FLEX Opentrons Flex Open Source væskehåndteringsrobot
“
Opentrons Flex
Spesifikasjoner:
- Generelle spesifikasjoner: Lorem ipsum dolor sitte
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Miljøspesifikasjoner: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Sertifiseringer: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Serienummer: XXX-XXXX-XXXX
Produktbruksinstruksjoner:
1. Instrumentinstallasjon og kalibrering:
Følg trinnene som er skissert i manualen for pipette og griper
installasjon.
2. Flytting:
For korte trekk, se avsnitt 2.5 i håndboken. Til
trekk på lang avstand, følg retningslinjene. Generell flytting
råd er også tilgjengelig.
3. Tilkoblinger:
Sørg for riktig strømtilkobling som beskrevet i håndboken.
Koble til USB og tilleggsenheter etter behov. Nettverkstilkoblinger
bør etableres etter instruksjonene.
4. Protokolldesigner:
Forstå kravene til Protocol Designer og lær hvordan
å designe nye protokoller eller endre eksisterende i henhold til laboratoriet ditt
krav.
5. Python Protocol API:
Utforsk å skrive og kjøre skript ved hjelp av Python Protocol API.
Oppdag Python-eksklusive funksjoner for forbedret funksjonalitet.
6. OT-2-protokoller:
Lær om OT-2 Python-protokoller, OT-2 JSON-protokoller og
Magnetiske modulprotokoller for forskjellige typer eksperimenter.
Ofte stilte spørsmål (FAQ):
Spørsmål: Hvordan feilsøker jeg hvis roboten ikke beveger seg som
forventet?
A: Sjekk strømtilkoblingen, sørg for riktig kalibrering av
instrumenter, og kontroller at det ikke er noen hindringer i
robotens vei.
Spørsmål: Kan jeg bruke tilpassede pipetter med Opentrons Flex?
A: Opentrons anbefaler å bruke kompatible pipetter for optimal
ytelse og nøyaktighet.
"`
Opentrons Flex
Bruksanvisning
Opentrons Labworks Inc.
desember 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Registrerte navn, varemerker osv. brukt i dette dokumentet, selv når de ikke er spesifikt merket som sådan, skal ikke anses som ubeskyttet ved lov.
Innholdsfortegnelse
Forord . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Strukturen til denne håndboken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Merknader og advarsler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Kapittel 1 Introduksjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Velkommen til Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Hva er nytt i Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flex arbeidsstasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Sikkerhetsinformasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Sikkerhetssymboler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elektriske sikkerhetsadvarsler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Ytterligere sikkerhetsadvarsler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Sikkerhetsregler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologisk sikkerhet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Giftige gasser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Brannfarlige væsker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Overholdelse av forskrifter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Sikkerhet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetisk kompatibilitet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC advarsler og merknader . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Canada ISED-samsvar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Miljøadvarsel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi forhåndssertifisering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Kapittel 2: Installasjon og flytting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Sikkerhets- og driftskrav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Hvor skal Opentrons Flex plasseres . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Strømforbruk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Miljøforhold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Utboksing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Innsats og tid som kreves . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Kasse og emballasjemateriale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Produktelementer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Del 1: Fjern kassen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Del 2: Slipp Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Del 3: Sluttmontering og strøm på . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Første kjøring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Slå på . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Koble til et nettverk eller datamaskin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Installere programvareoppdateringer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Fest nødstoppshengsel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Gi roboten et navn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instrumentinstallasjon og kalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipetteinstallasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Installasjon av griper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Flytting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Korte trekk. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Langdistansetrekk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Generelle flytteråd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Siste tanker om flytting. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Kapittel 3: Systembeskrivelse. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fysiske komponenter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Ramme og kabinett . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Dekk og arbeidsområde . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging området. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Dekkinnredning. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Avfallsrenne. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging område spor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Bevegelsessystem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Berøringsskjerm og LED-skjermer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipetter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipettespesifikasjoner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipettekalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipettespiss stativadapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Henting av delvis tips . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipettesensorer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipettefastvareoppdateringer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Griper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Griper spesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Griperkalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripper-fastvareoppdateringer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Nødstopp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Når skal nødstoppet brukes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Aktivere og frigjøre nødstoppet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Tilkoblinger . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Strømtilkobling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB- og tilleggstilkoblinger . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Nettverkstilkoblinger . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Systemspesifikasjoner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Generelle spesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Miljøspesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sertifiseringer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serienummer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Kapittel 4: Moduler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Støttede moduler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modulcaddiesystem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Modulkalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Når moduler skal kalibreres. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Hvordan kalibrere moduler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Heater-shaker modul GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker funksjoner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker spesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetisk blokk GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetiske blokkfunksjoner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Spesifikasjoner for magnetblokker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperaturmodul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperaturmodulfunksjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperaturmodulspesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Termosyklermodul GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Termosyklerfunksjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Termosyklerspesifikasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Kapittel 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Labware-konsepter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware som maskinvare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware som data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Tilpasset labvare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Reservoarer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer med én brønn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer med flere brønner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer og API-definisjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Tilpasset reservoar labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Brønnplater . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-brønns plater. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-brønns plater . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-brønns plater . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-brønners plater. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-brønns plater . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-brønns plater . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Brønnplateadaptere. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Brønnplater og API-definisjoner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Spesialtilpasset brønnplate labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Spisser og tippstativer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tipsstativer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tippipette-kompatibilitet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Tipsstativadapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Rør og rørstativ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Rør- og stativkombinasjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6-rørs stativer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 10-rørs stativer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15-rørs stativer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24-rørs stativer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 API-definisjoner for rørstativ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Tilpasset laboratorieutstyr for rørstativ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminiumsblokker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Flat bunnplate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-brønners aluminiumsblokk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-brønners aluminiumsblokk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Frittstående adaptere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Labwarekombinasjoner av aluminiumblokker . . . . . . . . . . . . . . . .94 24-brønners laboratorieutstyrskombinasjoner av aluminiumblokk . . . . . . . . .95 96-brønners laboratorieutstyrskombinasjoner av aluminiumblokk . . . . . . . . .95 5.7 Labware og Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Egendefinerte definisjoner av laboratorievare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Opprette egendefinerte laboratorievaredefinisjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON labware-skjema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON-labwaredefinisjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Kapittel 6: Protokollutvikling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Forhåndsdefinerte protokoller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protokollbibliotek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Tjeneste for utvikling av tilpasset protokoll . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protokolldesigner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolldesignerkrav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Utforme en protokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Endre eksisterende protokoller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Skrive og kjøre skript . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Python-eksklusive funksjoner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2-protokoller. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python-protokoller. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON-protokoller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetiske modulprotokoller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Kapittel 7: Programvare og drift. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Berøringsskjermdrift. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Robotdashbord . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protokollhåndtering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protokolldetaljer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Kjør oppsett . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Posisjonskontroll for laboratorieutstyr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Kjørefremgang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Fullføring av kjøring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Instrumentstyring. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Robotinnstillinger. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Dekkkonfigurasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Appinstallasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Overføre protokoller til Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Modulstatus og kontroller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Nylige protokollkjøringer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Avansert drift . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Kommandolinjeoperasjon over SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Kapittel 8: Vedlikehold og service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Rengjøre Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Før du begynner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Hva du kan rengjøre . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Rengjøringsløsninger. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Rengjøring av karm og vinduspanel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Dekkrengjøring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Gantry rengjøring. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Rensing av avfallssjakt. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Rengjøring av pipetter og spisser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pipettesanering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Rengjøring av pipettespisser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Rengjøring av griperen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Rengjøringsmoduler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Generell modulrengjøring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler tetninger. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Autoklavsikkert laboratorieutstyr . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Service Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons-tjenester . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Installasjonskvalifisering og driftskvalifisering . . . 155 Forebyggende vedlikehold . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garanti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Vedlegg A: Ordliste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Vedlegg B: Tilleggsdokumentasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API-dokumentasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API-referanse. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Utviklerdokumentasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Vedlegg C: Programvare med åpen kildekode . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons på GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Andre depoter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Vedlegg D: Støtte og kontaktinformasjon . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Salg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Støtte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Bedriftsinformasjon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Forord
Velkommen til bruksanvisningen for Opentrons Flex væskehåndteringsrobot. Denne håndboken guider deg gjennom omtrent alt du trenger å vite for å sette opp og bruke Flex, med fokus på emner som er mest relevante for hverdagsbrukere av Flex i et laboratoriemiljø.
Strukturen til denne håndboken
Opentrons Flex er et komplekst system, så det er mange forskjellige veier for å lære alt det kan gjøre. Gå gjerne rett til kapittelet som tar for seg det emnet du er nysgjerrig på! For eksample, hvis du allerede har en Flex satt opp i laboratoriet ditt, kan du hoppe forbi kapittelet Installasjon og flytting.
Hvis du foretrekker en veiledet tilnærming, er denne håndboken strukturert slik at du kan følge den fra begynnelse til slutt.
Lær om Flex. De karakteristiske trekk ved Flex er oppført i kapittel 1: Introduksjon. Innledningen inneholder også viktig informasjon om sikkerhet og forskrifter.
Kom i gang med Flex. Hvis du trenger å sette opp din Flex, følg de detaljerte instruksjonene i kapittel 2: Installasjon og flytting. Gjør deg så kjent med komponentene til Flex i kapittel 3: Systembeskrivelse.
Sett opp dekket ditt. Konfigurering av kortstokken muliggjør ulike vitenskapelige applikasjoner på Flex. Kapittel 4: Moduler beskriver Opentrons periferiutstyr som du kan installere i eller på toppen av dekket for å utføre spesifikke vitenskapelige oppgaver. Kapittel 5: Labware forklarer hvordan man arbeider med utstyr for oppbevaring av væsker.
Kjør en protokoll. Kjernebruken av Flex er å kjøre standardiserte vitenskapelige prosedyrer, kjent som protokoller. Kapittel 6: Protokollutvikling tilbyr flere måter å skaffe ferdige protokoller eller designe dem selv. For å kjøre protokollen, følg instruksjonene i Kapittel 7: Programvare og drift, som også har instruksjoner for å utføre andre oppgaver og tilpasse robotens innstillinger.
Hold Flex i gang. Følg rådene i kapittel 8: Vedlikehold og service for å holde Flex ren og kjøre optimalt. Eller registrer deg for en av Opentrons-tjenestene som er oppført der, og la oss ta oss av Flex for deg.
Lær enda mer. Trenger du fortsatt noe annet? Se vedleggene. Vedlegg A: Ordliste definerer Flex-relaterte termer. Vedlegg B: Tilleggsdokumentasjon viser deg til enda flere ressurser for Opentrons produkter og skriving av kode for å kontrollere Flex.
OPENTRONS FLEX
9
FORORD
Vedlegg C: Programvare med åpen kildekode forklarer hvordan Opentrons programvare er vert på GitHub som en ressurs for både utviklere og ikke-utviklere.
Vedlegg D: Støtte og kontaktinformasjon viser hvordan du kommer i kontakt med Opentrons hvis du trenger hjelp utover det vår dokumentasjon gir.
Merknader og advarsler
I denne håndboken finner du spesielt formaterte notat- og advarselsblokker. Merknader gir nyttig informasjon som kanskje ikke er åpenbar i den vanlige bruken av Flex. Vær spesielt oppmerksom på advarslene – de brukes kun i situasjoner der du risikerer personskade, skade på utstyr, tap eller ødeleggelse avampfiler eller reagenser, tap av data eller annen skade. Merknader og advarsler ser slik ut:
Sample Merk: Dette er noe du burde vite, men det utgjør ingen fare.
Sample Advarsel: Dette er noe du trenger å vite fordi det er risiko forbundet med det.
10
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1
Introduksjon
Dette kapittelet introduserer deg til Opentrons Flex-økosystemet, inkludert den generelle systemdesignen og tilgjengelige arbeidsstasjonskonfigurasjoner. Den inneholder også viktig samsvars- og sikkerhetsinformasjon, som du bør ta igjenview før du setter opp Opentrons Flex-roboten. For mer informasjon om funksjonene til Opentrons Flex, se kapittelet Systembeskrivelse.
1.1 Velkommen til Opentrons Flex
Opentrons Flex er en væskehåndteringsrobot designet for høy gjennomstrømning og komplekse arbeidsflyter. Flex-roboten er basen i et modulært system som inkluderer pipetter, en griper for laboratorieutstyr, dekksfester, moduler på dekk og laboratorieutstyr – alt dette kan du bytte ut selv. Flex er designet med en berøringsskjerm slik at du kan jobbe med den direkte på laboratoriebenken, eller du kan kontrollere den fra hele laboratoriet med Opentrons-appen eller våre åpen kildekode-APIer.
Flex-arbeidsstasjoner kommer med alt utstyret – robot, maskinvare og labware – som du trenger for å komme i gang med å automatisere vanlige laboratorieoppgaver. For andre applikasjoner kjører Opentrons Flex på fullstendig åpen kildekode-programvare og fastvare, og er reagens- og labware-agnostisk, noe som gir deg kontroll over hvordan du designer og kjører protokollene dine.
Hva er nytt i Flex
Opentrons Flex er en del av Opentrons væskehåndteringsserie av roboter. Brukere av Opentrons Flex kan være kjent med Opentrons OT-2, vår personlige pipetteringsrobot. Flex går utover mulighetene til OT-2 på flere nøkkelområder, og leverer høyere gjennomstrømning og gangtid.
Funksjon Pipettegjennomstrømning
Pipette- og spisskapasitet
Beskrivelse
Flex-pipetter har 1, 8 eller 96 kanaler. 96-kanals pipetten opererer på 12 ganger så mange brønner på en gang som den største OT-2 pipetten.
Flex-pipetter har større volumområder (1 µL, 50 µL) og kan alle fungere med et hvilket som helst volum av Opentrons Flex-spisser. Dette er en forbedring i forhold til OT-5-pipetter, som har mindre rekkevidde og må bruke spisser med et matchende volumområde.
OPENTRONS FLEX
11
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Griper Automatisk kalibrering Berøringsskjerm Modul caddies Dekksporkoordinater Bevegelig søppel Størrelse og vekt
Opentrons Flex Gripper plukker opp og flytter laboratorieutstyr rundt på dekket automatisk, uten brukerintervensjon. Griperen muliggjør mer komplekse arbeidsflyter innenfor en enkelt protokollkjøring.
Posisjonskalibrering av Flex-pipetter og griperen er helautomatisert. Trykk på én knapp, og instrumentet vil bevege seg til presisjonsbearbeidede punkter på dekket for å bestemme dens nøyaktige posisjon, og lagre disse dataene for bruk i protokollene dine.
Flex har sitt eget berøringsskjermgrensesnitt som lar deg styre det direkte, i tillegg til å bruke Opentrons-appen. Bruk berøringsskjermen til å starte protokollkjøringer, sjekke jobbstatus og endre innstillinger direkte på roboten.
Flex-moduler passer inn i caddier som opptar plass under dekk. Caddies plasserer laboratorieutstyret nærmere dekkoverflaten og gir mulighet for kabelføring under dekk. Caddies muliggjør enda flere modul- og laboratoriekonfigurasjoner på dekket.
Dekkspor på Flex er nummerert med et koordinatsystem (A1D4) som ligner på hvordan brønner er nummerert på laboratorieutstyr.
Søppelkassen kan gå på flere dekkplasseringer på Flex. Standardplasseringen (spor A3) er den anbefalte plasseringen. Du kan også bruke griperen til å kaste søppel i den valgfrie avfallsrennen.
Flex er litt større og mye tyngre enn OT-2. Installasjonsoppgaver på Flex krever bistand fra en laboratoriepartner.
En detaljert sammenligning av robotens tekniske spesifikasjoner er tilgjengelig på Opentrons webnettstedet.
Både Flex- og OT-2-roboter kjører på vår åpen kildekode-programvare, og Opentrons-appen kan kontrollere begge typer roboter samtidig. Selv om OT-2-protokoller ikke kan kjøres direkte på Flex, er det enkelt å tilpasse dem (se delen OT-2-protokoller i kapittelet om protokollutvikling for detaljer).
Flex arbeidsstasjoner
Opentrons Flex-arbeidsstasjoner inkluderer Flex-roboten, tilbehør, pipetter og griper, moduler på dekk og laboratorieutstyr som trengs for å automatisere en bestemt applikasjon. Alle arbeidsstasjonskomponenter er modulære. Hvis du trenger å endre applikasjoner, kan du legge til eller bytte inn annen Flex-maskinvare og kompatible forbruksvarer.
12
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1: INNLEDNING
NGS ARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex NGS Workstation automatiserer NGS-bibliotekets forberedelse. Den kan automatisere arbeidsflyter for forhåndssekvensering ved å bruke et hvilket som helst ledende reagenssystem, inkludert fragmenterings- og tagmentasjonsbasert bibliotekforberedelse.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer NGS Workstation:
Griper Valg av pipettekonfigurasjon
To 8-kanals pipetter (1 µL og 50 5 µL) 1000-kanals pipette (96 5 µL) avfallssjakt magnetisk blokktemperaturmodul Thermocycler Module Labware-sett med filterspisser, mikrosentrifugerør, reservoarer og PCR-plater
PCR-ARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex PCR Workstation automatiserer PCR-oppsett og termosykling arbeidsflyter i opptil 96 samples. Den kan alikvotere kjølte reagenser og samples inn i en 96-brønners PCR-plate. Med tillegg av den automatiserte Thermocycler-modulen, bruk griperen til å laste platen inn i Thermocycler, og kjør deretter ditt valgte PCR-program.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer PCR-arbeidsstasjonen:
Griper Valg av pipettekonfigurasjon
1-kanals pipette (1 µL) og 50-kanals pipette (8 µL) 1-kanals pipette (50 µL) avfallssjakttemperaturmodul Labware-sett med filterspisser, mikrosentrifugerør, reservoarer og PCR-plater
OPENTRONS FLEX
13
KAPITTEL 1: INNLEDNING
NUKLEINSYRE EKSTRAKSJONSARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation automatiserer DNA/RNA-isolering og rensing. Den bruker magnetblokken for separering av magnetiske perler, og Heater-Shaker for s.ample lysis og resuspensjon av magnetiske perler.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer Nucleic Acid Extraction Workstation:
Griper Valg av pipettekonfigurasjon
1-kanals pipette (5 1000 µL) og 8-kanals pipette (5 1000 µL) 96-kanals pipette (5 1000 µL) avfallssjakt Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware-sett med filterspisser, reservoarer, PCR-plater og dypbrønnplater
MAGNETISK PERLE PROTEIN RENSINGSARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatiserer småskala proteinrensing og proteomikkampforberedelse i opptil 96 samples. Den er kompatibel med mange populære magnetiske perlebaserte reagenser.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer Protein Purification Workstation:
Griper Valg av pipettekonfigurasjon
1-kanals pipette (5 1000 µL) og 8-kanals pipette (5 1000 µL) 96-kanals pipette (5 1000 µL) avfallssjakt Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware-sett med filterspisser, reservoarer, PCR-plater og dypbrønnplater
FLEX PREP ARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex Prep Workstation automatiserer enkle pipetteringsarbeidsflyter. Konfigurer arbeidsstasjonen med 1-kanals og 8-kanals pipetter for å utføre oppgaver som f.eks.ample overføring, sample duplisering, og
14
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1: INNLEDNING
reagens-alikvotering. Konfigurer arbeidsstasjonen med 96-kanals pipette for å utføre reagensalikvotering med høy gjennomstrømning og platest.amping.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer Flex Prep Workstation:
Valg av pipettekonfigurasjon: 1-kanals pipette (5 µL) og 1000-kanals pipette (8 µL) 5-kanals pipette (1000 µL)
Labware-sett med filterspisser, mikrosentrifugerør og reservoarer
PLASMID PREP ARBEIDSSTASJON
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatiserer magnetisk-perlebaserte plasmidekstraksjons- og rensearbeidsflyter. Denne arbeidsstasjonen er utstyrt med pipetter med høyt volum, en Heater-Shaker-modul og en magnetisk blokk for å imøtekomme det meste av perlebasert kjemi.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer Plasmid Prep Workstation:
Gripper 1-kanals pipette (5 1000 µL) og 8-kanals pipette (5 1000 µL) avfallssjakt Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware-sett med filterspisser, mikrosentrifugerør, reservoarer, PCR-plater og dypbrønnplater
SYNBIO WORKSTATION
Opentrons Flex SynBio Workstation automatiserer en rekke syntetiske biologi-arbeidsflyter som DNA-syntese og kloning. Den bruker magnetblokken og temperaturmodulen for å støtte det meste av perlebasert kjemi. Legg til Thermocycler-modulen for å utføre oppvarmede lokkinkubasjoner og amplifikasjoner.
I tillegg til Flex-roboten inkluderer SynBio Workstation:
Gripper 1-kanals pipette (5 µL) og 1000-kanals pipette (8 µL) magnetisk blokktemperaturmodul
OPENTRONS FLEX
15
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Labware-sett med vanlige og filterspisser, mikrosentrifugerør, reservoarer, PCR-plater og dypbrønnplater
1.2 Sikkerhetsinformasjon
Opentrons Flex væskehåndteringsrobot er designet for sikker drift. Se spesifikasjonene og samsvarsretningslinjene i denne delen for å sikre sikker bruk av din Flex. Disse retningslinjene dekker sikker bruk av inngangs- og utgangstilkoblinger for produktet, inkludert strøm- og datatilkoblinger, samt advarselsetiketter som finnes på Flex-roboten og relatert maskinvare. Bruk av enheten på en annen måte enn de som er spesifisert i denne håndboken kan sette brukeren og utstyret i fare.
Sikkerhetssymboler
Ulike etiketter på Flex og i denne håndboken advarer deg om kilder til potensiell skade eller skade.
Symbol
Beskrivelse
Advarsel: Varsler brukere om potensielt farlige forhold. Handlinger som kan føre til personskade eller død.
Forsiktig: Advarer brukere mot skade på utstyret. Tapte eller ødelagte data. Uopprettelig avbrudd av operasjonen som utføres.
Elektrisk støt: Identifiserer instrumentkomponenter som kan utgjøre en risiko for elektrisk støt hvis instrumentet håndteres på feil måte.
Varm overflate: Identifiserer instrumentkomponenter som utgjør en risiko for personskade på grunn av høy varme/temperaturer hvis instrumentet håndteres feil.
Klempunkt: Identifiserer instrumentkomponenter som kan utgjøre en risiko for personskade når de er i bevegelse.
16
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Du finner følgende etiketter på Flex:
Etiketter for åndsverk Samsvarsetiketter (f.eks. ETL) Elektriske fareetiketter Generelle advarselsetiketter Produktetiketter Klempunktetiketter Høy volumtage-etiketter Effektetiketter
Elektriske sikkerhetsadvarsler
Følg alltid følgende elektriske sikkerhetsadvarsler:
Symbol
Beskrivelse
Koble roboten til en jordet klasse 1-krets. Se avsnittet Strømtilkobling i kapittelet Systembeskrivelse.
Ikke koble til (plug til), koble fra (kopple fra) eller bruk AC-strømkabler hvis: Kabelen er frynsete eller skadet. Andre tilkoblede kabler, ledninger eller kontakter er frynsete eller skadet.
Bruk av skadede strømledninger kan forårsake elektrisk støt som resulterer i alvorlig skade eller skade på roboten.
Ikke bytt ut vekselstrømkabelen med mindre du er i anvisning fra Opentrons Support.
For mer informasjon om elektriske krav, se delen Strømforbruk i kapittelet Installasjon og flytting.
OPENTRONS FLEX
17
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Ytterligere sikkerhetsadvarsler
Følg alltid følgende ekstra sikkerhetsadvarsler:
Symbol
Beskrivelse
Opentrons Flex er ikke sertifisert for bruk med eksplosive eller brennbare væsker. Ikke legg plater, rør eller hetteglass som inneholder eksplosive eller brennbare væsker inn i roboten eller bruk instrumentet på annen måte med eksplosive eller brennbare væsker i kabinettet.
Bruk god laboratoriepraksis og følg produsentens forholdsregler når du arbeider med kjemikalier. Opentrons er ikke ansvarlig eller ansvarlig for skader på grunn av, eller som et resultat av, bruk av farlige kjemikalier.
Flex veier 88.5 kg (195 lbs). Som et resultat krever det to personer for å løfte og flytte det trygt. Se avsnittet Flytting i kapittelet Installasjon og flytting.
Flex bør plasseres på en overflate som er i stand til å bære vekten på 88.5 kg (195 lbs) med tilstrekkelig overflate til å romme roboten pluss dens minste klaringsavstand (20 cm/8 in). Se avsnittet Sikkerhets- og driftskrav i kapittelet Installasjon og flytting.
Flex kan avgi vibrasjoner mens den er i drift. Plasser roboten på en overflate som er solid, jevn og vannavstøtende med tverravstivende eller sveisede skjøter. Se avsnittet Sikkerhets- og driftskrav i kapittelet Installasjon og flytting.
Sikkerhetsregler
Følg disse forholdsreglene for å beskytte Flex mot skade:
18
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Symbol
Beskrivelse
Bruk labware som er ANSI/SLAS-kompatibel eller godkjent av Opentrons. Se kapittelet Labware.
Hold etsende materialer, midler eller andre skadelige materialer unna roboten.
Biologisk sikkerhet
Behandle prøver og reagenser som inneholder materialer tatt fra mennesker som potensielt smittefarlige stoffer. Opentrons anbefaler å bruke sikre laboratorieprosedyrer som forklart i Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6. utgave.
Under normale omstendigheter skaper ikke Flex påvisbare aerosoler fra kildevæsker. Men under visse forhold er det mulig å generere aerosoler fra kildevæsker. Når du bruker biosikkerhetsnivå 2 eller høyere kildevæsker, bør du vurdere å ta forholdsregler mot aerosoleksponering, i samsvar med lokale reguleringsorganer. For å minimere den potensielle risikoen for aerosoleksponering fra roboten, sørg for at du:
Utfør vedlikehold som beskrevet i kapittelet Vedlikehold og service. Installer og fest alle instrumentdeksler, pipetter, moduler og laboratorieutstyr på riktig måte. Bruk riktig pipeteringsteknikk for å hjelpe til med å redusere aerosoler.
Giftige gasser
Hvis du jobber med flyktige løsemidler eller giftige stoffer, bruk et effektivt laboratorieventilasjonssystem for å fjerne eventuelle damper som kan produseres.
Brannfarlige væsker
Flex har ikke blitt evaluert for bruk med brennbare væsker og bør ikke brukes med brennbare væsker.
OPENTRONS FLEX
19
KAPITTEL 1: INNLEDNING
1.3 Overholdelse av forskrifter
Opentrons Flex overholder alle gjeldende krav i følgende sikkerhets- og elektromagnetiske standarder.
Sikkerhet
Regel-ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Tittel
Sikkerhetskrav for elektrisk utstyr for måling, kontroll og laboratoriebruk Del 1: Generelle krav
Spesielle krav til laboratorieutstyr for blanding og omrøring
Elektromagnetisk kompatibilitet
Regel-ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Part 15 Subpart B Klasse A IC ICES-003
Tittel
Elektrisk utstyr for måling, kontroll og laboratoriebruk EMC-krav Del 1: Generelle krav Utilsiktede radiatorer
Spektrumstyring og telekommunikasjonsforstyrrelser som forårsaker utstyr Standard informasjonsteknologiutstyr (inkludert digitalt apparat)
FCC advarsler og merknader
Advarsel: Endringer eller modifikasjoner av denne enheten som ikke er uttrykkelig godkjent av Opentrons, kan ugyldiggjøre brukerens rett til å bruke utstyret.
Denne enheten er i samsvar med del 15 av FCC-reglene. Driften er underlagt følgende:
20
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 1: INNLEDNING
Denne enheten kan ikke forårsake skadelig interferens. Denne enheten må akseptere all interferens som mottas, inkludert interferens som kan forårsake uønskede
operasjon.
Merk: Dette utstyret er testet og funnet å være i samsvar med grensene for en digital enhet i klasse A, i henhold til del 15 av FCC-reglene. Disse grensene er utformet for å gi rimelig beskyttelse mot skadelig interferens når utstyret brukes i et kommersielt miljø. Dette utstyret genererer, bruker og kan utstråle radiofrekvensenergi, og hvis det ikke er installert og brukt i samsvar med bruksanvisningen, kan det forårsake skadelig interferens på radiokommunikasjon. Bruk av dette utstyret i et boligområde vil sannsynligvis forårsake skadelig interferens, i så fall vil brukeren bli pålagt å korrigere interferensen for egen regning.
Canada ISED-samsvar
Canada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Dette produktet oppfyller gjeldende tekniske spesifikasjoner for Canada for Innovation, Science and Economic Development.
Present produit est conforme aux spesifikasjonsteknikker som gjelder for Innovation, Sciences og Development économique Canada.
Miljøadvarsel
Advarsel: Kreft og reproduktiv skade www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi forhåndssertifisering
Wi-Fi-modulen er forhåndssertifisert for bruk i mange regioner:
USA (FCC): FCC Identifikator UAY-W8997-M1216 European Economic Area (CE): Ingen offentlig identifikator (egenerklæring) Canada (IC): Maskinvareversjon Identifikasjonsnummer W8997-M1216 Japan (TELEC): Sertifisert nummer 020-170034 India (WPC): Registreringsnummer ETA-SD-20191005525 (egenerklæring)
OPENTRONS FLEX
21
KAPITTEL 2
Installasjon og flytting
Dette kapittelet beskriver hvordan du forbereder laboratoriet for Opentrons Flex, hvordan du setter opp roboten og hvordan du flytter den om nødvendig. Før du mottar din Flex, sørg for at laboratoriet eller anlegget ditt oppfyller alle kriteriene i delen Sikkerhets- og driftskrav. Når det er på tide å få Flex opp og gå, følg de detaljerte instruksjonene i delene Unboxing, First Run og Instrument Installation and Calibration, eller bruk Opentrons Onsite Support Setup-tjenesten. Og hvis du noen gang trenger å flytte din Flex til en ny plassering, nær eller fjern, følg trinnene i Flytting-delen.
2.1 Sikkerhets- og driftskrav
Hvor skal Opentrons Flex plasseres
Plass er en verdifull vare i nesten alle laboratorier. Flex kommer til å trenge litt – men ikke for mye, siden den er designet for å passe på halvparten av en standard laboratoriebenk. Sørg for at du har en plass som oppfyller følgende kriterier.
Benkeoverflate: Stasjonær, solid, jevn, vannavstøtende overflate. Bord eller benker med hjul (selv låsende hjul) anbefales ikke. Flex beveger seg raskt og har mye masse, som kan riste eller ubalanse lette eller bevegelige bord.
Vektbærende: Roboten alene veier 88.5 kg (195 lb) og skal bare løftes av to personer som jobber sammen. Plasser roboten på en overflate som lett kan bære vekten pluss vekten av eventuelle moduler, laboratorieutstyr, væsker eller annet laboratorieutstyr som skal brukes i applikasjonene dine.
Driftsrom: Robotens basedimensjoner er 87 cm B x 69 cm D x 84 cm H (ca. 34" x 27" x 33"). Flex trenger 20 cm (8") side- og bakklaring for kabler, USB-tilkoblinger og for å fjerne eksos fra moduler som varmer og avkjøler.
Advarsel: Ikke plasser sidene eller baksiden av Flex i flukt mot en vegg.
22
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
84 cm 33"
87 cm 34"
Opentrons Flex base dimensjoner.
69 cm 27"
20 cm 8"
20 cm 8"
20 cm 8"
Topp view av Opentrons Flex, som viser minimum side- og ryggklaring.
OPENTRONS FLEX
23
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Strømforbruk
Opentrons Flex bør kobles til et vegguttak på eller i nærheten av benken hvor du installerer den. Koble kun Flex til kretser som kan håndtere maksimalt strømforbruk:
Inngangseffekt: 36 VDC, 6.1 A Tomgangsforbruk: 30 W Typisk forbruk: 40 W (under protokollkjøring) Maksimalt forbruk: Omtrent 50 W
Nøyaktig strømforbruk avhenger av:
Mengden og typen bevegelse utført under en protokoll. Hvor lang tid roboten bruker inaktiv. Status for lysene på roboten. Hvor mange instrumenter er festet.
Husk å ta hensyn til annen elektronikk som bruker strøm på samme krets, inkludert Flex-moduler med egne strømforsyninger. For eksampI tillegg har Thermocycler-modulen et maksimalt strømforbruk (630 W) som er mye større enn selve Flex-roboten. Om nødvendig, ta kontakt med lederen av anlegget ditt for å sikre at det oppfyller utstyrets strømkrav.
Miljøforhold
Miljøforholdene for anbefalt bruk, akseptabel bruk og lagring varierer:
Anbefalt for systemdrift
Akseptabelt for systemdrift
Omgivelsestemperatur +20 til +25 °C
+2 til +40 °C
Relativ fuktighet Høyde
40 %, ikke-kondenserende
Omtrent 500 moh
30 %, ikke-kondenserende (under 80 °C)
Opp til 2000 moh
Lagring og transport
-10 til +60 °C
10 %, ikke-kondenserende (under 85 °C)
Opp til 2000 moh
24
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Opentrons har validert ytelsen til Opentrons Flex under forholdene som anbefales for systemdrift, og drift under disse forholdene bør gi optimale resultater. Flex er trygt å bruke under forhold som er akseptable for systemdrift, men resultatene kan variere. Ikke slå på eller bruk Flex under forhold utenfor disse grensene. Oppbevarings- og transportbetingelsene gjelder kun når roboten er fullstendig frakoblet strøm og annet utstyr.
2.2 Unboxing
Gratulerer! Din Opentrons Flex har ankommet og du har forberedt en plass for den i laboratoriet. La oss åpne den monsterkassen, fjerne roboten og klargjøre den for drift. Informasjonen i denne delen gir en deleliste og instruksjoner som leder deg gjennom trinnene som kreves for å få Flex utpakket, konfigurert og klar til bruk. Vi har delt oppsettsprosedyren i tre deler:
Del 1 dekker demontering av kassen. Del 2 tar for seg å løsne Flex fra kassen og flytte den til et endelig monteringssted. Del 3 dekker sluttmontering og slå på roboten for første gang.
Innsats og tid kreves
Du bør be en laboratoriepartner om å hjelpe med utboksing, løfting, flytting og montering. Du må budsjettere rundt 30 minutter til en time for denne innsatsen.
Merk: Flex krever to personer for å løfte den ordentlig. Å løfte og bære Flex i håndtakene er også den beste måten å flytte roboten på.
Kasse og emballasjemateriale
Å pakke ut en Flex gir deg en fantastisk robot, men du sitter også igjen med flere store kassepaneler sammen med diverse fraktkomponenter og polstring. Selv om du kan forkaste dette materialet, oppfordrer vi deg til å beholde disse varene hvis lagringsplass er tilgjengelig. Emballasjen er gjenbrukbar, noe som hjelper deg med å forberede Flex for frakt hvis du noen gang trenger å sende den et annet sted (f.eks. til en konferanse eller et nytt anlegg) i fremtiden.
OPENTRONS FLEX
25
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Produktelementer
Flex leveres med komponentene som er oppført nedenfor. Pipetter, griperen og modulene kommer i separat emballasje fra Flex hovedkassen, selv om du kjøpte dem sammen som en arbeidsstasjon.
(1) Opentrons Flex-robot
(1) USB -kabel
(1) Strømkabel
(1) Ethernet-kabel
(5) L-nøkler (12 mm sekskant, 1.5 mm sekskant, 2.5 mm sekskant, 3 mm sekskant,
T10 Torx)
(1) Nødstopp-anheng
(1) Dekkspor med klemmer for laboratorieutstyr
(4) Reserveklemmer for laboratorieutstyr
(1) Pipettekalibreringssonde
(4) Bærehåndtak og hetter
(1) Øverste vinduspanel
(4) Sidevinduspaneler
(1) 2.5 mm sekskantskrutrekker
(1) 19 mm skiftenøkkel
(16 + reservedeler) Vinduskruer (M4x8 mm flatt hode)
26
(10) Ekstra dekksporskruer (M4x10 mm pipehode)
(12) Reservedekkklemmeskruer (M3x6 mm pipehode)
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Del 1: Fjern kassen
Opentrons sender din Flex i en solid kryssfinerkasse. Fraktkassen bruker krok og lås clamps for å feste topp-, side- og bunnpanelene sammen. Å bruke låser, i stedet for spiker eller skruer, betyr at du ikke trenger et brekkjern (eller mye kraft) for å demontere kassen, og du kan sette den sammen senere, om nødvendig.
Merk: Kassekanter kan bli grove opp under frakt. Det kan være lurt å bruke arbeidshansker for å beskytte hendene mot tresplinter.
For å frigjøre låsene, vipp låsetappen opp og vri den til venstre (mot klokken). Denne handlingen flytter clamp armen ut av den tilsvarende festebraketten. Du kan deretter vippe låsearmen vekk fra kassen.
1 Lås opp de åtte låsene som holder toppen til sidene.
2 Fjern topppanelet etter at du har løsnet låsene.
OPENTRONS FLEX
27
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING 3 Klipp opp den blå forsendelsesposen, fjern disse gjenstandene fra polstringen og legg dem til side:
Brukersett Strøm-, Ethernet- og USB-kabler Nødstopp-anheng
4 Fjern den øverste delen av skumpolstringen for å avdekke vinduspanelene. Polstringen beskytter side- og topppanelene.
5 Fjern vinduspanelene og sett dem til side. Disse legger du ved senere.
28
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
6 Lås opp de resterende 16 låsene som holder sidepanelene til hverandre og bunnen av kassen. 7 Fjern sidepanelene og sett dem til side.
Del 2: Slipp Flex
Etter å ha fullført trinnene i del 1, bør du nå se en robot som er i en beskyttende pose og festet til oransje stålmonteringskomponenter. Posen omslutter roboten og beskytter den mot ytre miljø. Stålbraketter fester roboten til bunnen av kassen. To fraktrammer støtter roboten, fordeler vekten jevnt og holder den stiv slik at den ikke forvrider seg under frakt. Fortsett å pakke ut Flex og få den av kassebasen.
8 Bruk 19 mm skiftenøkkelen fra brukersettet til å løsne brakettene fra kassebunnen. Du kan kaste brakettene, eller lagre dem for fremtidig bruk.
OPENTRONS FLEX
29
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING 9 Trekk eller rull forsendelsesposen helt ned for å eksponere hele roboten.
10 Med hjelp fra laboratoriepartneren din, ta tak i håndtakene i de oransje forsendelsesrammene på hver side av robotens base, løft Flex av kassebasen og sett den ned på gulvet. Lagre eller kast kassebunnen og fraktrammen.
30
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING 11 Bruk den 12 mm sekskantede L-nøkkelen fra brukersettet, fjern de fire boltene som holder fraktrammene til
Flex. Lagre eller kast rammene og boltene.
12 Fjern de fire aluminiumshåndtakene fra brukersettet. Skru håndtakene på de samme stedene som holdt 12 mm fraktrammeboltene.
OPENTRONS FLEX
31
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
13 Med hjelp fra laboratoriepartneren din, løft Flex i bærehåndtakene og flytt den til en arbeidsbenk for sluttmontering.
Del 3: Sluttmontering og strøm på
Etter å ha flyttet Flex til et midlertidig arbeidsområde, eller dets permanente hjem, er det på tide å legge siste hånd på din nye robot.
14 Hvis du har flyttet roboten til det endelige arbeidsstedet, fjern bærehåndtakene og sett dem tilbake med etterbehandlingshettene. Hettene lukker håndtaksåpningene i rammen og gir roboten et rent utseende. Sett håndtakene tilbake i brukersettet for oppbevaring.
32
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
15 Ta opp topp- og sidepanelene fra pakkeskummet du legger til side etter at du har fjernet kassetoppen.
16 Monter vinduspanelene på Flex ved å følge merkingsinformasjonen på den fremre beskyttelsesfilmen. Fjern deretter beskyttelsesfilmen.
17 Bruk de skrå vindusskruene og 2.5 mm skrutrekkeren fra brukersettet til å feste vinduspanelene til Flex. Sørg for at de skrå (V-formede) hullene i vinduspanelene vender ut (mot deg). Dette gjør at skruene kan passe i flukt med overflaten av vinduet.
Advarsel: Feil orientering av panelene kan føre til skade. For høyt skrumoment kan sprekke panelene. Stram skruene for hånd til vinduspanelene er rimelig sikre. Dette er ikke en styrkeprøve.
OPENTRONS FLEX
33
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING 18 Bruk en 2.5 mm skrutrekker fra brukersettet til å fjerne låseskruene fra portalen. Disse
skruer hindrer portalen i å bevege seg under transport. Gantry-låseskruene er plassert: På venstre sideskinne nær fronten av roboten. Under den vertikale portalarmen. På høyre sideskinne nær fronten av roboten i en oransje brakett. Det er to skruer her.
Portalen beveger seg lett for hånd etter at alle transportskruene er fjernet. 19 Klipp og fjern de to gummibåndene som holder søppelkassen på plass under transport.
34
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
20 Koble strømledningen til Flex og koble den til stikkontakten. Sørg for at dekksområdet er fritt for hindringer. Vri strømbryteren bak på venstre side av roboten. Når portalen er slått på, flytter den til hjemmeposisjonen, og berøringsskjermen viser ytterligere konfigurasjonsinstruksjoner.
Nå som din Flex er ute av esken og klar til bruk, fortsett til First Run-delen nedenfor.
2.3 Første kjøring
Utfør grunnleggende oppsett på berøringsskjermen før du kobler annen maskinvare til Flex. Roboten vil veilede deg gjennom å koble til laboratorienettverket ditt, oppdatere til den nyeste programvaren og tilpasse Flex ved å gi den et navn.
Slå på
Når du slår på Flex, vil Opentrons-logoen vises på berøringsskjermen. Etter noen få øyeblikk vil den vise "Velkommen til din Opentrons Flex"-skjerm.
Opentrons Flex velkomstskjerm. Du skal bare se denne skjermen når du starter Flex for første gang.
OPENTRONS FLEX
35
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Koble til et nettverk eller datamaskin
Følg instruksjonene på berøringsskjermen for å koble roboten til slik at den kan se etter programvareoppdateringer og motta protokoll files. Det er tre tilkoblingsmetoder: Wi-Fi, Ethernet og USB.
Alternativer for nettverkstilkobling. Du må ha internettforbindelse for å sette opp Flex. Wi-Fi: Bruk berøringsskjermen til å koble til Wi-Fi-nettverk som er sikret med WPA2 personlig autentisering (de fleste nettverk som bare krever et passord for å bli med, faller under denne kategorien).
Merk: Flex støtter ikke captive portaler (nettverk som ikke har et passord, men laster inn en webside for å autentisere brukere etter tilkobling).
Du kan også koble til et åpent Wi-Fi-nettverk, men dette anbefales ikke.
Advarsel: Kobling til et åpent Wi-Fi-nettverk vil tillate alle innen rekkevidde av nettverkssignalet å kontrollere Opentrons Flex-roboten uten autentisering.
Hvis du trenger å koble til et Wi-Fi-nettverk som bruker bedriftsautentisering (inkludert "eduroam" og lignende akademiske nettverk som krever brukernavn og passord), kobler du først til Opentrons-appen via Ethernet eller USB for å fullføre det første oppsettet. Koble deretter til bedriftens Wi-Fi-nettverk i nettverksinnstillingene for Flex. Slik får du tilgang til nettverksinnstillingene:
36
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
1. Klikk på Enheter i venstre sidefelt i Opentrons-appen. 2. Klikk på menyen med tre prikker () for Flex og velg Robotinnstillinger. 3. Klikk på fanen Nettverk.
Velg nettverket ditt fra rullegardinmenyen eller velg "Bli med i annet nettverk ..." og skriv inn SSID. Velg bedriftsautentiseringsmetoden som nettverket ditt bruker. De støttede metodene er:
EAP-TTLS med TLS EAP-TTLS med MS-CHAP v2 EAP-TTLS med MD5 EAP-PEAP med MS-CHAP v2 EAP-TLS
Hver av disse metodene krever et brukernavn og passord, og avhengig av din eksakte nettverkskonfigurasjon kan det kreves sertifikat files eller andre alternativer. Se anleggets IT-dokumentasjon eller kontakt IT-ansvarlig for detaljer om nettverksoppsettet.
Ethernet: Koble roboten til en nettverkssvitsj eller hub med en Ethernet-kabel. Du kan også koble direkte til Ethernet-porten på datamaskinen, fra robotsystemversjon 7.1.0.
USB: Koble den medfølgende USB A-til-B-kabelen til robotens USB-B-port og en åpen port på datamaskinen. Bruk en USB B-til-C-kabel eller en USB A-til-C-adapter hvis datamaskinen din ikke har en USB-A-port.
For å fortsette med oppsettet, må den tilkoblede datamaskinen ha Opentrons-appen installert og kjøre. For detaljer om installasjon av Opentrons-appen, se avsnittet om appinstallasjon i kapittelet Programvare og drift.
Installer programvareoppdateringer
Nå som du har koblet til et nettverk eller en datamaskin, kan roboten se etter programvare- og fastvareoppdateringer og laste dem ned om nødvendig. Hvis det er en oppdatering, kan det ta noen minutter å installere. Når oppdateringen er fullført, vil roboten starte på nytt.
OPENTRONS FLEX
37
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Fest nødstoppshengsel
Koble det medfølgende nødstopphenget (nødstopp) til en ekstra port (AUX-1 eller AUX-2) på baksiden av roboten.
Før og etter tilkobling av nødstopphengeren.
Det er obligatorisk å feste og aktivere nødstoppet for å feste instrumenter og kjøre protokoller på Flex. For mer informasjon om bruk av nødstoppet under robotdrift, se delen Nødstopphenger i kapittelet Systembeskrivelse.
Gi roboten din et navn
Ved å navngi roboten din kan du enkelt identifisere den i laboratoriemiljøet ditt. Hvis du har flere Opentrons-roboter på nettverket ditt, sørg for å gi dem unike navn. Når du har bekreftet robotens navn, vil du bli tatt til Opentrons Flex Dashboard. Det neste trinnet du vil ta er sannsynligvis å feste instrumenter, som er dekket i neste avsnitt.
2.4 Instrumentinstallasjon og kalibrering
Etter innledende robotoppsett er neste trinn å feste instrumenter til roboten og kalibrere dem.
For å installere et instrument, trykk først på Instrumenter på berøringsskjermen eller gå til delen Pipetter og moduler på enhetens detaljskjerm i Opentrons-appen. Velg et tomt feste og velg enten Fest pipette eller Fest griper. Hvis holderen du vil bruke allerede er opptatt, må du først ta av pipetten eller griperen.
38
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Merk: Den generelle installasjonsprosessen er den samme uavhengig av om du bruker berøringsskjermen eller Opentrons-appen. Uansett hvilken enhet du begynner på vil kontrollere installasjonsprosessen til du fullfører eller avbryter den.
Hvis du begynner på berøringsskjermen, vil appen vise roboten som "opptatt". Hvis du begynner i appen, vil berøringsskjermen vise en modal som indikerer at instrumentinstallasjonen pågår.
Den nøyaktige installasjonsprosessen varierer avhengig av instrumentet du kobler til, som dekket i avsnittene nedenfor. Alle instrumenter har en automatisert kalibreringsprosedyre, som du bør utføre umiddelbart etter installasjon.
Installasjon av pipette
Når du installerer en pipette, vil du bli guidet gjennom følgende trinn på berøringsskjermen eller i Opentrons-appen.
1. VELG PIPETTETYPE Velg mellom 1- eller 8-kanals pipette og 96-kanals pipette. Å feste 96-kanals pipetten krever noen få ekstra trinn fordi den festes til en spesiell monteringsplate som spenner over begge pipettefestene.
2. FORBEREDELSE FOR INSTALLASJON Fjern laboratorieutstyr fra dekket og ryd opp i arbeidsområdet for å gjøre feste og kalibrering enklere. Samle også nødvendig utstyr, for eksempel kalibreringssonden, sekskantskrutrekkeren og monteringsplaten (for 96-kanals pipetten).
3. KOBLE TIL OG SIKRE PIPETTEN Gantryet vil bevege seg til fronten av roboten slik at du kan feste pipetten.
1- og 8-kanals pipetter kobles direkte til en pipettefeste. 96-kanals pipetten krever en monteringsplate. For å feste monteringsplaten må du først koble fra z-aksevognen for høyre pipettefeste.
OPENTRONS FLEX
39
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Koble pipetten til det valgte pipettefestet og fest skruene.
4. KJØR AUTOMATISK KALIBRERING For å kalibrere pipetten, fest kalibreringssonden til riktig pipettedyse. Pipetten vil automatisk bevege seg for å berøre visse punkter på dekket og lagre disse kalibreringsverdiene for fremtidig bruk. Når kalibreringen er fullført og du har fjernet proben, vil pipetten være klar til bruk i protokoller.
Montering av griper
Når du installerer griperen, vil du bli guidet gjennom følgende trinn på berøringsskjermen eller i Opentrons-appen.
1. FORBEREDELSE FOR INSTALLASJON Fjern laboratorieutstyr fra dekket og ryd opp i arbeidsområdet for å gjøre feste og kalibrering enklere. Samle også den nødvendige sekskantskrutrekkeren og sørg for at kalibreringspinnen er i oppbevaringsområdet på griperen.
2. KOBLE TIL OG SIKRE GRIPPEREN Portalen vil bevege seg til fronten av roboten slik at du kan feste griperen. Koble griperen til forlengelsesfestet og fest skruene.
3. KJØR AUTOMATISK KALIBRERING For å kalibrere griperen, sett inn kalibreringspinnen i frontkjeven. Griperen vil automatisk bevege seg for å berøre visse punkter på dekket og lagre disse kalibreringsverdiene for fremtidig bruk. Gjenta deretter samme prosess med kalibreringspinnen i bakkjeven. Når kalibreringen er fullført og du har satt pinnen tilbake på oppbevaringsstedet, vil griperen være klar til bruk i protokoller.
2.5 Flytting
Denne delen gir råd og instruksjoner om hvordan du flytter din Opentrons Flex-robot over korte og lange avstander.
40
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Korte trekk
Et kort trekk spenner over en rekke avstander fra «la oss bare flytte det litt over» til over laboratoriet, ned i gangen eller en annen etasje i bygningen din. I disse tilfellene kan du flytte Flex for hånd. Transport av den på en håndvogn er også et godt alternativ.
Advarsel: Flex veier 88.5 kg. Som et resultat krever det to personer for å løfte og flytte det trygt.
Fest løftehåndtakene igjen for å flytte Flex til et nytt sted i nærheten. Å løfte og bære Flex i håndtakene er den riktige måten å flytte roboten på korte avstander. Fjern håndtakene og oppbevar dem i brukersettet etter at flyttingen er fullført. For å unngå å skade roboten, bruk alltid løftehåndtakene til å ta den opp og flytte den. Ikke ta tak i rammen for å løfte eller flytte roboten.
Langdistansebevegelser
En langdistanseflytting transporterer din Flex fra eiendommen til universitetet, anlegget eller institusjonen din. På tvers av byen, til en ny by, stat, provins eller land er alle eksamples av en langdistansebevegelse. I dette tilfellet må du pakke Flex for å beskytte den mot elementene, støt og røffe bevegelser som kan oppstå under transport.
Hvis du har beholdt forsendelseskassen og de innvendige støttene som fulgte med Flex, kan du pakke den om i disse materialene for en flytting over lengre avstander. Følg utbokstrinnene i omvendt rekkefølge for å forberede Flex for en langdistansebevegelse. I utgangspunktet bør du:
Koble fra strøm- og nettverkskabelen, hvis den er tilkoblet. Fjern all tilkoblet maskinvare og labware. Fest dekkplatene igjen. Lås portalen (se avsnittet Generelle flytteråd nedenfor). Fjern og oppbevar vinduspanelene.
Hvis du beholdt den originale kassen:
Fest fraktrammen til Flex og fest den til pallebunnen ved hjelp av L-brakettene. Legg til polstring og sett sammen forsendelseskassen.
OPENTRONS FLEX
41
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Hvis du ikke har den originale kassen og relatert materiale, kontakt et anerkjent fraktselskap. De kan administrere pakking, transport og leveringsprosessen for deg.
Generelle flytteråd
KOBLE UD STRØM- OG NETTVERKSKABLER Før du flytter din Flex, ikke glem å: Slå av strømmen og koble den fra strømforsyningen. Koble fra Ethernet- eller USB-kabelen, hvis den brukes.
LÅS GANTRY Før du flytter Flex, sett inn låseskruene igjen for å holde portalen på plass. Portallåsepunktene er plassert: På venstre sideskinne nær fronten av roboten. Under den vertikale portalarmen. På høyre sideskinne nær fronten av roboten. Å låse denne delen av portalen krever det lille
oransje brakett og to låseskruer.
42
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
HJEM GANTRY Du vil kanskje ikke låse portalen hvis du bare flytter roboten til et sted i nærheten. Hvis du bestemmer deg for å ikke låse den, bruk i det minste berøringsskjermen eller Opentrons-appen til å sende portalen til utgangsposisjonen før du slår den av. For å starte portalen via berøringsskjermen, trykk på menyen med tre prikker () og trykk deretter på Hjem portal. Slik setter du portalen via Opentrons-appen: Klikk på Enheter. Klikk på din Flex i enhetslisten. Klikk på menyen med tre prikker () og klikk deretter på Hjem-portalen.
FJERN MODULER Moduler på dekk og andre tilbehør legger ekstra vekt på din Flex. De påvirker også robotens tyngdepunkt, noe som kan få den til å føles "tippy" når den løftes. For å hjelpe til med å lette og balansere roboten, fjern eventuelle tilkoblede instrumenter og laboratorieutstyr før du tar den opp.
REINSTALLERE DEKKSPLASSER Vi anbefaler å feste dekksporene på nytt for en langdistansebevegelse. Å sikre sporene på deres opprinnelige plassering bidrar til å forhindre utilsiktet tap. Å feste dekksporene for korte bevegelser rundt i laboratoriet er valgfritt.
REKALIBRERING ETTER FLYTTING Du bør kalibrere alle instrumenter og moduler på nytt etter å ha installert dem på nytt. For mer informasjon om modulkalibrering, se kapittelet Moduler.
OPENTRONS FLEX
43
KAPITTEL 2: INSTALLASJON OG FLYTTING
Siste tanker om flytting
Din Flex er en solid og velbygd maskin, men den er også et presist vitenskapelig instrument designet for krevende toleranser. Som et resultat bør du behandle den med forsiktighet når du flytter den innenfor ditt lokale arbeidsområde eller sender den over hele landet. Dette betyr å følge veiledningen gitt her og bruke din egen sunne fornuft om hvordan du transporterer et dyrt laboratorieutstyr. Hovedpoenget: Når du flytter Flex, må du være forsiktig og ekstra polstring.
Hvis du har spørsmål eller bekymringer angående flytting av din Flex, kontakt oss på support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3
Systembeskrivelse
Dette kapittelet beskriver maskinvaresystemene til Opentrons Flex, som ligger til grunn for kjernefunksjonene for laboratorieautomatisering. Dekk-, portal- og instrumentfestene til Opentrons Flex muliggjør bruk av presisjonskomponenter for væske- og laboratoriehåndtering. Berøringsskjermen på enheten gjør det mulig å kjøre protokoller og sjekke robotens status uten å måtte ta med datamaskinen til laboratoriebenken. Kablet og trådløs tilkobling muliggjør ytterligere kontroll fra Opentrons-appen (se kapittelet Programvare og drift for flere detaljer) og utvider systemets funksjoner ved å koble til eksterne enheter (se kapittelet Moduler).
3.1 Fysiske komponenter
Kamera
Statuslys
Berøringsskjerm
Ramme
Gantry Deck
Inngangsdør
Plassering av de fysiske komponentene til Opentrons Flex.
Sidevinduer med håndtak
OPENTRONS FLEX
45
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Ramme og innkapsling
Rammen til Opentrons Flex-roboten gir stivhet og strukturell støtte for dekk og portal. Alle de mekaniske undersystemene er plassert på og montert på hovedrammen. Rammen er hovedsakelig konstruert av platemetall og aluminiumprofiler.
Metallrammen har åpninger for sidevinduer og en inngangsdør laget av gjennomsiktig polykarbonat som lar deg se hva som foregår inne i Flex. Frontdørhengslene åpnes for tilgang til det indre av systemet. Med inngangsdøren åpen kan du feste instrumenter, moduler og dekksfester; klargjør dekket før en protokoll; eller manipulere tilstanden til dekket under en protokoll.
Hvite LED-striper på innsiden av rammens toppkanter gir programvarekontrollerbar omgivelsesbelysning. Et 2-megapiksel kamera kan fotografere dekket og arbeidsområdet for opptak og sporing av protokollutførelse.
Dekk og arbeidsområde
Dekket er den maskinerte aluminiumsoverflaten som automatiserte vitenskapsprotokoller utføres på. Dekket har 12 hovedspor i ANSI/SLAS-format som kan rekonfigureres for å holde laboratorieutstyr, moduler og forbruksvarer. Dekksporene identifiseres av et koordinatsystem, med spor A1 bak til venstre og spor D3 foran til høyre.
Utvidelsesspor (for termosykler) Arbeidsområde
Staging Område
Områder på dekket i Flex.
46
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Arbeidsområdet er det fysiske rommet over dekket som er tilgjengelig for pipettering. Labware plassert i spor A1 til D3 er i arbeidsområdet.
Opentrons Flex kommer med avtagbare dekkspor for alle 12 posisjoner i arbeidsområdet. Hvert dekkspor har hjørneklips for laboratorieutstyr for sikker plassering av laboratorieutstyr på dekket.
Du kan rekonfigurere dekket ved å erstatte sporene med andre dekksfester, inkludert den flyttbare søppel, avfallsrenne og modulcaddies. Utvidelsessporet bak A1 brukes kun til å gi ekstra plass til Thermocycler-modulen, som opptar spor A1 og B1.
Merk: Dekkspor kan byttes ut i en kolonne (1, 2 eller 3), men ikke på tvers av kolonner; kolonne 1 og kolonne 3 spor er forskjellige deler til tross for deres like størrelse. Du kan se hvilken kolonne et spor går inn ved å orientere den blå labware-klemmen bak til venstre.
Du bør la dekkspor være installert på steder der du ønsker å plassere frittstående laboratorieutstyr. Dekket og gjenstandene som er plassert på det forblir statiske, med mindre de flyttes av griperen eller manuell inngripen.
Stagområde
Stagingområdet er ekstra plass langs høyre side av dekket. Du kan lagre labware på denne plasseringen etter installasjon av staging område spor. Labware plassert i sporene A4 til D4 er i staging området. Flex-pipetter kan ikke nå inn i staging-området, men griperen kan plukke opp og flytte laboratorieutstyr til og fra dette stedet. Å legge til ekstra spor bidrar til å holde arbeidsområdet tilgjengelig for utstyret som brukes i dine automatiserte protokoller.
Staging area slots er inkludert i visse arbeidsstasjonskonfigurasjoner og er også tilgjengelige for kjøp fra https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Stagområde med spor installert
Dekk inventar
Inventar er maskinvare som erstatter standard dekkspor. De lar deg tilpasse dekkoppsettet og legge til funksjonalitet til Flex. For øyeblikket inkluderer dekkarmaturer stagsporene i området, den interne søppelkassen og den eksterne avfallsrennen. Du kan bare installere armaturer i noen få spesifikke kortstokker. Tabellen nedenfor viser dekkplasseringene for hver armatur.
Armatur Staging area slots Søppelkasse Avfallsrenne Avfallsrenne med staging område spor
Spor A3D3 A1D1 og A3-D3 D3 kun D3
Armaturene er uten strøm. De inneholder ikke elektroniske eller mekaniske komponenter som kommuniserer deres nåværende tilstand og dekkplassering til roboten. Dette betyr at du må bruke dekkkonfigurasjonsfunksjonen for å fortelle Flex hvilke armaturer som er festet til dekket og hvor de er plassert.
48
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Du kan få tilgang til dekkkonfigurasjonsinnstillingene fra berøringsskjermen via menyen med tre prikker () og fra Opentrons-appen. Se avsnittet Dekkkonfigurasjon i kapittelet Programvare og drift for informasjon om hvordan du konfigurerer dekk fra berøringsskjermen.
Avfallsrenne
Opentrons Flex-avfallssjakt overfører væsker, tips, tippstativer og brønnplater fra Flex-kabinettet til en søppelbeholder plassert under dens ytre åpning. Avfallssjakten festes til en dekkplateadapter som passer i spor D3. Den kommer også med et spesielt vindushalvpanel som lar sjakten strekke seg ut fra fronten av roboten.
Komponenter i avfallsrennen.
Dekkplateadapter
Avfallssjakt
Dekkplateadapter med Staging Område
Staging område spor
Staging area slots er ANSI/SLAS kompatible dekkstykker som erstatter standard spor i kolonne 3 og legger til nye spor til stagingområde – alt uten å miste plass i arbeidsområdet. Du kan installere et enkelt spor eller maksimalt fire spor for å lage en ny kolonne (A4 til D4) langs høyre side av kortstokken. Vær imidlertid oppmerksom på at utskifting av dekkspor A3 krever flytting av søppelkassen. Ved å legge til stagMed plass til dekket kan Flex-roboten lagre mer laboratorieutstyr og operere mer effektivt.
OPENTRONS FLEX
Flex staging område spor.
49
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
INSTALLASJON AV SLOT
For å installere, fjern skruene som fester et standard spor til dekket og erstatte det med staging område spor. Etter installasjonen, bruk berøringsskjermen eller Opentrons-appen for å fortelle roboten du har lagt til somtaging område spor til dekket.
Installerer somtaging område spor.
SPOTKOMPATIBILITET Stagsporene i området er kompatible med Flex-instrumentene, modulene og laboratorieutstyret som er oppført nedenfor.
Flex komponent Gripper Pipetter Moduler
Labware
Stagkompatibilitet med området
Flex Gripper kan flytte laboratorieutstyr til eller fra staging område spor.
Flex-pipetter kan ikke nå staging området. Bruk griperen til å flytte spissstativer og laboratorieutstyr fra staging området til arbeidsområdet før pipettering.
Magnetisk blokk GEN1 kan plasseres i kolonne 3 på toppen av astaging område spor. Moduler støttes ikke i kolonne 4.
Motordrevne moduler som Heater-Shaker og Temperature Module passer inn i caddies som kan plasseres i kolonne 3. Du kan ikke legge til somtaging område sporet til en posisjon okkupert av en modul caddie.
Staging area slots har samme ANSI/SLAS dimensjoner som standard dekk spor. Bruk griper-kompatibel laboratorieutstyr i staging-området, eller legg til og fjern labware manuelt fra denne plasseringen.
50
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Bevegelsessystem
Festet til rammen er portalen, som er robotens bevegelses- og posisjoneringssystem. Portalen beveger seg separat langs x- og y-aksen for å plassere pipettene og griperen på nøyaktige steder for protokollutførelse. Bevegelsen langs disse aksene er nøyaktig til nærmeste 0.1 mm. Gantryet styres av 36 VDC hybride bipolare trinnmotorer. På sin side er pipettefestene og forlengelsesfestet festet til portalen. Disse beveger seg langs z-aksen for å plassere pipettene og griperen på nøyaktige steder for protokollutførelse. Bevegelse langs denne aksen styres av 36 VDC hybride bipolare trinnmotorer. Elektronikken i portalen gir 36 VDC strøm og kommunikasjon til pipettene og griperen når den er festet.
Gantry
Pipettefester
Forlengelsesfeste
Plassering av instrumentfester på Flex.
Berøringsskjerm og LED-skjermer
Det primære brukergrensesnittet er den 7-tommers LCD-berøringsskjermen, plassert foran til høyre på roboten. Berøringsskjermen er dekket med Gorilla Glass 3 for motstand mot riper og skader. Få tilgang til mange funksjoner i Flex direkte på berøringsskjermen, inkludert:
OPENTRONS FLEX
51
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Protokolladministrasjon Protokolloppsett, utførelse og overvåking Labware-administrasjon Robotinnstillinger Systemprogramvare og fastvareoppdateringer Driftslogger og feilmeldinger
For mer informasjon om bruk av Flex via berøringsskjermen, se delen Berøringsskjermdrift i kapittelet Programvare og betjening.
Statuslyset er en stripe med lysdioder langs den øvre fronten av roboten som gir umiddelbar informasjon om roboten. Ulike farger og belysningsmønstre kan kommunisere forskjellige suksess-, fiasko- eller inaktive tilstander:
LED farge Hvit Nøytral tilstand
Grønn Normal oppgir
Blå Obligatoriske tilstander Gul Unormale tilstander Rød Nødtilstander
LED-mønster Solid Pulsing
Blinker to ganger
Solid pulserende pulserende
Robotstatus
Slått på og kjører ikke en protokoll Roboten er opptatt (f.eks. oppdaterer programvare eller fastvare, setter opp protokollkjøring, kansellerer protokollkjøring) Handlingen er fullført (f.eks. protokoll lagret, programvare oppdatert, instrument tilkoblet eller frakoblet) Protokoll kjører Protokoll er fullført Protokollen er satt på pause
Fast
Programvarefeil
Blinker tre ganger, gjentatte ganger
Fysisk feil (f.eks. instrumentkrasj)
Statuslyset kan også deaktiveres i robotinnstillingene.
52
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
3.2 Pipetter
Opentrons pipetter er konfigurerbare enheter som brukes til å flytte væsker gjennom arbeidsområdet under utførelse av protokoller. Det er flere Opentrons Flex-pipetter, som kan håndtere volumer fra 1 µL til 1000 µL i 1, 8 eller 96 kanaler:
Opentrons Flex 1-kanals pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-kanals pipette (1 µL) Opentrons Flex 5-kanals pipette (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanals pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-kanals pipette (8-kanals pipette)
Pipetter festes til portalen ved hjelp av festeskruer på forsiden av pipetten. 1-kanals og 8-kanals pipetter opptar hver en pipettefeste (venstre eller høyre); 96-kanals pipetten opptar begge monteringene. For detaljer om installasjon av pipetter, se Instrumentinstallasjon og kalibrering.
Fangefeste
Skruer
Festeskruer
Ejektor
Dyser (utskiftbare O-ringer)
Dyser (faste O-ringer)
Plassering av komponentene til 1-, 8- og 96-kanals pipettene.
Ejektor
OPENTRONS FLEX
53
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Pipettene plukker opp engangsplastspisser ved å trykke dem på pipettedysene, og bruker deretter spissene til å aspirere og dispensere væsker. Mengden total kraft som kreves for opphenting øker ettersom flere tips blir plukket opp samtidig. For mindre antall spisser, fester pipetten spisser ved å skyve hver pipettedyse ned i en spiss. For å oppnå den nødvendige kraften for å plukke opp et fullt stativ med spisser, trekker 96-kanals pipetten også spissene oppover på dysene. Denne trekkhandlingen krever plassering av spissstativ i en tuppstativadapter, i stedet for direkte i et dekkspor. For å kaste spissene (eller sette dem tilbake til stativet), skyver pipetteutkastermekanismen tuppene av dysene.
Pipettespesifikasjoner
Opentrons Flex-pipetter er designet for å håndtere et bredt spekter av volumer. På grunn av det brede spekteret, kan de bruke flere størrelser på spisser, noe som påvirker deres væskehåndteringsegenskaper. Opentrons har testet Flex-pipetter for nøyaktighet og presisjon i en rekke spiss- og væskevolumkombinasjoner:
Pipette
Flex 1-kanal
50 µL
Flex 1-kanal
1000 µL
Flex 8-kanal
50 µL
Flex 8-kanal
1000 µL
Spisskapasitet 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL
Testet volum 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Nøyaktighet %D 8.00 % 1.50 % 1.25 % 5.00 % 0.50 % 0.50 % 0.50 % 10.00 % 2.50 % 1.25 % 8.00 % 2.50 % 1.00 % 0.70 %
Presisjon %CV 7.00 % 0.50 % 0.40 % 2.50 % 0.30 % 0.15 % 0.15 % 8.00 % 1.00 % 0.60 % 4.00 % 0.60 % 0.25 % 0.15 %
54
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Flex 96-kanal
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Ha denne nøyaktighetsinformasjonen i bakhodet når du velger tips til pipetten. Generelt, for best resultat bør du bruke de minste tipsene som oppfyller behovene til protokollen din.
Merk: Opentrons utfører volumetrisk testing av Flex-pipetter for å sikre at de oppfyller nøyaktighets- og presisjonsspesifikasjonene som er oppført ovenfor. Du trenger ikke å kalibrere volumet som pipettene dispenserer før bruk. Du trenger bare å utføre posisjonskalibrering. Se neste avsnitt, samt avsnittet om pipetteinstallasjon i kapittelet Installasjon og flytting, for detaljer.
Opentrons Care og Opentrons Care Plus-tjenestene inkluderer årlig pipettebytte og kalibreringssertifikater. Se avsnittet Service Flex i kapittelet Vedlikehold og service for detaljer.
Pipettekalibrering
Brukersettet inkluderer en pipettekalibreringsprobe av metall, som du bruker under posisjonskalibrering. Under protokollkjøringer, oppbevar sonden trygt på den magnetiske holderen på den fremre søylen til roboten. Under kalibreringsprosessen fester du sonden til den aktuelle dysen og låser den på plass. Roboten flytter sonden til kalibreringspunkter på dekket for å måle pipettens nøyaktige posisjon.
Adapter for pipettespissstativ
Opentrons Flex 96-kanals pipette leveres med fire tippstativadaptere. Dette er presisjonsformede aluminiumsbraketter som du plasserer på dekket. Adapterne har plass til Flex 50 L, 200 L og 1000 µL tuppstativer.
OPENTRONS FLEX
55
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
På grunn av kraften som er involvert, krever 96-kanals pipetten en adapter for å feste et stativ med full spiss på riktig måte. Under festeprosedyren beveger pipetten seg over adapteren, senker seg ned på monteringspinnene og trekker spissene på pipettene ved å løfte adapteren og spissstativet. Å trekke spissene, i stedet for å skyve, gir innflytelsen som trengs for å feste spissene til pipettene og forhindrer vridning av dekkoverflaten. Når den er ferdig, senker 96-kanals pipetten adapteren og det tomme spissenstativet ned på dekket. Se delen Tips og tipshyller i Labware-kapittelet for mer informasjon.
Henting av delvis tips
96-kanals pipetten kan plukke opp et helt stativ med spisser eller et mindre antall spisser. Dette øker antallet applikasjoner du kan utføre med 96-kanals pipetten, siden den opptar begge pipettefestene.
For øyeblikket støtter 96-kanals pipetten delvis spissopphenting for 8 spisser i en kolonnelayout. I denne konfigurasjonen bruker pipetten enten dysene lengst til venstre for å plukke opp spisser fra høyre til venstre fra et spisserstativ, eller dysene lengst til høyre for å plukke opp spisser fra venstre mot høyre fra et spisserstativ.
Når du plukker opp færre enn 96 spisser fra et tipsstativ, må stativet plasseres direkte på dekket, ikke i tipsstativadapteren.
Pipettesensorer
Opentrons Flex-pipetter har en rekke sensorer som registrerer og registrerer data om statusen til pipetten og eventuelle tips den har fanget opp.
KAPASITANSESENSORER
I kombinasjon med en metallsonde eller ledende spiss, oppdager kapasitanssensorene når pipetten kommer i kontakt med noe. Deteksjon av kontakt mellom metallsonden og dekket brukes i den automatiske pipettekalibreringen og modulkalibreringsprosessene.
1-kanals pipetter har én kapasitanssensor, mens flerkanalspipetter har to: på kanaler 1 og 8 av 8-kanals pipetter, og på kanaler 1 og 96 (posisjon A1 og H12) på 96-kanals pipetten.
56
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
OPTISK SPIS NÆRVÆRELSESENSORER
En fotoavbryterbryter oppdager posisjonen til pipettens spissutstøtermekanisme, og bekrefter om spissene ble plukket opp eller mistet. 1-kanals, 8-kanals og 96-kanals pipetter har alle en enkelt optisk sensor som overvåker spissfestet på tvers av alle kanaler.
Pipett-fastvareoppdateringer
Opentrons Flex oppdaterer pipettefastvaren automatisk for å holde den synkronisert med robotprogramvaren. Pipettefastvareoppdateringer er vanligvis raske og skjer når:
Du fester en pipette. Roboten starter på nytt.
Hvis, av en eller annen grunn, pipettefastvaren og robotprogramvareversjonene dine går ut av synkronisering, kan du manuelt oppdatere fastvaren i Opentrons-appen.
1. Klikk på Enheter. 2. Klikk på din Flex i enhetslisten. 3. Under Instrumenter og moduler vil pipetten som ikke er synkronisert vise en advarselsbannerlesing
"Fastvareoppdatering tilgjengelig." Klikk på Oppdater nå for å starte oppdateringen.
Du kan view den installerte fastvareversjonen av en hvilken som helst tilkoblet pipette. På berøringsskjermen går du til Instrumenter og trykker på pipettenavnet. I Opentrons-appen finner du pipettekortet under Instrumenter og moduler, klikker på menyen med tre prikker (), og klikker deretter Om pipette.
3.3 Griper
Griperen flytter laboratorieutstyr gjennom hele arbeidsområdet og stagområde under utførelse av protokoller. Griperen festes til forlengelsesfestet, som er atskilt fra pipettefestene; griperen kan brukes med hvilken som helst pipettekonfigurasjon. For detaljer om installasjon av griperen, se Instrumentinstallasjon og kalibrering.
Griperen kan flytte laboratorieutstyr over dekket og inn på eller av moduler. Griperen kan manipulere visse brønnplater med skjørt, dype brønnplater og spissstativer. For mer informasjon om hvilken labware griperen kan flytte, se Labware og Opentrons Flex Gripper-delen av Labware-kapittelet, eller konsulter Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
57
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Griper spesifikasjoner
Kjevene utfører den primære bevegelsen til griperen, som er å åpne eller lukke to parallelle skovler for å påføre eller frigjøre kraft på sidene av laboratorieutstyret. Bevegelse av kjevene styres av en 36 VDC børstet motor koblet til et tannstang-girsystem.
For å flytte et stykke laboratorieutstyr som har blitt grepet av kjevene, løfter portalen griperen langs z-aksen, flytter den sideveis og senker den deretter ned i laboratorieutstyrets nye posisjon.
Plassering av komponenter til griperen.
Festeskruer
Kalibreringsstift Jaws Paddles
Griper kalibrering
Griperen inkluderer en metallkalibreringsstift. Kalibreringsstiften er plassert i et forsenket oppbevaringsområde på den nedre delen av griperen. En magnet holder pinnen på plass. For å fjerne kalibreringspinnen tar du tak i den med fingrene og drar forsiktig. For å erstatte pinnen, sett den tilbake i lagringssporet. Du vet at den er sikker når den klikker på plass.
Når du kalibrerer griperen, fester du pinnen til hver kjeve etter tur. Roboten flytter tappen til kalibreringspunkter på dekket for å måle griperens nøyaktige posisjon.
Under protokollkjøring, plasser pinnen i oppbevaringsområdet for oppbevaring. Kontakt oss på support@opentrons.com hvis du mister kalibreringspinnen.
Gripper-fastvareoppdateringer
Opentrons Flex oppdaterer automatisk griperens fastvare for å holde den synkronisert med robotens programvareversjon. Gripper-fastvareoppdateringer er vanligvis raske og skjer når:
58
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Du fester griperen. Roboten starter på nytt.
Hvis, av en eller annen grunn, gripper-fastvaren og robotprogramvaren din ikke er synkronisert, kan du manuelt oppdatere fastvaren i Opentrons-appen.
1. Klikk på Enheter. 2. Klikk på din Flex i enhetslisten. 3. Under Instrumenter og moduler vil den usynkroniserte griperen vise en advarselsbannerlesing
"Fastvareoppdatering tilgjengelig." Klikk på Oppdater nå for å starte oppdateringen.
Du kan view den for øyeblikket installerte fastvareversjonen av griperen. På berøringsskjermen går du til Instrumenter og trykker på griperen. I Opentrons-appen finner du griperkortet under Instrumenter og moduler, klikker på trepunktsmenyen (), og klikker deretter Om griper.
3.4 Nødstopp-anheng
Emergency Stop Pendant (E-stop) er en dedikert maskinvareknapp for raskt å stoppe robotens bevegelse. Opentrons Flex krever at en funksjonell, utkoblet nødstopp til enhver tid er festet. Når du trykker på stoppknappen, kansellerer Flex enhver løpende protokoll eller oppsettarbeidsflyt så raskt som mulig og forhindrer de fleste robotbevegelser.
Når du skal bruke nødstoppet
Du må kanskje trykke på nødstoppet:
Når det er overhengende fare for personskade eller skade på en bruker. Når det er overhengende fare for skade på roboten eller annen maskinvare. Når samplesninger eller reagenser er i overhengende fare for kontaminering. Etter en maskinvarekollisjon.
Ideelt sett bør du aldri måtte trykke på nødstoppet (bortsett fra under sjeldne testing av maskinvarekvalitet).
Ikke bruk nødstoppet til å avbryte normale, forventede operasjoner. Bruk i stedet programvareknappen på berøringsskjermen eller i Opentrons-appen. Pause via programvare vil la deg gjenoppta eller kansellere protokollen, mens et trykk på nødstoppet alltid kansellerer protokollen umiddelbart.
OPENTRONS FLEX
59
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Engasjere og slipp nødstoppet
Nødstopperen har en trykk-for-å-engasjere, vri-for-utløsning-mekanisme.
Aktiver: Trykk hardt ned på den røde knappen. Flex vil gå inn i stoppet tilstand. Løs: Når du har stoppet, må du trygt løse eventuelle problemer i arbeidsområdet, for eksempel å fjerne søl,
fjerning av laboratorieutstyr, eller flytting av portalen (den skal bevege seg fritt og enkelt for hånd). Slipp: Vri knappen med klokken. Den vil sprette opp til sin frakoblede posisjon. Tilbakestill: På berøringsskjermen eller i Opentrons-appen bekrefter du at du er klar for å gjenoppta Flex
bevegelse. Portalen vil gå tilbake til utgangsposisjonen og modulaktiviteten vil gjenopptas.
I stoppet tilstand vil Flex og tilkoblet maskinvare oppføre seg som følger:
Maskinvare Gantry Pipetter
Griper
Varme-shaker-modul
Temperaturmodul Termosykkelmodul Statuslys Berøringsskjerm
Oppførsel
Automatisk horisontal bevegelse stoppes. Manuell horisontal bevegelse er tillatt.
Vertikal bevegelse av pipetter stanses. Motorbremsene på vertikale akser er aktivert for å forhindre
pipetter fra å falle. Stempelbevegelse og spissopphenting stanses.
Vertikal bevegelse av griperen stanses. Motorbremsen på den vertikale aksen er aktivert for å forhindre
griperen fra å falle. Kjevemotorene som utøver gripekraft forblir aktivert, så
griperen vil ikke miste laboratorieutstyr den kan bære.
Shakeren stopper og går hjem. Labware-låsen åpnes. Oppvarming er deaktivert.
Oppvarming eller kjøling er deaktivert.
Oppvarming eller kjøling er deaktivert.
Lyset blir rødt.
En kanselleringsmelding tar over skjermen. En indikator på skjermen viser når du har lykkes
koblet ut stoppknappen.
60
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
3.5 Tilkoblinger
På/av-bryter
Sidetrekk
USB-A-porter
IEC strøminntak
Porter AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Strømtilkobling
Opentrons Flex kobles til en strømkilde via et standard IEC-C14-inntak. Roboten inneholder en intern full-range AC/DC-strømforsyning, som aksepterer 100 VAC, 240/50 Hz inngang og konverterer den til 60 VDC. All annen intern elektronikk drives av 36 VDC-forsyningen.
Advarsel: Bruk kun strømledningen som følger med roboten. Ikke bruk en strømledning med utilstrekkelig strøm eller volumtage rangeringer.
Hold strømledningen fri for hindringer, slik at du kan fjerne den om nødvendig.
Det er også et CR1220 myntcellebatteri for å drive robotens sanntidsklokke når den ikke er koblet til strømnettet. Batteriet er plassert inne i berøringsskjermen. Kontakt Opentrons Support for mer informasjon hvis du tror du trenger å bytte ut batteriet.
OPENTRONS FLEX
61
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
USB og ekstra tilkoblinger
Opentrons Flex har totalt 10 USB-porter plassert i forskjellige områder av roboten, som tjener forskjellige formål.
De 8 bakre USB-A-portene (nummerert USB-1 til USB-8) og 2 hjelpeporter (M12-kontakter nummerert AUX-1 og AUX-2) er for tilkobling av Opentrons-moduler og tilbehør. Se kapittelet Moduler for mer informasjon om hvordan du kobler til disse enhetene og bruker dem i protokollene dine. Den bakre USB-B-porten er for å koble roboten til en bærbar eller stasjonær datamaskin, for å etablere kommunikasjon med Opentrons-appen som kjører på den tilkoblede datamaskinen. Den fremre USB-A-porten (USB-9), plassert under berøringsskjermen, har samme funksjonalitet som de bakre USB-A-portene.
Merk: USB-portene er strømbegrenset for å beskytte roboten og tilkoblede enheter. Strømforsyningen er delt internt i tre portgrupper: de venstre bakre USB-A-portene (USB-1 til USB-4), de høyre bakre USB-A-portene (USB-5 til USB-8), og de fremre USB-A havn. Hver av disse gruppene vil levere maksimalt 500 mA til tilkoblede USB 2.0-kompatible enheter.
Nettverkstilkoblinger
Opentrons Flex kan koble til et lokalnettverk via en kablet (Ethernet) eller trådløs (Wi-Fi) tilkobling.
Ethernet-porten er plassert på baksiden av roboten. Koble den til en Ethernet-hub eller slå på nettverket. Eller, fra robotsystemversjon 7.1.0, koble den direkte til en Ethernet-port på datamaskinen. Den interne Wi-Fi-modulen støtter 802.11 ac/a/b/g/n-nettverk med en dual-band 2.4/5 GHz antenne.
62
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
3.6 Systemspesifikasjoner
Generelle spesifikasjoner
Dimensjoner Vekt Dekkspor
Berøringsskjerm
Wi-Fi Ethernet USB
Kamera Robot strøminngang
Nettforsyning voltage fluktuasjon Nettforsyning frekvens fluktuasjon Fordelingssystem Kortslutning forsyningsstrøm Rammesammensetning Vindussammensetning Ventilasjonskrav
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 tommer (B, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-kompatible spor i arbeidsområdet
(tilgjengelig for pipetter) 4 ekstra spor for staging tips og labware
(kun tilgjengelig for griperen) 7-tommers LCD-berøringsskjerm med ripe- og skadebestandig Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n dual-band (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A-porter 1 USB-B-port USB 2.0-hastighet
2 MP, foto og video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10 %
±5 %
TN-S
6.3 A
Stiv stål og CNC aluminium design
Avtakbare sidevinduer og inngangsdør i polykarbonat Minst 20 cm / 8 mellom enheten og en vegg
OPENTRONS FLEX
63
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Krav til tilkoblet PC
Opentrons-appen kjører på: Windows 10 eller nyere macOS 10.10 eller nyere Ubuntu 12.04 eller nyere
Miljøspesifikasjoner
Miljøforhold Omgivelsestemperatur Relativ fuktighet Forurensningsgrad
Kun innendørs bruk +20 til +25 °C (anbefalt) 40 %, ikke-kondenserende (anbefalt) 60 (kun ikke-ledende forurensning)
For ytterligere informasjon om akseptable miljøforhold for bruk og transport, se avsnittet Miljøforhold i kapittelet Installasjon og flytting.
Sertifiseringer
Sertifiseringer komplett Ikke sertifisert/validert
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Et sammendrag av sertifiseringsinformasjon er trykt på et klistremerke på baksiden av Flex, nær på/av-bryteren. For detaljert sertifiserings- og samsvarsinformasjon, se delen for overholdelse av forskrifter i introduksjonen.
Serienummer
Hver Flex har et unikt serienummer. Formatet på serienummeret gir tilleggsinformasjon, inkludert robotens produksjonsdato. For eksample, serienummeret FLXA1020231007001 vil indikere:
64
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 3: SYSTEMBESKRIVELSE
Tegn FLX A10 2023 10 07 001
Kategori Modell Versjon År Måned Dag Enhet
Betydning Roboten er en Opentrons Flex. En kode for produksjonsversjonen av roboten. Roboten ble laget i 2023. Roboten ble laget i oktober. Roboten ble laget den 7. dagen i måneden. Et unikt nummer for roboter laget på en bestemt dag.
Du kan finne serienummeret til din Flex:
På sertifiseringsklistremerket på baksiden av Flex, nær på/av-bryteren. På baksiden av berøringsskjermen (mot arbeidsområdet). I Opentrons-appen under Enheter > din Flex > Robotinnstillinger > Avansert.
OPENTRONS FLEX
65
KAPITTEL 4
Moduler
Opentrons Flex integreres med en rekke Opentrons maskinvaremoduler. Alle moduler er periferiutstyr som opptar dekkspor, og de fleste styres av roboten over en USB-tilkobling.
Dette kapittelet beskriver funksjonene og fysiske spesifikasjonene til moduler som er kompatible med Opentrons Flex-systemet, samt hvordan de festes og kalibreres. For ytterligere detaljer om moduloppsett og bruk, se manualene for de enkelte modulene. For detaljer om integrering av moduler i protokollene dine, se Protocol Designer-delen av Protocol Development-kapittelet eller den elektroniske Python Protocol API-dokumentasjonen.
4.1 Støttede moduler
Opentrons Flex er kompatibel med fire typer Opentrons-moduler på dekk:
Heater-Shaker-modulen sørger for oppvarming på dekk og omløpsristing. Modulen kan varmes opp til 95 °C, og kan riste samples fra 200 til 3000 rpm.
Magnetisk blokk er en passiv enhet som holder laboratorieutstyr nær sine høystyrke neodymmagneter. OT-2 Magnetic Module GEN1 og GEN2, som aktivt beveger magnetene sine opp og ned i forhold til laboratorieutstyr, støttes ikke på Opentrons Flex.
Temperaturmodulen er en varm- og kaldplatemodul som er i stand til å opprettholde stabile temperaturer mellom 4 og 95 °C.
Thermocycler-modulen gir helautomatisert termosykling på dekk, som muliggjør automatisering av oppstrøms og nedstrøms arbeidsflyttrinn. Thermocycler GEN2 er fullt kompatibel med griperen. Thermocycler GEN1 kan ikke brukes med griperen, og støttes derfor ikke på Opentrons Flex.
Noen moduler opprinnelig designet for OT-2 er kompatible med Flex, som oppsummert i tabellen nedenfor. Et hakemerke indikerer kompatibilitet, og en X indikerer inkompatibilitet.
66
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
Enhetstype og generasjon Heater-Shaker Module GEN1 Magnetic Module GEN1 Magnetic Module GEN2 Magnetic Block GEN1 Temperatur Module GEN1 Temperature Module GEN2 Thermocycler Module GEN1 Thermocycler Module GEN2 HEPA Module
OT-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Modul caddie system
Kompatible moduler er designet for å passe inn i caddies som opptar plass under dekk. Dette systemet lar laboratorieutstyr på toppen av moduler forbli nærmere dekkoverflaten, og det muliggjør også kabelføring under dekk slik at dekket forblir ryddig under protokollkjøringen.
Caddies for Heater-Shaker-, Temperatur- og Thermocycler-modulene.
OPENTRONS FLEX
67
KAPITTEL 4: MODULER
For å montere en modul i dekksoverflaten, må den først plasseres i den tilsvarende modulholderen. Hver type kompatibel modul har sin egen caddie-design som justerer modulen og laboratorieutstyret nøyaktig med dekket rundt. (Unntaket er den magnetiske blokken, som ikke krever strøm- eller USB-kabelføring og dermed sitter direkte på dekkoverflaten.) Caddier for moduler som opptar et enkelt spor kan plasseres hvor som helst i kolonne 1 eller 3; Thermocycler kan bare plasseres i spor A1 og B1 samtidig.
Generelt, for å installere en modulcaddie:
1. Fjern eventuelle kortstokkspor fra stedet der modulen skal gå. 2. Sett modulen inn i caddien og stram til ankrene. 3. Før modulstrøm- og USB-kablene gjennom sidedekslene, opp gjennom det tomme dekksporet, og
fest dem til modulen. 4. Sett modulholderen inn i sporet og skru den på plass.
For nøyaktige installasjonsinstruksjoner, se hurtigstartguiden eller instruksjonshåndboken for den spesifikke modulen. Kabeltilkoblinger og festemetode til caddien varierer fra modul til modul.
4.3 Modulkalibrering
Når du først installerer en modul på Flex, må du kjøre automatisert posisjonskalibrering. Denne prosessen ligner på posisjonskalibrering for instrumenter, og sikrer at Flex beveger seg til de nøyaktige plasseringene for optimal protokollytelse. Under kalibrering vil Flex flytte til steder på en modulkalibreringsadapter, som ligner på kalibreringsrutene som er en del av flyttbare dekkspor.
Kalibreringsadaptere for Heater-Shaker-, Temperatur- og Thermocycler-modulene.
Modulkalibrering er nødvendig for alle moduler som installeres via en caddie: Heater-Shaker-, Temperatur- og Thermocycler-modulene. Den magnetiske blokken krever ikke kalibrering, og er klar til bruk så snart du plasserer den på dekk.
68
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
Når du skal kalibrere moduler
Flex ber deg automatisk om å utføre kalibrering når du kobler til og slår på en modul som ikke har noen lagrede kalibreringsdata. (Du kan avvise denne forespørselen, men du vil ikke kunne kjøre protokoller med modulen før du kalibrerer den.)
Når du har fullført kalibreringen, lagrer Flex kalibreringsdataene og modulens serienummer for fremtidig bruk. Flex vil ikke be deg om å kalibrere på nytt med mindre du sletter kalibreringsdataene for den modulen i robotinnstillingene. Du kan fritt slå modulen på og av, eller til og med flytte den til en annen kortstokk uten å måtte kalibrere på nytt. Hvis du ønsker å kalibrere på nytt, kan du starte prosessen når som helst fra modulkortet i Opentrons-appen. (Rekalibrering er ikke tilgjengelig fra berøringsskjermen.)
Hvordan kalibrere moduler
Instruksjoner på berøringsskjermen eller i Opentrons-appen vil veilede deg gjennom kalibreringsprosedyren. Generelt er trinnene:
1. Samle det nødvendige utstyret, inkludert modulkalibreringsadapteren og pipettekalibreringsproben. 2. Plasser kalibreringsadapteren på moduloverflaten og sørg for at den er helt i vater.
Noen moduler kan kreve at du fester adapteren til modulen. 3. Fest kalibreringsproben til en pipette. 4. Flex vil automatisk bevege seg for å berøre visse punkter på kalibreringsadapteren og lagre disse
kalibreringsverdier for fremtidig bruk.
Når kalibreringen er fullført og du har fjernet adapteren og sonden, vil modulen være klar til bruk i protokoller.
Du kan når som helst view og administrer modulkalibreringsdataene dine i Opentrons-appen. Gå til Robotinnstillinger for Flex og klikk på fanen Kalibrering.
OPENTRONS FLEX
69
KAPITTEL 4: MODULER
4.4 Heater-shaker modul GEN1
Heater-Shaker funksjoner
OPPVARMING OG RISTING
Heater-Shaker gir oppvarming på dekk og orbital risting. Modulen kan varmes opp til 95 °C, med følgende temperaturprofile:
Temperaturområde: 37 °C Temperaturnøyaktighet: ±95 °C ved 0.5 °C Temperaturensartethet: ±55 °C ved 0.5 °CRamp hastighet: 10 °C/min
Modulen kan riste samples fra 200 til 3000 rpm, med følgende risteprofffile:
Orbital diameter: 2.0 mm Orbital retning: Med klokken Hastighetsområde: 200 rpm Hastighetsnøyaktighet: ±3000 rpm
Modulen har en drevet laboratorielås for å feste platene til modulen før risting.
70
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
TERMISK ADAPTERE En kompatibel termisk adapter kreves for å legge til laboratorieutstyr til Heater-Shakeren. Adaptere kan kjøpes direkte fra Opentrons på https://shop.opentrons.com. For øyeblikket tilgjengelige termiske adaptere inkluderer:
Universal flat adapter
PCR-adapter
Dypbrønnadapter
96 Flatbunnsadapter
PROGRAMVAREKONTROLL
Heater-Shaker er fullt programmerbar i Protocol Designer og Python Protocol API. Python API tillater i tillegg at andre protokolltrinn kan utføres parallelt mens Heater-Shakeren er aktiv. Se Ikke-blokkerende kommandoer i API-dokumentasjonen for detaljer om å legge til parallelle trinn i protokollene dine.
Utenfor protokoller kan Opentrons-appen vise gjeldende status for Heater-Shaker og kan direkte kontrollere varmeapparatet, shakeren og labware-låsen.
OPENTRONS FLEX
71
KAPITTEL 4: MODULER
Heater-Shaker spesifikasjoner
Dimensjoner Vekt Modul strøminngang Strømadapterinngang Nettforsyning voltage fluktuasjon Overvoltage Strømforbruk
152 × 90 × 82 mm (L/B/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60 % Kategori II Tomgang: 10 W
Typisk: Risting: 4 W Oppvarming: 11 W Oppvarming og risting: 10 W
Miljøforhold Omgivelsestemperatur Relativ fuktighet Høyde Forurensningsgrad
Maksimum: 125 W Kun innendørs bruk 130 °C Opptil 20 %, ikke-kondenserende Opp til 25 m over havet 80
72
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
4.5 Magnetisk blokk GEN1
Magnetiske blokkfunksjoner
Opentrons Magnetic Block GEN1 er en magnetisk plateholder med 96 brønner. Magnetiske blokker brukes i protokoller som er avhengige av magnetisme for å trekke partikler ut av suspensjon og holde dem i brønnplater under vask, skylling eller andre elueringsprosedyrer. For eksample, automatisert NGS forberedelse; rensing av genomisk og mitokondrielt DNA, RNA eller proteiner; og andre utvinningsprosedyrer er alle brukstilfeller som kan involvere magnetiske blokker.
MAGNETISKE KOMPONENTER
Den magnetiske blokken er uten strøm, inneholder ingen elektroniske komponenter og beveger ikke magnetiske perler opp eller ned i løsningen. Brønnene består av 96 høystyrke neodym-ringmagneter festet til en fjærbelastet seng, som bidrar til å opprettholde toleranser mellom blokken og pipettene mens de kjører automatiserte protokoller.
PROGRAMVAREKONTROLL
Magnetic Block GEN1 er fullt programmerbar i Protocol Designer og Python Protocol API.
OPENTRONS FLEX
73
KAPITTEL 4: MODULER
Utenfor protokoller er imidlertid ikke berøringsskjermen og Opentrons-appen klar over og kan ikke vise gjeldende status for den magnetiske blokken GEN1. Dette er en modul uten strøm. Den inneholder ikke elektroniske eller mekaniske komponenter som kan kommunisere med Flex-roboten. Du "kontrollerer" den magnetiske blokken via protokoller som bruker Opentrons Flex Gripper for å legge til og fjerne labware fra denne modulen.
Spesifikasjoner for magnetblokker
Dimensjoner Vekt Moduleffekt Magnetkvalitet Miljøforhold Omgivelsestemperatur Relativ fuktighet Høyde Forurensningsgrad
136 × 94 × 45 mm (L/B/H) 1.13 kg Ingen, modulen er uten strøm N52 neodym Kun innendørs bruk 20 °C 25 %, ikke-kondenserende Opp til 30 m over havet 80
74
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
4.6 Temperaturmodul GEN2
Temperaturmodulfunksjoner
OPPVARMING OG KJØLING
Opentrons temperaturmodul GEN2 er en varm og kald platemodul. Det brukes ofte i protokoller som krever oppvarming, kjøling eller temperaturendringer. Modulen kan nå og opprettholde temperaturer fra 4 °C til 95 °C i løpet av minutter, avhengig av modulens konfigurasjon og innhold.
TERMISKE BLOKKER
For å holde laboratorieutstyr på temperatur, bruker modulen termiske aluminiumblokker. Modulen leveres med 24-brønns og 96-brønners termiske blokker. Temperaturmodulen kommer med en dyp brønnblokk og en flat bunnblokk designet for bruk med Flex Gripper. Blokkene inneholder 1.5 mL og 2.0 mL rør, 96-brønns PCR-plater, PCR-strimler, dype brønnplater og flatbunnsplater.
OPENTRONS FLEX
75
KAPITTEL 4: MODULER
Merk: Modulen leveres også med en flat bunnblokk for OT-2. Ikke bruk OT-2-blokken med Flex. Den flate bunnblokken for Flex har ordene "Opentrons Flex" på toppoverflaten. Den for OT-2 gjør det ikke.
24-brønns termisk blokk
96-brønns termisk blokk
Dypbrønn termisk blokk
Flatbunnet termisk blokk for Flex
VANNBAD OG OPPVARMING
Fordi luft er en god termisk isolator, kan hull mellom laboratorieutstyr og en termisk blokk påvirke ytelsen til temperaturmodulen tid til temperatur. Plassering av litt vann i 24- eller 96-brønners termiske blokker eliminerer luftspalter og forbedrer varmeeffektiviteten. Den ideelle mengden vann avhenger av termisk blokk og laboratorieutstyr. Se temperaturmodulens hvitbok for ytterligere anbefalinger.
PROGRAMVAREKONTROLL
Temperaturmodulen er fullt programmerbar i Protocol Designer og Python Protocol API.
Utenfor protokoller kan Opentrons-appen vise gjeldende status for temperaturmodulen og kan direkte kontrollere temperaturen på overflateplaten.
76
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
Temperaturmodul spesifikasjoner
Dimensjoner Vekt Moduleffekt
Miljøforhold Omgivelsestemperatur Relativ fuktighet Høyde Forurensningsgrad
194 × 90 × 84 mm (L/B/H) 1.5 kg Inngang: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Utgang: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks. Kun innendørs bruk <219.6 °C (anbefalt for optimal kjøling ) Opptil 22 %, ikke-kondenserende Opp til 60 m over havet 2000
4.7 Termosyklermodul GEN2
OPENTRONS FLEX
77
KAPITTEL 4: MODULER
Thermocycler funksjoner
Opentrons Thermocycler Module GEN2 er en helautomatisert termosykler på dekk som gir håndfri PCR i et 96-brønners plateformat. Det oppvarmede lokket og engangsforseglingen passer tett over platen, noe som sikrer effektivample oppvarming og minimal fordamping.
OPPVARMING OG KJØLING Thermocycler-blokken kan varmes og avkjøles, og lokket kan varmes opp med følgende temperaturprofffile: Termisk blokk temperaturområde: 4 °C Termisk blokk maksimal oppvarming ramp hastighet: 4.25 °C/s fra GEN2 omgivelsestemperatur til 95 °C Termisk blokk maksimal kjøling ramp hastighet: 2.0 °C/s fra 95 °C til omgivelsestemperatur Lokktemperaturområde: 37 °C Lokktemperaturnøyaktighet: ±110 °C Det automatiserte lokket kan åpnes eller lukkes etter behov under protokollutførelse.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler kan utføre profiles: automatisk sykling gjennom en sekvens av blokktemperaturer for å utføre varmefølsomme reaksjoner.
AUTOMATISERINGSTETNINGER AV GUMMI Thermocycler kommer med automatiserte gummipakninger for å redusere fordampning. Hver forsegling må steriliseres før bruk og kan brukes i flere kjøringer. Ytterligere forseglinger kan kjøpes direkte fra Opentrons på https://shop.opentrons.com.
PROGRAMVAREKONTROLL Thermocycler er fullt programmerbar i Protocol Designer og Python Protocol API. Utenfor protokoller kan Opentrons-appen vise gjeldende status til Thermocycler og kan direkte kontrollere blokktemperaturen, lokktemperaturen og lokkposisjonen.
78
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 4: MODULER
Thermocycler spesifikasjoner
Mål (lokk åpent) Mål (lokk lukket) Vekt (inkludert bakre kanal) Strømadapter vol.tage Strømadapterstrøm Overvoltage Miljøforhold Omgivelsestemperatur Relativ fuktighet Høyde Ventilasjonskrav
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/B/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/B/H) 8.4 kg 100 V ved 240/50 Hz 60 A Kategori II Innendørs bruk kun 8.5 °C; 5 °C (akseptabelt) 20 %, ikke-kondenserende Opp til 25 m over havet Minst 2 cm / 40 mellom enheten og en vegg
OPENTRONS FLEX
79
KAPITTEL 5
Labware
Dette kapittelet dekker elementer i Opentrons Labware Library du kan bruke med Opentrons Flex og Opentrons Flex Gripper. Den dekker også tilpasset labware og, for våre superbrukere, kobler labware-komponenter til deres tilsvarende JSON file definisjoner.
Du kan kjøpe labware fra produsentene av originalutstyr eller fra Opentrons-butikken på https://shop.opentrons.com. Og Opentrons jobber alltid med å verifisere nye laboratorievaredefinisjoner. Se Labware Library (lenket ovenfor) for de siste oppføringene.
5.1 Labware-konsepter
Labware omfatter mer enn bare objektene plassert på dekket og brukt i en protokoll. For å hjelpe deg å forstå Opentrons labware, la oss undersøke dette emnet fra tre forskjellige perspektiver. For Opentrons Flex inkluderer labware elementer i vårt Labware-bibliotek, data som definerer hver del av labware, og tilpasset labware.
Labware som maskinvare
Labware-biblioteket inkluderer alt du kan bruke som standard med Opentrons Flex. Dette er holdbare komponenter og forbruksartikler som du arbeider med, gjenbruker eller forkaster mens du kjører en protokoll. Du trenger ikke ta noen spesielle skritt for å jobbe med elementene i Labware-biblioteket. Flex-roboten vet hvordan den skal jobbe med alt i biblioteket automatisk.
Labware som data
Labware-informasjon lagres i Javascript-objektnotasjon (JSON) files med .json file utvidelser. En JSON file inkluderer romlige dimensjoner (lengde, bredde, høyde), volumetrisk kapasitet (L, mL) og andre beregninger som definerer overflateegenskaper, deres former og plassering. Når du kjører en protokoll, leser Flex disse .json files å vite hva labware er på dekk og hvordan du arbeider med det.
80
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Tilpasset labvare
Custom Labware er labware som ikke er inkludert i Labware Library eller er labware laget av Custom Labware Creator. Men noen ganger kommer ideen om tilpasset labware tynget av forestillinger om kompleksitet, utgifter eller vanskeligheter. Men tilpasset labware bør ikke være vanskelig å forstå eller lage. La oss ta et øyeblikk til å pakke ut konseptet med tilpasset labware.
Som eksample, Opentrons Labware Library inkluderer 96-brønns plater (200 L) fra Corning og BioRad, men andre produsenter lager også disse brønnplatene. Og takket være allment aksepterte industristandarder er forskjellene mellom disse allestedsnærværende laboratorieelementene små. Imidlertid er en vanlig 200 L, 96-brønns plate fra Stellar Scientific, Oxford Lab eller Krackeler Scientific (eller en annen leverandør for den saks skyld) "tilpasset labware" for Flex fordi den ikke er forhåndsdefinert i vårt Labware Library . I tillegg kan mindre forskjeller i labware-dimensjoner ha en drastisk innvirkning på suksessen til protokollkjøringen din. Av denne grunn er det viktig å ha en nøyaktig definisjon av labware for hver labware du vil bruke i protokollen.
Også, mens tilpasset labware kan være et esoterisk, engangssett, er det mesteparten av tiden bare spissene, platene, rørene og stativene som brukes hver dag i laboratorier over hele verden. Igjen, den eneste forskjellen mellom Opentrons labware og tilpasset labware er at det nye elementet ikke er forhåndsdefinert i programvaren som driver roboten. Flex kan, og fungerer, med andre grunnleggende labware-artikler eller noe unikt, men du må registrere det elementets egenskaper i en labware-definisjon JSON file og importer disse dataene til Opentrons-appen. Se avsnittet Custom Labware-definisjoner nedenfor for mer informasjon.
For å oppsummere inkluderer labware:
Alt i Opentrons Labware Library. Labware-definisjoner: data i en JSON file som definerer former, størrelser og muligheter for individuelle elementer
som brønnplater, spisser, reservoarer osv. Tilpasset labware, som er elementer som ikke er inkludert i Labware Library.
Etter reviewmed disse viktige konseptene, la oss undersøke kategoriene og elementene i Opentrons Labware Library. Etter det avslutter vi kapitlet med en overview av datakomponentene til et laboratorium file og oppsummere Opentrons funksjoner og tjenester som hjelper deg med å lage tilpasset labware.
OPENTRONS FLEX
81
KAPITTEL 5: LABVARE
5.2 Reservoarer
Opentrons Flex fungerer som standard med enkelt- og flerbrønnsreservoarene som er oppført nedenfor. Å bruke disse reservoarene bidrar til å redusere forberedelsesarbeidet fordi de er automatiserte rett ut av esken. Reservoarinformasjon er også tilgjengelig i Opentrons Labware Library.
Reservoarer med én brønn
Produsentens spesifikasjoner
Agilent
290 mL V bunn
Aksygen
90 mL Flatbunn
REDE
195 mL Flatbunn
290 mL V bunn
API-lastnavn
agilient_1_ reservoar_290ml
oksygen_1_ reservoar_90 ml
reir_1_ reservoar_195 ml
reir_1_ reservoar_290 ml
Reservoarer med flere brønner
Produsentens spesifikasjoner
REDE
12 brønner 15 mL/brønn V bunn
USA Scientific
12 brønner 22 mL/brønn V bunn
API-lastnavn nest_12_ reservoar_15ml
usascientific_12_ reservoar_22ml
82
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Reservoarer og API-definisjoner
Opentrons Labware Library definerer egenskapene til reservoarene som er oppført ovenfor i separat JSON files. Roboten og Opentrons Python API er avhengig av disse JSON-definisjonene for å fungere med laboratorievare som brukes av protokollene dine. For eksample, når du arbeider med API, godtar ProtocolContext.load_labware-funksjonen disse labware-navnene som gyldige parametere i koden din. Koblede API-lastnavn kobles til definisjonene av reservoarlabware i Opentrons GitHub-depot.
Tilpasset reservoar labware
Prøv å lage en egendefinert definisjon av laboratorievare med Opentrons Labware Creator hvis et reservoar du ønsker å bruke ikke er oppført her. En tilpasset definisjon kombinerer alle dimensjoner, metadata, former, volumetrisk kapasitet og annen informasjon i en JSON file. Opentrons Flex trenger denne informasjonen for å forstå hvordan du arbeider med din egendefinerte laboratorievare. Se delen Custom Labware Definitions for mer informasjon.
5.3 Brønnplater
Opentrons Flex fungerer som standard med brønnplater oppført nedenfor. Å bruke disse brønnplatene bidrar til å redusere forberedelsesarbeidet fordi de er automatiseringsklare rett ut av esken. Brønnplateinformasjon er også tilgjengelig i Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
83
KAPITTEL 5: LABVARE
6-brønns plater
Produsent Corning
Spesifikasjoner
6 brønner 16.8 mL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
API-lastnavn corning_6_brønnplate_16.8ml_flat
12-brønns plater
Produsent Corning
Spesifikasjoner
12 brønner 6.9 mL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
API-lastnavn corning_12_brønnplate_6.9ml_flat
24-brønns plater
Produsent Corning
Spesifikasjoner
24 brønner 3.4 mL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
API-lastnavn corning_24_brønnplate_3.4ml_flat
48-brønns plater
Produsent Corning
Spesifikasjoner
48 brønner 1.6 mL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
API-lastnavn corning_48_brønnplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
96-brønns plater
Produsent Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific
Spesifikasjoner
96 brønner 200 µL/brønn Sirkulære brønner, V-bunn
96 brønner 360 µL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
96 brønner 100 µL/brønn Sirkulære brønner, V-bunn PCR fullt skjørt
96 brønner 200 µL/brønn Sirkulære brønner, flat bunn
96 dype brønner 2000 µL/brønn Firkantede brønner, V-bunn
Tøffe 96 brønner 200 µL/brønn Sirkulære brønner, V-bunn PCR fullt skjørt
Nunc 96 dype brønner 1300 µL/brønn Sirkulære brønner, U-bunn
Nunc 96 dype brønner 2000 µL/brønn Sirkulære brønner, U-bunn
96 dype brønner 2.4 mL/brønn Firkantede brønner, U-bunn
API-lastnavn biorad_96_brønnplate_200ul_pcr
corning_96_brønnplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
reir_96_brønnplate_200ul_flat
nest_96_brønnplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ skjørt
thermoscientificnunc_96_brønnplate_ 1300ul termovitenskapelignunc_96_brønnplate_ 2000ul usascientific_96_brønnplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
KAPITTEL 5: LABVARE
384-brønns plater
Produsent Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Spesifikasjoner
384 brønner 40 µL/brønn Sirkulære brønner, V-bunn
384 brønner 50 µL/brønn Sirkulære brønner, V-bunn
384 brønner 112 µL/brønn Firkantede brønner, flat bunn
API-lastnavn anvendt biosystemsmicroamp_384_ brønnplate_40ul biorad_384_brønnplate_50ul
corning_384_brønnplate_112ul_flat
Brønnplateadaptere
Aluminiumsplatene oppført nedenfor er termiske adaptere for Opentrons Heater-Shaker GEN1-modul. Du kan bruke disse frittstående adapterdefinisjonene til å laste Opentrons-verifiserte eller tilpassede labware på toppen av Heater-Shakeren.
Adaptertype Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter
API-lastnavn opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Du kan også laste både adapteren og labware med en enkelt definisjon. Vårt Labware-bibliotek inkluderer flere forhåndskonfigurerte termiske adaptere og labware-kombinasjoner som gjør Heater-Shaker klar til bruk rett ut av esken.
86
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Merk: Ikke bruk en kombinert definisjon hvis du trenger å flytte labware på eller av Heater-Shakeren under protokollen, enten med griperen eller manuelt. Bruk en frittstående adapterdefinisjon i stedet.
Kombinasjon av adapter/labware
API-lastnavn
Opentrons 96 dypbrønnvarmer-shakeradapter med NEST dypbrønnplate 2 mL
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 flatbunnsvarmer-shakeradapter med NEST 96-brønnsplate 200 µL flat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter med NEST Well Plate 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter med Corning 384 Well Plate 112 µL Flat
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adaptere kan kjøpes direkte fra Opentrons på https://shop.opentrons.com.
Brønnplater og API-definisjoner
Opentrons Labware Library definerer egenskapene til brønnplatene oppført ovenfor i separat JSON files. Flex-roboten og Opentrons Python API er avhengig av disse JSON-definisjonene for å fungere med laboratorievare som brukes av protokollene dine. For eksample, når du arbeider med API, godtar ProtocolContext.load_labware-funksjonen disse labware-navnene som gyldige parametere i koden din. Koblede API-lastnavn kobles til brønnplatelabwaredefinisjonene i Opentrons GitHub-depot.
Tilpasset brønnplate labware
Prøv å bruke Opentrons Labware Creator for å lage en egendefinert labware-definisjon hvis en brønnplate du ønsker å bruke ikke er oppført her. En tilpasset definisjon kombinerer alle dimensjoner, metadata, former, volumetrisk kapasitet og annen informasjon i en JSON file. Opentrons Flex leser denne informasjonen for å forstå hvordan du arbeider med din egendefinerte laboratorievare. Se delen Custom Labware Definitions for mer informasjon.
OPENTRONS FLEX
87
KAPITTEL 5: LABVARE
5.4 Spisser og tippstativer
Opentrons Flex-spisser kommer i størrelsene 50 µL, 200 µL og 1000 µL. Dette er klare, ikke-ledende polypropylenspisser som er tilgjengelige med eller uten filter. De er pakket sterilt i stativer som inneholder 96 tips og er fri for DNase, RNase, protease, pyrogener, humant DNA, endotoksiner og PCR-hemmere. Reoler inkluderer også lotnummer og utløpsdatoer.
Flex pipettespisser fungerer med Opentrons Flex 50 µL og 1000 µL pipetter i 1-, 8- og 96-kanals konfigurasjoner. Mens du kan sette hvilken som helst av Flex-spissene på 50 L og 1000 L pipettene, prøv å matche spissen til pipettens nominelle kapasitet. For eksample, kan det være rart å sette en 1000 L spiss på 50 L pipetten. For 1000 L pipetten kan du absolutt bruke en 50 L, 200 L eller 1000 L spiss.
Tips stativer
Ufiltrerte og filtrerte spisser er samlet i et stativ som består av en gjenbrukbar bunnplate, en midtplate som rommer 96 spisser, og et lokk.
Tipsstativ etter volum 50 µL 200 µL 1000 µL
API-lastnavn
Ufiltrert: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrert: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Ufiltrert: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrert: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Ufiltrert: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrert: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
For å hjelpe med identifisering er midtplatene for spissstativet fargekodet basert på spissens størrelse:
50 µL: magenta 200 L: gul 1000 µL: blå
88
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Ved bestilling eller ombestilling kommer tips og stativer i to forskjellige pakkede konfigurasjoner:
Stativ: Består av separat krympepakkede tuppstativer (bunnplate, midtplate med spisser og lokk). Rack-konfigurasjoner er best når renslighet er avgjørende, for å unngå krysskontaminering, eller når protokollene dine ikke tillater gjenbruk av grunnplater eller komponenter.
Påfyll: Består av ett komplett tippstativ (bunnplate, midtplate med spisser og lokk) og individuelle spisserbeholdere. Påfyllingskonfigurasjoner er best når protokollene dine tillater gjenbruk av grunnplater eller komponenter.
Tippipette-kompatibilitet
Flex-pipettespisser er designet for Opentrons Flex-pipetter. Flex-spisser er ikke bakoverkompatible med Opentrons OT-2-pipetter, og du kan heller ikke bruke OT-2-spisser på Flex-pipetter.
Andre bransjestandardspisser kan fungere med Flex-pipetter, men dette anbefales ikke. For å sikre optimal ytelse bør du kun bruke Opentrons Flex-spisser med Flex-pipetter.
Tips rack adapter
96-kanals pipetten krever en adapter for å feste et helt stativ med tips på riktig måte. Under festeprosedyren beveger pipetten seg over adapteren, senker seg ned på monteringspinnene og trekker spissene på pipettene ved å løfte adapteren og spissstativet.
OPENTRONS FLEX
89
KAPITTEL 5: LABVARE
Merk: Bruk kun tipsstativadapteren når du plukker opp et fullt stativ med tips på en gang. Plasser spissstativer direkte på dekket når du plukker opp færre tips.
Advarsel: Klempunktsfare. Hold hendene borte fra spissenstativadapteren mens pipetten fester pipettespissene.
Adapter type Opentrons Flex 96 Tips Rack Adapter
API-lastnavn opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Tippstativadapteren er kompatibel med Opentrons Flex Gripper. Du kan bruke griperen til å plassere ferske tippstativer på adapteren eller til å plukke opp og flytte brukte tipsstativer inn i avfallsrennen.
5.5 Rør og rørstativ
Opentrons 4-i-1 rørstativ-system fungerer med Opentrons Flex som standard. Å bruke 4-i-1-rørstativet bidrar til å redusere forberedelsesarbeidet fordi kombinasjonene det gir er automatiseringsklare rett ut av esken. Mer informasjon er også tilgjengelig i Opentrons Labware Library.
90
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Rør- og stativkombinasjoner
Opentrons 4-i-1 rørstativ støtter et bredt utvalg av rørstørrelser, enkeltvis eller i forskjellige størrelseskombinasjoner (volum). Disse inkluderer et: 6-rørsstativ for 50 mL rør (6 x 50 mL). 10-rørs kombinasjonsstativ for fire 50 mL rør og seks 15 mL rør (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). 15-rørsstativ for 15 mL rør (15 x 15 mL). 24-rørsstativ for 0.5 mL, 1.5 mL eller 2 mL rør (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Merk: Alle rør er sylindriske med V-formet (konisk) bunn med mindre annet er angitt.
6-rørs stativer
Rør type 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-rørs stativer
Rørtype 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL
API-lastnavn opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
KAPITTEL 5: LABVARE
15-rørs stativer
Rør type 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
API-lastnavn opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24-rørs stativer
Rørtype
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, U-formet bunn 24 generisk 2 mL skrukork 24 NEST 0.5 mL skrukork 24 NEST 1.5 mL skrukork 24 NEST 1.5 mL snapcap 24 NEST 2 mL NEST 24 mL trykklokk, U-formet bunn
API-lastnavn opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Rørstativ API-definisjoner
Opentrons Labware Library definerer egenskapene til rørstativene oppført ovenfor i separat JSON files. Flex-roboten og Opentrons Python API er avhengig av disse JSON-definisjonene for å fungere med laboratorievare som brukes av protokollene dine. For eksample, når du arbeider med API, godtar ProtocolContext.load_labware-funksjonen disse labware-navnene som gyldige parametere i koden din. Koblede API-lastnavn kobles til definisjonene av tube rack-labware i Opentrons GitHub-depot.
92
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Tilpasset laboratorieutstyr for rørstativ
Prøv å lage en egendefinert definisjon av laboratorievare ved å bruke Opentrons Labware Creator hvis en kombinasjon av rør og stativ du vil bruke ikke er oppført her. En tilpasset definisjon kombinerer alle dimensjoner, metadata, former, volumetrisk kapasitet og annen informasjon i en JSON file. Opentrons Flex leser denne informasjonen for å forstå hvordan du arbeider med din egendefinerte laboratorievare. Se delen Custom Labware Definitions for mer informasjon.
5.6 Aluminiumsblokker
Aluminiumsblokker leveres med temperaturmodulen GEN2 og kan kjøpes separat som et tredelt sett. Settet inkluderer en flat bunnplate, en 24-brønns blokk og en 96-brønns blokk.
Opentrons Flex bruker aluminiumsblokker for å holde sample rør og brønnplater på temperaturmodulen eller direkte på dekk. Når de brukes med temperaturmodulen, kan aluminiumsblokkene beholde din sample-rør, PCR-strimler eller plater ved en konstant temperatur mellom 4 °C og 95 °C.
Flat bunnplate
Den flate bunnplaten for Flex leveres med temperaturmodulens caddie og er kompatibel med forskjellige ANSI/SLAS standard brønnplater. Denne flate platen skiller seg fra platen som leveres med selve temperaturmodulen eller det separate tredelte settet. Den har en bredere arbeidsflate og avfasede hjørneklemmer. Disse funksjonene bidrar til å forbedre ytelsen til Opentrons Flex Gripper når du flytter laboratorieutstyr på eller av platen.
Du kan se hvilken flat bunnplate du har fordi den for Flex har ordene "Opentrons Flex" på toppoverflaten. Den for OT-2 gjør det ikke.
OPENTRONS FLEX
93
KAPITTEL 5: LABVARE
24-brønns aluminiumsblokk
24-brønns blokken brukes med individuelle sample hetteglass. For eksample, den godtar sample hetteglass som:
Ha V-formet eller U-formet bunn. Sikre innholdet med trykklokk eller skrukork. Hold væske i kapasiteter på 0.5 mL, 1.5 mL og 2 mL.
96-brønns aluminiumsblokk
96-brønns blokken støtter et bredt utvalg av brønnplatetyper. For eksample, den godtar brønnplater som er:
Fra store brønnplateprodusenter som Bio-Rad og NEST.
Designet med V-formet bunn, U-formet bunn eller flat bunn.
Designet med 100 µL eller 200 µL brønner.
Den er også kompatibel med generiske PCR-strips.
Frittstående adaptere
Termisk blokk Flex flat bunnplate 24-brønns aluminiumsblokk 96-brønns aluminiumsblokk
API-lastnavn opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Se kombinasjoner av laboratorievare nedenfor. opentrons_96_brønn_aluminiumsblokk
Kombinasjoner av laboratorieutstyr av aluminiumblokker
Opentrons Labware Library støtter følgende blokk-, hetteglass- og brønnplatekombinasjoner, som også er definert i separat JSON-labwaredefinisjon files. Flex-roboten og Opentrons Python API
94
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
stole på disse JSON-definisjonene for å fungere med labware som brukes av protokollene dine. For eksample, når du arbeider med API, godtar ProtocolContext.load_labware-funksjonen disse labware-navnene som gyldige parametere i koden din. Tabellene nedenfor viser standard blokk-/beholderkombinasjoner og relaterte API-lastnavn. Lenker kobles til tilsvarende JSON-definisjoner i Opentrons GitHub-depot.
Merk: Alle rør har V-formet bunn med mindre annet er angitt.
24-brønners laboratorieutstyrskombinasjoner av aluminiumblokker
24-brønners blokkinnhold Generisk 2 mL skrukork NEST 0.5 mL skrukork NEST 1.5 mL skrukork NEST 1.5 mL snaphette NEST 2 mL skrukork NEST 2 mL snaphette, U-formet bunn
API-belastningsnavn opentrons_24_aluminiumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_luminum_capnest _24_aluminiumblock_nest_2ml_snapcap
96-brønners laboratorieutstyrskombinasjoner av aluminiumblokker
96-brønns blokkinnhold Bio-Rad-brønnplate 200 µL Generisk PCR-strimmel 200 µL NEST-brønnplate 100 µL
API-lastnavn opentrons_96_aluminiumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminiumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminiumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
KAPITTEL 5: LABVARE
5.7 Labware og Opentrons Flex Gripper
Selv om Opentrons Flex fungerer med alt inventaret i Labware-biblioteket, er Opentrons Flex Gripper kun kompatibel med spesifikke laboratorievarer. For øyeblikket er Gripper optimalisert for bruk med følgende laboratorieutstyr.
Labware kategori dype brønnplater med skjørt 96 brønnplater
Tipsstativer (ufiltrerte og filtrerte tips)
Merker
NEST 96 dypbrønnplate 2 mL
Opentrons Tough 96 Well Plate 200 µL PCR Full Skirt NEST 96 Well Plate 200 µL Flat
Opentrons Flex 96 Tips Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tips Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tips Rack 1000 µL
Merk: For best resultat, bruk Flex Gripper kun med laboratorieutstyret oppført ovenfor. Flex Gripper kan fungere med annen ANSI/SLAS-automatiseringskompatibel laboratorievare, men dette anbefales ikke.
5.8 Egendefinerte definisjoner av laboratorievare
Som diskutert i begynnelsen av dette kapittelet, er tilpasset labware labware som ikke er oppført i Opentrons Labware Library. Du kan bruke andre vanlige eller unike laboratorieartikler med Flex ved nøyaktig å måle og registrere egenskapene til det objektet og lagre disse dataene i en JSON file. Når de importeres til appen, bruker Flex og API de JSON-dataene til å samhandle med laboratorievaren din. Opentrons tilbyr verktøy og tjenester, som vi vil undersøke nedenfor, for å hjelpe deg med å bruke Flex med tilpasset labware.
96
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
Opprette egendefinerte definisjoner av laboratorievare
Opentrons verktøy og tjenester hjelper deg med å sette tilpasset labware innen rekkevidde. Disse funksjonene passer til ulike ferdighetsnivåer og arbeidsmåter. Å lage din egen laboratorievare, og bruke den med Opentrons Flex, bidrar til å gjøre roboten til et allsidig og kraftig tillegg til laboratoriet ditt.
TILPASSET LABVARESKAPER
Custom Labware Creator er en ikke-kode, web-basert verktøy som bruker et grafisk grensesnitt for å hjelpe deg med å lage en definisjon av laboratorievare file. Labware Creator produserer en JSON-labwaredefinisjon file som du importerer til Opentrons-appen. Etter det er din egendefinerte labware tilgjengelig for Flex-roboten og Python API.
TILPASSET LABWARE SERVICE
Ta kontakt med oss hvis laboratorievaren du vil bruke ikke er tilgjengelig i biblioteket, hvis du ikke kan lage dine egne definisjoner, eller fordi et tilpasset element inneholder forskjellige former, størrelser eller andre uregelmessigheter beskrevet nedenfor.
Labware du kan definere i Labware Creator
; Brønner og rør er ensartede og identiske. ; Alle rader er jevnt fordelt
(avstanden mellom radene er lik).
; Alle kolonnene er jevnt fordelt (avstanden mellom kolonnene er lik).
; Passer perfekt i ett dekkspor.
Labware Opentrons må definere ; Brønner og rørformer varierer. ; Radene er ikke jevnt fordelt.
; Kolonnene er ikke jevnt fordelt.
; Mindre enn ett kortstokkspor (krever adapter) eller spenner over flere kortstokkspor.
OPENTRONS FLEX
97
KAPITTEL 5: LABVARE
Her er noen diagrammer som hjelper deg å visualisere eksenamples beskrevet ovenfor. Vanlig Alle kolonner er jevnt fordelt og alle rader er jevnt fordelt. Kolonner trenger ikke ha samme avstand som rader.
Vanlig Gitteret trenger ikke å være i midten av laboratorieutstyret.
Uregelmessige rader er jevnt fordelt, men kolonnene er ikke jevnt fordelt.
Uregelmessige kolonner/rader er jevnt fordelt, men brønnene er ikke identiske.
Uregelmessig Det er mer enn ett rutenett.
Vårt labware-team vil jobbe for å forstå dine behov og designe tilpassede labware-definisjoner for deg. Se støtteartiklene Request a Custom Labware Definition og Custom Labware Request-skjemaet for mer informasjon. Dette er en avgiftsbasert tjeneste.
98
OPENTRONS FLEX
KAPITTEL 5: LABVARE
PYTHON API
Selv om du ikke kan lage tilpasset labware med vår API, kan du bruke tilpasset labware med de tilgjengelige API-metodene. Du må imidlertid først definere din egendefinerte labware og importere den til Opentrons-appen. Når du har lagt til labware til Opentrons-appen, er den tilgjengelig for Python API og roboten. Se delen Custom Labware Definitions i Python API-dokumentasjonen for mer informasjon. For informasjon om skriving av protokollskript med API, se Python Protocol API-delen i kapittelet Protocol Development.
JSON labware-skjema
En JSON file er planen for Opentrons standard og tilpassede labware. Dette file inneholder og organiserer labware-data i henhold til designspesifikasjonene satt av standardskjemaet.
Et skjema er en ramme
Dokumenter / Ressurser
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex åpen kildekode væskehåndteringsrobot [pdf] Bruksanvisning FLEX Opentrons Flex åpen kildekode væskehåndteringsrobot, FLEX, Opentrons Flex åpen kildekode væskehåndteringsrobot, Flex åpen kildekode væskehåndteringsrobot, åpen kildekode væskehåndteringsrobot, kildekode væskehåndteringsrobot, væskehåndteringsrobot, håndteringsrobot, robot |