panduan ini meliputi penggunaan selamat sambungan input dan output untuk produk, termasuk sambungan kuasa dan data, serta label amaran yang terdapat pada robot Flex dan perkakasan yang berkaitan. Menggunakan peranti dengan cara selain daripada yang dinyatakan dalam manual ini boleh membahayakan pengguna dan peralatan.
Simbol keselamatan
Pelbagai label pada Flex dan dalam manual ini memberi amaran kepada anda tentang sumber kemungkinan kecederaan atau bahaya.
Simbol
Penerangan
Amaran: Memberi amaran kepada pengguna tentang keadaan yang berpotensi berbahaya. Tindakan yang boleh mengakibatkan kecederaan diri atau kematian.
Awas: Memberi amaran kepada pengguna terhadap Kerosakan pada peralatan. Data hilang atau rosak. Gangguan yang tidak dapat dipulihkan bagi operasi yang dijalankan.
Kejutan elektrik: Mengenal pasti komponen instrumen yang mungkin menimbulkan risiko kejutan elektrik jika instrumen dikendalikan dengan tidak betul.
Permukaan panas: Mengenal pasti komponen instrumen yang menimbulkan risiko kecederaan diri akibat haba/suhu yang tinggi jika instrumen dikendalikan dengan tidak betul.
Titik cubitan: Mengenal pasti komponen instrumen yang boleh menimbulkan risiko kecederaan diri apabila bergerak.
16
OPENRONS FLEX
BAB 1 PENGENALAN
Anda akan menemui label berikut pada Flex:
Label harta intelek Label pematuhan kawal selia (cth, ETL) Label bahaya elektrik Label amaran am Label produk Label titik secubit Vol tinggitage label Label penarafan kuasa
Amaran keselamatan elektrik
Sentiasa patuhi amaran keselamatan elektrik berikut:
Simbol
Penerangan
Palamkan robot ke dalam litar Kelas 1 yang dibumikan. Lihat bahagian Sambungan Kuasa dalam bab Penerangan Sistem.
Jangan sambung (palam masuk), cabut (cabut palam), atau gunakan kabel kuasa AC jika: Kabel terkoyak atau rosak. Kabel, kord, atau bekas lain yang dipasang tercarik atau rosak.
Menggunakan kord kuasa yang rosak boleh menyebabkan bahaya kejutan elektrik yang mengakibatkan kecederaan serius atau kerosakan pada robot.
Jangan gantikan kabel kuasa AC melainkan atas arahan Sokongan Opentrons.
Untuk maklumat lanjut tentang keperluan elektrik, lihat bahagian Penggunaan Kuasa dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
OPENRONS FLEX
17
BAB 1 PENGENALAN
Amaran keselamatan tambahan
Sentiasa patuhi amaran keselamatan tambahan berikut:
Simbol
Penerangan
Opentrons Flex belum disahkan untuk digunakan dengan cecair mudah meletup atau mudah terbakar. Jangan muatkan plat, tiub atau botol yang mengandungi cecair letupan atau mudah terbakar ke dalam robot atau sebaliknya mengendalikan instrumen dengan cecair mudah letupan atau mudah terbakar di dalam kepungan.
Gunakan amalan makmal yang baik dan ikuti langkah berjaga-jaga pengeluar apabila bekerja dengan bahan kimia. Opentrons tidak bertanggungjawab atau bertanggungjawab untuk sebarang kerosakan kerana, atau akibat daripada, penggunaan bahan kimia berbahaya.
Flex mempunyai berat 88.5 kg (195 lbs). Akibatnya, ia memerlukan dua orang untuk mengangkat dan memindahkannya dengan selamat. Lihat bahagian Penempatan Semula dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
Flex hendaklah diletakkan di atas permukaan yang mampu menampung beratnya sebanyak 88.5 kg (195 lbs) dengan luas permukaan yang mencukupi untuk menampung robot serta jarak kelegaan minimumnya (20 cm/8 in). Lihat bahagian Keselamatan dan Keperluan Operasi dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
Flex boleh mengeluarkan getaran semasa beroperasi. Letakkan robot pada permukaan yang kukuh, rata dan kalis air dengan pendakap silang atau sambungan yang dikimpal. Lihat bahagian Keselamatan dan Keperluan Operasi dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
Amaran keselamatan
Untuk membantu melindungi Flex daripada kerosakan, ikut langkah berjaga-jaga ini:
18
OPENRONS FLEX
BAB 1 PENGENALAN
Simbol
Penerangan
Gunakan perisian makmal yang mematuhi ANSI/SLAS atau diluluskan oleh Opentrons. Lihat bab Labware.
Jauhkan bahan menghakis, agen atau bahan yang merosakkan daripada robot.
Keselamatan biologi
Rawat spesimen dan reagen yang mengandungi bahan yang diambil daripada manusia sebagai agen yang berpotensi berjangkit. Opentrons mengesyorkan menggunakan prosedur makmal yang selamat seperti yang dijelaskan dalam Biokeselamatan dalam Makmal Mikrobiologi dan Bioperubatan (BMBL) Edisi Ke-6.
Dalam keadaan biasa, Flex tidak mencipta aerosol yang boleh dikesan daripada cecair sumber. Walau bagaimanapun, dalam keadaan tertentu, adalah mungkin untuk menghasilkan aerosol daripada cecair sumber. Apabila beroperasi dengan cecair sumber tahap biokeselamatan 2 atau lebih tinggi, pertimbangkan untuk mengambil langkah berjaga-jaga terhadap pendedahan aerosol, menurut badan kawal selia tempatan anda. Untuk meminimumkan potensi risiko pendedahan aerosol daripada robot, pastikan anda:
Lakukan penyelenggaraan seperti yang diterangkan dalam bab Penyelenggaraan dan Perkhidmatan. Pasang dan selamatkan semua penutup instrumen, pipet, modul dan perisian makmal dengan betul. Gunakan teknik paip yang betul untuk membantu dalam pengurangan aerosol.
Asap beracun
Jika anda menggunakan pelarut meruap atau bahan toksik, gunakan sistem pengudaraan makmal yang cekap untuk mengeluarkan sebarang wap yang mungkin terhasil.
Cecair mudah terbakar
Flex belum dinilai untuk digunakan dengan cecair mudah terbakar dan tidak boleh digunakan dengan cecair mudah terbakar.
OPENRONS FLEX
19
BAB 1 PENGENALAN
1.3 Pematuhan kawal selia
Opentrons Flex mematuhi semua keperluan terpakai bagi piawaian keselamatan dan elektromagnet berikut.
Keselamatan
ID Peraturan IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Tajuk
Keperluan Keselamatan untuk Peralatan Elektrik untuk Pengukuran, Kawalan dan Penggunaan Makmal Bahagian 1: Keperluan Am
Keperluan khusus untuk peralatan makmal untuk mencampur dan mengacau
Keserasian elektromagnet
ID Peraturan EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Bahagian 15 Subbahagian B Kelas A IC ICES-003
Tajuk
Peralatan Elektrik untuk Pengukuran, Kawalan dan Penggunaan Makmal Keperluan EMC Bahagian 1: Keperluan Am Radiator Tidak Disengajakan
Pengurusan Spektrum dan Gangguan TelekomunikasiMenyebabkan Peralatan Peralatan Teknologi Maklumat Standard (Termasuk Radas Digital)
Amaran dan nota FCC
Amaran: Perubahan atau pengubahsuaian pada unit ini yang tidak diluluskan secara nyata oleh Opentrons boleh membatalkan kuasa pengguna untuk mengendalikan peralatan.
Peranti ini mematuhi Bahagian 15 peraturan FCC. Operasi adalah tertakluk kepada perkara berikut:
20
OPENRONS FLEX
BAB 1 PENGENALAN
Peranti ini mungkin tidak menyebabkan gangguan berbahaya. Peranti ini mesti menerima sebarang gangguan yang diterima, termasuk gangguan yang mungkin menyebabkan yang tidak diingini
operasi.
Nota: Peralatan ini telah diuji dan didapati mematuhi had untuk peranti digital Kelas A, menurut Bahagian 15 peraturan FCC. Had ini direka bentuk untuk memberikan perlindungan yang munasabah terhadap gangguan berbahaya apabila peralatan dikendalikan dalam persekitaran komersial. Peralatan ini menjana, menggunakan, dan boleh memancarkan tenaga frekuensi radio dan, jika tidak dipasang dan digunakan mengikut manual arahan, boleh menyebabkan gangguan berbahaya kepada komunikasi radio. Pengendalian peralatan ini di kawasan kediaman berkemungkinan menyebabkan gangguan yang berbahaya dan dalam hal ini pengguna akan diminta untuk membetulkan gangguan tersebut dengan perbelanjaan mereka sendiri.
Pematuhan ISED Kanada
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Produk ini memenuhi spesifikasi teknikal Inovasi, Sains dan Pembangunan Ekonomi Kanada yang berkenaan.
Le présent produit est conforme aux spécifications techniques applicables d'Innovation, Sciences and Developpement economique Canada.
Amaran alam sekitar
Amaran: Kanser dan Kemudaratan Reproduktif www.P65Warnings.ca.gov
pensijilan Wi-Fi
Modul Wi-Fi telah diperakui untuk digunakan di banyak wilayah:
Amerika Syarikat (FCC): Pengecam FCC UAY-W8997-M1216 Kawasan Ekonomi Eropah (CE): Tiada pengecam awam (pengisytiharan diri) Kanada (IC): Nombor Pengenalan Versi Perkakasan W8997-M1216 Jepun (TELEC): Nombor disahkan 020-170034 India (WPC): Nombor pendaftaran ETA-SD-20191005525 (pengisytiharan diri)
OPENRONS FLEX
21
BAB 2
Pemasangan dan Penempatan Semula
Bab ini menerangkan cara menyediakan makmal anda untuk Opentrons Flex, cara menyediakan robot dan cara mengalihkannya jika perlu. Sebelum mengambil penghantaran Flex anda, pastikan makmal atau kemudahan anda memenuhi semua kriteria dalam bahagian Keperluan Keselamatan dan Operasi. Apabila tiba masanya untuk mengaktifkan dan menjalankan Flex anda, ikut arahan terperinci dalam bahagian Nyah Kotak, Larian Pertama dan Pemasangan Instrumen dan Penentukuran, atau gunakan perkhidmatan Persediaan Sokongan Di Tapak Opentrons. Dan jika anda perlu mengalihkan Flex anda ke lokasi baharu, dekat atau jauh, ikut langkah dalam bahagian Penempatan Semula.
2.1 Keperluan keselamatan dan operasi
Di mana untuk meletakkan Opentrons Flex
Ruang adalah komoditi yang berharga di hampir setiap makmal. Flex anda akan memerlukan sedikit–tetapi tidak terlalu banyak, kerana ia direka untuk dimuatkan pada separuh daripada bangku makmal standard. Pastikan anda mempunyai ruang yang memenuhi kriteria berikut.
Permukaan bangku: Pegun, kukuh, paras, permukaan kalis air. Meja atau bangku dengan roda (walaupun roda berkunci) tidak disyorkan. Flex bergerak pantas dan mempunyai banyak jisim, yang boleh menggoncang atau tidak seimbang meja ringan atau boleh alih.
Menanggung berat: Robot sahaja mempunyai berat 88.5 kg (195 lb) dan hanya boleh diangkat oleh dua orang yang bekerja bersama. Letakkan robot di atas permukaan yang mudah menyokong beratnya serta berat mana-mana modul, perisian makmal, cecair atau peralatan makmal lain untuk digunakan dalam aplikasi anda.
Ruang kendalian: Dimensi asas robot ialah 87 cm W x 69 cm D x 84 cm H (kira-kira 34″ x 27″ x 33″). Flex memerlukan 20 cm (8″) kelegaan sisi dan belakang untuk kabel, sambungan USB dan untuk menghilangkan ekzos daripada modul yang panas dan sejuk.
Amaran: Jangan letakkan sisi atau belakang flush Flex pada dinding.
22
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
84 cm 33″
87 cm 34″
Dimensi asas Opentrons Flex.
69 cm 27″
20 cm 8″
20 cm 8″
20 cm 8″
Atas view Opentrons Flex, menunjukkan kelegaan sisi dan belakang minimum.
OPENRONS FLEX
23
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Penggunaan kuasa
Opentrons Flex harus disambungkan ke alur keluar dinding di atau berhampiran lokasi bangku tempat anda memasangnya. Hanya sambungkan Flex ke litar yang boleh menampung cabutan kuasa maksimumnya:
Kuasa input: 36 VDC, 6.1 A Penggunaan melahu: 30 W Penggunaan biasa: 40 W (semasa protokol dijalankan) Penggunaan maksimum: Anggaran 50 W
Penggunaan kuasa yang tepat bergantung kepada:
Jumlah dan jenis pergerakan yang dilaksanakan semasa protokol. Jumlah masa robot menghabiskan masa melahu. Status lampu pada robot. Berapa banyak instrumen yang dilampirkan.
Ingat untuk mengambil kira elektronik lain yang menggunakan kuasa pada litar yang sama, termasuk modul Flex dengan bekalan kuasa mereka sendiri. Untuk exampOleh itu, Modul Thermocycler mempunyai penggunaan kuasa maksimum (630 W) yang jauh lebih besar daripada robot Flex itu sendiri. Jika perlu, rujuk pengurus kemudahan anda untuk memastikan ia memenuhi keperluan kuasa peralatan anda.
Keadaan persekitaran
Keadaan persekitaran untuk penggunaan yang disyorkan, penggunaan yang boleh diterima dan penyimpanan berbeza-beza:
Disyorkan untuk operasi sistem
Boleh diterima untuk operasi sistem
Suhu persekitaran +20 hingga +25 °C
+2 hingga +40 °C
Kelembapan relatif Ketinggian
40%, tidak terkondensasi
Lebih kurang 500 m dari aras laut
30%, tidak pemeluwapan (di bawah 80 °C)
Sehingga 2000 m dari aras laut
Penyimpanan dan pengangkutan
-10 hingga +60 °C
10%, tidak pemeluwapan (di bawah 85 °C)
Sehingga 2000 m dari aras laut
24
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Opentrons telah mengesahkan prestasi Opentrons Flex dalam keadaan yang disyorkan untuk operasi sistem, dan operasi dalam keadaan tersebut harus memberikan hasil yang optimum. Flex selamat digunakan dalam keadaan yang boleh diterima untuk operasi sistem, tetapi keputusan mungkin berbeza-beza. Jangan hidupkan atau gunakan Flex dalam keadaan di luar had tersebut. Keadaan penyimpanan dan pengangkutan hanya terpakai apabila robot diputuskan sepenuhnya daripada kuasa dan peralatan lain.
2.2 Membuka kotak
tahniah! Opentrons Flex anda telah tiba dan anda telah menyediakan ruang untuknya dalam makmal anda. Mari buka peti raksasa itu, keluarkan robot dan sediakannya untuk operasi. Maklumat dalam bahagian ini menyediakan senarai bahagian dan arahan yang membimbing anda melalui langkah-langkah yang diperlukan untuk mendapatkan Flex dinyahkotak, disediakan dan sedia untuk digunakan. Kami telah membahagikan prosedur persediaan kepada tiga bahagian:
Bahagian 1 meliputi membuka peti. Bahagian 2 meliputi menanggalkan Flex daripada peti dan mengalihkannya ke lokasi pemasangan terakhir. Bahagian 3 merangkumi pemasangan terakhir dan menghidupkan robot untuk kali pertama.
Usaha dan masa yang diperlukan
Anda perlu meminta rakan kongsi makmal untuk membantu dengan proses membuka kotak, mengangkat, mengalih dan memasang. Anda perlu membelanjakan kira-kira 30 minit hingga satu jam untuk usaha ini.
Nota: Flex memerlukan dua orang untuk mengangkatnya dengan betul. Selain itu, mengangkat dan membawa Flex dengan pemegangnya ialah cara terbaik untuk menggerakkan robot.
Peti dan bahan pembungkusan
Membongkar Flex memberikan anda robot yang hebat, tetapi anda juga ditinggalkan dengan beberapa panel peti besar bersama-sama dengan pelbagai komponen penghantaran dan pelapik. Walaupun anda boleh membuang bahan ini, kami menggalakkan anda menyimpan item ini jika ruang simpanan tersedia. Pembungkusan boleh diguna semula, yang membantu menyediakan Flex anda untuk penghantaran jika anda perlu menghantarnya ke tempat lain (cth, ke persidangan atau kemudahan baharu) pada masa hadapan.
OPENRONS FLEX
25
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Elemen produk
Flex dihantar dengan komponen yang disenaraikan di bawah. Pipet, pencengkam dan modul datang dalam pembungkusan berasingan daripada peti Flex utama, walaupun anda membelinya bersama-sama sebagai stesen kerja.
(1) Robot Opentrons Flex
(1) Kabel USB
(1) Kabel kuasa
(1) Kabel Ethernet
(5) Kekunci L (hex 12 mm, hex 1.5 mm, hex 2.5 mm, hex 3 mm,
T10 Torx)
(1) Loket Berhenti Kecemasan
(1) Slot dek dengan klip perisian makmal
(4) Klip alat makmal ganti
(1) Probe penentukuran pipet
(4) Membawa pemegang dan topi
(1) Panel tetingkap atas
(4) Panel tingkap sisi
(1) Pemutar skru hex 2.5 mm
(1) sepana 19 mm
(16 + alat ganti) Skru tingkap (kepala rata M4x8 mm)
26
(10) Skru slot dek ganti (kepala soket M4x10 mm)
(12) Skru klip geladak ganti (kepala soket M3x6 mm)
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Bahagian 1: Keluarkan peti
Opentrons menghantar Flex anda dalam peti papan lapis yang kukuh. Peti perkapalan menggunakan cangkuk dan selak clamps untuk mengikat panel atas, sisi dan bawah bersama-sama. Menggunakan selak, bukannya paku atau skru, bermakna anda tidak memerlukan palang (atau banyak daya) untuk membuka peti, dan anda boleh memasangnya semula kemudian, jika perlu.
Nota: Tepi peti boleh menjadi kasar semasa penghantaran. Anda mungkin mahu menggunakan sarung tangan kerja untuk melindungi tangan anda daripada serpihan kayu.
Untuk melepaskan selak, balikkan tab selak ke atas dan pusingkannya ke kiri (lawan arah jam). Tindakan ini menggerakkan clamp lengan keluar daripada kurungan penahan yang sepadan. Anda kemudian boleh flip lengan selak dari peti.
1 Buka kunci lapan selak yang menahan bahagian atas ke sisi.
2 Tanggalkan panel atas selepas melepaskan selak.
OPENRONS FLEX
27
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA 3 Potong beg penghantaran berwarna biru, keluarkan barang-barang ini daripada padding, dan ketepikan:
Kabel Kuasa Kit Pengguna, Ethernet dan USB Loket Berhenti Kecemasan
4 Tanggalkan bahagian atas pelapik buih untuk mendedahkan panel tingkap. Pelapik melindungi panel sisi dan atas.
5 Keluarkan panel tingkap dan ketepikannya. Anda akan melampirkan ini kemudian.
28
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
6 Buka kunci baki 16 selak yang menahan panel sisi antara satu sama lain dan pangkal peti. 7 Keluarkan panel sisi dan ketepikannya.
Bahagian 2: Lepaskan Flex
Selepas melengkapkan langkah dalam Bahagian 1, anda kini sepatutnya melihat robot yang berada dalam beg pelindung dan dilekatkan pada komponen pelekap keluli oren. Beg itu menutup robot dan melindunginya dari persekitaran luar. Kurungan keluli mengikat robot ke bahagian bawah peti. Dua bingkai perkapalan menyokong robot, mengagihkan beratnya secara sama rata, dan memastikan ia tegar supaya ia tidak melengkung semasa penghantaran. Teruskan membongkar Flex dan mengeluarkannya dari pangkalan peti.
8 Menggunakan sepana 19 mm dari Kit Pengguna, tanggalkan kurungan dari bahagian bawah peti. Anda boleh membuang kurungan, atau menyimpannya untuk kegunaan masa hadapan.
OPENRONS FLEX
29
BAB 2: PEMASANGAN DAN LOKASI SEMULA 9 Tarik atau gulung beg penghantaran ke bawah untuk mendedahkan keseluruhan robot.
10 Dengan bantuan daripada rakan makmal anda, ambil pegangan dalam bingkai penghantaran berwarna jingga di kedua-dua belah tapak robot, angkat Flex dari pangkalan peti dan letakkannya di atas lantai. Simpan atau buang pangkalan peti dan bingkai penghantaran.
30
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA 11 Menggunakan kekunci L hex 12 mm dari Kit Pengguna, tanggalkan empat bolt yang menahan bingkai penghantaran ke
yang Flex. Simpan atau buang bingkai dan bolt.
12 Tanggalkan empat pemegang aluminium daripada Kit Pengguna. Skru pemegang ke lokasi yang sama yang memegang bolt bingkai penghantaran 12 mm.
OPENRONS FLEX
31
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
13 Dengan bantuan daripada rakan makmal anda, angkat Flex dengan pemegang pembawanya dan alihkannya ke meja kerja untuk pemasangan akhir.
Bahagian 3: Perhimpunan akhir dan hidupkan
Selepas mengalihkan Flex ke kawasan kerja sementara, atau rumah tetapnya, sudah tiba masanya untuk meletakkan sentuhan akhir pada robot baharu anda.
14 Jika anda telah mengalihkan robot ke lokasi terakhir yang berfungsi, tanggalkan pemegang pembawa dan gantikannya dengan penutup kemasan. Penutup menutup bukaan pemegang dalam bingkai dan memberikan robot rupa yang bersih. Kembalikan pemegang ke Kit Pengguna untuk penyimpanan.
32
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
15 Dapatkan semula panel atas dan sisi daripada buih pembungkus yang anda ketepikan selepas mengeluarkan bahagian atas peti.
16 Pasangkan panel tingkap pada Flex dengan mengikut maklumat pelabelan pada filem pelindung hadapan. Kemudian keluarkan filem pelindung.
17 Menggunakan skru tingkap serong dan pemutar skru 2.5 mm daripada Kit Pengguna, pasangkan panel tingkap pada Flex. Pastikan lubang serong (berbentuk V) pada panel tingkap menghadap ke luar (ke arah anda). Ini membolehkan skru muat siram dengan permukaan tingkap.
Amaran: Mengorientasikan panel secara salah boleh menyebabkan kerosakan. Tork skru yang berlebihan boleh memecahkan panel. Kencangkan skru dengan tangan sehingga panel tingkap cukup selamat. Ini bukan percubaan kekuatan.
OPENRONS FLEX
33
BAB 2: PEMASANGAN DAN LOKASI SEMULA 18 Menggunakan pemutar skru 2.5 mm daripada Kit Pengguna, keluarkan skru pengunci daripada gantri. Ini
skru menghalang gantri daripada bergerak semasa dalam transit. Skru pengunci gantri terletak: Pada rel sebelah kiri berhampiran hadapan robot. Di bawah lengan gantri menegak. Pada rel sebelah kanan berhampiran hadapan robot dalam kurungan oren. Terdapat dua skru di sini.
Gantri bergerak dengan mudah dengan tangan selepas menanggalkan semua skru penghantaran. 19 Potong dan tanggalkan dua gelang getah yang menahan tong sampah di tempatnya semasa penghantaran.
34
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
20 Pasangkan kord kuasa ke Flex dan pasangkannya ke alur keluar dinding. Pastikan kawasan geladak bebas daripada halangan. Pusingkan suis kuasa di sebelah kiri belakang robot. Setelah dihidupkan, gantri bergerak ke lokasi rumahnya dan skrin sentuh memaparkan arahan konfigurasi tambahan.
Memandangkan Flex anda sudah berada di luar kotak dan sedia untuk digunakan, teruskan ke bahagian Larian Pertama di bawah.
2.3 Larian pertama
Lakukan persediaan asas pada skrin sentuh sebelum menyambungkan sebarang perkakasan lain ke Flex anda. Robot akan membimbing anda melalui penyambungan ke rangkaian makmal anda, mengemas kini kepada perisian terkini dan memperibadikan Flex dengan memberikannya nama.
Hidupkan kuasa
Apabila anda menghidupkan Flex, logo Opentrons akan muncul pada skrin sentuh. Selepas beberapa saat, ia akan menunjukkan skrin "Selamat Datang ke Opentrons Flex anda".
Skrin alu-aluan Opentrons Flex. Anda seharusnya hanya melihat skrin ini apabila anda memulakan Flex anda buat kali pertama.
OPENRONS FLEX
35
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Sambung ke rangkaian atau komputer
Ikut gesaan pada skrin sentuh untuk menyambungkan robot anda supaya ia boleh menyemak kemas kini perisian dan menerima protokol files. Terdapat tiga kaedah sambungan: Wi-Fi, Ethernet dan USB.
Pilihan sambungan rangkaian. Anda perlu mempunyai sambungan internet untuk menyediakan Flex. Wi-Fi: Gunakan skrin sentuh untuk menyambung ke rangkaian Wi-Fi yang dilindungi dengan pengesahan Peribadi WPA2 (kebanyakan rangkaian yang hanya memerlukan kata laluan untuk menyertai termasuk dalam kategori ini).
Nota: Flex tidak menyokong portal tawanan (rangkaian yang tidak mempunyai kata laluan tetapi memuatkan a webhalaman untuk mengesahkan pengguna selepas menyambung).
Anda juga boleh menyambung ke rangkaian Wi-Fi terbuka, tetapi ini tidak disyorkan.
Amaran: Menyambung ke rangkaian Wi-Fi terbuka akan membenarkan sesiapa sahaja dalam julat isyarat rangkaian mengawal robot Opentrons Flex anda tanpa pengesahan.
Jika anda perlu menyambung ke rangkaian Wi-Fi yang menggunakan pengesahan perusahaan (termasuk "eduroam" dan rangkaian akademik serupa yang memerlukan nama pengguna dan kata laluan), mula-mula sambung ke Apl Opentrons melalui Ethernet atau USB untuk melengkapkan persediaan awal. Kemudian sambung ke rangkaian Wi-Fi perusahaan dalam tetapan rangkaian untuk Flex anda. Untuk mengakses tetapan rangkaian:
36
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
1. Klik Peranti di bar sisi kiri Apl Opentrons. 2. Klik menu tiga titik () untuk Flex anda dan pilih Tetapan Robot. 3. Klik tab Rangkaian.
Pilih rangkaian anda daripada menu lungsur turun atau pilih "Sertai rangkaian lain..." dan masukkan SSIDnya. Pilih kaedah pengesahan perusahaan yang digunakan oleh rangkaian anda. Kaedah yang disokong ialah:
EAP-TTLS dengan TLS EAP-TTLS dengan MS-CHAP v2 EAP-TTLS dengan MD5 EAP-PEAP dengan MS-CHAP v2 EAP-TLS
Setiap kaedah ini memerlukan nama pengguna dan kata laluan, dan bergantung pada konfigurasi rangkaian tepat anda mungkin memerlukan sijil files atau pilihan lain. Rujuk dokumentasi IT kemudahan anda atau hubungi pengurus IT anda untuk butiran persediaan rangkaian anda.
Ethernet: Sambungkan robot anda ke suis rangkaian atau hab dengan kabel Ethernet. Anda juga boleh menyambung terus ke port Ethernet pada komputer anda, bermula dalam sistem robot versi 7.1.0.
USB: Sambungkan kabel USB A-to-B yang disediakan ke port USB-B robot dan port terbuka pada komputer anda. Gunakan kabel USB B-to-C atau penyesuai USB A-to-C jika komputer anda tidak mempunyai port USB-A.
Untuk meneruskan persediaan, komputer yang disambungkan mesti memasang Apl Opentrons dan berjalan. Untuk butiran tentang memasang Apl Opentrons, lihat bahagian Pemasangan Apl dalam bab Perisian dan Operasi.
Pasang kemas kini perisian
Memandangkan anda telah disambungkan ke rangkaian atau komputer, robot boleh menyemak kemas kini perisian dan perisian tegar dan memuat turunnya jika perlu. Jika terdapat kemas kini, ia mungkin mengambil masa beberapa minit untuk dipasang. Setelah kemas kini selesai, robot akan dimulakan semula.
OPENRONS FLEX
37
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Pasang Loket Berhenti Kecemasan
Sambungkan Loket Hentian Kecemasan (E-stop) yang disertakan ke port tambahan (AUX-1 atau AUX-2) di bahagian belakang robot.
Sebelum dan selepas menyambungkan Loket Hentian Kecemasan.
Melampirkan dan mendayakan E-stop adalah wajib untuk melampirkan instrumen dan menjalankan protokol pada Flex. Untuk maklumat lanjut tentang menggunakan E-stop semasa operasi robot, lihat bahagian Loket Hentian Kecemasan dalam bab Penerangan Sistem.
Beri nama robot anda
Menamakan robot anda membolehkan anda mengenal pasti dengan mudah dalam persekitaran makmal anda. Jika anda mempunyai berbilang robot Opentrons pada rangkaian anda, pastikan anda memberi mereka nama yang unik. Setelah anda mengesahkan nama robot anda, anda akan dibawa ke Papan Pemuka Opentrons Flex anda. Kemungkinan langkah seterusnya yang anda ingin ambil ialah melampirkan instrumen, yang diliputi dalam bahagian seterusnya.
2.4 Pemasangan dan penentukuran instrumen
Selepas persediaan robot awal, langkah seterusnya ialah melampirkan instrumen pada robot dan menentukurnya.
Untuk memasang instrumen, mula-mula ketik Instrumen pada skrin sentuh atau pergi ke bahagian Pipet dan Modul pada skrin butiran peranti dalam Apl Opentrons. Pilih pelekap kosong dan pilih sama ada Lampirkan Pipet atau Lampirkan Gripper. Jika pelekap yang anda ingin gunakan sudah terisi, anda perlu menanggalkan pipet atau pencengkam terlebih dahulu.
38
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Nota: Proses pemasangan keseluruhan adalah sama tidak kira sama ada anda menggunakan skrin sentuh atau Apl Opentrons. Mana-mana peranti yang anda mulakan akan mengawal proses pemasangan sehingga anda melengkapkan atau membatalkannya.
Jika anda mula menggunakan skrin sentuh, apl akan menunjukkan robot sebagai "sibuk". Jika anda memulakan dalam apl, skrin sentuh akan menunjukkan modal yang menunjukkan bahawa pemasangan instrumen sedang dijalankan.
Proses pemasangan yang tepat berbeza-beza bergantung pada instrumen yang anda lampirkan, seperti yang diliputi dalam bahagian di bawah. Semua instrumen mempunyai prosedur penentukuran automatik, yang perlu anda lakukan serta-merta selepas pemasangan.
Pemasangan pipet
Apabila anda memasang pipet, anda akan dibimbing melalui langkah berikut pada skrin sentuh atau dalam Apl Opentrons.
1. PILIH JENIS PIPET Pilih antara Pipet 1 atau 8 Saluran dan Pipet 96 Saluran. Memasang Pipet 96 Saluran memerlukan beberapa langkah tambahan kerana ia melekat pada plat pelekap khas yang merentangi kedua-dua pelekap pipet.
2. BERSEDIA UNTUK PEMASANGAN Keluarkan peralatan makmal dari dek dan bersihkan kawasan kerja untuk memudahkan pemasangan dan penentukuran. Juga kumpulkan peralatan yang diperlukan, seperti probe penentukuran, pemutar skru hex, dan plat pelekap (untuk Pipet 96 Saluran).
3. SAMBUNG DAN SELAMATKAN PIPET Gantri akan bergerak ke hadapan robot supaya anda boleh memasang pipet.
Pipet 1 dan 8 Saluran bersambung terus ke pelekap pipet. Pipet 96 Saluran memerlukan plat pelekap. Untuk memasang plat pelekap, anda mesti memutuskan sambungan gerabak paksi z terlebih dahulu untuk pelekap pipet yang betul.
OPENRONS FLEX
39
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Sambungkan pipet ke pelekap pipet yang dipilih dan kencangkan skrunya.
4. JALANKAN PENENTUAN AUTOMATIK Untuk menentukur pipet, pasangkan probe kalibrasi pada muncung pipet yang sesuai. Pipet akan bergerak secara automatik untuk menyentuh titik tertentu pada dek dan menyimpan nilai penentukuran ini untuk kegunaan masa hadapan. Setelah penentukuran selesai dan anda telah mengeluarkan probe, pipet akan sedia untuk digunakan dalam protokol.
Pemasangan gripper
Apabila anda memasang pencengkam, anda akan dibimbing melalui langkah berikut pada skrin sentuh atau dalam Apl Opentrons.
1. BERSEDIA UNTUK PEMASANGAN Keluarkan peralatan makmal dari dek dan bersihkan kawasan kerja untuk memudahkan pemasangan dan penentukuran. Kumpulkan juga pemutar skru hex yang diperlukan dan pastikan pin penentukuran berada di kawasan penyimpanannya pada penggenggam.
2. SAMBUNG DAN SELAMATKAN GRIPPER Gantry akan bergerak ke hadapan robot supaya anda boleh memasang gripper. Sambungkan pencengkam ke pelekap sambungan dan selamatkan skrunya.
3. JALANKAN PENENTUAN AUTOMATIK Untuk menentukur penggenggam, masukkan pin penentukuran di rahang hadapan. Penggenggam akan bergerak secara automatik untuk menyentuh titik tertentu pada dek dan menyimpan nilai penentukuran ini untuk kegunaan masa hadapan. Kemudian ulangi proses yang sama dengan pin penentukuran di rahang belakang. Setelah penentukuran selesai dan anda telah meletakkan semula pin di lokasi penyimpanannya, penggenggam akan sedia untuk digunakan dalam protokol.
2.5 Penempatan semula
Bahagian ini memberikan nasihat dan arahan tentang cara menggerakkan robot Opentrons Flex anda pada jarak dekat dan jauh.
40
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Pergerakan pendek
Pergerakan singkat menjangkau julat jarak dari "mari kita gerakkannya sedikit" ke seberang makmal, menuruni lorong atau tingkat lain dalam bangunan anda. Dalam kes ini, anda boleh menggerakkan Flex anda dengan tangan. Mengangkutnya menggunakan troli tangan juga merupakan pilihan yang baik.
Amaran: Flex mempunyai berat 88.5 kg. Akibatnya, ia memerlukan dua orang untuk mengangkat dan memindahkannya dengan selamat.
Pasang semula pemegang lif untuk mengalihkan Flex anda ke lokasi baharu yang berdekatan. Mengangkat dan membawa Flex dengan pemegangnya ialah cara yang betul untuk menggerakkan robot dalam jarak dekat. Keluarkan pemegang dan simpannya dalam Kit Pengguna selepas pemindahan selesai. Untuk mengelakkan robot rosak, sentiasa gunakan pemegang lif untuk mengambil dan mengalihkannya. Jangan ambil bingkai untuk mengangkat atau menggerakkan robot anda.
Pergerakan jarak jauh
Pergerakan jarak jauh membawa Flex anda keluar dari kawasan universiti, kemudahan atau institusi anda. Merentasi bandar, ke bandar, negeri, wilayah atau negara baharu semuanya bekasamples daripada pergerakan jarak jauh. Dalam kes ini, anda perlu mengemas Flex untuk melindunginya daripada unsur, kejutan dan pergerakan kasar yang mungkin berlaku semasa dalam transit.
Jika anda telah menyimpan peti perkapalan dan sokongan dalaman yang disertakan bersama Flex anda, anda boleh membungkusnya semula dalam bahan ini untuk pergerakan jarak jauh. Ikuti langkah membuka kotak dalam urutan terbalik untuk menyediakan Flex anda untuk pergerakan jarak jauh. Pada asasnya, anda harus:
Putuskan sambungan kabel kuasa dan rangkaian, jika disambungkan. Keluarkan semua perkakasan dan perisian makmal yang dilampirkan. Pasang semula plat dek. Kunci gantri (lihat bahagian Nasihat Pergerakan Umum di bawah). Keluarkan dan simpan panel tingkap.
Jika anda menyimpan peti asal:
Pasang semula bingkai penghantaran pada Flex dan kencangkan pada dasar palet menggunakan kurungan L. Tambah padding dan pasang semula peti penghantaran.
OPENRONS FLEX
41
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Jika anda tidak mempunyai peti asal dan bahan berkaitan, hubungi syarikat perkapalan yang bereputasi. Mereka boleh menguruskan proses pembungkusan, pengangkutan dan penghantaran untuk anda.
Nasihat bergerak am
PUSATKAN KABEL KUASA DAN RANGKAIAN Sebelum menggerakkan Flex anda, jangan lupa untuk: Matikan kuasa dan cabut plagnya daripada bekalan kuasa. Putuskan sambungan kabel Ethernet atau USB, jika digunakan.
KUNCI GANTRY Sebelum menggerakkan Flex anda, masukkan semula skru pengunci untuk menahan gantri di tempatnya. Titik penguncian gantri terletak: Pada rel sebelah kiri berhampiran hadapan robot. Di bawah lengan gantri menegak. Pada rel sebelah kanan berhampiran hadapan robot. Mengunci bahagian gantri ini memerlukan yang kecil
pendakap oren dan dua skru pengunci.
42
OPENRONS FLEX
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
HOME THE GANTRY Anda mungkin tidak mahu mengunci gantri jika anda hanya mengalihkan robot ke lokasi berdekatan. Jika anda memutuskan untuk tidak menguncinya, sekurang-kurangnya gunakan skrin sentuh atau Apl Opentrons untuk menghantar gantri ke kedudukan utamanya sebelum mematikannya. Untuk menempatkan gantri melalui skrin sentuh, ketik menu tiga titik () dan kemudian ketik Gantri Utama. Untuk menempatkan gantri melalui Apl Opentrons: Klik Peranti. Klik pada Flex anda dalam senarai peranti. Klik menu tiga titik () dan kemudian klik gantri Laman Utama.
KELUARKAN MODUL Modul dalam dek dan lampiran lain menambah berat tambahan pada Flex anda. Ia juga menjejaskan pusat graviti robot, yang boleh menyebabkan ia berasa "tippy" apabila mengangkatnya. Untuk membantu meringankan dan mengimbangi robot, keluarkan sebarang instrumen dan perisian makmal yang dipasang sebelum anda mengambilnya.
PASANG SEMULA SLOT DEK Kami mengesyorkan agar anda memasang semula slot dek untuk pergerakan jarak jauh. Mengamankan slot di lokasi asalnya membantu mengelakkan kehilangan secara tidak sengaja. Memasang semula slot dek untuk pergerakan pendek di sekeliling makmal adalah pilihan.
PENCALIBRASI SELEPAS PERGERAKAN Anda harus menentukur semula mana-mana instrumen dan modul selepas memasangnya semula. Untuk butiran lanjut tentang penentukuran modul, lihat bab Modul.
OPENRONS FLEX
43
BAB 2: PEMASANGAN DAN PENEMPATAN SEMULA
Pemikiran akhir tentang bergerak
Flex anda ialah mesin yang kukuh dan dibina dengan baik, tetapi ia juga merupakan instrumen saintifik yang tepat yang direka bentuk untuk memastikan toleransi. Akibatnya, anda harus merawatnya dengan berhati-hati apabila memindahkannya ke dalam kawasan kerja tempatan anda atau menghantarnya ke seluruh negara. Ini bermakna mengikut panduan yang disediakan di sini dan menggunakan akal fikiran anda sendiri tentang cara mengangkut peralatan makmal yang mahal. Intinya: apabila menggerakkan Flex anda, silap langkah berhati-hati dan pelapik tambahan.
Jika anda mempunyai soalan atau kebimbangan mengenai penempatan semula Flex anda, hubungi kami di support@opentrons.com.
44
OPENRONS FLEX
BAB 3
Penerangan Sistem
Bab ini menerangkan sistem perkakasan Opentrons Flex, yang mendasari ciri automasi makmal terasnya. Pelekap dek, gantri dan instrumen Opentrons Flex membolehkan penggunaan cecair ketepatan dan komponen pengendalian perisian makmal. Skrin sentuh pada peranti membolehkan menjalankan protokol dan menyemak status robot tanpa perlu membawa komputer anda ke bangku makmal. Kesambungan berwayar dan wayarles membolehkan kawalan tambahan daripada Apl Opentrons (lihat bab Perisian dan Operasi untuk butiran lanjut) dan melanjutkan ciri sistem dengan melampirkan peranti (lihat bab Modul).
3.1 Komponen fizikal
Kamera
Cahaya Status
Skrin sentuh
Bingkai
Dek Gantry
Pintu Depan
Lokasi komponen fizikal Opentrons Flex.
Penutup Pemegang Windows Sisi
OPENRONS FLEX
45
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Bingkai dan kepungan
Bingkai robot Opentrons Flex menyediakan ketegaran dan sokongan struktur untuk dek dan gantrinya. Semua subsistem mekanikal terletak pada dan dipasang pada bingkai utama. Bingkai dibina terutamanya daripada kepingan logam dan penyemperitan aluminium.
Bingkai logam mempunyai bukaan untuk tingkap sisi dan pintu hadapan yang diperbuat daripada polikarbonat lutsinar yang membolehkan anda melihat apa yang berlaku di dalam Flex. Engsel pintu depan terbuka untuk akses ke bahagian dalam sistem. Dengan pintu depan terbuka, anda boleh memasang instrumen, modul dan lekapan dek; sediakan dek sebelum protokol; atau memanipulasi keadaan dek semasa protokol.
Jalur LED putih pada bahagian tepi atas bahagian dalam bingkai menyediakan pencahayaan ambien yang boleh dikawal perisian. Kamera 2 megapiksel boleh memotret dek dan kawasan kerja untuk merakam dan menjejaki pelaksanaan protokol.
Dek dan kawasan kerja
Dek ialah permukaan aluminium yang dimesin di mana protokol sains automatik dilaksanakan. Dek ini mempunyai 12 slot format ANSI/SLAS utama yang boleh dikonfigurasikan semula untuk menyimpan perisian makmal, modul dan bahan habis pakai. Slot dek dikenal pasti oleh sistem koordinat, dengan slot A1 di bahagian kiri belakang dan slot D3 di bahagian hadapan kanan.
Slot Pengembangan (untuk Thermocycler) Kawasan Kerja
StagKawasan Kawasan
Kawasan dek dalam Flex.
46
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Kawasan kerja ialah ruang fizikal di atas dek yang boleh diakses untuk paip. Labware yang diletakkan dalam slot A1 hingga D3 berada di kawasan kerja.
Opentrons Flex dilengkapi dengan slot dek boleh tanggal untuk semua 12 kedudukan di kawasan kerja. Setiap slot dek mempunyai klip peralatan makmal sudut untuk meletakkan perisian makmal dengan selamat pada dek.
Anda boleh mengkonfigurasi semula dek dengan menggantikan slot dengan lekapan dek lain, termasuk sampah boleh alih, pelongsor buangan dan kedi modul. Slot pengembangan di belakang A1 hanya digunakan untuk memberi ruang tambahan untuk Modul Thermocycler, yang menduduki slot A1 dan B1.
Nota: Slot dek boleh ditukar ganti dalam lajur (1, 2 atau 3) tetapi tidak merentas lajur; slot lajur 1 dan lajur 3 adalah kepingan yang berbeza walaupun saiznya serupa. Anda boleh mengetahui lajur mana satu slot masuk dengan mengorientasikan klip labware biru ke kiri belakang.
Anda harus meninggalkan slot dek dipasang di lokasi yang anda ingin letakkan perisian makmal kendiri. Dek dan barang yang diletakkan di atasnya kekal statik, melainkan digerakkan oleh pencengkam atau campur tangan manual.
Stagkawasan ing
Stagkawasan adalah ruang tambahan di sepanjang sebelah kanan dek. Anda boleh menyimpan perisian makmal di lokasi ini selepas memasang stagslot kawasan ing. Labware yang diletakkan dalam slot A4 hingga D4 berada dalam stagkawasan ing. Pipet fleksibel tidak boleh sampai ke dalam stagkawasan, tetapi pencengkam boleh mengambil dan mengalihkan perisian makmal ke dan dari lokasi ini. Menambah slot tambahan membantu memastikan kawasan kerja tersedia untuk peralatan yang digunakan dalam protokol automatik anda.
Stagslot kawasan dimasukkan dalam konfigurasi stesen kerja tertentu dan juga tersedia untuk pembelian daripada https://shop.opentrons.com.
OPENRONS FLEX
47
BAB 3: HURAIAN SISTEM
StagKawasan dengan Slot Dipasang
Lekapan dek
Lekapan ialah item perkakasan yang menggantikan slot dek standard. Mereka membenarkan anda menyesuaikan reka letak dek dan menambah fungsi pada Flex anda. Pada masa ini, lekapan dek termasuk stagslot kawasan, tong sampah dalaman, dan pelongsor sisa luaran. Anda hanya boleh memasang lekapan dalam beberapa slot dek tertentu. Jadual berikut menyenaraikan lokasi dek untuk setiap lekapan.
Lekapan Stagslot kawasan Tong sampah Pelongsor sampah Pelongsor sampah dengan stagslot kawasan ing
Slot A3D3 A1D1 dan A3-D3 D3 sahaja D3 sahaja
Lekapan tidak berkuasa. Ia tidak mengandungi komponen elektronik atau mekanikal yang menyampaikan keadaan semasa dan lokasi dek kepada robot. Ini bermakna anda perlu menggunakan ciri konfigurasi dek untuk memberitahu Flex apakah lekapan yang dipasang pada dek dan di mana ia berada.
48
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Anda boleh mengakses tetapan konfigurasi dek daripada skrin sentuh melalui menu tiga titik () dan daripada Apl Opentrons. Lihat bahagian Konfigurasi Dek dalam bab Perisian dan Operasi untuk mendapatkan maklumat tentang cara mengkonfigurasi dek daripada skrin sentuh.
pelongsor buangan
Opentrons Flex Waste Chute memindahkan cecair, hujung, rak hujung dan plat perigi dari kandang Flex ke bekas sampah yang diletakkan di bawah bukaan luarannya. Pelongsor buangan melekat pada penyesuai plat dek yang sesuai dengan slot D3. Ia juga dilengkapi dengan panel separuh tingkap khas yang membolehkan pelongsor keluar dari hadapan robot.
Komponen pelongsor sisa.
Penyesuai Plat Dek Penutup
Pelongsor Sisa
Penyesuai Plat Dek dengan StagKawasan Kawasan
Stagslot kawasan ing
Stagslot kawasan adalah kepingan dek serasi ANSI/SLAS yang menggantikan slot standard dalam lajur 3 dan menambah slot baharu pada stagkawasan — semuanya tanpa kehilangan ruang di kawasan kerja. Anda boleh memasang satu slot atau maksimum empat slot untuk mencipta lajur baharu (A4 hingga D4) di sepanjang sebelah kanan dek. Walau bagaimanapun, ambil perhatian bahawa menggantikan slot dek A3 memerlukan pengalihan tong sampah. Dengan menambah stagdalam slot kawasan ke geladak, robot Flex anda boleh menyimpan lebih banyak perisian makmal dan beroperasi dengan lebih cekap.
OPENRONS FLEX
Flex stagslot kawasan ing.
49
BAB 3: HURAIAN SISTEM
PEMASANGAN SLOT
Untuk memasang, keluarkan skru yang memasang slot standard pada geladak dan gantikannya dengan stagslot kawasan ing. Selepas pemasangan, gunakan skrin sentuh atau Apl Opentrons untuk memberitahu robot yang telah anda tambahkan sebagaitagslot kawasan ke geladak.
Memasang sebagaitagslot kawasan ing.
KESESUAIAN SLOT Stagslot kawasan serasi dengan instrumen Flex, modul dan perisian makmal yang disenaraikan di bawah.
Komponen Flex Gripper Pipets Modules
Makmal
Stagkeserasian kawasan
Flex Gripper boleh memindahkan perisian makmal ke atau dari stagslot kawasan ing.
Pipet fleksibel tidak boleh mencapai stagkawasan ing. Gunakan pencengkam untuk mengalihkan rak hujung dan peralatan makmal dari stagmasuk ke kawasan kerja sebelum paip.
Blok Magnetik GEN1 boleh diletakkan di lajur 3 di atas sebagaitagslot kawasan ing. Modul tidak disokong dalam lajur 4.
Modul berkuasa seperti Heater-Shaker dan Modul Suhu dimuatkan ke dalam kedi yang boleh diletakkan di lajur 3. Anda tidak boleh menambah sebagaitagslot kawasan ke kedudukan yang diduduki oleh kedi modul.
Stagslot kawasan mempunyai dimensi ANSI/SLAS yang sama seperti slot dek standard. Gunakan perisian makmal serasi penggenggam dalam stagkawasan, atau tambah dan alih keluar perisian makmal secara manual dari lokasi ini.
50
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Sistem pergerakan
Dipasang pada bingkai ialah gantri, iaitu sistem pergerakan dan kedudukan robot. Gantri bergerak secara berasingan di sepanjang paksi-x dan y untuk meletakkan pipet dan pencengkam pada lokasi yang tepat untuk pelaksanaan protokol. Pergerakan di sepanjang paksi ini adalah tepat kepada 0.1 mm yang terdekat. Gantri dikawal oleh motor stepper bipolar hibrid 36 VDC. Sebaliknya, dipasang pada gantri ialah pelekap pipet dan pelekap sambungan. Ini bergerak di sepanjang paksi z untuk meletakkan pipet dan pencengkam pada lokasi yang tepat untuk pelaksanaan protokol. Pergerakan di sepanjang paksi ini dikawal oleh motor stepper bipolar hibrid 36 VDC. Elektronik yang terkandung dalam gantri memberikan kuasa dan komunikasi 36 VDC kepada pipet dan pencengkam, apabila dipasang.
Gantry
Pemasangan Pipet
Pelekap Sambungan
Lokasi pelekap instrumen pada Flex.
Skrin sentuh dan paparan LED
Antara muka pengguna utama ialah skrin sentuh LCD 7-inci, terletak di sebelah kanan hadapan robot. Skrin sentuh ditutup dengan Gorilla Glass 3 untuk rintangan calar dan kerosakan. Akses banyak ciri Flex terus pada skrin sentuh, termasuk:
OPENRONS FLEX
51
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Pengurusan protokol Persediaan protokol, pelaksanaan dan pemantauan Pengurusan Labware Tetapan robot Perisian sistem dan kemas kini perisian tegar Log operasi dan pemberitahuan ralat
Untuk mendapatkan maklumat lanjut tentang menggunakan Flex melalui skrin sentuh, lihat bahagian Operasi Skrin Sentuh dalam bab Perisian dan Operasi.
Lampu status ialah jalur LED di sepanjang bahagian atas hadapan robot yang memberikan maklumat sekilas pandang tentang robot. Warna dan corak pencahayaan yang berbeza boleh menyampaikan pelbagai kejayaan, kegagalan atau keadaan terbiar:
Warna LED Putih Neutral keadaan
Keadaan Normal Hijau
Biru Mandatory states Yellow Abnormal states Merah Emergency states
Corak LED Berdenyut Pepejal
Berkelip dua kali
Denyutan Pepejal Denyutan
Status robot
Dihidupkan dan tidak menjalankan protokol Robot sedang sibuk (cth, mengemas kini perisian atau perisian tegar, menyediakan jalan protokol, membatalkan jalan protokol) Tindakan selesai (cth, protokol disimpan, perisian dikemas kini, instrumen dilampirkan atau ditanggalkan) Protokol sedang berjalan Protokol selesai Protokol dijeda
Padat
Ralat perisian
Berkelip tiga kali, berulang kali
Ralat fizikal (cth, ranap alat)
Lampu status juga boleh dilumpuhkan dalam tetapan robot.
52
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
3.2 Pipet
Pipet Opentrons ialah peranti boleh dikonfigurasikan yang digunakan untuk memindahkan cecair ke seluruh kawasan kerja semasa pelaksanaan protokol. Terdapat beberapa pipet Opentrons Flex, yang boleh mengendalikan volum dari 1 µL hingga 1000 µL dalam 1, 8, atau 96 saluran:
Opentrons Flex 1-Channel Pipet (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 5-Channel Pipette (1000 µL) Opentrons Flex 8-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (8 µL) Opentrons Flex 5-Channel Pipette (1000 µL) Opentrons Flex 96-L
Pipet dipasang pada gantri menggunakan skru tawanan di hadapan pipet. Pipet 1 saluran dan 8 saluran masing-masing menduduki satu pelekap pipet (kiri atau kanan); pipet 96 saluran menduduki kedua-dua pelekap. Untuk butiran tentang memasang pipet, lihat Pemasangan dan Penentukuran Instrumen.
Lampiran Tawanan
Skru
Skru Lampiran Tawanan
Ejektor
Muncung (Gelang-O Boleh Ganti)
Muncung (Gelang O Tetap)
Lokasi komponen pipet 1-, 8- dan 96 saluran.
Ejektor
OPENRONS FLEX
53
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Pipet mengambil hujung plastik pakai buang dengan menekannya pada muncung pipet, dan kemudian gunakan petua untuk menyedut dan mengeluarkan cecair. Jumlah daya yang diperlukan untuk pengambilan meningkat apabila lebih banyak petua diambil secara serentak. Untuk bilangan petua yang lebih kecil, pipet melekatkan hujung dengan menolak setiap muncung pipet ke dalam hujung. Untuk mencapai daya yang diperlukan untuk mengambil rak penuh petua, pipet 96 saluran juga menarik hujung ke atas ke muncung. Tindakan menarik ini memerlukan meletakkan rak hujung ke dalam penyesuai rak hujung, bukannya terus dalam slot dek. Untuk membuang hujung (atau mengembalikannya ke raknya), mekanisme ejektor pipet menolak hujung muncung.
Spesifikasi pipet
Pipet Opentrons Flex direka untuk mengendalikan pelbagai volum. Oleh kerana julat keseluruhannya yang luas, mereka boleh menggunakan berbilang saiz petua, yang mempengaruhi ciri pengendalian cecair mereka. Opentrons telah menguji pipet Flex untuk ketepatan dan ketepatan dalam beberapa kombinasi hujung dan isipadu cecair:
Pipet
Flex 1-Saluran
50 µL
Flex 1-Saluran
1000 µL
Flex 8-Saluran
50 µL
Flex 8-Saluran
1000 µL
Kapasiti Petua 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200µL 1000µL
Isipadu Diuji 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Ketepatan %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Ketepatan %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Flex 96-Saluran
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Simpan maklumat ketepatan ini dalam fikiran apabila memilih petua untuk pipet anda. Secara umum, untuk hasil terbaik anda harus menggunakan petua terkecil yang memenuhi keperluan protokol anda.
Nota: Opentrons menjalankan ujian volumetrik bagi pipet Flex untuk memastikan ia memenuhi ketepatan dan spesifikasi ketepatan yang disenaraikan di atas. Anda tidak perlu menentukur volum yang dikeluarkan oleh pipet anda sebelum digunakan. Anda hanya perlu melakukan penentukuran kedudukan. Lihat bahagian seterusnya, serta bahagian Pemasangan Pipet dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula, untuk butiran.
Perkhidmatan Opentrons Care dan Opentrons Care Plus termasuk penggantian pipet tahunan dan sijil penentukuran. Lihat bahagian Servis Flex dalam bab Penyelenggaraan dan Servis untuk mendapatkan butiran.
Penentukuran pipet
Kit Pengguna termasuk probe penentukuran pipet logam, yang anda gunakan semasa penentukuran kedudukan. Semasa protokol berjalan, simpan probe dengan selamat pada pemegang magnet pada tiang hadapan robot. Semasa proses penentukuran, pasangkan probe pada muncung yang sesuai dan kuncikannya di tempatnya. Robot menggerakkan probe ke titik penentukuran di dek untuk mengukur kedudukan tepat pipet.
Penyesuai rak hujung pipet
Pipet saluran Opentrons Flex 96 dihantar dengan empat penyesuai rak hujung. Ini adalah kurungan aluminium berbentuk ketepatan yang anda letakkan di atas geladak. Penyesuai memegang rak hujung Flex 50 L, 200 L dan 1000 µL.
OPENRONS FLEX
55
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Kerana daya yang terlibat, pipet 96 saluran memerlukan penyesuai untuk memasang rak hujung penuh dengan betul. Semasa prosedur pemasangan, pipet bergerak ke atas penyesuai, menurunkan dirinya ke pin pelekap, dan menarik hujung ke pipet dengan mengangkat penyesuai dan rak hujung. Menarik petua, bukannya menolak, memberikan leverage yang diperlukan untuk mendapatkan petua pada pipet dan menghalang permukaan geladak melengkung. Apabila selesai, pipet 96 saluran menurunkan penyesuai dan rak hujung kosong ke geladak. Lihat bahagian Petua dan rak petua dalam bab Labware untuk mendapatkan maklumat lanjut.
Pengambilan hujung separa
Pipet 96 saluran boleh mengambil rak penuh petua atau bilangan petua yang lebih kecil. Ini meningkatkan bilangan aplikasi yang boleh anda lakukan dengan pipet 96 saluran, kerana ia menduduki kedua-dua pelekap pipet.
Pada masa ini, pipet 96 saluran menyokong pengambilan hujung separa untuk 8 petua dalam reka letak lajur. Dalam konfigurasi ini, pipet sama ada menggunakan muncung paling kirinya untuk mengambil petua kanan-ke-kiri daripada rak hujung, atau muncung paling kanannya untuk mengambil petua kiri-ke-kanan daripada rak hujung.
Apabila mengambil kurang daripada 96 hujung daripada rak hujung, rak mesti diletakkan terus pada geladak, bukan dalam penyesuai rak hujung.
Penderia pipet
Pipet Opentrons Flex mempunyai beberapa penderia yang mengesan dan merekod data tentang status pipet dan sebarang petua yang telah diambilnya.
PENDERIA KEUPAYAAN
Dalam kombinasi dengan probe logam atau hujung konduktif, sensor kapasitans mengesan apabila pipet bersentuhan dengan sesuatu. Pengesanan sentuhan antara kuar logam dan dek digunakan dalam penentukuran pipet automatik dan proses penentukuran modul.
Pipet 1 saluran mempunyai satu penderia kapasitans, manakala pipet berbilang saluran mempunyai dua: pada saluran 1 dan 8 daripada pipet 8 saluran, dan pada saluran 1 dan 96 (kedudukan A1 dan H12) pipet 96 saluran.
56
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
PENDERIA KEHADIRAN PETUA OPTIK
Suis photointerruptor mengesan kedudukan mekanisme ejector hujung pipet, mengesahkan sama ada tip berjaya diambil atau dijatuhkan. Pipet 1 saluran, 8 saluran dan 96 saluran semuanya mempunyai penderia optik tunggal yang memantau lampiran hujung merentas semua saluran.
Kemas kini perisian tegar pipet
Opentrons Flex secara automatik mengemas kini perisian tegar pipet untuk memastikan ia segerak dengan versi perisian robot. Kemas kini perisian tegar pipet biasanya cepat dan berlaku apabila:
Anda memasang pipet. Robot dimulakan semula.
Jika, atas sebarang sebab, versi perisian tegar pipet dan perisian robot anda tidak disegerakkan, anda boleh mengemas kini perisian tegar secara manual dalam Apl Opentrons.
1. Klik Peranti. 2. Klik pada Flex anda dalam senarai peranti. 3. Di bawah Instrumen dan Modul, pipet tidak segerak akan menunjukkan bacaan sepanduk amaran
"Kemas kini perisian tegar tersedia." Klik Kemas Kini sekarang untuk memulakan kemas kini.
awak boleh view versi perisian tegar yang dipasang pada masa ini bagi mana-mana pipet yang dilampirkan. Pada skrin sentuh, pergi ke Instrumen dan ketik nama pipet. Dalam Apl Opentrons, cari kad pipet di bawah Instrumen dan Modul, klik menu tiga titik (), dan kemudian klik Perihal pipet.
3.3 Penggenggam
Penggenggam menggerakkan perisian makmal ke seluruh kawasan kerja dan stagkawasan semasa pelaksanaan protokol. Pencengkam melekat pada pelekap sambungan, yang berasingan daripada pelekap pipet; pencengkam boleh digunakan dengan sebarang konfigurasi pipet. Untuk butiran tentang memasang penggenggam, lihat Pemasangan dan Penentukuran Instrumen.
Penggenggam boleh menggerakkan perisian makmal merentasi dek dan ke atas atau luar modul. Penggenggam boleh memanipulasi plat perigi berskiring penuh tertentu, plat perigi dalam dan rak hujung. Untuk butiran lanjut tentang perisian lab yang boleh digerakkan oleh penggenggam, lihat bahagian Labware dan Opentrons Flex Gripper dalam bab Labware, atau rujuk Perpustakaan Opentrons Labware.
OPENRONS FLEX
57
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Spesifikasi Gripper
Rahang melakukan gerakan utama penggenggam, iaitu membuka atau menutup dua dayung selari untuk menggunakan atau melepaskan daya pada sisi labware. Pergerakan rahang dikawal oleh motor berus 36 VDC yang disambungkan kepada sistem gear rak-dan-pinion.
Untuk menggerakkan sekeping labware yang telah dicengkam oleh rahang, gantri mengangkat pencengkam sepanjang paksi-z, menggerakkannya ke sisi, dan kemudian menurunkannya ke kedudukan baru labware.
Lokasi komponen penggenggam.
Skru lampiran
Kalibrasi pin Jaws Paddles
Penentukuran Gripper
Penggenggam termasuk pin penentukuran logam. Pin penentukuran terletak di kawasan simpanan ceruk di bahagian bawah pencengkam. Magnet memegang pin di tempatnya. Untuk mengeluarkan pin penentukuran, genggam dengan jari anda dan tarik perlahan-lahan. Untuk menggantikan pin, masukkan semula ke dalam slot storan. Anda akan tahu ia selamat apabila ia terpasang pada tempatnya.
Apabila menentukur penggenggam, pasangkan pin pada setiap rahang secara bergilir-gilir. Robot menggerakkan pin ke titik penentukuran di dek untuk mengukur kedudukan tepat penggenggam.
Semasa protokol berjalan, letakkan pin di kawasan simpanannya untuk disimpan dengan selamat. Hubungi kami di support@opentrons.com jika anda kehilangan pin penentukuran.
Kemas kini perisian tegar Gripper
Opentrons Flex secara automatik mengemas kini perisian tegar gripper untuk memastikan ia segerak dengan versi perisian robot. Kemas kini perisian tegar Gripper biasanya cepat dan berlaku apabila:
58
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Anda pasangkan pencengkam. Robot dimulakan semula.
Jika, atas sebarang sebab, versi perisian tegar gripper dan perisian robot anda tidak segerak, anda boleh mengemas kini perisian tegar secara manual dalam Apl Opentrons.
1. Klik Peranti. 2. Klik pada Flex anda dalam senarai peranti. 3. Di bawah Instrumen dan Modul, penggenggam yang tidak segerak akan menunjukkan bacaan sepanduk amaran
"Kemas kini perisian tegar tersedia." Klik Kemas Kini sekarang untuk memulakan kemas kini.
awak boleh view versi perisian tegar yang dipasang pada masa ini bagi gripper. Pada skrin sentuh, pergi ke Instrumen dan ketik penggenggam. Dalam Apl Opentrons, cari kad penggenggam di bawah Instrumen dan Modul, klik menu tiga titik (), dan kemudian klik Perihal penggenggam.
3.4 Loket Berhenti Kecemasan
Loket Hentian Kecemasan (E-stop) ialah butang perkakasan khusus untuk menghentikan gerakan robot dengan cepat. Opentrons Flex memerlukan E-stop yang berfungsi dan dilepaskan untuk dipasang pada setiap masa. Apabila anda menekan butang henti, Flex membatalkan sebarang protokol berjalan atau aliran kerja persediaan secepat mungkin dan menghalang kebanyakan pergerakan robot.
Bila hendak menggunakan E-stop
Anda mungkin perlu menekan E-stop:
Apabila terdapat risiko kecederaan atau bahaya kepada pengguna. Apabila terdapat risiko kerosakan pada robot atau perkakasan lain. Apabila samples atau reagen berada dalam bahaya pencemaran. Selepas perlanggaran perkakasan.
Sebaik-baiknya anda tidak perlu menekan E-stop (kecuali semasa ujian kualiti perkakasan yang jarang berlaku).
Jangan gunakan E-stop untuk membatalkan operasi biasa yang dijangkakan. Sebaliknya, gunakan butang perisian pada skrin sentuh atau dalam Apl Opentrons. Menjeda melalui perisian akan membolehkan anda menyambung semula atau membatalkan protokol anda, manakala menekan E-stop sentiasa membatalkan protokol serta-merta.
OPENRONS FLEX
59
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Melibatkan dan melepaskan E-stop
E-stop mempunyai mekanisme press-to-engage, twist-to-release.
Libatkan: Tekan butang merah ke bawah dengan kuat. Flex akan memasuki keadaan berhenti. Selesaikan: Setelah berhenti, atasi dengan selamat sebarang masalah di kawasan kerja, seperti membersihkan tumpahan,
mengeluarkan perisian makmal, atau menggerakkan gantri (ia harus bergerak dengan bebas dan mudah dengan tangan). Pelepas: Pusing butang mengikut arah jam. Ia akan muncul ke kedudukannya yang terlepas. Tetapkan Semula: Pada skrin sentuh atau dalam Apl Opentrons, sahkan bahawa anda sudah bersedia untuk Flex menyambung semula
gerakan. Gantri akan kembali ke kedudukan asalnya dan aktiviti modul akan disambung semula.
Dalam keadaan berhenti, Flex dan perkakasan yang disambungkan akan berkelakuan seperti berikut:
Pipet Gantri Perkakasan
Gripper
Modul Pemanas-Gegar
Modul Suhu Modul Thermocycler Status cahaya Skrin sentuh
Tingkah laku
Pergerakan mendatar automatik dihentikan. Pergerakan mendatar manual dibenarkan.
Pergerakan menegak pipet dihentikan. Brek motor pada paksi menegak dihidupkan untuk menghalang
pipet daripada jatuh. Pergerakan pelocok dan pengambilan hujung dihentikan.
Pergerakan menegak pencengkam dihentikan. Brek motor pada paksi menegak dihidupkan untuk menghalang
pencengkam daripada jatuh. Motor rahang yang menggunakan daya cengkam kekal didayakan, jadi
penggenggam tidak akan menjatuhkan labware yang mungkin dibawanya.
Goncang berhenti dan pulang. Selak peralatan makmal terbuka. Pemanasan dinyahdayakan.
Pemanasan atau penyejukan dinyahdayakan.
Pemanasan atau penyejukan dinyahdayakan.
Lampu bertukar merah.
Mesej pembatalan mengambil alih skrin. Penunjuk pada skrin menunjukkan apabila anda telah berjaya
menanggalkan butang berhenti.
60
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
3.5 Sambungan
Suis Hidup/Mati
Penutup Sampingan
Port USB-A
Masuk Kuasa IEC
Port AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Sambungan kuasa
Opentrons Flex menyambung kepada sumber kuasa melalui salur masuk IEC-C14 standard. Robot itu mengandungi bekalan kuasa AC/DC julat penuh dalaman, menerima 100 VAC, input 240/50 Hz dan menukarkannya kepada 60 VDC. Semua elektronik dalaman lain dikuasakan oleh bekalan 36 VDC.
Amaran: Hanya gunakan kord kuasa yang disediakan bersama robot. Jangan gunakan kord kuasa dengan arus atau vol yang tidak mencukupitage penilaian.
Pastikan kord kuasa bebas daripada halangan supaya anda boleh mengeluarkannya jika perlu.
Terdapat juga bateri sel syiling CR1220 untuk menghidupkan jam masa nyata robot apabila tidak disambungkan kepada kuasa utama. Bateri terletak di dalam penutup skrin sentuh. Hubungi Sokongan Opentrons untuk mendapatkan maklumat lanjut jika anda fikir anda perlu menggantikan bateri.
OPENRONS FLEX
61
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Sambungan USB dan tambahan
Opentrons Flex mempunyai 10 jumlah port USB yang terletak di kawasan robot yang berbeza, yang berfungsi untuk tujuan yang berbeza.
8 port USB-A belakang (bernombor USB-1 hingga USB-8) dan 2 port tambahan (penyambung M12 bernombor AUX-1 dan AUX-2) adalah untuk menyambungkan modul dan aksesori Opentrons. Lihat bab Modul untuk mendapatkan maklumat lanjut tentang menyambungkan peranti ini dan menggunakannya dalam protokol anda. Port USB-B belakang adalah untuk menyambungkan robot ke komputer riba atau komputer meja, untuk mewujudkan komunikasi dengan Apl Opentrons yang berjalan pada komputer yang disambungkan. Port USB-A hadapan (USB-9), terletak di bawah paparan skrin sentuh, mempunyai fungsi yang sama seperti port USB-A belakang.
Nota: Port USB adalah terhad kuasa untuk melindungi robot dan peranti yang disambungkan. Penghantaran kuasa dibahagikan secara dalaman kepada tiga kumpulan port: port USB-A belakang kiri (USB-1 hingga USB-4), port USB-A belakang kanan (USB-5 hingga USB-8) dan USB-A hadapan pelabuhan. Setiap kumpulan ini akan menyampaikan maksimum 500 mA kepada peranti serasi USB 2.0 yang disambungkan.
Sambungan rangkaian
Opentrons Flex boleh menyambung ke rangkaian kawasan tempatan melalui sambungan berwayar (Ethernet) atau wayarles (Wi-Fi).
Port Ethernet terletak di bahagian belakang robot. Sambungkannya ke hab Ethernet atau hidupkan rangkaian anda. Atau, bermula dalam sistem robot versi 7.1.0, sambungkannya terus ke port Ethernet pada komputer anda. Modul Wi-Fi dalaman menyokong rangkaian 802.11 ac/a/b/g/n dengan antena dwi-jalur 2.4/5 GHz.
62
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
3.6 Spesifikasi sistem
Spesifikasi am
Dimensi Berat slot Dek
Skrin sentuh
USB Ethernet Wi-Fi
Input kuasa Robot Kamera
Bekalan utama voltagturun naik frekuensi bekalan sesalur Sistem pengagihan Arus bekalan litar pintas Komposisi bingkai Komposisi tingkap Keperluan pengudaraan
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 in (W, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 slot serasi ANSI/SLAS di kawasan kerja
(boleh diakses oleh pipet) 4 slot tambahan untuk stagpetua dan perisian makmal
(hanya boleh diakses oleh penggenggam) Skrin sentuh LCD 7-inci dengan Gorilla Glass tahan calar dan kerosakan 3
802.11 ac/a/b/g/n dwi-jalur (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 port USB-A 1 port USB-B kelajuan USB 2.0
2MP, foto dan video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Reka bentuk keluli tegar dan aluminium CNC
Tingkap sisi polikarbonat boleh tanggal dan pintu hadapan Sekurang-kurangnya 20 cm / 8 di antara unit dan dinding
OPENRONS FLEX
63
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Keperluan PC yang disambungkan
Apl Opentrons berjalan pada: Windows 10 atau lebih baru macOS 10.10 atau lebih baru Ubuntu 12.04 atau lebih baru
Spesifikasi alam sekitar
Keadaan persekitaran Suhu persekitaran Kelembapan relatif Tahap pencemaran
Penggunaan dalaman sahaja +20 hingga +25 °C (disyorkan) 40%, tidak pemeluwapan (disyorkan) 60 (pencemaran tidak konduktif sahaja)
Untuk maklumat tambahan tentang keadaan persekitaran yang boleh diterima untuk kegunaan dan pengangkutan, lihat bahagian Keadaan Persekitaran dalam bab Pemasangan dan Penempatan Semula.
Pensijilan
Pensijilan lengkap Tidak diperakui/disahkan
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Ringkasan maklumat pensijilan dicetak pada pelekat di belakang Flex, berhampiran suis hidup/mati. Untuk maklumat pensijilan dan pematuhan terperinci, lihat bahagian Pematuhan Kawal Selia dalam Pengenalan.
Nombor siri
Setiap Flex mempunyai nombor siri yang unik. Format nombor siri memberikan maklumat tambahan, termasuk tarikh pengeluaran robot. Untuk example, nombor siri FLXA1020231007001 akan menunjukkan:
64
OPENRONS FLEX
BAB 3: HURAIAN SISTEM
Watak FLX A10 2023 10 07 001
Versi Model Kategori Tahun Bulan Bulan Hari
Maknanya Robot itu adalah Opentrons Flex. Kod untuk versi pengeluaran robot. Robot itu dibuat pada tahun 2023. Robot itu dibuat pada bulan Oktober. Robot itu dibuat pada hari ke-7 bulan itu. Nombor unik untuk robot yang dibuat pada hari tertentu.
Anda boleh mencari nombor siri untuk Flex anda:
Pada pelekat pensijilan di belakang Flex, berhampiran suis hidup/mati. Pada bahagian belakang skrin sentuh (ke arah kawasan kerja). Dalam Apl Opentrons di bawah Peranti > Flex anda > tetapan Robot > Lanjutan.
OPENRONS FLEX
65
BAB 4
Modul
Opentrons Flex disepadukan dengan beberapa modul perkakasan Opentrons. Semua modul adalah persisian yang menduduki slot dek, dan kebanyakannya dikawal oleh robot melalui sambungan USB.
Bab ini menerangkan fungsi dan spesifikasi fizikal modul yang serasi dengan sistem Opentrons Flex, serta cara memasang dan menentukurnya. Untuk butiran lanjut tentang persediaan dan penggunaan modul, rujuk manual untuk modul individu. Untuk butiran mengenai penyepaduan modul ke dalam protokol anda, lihat bahagian Pereka Protokol dalam bab Pembangunan Protokol atau dokumentasi API Protokol Python dalam talian.
4.1 Modul yang disokong
Opentrons Flex serasi dengan empat jenis modul Opentrons di atas dek:
Modul Heater-Shaker menyediakan pemanasan di atas dek dan gegaran orbit. Modul boleh dipanaskan hingga 95 °C, dan boleh menggoncang sampkurang dari 200 hingga 3000 rpm.
Blok Magnetik ialah peranti pasif yang memegang perisian makmal hampir dengan magnet neodymium berkekuatan tinggi. Modul Magnetik OT-2 GEN1 dan GEN2, yang secara aktif menggerakkan magnetnya ke atas dan ke bawah berbanding perisian makmal, tidak disokong pada Opentrons Flex.
Modul Suhu ialah modul plat panas dan sejuk yang mampu mengekalkan suhu keadaan mantap antara 4 dan 95 °C.
Modul Thermocycler menyediakan kitar termos automatik sepenuhnya di atas dek, membolehkan automasi langkah aliran kerja huluan dan hiliran. Thermocycler GEN2 serasi sepenuhnya dengan gripper. Thermocycler GEN1 tidak boleh digunakan dengan penggenggam, dan oleh itu tidak disokong pada Opentrons Flex.
Beberapa modul yang asalnya direka untuk OT-2 adalah serasi dengan Flex, seperti yang diringkaskan dalam jadual di bawah. Tanda semak menunjukkan keserasian, dan X menunjukkan ketidakserasian.
66
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
Jenis peranti dan penjanaan Modul Pemanas-Shaker GEN1 Modul Magnetik GEN1 Modul Magnet GEN2 Blok Magnet GEN1 Modul Suhu GEN1 Modul Suhu GEN2 Modul Termosikal GEN1 Modul Termosikal GEN2 Modul HEPA GENXNUMX
OT-2
Lentur
×
×
×
×
×
×
4.2 Sistem kedi modul
Modul yang serasi direka bentuk agar sesuai dengan kedi yang menempati ruang di bawah dek. Sistem ini membenarkan perisian makmal di atas modul kekal lebih dekat dengan permukaan dek, dan ia juga membenarkan penghalaan kabel bawah dek supaya dek kekal kemas semasa protokol anda berjalan.
Caddies untuk Modul Pemanas-Shaker, Suhu dan Thermocycler.
OPENRONS FLEX
67
BAB 4: MODUL
Untuk memasukkan modul ke dalam permukaan dek, ia mesti diletakkan terlebih dahulu ke dalam kedi modul yang sepadan. Setiap jenis modul yang serasi mempunyai reka bentuk kedi sendiri yang menjajarkan modul dan perisian makmal dengan tepat dengan dek sekeliling. (Pengecualian ialah Blok Magnetik, yang tidak memerlukan penghalaan kuasa atau kabel USB dan dengan itu terletak terus pada permukaan geladak.) Caddy untuk modul yang menduduki satu slot boleh diletakkan di mana-mana dalam lajur 1 atau 3; Thermocycler hanya boleh diletakkan dalam slot A1 dan B1 secara serentak.
Secara umum, untuk memasang kedi modul:
1. Keluarkan sebarang slot dek dari lokasi di mana modul akan pergi. 2. Letakkan modul ke dalam kedinya dan ketatkan sauhnya. 3. Halakan kuasa modul dan kabel USB melalui penutup sisi, ke atas melalui slot dek kosong, dan
lampirkannya pada modul. 4. Letakkan kedi modul ke dalam slot dan skru ke tempatnya.
Untuk arahan pemasangan yang tepat, rujuk Panduan Mula Pantas atau Manual Arahan untuk modul tertentu. Sambungan kabel dan kaedah melekat pada caddy berbeza mengikut modul.
4.3 Penentukuran modul
Apabila anda mula-mula memasang modul pada Flex, anda perlu menjalankan penentukuran kedudukan automatik. Proses ini serupa dengan penentukuran kedudukan untuk instrumen, dan memastikan bahawa Flex bergerak ke lokasi yang betul tepat untuk prestasi protokol yang optimum. Semasa penentukuran, Flex akan berpindah ke lokasi pada penyesuai penentukuran modul, yang kelihatan serupa dengan petak penentukuran yang merupakan sebahagian daripada slot dek boleh tanggal.
Penyesuai penentukuran untuk Modul Pemanas-Shaker, Suhu dan Thermocycler.
Penentukuran modul diperlukan untuk semua modul yang dipasang melalui kedi: Modul Pemanas-Shaker, Suhu dan Thermocycler. Blok Magnetik tidak memerlukan penentukuran, dan sedia untuk digunakan sebaik sahaja anda meletakkannya di atas geladak.
68
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
Bila hendak menentukur modul
Flex secara automatik menggesa anda untuk melakukan penentukuran apabila anda menyambung dan menghidupkan modul yang tidak mempunyai sebarang data penentukuran yang disimpan. (Anda boleh mengetepikan gesaan ini, tetapi anda tidak akan dapat menjalankan protokol dengan modul sehingga anda menentukurnya.)
Setelah anda melengkapkan penentukuran, Flex menyimpan data penentukuran dan nombor siri modul untuk kegunaan masa hadapan. Flex tidak akan menggesa anda untuk menentukur semula melainkan anda memadamkan data penentukuran untuk modul tersebut dalam tetapan robot. Anda boleh menghidupkan dan mematikan modul anda secara bebas, atau mengalihkannya ke slot dek lain, tanpa perlu menentukur semula. Jika anda ingin menentukur semula, anda boleh memulakan proses pada bila-bila masa dari kad modul dalam Apl Opentrons. (Penentukuran semula tidak tersedia daripada skrin sentuh.)
Bagaimana untuk menentukur modul
Arahan pada skrin sentuh atau dalam Aplikasi Opentrons akan membimbing anda melalui prosedur penentukuran. Secara umum langkah-langkahnya ialah:
1. Kumpulkan peralatan yang diperlukan, termasuk penyesuai penentukuran modul dan probe penentukuran pipet. 2. Letakkan penyesuai penentukuran pada permukaan modul dan pastikan ia sama rata.
Sesetengah modul mungkin memerlukan anda mengikat penyesuai pada modul. 3. Pasangkan probe kalibrasi pada pipet. 4. Flex akan bergerak secara automatik untuk menyentuh titik tertentu pada penyesuai penentukuran dan menyimpannya
nilai penentukuran untuk kegunaan masa hadapan.
Setelah penentukuran selesai dan anda telah mengeluarkan penyesuai dan probe, modul akan sedia untuk digunakan dalam protokol.
Pada bila-bila masa, anda boleh view dan urus data penentukuran modul anda dalam Apl Opentrons. Pergi ke Tetapan Robot untuk Flex anda dan klik pada tab Kalibrasi.
OPENRONS FLEX
69
BAB 4: MODUL
4.4 Modul Pemanas-Gegar GEN1
Ciri Pemanas-Shaker
PEMANASAN DAN BERGEGAR
Heater-Shaker menyediakan pemanasan di atas dek dan gegaran orbit. Modul boleh dipanaskan hingga 95 °C, dengan pro suhu berikutfile:
Julat suhu: 37 °C Kejituan suhu: ±95 °C pada 0.5 °C Keseragaman suhu: ±55 °C pada 0.5 °CRamp kadar: 10 °C/min
Modul boleh menggegarkan samples dari 200 hingga 3000 rpm, dengan pro goncangan berikutfile:
Diameter orbit: 2.0 mm Arah orbit: Julat kelajuan mengikut arah jam: 200 rpm Ketepatan kelajuan: ±3000 rpm
Modul ini mempunyai selak labware berkuasa untuk mengamankan plat pada modul sebelum digoncang.
70
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
PENYESUAIAN TERMA Penyesuai haba yang serasi diperlukan untuk menambah perisian makmal pada Pemanas-Shaker. Penyesuai boleh dibeli terus daripada Opentrons di https://shop.opentrons.com. Penyesuai Terma yang tersedia pada masa ini termasuk:
Penyesuai Rata Sejagat
Penyesuai PCR
Penyesuai Telaga Dalam
96 Penyesuai Bawah Rata
KAWALAN PERISIAN
Heater-Shaker boleh diprogramkan sepenuhnya dalam Protocol Designer dan Python Protocol API. API Python juga membenarkan langkah protokol lain dilakukan secara selari semasa Heater-Shaker aktif. Lihat Perintah tidak menyekat dalam dokumentasi API untuk mendapatkan butiran tentang menambah langkah selari pada protokol anda.
Di luar protokol, Apl Opentrons boleh memaparkan status semasa Heater-Shaker dan boleh mengawal terus pemanas, shaker dan selak labware.
OPENRONS FLEX
71
BAB 4: MODUL
Spesifikasi Heater-Shaker
Dimensi Berat Modul input kuasa Input penyesuai kuasa Bekalan sesalur voltage turun naik Overvoltage Penggunaan kuasa
152 × 90 × 82 mm (L/W/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategori II Melahu: 10 W
Biasa: Goncangan: 4 W Pemanasan: 11 W Pemanasan dan gegaran: 10 W
Keadaan persekitaran Suhu persekitaran Kelembapan relatif Ketinggian Tahap Pencemaran
Maksimum: 125 W Penggunaan dalaman sahaja 130 °C Sehingga 20%, tidak terkondensasi Sehingga 25 m dari aras laut 80
72
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
4.5 Blok Magnet GEN1
Ciri Blok Magnet
Opentrons Magnetic Block GEN1 ialah pemegang plat 96-telaga magnetik. Blok magnet digunakan dalam protokol yang bergantung pada kemagnetan untuk mengeluarkan zarah daripada ampaian dan mengekalkannya dalam plat perigi semasa mencuci, membilas atau prosedur elusi lain. Untuk example, penyediaan NGS automatik; menulenkan DNA, RNA, atau protein genomik dan mitokondria; dan prosedur pengekstrakan lain adalah semua kes penggunaan yang boleh melibatkan blok magnet.
KOMPONEN MAGNET
Blok Magnetik tidak berkuasa, tidak mengandungi sebarang komponen elektronik, dan tidak menggerakkan manik magnet ke atas atau ke bawah dalam larutan. Telaga terdiri daripada 96 magnet cincin neodymium berkekuatan tinggi yang dipasang pada katil bermuatan spring, yang membantu mengekalkan toleransi antara blok dan pipet semasa menjalankan protokol automatik.
KAWALAN PERISIAN
Blok Magnetik GEN1 boleh diprogramkan sepenuhnya dalam Pereka Protokol dan API Protokol Python.
OPENRONS FLEX
73
BAB 4: MODUL
Di luar protokol, bagaimanapun, skrin sentuh dan Apl Opentrons tidak mengetahui dan tidak dapat memaparkan status semasa Blok Magnetik GEN1. Ini adalah modul yang tidak berkuasa. Ia tidak mengandungi komponen elektronik atau mekanikal yang boleh berkomunikasi dengan robot Flex. Anda "mengawal" Blok Magnetik melalui protokol yang menggunakan Opentrons Flex Gripper untuk menambah dan mengalih keluar perisian makmal daripada modul ini.
Spesifikasi Blok Magnetik
Dimensi Berat Modul kuasa Gred magnet Keadaan persekitaran Suhu persekitaran Kelembapan relatif Ketinggian Darjah pencemaran
136 × 94 × 45 mm (L/W/H) 1.13 kg Tiada, modul tidak dikuasakan N52 neodymium Penggunaan dalam bangunan sahaja 20 °C 25%, tidak terkondensasi Sehingga 30 m dari aras laut 80
74
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
4.6 Modul Suhu GEN2
Ciri-ciri Modul Suhu
PEMANASAN DAN PENYEJUKAN
Modul Suhu Opentrons GEN2 ialah modul plat panas dan sejuk. Ia sering digunakan dalam protokol yang memerlukan pemanasan, penyejukan atau perubahan suhu. Modul boleh mencapai dan mengekalkan suhu antara 4 °C hingga 95 °C dalam beberapa minit, bergantung pada konfigurasi dan kandungan modul.
BLOK TERMA
Untuk memegang perisian makmal pada suhu, modul menggunakan blok haba aluminium. Modul ini dilengkapi dengan blok terma 24well dan 96-well. Kedi Modul Suhu dilengkapi dengan blok perigi dalam dan blok bawah rata yang direka untuk digunakan dengan Flex Gripper. Blok tersebut memuatkan tiub 1.5 mL dan 2.0 mL, plat PCR 96 telaga, jalur PCR, plat telaga dalam dan plat bawah rata.
OPENRONS FLEX
75
BAB 4: MODUL
Nota: Modul ini juga dihantar dengan blok bawah rata untuk OT-2. Jangan gunakan blok OT-2 dengan Flex. Blok bawah rata untuk Flex mempunyai perkataan "Opentrons Flex" pada permukaan atasnya. Yang untuk OT-2 tidak.
Blok haba 24-telaga
Blok haba 96-telaga
Blok haba telaga dalam
Blok haba bawah rata untuk Flex
MANDIAN AIR DAN PEMANASAN
Oleh kerana udara adalah penebat haba yang baik, jurang antara perisian makmal dan blok haba boleh menjejaskan prestasi suhu-masa ke suhu Modul Suhu. Meletakkan sedikit air dalam blok haba 24 atau 96 telaga menghilangkan jurang udara dan meningkatkan kecekapan pemanasan. Jumlah air yang ideal bergantung pada blok haba dan perkakasan makmal. Lihat Kertas Putih Modul Suhu untuk cadangan lanjut.
KAWALAN PERISIAN
Modul Suhu boleh diprogramkan sepenuhnya dalam Pereka Protokol dan API Protokol Python.
Di luar protokol, Apl Opentrons boleh memaparkan status semasa Modul Suhu dan boleh mengawal terus suhu plat permukaan.
76
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
Spesifikasi Modul Suhu
Dimensi Berat kuasa Modul
Keadaan persekitaran Suhu persekitaran Kelembapan relatif Ketinggian Tahap Pencemaran
194 × 90 × 84 mm (L/W/H) 1.5 kg Input: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Output: 4.0 VDC, 36 A, maks 6.1 W Penggunaan dalaman sahaja <219.6 °C (disyorkan untuk penyejukan optimum ) Sehingga 22%, tidak terkondensasi Sehingga 60 m di atas paras laut 2000
4.7 Modul Termosikal GEN2
OPENRONS FLEX
77
BAB 4: MODUL
Ciri-ciri Thermocycler
Opentrons Thermocycler Module GEN2 ialah mesin termosikal atas dek automatik sepenuhnya, menyediakan PCR bebas tangan dalam format plat 96-telaga. Tudung yang dipanaskan dan pengedap pakai buangnya muat rapat di atas pinggan, memastikan s cekapamppemanasan dan penyejatan minimum.
PEMANASAN DAN PENYEJUKAN Blok Thermocycler boleh memanaskan dan menyejukkan, dan penutupnya boleh memanaskan, dengan pro suhu berikutfile: Julat suhu blok terma: 4 °C Pemanasan maksimum blok terma ramp kadar: 4.25 °C/s dari ambien GEN2 hingga 95 °C Blok haba penyejukan maksimum ramp kadar: 2.0 °C/s dari 95 °C ke ambien Julat suhu penutup: 37 °C Ketepatan suhu penutup: ±110 °C Tudung automatik boleh dibuka atau ditutup mengikut keperluan semasa pelaksanaan protokol.
TERMOSIKAL PROFILES Thermocycler boleh melaksanakan profiles: berbasikal secara automatik melalui jujukan suhu blok untuk melakukan tindak balas sensitif haba.
PENGAUTOMASI GETAH Thermocycler dilengkapi dengan pengedap automasi getah untuk membantu mengurangkan penyejatan. Setiap meterai mesti disterilkan sebelum digunakan dan boleh digunakan untuk beberapa larian. Seal tambahan boleh dibeli terus daripada Opentrons di https://shop.opentrons.com.
KAWALAN PERISIAN Thermocycler boleh diprogramkan sepenuhnya dalam Protocol Designer dan Python Protocol API. Di luar protokol, Apl Opentrons boleh memaparkan status semasa Thermocycler dan boleh mengawal terus suhu blok, suhu penutup dan kedudukan penutup.
78
OPENRONS FLEX
BAB 4: MODUL
Spesifikasi termocycler
Dimensi (tutup terbuka) Dimensi (tutup tertutup) Berat (termasuk saluran belakang) Penyesuai kuasa voltage Penyesuai kuasa Overvol semasatage Keadaan persekitaran Suhu persekitaran Kelembapan relatif Ketinggian Keperluan pengudaraan
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/W/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/W/H) 8.4 kg 100 V pada 240/50 Hz 60 A Kategori II Penggunaan Dalaman hanya 8.5 °C (sadapan); 5 °C (boleh diterima) 20%, tidak pemeluwapan Sehingga 25 m di atas paras laut Sekurang-kurangnya 2 cm / 40 di antara unit dan dinding
OPENRONS FLEX
79
BAB 5
Makmal
Bab ini merangkumi item dalam Perpustakaan Opentrons Labware yang anda boleh gunakan dengan Opentrons Flex dan Opentrons Flex Gripper. Ia juga meliputi perisian makmal tersuai dan, untuk pengguna berkuasa kami, memautkan komponen perisian makmal kepada JSON yang sepadan file takrifan.
Anda boleh membeli perisian makmal daripada pengeluar peralatan asal atau dari kedai Opentrons di https://shop.opentrons.com. Dan, Opentrons sentiasa berusaha untuk mengesahkan definisi perisian makmal baharu. Lihat Perpustakaan Labware (dipautkan di atas) untuk penyenaraian terkini.
5.1 Konsep perisian makmal
Labware merangkumi lebih daripada sekadar objek yang diletakkan di atas dek dan digunakan dalam protokol. Untuk membantu anda memahami perisian makmal Opentrons, mari kita periksa topik ini dari tiga perspektif berbeza. Untuk Opentrons Flex, labware menyertakan item dalam Perpustakaan Labware kami, data yang mentakrifkan setiap bahagian labware, dan labware tersuai.
Labware sebagai perkakasan
Perpustakaan Labware termasuk semua yang anda boleh gunakan secara lalai dengan Opentrons Flex. Ini adalah komponen tahan lama dan item boleh guna yang anda gunakan, gunakan semula atau buang semasa menjalankan protokol. Anda tidak perlu mengambil sebarang langkah khas untuk bekerja dengan item dalam Perpustakaan Labware. Robot Flex tahu cara bekerja dengan segala-galanya dalam perpustakaan secara automatik.
Labware sebagai data
Maklumat Labware disimpan dalam notasi objek Javascript (JSON) files dengan .json file sambungan. JSON file termasuk dimensi spatial (panjang, lebar, tinggi), kapasiti isipadu (L, mL) dan metrik lain yang mentakrifkan ciri permukaan, bentuk dan lokasinya. Apabila menjalankan protokol, Flex membaca .json ini files untuk mengetahui perisian makmal apa yang ada pada dek dan cara untuk bekerja dengannya.
80
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Perisian makmal tersuai
Perisian makmal tersuai ialah perisian makmal yang tidak disertakan dalam Pustaka Labware atau perisian makmal yang dicipta oleh Pencipta Perisian Lab Perisian Tersuai. Walau bagaimanapun, kadangkala idea perisian makmal tersuai dibebani oleh tanggapan tentang kerumitan, perbelanjaan atau kesukaran. Tetapi, perisian makmal tersuai seharusnya tidak sukar untuk difahami atau dibuat. Mari luangkan sedikit masa untuk membongkar konsep perisian makmal tersuai.
Sebagai bekasampOleh itu, Perpustakaan Opentrons Labware termasuk plat 96-telaga (200 L) daripada Corning dan BioRad, tetapi pengeluar lain membuat plat perigi ini juga. Dan, terima kasih kepada piawaian industri yang diterima umum, perbezaan antara item makmal di mana-mana ini adalah kecil. Walau bagaimanapun, plat 200 L, 96-telaga biasa dari Stellar Scientific, Oxford Lab atau Krackeler Scientific (atau mana-mana pembekal lain dalam hal itu) ialah "perisian makmal tersuai" untuk Flex kerana ia tidak ditakrifkan sebelumnya dalam Perpustakaan Labware kami . Selain itu, perbezaan kecil dalam dimensi perisian makmal boleh memberi kesan drastik pada kejayaan protokol anda. Atas sebab ini, adalah penting untuk mempunyai definisi perisian makmal yang tepat untuk setiap perisian makmal yang anda mahu gunakan dalam protokol anda.
Selain itu, walaupun perisian makmal tersuai boleh menjadi kit esoterik, sekali sahaja, selalunya ia hanyalah petua, pinggan, tiub dan rak yang digunakan setiap hari di makmal di seluruh dunia. Sekali lagi, satu-satunya perbezaan antara perisian makmal Opentrons dan perisian makmal tersuai ialah item baharu tidak dipratakrifkan dalam perisian yang menggerakkan robot. Flex boleh, dan berfungsi, berfungsi dengan item perisian makmal asas lain atau sesuatu yang unik, tetapi anda perlu merekodkan ciri item itu dalam definisi perisian makmal JSON file dan import data tersebut ke dalam Apl Opentrons. Lihat bahagian Definisi Perisian Makmal Tersuai di bawah untuk mendapatkan maklumat lanjut.
Sebagai kesimpulan, labware termasuk:
Segala-galanya dalam Perpustakaan Opentrons Labware. Takrifan Labware: data dalam JSON file yang mentakrifkan bentuk, saiz dan keupayaan item individu
seperti pinggan perigi, petua, takungan, dsb. Perisian makmal tersuai, yang merupakan item yang tidak disertakan dalam Perpustakaan Labware.
Selepas semulaviewDalam konsep penting ini, mari kita periksa kategori dan item dalam Perpustakaan Opentrons Labware. Selepas itu, kita akan menghabiskan bab dengan tamatview daripada komponen data perisian makmal file dan ringkaskan ciri dan perkhidmatan Opentrons yang membantu anda mencipta perisian makmal tersuai.
OPENRONS FLEX
81
BAB 5: LABWARE
5.2 Takungan
Opentrons Flex berfungsi secara lalai dengan takungan tunggal dan berbilang perigi yang disenaraikan di bawah. Menggunakan takungan ini membantu mengurangkan beban kerja persediaan anda kerana ia sedia automasi di luar kotak. Maklumat takungan juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.
Takungan telaga tunggal
Spesifikasi Pengeluar
Agilent
290 mL V bahagian bawah
Aksigen
90 mL Bahagian bawah rata
SARANG
195 mL Bahagian bawah rata
290 mL V bahagian bawah
Nama beban API
tangkas_1_ takungan_290ml
axygen_1_ takungan_90ml
sarang_1_ takungan_195ml
sarang_1_ takungan_290ml
Takungan berbilang perigi
Spesifikasi Pengeluar
SARANG
12 telaga 15 mL/telaga V bawah
Saintifik Amerika Syarikat
12 telaga 22 mL/telaga V bawah
Nama beban API nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml
82
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Takungan dan takrifan API
Perpustakaan Opentrons Labware mentakrifkan ciri-ciri takungan yang disenaraikan di atas dalam JSON berasingan files. Robot dan Opentrons Python API bergantung pada takrifan JSON ini untuk berfungsi dengan perisian makmal yang digunakan oleh protokol anda. Untuk exampOleh itu, apabila bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama perisian makmal ini sebagai parameter yang sah dalam kod anda. Nama beban API terpaut bersambung ke takrifan perisian makmal takungan dalam repositori Opentrons GitHub.
Perisian makmal takungan tersuai
Cuba cipta definisi perisian makmal tersuai dengan Pencipta Labware Opentrons jika takungan yang anda ingin gunakan tidak disenaraikan di sini. Definisi tersuai menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasiti volumetrik dan maklumat lain dalam JSON file. Opentrons Flex memerlukan maklumat ini untuk memahami cara bekerja dengan perisian makmal tersuai anda. Lihat bahagian Definisi Perisian Makmal Tersuai untuk mendapatkan maklumat lanjut.
5.3 Pinggan perigi
Opentrons Flex berfungsi secara lalai dengan plat perigi yang disenaraikan di bawah. Menggunakan plat perigi ini membantu mengurangkan beban kerja persediaan anda kerana ia sedia automasi di luar kotak. Maklumat plat perigi juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.
OPENRONS FLEX
83
BAB 5: LABWARE
6-plat perigi
Pengeluar Corning
Spesifikasi
6 telaga 16.8 mL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
Nama beban API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12-plat perigi
Pengeluar Corning
Spesifikasi
12 telaga 6.9 mL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
Nama beban API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24-plat perigi
Pengeluar Corning
Spesifikasi
24 telaga 3.4 mL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
Nama beban API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48-plat perigi
Pengeluar Corning
Spesifikasi
48 telaga 1.6 mL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
Nama beban API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
96-plat perigi
Pengeluar Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
Saintifik Amerika Syarikat
Spesifikasi
96 telaga 200 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah V
96 telaga 360 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
96 telaga 100 µL/telaga Telaga bulat, V bawah skirt penuh PCR
96 telaga 200 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah rata
96 telaga dalam 2000 µL/telaga Telaga persegi, bahagian bawah V
Telaga 96 tegar 200 µL/telaga Telaga bulat, skirt penuh PCR bawah V
Telaga dalam Nunc 96 1300 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah U
Telaga dalam Nunc 96 2000 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah U
96 telaga dalam 2.4 mL/telaga Telaga persegi, bahagian bawah U
Nama beban API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ skirt
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENRONS FLEX
85
BAB 5: LABWARE
384-plat perigi
Bio-Rad Gunaan Biosistem Pengeluar
Corning
Spesifikasi
384 telaga 40 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah V
384 telaga 50 µL/telaga Telaga bulat, bahagian bawah V
384 telaga 112 µL/telaga Telaga persegi, bahagian bawah rata
Nama beban API digunakanbiosistemmikroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Penyesuai plat telaga
Plat aluminium yang disenaraikan di bawah ialah penyesuai haba untuk modul Opentrons Heater-Shaker GEN1. Anda boleh menggunakan takrifan penyesuai kendiri ini untuk memuatkan perisian makmal Opentron yang disahkan atau tersuai di atas Heater-Shaker.
Jenis penyesuai Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter
Nama beban API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Anda juga boleh memuatkan kedua-dua penyesuai dan perisian makmal dengan satu definisi. Perpustakaan Labware kami termasuk beberapa penyesuai terma pra-konfigurasi dan gabungan perisian makmal yang menjadikan Heater-Shaker sedia untuk digunakan terus dari kotak.
86
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Nota: Jangan gunakan definisi gabungan jika anda perlu mengalihkan perisian makmal ke atas atau luar daripada Heater-Shaker semasa protokol anda, sama ada dengan pencengkam atau secara manual. Sebaliknya, gunakan definisi penyesuai kendiri.
Gabungan penyesuai/perisian makmal
Nama beban API
Penyesuai Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker dengan NEST Deep Well Plate 2 mL
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Penyesuai Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker dengan NEST 96 Well Plate 200 µL Flat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter dengan NEST Well Plate 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter dengan Corning 384 Well Plate 112 µL Flat
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Penyesuai boleh dibeli terus daripada Opentrons di https://shop.opentrons.com.
Plat perigi dan definisi API
Perpustakaan Opentrons Labware mentakrifkan ciri plat perigi yang disenaraikan di atas dalam JSON berasingan files. Robot Flex dan Opentrons Python API bergantung pada takrifan JSON ini untuk berfungsi dengan perisian makmal yang digunakan oleh protokol anda. Untuk exampOleh itu, apabila bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama perisian makmal ini sebagai parameter yang sah dalam kod anda. Nama beban API yang dipautkan bersambung ke definisi perisian lab plat telaga dalam repositori Opentrons GitHub.
Perisian makmal plat perigi tersuai
Cuba gunakan Opentrons Labware Creator untuk membuat definisi labware tersuai jika plat perigi yang anda ingin gunakan tidak disenaraikan di sini. Definisi tersuai menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasiti volumetrik dan maklumat lain dalam JSON file. Opentrons Flex membaca maklumat ini untuk memahami cara bekerja dengan perisian makmal tersuai anda. Lihat bahagian Definisi Perisian Makmal Tersuai untuk mendapatkan maklumat lanjut.
OPENRONS FLEX
87
BAB 5: LABWARE
5.4 Petua dan rak hujung
Petua Opentrons Flex terdapat dalam saiz 50 µL, 200 µL dan 1000 µL. Ini adalah petua polipropilena yang jelas dan tidak mengalir yang tersedia dengan atau tanpa penapis. Ia dibungkus steril dalam rak yang mengandungi 96 hujung dan bebas daripada DNase, RNase, protease, pirogen, DNA manusia, endotoksin dan perencat PCR. Rak juga termasuk nombor lot dan tarikh luput.
Petua pipet fleksibel berfungsi dengan pipet Opentrons Flex 50 µL dan 1000 µL dalam konfigurasi 1-, 8- dan 96 saluran. Walaupun anda boleh meletakkan mana-mana petua Flex pada pipet 50 L dan 1000 L, cuba padankan hujung dengan kapasiti undian pipet. Untuk exampOleh itu, mungkin pelik untuk meletakkan hujung 1000 L pada pipet 50 L. Untuk pipet 1000 L, anda pasti boleh menggunakan hujung 50 L, 200 L atau 1000 L.
Rak petua
Petua yang tidak ditapis dan ditapis digabungkan ke dalam rak yang terdiri daripada plat asas boleh guna semula, plat tengah yang memuatkan 96 hujung dan penutup.
Rak hujung mengikut isipadu 50 µL 200 µL 1000 µL
Nama beban API
Tidak ditapis: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Ditapis: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Tidak ditapis: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Ditapis: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Tidak ditapis: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Ditapis: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Untuk membantu dengan pengenalan, rak hujung plat tengah dikodkan warna berdasarkan saiz hujung:
50 µL: magenta 200 L: kuning 1000 µL: biru
88
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Apabila memesan atau menyusun semula, petua dan rak datang dalam dua konfigurasi pakej yang berbeza:
Rak: Terdiri daripada rak hujung berbalut mengecut secara berasingan (plat asas, plat tengah dengan hujung dan penutup). Konfigurasi racked adalah terbaik apabila kebersihan diutamakan, untuk mengelakkan pencemaran silang atau apabila protokol anda tidak membenarkan plat asas atau penggunaan semula komponen.
Isi semula: Terdiri daripada satu rak hujung lengkap (plat asas, plat tengah dengan hujung dan penutup) dan bekas hujung individu. Konfigurasi isi semula adalah yang terbaik apabila protokol anda membenarkan penggunaan semula plat asas atau komponen.
Keserasian tippipet
Petua pipet fleksibel direka untuk pipet Opentrons Flex. Petua Flex tidak serasi ke belakang dengan pipet Opentrons OT-2, dan anda juga tidak boleh menggunakan petua OT-2 pada pipet Flex.
Petua standard industri lain mungkin berfungsi dengan pipet Flex, tetapi ini tidak disyorkan. Untuk memastikan prestasi optimum, anda hanya perlu menggunakan petua Opentrons Flex dengan pipet Flex.
Penyesuai rak hujung
Pipet 96 saluran memerlukan penyesuai untuk memasang rak penuh petua dengan betul. Semasa prosedur pemasangan, pipet bergerak ke atas penyesuai, menurunkan dirinya ke pin pelekap, dan menarik hujung ke pipet dengan mengangkat penyesuai dan rak hujung.
OPENRONS FLEX
89
BAB 5: LABWARE
Nota: Hanya gunakan penyesuai rak hujung apabila mengambil rak penuh petua sekaligus. Letakkan rak hujung terus di geladak apabila mengambil lebih sedikit petua.
Amaran: Bahaya titik cubitan. Jauhkan tangan daripada penyesuai rak hujung semasa pipet memasang hujung pipet.
Jenis penyesuai Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
Nama beban API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Penyesuai rak hujung serasi dengan Opentrons Flex Gripper. Anda boleh menggunakan pencengkam untuk meletakkan rak hujung baru pada penyesuai atau untuk mengambil dan memindahkan rak hujung terpakai ke dalam pelongsor sisa.
5.5 Tiub dan rak tiub
Sistem Rak Tiub Opentrons 4-dalam-1 berfungsi dengan Opentrons Flex secara lalai. Menggunakan rak tiub 4-dalam-1 membantu mengurangkan beban kerja persediaan anda kerana kombinasi yang disediakannya sedia automasi terus dari kotak. Maklumat lanjut juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.
90
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Gabungan tiub dan rak
Rak tiub Opentrons 4-dalam-1 menyokong pelbagai jenis saiz tiub, secara tunggal atau dalam kombinasi saiz (isipadu) yang berbeza. Ini termasuk: rak 6-tiub untuk tiub 50 mL (6 x 50 mL). Rak gabungan 10 tiub untuk empat tiub 50 mL dan enam tiub 15 mL (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). Rak 15 tiub untuk tiub 15 mL (15 x 15 mL). Rak 24 tiub untuk tiub 0.5 mL, 1.5 mL atau 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Nota: Semua tiub adalah silinder dengan bahagian bawah berbentuk V (kon) melainkan dinyatakan sebaliknya.
Rak 6 tiub
Jenis tiub 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
Rak 10 tiub
Jenis tiub 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL
Nama beban API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENRONS FLEX
91
BAB 5: LABWARE
Rak 15 tiub
Jenis tiub 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
Nama beban API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
Rak 24 tiub
Jenis tiub
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, bahagian bawah berbentuk U 24 generik 2 mL screw cap 24 NEST 0.5 mL screw cap 24 NEST 1.5 mL screw cap 24 NEST 1.5 mL screw cap 24 NEST 2 mL screw cap 24 NEST 2 mL screw cap NEST XNUMX mL penutup snap, bahagian bawah berbentuk U
Nama beban API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Takrifan API rak tiub
Perpustakaan Opentrons Labware mentakrifkan ciri-ciri rak tiub yang disenaraikan di atas dalam JSON berasingan files. Robot Flex dan Opentrons Python API bergantung pada takrifan JSON ini untuk berfungsi dengan perisian makmal yang digunakan oleh protokol anda. Untuk exampOleh itu, apabila bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama perisian makmal ini sebagai parameter yang sah dalam kod anda. Nama beban API terpaut disambungkan ke definisi perisian makmal rak tiub dalam repositori Opentrons GitHub.
92
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Perisian makmal rak tiub tersuai
Cuba cipta definisi perisian makmal tersuai menggunakan Pencipta Labware Opentrons jika gabungan tiub dan rak yang anda ingin gunakan tidak disenaraikan di sini. Definisi tersuai menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasiti volumetrik dan maklumat lain dalam JSON file. Opentrons Flex membaca maklumat ini untuk memahami cara bekerja dengan perisian makmal tersuai anda. Lihat bahagian Definisi Perisian Makmal Tersuai untuk mendapatkan maklumat lanjut.
5.6 Blok aluminium
Blok aluminium dihantar dengan Modul Suhu GEN2 dan boleh dibeli secara berasingan sebagai set tiga keping. Set ini termasuk plat bawah rata, blok 24-telaga, dan blok 96-telaga.
Opentrons Flex menggunakan blok aluminium untuk memegang samptiub dan plat perigi pada Modul Suhu atau terus di geladak. Apabila digunakan dengan Modul Suhu, blok aluminium boleh mengekalkan s andaamptiub, jalur PCR, atau plat pada suhu malar antara 4 °C dan 95 °C.
Plat bawah rata
Plat bawah rata untuk Flex dihantar dengan kedi Modul Suhu dan serasi dengan pelbagai plat perigi standard ANSI/SLAS. Plat rata ini berbeza daripada plat yang dihantar dengan Modul Suhu itu sendiri atau set tiga keping yang berasingan. Ia mempunyai permukaan kerja yang lebih luas dan klip sudut berchamfered. Ciri-ciri ini membantu meningkatkan prestasi Opentrons Flex Gripper apabila mengalihkan perisian makmal ke atas atau luar pinggan.
Anda boleh mengetahui plat bawah rata yang anda miliki kerana plat untuk Flex mempunyai perkataan "Opentrons Flex" pada permukaan atasnya. Yang untuk OT-2 tidak.
OPENRONS FLEX
93
BAB 5: LABWARE
Blok aluminium 24 telaga
Blok 24-telaga digunakan dengan s individuample vials. Untuk example, ia menerima sample vials bahawa:
Mempunyai bahagian bawah berbentuk V atau U. Selamatkan kandungan dengan penutup snap atau penutup skru. Pegang cecair dalam kapasiti 0.5 mL, 1.5 mL dan 2 mL.
Blok aluminium 96 telaga
Blok 96-telaga menyokong pelbagai jenis plat telaga. Untuk example, ia menerima plat telaga iaitu:
Daripada pengeluar plat telaga utama seperti Bio-Rad dan NEST.
Direka dengan bahagian bawah berbentuk V, bahagian bawah berbentuk U atau bahagian bawah rata.
Direka dengan telaga 100 µL atau 200 µL.
Ia juga serasi dengan jalur PCR generik.
Penyesuai kendiri
Blok haba Flex plat bawah rata 24-telaga blok aluminium 96-telaga blok aluminium
Nama beban API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Lihat gabungan perisian makmal di bawah. opentrons_96_well_aluminium_block
Gabungan perkakas makmal blok aluminium
Perpustakaan Opentrons Labware menyokong gabungan blok, vial dan plat perigi berikut, yang juga ditakrifkan dalam definisi perisian makmal JSON yang berasingan files. Robot Flex dan Opentrons Python API
94
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
bergantung pada takrifan JSON ini untuk berfungsi dengan perisian makmal yang digunakan oleh protokol anda. Untuk exampOleh itu, apabila bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama perisian makmal ini sebagai parameter yang sah dalam kod anda. Jadual di bawah menyenaraikan gabungan blok/bekas lalai dan nama beban API yang berkaitan. Pautan bersambung ke definisi JSON yang sepadan dalam repositori Opentrons GitHub.
Nota: Semua tiub mempunyai bahagian bawah berbentuk V melainkan dinyatakan sebaliknya.
Kombinasi perkakas makmal blok aluminium 24 perigi
Kandungan blok 24-telaga Generik 2 mL penutup skru NEST 0.5 mL penutup skru NEST 1.5 mL skru penutup NEST 1.5 mL penutup skru NEST 2 mL skru penutup NEST 2 mL penutup skru, bahagian bawah berbentuk U
Nama beban API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snap_lubang_bukak_sarang_24ml_snap 2_aluminiumblock_nest_24ml_snapcap
Kombinasi perkakas makmal blok aluminium 96 perigi
Kandungan blok telaga 96 Plat perigi Bio-Rad 200 µL Jalur PCR generik 200 µL plat perigi NEST 100 µL
Nama beban API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENRONS FLEX
95
BAB 5: LABWARE
5.7 Labware dan Opentrons Flex Gripper
Walaupun Opentrons Flex berfungsi dengan semua inventori dalam Perpustakaan Labware, Opentrons Flex Gripper serasi dengan item perisian makmal tertentu sahaja. Pada masa ini, Gripper dioptimumkan untuk digunakan dengan item perisian makmal berikut.
Kategori Labware Plat Telaga Dalam Berskirt Penuh 96 Plat Telaga
Rak Petua (petua tidak ditapis dan ditapis)
Jenama
NEST 96 Plat Telaga Dalam 2 mL
Opentrons Tough 96 Well Plate 200 µL PCR Skirt Penuh NEST 96 Well Plate 200 µL Flat
Rak Petua Opentrons Flex 96 50 µL Rak Petua Opentrons Flex 96 200 µL Rak Petua Opentrons Flex 96 1000 µL
Nota: Untuk hasil terbaik, gunakan Flex Gripper hanya dengan perisian makmal yang disenaraikan di atas. Flex Gripper mungkin berfungsi dengan perisian makmal mematuhi automasi ANSI/SLAS lain, tetapi ini tidak disyorkan.
5.8 Takrifan perisian makmal tersuai
Seperti yang dibincangkan pada permulaan bab ini, perisian makmal tersuai ialah perisian makmal yang tidak disenaraikan dalam Perpustakaan Opentrons Labware. Anda boleh menggunakan item labware biasa atau unik lain dengan Flex dengan mengukur dan merekodkan ciri objek itu dengan tepat dan menyimpan data tersebut dalam JSON file. Apabila diimport ke dalam apl, Flex dan API menggunakan data JSON itu untuk berinteraksi dengan perisian makmal anda. Opentrons menyediakan alatan dan perkhidmatan, yang akan kami periksa di bawah, untuk membantu anda menggunakan Flex dengan perisian makmal tersuai.
96
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
Mencipta definisi perisian makmal tersuai
Alat dan perkhidmatan Opentrons membantu meletakkan perisian makmal tersuai dalam jangkauan anda. Ciri-ciri ini menampung tahap kemahiran dan cara kerja yang berbeza. Mencipta perisian makmal anda sendiri, dan menggunakannya dengan Opentrons Flex, membantu menjadikan robot sebagai tambahan yang serba boleh dan berkuasa untuk makmal anda.
PENCIPTA PERANGKAT MAKMAL TERSUAI
Pencipta Labware Tersuai ialah tanpa kod, web-alat berasaskan yang menggunakan antara muka grafik untuk membantu anda mencipta definisi perisian makmal file. Labware Creator menghasilkan definisi labware JSON file yang anda import ke dalam Apl Opentrons. Selepas itu, perisian makmal tersuai anda tersedia untuk robot Flex dan API Python.
PERKHIDMATAN LABWARE TERSUAI
Hubungi kami jika perisian makmal yang anda ingin gunakan tidak tersedia dalam pustaka, jika anda tidak boleh membuat takrifan anda sendiri atau kerana item tersuai termasuk bentuk, saiz atau penyelewengan lain yang diterangkan di bawah.
Labware yang anda boleh tentukan dalam Labware Creator
; Telaga dan tiub adalah seragam dan serupa. ; Semua baris dijarakkan sama rata
(ruang antara baris adalah sama).
; Semua lajur dijarakkan sama rata (ruang antara lajur adalah sama).
; Sesuai dengan sempurna dalam satu slot dek.
Labware Opentrons perlu mentakrifkan; Bentuk telaga dan tiub berbeza-beza. ; Baris tidak sama rata.
; Lajur tidak sama rata.
; Lebih kecil daripada satu slot dek (memerlukan penyesuai) atau merentangi berbilang slot dek.
OPENRONS FLEX
97
BAB 5: LABWARE
Berikut ialah beberapa rajah yang membantu anda menggambarkan bekasamples yang diterangkan di atas. Biasa Semua lajur dijarakkan sama rata dan semua baris dijarakkan sama rata. Lajur tidak perlu mempunyai jarak yang sama dengan baris.
Biasa Grid tidak perlu berada di tengah-tengah perisian makmal.
Baris Tidak Sekata adalah sama rata tetapi lajur tidak sama rata.
Lajur/baris tidak teratur adalah sama rata tetapi telaga tidak sama.
Tidak Teratur Terdapat lebih daripada satu grid.
Pasukan labware kami akan berusaha untuk memahami keperluan anda dan mereka bentuk definisi labware tersuai untuk anda. Lihat artikel sokongan Meminta Definisi Perisian Makmal Tersuai dan borang Permintaan Perisian Makmal Tersuai untuk maklumat lanjut. Ini adalah perkhidmatan berasaskan bayaran.
98
OPENRONS FLEX
BAB 5: LABWARE
API PYTHON
Walaupun anda tidak boleh mencipta perisian makmal tersuai dengan API kami, anda boleh menggunakan perisian makmal tersuai dengan kaedah API yang tersedia. Walau bagaimanapun, anda perlu menentukan perisian makmal tersuai anda terlebih dahulu dan mengimportnya ke dalam Apl Opentrons. Sebaik sahaja anda telah menambahkan perisian makmal anda pada Apl Opentrons, ia tersedia untuk API Python dan robot. Lihat bahagian Definisi Perisian Makmal Tersuai dalam dokumentasi API Python untuk mendapatkan maklumat lanjut. Untuk mendapatkan maklumat tentang menulis skrip protokol dengan API, lihat bahagian API Protokol Python dalam bab Pembangunan Protokol.
Skema perisian makmal JSON
JSON file ialah pelan tindakan untuk perisian makmal standard dan tersuai Opentrons. ini file mengandungi dan menyusun data perisian makmal mengikut spesifikasi reka bentuk yang ditetapkan oleh skema lalai.
Skema ialah bingkai
Dokumen / Sumber
![]() |
opentrons FLEX FLEX Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka Opentrons Flex [pdf] Manual Arahan Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka FLEX Opentrons Flex, FLEX, Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka Opentrons Flex, Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka Flex, Robot Pengendalian Cecair Sumber Terbuka, Robot Pengendalian Cecair Sumber, Robot Pengendalian Cecair, Robot Pengendalian, Robot |