Robot do obsługi cieczy FLEX Opentrons Flex Open Source
“
Opentron Flex
Dane techniczne:
- Dane ogólne: Lorem ipsum ból siedzi
amet, consectetur adipiscing elita. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Specyfikacje środowiskowe: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elita. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Certyfikaty: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elita. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Numer seryjny: XXX-XXXX-XXXXXX
Instrukcje dotyczące stosowania produktu:
1. Instalacja i kalibracja przyrządu:
Postępuj zgodnie z instrukcjami zawartymi w instrukcji obsługi pipety i chwytaka
instalacja.
2. Przeprowadzka:
Informacje na temat krótkich ruchów można znaleźć w rozdziale 2.5 instrukcji. Dla
przeprowadzki na duże odległości, postępuj zgodnie z podanymi wytycznymi. Ogólne w ruchu
dostępne są również porady.
3. Połączenia:
Upewnij się, że podłączenie zasilania jest prawidłowe, jak opisano w instrukcji.
W razie potrzeby podłącz urządzenia USB i pomocnicze. Połączenia sieciowe
należy ustalić zgodnie z instrukcją.
4. Projektant protokołu:
Poznaj wymagania dotyczące Projektanta protokołów i dowiedz się, jak to zrobić
zaprojektować nowe protokoły lub zmodyfikować istniejące zgodnie z wymaganiami laboratorium
wymagania.
5. API protokołu Python:
Poznaj pisanie i uruchamianie skryptów przy użyciu interfejsu API protokołu Python.
Odkryj ekskluzywne funkcje Pythona, aby zwiększyć funkcjonalność.
6. Protokoły OT-2:
Dowiedz się o protokołach OT-2 Python, protokołach OT-2 JSON i
Protokoły modułów magnetycznych do różnych typów eksperymentów.
Najczęściej zadawane pytania (FAQ):
P: Jak rozwiązać problem, jeśli robot się nie porusza?
oczekiwany?
Odp.: Sprawdź połączenie zasilania, upewnij się, że kalibracja jest prawidłowa
przyrządów i sprawdzić, czy nie ma żadnych przeszkód w ich działaniu
ścieżkę robota.
P: Czy mogę używać niestandardowych pipet z Opentrons Flex?
Odp.: Opentrons zaleca stosowanie kompatybilnych pipet w celu uzyskania optymalnych wyników
wydajność i dokładność.
„`
Opentron Flex
Instrukcja obsługi
Opentrons Labworks Inc.
Grudzień 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Zastrzeżonych nazw, znaków towarowych itp. użytych w tym dokumencie, nawet jeśli nie są one specjalnie oznaczone jako takie, nie należy uważać za niechronione przez prawo.
Spis treści
Przedmowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktura niniejszej instrukcji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Uwagi i ostrzeżenia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Rozdział 1 Wstęp . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Witamy w Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Co nowego w Flexie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 stacji roboczych Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Informacje dotyczące bezpieczeństwa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Symbole bezpieczeństwa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Ostrzeżenia dotyczące bezpieczeństwa elektrycznego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Dodatkowe ostrzeżenia dotyczące bezpieczeństwa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Przestrogi dotyczące bezpieczeństwa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Bezpieczeństwo biologiczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Toksyczne opary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Ciecze łatwopalne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Zgodność z przepisami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Bezpieczeństwo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kompatybilność elektromagnetyczna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Ostrzeżenia i uwagi FCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Zgodność z kanadyjskim ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Ostrzeżenie dotyczące ochrony środowiska . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wstępna certyfikacja Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Rozdział 2: Instalacja i przeniesienie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Wymagania dotyczące bezpieczeństwa i obsługi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Gdzie umieścić Opentron Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Pobór mocy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Warunki środowiskowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Rozpakowywanie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Wymagany wysiłek i czas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Skrzynia i materiały opakowaniowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elementy produktu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Część 1: Zdejmij skrzynię . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Część 2: Zwolnij napięcie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Część 3: Montaż końcowy i włączenie zasilania . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Pierwsze uruchomienie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Włącz zasilanie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Połącz się z siecią lub komputerem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Zainstaluj aktualizacje oprogramowania . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Zamontuj zawieszkę wyłącznika awaryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Nadaj swojemu robotowi imię . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instalacja i kalibracja przyrządu . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Instalacja pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Montaż chwytaka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 40
2.5 Przeniesienie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Krótkie ruchy. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Ruchy długodystansowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Ogólne porady dotyczące przeprowadzek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Ostatnie przemyślenia na temat przeprowadzki. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Rozdział 3: Opis systemu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Elementy fizyczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Rama i obudowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Pokład i obszar roboczy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 Stagobszar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Osprzęt pokładowy. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Zsyp na śmieci. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49 Stagszczeliny obszarowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 System poruszania się . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Ekran dotykowy i wyświetlacze LED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Specyfikacje pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Kalibracja pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adapter statywu na końcówki do pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Częściowe zbieranie końcówek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Czujniki pipetowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Aktualizacje oprogramowania sprzętowego pipety . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Chwytak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Specyfikacje chwytaka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibracja chwytaka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Aktualizacje oprogramowania sprzętowego chwytaka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Zawieszka wyłącznika awaryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kiedy używać wyłącznika awaryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Włączanie i zwalnianie wyłącznika awaryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 60
3.5 Połączenia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Podłączenie zasilania . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Złącza USB i pomocnicze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Połączenia sieciowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 62
3.6 Specyfikacje systemu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specyfikacje ogólne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specyfikacje środowiskowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Certyfikaty .64. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Numer seryjny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 64
Rozdział 4: Moduły . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Obsługiwane moduły . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 System mocowania modułów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Kalibracja modułu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kiedy kalibrować moduły. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Jak kalibrować moduły . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Moduł nagrzewnicy-wstrząsacza GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Funkcje podgrzewacza i wytrząsarki. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specyfikacje podgrzewacza i wytrząsarki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Blok magnetyczny GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Funkcje bloku magnetycznego. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specyfikacje bloku magnetycznego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Moduł temperaturowy GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Funkcje modułu temperatury . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specyfikacje modułu temperatury . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Moduł termocyklera GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Funkcje termocyklera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specyfikacje termocyklerów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Rozdział 5: Sprzęt laboratoryjny . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Koncepcje sprzętu laboratoryjnego. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Sprzęt laboratoryjny jako sprzęt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Sprzęt laboratoryjny jako dane . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Niestandardowe przybory laboratoryjne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Zbiorniki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Zbiorniki jednoodwiertowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Zbiorniki wieloodwiertowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Zbiorniki i definicje API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Niestandardowe wyposażenie laboratoryjne ze zbiornikiem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Płytki dołkowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Płytki 6-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 płytki 12-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 płytki 24-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 płytki 48-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 płytki 96-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 płytki 384-dołkowe. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Adaptery płytek dołkowych .86. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Płytki dołkowe .86 i definicje API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Niestandardowe sprzęt laboratoryjny do płytek dołkowych. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Końcówki i stojaki na końcówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Stojaki na końcówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Kompatybilność z pipetą . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adapter stojaka na końcówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Probówki i stojaki na probówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinacje rur i stojaków . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stojaki na 6 probówek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 stojaków na 10 probówek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stojaki na 15 probówek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Stojaki na 24 probówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Definicje API stojaków na probówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Niestandardowe przybory laboratoryjne do stojaków na probówki . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Bloki aluminiowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Płaska płyta dolna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-studzienkowy blok aluminiowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-studzienkowy blok aluminiowy . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Adaptery autonomiczne . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Zestawy akcesoriów laboratoryjnych z bloków aluminiowych . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinacje akcesoriów laboratoryjnych z 24-dołkowymi blokami aluminiowymi . . . . . . . . .95 Kombinacje akcesoriów laboratoryjnych z 96-dołkowymi blokami aluminiowymi . . . . . . . . .95 5.7 Sprzęt laboratoryjny i chwytak Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Tworzenie niestandardowych definicji akcesoriów laboratoryjnych . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Schemat sprzętu laboratoryjnego JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Definicje sprzętu laboratoryjnego JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Rozdział 6: Opracowanie protokołu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Gotowe protokoły . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Biblioteka protokołów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Usługa opracowywania protokołu niestandardowego . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Projektant protokołu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Wymagania projektanta protokołu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Projektowanie protokołu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Modyfikowanie istniejących protokołów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API protokołu Pythona. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Pisanie i uruchamianie skryptów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 funkcji dostępnych wyłącznie w języku Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Protokoły OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 Protokoły Pythona OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 Protokoły JSON OT-2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protokoły modułu magnetycznego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Rozdział 7: Oprogramowanie i obsługa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Obsługa ekranu dotykowego. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Pulpit robota . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Zarządzanie protokołami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Szczegóły protokołu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Uruchom konfigurację . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Kontrola położenia sprzętu laboratoryjnego . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Uruchom postęp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Zakończenie przebiegu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Zarządzanie instrumentami. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Ustawienia robota. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfiguracja pokładu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Aplikacja Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalacja aplikacji . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Przesyłanie protokołów do Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Stan modułu i sterowanie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Ostatnie uruchomienia protokołu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Zaawansowana obsługa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Notatnik Jupytera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operacje z wiersza poleceń przez SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Rozdział 8: Konserwacja i serwis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Czyszczenie Flexa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Zanim zaczniesz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Co możesz wyczyścić . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Rozwiązania czyszczące. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Czyszczenie ram i szyb . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Czyszczenie tarasu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Czyszczenie suwnicy. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Czyszczenie zsypu śmieci. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Czyszczenie pipet i końcówek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminacja pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Czyszczenie końcówek do pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Czyszczenie chwytaka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Moduły czyszczące. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Ogólne czyszczenie modułu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Uszczelki termocyklera. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Sprzęt laboratoryjny nadający się do autoklawowania . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Elastyczny serwis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Usługi Opentronów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kwalifikacja instalacyjna i kwalifikacja operacyjna . . . 155 Konserwacja zapobiegawcza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Gwarancja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Dodatek A: Glosariusz . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Załącznik B: Dokumentacja dodatkowa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Centrum wiedzy Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentacja API protokołu Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Informacje o API HTTP Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentacja deweloperska . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Dodatek C: Oprogramowanie typu open source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons na GitHubie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Monorepo Opentronów . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Inne repozytoria . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Załącznik D: Wsparcie i informacje kontaktowe . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Sprzedaż . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Wsparcie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Informacje biznesowe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Przedmowa
Witamy w instrukcji obsługi robota do transportu cieczy Opentrons Flex. Niniejsza instrukcja przeprowadzi Cię przez prawie wszystko, co musisz wiedzieć, aby skonfigurować i używać Flex, koncentrując się na tematach, które są najbardziej istotne dla codziennych użytkowników Flex w środowisku laboratoryjnym.
Struktura tej instrukcji
Opentrons Flex to złożony system, dlatego istnieje wiele różnych ścieżek poznania wszystkich jego możliwości. Możesz od razu przejść do rozdziału poświęconego dowolnemu tematowi, który Cię interesuje! Na przykładample, jeśli masz już skonfigurowanego Flexa w swoim laboratorium, możesz pominąć rozdział Instalacja i przeniesienie.
Jeśli wolisz podejście z przewodnikiem, struktura tego podręcznika pozwala na zapoznanie się z nim od początku do końca.
Dowiedz się o Flexie. Cechy wyróżniające Flex zostały wymienione w Rozdziale 1: Wprowadzenie. Wprowadzenie zawiera także ważne informacje dotyczące bezpieczeństwa i przepisów.
Zacznij korzystać z Flexa. Jeśli chcesz skonfigurować Flex, postępuj zgodnie ze szczegółowymi instrukcjami w Rozdziale 2: Instalacja i przeniesienie. Następnie zapoznaj się ze składnikami Flex w Rozdziale 3: Opis systemu.
Skonfiguruj swoją talię. Skonfigurowanie talii umożliwia różne zastosowania naukowe na platformie Flex. Rozdział 4: Moduły opisuje urządzenia peryferyjne Opentrons, które można zainstalować na pokładzie lub na nim, aby wykonywać określone zadania naukowe. Rozdział 5: Sprzęt laboratoryjny wyjaśnia, jak pracować ze sprzętem do przechowywania płynów.
Uruchom protokół. Podstawowym zastosowaniem Flexa jest prowadzenie standardowych procedur naukowych, znanych jako protokoły. Rozdział 6: Tworzenie protokołów oferuje kilka sposobów uzyskania gotowych protokołów lub samodzielnego ich zaprojektowania. Aby uruchomić protokół, postępuj zgodnie z instrukcjami zawartymi w Rozdziale 7: Oprogramowanie i obsługa, który zawiera również instrukcje dotyczące wykonywania innych zadań i dostosowywania ustawień robota.
Utrzymuj działanie Flexa. Postępuj zgodnie ze wskazówkami zawartymi w Rozdziale 8: Konserwacja i serwis, aby utrzymać Flex w czystości i optymalnie działać. Lub zarejestruj się w jednej z wymienionych tam usług Opentrons i pozwól nam zająć się Flexem za Ciebie.
Dowiedz się jeszcze więcej. Nadal potrzebujesz czegoś innego? Zapoznaj się z załącznikami. Dodatek A: Glosariusz definiuje terminy związane z Flex. Dodatek B: Dodatkowa dokumentacja wskazuje jeszcze więcej zasobów dotyczących produktów Opentrons i pisania kodu do sterowania Flex.
OPENTRON FLEX
9
PRZEDMOWA
Dodatek C: Oprogramowanie typu open source wyjaśnia, w jaki sposób oprogramowanie Opentrons jest hostowane w serwisie GitHub jako źródło informacji zarówno dla programistów, jak i osób niebędących programistami.
Dodatek D: Wsparcie i informacje kontaktowe zawiera listę sposobów skontaktowania się z Opentrons, jeśli potrzebujesz pomocy wykraczającej poza to, co zapewnia nasza dokumentacja.
Uwagi i ostrzeżenia
W tej instrukcji znajdziesz specjalnie sformatowane bloki z uwagami i ostrzeżeniami. Uwagi zawierają przydatne informacje, które mogą nie być oczywiste w trakcie zwykłego korzystania z Flex. Zwróć szczególną uwagę na ostrzeżenia – stosuje się je wyłącznie w sytuacjach, w których istnieje ryzyko obrażeń ciała, uszkodzenia sprzętu, utraty lub zepsuciaampplików lub odczynników, utratę danych lub inne szkody. Uwagi i ostrzeżenia wyglądają następująco:
Sample Uwaga: jest to coś, co powinieneś wiedzieć, ale nie stwarza to żadnego zagrożenia.
Sample Ostrzeżenie: musisz o tym wiedzieć, ponieważ wiąże się to z ryzykiem.
10
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1
Wstęp
W tym rozdziale zapoznasz się z ekosystemem Opentrons Flex, w tym z ogólnym projektem systemu i dostępnymi konfiguracjami stacji roboczych. Zawiera także ważne informacje dotyczące zgodności i bezpieczeństwa, z którymi należy się zapoznaćview przed skonfigurowaniem robota Opentrons Flex. Więcej szczegółów na temat funkcji Opentrons Flex można znaleźć w rozdziale Opis systemu.
1.1 Witamy w Opentrons Flex
Opentrons Flex to robot do transportu cieczy zaprojektowany z myślą o dużej przepustowości i złożonych przepływach pracy. Robot Flex stanowi podstawę systemu modułowego, który obejmuje pipety, chwytak do sprzętu laboratoryjnego, osprzęt pokładowy, moduły pokładowe i sprzęt laboratoryjny — wszystko to można wymienić samodzielnie. Flex został zaprojektowany z ekranem dotykowym, dzięki czemu można z nim pracować bezpośrednio na stole laboratoryjnym lub można nim sterować z całego laboratorium za pomocą aplikacji Opentrons lub naszych interfejsów API typu open source.
Stacje robocze Flex są dostarczane z całym sprzętem — robotem, sprzętem i sprzętem laboratoryjnym — potrzebnym do rozpoczęcia automatyzacji typowych zadań laboratoryjnych. W przypadku innych zastosowań Opentrons Flex działa na oprogramowaniu i oprogramowaniu sprzętowym w pełni open source i jest niezależny od odczynników i sprzętu laboratoryjnego, co daje kontrolę nad sposobem projektowania i uruchamiania protokołów.
Co nowego w Flexie
Opentrons Flex jest częścią serii robotów Opentrons do obsługi cieczy. Użytkownicy Opentrons Flex mogą znać Opentrons OT-2, nasz osobisty robot do pipetowania. Flex wykracza poza możliwości OT-2 w kilku kluczowych obszarach, zapewniając wyższą przepustowość i czas przejścia.
Funkcja Przepustowość pipety
Pojemność pipet i końcówek
Opis
Pipety Flex mają 1, 8 lub 96 kanałów. Pipeta 96-kanałowa obsługuje jednocześnie 12 razy więcej dołków niż największa pipeta OT-2.
Pipety Flex mają większe zakresy objętości (1 µL, 50 µL) i wszystkie mogą współpracować z końcówkami Opentrons Flex o dowolnej objętości. Stanowi to ulepszenie w stosunku do pipet OT-5, które mają mniejsze zakresy i muszą używać końcówek o pasującym zakresie objętości.
OPENTRON FLEX
11
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
Chwytak Automatyczna kalibracja Kółka na moduły z ekranem dotykowym Współrzędne szczeliny na pokładzie Ruchome śmieci Rozmiar i waga
Chwytak Opentrons Flex Gripper automatycznie podnosi i przenosi sprzęt laboratoryjny po stole, bez interwencji użytkownika. Chwytak umożliwia bardziej złożone przepływy pracy w ramach jednego przebiegu protokołu.
Kalibracja pozycyjna pipet Flex i chwytaka jest w pełni zautomatyzowana. Naciśnij jeden przycisk, a urządzenie przesunie się do precyzyjnie obrobionych punktów na pokładzie, aby określić jego dokładną pozycję i zapisać te dane do wykorzystania w protokołach.
Flex ma własny interfejs dotykowy, który umożliwia bezpośrednie sterowanie, oprócz korzystania z aplikacji Opentrons. Użyj ekranu dotykowego, aby rozpocząć przebieg protokołu, sprawdzić status zadania i zmienić ustawienia bezpośrednio na robocie.
Moduły Flex pasują do pojemników zajmujących miejsce pod pokładem. Pojemniki umieszczają sprzęt laboratoryjny bliżej powierzchni pokładu i umożliwiają poprowadzenie kabli pod pokładem. Caddies umożliwiają jeszcze większą liczbę konfiguracji modułów i akcesoriów laboratoryjnych na pokładzie.
Gniazda na płycie Flex są ponumerowane przy użyciu układu współrzędnych (A1D4), który jest podobny do numeracji dołków w sprzęcie laboratoryjnym.
Kosz na śmieci może znajdować się w wielu lokalizacjach na platformie Flex. Domyślna lokalizacja (gniazdo A3) jest pozycją zalecaną. Chwytaka można także używać do wyrzucania śmieci do opcjonalnego zsypu.
Flex jest nieco większy i znacznie cięższy niż OT-2. Zadania instalacyjne w programie Flex wymagają pomocy partnera laboratoryjnego.
Szczegółowe porównanie specyfikacji technicznych robotów jest dostępne na platformie Opentrons webstrona.
Zarówno roboty Flex, jak i OT-2 działają na naszym oprogramowaniu typu open source, a aplikacja Opentrons może sterować obydwoma typami robotów jednocześnie. Chociaż protokołów OT-2 nie można uruchomić bezpośrednio na platformie Flex, można je łatwo dostosować (szczegóły można znaleźć w sekcji Protokoły OT-2 w rozdziale Tworzenie protokołów).
Elastyczne stacje robocze
Stacje robocze Opentrons Flex obejmują robota Flex, akcesoria, pipety i chwytak, moduły pokładowe i sprzęt laboratoryjny niezbędny do zautomatyzowania określonej aplikacji. Wszystkie elementy stacji roboczej są modułowe. Jeśli zajdzie potrzeba zmiany aplikacji, możesz dodać lub zamienić inny sprzęt Flex i kompatybilne materiały eksploatacyjne.
12
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
STACJA ROBOCZA NGS
Stacja robocza Opentrons Flex NGS automatyzuje przygotowanie bibliotek NGS. Może zautomatyzować przebieg wstępnego sekwencjonowania przy użyciu dowolnego wiodącego systemu odczynników, w tym fragmentacji i tagprzygotowanie biblioteki oparte na wzmiankach.
Oprócz robota Flex stacja robocza NGS obejmuje:
Chwytak Wybór konfiguracji pipety
Dwie pipety 8-kanałowe (1 µl i 50 µl) Pipeta 5-kanałowa (1000 µl) Zsyp na odpady Blok magnetyczny Moduł temperaturowy Moduł termocyklera Zestaw akcesoriów laboratoryjnych z końcówkami z filtrem, probówkami do mikrowirówki, zbiornikami i płytkami do PCR
STACJA ROBOCZA PCR
Stacja robocza Opentrons Flex PCR automatyzuje konfigurację PCR i przebieg procesów termocyklicznych przez maksymalnie 96 samples. Może rozdzielać schłodzone odczynniki i samples do 96-dołkowej płytki do PCR. Po dodaniu zautomatyzowanego modułu termocyklera użyj chwytaka, aby załadować płytkę do termocyklera, a następnie uruchom wybrany program PCR.
Oprócz robota Flex, stacja robocza PCR zawiera:
Chwytak Wybór konfiguracji pipety
Pipeta 1-kanałowa (1 µL) i Pipeta 50-kanałowa (8 µL) Pipeta 1-kanałowa (50 µL) Moduł temperaturowy zsypu na odpady Zestaw laboratoryjny z końcówkami z filtrem, probówkami do mikrowirówki, zbiornikami i płytkami do PCR
OPENTRON FLEX
13
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
STANOWISKO DO EKSTRAKCJI KWASÓW NUKLEINOWYCH
Stacja robocza do ekstrakcji kwasu nukleinowego Opentrons Flex automatyzuje izolację i oczyszczanie DNA/RNA. Wykorzystuje blok magnetyczny do separacji kulek magnetycznych i podgrzewacz-wytrząsarkę do sampliza i ponowne zawieszanie kulek magnetycznych.
Oprócz robota Flex, stanowisko do ekstrakcji kwasów nukleinowych obejmuje:
Chwytak Wybór konfiguracji pipety
Pipeta 1-kanałowa (5 µL) i Pipeta 1000-kanałowa (8 µL) Pipeta 5-kanałowa (1000 µL) Zsyp na odpady Blok magnetyczny Moduł podgrzewacza i wytrząsarki Zestaw laboratoryjny z końcówkami z filtrem, zbiornikami, płytkami do PCR i płytkami z głębokimi dołkami
STACJA ROBOCZA DO OCZYSZCZANIA BIAŁEK Z KULEK MAGNETYCZNYCH
Stacja robocza do oczyszczania białek z kulkami magnetycznymi Opentrons Flex automatyzuje oczyszczanie białek na małą skalę i proteomikęample przygotuj do 96 samples. Jest kompatybilny z wieloma popularnymi odczynnikami na bazie kulek magnetycznych.
Oprócz robota Flex, stanowisko do oczyszczania białek obejmuje:
Chwytak Wybór konfiguracji pipety
Pipeta 1-kanałowa (5 µL) i Pipeta 1000-kanałowa (8 µL) Pipeta 5-kanałowa (1000 µL) Zsyp na odpady Blok magnetyczny Moduł podgrzewacza i wytrząsarki Zestaw laboratoryjny z końcówkami z filtrem, zbiornikami, płytkami do PCR i płytkami z głębokimi dołkami
STACJA ROBOCZA FLEX PRZYGOTOWANIA
Stacja robocza Opentrons Flex Prep automatyzuje proste procesy pipetowania. Skonfiguruj stację roboczą z pipetami 1-kanałowymi i 8-kanałowymi do wykonywania takich zadań jakample transfer, samppowielanie plików i
14
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
porcjowanie odczynnika. Skonfiguruj stację roboczą z 96-kanałową pipetą, aby wykonywać wysokowydajne porcjowanie odczynników i przygotowywanie płytekamping.
Oprócz robota Flex stacja robocza Flex Prep obejmuje:
Możliwość wyboru konfiguracji pipety: Pipeta 1-kanałowa (5 µL) i Pipeta 1000-kanałowa (8 µL) Pipeta 5-kanałowa (1000 µL)
Zestaw akcesoriów laboratoryjnych z końcówkami filtrów, probówkami do mikrowirówki i zbiornikami
STACJA ROBOCZA PRZYGOTOWANIA PLAZMIDU
Stacja robocza Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatyzuje procesy ekstrakcji i oczyszczania plazmidów przy użyciu kulek magnetycznych. To stanowisko robocze jest wyposażone w pipety o dużej objętości, moduł podgrzewacza-wytrząsarki i blok magnetyczny, aby pomieścić większość chemii na bazie kulek.
Oprócz robota Flex, stacja robocza do przygotowania plazmidu obejmuje:
Chwytak Pipeta 1-kanałowa (5 µL) i Pipeta 1000-kanałowa (8 µL) Zsyp na odpady Blok magnetyczny Moduł podgrzewacza-wytrząsarki Zestaw akcesoriów laboratoryjnych z końcówkami z filtrem, probówkami do mikrowirówki, zbiornikami, płytkami do PCR i płytkami z głębokimi dołkami
STACJA ROBOCZA SYNBIO
Stacja robocza Opentrons Flex SynBio automatyzuje różnorodne procesy biologii syntetycznej, takie jak synteza i klonowanie DNA. Wykorzystuje blok magnetyczny i moduł temperaturowy do obsługi większości chemii opartej na kulkach. Dodaj moduł termocyklera, aby przeprowadzić inkubację z podgrzewaną pokrywą i ampligacje.
Oprócz robota Flex, stacja robocza SynBio zawiera:
Pipeta 1-kanałowa z chwytakiem (5 µL) i pipeta 1000-kanałowa (8 µL) Moduł temperaturowy z blokiem magnetycznym
OPENTRON FLEX
15
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
Zestaw akcesoriów laboratoryjnych obejmujący końcówki zwykłe i z filtrem, probówki do mikrowirówki, zbiorniki, płytki do PCR i płytki z głębokimi dołkami
1.2 Informacje dotyczące bezpieczeństwa
Robot do transportu cieczy Opentrons Flex został zaprojektowany z myślą o bezpiecznej pracy. Aby zapewnić bezpieczne użytkowanie Flexa, zapoznaj się ze specyfikacjami i wytycznymi dotyczącymi zgodności w tej sekcji. Niniejsze wytyczne obejmują bezpieczne korzystanie z złącz wejściowych i wyjściowych produktu, w tym złączy zasilania i danych, a także etykiety ostrzegawcze znajdujące się na robocie Flex i powiązanym sprzęcie. Używanie urządzenia w sposób inny niż określony w niniejszej instrukcji może narazić użytkownika i sprzęt na ryzyko.
Symbole bezpieczeństwa
Różne etykiety na Flexie i w tej instrukcji ostrzegają o źródłach potencjalnych obrażeń.
Symbol
Opis
Ostrzeżenie: ostrzega użytkowników o potencjalnie niebezpiecznych warunkach. Działania, które mogą skutkować obrażeniami ciała lub śmiercią.
Uwaga: ostrzega użytkowników przed uszkodzeniem sprzętu. Utracone lub uszkodzone dane. Nieodwracalna przerwa w wykonywanej operacji.
Porażenie prądem elektrycznym: Identyfikuje elementy instrumentu, które mogą stwarzać ryzyko porażenia prądem elektrycznym w przypadku nieprawidłowego obchodzenia się z instrumentem.
Gorąca powierzchnia: Identyfikuje elementy instrumentu, które stwarzają ryzyko obrażeń ciała z powodu wysokiej temperatury/temperatury, jeśli instrument jest niewłaściwie obsługiwany.
Punkt uszczypnięcia: Identyfikuje elementy instrumentu, które mogą stwarzać ryzyko obrażeń ciała w ruchu.
16
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
Na Flex znajdziesz następujące etykiety:
Etykiety własności intelektualnej Etykiety zgodności z przepisami (np. ETL) Etykiety zagrożeń elektrycznych Etykiety ogólnych ostrzeżeń Etykiety produktów Etykiety punktów wskazujących na ryzyko zmiażdżenia Duża objętośćtagEtykiety e Etykiety znamionowe mocy
Ostrzeżenia dotyczące bezpieczeństwa elektrycznego
Zawsze należy przestrzegać następujących ostrzeżeń dotyczących bezpieczeństwa elektrycznego:
Symbol
Opis
Podłącz robota do uziemionego obwodu klasy 1. Zobacz sekcję Podłączenie zasilania w rozdziale Opis systemu.
Nie podłączaj (podłączaj), nie odłączaj (odłączaj) ani nie używaj kabli zasilających prądu przemiennego, jeśli: Kabel jest postrzępiony lub uszkodzony. Inne podłączone kable, przewody lub gniazda są postrzępione lub uszkodzone.
Używanie uszkodzonych przewodów zasilających może spowodować ryzyko porażenia prądem elektrycznym, co może skutkować poważnymi obrażeniami ciała lub uszkodzeniem robota.
Nie wymieniaj kabla zasilającego AC, chyba że jest to zgodne z poleceniem wsparcia Opentrons.
Aby uzyskać więcej informacji na temat wymagań elektrycznych, zobacz sekcję Pobór mocy w rozdziale Instalacja i przeniesienie.
OPENTRON FLEX
17
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
Dodatkowe ostrzeżenia dotyczące bezpieczeństwa
Zawsze należy przestrzegać następujących dodatkowych ostrzeżeń dotyczących bezpieczeństwa:
Symbol
Opis
Opentrons Flex nie posiada certyfikatu do użytku z cieczami wybuchowymi lub łatwopalnymi. Nie wkładaj do robota płytek, probówek ani fiolek zawierających ciecze wybuchowe lub łatwopalne ani nie obsługuj urządzenia w inny sposób, gdy w obudowie znajdują się ciecze wybuchowe lub łatwopalne.
Podczas pracy z chemikaliami należy stosować dobre praktyki laboratoryjne i przestrzegać środków ostrożności producenta. Opentrons nie ponosi odpowiedzialności za jakiekolwiek szkody powstałe w wyniku lub w wyniku użycia niebezpiecznych chemikaliów.
Flex waży 88.5 kg (195 funtów). W rezultacie do jego bezpiecznego podniesienia i przeniesienia potrzebne są dwie osoby. Zobacz sekcję Relokacja w rozdziale Instalacja i relokacja.
Flex należy umieścić na powierzchni zdolnej utrzymać ciężar 88.5 kg (195 funtów), o powierzchni wystarczającej do pomieszczenia robota plus jego minimalna odległość (20 cm/8 cali). Patrz sekcja Wymagania dotyczące bezpieczeństwa i obsługi w rozdziale Instalacja i przeniesienie.
Flex może emitować wibracje podczas pracy. Umieść robota na stabilnej, równej i wodoodpornej powierzchni, wyposażonej w stężenia krzyżowe lub złącza spawane. Patrz sekcja Wymagania dotyczące bezpieczeństwa i obsługi w rozdziale Instalacja i przeniesienie.
Środki ostrożności
Aby chronić Flex przed uszkodzeniem, należy przestrzegać następujących środków ostrożności:
18
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
Symbol
Opis
Używaj sprzętu laboratoryjnego zgodnego z ANSI/SLAS lub zatwierdzonego przez Opentrons. Zobacz rozdział Sprzęt laboratoryjny.
Materiały, środki i inne szkodliwe materiały należy trzymać z dala od robota.
Bezpieczeństwo biologiczne
Próbki i odczynniki zawierające materiały pobrane od ludzi należy traktować jako czynniki potencjalnie zakaźne. Opentrons zaleca stosowanie bezpiecznych procedur laboratoryjnych, jak wyjaśniono w dokumencie Bezpieczeństwo biologiczne w laboratoriach mikrobiologicznych i biomedycznych (BMBL), wydanie 6.
W normalnych okolicznościach Flex nie wytwarza wykrywalnych aerozoli z cieczy źródłowych. Jednakże pod pewnymi warunkami możliwe jest wytwarzanie aerozoli z cieczy źródłowych. Podczas pracy z płynami źródłowymi o poziomie bezpieczeństwa biologicznego 2 lub wyższym należy rozważyć podjęcie środków ostrożności zapobiegających narażeniu na aerozole, zgodnie z lokalnymi organami regulacyjnymi. Aby zminimalizować potencjalne ryzyko narażenia robota na aerozol, upewnij się, że:
Wykonaj konserwację zgodnie z opisem w rozdziale Konserwacja i serwis. Prawidłowo zainstaluj i zabezpiecz wszystkie pokrywy instrumentów, pipety, moduły i sprzęt laboratoryjny. Aby ograniczyć powstawanie aerozoli, należy stosować odpowiednią technikę pipetowania.
Toksyczne opary
Jeśli pracujesz z lotnymi rozpuszczalnikami lub substancjami toksycznymi, użyj wydajnego systemu wentylacji laboratoryjnej, aby usunąć wszelkie powstające opary.
Ciecze łatwopalne
Flex nie został oceniony pod kątem stosowania z łatwopalnymi cieczami i nie powinien być używany z łatwopalnymi cieczami.
OPENTRON FLEX
19
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
1.3 Zgodność z przepisami
Opentrons Flex spełnia wszystkie obowiązujące wymagania następujących norm bezpieczeństwa i elektromagnetycznych.
Bezpieczeństwo
Identyfikator reguły IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Tytuł
Wymagania bezpieczeństwa dotyczące sprzętu elektrycznego do pomiarów, kontroli i użytku laboratoryjnego Część 1: Wymagania ogólne
Wymagania szczegółowe dotyczące urządzeń laboratoryjnych do mieszania i mieszania
Kompatybilność elektromagnetyczna
Identyfikator reguły EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR część 15 podczęść B klasa A IC ICES-003
Tytuł
Sprzęt elektryczny do pomiarów, sterowania i użytku laboratoryjnego Wymagania EMC Część 1: Wymagania ogólne Niezamierzone grzejniki
Zarządzanie widmem i zakłócenia telekomunikacyjne Sprzęt powodujący Standardowy sprzęt technologii informatycznych (w tym aparaty cyfrowe)
Ostrzeżenia i uwagi FCC
Ostrzeżenie: Zmiany lub modyfikacje tego urządzenia, które nie zostały wyraźnie zatwierdzone przez Opentrons, mogą unieważnić uprawnienia użytkownika do obsługi sprzętu.
To urządzenie jest zgodne z częścią 15 przepisów FCC. Operacja podlega następującym zasadom:
20
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 1: WPROWADZENIE
To urządzenie nie może powodować szkodliwych zakłóceń. To urządzenie musi akceptować wszelkie odbierane zakłócenia, w tym zakłócenia, które mogą powodować niepożądane
działanie.
Uwaga: To urządzenie zostało przetestowane i uznane za zgodne z ograniczeniami dla urządzeń cyfrowych klasy A, zgodnie z częścią 15 przepisów FCC. Ograniczenia te mają na celu zapewnienie rozsądnej ochrony przed szkodliwymi zakłóceniami, gdy sprzęt jest używany w środowisku komercyjnym. To urządzenie generuje, wykorzystuje i może emitować energię o częstotliwości radiowej, a jeśli nie zostanie zainstalowane i nie będzie używane zgodnie z instrukcją obsługi, może powodować szkodliwe zakłócenia w komunikacji radiowej. Eksploatacja tego sprzętu w obszarze mieszkalnym może powodować szkodliwe zakłócenia i w takim przypadku użytkownik będzie zobowiązany do usunięcia zakłóceń na własny koszt.
Zgodność z kanadyjskim ISED
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Produkt ten spełnia stosowne specyfikacje techniczne Ministerstwa Innowacji, Nauki i Rozwoju Gospodarczego Kanady.
Obecny produkt jest zgodny ze specyfikacjami technik mających zastosowanie do innowacji, nauki i rozwoju gospodarczego w Kanadzie.
Ostrzeżenie środowiskowe
Ostrzeżenie: rak i zaburzenia reprodukcyjne www.P65Warnings.ca.gov
Wstępna certyfikacja Wi-Fi
Moduł Wi-Fi jest wstępnie certyfikowany do użytku w wielu regionach:
Stany Zjednoczone (FCC): Identyfikator FCC UAY-W8997-M1216 Europejski Obszar Gospodarczy (CE): Brak publicznego identyfikatora (deklaracja własna) Kanada (IC): Numer identyfikacyjny wersji sprzętu W8997-M1216 Japonia (TELEC): Numer certyfikatu 020-170034 Indie (WPC): Numer rejestracyjny ETA-SD-20191005525 (oświadczenie własne)
OPENTRON FLEX
21
ROZDZIAŁ 2
Instalacja i relokacja
W tym rozdziale opisano, jak przygotować laboratorium na Opentrons Flex, jak skonfigurować robota i jak go przenosić, jeśli to konieczne. Przed odbiorem Flexa należy upewnić się, że laboratorium lub placówka spełnia wszystkie kryteria określone w części Wymagania dotyczące bezpieczeństwa i obsługi. Kiedy nadejdzie czas, aby uruchomić Flex, postępuj zgodnie ze szczegółowymi instrukcjami zawartymi w sekcjach Rozpakowywanie, Pierwsze uruchomienie oraz Instalacja i kalibracja instrumentu lub skorzystaj z usługi konfiguracji pomocy technicznej Opentrons na miejscu. A jeśli kiedykolwiek będziesz musiał przenieść Flexa do nowej lokalizacji, bliższej lub dalszej, wykonaj czynności opisane w sekcji Przenoszenie.
2.1 Wymagania dotyczące bezpieczeństwa i obsługi
Gdzie umieścić Opentron Flex
Przestrzeń jest cennym towarem w niemal każdym laboratorium. Twój Flex będzie potrzebował trochę, ale nie za dużo, ponieważ został zaprojektowany tak, aby zmieścił się na połowie standardowego stołu laboratoryjnego. Upewnij się, że masz przestrzeń, która spełnia następujące kryteria.
Powierzchnia ławki: nieruchoma, stabilna, równa i wodoodporna powierzchnia. Nie zaleca się stosowania stołów lub ławek z kółkami (nawet kołami blokującymi). Flex porusza się szybko i ma dużą masę, która może wstrząsnąć lub zachwiać lekkimi lub ruchomymi stołami.
Unoszenie ciężaru: Sam robot waży 88.5 kg (195 funtów) i powinien być podnoszony wyłącznie przez dwie osoby pracujące razem. Umieść robota na powierzchni, która z łatwością utrzyma jego ciężar oraz wagę wszelkich modułów, akcesoriów laboratoryjnych, płynów lub innego sprzętu laboratoryjnego, który będzie używany w Twoich zastosowaniach.
Przestrzeń robocza: Wymiary podstawy robota to 87 cm szer. x 69 cm gł. x 84 cm wys. (około 34″ x 27″ x 33″). Flex potrzebuje 20 cm (8″) prześwitu z boku i z tyłu na kable, złącza USB oraz do odprowadzania spalin z modułów, które grzeją i chłodzą.
Ostrzeżenie: Nie umieszczaj boków ani tyłu Flex przy ścianie.
22
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
84 cm 33 cali
87 cm 34 cali
Wymiary podstawy Opentrons Flex.
69 cm 27 cali
20 cm 8 cali
20 cm 8 cali
20 cm 8 cali
Szczyt view Opentrons Flex, pokazując minimalny prześwit boczny i tylny.
OPENTRON FLEX
23
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Pobór mocy
Opentrons Flex należy podłączyć do gniazdka ściennego w miejscu instalacji lub w jego pobliżu. Podłącz Flex tylko do obwodów, które mogą pomieścić jego maksymalny pobór mocy:
Moc wejściowa: 36 VDC, 6.1 A Pobór mocy w stanie bezczynności: 30 W Typowy pobór: 40 W (podczas działania protokołu) Maksymalny pobór: Około 50 W
Dokładny pobór mocy zależy od:
Ilość i rodzaj ruchu wykonanego podczas protokołu. Ilość czasu, jaki robot spędza bezczynnie. Stan świateł robota. Ile instrumentów jest podłączonych.
Pamiętaj, aby uwzględnić inne urządzenia elektroniczne zużywające energię w tym samym obwodzie, w tym moduły Flex z własnymi zasilaczami. Na przykładample, moduł termocyklera ma maksymalny pobór mocy (630 W), który jest znacznie większy niż sam robot Flex. Jeśli to konieczne, skonsultuj się z kierownikiem swojej placówki, aby upewnić się, że spełnia ona wymagania dotyczące zasilania Twojego sprzętu.
Warunki środowiskowe
Warunki środowiskowe dotyczące zalecanego, dopuszczalnego użytkowania i przechowywania są różne:
Zalecany do pracy systemowej
Dopuszczalne do działania systemu
Temperatura otoczenia +20 do +25°C
+2 do +40 °C
Wilgotność względna Wysokość
40%, bez kondensacji
Około 500 m nad poziomem morza
30%, bez kondensacji (poniżej 80°C)
Do 2000 m n.p.m.
Przechowywanie i transport
-10 do +60 °C
10%, bez kondensacji (poniżej 85°C)
Do 2000 m n.p.m.
24
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Firma Opentrons zweryfikowała wydajność Opentrons Flex w warunkach zalecanych do działania systemu i praca w tych warunkach powinna zapewnić optymalne wyniki. Flex można bezpiecznie stosować w warunkach akceptowalnych dla pracy systemu, jednak rezultaty mogą się różnić. Nie włączaj ani nie używaj Flex w warunkach wykraczających poza te granice. Warunki przechowywania i transportu mają zastosowanie wyłącznie wtedy, gdy robot jest całkowicie odłączony od zasilania i innego sprzętu.
2.2 Rozpakowywanie
Gratulacje! Twój Opentrons Flex już dotarł i przygotowałeś dla niego miejsce w swoim laboratorium. Otwórzmy tę potworną skrzynię, usuńmy robota i przygotujmy go do pracy. Informacje zawarte w tej sekcji zawierają listę części i instrukcje, które przeprowadzą Cię przez kroki wymagane do rozpakowania Flexa, jego skonfigurowania i przygotowania do użycia. Procedurę konfiguracji podzieliliśmy na trzy części:
Część 1 obejmuje demontaż skrzyni. Część 2 obejmuje odłączenie Flexa od skrzyni i przeniesienie go do miejsca montażu końcowego. Część 3 obejmuje montaż końcowy i pierwsze uruchomienie robota.
Wymagany wysiłek i czas
Będziesz chciał poprosić partnera laboratoryjnego o pomoc w procesie rozpakowywania, podnoszenia, przenoszenia i montażu. Na ten wysiłek będziesz musiał przeznaczyć około 30 minut do godziny.
Uwaga: Do prawidłowego podniesienia Flexa potrzebne są dwie osoby. Najlepszym sposobem przenoszenia robota jest także podnoszenie i przenoszenie Flexa za uchwyty.
Skrzynia i materiał opakowaniowy
Rozpakowanie Flexa daje niesamowitego robota, ale pozostaje też kilka dużych paneli skrzyń wraz z różnymi elementami do wysyłki i wyściółką. Chociaż możesz wyrzucić ten materiał, zachęcamy do zatrzymania tych przedmiotów, jeśli jest dostępne miejsce do przechowywania. Opakowanie jest wielokrotnego użytku, co pomaga przygotować Flexa do wysyłki, jeśli w przyszłości zajdzie potrzeba wysłania go w inne miejsce (np. na konferencję lub do nowego obiektu).
OPENTRON FLEX
25
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Elementy produktu
Flex jest dostarczany z komponentami wymienionymi poniżej. Pipety, chwytak i moduły są dostarczane w oddzielnych opakowaniach od głównej skrzynki Flex, nawet jeśli zakupiono je razem jako stację roboczą.
(1) Robot Opentrons Flex
(1) kabel USB
(1) Kabel zasilający
(1) Kabel Ethernet
(5) Klucze trzpieniowe (sześciokąt 12 mm, sześciokąt 1.5 mm, sześciokąt 2.5 mm, sześciokąt 3 mm,
Torx T10)
(1) Zawieszka wyłącznika awaryjnego
(1) Szczelina na pokładzie z klipsami na akcesoria laboratoryjne
(4) Zapasowe klipsy do akcesoriów laboratoryjnych
(1) Sonda do kalibracji pipety
(4) Uchwyty i nakładki do przenoszenia
(1) Górny panel okienny
(4) Boczne panele okienne
(1) Śrubokręt sześciokątny 2.5 mm
(1) Klucz 19 mm
(16 + części zamienne) Śruby okienne (łeb płaski M4x8 mm)
26
(10) Zapasowe śruby do rowków w pokładzie (z łbem gniazdowym M4x10 mm)
(12) Zapasowe śruby zaciskowe pokładu (łeb gniazdowy M3x6 mm)
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Część 1: Usuń skrzynię
Opentrons wysyła Flex w wytrzymałej skrzyni ze sklejki. W skrzyni wysyłkowej zastosowano hak i zatrzask klampaby połączyć ze sobą górny, boczny i dolny panel. Użycie zatrzasków zamiast gwoździ lub śrub oznacza, że do demontażu skrzynki nie będzie potrzebny łom (ani duża siła), a w razie potrzeby można ją później ponownie złożyć.
Uwaga: Krawędzie skrzynek mogą ulec szorstkości podczas transportu. Możesz użyć rękawic roboczych, aby chronić ręce przed odłamkami drewna.
Aby zwolnić zatrzaski, podnieś zatrzask zatrzasku do góry i obróć go w lewo (w kierunku przeciwnym do ruchu wskazówek zegara). Ta akcja przesuwa clamp ramię z odpowiedniego wspornika mocującego. Następnie można odchylić ramię zatrzasku od skrzyni.
1 Odblokuj osiem zatrzasków mocujących górę po bokach.
2 Zdejmij panel górny po zwolnieniu zatrzasków.
OPENTRON FLEX
27
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZENOSZENIE 3 Rozetnij niebieską torbę transportową, wyjmij następujące elementy z wyściółki i odłóż je na bok:
Zestaw użytkownika Kable zasilające, Ethernet i USB Zawieszka wyłącznika awaryjnego
4 Zdejmij górną część piankowej wyściółki, aby odsłonić panele okienne. Wyściółka chroni panele boczne i górne.
5 Zdejmij panele okienne i odłóż je na bok. Dołączysz je później.
28
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
6 Odblokuj pozostałe 16 zatrzasków łączących panele boczne ze sobą i podstawą skrzyni. 7 Zdejmij panele boczne i odłóż je na bok.
Część 2: Zwolnij Flex
Po wykonaniu kroków z części 1 powinieneś teraz zobaczyć robota w torbie ochronnej i przymocowanego do pomarańczowych stalowych elementów montażowych. Torba zamyka robota i chroni go przed środowiskiem zewnętrznym. Stalowe wsporniki mocują robota do spodu skrzyni. Dwie ramy transportowe podtrzymują robota, równomiernie rozkładając jego ciężar i utrzymując go w sztywności, aby nie wypaczał się podczas transportu. Kontynuuj rozpakowywanie Flexa i zdejmowanie go z podstawy skrzyni.
8 Używając klucza 19 mm z zestawu użytkownika, odkręć wsporniki od spodu skrzynki. Możesz wyrzucić nawiasy lub zachować je do wykorzystania w przyszłości.
OPENTRON FLEX
29
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZENOSZENIE 9 Pociągnij lub zwiń torbę transportową do samego końca, aby odsłonić całego robota.
10 Z pomocą partnera laboratoryjnego chwyć uchwyty w pomarańczowych ramach transportowych po obu stronach podstawy robota, podnieś Flex z podstawy skrzyni i połóż go na podłodze. Zachowaj lub wyrzuć podstawę skrzyni i ramę transportową.
30
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZENOSZENIE 11 Używając klucza sześciokątnego 12 mm z zestawu użytkownika, odkręć cztery śruby mocujące ramy transportowe do
Flexa. Zachowaj lub wyrzuć ramy i śruby.
12 Wyjmij cztery aluminiowe uchwyty z zestawu użytkownika. Wkręć uchwyty w te same miejsca, w których znajdowały się śruby ramy transportowej 12 mm.
OPENTRON FLEX
31
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
13 Z pomocą partnera laboratoryjnego podnieś Flex za uchwyty do przenoszenia i przenieś go na stół warsztatowy w celu końcowego montażu.
Część 3: Montaż końcowy i włączenie zasilania
Po przeniesieniu Flexa do tymczasowego miejsca pracy lub do stałego miejsca zamieszkania, nadszedł czas na wykończenie nowego robota.
14 Jeżeli przeniosłeś robota do docelowego miejsca pracy, zdejmij uchwyty do przenoszenia i zastąp je nakładkami wykończeniowymi. Zaślepki zamykają otwory uchwytów w ramie i nadają robotowi schludny wygląd. Odłóż uchwyty do zestawu użytkownika w celu przechowywania.
32
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
15 Wyjmij górny i boczne panele z pianki do pakowania, którą odłożyłeś po zdjęciu góry skrzynki.
16 Zamontuj panele okienne na Flex, postępując zgodnie z informacjami na etykiecie znajdującej się na przedniej folii ochronnej. Następnie usuń folię ochronną.
17 Używając skośnych śrub do okien i śrubokręta 2.5 mm z zestawu użytkownika, przymocuj panele okienne do Flex. Upewnij się, że skośne otwory w panelach okiennych (w kształcie litery V) są skierowane na zewnątrz (w Twoją stronę). Dzięki temu wkręty zlicują się z powierzchnią okna.
Ostrzeżenie: Nieprawidłowe ustawienie paneli może spowodować uszkodzenie. Nadmierny moment dokręcenia śruby może spowodować pęknięcie paneli. Ręcznie dokręcaj śruby, aż panele okienne będą odpowiednio zabezpieczone. To nie jest próba sił.
OPENTRON FLEX
33
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZENOSZENIE 18 Za pomocą śrubokręta 2.5 mm z zestawu użytkownika wykręć śruby blokujące z suwnicy. Te
śruby zapobiegają przesuwaniu się suwnicy podczas transportu. Śruby blokujące gantry znajdują się: Na lewej szynie bocznej, w pobliżu przodu robota. Pod pionowym ramieniem suwnicy. Po prawej stronie szyny, w pobliżu przodu robota, w pomarańczowym wsporniku. Są tu dwie śruby.
Bramę można łatwo przesuwać ręcznie po usunięciu wszystkich śrub transportowych. 19 Przetnij i usuń dwie gumki utrzymujące kosz na śmieci na miejscu podczas transportu.
34
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
20 Podłącz przewód zasilający do Flexa i podłącz go do gniazdka ściennego. Upewnij się, że obszar pokładu jest wolny od przeszkód. Przełącz wyłącznik zasilania z tyłu, po lewej stronie robota. Po włączeniu brama przemieszcza się do swojej lokalizacji początkowej, a na ekranie dotykowym wyświetlane są dodatkowe instrukcje konfiguracji.
Teraz, gdy Flex jest wyjęty z pudełka i gotowy do pracy, przejdź do sekcji Pierwsze uruchomienie poniżej.
2.3 Pierwsze uruchomienie
Przed podłączeniem innego sprzętu do Flexa wykonaj podstawową konfigurację na ekranie dotykowym. Robot poprowadzi Cię przez proces łączenia się z siecią laboratoryjną, aktualizację oprogramowania do najnowszej wersji i personalizację Flexa poprzez nadanie mu nazwy.
Włącz zasilanie
Po włączeniu Flex na ekranie dotykowym pojawi się logo Opentrons. Po kilku chwilach wyświetli się ekran „Witamy w Opentrons Flex”.
Ekran powitalny Opentrons Flex. Powinieneś zobaczyć ten ekran tylko wtedy, gdy uruchamiasz Flex po raz pierwszy.
OPENTRON FLEX
35
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Połącz się z siecią lub komputerem
Postępuj zgodnie z instrukcjami wyświetlanymi na ekranie dotykowym, aby połączyć robota, aby mógł sprawdzić dostępność aktualizacji oprogramowania i odebrać protokół fileS. Istnieją trzy metody połączenia: Wi-Fi, Ethernet i USB.
Opcje połączenia sieciowego. Aby skonfigurować Flex, musisz mieć połączenie z Internetem. Wi-Fi: użyj ekranu dotykowego, aby połączyć się z sieciami Wi-Fi zabezpieczonymi za pomocą uwierzytelniania WPA2 Personal (większość sieci, które wymagają jedynie hasła do przyłączenia, należy do tej kategorii).
Uwaga: Flex nie obsługuje portali przechwytujących (sieci, które nie mają hasła, ale ładują plik webstrona do uwierzytelniania użytkowników po połączeniu).
Możesz także połączyć się z otwartą siecią Wi-Fi, ale nie jest to zalecane.
Ostrzeżenie: połączenie z otwartą siecią Wi-Fi umożliwi każdej osobie znajdującej się w zasięgu sygnału sieciowego kontrolowanie robota Opentrons Flex bez uwierzytelniania.
Jeśli chcesz połączyć się z siecią Wi-Fi korzystającą z uwierzytelniania korporacyjnego (w tym „eduroam” i podobnymi sieciami akademickimi, które wymagają nazwy użytkownika i hasła), najpierw połącz się z aplikacją Opentrons przez Ethernet lub USB, aby dokończyć wstępną konfigurację. Następnie połącz się z firmową siecią Wi-Fi w ustawieniach sieciowych urządzenia Flex. Aby uzyskać dostęp do ustawień sieciowych:
36
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
1. Kliknij Urządzenia na lewym pasku bocznym aplikacji Opentrons. 2. Kliknij menu z trzema kropkami () swojego Flex i wybierz Ustawienia robota. 3. Kliknij kartę Sieć.
Wybierz swoją sieć z rozwijanego menu lub wybierz „Dołącz do innej sieci…” i wprowadź jej identyfikator SSID. Wybierz metodę uwierzytelniania korporacyjnego używaną w Twojej sieci. Obsługiwane metody to:
EAP-TTLS z TLS EAP-TTLS z MS-CHAP v2 EAP-TTLS z MD5 EAP-PEAP z MS-CHAP v2 EAP-TLS
Każda z tych metod wymaga nazwy użytkownika i hasła, a w zależności od dokładnej konfiguracji sieci może wymagać certyfikatu filelub inne opcje. Zapoznaj się z dokumentacją informatyczną swojej placówki lub skontaktuj się ze swoim menedżerem IT, aby uzyskać szczegółowe informacje na temat konfiguracji sieci.
Ethernet: Podłącz robota do przełącznika sieciowego lub koncentratora za pomocą kabla Ethernet. Można także podłączyć się bezpośrednio do portu Ethernet w komputerze, począwszy od wersji systemu robota 7.1.0.
USB: Podłącz dostarczony kabel USB A do B do portu USB-B robota i wolnego portu w komputerze. Jeśli komputer nie jest wyposażony w port USB-A, użyj kabla USB B do C lub adaptera USB A do C.
Aby kontynuować konfigurację, na podłączonym komputerze musi być zainstalowana i uruchomiona aplikacja Opentrons. Aby uzyskać szczegółowe informacje na temat instalacji aplikacji Opentrons, zobacz sekcję Instalacja aplikacji w rozdziale Oprogramowanie i obsługa.
Zainstaluj aktualizacje oprogramowania
Teraz, gdy masz połączenie z siecią lub komputerem, robot może sprawdzić dostępność aktualizacji oprogramowania i oprogramowania sprzętowego oraz pobrać je w razie potrzeby. Jeśli dostępna jest aktualizacja, jej zainstalowanie może zająć kilka minut. Po zakończeniu aktualizacji robot uruchomi się ponownie.
OPENTRON FLEX
37
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Zamocuj zawieszkę wyłącznika awaryjnego
Podłącz dołączony wisiorek zatrzymania awaryjnego (E-stop) do portu pomocniczego (AUX-1 lub AUX-2) z tyłu robota.
Przed i po podłączeniu zawieszki wyłącznika awaryjnego.
Podłączenie i włączenie wyłącznika awaryjnego jest obowiązkowe w przypadku podłączania instrumentów i uruchamiania protokołów na Flex. Więcej informacji na temat korzystania z wyłącznika awaryjnego podczas pracy robota można znaleźć w części Zawieszka wyłącznika awaryjnego w rozdziale Opis systemu.
Nadaj swojemu robotowi imię
Nazwanie robota pozwala łatwo zidentyfikować go w środowisku laboratoryjnym. Jeśli w Twojej sieci znajduje się wiele robotów Opentrons, pamiętaj o nadaniu im unikalnych nazw. Po potwierdzeniu nazwy robota zostaniesz przeniesiony do pulpitu nawigacyjnego Opentrons Flex. Prawdopodobnie następnym krokiem, który będziesz chciał wykonać, będzie podłączenie instrumentów, co opisano w następnej sekcji.
2.4 Instalacja i kalibracja przyrządu
Po wstępnej konfiguracji robota następnym krokiem jest podłączenie instrumentów do robota i ich kalibracja.
Aby zainstalować instrument, najpierw dotknij Instrumenty na ekranie dotykowym lub przejdź do sekcji Pipety i moduły na ekranie szczegółów urządzenia w aplikacji Opentrons. Wybierz pusty uchwyt i wybierz opcję Dołącz pipetę lub Dołącz chwytak. Jeśli uchwyt, którego chcesz użyć, jest już zajęty, musisz najpierw odłączyć pipetę lub chwytak.
38
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Uwaga: Ogólny proces instalacji jest taki sam, niezależnie od tego, czy używasz ekranu dotykowego, czy aplikacji Opentrons. Niezależnie od tego, na jakim urządzeniu rozpoczniesz, proces instalacji będzie kontrolowany do czasu jej zakończenia lub anulowania.
Jeśli zaczniesz na ekranie dotykowym, aplikacja pokaże robotowi jako „zajęty”. Jeśli zaczniesz w aplikacji, na ekranie dotykowym pojawi się komunikat wskazujący, że instalacja urządzenia jest w toku.
Dokładny proces instalacji różni się w zależności od podłączanego instrumentu, jak opisano w poniższych sekcjach. Wszystkie przyrządy posiadają zautomatyzowaną procedurę kalibracji, którą należy przeprowadzić natychmiast po instalacji.
Instalacja pipety
Po zainstalowaniu pipety będziesz prowadzony przez następujące kroki na ekranie dotykowym lub w aplikacji Opentrons.
1. WYBIERZ TYP PIPETY Wybierz pomiędzy pipetą 1- lub 8-kanałową a pipetą 96-kanałową. Mocowanie pipety 96-kanałowej wymaga kilku dodatkowych czynności, ponieważ mocuje się ją do specjalnej płyty montażowej, która obejmuje oba mocowania pipet.
2. PRZYGOTUJ SIĘ DO INSTALACJI Usuń akcesoria laboratoryjne ze stołu i oczyść obszar roboczy, aby ułatwić mocowanie i kalibrację. Zbierz również potrzebne wyposażenie, takie jak sonda kalibracyjna, śrubokręt sześciokątny i płytka montażowa (dla pipety 96-kanałowej).
3. PODŁĄCZ I ZABEZPIECZ PIPETĘ Portal przesunie się do przodu robota, umożliwiając podłączenie pipety.
Pipety 1- i 8-kanałowe podłącza się bezpośrednio do uchwytu na pipetę. Pipeta 96-kanałowa wymaga płytki montażowej. Aby zamontować płytkę montażową należy najpierw odłączyć wózek osi Z od prawego mocowania pipety.
OPENTRON FLEX
39
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Podłącz pipetę do wybranego uchwytu pipety i skręć jego śruby.
4. PRZEPROWADŹ AUTOMATYCZNĄ KALIBRACJĘ Aby skalibrować pipetę, należy podłączyć sondę kalibracyjną do odpowiedniej dyszy pipety. Pipeta automatycznie przesunie się, aby dotknąć określonych punktów na stole i zapisać wartości kalibracji do wykorzystania w przyszłości. Po zakończeniu kalibracji i usunięciu sondy pipeta będzie gotowa do użycia w protokołach.
Instalacja chwytaka
Po zainstalowaniu chwytaka zostaną Państwo poprowadzeni przez następujące kroki na ekranie dotykowym lub w aplikacji Opentrons.
1. PRZYGOTOWANIE DO INSTALACJI Wyjmij akcesoria laboratoryjne ze stołu i oczyść obszar roboczy, aby ułatwić mocowanie i kalibrację. Zbierz także wymagany śrubokręt sześciokątny i upewnij się, że kołek kalibracyjny znajduje się w miejscu przechowywania na chwytaku.
2. PODŁĄCZ I ZABEZPIECZ CHWYTAK Portal przesunie się do przodu robota, umożliwiając podłączenie chwytaka. Podłącz chwytak do uchwytu przedłużającego i dokręć jego śruby.
3. PRZEPROWADŹ AUTOMATYCZNĄ KALIBRACJĘ Aby skalibrować chwytak, włóż kołek kalibracyjny w przednią szczękę. Chwytak automatycznie przesunie się, aby dotknąć określonych punktów na platformie i zapisać wartości kalibracji do wykorzystania w przyszłości. Następnie powtórz ten sam proces z kołkiem kalibracyjnym w tylnej szczęce. Po zakończeniu kalibracji i umieszczeniu trzpienia z powrotem w miejscu przechowywania chwytak będzie gotowy do użycia w protokołach.
2.5 Przeniesienie
W tej sekcji znajdują się porady i instrukcje dotyczące przemieszczania robota Opentrons Flex na krótkich i długich dystansach.
40
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Krótkie ruchy
Krótki ruch obejmuje różne odległości, od „przesuńmy to trochę” do drugiego końca laboratorium, korytarza lub innego piętra budynku. W takich przypadkach możesz przesuwać Flex ręcznie. Dobrym rozwiązaniem jest również transportowanie go na wózku ręcznym.
Ostrzeżenie: Flex waży 88.5 kg. W rezultacie do jego bezpiecznego podniesienia i przeniesienia potrzebne są dwie osoby.
Zamontuj ponownie uchwyty do podnoszenia, aby przenieść Flex w nowe, pobliskie miejsce. Podnoszenie i przenoszenie Flexa za uchwyty to właściwy sposób przemieszczania robota na krótkie odległości. Po zakończeniu przenoszenia usuń uchwyty i przechowuj je w zestawie użytkownika. Aby zapobiec uszkodzeniu robota, do podnoszenia go i przenoszenia zawsze używaj uchwytów do podnoszenia. Nie chwytaj ramy, aby podnieść lub przenieść robota.
Przeprowadzki na duże odległości
Przeprowadzka na duże odległości powoduje transport Flexa poza teren uniwersytetu, placówki lub instytucji. Po drugiej stronie miasta, do nowego miasta, stanu, prowincji lub kraju, wszyscy są exampto raczej przeprowadzka na odległość. W takim przypadku będziesz musiał zapakować Flex, aby chronić go przed czynnikami atmosferycznymi, wstrząsami i nierównymi ruchami, które mogą wystąpić podczas transportu.
Jeśli zachowałeś skrzynię transportową i wewnętrzne wsporniki dostarczone z Flexem, możesz go ponownie zapakować w te materiały w celu przeprowadzki na dużą odległość. Wykonaj kroki rozpakowywania w odwrotnej kolejności, aby przygotować Flexa do transportu na duże odległości. Zasadniczo powinieneś:
Odłącz kabel zasilający i kabel sieciowy, jeśli jest podłączony. Usuń cały podłączony sprzęt i akcesoria laboratoryjne. Zamontuj ponownie płyty tarasowe. Zablokuj suwnicę (patrz sekcja Ogólne porady dotyczące przenoszenia poniżej). Zdjąć i przechowywać panele okienne.
Jeśli zachowałeś oryginalną skrzynkę:
Ponownie przymocuj ramę transportową do Flex i przymocuj ją do podstawy palety za pomocą wsporników w kształcie litery L. Dodaj wyściółkę i złóż ponownie skrzynię transportową.
OPENTRON FLEX
41
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Jeśli nie masz oryginalnej skrzynki i powiązanych materiałów, skontaktuj się z renomowaną firmą spedycyjną. Mogą zarządzać procesem pakowania, transportu i dostawy za Ciebie.
Ogólne porady dotyczące przeprowadzek
ODŁĄCZ KABEL ZASILANIA I SIECI Przed przeniesieniem Flexa nie zapomnij o: Wyłączeniu zasilania i odłączeniu go od źródła zasilania. Odłącz kabel Ethernet lub USB, jeśli jest używany.
ZABLOKOWANIE BRAMY Przed przeniesieniem Flexa włóż ponownie śruby blokujące, aby utrzymać suwnicę na miejscu. Punkty blokowania gantry znajdują się: Na lewej szynie bocznej, w pobliżu przodu robota. Pod pionowym ramieniem suwnicy. Po prawej stronie szyny, w pobliżu przodu robota. Zamknięcie tej części suwnicy wymaga małego elementu
pomarańczowy wspornik i dwie śruby zabezpieczające.
42
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
DOM BRAMY Możesz nie chcieć blokować suwnicy, jeśli przenosisz robota tylko do pobliskiego miejsca. Jeśli zdecydujesz się nie blokować, użyj przynajmniej ekranu dotykowego lub aplikacji Opentrons, aby ustawić suwnicę w pozycji wyjściowej przed jej wyłączeniem. Aby ustawić suwnicę za pomocą ekranu dotykowego, dotknij menu z trzema kropkami (), a następnie dotknij opcji Strona główna suwnicy. Aby ustawić suwnicę za pomocą aplikacji Opentrons: Kliknij Urządzenia. Kliknij swój Flex na liście urządzeń. Kliknij menu z trzema kropkami (), a następnie kliknij Portal główny.
USUŃ MODUŁY Moduły wbudowane i inne elementy dodatkowe zwiększają wagę Flexa. Wpływają również na środek ciężkości robota, co może powodować uczucie „przechylania się” podczas podnoszenia. Aby zmniejszyć wagę i zrównoważyć robota, przed jego podniesieniem należy zdjąć wszelkie podłączone instrumenty i sprzęt laboratoryjny.
ZAMONTUJ PONOWNIE GNIAZDA W POKŁADIE Zalecamy ponowne zamontowanie gniazd w pokładzie w przypadku przemieszczania się na duże odległości. Zabezpieczenie gniazd w ich oryginalnych lokalizacjach pomaga zapobiec przypadkowej utracie. Ponowne podłączenie gniazd talii na potrzeby krótkich ruchów po laboratorium jest opcjonalne.
PONOWNA KALIBRACJA PO PRZEMIESZCZENIU Należy ponownie skalibrować wszystkie instrumenty i moduły po ich ponownej instalacji. Więcej szczegółów na temat kalibracji modułów można znaleźć w rozdziale Moduły.
OPENTRON FLEX
43
ROZDZIAŁ 2: INSTALACJA I PRZEMIESZCZENIE
Ostatnie przemyślenia na temat przeprowadzki
Twój Flex to solidna i dobrze zbudowana maszyna, ale jest także precyzyjnym instrumentem naukowym zaprojektowanym z zachowaniem rygorystycznych tolerancji. W związku z tym należy obchodzić się z nim ostrożnie podczas przenoszenia go w obrębie lokalnego obszaru pracy lub wysyłania za granicę. Oznacza to przestrzeganie podanych tutaj wskazówek i kierowanie się własnym zdrowym rozsądkiem w kwestii transportu drogiego sprzętu laboratoryjnego. Konkluzja: podczas przenoszenia Flexa zachowaj ostrożność i dodatkową wyściółkę.
Jeśli masz pytania lub wątpliwości dotyczące przeniesienia Flexa, skontaktuj się z nami pod adresem support@opentrons.com.
44
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3
Opis systemu
W tym rozdziale opisano systemy sprzętowe Opentrons Flex, które leżą u podstaw jego podstawowych funkcji automatyzacji laboratorium. Pokład, suwnica i mocowania instrumentów Opentrons Flex umożliwiają użycie precyzyjnych komponentów do obsługi płynów i sprzętu laboratoryjnego. Ekran dotykowy urządzenia umożliwia uruchamianie protokołów i sprawdzanie stanu robota bez konieczności zabierania komputera do stołu laboratoryjnego. Łączność przewodowa i bezprzewodowa umożliwia dodatkową kontrolę z aplikacji Opentrons (więcej szczegółów można znaleźć w rozdziale Oprogramowanie i obsługa) oraz rozszerzanie funkcji systemu poprzez podłączenie urządzeń peryferyjnych (patrz rozdział Moduły).
3.1 Elementy fizyczne
Kamera
Kontrolka stanu
Ekran dotykowy
Rama
Pokład suwnicy
Drzwi wejściowe
Lokalizacje fizycznych komponentów Opentrons Flex.
Zaślepki klamek bocznych okien
OPENTRON FLEX
45
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Rama i obudowa
Rama robota Opentrons Flex zapewnia sztywność i wsparcie konstrukcyjne pokładowi i suwnicy. Wszystkie podzespoły mechaniczne są umieszczone i zamontowane na ramie głównej. Rama zbudowana jest głównie z blachy i profili aluminiowych.
Metalowa rama posiada otwory na boczne okna oraz drzwi wejściowe wykonane z przezroczystego poliwęglanu, dzięki którym można zobaczyć, co dzieje się wewnątrz Flexa. Zawiasy przednich drzwi są otwarte, co umożliwia dostęp do wnętrza systemu. Przy otwartych drzwiach przednich można przymocować instrumenty, moduły i osprzęt pokładowy; przygotować pokład przed protokołem; lub manipuluj stanem talii podczas protokołu.
Białe paski LED na wewnętrznych, górnych krawędziach ramy zapewniają oświetlenie otoczenia sterowane programowo. 2-megapikselowy aparat może fotografować pokład i obszar roboczy w celu rejestrowania i śledzenia wykonania protokołu.
Pokład i obszar roboczy
Pokład to obrobiona maszynowo powierzchnia aluminiowa, na której wykonywane są zautomatyzowane protokoły naukowe. W talii znajduje się 12 głównych gniazd w formacie ANSI/SLAS, które można skonfigurować tak, aby mieściły sprzęt laboratoryjny, moduły i materiały eksploatacyjne. Szczeliny w pokładzie są identyfikowane za pomocą układu współrzędnych, gdzie szczelina A1 znajduje się z tyłu po lewej stronie, a szczelina D3 z przodu po prawej stronie.
Gniazdo rozszerzeń (dla termocyklera) Obszar roboczy
Stagobszar
Obszary pokładu w ramach Flex.
46
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Obszar roboczy to fizyczna przestrzeń nad platformą, dostępna do pipetowania. Sprzęt laboratoryjny umieszczony w gniazdach od A1 do D3 znajduje się w obszarze roboczym.
Opentrons Flex jest wyposażony w wyjmowane szczeliny w pokładzie dla wszystkich 12 pozycji w obszarze roboczym. W każdym gnieździe blatu znajdują się narożne klipsy na akcesoria laboratoryjne umożliwiające bezpieczne umieszczenie akcesoriów na pokładzie.
Można zmienić konfigurację pokładu, zastępując gniazda innymi elementami wyposażenia pokładu, w tym ruchomym koszem na śmieci, zsypem na odpady i pojemnikami na moduły. Szczelina rozszerzeń za A1 służy jedynie do zapewnienia dodatkowego miejsca dla modułu termocyklera, który zajmuje gniazda A1 i B1.
Uwaga: Szczeliny w talii można wymieniać w obrębie kolumny (1, 2 lub 3), ale nie pomiędzy kolumnami; Szczeliny w kolumnie 1 i kolumnie 3 to odrębne elementy pomimo podobnego rozmiaru. Możesz określić, w której kolumnie znajduje się gniazdo, ustawiając niebieski klips na akcesoria laboratoryjne z tyłu po lewej stronie.
Należy pozostawić szczeliny w pokładzie zainstalowane w miejscach, w których chcesz umieścić samodzielny sprzęt laboratoryjny. Pokład i umieszczone na nim przedmioty pozostają nieruchome, chyba że zostaną poruszone chwytakiem lub interwencją ręczną.
Stagobszar
StagObszar roboczy to dodatkowa przestrzeń po prawej stronie pokładu. Po zainstalowaniu oprogramowania s. można w tym miejscu przechowywać sprzęt laboratoryjnytagszczeliny obszarowe. Sprzęt laboratoryjny umieszczony w gniazdach od A4 do D4 znajduje się w stagobszar. Pipety Flex nie mogą sięgać do stagobszarze, ale chwytak może podnosić i przenosić sprzęt laboratoryjny do i z tego miejsca. Dodanie dodatkowych gniazd pomaga zachować obszar roboczy dostępny dla sprzętu używanego w zautomatyzowanych protokołach.
StagGniazda obszaru roboczego są zawarte w niektórych konfiguracjach stacji roboczych i można je również kupić na stronie https://shop.opentrons.com.
OPENTRON FLEX
47
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
StagObszar z zainstalowanymi gniazdami
Osprzęt pokładowy
Oprawy to elementy sprzętowe, które zastępują standardowe gniazda w talii. Pozwalają dostosować układ talii i dodać funkcjonalność do Flexa. Obecnie wyposażenie pokładu obejmuje stagszczeliny w obszarze roboczym, wewnętrzny kosz na śmieci i zewnętrzny zsyp na odpady. Urządzenia można instalować tylko w kilku określonych gniazdach w talii. W poniższej tabeli wymieniono lokalizacje pokładów dla każdego urządzenia.
Oprawa StagSzczeliny w obszarze Kosz na śmieci Zsyp na odpady Zsyp na odpady z stagszczelina obszarowa
Gniazda A3D3 A1D1 i A3-D3 Tylko D3 Tylko D3
Oprawy są pozbawione zasilania. Nie zawierają elementów elektronicznych ani mechanicznych, które informowałyby robota o ich bieżącym stanie i położeniu pokładu. Oznacza to, że musisz użyć funkcji konfiguracji decku, aby Flex wiedział, jakie urządzenia są podłączone do decku i gdzie się znajdują.
48
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Dostęp do ustawień konfiguracji urządzenia można uzyskać z ekranu dotykowego poprzez menu z trzema kropkami () oraz z aplikacji Opentrons. Informacje na temat konfigurowania odtwarzacza za pomocą ekranu dotykowego można znaleźć w części Konfiguracja urządzenia w rozdziale Oprogramowanie i obsługa.
Zsyp na śmieci
Zsyp na odpady Flex firmy Opentrons przenosi płyny, końcówki, statywy na końcówki i płytki dołkowe z obudowy Flex do pojemnika na śmieci umieszczonego poniżej jej zewnętrznego otworu. Zsyp na odpady mocuje się do adaptera płyty pokładowej, który pasuje do szczeliny D3. Jest również wyposażony w specjalny półpanel okienny, który umożliwia wysunięcie rynny z przodu robota.
Elementy zsypu na odpady.
Adapter płyty pokładowej pokrywy
Zsyp na odpady
Adapter płyty tarasowej z Stagobszar
Stagszczeliny obszarowe
Staggniazda obszaru roboczego to elementy pokładu zgodne z ANSI/SLAS, które zastępują standardowe gniazda w kolumnie 3 i dodają nowe gniazda dotagpowierzchni roboczej — wszystko to bez utraty miejsca w obszarze roboczym. Możesz zainstalować jedno miejsce lub maksymalnie cztery miejsca, aby utworzyć nową kolumnę (A4 do D4) wzdłuż prawej strony talii. Należy jednak pamiętać, że wymiana szczeliny A3 w pokładzie wymaga przesunięcia kosza na śmieci. Dodając stagDzięki szczelinom w płycie robot Flex może przechowywać więcej akcesoriów laboratoryjnych i działać wydajniej.
OPENTRON FLEX
Flex stagszczelina obszarowa.
49
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
INSTALACJA SLOTU
Aby zainstalować, wykręć śruby mocujące standardowe gniazdo do decku i zastąp je gniazdem stagszczelina obszarowa. Po instalacji użyj ekranu dotykowego lub aplikacji Opentrons, aby poinformować robota, który dodałeś jakotagszczelinę w obszarze pokładu.
Instalacja jakotagszczelina obszarowa.
ZGODNOŚĆ Z GNIAZDAMI StagGniazda obszaru roboczego są kompatybilne z instrumentami, modułami i sprzętem laboratoryjnym Flex wymienionymi poniżej.
Moduły pipet chwytakowych z komponentem Flex
Sprzęt laboratoryjny
Stagkompatybilność obszaru
Flex Gripper może przenosić sprzęt laboratoryjny do lub z stagszczeliny obszarowe.
Pipety Flex nie mogą dotrzeć do stagobszar. Użyj chwytaka, aby przenieść statywy na końcówki i sprzęt laboratoryjny z urządzenia stagprzenieść do obszaru roboczego przed pipetowaniem.
Blok magnetyczny GEN1 można umieścić w kolumnie 3 na górzetagszczelina obszarowa. Moduły nie są obsługiwane w kolumnie 4.
Zasilane moduły, takie jak wytrząsarka podgrzewająca i moduł temperaturowy, pasują do pojemników, które można umieścić w kolumnie 3. Nie można dodawać jakotagprzesunąć szczelinę obszarową do miejsca zajmowanego przez oprawę modułu.
StagSzczeliny obszaru roboczego mają te same wymiary ANSI/SLAS, co standardowe szczeliny pokładowe. Używaj sprzętu laboratoryjnego kompatybilnego z chwytakiem w stagobszarze lub ręcznie dodawać i usuwać akcesoria laboratoryjne z tej lokalizacji.
50
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
System ruchu
Do ramy przymocowana jest suwnica, która stanowi system ruchu i pozycjonowania robota. Portal porusza się oddzielnie wzdłuż osi x i y, ustawiając pipety i chwytak w precyzyjnych miejscach w celu wykonania protokołu. Ruch wzdłuż tych osi odbywa się z dokładnością do 0.1 mm. Bramą steruje się hybrydowymi bipolarnymi silnikami krokowymi 36 VDC. Z kolei do suwnicy przymocowane są uchwyty do pipet i uchwyt przedłużający. Poruszają się one wzdłuż osi Z, ustawiając pipety i chwytak w precyzyjnych miejscach w celu wykonania protokołu. Ruch wzdłuż tej osi jest kontrolowany przez hybrydowe bipolarne silniki krokowe 36 VDC. Elektronika zawarta w suwnicy zapewnia zasilanie 36 VDC i komunikację z pipetami i chwytakiem, jeśli są podłączone.
Suwnica
Uchwyty do pipet
Uchwyt przedłużający
Położenie uchwytów przyrządów na Flex.
Ekran dotykowy i wyświetlacze LED
Podstawowym interfejsem użytkownika jest 7-calowy ekran dotykowy LCD, umieszczony z przodu po prawej stronie robota. Ekran dotykowy pokryty jest szkłem Gorilla Glass 3 zapewniającym odporność na zarysowania i uszkodzenia. Uzyskaj dostęp do wielu funkcji Flex bezpośrednio na ekranie dotykowym, w tym:
OPENTRON FLEX
51
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Zarządzanie protokołami Konfiguracja, wykonywanie i monitorowanie protokołu Zarządzanie sprzętem laboratoryjnym Ustawienia robota Aktualizacje oprogramowania systemowego i oprogramowania sprzętowego Dzienniki operacji i powiadomienia o błędach
Aby uzyskać więcej informacji na temat korzystania z Flex za pomocą ekranu dotykowego, zobacz sekcję Obsługa ekranu dotykowego w rozdziale Oprogramowanie i obsługa.
Lampka stanu to pasek diod LED umieszczony w górnej części przodu robota, który zapewnia szybki dostęp do informacji o robocie. Różne kolory i wzory podświetlenia mogą sygnalizować różne sukcesy, niepowodzenia lub stany bezczynności:
Kolor diody LED Biały Stany neutralne
Zielony Stany normalne
Niebieski Stany obowiązkowe Żółty Stany nieprawidłowe Czerwony Stany awaryjne
Wzór diody LED Stałe pulsowanie
Mruga dwa razy
Stałe Pulsowanie Pulsowanie
Status robota
Włączony i nie uruchamia protokołu Robot jest zajęty (np. aktualizacją oprogramowania lub oprogramowania sprzętowego, konfigurowaniem przebiegu protokołu, anulowaniem przebiegu protokołu) Akcja została ukończona (np. zapisanie protokołu, aktualizacja oprogramowania, podłączenie lub odłączenie instrumentu) Protokół jest uruchomiony Protokół został ukończony Protokół jest wstrzymany
Solidny
Błąd oprogramowania
Miga trzykrotnie, wielokrotnie
Błąd fizyczny (np. awaria instrumentu)
Lampkę stanu można również wyłączyć w ustawieniach robota.
52
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
3.2 Pipety
Pipety Opentrons to konfigurowalne urządzenia służące do przemieszczania cieczy po obszarze roboczym podczas wykonywania protokołów. Istnieje kilka pipet Opentrons Flex, które mogą obsługiwać objętości od 1 µl do 1000 µl w 1, 8 lub 96 kanałach:
Pipeta 1-kanałowa Opentrons Flex (1 µL) Pipeta 50-kanałowa Opentrons Flex (1 µL) Pipeta 5-kanałowa Opentrons Flex (1000 µL) Pipeta 8-kanałowa Opentrons Flex (1 µL) Pipeta 50-kanałowa Opentrons Flex (8 µL)
Pipety mocuje się do suwnicy za pomocą śrub mocujących z przodu pipety. Pipety 1-kanałowe i 8-kanałowe zajmują jedno mocowanie pipety (lewe lub prawe); Pipeta 96-kanałowa zajmuje oba mocowania. Szczegółowe informacje na temat instalowania pipet można znaleźć w części Instalacja i kalibracja urządzenia.
Przywiązanie do niewoli
Śruby
Uwięzione śruby mocujące
Wyrzutnik
Dysze (wymienne O-ringi)
Dysze (stałe pierścienie uszczelniające)
Rozmieszczenie elementów pipet 1-, 8- i 96-kanałowych.
Wyrzutnik
OPENTRON FLEX
53
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Pipety pobierają jednorazowe plastikowe końcówki, dociskając je do dysz pipet, a następnie wykorzystują końcówki do aspirowania i dozowania cieczy. Całkowita siła wymagana do pobrania wzrasta w miarę jednoczesnego pobierania większej liczby końcówek. W przypadku mniejszej liczby końcówek pipeta mocuje końcówki, wpychając każdą dyszę pipety w końcówkę. Aby uzyskać siłę niezbędną do pobrania pełnego stojaka z końcówkami, 96-kanałowa pipeta naciąga również końcówki w górę na dysze. To działanie ciągnące wymaga umieszczenia stojaków na końcówki w adapterze stojaka na końcówki, a nie bezpośrednio w szczelinie pokładu. Aby wyrzucić końcówki (lub odłożyć je z powrotem na stojak), mechanizm wyrzutnika pipet wypycha końcówki z dysz.
Specyfikacje pipet
Pipety Opentrons Flex są przeznaczone do obsługi szerokiego zakresu objętości. Ze względu na szeroki zakres ogólny można w nich stosować końcówki o różnych rozmiarach, co wpływa na ich charakterystykę przenoszenia cieczy. Firma Opentrons przetestowała pipety Flex pod kątem dokładności i precyzji w szeregu kombinacji końcówek i objętości cieczy:
Pipeta
Flex 1-kanałowy
50 µl
Flex 1-kanałowy
1000 µl
Flex 8-kanałowy
50 µl
Flex 8-kanałowy
1000 µl
Pojemność końcówki 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Badana objętość 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µl 1000 µl
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Dokładność %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Precyzja %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Flex 96-kanałowy
1000 µl
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Należy pamiętać o tych informacjach dotyczących dokładności przy wyborze końcówek do pipety. Ogólnie rzecz biorąc, aby uzyskać najlepsze wyniki, należy używać najmniejszych końcówek, które spełniają wymagania protokołu.
Uwaga: Opentrons przeprowadza testy wolumetryczne pipet Flex, aby upewnić się, że spełniają one wymienione powyżej specyfikacje dokładności i precyzji. Nie ma konieczności kalibrowania objętości dozowanej za pomocą pipet przed użyciem. Należy jedynie przeprowadzić kalibrację pozycyjną. Aby uzyskać szczegółowe informacje, zobacz następną sekcję, a także sekcję Instalacja pipety w rozdziale Instalacja i przenoszenie.
Usługi Opentrons Care i Opentrons Care Plus obejmują coroczną wymianę pipet i certyfikaty kalibracji. Aby uzyskać szczegółowe informacje, zobacz sekcję Elastyczny serwis w rozdziale Konserwacja i serwis.
Kalibracja pipety
Zestaw użytkownika zawiera metalową sondę kalibracyjną pipety, której używa się podczas kalibracji pozycyjnej. Podczas przebiegu protokołu bezpiecznie przechowuj sondę na uchwycie magnetycznym na przednim słupku robota. Podczas procesu kalibracji załóż sondę na odpowiednią dyszę i zablokuj ją na miejscu. Robot przesuwa sondę do punktów kalibracyjnych na stole, aby zmierzyć dokładne położenie pipety.
Adapter stojaka na końcówki pipet
Pipeta 96-kanałowa Opentrons Flex jest dostarczana z czterema adapterami stojaków na końcówki. Są to precyzyjnie uformowane aluminiowe wsporniki, które umieszcza się na pokładzie. Adaptery mieszczą statywy na końcówki Flex 50 L, 200 L i 1000 µL.
OPENTRON FLEX
55
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Ze względu na wymaganą siłę pipeta 96-kanałowa wymaga adaptera w celu prawidłowego zamocowania statywu z pełnymi końcówkami. Podczas mocowania pipeta przesuwa się nad adapterem, opuszcza się na kołki montażowe i naciąga końcówki na pipety, podnosząc adapter i stojak na końcówki. Ciągnięcie końcówek, a nie popychanie, zapewnia dźwignię potrzebną do zamocowania końcówek do pipet i zapobiega wypaczaniu powierzchni zespołu. Po zakończeniu 96-kanałowa pipeta opuszcza adapter i pusty statyw na końcówki na platformę. Więcej informacji można znaleźć w sekcji Końcówki i statywy na końcówki w rozdziale Sprzęt laboratoryjny.
Częściowy odbiór napiwków
Pipeta 96-kanałowa może pobrać cały stojak z końcówkami lub mniejszą liczbę końcówek. Zwiększa to liczbę zastosowań, jakie można wykonać za pomocą pipety 96-kanałowej, ponieważ zajmuje ona oba uchwyty do pipet.
Obecnie pipeta 96-kanałowa obsługuje częściowe pobieranie końcówek dla 8 końcówek w układzie kolumnowym. W tej konfiguracji pipeta wykorzystuje dysze położone najbardziej po lewej stronie do pobierania końcówek od prawej do lewej ze stojaka na końcówki lub dysze znajdujące się najbardziej na prawo do pobierania końcówek od lewej do prawej ze stojaka na końcówki.
W przypadku pobierania mniej niż 96 końcówek ze stojaka na końcówki, statyw należy umieścić bezpośrednio na pokładzie, a nie w adapterze stojaka na końcówki.
Czujniki pipetowe
Pipety Opentrons Flex są wyposażone w szereg czujników, które wykrywają i rejestrują dane o stanie pipety i wszelkich pobranych końcówkach.
CZUJNIKI POJEMNOŚCI
W połączeniu z metalową sondą lub przewodzącą końcówką czujniki pojemności wykrywają kontakt pipety z czymś. Wykrywanie kontaktu metalowej sondy z płytką jest wykorzystywane w procesach automatycznej kalibracji pipet i kalibracji modułów.
Pipety 1-kanałowe posiadają jeden czujnik pojemności, natomiast pipety wielokanałowe posiadają dwa czujniki: na kanałach 1 i 8 pipety 8-kanałowej oraz na kanałach 1 i 96 (pozycje A1 i H12) pipety 96-kanałowej.
56
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
OPTYCZNE CZUJNIKI OBECNOŚCI KOŃCÓWKI
Przełącznik fotoprzerywacza wykrywa położenie mechanizmu wyrzutnika końcówek pipety, potwierdzając, czy końcówki zostały pomyślnie pobrane, czy upuszczone. Pipety 1-kanałowe, 8-kanałowe i 96-kanałowe są wyposażone w pojedynczy czujnik optyczny, który monitoruje zamocowanie końcówki we wszystkich kanałach.
Aktualizacje oprogramowania sprzętowego pipety
Opentrons Flex automatycznie aktualizuje oprogramowanie sprzętowe pipet, aby zapewnić jego synchronizację z wersją oprogramowania robota. Aktualizacje oprogramowania sprzętowego pipet są zazwyczaj szybkie i mają miejsce, gdy:
Dołączasz pipetę. Robot uruchamia się ponownie.
Jeśli z jakiegokolwiek powodu wersja oprogramowania sprzętowego pipety i oprogramowania robota nie jest zsynchronizowana, można ręcznie zaktualizować oprogramowanie sprzętowe w aplikacji Opentrons.
1. Kliknij Urządzenia. 2. Kliknij swój Flex na liście urządzeń. 3. W obszarze Instruments and Modules w przypadku niezsynchronizowanej pipety zostanie wyświetlony baner ostrzegawczy
„Dostępna aktualizacja oprogramowania sprzętowego.” Kliknij Aktualizuj teraz, aby rozpocząć aktualizację.
Możesz view aktualnie zainstalowana wersja oprogramowania sprzętowego dowolnej podłączonej pipety. Na ekranie dotykowym przejdź do opcji Instrumenty i dotknij nazwy pipety. W aplikacji Opentrons znajdź kartę pipety w sekcji Instrumenty i moduły, kliknij menu z trzema kropkami (), a następnie kliknij Informacje o pipecie.
3.3 Chwytak
Chwytak przesuwa sprzęt laboratoryjny po całym obszarze roboczym i stagobszar podczas wykonywania protokołów. Chwytak mocuje się do uchwytu przedłużającego, który jest oddzielony od uchwytów do pipet; chwytak może być używany z dowolną konfiguracją pipety. Szczegółowe informacje na temat instalowania chwytaka można znaleźć w części Instalacja i kalibracja przyrządu.
Chwytak może przenosić sprzęt laboratoryjny po pokładzie oraz na moduły lub z nich. Chwytak może manipulować niektórymi płytkami z pełnymi dołkami, płytkami z głębokimi dołkami i statywami na końcówki. Aby uzyskać więcej informacji na temat sprzętu laboratoryjnego, który może przenosić chwytak, zobacz sekcję Sprzęt laboratoryjny i chwytak Opentrons Flex w rozdziale Sprzęt laboratoryjny lub zapoznaj się z biblioteką sprzętu laboratoryjnego Opentrons.
OPENTRON FLEX
57
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Specyfikacje chwytaka
Szczęki wykonują główny ruch chwytaka, polegający na otwieraniu lub zamykaniu dwóch równoległych łopatek w celu przyłożenia lub zwolnienia siły na boki sprzętu laboratoryjnego. Ruch szczęk jest kontrolowany przez silnik szczotkowy 36 VDC połączony z przekładnią zębatkową.
Aby przesunąć element wyposażenia laboratoryjnego, który został uchwycony przez szczęki, suwnica podnosi chwytak wzdłuż osi Z, przesuwa go w bok, a następnie opuszcza do nowego położenia sprzętu laboratoryjnego.
Położenie elementów chwytaka.
Śruby mocujące
Trzpień kalibracyjny Szczęki Łopatki
Kalibracja chwytaka
Chwytak zawiera metalowy kołek kalibracyjny. Trzpień kalibracyjny znajduje się we wgłębieniu w dolnej części chwytaka. Magnes utrzymuje szpilkę na miejscu. Aby wyjąć trzpień kalibracyjny, chwyć go palcami i delikatnie pociągnij. Aby wymienić trzpień, włóż go z powrotem do gniazda. Będziesz mieć pewność, że jest bezpieczny, gdy zatrzaśnie się na swoim miejscu.
Podczas kalibracji chwytaka należy przymocować sworzeń po kolei do każdej szczęki. Robot przesuwa sworzeń do punktów kalibracyjnych na platformie, aby zmierzyć dokładne położenie chwytaka.
Podczas przebiegu protokołu umieść szpilkę w miejscu przechowywania w celu bezpiecznego przechowywania. Jeśli zgubisz pin kalibracyjny, skontaktuj się z nami pod adresem support@opentrons.com.
Aktualizacje oprogramowania sprzętowego chwytaka
Opentrons Flex automatycznie aktualizuje oprogramowanie sprzętowe chwytaka, aby zapewnić jego synchronizację z wersją oprogramowania robota. Aktualizacje oprogramowania sprzętowego chwytaka są zazwyczaj szybkie i mają miejsce, gdy:
58
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Dołączasz chwytak. Robot uruchamia się ponownie.
Jeśli z jakiegokolwiek powodu wersja oprogramowania chwytaka i oprogramowania robota nie jest zsynchronizowana, możesz ręcznie zaktualizować oprogramowanie w aplikacji Opentrons.
1. Kliknij Urządzenia. 2. Kliknij swój Flex na liście urządzeń. 3. W obszarze Instrumenty i moduły niezsynchronizowany chwytak wyświetli baner ostrzegawczy
„Dostępna aktualizacja oprogramowania sprzętowego.” Kliknij Aktualizuj teraz, aby rozpocząć aktualizację.
Możesz view aktualnie zainstalowana wersja oprogramowania chwytaka. Na ekranie dotykowym przejdź do opcji Instrumenty i dotknij chwytaka. W aplikacji Opentrons znajdź kartę chwytaka w obszarze Instrumenty i moduły, kliknij menu z trzema kropkami (), a następnie kliknij Informacje o chwytaku.
3.4 Zawieszka wyłącznika awaryjnego
Zawieszka zatrzymania awaryjnego (E-stop) to dedykowany przycisk sprzętowy umożliwiający szybkie zatrzymanie ruchu robota. Opentrons Flex wymaga sprawnego, odłączonego wyłącznika awaryjnego, który musi być podłączony przez cały czas. Po naciśnięciu przycisku zatrzymania Flex możliwie najszybciej anuluje bieżący protokół lub przebieg konfiguracji i zapobiega większości ruchów robota.
Kiedy używać wyłącznika awaryjnego
Może być konieczne naciśnięcie przycisku zatrzymania awaryjnego:
Gdy istnieje bezpośrednie ryzyko obrażeń lub szkody dla użytkownika. Gdy istnieje bezpośrednie ryzyko uszkodzenia robota lub innego sprzętu. Kiedy sampLeki lub odczynniki są narażone na bezpośrednie niebezpieczeństwo skażenia. Po kolizji sprzętowej.
Idealnie byłoby, gdyby nigdy nie było konieczności naciskania wyłącznika awaryjnego (z wyjątkiem rzadkich testów jakości sprzętu).
Nie używaj wyłącznika awaryjnego do anulowania normalnych, oczekiwanych operacji. Zamiast tego użyj przycisku oprogramowania na ekranie dotykowym lub w aplikacji Opentrons. Wstrzymanie za pomocą oprogramowania umożliwi wznowienie lub anulowanie protokołu, natomiast naciśnięcie przycisku E-stop zawsze powoduje natychmiastowe anulowanie protokołu.
OPENTRON FLEX
59
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Włączanie i zwalnianie wyłącznika awaryjnego
Urządzenie E-stop posiada mechanizm, który umożliwia wciśnięcie i przekręcenie w celu zwolnienia.
Włączanie: Naciśnij mocno czerwony przycisk. Flex przejdzie w stan zatrzymania. Rozwiązanie: Po zatrzymaniu bezpiecznie rozwiąż wszelkie problemy w miejscu pracy, takie jak usuwanie rozlanych płynów,
wyjmowanie akcesoriów laboratoryjnych lub przesuwanie suwnicy (powinna ona poruszać się swobodnie i łatwo ręcznie). Zwolnienie: Przekręć przycisk w kierunku zgodnym z ruchem wskazówek zegara. Podniesie się do pozycji wyłączonej. Resetuj: na ekranie dotykowym lub w aplikacji Opentrons potwierdź, że jesteś gotowy na wznowienie Flex
ruch. Portal powróci do pozycji wyjściowej i działanie modułu zostanie wznowione.
W stanie zatrzymania Flex i podłączony sprzęt będą zachowywać się w następujący sposób:
Sprzętowe pipety gantry
Chwytak
Moduł podgrzewacza i wytrząsarki
Moduł temperatury Moduł termocyklera Lampka stanu Ekran dotykowy
Zachowanie
Automatyczny ruch poziomy zostaje zatrzymany. Dopuszczalny jest ręczny ruch poziomy.
Pionowy ruch pipet został zatrzymany. Aby temu zapobiec, włączane są hamulce silnika na osiach pionowych
pipety przed upadkiem. Ruch tłoka i pobieranie końcówki zostały zatrzymane.
Ruch pionowy chwytaka zostaje zatrzymany. Hamulec silnika na osi pionowej jest włączony, aby zapobiec
chwytak przed upadkiem. Silniki szczęk wywierające siłę chwytającą pozostają włączone, tzw
chwytak nie upuści przenoszonych przez siebie akcesoriów laboratoryjnych.
Wytrząsarka zatrzymuje się i wraca do domu. Otwiera się zatrzask akcesoriów laboratoryjnych. Ogrzewanie jest wyłączone.
Ogrzewanie lub chłodzenie jest wyłączone.
Ogrzewanie lub chłodzenie jest wyłączone.
Światło zmienia kolor na czerwony.
Na ekranie pojawi się komunikat o anulowaniu. Wskaźnik na ekranie poinformuje Cię o pomyślnym zakończeniu
zwolnił przycisk stop.
60
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
3.5 Połączenia
Przełącznik włączania/wyłączania
Osłony boczne
Porty USB-A
Wejście zasilania IEC
Porty AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Podłączenie zasilania
Opentrons Flex łączy się ze źródłem zasilania poprzez standardowe wejście IEC-C14. Robot zawiera wewnętrzny, pełnozakresowy zasilacz AC/DC, akceptujący napięcie wejściowe 100 VAC, 240/50 Hz i przekształcający je na napięcie 60 VDC. Cała pozostała elektronika wewnętrzna jest zasilana napięciem 36 VDC.
Ostrzeżenie: Używaj wyłącznie przewodu zasilającego dostarczonego z robotem. Nie używaj przewodu zasilającego o niewystarczającym natężeniu prądu lub głośnościtage oceny.
Przewód zasilający powinien być wolny od przeszkód, aby w razie potrzeby można go było odłączyć.
Dostępna jest również bateria pastylkowa CR1220, która zasila zegar czasu rzeczywistego robota, gdy nie jest on podłączony do zasilania sieciowego. Bateria znajduje się wewnątrz obudowy ekranu dotykowego. Skontaktuj się z pomocą techniczną Opentrons, aby uzyskać więcej informacji, jeśli uważasz, że musisz wymienić baterię.
OPENTRON FLEX
61
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Złącza USB i pomocnicze
Opentrons Flex ma w sumie 10 portów USB zlokalizowanych w różnych obszarach robota, które służą różnym celom.
8 tylnych portów USB-A (ponumerowanych od USB-1 do USB-8) i 2 porty pomocnicze (złącza M12 o numerach AUX-1 i AUX-2) służą do podłączania modułów i akcesoriów Opentrons. Więcej informacji na temat podłączania tych urządzeń i używania ich w protokołach można znaleźć w rozdziale Moduły. Tylny port USB-B służy do podłączenia robota do laptopa lub komputera stacjonarnego w celu nawiązania komunikacji z aplikacją Opentrons działającą na podłączonym komputerze. Przedni port USB-A (USB-9), umieszczony pod wyświetlaczem dotykowym, ma taką samą funkcjonalność jak tylne porty USB-A.
Uwaga: porty USB mają ograniczoną moc, aby chronić robota i podłączone urządzenia. Zasilanie jest podzielone wewnętrznie na trzy grupy portów: lewe tylne porty USB-A (USB-1 do USB-4), prawe tylne porty USB-A (USB-5 do USB-8) i przednie USB-A Port. Każda z tych grup dostarcza maksymalnie 500 mA do podłączonych urządzeń zgodnych ze standardem USB 2.0.
Połączenia sieciowe
Opentrons Flex może łączyć się z siecią lokalną za pośrednictwem połączenia przewodowego (Ethernet) lub bezprzewodowego (Wi-Fi).
Port Ethernet znajduje się z tyłu robota. Podłącz go do koncentratora Ethernet lub włącz swoją sieć. Lub, począwszy od wersji systemu robota 7.1.0, podłącz go bezpośrednio do portu Ethernet w komputerze. Wewnętrzny moduł Wi-Fi obsługuje sieci 802.11 ac/a/b/g/n z dwuzakresową anteną 2.4/5 GHz.
62
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
3.6 Specyfikacje systemu
Specyfikacje ogólne
Wymiary Waga Szczeliny w pokładzie
Ekran dotykowy
Wi-Fi Ethernet USB
Wejście zasilania robota kamery
Zasilanie sieciowe voltagwahania częstotliwości wahania częstotliwości zasilania sieciowego system dystrybucji prąd zwarciowy składu ramy składu okna wymagania wentylacyjne
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 cale (szer., gł., wys.)
88.5 kg / 195 funtów 12 gniazd zgodnych z ANSI/SLAS w obszarze roboczym
(dostępne dla pipet) 4 dodatkowe miejsca na stagwskazówki i sprzęt laboratoryjny
(dostępny tylko dla chwytaka) 7-calowy ekran dotykowy LCD z odpornym na zarysowania i uszkodzenia szkłem Gorilla Glass 3
Dwuzakresowy standard 802.11 ac/a/b/g/n (2.4/5 GHz)
100 Mb/s 9 portów USB-A 1 port USB-B Szybkość USB 2.0
2 MP, zdjęcia i wideo 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Sztywna konstrukcja ze stali i aluminium CNC
Zdejmowane okna boczne i drzwi przednie z poliwęglanu Co najmniej 20 cm / 8 pomiędzy urządzeniem a ścianą
OPENTRON FLEX
63
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Wymagania dotyczące podłączonego komputera
Aplikacja Opentrons działa na: Windows 10 lub nowszym, macOS 10.10 lub nowszym, Ubuntu 12.04 lub nowszym
Specyfikacje środowiskowe
Warunki środowiskowe Temperatura otoczenia Wilgotność względna Stopień zanieczyszczenia
Tylko do użytku w pomieszczeniach +20 do +25°C (zalecane) 40%, bez kondensacji (zalecane) 60 (tylko zanieczyszczenia nieprzewodzące)
Aby uzyskać dodatkowe informacje na temat akceptowalnych warunków środowiskowych dotyczących użytkowania i transportu, zobacz sekcję Warunki środowiskowe w rozdziale Instalacja i przeniesienie.
Certyfikaty
Certyfikaty ukończone Brak certyfikatu/zatwierdzenia
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Podsumowanie informacji certyfikacyjnych jest wydrukowane na naklejce z tyłu Flex, w pobliżu włącznika/wyłącznika. Szczegółowe informacje na temat certyfikacji i zgodności można znaleźć w sekcji Zgodność z przepisami we wstępie.
Numer seryjny
Każdy Flex ma unikalny numer seryjny. Format numeru seryjnego dostarcza dodatkowych informacji, m.in. daty produkcji robota. Na przykładample, numer seryjny FLXA1020231007001 wskazywałby:
64
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 3: OPIS SYSTEMU
Znaki FLX A10 2023 10 07 001
Kategoria Model Wersja Rok Miesiąc Dzień Jednostka
Znaczenie Robot to Opentrons Flex. Kod wersji produkcyjnej robota. Robot powstał w 2023 roku. Robot powstał w październiku. Robot powstał 7-go dnia miesiąca. Unikalny numer dla robotów wyprodukowanych w określonym dniu.
Numer seryjny urządzenia Flex znajdziesz:
Na naklejce certyfikacyjnej z tyłu Flex, w pobliżu włącznika/wyłącznika. Z tyłu ekranu dotykowego (w kierunku obszaru roboczego). W aplikacji Opentrons w obszarze Urządzenia > Twój Flex > Ustawienia robota > Zaawansowane.
OPENTRON FLEX
65
ROZDZIAŁ 4
Moduły
Opentrons Flex integruje się z wieloma modułami sprzętowymi Opentrons. Wszystkie moduły to urządzenia peryferyjne, które zajmują miejsca na pokładzie, a większość z nich jest sterowana przez robota za pośrednictwem połączenia USB.
W tym rozdziale opisano funkcje i specyfikacje fizyczne modułów kompatybilnych z systemem Opentrons Flex, a także sposób ich podłączania i kalibracji. Więcej szczegółów na temat konfiguracji i użytkowania modułów można znaleźć w instrukcjach poszczególnych modułów. Aby uzyskać szczegółowe informacje na temat integrowania modułów z protokołami, zobacz sekcję Projektant protokołów w rozdziale Tworzenie protokołów lub internetową dokumentację API protokołu Python.
4.1 Obsługiwane moduły
Opentrons Flex jest kompatybilny z czterema typami modułów Opentrons na pokładzie:
Moduł nagrzewnicy-wytrząsarki zapewnia ogrzewanie na pokładzie i wytrząsanie orbitalne. Moduł można nagrzać do 95°C i potrząsać nimampw zakresie od 200 do 3000 obr./min.
Blok magnetyczny to urządzenie pasywne, które utrzymuje sprzęt laboratoryjny blisko magnesów neodymowych o dużej wytrzymałości. Moduły magnetyczne OT-2 GEN1 i GEN2, które aktywnie przesuwają swoje magnesy w górę i w dół względem sprzętu laboratoryjnego, nie są obsługiwane przez Opentrons Flex.
Moduł temperaturowy to moduł z płytą grzejną i zimną, który jest w stanie utrzymać stałą temperaturę w zakresie od 4 do 95°C.
Moduł termocyklera zapewnia w pełni zautomatyzowany cykl termocyklingowy na pokładzie, umożliwiając automatyzację etapów przepływu pracy przed i za urządzeniem. Termocykler GEN2 jest w pełni kompatybilny z chwytakiem. Termocyklera GEN1 nie można używać z chwytakiem i dlatego nie jest obsługiwany przez Opentrons Flex.
Niektóre moduły pierwotnie zaprojektowane dla OT-2 są kompatybilne z Flex, co podsumowano w poniższej tabeli. Znacznik wyboru wskazuje zgodność, a X oznacza niezgodność.
66
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Typ i generacja urządzenia Moduł podgrzewacza-wytrząsacza GEN1 Moduł magnetyczny GEN1 Moduł magnetyczny GEN2 Blok magnetyczny GEN1 Moduł temperaturowy GEN1 Moduł temperaturowy GEN2 Moduł termocyklera GEN1 Moduł termocyklera GEN2 Moduł HEPA
OT-2
Przewód
×
×
×
×
×
×
4.2 System caddy modułów
Kompatybilne moduły zaprojektowano tak, aby pasowały do pojemników zajmujących miejsce pod pokładem. System ten pozwala na umieszczenie akcesoriów laboratoryjnych znajdujących się na modułach bliżej powierzchni platformy, a także umożliwia prowadzenie kabli pod platformą, dzięki czemu na platformie pozostaje porządek podczas wykonywania protokołów.
Pojemniki na moduły podgrzewacza, wytrząsarki, temperatury i termocyklera.
OPENTRON FLEX
67
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Aby dopasować moduł do powierzchni pokładu, należy go najpierw umieścić w odpowiednim pojemniku na moduł. Każdy typ kompatybilnego modułu ma swój własny projekt uchwytu, który precyzyjnie dopasowuje moduł i akcesoria laboratoryjne do otaczającego blatu. (Wyjątkiem jest blok magnetyczny, który nie wymaga zasilania ani prowadzenia kabla USB i dlatego jest umieszczany bezpośrednio na powierzchni pokładu.) Caddies na moduły zajmujące jedno miejsce można umieścić w dowolnym miejscu w kolumnie 1 lub 3; Termocykler można umieścić tylko w gniazdach A1 i B1 jednocześnie.
Ogólnie rzecz biorąc, aby zainstalować caddy modułu:
1. Usuń wszystkie szczeliny w talii z miejsca, w którym ma zostać umieszczony moduł. 2. Umieść moduł w uchwycie i dokręć jego mocowania. 3. Poprowadź kable zasilania modułu i USB przez boczne pokrywy, w górę przez puste gniazdo w urządzeniu i
przymocuj je do modułu. 4. Umieść oprawę modułu w gnieździe i przykręć ją na miejsce.
Dokładne instrukcje dotyczące instalacji można znaleźć w Skróconej instrukcji obsługi lub instrukcji obsługi konkretnego modułu. Połączenia kablowe i sposób mocowania do caddy różnią się w zależności od modułu.
4.3 Kalibracja modułu
Kiedy po raz pierwszy instalujesz moduł w Flex, musisz przeprowadzić automatyczną kalibrację pozycyjną. Proces ten jest podobny do kalibracji pozycyjnej instrumentów i zapewnia, że Flex przemieszcza się dokładnie w odpowiednie miejsca, co zapewnia optymalną wydajność protokołu. Podczas kalibracji Flex przesunie się do miejsc na adapterze kalibracji modułu, który wygląda podobnie do kwadratów kalibracyjnych będących częścią wyjmowanych gniazd w pokładzie.
Adaptery kalibracyjne do modułów wytrząsarki grzewczej, modułu temperatury i termocyklera.
Kalibracja modułu jest wymagana w przypadku wszystkich modułów instalowanych za pośrednictwem uchwytu: modułu nagrzewnicy-wytrząsarki, modułu temperatury i modułu termocyklera. Blok magnetyczny nie wymaga kalibracji i jest gotowy do użycia zaraz po umieszczeniu go na pokładzie.
68
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Kiedy kalibrować moduły
Flex automatycznie wyświetla monit o wykonanie kalibracji po podłączeniu i włączeniu modułu, który nie ma zapisanych żadnych danych kalibracyjnych. (Możesz odrzucić ten monit, ale nie będziesz mógł uruchamiać protokołów z modułem, dopóki go nie skalibrujesz.)
Po zakończeniu kalibracji Flex przechowuje dane kalibracyjne i numer seryjny modułu do wykorzystania w przyszłości. Flex nie wyświetli monitu o ponowną kalibrację, chyba że usuniesz dane kalibracyjne dla tego modułu w ustawieniach robota. Możesz swobodnie włączać i wyłączać moduł, a nawet przenosić go do innego gniazda w talii, bez konieczności ponownej kalibracji. Jeśli chcesz przeprowadzić ponowną kalibrację, możesz rozpocząć proces w dowolnym momencie z poziomu karty modułu w aplikacji Opentrons. (Ponowna kalibracja nie jest dostępna z poziomu ekranu dotykowego.)
Jak skalibrować moduły
Instrukcje wyświetlane na ekranie dotykowym lub w aplikacji Opentrons poprowadzą Cię przez procedurę kalibracji. Ogólnie rzecz biorąc, kroki są następujące:
1. Zbierz wymagany sprzęt, w tym adapter do kalibracji modułu i sondę do kalibracji pipety. 2. Umieść adapter kalibracyjny na powierzchni modułu i upewnij się, że jest całkowicie wypoziomowany.
Niektóre moduły mogą wymagać przymocowania adaptera do modułu. 3. Przymocuj sondę kalibracyjną do pipety. 4. Flex automatycznie dotknie określonych punktów adaptera kalibracyjnego i zapisze je
wartości kalibracyjnych do wykorzystania w przyszłości.
Po zakończeniu kalibracji i usunięciu adaptera i sondy moduł będzie gotowy do użycia w protokołach.
W każdej chwili możesz view i zarządzaj danymi kalibracji modułu w aplikacji Opentrons. Przejdź do Ustawień robota dla swojego Flex i kliknij zakładkę Kalibracja.
OPENTRON FLEX
69
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
4.4 Moduł nagrzewnicy-wstrząsacza GEN1
Funkcje podgrzewacza i wytrząsarki
OGRZEWANIE I WSTRZĄSANIE
Heater-Shaker zapewnia ogrzewanie na pokładzie i wytrząsanie orbitalne. Moduł można nagrzać do 95°C, przy następującej temperaturze profile:
Zakres temperatur: 37°C Dokładność temperatury: ±95°C przy 0.5°C Jednorodność temperatury: ±55°C przy 0.5°CRamp szybkość: 10°C/min
Moduł może potrząsnąć samples od 200 do 3000 obr/min, z następującym stopniem wytrząsaniafile:
Średnica orbity: 2.0 mm Kierunek orbity: zgodnie z ruchem wskazówek zegara Zakres prędkości: 200 obr/min Dokładność prędkości: ±3000 obr/min
Moduł posiada zasilany zatrzask do mocowania akcesoriów laboratoryjnych, służący do mocowania płytek do modułu przed wytrząsaniem.
70
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
ADAPTERY TERMICZNE Do dodania akcesoriów laboratoryjnych do podgrzewacza-wytrząsarki wymagany jest kompatybilny adapter termiczny. Adaptery można kupić bezpośrednio w firmie Opentrons pod adresem https://shop.opentrons.com. Obecnie dostępne adaptery termiczne obejmują:
Uniwersalny adapter płaski
Adapter PCR
Adapter studni głębinowych
Adapter z płaską dolną częścią 96
KONTROLA OPROGRAMOWANIA
Heater-Shaker jest w pełni programowalny w Protocol Designer i API protokołu Python. Interfejs API Pythona dodatkowo umożliwia równoległe wykonywanie innych kroków protokołu, gdy aktywny jest Heater-Shaker. Aby uzyskać szczegółowe informacje na temat dodawania kroków równoległych do protokołów, zobacz Polecenia nieblokujące w dokumentacji API.
Poza protokołami aplikacja Opentrons może wyświetlać aktualny stan podgrzewacza-wytrząsarki i może bezpośrednio sterować podgrzewaczem, wytrząsarką i zatrzaskiem akcesoriów laboratoryjnych.
OPENTRON FLEX
71
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Specyfikacje podgrzewacza i wytrząsarki
Wymiary Waga Wejście zasilania modułu Wejście zasilacza Objętość zasilania sieciowegotage fluktuacja Overvoltage Pobór mocy
152 × 90 × 82 mm (dł./szer./wys.) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategoria II Bezczynność: 10 W
Typowo: Wytrząsanie: 4 W Ogrzewanie: 11 W Ogrzewanie i wytrząsanie: 10 W
Warunki środowiskowe Temperatura otoczenia Wilgotność względna Wysokość Wysokość Stopień zanieczyszczenia
Maksymalnie: 125 W Tylko do użytku w pomieszczeniach 130 °C Do 20%, bez kondensacji Do 25 m nad poziomem morza 80
72
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
4.5 Blok magnetyczny GEN1
Funkcje bloku magnetycznego
Blok magnetyczny Opentrons GEN1 to magnetyczny uchwyt na 96-dołkowe płytki. Bloki magnetyczne są stosowane w protokołach, które opierają się na magnetyzmie w celu wyciągnięcia cząstek z zawiesiny i zatrzymania ich w płytkach podczas przemywania, płukania lub innych procedur elucji. Na przykładample, automatyczne przygotowanie NGS; oczyszczanie genomowego i mitochondrialnego DNA, RNA lub białek; i inne procedury ekstrakcji to przypadki użycia, które mogą obejmować bloki magnetyczne.
KOMPONENTY MAGNETYCZNE
Blok magnetyczny nie jest zasilany, nie zawiera żadnych elementów elektronicznych i nie przesuwa kulek magnetycznych w górę ani w dół w roztworze. Dołki składają się z 96 neodymowych magnesów pierścieniowych o wysokiej wytrzymałości, przymocowanych do łoża obciążonego sprężyną, co pomaga zachować tolerancje pomiędzy blokiem a pipetami podczas wykonywania zautomatyzowanych protokołów.
KONTROLA OPROGRAMOWANIA
Blok magnetyczny GEN1 jest w pełni programowalny w Protocol Designer i API protokołu Python.
OPENTRON FLEX
73
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Jednak poza protokołami ekran dotykowy i aplikacja Opentrons nie rozpoznają aktualnego stanu bloku magnetycznego GEN1 i nie mogą go wyświetlić. Jest to moduł bez zasilania. Nie zawiera elementów elektronicznych ani mechanicznych, które mogłyby komunikować się z robotem Flex. „Kontrolujesz” blok magnetyczny za pomocą protokołów wykorzystujących chwytak Opentrons Flex Gripper do dodawania i usuwania akcesoriów laboratoryjnych z tego modułu.
Specyfikacje bloku magnetycznego
Wymiary Waga Moc modułu Stopień magnesu Warunki środowiskowe Temperatura otoczenia Wilgotność względna Wysokość Wysokość Stopień zanieczyszczenia
136 × 94 × 45 mm (dł./szer./wys.) 1.13 kg Brak, moduł nie jest zasilany Neodym N52 Tylko do użytku w pomieszczeniach 20 °C 25%, bez kondensacji Do 30 m nad poziomem morza 80
74
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
4.6 Moduł temperaturowy GEN2
Funkcje modułu temperatury
OCIEPLANIE I OCHŁADZANIE
Moduł temperaturowy Opentrons GEN2 to moduł gorącej i zimnej płyty. Jest często używany w protokołach wymagających ogrzewania, chłodzenia lub zmian temperatury. Moduł może osiągnąć i utrzymać temperaturę w zakresie od 4°C do 95°C w ciągu kilku minut, w zależności od konfiguracji i zawartości modułu.
BLOKI TERMICZNE
Aby utrzymać temperaturę naczyń laboratoryjnych, moduł wykorzystuje aluminiowe bloki termiczne. Moduł jest wyposażony w bloki termiczne 24-dołkowe i 96-dołkowe. Caddy modułu temperatury jest wyposażony w blok głębokiej studni i blok z płaskim dnem, przeznaczone do użytku z chwytakiem Flex. Bloki mieszczą probówki 1.5 mL i 2.0 mL, 96-dołkowe płytki do PCR, paski do PCR, płytki z głębokimi dołkami i płytki z płaskim dnem.
OPENTRON FLEX
75
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Uwaga: moduł jest również dostarczany z blokiem z płaskim dnem dla OT-2. Nie używaj bloku OT-2 z Flex. Blok z płaskim dnem dla Flex ma na górnej powierzchni napis „Opentrons Flex”. Ten dla OT-2 nie.
24-dołkowy blok termiczny
96-dołkowy blok termiczny
Blok termiczny ze studni głębinowej
Blok termiczny z płaskim dnem dla Flex
ŁAŹNIE WODNE I OGRZEWANIE
Ponieważ powietrze jest dobrym izolatorem termicznym, szczeliny między sprzętem laboratoryjnym a blokiem termicznym mogą mieć wpływ na zachowanie modułu temperaturowego w funkcji czasu i temperatury. Umieszczenie niewielkiej ilości wody w 24- lub 96-studzienkowych blokach termicznych eliminuje szczeliny powietrzne i poprawia efektywność ogrzewania. Idealna ilość wody zależy od bloku termicznego i akcesoriów laboratoryjnych. Dalsze zalecenia można znaleźć w białej księdze dotyczącej modułu temperatury.
KONTROLA OPROGRAMOWANIA
Moduł temperaturowy jest w pełni programowalny w Protocol Designer i API protokołu Python.
Poza protokołami aplikacja Opentrons może wyświetlać aktualny stan modułu temperatury i może bezpośrednio kontrolować temperaturę płyty powierzchniowej.
76
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Specyfikacje modułu temperaturowego
Wymiary Waga Moc modułu
Warunki środowiskowe Temperatura otoczenia Wilgotność względna Wysokość Wysokość Stopień zanieczyszczenia
194 × 90 × 84 mm (dł./szer./wys.) 1.5 kg Wejście: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Wyjście: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks. Tylko do użytku w pomieszczeniach <219.6°C (zalecane w celu zapewnienia optymalnego chłodzenia ) Do 22%, bez kondensacji Do 60 m nad poziomem morza 2000
4.7 Moduł termocyklera GEN2
OPENTRON FLEX
77
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Funkcje termocyklera
Moduł termocyklera Opentrons GEN2 to w pełni zautomatyzowany termocykler pokładowy, umożliwiający PCR bez użycia rąk w formacie płytki z 96 dołkami. Podgrzewana pokrywa i jednorazowa uszczelka ściśle przylegają do talerza, zapewniając wydajne czyszczenieample ogrzewanie i minimalne parowanie.
OGRZEWANIE I CHŁODZENIE Blok termocyklera może ogrzewać i chłodzić, a jego pokrywa może nagrzewać się w następującej temperaturze:file: Zakres temperatur bloku termicznego: 4 °C Maksymalne ogrzewanie bloku termicznego ramp szybkość: 4.25°C/s od otoczenia GEN2 do 95°C Maksymalne chłodzenie bloku termicznego ramp szybkość: 2.0°C/s od 95°C do otoczenia Zakres temperatury pokrywy: 37°C Dokładność temperatury pokrywy: ±110°C Automatyczną pokrywę można otwierać lub zamykać w zależności od potrzeb podczas wykonywania protokołu.
TERMOCYKLER PROFILES Termocykler może wykonać profiles: automatyczne przełączanie sekwencji temperatur bloku w celu przeprowadzenia reakcji wrażliwych na ciepło.
GUMOWE USZCZELKI AUTOMATYKI Termocykler jest wyposażony w gumowe uszczelki automatyki, które pomagają zredukować parowanie. Każdą uszczelkę należy wysterylizować przed użyciem i można ją wykorzystać w kilku seriach. Dodatkowe uszczelki można kupić bezpośrednio w firmie Opentrons pod adresem https://shop.opentrons.com.
KONTROLA OPROGRAMOWANIA Termocykler jest w pełni programowalny w Protocol Designer i API protokołu Python. Poza protokołami aplikacja Opentrons może wyświetlać aktualny stan termocyklera i może bezpośrednio kontrolować temperaturę bloku, temperaturę pokrywy i położenie pokrywy.
78
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 4: MODUŁY
Specyfikacje termocyklera
Wymiary (otwarta pokrywa) Wymiary (zamknięta pokrywa) Waga (łącznie z tylnym kanałem) Zasilacz pojtage Prąd zasilacza Overvoltage Warunki środowiskowe Temperatura otoczenia Wilgotność względna Wysokość Wysokość Wymagania dotyczące wentylacji
244.95 × 172 × 310.1 mm (dł./szer./wys.) 244.95 × 172 × 170.35 mm (dł./szer./wys.) 8.4 kg 100 V przy 240/50 Hz 60 A Kategoria II Tylko do użytku w pomieszczeniach 8.5°C (idealnie); 5°C (akceptowalna) 20%, bez kondensacji Do 25 m nad poziomem morza Co najmniej 2 cm / 40 pomiędzy urządzeniem a ścianą
OPENTRON FLEX
79
ROZDZIAŁ 5
Sprzęt laboratoryjny
W tym rozdziale opisano elementy biblioteki Opentrons Labware Library, których można używać z Opentrons Flex i Opentrons Flex Gripper. Obejmuje również niestandardowe wyposażenie laboratoryjne, a dla naszych zaawansowanych użytkowników łączy komponenty sprzętu laboratoryjnego z odpowiadającym im kodem JSON file definicje.
Sprzęt laboratoryjny można kupić od producentów oryginalnego sprzętu lub w sklepie Opentrons pod adresem https://shop.opentrons.com. Opentrons zawsze pracuje nad weryfikacją nowych definicji sprzętu laboratoryjnego. Najnowsze wykazy można znaleźć w Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych (link powyżej).
5.1 Koncepcje sprzętu laboratoryjnego
Sprzęt laboratoryjny to coś więcej niż tylko przedmioty umieszczane na pokładzie i wykorzystywane w protokole. Aby pomóc Ci zrozumieć sprzęt laboratoryjny Opentrons, przeanalizujmy ten temat z trzech różnych perspektyw. W przypadku Opentrons Flex wyposażenie laboratoryjne obejmuje elementy z naszej biblioteki akcesoriów laboratoryjnych, dane definiujące każdy element wyposażenia laboratoryjnego oraz niestandardowe wyposażenie laboratoryjne.
Sprzęt laboratoryjny jako sprzęt
Biblioteka Labware zawiera wszystko, czego można domyślnie używać w Opentrons Flex. Są to trwałe komponenty i materiały eksploatacyjne, z którymi pracujesz, wykorzystujesz je ponownie lub wyrzucasz podczas wykonywania protokołu. Aby pracować z elementami w Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych, nie trzeba podejmować żadnych specjalnych kroków. Robot Flex wie, jak automatycznie pracować ze wszystkim w bibliotece.
Sprzęt laboratoryjny jako dane
Informacje o sprzęcie laboratoryjnym są przechowywane w notacji obiektowej JavaScript (JSON) files z .json file rozszerzenia. JSON file obejmuje wymiary przestrzenne (długość, szerokość, wysokość), pojemność objętościową (L, ml) i inne metryki definiujące cechy powierzchni, ich kształty i położenie. Podczas uruchamiania protokołu Flex odczytuje te pliki .json filemusimy wiedzieć, jakie przybory laboratoryjne znajdują się na pokładzie i jak z nimi pracować.
80
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Niestandardowe przybory laboratoryjne
Niestandardowe akcesoria laboratoryjne to akcesoria, które nie są zawarte w Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych lub są akcesoriami stworzonymi przez Kreatora niestandardowych akcesoriów laboratoryjnych. Czasami jednak pomysł niestandardowego sprzętu laboratoryjnego jest obarczony pojęciami złożoności, kosztów lub trudności. Jednak niestandardowe przybory laboratoryjne nie powinny być trudne do zrozumienia ani stworzenia. Poświęćmy chwilę na rozwinięcie koncepcji niestandardowego sprzętu laboratoryjnego.
Jako byłyample, biblioteka Opentrons Labware Library zawiera 96-dołkowe płytki (200 l) firm Corning i BioRad, ale inni producenci również produkują te płytki. A dzięki powszechnie przyjętym standardom branżowym różnice między tymi wszechobecnymi urządzeniami laboratoryjnymi są niewielkie. Jednakże zwykła płytka o pojemności 200 l i 96 dołkach firmy Stellar Scientific, Oxford Lab lub Krackeler Scientific (lub dowolnego innego dostawcy) jest „niestandardowym sprzętem laboratoryjnym” dla Flex, ponieważ nie jest wstępnie zdefiniowana w naszej Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych . Ponadto drobne różnice w wymiarach akcesoriów laboratoryjnych mogą mieć drastyczny wpływ na powodzenie przebiegu protokołu. Z tego powodu ważne jest, aby mieć dokładną definicję każdego sprzętu laboratoryjnego, którego chcesz używać w swoim protokole.
Ponadto, chociaż niestandardowe akcesoria laboratoryjne mogą być ezoterycznym, jednorazowym elementem zestawu, w większości przypadków są to tylko końcówki, płytki, probówki i statywy używane codziennie w laboratoriach na całym świecie. Ponownie, jedyną różnicą między sprzętem laboratoryjnym Opentron a sprzętem laboratoryjnym niestandardowym jest to, że nowy element nie jest wstępnie zdefiniowany w oprogramowaniu zasilającym robota. Flex może i współpracuje z innymi podstawowymi elementami wyposażenia laboratoryjnego lub czymś wyjątkowym, ale należy zapisać charakterystykę tego elementu w definicji sprzętu laboratoryjnego w formacie JSON file i zaimportuj te dane do aplikacji Opentrons. Aby uzyskać więcej informacji, zobacz sekcję Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego poniżej.
Podsumowując, sprzęt laboratoryjny obejmuje:
Wszystko w bibliotece Opentrons Labware Library. Definicje sprzętu laboratoryjnego: dane w formacie JSON file który określa kształty, rozmiary i możliwości poszczególnych elementów
jak płytki dołkowe, końcówki, zbiorniki itp. Niestandardowe akcesoria laboratoryjne, które nie są zawarte w Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych.
Po ponownymviewBiorąc pod uwagę te ważne pojęcia, przyjrzyjmy się kategoriom i elementom w bibliotece Opentrons Labware Library. Potem zakończymy rozdział dokończeniemview komponentów danych sprzętu laboratoryjnego file i podsumuj funkcje i usługi Opentrons, które pomogą Ci stworzyć niestandardowy sprzęt laboratoryjny.
OPENTRON FLEX
81
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
5.2 Zbiorniki
Opentrons Flex domyślnie współpracuje ze zbiornikami jedno- i wielostudzienkowymi wymienionymi poniżej. Korzystanie z tych zbiorników pomaga zmniejszyć obciążenie pracą przygotowawczą, ponieważ są one gotowe do automatyzacji od razu po wyjęciu z pudełka. Informacje o zbiornikach są również dostępne w bibliotece Opentrons Labware Library.
Zbiorniki jednostudzienkowe
Specyfikacje producenta
Złośliwy
Dno 290 mL V
Aksygen
90 mL Płaskie dno
GNIAZDO
195 mL Płaskie dno
Dno 290 mL V
Nazwa ładowania interfejsu API
agilient_1_ zbiornik_290ml
axygen_1_ zbiornik_90ml
gniazdo_1_ zbiornik_195ml
gniazdo_1_ zbiornik_290ml
Zbiorniki wielostudzienkowe
Specyfikacje producenta
GNIAZDO
12 dołków 15 mL/dołek V na dole
USA Naukowe
12 dołków 22 mL/dołek V na dole
Nazwa obciążenia API gniazdo_12_ zbiornik_15ml
usascientific_12_ zbiornik_22ml
82
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Zbiorniki i definicje API
Biblioteka Opentrons Labware Library definiuje charakterystykę zbiorników wymienionych powyżej w osobnym formacie JSON fileS. Robot i interfejs API Opentrons Python korzystają z tych definicji JSON, aby współpracować ze sprzętem laboratoryjnym używanym przez Twoje protokoły. Na przykładample podczas pracy z interfejsem API funkcja ProtocolContext.load_labware akceptuje nazwy tych akcesoriów jako prawidłowe parametry w kodzie. Połączone nazwy obciążeń API łączą się z definicjami sprzętu laboratoryjnego w repozytorium Opentrons GitHub.
Niestandardowe wyposażenie laboratoryjne zbiornika
Spróbuj utworzyć niestandardową definicję sprzętu laboratoryjnego za pomocą narzędzia Opentrons Labware Creator, jeśli zbiornika, którego chcesz użyć, nie ma na liście. Definicja niestandardowa łączy wszystkie wymiary, metadane, kształty, pojemność wolumetryczną i inne informacje w formacie JSON file. Opentrons Flex potrzebuje tych informacji, aby zrozumieć, jak pracować z niestandardowym sprzętem laboratoryjnym. Aby uzyskać więcej informacji, zobacz sekcję Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego.
5.3 Dołkowe płytki
Opentrons Flex domyślnie współpracuje z płytkami dołkowymi wymienionymi poniżej. Korzystanie z tych płytek dołkowych pomaga zmniejszyć obciążenie pracą przygotowawczą, ponieważ są one gotowe do automatyzacji od razu po wyjęciu z pudełka. Informacje o płytkach dołkowych są także dostępne w bibliotece Opentrons Labware Library.
OPENTRON FLEX
83
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Płytki 6-dołkowe
Producent Corning
Specyfikacje
6 dołków 16.8 ml/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
Nazwa obciążenia API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
Płytki 12-dołkowe
Producent Corning
Specyfikacje
12 dołków 6.9 ml/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
Nazwa obciążenia API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
Płytki 24-dołkowe
Producent Corning
Specyfikacje
24 dołków 3.4 ml/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
Nazwa obciążenia API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
Płytki 48-dołkowe
Producent Corning
Specyfikacje
48 dołków 1.6 ml/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
Nazwa obciążenia API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Płytki 96-dołkowe
Producent Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Naukowe
Specyfikacje
96 dołków 200 µl/dołek Dołki okrągłe, dno V
96 dołków 360 µl/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
96 dołków 100 µl/dołek Dołki okrągłe, pełne dno PCR w kształcie litery V
96 dołków 200 µl/dołek Dołki okrągłe, płaskie dno
96 głębokich dołków 2000 µl/dołek Kwadratowe dołki, dno V
Wytrzymałe 96 dołków 200 µl/dołek Dołki okrągłe, pełna spódnica PCR z dnem V
Nunc 96 głębokich dołków 1300 µl/dołek Dołki okrągłe, dno w kształcie litery U
Nunc 96 głębokich dołków 2000 µl/dołek Dołki okrągłe, dno w kształcie litery U
96 głębokich dołków 2.4 ml/dołek Kwadratowe dołki, dno w kształcie litery U
Nazwa obciążenia API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
gniazdo_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
gniazdo_96_wellplate_200ul_flat
gniazdo_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ spódnica
termonaukowanunc_96_wellplate_ 1300ul termonaukowanunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRON FLEX
85
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Płytki 384-dołkowe
Producent Applied Biosystems Bio-Rad
Kornwalia
Specyfikacje
384 dołków 40 µl/dołek Dołki okrągłe, dno V
384 dołków 50 µl/dołek Dołki okrągłe, dno V
384 dołki 112 µl/dołek Kwadratowe dołki, płaskie dno
Nazwa ładowania API Applybiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Cóż, adaptery do płytek
Wymienione poniżej płyty aluminiowe to adaptery termiczne dla modułu Opentrons Heater-Shaker GEN1. Możesz użyć tych samodzielnych definicji adapterów, aby załadować zweryfikowane lub niestandardowe wyposażenie laboratoryjne Opentrons na wytrząsarkę Heater-Shaker.
Typ adaptera Opentrons Uniwersalny płaski adapter do podgrzewacza i wytrząsarki Opentrons 96 PCR Adapter do podgrzewacza i wytrząsarki Opentrons 96 Deep Well Adapter do podgrzewacza i wytrząsarki Opentrons 96 Adapter do podgrzewacza i wytrząsarki z płaskim dnem
Nazwa ładowania API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Można także załadować adapter i akcesoria laboratoryjne w ramach jednej definicji. Nasza biblioteka akcesoriów laboratoryjnych zawiera kilka wstępnie skonfigurowanych kombinacji adapterów termicznych i akcesoriów laboratoryjnych, dzięki którym podgrzewacz-wytrząsarka jest gotowa do użycia od razu po wyjęciu z pudełka.
86
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Uwaga: Nie używaj definicji łączonej, jeśli podczas protokołu musisz przenosić sprzęt laboratoryjny na podgrzewacz-wytrząsarkę lub z niej, czy to za pomocą chwytaka, czy ręcznie. Zamiast tego użyj definicji adaptera autonomicznego.
Połączenie adaptera i sprzętu laboratoryjnego
Nazwa ładowania interfejsu API
Adapter do podgrzewacza i wytrząsarki do głębokich dołków Opentrons 96 z płytką do głębokich dołków NEST 2 mL
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Adapter wytrząsarki z płaskim dnem Opentrons 96 i płytką NEST 96-dołkową 200 µL, płaska
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Adapter do podgrzewacza i wytrząsarki Opentrons 96 z płytką dołkową NEST 100 µl
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Uniwersalny adapter płaski podgrzewacz-wytrząsarka Opentrons z płytką Corning 384 Well Plate 112 µL płaska
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adaptery można kupić bezpośrednio w firmie Opentrons pod adresem https://shop.opentrons.com.
Płytki studniowe i definicje API
Biblioteka Opentrons Labware Library definiuje charakterystykę płytek dołkowych wymienionych powyżej w osobnym formacie JSON fileS. Robot Flex i interfejs API Opentrons Python korzystają z tych definicji JSON, aby współpracować ze sprzętem laboratoryjnym używanym przez Twoje protokoły. Na przykładample podczas pracy z interfejsem API funkcja ProtocolContext.load_labware akceptuje nazwy tych akcesoriów jako prawidłowe parametry w kodzie. Połączone nazwy obciążeń API łączą się z definicjami akcesoriów laboratoryjnych płytek dołkowych w repozytorium Opentrons GitHub.
Niestandardowe wyposażenie laboratoryjne płytek dołkowych
Spróbuj użyć narzędzia Opentrons Labware Creator, aby utworzyć niestandardową definicję sprzętu laboratoryjnego, jeśli płytki dołkowej, której chcesz użyć, nie ma na liście. Definicja niestandardowa łączy wszystkie wymiary, metadane, kształty, pojemność wolumetryczną i inne informacje w formacie JSON file. Opentrons Flex odczytuje te informacje, aby zrozumieć, jak pracować z niestandardowym sprzętem laboratoryjnym. Aby uzyskać więcej informacji, zobacz sekcję Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego.
OPENTRON FLEX
87
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
5.4 Napiwki i stojaki na końcówki
Końcówki Opentrons Flex są dostępne w rozmiarach 50 µL, 200 µL i 1000 µL. Są to przezroczyste, nieprzewodzące końcówki polipropylenowe, dostępne z filtrami lub bez. Są pakowane w sterylnych stojakach mieszczących 96 końcówek i nie zawierają DNazy, RNazy, proteazy, pirogenów, ludzkiego DNA, endotoksyn i inhibitorów PCR. Na stojakach znajdują się również numery partii i daty ważności.
Końcówki do pipet Flex współpracują z pipetami Opentrons Flex 50 µL i 1000 µL w konfiguracjach 1-, 8- i 96-kanałowych. Chociaż do pipet 50 l i 1000 l można założyć dowolną końcówkę Flex, należy spróbować dopasować końcówkę do pojemności znamionowej pipety. Na przykładample, dziwne może być umieszczenie końcówki 1000 l na pipecie 50 l. W przypadku pipety 1000 l z pewnością można zastosować końcówkę 50 l, 200 l lub 1000 l.
Stojaki na napiwki
Końcówki niefiltrowane i filtrowane są pakowane w stojak składający się z płyty podstawy wielokrotnego użytku, płytki środkowej mieszczącej 96 końcówek oraz pokrywy.
Statyw na końcówki według objętości 50 µl 200 µl 1000 µl
Nazwa ładowania interfejsu API
Niefiltrowane: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrowane: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Niefiltrowane: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrowane: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Niefiltrowane: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrowane: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Aby ułatwić identyfikację, środkowe płytki stojaków na końcówki są oznaczone kolorami w zależności od rozmiaru końcówek:
50 µL: magenta 200 L: żółty 1000 µL: niebieski
88
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Przy zamawianiu lub ponownym zamawianiu końcówki i stojaki są dostępne w dwóch różnych konfiguracjach:
Statywy: Składają się z oddzielnie owiniętych w folię termokurczliwą stojaków na końcówki (płyta podstawowa, płyta środkowa z końcówkami i pokrywa). Konfiguracje stojakowe sprawdzają się najlepiej, gdy czystość jest najważniejsza, aby uniknąć skażenia krzyżowego lub gdy protokoły nie pozwalają na ponowne użycie płyty podstawowej lub komponentu.
Uzupełnienia: Składają się z jednego kompletnego stojaka na końcówki (płyta podstawowa, płyta środkowa z końcówkami i pokrywa) oraz pojedynczych pojemników na końcówki. Konfiguracje uzupełniania są najlepsze, gdy protokoły pozwalają na ponowne użycie płyty podstawowej lub komponentu.
Kompatybilność z tippipetą
Końcówki do pipet Flex są przeznaczone do pipet Opentrons Flex. Końcówki Flex nie są wstecznie kompatybilne z pipetami Opentrons OT-2, nie można też używać końcówek OT-2 w pipetach Flex.
Z pipetami Flex mogą współpracować inne końcówki zgodne ze standardami branżowymi, ale nie jest to zalecane. Aby zapewnić optymalną wydajność, z pipetami Flex należy używać wyłącznie końcówek Opentrons Flex.
Adapter stojaka na końcówki
Pipeta 96-kanałowa wymaga adaptera w celu prawidłowego zamocowania pełnego stojaka z końcówkami. Podczas mocowania pipeta przesuwa się nad adapterem, opuszcza się na kołki montażowe i naciąga końcówki na pipety, podnosząc adapter i stojak na końcówki.
OPENTRON FLEX
89
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Uwaga: Adaptera stojaka na końcówki należy używać wyłącznie w przypadku jednoczesnego pobierania pełnego stojaka z końcówkami. Jeśli zbierasz mniej końcówek, umieść stojaki na końcówki bezpośrednio na pokładzie.
Ostrzeżenie: ryzyko uszczypnięcia. Podczas mocowania końcówek do pipet trzymaj ręce z dala od adaptera statywu na końcówki.
Typ adaptera Opentrons Flex 96 Adapter stojaka na końcówki
Nazwa ładowania API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Adapter statywu na końcówki jest kompatybilny z chwytakiem Opentrons Flex Gripper. Za pomocą chwytaka można umieścić stojaki na świeże końcówki na adapterze lub podnieść i przenieść zużyte statywy na końcówki do zsypu na odpady.
5.5 Probówki i stojaki na probówki
System Opentrons 4-w-1 Tube Rack domyślnie współpracuje z Opentrons Flex. Korzystanie ze stojaka na probówki 4 w 1 pomaga zmniejszyć obciążenie pracą przygotowawczą, ponieważ zapewniane przez niego kombinacje są gotowe do automatyzacji od razu po wyjęciu z pudełka. Więcej informacji można znaleźć także w bibliotece Opentrons Labware Library.
90
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Kombinacje rur i stojaków
Stojak na probówki 4 w 1 Opentrons obsługuje szeroką gamę rozmiarów probówek, pojedynczo lub w różnych kombinacjach wielkości (objętości). Należą do nich: Statyw na 6 probówek na probówki 50 mL (6 x 50 mL). Statyw kombinowany na 10 probówek na cztery probówki 50 mL i sześć probówek 15 mL (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). Statyw na 15 probówek na probówki 15 mL (15 x 15 mL). Statyw na 24 probówki na probówki 0.5 mL, 1.5 mL lub 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Uwaga: Wszystkie probówki są cylindryczne z dnami w kształcie litery V (stożkowymi), chyba że wskazano inaczej.
Stojaki na 6 probówek
Typ probówki 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
Stojaki na 10 probówek
Typ probówki 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL
Nazwa ładowania API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRON FLEX
91
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Stojaki na 15 probówek
Typ probówki 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
Nazwa ładowania API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
Stojaki na 24 probówek
Rodzaj tuby
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, spód w kształcie litery U 24 ogólne 2 mL zakrętka 24 NEST 0.5 mL zakrętka 24 NEST 1.5 mL zakrętka 24 NEST 1.5 mL zakrętka zatrzaskowa 24 NEST 2 mL zakrętka 24 NEST 2 mL zatrzaskiwana zatyczka, spód w kształcie litery U
Nazwa ładowania API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Definicje API stojaków na probówki
Biblioteka Opentrons Labware Library definiuje charakterystykę stojaków na probówki wymienionych powyżej w osobnym formacie JSON fileS. Robot Flex i interfejs API Opentrons Python korzystają z tych definicji JSON, aby współpracować ze sprzętem laboratoryjnym używanym przez Twoje protokoły. Na przykładample podczas pracy z interfejsem API funkcja ProtocolContext.load_labware akceptuje nazwy tych akcesoriów jako prawidłowe parametry w kodzie. Połączone nazwy obciążeń API łączą się z definicjami sprzętu laboratoryjnego w stojaku na probówki w repozytorium Opentrons GitHub.
92
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Niestandardowe wyposażenie laboratoryjne do stojaków na probówki
Spróbuj utworzyć niestandardową definicję sprzętu laboratoryjnego za pomocą narzędzia Opentrons Labware Creator, jeśli na liście nie ma kombinacji probówek i statywów, której chcesz użyć. Definicja niestandardowa łączy wszystkie wymiary, metadane, kształty, pojemność wolumetryczną i inne informacje w formacie JSON file. Opentrons Flex odczytuje te informacje, aby zrozumieć, jak pracować z niestandardowym sprzętem laboratoryjnym. Aby uzyskać więcej informacji, zobacz sekcję Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego.
5.6 Bloki aluminiowe
Bloki aluminiowe są dostarczane z modułem temperaturowym GEN2 i można je kupić osobno w zestawie trzyczęściowym. Zestaw zawiera płytkę z płaskim dnem, blok 24-dołkowy i blok 96-dołkowy.
Opentrons Flex wykorzystuje aluminiowe bloki do przechowywania sample probówki i płytki studzienek na module temperaturowym lub bezpośrednio na pokładzie. W połączeniu z modułem temperaturowym aluminiowe bloki mogą utrzymać Twoje daneampprobówki, paski do PCR lub płytki w stałej temperaturze od 4°C do 95°C.
Płaska płyta dolna
Płaska płyta dolna dla Flex jest dostarczana z uchwytem modułu temperatury i jest kompatybilna z różnymi płytkami dołkowymi zgodnymi ze standardami ANSI/SLAS. Ta płaska płyta różni się od płyty dostarczanej z samym modułem temperaturowym lub oddzielnym trzyczęściowym zestawem. Posiada szerszą powierzchnię roboczą i ścięte klipsy narożne. Funkcje te pomagają poprawić wydajność chwytaka Opentrons Flex Gripper podczas przenoszenia akcesoriów laboratoryjnych na płytkę lub z niej.
Możesz rozpoznać, którą płytkę z płaskim dnem posiadasz, ponieważ płyta przeznaczona do Flex ma na górnej powierzchni napis „Opentrons Flex”. Ten dla OT-2 nie.
OPENTRON FLEX
93
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
24-dołkowy blok aluminiowy
Blok 24-dołkowy jest używany z indywidualnymi sampfiolki. Na przykładample, akceptuje sampfiolki, które:
Mają dno w kształcie litery V lub U. Zabezpiecz zawartość za pomocą zatrzasków lub zakrętek. Trzymaj płyn w pojemnościach 0.5 mL, 1.5 mL i 2 mL.
96-dołkowy blok aluminiowy
Blok 96-dołkowy obsługuje szeroką gamę typów płytek. Na przykładample, dobrze przyjmuje płytki, które są:
Od głównych producentów płytek dołkowych, takich jak Bio-Rad i NEST.
Zaprojektowane z dnem w kształcie litery V, dnem w kształcie litery U lub płaskim dnem.
Zaprojektowane z dołkami o pojemności 100 µl lub 200 µl.
Jest także kompatybilny z typowymi paskami PCR.
Samodzielne adaptery
Blok termiczny Płyta Flex z płaskim dnem 24-dołkowy blok aluminiowy 96-dołkowy blok aluminiowy
Nazwa obciążenia API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Zobacz kombinacje akcesoriów laboratoryjnych poniżej. opentrons_96_well_aluminum_block
Kombinacje akcesoriów laboratoryjnych z bloków aluminiowych
Biblioteka Opentrons Labware Library obsługuje następujące kombinacje bloków, fiolek i płytek dołkowych, które są również zdefiniowane w osobnej definicji sprzętu laboratoryjnego JSON fileS. Robot Flex i API Opentrons Python
94
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
polegaj na tych definicjach JSON, aby pracować ze sprzętem laboratoryjnym używanym przez Twoje protokoły. Na przykładample podczas pracy z interfejsem API funkcja ProtocolContext.load_labware akceptuje nazwy tych akcesoriów jako prawidłowe parametry w kodzie. Poniższe tabele zawierają domyślne kombinacje bloków/kontenerów i powiązane nazwy obciążeń API. Linki łączą się z odpowiednimi definicjami JSON w repozytorium Opentrons GitHub.
Uwaga: wszystkie probówki mają dna w kształcie litery V, chyba że wskazano inaczej.
Kombinacje akcesoriów laboratoryjnych z 24-dołkowymi blokami aluminiowymi
Zawartość bloku 24-dołkowego Generic 2 mL zakrętka NEST 0.5 mL zakrętka NEST 1.5 mL zakrętka NEST 1.5 mL zakrętka NEST 2 mL zakrętka NEST 2 mL zakrętka zatrzaskowa, spód w kształcie litery U
Nazwa ładowania API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_ gniazdo_2ml_snapcap
Kombinacje akcesoriów laboratoryjnych z 96-dołkowymi blokami aluminiowymi
Zawartość bloku 96-dołkowego Płytka dołkowa Bio-Rad 200 µl Pasek Generic PCR 200 µL Płytka dołkowa NEST 100 µL
Nazwa ładowania API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRON FLEX
95
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
5.7 Sprzęt laboratoryjny i chwytak Opentrons Flex
Chociaż Opentrons Flex współpracuje ze wszystkimi produktami znajdującymi się w Bibliotece akcesoriów laboratoryjnych, chwytak Opentrons Flex Gripper jest kompatybilny tylko z określonymi elementami sprzętu laboratoryjnego. Obecnie chwytak jest zoptymalizowany do użytku z następującymi akcesoriami laboratoryjnymi.
Kategoria sprzętu laboratoryjnego Płytki z głębokimi dołkami Płytki 96-dołkowe z pełnym obrzeżem
Statywy na końcówki (końcówki niefiltrowane i filtrowane)
Marki
Płytka z głębokimi dołkami NEST 96 2 mL
Opentrons Tough 96-dołkowa płytka 200 µl PCR z pełną osłoną NEST 96-dołkowa płytka 200 µl płaska
Statyw na końcówki Opentrons Flex 96 50 µl Statyw na końcówki Opentrons Flex 96 200 µL Statyw na końcówki Opentrons Flex 96 1000 µL
Uwaga: Aby uzyskać najlepsze wyniki, należy używać chwytaka Flex wyłącznie z akcesoriami wymienionymi powyżej. Flex Gripper może współpracować z innym sprzętem laboratoryjnym zgodnym z automatyzacją ANSI/SLAS, ale nie jest to zalecane.
5.8 Niestandardowe definicje sprzętu laboratoryjnego
Jak omówiono na początku tego rozdziału, niestandardowe wyposażenie laboratoryjne to wyposażenie laboratoryjne, którego nie ma na liście w Bibliotece sprzętu laboratoryjnego Opentrons. Z Flexem można używać innych popularnych lub unikalnych akcesoriów laboratoryjnych, dokładnie mierząc i rejestrując charakterystykę tego obiektu oraz zapisując te dane w formacie JSON file. Po zaimportowaniu do aplikacji Flex i interfejs API wykorzystują dane JSON do interakcji z akcesoriami laboratoryjnymi. Opentrons zapewnia narzędzia i usługi, które omówimy poniżej, aby pomóc Ci używać Flex z niestandardowym sprzętem laboratoryjnym.
96
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Tworzenie niestandardowych definicji akcesoriów laboratoryjnych
Narzędzia i usługi Opentrons pomagają zapewnić niestandardowy sprzęt laboratoryjny w zasięgu ręki. Funkcje te odpowiadają różnym poziomom umiejętności i sposobom pracy. Tworzenie własnego sprzętu laboratoryjnego i używanie go z Opentrons Flex sprawia, że robot staje się wszechstronnym i wydajnym dodatkiem do Twojego laboratorium.
KREATOR NIESTANDARDOWYCH AKCESORIÓW LABORATORYJNYCH
Kreator niestandardowych akcesoriów laboratoryjnych nie wymaga kodu, web-narzędzie, które wykorzystuje interfejs graficzny, aby pomóc w utworzeniu definicji sprzętu laboratoryjnego file. Labware Creator tworzy definicję sprzętu laboratoryjnego w formacie JSON file które importujesz do aplikacji Opentrons. Następnie niestandardowe akcesoria laboratoryjne będą dostępne dla robota Flex i interfejsu API języka Python.
SERWIS NIESTANDARDOWYCH SPRZĘTÓW LABORATORYJNYCH
Skontaktuj się z nami, jeśli akcesoria, których chcesz użyć, nie są dostępne w bibliotece, jeśli nie możesz utworzyć własnych definicji lub ponieważ niestandardowy element ma inne kształty, rozmiary lub inne nieregularności opisane poniżej.
Sprzęt laboratoryjny, który możesz zdefiniować w Labware Creator
; Studnie i probówki są jednolite i identyczne. ; Wszystkie rzędy są równomiernie rozmieszczone
(odstępy między rzędami są równe).
; Wszystkie kolumny są równomiernie rozmieszczone (odstępy między kolumnami są równe).
; Idealnie pasuje do jednego gniazda w talii.
Oprogramowanie Labware Opentrons musi zdefiniować; Kształty studni i rur są różne. ; Rzędy nie są równomiernie rozmieszczone.
; Kolumny nie są równomiernie rozmieszczone.
; Mniejsza niż jedno gniazdo w talii (wymaga adaptera) lub obejmuje wiele szczelin w talii.
OPENTRON FLEX
97
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
Oto kilka diagramów, które pomogą Ci zwizualizować byłegoamppliki opisane powyżej. Regularne Wszystkie kolumny są równomiernie rozmieszczone i wszystkie wiersze są równomiernie rozmieszczone. Kolumny nie muszą mieć takich samych odstępów jak wiersze.
Regularny Siatka nie musi znajdować się pośrodku akcesoriów laboratoryjnych.
Nieregularne Wiersze są równomiernie rozmieszczone, ale kolumny nie są równomiernie rozmieszczone.
Nieregularne Kolumny/wiersze są równomiernie rozmieszczone, ale dołki nie są identyczne.
Nieregularny Istnieje więcej niż jedna siatka.
Nasz zespół zajmujący się sprzętem laboratoryjnym będzie starał się zrozumieć Twoje potrzeby i zaprojektować dla Ciebie niestandardowe definicje sprzętu laboratoryjnego. Więcej informacji można znaleźć w artykułach pomocy „Żądanie definicji niestandardowego sprzętu laboratoryjnego” i „Formularz żądania niestandardowego sprzętu laboratoryjnego”. Jest to usługa płatna.
98
OPENTRON FLEX
ROZDZIAŁ 5: AKCESORIA LABORATORYJNE
API PYTHONA
Chociaż za pomocą naszego interfejsu API nie można tworzyć niestandardowych akcesoriów laboratoryjnych, można ich używać za pomocą dostępnych metod interfejsu API. Najpierw jednak musisz zdefiniować niestandardowe wyposażenie laboratoryjne i zaimportować je do aplikacji Opentrons. Po dodaniu sprzętu laboratoryjnego do aplikacji Opentrons staje się on dostępny dla interfejsu API języka Python i robota. Więcej informacji można znaleźć w sekcji Definicje niestandardowego sprzętu laboratoryjnego w dokumentacji interfejsu API języka Python. Aby uzyskać informacje na temat pisania skryptów protokołów za pomocą interfejsu API, zobacz sekcję API protokołu Python w rozdziale Rozwój protokołu.
Schemat sprzętu laboratoryjnego JSON
JSON file to projekt standardowego i niestandardowego sprzętu laboratoryjnego Opentrons. Ten file zawiera i organizuje dane sprzętu laboratoryjnego zgodnie ze specyfikacjami projektowymi określonymi w schemacie domyślnym.
Schemat jest ramą
Dokumenty / Zasoby
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source Robot do transportu cieczy [plik PDF] Instrukcja obsługi FLEX Opentrons Flex Open Source Robot do obsługi cieczy, FLEX, Opentrons Flex Open Source Robot do obsługi cieczy, Flex Open Source Robot do obsługi cieczy, Robot do obsługi cieczy typu open source, Source Robot do obsługi cieczy, Robot do obsługi cieczy, Robot do obsługi cieczy, Robot |