FLEX Opentrons Flex atvirojo kodo skysčių tvarkymo robotas
“
Opentrons Flex
Specifikacijos:
- Bendrosios specifikacijos: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Aplinkosaugos specifikacijos: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
Incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Sertifikatai: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incidunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Serijos numeris: XXX-XXXX-XXXX
Produkto naudojimo instrukcijos:
1. Prietaiso montavimas ir kalibravimas:
Atlikite pipetės ir griebtuvo vadove nurodytus veiksmus
įrengimas.
2. Perkėlimas:
Trumpus judesius žr. vadovo 2.5 skyriuje. Dėl
judesiai dideliais atstumais, laikykitės pateiktų nurodymų. Bendras kraustymasis
taip pat galima patarti.
3. Jungtys:
Užtikrinkite tinkamą maitinimo prijungimą, kaip nurodyta vadove.
Jei reikia, prijunkite USB ir pagalbinius įrenginius. Tinklo jungtys
turi būti nustatyta pagal instrukcijas.
4. Protokolo kūrėjas:
Supraskite Protocol Designer reikalavimus ir sužinokite, kaip tai padaryti
sukurti naujus protokolus arba modifikuoti esamus pagal savo laboratoriją
reikalavimus.
5. Python Protocol API:
Naršykite scenarijų rašymą ir vykdymą naudodami Python Protocol API.
Atraskite išskirtines Python funkcijas, kad pagerintumėte funkcionalumą.
6. OT-2 protokolai:
Sužinokite apie OT-2 Python protokolus, OT-2 JSON protokolus ir
Magnetinio modulio protokolai įvairių tipų eksperimentams.
Dažnai užduodami klausimai (DUK):
K: Kaip pašalinti triktis, jei robotas nejuda kaip
tikimasi?
A: Patikrinkite maitinimo jungtį, užtikrinkite tinkamą kalibravimą
prietaisus ir patikrinkite, ar nėra kliūčių
roboto kelias.
Kl.: Ar galiu naudoti pasirinktines pipetes su Opentrons Flex?
A: Opentrons rekomenduoja naudoti suderinamas pipetes, kad būtų optimalus
našumas ir tikslumas.
“`
Opentrons Flex
Instrukcijų vadovas
„Opentrons Labworks Inc.
2023 m. gruodžio mėn
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Šiame dokumente naudojami registruoti pavadinimai, prekių ženklai ir kt., net jei jie nėra specialiai pažymėti, neturi būti laikomi neapsaugotais įstatymų.
Turinys
Pratarmė . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Šio vadovo struktūra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Pastabos ir įspėjimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1 skyrius: Įvadas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Sveiki atvykę į Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Kas naujo Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flex darbo stočių . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Saugos informacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Saugos simboliai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elektros saugos įspėjimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Papildomi saugos įspėjimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Saugos priemonės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologinė sauga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Toksiški dūmai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Degūs skysčiai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Teisės aktų laikymasis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Sauga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetinis suderinamumas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC įspėjimai ir pastabos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kanada ISED atitiktis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Aplinkosaugos įspėjimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 „Wi-Fi“ išankstinis sertifikavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
2 skyrius: Įrengimas ir perkėlimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Saugos ir eksploatavimo reikalavimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Kur dėti Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Energijos suvartojimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Aplinkos sąlygos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Išpakavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Reikalingos pastangos ir laikas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Dėžė ir pakavimo medžiagos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Gaminio elementai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 1 dalis: dėžės išėmimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 2 dalis: Atleiskite lankstumą. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 3 dalis: Galutinis surinkimas ir maitinimo įjungimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Pirmasis paleidimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Įjunkite maitinimą . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Prisijungimas prie tinklo arba kompiuterio . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Įdiekite programinės įrangos naujinimus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Avarinio stabdymo pakabuko pritvirtinimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Suteikite savo robotui vardą . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Prietaiso įrengimas ir kalibravimas . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipetės montavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Griebtuvo montavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Perkėlimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Trumpi judesiai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Judėjimai dideliais atstumais . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Bendrieji patarimai persikraustymui . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Paskutinės mintys apie persikėlimą. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
3 skyrius: Sistemos aprašymas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fiziniai komponentai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Rėmas ir gaubtas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Denis ir darbo zona . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staggavimo srityje. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Denio armatūra. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Atliekų latakas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagploto lizdai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Judėjimo sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Jutiklinis ekranas ir LED ekranai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipetės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipetės specifikacijos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipetės kalibravimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipetės antgalio stovo adapteris. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Dalinis antgalio paėmimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetės jutikliai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetės programinės aparatinės įrangos naujinimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Griebtuvas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Griebtuvo specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Griebtuvo kalibravimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripper programinės aparatinės įrangos naujinimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Avarinio stabdymo pakabukas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kada naudoti E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 E-stop įjungimas ir atleidimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Jungtys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Maitinimo jungtis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB ir pagalbinės jungtys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Tinklo jungtys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Sistemos specifikacijos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Bendrosios specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Aplinkos specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sertifikatai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serijos numeris . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
4 skyrius: Moduliai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Palaikomi moduliai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modulio korpuso sistema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Modulio kalibravimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kada kalibruoti modulius. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Kaip kalibruoti modulius . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Šildytuvo-kratytuvo modulis GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Šildytuvo-kratytuvo savybės. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Šildytuvo-kratytuvo specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetinis blokas GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetinio bloko savybės. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetinio bloko specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperatūros modulis GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatūros modulio savybės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatūros modulio specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Termociklerio modulis GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Termociklerio funkcijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Termociklerio specifikacijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
5 skyrius: Laboratoriniai įrenginiai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Laboratorinės įrangos koncepcijos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratorinė įranga kaip techninė įranga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratorinė įranga kaip duomenys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Individualizuotos laboratorijos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Rezervuarai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Vieno šulinio rezervuarai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Daugiašuliniai rezervuarai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervuarai ir API apibrėžtys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Individualūs rezervuarų laboratoriniai įrankiai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Šulinių plokštės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6 šulinėlių plokštelės. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12 šulinėlių plokštelės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24 šulinėlių plokštelės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48 šulinėlių plokštelės. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96 šulinėlių plokštelės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384 šulinėlių plokštelės . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Šulinio plokščių adapteriai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Šulinių plokštės ir API apibrėžimai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Individualizuotos šulinių plokštelių laboratorijos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Antgaliai ir antgalių laikikliai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Antgalių lentynos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tipipette suderinamumas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Antgalio stovo adapteris . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Vamzdžiai ir vamzdžių lentynos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Vamzdžių ir stelažų deriniai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6 vamzdžių lentynos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 10 vamzdžių lentynos. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15 vamzdžių lentynos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24 vamzdžių stelažai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Vamzdžių stovo API apibrėžimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Pasirinktiniai vamzdžių stovo laboratoriniai įrankiai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aliuminio blokeliai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Plokščiadugnė plokštė . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24 šulinėlių aliuminio blokas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96 šulinėlių aliuminio blokas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Autonominiai adapteriai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Aliuminio blokelių laboratorinių įrankių deriniai . . . . . . . . . . . . . . . .94 24 šulinėlių aliuminio blokelių laboratorinių reikmenų deriniai . . . . . . . . .95 96 šulinėlių aliuminio blokelių laboratorinių reikmenų deriniai . . . . . . . . .95 5.7 Laboratoriniai įrankiai ir Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Pasirinktiniai laboratorinių programų apibrėžimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Pasirinktinių laboratorinių programų apibrėžimų kūrimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON laboratorijos schema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON laboratorinių programų apibrėžimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 6 skyrius: Protokolo kūrimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Iš anksto sudaryti protokolai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protokolų biblioteka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Pasirinktinio protokolo kūrimo paslauga . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protokolo kūrėjas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolo kūrėjo reikalavimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolo kūrimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Esamų protokolų keitimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Scenarijų rašymas ir vykdymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 išskirtinių Python funkcijų . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 protokolai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python protokolai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON protokolai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetinio modulio protokolai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
7 skyrius: Programinė įranga ir veikimas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Jutiklinio ekrano veikimas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Roboto prietaisų skydelis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protokolo valdymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protokolo informacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Paleisti sąranką . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Laboratorinės įrangos padėties patikrinimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Vykdymo eiga. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Vykdymo pabaiga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Prietaisų valdymas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Roboto nustatymai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Denio konfigūracija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 „Opentrons“ programa. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Programėlių diegimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Protokolų perkėlimas į „Flex“. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Modulio būsena ir valdikliai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Naujausi protokolo paleidimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Išplėstinis valdymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter užrašų knygelė . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Komandinės eilutės veikimas per SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
8 skyrius: Priežiūra ir aptarnavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 „Flex“ valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Prieš pradėdami . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Ką galite išvalyti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Valymo tirpalai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Rėmo ir langų plokščių valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Denio valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Portalo valymas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Atliekų latako valymas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Pipečių ir antgalių valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Nukenksminimas pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Pipetės antgalių valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Griebtuvo valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Valymo moduliai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Bendrasis modulio valymas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler sandarikliai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Autoklave saugi laboratorinė įranga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Flex aptarnavimas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons paslaugos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Montavimo ir eksploatavimo kvalifikacija . . . 155 Prevencinė priežiūra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garantija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 A priedas: Žodynėlis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 B priedas: Papildoma dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API nuoroda. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Kūrėjo dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 C priedas: Atvirojo kodo programinė įranga . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 „Opentrons“ sistemoje „GitHub“ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Kitos saugyklos . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 D priedas: Pagalba ir kontaktinė informacija . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Pardavimai . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Pagalba . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Verslo informacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Pratarmė
Sveiki atvykę į Opentrons Flex skysčių tvarkymo roboto naudojimo instrukciją. Šiame vadove pateikiama informacija apie viską, ką reikia žinoti norint nustatyti ir naudoti „Flex“, daugiausia dėmesio skiriant temoms, kurios yra aktualiausios kasdieniams „Flex“ naudotojams laboratorijos aplinkoje.
Šio vadovo struktūra
Opentrons Flex yra sudėtinga sistema, todėl yra daug skirtingų būdų išmokti visko, ką ji gali padaryti. Nedvejodami pereikite tiesiai prie skyriaus, kuriame aptariama bet kokia jus dominanti tema! Pavyzdžiui,ampJei savo laboratorijoje jau nustatėte „Flex“, galite praleisti skyrių „Įdiegimas ir perkėlimas“.
Jei pageidaujate vadovaujamo požiūrio, šis vadovas sudarytas taip, kad galėtumėte juo vadovautis nuo pradžios iki pabaigos.
Sužinokite apie „Flex“. Skiriamieji Flex bruožai išvardyti 1 skyriuje: Įvadas. Įvade taip pat pateikiama svarbi saugos ir reguliavimo informacija.
Pradėkite nuo Flex. Jei reikia nustatyti „Flex“, vadovaukitės išsamiomis instrukcijomis, pateiktomis 2 skyriuje: Įdiegimas ir perkėlimas. Tada susipažinkite su Flex komponentais 3 skyriuje: Sistemos aprašymas.
Nustatykite savo denį. Konfigūravus denį, Flex galima naudoti įvairias mokslines programas. 4 skyriuje: Moduliai aprašomi „Opentrons“ išoriniai įrenginiai, kuriuos galite įdiegti į denį arba ant jo, kad atliktumėte konkrečias mokslines užduotis. 5 skyriuje: Laboratoriniai įrenginiai paaiškina, kaip dirbti su skysčių laikymo įranga.
Vykdykite protokolą. Pagrindinis „Flex“ naudojimas yra standartizuotų mokslinių procedūrų, žinomų kaip protokolai, vykdymas. 6 skyrius: Protokolo kūrimas siūlo kelis būdus, kaip gauti paruoštus protokolus arba sukurti juos patiems. Norėdami paleisti protokolą, vadovaukitės instrukcijomis, pateiktomis 7 skyriuje: Programinė įranga ir valdymas, kuriame taip pat pateikiamos instrukcijos, kaip atlikti kitas užduotis ir tinkinti roboto nustatymus.
Paleiskite „Flex“. Vadovaukitės patarimais, pateiktais 8 skyriuje: Priežiūra ir aptarnavimas, kad jūsų „Flex“ būtų švarus ir veiktų optimaliai. Arba prisiregistruokite gauti vieną iš ten išvardytų Opentrons paslaugų ir leiskite mums pasirūpinti Flex už jus.
Sužinok dar daugiau. Vis dar reikia kažko kito? Peržiūrėkite priedus. A priedas: Žodynėlis apibrėžia su Flex susijusius terminus. B priedas: Papildoma dokumentacija nurodo dar daugiau išteklių, skirtų Opentrons produktams ir kodo rašymui Flex valdyti.
OPENTRONS FLEX
9
PRATARMĖ
C priede: atvirojo kodo programinė įranga paaiškina, kaip Opentrons programinė įranga yra priglobta GitHub kaip šaltinis kūrėjams ir ne kūrėjams.
D priede: Pagalba ir kontaktinė informacija nurodo, kaip susisiekti su „Opentrons“, jei jums reikia pagalbos, nei numatyta mūsų dokumentuose.
Pastabos ir įspėjimai
Šiame vadove rasite specialiai suformatuotų pastabų ir įspėjimų blokų. Pastabos suteikia naudingos informacijos, kuri gali būti neaiški naudojant įprastą Flex. Ypatingą dėmesį atkreipkite į įspėjimus – jie naudojami tik tais atvejais, kai kyla pavojus susižaloti, sugadinti įrangą, prarasti ar sugadintiampreagentų, duomenų praradimo ar kitos žalos. Pastabos ir įspėjimai atrodo taip:
Sample Pastaba: tai yra kažkas, ką turėtumėte žinoti, bet tai nekelia jokio pavojaus.
Sample Įspėjimas: tai yra kažkas, ką turite žinoti, nes yra su tuo susijusi rizika.
10
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS
Įvadas
Šiame skyriuje supažindinama su „Opentrons Flex“ ekosistema, įskaitant bendrą sistemos dizainą ir galimas darbo vietos konfigūracijas. Jame taip pat yra svarbi atitikties ir saugos informacija, kurią turėtumėte pakartotiview prieš nustatydami savo Opentrons Flex robotą. Daugiau informacijos apie Opentrons Flex ypatybes rasite skyriuje Sistemos aprašymas.
1.1 Sveiki atvykę į „Opentrons Flex“.
Opentrons Flex yra skysčių tvarkymo robotas, sukurtas dideliam našumui ir sudėtingoms darbo eigoms. „Flex“ robotas yra modulinės sistemos, kurią sudaro pipetės, laboratorijos griebtuvas, denio tvirtinimo detalės, ant denio moduliai ir laboratorijos įranga, pagrindas – visa tai galite pakeisti patys. „Flex“ sukurtas su jutikliniu ekranu, todėl galite dirbti su juo tiesiai prie laboratorijos stendo arba valdyti jį iš visos laboratorijos naudodami „Opentrons“ programą arba mūsų atvirojo kodo API.
„Flex“ darbo stotyse yra visa įranga – robotas, techninė ir laboratorinė įranga, kurios jums reikia norint pradėti automatizuoti įprastas laboratorijos užduotis. Kitoms programoms „Opentrons Flex“ veikia visiškai atvirojo kodo programinėje įrangoje ir programinėje įrangoje, yra reagentų ir laboratorinių programų agnostikas, todėl galite valdyti, kaip kuriate ir paleidžiate savo protokolus.
Kas naujo Flex
„Opentrons Flex“ yra „Opentrons“ skysčių krovimo robotų serijos dalis. „Opentrons Flex“ naudotojai gali būti susipažinę su Opentrons OT-2, mūsų asmeniniu pipetavimo robotu. „Flex“ pranoksta OT-2 galimybes keliose pagrindinėse srityse, užtikrindama didesnį pralaidumą ir didesnį pasivaikščiojimo laiką.
Funkcijos Pipetės pralaidumas
Pipetės ir antgalio talpa
Aprašymas
Flex pipetės turi 1, 8 arba 96 kanalus. 96 kanalų pipetė vienu metu veikia 12 kartų daugiau šulinių nei didžiausia OT-2 pipetė.
Flex pipetės turi didesnius tūrio diapazonus (1 µL, 50 5 µL) ir gali veikti su bet kokio tūrio Opentrons Flex antgaliais. Tai patobulinimas, palyginti su OT-1000 pipetėmis, kurių diapazonas yra mažesnis ir turi būti naudojami atitinkamo tūrio diapazono antgaliai.
OPENTRONS FLEX
11
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Griebtuvas Automatizuotas kalibravimas Jutiklinis ekranas Modulio korpusai Denio lizdo koordinatės Kilnojamos šiukšlės Dydis ir svoris
„Opentrons Flex Gripper“ automatiškai, be vartotojo įsikišimo, paima ir perkelia laboratorijos reikmenis po denį. Griebtuvas leidžia atlikti sudėtingesnes darbo eigas per vieną protokolą.
Flex pipečių ir griebtuvo padėties kalibravimas yra visiškai automatizuotas. Paspauskite vieną mygtuką ir instrumentas pajudės į tiksliai apdirbtus taškus ant denio, kad nustatytų tikslią jo padėtį, išsaugos tuos duomenis, kad galėtumėte naudoti jūsų protokoluose.
„Flex“ turi savo jutiklinio ekrano sąsają, leidžiančią valdyti tiesiogiai, be „Opentrons“ programos. Naudokite jutiklinį ekraną, kad paleistumėte protokolo vykdymą, patikrintumėte darbo būseną ir pakeistumėte nustatymus tiesiai ant roboto.
„Flex“ moduliai telpa į korpusus, kurie užima vietą žemiau denio. „Caddies“ padeda jūsų laboratorijos reikmenis arčiau denio paviršiaus ir leidžia kabelius nutiesti žemiau denio. „Caddies“ įgalina dar daugiau modulių ir laboratorinių įrenginių konfigūracijų denyje.
„Flex“ denio lizdai yra sunumeruoti koordinačių sistema (A1D4), kuri yra panaši į tai, kaip šuliniai numeruojami laboratorijoje.
„Flex“ šiukšliadėžė gali būti keliose denio vietose. Numatytoji vieta (lizdas A3) yra rekomenduojama padėtis. Taip pat galite naudoti griebtuvą, kad išmestumėte šiukšles į pasirenkamą atliekų lataką.
Flex yra šiek tiek didesnis ir daug sunkesnis nei OT-2. „Flex“ diegimo užduotims atlikti reikalinga laboratorijos partnerio pagalba.
Išsamų roboto techninių specifikacijų palyginimą galima rasti Opentrons websvetainę.
Tiek Flex, tiek OT-2 robotai veikia mūsų atvirojo kodo programinėje įrangoje, o Opentrons App gali valdyti abiejų tipų robotus vienu metu. Nors OT-2 protokolų negalima paleisti tiesiogiai naudojant „Flex“, juos lengva pritaikyti (daugiau informacijos rasite Protokolo kūrimo skyriaus skyriuje „OT-2 protokolai“).
Flex darbo vietos
„Opentrons Flex“ darbo stotyse yra „Flex“ robotas, priedai, pipetės ir griebtuvas, denio moduliai ir laboratorinė įranga, reikalinga tam tikrai programai automatizuoti. Visi darbo vietos komponentai yra moduliniai. Jei reikia pakeisti programas, galite pridėti arba pakeisti kitą „Flex“ aparatinę įrangą ir suderinamas eksploatacines medžiagas.
12
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS: ĮVADAS
NGS DARBO STOTIS
„Opentrons Flex NGS Workstation“ automatizuoja NGS bibliotekos paruošimą. Jis gali automatizuoti išankstinio sekvenavimo darbo eigas naudojant bet kurią pirmaujančią reagentų sistemą, įskaitant suskaidymo ir tagmintimis grįstos bibliotekos paruošimas.
Be Flex roboto, NGS Workstation apima:
Griebtuvas Pipetės konfigūracijos pasirinkimas
Dvi 8 kanalų pipetės (1 µL ir 50 5 µL) 1000 kanalų pipetės (96 5 µL) atliekų latako magnetinio bloko temperatūros modulis Thermocycler Module Labware rinkinys su filtrų antgaliais, mikrocentrifugos vamzdeliais, rezervuarais ir PCR plokštelėmis
PCR DARBO STOTIS
„Opentrons Flex PCR“ darbo stotis automatizuoja PGR sąranką ir termociklo darbo eigas iki 96 s.amples. Jis gali alikvoti atšaldytus reagentus ir sampį 96 šulinėlių PGR plokštelę. Pridėję automatinį termociklerio modulį, naudokite griebtuvą, kad įkeltumėte plokštę į Thermocycler, tada paleiskite pasirinktą PGR programą.
Be „Flex“ roboto, PCR darbo stotyje yra:
Griebtuvas Pipetės konfigūracijos pasirinkimas
1 kanalo pipetės (1 µL) ir 50 kanalų pipetės (8 µL) 1 kanalų pipetės (50 96 µL) atliekų latako temperatūros modulio laboratorijos rinkinys su filtrų antgaliais, mikrocentrifugos vamzdeliais, rezervuarais ir PGR plokštelėmis
OPENTRONS FLEX
13
1 SKYRIUS: ĮVADAS
NULEORŪGŠČIŲ IŠSTRAUKIMO DARBO STOETA
Nukleino rūgščių ekstrahavimo darbo stotis „Opentrons Flex“ automatizuoja DNR/RNR išskyrimą ir gryninimą. Jame naudojamas magnetinis blokas magnetiniams rutuliukams atskirti, o šildytuvas-kratytuvasampmagnetinių granulių lizė ir resuspensija.
Be „Flex“ roboto, nukleino rūgščių ekstrahavimo darbo vietoje yra:
Griebtuvas Pipetės konfigūracijos pasirinkimas
1 kanalo pipetė (5 1000 µL) ir 8 kanalų pipetė (5 1000 µL) 96 kanalų pipetė (5 1000 µL) atliekų latako magnetinio bloko šildytuvo-kratytuvo modulis Laboratorijos rinkinys su filtrų antgaliais, rezervuarais ir giliųjų PCR plokštelėmis
MAGNETINIŲ KARALIŲ BALTYMŲ VALYMO DARBO STOTIS
„Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation“ automatizuoja nedidelio masto baltymų valymą ir proteomiką.ample prep iki 96 samples. Jis suderinamas su daugeliu populiarių magnetinių granulių reagentų.
Be „Flex“ roboto, baltymų valymo darbo stotyje yra:
Griebtuvas Pipetės konfigūracijos pasirinkimas
1 kanalo pipetė (5 1000 µL) ir 8 kanalų pipetė (5 1000 µL) 96 kanalų pipetė (5 1000 µL) atliekų latako magnetinio bloko šildytuvo-kratytuvo modulis Laboratorijos rinkinys su filtrų antgaliais, rezervuarais ir giliųjų PCR plokštelėmis
FLEX PREP DARBO STOTIS
Opentrons Flex Prep Workstation automatizuoja paprastas pipetavimo darbo eigas. Konfigūruokite darbo vietą naudodami 1 kanalo ir 8 kanalų pipetes, kad galėtumėte atlikti tokias užduotis kaip sample perdavimas, sample dubliavimas, ir
14
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS: ĮVADAS
reagentų alikvotavimas. Sukonfigūruokite darbo vietą naudodami 96 kanalų pipetę, kad atliktumėte didelio našumo reagento alikvotines dalis ir plokštelių st.amping.
Be „Flex“ roboto, „Flex Prep Workstation“ apima:
Pipetės konfigūracijos pasirinkimas: 1 kanalo pipetė (5 1000 µL) ir 8 kanalų pipetė (5 1000 µL) 96 kanalų pipetė (5 1000 µL)
Laboratorinių įrankių rinkinys su filtrų antgaliais, mikrocentrifugos mėgintuvėliais ir rezervuarais
PLAZIDĖS PARENGIMAS DARBO STOTIS
„Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation“ automatizuoja magnetinių granulių pagrindu pagamintos plazmidės ekstrahavimo ir valymo darbo eigą. Šioje darbo vietoje yra didelio tūrio pipetės, šildytuvo-kratytuvo modulis ir magnetinis blokas, kad būtų galima pritaikyti daugumą granulių pagrindu pagamintos chemijos.
Be Flex roboto, Plasmid Prep Workstation apima:
Griebtuvo 1 kanalo pipetė (5 1000 µL) ir 8 kanalų pipetė (5 1000 µL) atliekų latako magnetinio bloko šildytuvo-kratytuvo modulis Laboratorijos rinkinys su filtrų antgaliais, mikrocentrifugos vamzdeliais, rezervuarais, PGR plokštelėmis ir giliųjų šulinių plokštelėmis
SYNBIO DARBO STOTIS
Opentrons Flex SynBio Workstation automatizuoja įvairias sintetinės biologijos darbo eigas, tokias kaip DNR sintezė ir klonavimas. Jis naudoja magnetinį bloką ir temperatūros modulį, kad palaikytų daugumą granulių chemijos. Pridėkite Thermocycler modulį, kad atliktumėte šildomo dangčio inkubaciją ir amplifications.
Be Flex roboto, SynBio Workstation apima:
Griebtuvo 1 kanalo pipetės (5 1000 µL) ir 8 kanalų pipetės (5 1000 µL) magnetinio bloko temperatūros modulis
OPENTRONS FLEX
15
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Laboratorijos rinkinys su įprastais ir filtrų antgaliais, mikrocentrifugos mėgintuvėliais, rezervuarais, PGR plokštelėmis ir giliųjų šulinių plokštelėmis
1.2 Saugos informacija
Skysčių tvarkymo robotas Opentrons Flex sukurtas saugiam darbui. Norėdami užtikrinti saugų „Flex“ naudojimą, žiūrėkite šiame skyriuje pateiktas specifikacijas ir atitikties gaires. Šios rekomendacijos apima saugų gaminio įvesties ir išvesties jungčių naudojimą, įskaitant maitinimo ir duomenų jungtis, taip pat įspėjamąsias etiketes, esančias ant „Flex“ roboto ir susijusios aparatinės įrangos. Naudojant prietaisą kitaip nei nurodyta šiame vadove, gali kilti pavojus naudotojui ir įrangai.
Saugos simboliai
Įvairios etiketės ant „Flex“ ir šiame vadove įspėja apie galimo sužalojimo ar žalos šaltinius.
Simbolis
Aprašymas
Įspėjimas: įspėja naudotojus apie potencialiai pavojingas sąlygas. Veiksmai, kurie gali baigtis asmens sužalojimu arba mirtimi.
Įspėjimas: įspėja naudotojus, kad nepažeistumėte įrangos. Prarasti arba sugadinti duomenys. Neatkuriamas atliekamos operacijos pertraukimas.
Elektros smūgis: nustato prietaiso komponentus, dėl kurių gali kilti elektros smūgio pavojus, jei prietaisas bus naudojamas netinkamai.
Karštas paviršius: nustato prietaiso komponentus, dėl kurių kyla pavojus susižaloti dėl aukšto karščio/temperatūros, jei prietaisas naudojamas netinkamai.
Suspaudimo taškas: nurodo prietaiso komponentus, kurie judant gali kelti pavojų susižeisti.
16
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Ant Flex rasite šias etiketes:
Intelektinės nuosavybės etiketės Reguliavimo atitikties etiketės (pvz., ETL) Elektros pavojaus etiketės Bendrosios įspėjamosios etiketės Produkto etiketės Suspaudimo taško etiketės Didelio tūriotage etiketės Galios įvertinimo etiketės
Elektros saugos įspėjimai
Visada laikykitės šių elektros saugos įspėjimų:
Simbolis
Aprašymas
Prijunkite robotą į įžemintą 1 klasės grandinę. Žr. skyriaus „Sistemos aprašymas“ skyrių „Maitinimo prijungimas“.
Nejunkite (prijunkite), neatjunkite (atjunkite) ir nenaudokite kintamosios srovės maitinimo kabelių, jei: Kabelis yra susidėvėjęs arba pažeistas. Kiti prijungti kabeliai, laidai ar lizdai yra susidėvėję arba pažeisti.
Naudojant pažeistus maitinimo laidus gali kilti elektros smūgio pavojus, rimtai susižaloti arba sugadinti robotą.
Nekeiskite kintamosios srovės maitinimo laido, nebent taip nurodė Opentrons Support.
Daugiau informacijos apie elektros reikalavimus rasite skyriaus Įrengimas ir perkėlimas skirsnyje Energijos suvartojimas.
OPENTRONS FLEX
17
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Papildomi saugos įspėjimai
Visada laikykitės šių papildomų saugos įspėjimų:
Simbolis
Aprašymas
Opentrons Flex nebuvo sertifikuotas naudoti su sprogiais ar degiais skysčiais. Nedėkite į robotą plokščių, vamzdelių ar buteliukų, kuriuose yra sprogių arba degių skysčių, ir kitaip nenaudokite prietaiso, kai korpuse yra sprogių ar degių skysčių.
Dirbdami su cheminėmis medžiagomis laikykitės geros laboratorinės praktikos ir laikykitės gamintojo atsargumo priemonių. „Opentrons“ nėra atsakinga ir neatsako už žalą, padarytą dėl pavojingų cheminių medžiagų naudojimo arba dėl jų naudojimo.
„Flex“ sveria 88.5 kg (195 svarus). Todėl jį saugiai pakelti ir perkelti reikia dviejų žmonių. Žr. skyrių „Perkėlimas“ skyriuje „Įrengimas ir perkėlimas“.
„Flex“ turi būti pastatytas ant paviršiaus, galinčio atlaikyti 88.5 kg (195 svarų) svorį ir kurio paviršiaus plotas būtų pakankamas, kad tilptų robotas ir jo minimalus atstumas (20 cm/8 colių). Žr. skyrių Saugos ir eksploatavimo reikalavimai skyriuje Įrengimas ir perkėlimas.
Flex veikimo metu gali skleisti vibraciją. Padėkite robotą ant tvirto, lygaus ir vandeniui atsparaus paviršiaus su kryžminėmis arba suvirintomis jungtimis. Žr. skyrių Saugos ir eksploatavimo reikalavimai skyriuje Įrengimas ir perkėlimas.
Saugos įspėjimai
Norėdami apsaugoti Flex nuo pažeidimų, laikykitės šių atsargumo priemonių:
18
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Simbolis
Aprašymas
Naudokite laboratorinę įrangą, kuri yra suderinama su ANSI / SLAS arba patvirtinta Opentrons. Žr. skyrių „Labware“.
Korozines medžiagas, priemones ar kitaip žalojančias medžiagas laikykite toliau nuo roboto.
Biologinė sauga
Mėginius ir reagentus, kurių sudėtyje yra medžiagų, paimtų iš žmonių, laikykite potencialiai infekcinius agentus. Opentrons rekomenduoja naudoti saugias laboratorines procedūras, kaip paaiškinta Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6th Edition.
Įprastomis aplinkybėmis Flex nesukuria aptinkamų aerozolių iš šaltinio skysčių. Tačiau tam tikromis sąlygomis iš šaltinių skysčių galima susidaryti aerozolių. Kai dirbate su 2 ar aukštesnio biologinio saugumo lygio šaltinio skysčiais, pagal savo vietines reguliavimo institucijas apsvarstykite galimybę imtis atsargumo priemonių, kad išvengtumėte aerozolio poveikio. Kad sumažintumėte galimą roboto aerozolio poveikio riziką, įsitikinkite, kad:
Atlikite techninę priežiūrą, kaip aprašyta skyriuje Priežiūra ir aptarnavimas. Tinkamai sumontuokite ir pritvirtinkite visus instrumentų dangčius, pipetes, modulius ir laboratorijos reikmenis. Naudokite tinkamą pipetavimo techniką, kad sumažintumėte aerozolių kiekį.
Toksiški dūmai
Jei dirbate su lakiaisiais tirpikliais ar toksiškomis medžiagomis, naudokite efektyvią laboratorinę vėdinimo sistemą, kad pašalintumėte bet kokius garus, kurie gali susidaryti.
Degūs skysčiai
Flex nebuvo įvertintas kaip tinkamas naudoti su degiais skysčiais ir neturėtų būti naudojamas su degiais skysčiais.
OPENTRONS FLEX
19
1 SKYRIUS: ĮVADAS
1.3 Teisės aktų laikymasis
Opentrons Flex atitinka visus taikomus toliau pateiktų saugos ir elektromagnetinių standartų reikalavimus.
Saugumas
Taisyklės ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Pavadinimas
Saugos reikalavimai matavimo, valdymo ir laboratorijos elektros įrangai 1 dalis. Bendrieji reikalavimai
Ypatingi reikalavimai laboratorinei maišymo ir maišymo įrangai
Elektromagnetinis suderinamumas
Taisyklės ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR 15 dalies B poskyrio A klasės IC ICES-003
Pavadinimas
Elektros įranga, skirta matavimui, kontrolei ir laboratoriniam naudojimui EMS reikalavimai 1 dalis. Bendrieji reikalavimai Netyčiniai radiatoriai
Spektro valdymas ir telekomunikacijų trikdžius sukelianti įranga Standartinė informacinių technologijų įranga (įskaitant skaitmeninius aparatus)
FCC įspėjimai ir pastabos
Įspėjimas: šio įrenginio pakeitimai ar modifikacijos, kurių Opentrons aiškiai nepatvirtino, gali panaikinti vartotojo teisę naudoti įrangą.
Šis įrenginys atitinka FCC taisyklių 15 dalį. Operacija priklauso nuo šių sąlygų:
20
OPENTRONS FLEX
1 SKYRIUS: ĮVADAS
Šis prietaisas negali sukelti žalingų trukdžių. Šis įrenginys turi priimti bet kokius gaunamus trikdžius, įskaitant trikdžius, kurie gali sukelti nepageidaujamų
operacija.
Pastaba: ši įranga buvo išbandyta ir nustatyta, kad ji atitinka A klasės skaitmeninio įrenginio apribojimus pagal FCC taisyklių 15 dalį. Šios ribos sukurtos siekiant užtikrinti tinkamą apsaugą nuo žalingų trukdžių, kai įranga naudojama komercinėje aplinkoje. Ši įranga generuoja, naudoja ir gali spinduliuoti radijo dažnių energiją ir, jei ji sumontuota ir naudojama ne pagal instrukcijų vadovą, gali sukelti žalingų radijo ryšio trikdžių. Naudojant šią įrangą gyvenamojoje vietovėje gali kilti žalingų trikdžių, tokiu atveju vartotojas turės ištaisyti trikdžius savo lėšomis.
Kanados ISED atitiktis
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Šis gaminys atitinka taikomas Kanados inovacijų, mokslo ir ekonominės plėtros technines specifikacijas.
Present produit est conforme aux pécifications techniks taikomas d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Aplinkos įspėjimas
Įspėjimas: vėžys ir žala reprodukcijai www.P65Warnings.ca.gov
„Wi-Fi“ išankstinis sertifikavimas
„Wi-Fi“ modulis yra sertifikuotas naudoti daugelyje regionų:
Jungtinės Valstijos (FCC): FCC identifikatorius UAY-W8997-M1216 Europos ekonominė erdvė (CE): nėra viešo identifikatoriaus (savarankiška deklaracija) Kanada (IC): aparatinės įrangos versijos identifikavimo numeris W8997-M1216 Japonija (TELEC): sertifikuotas numeris 020-170034 Indija (WPC): registracijos numeris ETA-SD-20191005525 (savarankiška deklaracija)
OPENTRONS FLEX
21
2 SKYRIUS
Montavimas ir perkėlimas
Šiame skyriuje aprašoma, kaip paruošti laboratoriją Opentrons Flex, kaip nustatyti robotą ir, jei reikia, jį perkelti. Prieš priimdami „Flex“ pristatymą, įsitikinkite, kad jūsų laboratorija ar įrenginys atitinka visus „Saugos ir eksploatavimo reikalavimų“ skyriaus kriterijus. Atėjus laikui paleisti „Flex“ ir paleisti, vadovaukitės išsamiomis instrukcijomis, pateiktomis skyriuose „Išpakavimas“, „Pirmasis paleidimas“ ir „Prietaiso diegimas ir kalibravimas“, arba naudokite „Opentrons Onsite Support Set Up“ paslaugą. Ir jei kada nors reikės perkelti savo Flex į naują vietą, netoli ar toli, atlikite skyriuje Perkėlimas nurodytus veiksmus.
2.1 Saugos ir eksploatavimo reikalavimai
Kur įdėti Opentrons Flex
Erdvė yra vertinga prekė beveik kiekvienoje laboratorijoje. Jūsų „Flex“ reikės šiek tiek, bet ne per daug, nes jis sukurtas taip, kad tilptų ant pusės standartinio laboratorijos suolo. Įsitikinkite, kad turite erdvę, kuri atitinka šiuos kriterijus.
Suolo paviršius: stacionarus, tvirtas, lygus, vandeniui atsparus paviršius. Nerekomenduojami stalai ar suolai su ratukais (net ir fiksuojančiais ratais). Flex greitai juda ir turi daug masės, dėl kurios gali sujudėti ar išbalansuoti lengvus ar kilnojamus stalus.
Svorio guolis: vienas robotas sveria 88.5 kg (195 svarai) ir jį turėtų kelti tik du kartu dirbantys žmonės. Padėkite robotą ant paviršiaus, kuris gali lengvai išlaikyti jo svorį ir bet kokių modulių, laboratorinių reikmenų, skysčių ar kitos laboratorinės įrangos, kuri bus naudojama jūsų programose, svorį.
Veikimo vieta: roboto pagrindo matmenys yra 87 cm P x 69 cm D x 84 cm A (apie 34 col. x 27 ' x 33 col.). „Flex“ reikia 20 cm (8 colių) šoninės ir galinės laisvos vietos kabeliams, USB jungtims ir išmetamųjų dujų išmetimui iš šildančių ir vėsinančių modulių.
Įspėjimas: Nestatykite „Flex“ šonų ar galinės pusės lygiai prie sienos.
22
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
84 cm 33 colio
87 cm 34 colio
Opentrons Flex pagrindo matmenys.
69 cm 27 colio
20 cm 8 colio
20 cm 8 colio
20 cm 8 colio
Į viršų view Opentrons Flex, rodantis minimalų šoninį ir galinį prošvaisą.
OPENTRONS FLEX
23
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Energijos suvartojimas
„Opentrons Flex“ turi būti prijungtas prie sieninio lizdo toje vietoje, kurioje jį montuojate, arba šalia jo. „Flex“ junkite tik prie grandinių, kurios gali pritaikyti didžiausią jo galią:
Įvesties galia: 36 VDC, 6.1 A Sąnaudos tuščiąja eiga: 30 W Įprastos sąnaudos: 40 W (protokolo veikimo metu) Maksimalus suvartojimas: apie 50 W
Tikslus energijos suvartojimas priklauso nuo:
Protokolo metu atlikto judesio kiekis ir tipas. Laikas, kurį robotas praleidžia nenaudojamas. Roboto lempučių būsena. Kiek instrumentų pritvirtinta.
Nepamirškite atsižvelgti į kitą elektroniką, kuri naudoja energiją toje pačioje grandinėje, įskaitant „Flex“ modulius su savo maitinimo šaltiniais. Pavyzdžiui,ample, Thermocycler Module sunaudoja maksimalią galią (630 W), kuri yra daug didesnė nei paties Flex roboto. Jei reikia, pasitarkite su savo įstaigos vadovu, kad įsitikintumėte, jog jis atitinka jūsų įrangos galios reikalavimus.
Aplinkos sąlygos
Rekomenduojamo naudojimo, priimtino naudojimo ir laikymo aplinkos sąlygos skiriasi:
Rekomenduojamas sistemos veikimui
Priimtinas sistemos veikimui
Aplinkos temperatūra nuo +20 iki +25 °C
+2 iki +40 °C
Santykinė oro drėgmė Aukštis virš jūros lygio
40%, nekondensuojantis
Maždaug 500 m virš jūros lygio
30%, nekondensuojantis (žemesnėje kaip 80 °C)
Iki 2000 m virš jūros lygio
Sandėliavimas ir transportavimas
-10 iki +60 °C
10%, nekondensuojantis (žemesnėje kaip 85 °C)
Iki 2000 m virš jūros lygio
24
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
„Opentrons“ patvirtino „Opentrons Flex“ veikimą rekomenduojamomis sistemos veikimo sąlygomis, o veikimas tokiomis sąlygomis turėtų užtikrinti optimalius rezultatus. Flex yra saugu naudoti sistemos veikimui priimtinomis sąlygomis, tačiau rezultatai gali skirtis. Neįjunkite ir nenaudokite „Flex“ sąlygomis, kurios nepatenka į šias ribas. Laikymo ir transportavimo sąlygos taikomos tik tada, kai robotas yra visiškai atjungtas nuo maitinimo ir kitos įrangos.
2.2 Išpakavimas
Sveikiname! Jūsų „Opentrons Flex“ atvežtas ir jūs paruošėte jam vietą savo laboratorijoje. Atidarykime tą pabaisos dėžę, išimkime robotą ir paruošime jį darbui. Šiame skyriuje pateiktoje informacijoje pateikiamas dalių sąrašas ir instrukcijos, padėsiančios atlikti veiksmus, kurių reikia norint išpakuoti, nustatyti ir paruošti naudojimui „Flex“. Sąrankos procedūrą suskirstėme į tris dalis:
1 dalis apima dėžės išardymą. 2 dalis apima Flex nuėmimą nuo dėžės ir perkėlimą į galutinę surinkimo vietą. 3 dalis apima galutinį roboto surinkimą ir maitinimo įjungimą pirmą kartą.
Reikia pastangų ir laiko
Norėsite paprašyti laboratorijos partnerio padėti išpakuoti, pakelti, perkelti ir surinkti. Šioms pastangoms turėsite skirti nuo 30 minučių iki valandos.
Pastaba: norint tinkamai pakelti „Flex“, reikia dviejų žmonių. Be to, „Flex“ kėlimas ir nešimas už rankenų yra geriausias būdas perkelti robotą.
Dėžė ir pakavimo medžiaga
Išpakavus „Flex“, gausite nuostabų robotą, tačiau taip pat lieka keletas didelių dėžės plokščių, įvairių gabenimo komponentų ir kamšalų. Nors galite išmesti šią medžiagą, rekomenduojame pasilikti šiuos daiktus, jei yra vietos saugykloje. Pakuotė yra daugkartinio naudojimo, o tai padeda paruošti jūsų „Flex“ siuntimui, jei kada nors reikės jį išsiųsti kur nors kitur (pvz., į konferenciją ar naują objektą).
OPENTRONS FLEX
25
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Produkto elementai
Flex pristatomas su toliau išvardytais komponentais. Pipetės, griebtuvas ir moduliai yra atskirose pakuotėse iš pagrindinės „Flex“ dėžutės, net jei pirkote juos kartu kaip darbo vietą.
(1) Opentrons Flex robotas
(1) USB laidas
(1) Maitinimo kabelis
(1) Ethernet kabelis
(5) L formos raktai (12 mm šešiabriauniai, 1.5 mm šešiakampiai, 2.5 mm šešiakampiai, 3 mm šešiakampiai,
T10 Torx)
(1) Avarinio stabdymo pakabukas
(1) Denio lizdas su laboratorinių įrankių spaustukais
(4) Atsarginiai laboratorinių reikmenų spaustukai
(1) Pipetės kalibravimo zondas
(4) Nešiojimo rankenos ir dangteliai
(1) Viršutinė lango plokštė
(4) Šoninės langų plokštės
(1) 2.5 mm šešiabriaunis atsuktuvas
(1) 19 mm veržliaraktis
(16 ir daugiau atsarginių dalių) Langų varžtai (M4x8 mm plokščia galvutė)
26
(10) Atsarginiai denio lizdo varžtai (M4x10 mm lizdo galvutė)
(12) Atsarginiai denio spaustuko varžtai (M3x6 mm lizdo galvutė)
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
1 dalis: išimkite dėžę
„Opentrons“ pristato jūsų „Flex“ tvirtoje faneros dėžėje. Siuntimo dėžėje naudojamas kabliukas ir skląstisamps sujungti viršutinę, šoninę ir apatinę plokštes. Jei naudojate skląsčius, o ne vinius ar varžtus, jums nereikės laužtuvo (ar daug jėgos), kad išardytumėte dėžę, o vėliau, jei reikės, galėsite ją surinkti iš naujo.
Pastaba: gabenimo metu dėžės kraštai gali sutirštėti. Norėdami apsaugoti rankas nuo medžio drožlių, galite mūvėti darbo pirštines.
Norėdami atlaisvinti skląsčius, pasukite skląsčio skirtuką aukštyn ir pasukite į kairę (prieš laikrodžio rodyklę). Šis veiksmas perkelia clamp ištraukite ranką iš atitinkamo laikiklio. Tada galite atsukti skląsčio svirtį nuo dėžės.
1 Atrakinkite aštuonis skląsčius, laikančius viršų į šonus.
2 Atleidę skląsčius, nuimkite viršutinį skydelį.
OPENTRONS FLEX
27
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS 3 Nupjaukite mėlyną gabenimo maišelį, išimkite šiuos elementus iš kamšalo ir padėkite į šalį:
Vartotojo rinkinio maitinimo, eterneto ir USB laidai Emergency Stop Pakabukas
4 Nuimkite viršutinę putplasčio paminkštinimo dalį, kad atskleistumėte langų plokštes. Paminkštinimas apsaugo šonines ir viršutines plokštes.
5 Nuimkite langų plokštes ir padėkite jas į šalį. Juos pridėsite vėliau.
28
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
6 Atrakinkite likusius 16 skląsčių, laikančių šonines plokštes vienas prie kito ir dėžės pagrindą. 7 Nuimkite šonines plokštes ir padėkite jas į šalį.
2 dalis: Atleiskite Flex
Atlikę 1 dalyje nurodytus veiksmus, dabar turėtumėte pamatyti robotą, esantį apsauginiame maišelyje ir pritvirtintą prie oranžinių plieninių tvirtinimo komponentų. Krepšys apgaubia robotą ir apsaugo jį nuo išorinės aplinkos. Plieniniai laikikliai pritvirtina robotą prie dėžės dugno. Du transportavimo rėmai palaiko robotą, tolygiai paskirstydami jo svorį ir išlaikydami standų, kad gabenant nesikreiptų. Toliau išpakuokite „Flex“ ir nuimkite jį nuo dėžės pagrindo.
8 Naudodami 19 mm veržliaraktį iš vartotojo rinkinio, atsukite laikiklius nuo dėžės dugno. Galite išmesti skliaustus arba išsaugoti juos naudoti ateityje.
OPENTRONS FLEX
29
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS 9 Patraukite arba susukite siuntimo maišą iki galo žemyn, kad atskleistumėte visą robotą.
10 Laboratorijos partnerio pagalba suimkite už oranžinių gabenimo rėmelių rankenų abiejose roboto pagrindo pusėse, pakelkite „Flex“ nuo dėžės pagrindo ir padėkite ant grindų. Išsaugokite arba išmeskite dėžės pagrindą ir transportavimo rėmą.
30
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS 11 Naudodami 12 mm šešiabriaunį L formos raktą iš vartotojo rinkinio, nuimkite keturis varžtus, laikančius transportavimo rėmus.
Flex. Išsaugokite arba išmeskite rėmus ir varžtus.
12 Nuimkite keturias aliuminio rankenas iš vartotojo rinkinio. Įsukite rankenas į tas pačias vietas, kuriose buvo 12 mm transportavimo rėmo varžtai.
OPENTRONS FLEX
31
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
13 Laboratorijos partnerio pagalba pakelkite „Flex“ už nešimo rankenų ir perkelkite ant darbastalio, kad galėtumėte galutinai surinkti.
3 dalis: Galutinis surinkimas ir įjungimas
Perkėlus „Flex“ į laikiną darbo vietą arba nuolatinius jo namus, laikas atnaujinti savo naująjį robotą.
14 Jei perkėlėte robotą į galutinę darbo vietą, nuimkite nešiojimo rankenas ir uždėkite jas apdailos dangteliais. Dangteliai uždaro rankenos angas rėme ir suteikia robotui švarią išvaizdą. Grąžinkite rankenas į vartotojo rinkinį saugoti.
32
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
15 Išimkite viršutines ir šonines plokštes iš pakavimo putplasčio, kurį atidėjote nuėmę dėžės viršų.
16 Pritvirtinkite langų plokštes prie „Flex“ vadovaudamiesi priekinės apsauginės plėvelės ženklinimo informacija. Tada nuimkite apsauginę plėvelę.
17 Naudodami nuožulnus lango varžtus ir 2.5 mm atsuktuvą iš vartotojo rinkinio, pritvirtinkite langų plokštes prie Flex. Įsitikinkite, kad nuožulnios (V formos) skylės langų plokštėse yra nukreiptos į išorę (į jus). Tai leidžia varžtams priglusti prie lango paviršiaus.
Įspėjimas: Neteisingai nukreipus plokštes galite sugadinti. Per didelis varžto sukimo momentas gali sulaužyti plokštes. Ranka priveržkite varžtus, kol langų plokštės bus pakankamai saugios. Tai nėra jėgų išbandymas.
OPENTRONS FLEX
33
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS 18 Naudodami 2.5 mm atsuktuvą iš vartotojo rinkinio, atsukite fiksavimo varžtus iš portalo. Šie
varžtai neleidžia portalui judėti gabenant. Portalo fiksavimo varžtai yra: ant kairiojo šoninio bėgio šalia roboto priekio. Po vertikalia portalo svirtimi. Ant dešiniojo šoninio bėgio šalia roboto priekio oranžiniame laikiklyje. Čia yra du varžtai.
Portalas lengvai juda rankomis, atsukus visus transportavimo varžtus. 19 Nupjaukite ir nuimkite dvi gumines juostas, kurios gabenimo metu laiko šiukšliadėžę.
34
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
20 Prijunkite maitinimo laidą prie Flex ir įkiškite į sieninį lizdą. Įsitikinkite, kad denio srityje nėra kliūčių. Apverskite maitinimo jungiklį, esantį roboto gale, kairėje. Įjungus, platforma persikelia į pradinę vietą, o jutikliniame ekrane rodomos papildomos konfigūracijos instrukcijos.
Dabar, kai jūsų „Flex“ išimtas iš dėžutės ir paruoštas naudoti, pereikite prie toliau esančio skyriaus „Pirmasis paleidimas“.
2.3 Pirmas važiavimas
Prieš prijungdami bet kokią kitą aparatinę įrangą prie „Flex“, jutikliniame ekrane atlikite pagrindinę sąranką. Robotas padės jums prisijungti prie laboratorijos tinklo, atnaujinti naujausią programinę įrangą ir suasmeninti „Flex“, suteikdamas jam pavadinimą.
Maitinimas
Kai įjungsite „Flex“, jutikliniame ekrane pasirodys „Opentrons“ logotipas. Po kelių akimirkų bus rodomas ekranas „Sveiki atvykę į jūsų Opentrons Flex“.
„Opentrons Flex“ pasveikinimo ekranas. Šį ekraną turėtumėte matyti tik pirmą kartą paleidę Flex.
OPENTRONS FLEX
35
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Prisijunkite prie tinklo arba kompiuterio
Vykdykite jutikliniame ekrane pateikiamus nurodymus, kad prijungtumėte robotą, kad jis galėtų patikrinti, ar nėra programinės įrangos naujinių ir gauti protokolą files. Yra trys prisijungimo būdai: „Wi-Fi“, „Ethernet“ ir USB.
Tinklo ryšio parinktys. Norėdami nustatyti „Flex“, turite turėti interneto ryšį. „Wi-Fi“: naudokite jutiklinį ekraną, kad prisijungtumėte prie „Wi-Fi“ tinklų, apsaugotų WPA2 asmeniniu autentifikavimu (dauguma tinklų, kuriems norint prisijungti reikia tik slaptažodžio, patenka į šią kategoriją).
Pastaba: „Flex“ nepalaiko fiksuotų portalų (tinklų, kurie neturi slaptažodžio, bet įkelia a webpuslapį, kad prisijungus būtų galima autentifikuoti vartotojus).
Taip pat galite prisijungti prie atviro „Wi-Fi“ tinklo, tačiau tai nerekomenduojama.
Įspėjimas: Prisijungus prie atviro „Wi-Fi“ tinklo, visi tinklo signalo diapazone esantys asmenys galės valdyti jūsų Opentrons Flex robotą be autentifikavimo.
Jei reikia prisijungti prie „Wi-Fi“ tinklo, kuriame naudojamas įmonės autentifikavimas (įskaitant „eduroam“ ir panašius akademinius tinklus, kuriems reikalingas vartotojo vardas ir slaptažodis), pirmiausia prisijunkite prie „Opentrons“ programos per Ethernet arba USB, kad užbaigtumėte pradinę sąranką. Tada savo „Flex“ tinklo nustatymuose prisijunkite prie įmonės „Wi-Fi“ tinklo. Norėdami pasiekti tinklo nustatymus:
36
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
1. Spustelėkite Devices kairiojoje Opentrons programos šoninėje juostoje. 2. Spustelėkite trijų taškų meniu () savo Flex ir pasirinkite Robot Settings. 3. Spustelėkite skirtuką Networking.
Išskleidžiamajame meniu pasirinkite savo tinklą arba pasirinkite „Prisijungti prie kito tinklo…“ ir įveskite jo SSID. Pasirinkite įmonės autentifikavimo metodą, kurį naudoja jūsų tinklas. Palaikomi metodai yra šie:
EAP-TTLS su TLS EAP-TTLS su MS-CHAP v2 EAP-TTLS su MD5 EAP-PEAP su MS-CHAP v2 EAP-TLS
Kiekvienam iš šių metodų reikalingas vartotojo vardas ir slaptažodis, o priklausomai nuo tikslios tinklo konfigūracijos gali reikėti sertifikato files ar kitas parinktis. Norėdami sužinoti daugiau apie tinklo sąranką, kreipkitės į savo įstaigos IT dokumentaciją arba susisiekite su IT vadovu.
Ethernet: prijunkite savo robotą prie tinklo jungiklio arba šakotuvo eterneto kabeliu. Taip pat galite prisijungti tiesiogiai prie savo kompiuterio Ethernet prievado, pradedant nuo 7.1.0 roboto sistemos versijos.
USB: Prijunkite pateiktą USB A-B laidą prie roboto USB-B prievado ir atviro kompiuterio prievado. Jei kompiuteryje nėra USB-A prievado, naudokite USB B-to-C kabelį arba USB A-C adapterį.
Norint tęsti sąranką, prijungtame kompiuteryje turi būti įdiegta ir paleista programa „Opentrons“. Išsamesnės informacijos apie Opentrons programėlės diegimą rasite skyriuje Programos diegimas skyriuje Programinė įranga ir veikimas.
Įdiekite programinės įrangos naujinimus
Dabar, kai esate prisijungę prie tinklo ar kompiuterio, robotas gali patikrinti, ar nėra programinės įrangos ir programinės įrangos naujinių, ir, jei reikia, juos atsisiųsti. Jei yra naujinimas, jo įdiegimas gali užtrukti kelias minutes. Kai atnaujinimas bus baigtas, robotas paleis iš naujo.
OPENTRONS FLEX
37
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Pritvirtinkite avarinio stabdymo pakabuką
Prijunkite pridedamą avarinio stabdymo pakabuką (E-stop) prie papildomo prievado (AUX-1 arba AUX-2), esančio roboto gale.
Prieš ir po avarinio stabdymo pakabuko prijungimo.
Pritvirtinti ir įjungti E-stop yra privaloma, norint pritvirtinti prietaisus ir paleisti protokolus „Flex“. Daugiau informacijos apie E-stop naudojimą roboto veikimo metu rasite sistemos aprašymo skyriaus avarinio stabdymo pakabukas skyriuje.
Suteik savo robotui vardą
Suteikę robotui pavadinimą, galėsite lengvai jį atpažinti laboratorijos aplinkoje. Jei tinkle turite kelis Opentrons robotus, būtinai suteikite jiems unikalius pavadinimus. Kai patvirtinsite savo roboto pavadinimą, būsite nukreipti į „Opentrons Flex“ prietaisų skydelį. Tikėtina, kad kitas veiksmas, kurį norėsite atlikti, yra instrumentų pritvirtinimas, kuris bus aptartas kitame skyriuje.
2.4 Prietaiso įrengimas ir kalibravimas
Po pradinės roboto sąrankos, kitas žingsnis yra prie roboto pritvirtinti instrumentus ir juos kalibruoti.
Norėdami įdiegti instrumentą, pirmiausia palieskite Instrumentai jutikliniame ekrane arba eikite į "Opentrons" programos įrenginio išsamios informacijos ekrano skyrių "Pipetės ir moduliai". Pasirinkite tuščią laikiklį ir pasirinkite Attach Pipette arba Attach Gripper. Jei laikiklis, kurį norite naudoti, jau užimtas, pirmiausia turite nuimti pipetę arba griebtuvą.
38
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Pastaba: bendras diegimo procesas yra vienodas, nepaisant to, ar naudojate jutiklinį ekraną, ar „Opentrons“ programą. Nepriklausomai nuo to, kokį įrenginį pradėsite naudoti, jis valdys diegimo procesą, kol jį užbaigsite arba atšauksite.
Jei pradėsite nuo jutiklinio ekrano, programa parodys, kad robotas yra „užimtas“. Jei pradėsite nuo programėlės, jutikliniame ekrane bus rodomas modalas, nurodantis, kad vyksta instrumento diegimas.
Tikslus diegimo procesas priklauso nuo prijungiamo instrumento, kaip aprašyta toliau pateiktuose skyriuose. Visi prietaisai turi automatizuotą kalibravimo procedūrą, kurią turėtumėte atlikti iškart po įdiegimo.
Pipetės montavimas
Kai įdėsite pipetę, jutikliniame ekrane arba programėlėje Opentrons bus atlikti toliau nurodyti veiksmai.
1. PASIRINKITE PIPETĖS TIPĄ Pasirinkite iš 1 arba 8 kanalų pipetės arba 96 kanalų pipetės. Norint pritvirtinti 96 kanalų pipetę, reikia atlikti kelis papildomus veiksmus, nes ji tvirtinama prie specialios tvirtinimo plokštės, kuri apima abu pipetės laikiklius.
2. PASIRENGIMAS MONTAVIMUI Nuimkite laboratorinius įrankius nuo denio ir išvalykite darbo vietą, kad būtų lengviau pritvirtinti ir kalibruoti. Taip pat surinkite reikiamą įrangą, pvz., kalibravimo zondą, šešiabriaunį atsuktuvą ir montavimo plokštę (96 kanalų pipetei).
3. PRIJUNGITE IR UŽTIKRINKITE PIPETĘ Portalas pajudės į roboto priekį, kad galėtumėte pritvirtinti pipetę.
1 ir 8 kanalų pipetės jungiamos tiesiai prie pipetės laikiklio. 96 kanalų pipetei reikia tvirtinimo plokštės. Norėdami pritvirtinti tvirtinimo plokštę, pirmiausia turite atjungti dešiniojo pipetės laikiklio z ašies vežimėlį.
OPENTRONS FLEX
39
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Prijunkite pipetę prie pasirinkto pipetės laikiklio ir pritvirtinkite jo varžtus.
4. VYKDYKITE AUTOMATIZUOTĄ KALIBRAVIMĄ Norėdami sukalibruoti pipetę, pritvirtinkite kalibravimo zondą prie atitinkamo pipetės antgalio. Pipetė automatiškai judės, kad paliestų tam tikrus antdėklo taškus ir išsaugos šias kalibravimo vertes, kad galėtumėte naudoti ateityje. Kai kalibravimas bus baigtas ir pašalinsite zondą, pipetė bus paruošta naudoti protokoluose.
Griebtuvo montavimas
Įdiegę griebtuvą, jutikliniame ekrane arba „Opentrons“ programoje būsite nukreipti atlikti toliau nurodytus veiksmus.
1. PASIRENGIMAS MONTAVIMUI Nuimkite laboratorinius įrankius nuo denio ir išvalykite darbo vietą, kad būtų lengviau pritvirtinti ir kalibruoti. Taip pat surinkite reikiamą šešiabriaunį atsuktuvą ir įsitikinkite, kad kalibravimo kaištis yra griebtuvo laikymo vietoje.
2. PRIJUNGITE IR UŽTIKRINKITE GRIEBETĮ Portalas pajudės į roboto priekį, kad galėtumėte pritvirtinti griebtuvą. Prijunkite griebtuvą prie prailginimo laikiklio ir pritvirtinkite jo varžtus.
3. VYKDYKITE AUTOMATIZUOTĄ KALIBRAVIMĄ Norėdami sukalibruoti griebtuvą, įkiškite kalibravimo kaištį į priekinį žandikaulį. Griebtuvas automatiškai pajudės, kad paliestų tam tikrus denio taškus ir išsaugos šias kalibravimo vertes naudoti ateityje. Tada pakartokite tą patį procesą su kalibravimo kaiščiu užpakaliniame žandikaulyje. Kai kalibravimas bus baigtas ir kaištį įdėsite atgal į saugojimo vietą, griebtuvas bus paruoštas naudoti protokoluose.
2.5 Perkėlimas
Šiame skyriuje pateikiami patarimai ir instrukcijos, kaip perkelti Opentrons Flex robotą trumpais ir dideliais atstumais.
40
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Trumpi judesiai
Trumpas judesys apima įvairius atstumus nuo „šiek tiek perkelkime“ iki laboratorijos, koridoriaus ar kito jūsų pastato aukšto. Tokiais atvejais „Flex“ galite perkelti ranka. Taip pat geras pasirinkimas yra gabenti jį ant rankinio vežimėlio.
Įspėjimas: „Flex“ sveria 88.5 kg. Todėl jį saugiai pakelti ir perkelti reikia dviejų žmonių.
Vėl pritvirtinkite kėlimo rankenas, kad perkeltumėte „Flex“ į naują netoliese esančią vietą. Flex kėlimas ir nešimas už rankenų yra tinkamas būdas perkelti robotą nedideliais atstumais. Nuimkite rankenas ir, baigę perkėlimą, laikykite jas vartotojo rinkinyje. Kad nesugadintumėte roboto, visada naudokite kėlimo rankenas, kad jį paimtumėte ir perkeltumėte. Negriebkite už rėmo, norėdami pakelti ar perkelti savo robotą.
Judėjimai dideliais atstumais
Perkeliant ilgą atstumą jūsų „Flex“ iškeliauja iš universiteto, objekto ar įstaigos teritorijos. Visame mieste, į naują miestą, valstiją, provinciją ar šalį yra buvęamples judesiai dideliais atstumais. Tokiu atveju turėsite supakuoti „Flex“, kad apsaugotumėte jį nuo elementų, smūgių ir šiurkščių judesių, kurie gali atsirasti gabenant.
Jei išsaugojote siuntimo dėžę ir vidines atramas, gautas kartu su „Flex“, galite perpakuoti ją į šias medžiagas, kad galėtumėte gabenti didelius atstumus. Vykdykite išpakavimo veiksmus atvirkštine tvarka, kad paruoštumėte savo „Flex“ važiavimui dideliais atstumais. Iš esmės turėtumėte:
Atjunkite maitinimo ir tinklo kabelį, jei prijungti. Pašalinkite visą prijungtą techninę ir laboratorinę įrangą. Vėl pritvirtinkite denio plokštes. Užrakinkite portalą (žr. skyrių „Bendrieji perkėlimo patarimai“ toliau). Nuimkite ir saugokite langų plokštes.
Jei pasilikote originalią dėžę:
Vėl pritvirtinkite transportavimo rėmą prie Flex ir pritvirtinkite jį prie padėklo pagrindo naudodami L formos laikiklius. Pridėkite kamšalą ir vėl surinkite siuntimo dėžę.
OPENTRONS FLEX
41
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Jei neturite originalios dėžės ir susijusios medžiagos, susisiekite su patikima siuntų įmone. Jie gali valdyti pakavimo, transportavimo ir pristatymo procesą už jus.
Bendras judėjimo patarimas
ATJUNKITE MAITINIMO IR TINKLO KABELIUS Prieš perkeldami „Flex“, nepamirškite: Išjunkite maitinimą ir atjunkite jį nuo maitinimo šaltinio. Atjunkite Ethernet arba USB kabelį, jei naudojamas.
UŽRAKINTI PORTALĄ Prieš perkeldami „Flex“, vėl įsukite fiksavimo varžtus, kad platforma laikytųsi vietoje. Portalo fiksavimo taškai yra: ant kairiojo šoninio bėgio šalia roboto priekio. Po vertikalia portalo svirtimi. Ant dešiniojo šoninio bėgio šalia roboto priekio. Norint užrakinti šią portalo dalį, reikia mažo
oranžinis laikiklis ir du fiksavimo varžtai.
42
OPENTRONS FLEX
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
PAGRINDINĖ GANTIJA Galbūt nenorėsite užrakinti portalo, jei tik perkeliate robotą į netoliese esančią vietą. Jei nuspręsite jo neužrakinti, bent jau naudokite jutiklinį ekraną arba „Opentrons“ programą, kad nukreiptumėte portalą į pradinę padėtį prieš išjungdami. Norėdami atidaryti portalą per jutiklinį ekraną, bakstelėkite trijų taškų meniu (), tada bakstelėkite Pagrindinis portalas. Norėdami pradėti portalą naudodami „Opentrons“ programą: spustelėkite Įrenginiai. Įrenginių sąraše spustelėkite savo Flex. Spustelėkite trijų taškų meniu (), tada spustelėkite Pagrindinis portalas.
MODULIŲ PAŠALINIMAS Deke esantys moduliai ir kiti priedai suteikia jūsų „Flex“ papildomo svorio. Jie taip pat turi įtakos roboto svorio centrui, todėl jį keliant jis gali jaustis „pasviręs“. Kad palengvintumėte ir subalansuotumėte robotą, prieš paimdami jį nuimkite visus prijungtus instrumentus ir laboratorijos reikmenis.
Iš naujo Įdiekite denio angas Rekomenduojame vėl pritvirtinti denio angas, jei norite judėti dideliu atstumu. Lizdų tvirtinimas pradinėse vietose padeda išvengti atsitiktinio praradimo. Neprivaloma pakartotinai pritvirtinti denio angas, kad būtų galima trumpam judėti laboratorijoje.
KARALIBRAVIMAS PO PERĖJIMO Turėtumėte iš naujo sukalibruoti visus prietaisus ir modulius, juos sumontavę iš naujo. Daugiau informacijos apie modulio kalibravimą rasite skyriuje Moduliai.
OPENTRONS FLEX
43
2 SKYRIUS: MONTAVIMAS IR PERKELIMAS
Paskutinės mintys apie persikėlimą
Jūsų Flex yra tvirta ir gerai sukonstruota mašina, tačiau tai taip pat tikslus mokslinis instrumentas, sukurtas laikantis griežtų leistinų nuokrypių. Todėl perkeldami jį į vietinę darbo vietą arba siųsdami į kitą šalį, turėtumėte su juo elgtis atsargiai. Tai reiškia, kad reikia laikytis čia pateiktų nurodymų ir vadovautis sveiku protu, kaip transportuoti brangią laboratorinę įrangą. Apatinė eilutė: perkeldami „Flex“, būkite atsargūs ir būkite atsargūs.
Jei turite klausimų ar rūpesčių dėl „Flex“ perkėlimo, susisiekite su mumis adresu support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS
Sistemos aprašymas
Šiame skyriuje aprašomos „Opentrons Flex“ aparatinės įrangos sistemos, kuriomis grindžiamos pagrindinės laboratorijos automatizavimo funkcijos. „Opentrons Flex“ denis, portalas ir prietaisų laikikliai leidžia naudoti tikslius skysčių ir laboratorijos reikmenų tvarkymo komponentus. Įrenginyje esantis jutiklinis ekranas leidžia paleisti protokolus ir patikrinti roboto būseną nenešant kompiuterio į laboratorijos stendą. Laidinis ir belaidis ryšys leidžia papildomai valdyti iš Opentrons App (daugiau informacijos rasite skyriuje Programinė įranga ir valdymas) ir išplėsti sistemos funkcijas prijungiant periferinius įrenginius (žr. skyrių Moduliai).
3.1 Fiziniai komponentai
Fotoaparatas
Būsenos lemputė
Jutiklinis ekranas
Rėmas
Portalo denis
Priekinės durys
„Opentrons Flex“ fizinių komponentų vietos.
Šoninių langų rankenos dangteliai
OPENTRONS FLEX
45
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Rėmas ir korpusas
„Opentrons Flex“ roboto rėmas užtikrina jo denio ir portalo tvirtumą ir konstrukcinę atramą. Visi mechaniniai posistemiai yra ant pagrindinio rėmo ir pritvirtinti prie jo. Rėmas daugiausia pagamintas iš lakštinio metalo ir aliuminio ekstruzijos.
Metaliniame rėme yra angos šoniniams langams ir priekinės durys iš skaidraus polikarbonato, kurios leidžia matyti, kas vyksta Flex viduje. Priekinių durų vyriai atsidaro, kad būtų galima patekti į sistemos vidų. Atidarę priekines duris galite pritvirtinti instrumentus, modulius ir denio tvirtinimo detales; paruošti denį prieš protokolą; arba manipuliuoti denio būsena protokolo metu.
Baltos LED juostelės vidiniuose viršutiniuose rėmo kraštuose suteikia programine įranga valdomą aplinkos apšvietimą. 2 megapikselių kamera gali fotografuoti denį ir darbo sritį, kad būtų galima įrašyti ir sekti protokolo vykdymą.
Denis ir darbo zona
Denis yra apdirbtas aliuminio paviršius, ant kurio vykdomi automatizuoti mokslo protokolai. Dene yra 12 pagrindinių ANSI / SLAS formato lizdų, kuriuos galima iš naujo sukonfigūruoti, kad būtų galima laikyti laboratorinę įrangą, modulius ir eksploatacines medžiagas. Denio lizdai identifikuojami pagal koordinačių sistemą: lizdas A1 yra gale kairėje ir lizdas D3 priekyje dešinėje.
Išplėtimo anga (termocikleriui) darbo zona
Staggavimo srityje
Denio sritys Flex viduje.
46
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Darbo zona yra fizinė erdvė virš denio, kuri yra prieinama pipetavimui. Laboratoriniai įrankiai, patalpinti į lizdus A1–D3, yra darbo zonoje.
Opentrons Flex yra su nuimamais denio angomis visoms 12 pozicijų darbo zonoje. Kiekviename denio lizde yra kampiniai laboratorinių įrankių spaustukai, skirti saugiai įdėti laboratorijos reikmenis ant denio.
Galite iš naujo sukonfigūruoti denį, pakeisdami lizdus kitais denio tvirtinimo elementais, įskaitant kilnojamą šiukšliadėžę, atliekų lataką ir modulių korpusus. Išplėtimo anga už A1 naudojama tik tam, kad būtų galima padaryti daugiau vietos Thermocycler moduliui, kuris užima A1 ir B1 lizdus.
Pastaba: Denio lizdus galima keisti stulpelyje (1, 2 arba 3), bet ne stulpelių viduje; 1 stulpelio ir 3 stulpelio lizdai yra skirtingos dalys, nepaisant panašaus dydžio. Galite nustatyti, į kurį stulpelį patenka lizdas, nukreipę mėlyną laboratorijos spaustuką į galinę kairę pusę.
Turėtumėte palikti denio lizdus, įrengtus tose vietose, kur norite dėti atskiras laboratorijos priemones. Denis ir ant jo padėti daiktai išlieka statiški, nebent jie būtų pajudinti griebtuvu arba rankiniu būdu.
Stagsritį
ŠtagSritis yra papildoma erdvė dešinėje denio pusėje. Įdiegę stagploto lizdus. Laboratoriniai įrankiai, dedami į lizdus A4–D4, yra stagzonoje. Flex pipetės negali pasiekti stagzonoje, tačiau griebtuvas gali paimti ir perkelti laboratorinius įrankius į šią vietą ir iš jos. Pridėjus papildomų lizdų, darbo zona bus prieinama jūsų automatizuotuose protokoluose naudojamai įrangai.
Stagzonų lizdai yra įtraukti į tam tikras darbo stočių konfigūracijas ir juos taip pat galima įsigyti iš https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Stagplotas su sumontuotais lizdais
Denio armatūra
Šviestuvai yra techninės įrangos elementai, pakeičiantys standartinius denio lizdus. Jie leidžia tinkinti denio išdėstymą ir papildyti „Flex“ funkcionalumą. Šiuo metu denio armatūra apima stagangos, vidinė šiukšlių dėžė ir išorinis atliekų latakas. Įrenginius galite montuoti tik keliuose konkrečiuose denio lizduose. Toliau pateiktoje lentelėje išvardytos kiekvienos armatūros denio vietos.
Armatūra Stagploto angos Šiukšlių dėžė Atliekų latakas Atliekų latakas su staging zonos lizdas
Lizdai A3D3 A1D1 ir A3-D3 D3 tik D3
Šviestuvai yra be maitinimo. Juose nėra elektroninių ar mechaninių komponentų, kurie praneštų apie esamą jų būseną ir denio vietą robotui. Tai reiškia, kad turite naudoti denio konfigūravimo funkciją, kad „Flex“ žinotų, kokie įrenginiai yra pritvirtinti prie denio ir kur jie yra.
48
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Denio konfigūracijos nustatymus galite pasiekti iš jutiklinio ekrano per trijų taškų () meniu ir iš Opentrons App. Žr. skyrių „Denio konfigūracija“ skyriuje „Programinė įranga ir valdymas“, kad sužinotumėte, kaip konfigūruoti denį naudojant jutiklinį ekraną.
Atliekų latakas
Opentrons Flex atliekų latakas perkelia skysčius, antgalius, antgalių lentynas ir šulinių plokštes iš Flex gaubto į šiukšlių talpyklą, esančią po išorine anga. Atliekų latakas tvirtinamas prie denio plokštės adapterio, kuris telpa į D3 angą. Jame taip pat yra speciali lango pusė, kuri leidžia latakui išsikišti iš roboto priekio.
Atliekų latako komponentai.
Dangčio denio plokštės adapteris
Atliekų latakas
Denio plokštės adapteris su Staggavimo srityje
Stagploto lizdus
Stagzonų lizdai yra su ANSI/SLAS suderinami denio elementai, kurie pakeičia standartinius lizdus 3 stulpelyje ir papildo naujus lizdustagdarbo zona – visa tai neprarandant vietos darbo zonoje. Galite įdiegti vieną lizdą arba daugiausia keturis lizdus, kad sukurtumėte naują stulpelį (A4–D4) dešinėje denio pusėje. Tačiau atminkite, kad norint pakeisti denio lizdą A3, reikia perkelti šiukšliadėžę. Pridėjus stagPrijungę prie denio ploto plyšius, jūsų „Flex“ robotas gali laikyti daugiau laboratorinės įrangos ir veikti efektyviau.
OPENTRONS FLEX
Flex staging zonos lizdas.
49
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
LĖŠŲ MONTAVIMAS
Norėdami sumontuoti, atsukite varžtus, kuriais prie denio pritvirtinamas standartinis lizdas, ir pakeiskite jį staging zonos lizdas. Įdiegę naudokite jutiklinį ekraną arba „Opentrons“ programą, kad nurodytumėte robotui, kurį pridėjote kaiptagploto lizdą prie denio.
Diegimas kaiptaging zonos lizdas.
LIŠKŲ SUDERINAMUMAS Stagzonų lizdai yra suderinami su toliau išvardytais Flex instrumentais, moduliais ir laboratorijos įranga.
Lanksčių komponentų griebtuvų pipetės moduliai
Laboratoriniai įrankiai
Stagsuderinamumo srityje
Flex Gripper gali perkelti laboratorijos reikmenis į arba iš stagploto lizdus.
Flex pipetės negali pasiekti stagzonoje. Naudokite griebtuvą, kad perkeltumėte antgalių lentynas ir laboratorijos reikmenis iš stagprieš pipetę nuneškite į darbo zoną.
Magnetinis blokas GEN1 gali būti dedamas į 3 stulpelį ant astaging zonos lizdas. 4 stulpelyje moduliai nepalaikomi.
Maitinami moduliai, tokie kaip šildytuvas-kratytuvas ir temperatūros modulis, telpa į korpusus, kuriuos galima įdėti į 3 stulpelį. Negalite pridėti kaiptagploto lizdą į vietą, kurią užima modulio korpusas.
Stagploto lizdai turi tokius pat ANSI/SLAS matmenis kaip ir standartinių denio lizdų. Naudokite su griebtuvu suderinamas laboratorines priemonestagarba rankiniu būdu pridėkite ir pašalinkite laboratorinę įrangą iš šios vietos.
50
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Judėjimo sistema
Prie rėmo pritvirtintas portalas, kuris yra roboto judėjimo ir padėties nustatymo sistema. Portalas juda atskirai išilgai x ir y ašių, kad pipetės ir griebtuvas būtų išdėstytos tiksliose protokolo vykdymo vietose. Judėjimas išilgai šių ašių yra 0.1 mm tikslumas. Portalas valdomas 36 VDC hibridiniais dvipoliais žingsniniais varikliais. Savo ruožtu prie portalo yra pritvirtinti pipetės laikikliai ir prailginimo laikiklis. Jie juda išilgai z ašies, kad pipetės ir griebtuvas būtų tiksliose protokolo vykdymo vietose. Judėjimą išilgai šios ašies valdo 36 VDC hibridiniai bipoliniai žingsniniai varikliai. Portale esanti elektronika suteikia 36 V nuolatinės srovės maitinimą ir ryšį su pipetėmis ir griebtuvu, kai jie pritvirtinti.
Portalas
Pipetės laikikliai
Prailginimo laikiklis
Instrumentų laikiklių vieta ant Flex.
Jutiklinis ekranas ir LED ekranai
Pagrindinė vartotojo sąsaja yra 7 colių LCD jutiklinis ekranas, esantis priekinėje dešinėje roboto pusėje. Jutiklinis ekranas padengtas „Gorilla Glass 3“, kad būtų atsparus įbrėžimams ir pažeidimams. Tiesiogiai jutikliniame ekrane pasiekite daugybę „Flex“ funkcijų, įskaitant:
OPENTRONS FLEX
51
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Protokolo valdymas Protokolo sąranka, vykdymas ir stebėjimas Laboratorijos valdymas Roboto nustatymai Sistemos programinės įrangos ir programinės įrangos atnaujinimai Operacijų žurnalai ir klaidų pranešimai
Daugiau informacijos apie „Flex“ naudojimą jutikliniame ekrane rasite skyriaus „Programinė įranga ir valdymas“ skyriuje „Jutiklinio ekrano valdymas“.
Būsenos lemputė yra šviesos diodų juostelė viršutinėje roboto priekinėje dalyje, kuri iš pirmo žvilgsnio pateikia informaciją apie robotą. Įvairios spalvos ir apšvietimo modeliai gali perduoti įvairias sėkmės, nesėkmės ar neveikimo būsenas:
LED spalva Balta Neutralios būsenos
Žalia Normalios būsenos
Mėlyna Privalomos būsenos Geltona Nenormalios būsenos Raudona Avarinės būsenos
LED modelis Solid Pulsing
Sumirksi du kartus
Tvirtas pulsuojantis pulsavimas
Roboto būsena
Įjungtas ir neveikia protokolas Robotas užimtas (pvz., atnaujina programinę įrangą arba programinę įrangą, nustato protokolo vykdymą, atšaukia protokolo vykdymą) Veiksmas baigtas (pvz., protokolas išsaugotas, programinė įranga atnaujinta, prietaisas prijungtas arba atjungtas) Protokolas veikia Protokolas baigtas Protokolas pristabdytas
Tvirtas
Programinės įrangos klaida
Sumirksi tris kartus, pakartotinai
Fizinė klaida (pvz., prietaiso gedimas)
Būsenos lemputę taip pat galima išjungti roboto nustatymuose.
52
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
3.2 Pipetės
Opentrons pipetės yra konfigūruojami įrenginiai, naudojami skysčiams perkelti visoje darbo zonoje vykdant protokolus. Yra kelios Opentrons Flex pipetės, kurios gali apdoroti nuo 1 µL iki 1000 µL tūrį 1, 8 arba 96 kanaluose:
„Opentrons Flex“ 1 kanalo pipetė (1 µL) „Opentrons Flex“ 50 kanalo pipetė (1 5 µL) „Opentrons Flex“ 1000 kanalų pipetė (8 µL) „Opentrons Flex“ 1 kanalų pipetė (50 µl, 8 µL) 5 µl)
Pipetės pritvirtinamos prie portalo naudojant pipetės priekyje esančius varžtus. 1 kanalo ir 8 kanalų pipetės užima vieną pipetės laikiklį (kairėje arba dešinėje); 96 kanalų pipetė užima abu laikiklius. Daugiau informacijos apie pipečių montavimą rasite Prietaiso montavimas ir kalibravimas.
Nelaisvas priedas
Varžtai
Tvirtinimo varžtai
Išmetiklis
Purkštukai (keičiami sandarinimo žiedai)
Purkštukai (fiksuoti O žiedai)
1, 8 ir 96 kanalų pipečių komponentų vietos.
Išmetiklis
OPENTRONS FLEX
53
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Pipetės paima vienkartinius plastikinius antgalius, prispausdamos juos ant pipetės antgalių, o tada antgalius naudoja skysčiams įsiurbti ir dozuoti. Bendros jėgos, reikalingos paėmimui, dydis didėja, kai vienu metu paimama daugiau galiukų. Jei antgalių skaičius yra mažesnis, pipetė antgalius pritvirtina stumdama kiekvieną pipetės antgalį žemyn į antgalį. Kad pasiektų reikiamą jėgą paimti visą antgalių stovą, 96 kanalų pipetė taip pat traukia antgalius aukštyn ant purkštukų. Norint atlikti šį traukimo veiksmą, antgalių lentynas reikia įdėti į antgalių lentynos adapterį, o ne tiesiai į denio angą. Norėdami išmesti antgalius (arba grąžinti juos į stovą), pipetės išstūmimo mechanizmas nustumia antgalius nuo purkštukų.
Pipetės specifikacijos
Opentrons Flex pipetės skirtos įvairiems tūriams apdoroti. Dėl plataus asortimento jie gali naudoti kelių dydžių antgalius, kurie turi įtakos jų skysčių tvarkymo savybėms. „Opentrons“ išbandė „Flex“ pipečių tikslumą ir tikslumą įvairiuose antgalio ir skysčio tūrio deriniuose:
Pipete
Flex 1-Channel
50 µl
Flex 1-Channel
1000 µl
Flex 8-Channel
50 µl
Flex 8-Channel
1000 µl
Antgalis Talpa 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL XNUMX µL
Išbandytas tūris 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Tikslumas % D 8.00 % 1.50 % 1.25 % 5.00 % 0.50 % 0.50 % 0.50 % 10.00 % 2.50 % 1.25 % 8.00 % 2.50 % 1.00 % 0.70 %
Tikslumas %CV 7.00 % 0.50 % 0.40 % 2.50 % 0.30 % 0.15 % 0.15 % 8.00 % 1.00 % 0.60 % 4.00 % 0.60 % 0.25 % 0.15 %
54
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Flex 96-Channel
1000 µl
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Turėkite omenyje šią tikslumo informaciją rinkdamiesi pipetės antgalius. Apskritai, norėdami pasiekti geriausių rezultatų, turėtumėte naudoti mažiausius antgalius, kurie atitinka jūsų protokolo poreikius.
Pastaba: „Opentrons“ atlieka Flex pipečių tūrinį tyrimą, kad įsitikintų, jog jos atitinka aukščiau nurodytas tikslumo ir tikslumo specifikacijas. Prieš naudodami pipetės dozuojamo tūrio kalibruoti nereikia. Jums tereikia atlikti padėties kalibravimą. Išsamesnės informacijos ieškokite kitame skyriuje, taip pat skyriaus „Įdiegimas ir perkėlimas“ skyriuje „Pipetės diegimas“.
„Opentrons Care“ ir „Opentrons Care Plus“ paslaugos apima kasmetinį pipetės keitimą ir kalibravimo sertifikatus. Išsamesnės informacijos ieškokite skyriaus „Priežiūra ir aptarnavimas“ skyriuje „Service Flex“.
Pipetės kalibravimas
Vartotojo rinkinyje yra metalinis pipetės kalibravimo zondas, kurį naudojate kalibruodami padėtį. Vykdydami protokolą, saugiai laikykite zondą magnetiniame laikiklyje, esančiame priekiniame roboto stulpelyje. Kalibravimo proceso metu pritvirtinkite zondą prie atitinkamo antgalio ir užfiksuokite jį vietoje. Robotas perkelia zondą į kalibravimo taškus denyje, kad išmatuotų tikslią pipetės padėtį.
Pipetės antgalio stovo adapteris
„Opentrons Flex 96“ kanalų pipetė tiekiama su keturiais antgalių stovo adapteriais. Tai yra tiksliai suformuoti aliuminio laikikliai, kuriuos dedate ant denio. Adapteriai laikosi Flex 50 L, 200 L ir 1000 µL antgalių lentynos.
OPENTRONS FLEX
55
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Dėl jėgos, 96 kanalų pipetei reikia adapterio, kad būtų galima tinkamai pritvirtinti visą antgalio stovą. Tvirtinimo procedūros metu pipetė juda ant adapterio, nusileidžia ant tvirtinimo kaiščių ir, pakeldama adapterį ir antgalių stovą, užtraukia antgalius ant pipečių. Antgalius traukiant, o ne stumiant, gaunamas svertas, reikalingas antgaliams pritvirtinti prie pipečių ir neleidžia deformuotis denio paviršiaus. Kai baigsite, 96 kanalų pipetė nuleidžia adapterį ir tuščią antgalių lentyną ant denio. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. skyrių „Patarimai ir antgalių stovai“ skyriuje „Labware“.
Dalinis arbatpinigių paėmimas
96 kanalų pipete galima paimti visą antgalių lentyną arba mažesnį antgalių skaičių. Tai padidina aplikacijų skaičių, kurią galite atlikti su 96 kanalų pipete, nes ji užima abi pipetės laikiklius.
Šiuo metu 96 kanalų pipetė palaiko dalinį antgalių paėmimą 8 antgaliams stulpelio išdėstyme. Esant tokiai konfigūracijai, pipetė arba naudoja savo kairiausius purkštukus, kad paimtų antgalius iš dešinės į kairę nuo antgalių stovo, arba dešiniausius antgalius, kad paimtų antgalius iš kairės į dešinę nuo antgalių stovo.
Paimant mažiau nei 96 antgalius iš antgalių lentynos, stovas turi būti dedamas tiesiai ant padėklo, o ne į antgalių lentynos adapterį.
Pipetės jutikliai
„Opentrons Flex“ pipetės turi daugybę jutiklių, kurie aptinka ir įrašo duomenis apie pipetės būseną ir visus jos paimtus antgalius.
TALPOS JUTIKLIAI
Kartu su metaliniu zondu arba laidžiu antgaliu, talpos jutikliai nustato, kada pipetė su kuo nors susiliečia. Metalinio zondo ir denio kontakto aptikimas naudojamas automatinio pipetės kalibravimo ir modulio kalibravimo procesuose.
1 kanalo pipetės turi vieną talpos jutiklį, o kelių kanalų pipetės turi du: 1 kanalų pipetės 8 ir 8 kanaluose ir 1 kanalų pipetės 96 ir 1 kanaluose (A12 ir H96 padėtys).
56
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
OPTINIAI ANTAUKČIAI BŪVIMO JUTIKLIAI
Fotopertraukiklio jungiklis nustato pipetės antgalio išstūmimo mechanizmo padėtį ir patvirtina, ar antgaliai buvo sėkmingai paimti, ar numesti. 1 kanalo, 8 kanalų ir 96 kanalų pipetės turi vieną optinį jutiklį, kuris stebi antgalio pritvirtinimą visuose kanaluose.
Pipetės programinės įrangos atnaujinimai
„Opentrons Flex“ automatiškai atnaujina pipetės programinę-aparatinę įrangą, kad ji būtų sinchronizuota su roboto programinės įrangos versija. Pipetės programinės įrangos atnaujinimai paprastai yra greiti ir įvyksta, kai:
Pridedate pipetę. Robotas paleidžiamas iš naujo.
Jei dėl kokių nors priežasčių pipetės programinės įrangos ir roboto programinės įrangos versijos nesinchronizuojamos, galite rankiniu būdu atnaujinti programinę-aparatinę įrangą Opentrons programoje.
1. Spustelėkite Įrenginiai. 2. Įrenginių sąraše spustelėkite savo Flex. 3. Skiltyje Instrumentai ir moduliai nesinchronizuotoje pipetėje bus rodomas įspėjamasis reklamjuostės rodmuo
„Galimas programinės įrangos naujinimas“. Spustelėkite Atnaujinti dabar, kad pradėtumėte naujinimą.
Jūs galite view šiuo metu įdiegtos bet kurios prijungtos pipetės programinės įrangos versija. Jutikliniame ekrane eikite į Instrumentai ir bakstelėkite pipetės pavadinimą. Opentrons programoje raskite pipetės kortelę skiltyje Instrumentai ir moduliai, spustelėkite trijų taškų meniu (), tada spustelėkite Apie pipetę.
3.3 Griebtuvas
Griebtuvas perkelia laboratorijos reikmenis visoje darbo zonoje ir stagvykdant protokolus. Griebtuvas tvirtinamas prie prailginimo laikiklio, kuris yra atskirai nuo pipetės laikiklių; griebtuvas gali būti naudojamas su bet kokia pipetės konfigūracija. Daugiau informacijos apie griebtuvo montavimą rasite Prietaiso montavimas ir kalibravimas.
Griebtuvas gali perkelti laboratorinius įrankius per denį ir ant modulių arba nuo jų. Griebtuvas gali manipuliuoti tam tikromis visiškai aptrauktomis šulinių plokštelėmis, giliųjų šulinių plokštėmis ir antgalių lentynomis. Norėdami gauti daugiau informacijos apie tai, kokią laboratorinę įrangą gali perkelti griebtuvas, žr. Labware skyriaus skyrius Labware ir Opentrons Flex Gripper arba skaitykite Opentrons Labware biblioteką.
OPENTRONS FLEX
57
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Griebtuvo specifikacijos
Žandikauliai atlieka pagrindinį griebtuvo judesį, ty atidaro arba uždaro dvi lygiagrečias mentes, kad būtų pritaikyta arba atleidžiama jėga laboratorijos indų šonuose. Žandikaulių judėjimas valdomas 36 VDC šepečiu varikliu, prijungtu prie krumpliaračio sistemos.
Norėdami perkelti laboratorinį įrankį, kuris buvo suimtas nasrais, portalas pakelia griebtuvą išilgai z ašies, perkelia jį į šoną ir nuleidžia į naują laboratorijos indų padėtį.
Griebtuvo komponentų vietos.
Tvirtinimo varžtai
Kalibravimo kaištis Jaws Paddles
Griebtuvo kalibravimas
Griebtuvas turi metalinį kalibravimo kaištį. Kalibravimo kaištis yra apatinėje griebtuvo dalyje esančioje nišoje. Magnetas laiko kaištį vietoje. Norėdami nuimti kalibravimo kaištį, suimkite jį pirštais ir švelniai traukite. Norėdami pakeisti kaištį, įdėkite jį atgal į laikymo angą. Sužinosite, kad jis saugus, kai užsifiksuos į vietą.
Kalibruodami griebtuvą, paeiliui pritvirtinkite kaištį prie kiekvieno žandikaulio. Robotas perkelia kaištį į kalibravimo taškus denyje, kad išmatuotų tikslią griebtuvo padėtį.
Vykdydami protokolą, įdėkite smeigtuką į saugojimo vietą. Jei pametėte kalibravimo kaištį, susisiekite su mumis adresu support@opentrons.com.
Gripper programinės įrangos atnaujinimai
„Opentrons Flex“ automatiškai atnaujina griebtuvo programinę-aparatinę įrangą, kad ji būtų sinchronizuota su roboto programinės įrangos versija. Gripper programinės aparatinės įrangos atnaujinimai paprastai yra greiti ir įvyksta, kai:
58
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Pridedate griebtuvą. Robotas paleidžiamas iš naujo.
Jei dėl kokių nors priežasčių jūsų griebtuvo programinės įrangos ir roboto programinės įrangos versijos nesinchronizuojamos, galite rankiniu būdu atnaujinti programinę-aparatinę įrangą Opentrons programoje.
1. Spustelėkite Įrenginiai. 2. Įrenginių sąraše spustelėkite savo Flex. 3. Skiltyje Instrumentai ir moduliai nesinchronizuotas griebtuvas parodys įspėjamąją reklamjuostę
„Galimas programinės įrangos naujinimas“. Spustelėkite Atnaujinti dabar, kad pradėtumėte naujinimą.
Jūs galite view šiuo metu įdiegta griebtuvo programinės įrangos versija. Jutikliniame ekrane eikite į Instrumentai ir bakstelėkite griebtuvą. „Opentrons“ programoje skiltyje Instrumentai ir moduliai raskite griebtuvo kortelę, spustelėkite trijų taškų meniu (), tada spustelėkite Apie griebtuvą.
3.4 Avarinio stabdymo pakabukas
Avarinio stabdymo pakabukas (E-stop) yra specialus aparatūros mygtukas, skirtas greitai sustabdyti roboto judėjimą. „Opentrons Flex“ visada turi būti pritvirtintas funkcionalus, atjungtas „E-stop“. Kai paspausite sustabdymo mygtuką, „Flex“ kuo greičiau atšaukia bet kokį veikiantį protokolą arba sąrankos darbo eigą ir užkerta kelią daugumai roboto judėjimo.
Kada naudotis E-stotele
Gali tekti paspausti E-stop:
Kai yra neišvengiama rizika susižaloti arba sužaloti vartotoją. Kai yra neišvengiama rizika sugadinti robotą ar kitą techninę įrangą. Kai samples ar reagentus gresia tiesioginis užteršimo pavojus. Po aparatinės įrangos susidūrimo.
Idealiu atveju jums niekada nereikėtų spausti E-stop (išskyrus retus aparatūros kokybės testus).
Nenaudokite E-stop norėdami atšaukti įprastas, numatytas operacijas. Vietoj to naudokite programinės įrangos mygtuką jutikliniame ekrane arba programoje Opentrons. Pristabdę programinę įrangą, galėsite atnaujinti arba atšaukti protokolą, o paspaudus E-stop, protokolas visada atšaukiamas nedelsiant.
OPENTRONS FLEX
59
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
E-stop įjungimas ir atleidimas
E-stop turi paspaudimo, kad užsifiksuotų, pasukimo ir atleidimo mechanizmą.
Įjungimas: Tvirtai paspauskite raudoną mygtuką. Flex pateks į sustabdytą būseną. Išspręskite: sustoję saugiai spręskite visas darbo zonos problemas, pvz., išvalykite išsiliejimus,
laboratorinių reikmenų išėmimas arba portalo perkėlimas (jis turi laisvai ir lengvai judėti ranka). Atleidimas: pasukite mygtuką pagal laikrodžio rodyklę. Jis iššoks į išjungtą padėtį. Nustatyti iš naujo: jutikliniame ekrane arba „Opentrons“ programoje patvirtinkite, kad esate pasiruošę atnaujinti „Flex“
judesį. Portalas grįš į pradinę padėtį ir modulio veikla bus atnaujinta.
Sustabdytoje būsenoje „Flex“ ir prijungta aparatinė įranga veiks taip:
Aparatinės įrangos portalinės pipetės
Griebtuvas
Šildytuvo-kratytuvo modulis
Temperatūros modulio termociklerio modulio būsenos lemputė Jutiklinis ekranas
Elgesys
Automatinis horizontalus judėjimas sustabdomas. Leidžiamas rankinis horizontalus judėjimas.
Sustabdomas vertikalus pipečių judėjimas. Variklio stabdžiai ant vertikalių ašių yra įjungti, kad būtų išvengta
pipetės nuo kritimo. Stūmoklio judėjimas ir antgalio paėmimas sustabdomas.
Vertikalus griebtuvo judėjimas sustabdomas. Variklio stabdys vertikalioje ašyje yra įjungtas, kad būtų išvengta
griebtuvas nuo kritimo. Žandikaulio varikliai, darantys sugriebimo jėgą, lieka įjungti, taigi
griebtuvas nenumes laboratorinių įrankių, kuriuos jis gali turėti.
Kratytuvas sustoja ir grįžta namo. Atsidaro laboratorijos įrangos fiksatorius. Šildymas išjungtas.
Šildymas arba vėsinimas išjungtas.
Šildymas arba vėsinimas išjungtas.
Šviesa užsidega raudonai.
Ekraną užvaldo atšaukimo pranešimas. Ekrane rodomas indikatorius rodo, kada sėkmingai
išjungė sustabdymo mygtuką.
60
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
3.5 Jungtys
Įjungimo/išjungimo jungiklis
Šoniniai dangteliai
USB-A prievadai
IEC maitinimo įvadas
Prievadai AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Maitinimo jungtis
„Opentrons Flex“ jungiasi prie maitinimo šaltinio per standartinį IEC-C14 įvadą. Robotas turi vidinį viso diapazono AC/DC maitinimo šaltinį, priimantį 100 VAC, 240/50 Hz įvestį ir konvertuojantį į 60 VDC. Visa kita vidinė elektronika maitinama iš 36 V nuolatinės srovės maitinimo šaltinio.
Įspėjimas: naudokite tik su robotu pateiktą maitinimo laidą. Nenaudokite maitinimo laido, kurio srovė ar tūris yra nepakankamastage reitingai.
Laikykite maitinimo laidą be kliūčių, kad prireikus galėtumėte jį išimti.
Taip pat yra CR1220 monetų elementas, skirtas maitinti roboto laikrodį realiuoju laiku, kai jis neprijungtas prie maitinimo tinklo. Baterija yra jutiklinio ekrano korpuse. Jei manote, kad reikia pakeisti bateriją, susisiekite su „Opentrons“ palaikymo komanda.
OPENTRONS FLEX
61
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
USB ir pagalbinės jungtys
„Opentrons Flex“ iš viso turi 10 USB prievadų, esančių skirtingose roboto vietose, kurie naudojami skirtingiems tikslams.
8 galiniai USB-A prievadai (numeruoti USB-1 per USB-8) ir 2 pagalbiniai prievadai (M12 jungtys, numeruojami AUX-1 ir AUX-2) skirti Opentrons moduliams ir priedams prijungti. Daugiau informacijos apie šių įrenginių prijungimą ir naudojimą protokoluose rasite skyriuje Moduliai. Galinis USB-B prievadas skirtas prijungti robotą prie nešiojamojo ar stalinio kompiuterio, kad būtų galima užmegzti ryšį su prijungtame kompiuteryje veikiančia programa Opentrons. Priekinis USB-A prievadas (USB-9), esantis po jutikliniu ekranu, turi tas pačias funkcijas kaip ir galiniai USB-A prievadai.
Pastaba: USB prievadų galia yra ribota, kad apsaugotų robotą ir prijungtus įrenginius. Energijos tiekimas viduje suskirstytas į tris prievadų grupes: kairieji galiniai USB-A prievadai (USB-1 per USB-4), dešinieji galiniai USB-A prievadai (USB-5 per USB-8) ir priekiniai USB-A prievadai. uostas. Kiekviena iš šių grupių tieks daugiausia 500 mA į prijungtus USB 2.0 suderinamus įrenginius.
Tinklo jungtys
„Opentrons Flex“ gali prisijungti prie vietinio tinklo laidiniu (Ethernet) arba belaidžiu (Wi-Fi) ryšiu.
Ethernet prievadas yra roboto gale. Prijunkite jį prie Ethernet šakotuvo arba įjunkite tinklą. Arba, pradedant nuo 7.1.0 roboto sistemos, prijunkite jį tiesiai prie kompiuterio Ethernet prievado. Vidinis Wi-Fi modulis palaiko 802.11 ac/a/b/g/n tinklus su dviejų juostų 2.4/5 GHz antena.
62
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
3.6 Sistemos specifikacijos
Bendrosios specifikacijos
Matmenys Svoris Deck lizdai
Jutiklinis ekranas
Wi-Fi Ethernet USB
Fotoaparato roboto maitinimo įvestis
Maitinimo tinklo tomastage svyravimas Tinklo maitinimo dažnio svyravimas Paskirstymo sistema Trumpojo jungimo maitinimo srovė Rėmo kompozicija Langų sudėtis Vėdinimo reikalavimai
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 coliai (W, D, A)
88.5 kg / 195 svarų 12 su ANSI / SLAS suderinami lizdai darbo zonoje
(prieinamos pipetėmis) 4 papildomi angos stagpatarimai ir laboratoriniai įrankiai
(prieinamas tik griebtuvui) 7 colių LCD jutiklinis ekranas su įbrėžimams ir pažeidimams atspariu Gorilla Glass 3 stiklu
802.11 ac/a/b/g/n dviejų juostų (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A prievadai 1 USB-B prievadas USB 2.0 sparta
2MP, nuotrauka ir vaizdo įrašas 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10 %
±5 %
TN-S
6.3 A
Tvirtas plieno ir CNC aliuminio dizainas
Nuimami polikarbonato šoniniai langai ir priekinės durys Mažiausiai 20 cm / 8 tarp įrenginio ir sienos
OPENTRONS FLEX
63
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Reikalavimai prijungtam kompiuteriui
„Opentrons“ programa veikia: „Windows 10“ arba naujesnė „macOS 10.10“ arba naujesnė versija „Ubuntu 12.04“ ar naujesnė versija
Aplinkosaugos specifikacijos
Aplinkos sąlygos Aplinkos temperatūra Santykinė drėgmė Užterštumo laipsnis
Naudojimas tik patalpose nuo +20 iki +25 °C (rekomenduojama) 40%, nekondensuojantis (rekomenduojama) 60 (tik dėl nelaidžios taršos)
Daugiau informacijos apie priimtinas naudojimo ir transportavimo aplinkos sąlygas rasite skyriaus Įrengimas ir perkėlimas skyriuje Aplinkos sąlygos.
Sertifikatai
Sertifikatai baigti Nesertifikuota / patvirtinta
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Sertifikavimo informacijos santrauka atspausdinta ant lipduko Flex galinėje pusėje, šalia įjungimo/išjungimo jungiklio. Išsamios informacijos apie sertifikavimą ir atitiktį rasite įvado skyriuje Atitiktis reglamentams.
Serijos numeris
Kiekvienas Flex turi unikalų serijos numerį. Serijos numerio formatas suteikia papildomos informacijos, įskaitant roboto pagaminimo datą. Pavyzdžiui,ample, serijos numeris FLXA1020231007001 nurodytų:
64
OPENTRONS FLEX
3 SKYRIUS: SISTEMOS APRAŠYMAS
Veikėjai FLX A10 2023 10 07 001
Kategorija Modelis Versija Metai Mėnuo Diena Vienetas
Reikšmė Robotas yra Opentrons Flex. Gamybinės roboto versijos kodas. Robotas pagamintas 2023 metais. Robotas pagamintas spalį. Robotas buvo pagamintas 7 mėnesio dieną. Unikalus numeris robotams, pagamintiems tam tikrą dieną.
Savo Flex serijos numerį galite rasti:
Ant sertifikavimo lipduko „Flex“ gale, šalia įjungimo / išjungimo jungiklio. Kitoje jutiklinio ekrano pusėje (darbo zonos link). „Opentrons“ programos dalyje Įrenginiai > jūsų Flex > Roboto nustatymai > Išplėstinė.
OPENTRONS FLEX
65
4 SKYRIUS
Moduliai
„Opentrons Flex“ integruojamas su daugeliu „Opentrons“ aparatinės įrangos modulių. Visi moduliai yra išoriniai įrenginiai, kurie užima denio lizdus, o daugumą jų valdo robotas per USB jungtį.
Šiame skyriuje aprašomos su Opentrons Flex sistema suderinamų modulių funkcijos ir fizinės specifikacijos, taip pat kaip juos pritvirtinti ir kalibruoti. Daugiau informacijos apie modulio sąranką ir naudojimą rasite atskirų modulių vadovuose. Norėdami gauti daugiau informacijos apie modulių integravimą į savo protokolus, žr. Protokolo kūrimo skyriaus Protocol Designer skyrių arba internetinę Python Protocol API dokumentaciją.
4.1 Palaikomi moduliai
„Opentrons Flex“ yra suderinamas su keturių tipų „Opentrons“ moduliais:
„Heater-Shaker“ modulis užtikrina šildymą denyje ir orbitinį purtymą. Modulis gali būti šildomas iki 95 °C ir gali purtyti sampnuo 200 iki 3000 aps./min.
Magnetinis blokas yra pasyvus prietaisas, laikantis laboratorijos reikmenis arti didelio stiprumo neodimio magnetų. „Opentrons Flex“ nepalaiko OT-2 magnetinių modulių GEN1 ir GEN2, kurie aktyviai judina savo magnetus aukštyn ir žemyn, palyginti su laboratorijos įranga.
Temperatūros modulis yra karšto ir šalto plokščių modulis, galintis palaikyti pastovią temperatūrą nuo 4 iki 95 °C.
„Thermocycler Module“ suteikia denyje visiškai automatizuotą termociklą, leidžiantį automatizuoti prieš srovę ir pasroviui atliekamus darbo eigos veiksmus. Thermocycler GEN2 yra visiškai suderinamas su griebtuvu. Thermocycler GEN1 negalima naudoti su griebtuvu, todėl Opentrons Flex nepalaiko.
Kai kurie moduliai, iš pradžių sukurti OT-2, yra suderinami su Flex, kaip apibendrinama toliau esančioje lentelėje. Varnelė rodo suderinamumą, o X – nesuderinamumą.
66
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
Įrenginio tipas ir karta Šildytuvo-kratytuvo modulis GEN1 magnetinis modulis GEN1 magnetinis modulis GEN2 magnetinis blokas GEN1 temperatūros modulis GEN1 temperatūros modulis GEN2 termociklerio modulis GEN1 termociklerio modulis GEN2 HEPA modulis
OT-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Modulio korpuso sistema
Suderinami moduliai yra sukurti taip, kad tilptų į korpusus, kurie užima vietą žemiau denio. Ši sistema leidžia ant modulių esančiai laboratorinei įrangai likti arčiau denio paviršiaus, taip pat leidžia nutiesti kabelius žemiau denio, kad denis išliktų tvarkingas, kai vykdomas protokolas.
Šildytuvo-kratytuvo, temperatūros ir termociklerio modulių korpusai.
OPENTRONS FLEX
67
4 SKYRIUS. MODULIAI
Kad modulis tilptų į denio paviršių, pirmiausia jis turi būti įdėtas į atitinkamą modulio korpusą. Kiekvienas suderinamo modulio tipas turi savo korpuso dizainą, kuris tiksliai suderina modulį ir laboratorijos įrangą su aplinkiniu deniu. (Išimtis yra magnetinis blokas, kuriam nereikia maitinimo ar USB kabelio nutiesimo, todėl jis sėdi tiesiai ant denio paviršiaus.) Vieną lizdą užimančių modulių korpusai gali būti dedami bet kur 1 arba 3 stulpelyje; Thermocycler gali būti dedamas tik į lizdus A1 ir B1 vienu metu.
Apskritai, norėdami įdiegti modulio korpusą:
1. Pašalinkite visus denio lizdus iš vietos, kur bus modulis. 2. Įdėkite modulį į korpusą ir priveržkite jo inkarus. 3. Nukreipkite modulio maitinimo ir USB laidus per šoninius dangčius, aukštyn per tuščią denio angą ir
prijunkite juos prie modulio. 4. Įdėkite modulio korpusą į angą ir įsukite į vietą.
Tikslių diegimo instrukcijų ieškokite konkretaus modulio trumposios pradžios vadove arba instrukcijų vadove. Kabelių jungtys ir tvirtinimo prie korpuso būdas skiriasi priklausomai nuo modulio.
4.3 Modulio kalibravimas
Kai pirmą kartą įdiegiate modulį „Flex“, turite atlikti automatinį padėties kalibravimą. Šis procesas yra panašus į instrumentų padėties kalibravimą ir užtikrina, kad „Flex“ judės į tikslias tinkamas vietas, kad būtų užtikrintas optimalus protokolo veikimas. Kalibravimo metu „Flex“ persikels į modulio kalibravimo adapterio vietas, kurios atrodo panašios į kalibravimo kvadratus, kurie yra nuimamų denio lizdų dalis.
Kalibravimo adapteriai, skirti šildytuvo-platytuvo, temperatūros ir termociklerio moduliams.
Modulio kalibravimas reikalingas visiems moduliams, kurie montuojami per „caddy“: „Heter-Shaker“, „Temperature“ ir „Thermocycler“ modulius. Magnetiniam blokui nereikia kalibruoti ir jis yra paruoštas naudoti, kai tik jį pastatysite ant denio.
68
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
Kada kalibruoti modulius
„Flex“ automatiškai paragins atlikti kalibravimą, kai prijungiate ir įjungiate modulį, kuriame nėra išsaugotų kalibravimo duomenų. (Galite atmesti šį raginimą, bet negalėsite paleisti protokolų su moduliu, kol jo nesukalibruosite.)
Kai baigsite kalibravimą, „Flex“ išsaugo kalibravimo duomenis ir modulio serijos numerį, kad galėtumėte juos naudoti ateityje. „Flex“ neprašys jūsų iš naujo kalibruoti, nebent ištrinsite to modulio kalibravimo duomenis roboto nustatymuose. Galite laisvai įjungti ir išjungti savo modulį arba netgi perkelti jį į kitą denio lizdą, nereikės iš naujo kalibruoti. Jei norite iš naujo kalibruoti, bet kuriuo metu galite pradėti procesą iš modulio kortelės Opentrons programoje. (Pakartotinis kalibravimas negalimas naudojant jutiklinį ekraną.)
Kaip kalibruoti modulius
Jutikliniame ekrane arba Opentrons programoje pateikiamos instrukcijos padės atlikti kalibravimo procedūrą. Apskritai žingsniai yra šie:
1. Surinkite reikiamą įrangą, įskaitant modulio kalibravimo adapterį ir pipetės kalibravimo zondą. 2. Uždėkite kalibravimo adapterį ant modulio paviršiaus ir įsitikinkite, kad jis yra visiškai lygus.
Kai kuriems moduliams gali reikėti pritvirtinti adapterį prie modulio. 3. Kalibravimo zondą prijunkite prie pipetės. 4. Flex automatiškai judės, kad paliestų tam tikrus kalibravimo adapterio taškus ir juos išsaugos
kalibravimo vertes naudoti ateityje.
Kai kalibravimas bus baigtas ir pašalinsite adapterį bei zondą, modulis bus paruoštas naudoti protokoluose.
Bet kuriuo metu galite view ir tvarkykite savo modulio kalibravimo duomenis Opentrons programėlėje. Eikite į „Flex“ roboto nustatymus ir spustelėkite skirtuką Kalibravimas.
OPENTRONS FLEX
69
4 SKYRIUS. MODULIAI
4.4 Šildytuvo-kratytuvo modulis GEN1
Heater-Shaker savybės
ŠILDYMAS IR DRATYMAS
„Heater-Shaker“ užtikrina šildymą denyje ir orbitinį purtymą. Modulis gali būti šildomas iki 95 °C, esant tokiai temperatūrai profile:
Temperatūros diapazonas: 37 °C Temperatūros tikslumas: ±95 °C esant 0.5 °C Temperatūros tolygumas: ±55 °C esant 0.5 °CRamp greitis: 10 °C/min
Modulis gali purtyti sampnuo 200 iki 3000 aps./minfile:
Orbitos skersmuo: 2.0 mm Orbitos kryptis: pagal laikrodžio rodyklę Greičių diapazonas: 200 aps./min. Greičio tikslumas: ±3000 aps./min.
Modulis turi laboratorinį fiksatorių, skirtą pritvirtinti plokštes prie modulio prieš purtant.
70
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
ŠILUMINIAI ADAPTERIAI Norint pridėti laboratorijos reikmenis prie šildytuvo-kratytuvo, reikalingas suderinamas šiluminis adapteris. Adapterius galima įsigyti tiesiogiai iš „Opentrons“ adresu https://shop.opentrons.com. Šiuo metu galimi šiluminiai adapteriai:
Universalus plokščias adapteris
PCR adapteris
Giluminio šulinio adapteris
96 Plokščiadugnis adapteris
PROGRAMINĖS ĮRANGOS KONTROLĖ
„Heater-Shaker“ yra visiškai programuojamas Protocol Designer ir Python Protocol API. „Python“ API taip pat leidžia lygiagrečiai atlikti kitus protokolo veiksmus, kai veikia „Heater-Shaker“. Išsamios informacijos apie lygiagrečių veiksmų įtraukimą į protokolus žr. API dokumentacijos skyriuje Neblokuojančios komandos.
Be protokolų, „Opentrons“ programa gali rodyti dabartinę „Heater-Shaker“ būseną ir tiesiogiai valdyti šildytuvą, purtytuvą ir laboratorijos įrangos skląstį.
OPENTRONS FLEX
71
4 SKYRIUS. MODULIAI
Heater-Shaker specifikacijos
Matmenys Svoris Modulio maitinimo įėjimas Maitinimo adapterio įėjimas Maitinimo ttage svyravimas Overvoltage Energijos suvartojimas
152 × 90 × 82 mm (L/W/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60 % II kategorija Tuščioji eiga: 10 W
Įprasta: purtymas: 4 W Kaitinimas: 11 W Kaitinimas ir purtymas: 10 W
Aplinkos sąlygos Aplinkos temperatūra Santykinė drėgmė Aukštis Virš jūros užterštumo laipsnis
Maksimalus: 125 W Naudojimas tik patalpose 130 °C Iki 20%, nesikondensuojantis Iki 25 m virš jūros lygio 80
72
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
4.5 Magnetinis blokas GEN1
Magnetinio bloko savybės
Opentrons Magnetic Block GEN1 yra magnetinis 96 šulinėlių plokštelės laikiklis. Magnetiniai blokai naudojami protokoluose, kurie remiasi magnetizmu, norint ištraukti daleles iš suspensijos ir išlaikyti jas šulinių plokštelėse plovimo, skalavimo ar kitų eliuavimo procedūrų metu. Pavyzdžiui,ample, automatizuotas NGS paruošimas; genomo ir mitochondrijų DNR, RNR arba baltymų valymas; ir kitos ištraukimo procedūros yra naudojimo atvejai, kai gali būti naudojami magnetiniai blokai.
MAGNETINIAI KOMPONENTAI
Magnetinis blokas yra be maitinimo, jame nėra jokių elektroninių komponentų ir tirpale nejudinami magnetiniai rutuliukai aukštyn ar žemyn. Šulinius sudaro 96 didelio stiprumo neodimio žiediniai magnetai, pritvirtinti prie spyruoklinės lovos, o tai padeda išlaikyti leistinus nuokrypius tarp bloko ir pipečių vykdant automatizuotus protokolus.
PROGRAMINĖS ĮRANGOS KONTROLĖ
Magnetinis blokas GEN1 yra visiškai programuojamas Protocol Designer ir Python Protocol API.
OPENTRONS FLEX
73
4 SKYRIUS. MODULIAI
Tačiau už protokolų ribų jutiklinis ekranas ir „Opentrons“ programa nežino ir negali parodyti dabartinės magnetinio bloko GEN1 būsenos. Tai modulis be maitinimo. Jame nėra elektroninių ar mechaninių komponentų, galinčių susisiekti su Flex robotu. Magnetinį bloką „valdote“ protokolais, kurie naudoja „Opentrons Flex Gripper“, kad pridėtų ir pašalintų laboratorinę įrangą iš šio modulio.
Magnetinio bloko specifikacijos
Matmenys Svoris Modulio galia Magneto klasė Aplinkos sąlygos Aplinkos temperatūra Santykinė drėgmė Aukštis Užterštumo laipsnis
136 × 94 × 45 mm (L/W/H) 1.13 kg Nėra, modulis yra be maitinimo N52 neodimio Naudoti tik patalpose 20 °C 25%, nesikondensuojantis Iki 30 m virš jūros lygio 80
74
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
4.6 Temperatūros modulis GEN2
Temperatūros modulio savybės
ŠILDYMAS IR VĖSINIMAS
Opentrons Temperature Module GEN2 yra karšto ir šalto plokščių modulis. Jis dažnai naudojamas protokoluose, kuriems reikalingas šildymas, vėsinimas arba temperatūros pokyčiai. Modulis gali pasiekti ir palaikyti temperatūrą nuo 4 °C iki 95 °C per kelias minutes, priklausomai nuo modulio konfigūracijos ir turinio.
TERMINIAI BLOKAI
Norint išlaikyti laboratorinius reikmenis esant temperatūrai, modulyje naudojami aliuminio termoblokai. Modulis tiekiamas su 24 šulinėlių ir 96 šulinėlių šiluminiais blokais. Temperatūros modulio korpusas yra su gilaus šulinio bloku ir plokščiu dugnu, skirtu naudoti su Flex Gripper. Blokeliuose yra 1.5 ml ir 2.0 ml mėgintuvėliai, 96 šulinėlių PGR plokštelės, PGR juostelės, gilių šulinių plokštelės ir plokščio dugno plokštelės.
OPENTRONS FLEX
75
4 SKYRIUS. MODULIAI
Pastaba: Modulis taip pat pristatomas su plokščiu dugnu, skirtu OT-2. Nenaudokite OT-2 bloko su Flex. Flex plokščio dugno bloko viršutiniame paviršiuje yra užrašas „Opentrons Flex“. OT-2 skirtas ne.
24 šulinėlių termoblokas
96 šulinėlių termoblokas
Giluminio šulinio termoblokas
Flex termoblokas plokščiu dugnu
VANDENS VONYS IR ŠILDYMAS
Kadangi oras yra geras šilumos izoliatorius, tarpai tarp laboratorijos įrangos ir šiluminio bloko gali turėti įtakos temperatūros modulio veikimo laikui ir temperatūrai. Įdėjus šiek tiek vandens į 24 arba 96 šulinių termoblokus, pašalinami oro tarpai ir pagerėja šildymo efektyvumas. Idealus vandens kiekis priklauso nuo termobloko ir laboratorinės įrangos. Daugiau rekomendacijų rasite Temperatūros modulio baltojoje knygoje.
PROGRAMINĖS ĮRANGOS KONTROLĖ
Temperatūros modulis yra visiškai programuojamas Protocol Designer ir Python Protocol API.
Be protokolų, „Opentrons“ programa gali rodyti dabartinę temperatūros modulio būseną ir tiesiogiai valdyti paviršiaus plokštės temperatūrą.
76
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
Temperatūros modulio specifikacijos
Matmenys Svoris Modulio galia
Aplinkos sąlygos Aplinkos temperatūra Santykinė drėgmė Aukštis Virš jūros užterštumo laipsnis
194 × 90 × 84 mm (L/W/H) 1.5 kg Įvestis: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Išėjimas: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks. Naudojimas patalpose tik <219.6 °C (rekomenduojama optimaliam vėsinimui) ) Iki 22%, nesikondensuojantis Iki 60 m virš jūros lygio 2000
4.7 Termociklerio modulis GEN2
OPENTRONS FLEX
77
4 SKYRIUS. MODULIAI
Termociklerio savybės
„Opentrons Thermocycler Module GEN2“ yra visiškai automatizuotas termocikleris denyje, teikiantis laisvų rankų įrangos PGR 96 šulinėlių plokštelės formatu. Jo šildomas dangtis ir vienkartinis sandariklis tvirtai priglunda prie plokštės, užtikrinant efektyvų sample šildymas ir minimalus garavimas.
ŠILDYMAS IR VĖSINIMAS Thermocycler blokas gali šildyti ir vėsinti, o jo dangtis gali šildyti, esant tokiai temperatūraifile: Termobloko temperatūros diapazonas: 4 °C Termobloko maksimalus šildymas ramp greitis: 4.25 °C/s nuo GEN2 aplinkos iki 95 °C terminio bloko maksimalus aušinimas ramp greitis: 2.0 °C/s nuo 95 °C iki aplinkos.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler gali atlikti profiles: automatiškai perjungiama bloko temperatūrų seka, kad būtų atlikta šilumai jautri reakcija.
GUMINIAI AUTOMATINIAI TARPIKLIAI Thermocycler komplektuojamas su guminiais automatikos tarpikliais, kurie padeda sumažinti garavimą. Kiekvienas sandariklis prieš naudojimą turi būti sterilizuotas ir gali būti naudojamas keletą kartų. Papildomus sandariklius galima įsigyti tiesiogiai iš Opentrons adresu https://shop.opentrons.com.
PROGRAMINĖS ĮRANGOS VALDYMAS Thermocycler yra visiškai programuojamas Protocol Designer ir Python Protocol API. Be protokolų, „Opentrons“ programa gali rodyti dabartinę „Thermocycler“ būseną ir tiesiogiai valdyti bloko temperatūrą, dangčio temperatūrą ir dangčio padėtį.
78
OPENTRONS FLEX
4 SKYRIUS. MODULIAI
Termociklerio specifikacijos
Matmenys (dangtelis atidarytas) Matmenys (dangtis uždarytas) Svoris (įskaitant galinį kanalą) Maitinimo adapteristage Maitinimo adapterio srovė Overvoltage Aplinkos sąlygos Aplinkos temperatūra Santykinė drėgmė Aukštis Vėdinimo reikalavimai
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/W/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/W/H) 8.4 kg 100 V esant 240/50 Hz 60 A II kategorija Naudoti tik patalpose (8.5 °C); 5 °C (priimtina) 20%, nesikondensuojanti Iki 25 m virš jūros lygio Mažiausiai 2 cm / 40 tarp įrenginio ir sienos
OPENTRONS FLEX
79
5 SKYRIUS
Laboratoriniai įrankiai
Šiame skyriuje aprašomi Opentrons Labware bibliotekos elementai, kuriuos galite naudoti su Opentrons Flex ir Opentrons Flex Gripper. Ji taip pat apima tinkintą laboratorinę įrangą ir, mūsų patyrusiems vartotojams, susieja laboratorinės įrangos komponentus su atitinkamu JSON file apibrėžimai.
Laboratorinius prietaisus galite įsigyti iš originalios įrangos gamintojų arba Opentrons parduotuvės adresu https://shop.opentrons.com. Ir „Opentrons“ visada stengiasi patikrinti naujus laboratorinių programų apibrėžimus. Naujausius sąrašus rasite Labware bibliotekoje (nuoroda aukščiau).
5.1 Laboratorinės įrangos koncepcijos
Laboratoriniai įrenginiai apima ne tik objektus, esančius ant denio ir naudojamus protokole. Kad padėtume suprasti „Opentrons“ laboratorinę įrangą, panagrinėkime šią temą iš trijų skirtingų perspektyvų. „Opentrons Flex“ laboratorinė įranga apima elementus, esančius mūsų laboratorijų bibliotekoje, duomenis, apibrėžiančius kiekvieną laboratorinę įrangą, ir pritaikytą laboratorinę įrangą.
Laboratorinė įranga kaip techninė įranga
Labware bibliotekoje yra viskas, ką pagal numatytuosius nustatymus galite naudoti su Opentrons Flex. Tai yra patvarūs komponentai ir eksploatacinės medžiagos, su kuriomis dirbate, pakartotinai naudojate arba išmetate vykdydami protokolą. Norint dirbti su Labware bibliotekos elementais, nereikia imtis jokių specialių veiksmų. „Flex“ robotas žino, kaip automatiškai dirbti su viskuo, kas yra bibliotekoje.
Laboratorinė įranga kaip duomenys
Laboratorijos informacija saugoma „Javascript“ objektų žymėjime (JSON) files su .json file plėtiniai. JSON file apima erdvinius matmenis (ilgį, plotį, aukštį), tūrinį pajėgumą (L, ml) ir kitus rodiklius, kurie apibrėžia paviršiaus ypatybes, jų formas ir vietas. Vykdydamas protokolą, „Flex“ nuskaito šiuos .json files žinoti, kokie laboratoriniai įrankiai yra ant denio ir kaip su jais dirbti.
80
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Individualizuota laboratorinė įranga
Pasirinktinė laboratorinė įranga yra laboratorinė įranga, kuri nėra įtraukta į Labware biblioteką arba yra sukurta Custom Labware Creator. Tačiau kartais individualios laboratorinės įrangos idėją apsunkina sudėtingumo, išlaidų ar sunkumų sąvokos. Tačiau pritaikytą laboratorinę įrangą neturėtų būti sunku suprasti ar sukurti. Skirkime šiek tiek laiko, kad išpakuotų individualios laboratorinės įrangos koncepciją.
Kaip buvęsamp„Opentrons Labware Library“ apima 96 šulinėlių plokšteles (200 L) iš „Corning“ ir „BioRad“, tačiau kiti gamintojai taip pat gamina šias šulinių plokštes. Ir dėl visuotinai priimtų pramonės standartų skirtumai tarp šių visur esančių laboratorijos elementų yra nedideli. Tačiau įprasta 200 l, 96 šulinėlių plokštelė iš Stellar Scientific, Oxford Lab arba Krackeler Scientific (ar bet kurio kito tiekėjo) yra „Flex“ „priskirta laboratorinė įranga“, nes ji nėra iš anksto apibrėžta mūsų laboratorijų bibliotekoje. . Be to, nedideli laboratorinės įrangos matmenų skirtumai gali turėti drastiškos įtakos jūsų protokolo vykdymo sėkmei. Dėl šios priežasties svarbu turėti tikslų kiekvienos laboratorinės įrangos, kurią norite naudoti savo protokole, apibrėžimą.
Be to, nors pritaikyta laboratorinė įranga gali būti ezoterinis, vienetinis rinkinys, dažniausiai tai yra tik antgaliai, lėkštės, vamzdeliai ir stovai, kurie kasdien naudojami laboratorijose visame pasaulyje. Vėlgi, vienintelis skirtumas tarp „Opentrons“ laboratorinės įrangos ir pasirinktinės laboratorinės įrangos yra tas, kad naujas elementas nėra iš anksto nustatytas programinėje įrangoje, kuri maitina robotą. „Flex“ gali veikti ir veikia su kitais pagrindiniais laboratorijos elementais ar kažkuo unikaliu, tačiau to elemento charakteristikas turite įrašyti į laboratorinės įrangos apibrėžimą JSON. file ir importuoti tuos duomenis į „Opentrons“ programą. Daugiau informacijos rasite toliau esančiame skyriuje „Custom Labware Definitions“.
Apibendrinant, laboratorinė įranga apima:
Viskas Opentrons Labware bibliotekoje. Laboratorijos apibrėžimai: duomenys JSON file kuri apibrėžia atskirų daiktų formas, dydžius ir galimybes
pvz., šulinių plokštės, antgaliai, rezervuarai ir tt Individualizuotos laboratorijos, kurios nėra įtrauktos į Labware biblioteką.
Po reviewŽinodami šias svarbias sąvokas, panagrinėkime Opentrons Labware bibliotekos kategorijas ir elementus. Po to skyrių užbaigsime su pabaigaview laboratorinės įrangos duomenų komponentų file ir apibendrinkite „Opentrons“ funkcijas ir paslaugas, kurios padeda sukurti pasirinktinę laboratorinę įrangą.
OPENTRONS FLEX
81
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
5.2 Rezervuarai
„Opentrons Flex“ pagal numatytuosius nustatymus veikia su toliau išvardytais vieno ir kelių šulinių rezervuarais. Šių rezervuarų naudojimas padeda sumažinti parengiamojo darbo naštą, nes jie yra paruošti automatizuoti iš karto. Informacija apie rezervuarus taip pat pateikiama Opentrons Labware bibliotekoje.
Vieno šulinio rezervuarai
Gamintojo specifikacijos
Agilent
290 ml V apačioje
Axygen
90 ml Plokščias dugnas
NEST
195 ml Plokščias dugnas
290 ml V apačioje
API įkėlimo pavadinimas
agilient_1_ rezervuaras_290ml
axygen_1_ rezervuaras_90ml
lizdas_1_ rezervuaras_195ml
lizdas_1_ rezervuaras_290ml
Daugiašuliniai rezervuarai
Gamintojo specifikacijos
NEST
12 šulinėlių 15 ml/šulinėlio V dugnas
JAV mokslinis
12 šulinėlių 22 ml/šulinėlio V dugnas
API įkrovos pavadinimas nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ rezervuaras_22ml
82
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Rezervuarai ir API apibrėžimai
Opentrons Labware biblioteka apibrėžia rezervuarų, išvardytų aukščiau atskirame JSON, charakteristikas. files. Robotas ir „Opentrons Python“ API remiasi šiais JSON apibrėžimais, kad veiktų su jūsų protokolų naudojama laboratorine įranga. Pavyzdžiui,ample, kai dirbama su API, funkcija ProtocolContext.load_labware priima šiuos laboratorijos programų pavadinimus kaip galiojančius jūsų kodo parametrus. Susieti API apkrovos pavadinimai prisijungia prie rezervuaro laboratorijos apibrėžimų Opentrons GitHub saugykloje.
Individualūs rezervuarų laboratoriniai įrankiai
Pabandykite sukurti tinkintą laboratorinės įrangos apibrėžimą naudodami Opentrons Labware Creator, jei rezervuaras, kurį norite naudoti, čia nepateiktas. Tinkintas apibrėžimas sujungia visus matmenis, metaduomenis, formas, tūrinę talpą ir kitą JSON informaciją. file. „Opentrons Flex“ reikia šios informacijos, kad suprastų, kaip dirbti su pasirinkta laboratorine įranga. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. skyrių „Custom Labware Definitions“.
5.3 Šulinių plokštės
„Opentrons Flex“ pagal numatytuosius nustatymus veikia su toliau nurodytomis šulinių plokštelėmis. Šių šulinių plokščių naudojimas padeda sumažinti parengiamojo darbo naštą, nes jos yra paruoštos automatizuoti iš karto. Informacija apie šulinių plokštes taip pat pateikiama Opentrons Labware bibliotekoje.
OPENTRONS FLEX
83
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
6 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Corning
Specifikacijos
6 šulinėliai 16.8 mL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
API įkrovos pavadinimas corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Corning
Specifikacijos
12 šulinėliai 6.9 mL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
API įkrovos pavadinimas corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Corning
Specifikacijos
24 šulinėliai 3.4 mL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
API įkrovos pavadinimas corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Corning
Specifikacijos
48 šulinėliai 1.6 mL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
API įkrovos pavadinimas corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
96 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
JAV mokslinis
Specifikacijos
96 šulinėliai 200 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, V dugnas
96 šulinėliai 360 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
96 šulinėliai 100 µL/šulinėliai Apvalūs šulinėliai, V apačia PGR pilna sienelė
96 šulinėliai 200 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, plokščias dugnas
96 gilūs šuliniai 2000 µL/šulinėliai Kvadratiniai šuliniai, V dugnas
Tvirtas 96 šulinėliai 200 µl/šulinėliai Apvalūs šulinėliai, V apačia PGR pilna sienelė
Nunc 96 giliai šulinėliai 1300 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, U dugnas
Nunc 96 giliai šulinėliai 2000 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, U dugnas
96 giliai šulinėliai 2.4 mL/šulinėliai Kvadratiniai šuliniai, U dugnas
API įkrovos pavadinimas biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
lizdas_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
lizdas_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ sijonas
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
384 šulinėlių plokštelės
Gamintojas Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Specifikacijos
384 šulinėliai 40 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, V dugnas
384 šulinėliai 50 µL/šulinėliai Apvalūs šuliniai, V dugnas
384 šulinėliai 112 µL/šulinėliai Kvadratiniai šuliniai, plokščias dugnas
API įkėlimo pavadinimas taikomasbiosystemsmicroamp_384_ šulinio plokštelė_40ul biorad_384_šulinio plokštė_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Šulinių plokščių adapteriai
Žemiau išvardytos aliuminio plokštės yra terminiai adapteriai, skirti Opentrons Heater-Shaker GEN1 moduliui. Galite naudoti šiuos atskirus adapterio apibrėžimus, norėdami įkelti „Opentrons“ patikrintą arba pritaikytą laboratorinę įrangą ant „Heater-Shaker“.
Adapterio tipas Opentrons Universalus plokščias šildytuvo-kratytuvo adapteris Opentrons 96 PCR šildytuvo-kratytuvo adapteris Opentrons 96 gilaus šulinio šildytuvo-kratytuvo adapteris Opentrons 96 plokščio dugno šildytuvo-kratytuvo adapteris
API įkėlimo pavadinimas opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Taip pat galite įkelti adapterį ir laboratorijos įrangą naudodami vieną apibrėžtį. Mūsų laboratorijų bibliotekoje yra keli iš anksto sukonfigūruoti terminiai adapteriai ir laboratorijos įrangos deriniai, dėl kurių „Heater-Shaker“ yra paruoštas naudoti iš karto.
86
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Pastaba: Nenaudokite kombinuoto apibrėžimo, jei jums reikia perkelti laboratorinius įrankius ant Heater-Shaker arba iš jo, naudojant griebtuvą arba rankiniu būdu. Vietoj to naudokite atskirą adapterio apibrėžimą.
Adapterio / laboratorijos derinys
API įkėlimo pavadinimas
„Opentrons 96“ giluminio šulinio šildytuvo-kratytuvo adapteris su NEST gilaus šulinio plokšte 2 ml
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
„Opentrons 96“ plokščio dugno šildytuvo ir purtytuvo adapteris su NEST 96 šulinių plokšte, 200 µL plokščia
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR šildytuvo-kratytuvo adapteris su NEST šulinio plokšte 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
„Opentrons“ universalus plokščias šildytuvo-kratytuvo adapteris su Corning 384 šulinėlių plokšte 112 µL plokščia
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adapterius galima įsigyti tiesiogiai iš „Opentrons“ adresu https://shop.opentrons.com.
Šulinių plokštės ir API apibrėžimai
Opentrons Labware biblioteka apibrėžia pirmiau atskirame JSON išvardintas šulinių plokštelių charakteristikas files. „Flex“ robotas ir „Opentrons Python“ API remiasi šiais JSON apibrėžimais, kad veiktų su jūsų protokolų naudojama laboratorine įranga. Pavyzdžiui,ample, kai dirbama su API, funkcija ProtocolContext.load_labware priima šiuos laboratorijos programų pavadinimus kaip galiojančius jūsų kodo parametrus. Susieti API apkrovos pavadinimai prisijungia prie šulinėlių plokštelių laboratorijos apibrėžimų Opentrons GitHub saugykloje.
Individualūs šulinių plokštelių laboratoriniai įrankiai
Pabandykite naudoti „Opentrons Labware Creator“, kad sukurtumėte tinkintą laboratorinės įrangos apibrėžimą, jei čia nepateikta norimos naudoti šulinio plokštės. Tinkintas apibrėžimas sujungia visus matmenis, metaduomenis, formas, tūrinę talpą ir kitą JSON informaciją. file. „Opentrons Flex“ perskaito šią informaciją, kad suprastų, kaip dirbti su pasirinkta laboratorine įranga. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. skyrių „Custom Labware Definitions“.
OPENTRONS FLEX
87
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
5.4 Antgaliai ir antgalių lentynos
„Opentrons Flex“ antgaliai yra 50 µL, 200 µL ir 1000 µL dydžių. Tai skaidrūs, nelaidūs polipropileniniai antgaliai, kuriuos galima įsigyti su filtrais arba be jų. Jie steriliai supakuoti į stelažus, kuriuose yra 96 antgaliai ir kuriuose nėra DNazės, Rnazės, proteazės, pirogenų, žmogaus DNR, endotoksinų ir PGR inhibitorių. Ant lentynų taip pat yra partijų numeriai ir galiojimo datos.
Flex pipetės antgaliai veikia su Opentrons Flex 50 µL ir 1000 µL pipetėmis 1, 8 ir 96 kanalų konfigūracijomis. Nors ant 50 l ir 1000 XNUMX l pipečių galite uždėti bet kurį Flex antgalį, pabandykite antgalį suderinti su pipetės vardine talpa. Pavyzdžiui,ampgali būti keista uždėti 1000 L galiuką ant 50 L pipetės. 1000 L pipetei tikrai galite naudoti 50 L, 200 L arba 1000 L antgalį.
Antgalių lentynos
Nefiltruoti ir filtruojami antgaliai sujungiami į stovą, kurį sudaro daugkartinio naudojimo pagrindo plokštė, vidurinė plokštė, kurioje yra 96 antgaliai, ir dangtis.
Antgalių lentynėlė pagal tūrį 50 µL 200 µL 1000 µL
API įkėlimo pavadinimas
Nefiltruota: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtruota: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Nefiltruota: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtruota: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Nefiltruota: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtruota: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Kad būtų lengviau identifikuoti, antgalio stovo vidurinės plokštės yra spalvomis koduojamos pagal antgalio dydį:
50 µL: rausvai raudona 200 L: geltona 1000 µL: mėlyna
88
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Užsakant arba persakant, antgaliai ir lentynos yra dviejų skirtingų supakuotų konfigūracijų:
Lentynos: susideda iš atskirai susitraukiančių antgalių lentynų (pagrindinė plokštė, vidurinė plokštė su antgaliais ir dangtelis). Pakabinamos konfigūracijos yra geriausios, kai svarbiausia yra švara, kad būtų išvengta kryžminio užteršimo arba kai jūsų protokolai neleidžia pakartotinai naudoti pagrindo plokštės ar komponentų.
Papildymai: susideda iš vienos pilnos antgalių lentynos (pagrindinės plokštės, vidurinės plokštės su antgaliais ir dangteliu) ir atskirų antgalių konteinerių. Papildymo konfigūracijos yra geriausios, kai jūsų protokolai leidžia pakartotinai naudoti pagrindo plokštę arba komponentus.
Tipipette suderinamumas
Flex pipetės antgaliai yra skirti Opentrons Flex pipetėms. Flex antgaliai atgal nesuderinami su Opentrons OT-2 pipetėmis, taip pat negalima naudoti OT-2 antgalių su Flex pipetėmis.
Su „Flex“ pipetėmis gali veikti ir kiti pramonės standartai, tačiau tai nerekomenduojama. Norėdami užtikrinti optimalų veikimą, su Flex pipetėmis turėtumėte naudoti tik Opentrons Flex antgalius.
Antgalio stovo adapteris
Norint tinkamai pritvirtinti visą antgalių stovą, 96 kanalų pipetei reikalingas adapteris. Tvirtinimo procedūros metu pipetė juda ant adapterio, nusileidžia ant tvirtinimo kaiščių ir, pakeldama adapterį ir antgalių stovą, užtraukia antgalius ant pipečių.
OPENTRONS FLEX
89
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Pastaba: antgalių stovo adapterį naudokite tik tada, kai iš karto paimate visą antgalių lentyną. Padėkite antgalių lentynas tiesiai ant denio, kai renkate mažiau antgalių.
Įspėjimas: suspaudimo taško pavojus. Kol pipetė tvirtina pipetės antgalius, rankas laikykite toliau nuo antgalio stovo adapterio.
Adapterio tipas Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
API įkėlimo pavadinimas opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Antgalio laikiklio adapteris yra suderinamas su Opentrons Flex Gripper. Galite naudoti griebtuvą, norėdami ant adapterio įdėti šviežių antgalių laikiklius arba paimti ir perkelti panaudotus antgalių laikiklius į atliekų lataką.
5.5 Vamzdžiai ir vamzdžių lentynos
„Opentrons 4-in-1 Tube Rack“ sistema veikia su „Opentrons Flex“ pagal numatytuosius nustatymus. Vamzdžių stovo „4-in-1“ naudojimas padeda sumažinti parengiamojo darbo naštą, nes jo teikiami deriniai yra paruošti automatizuoti iš karto. Daugiau informacijos taip pat rasite Opentrons Labware bibliotekoje.
90
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Vamzdžių ir stovo deriniai
„Opentrons 4-in-1“ vamzdžių stovas palaiko daugybę įvairių dydžių vamzdžių, pavienius arba skirtingų dydžių (tūrio) derinius. Tai apima: 6 mėgintuvėlių stovą 50 ml mėgintuvėliams (6 x 50 ml). 10 mėgintuvėlių kombinuotas stovas keturiems 50 ml mėgintuvėliams ir šešiems 15 ml mėgintuvėliams (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). 15 mėgintuvėlių stovas 15 ml mėgintuvėliams (15 x 15 ml). 24 mėgintuvėlių stovas 0.5 ml, 1.5 ml arba 2 ml mėgintuvėliams (24 x 0.5 ml, 1.5 ml, 2 ml).
Pastaba: Visi vamzdeliai yra cilindriniai su V formos (kūginiu) dugnu, jei nenurodyta kitaip.
6 vamzdžių lentynos
Mėgintuvėlis tipas 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10 vamzdžių lentynos
4 tipo vamzdelis Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml
API įkėlimo pavadinimas opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
15 vamzdžių lentynos
Mėgintuvėlis tipas 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
API įkėlimo pavadinimas opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24 vamzdžių lentynos
Vamzdžio tipas
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, U formos dugnas 24 bendri 2 ml užsukamas dangtelis 24 NEST 0.5 ml užsukamas dangtelis 24 NEST 1.5 ml užsukamas dangtelis 24 NEST 1.5 ml užsukamas dangtelis 24 NEST2 mL užsukamas dangtelis NEST 24 ml užsegamas dangtelis, U formos dugnas
API įkėlimo pavadinimas opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Vamzdžių stovo API apibrėžimai
Opentrons Labware biblioteka apibrėžia anksčiau atskirame JSON išvardintas vamzdžių stovų charakteristikas files. „Flex“ robotas ir „Opentrons Python“ API remiasi šiais JSON apibrėžimais, kad veiktų su jūsų protokolų naudojama laboratorine įranga. Pavyzdžiui,ample, kai dirbama su API, funkcija ProtocolContext.load_labware priima šiuos laboratorijos programų pavadinimus kaip galiojančius jūsų kodo parametrus. Susieti API apkrovos pavadinimai jungiasi prie vamzdžių stovo laboratorijos apibrėžimų Opentrons GitHub saugykloje.
92
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Individualizuotos vamzdžių stovo laboratorijos reikmenys
Pabandykite sukurti tinkintą laboratorinės įrangos apibrėžimą naudodami Opentrons Labware Creator, jei čia nepateiktas norimas naudoti vamzdelio ir stovo derinys. Tinkintas apibrėžimas sujungia visus matmenis, metaduomenis, formas, tūrinę talpą ir kitą JSON informaciją. file. „Opentrons Flex“ perskaito šią informaciją, kad suprastų, kaip dirbti su pasirinkta laboratorine įranga. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. skyrių „Custom Labware Definitions“.
5.6 Aliuminio blokeliai
Aliuminio blokeliai pristatomi kartu su temperatūros moduliu GEN2 ir juos galima įsigyti atskirai kaip trijų dalių rinkinį. Rinkinį sudaro plokščio dugno plokštė, 24 šulinėlių blokas ir 96 šulinėlių blokas.
„Opentrons Flex“ naudoja aliuminio blokus, kad laikytų sampvamzdelius ir šulinių plokštes ant temperatūros modulio arba tiesiai ant denio. Naudojant kartu su temperatūros moduliu, aliuminio blokai gali išlaikyti jūsų sampmėgintuvėlius, PGR juosteles arba plokšteles pastovioje 4–95 °C temperatūroje.
Plokščia apatinė plokštė
Plokščias dugno plokštės, skirtos Flex laivams su temperatūros modulio korpusu ir yra suderinamos su įvairiomis ANSI/SLAS standartinėmis šulinių plokštėmis. Ši plokščia plokštė skiriasi nuo plokštės, kuri pristatoma su pačiu temperatūros moduliu arba atskiru trijų dalių rinkiniu. Jame yra platesnis darbinis paviršius ir kampiniai spaustukai. Šios funkcijos padeda pagerinti „Opentrons Flex Gripper“ veikimą perkeliant laboratorijos reikmenis ant plokštės arba nuo jos.
Galite suprasti, kokią plokščią dugną turite, nes ant „Flex“ skirtos plokštės viršutiniame paviršiuje yra užrašas „Opentrons Flex“. OT-2 skirtas ne.
OPENTRONS FLEX
93
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
24 šulinėlių aliuminio blokas
24 šulinėlių blokas naudojamas su atskiromis sample buteliukus. Pavyzdžiui,ample, tai priima sample buteliukai, kurie:
Turėkite V arba U formos dugną. Pritvirtinkite turinį užsukamais arba užsukamais dangteliais. Laikykite skystį 0.5 ml, 1.5 ml ir 2 ml talpos.
96 šulinėlių aliuminio blokas
96 šulinėlių blokas palaiko įvairius šulinių plokščių tipus. Pavyzdžiui,ample, jis priima šulinių plokštes, kurios yra:
Iš pagrindinių šulinių plokščių gamintojų, tokių kaip Bio-Rad ir NEST.
Sukurta su V formos dugnu, U formos dugnu arba plokščiu dugnu.
Sukurta su 100 µL arba 200 µL šulinėliais.
Jis taip pat suderinamas su bendromis PGR juostelėmis.
Autonominiai adapteriai
Terminis blokas Flex plokščio dugno plokštė 24 šulinėlių aliuminio blokas 96 šulinėlių aliuminio blokas
API įkrovos pavadinimas opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Žr. toliau pateiktus laboratorinių programų derinius. opentrons_96_well_aluminum_block
Aliuminio blokelių laboratorinių įrankių deriniai
„Opentrons Labware Library“ palaiko šiuos blokų, buteliukų ir šulinių plokštelių derinius, kurie taip pat apibrėžti atskirame JSON laboratorijos programos apibrėžime files. „Flex“ robotas ir „Opentrons Python“ API
94
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
pasikliaukite šiais JSON apibrėžimais, kad dirbtumėte su jūsų protokolų naudojama laboratorine įranga. Pavyzdžiui,ample, kai dirbama su API, funkcija ProtocolContext.load_labware priima šiuos laboratorijos programų pavadinimus kaip galiojančius jūsų kodo parametrus. Toliau pateiktose lentelėse pateikiami numatytieji blokų / sudėtinių rodinių deriniai ir susiję API įkėlimo pavadinimai. Nuorodos jungiasi prie atitinkamų JSON apibrėžimų Opentrons GitHub saugykloje.
Pastaba: Visų vamzdžių dugnas yra V formos, jei nenurodyta kitaip.
24 šulinėlių aliuminio blokelių laboratorinių reikmenų deriniai
24 šulinėlių bloko turinys Bendras 2 ml užsukamas dangtelis NEST 0.5 ml užsukamas dangtelis NEST 1.5 ml užsukamas dangtelis NEST 1.5 ml užsukamas dangtelis NEST 2 ml užsukamas dangtelis NEST 2 ml užsukamas dangtelis, U formos dugnas
API įkrovos pavadinimas opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_aluminumblock_nest_24ml. užsukamas dangtelis opentrons_2_aluminumblock_nest_24ml_snapcap
96 šulinėlių aliuminio blokelių laboratorinių reikmenų deriniai
96 šulinėlių bloko turinys Bio-Rad šulinėlių plokštelė 200 µL bendroji PGR juostelė 200 µL NEST šulinėlių plokštelė 100 µL
API įkrovos pavadinimas opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
5.7 Laboratoriniai įrankiai ir Opentrons Flex Gripper
Nors „Opentrons Flex“ veikia su visais laboratorijų bibliotekos inventoriumi, „Opentrons Flex Gripper“ yra suderinamas tik su tam tikrais laboratorijos elementais. Šiuo metu „Gripper“ yra optimizuotas naudoti su šiais laboratoriniais įrankiais.
Laboratorinės įrangos kategorija Giluminio šulinio lėkštės Pilnai skirtos 96 šulinių lėkštės
Antgalių stovai (nefiltruoti ir filtruoti antgaliai)
Prekiniai ženklai
NEST 96 gilaus šulinio plokštelė 2 ml
Opentrons Tough 96 šulinėlių plokštelė 200 µL PGR pilnas sijonas NEST 96 šulinėlių plokštelė 200 µL plokščia
„Opentrons Flex 96“ antgalių lentynėlė 50 µL „Opentrons Flex 96“ antgalių lentynėlė 200 µL „Opentrons Flex 96“ antgalių lentynėlė 1000 µL
Pastaba: Norėdami gauti geriausius rezultatus, naudokite „Flex Gripper“ tik su aukščiau išvardytais laboratoriniais įrankiais. „Flex Gripper“ gali veikti su kita ANSI/SLAS automatizavimo suderinama laboratorine įranga, tačiau tai nerekomenduojama.
5.8 Individualių laboratorinių programų apibrėžimai
Kaip aptarta šio skyriaus pradžioje, pasirinktinė laboratorinė įranga yra laboratorinė įranga, kuri nėra įtraukta į Opentrons Labware biblioteką. Su „Flex“ galite naudoti kitus įprastus ar unikalius laboratorijos elementus, tiksliai išmatuodami ir įrašydami to objekto charakteristikas ir išsaugodami tuos duomenis JSON. file. Kai importuojama į programą, „Flex“ ir API naudoja tuos JSON duomenis, kad sąveikautų su jūsų laboratorinėmis programomis. „Opentrons“ teikia įrankius ir paslaugas, kuriuos išnagrinėsime toliau, kad padėtų jums naudoti „Flex“ su pasirinktine laboratorine įranga.
96
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Pasirinktinių laboratorinių programų apibrėžimų kūrimas
„Opentrons“ įrankiai ir paslaugos padeda jums pasiekti pritaikytą laboratorinę įrangą. Šios funkcijos atitinka skirtingus įgūdžių lygius ir darbo būdus. Kurdami savo laboratorijos įrangą ir naudodami ją su Opentrons Flex, robotas taps universaliu ir galingu jūsų laboratorijos priedu.
TINKINTOS LABORINĖS ĮRANGOS KŪRĖJAS
Custom Labware Creator yra be kodo, web- pagrįstas įrankis, kuriame naudojama grafinė sąsaja, padedanti sukurti laboratorinės įrangos apibrėžimą file. Labware Creator sukuria JSON laboratorinės įrangos apibrėžimą file kurį importuojate į „Opentrons“ programą. Po to jūsų pasirinktinė laboratorinė įranga bus prieinama „Flex“ robotui ir „Python“ API.
PRIVALOMA LABORINĖS ĮRANGOS PASLAUGA
Susisiekite su mumis, jei laboratorinės įrangos, kurią norite naudoti, nėra bibliotekoje, jei negalite sukurti savo apibrėžimų arba todėl, kad pasirinktoje prekėje yra skirtingų formų, dydžių ar kitų pažeidimų, aprašytų toliau.
Labware Creator galite nustatyti Labware Creator
; Šuliniai ir vamzdeliai yra vienodi ir vienodi. ; Visos eilutės yra tolygiai išdėstytos
(tarpas tarp eilučių lygus).
; Visi stulpeliai yra tolygiai išdėstyti (tarpas tarp stulpelių yra lygus).
; Puikiai telpa į vieną denio lizdą.
Labware Opentrons turi apibrėžti ; Šulinių ir vamzdžių formos skiriasi. ; Eilutės nėra tolygiai išdėstytos.
; Stulpeliai nėra tolygiai išdėstyti.
; Mažesnis nei vienas denio lizdas (reikalingas adapteris) arba apima kelis denio lizdus.
OPENTRONS FLEX
97
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
Štai keletas diagramų, kurios padės įsivaizduoti buvampmažiau aprašyta aukščiau. Reguliarus Visi stulpeliai yra tolygiai išdėstyti, o visos eilutės yra vienodai išdėstytos. Stulpeliai nebūtinai turi būti tokie patys kaip eilutės.
Įprasta Tinklelis nebūtinai turi būti laboratorijos indų centre.
Netaisyklingos eilutės išdėstytos tolygiai, bet stulpeliai netolygiai išdėstyti.
Netaisyklingos stulpeliai / eilutės yra tolygiai išdėstyti, bet šuliniai nėra identiški.
Nereguliarus Yra daugiau nei vienas tinklelis.
Mūsų laboratorinės įrangos komanda dirbs, kad suprastų jūsų poreikius ir sukurs jums pritaikytus laboratorinės įrangos apibrėžimus. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. pagalbos straipsnius „Užklausos dėl tinkintos laboratorijos įrangos apibrėžimo“ ir „Custom Labware Request“ formą. Tai mokama paslauga.
98
OPENTRONS FLEX
5 SKYRIUS: LABORINĖS ĮRANGOS
PYTHON API
Nors negalite sukurti tinkintų laboratorinių programų naudodami mūsų API, galite naudoti pasirinktines laboratorines programas su turimais API metodais. Tačiau pirmiausia turite apibrėžti pasirinktinę laboratorinę įrangą ir importuoti ją į „Opentrons“ programą. Pridėjus laboratorinę įrangą prie „Opentrons“ programos, ji bus pasiekiama „Python“ API ir robotui. Norėdami gauti daugiau informacijos, žr. Python API dokumentacijos skyrių Custom Labware apibrėžimai. Norėdami gauti informacijos apie protokolo scenarijų rašymą naudojant API, žr. Python Protocol API skyrių Protokolo kūrimas skyriuje.
JSON laboratorijos schema
JSON file yra „Opentrons“ standartinės ir individualios laboratorinės įrangos projektas. Tai file yra ir tvarkomi laboratorijos duomenys pagal projektavimo specifikacijas, nustatytas pagal numatytąją schemą.
Schema yra rėmelis
Dokumentai / Ištekliai
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source skysčių tvarkymo robotas [pdfNaudojimo instrukcija FLEX Opentrons Flex atviro kodo skysčių tvarkymo robotas, FLEX, Opentrons Flex atvirojo kodo skysčių tvarkymo robotas, Flex atvirojo kodo skysčių tvarkymo robotas, atvirojo kodo skysčių tvarkymo robotas, šaltinio skysčių tvarkymo robotas, skysčių tvarkymo robotas, tvarkymo robotas, robotas |