FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot
“
Opentrons Flex
Mga pagtutukoy:
- Pangkalahatang Pagtutukoy: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Mga Detalye ng Pangkapaligiran: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Mga Sertipikasyon: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Serial Number: XXX-XXXX-XXXX
Mga Tagubilin sa Paggamit ng Produkto:
1. Pag-install at Pag-calibrate ng Instrumento:
Sundin ang mga hakbang na nakabalangkas sa manwal para sa pipette at gripper
pag-install.
2. Relokasyon:
Para sa mga maikling galaw, sumangguni sa seksyon 2.5 sa manwal. Para sa
mga malayuang galaw, sundin ang mga alituntuning ibinigay. Pangkalahatang paglipat
magagamit din ang payo.
3. Mga Koneksyon:
Tiyakin ang wastong koneksyon ng kuryente gaya ng nakadetalye sa manual.
Ikonekta ang USB at mga auxiliary na device kung kinakailangan. Mga koneksyon sa network
dapat itatag kasunod ng mga tagubilin.
4. Protocol Designer:
Unawain ang mga kinakailangan para sa Protocol Designer at alamin kung paano
upang magdisenyo ng mga bagong protocol o baguhin ang mga dati nang ayon sa iyong lab
kinakailangan.
5. Python Protocol API:
Galugarin ang pagsusulat at pagpapatakbo ng mga script gamit ang Python Protocol API.
Tuklasin ang mga feature na eksklusibo sa Python para sa pinahusay na functionality.
6. Mga Protokol ng OT-2:
Alamin ang tungkol sa OT-2 Python protocol, OT-2 JSON protocol, at
Mga protocol ng Magnetic Module para sa iba't ibang uri ng mga eksperimento.
Mga Madalas Itanong (FAQ):
T: Paano ako mag-troubleshoot kung ang robot ay hindi gumagalaw bilang
inaasahan?
A: Suriin ang koneksyon ng kuryente, tiyakin ang wastong pagkakalibrate ng
mga instrumento, at i-verify na walang mga sagabal sa
landas ng robot.
T: Maaari ba akong gumamit ng mga custom na pipette sa Opentrons Flex?
A: Inirerekomenda ng Opentrons ang paggamit ng mga katugmang pipette para sa pinakamainam
pagganap at katumpakan.
“`
Opentrons Flex
Manwal ng Pagtuturo
Opentrons Labworks Inc.
Disyembre 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Ang mga rehistradong pangalan, trademark, atbp. na ginamit sa dokumentong ito, kahit na hindi partikular na minarkahan bilang ganoon, ay hindi dapat ituring na hindi protektado ng batas.
Talaan ng mga Nilalaman
Paunang Salita . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Istraktura ng manwal na ito. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Mga tala at babala. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Kabanata 1 Panimula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Maligayang pagdating sa Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Ano ang bago sa Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flex workstation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Impormasyong pangkaligtasan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Mga simbolo ng kaligtasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Mga babala sa kaligtasan ng elektrikal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Karagdagang mga babala sa kaligtasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Mga pag-iingat sa kaligtasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biyolohikal na kaligtasan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Nakakalason na usok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Nasusunog na likido . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Pagsunod sa regulasyon. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kaligtasan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Electromagnetic compatibility. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 mga babala at tala ng FCC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Pagsunod sa ISED ng Canada. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Babala sa kapaligiran . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi precertification . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Kabanata 2: Pag-install at Relokasyon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Mga kinakailangan sa kaligtasan at pagpapatakbo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Saan ilalagay ang Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Pagkonsumo ng kuryente. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Mga kondisyon sa kapaligiran. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Pag-unbox . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Pagsisikap at oras na kailangan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Crate at packing material. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Mga elemento ng produkto. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Bahagi 1: Alisin ang crate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Bahagi 2: Bitawan ang Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Bahagi 3: Pangwakas na pagpupulong at power on . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Unang pagtakbo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 I-on ang . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Kumonekta sa isang network o computer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Mag-install ng mga update sa software. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Ikabit ang Emergency Stop Pendant. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Bigyan ng pangalan ang iyong robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Pag-install at pagkakalibrate ng instrumento. . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pag-install ng pipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Pag-install ng gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Relokasyon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Maikling galaw. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Mga galaw na malayuan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Pangkalahatang nakakaganyak na payo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Mga huling pag-iisip tungkol sa paglipat. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Kabanata 3: Paglalarawan ng System. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Mga sangkap na pisikal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Frame at enclosure . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Deck at working area. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagsa lugar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Deck fixtures. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Basura chute. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagmga puwang ng lugar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sistema ng paggalaw. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Touchscreen at LED display . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Mga Pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Mga detalye ng pipette. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pag-calibrate ng pipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipette tip rack adapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Bahagyang tip pickup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Mga sensor ng pipette. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Mga update sa firmware ng pipette. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Mga detalye ng gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Pag-calibrate ng gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Mga update ng firmware ng Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Emergency Stop Pendant . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kailan gagamitin ang E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Pagsali at pagpapakawala ng E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Mga Koneksyon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Koneksyon ng kuryente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB at auxiliary na koneksyon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Mga koneksyon sa network . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Mga detalye ng system. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Pangkalahatang mga detalye. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Mga detalye ng kapaligiran. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Mga Sertipikasyon. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serial number . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Kabanata 4: Mga Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Mga suportadong module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Module caddy system. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Pag-calibrate ng module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kailan mag-calibrate ng mga module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Paano i-calibrate ang mga module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Heater-Shaker Module GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Mga tampok ng Heater-Shaker. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Mga detalye ng Heater-Shaker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetic Block GEN1. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Mga tampok na Magnetic Block. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Mga detalye ng Magnetic Block. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperatura Module GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Mga tampok ng Temperatura Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Mga detalye ng Temperature Module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Thermocycler Module GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Mga tampok ng Thermocycler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Mga detalye ng Thermocycler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Kabanata 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Mga konsepto ng Labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware bilang hardware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware bilang data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Custom labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Mga Reservoir . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Single-well reservoir . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Mga multi-well reservoir. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Mga reservoir at mga kahulugan ng API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Custom na reservoir labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Mga plato ng balon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-well plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-well plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-well plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-well plates. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-well plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-well plates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Well plate adapters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Well plates at mga kahulugan ng API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Custom well plate labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Mga tip at tip rack. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tip rack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tippipette compatibility . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Tip rack adapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Mga tubo at tube rack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Mga kumbinasyon ng tubo at rack. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6-tube rack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 10-tube rack. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15-tube rack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24-tube rack . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Mga kahulugan ng Tube rack API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Custom na tube rack labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Mga bloke ng aluminyo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Flat bottom plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-well aluminum block . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-well aluminum block . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Mga standalone na adapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Mga kumbinasyon ng labware na bloke ng aluminyo. . . . . . . . . . . . . . . .94 24-well aluminum block mga kumbinasyon ng labware . . . . . . . . .95 96-well aluminum block mga kumbinasyon ng labware . . . . . . . . .95 5.7 Labware at ang Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Pasadyang mga kahulugan ng labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Paglikha ng mga pasadyang kahulugan ng labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON labware schema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 mga kahulugan ng labware ng JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Kabanata 6: Pagbuo ng Protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Mga paunang ginawang protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protocol Library . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Serbisyo ng Custom Protocol Development . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protocol Designer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Mga kinakailangan ng Protocol Designer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Pagdidisenyo ng protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Pagbabago ng mga kasalukuyang protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Pagsusulat at pagpapatakbo ng mga script . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Mga tampok na eksklusibo sa Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 na mga protocol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python protocol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Mga protocol ng Magnetic Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Kabanata 7: Software at Operasyon. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Pagpapatakbo ng touchscreen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Robot dashboard . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Pamamahala ng protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Mga detalye ng protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Patakbuhin ang setup . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Pagsusuri ng Posisyon ng Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Patakbuhin ang progreso. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Pagkumpleto ng pagtakbo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Pamamahala ng instrumento. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Mga setting ng robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Configuration ng deck . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Pag-install ng app . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Paglilipat ng mga protocol sa Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Status at mga kontrol ng module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Kamakailang protocol na tumatakbo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Advanced na operasyon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Command-line na operasyon sa SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Kabanata 8: Pagpapanatili at Serbisyo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Paglilinis ng iyong Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Bago ka magsimula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Ano ang maaari mong linisin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Mga solusyon sa paglilinis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Paglilinis ng frame at window panel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Paglilinis ng kubyerta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Paglilinis ng gantry. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Paglilinis ng chute ng basura. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Paglilinis ng mga pipette at tip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pag-decontamination ng pipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Mga tip sa paglilinis ng pipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Paglilinis ng gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Paglilinis ng mga module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Pangkalahatang paglilinis ng module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler seal. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Labware na ligtas sa autoclave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Servicing Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Mga serbisyo ng Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kwalipikasyon sa pag-install at kwalipikasyon sa pagpapatakbo. . . 155 Preventative maintenance . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Warranty . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Appendix A: Glossary . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Appendix B: Karagdagang Dokumentasyon. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentasyon ng Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API reference. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentasyon ng developer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Appendix C: Open-Source Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons sa GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Iba pang mga repositoryo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Appendix D: Suporta at Impormasyon sa Pakikipag-ugnayan . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Benta. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Suporta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Impormasyon sa negosyo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Paunang Salita
Maligayang pagdating sa manual ng pagtuturo para sa Opentrons Flex liquid handling robot. Ginagabayan ka ng manual na ito sa halos lahat ng kailangan mong malaman para i-set up at gamitin ang Flex, na tumutuon sa mga paksang pinaka-nauugnay sa pang-araw-araw na mga gumagamit ng Flex sa isang kapaligiran sa lab.
Istruktura ng manwal na ito
Ang Opentrons Flex ay isang kumplikadong sistema, kaya maraming iba't ibang mga landas sa pag-aaral ng lahat ng magagawa nito. Huwag mag-atubiling pumunta nang diretso sa kabanata na tumutugon sa anumang paksang gusto mong malaman! Para kay exampOo, kung mayroon ka nang naka-set up na Flex sa iyong lab, maaari mong laktawan ang kabanata ng Pag-install at Relokasyon.
Kung mas gusto mo ang isang may gabay na diskarte, ang manwal na ito ay nakabalangkas upang masundan mo ito mula simula hanggang katapusan.
Alamin ang tungkol kay Flex. Ang mga natatanging tampok ng Flex ay nakalista sa Kabanata 1: Panimula. Kasama rin sa panimula ang mahalagang impormasyon sa kaligtasan at regulasyon.
Magsimula sa Flex. Kung kailangan mong i-set up ang iyong Flex, sundin ang mga detalyadong tagubilin sa Kabanata 2: Pag-install at Relokasyon. Pagkatapos ay gawing pamilyar ang iyong sarili sa mga bahagi ng Flex sa Kabanata 3: Paglalarawan ng System.
I-set up ang iyong deck. Ang pag-configure sa deck ay nagbibigay-daan sa iba't ibang siyentipikong aplikasyon sa Flex. Kabanata 4: Inilalarawan ng mga module ang mga peripheral ng Opentrons na maaari mong i-install sa o sa ibabaw ng deck upang magsagawa ng mga partikular na gawaing pang-agham. Kabanata 5: Ipinapaliwanag ng Labware kung paano gamitin ang kagamitan para sa paghawak ng mga likido.
Magpatakbo ng protocol. Ang pangunahing paggamit ng Flex ay nagpapatakbo ng mga pamantayang pang-agham na pamamaraan, na kilala bilang mga protocol. Kabanata 6: Ang Protocol Development ay nag-aalok ng ilang paraan para makakuha ng mga handa na protocol o magdisenyo ng mga ito sa iyong sarili. Upang patakbuhin ang iyong protocol, sundin ang mga tagubilin sa Kabanata 7: Software at Operasyon, na mayroon ding mga tagubilin para sa pagsasagawa ng iba pang mga gawain at pag-customize ng mga setting ng iyong robot.
Patuloy na tumakbo si Flex. Sundin ang payo sa Kabanata 8: Pagpapanatili at Serbisyo upang mapanatiling malinis at gumagana nang mahusay ang iyong Flex. O mag-sign up para sa isa sa mga serbisyo ng Opentrons na nakalista doon at hayaan kaming pangalagaan ang Flex para sa iyo.
Matuto pa. Kailangan pa ba ng iba? Kumonsulta sa mga apendise. Appendix A: Tinutukoy ng Glossary ang mga terminong nauugnay sa Flex. Appendix B: Itinuturo ka ng Karagdagang Dokumentasyon sa higit pang mga mapagkukunan para sa mga produkto ng Opentrons at pagsulat ng code upang makontrol ang Flex.
OPENRONS FLEX
9
PAUNANG-TAO
Appendix C: Ipinapaliwanag ng Open-Source Software kung paano naka-host ang Opentrons software sa GitHub bilang mapagkukunan para sa parehong mga developer at hindi developer.
Appendix D: Ang Impormasyon sa Suporta at Pakikipag-ugnayan ay naglilista kung paano makipag-ugnayan sa Opentrons kung kailangan mo ng tulong na higit pa sa ibinibigay ng aming dokumentasyon.
Mga tala at babala
Sa buong manwal na ito, makikita mo ang espesyal na naka-format na tala at mga bloke ng babala. Ang mga tala ay nagbibigay ng kapaki-pakinabang na impormasyon na maaaring hindi halata sa karaniwang kurso ng paggamit ng Flex. Bigyang-pansin ang mga babala–ginagamit lamang ang mga ito sa mga sitwasyon kung saan nanganganib ka ng personal na pinsala, pinsala sa kagamitan, pagkawala o pagkasira ng s.amples o reagents, pagkawala ng data, o iba pang pinsala. Ang mga tala at babala ay ganito ang hitsura:
Sample Tandaan: Ito ay isang bagay na dapat mong malaman, ngunit hindi ito nagdudulot ng anumang panganib.
Sample Babala: Ito ay isang bagay na kailangan mong malaman dahil may panganib na nauugnay dito.
10
OPENRONS FLEX
KABANATA 1
Panimula
Ang kabanatang ito ay nagpapakilala sa iyo sa Opentrons Flex ecosystem, kasama ang pangkalahatang disenyo ng system at magagamit na mga configuration ng workstation. Kasama rin dito ang mahalagang pagsunod at impormasyong pangkaligtasan, na dapat mong muliview bago i-set up ang iyong Opentrons Flex robot. Para sa higit pang mga detalye sa mga tampok ng Opentrons Flex, tingnan ang kabanata ng Paglalarawan ng System.
1.1 Maligayang pagdating sa Opentrons Flex
Ang Opentrons Flex ay isang liquid-handling robot na idinisenyo para sa mataas na throughput at kumplikadong mga daloy ng trabaho. Ang Flex robot ay ang base ng isang modular system na kinabibilangan ng mga pipette, labware gripper, deck fixtures, on-deck modules, at labware — lahat ng ito ay maaari mong palitan ng iyong sarili. Dinisenyo ang Flex gamit ang touchscreen para magamit mo ito nang direkta sa lab bench, o makokontrol mo ito mula sa buong lab mo gamit ang Opentrons App o ang aming mga open-source na API.
Kasama sa mga Flex workstation ang lahat ng kagamitan — robot, hardware, at labware — na kailangan mo para makapagsimula sa pag-automate ng mga karaniwang gawain sa lab. Para sa iba pang mga application, tumatakbo ang Opentrons Flex sa ganap na open-source na software at firmware, at reagent- at labware-agnostic, na nagbibigay sa iyo ng kontrol sa kung paano mo idinisenyo at pinapatakbo ang iyong mga protocol.
Ano ang bago sa Flex
Ang Opentrons Flex ay bahagi ng Opentrons liquid handler series ng mga robot. Maaaring pamilyar ang mga gumagamit ng Opentrons Flex sa Opentrons OT-2, ang aming personal na pipetting robot. Ang Flex ay lumampas sa mga kakayahan ng OT-2 sa ilang mahahalagang lugar, na naghahatid ng mas mataas na throughput at oras ng paglalakad.
Tampok ang throughput ng Pipette
Mga kapasidad ng pipette at tip
Paglalarawan
Ang mga flex pipette ay may 1, 8, o 96 na channel. Ang 96-channel pipette ay gumagana sa 12 beses na mas maraming balon nang sabay-sabay kaysa sa pinakamalaking OT-2 pipette.
Ang mga Flex pipette ay may mas malaking hanay ng volume (1 µL, 50 µL) at lahat ay maaaring gumana sa anumang dami ng Opentrons Flex tip. Ito ay isang pagpapabuti sa mga OT-5 pipette, na may mas maliliit na hanay at dapat gumamit ng mga tip na may tumutugmang hanay ng volume.
OPENRONS FLEX
11
KABANATA 1 PANIMULA
Gripper Automated calibration Touchscreen Module caddies Deck slot coordinate Movable trash Sukat at bigat
Ang Opentrons Flex Gripper ay kumukuha at naglilipat ng labware sa paligid ng deck nang awtomatiko, nang walang interbensyon ng user. Ang gripper ay nagbibigay-daan sa mas kumplikadong mga daloy ng trabaho sa loob ng iisang protocol run.
Ang posisyong pagkakalibrate ng Flex pipettes at ang gripper ay ganap na awtomatiko. Pindutin ang isang button, at lilipat ang instrumento sa mga precision-machined na punto sa deck upang matukoy ang eksaktong posisyon nito, na i-save ang data na iyon para magamit sa iyong mga protocol.
Ang Flex ay may sariling touchscreen na interface na hinahayaan kang direktang kontrolin ito, bilang karagdagan sa paggamit ng Opentrons App. Gamitin ang touchscreen upang simulan ang pagtakbo ng protocol, tingnan ang katayuan ng trabaho, at baguhin ang mga setting sa mismong robot.
Ang mga Flex module ay umaangkop sa mga caddy na sumasakop sa espasyo sa ibaba ng deck. Inilalagay ng mga Caddies ang iyong labware nang mas malapit sa ibabaw ng kubyerta at nagbibigay-daan para sa pagruruta ng cable sa ibaba ng deck. Ang mga Caddies ay nagbibigay-daan sa higit pang mga configuration ng module at labware sa deck.
Ang mga deck slot sa Flex ay binibilang gamit ang isang coordinate system (A1D4) na katulad ng kung paano binibilang ang mga balon sa labware.
Maaaring pumunta ang trash bin sa maraming lokasyon ng deck sa Flex. Ang default na lokasyon (slot A3) ay ang inirerekomendang posisyon. Maaari mo ring gamitin ang gripper upang itapon ang basura sa opsyonal na waste chute.
Ang Flex ay medyo mas malaki at mas mabigat kaysa sa OT-2. Ang mga gawain sa pag-install sa Flex ay nangangailangan ng tulong ng isang kasosyo sa lab.
Ang isang detalyadong paghahambing ng mga teknikal na detalye ng robot ay magagamit sa Opentrons website.
Parehong tumatakbo ang Flex at OT-2 na mga robot sa aming open-source na software, at makokontrol ng Opentrons App ang parehong uri ng mga robot nang sabay-sabay. Bagama't ang mga protocol ng OT-2 ay hindi maaaring patakbuhin nang direkta sa Flex, ito ay diretso upang iakma ang mga ito (tingnan ang seksyon ng OT-2 Protocols ng Protocol Development chapter para sa mga detalye).
Flex workstation
Kasama sa mga workstation ng Opentrons Flex ang Flex robot, mga accessories, pipette at gripper, on-deck modules, at labware na kailangan upang i-automate ang isang partikular na application. Ang lahat ng mga bahagi ng workstation ay modular. Kung kailangan mong magpalit ng mga application, maaari kang magdagdag o magpalit sa ibang Flex hardware at mga compatible na consumable.
12
OPENRONS FLEX
KABANATA 1 PANIMULA
NGS WORKSTATION
Ang Opentrons Flex NGS Workstation ay nag-aautomat ng NGS library prep. Maaari nitong i-automate ang mga pre-sequencing na daloy ng trabaho gamit ang anumang nangungunang reagent system, kabilang ang fragmentation- at tagpaghahanda sa library na nakabatay sa pag-iisip.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa NGS Workstation ang:
Gripper Pagpili ng pagsasaayos ng pipette
Dalawang 8-Channel Pipette (1 µL at 50 µL) 5-Channel Pipette (1000 µL) Waste Chute Magnetic Block Temperature Module Thermocycler Module Labware kit na may mga filter tip, microcentrifuge tubes, reservoir, at PCR plates
PCR WORKSTATION
Ang Opentrons Flex PCR Workstation ay nag-o-automate ng PCR setup at thermocycling workflow nang hanggang 96 samples. Maaari itong aliquot pinalamig reagents at samples sa isang 96-well PCR plate. Sa pagdaragdag ng automated Thermocycler Module, gamitin ang gripper upang i-load ang plate sa Thermocycler, at pagkatapos ay patakbuhin ang iyong napiling PCR program.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa PCR Workstation ang:
Gripper Pagpili ng pagsasaayos ng pipette
1-Channel Pipette (1 µL) at 50-Channel Pipette (8 µL) 1-Channel Pipette (50 µL) Waste Chute Temperature Module Labware kit na may mga filter tip, microcentrifuge tubes, reservoir, at PCR plates
OPENRONS FLEX
13
KABANATA 1 PANIMULA
NUCLEIC ACID EXTRACTION WORKSTATION
Ang Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation ay nag-automate ng paghihiwalay at paglilinis ng DNA/RNA. Ginagamit nito ang Magnetic Block para sa paghihiwalay ng magnetic beads, at ang Heater-Shaker para sa sample lysis at resuspension ng magnetic beads.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa Nucleic Acid Extraction Workstation ang:
Gripper Pagpili ng pagsasaayos ng pipette
1-Channel Pipette (5 µL) at 1000-Channel Pipette (8 µL) 5-Channel Pipette (1000 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware kit na may mga filter tip, reservoir, PCR plates, at deep well plates
MAGNETIC BEAD PROTEIN PURIFICATION WORKSTATION
Ang Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation ay nag-o-automate ng small-scale protein purification at proteomicsampmaghanda ng hanggang 96 samples. Ito ay katugma sa maraming sikat na magnetic-bead-based reagents.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa Protein Purification Workstation ang:
Gripper Pagpili ng pagsasaayos ng pipette
1-Channel Pipette (5 µL) at 1000-Channel Pipette (8 µL) 5-Channel Pipette (1000 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware kit na may mga filter tip, reservoir, PCR plates, at deep well plates
FLEX Prep WORKSTATION
Ang Opentrons Flex Prep Workstation ay nag-automate ng mga simpleng pipetting workflow. I-configure ang workstation gamit ang 1-Channel at 8-Channel Pipettes para magsagawa ng mga gawain tulad ng sampang paglipat, sample duplikasyon, at
14
OPENRONS FLEX
KABANATA 1 PANIMULA
reagent aliquoting. I-configure ang workstation gamit ang 96-Channel Pipette para magsagawa ng high-throughput reagent aliquoting at plate stamping.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa Flex Prep Workstation ang:
Pagpili ng configuration ng pipette: 1-Channel Pipette (5 µL) at 1000-Channel Pipette (8 µL) 5-Channel Pipette (1000 µL)
Labware kit na may mga tip sa filter, microcentrifuge tubes, at reservoir
PLSMID Prep WORKSTATION
Ang Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation ay nag-automate ng magnetic-bead-based na plasmid extraction at purification workflows. Ang workstation na ito ay nilagyan ng mga high-volume na pipette, isang Heater-Shaker Module, at isang Magnetic Block upang ma-accommodate ang karamihan sa bead-based chemistry.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa Plasmid Prep Workstation ang:
Gripper 1-Channel Pipette (5 µL) at 1000-Channel Pipette (8 µL) Waste Chute Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware kit na may mga filter tip, microcentrifuge tubes, reservoirs, PCR plates, at deep well plates
SYNBIO WORKSTATION
Ang Opentrons Flex SynBio Workstation ay nag-automate ng iba't ibang synthetic biology workflows gaya ng DNA synthesis at cloning. Ginagamit nito ang Magnetic Block at Temperature Module upang suportahan ang karamihan sa kimika na nakabatay sa bead. Idagdag ang Thermocycler Module para magsagawa ng heated lid incubations at ampmga liipikasyon.
Bilang karagdagan sa Flex robot, kasama sa SynBio Workstation ang:
Gripper 1-Channel Pipette (5 µL) at 1000-Channel Pipette (8 µL) Magnetic Block Temperature Module
OPENRONS FLEX
15
KABANATA 1 PANIMULA
Labware kit na may regular at mga filter na tip, microcentrifuge tubes, reservoirs, PCR plates, at deep well plates
1.2 Impormasyon sa kaligtasan
Ang Opentrons Flex liquid handling robot ay idinisenyo para sa ligtas na operasyon. Sumangguni sa mga detalye at mga alituntunin sa pagsunod sa seksyong ito upang matiyak ang ligtas na paggamit ng iyong Flex. Sinasaklaw ng mga alituntuning ito ang ligtas na paggamit ng mga koneksyon sa input at output para sa produkto, kabilang ang mga koneksyon ng power at data, pati na rin ang mga label ng babala na makikita sa Flex robot at kaugnay na hardware. Ang paggamit ng device sa paraang maliban sa tinukoy sa manwal na ito ay maaaring ilagay sa panganib ang gumagamit at kagamitan.
Mga simbolo ng kaligtasan
Ang iba't ibang mga label sa Flex at sa manwal na ito ay nagbababala sa iyo tungkol sa mga mapagkukunan ng potensyal na pinsala o pinsala.
Simbolo
Paglalarawan
Babala: Inaalerto ang mga user sa Potensyal na mapanganib na mga kondisyon. Mga aksyon na maaaring magresulta sa personal na pinsala o kamatayan.
Babala: Nag-iingat sa mga gumagamit laban sa Pagkasira ng kagamitan. Nawala o sira ang data. Hindi mababawi na pagkaantala ng operasyon na ginagawa.
Electrical shock: Tinutukoy ang mga bahagi ng instrumento na maaaring magdulot ng panganib ng electrical shock kung ang instrumento ay hindi maayos na hinahawakan.
Mainit na ibabaw: Tinutukoy ang mga bahagi ng instrumento na nagdudulot ng panganib ng personal na pinsala dahil sa mataas na init/temperatura kung hindi wasto ang paghawak sa instrumento.
Pinch point: Tinutukoy ang mga bahagi ng instrumento na maaaring magdulot ng panganib ng personal na pinsala kapag gumagalaw.
16
OPENRONS FLEX
KABANATA 1 PANIMULA
Makikita mo ang mga sumusunod na label sa Flex:
Mga label ng intelektwal na ari-arian Mga label ng pagsunod sa regulasyon (hal., ETL) Mga label ng peligro sa elektrikal Mga pangkalahatang label ng babala Mga label ng produkto Mga label ng pinch point High voltage label Mga label ng power rating
Mga babala sa kaligtasan ng elektrikal
Palaging obserbahan ang sumusunod na mga babala sa kaligtasan ng kuryente:
Simbolo
Paglalarawan
Isaksak ang robot sa isang naka-ground, Class 1 na circuit. Tingnan ang seksyong Power Connection sa kabanata ng Paglalarawan ng System.
Huwag kumonekta (magsaksak), magdiskonekta (mag-unplug), o gumamit ng mga AC power cable kung: Ang cable ay punit o nasira. Ang iba pang nakakabit na mga kable, kurdon, o mga sisidlan ay punit o nasira.
Ang paggamit ng mga nasirang kable ng kuryente ay maaaring magdulot ng panganib sa electric shock na magreresulta sa malubhang pinsala o pinsala sa robot.
Huwag palitan ang AC power cable maliban kung sa direksyon ng Opentrons Support.
Para sa higit pang impormasyon sa mga kinakailangan sa kuryente, tingnan ang seksyong Pagkonsumo ng Power ng Kabanatang Pag-install at Relokasyon.
OPENRONS FLEX
17
KABANATA 1 PANIMULA
Mga karagdagang babala sa kaligtasan
Palaging obserbahan ang mga sumusunod na karagdagang babala sa kaligtasan:
Simbolo
Paglalarawan
Ang Opentrons Flex ay hindi na-certify para sa paggamit ng mga paputok o nasusunog na likido. Huwag maglagay ng mga plato, tubo, o vial na naglalaman ng mga paputok o nasusunog na likido sa robot o kung hindi man ay paandarin ang instrumento ng mga paputok o nasusunog na likido sa enclosure.
Gumamit ng mahusay na mga kasanayan sa laboratoryo at sundin ang mga pag-iingat ng tagagawa kapag nagtatrabaho sa mga kemikal. Ang Opentrons ay hindi mananagot o mananagot para sa anumang pinsala dahil sa, o bilang resulta ng, paggamit ng mga mapanganib na kemikal.
Ang Flex ay tumitimbang ng 88.5 kg (195 lbs). Bilang resulta, nangangailangan ito ng dalawang tao na buhatin at ilipat ito nang ligtas. Tingnan ang seksyong Relokasyon sa kabanata ng Pag-install at Relokasyon.
Ang Flex ay dapat ilagay sa ibabaw na kayang suportahan ang bigat nito na 88.5 kg (195 lbs) na may sapat na surface area para ma-accommodate ang robot kasama ang pinakamababang distansya ng clearance nito (20 cm/8 in). Tingnan ang seksyong Mga Kinakailangan sa Kaligtasan at Operasyon sa kabanata ng Pag-install at Relokasyon.
Ang Flex ay maaaring maglabas ng mga vibrations habang nasa operasyon. Ilagay ang robot sa isang ibabaw na matibay, patag, at lumalaban sa tubig na may mga cross-bracing o welded joints. Tingnan ang seksyong Mga Kinakailangan sa Kaligtasan at Operasyon sa kabanata ng Pag-install at Relokasyon.
Mga pag-iingat sa kaligtasan
Upang makatulong na protektahan ang Flex mula sa pinsala, sundin ang mga pag-iingat na ito:
18
OPENRONS FLEX
KABANATA 1 PANIMULA
Simbolo
Paglalarawan
Gumamit ng labware na sumusunod sa ANSI/SLAS o inaprubahan ng Opentrons. Tingnan ang Labware chapter.
Panatilihin ang mga kinakaing unti-unting materyales, ahente, o kung hindi man ay nakakasira ng mga materyales mula sa robot.
Kaligtasan ng biyolohikal
Tratuhin ang mga specimen at reagents na naglalaman ng mga materyales na kinuha mula sa mga tao bilang mga potensyal na nakakahawang ahente. Inirerekomenda ng Opentrons ang paggamit ng mga ligtas na pamamaraan sa laboratoryo tulad ng ipinaliwanag sa Biosafety sa Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6th Edition.
Sa ilalim ng normal na mga pangyayari, ang Flex ay hindi gumagawa ng mga nakikitang aerosol mula sa pinagmumulan ng mga likido. Gayunpaman, sa ilalim ng ilang mga kundisyon, posibleng makabuo ng mga aerosol mula sa mga pinagmumulan ng likido. Kapag gumagamit ng biosafety level 2 o mas mataas na pinagmumulan ng mga likido, isaalang-alang ang pag-iingat laban sa pagkakalantad sa aerosol, alinsunod sa iyong mga lokal na regulatory body. Upang mabawasan ang potensyal na panganib ng pagkakalantad ng aerosol mula sa robot, tiyaking ikaw ay:
Magsagawa ng pagpapanatili tulad ng inilarawan sa kabanata ng Pagpapanatili at Serbisyo. Tamang i-install at i-secure ang lahat ng instrument cover, pipette, module, at labware. Gumamit ng wastong pamamaraan ng pipetting upang makatulong sa pagpapagaan ng mga aerosol.
Nakalalasong usok
Kung nagtatrabaho ka sa mga pabagu-bagong solvent o mga nakakalason na sangkap, gumamit ng mahusay na sistema ng bentilasyon ng laboratoryo upang alisin ang anumang mga singaw na maaaring gawin.
Mga nasusunog na likido
Ang Flex ay hindi nasuri para sa paggamit sa mga nasusunog na likido at hindi dapat gamitin sa mga nasusunog na likido.
OPENRONS FLEX
19
KABANATA 1 PANIMULA
1.3 Pagsunod sa regulasyon
Sumusunod ang Opentrons Flex sa lahat ng naaangkop na kinakailangan ng mga sumusunod na pamantayan sa kaligtasan at electromagnetic.
Kaligtasan
Rule ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Pamagat
Mga Kinakailangang Pangkaligtasan para sa Kagamitang Pang-elektrisidad para sa Pagsukat, Pagkontrol, at Paggamit ng Laboratory Bahagi 1: Mga Pangkalahatang Kinakailangan
Mga partikular na kinakailangan para sa mga kagamitan sa laboratoryo para sa paghahalo at pagpapakilos
Electromagnetic compatibility
ID ng Panuntunan EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Part 15 Subpart B Class A IC ICES-003
Pamagat
Electrical Equipment para sa Pagsukat, Kontrol, at Paggamit ng Laboratory Mga Kinakailangan sa EMC Bahagi 1: Mga Pangkalahatang Pangangailangan Mga Hindi Sinasadyang Radiator
Pamamahala ng Spectrum at Panghihimasok sa Telekomunikasyon na Nagdulot ng Kagamitang Pamantayan na Kagamitan sa Teknolohiya ng Impormasyon (Kabilang ang Digital Apparatus)
Mga babala at tala ng FCC
Babala: Ang mga pagbabago o pagbabago sa unit na ito na hindi hayagang inaprubahan ng Opentrons ay maaaring magpawalang-bisa sa awtoridad ng user na patakbuhin ang kagamitan.
Sumusunod ang device na ito sa Part 15 ng FCC rules. Ang operasyon ay napapailalim sa mga sumusunod:
20
OPENRONS FLEX
KABANATA 1 PANIMULA
Ang device na ito ay maaaring hindi magdulot ng mapaminsalang interference. Dapat tanggapin ng device na ito ang anumang interference na natanggap, kabilang ang interference na maaaring magdulot ng hindi kanais-nais
operasyon.
Tandaan: Ang kagamitang ito ay nasubok at natagpuang sumusunod sa mga limitasyon para sa isang Class A na digital na device, alinsunod sa Bahagi 15 ng mga panuntunan ng FCC. Ang mga limitasyong ito ay idinisenyo upang magbigay ng makatwirang proteksyon laban sa mapaminsalang interference kapag ang kagamitan ay pinapatakbo sa isang komersyal na kapaligiran. Ang kagamitang ito ay bumubuo, gumagamit, at maaaring magpalabas ng enerhiya ng dalas ng radyo at, kung hindi na-install at ginamit alinsunod sa manual ng pagtuturo, ay maaaring magdulot ng nakakapinsalang interference sa mga komunikasyon sa radyo. Ang pagpapatakbo ng kagamitang ito sa isang residential area ay malamang na magdulot ng mapaminsalang interference kung saan kakailanganin ng user na itama ang interference sa kanilang sariling gastos.
Pagsunod sa ISED ng Canada
Canada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Natutugunan ng produktong ito ang naaangkop na mga teknikal na detalye ng Innovation, Science at Economic Development Canada.
Le présent produit est conforme aux spécifications techniques applicables d'Innovation, Sciences at Developpement économique Canada.
Babala sa kapaligiran
Babala: Kanser at Kapinsalaan sa Reproduktibo www.P65Warnings.ca.gov
Precertification ng Wi-Fi
Ang module ng Wi-Fi ay precertified para sa paggamit sa maraming rehiyon:
United States (FCC): FCC Identifier UAY-W8997-M1216 European Economic Area (CE): Walang pampublikong identifier (self-declaration) Canada (IC): Hardware Version Identification Number W8997-M1216 Japan (TELEC): Certified number 020-170034 India (WPC): Registration number ETA-SD-20191005525 (self-declaration)
OPENRONS FLEX
21
KABANATA 2
Pag-install at Relokasyon
Inilalarawan ng kabanatang ito kung paano ihanda ang iyong lab para sa Opentrons Flex, kung paano i-set up ang robot, at kung paano ito ilipat kung kinakailangan. Bago dalhin ang iyong Flex, tiyaking natutugunan ng iyong lab o pasilidad ang lahat ng pamantayan sa seksyong Mga Kinakailangan sa Kaligtasan at Operasyon. Kapag oras na para patakbuhin at patakbuhin ang iyong Flex, sundin ang mga detalyadong tagubilin sa Unboxing, First Run, at Pag-install ng Instrument at Calibration na mga seksyon, o gamitin ang Opentrons Onsite Support Set Up service. At kung kailangan mong ilipat ang iyong Flex sa isang bagong lokasyon, malapit o malayo, sundin ang mga hakbang sa seksyong Relokasyon.
2.1 Mga kinakailangan sa kaligtasan at pagpapatakbo
Kung saan ilalagay ang Opentrons Flex
Ang espasyo ay isang mahalagang kalakal sa halos bawat lab. Kakailanganin ng iyong Flex–ngunit hindi masyadong marami, dahil idinisenyo ito upang magkasya sa kalahati ng karaniwang lab bench. Tiyaking mayroon kang puwang na nakakatugon sa mga sumusunod na pamantayan.
Pang-ibabaw ng bangko: Nakatigil, matibay, antas, lumalaban sa tubig na ibabaw. Hindi inirerekomenda ang mga mesa o bangko na may mga gulong (kahit na mga naka-lock na gulong). Mabilis na gumagalaw ang Flex at may napakaraming masa, na maaaring mag-alog o mag-imbalance sa magaan o magagalaw na mga mesa.
Timbang ng timbang: Ang robot lamang ay tumitimbang ng 88.5 kg (195 lb) at dapat lamang buhatin ng dalawang taong nagtutulungan. Ilagay ang robot sa ibabaw na madaling sumuporta sa bigat nito kasama ang bigat ng anumang module, labware, likido, o iba pang kagamitan sa lab na gagamitin sa iyong mga application.
Operating space: Ang mga batayang sukat ng robot ay 87 cm W x 69 cm D x 84 cm H (mga 34″ x 27″ x 33″). Kailangan ng Flex ng 20 cm (8″) na clearance sa gilid at likod para sa mga cable, koneksyon sa USB, at para mawala ang tambutso mula sa mga module na umiinit at lumalamig.
Babala: Huwag iposisyon ang mga gilid o likod ng Flex flush sa dingding.
22
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
84 cm 33″
87 cm 34″
Mga sukat ng base ng Opentrons Flex.
69 cm 27″
20 cm 8″
20 cm 8″
20 cm 8″
Nangunguna view ng Opentrons Flex, na nagpapakita ng minimum na side at back clearance.
OPENRONS FLEX
23
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Pagkonsumo ng kuryente
Ang Opentrons Flex ay dapat na konektado sa isang saksakan sa dingding sa o malapit sa lokasyon ng bangko kung saan mo ito ini-install. Ikonekta lang ang Flex sa mga circuit na kayang tumanggap ng maximum power draw nito:
Input power: 36 VDC, 6.1 A Idle consumption: 30 W Karaniwang pagkonsumo: 40 W (sa panahon ng protocol run) Maximum na pagkonsumo: Humigit-kumulang 50 W
Ang eksaktong pagkonsumo ng kuryente ay nakasalalay sa:
Ang dami at uri ng paggalaw na isinagawa sa panahon ng isang protocol. Ang tagal ng oras na idle ng robot. Ang katayuan ng mga ilaw sa robot. Ilang instrumento ang nakakabit.
Tandaan na isaalang-alang ang iba pang mga electronics na kumukonsumo ng kuryente sa parehong circuit, kabilang ang mga Flex module na may sariling power supply. Para kay exampSa gayon, ang Thermocycler Module ay may pinakamataas na konsumo ng kuryente (630 W) na mas malaki kaysa sa Flex robot mismo. Kung kinakailangan, kumunsulta sa tagapamahala ng iyong pasilidad upang matiyak na natutugunan nito ang mga kinakailangan sa kuryente ng iyong kagamitan.
Mga kondisyon sa kapaligiran
Ang mga kondisyon sa kapaligiran para sa inirerekomendang paggamit, katanggap-tanggap na paggamit, at imbakan ay iba-iba:
Inirerekomenda para sa pagpapatakbo ng system
Katanggap-tanggap para sa pagpapatakbo ng system
Temperatura sa paligid +20 hanggang +25 °C
+2 hanggang +40 °C
Relatibong halumigmig Altitude
40%, hindi nagpapalapot
Humigit-kumulang 500 m sa ibabaw ng dagat
30%, hindi nakaka-condensing (sa ibaba 80 °C)
Hanggang 2000 m sa ibabaw ng dagat
Imbakan at transportasyon
-10 hanggang +60 °C
10%, hindi nakaka-condensing (sa ibaba 85 °C)
Hanggang 2000 m sa ibabaw ng dagat
24
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Pinatunayan ng Opentrons ang pagganap ng Opentrons Flex sa mga kondisyong inirerekomenda para sa pagpapatakbo ng system, at ang pagpapatakbo sa mga kundisyong iyon ay dapat magbigay ng pinakamainam na resulta. Ang Flex ay ligtas na gamitin sa mga kondisyong katanggap-tanggap para sa pagpapatakbo ng system, ngunit maaaring mag-iba ang mga resulta. Huwag i-on o gamitin ang Flex sa mga kundisyon sa labas ng mga hangganang iyon. Nalalapat lamang ang mga kundisyon ng imbakan at transportasyon kapag ang robot ay ganap na nadiskonekta sa kuryente at iba pang kagamitan.
2.2 Pag-unbox
Binabati kita! Dumating na ang iyong Opentrons Flex at naghanda ka ng puwang para dito sa iyong lab. Buksan natin ang halimaw na crate, alisin ang robot, at ihanda ito para sa operasyon. Ang impormasyon sa seksyong ito ay nagbibigay ng isang listahan ng mga bahagi at mga tagubilin na gagabay sa iyo sa mga hakbang na kinakailangan upang ma-unbox, ma-set up, at handa nang gamitin ang Flex. Hinati namin ang pamamaraan ng pag-setup sa tatlong bahagi:
Sinasaklaw ng Bahagi 1 ang pag-disassemble ng crate. Saklaw ng Bahagi 2 ang pagtanggal ng Flex mula sa crate at paglipat nito sa isang huling lokasyon ng pagpupulong. Saklaw ng Bahagi 3 ang huling pagpupulong at pagpapagana sa robot sa unang pagkakataon.
Kailangan ng pagsisikap at oras
Gusto mong hilingin sa isang kasosyo sa lab na tumulong sa proseso ng pag-unbox, pag-angat, paglipat, at pagpupulong. Kakailanganin mong magbadyet ng humigit-kumulang 30 minuto hanggang isang oras para sa pagsisikap na ito.
Tandaan: Ang Flex ay nangangailangan ng dalawang tao upang iangat ito ng maayos. Gayundin, ang pag-angat at pagdadala ng Flex sa pamamagitan ng mga hawakan nito ay ang pinakamahusay na paraan upang ilipat ang robot.
Crate at packing material
Ang pag-unpack ng Flex ay nagbibigay sa iyo ng isang kahanga-hangang robot, ngunit mayroon ka ring maraming malalaking crate panel kasama ng iba't ibang bahagi ng pagpapadala at padding. Bagama't maaari mong itapon ang materyal na ito, hinihikayat ka naming panatilihin ang mga item na ito kung may available na espasyo sa imbakan. Ang packaging ay magagamit muli, na tumutulong sa paghahanda ng iyong Flex para sa pagpapadala kung sakaling kailanganin mong ipadala ito sa ibang lugar (hal., sa isang kumperensya o isang bagong pasilidad) sa hinaharap.
OPENRONS FLEX
25
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Mga elemento ng produkto
Ang Flex ay nagpapadala kasama ang mga sangkap na nakalista sa ibaba. Ang mga pipette, gripper, at mga module ay may hiwalay na packaging mula sa pangunahing Flex crate, kahit na binili mo ang mga ito nang magkasama bilang isang workstation.
(1) Opentrons Flex robot
(1) USB cable
(1) Power cable
(1) Ethernet cable
(5) L-keys (12 mm hex, 1.5 mm hex, 2.5 mm hex, 3 mm hex,
T10 Torx)
(1) Emergency Stop Pendant
(1) Deck slot na may mga labware clip
(4) Mga ekstrang labware clip
(1) Pipette calibration probe
(4) May dalang mga hawakan at takip
(1) Nangungunang panel ng window
(4) Mga panel sa gilid ng bintana
(1) 2.5 mm hex screwdriver
(1) 19 mm na wrench
(16 + ekstra) Mga tornilyo sa bintana (M4x8 mm flat head)
26
(10) Mga ekstrang deck slot screws (M4x10 mm socket head)
(12) Mga ekstrang deck clip screw (M3x6 mm socket head)
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Bahagi 1: Alisin ang crate
Ipinapadala ng Opentrons ang iyong Flex sa isang matibay na plywood crate. Ang shipping crate ay gumagamit ng hook at latch clamps upang i-secure ang tuktok, gilid, at ibabang mga panel nang magkasama. Ang paggamit ng mga trangka, sa halip na mga pako o mga turnilyo, ay nangangahulugang hindi mo kakailanganin ng crowbar (o maraming puwersa) upang i-disassemble ang crate, at maaari mo itong muling buuin sa ibang pagkakataon, kung kinakailangan.
Tandaan: Maaaring magaspang ang mga gilid ng crate sa panahon ng pagpapadala. Maaaring gusto mong gumamit ng mga guwantes sa trabaho upang protektahan ang iyong mga kamay mula sa mga splints ng kahoy.
Upang bitawan ang mga latches, i-flip ang tab ng latch pataas at i-on ito sa kaliwa (counterclockwise). Ang pagkilos na ito ay gumagalaw sa clamp braso mula sa kaukulang retaining bracket nito. Maaari mong i-flip ang braso ng trangka palayo sa crate.
1 I-unlock ang walong trangka na humahawak sa itaas sa mga gilid.
2 Alisin ang tuktok na panel pagkatapos bitawan ang mga trangka.
OPENRONS FLEX
27
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT 3 Gupitin ang asul na shipping bag, alisin ang mga item na ito mula sa padding, at itabi ang mga ito:
User Kit Power, Ethernet, at mga USB cable na Emergency Stop Pendant
4 Alisin ang tuktok na piraso ng foam padding upang ilantad ang mga panel ng bintana. Pinoprotektahan ng padding ang gilid at tuktok na mga panel.
5 Alisin ang mga panel ng bintana at itabi ang mga ito. I-attach mo ang mga ito mamaya.
28
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
6 I-unlock ang natitirang 16 na trangka na humahawak sa mga side panel sa isa't isa at sa base ng crate. 7 Alisin ang mga side panel at itabi ang mga ito.
Bahagi 2: Bitawan ang Flex
Pagkatapos kumpletuhin ang mga hakbang sa Part 1, makikita mo na ngayon ang isang robot na nasa isang protective bag at nakakabit sa orange na steel mounting component. Ang bag ay nakapaloob sa robot at pinoprotektahan ito mula sa panlabas na kapaligiran. Itinatago ng mga bakal na bracket ang robot sa ilalim ng crate. Sinusuportahan ng dalawang shipping frame ang robot, pantay na ibinabahagi ang bigat nito, at pinapanatili itong matigas para hindi ito mag-warp habang nagpapadala. Patuloy na i-unpack ang Flex at alisin ito sa base ng crate.
8 Gamit ang 19 mm na wrench mula sa User Kit, i-unbolt ang mga bracket mula sa ilalim ng crate. Maaari mong itapon ang mga bracket, o i-save ang mga ito para magamit sa hinaharap.
OPENRONS FLEX
29
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT 9 Hilahin o igulong ang shipping bag hanggang sa ibaba upang malantad ang buong robot.
10 Sa tulong ng iyong kasosyo sa lab, kunin ang mga handhold sa orange na shipping frame sa magkabilang gilid ng base ng robot, iangat ang Flex mula sa base ng crate, at ilagay ito sa sahig. I-save o itapon ang crate base at shipping frame.
30
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT 11 Gamit ang 12 mm hex L-key mula sa User Kit, tanggalin ang apat na bolts na humahawak sa mga shipping frame sa
ang Flex. I-save o itapon ang mga frame at bolts.
12 Alisin ang apat na aluminum handle mula sa User Kit. I-screw ang mga handle sa parehong mga lokasyon kung saan hawak ang 12 mm shipping frame bolts.
OPENRONS FLEX
31
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
13 Sa tulong ng iyong kasosyo sa lab, iangat ang Flex sa pamamagitan ng dala nitong mga hawakan at ilipat ito sa isang workbench para sa huling pagpupulong.
Bahagi 3: Panghuling pagpupulong at pag-on
Pagkatapos ilipat ang Flex sa isang pansamantalang lugar ng trabaho, o ang permanenteng tahanan nito, oras na upang ilagay ang mga pagtatapos sa iyong bagong robot.
14 Kung inilipat mo ang robot sa huling lugar na gumagana, tanggalin ang mga hawakan ng dala at palitan ang mga ito ng mga takip sa pagtatapos. Isinasara ng mga takip ang mga bukasan ng hawakan sa frame at binibigyan ang robot ng malinis na hitsura. Ibalik ang mga handle sa User Kit para sa storage.
32
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
15 Kunin ang mga panel sa itaas at gilid mula sa packing foam na iyong itinabi pagkatapos alisin ang crate top.
16 Pagkasyahin ang mga panel ng bintana sa Flex sa pamamagitan ng pagsunod sa impormasyon ng label sa front protective film. Pagkatapos ay alisin ang proteksiyon na pelikula.
17 Gamit ang beveled window screws at ang 2.5 mm screwdriver mula sa User Kit, ikabit ang mga window panel sa Flex. Tiyaking nakaharap sa labas (patungo sa iyo) ang mga beveled (hugis-V) na butas sa mga panel ng bintana. Nagbibigay-daan ito sa mga turnilyo na magkasya sa ibabaw ng bintana.
Babala: Ang maling pag-orient sa mga panel ay maaaring humantong sa pagkasira. Ang labis na metalikang kuwintas ng tornilyo ay maaaring pumutok sa mga panel. Higpitan ng kamay ang mga turnilyo hanggang sa makatwirang secure ang mga panel ng bintana. Hindi ito pagsubok ng lakas.
OPENRONS FLEX
33
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAG-RELOCATION 18 Gamit ang 2.5 mm screwdriver mula sa User Kit, tanggalin ang locking screws mula sa gantry. Ang mga ito
pinipigilan ng mga turnilyo ang gantry na gumalaw habang nasa transit. Ang gantry locking screws ay matatagpuan: Sa kaliwang bahagi ng riles malapit sa harap ng robot. Sa ilalim ng patayong gantry arm. Sa kanang bahagi ng riles malapit sa harap ng robot sa isang orange na bracket. May dalawang turnilyo dito.
Ang gantri ay madaling gumagalaw sa pamamagitan ng kamay pagkatapos tanggalin ang lahat ng mga turnilyo sa pagpapadala. 19 Gupitin at tanggalin ang dalawang rubber band na humahawak sa basurahan habang nagpapadala.
34
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
20 Ikabit ang power cord sa Flex at isaksak ito sa saksakan sa dingding. Siguraduhin na ang lugar ng deck ay walang mga sagabal. I-flip ang power switch sa kaliwang likod ng robot. Kapag naka-on na, lilipat ang gantry sa lokasyon ng tahanan nito at magpapakita ang touchscreen ng mga karagdagang tagubilin sa pagsasaayos.
Ngayong wala na sa kahon ang iyong Flex at handa nang umalis, magpatuloy sa seksyong First Run sa ibaba.
2.3 Unang pagtakbo
Magsagawa ng pangunahing setup sa touchscreen bago ikonekta ang anumang iba pang hardware sa iyong Flex. Gagabayan ka ng robot sa pamamagitan ng pagkonekta sa iyong lab network, pag-update sa pinakabagong software, at pag-personalize ng Flex sa pamamagitan ng pagbibigay nito ng pangalan.
Power on
Kapag pinagana mo ang Flex, lalabas ang logo ng Opentrons sa touchscreen. Pagkaraan ng ilang sandali, ipapakita nito ang screen na "Welcome to your Opentrons Flex".
Ang Opentrons Flex na welcome screen. Dapat mo lang makita ang screen na ito kapag sinimulan mo ang iyong Flex sa unang pagkakataon.
OPENRONS FLEX
35
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Kumonekta sa isang network o computer
Sundin ang mga senyas sa touchscreen upang maikonekta ang iyong robot upang masuri nito ang mga update sa software at makatanggap ng protocol files. May tatlong paraan ng koneksyon: Wi-Fi, Ethernet, at USB.
Mga opsyon sa koneksyon sa network. Kailangan mong magkaroon ng koneksyon sa internet para i-set up ang Flex. Wi-Fi: Gamitin ang touchscreen para kumonekta sa mga Wi-Fi network na na-secure gamit ang WPA2 Personal authentication (karamihan sa mga network na nangangailangan lang ng password para makasali ay nasa kategoryang ito).
Tandaan: Hindi sinusuportahan ng Flex ang mga captive portal (mga network na walang password ngunit naglo-load ng a webpahina upang patotohanan ang mga user pagkatapos kumonekta).
Maaari ka ring kumonekta sa isang bukas na Wi-Fi network, ngunit hindi ito inirerekomenda.
Babala: Ang pagkonekta sa isang bukas na Wi-Fi network ay magbibigay-daan sa sinumang nasa hanay ng signal ng network na kontrolin ang iyong Opentrons Flex robot nang walang pagpapatotoo.
Kung kailangan mong kumonekta sa isang Wi-Fi network na gumagamit ng enterprise authentication (kabilang ang "eduroam" at mga katulad na akademikong network na nangangailangan ng username at password), kumonekta muna sa Opentrons App sa pamamagitan ng Ethernet o USB upang makumpleto ang paunang pag-setup. Pagkatapos ay kumonekta sa enterprise Wi-Fi network sa mga setting ng networking para sa iyong Flex. Upang ma-access ang mga setting ng networking:
36
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
1. I-click ang Mga Device sa kaliwang sidebar ng Opentrons App. 2. I-click ang tatlong-tuldok na menu () para sa iyong Flex at piliin ang Mga Setting ng Robot. 3. I-click ang tab na Networking.
Piliin ang iyong network mula sa dropdown na menu o piliin ang “Sumali sa ibang network…” at ilagay ang SSID nito. Piliin ang paraan ng pagpapatunay ng enterprise na ginagamit ng iyong network. Ang mga sinusuportahang pamamaraan ay:
EAP-TTLS na may TLS EAP-TTLS na may MS-CHAP v2 EAP-TTLS na may MD5 EAP-PEAP na may MS-CHAP v2 EAP-TLS
Ang bawat isa sa mga pamamaraang ito ay nangangailangan ng isang username at password, at depende sa iyong eksaktong network configuration ay maaaring mangailangan ng sertipiko files o iba pang mga pagpipilian. Kumonsulta sa dokumentasyon ng IT ng iyong pasilidad o makipag-ugnayan sa iyong IT manager para sa mga detalye ng setup ng iyong network.
Ethernet: Ikonekta ang iyong robot sa isang network switch o hub gamit ang isang Ethernet cable. Maaari ka ring direktang kumonekta sa Ethernet port sa iyong computer, simula sa bersyon 7.1.0 ng robot system.
USB: Ikonekta ang ibinigay na USB A-to-B cable sa USB-B port ng robot at isang bukas na port sa iyong computer. Gumamit ng USB B-to-C cable o USB A-to-C adapter kung walang USB-A port ang iyong computer.
Upang magpatuloy sa pag-setup, ang nakakonektang computer ay dapat na naka-install at tumatakbo ang Opentrons App. Para sa mga detalye sa pag-install ng Opentrons App, tingnan ang seksyong Pag-install ng App ng Software and Operation chapter.
Mag-install ng mga update sa software
Ngayong nakakonekta ka na sa isang network o computer, maaaring tingnan ng robot ang mga update sa software at firmware at i-download ang mga ito kung kinakailangan. Kung may update, maaaring tumagal ng ilang minuto upang mai-install. Kapag nakumpleto na ang pag-update, magre-restart ang robot.
OPENRONS FLEX
37
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Maglakip ng Emergency Stop Pendant
Ikonekta ang kasamang Emergency Stop Pendant (E-stop) sa isang auxiliary port (AUX-1 o AUX-2) sa likod ng robot.
Bago at pagkatapos ikonekta ang Emergency Stop Pendant.
Ang pag-attach at pagpapagana ng E-stop ay sapilitan para sa pag-attach ng mga instrumento at pagpapatakbo ng mga protocol sa Flex. Para sa karagdagang impormasyon sa paggamit ng E-stop sa panahon ng pagpapatakbo ng robot, tingnan ang seksyong Emergency Stop Pendant ng System Description chapter.
Bigyan ng pangalan ang iyong robot
Ang pagbibigay ng pangalan sa iyong robot ay nagbibigay-daan sa iyong madaling makilala ito sa iyong kapaligiran sa lab. Kung marami kang Opentrons na robot sa iyong network, tiyaking bigyan sila ng mga natatanging pangalan. Kapag nakumpirma mo na ang pangalan ng iyong robot, dadalhin ka sa iyong Opentrons Flex Dashboard. Malamang na ang susunod na hakbang na gusto mong gawin ay ang pag-attach ng mga instrumento, na sakop sa susunod na seksyon.
2.4 Pag-install at pagkakalibrate ng instrumento
Pagkatapos ng paunang pag-setup ng robot, ang susunod na hakbang ay ilakip ang mga instrumento sa robot at i-calibrate ang mga ito.
Upang mag-install ng instrumento, i-tap muna ang Mga Instrumento sa touchscreen o pumunta sa seksyong Pipettes at Modules ng screen ng detalye ng device sa Opentrons App. Pumili ng walang laman na mount at piliin ang alinman sa Attach Pipette o Attach Gripper. Kung ang mount na gusto mong gamitin ay okupado na, kailangan mo munang tanggalin ang pipette o gripper.
38
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Tandaan: Ang kabuuang proseso ng pag-install ay pareho kahit na ginagamit mo ang touchscreen o ang Opentrons App. Anumang device ang sisimulan mo ang magkokontrol sa proseso ng pag-install hanggang sa makumpleto o makansela mo ito.
Kung magsisimula ka sa touchscreen, ipapakita ng app ang robot bilang "abala." Kung magsisimula ka sa app, magpapakita ang touchscreen ng modal na nagsasaad na ang pag-install ng instrumento ay isinasagawa.
Ang eksaktong proseso ng pag-install ay nag-iiba depende sa instrumento na iyong ikinakabit, gaya ng saklaw sa mga seksyon sa ibaba. Ang lahat ng mga instrumento ay may automated na pamamaraan ng pagkakalibrate, na dapat mong gawin kaagad pagkatapos ng pag-install.
Pag-install ng pipette
Kapag nag-install ka ng pipette, gagabayan ka sa mga sumusunod na hakbang sa touchscreen o sa Opentrons App.
1. PUMILI NG URI NG PIPETTE Pumili sa pagitan ng 1- o 8-Channel Pipette at 96-Channel Pipette. Ang pag-attach sa 96-Channel Pipette ay nangangailangan ng ilang karagdagang hakbang dahil nakakabit ito sa isang espesyal na mounting plate na sumasaklaw sa parehong pipette mount.
2. MAGHANDA PARA SA PAG-INSTALL Alisin ang labware mula sa kubyerta at linisin ang lugar ng pagtatrabaho upang gawing mas madali ang pagkakabit at pagkakalibrate. Ipunin din ang mga kinakailangang kagamitan, tulad ng calibration probe, hex screwdriver, at mounting plate (para sa 96-Channel Pipette).
3. I-KONEKTA AT I-SECURE ANG PIPETTE Ang gantry ay lilipat sa harap ng robot para ikabit mo ang pipette.
Direktang kumonekta ang 1- at 8-Channel Pipettes sa isang pipette mount. Ang 96-Channel Pipette ay nangangailangan ng mounting plate. Upang ikabit ang mounting plate, kailangan mo munang idiskonekta ang z-axis carriage para sa tamang pipette mount.
OPENRONS FLEX
39
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Ikonekta ang pipette sa napiling pipette mount at i-secure ang mga turnilyo nito.
4. RUN AUTOMATED CALIBRATION Upang i-calibrate ang pipette, ikabit ang calibration probe sa naaangkop na pipette nozzle. Ang pipette ay awtomatikong lilipat upang hawakan ang ilang mga punto sa deck at i-save ang mga halaga ng pagkakalibrate para magamit sa hinaharap. Kapag kumpleto na ang pagkakalibrate at naalis mo na ang probe, magiging handa na ang pipette para magamit sa mga protocol.
Pag-install ng gripper
Kapag na-install mo ang gripper, gagabayan ka sa mga sumusunod na hakbang sa touchscreen o sa Opentrons App.
1. MAGHANDA PARA SA PAG-INSTALL Alisin ang labware mula sa deck at linisin ang lugar ng pagtatrabaho upang gawing mas madali ang pagkakabit at pagkakalibrate. Ipunin din ang kinakailangang hex screwdriver at siguraduhin na ang calibration pin ay nasa storage area nito sa gripper.
2. I-KONEKTA AT I-SECURE ANG GRIPPER Ang gantry ay lilipat sa harap ng robot upang maaari mong ikabit ang gripper. Ikonekta ang gripper sa extension mount at i-secure ang mga turnilyo nito.
3. RUN AUTOMATED CALIBRATION Upang i-calibrate ang gripper, ipasok ang calibration pin sa harap na panga. Ang gripper ay awtomatikong lilipat upang hawakan ang ilang mga punto sa deck at i-save ang mga halaga ng pagkakalibrate para magamit sa hinaharap. Pagkatapos ay ulitin ang parehong proseso gamit ang calibration pin sa likod na panga. Kapag kumpleto na ang pagkakalibrate at naibalik mo na ang pin sa lokasyon ng imbakan nito, magiging handa na ang gripper para magamit sa mga protocol.
2.5 Relokasyon
Ang seksyong ito ay nagbibigay ng payo at mga tagubilin tungkol sa kung paano ilipat ang iyong Opentrons Flex robot sa maikli at malalayong distansya.
40
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Maikling galaw
Ang isang maikling paglipat ay sumasaklaw sa isang hanay ng mga distansya mula sa "ilipat lang natin ito nang kaunti" hanggang sa buong lab, pababa ng bulwagan, o isa pang palapag sa iyong gusali. Sa mga kasong ito, maaari mong ilipat ang iyong Flex sa pamamagitan ng kamay. Ang pagdadala nito sa isang hand cart ay isa ring magandang opsyon.
Babala: Ang Flex ay tumitimbang ng 88.5 kg. Bilang resulta, nangangailangan ito ng dalawang tao na buhatin at ilipat ito nang ligtas.
Muling ikabit ang mga elevator handle upang ilipat ang iyong Flex sa isang bago, malapit na lokasyon. Ang pag-angat at pagdadala ng Flex sa pamamagitan ng mga hawakan nito ay ang tamang paraan upang ilipat ang robot sa maikling distansya. Alisin ang mga hawakan at itago ang mga ito sa User Kit pagkatapos makumpleto ang paglipat. Upang maiwasang mapinsala ang robot, palaging gamitin ang mga handle ng elevator para kunin ito at ilipat ito. Huwag kunin ang frame para iangat o ilipat ang iyong robot.
Long-distance moves
Ang isang malayuang paglipat ay naghahatid ng iyong Flex sa bakuran ng iyong unibersidad, pasilidad, o institusyon. Sa buong bayan, sa isang bagong lungsod, estado, lalawigan, o bansa ay lahat ng examples ng isang malayuang galaw. Sa kasong ito, kakailanganin mong i-pack ang Flex upang maprotektahan ito mula sa mga elemento, pagkabigla, at magaspang na paggalaw na maaaring mangyari habang nasa transit.
Kung iningatan mo ang shipping crate at mga panloob na suporta na kasama ng iyong Flex, maaari mo itong i-repackage sa mga materyales na ito para sa isang malayuang paglipat. Sundin ang mga hakbang sa pag-unbox sa reverse order para ihanda ang iyong Flex para sa isang long-distance na paglipat. Karaniwan, dapat mong:
Idiskonekta ang power at network cable, kung nakakabit. Alisin ang lahat ng nakalakip na hardware at labware. Muling ikabit ang mga plato ng deck. I-lock ang gantry (tingnan ang seksyon ng General Moving Advice sa ibaba). Alisin at iimbak ang mga panel ng window.
Kung itinago mo ang orihinal na crate:
Muling ikabit ang shipping frame sa Flex at i-secure ito sa pallet base gamit ang mga L-bracket. Magdagdag ng padding at muling buuin ang shipping crate.
OPENRONS FLEX
41
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Kung wala kang orihinal na crate at kaugnay na materyal, makipag-ugnayan sa isang kagalang-galang na kumpanya sa pagpapadala. Maaari nilang pamahalaan ang proseso ng pag-iimpake, transportasyon, at paghahatid para sa iyo.
Pangkalahatang gumagalaw na payo
Idiskonekta ang POWER AT NETWORK CABLES Bago ilipat ang iyong Flex, huwag kalimutang: I-off ang power at tanggalin ito sa power supply. Idiskonekta ang Ethernet o USB cable, kung ginamit.
I-LOCK ANG GANTRY Bago ilipat ang iyong Flex, muling ipasok ang locking screws upang hawakan ang gantry sa lugar. Ang mga gantry locking point ay matatagpuan: Sa kaliwang bahagi ng riles malapit sa harap ng robot. Sa ilalim ng patayong gantry arm. Sa kanang bahagi ng riles malapit sa harap ng robot. Ang pag-lock sa bahaging ito ng gantry ay nangangailangan ng maliit
orange na bracket at dalawang locking screw.
42
OPENRONS FLEX
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
HOME THE GANTRY Maaaring hindi mo gustong i-lock ang gantry kung ililipat mo lang ang robot sa malapit na lokasyon. Kung magpasya kang huwag i-lock ito, gamitin man lang ang touchscreen o ang Opentrons App upang ipadala ang gantry sa posisyon nito sa bahay bago ito patayin. Upang i-home ang gantry sa pamamagitan ng touchscreen, i-tap ang three-dot menu () at pagkatapos ay i-tap ang Home gantry. Upang maiuwi ang gantry sa pamamagitan ng Opentrons App: I-click ang Mga Device. Mag-click sa iyong Flex sa listahan ng device. I-click ang tatlong-tuldok na menu () at pagkatapos ay i-click ang Home gantry.
TANGGAL ANG MGA MODUL Ang mga module sa deck at iba pang mga attachment ay nagdaragdag ng dagdag na timbang sa iyong Flex. Naaapektuhan din ng mga ito ang center of gravity ng robot, na maaaring maging "tippy" kapag itinataas ito. Upang makatulong na gumaan at balansehin ang robot, alisin ang anumang mga nakakabit na instrumento at labware bago mo ito kunin.
I-INSTALL ANG MGA SLOT NG DECK Inirerekomenda naming muling ikabit ang mga puwang ng deck para sa isang malayuang paglipat. Ang pag-secure ng mga slot sa kanilang orihinal na lokasyon ay nakakatulong na maiwasan ang aksidenteng pagkawala. Opsyonal ang muling pagkabit sa mga puwang ng deck para sa mga maikling galaw sa paligid ng lab.
POST-MOVE RECALIBRATION Dapat mong muling i-calibrate ang anumang mga instrumento at module pagkatapos muling i-install ang mga ito. Para sa higit pang mga detalye sa pagkakalibrate ng module, tingnan ang kabanata ng Mga Module.
OPENRONS FLEX
43
KABANATA 2: PAG-INSTALL AT PAGLILIPAT
Mga huling pag-iisip tungkol sa paglipat
Ang iyong Flex ay isang matibay at mahusay na pagkakagawa ng makina, ngunit isa rin itong tumpak na pang-agham na instrumento na idinisenyo upang mahigpit ang mga pagpapaubaya. Bilang resulta, dapat mong tratuhin ito nang may pag-iingat kapag nililipat ito sa loob ng iyong lokal na lugar ng trabaho o ipinapadala ito sa buong bansa. Nangangahulugan ito ng pagsunod sa gabay na ibinigay dito at gamit ang iyong sariling sentido komun tungkol sa kung paano mag-transport ng isang mamahaling piraso ng kagamitan sa laboratoryo. Bottom line: kapag inililipat ang iyong Flex, magkamali sa panig ng pag-iingat at dagdag na padding.
Kung mayroon kang mga tanong o alalahanin tungkol sa paglipat ng iyong Flex, makipag-ugnayan sa amin sa support@opentrons.com.
44
OPENRONS FLEX
KABANATA 3
Paglalarawan ng System
Inilalarawan ng kabanatang ito ang mga sistema ng hardware ng Opentrons Flex, na sumasailalim sa mga pangunahing tampok ng automation ng lab nito. Ang deck, gantry, at instrument mounts ng Opentrons Flex ay nagbibigay-daan sa paggamit ng precision liquidat labware-handling na mga bahagi. Ang on-device na touchscreen ay nagbibigay-daan sa pagpapatakbo ng mga protocol at pagsuri sa katayuan ng robot nang hindi kailangang dalhin ang iyong computer sa lab bench. Ang wired at wireless na koneksyon ay nagbibigay-daan sa karagdagang kontrol mula sa Opentrons App (tingnan ang Software and Operation chapter para sa higit pang mga detalye) at pagpapalawak ng mga feature ng system sa pamamagitan ng pag-attach ng mga peripheral (tingnan ang Modules chapter).
3.1 Mga sangkap na pisikal
Camera
Liwanag ng Katayuan
Touchscreen
Frame
Gantry Deck
Front Door
Mga lokasyon ng mga pisikal na bahagi ng Opentrons Flex.
Mga Takip sa Pangilid na Panghawakan ng Windows
OPENRONS FLEX
45
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Frame at enclosure
Ang frame ng Opentrons Flex robot ay nagbibigay ng rigidity at structural support para sa deck at gantry nito. Ang lahat ng mga mekanikal na subsystem ay nakalagay at naka-mount sa pangunahing frame. Ang frame ay pangunahing gawa sa sheet metal at aluminum extrusions.
Ang metal frame ay may mga bakanteng para sa mga side window at isang front door na gawa sa transparent polycarbonate na nagbibigay-daan sa iyong makita kung ano ang nangyayari sa loob ng Flex. Bukas ang mga bisagra sa harap ng pinto para ma-access ang loob ng system. Kapag nakabukas ang pintuan sa harap, maaari kang mag-attach ng mga instrumento, module, at deck fixtures; ihanda ang deck bago ang isang protocol; o manipulahin ang estado ng deck sa panahon ng isang protocol.
Ang mga puting LED strip sa loob ng itaas na mga gilid ng frame ay nagbibigay ng software-controllable ambient lighting. Maaaring kunan ng larawan ng 2-megapixel camera ang deck at working area para sa pag-record at pagsubaybay sa pagpapatupad ng protocol.
Deck at working area
Ang deck ay ang machined aluminum surface kung saan ang mga automated science protocol ay isinasagawa. Ang deck ay may 12 pangunahing ANSI/SLAS-format na mga slot na maaaring i-reconfigure upang maghawak ng labware, modules, at consumables. Ang mga puwang ng deck ay nakikilala sa pamamagitan ng isang coordinate system, na may puwang A1 sa kaliwa sa likod at puwang D3 sa kanan sa harap.
Expansion Slot (para sa Thermocycler) Working Area
Stagsa Lugar
Mga lugar ng deck sa loob ng Flex.
46
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Ang working area ay ang pisikal na espasyo sa itaas ng deck na naa-access para sa pipetting. Ang labware na inilagay sa mga slot A1 hanggang D3 ay nasa working area.
Ang Opentrons Flex ay may mga naaalis na deck slot para sa lahat ng 12 posisyon sa working area. Ang bawat deck slot ay may mga sulok na labware clip para sa ligtas na paglalagay ng labware sa deck.
Maaari mong muling i-configure ang deck sa pamamagitan ng pagpapalit ng mga slot ng iba pang mga deck fixture, kabilang ang movable trash, waste chute, at module caddies. Ang expansion slot sa likod ng A1 ay ginagamit lamang para gumawa ng karagdagang espasyo para sa Thermocycler Module, na sumasakop sa mga slot A1 at B1.
Tandaan: Ang mga puwang ng deck ay mapapalitan sa loob ng isang column (1, 2, o 3) ngunit hindi sa mga column; Ang mga puwang ng column 1 at column 3 ay mga natatanging piraso sa kabila ng magkatulad na laki nito. Masasabi mo kung aling column ang papasok ng slot sa pamamagitan ng pag-orient sa asul na labware clip sa kaliwang likod.
Dapat mong iwanan ang mga puwang ng deck na naka-install sa mga lokasyon kung saan mo gustong maglagay ng standalone na labware. Ang deck at mga bagay na nakalagay dito ay nananatiling static, maliban kung ginalaw ng gripper o manual intervention.
Staging lugar
Ang stagAng lugar ay karagdagang espasyo sa kanang bahagi ng deck. Maaari kang mag-imbak ng labware sa lokasyong ito pagkatapos i-install ang stagmga puwang ng lugar. Labware na inilagay sa mga slot A4 hanggang D4 ay nasa stagsa lugar. Ang mga flex pipette ay hindi maabot sa stagsa lugar, ngunit maaaring kunin at ilipat ng gripper ang labware papunta at mula sa lokasyong ito. Ang pagdaragdag ng mga karagdagang slot ay nakakatulong na panatilihing available ang working area para sa mga kagamitang ginagamit sa iyong mga automated na protocol.
StagAng mga puwang ng lugar ay kasama sa ilang mga pagsasaayos ng workstation at magagamit din para mabili mula sa https://shop.opentrons.com.
OPENRONS FLEX
47
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
StagLugar na may Naka-install na Mga Puwang
Mga kabit sa deck
Ang mga fixture ay mga hardware na bagay na pumapalit sa mga karaniwang puwang ng deck. Hinahayaan ka nilang i-customize ang layout ng deck at magdagdag ng functionality sa iyong Flex. Sa kasalukuyan, kasama sa mga deck fixture ang stagmga puwang ng lugar, panloob na basurahan, at panlabas na basurahan. Maaari ka lamang mag-install ng mga fixture sa ilang partikular na deck slot. Inililista ng sumusunod na talahanayan ang mga lokasyon ng deck para sa bawat kabit.
Kabit StagMga puwang ng lugar ng Basura bin Waste chute Basura chute na may stagpuwang ng lugar
Mga Puwang A3D3 A1D1 at A3-D3 D3 lamang D3 lamang
Ang mga fixture ay walang kapangyarihan. Hindi naglalaman ang mga ito ng mga electronic o mekanikal na bahagi na nagpapaalam sa kanilang kasalukuyang estado at lokasyon ng deck sa robot. Nangangahulugan ito na kailangan mong gamitin ang tampok na configuration ng deck upang ipaalam sa Flex kung anong mga fixture ang nakakabit sa deck at kung saan matatagpuan ang mga ito.
48
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Maa-access mo ang mga setting ng configuration ng deck mula sa touchscreen sa pamamagitan ng three-dot () menu at mula sa Opentrons App. Tingnan ang seksyon ng Deck Configuration ng Software and Operation chapter para sa impormasyon kung paano i-configure ang deck mula sa touchscreen.
Basura chute
Ang Opentrons Flex Waste Chute ay naglilipat ng mga likido, mga tip, mga tip rack, at mga plato ng balon mula sa Flex enclosure patungo sa isang lalagyan ng basura na inilagay sa ibaba ng panlabas na bukasan nito. Ang waste chute ay nakakabit sa isang deck plate adapter na kasya sa slot D3. Mayroon din itong espesyal na window half panel na hinahayaan ang chute na lumampas sa harap ng robot.
Mga bahagi ng waste chute.
Cover Deck Plate Adapter
Basura Chute
Deck Plate Adapter na may Stagsa Lugar
Stagmga puwang ng lugar
StagAng mga puwang sa lugar ay mga piraso ng deck na katugma sa ANSI/SLAS na pumapalit sa mga karaniwang puwang sa column 3 at nagdaragdag ng mga bagong puwang sa staglugar — lahat nang hindi nawawalan ng espasyo sa lugar ng pagtatrabaho. Maaari kang mag-install ng isang puwang o maximum na apat na puwang upang lumikha ng bagong column (A4 hanggang D4) sa kanang bahagi ng deck. Tandaan, gayunpaman, na ang pagpapalit ng deck slot A3 ay nangangailangan ng paglipat ng basurahan. Sa pamamagitan ng pagdaragdag ng stagSa mga puwang ng lugar sa deck, ang iyong Flex robot ay maaaring mag-imbak ng mas maraming labware at gumana nang mas mahusay.
OPENRONS FLEX
Flex stagpuwang ng lugar.
49
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
PAG-INSTALL NG SLOT
Upang i-install, tanggalin ang mga turnilyo na nakakabit ng karaniwang puwang sa deck at palitan ito ng stagpuwang ng lugar. Pagkatapos ng pag-install, gamitin ang touchscreen o Opentrons App para sabihin sa robot na idinagdag mo bilangtagpuwang ng lugar sa deck.
Pag-install bilangtagpuwang ng lugar.
SLOT COMPATIBILITY StagAng mga puwang sa lugar ay tugma sa mga Flex instrument, module, at labware na nakalista sa ibaba.
Flex component Gripper Pipettes Modules
Labware
Stagpagiging tugma ng lugar
Maaaring ilipat ng Flex Gripper ang labware papunta o mula sa stagmga puwang ng lugar.
Hindi maabot ng mga flex pipette ang stagsa lugar. Gamitin ang gripper upang ilipat ang mga tip rack at labware mula sa stagang lugar sa lugar ng pagtatrabaho bago ang pipetting.
Ang Magnetic Block GEN1 ay maaaring ilagay sa column 3 sa ibabaw ng bilangtagpuwang ng lugar. Hindi sinusuportahan ang mga module sa column 4.
Ang mga pinapagana na module tulad ng Heater-Shaker at Temperature Module ay kasya sa mga caddies na maaaring ilagay sa column 3. Hindi ka maaaring magdagdag bilangtagpuwang ng lugar sa isang posisyon na inookupahan ng isang module caddy.
StagAng mga puwang ng lugar ay may parehong mga sukat ng ANSI/SLAS gaya ng mga karaniwang puwang ng deck. Gumamit ng gripper-compatible na labware sa stagsa lugar, o manu-manong magdagdag at mag-alis ng labware sa lokasyong ito.
50
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Sistema ng paggalaw
Naka-attach sa frame ang gantry, na siyang paggalaw at positioning system ng robot. Ang gantry ay gumagalaw nang hiwalay sa kahabaan ng x- at y-axis upang iposisyon ang mga pipette at gripper sa mga tiyak na lokasyon para sa pagpapatupad ng protocol. Ang paggalaw sa mga axes na ito ay tumpak sa pinakamalapit na 0.1 mm. Ang gantry ay kinokontrol ng 36 VDC hybrid bipolar stepper motors. Kaugnay nito, nakakabit sa gantry ang mga pipette mount at ang extension mount. Ang mga ito ay gumagalaw sa kahabaan ng z-axis upang iposisyon ang mga pipette at gripper sa mga tiyak na lokasyon para sa pagpapatupad ng protocol. Ang paggalaw sa kahabaan ng axis na ito ay kinokontrol ng 36 VDC hybrid bipolar stepper motors. Ang mga electronics na nakapaloob sa gantry ay nagbibigay ng 36 VDC na kapangyarihan at mga komunikasyon sa mga pipette at gripper, kapag nakakabit.
Gantry
Mga Pipette Mount
Extension Mount
Lokasyon ng mga naka-mount na instrumento sa Flex.
Touchscreen at LED display
Ang pangunahing user interface ay ang 7-inch LCD touchscreen, na matatagpuan sa harap na kanan ng robot. Ang touchscreen ay natatakpan ng Gorilla Glass 3 para sa scratch at damage resistance. I-access ang maraming feature ng Flex mismo sa touchscreen, kabilang ang:
OPENRONS FLEX
51
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Pamamahala ng protocol Pag-setup ng protocol, pagpapatupad, at pagsubaybay sa Labware management Mga setting ng robot Mga update ng software at firmware ng system Mga log ng operasyon at mga notification ng error
Para sa higit pang impormasyon sa paggamit ng Flex sa pamamagitan ng touchscreen, tingnan ang seksyon ng Touchscreen Operation ng Software and Operation chapter.
Ang status light ay isang strip ng mga LED sa tuktok na harapan ng robot na nagbibigay ng isang sulyap na impormasyon tungkol sa robot. Ang iba't ibang kulay at pattern ng pag-iilaw ay maaaring makipag-usap sa iba't ibang tagumpay, kabiguan, o idle states:
Kulay ng LED White Neutral na estado
Green Normal na estado
Blue Mandatory states Yellow Abnormal states Red Emergency states
LED pattern Solid Pulsing
Kumurap ng dalawang beses
Solid Pulsing Pulsing
Katayuan ng robot
Naka-on at hindi nagpapatakbo ng protocol Abala ang robot (hal., pag-update ng software o firmware, pag-set up ng protocol run, pagkansela ng protocol run) Kumpleto na ang pagkilos (hal., protocol na naka-imbak, na-update ang software, instrumento na naka-attach o natanggal) Protocol ay tumatakbo Kumpleto na ang Protocol Naka-pause ang Protocol
Solid
Error sa software
Kumurap ng tatlong beses, paulit-ulit
Pisikal na error (hal., pag-crash ng instrumento)
Maaari ding i-disable ang status light sa mga setting ng robot.
52
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
3.2 Pipet
Ang mga Opentrons pipette ay mga aparatong maaaring i-configure na ginagamit upang ilipat ang mga likido sa buong lugar ng pagtatrabaho sa panahon ng pagpapatupad ng mga protocol. Mayroong ilang mga Opentrons Flex pipette, na maaaring humawak ng mga volume mula 1 µL hanggang 1000 µL sa 1, 8, o 96 na channel:
Opentrons Flex 1-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 5-Channel Pipette (1000 µL) Opentrons Flex 8-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (8Channel5)
Ang mga pipette ay nakakabit sa gantry gamit ang mga captive screw sa harap ng pipette. Ang 1-channel at 8-channel na mga pipette ay sumasakop sa isang pipette mount (kaliwa o kanan); ang 96-channel pipette ay sumasakop sa parehong mga mount. Para sa mga detalye sa pag-install ng mga pipette, tingnan ang Pag-install at Pag-calibrate ng Instrumento.
Captive Attachment
Mga turnilyo
Captive Attachment Turnilyo
Ejector
Mga Nozzle (Mga Palitan na O-ring)
Mga Nozzle (Mga Nakapirming O-ring)
Mga lokasyon ng mga bahagi ng 1-, 8-, at 96-channel na mga pipette.
Ejector
OPENRONS FLEX
53
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Kinukuha ng mga pipette ang mga disposable plastic na tip sa pamamagitan ng pagpindot sa mga ito sa mga nozzle ng pipette, at pagkatapos ay ginagamit ang mga tip upang mag-aspirate at maglabas ng mga likido. Ang dami ng kabuuang puwersa na kinakailangan para sa pickup ay tumataas habang mas maraming tip ang nakuha nang sabay-sabay. Para sa mas maliit na bilang ng mga tip, ang pipette ay nakakabit ng mga tip sa pamamagitan ng pagtulak sa bawat pipette nozzle pababa sa isang tip. Upang makamit ang kinakailangang puwersa upang kunin ang isang buong rack ng mga tip, hinihila din ng 96-channel na pipette ang mga tip pataas papunta sa mga nozzle. Ang pagkilos na paghila na ito ay nangangailangan ng paglalagay ng mga tip rack sa isang tip rack adapter, sa halip na direkta sa isang deck slot. Upang itapon ang mga tip (o ibalik ang mga ito sa kanilang rack), itinutulak ng mekanismo ng pipette ejector ang mga tip sa mga nozzle.
Mga pagtutukoy ng pipette
Ang mga Opentrons Flex pipette ay idinisenyo upang mahawakan ang isang malawak na hanay ng mga volume. Dahil sa kanilang malawak na pangkalahatang hanay, maaari silang gumamit ng maraming laki ng mga tip, na nakakaapekto sa kanilang mga katangian sa paghawak ng likido. Sinubukan ng Opentrons ang mga Flex pipette para sa katumpakan at katumpakan sa ilang kumbinasyon ng tip at likido:
Pipette
Flex 1-Channel
50 µL
Flex 1-Channel
1000 µL
Flex 8-Channel
50 µL
Flex 8-Channel
1000 µL
Kapasidad ng Tip 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200µL
Nasubok na Dami 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Katumpakan %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Katumpakan %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Flex 96-Channel
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Isaisip ang katumpakang impormasyong ito kapag pumipili ng mga tip para sa iyong pipette. Sa pangkalahatan, para sa pinakamahusay na mga resulta dapat mong gamitin ang pinakamaliit na tip na nakakatugon sa mga pangangailangan ng iyong protocol.
Tandaan: Ang Opentrons ay nagsasagawa ng volumetric na pagsubok ng mga Flex pipette upang matiyak na natutugunan ng mga ito ang katumpakan at katumpakan na mga detalye na nakalista sa itaas. Hindi mo kailangang i-calibrate ang volume na ibinibigay ng iyong mga pipette bago gamitin. Kailangan mo lang magsagawa ng positional calibration. Tingnan ang susunod na seksyon, pati na rin ang seksyon ng Pag-install ng Pipette ng kabanata ng Pag-install at Relokasyon, para sa mga detalye.
Kasama sa mga serbisyo ng Opentrons Care at Opentrons Care Plus ang taunang pagpapalit ng pipette at mga sertipiko ng pagkakalibrate. Tingnan ang Servicing Flex na seksyon ng Maintenance and Service chapter para sa mga detalye.
Pag-calibrate ng pipette
Kasama sa User Kit ang metal pipette calibration probe, na ginagamit mo sa positional calibration. Habang tumatakbo ang protocol, ligtas na itabi ang probe sa magnetic holder sa harap na haligi ng robot. Sa panahon ng proseso ng pagkakalibrate, ikabit ang probe sa naaangkop na nozzle at i-lock ito sa lugar. Inililipat ng robot ang probe sa mga calibration point sa deck upang sukatin ang eksaktong posisyon ng pipette.
Pipette tip rack adapter
Ang Opentrons Flex 96-channel pipette ay nagpapadala ng apat na tip rack adapter. Ito ay mga precision formed aluminum bracket na inilalagay mo sa deck. Ang mga adapter ay may hawak na Flex 50 L, 200 L, at 1000 µL tip racks.
OPENRONS FLEX
55
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Dahil sa puwersang kasangkot, ang 96-channel pipette ay nangangailangan ng isang adaptor upang ikabit nang maayos ang isang buong tip rack. Sa panahon ng pamamaraan ng pag-attach, ang pipette ay gumagalaw sa ibabaw ng adaptor, ibinababa ang sarili sa mga mounting pin, at hinihila ang mga tip papunta sa mga pipette sa pamamagitan ng pag-angat ng adapter at tip rack. Ang paghila sa mga tip, sa halip na pagtulak, ay nagbibigay ng leverage na kinakailangan upang ma-secure ang mga tip sa mga pipette at maiwasan ang pag-warping sa ibabaw ng deck. Kapag natapos na, ibinababa ng 96-channel pipette ang adapter at walang laman na tip rack papunta sa deck. Tingnan ang seksyong Mga Tip at tip rack ng Labware chapter para sa higit pang impormasyon.
Bahagyang tip pickup
Ang 96-channel pipette ay maaaring kumuha ng isang buong rack ng mga tip o isang mas maliit na bilang ng mga tip. Pinapataas nito ang bilang ng mga application na maaari mong gawin gamit ang 96-channel pipette, dahil sinasakop nito ang parehong pipette mount.
Sa kasalukuyan, sinusuportahan ng 96-channel na pipette ang partial tip pickup para sa 8 tip sa isang column layout. Sa pagsasaayos na ito, ginagamit ng pipette ang pinakakaliwa nitong mga nozzle upang kunin ang mga tip mula kanan-pakaliwa mula sa isang tip rack, o ang pinakakanang mga nozzle nito upang kunin ang mga tip mula kaliwa-pakanan mula sa isang tip rack.
Kapag kumukuha ng mas kaunti sa 96 na tip mula sa isang tip rack, dapat na direktang ilagay ang rack sa deck, hindi sa tip rack adapter.
Mga sensor ng pipette
Ang mga Opentrons Flex pipette ay may ilang mga sensor na nagde-detect at nagtatala ng data tungkol sa status ng pipette at anumang mga tip na nakuha nito.
CAPACITANCE SENSORS
Sa kumbinasyon ng isang metal probe o conductive tip, ang mga capacitance sensor ay nakakakita kapag ang pipette ay nakikipag-ugnayan sa isang bagay. Ang pagtuklas ng contact sa pagitan ng metal probe at ng deck ay ginagamit sa mga automated pipette calibration at mga proseso ng pagkakalibrate ng module.
Ang 1-channel pipette ay may isang capacitance sensor, habang ang multi-channel pipette ay may dalawa: sa channel 1 at 8 ng 8-channel pipette, at sa channel 1 at 96 (posisyon A1 at H12) ng 96-channel pipette.
56
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
OPTICAL TIP PRESENCE SENSORS
Nakikita ng switch ng photointerruptor ang posisyon ng mekanismo ng tip ejector ng pipette, na nagpapatunay kung matagumpay na nakuha o nalaglag ang mga tip. Ang 1-channel, 8-channel, at 96-channel na pipette ay lahat ay may iisang optical sensor na sinusubaybayan ang tip attachment sa lahat ng channel.
Mga update sa firmware ng pipette
Awtomatikong ina-update ng Opentrons Flex ang pipette firmware upang mapanatili itong naka-sync sa bersyon ng software ng robot. Ang mga update sa firmware ng pipette ay karaniwang mabilis, at nangyayari sa tuwing:
Magkabit ka ng pipette. Nag-restart ang robot.
Kung, sa anumang kadahilanan, ang iyong pipette firmware at mga bersyon ng software ng robot ay hindi na-sync, maaari mong manual na i-update ang firmware sa Opentrons App.
1. I-click ang Mga Device. 2. Mag-click sa iyong Flex sa listahan ng device. 3. Sa ilalim ng Mga Instrumento at Module, ang out-of-sync na pipette ay magpapakita ng babalang babasahin ng banner
"Available ang pag-update ng firmware." I-click ang I-update ngayon upang simulan ang pag-update.
kaya mo view ang kasalukuyang naka-install na bersyon ng firmware ng anumang nakalakip na pipette. Sa touchscreen, pumunta sa Mga Instrumento at i-tap ang pangalan ng pipette. Sa Opentrons App, hanapin ang pipette card sa ilalim ng Mga Instrumento at Module, i-click ang tatlong tuldok na menu (), at pagkatapos ay i-click ang Tungkol sa pipette.
3.3 Gripper
Ang gripper ay gumagalaw ng labware sa buong lugar ng trabaho at staglugar sa panahon ng pagpapatupad ng mga protocol. Ang gripper ay nakakabit sa extension mount, na hiwalay sa pipette mounts; ang gripper ay maaaring gamitin sa anumang pagsasaayos ng pipette. Para sa mga detalye sa pag-install ng gripper, tingnan ang Pag-install at Pag-calibrate ng Instrumento.
Maaaring ilipat ng gripper ang labware sa buong deck at papunta o off ng mga module. Ang gripper ay maaaring manipulahin ang ilang ganap na skirted well plates, deep well plates, at tip racks. Para sa higit pang mga detalye sa kung anong labware ang maaaring ilipat ng gripper, tingnan ang Labware at ang Opentrons Flex Gripper na seksyon ng Labware chapter, o kumonsulta sa Opentrons Labware Library.
OPENRONS FLEX
57
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Mga pagtutukoy ng gripper
Ang mga panga ay gumaganap ng pangunahing paggalaw ng gripper, na kung saan ay upang buksan o isara ang dalawang parallel na paddle upang maglapat o maglabas ng puwersa sa mga gilid ng labware. Ang paggalaw ng mga panga ay kinokontrol ng isang 36 VDC brushed motor na konektado sa isang rack-and-pinion gear system.
Upang ilipat ang isang piraso ng labware na nahawakan ng mga panga, itinataas ng gantry ang gripper sa kahabaan ng z-axis, inililipat ito sa gilid, at pagkatapos ay ibinababa ito sa bagong posisyon ng labware.
Mga lokasyon ng mga bahagi ng gripper.
Mga attachment na turnilyo
Calibration pin Jaws Paddles
Pag-calibrate ng gripper
Ang gripper ay may kasamang metal calibration pin. Ang calibration pin ay matatagpuan sa isang recessed storage area sa ibabang bahagi ng gripper. Hinahawakan ng magnet ang pin sa lugar. Upang alisin ang pin ng pagkakalibrate, hawakan ito gamit ang iyong mga daliri at hilahin nang marahan. Upang palitan ang pin, ibalik ito sa puwang ng imbakan. Malalaman mong ligtas ito kapag napunta ito sa lugar.
Kapag nag-calibrate sa gripper, ikabit ang pin sa bawat panga nang magkakasunod. Inililipat ng robot ang pin sa mga calibration point sa deck upang sukatin ang eksaktong posisyon ng gripper.
Habang tumatakbo ang protocol, ilagay ang pin sa lugar ng imbakan nito para sa pag-iingat. Makipag-ugnayan sa amin sa support@opentrons.com kung mawala mo ang calibration pin.
Mga update ng firmware ng Gripper
Awtomatikong ina-update ng Opentrons Flex ang gripper firmware upang mapanatili itong naka-sync sa bersyon ng software ng robot. Karaniwang mabilis ang mga pag-update ng firmware ng Gripper, at nangyayari tuwing:
58
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Ikabit mo ang gripper. Nag-restart ang robot.
Kung, sa anumang kadahilanan, ang mga bersyon ng iyong gripper firmware at robot software ay hindi na-sync, maaari mong manual na i-update ang firmware sa Opentrons App.
1. I-click ang Mga Device. 2. Mag-click sa iyong Flex sa listahan ng device. 3. Sa ilalim ng Mga Instrumento at Module, ang out-of-sync na gripper ay magpapakita ng babalang babasahin ng banner
"Available ang pag-update ng firmware." I-click ang I-update ngayon upang simulan ang pag-update.
kaya mo view ang kasalukuyang naka-install na bersyon ng firmware ng gripper. Sa touchscreen, pumunta sa Mga Instrumento at i-tap ang gripper. Sa Opentrons App, hanapin ang gripper card sa ilalim ng Mga Instrumento at Module, i-click ang tatlong tuldok na menu (), at pagkatapos ay i-click ang Tungkol sa gripper.
3.4 Emergency Stop Pendant
Ang Emergency Stop Pendant (E-stop) ay isang nakalaang pindutan ng hardware para sa mabilis na pagpapahinto ng paggalaw ng robot. Nangangailangan ang Opentrons Flex ng isang functional, nakahiwalay na E-stop na ikabit sa lahat ng oras. Kapag pinindot mo ang stop button, kakanselahin ng Flex ang anumang tumatakbong protocol o setup ng workflow sa lalong madaling panahon at pinipigilan ang karamihan sa paggalaw ng robot.
Kailan gagamitin ang E-stop
Maaaring kailanganin mong pindutin ang E-stop:
Kapag may napipintong panganib ng pinsala o pinsala sa isang gumagamit. Kapag may napipintong panganib na masira ang robot o iba pang hardware. Kapag sampAng mga les o reagents ay nasa napipintong panganib ng kontaminasyon. Pagkatapos ng banggaan ng hardware.
Sa isip, hindi mo na kailangang pindutin ang E-stop (maliban sa madalang na pagsubok sa kalidad ng hardware).
Huwag gamitin ang E-stop para kanselahin ang normal, inaasahang mga operasyon. Sa halip, gamitin ang software button sa touchscreen o sa Opentrons App. Ang pag-pause sa pamamagitan ng software ay magbibigay-daan sa iyong ipagpatuloy o kanselahin ang iyong protocol, samantalang ang pagpindot sa E-stop ay palaging makakansela kaagad sa protocol.
OPENRONS FLEX
59
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Pakikipag-ugnayan at pagpapalabas ng E-stop
Ang E-stop ay may press-to-engage, twist-to-release na mekanismo.
Makipag-ugnayan: Itulak nang mahigpit ang pulang button. Papasok ang Flex sa huminto na estado. Lutasin: Sa sandaling tumigil, ligtas na tugunan ang anumang mga problema sa lugar ng trabaho, tulad ng paglilinis ng mga spills,
pag-alis ng labware, o paglipat ng gantry (dapat itong gumalaw nang malaya at madali sa pamamagitan ng kamay). Paglabas: I-twist ang button clockwise. Ito ay lilitaw sa kanyang nakahiwalay na posisyon. I-reset: Sa touchscreen o sa Opentrons App, kumpirmahin na handa ka na para sa Flex na magpatuloy
galaw. Babalik ang gantry sa posisyon nito sa bahay at magpapatuloy ang aktibidad ng module.
Sa huminto na estado, ang Flex at konektadong hardware ay kikilos tulad ng sumusunod:
Hardware Gantry Pipettes
Gripper
Module ng Heater-Shaker
Temperature Module Thermocycler Module Status light Touchscreen
Pag-uugali
Ang awtomatikong pahalang na paggalaw ay itinigil. Pinapayagan ang manu-manong pahalang na paggalaw.
Ang patayong paggalaw ng mga pipette ay itinigil. Ang mga preno ng motor sa mga patayong palakol ay nakatutok upang maiwasan
mga pipette mula sa pagkahulog. Ang galaw ng plunger at tip pickup ay itinigil.
Ang patayong paggalaw ng gripper ay itinigil. Ang preno ng motor sa vertical axis ay nakatutok upang maiwasan ang
gripper mula sa pagkahulog. Nananatiling naka-enable ang jaw motors na nagsasagawa ng gripping force, kaya
hindi ibababa ng gripper ang labware na maaaring dala nito.
Huminto ang shaker at umuwi. Bumukas ang labware latch. Ang pag-init ay hindi pinagana.
Ang pag-init o paglamig ay hindi pinagana.
Ang pag-init o paglamig ay hindi pinagana.
Ang ilaw ay nagiging pula.
Ang isang mensahe ng pagkansela ay tumatagal sa screen. Ang isang on-screen indicator ay nagpapakita kung ikaw ay matagumpay
tinanggal ang stop button.
60
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
3.5 Mga Koneksyon
I-on/I-off ang Switch
Mga Cover ng gilid
Mga USB-A Port
IEC Power Inlet
Mga Port AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Koneksyon ng kuryente
Ang Opentrons Flex ay kumokonekta sa isang pinagmumulan ng kuryente sa pamamagitan ng isang karaniwang pumapasok na IEC-C14. Ang robot ay naglalaman ng panloob na full-range na AC/DC power supply, tumatanggap ng 100 VAC, 240/50 Hz input at kino-convert ito sa 60 VDC. Ang lahat ng iba pang panloob na electronics ay pinapagana ng 36 VDC supply.
Babala: Gamitin lamang ang power cord na ibinigay kasama ng robot. Huwag gumamit ng power cord na may hindi sapat na kasalukuyang o voltage ratings.
Panatilihing walang mga sagabal ang power cord para maalis mo ito kung kinakailangan.
Mayroon ding CR1220 coin cell na baterya upang paandarin ang real-time na orasan ng robot kapag hindi nakakonekta sa mains power. Ang baterya ay matatagpuan sa loob ng touchscreen enclosure. Makipag-ugnayan sa Opentrons Support para sa karagdagang impormasyon kung sa tingin mo ay kailangan mong palitan ang baterya.
OPENRONS FLEX
61
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
USB at auxiliary na koneksyon
Ang Opentrons Flex ay mayroong 10 kabuuang USB port na matatagpuan sa iba't ibang lugar ng robot, na nagsisilbi sa iba't ibang layunin.
Ang 8 hulihan na USB-A port (na may numerong USB-1 hanggang USB-8) at 2 auxiliary port (M12 connector na may numerong AUX-1 at AUX-2) ay para sa pagkonekta ng Opentrons modules at accessories. Tingnan ang kabanata ng Modules para sa higit pang impormasyon sa pagkonekta sa mga device na ito at paggamit sa mga ito sa iyong mga protocol. Ang hulihan na USB-B port ay para sa pagkonekta sa robot sa isang laptop o desktop computer, upang magtatag ng komunikasyon sa Opentrons App na tumatakbo sa nakakonektang computer. Ang harap na USB-A port (USB-9), na matatagpuan sa ibaba ng touchscreen display, ay may parehong functionality gaya ng mga hulihan na USB-A port.
Tandaan: Ang mga USB port ay power-limited para protektahan ang robot at mga konektadong device. Ang paghahatid ng kuryente ay nahahati sa loob sa tatlong pangkat ng port: ang kaliwang likurang USB-A port (USB-1 hanggang USB-4), ang kanang likurang USB-A port (USB-5 hanggang USB-8), at ang harap na USB-A daungan. Ang bawat isa sa mga pangkat na ito ay maghahatid ng maximum na 500 mA sa mga nakakonektang USB 2.0compatible na device.
Mga koneksyon sa network
Maaaring kumonekta ang Opentrons Flex sa isang local area network sa pamamagitan ng wired (Ethernet) o wireless (Wi-Fi) na koneksyon.
Ang Ethernet port ay matatagpuan sa likuran ng robot. Ikonekta ito sa isang Ethernet hub o i-on ang iyong network. O, simula sa bersyon 7.1.0 ng robot system, direktang ikonekta ito sa isang Ethernet port sa iyong computer. Sinusuportahan ng internal na Wi-Fi module ang 802.11 ac/a/b/g/n network na may dual-band 2.4/5 GHz antenna.
62
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
3.6 Mga detalye ng system
Pangkalahatang mga pagtutukoy
Mga Sukat Timbang Mga puwang ng Deck
Touchscreen
Wi-Fi Ethernet USB
Camera Robot power input
Pangunahing supply ng voltage pagbabagu-bago ng mains supply frequency fluctuation System ng pamamahagi Kasalukuyang supply ng short-circuit Komposisyon ng frame Komposisyon ng bintana Mga kinakailangan sa bentilasyon
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 in (W, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-compatible na mga slot sa working area
(maa-access sa mga pipette) 4 na karagdagang puwang para sa stagmga tip at labware
(maa-access lang ng gripper) 7-inch LCD touchscreen na may scratch-and damage-resistant Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n dual-band (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A port 1 USB-B port USB 2.0 na bilis
2MP, larawan at video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Matibay na bakal at disenyo ng aluminyo ng CNC
Matatanggal na polycarbonate sa gilid na mga bintana at pintuan sa harap Hindi bababa sa 20 cm / 8 sa pagitan ng unit at isang dingding
OPENRONS FLEX
63
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Mga kinakailangan sa konektadong PC
Gumagana ang Opentrons App sa: Windows 10 o mas bago macOS 10.10 o mas bago Ubuntu 12.04 o mas bago
Mga pagtutukoy sa kapaligiran
Mga kondisyon sa kapaligiran Temperatura sa paligid Kamag-anak na kahalumigmigan Degree ng polusyon
Panloob na paggamit lang +20 hanggang +25 °C (inirerekomenda) 40%, non-condensing (inirerekomenda) 60 (non-conductive pollution lang)
Para sa karagdagang impormasyon sa mga katanggap-tanggap na kondisyon sa kapaligiran para sa paggamit at transportasyon, tingnan ang seksyong Mga Kondisyong Pangkapaligiran ng Kabanatang Pag-install at Relokasyon.
Mga Sertipikasyon
Kumpleto ang mga sertipikasyon Hindi na-certify/na-validate
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Ang isang buod ng impormasyon ng certification ay naka-print sa isang sticker sa likod ng Flex, malapit sa on/off switch. Para sa detalyadong impormasyon sa sertipikasyon at pagsunod, tingnan ang seksyong Regulatory Compliance sa Panimula.
Serial number
Ang bawat Flex ay may natatanging serial number. Ang format ng serial number ay nagbibigay ng karagdagang impormasyon, kabilang ang petsa ng paggawa ng robot. Para kay example, ang serial number na FLXA1020231007001 ay magsasaad ng:
64
OPENRONS FLEX
KABANATA 3: PAGLALARAWAN NG SISTEMA
Mga Character FLX A10 2023 10 07 001
Bersyon ng Modelo ng Kategorya Taon Buwan Araw Unit
Ibig sabihin Ang robot ay isang Opentrons Flex. Isang code para sa produksyon na bersyon ng robot. Ginawa ang robot noong 2023. Ginawa ang robot noong Oktubre. Ang robot ay ginawa noong ika-7 araw ng buwan. Isang natatanging numero para sa mga robot na ginawa sa isang partikular na araw.
Mahahanap mo ang serial number para sa iyong Flex:
Sa certification sticker sa likod ng Flex, malapit sa on/off switch. Sa reverse side ng touchscreen (patungo sa working area). Sa Opentrons App sa ilalim ng Mga Device > iyong Flex > Mga setting ng Robot > Advanced.
OPENRONS FLEX
65
KABANATA 4
Mga module
Ang Opentrons Flex ay sumasama sa isang bilang ng Opentrons hardware modules. Ang lahat ng mga module ay mga peripheral na sumasakop sa mga puwang ng deck, at karamihan ay kinokontrol ng robot sa pamamagitan ng isang koneksyon sa USB.
Inilalarawan ng kabanatang ito ang mga function at pisikal na detalye ng mga module na katugma sa Opentrons Flex system, pati na rin kung paano i-attach at i-calibrate ang mga ito. Para sa karagdagang detalye sa pag-setup at paggamit ng module, kumonsulta sa mga manwal para sa mga indibidwal na module. Para sa mga detalye sa pagsasama ng mga module sa iyong mga protocol, tingnan ang seksyon ng Protocol Designer ng Protocol Development chapter o ang online na dokumentasyon ng Python Protocol API.
4.1 Mga suportadong module
Ang Opentrons Flex ay katugma sa apat na uri ng on-deck Opentrons modules:
Ang Heater-Shaker Module ay nagbibigay ng on-deck heating at orbital shaking. Ang module ay maaaring painitin sa 95 °C, at maaaring magkalog sampmas mababa mula 200 hanggang 3000 rpm.
Ang Magnetic Block ay isang passive device na nagtataglay ng labware malapit sa mga high-strength na neodymium magnet nito. Ang OT-2 Magnetic Module GEN1 at GEN2, na aktibong gumagalaw sa kanilang mga magnet pataas at pababa kaugnay ng labware, ay hindi suportado sa Opentrons Flex.
Ang Temperature Module ay isang mainit at malamig na plate module na nakakapagpapanatili ng steady state na temperatura sa pagitan ng 4 at 95 °C.
Ang Thermocycler Module ay nagbibigay ng on-deck, ganap na automated na thermocycling, na nagpapagana ng automation ng upstream at downstream na mga hakbang sa daloy ng trabaho. Ang Thermocycler GEN2 ay ganap na katugma sa gripper. Ang Thermocycler GEN1 ay hindi maaaring gamitin sa gripper, at samakatuwid ay hindi suportado sa Opentrons Flex.
Ang ilang mga module na orihinal na idinisenyo para sa OT-2 ay katugma sa Flex, gaya ng nakabuod sa talahanayan sa ibaba. Ang isang checkmark ay nagpapahiwatig ng pagiging tugma, at ang isang X ay nagpapahiwatig ng hindi pagkakatugma.
66
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
Uri at henerasyon ng device Heater-Shaker Module GEN1 Magnetic Module GEN1 Magnetic Module GEN2 Magnetic Block GEN1 Temperature Module GEN1 Temperature Module GEN2 Thermocycler Module GEN1 Thermocycler Module GEN2 HEPA Module
OT-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Module caddy system
Ang mga katugmang module ay idinisenyo upang magkasya sa mga caddies na sumasakop sa espasyo sa ibaba ng deck. Ang system na ito ay nagbibigay-daan sa labware sa itaas ng mga module na manatiling mas malapit sa ibabaw ng deck, at nagbibigay-daan din ito para sa ibaba-deck na pagruruta ng cable upang manatiling malinis ang deck habang tumatakbo ang iyong protocol.
Mga Caddies para sa Heater-Shaker, Temperature, at Thermocycler Module.
OPENRONS FLEX
67
KABANATA 4: MGA MODYUL
Upang magkasya ang isang module sa ibabaw ng deck, dapat muna itong ilagay sa kaukulang module caddy. Ang bawat uri ng katugmang module ay may sariling disenyo ng caddy na nakaayon sa module at labware nang eksakto sa nakapalibot na deck. (Ang exception ay ang Magnetic Block, na hindi nangangailangan ng power o USB cable routing at sa gayon ay direktang nakaupo sa ibabaw ng deck.) Ang mga caddies para sa mga module na sumasakop sa isang slot ay maaaring ilagay saanman sa column 1 o 3; ang Thermocycler ay maaari lamang ilagay sa mga slot A1 at B1 nang sabay-sabay.
Sa pangkalahatan, para mag-install ng module caddy:
1. Alisin ang anumang mga puwang ng deck mula sa lokasyon kung saan pupunta ang module. 2. Ilagay ang module sa caddy nito at higpitan ang mga anchor nito. 3. Iruta ang module power at mga USB cable sa mga takip sa gilid, pataas sa walang laman na slot ng deck, at
ikabit ang mga ito sa modyul. 4. Ilagay ang module caddy sa slot at i-screw ito sa lugar.
Para sa eksaktong mga tagubilin sa pag-install, kumonsulta sa Quickstart Guide o Instruction Manual para sa partikular na module. Ang mga koneksyon ng cable at paraan ng pagkakabit sa caddy ay nag-iiba ayon sa module.
4.3 Pag-calibrate ng module
Kapag una kang nag-install ng module sa Flex, kailangan mong magpatakbo ng automated positional calibration. Ang prosesong ito ay katulad ng positional calibration para sa mga instrumento, at tinitiyak na ang Flex ay lilipat sa eksaktong tamang mga lokasyon para sa pinakamainam na pagganap ng protocol. Sa panahon ng pag-calibrate, lilipat ang Flex sa mga lokasyon sa isang module calibration adapter, na mukhang katulad ng mga calibration square na bahagi ng naaalis na mga puwang ng deck.
Mga adapter ng pagkakalibrate para sa Heater-Shaker, Temperature, at Thermocycler Module.
Kinakailangan ang pagkakalibrate ng module para sa lahat ng module na nag-i-install sa pamamagitan ng caddy: ang Heater-Shaker, Temperature, at Thermocycler Module. Ang Magnetic Block ay hindi nangangailangan ng pagkakalibrate, at handa nang gamitin sa sandaling ilagay mo ito sa deck.
68
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
Kailan mag-calibrate ng mga module
Awtomatikong sinenyasan ka ng Flex na magsagawa ng pag-calibrate kapag kumonekta at pinagana mo ang isang module na walang anumang nakaimbak na data ng pagkakalibrate. (Maaari mong i-dismiss ang prompt na ito, ngunit hindi mo magagawang magpatakbo ng mga protocol sa module hangga't hindi mo ito na-calibrate.)
Kapag nakumpleto mo na ang pagkakalibrate, iniimbak ng Flex ang data ng pagkakalibrate at serial number ng module para magamit sa hinaharap. Hindi ka ipo-prompt ng Flex na mag-recalibrate maliban kung tatanggalin mo ang data ng pagkakalibrate para sa module na iyon sa mga setting ng robot. Maaari mong malayang i-on at i-off ang iyong module, o kahit na ilipat ito sa isa pang slot ng deck, nang hindi na kailangang i-recalibrate. Kung gusto mong i-recalibrate, maaari mong simulan ang proseso anumang oras mula sa module card sa Opentrons App. (Hindi available ang recalibration mula sa touchscreen.)
Paano i-calibrate ang mga module
Gagabayan ka ng mga tagubilin sa touchscreen o sa Opentrons App sa proseso ng pagkakalibrate. Sa pangkalahatan, ang mga hakbang ay:
1. Ipunin ang mga kinakailangang kagamitan, kabilang ang module calibration adapter at pipette calibration probe. 2. Ilagay ang calibration adapter sa ibabaw ng module at tiyaking ganap itong pantay.
Maaaring kailanganin ng ilang module na i-fasten ang adapter sa module. 3. Ikabit ang calibration probe sa isang pipette. 4. Awtomatikong lilipat ang Flex upang hawakan ang ilang mga punto sa adapter ng pagkakalibrate at i-save ang mga ito
mga halaga ng pagkakalibrate para magamit sa hinaharap.
Kapag kumpleto na ang pagkakalibrate at naalis mo na ang adapter at probe, magiging handa na ang module para magamit sa mga protocol.
Kahit kailan, kaya mo view at pamahalaan ang iyong data ng pagkakalibrate ng module sa Opentrons App. Pumunta sa Mga Setting ng Robot para sa iyong Flex at mag-click sa tab na Calibration.
OPENRONS FLEX
69
KABANATA 4: MGA MODYUL
4.4 Heater-Shaker Module GEN1
Mga tampok ng Heater-Shaker
PAG-INIT AT PAG-Alog
Nagbibigay ang Heater-Shaker ng on-deck heating at orbital shaker. Maaaring painitin ang module sa 95 °C, na may sumusunod na temperatura profile:
Saklaw ng temperatura: 37 °C Katumpakan ng temperatura: ±95 °C sa 0.5 °C Pagkakapareho ng temperatura: ±55 °C sa 0.5 °CRamp rate: 10 °C/min
Ang module ay maaaring magkalog samples mula 200 hanggang 3000 rpm, kasama ang mga sumusunod na nanginginig na profile:
Orbital diameter: 2.0 mm Orbital na direksyon: Clockwise Speed range: 200 rpm Speed accuracy: ±3000 rpm
Ang module ay may powered labware latch para sa pag-secure ng mga plate sa module bago ang pagyanig.
70
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
THERMAL ADAPTERS Ang isang katugmang thermal adapter ay kinakailangan para sa pagdaragdag ng labware sa Heater-Shaker. Ang mga adaptor ay maaaring mabili nang direkta mula sa Opentrons sa https://shop.opentrons.com. Ang kasalukuyang available na Thermal Adapter ay kinabibilangan ng:
Universal Flat Adapter
PCR Adapter
Deep Well Adapter
96 Flat Bottom Adapter
KONTROL NG SOFTWARE
Ang Heater-Shaker ay ganap na na-program sa Protocol Designer at sa Python Protocol API. Ang Python API ay nagbibigay-daan din para sa iba pang mga hakbang sa protocol na maisagawa nang magkatulad habang ang Heater-Shaker ay aktibo. Tingnan ang mga command na hindi nagba-block sa dokumentasyon ng API para sa mga detalye sa pagdaragdag ng mga parallel na hakbang sa iyong mga protocol.
Sa labas ng mga protocol, maaaring ipakita ng Opentrons App ang kasalukuyang status ng Heater-Shaker at direktang makokontrol ang heater, shaker, at labware latch.
OPENRONS FLEX
71
KABANATA 4: MGA MODYUL
Mga pagtutukoy ng Heater-Shaker
Mga Dimensyon Timbang Module power input Power adapter input Voltage pagbabagu-bago Overvoltage Pagkonsumo ng kuryente
152 × 90 × 82 mm (L/W/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategorya II Idle: 10 W
Karaniwan: Panginginig: 4 W Pag-init: 11 W Pag-init at pag-alog: 10 W
Mga kondisyon sa kapaligiran Temperatura sa paligid Relatibong halumigmig Altitude Degree ng polusyon
Maximum: 125 W Panloob na paggamit lamang 130 °C Hanggang sa 20%, hindi nakakalason Hanggang 25 m sa ibabaw ng antas ng dagat 80
72
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
4.5 Magnetic Block GEN1
Mga tampok ng Magnetic Block
Ang Opentrons Magnetic Block GEN1 ay isang magnetic 96-well plate holder. Ginagamit ang mga magnetic block sa mga protocol na umaasa sa magnetism upang alisin ang mga particle mula sa suspension at panatilihin ang mga ito sa mga well plate sa panahon ng paghuhugas, pagbabanlaw, o iba pang mga pamamaraan ng elution. Para kay example, awtomatikong paghahanda ng NGS; naglilinis ng genomic at mitochondrial DNA, RNA, o mga protina; at iba pang mga pamamaraan ng pagkuha ay lahat ng mga kaso ng paggamit na maaaring may kinalaman sa mga magnetic block.
MAGNETIC COMPONENTS
Ang Magnetic Block ay hindi pinapagana, hindi naglalaman ng anumang mga elektronikong sangkap, at hindi nagpapagalaw ng mga magnetic bead pataas o pababa sa solusyon. Ang mga balon ay binubuo ng 96 na high-strength na neodymium ring magnet na nakadikit sa isang spring-loaded na kama, na tumutulong na mapanatili ang mga tolerance sa pagitan ng block at pipette habang nagpapatakbo ng mga automated na protocol.
KONTROL NG SOFTWARE
Ang Magnetic Block GEN1 ay ganap na na-program sa Protocol Designer at sa Python Protocol API.
OPENRONS FLEX
73
KABANATA 4: MGA MODYUL
Sa labas ng mga protocol, gayunpaman, ang touchscreen at ang Opentrons App ay hindi alam at hindi maaaring ipakita ang kasalukuyang katayuan ng Magnetic Block GEN1. Ito ay isang unpowered module. Hindi ito naglalaman ng mga electronic o mekanikal na bahagi na maaaring makipag-ugnayan sa Flex robot. "Kinokontrol" mo ang Magnetic Block sa pamamagitan ng mga protocol na gumagamit ng Opentrons Flex Gripper upang magdagdag at mag-alis ng labware mula sa module na ito.
Mga pagtutukoy ng Magnetic Block
Mga Dimensyon Timbang Module kapangyarihan Magnet grade Mga kondisyon sa kapaligiran Temperatura sa paligid Relatibong halumigmig Altitude Degree ng polusyon
.
74
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
4.6 Temperatura Module GEN2
Mga tampok ng Temperatura Module
PAG-INIT AT PAGPANIG
Ang Opentrons Temperature Module GEN2 ay isang mainit at malamig na plate module. Madalas itong ginagamit sa mga protocol na nangangailangan ng pag-init, pagpapalamig, o mga pagbabago sa temperatura. Maaaring maabot at mapanatili ng module ang mga temperatura mula 4 °C hanggang 95 °C sa loob ng ilang minuto, depende sa configuration at content ng module.
MGA THERMAL BLOCKS
Upang hawakan ang labware sa temperatura, ang module ay gumagamit ng aluminum thermal blocks. Ang module ay may kasamang 24well at 96-well thermal blocks. Ang Temperature Module caddy ay may kasamang deep well block at flat bottom block na idinisenyo para gamitin sa Flex Gripper. Ang mga bloke ay naglalaman ng 1.5 mL at 2.0 mL na tubo, 96-well PCR plate, PCR strips, deep well plate, at flat bottom plate.
OPENRONS FLEX
75
KABANATA 4: MGA MODYUL
Tandaan: Nagpapadala rin ang module na may flat bottom block para sa OT-2. Huwag gamitin ang OT-2 block na may Flex. Ang flat bottom block para sa Flex ay may mga salitang "Opentrons Flex" sa itaas na ibabaw nito. Ang para sa OT-2 ay hindi.
24-well thermal block
96-well thermal block
Deep well thermal block
Flat bottom thermal block para sa Flex
MGA PALIGO NG TUBIG AT PAG-INIT
Dahil ang hangin ay isang magandang thermal insulator, ang mga gaps sa pagitan ng labware at isang thermal block ay maaaring makaapekto sa time-totemperature performance ng Temperature Module. Ang paglalagay ng kaunting tubig sa 24- o 96-well thermal blocks ay nag-aalis ng mga air gaps at nagpapabuti ng heating efficiency. Ang perpektong dami ng tubig ay depende sa thermal block at labware. Tingnan ang Temperature Module White Paper para sa mga karagdagang rekomendasyon.
KONTROL NG SOFTWARE
Ang Temperature Module ay ganap na na-program sa Protocol Designer at sa Python Protocol API.
Sa labas ng mga protocol, maaaring ipakita ng Opentrons App ang kasalukuyang status ng Temperature Module at direktang makokontrol ang temperatura ng surface plate.
76
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
Mga detalye ng Temperature Module
Mga Dimensyon Timbang Module kapangyarihan
Mga kondisyon sa kapaligiran Temperatura sa paligid Relatibong halumigmig Altitude Degree ng polusyon
194 × 90 × 84 mm (L/W/H) 1.5 kg Input: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Output: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Panloob na paggamit lamang <219.6 °C (inirerekomenda para sa pinakamainam na paglamig ) Hanggang sa 22%, hindi nagpapalapot Hanggang 60 m sa ibabaw ng antas ng dagat 2000
4.7 Thermocycler Module GEN2
OPENRONS FLEX
77
KABANATA 4: MGA MODYUL
Mga tampok ng Thermocycler
Ang Opentrons Thermocycler Module GEN2 ay isang ganap na automated on-deck thermocycler, na nagbibigay ng hands-free PCR sa isang 96-well plate na format. Ang pinainit na takip at disposable seal nito ay magkasya nang mahigpit sa ibabaw ng plato, na tinitiyak ang mahusay na sampang pag-init at kaunting pagsingaw.
HEATING AND COOLING Ang Thermocycler's block ay maaaring magpainit at magpalamig, at ang takip nito ay maaaring uminit, na may sumusunod na temperatura profile: Saklaw ng temperatura ng thermal block: 4 °C Thermal block maximum heating ramp rate: 4.25 °C/s mula sa GEN2 ambient hanggang 95 °C Thermal block maximum cooling ramp rate: 2.0 °C/s mula 95 °C hanggang sa ambient Saklaw ng temperatura ng takip: 37 °C Katumpakan ng temperatura ng takip: ±110 °C Ang awtomatikong takip ay maaaring buksan o isara kung kinakailangan sa panahon ng pagpapatupad ng protocol.
THERMOCYCLER PROFILES Ang Thermocycler ay maaaring magsagawa ng profiles: awtomatikong umiikot sa isang pagkakasunud-sunod ng mga bloke na temperatura upang magsagawa ng mga reaksyong sensitibo sa init.
RUBBER AUTOMATION SEALS Ang Thermocycler ay may kasamang rubber automation seal upang makatulong na mabawasan ang evaporation. Ang bawat selyo ay dapat na isterilisado bago gamitin at maaaring gamitin para sa ilang pagtakbo. Ang mga karagdagang seal ay maaaring mabili nang direkta mula sa Opentrons sa https://shop.opentrons.com.
SOFTWARE CONTROL Ang Thermocycler ay ganap na naa-program sa Protocol Designer at sa Python Protocol API. Sa labas ng mga protocol, maaaring ipakita ng Opentrons App ang kasalukuyang status ng Thermocycler at direktang makokontrol ang block temperature, lid temperature, at lid position.
78
OPENRONS FLEX
KABANATA 4: MGA MODYUL
Mga pagtutukoy ng Thermocycler
Mga Dimensyon (bukas ang takip) Mga Dimensyon (sarado ang takip) Timbang (kabilang ang rear duct) Power adapter voltage Power adapter kasalukuyang Overvoltage Mga kondisyon sa kapaligiran Temperatura sa paligid Relatibong halumigmig Altitude Mga kinakailangan sa bentilasyon
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/W/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/W/H) 8.4 kg 100 V sa 240/50 Hz 60 A Kategorya II Panloob na paggamit °C lamang (8.5); 5 °C (acceptable) 20%, non-condensing Hanggang 25 m above sea level Hindi bababa sa 2 cm / 40 sa pagitan ng unit at isang pader
OPENRONS FLEX
79
KABANATA 5
Labware
Sinasaklaw ng kabanatang ito ang mga item sa Opentrons Labware Library na magagamit mo sa Opentrons Flex at sa Opentrons Flex Gripper. Sinasaklaw din nito ang custom na labware at, para sa aming mga power user, nagli-link ng mga bahagi ng labware sa kanilang kaukulang JSON file mga kahulugan.
Maaari kang bumili ng labware mula sa orihinal na mga tagagawa ng kagamitan o mula sa Opentrons shop sa https://shop.opentrons.com. At, palaging nagtatrabaho ang Opentrons upang i-verify ang mga bagong kahulugan ng labware. Tingnan ang Labware Library (naka-link sa itaas) para sa pinakabagong mga listahan.
5.1 Mga konsepto ng Labware
Sinasaklaw ng Labware ang higit pa sa mga bagay na inilagay sa deck at ginagamit sa isang protocol. Upang matulungan kang maunawaan ang Opentrons labware, suriin natin ang paksang ito mula sa tatlong magkakaibang pananaw. Para sa Opentrons Flex, kasama sa labware ang mga item sa aming Labware Library, data na tumutukoy sa bawat piraso ng labware, at custom na labware.
Labware bilang hardware
Kasama sa Labware Library ang lahat ng magagamit mo bilang default sa Opentrons Flex. Ito ay mga matibay na bahagi at mga nauubos na item na ginagamit mo, muling ginagamit, o itinatapon habang nagpapatakbo ng isang protocol. Hindi mo kailangang gumawa ng anumang mga espesyal na hakbang upang magtrabaho kasama ang mga item sa Labware Library. Alam ng Flex robot kung paano awtomatikong gumana sa lahat ng nasa library.
Labware bilang data
Ang impormasyon ng Labware ay naka-imbak sa Javascript object notation (JSON) filekasama si .json file mga extension. Isang JSON file may kasamang mga spatial na dimensyon (haba, lapad, taas), volumetric na kapasidad (L, mL), at iba pang sukatan na tumutukoy sa mga feature sa ibabaw, kanilang mga hugis, at mga lokasyon. Kapag nagpapatakbo ng protocol, binabasa ng Flex ang mga .json na ito files upang malaman kung ano ang labware ay nasa deck at kung paano gamitin ito.
80
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Custom na labware
Ang custom labware ay labware na hindi kasama sa Labware Library o labware na nilikha ng Custom Labware Creator. Gayunpaman, kung minsan ang ideya ng custom na labware ay nabibigatan ng mga ideya ng pagiging kumplikado, gastos, o kahirapan. Ngunit, hindi dapat mahirap unawain o gawin ang custom na labware. Maglaan tayo ng ilang sandali upang i-unpack ang konsepto ng custom na labware.
Bilang isang exampAng Opentrons Labware Library ay may kasamang 96-well plates (200 L) mula sa Corning at BioRad, ngunit ang ibang mga manufacturer ay gumagawa din ng mga well plate na ito. At, salamat sa karaniwang tinatanggap na mga pamantayan ng industriya, ang mga pagkakaiba sa mga nasa lahat ng lugar na ito sa lab ay maliit. Gayunpaman, ang isang ordinaryong 200 L, 96-well plate mula sa Stellar Scientific, Oxford Lab, o Krackeler Scientific (o anumang iba pang supplier para sa bagay na iyon) ay "custom labware" para sa Flex dahil hindi ito paunang tinukoy sa aming Labware Library . Bukod pa rito, ang mga maliliit na pagkakaiba sa mga sukat ng labware ay maaaring magkaroon ng matinding epekto sa tagumpay ng iyong protocol run. Para sa kadahilanang ito, mahalagang magkaroon ng tumpak na kahulugan ng labware para sa bawat labware na gusto mong gamitin sa iyong protocol.
Gayundin, habang ang custom na labware ay maaaring isang esoteric, one-off na piraso ng kit, kadalasan ito ay ang mga tip, plato, tubo, at rack na ginagamit araw-araw sa mga lab sa buong mundo. Muli, ang tanging pagkakaiba sa pagitan ng Opentrons labware at custom na labware ay ang bagong item ay hindi paunang natukoy sa software na nagpapagana sa robot. Ang Flex ay maaari, at gumagana, sa iba pang pangunahing labware item o isang bagay na natatangi, ngunit kailangan mong i-record ang mga katangian ng item na iyon sa isang labware definition JSON file at i-import ang data na iyon sa Opentrons App. Tingnan ang seksyong Custom Labware Definition sa ibaba para sa higit pang impormasyon.
Sa kabuuan, kasama sa labware ang:
Lahat ng nasa Opentrons Labware Library. Mga kahulugan ng Labware: data sa isang JSON file na tumutukoy sa mga hugis, sukat, at kakayahan ng mga indibidwal na item
tulad ng mga well plate, tip, reservoir, atbp. Custom labware, na mga item na hindi kasama sa Labware Library.
Pagkatapos ng mulingviewsa mahahalagang konseptong ito, suriin natin ang mga kategorya at item sa Opentrons Labware Library. Pagkatapos nito, tatapusin natin ang kabanata na may tapos naview ng mga bahagi ng data ng isang labware file at ibuod ang mga feature at serbisyo ng Opentrons na tumutulong sa iyong lumikha ng custom na labware.
OPENRONS FLEX
81
KABANATA 5: LABWARE
5.2 Mga Reservoir
Ang Opentrons Flex ay gumagana bilang default sa mga single- at multi-well reservoir na nakalista sa ibaba. Ang paggamit ng mga reservoir na ito ay nakakatulong na bawasan ang iyong pasanin sa paghahanda dahil ang mga ito ay handa na sa pag-automate sa labas ng kahon. Available din ang impormasyon ng reservoir sa Opentrons Labware Library.
Single-well reservoir
Mga Detalye ng Tagagawa
Agilent
290 mL V sa ibaba
Axygen
90 ML Flat bottom
NEST
195 ML Flat bottom
290 mL V sa ibaba
Pangalan ng pag-load ng API
agilient_1_ reservoir_290ml
axygen_1_ reservoir_90ml
nest_1_ reservoir_195ml
nest_1_ reservoir_290ml
Mga multi-well reservoir
Mga Detalye ng Tagagawa
NEST
12 balon 15 mL/well V ibaba
USA Scientific
12 balon 22 mL/well V ibaba
Pangalan ng pag-load ng API nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml
82
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Mga reservoir at mga kahulugan ng API
Tinutukoy ng Opentrons Labware Library ang mga katangian ng mga reservoir na nakalista sa itaas sa hiwalay na JSON files. Ang robot at ang Opentrons Python API ay umaasa sa mga kahulugan ng JSON na ito upang gumana sa labware na ginagamit ng iyong mga protocol. Para kay exampAt, kapag nagtatrabaho sa API, tinatanggap ng ProtocolContext.load_labware function ang mga pangalan ng labware na ito bilang mga wastong parameter sa iyong code. Ang mga naka-link na pangalan ng pag-load ng API ay kumokonekta sa mga kahulugan ng reservoir labware sa Opentrons GitHub repository.
Custom na reservoir labware
Subukang gumawa ng custom na kahulugan ng labware gamit ang Opentrons Labware Creator kung ang isang reservoir na gusto mong gamitin ay hindi nakalista dito. Pinagsasama ng custom na kahulugan ang lahat ng dimensyon, metadata, hugis, volumetric na kapasidad, at iba pang impormasyon sa isang JSON file. Kailangan ng Opentrons Flex ang impormasyong ito upang maunawaan kung paano gamitin ang iyong custom na labware. Tingnan ang seksyong Custom Labware Definition para sa higit pang impormasyon.
5.3 Mga plato ng balon
Ang Opentrons Flex ay gumagana bilang default sa mga well plate na nakalista sa ibaba. Ang paggamit ng mga well plate na ito ay nakakatulong na bawasan ang iyong pasanin sa paghahanda dahil ang mga ito ay handa na sa pag-automate sa labas ng kahon. Available din ang impormasyon ng well plate sa Opentrons Labware Library.
OPENRONS FLEX
83
KABANATA 5: LABWARE
6-well plates
Manufacturer Corning
Mga pagtutukoy
6 na balon 16.8 mL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
Pangalan ng pag-load ng API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12-well plates
Manufacturer Corning
Mga pagtutukoy
12 na balon 6.9 mL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
Pangalan ng pag-load ng API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24-well plates
Manufacturer Corning
Mga pagtutukoy
24 na balon 3.4 mL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
Pangalan ng pag-load ng API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48-well plates
Manufacturer Corning
Mga pagtutukoy
48 na balon 1.6 mL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
Pangalan ng pag-load ng API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
96-well plates
Manufacturer Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific
Mga pagtutukoy
96 na balon 200 µL/well Mga pabilog na balon, V sa ibaba
96 na balon 360 µL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
96 na balon 100 µL/well Mga pabilog na balon, V bottom PCR full skirt
96 na balon 200 µL/well Mga pabilog na balon, patag na ilalim
96 malalim na balon 2000 µL/well Square wells, V sa ibaba
Matigas na 96 na balon 200 µL/well Mga pabilog na balon, V bottom PCR full skirt
Nunc 96 deep wells 1300 µL/well Circular wells, U bottom
Nunc 96 deep wells 2000 µL/well Circular wells, U bottom
96 na malalim na balon 2.4 mL/well Mga square well, U bottom
Pangalan ng pag-load ng API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ skirt
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENRONS FLEX
85
KABANATA 5: LABWARE
384-well plates
Manufacturer Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Mga pagtutukoy
384 na balon 40 µL/well Mga pabilog na balon, V sa ibaba
384 na balon 50 µL/well Mga pabilog na balon, V sa ibaba
384 na balon 112 µL/well Mga parisukat na balon, patag na ilalim
API load name appliedbiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Well plate adapters
Ang mga aluminum plate na nakalista sa ibaba ay mga thermal adapter para sa Opentrons Heater-Shaker GEN1 module. Maaari mong gamitin ang mga standalone na kahulugan ng adapter na ito upang i-load ang Opentrons na na-verify o custom na labware sa ibabaw ng Heater-Shaker.
Uri ng adaptor Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Maaari mo ring i-load ang parehong adapter at labware na may iisang kahulugan. Kasama sa aming Labware Library ang ilang paunang na-configure na thermal adapter at mga kumbinasyon ng labware na ginagawang handa ang Heater-Shaker na gamitin kaagad sa labas ng kahon.
86
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Tandaan: Huwag gumamit ng pinagsamang kahulugan kung kailangan mong ilipat ang labware papunta o patayin ng Heater-Shaker sa panahon ng iyong protocol, alinman sa gripper o manu-mano. Gumamit na lang ng standalone na adapter definition.
Adapter/labware na kumbinasyon
Pangalan ng pag-load ng API
Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter na may NEST Deep Well Plate 2 mL
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter na may NEST 96 Well Plate 200 µL Flat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter na may NEST Well Plate 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter na may Corning 384 Well Plate 112 µL Flat
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Ang mga adaptor ay maaaring mabili nang direkta mula sa Opentrons sa https://shop.opentrons.com.
Well plates at mga kahulugan ng API
Tinutukoy ng Opentrons Labware Library ang mga katangian ng mga well plate na nakalista sa itaas sa hiwalay na JSON files. Ang Flex robot at ang Opentrons Python API ay umaasa sa mga kahulugan ng JSON na ito upang gumana sa labware na ginagamit ng iyong mga protocol. Para kay exampAt, kapag nagtatrabaho sa API, tinatanggap ng ProtocolContext.load_labware function ang mga pangalan ng labware na ito bilang mga wastong parameter sa iyong code. Ang mga naka-link na pangalan ng load ng API ay kumokonekta sa mga kahulugan ng well plate labware sa Opentrons GitHub repository.
Custom na well plate labware
Subukang gamitin ang Opentrons Labware Creator para gumawa ng custom na kahulugan ng labware kung hindi nakalista dito ang isang well plate na gusto mong gamitin. Pinagsasama ng custom na kahulugan ang lahat ng dimensyon, metadata, hugis, volumetric na kapasidad, at iba pang impormasyon sa isang JSON file. Binabasa ng Opentrons Flex ang impormasyong ito upang maunawaan kung paano gamitin ang iyong custom na labware. Tingnan ang seksyong Custom Labware Definition para sa higit pang impormasyon.
OPENRONS FLEX
87
KABANATA 5: LABWARE
5.4 Mga tip at tip rack
Ang mga tip sa Opentrons Flex ay may sukat na 50 µL, 200 µL, at 1000 µL. Ang mga ito ay malinaw, hindi nagsasagawa ng mga polypropylene na tip na available na mayroon o walang mga filter. Naka-package ang mga ito na sterile sa mga rack na naglalaman ng 96 na tip at walang DNase, RNase, protease, pyrogens, DNA ng tao, endotoxins, at PCR inhibitors. Kasama rin sa mga rack ang mga numero ng lot at petsa ng pag-expire.
Gumagana ang mga tip sa Flex pipette sa Opentrons Flex 50 µL at 1000 µL pipette sa 1-, 8-, at 96-channel na mga configuration. Bagama't maaari mong ilagay ang alinman sa mga Flex tip sa 50 L at 1000 L pipette, subukang itugma ang tip sa na-rate na kapasidad ng pipette. Para kay exampOo, maaaring kakaiba na maglagay ng 1000 L tip sa 50 L pipette. Para sa 1000 L pipette, maaari mong tiyak na gumamit ng 50 L, 200 L, o 1000 L tip.
Mga rack ng tip
Ang hindi na-filter at na-filter na mga tip ay isasama sa isang rack na binubuo ng isang magagamit muli na base plate, isang mid-plate na naglalaman ng 96 na mga tip, at isang takip.
Tip rack ayon sa volume 50 µL 200 µL 1000 µL
Pangalan ng pag-load ng API
Hindi na-filter: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Na-filter: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Hindi na-filter: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Na-filter: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Hindi na-filter: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Na-filter: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Upang tumulong sa pagkilala, ang mga tip rack sa kalagitnaan ng mga plato ay naka-code ng kulay batay sa laki ng tip:
50 µL: magenta 200 L: dilaw 1000 µL: asul
88
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Kapag nag-order o muling nag-aayos, ang mga tip at rack ay may dalawang magkaibang naka-package na configuration:
Mga Rack: Binubuo ng magkahiwalay na shrink-wrapped tip rack (base plate, mid-plate na may mga tip, at lid). Pinakamainam ang mga naka-rack na configuration kapag ang kalinisan ay pinakamahalaga, upang maiwasan ang cross-contamination, o kapag hindi pinapayagan ng iyong mga protocol ang paggamit muli ng base plate o bahagi.
Mga Refill: Binubuo ng isang kumpletong tip rack (base plate, mid plate na may mga tip, at takip) at mga indibidwal na lalagyan ng tip. Pinakamainam ang mga pagsasaayos ng refill kapag pinapayagan ng iyong mga protocol ang paggamit muli ng base plate o bahagi.
Tippipette compatibility
Ang mga tip sa Flex pipette ay idinisenyo para sa mga Opentrons Flex pipette. Ang mga tip sa Flex ay hindi tugma sa likod sa mga Opentrons OT-2 pipette, at hindi ka rin maaaring gumamit ng mga OT-2 na tip sa mga Flex pipette.
Ang iba pang mga tip sa pamantayan sa industriya ay maaaring gumana sa mga Flex pipette, ngunit hindi ito inirerekomenda. Upang matiyak ang pinakamabuting pagganap, dapat mo lamang gamitin ang mga tip sa Opentrons Flex na may mga Flex pipette.
Tip rack adapter
Ang 96-channel pipette ay nangangailangan ng isang adaptor upang ikabit nang maayos ang isang buong rack ng mga tip. Sa panahon ng pamamaraan ng pag-attach, ang pipette ay gumagalaw sa ibabaw ng adaptor, ibinababa ang sarili sa mga mounting pin, at hinihila ang mga tip papunta sa mga pipette sa pamamagitan ng pag-angat ng adapter at tip rack.
OPENRONS FLEX
89
KABANATA 5: LABWARE
Tandaan: Gamitin lamang ang tip rack adapter kapag kumukuha ng isang buong rack ng mga tip nang sabay-sabay. Direktang ilagay ang mga tip rack sa deck kapag kumukuha ng mas kaunting tip.
Babala: Pinch point panganib. Ilayo ang mga kamay sa tip rack adapter habang ang pipette ay nakakabit sa mga tip ng pipette.
Uri ng adaptor Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Ang adaptor ng tip rack ay katugma sa Opentrons Flex Gripper. Maaari mong gamitin ang gripper upang ilagay ang mga sariwang tip rack sa adapter o upang kunin at ilipat ang mga ginamit na tip rack sa waste chute.
5.5 Mga tubo at rack ng tubo
Gumagana ang Opentrons 4-in-1 Tube Rack system sa Opentrons Flex bilang default. Ang paggamit ng 4-in-1 na tube rack ay nakakatulong na bawasan ang iyong prep work burden dahil ang mga kumbinasyong ibinibigay nito ay automation-ready kaagad sa labas ng kahon. Higit pang impormasyon ay makukuha rin sa Opentrons Labware Library.
90
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Mga kumbinasyon ng tubo at rack
Ang Opentrons 4-in-1 tube rack ay sumusuporta sa iba't ibang laki ng tubo, isa-isa o sa iba't ibang laki (volume) na kumbinasyon. Kabilang dito ang isang: 6-tube rack para sa 50 mL tubes (6 x 50 mL). 10-tube combination rack para sa apat na 50 mL na tubo at anim na 15 mL na tubo (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). 15-tube rack para sa 15 mL tubes (15 x 15 mL). 24-tube rack para sa 0.5 mL, 1.5 mL, o 2 mL tubes (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Tandaan: Ang lahat ng mga tubo ay cylindrical na may hugis-V (conical) na ilalim maliban kung iba ang ipinahiwatig.
6-tube rack
Uri ng tubo 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-tube rack
Uri ng tubo 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENRONS FLEX
91
KABANATA 5: LABWARE
15-tube rack
Uri ng tubo 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24-tube rack
Uri ng tubo
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, hugis-U na ibaba 24 generic 2 mL screw cap 24 NEST 0.5 mL screw cap 24 NEST 1.5 mL screw cap 24 NEST 1.5 mL screw cap 24 NEST 2 mL screw cap 24 NEST 2 mL screw cap NEST XNUMX mL snap cap, hugis U sa ibaba
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Mga kahulugan ng Tube rack API
Tinutukoy ng Opentrons Labware Library ang mga katangian ng mga tube rack na nakalista sa itaas sa hiwalay na JSON files. Ang Flex robot at ang Opentrons Python API ay umaasa sa mga kahulugan ng JSON na ito upang gumana sa labware na ginagamit ng iyong mga protocol. Para kay exampAt, kapag nagtatrabaho sa API, tinatanggap ng ProtocolContext.load_labware function ang mga pangalan ng labware na ito bilang mga wastong parameter sa iyong code. Ang mga naka-link na pangalan ng load ng API ay kumokonekta sa mga kahulugan ng tube rack labware sa Opentrons GitHub repository.
92
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Custom na tube rack labware
Subukang gumawa ng custom na kahulugan ng labware gamit ang Opentrons Labware Creator kung hindi nakalista dito ang kumbinasyon ng tube at rack na gusto mong gamitin. Pinagsasama ng custom na kahulugan ang lahat ng dimensyon, metadata, hugis, volumetric na kapasidad, at iba pang impormasyon sa isang JSON file. Binabasa ng Opentrons Flex ang impormasyong ito upang maunawaan kung paano gamitin ang iyong custom na labware. Tingnan ang seksyong Custom Labware Definition para sa higit pang impormasyon.
5.6 Mga bloke ng aluminyo
Ipinapadala ang mga bloke ng aluminyo kasama ang Temperature Module GEN2 at maaaring bilhin nang hiwalay bilang isang tatlong pirasong set. Kasama sa set ang flat bottom plate, 24-well block, at 96-well block.
Ang Opentrons Flex ay gumagamit ng mga bloke ng aluminyo upang hawakan ang sample tubes at well plates sa Temperature Module o direkta sa deck. Kapag ginamit sa Temperature Module, ang mga aluminum block ay maaaring panatilihin ang iyong sampmga tubo, PCR strip, o mga plato sa pare-parehong temperatura sa pagitan ng 4 °C at 95 °C.
Flat bottom plate
Ang flat bottom plate para sa Flex ay ipinapadala kasama ang Temperature Module's caddy at tugma sa iba't ibang ANSI/SLAS standard well plates. Ang flat plate na ito ay naiiba sa plate na ipinapadala kasama ang Temperature Module mismo o ang hiwalay na three-piece set. Nagtatampok ito ng mas malawak na working surface at chamfered corner clips. Nakakatulong ang mga feature na ito na pahusayin ang performance ng Opentrons Flex Gripper kapag inililipat ang labware papunta o sa labas ng plato.
Masasabi mo kung aling flat bottom plate ang mayroon ka dahil ang para sa Flex ay may mga salitang "Opentrons Flex" sa ibabaw nito. Ang para sa OT-2 ay hindi.
OPENRONS FLEX
93
KABANATA 5: LABWARE
24-well aluminum block
Ang 24-well block ay ginagamit sa mga indibidwal na sample vials. Para kay example, tumatanggap ito ng sample vials na:
Magkaroon ng V-shaped o U-shaped bottoms. I-secure ang mga nilalaman gamit ang mga pagsasara ng snap cap o screw cap. Maghawak ng likido sa mga kapasidad na 0.5 mL, 1.5 mL, at 2 mL.
96-well aluminum block
Sinusuportahan ng 96-well block ang iba't ibang uri ng well plate. Para kay example, tumatanggap ito ng mga well plate na:
Mula sa mga pangunahing tagagawa ng well-plate tulad ng Bio-Rad at NEST.
Dinisenyo na may hugis-V na ilalim, hugis-U na ilalim, o patag na ilalim.
Dinisenyo gamit ang 100 µL o 200 µL na mga balon.
Ito ay katugma din sa mga generic na PCR strips.
Mga standalone na adapter
Thermal block Flex flat bottom plate 24-well aluminum block 96-well aluminum block
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Tingnan ang mga kumbinasyon ng labware sa ibaba. opentrons_96_well_aluminum_block
Mga kumbinasyon ng labware na bloke ng aluminyo
Sinusuportahan ng Opentrons Labware Library ang mga sumusunod na kumbinasyon ng block, vial, at well plate, na tinukoy din sa hiwalay na kahulugan ng JSON labware files. Ang Flex robot at ang Opentrons Python API
94
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
umasa sa mga kahulugan ng JSON na ito upang gumana sa labware na ginagamit ng iyong mga protocol. Para kay exampAt, kapag nagtatrabaho sa API, tinatanggap ng ProtocolContext.load_labware function ang mga pangalan ng labware na ito bilang mga wastong parameter sa iyong code. Inililista ng mga talahanayan sa ibaba ang mga default na kumbinasyon ng block/container at mga nauugnay na pangalan ng pag-load ng API. Kumokonekta ang mga link sa kaukulang mga kahulugan ng JSON sa Opentrons GitHub repository.
Tandaan: Ang lahat ng tubo ay may hugis-V na ilalim maliban kung iba ang ipinahiwatig.
24-well aluminum block mga kumbinasyon ng labware
24-well block contents Generic na 2 mL screw cap NEST 0.5 mL screw cap NEST 1.5 mL screw cap NEST 1.5 mL snap cap NEST 2 mL screw cap NEST 2 mL snap cap, U-shaped na ilalim
Ang pangalan ng pag-load ng API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snap 24_aluminumblock_nest_2ml_snapcap
96-well aluminum block mga kumbinasyon ng labware
96-well block contents Bio-Rad well plate 200 µL Generic PCR strip 200 µL NEST well plate 100 µL
Pangalan ng pag-load ng API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENRONS FLEX
95
KABANATA 5: LABWARE
5.7 Labware at ang Opentrons Flex Gripper
Bagama't gumagana ang Opentrons Flex sa lahat ng imbentaryo sa Labware Library, ang Opentrons Flex Gripper ay tugma sa mga partikular na item sa labware lamang. Sa kasalukuyan, ang Gripper ay na-optimize para sa paggamit sa mga sumusunod na labware item.
Kategorya ng Labware Mga Deep Well Plate na Ganap na Skirted 96 Well Plate
Mga Tip Rack (hindi na-filter at na-filter na mga tip)
Mga tatak
NEST 96 Deep Well Plate 2 mL
Opentrons Tough 96 Well Plate 200 µL PCR Full Skirt NEST 96 Well Plate 200 µL Flat
Opentrons Flex 96 Tip Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 1000 µL
Tandaan: Para sa pinakamahusay na mga resulta, gamitin lamang ang Flex Gripper kasama ang labware na nakalista sa itaas. Ang Flex Gripper ay maaaring gumana sa iba pang ANSI/SLAS automation compliant labware, ngunit hindi ito inirerekomenda.
5.8 Pasadyang mga kahulugan ng labware
Gaya ng tinalakay sa simula ng kabanatang ito, ang custom na labware ay labware na hindi nakalista sa Opentrons Labware Library. Maaari kang gumamit ng iba pang karaniwan o natatanging labware item gamit ang Flex sa pamamagitan ng tumpak na pagsukat at pagtatala ng mga katangian ng bagay na iyon at pag-save ng data na iyon sa isang JSON file. Kapag na-import sa app, ginagamit ng Flex at ng API ang data ng JSON na iyon upang makipag-ugnayan sa iyong labware. Nagbibigay ang Opentrons ng mga tool at serbisyo, na susuriin namin sa ibaba, upang matulungan kang gamitin ang Flex gamit ang custom na labware.
96
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
Paglikha ng mga pasadyang kahulugan ng labware
Tumutulong ang mga tool at serbisyo ng Opentrons na ilagay ang custom na labware sa iyong abot. Ang mga tampok na ito ay tumanggap ng iba't ibang antas ng kasanayan at paraan ng pagtatrabaho. Ang paggawa ng sarili mong labware, at paggamit nito sa Opentrons Flex, ay nakakatulong na gawing versatile at malakas na karagdagan ang robot sa iyong lab.
CUSTOM LABWARE CREATOR
Ang Custom Labware Creator ay isang walang code, web-based na tool na gumagamit ng graphical na interface upang matulungan kang lumikha ng kahulugan ng labware file. Gumagawa ang Labware Creator ng JSON labware definition file na ini-import mo sa Opentrons App. Pagkatapos nito, magagamit ang iyong custom na labware sa Flex robot at sa Python API.
CUSTOM LABWARE SERVICE
Makipag-ugnayan sa amin kung ang labware na gusto mong gamitin ay hindi available sa library, kung hindi ka makakagawa ng sarili mong mga kahulugan, o dahil ang isang custom na item ay may kasamang iba't ibang hugis, laki, o iba pang iregularidad na inilalarawan sa ibaba.
Labware na maaari mong tukuyin sa Labware Creator
; Ang mga balon at tubo ay pare-pareho at magkapareho. ; Ang lahat ng mga hilera ay pantay-pantay
(ang espasyo sa pagitan ng mga hilera ay pantay).
; Ang lahat ng mga column ay pantay-pantay (ang espasyo sa pagitan ng mga column ay pantay).
; Tamang-tama ang sukat sa isang puwang ng deck.
Kailangang tukuyin ng Labware Opentrons; Iba-iba ang hugis ng mga balon at tubo. ; Ang mga hilera ay hindi pantay-pantay.
; Ang mga hanay ay hindi pantay-pantay.
; Mas maliit sa isang deck slot (nangangailangan ng adapter) o sumasaklaw sa maraming deck slot.
OPENRONS FLEX
97
KABANATA 5: LABWARE
Narito ang ilang mga diagram na makakatulong sa iyong makita ang datingampmga inilarawan sa itaas. Regular Ang lahat ng column ay pantay-pantay ang pagitan at lahat ng row ay pantay-pantay. Ang mga column ay hindi kailangang magkaroon ng parehong puwang sa mga row.
Regular Ang grid ay hindi kailangang nasa gitna ng labware.
Ang mga Irregular Row ay pantay-pantay ngunit ang mga column ay hindi pantay-pantay.
Ang mga hindi regular na Column/row ay pantay-pantay ngunit ang mga balon ay hindi magkapareho.
Irregular Mayroong higit sa isang grid.
Ang aming labware team ay gagana upang maunawaan ang iyong mga pangangailangan at magdisenyo ng mga custom na kahulugan ng labware para sa iyo. Tingnan ang mga artikulo ng suporta na Humihiling ng Custom na Labware Definition at ang Custom Labware Request form para sa higit pang impormasyon. Ito ay isang bayad-based na serbisyo.
98
OPENRONS FLEX
KABANATA 5: LABWARE
PYTHON API
Bagama't hindi ka makakagawa ng custom na labware gamit ang aming API, maaari mong gamitin ang custom na labware gamit ang mga available na pamamaraan ng API. Gayunpaman, kailangan mo munang tukuyin ang iyong custom na labware at i-import ito sa Opentrons App. Kapag naidagdag mo na ang iyong labware sa Opentrons App, available na ito sa Python API at sa robot. Tingnan ang seksyong Custom Labware Definition ng dokumentasyon ng Python API para sa higit pang impormasyon. Para sa impormasyon tungkol sa pagsusulat ng mga script ng protocol gamit ang API, tingnan ang seksyong Python Protocol API sa kabanata ng Protocol Development.
JSON labware schema
Isang JSON file ay ang blueprint para sa Opentrons standard at custom labware. Ito file naglalaman at nag-aayos ng data ng labware ayon sa mga detalye ng disenyo na itinakda ng default na schema.
Ang schema ay isang frame
Mga Dokumento / Mga Mapagkukunan
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot [pdf] Manwal ng Pagtuturo FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, FLEX, Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, Flex Open Source Liquid Handling Robot, Open Source Liquid Handling Robot, Source Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, Robot |