FLEX Opentrons Flex avatud lähtekoodiga vedeliku käitlemise robot
“
Opentrons Flex
Tehnilised andmed:
- Üldised spetsifikatsioonid: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Keskkonnaspetsifikatsioonid: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing eliit. Sed do eiusmod tempor
incidunt ut labore et dolore magna aliqua. - Sertifikaadid: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incidunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Seerianumber: XXX-XXXX-XXXX
Toote kasutusjuhised:
1. Seadme paigaldamine ja kalibreerimine:
Järgige pipeti ja haaratsi juhendis kirjeldatud samme
paigaldus.
2. Ümberpaigutamine:
Lühikeste liigutuste kohta vaadake juhendi jaotist 2.5. Sest
pikamaa käigud, järgige antud juhiseid. Üldine kolimine
nõuanded on samuti saadaval.
3. Ühendused:
Veenduge, et vooluühendus on juhendis kirjeldatud.
Ühendage USB ja lisaseadmed vastavalt vajadusele. Võrguühendused
tuleks kehtestada vastavalt juhistele.
4. Protokolli kujundaja:
Saate aru Protocol Designeri nõuetest ja õppige, kuidas
uute protokollide kujundamiseks või olemasolevate muutmiseks vastavalt oma laborile
nõuded.
5. Pythoni protokolli API:
Avastage Pythoni protokolli API abil skriptide kirjutamist ja käitamist.
Avastage Pythoni eksklusiivsed funktsioonid täiustatud funktsionaalsuse jaoks.
6. OT-2 protokollid:
Lisateavet OT-2 Pythoni protokollide, OT-2 JSON-protokollide ja
Magnetmooduli protokollid erinevat tüüpi katsete jaoks.
Korduma kippuvad küsimused (KKK):
K: Kuidas teha tõrkeotsingut, kui robot ei liigu nagu
oodata?
V: Kontrollige toiteühendust ja veenduge, et see on õigesti kalibreeritud
instrumente ja veenduge, et seadmes pole takistusi
roboti tee.
K: Kas ma saan Opentrons Flexiga kasutada kohandatud pipette?
V: Opentrons soovitab optimaalseks kasutamiseks kasutada ühilduvaid pipette
jõudlus ja täpsus.
"`
Opentrons Flex
Kasutusjuhend
Opentrons Labworks Inc.
detsember 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Selles dokumendis kasutatud registreeritud nimesid, kaubamärke jne, isegi kui need ei ole spetsiaalselt märgistatud, ei loeta seadusega kaitsmata.
Sisukord
Eessõna . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Käesoleva juhendi ülesehitus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Märkused ja hoiatused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1. peatükk: Sissejuhatus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Tere tulemast Opentrons Flexi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Mis on uut Flexis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flexi tööjaamad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Ohutusalane teave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Ohutussümbolid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elektriohutushoiatused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Täiendavad ohutushoiatused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Ohutusnõuded . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Bioloogiline ohutus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Mürgised aurud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Tuleohtlikud vedelikud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Nõuetele vastavus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Ohutus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetiline ühilduvus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC hoiatused ja märkused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kanada ISED vastavus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Keskkonnahoiatus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi eelsertifikaat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
2. peatükk: Paigaldamine ja ümberpaigutamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Ohutus- ja kasutusnõuded . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Kuhu Opentrons Flex paigutada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Energiatarve . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Keskkonnatingimused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Karbist lahtivõtmine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Nõutav pingutus ja aeg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Kast ja pakkematerjal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Tooteelemendid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 1. osa: aediku eemaldamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Osa 2: Vabastage Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Osa 3: Lõplik kokkupanek ja sisselülitamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Esimene jooks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Toide sisse . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Võrgu või arvutiga ühenduse loomine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Tarkvaravärskenduste installimine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Hädaseiskamisripatsi kinnitamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Andke oma robotile nimi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Seadme paigaldamine ja kalibreerimine . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipeti paigaldamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Haaratsi paigaldamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Ümberpaigutamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Lühikesed käigud. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Kaugkäigud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Üldised kolimisnõuanded . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Viimased mõtted kolimisest. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
3. peatükk: Süsteemi kirjeldus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Füüsilised komponendid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Raam ja korpus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Tekk ja tööala . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagala . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Tekiseadmed. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Jäätmerenn. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagala teenindusajad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Liikumissüsteem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Puuteekraan ja LED-ekraanid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipetid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipeti tehnilised andmed. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipeti kalibreerimine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipetiotsiku riiuli adapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Jootraha osaline korjamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetiandurid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetti püsivara värskendused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Haarats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Haaratsi tehnilised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Haaratsi kalibreerimine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripperi püsivara värskendused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Hädaseiskamisripats . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Millal E-peatust kasutada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 E-peatuse sisselülitamine ja vabastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Ühendused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Toiteühendus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB- ja lisaühendused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Võrguühendused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Süsteemi spetsifikatsioonid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Üldised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Keskkonnaspetsifikatsioonid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sertifikaadid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Seerianumber . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
4. peatükk: moodulid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Toetatud moodulid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Moodulikorpuse süsteem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Mooduli kalibreerimine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Millal mooduleid kalibreerida. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Kuidas mooduleid kalibreerida . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Soojendi-raputi moodul GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker omadused. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker tehnilised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetplokk GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetploki omadused. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetploki tehnilised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperatuurimoodul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatuurimooduli omadused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatuurimooduli tehnilised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Termotsükleri moodul GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Thermocycleri omadused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Termotsirkulaatori tehnilised andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
5. peatükk: Laborinõud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Laboratooriumi mõisted. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware kui riistvara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware kui andmed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Kohandatud laborivara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Mahutid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Ühe süvendiga reservuaarid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Mitme süvendiga reservuaarid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservuaarid ja API määratlused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Kohandatud reservuaari laborinõud. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Kaevuplaadid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6 süvendiga plaadid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12 süvendiga plaati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24 süvendiga plaati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48 süvendiga plaati. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96 süvendiga plaati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384 süvendiga plaati . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Kaevuplaadi adapterid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Kaevuplaadid ja API määratlused. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Kohandatud kaevuplaadi laborinõud. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Otsikud ja otsakuriiulid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Otsariiulid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tippette'i ühilduvus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Otsaresti adapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Torud ja toruriiulid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Toru ja riiuli kombinatsioonid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6 toruga nagid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 10 toruga nagid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15 toruga nagid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24-torulised nagid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Toruriiuli API määratlused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Kohandatud toruriiuli laborinõud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Alumiiniumplokid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Lamedapõhjaline plaat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24 süvendiga alumiiniumplokk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96 süvendiga alumiiniumplokk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Eraldiseisvad adapterid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Alumiiniumplokkidest laborivara kombinatsioonid . . . . . . . . . . . . . . . .94 24 süvendiga alumiiniumplokkidest laborinõude kombinatsioonid . . . . . . . . .95 96 süvendiga alumiiniumplokkidest laborinõude kombinatsioonid . . . . . . . . .95 5.7 Laboratorid ja Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Kohandatud laborivara määratlused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Kohandatud laborivara definitsioonide loomine . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSONi laborivaraskeem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON-laborivara määratlused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 6. peatükk: Protokolli arendamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Ettevalmistatud protokollid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protokolli raamatukogu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Kohandatud protokolli arendusteenus . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protokolli kujundaja. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolli kujundaja nõuded . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolli koostamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Olemasolevate protokollide muutmine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Pythoni protokolli API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Skriptide kirjutamine ja käitamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Pythoni eksklusiivset funktsiooni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 protokollid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Pythoni protokolli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON-protokolli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetmooduli protokollid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
7. peatükk: Tarkvara ja kasutamine. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Puuteekraani kasutamine. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Roboti armatuurlaud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protokollihaldus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protokolli üksikasjad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Käivitage häälestus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Labware asendi kontroll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Jooksu edenemine. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Jooksu lõpetamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Instrumentide haldamine. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Roboti seaded. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Teki konfiguratsioon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Rakendus Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Rakenduse installimine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Protokollide edastamine Flexi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Mooduli olek ja juhtelemendid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Hiljutised protokollijooksud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Täpsemad funktsioonid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyteri märkmik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Käsurea operatsioon SSH kaudu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
8. peatükk: Hooldus ja teenindus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Flexi puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Enne alustamist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Mida saab puhastada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Puhastuslahused. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Raami ja aknapaneelide puhastus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Teki puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Portaali puhastamine. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Jäätmerenni puhastus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Pipettide ja otsikute puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pipeti saastest puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Pipetiotsikute puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Haaratsi puhastamine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Puhastusmoodulid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Mooduli üldpuhastus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycleri tihendid. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Autoklaavikindlad laboritarbed . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Flexi hooldus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentroni teenused . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Paigaldamise ja käitamise kvalifikatsioon . . . 155 Ennetav hooldus . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garantii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Lisa A: Sõnastik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Lisa B: Täiendav dokumentatsioon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Pythoni protokolli API dokumentatsioon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API viide. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Arendaja dokumentatsioon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Lisa C: Avatud lähtekoodiga tarkvara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentronid GitHubis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Muud hoidlad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Lisa D: Tugi- ja kontaktteave . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Müük . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Tugi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Äriteave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Eessõna
Tere tulemast Opentrons Flex vedeliku käitlemisroboti kasutusjuhendisse. See juhend juhendab teid peaaegu kõiges, mida peate Flexi seadistamiseks ja kasutamiseks teadma, keskendudes teemadele, mis on laborikeskkonnas Flexi igapäevaste kasutajate jaoks kõige asjakohasemad.
Selle juhendi ülesehitus
Opentrons Flex on keeruline süsteem, nii et kõige selle õppimiseks on palju erinevaid teid. Hüppa julgelt otse peatüki juurde, mis käsitleb mis tahes teemat, mis sind huvitab! NäiteksampKui teie laboris on Flex juba seadistatud, võite installimise ja ümberpaigutamise peatüki vahele jätta.
Kui eelistate juhitud lähenemist, on käesolev juhend üles ehitatud nii, et saate seda algusest lõpuni jälgida.
Lisateavet Flexi kohta. Flexi eristavad omadused on loetletud 1. peatükis: Sissejuhatus. Sissejuhatus sisaldab ka olulist ohutus- ja regulatiivset teavet.
Alustage Flexiga. Kui teil on vaja oma Flexi seadistada, järgige peatükis 2: Paigaldamine ja ümberpaigutamine toodud üksikasjalikke juhiseid. Seejärel tutvuge Flexi komponentidega peatükis 3: Süsteemi kirjeldus.
Seadistage oma tekk. Teki konfigureerimine võimaldab Flexis erinevaid teaduslikke rakendusi. Peatükk 4: Moodulid kirjeldab Opentronsi välisseadmeid, mida saate konkreetsete teaduslike ülesannete täitmiseks seadmesse või selle peale installida. 5. peatükk: Laborinõud selgitab, kuidas töötada vedelike hoidmiseks mõeldud seadmetega.
Käivitage protokoll. Flexi põhikasutusala on standardiseeritud teaduslike protseduuride, mida tuntakse protokollidena, käitamine. 6. peatükk: Protokolliarendus pakub mitmeid viise valmis protokollide hankimiseks või nende ise kujundamiseks. Protokolli käivitamiseks järgige juhiseid peatükis 7: Tarkvara ja kasutamine, kus on ka juhised muude toimingute tegemiseks ja teie roboti sätete kohandamiseks.
Hoidke Flex töös. Järgige 8. peatükis: Hooldus ja hooldus toodud nõuandeid, et hoida oma Flex puhtana ja optimaalselt töökorras. Või registreeruge mõne seal loetletud Opentroni teenuse kasutajaks ja laske meil Flexi eest teie eest hoolitseda.
Õppige veelgi rohkem. Kas on ikka midagi muud vaja? Tutvu lisadega. Lisa A: Sõnastik määratleb Flexiga seotud terminid. Lisa B: Täiendav dokumentatsioon juhib teile veelgi rohkem ressursse Opentronsi toodete jaoks ja Flexi juhtimiseks koodi kirjutamiseks.
OPENTRONS FLEX
9
EESSÕNA
Lisa C: avatud lähtekoodiga tarkvara selgitab, kuidas Opentroni tarkvara GitHubis hostitakse nii arendajatele kui ka mittearendajatele mõeldud ressursina.
Lisas D: tugi- ja kontaktteave loetletakse, kuidas Opentronsiga ühendust võtta, kui vajate abi lisaks meie dokumentatsioonis pakutule.
Märkused ja hoiatused
Selles juhendis leiate spetsiaalselt vormindatud märkme- ja hoiatusplokke. Märkused pakuvad kasulikku teavet, mis ei pruugi Flexi tavapärase kasutamise käigus ilmneda. Pöörake erilist tähelepanu hoiatustele – neid kasutatakse ainult olukordades, kus on oht saada kehavigastusi, kahjustada seadmeid, kaotada või rikneda.ampreaktiive, andmete kadumist või muud kahju. Märkused ja hoiatused näevad välja järgmised:
SampMärkus: see on midagi, mida peaksite teadma, kuid see ei kujuta endast ohtu.
SampHoiatus: seda peate teadma, kuna sellega on seotud risk.
10
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK
Sissejuhatus
See peatükk tutvustab teile Opentrons Flexi ökosüsteemi, sealhulgas süsteemi üldist disaini ja saadaolevaid tööjaama konfiguratsioone. See sisaldab ka olulist vastavus- ja ohutusteavet, mida peaksite uuesti tegemaview enne Opentrons Flexi roboti seadistamist. Lisateavet Opentrons Flexi funktsioonide kohta leiate peatükist Süsteemi kirjeldus.
1.1 Tere tulemast Opentrons Flexi
Opentrons Flex on vedeliku käitlemise robot, mis on loodud suure läbilaskevõime ja keerukate töövoogude jaoks. Flexi robot on moodulsüsteemi alus, mis sisaldab pipette, laboritarvikute haaratsit, tekikinnitusi, tekil olevaid mooduleid ja laborinõusid – need kõik saate ise välja vahetada. Flex on disainitud puuteekraaniga, nii et saate sellega töötada otse laboripingis või juhtida seda kogu laborist Opentronsi rakenduse või meie avatud lähtekoodiga API-de abil.
Flexi tööjaamadega on kaasas kõik seadmed – robot, riistvara ja laborivara –, mida vajate tavaliste laboritoimingute automatiseerimise alustamiseks. Muude rakenduste jaoks töötab Opentrons Flex täielikult avatud lähtekoodiga tarkvara ja püsivaraga ning on reaktiivi- ja laborivaraagnostiline, andes teile kontrolli selle üle, kuidas oma protokolle kujundate ja käitate.
Mis on Flexis uut?
Opentrons Flex on osa Opentronsi vedelikukäitlusseadmete seeriast. Opentrons Flexi kasutajad võivad olla tuttavad Opentrons OT-2, meie isikliku pipeteerimisrobotiga. Flex ületab mitmes võtmevaldkonnas OT-2 võimalusi, pakkudes suuremat läbilaskevõimet ja kasutusaega.
Funktsiooni pipeti läbilaskevõime
Pipettide ja otsikute maht
Kirjeldus
Flex-pipettidel on 1, 8 või 96 kanalit. 96-kanaliline pipett töötab korraga 12 korda rohkematel süvenditel kui suurim OT-2 pipett.
Flex-pipettidel on suuremad mahuvahemikud (1 µL, 50 µL) ja need võivad töötada mis tahes mahu Opentrons Flex otsikutega. See on täiustus võrreldes OT-5 pipettidega, mille vahemikud on väiksemad ja mis peavad kasutama sobiva mahuvahemikuga otsikuid.
OPENTRONS FLEX
11
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
Haarats Automaatne kalibreerimine Puuteekraan Moodulikorpused Teki pesa koordinaadid Teisaldatav prügikast Suurus ja kaal
Opentrons Flex Gripper korjab ja liigutab laboritarbeid tekil automaatselt, ilma kasutaja sekkumiseta. Haarats võimaldab ühe protokolli käigus keerukamaid töövooge.
Flex pipettide ja haaratsi asendi kalibreerimine on täielikult automatiseeritud. Vajutage ühte nuppu ja instrument liigub tekil täppistöödeldud punktidesse, et määrata selle täpne asukoht, salvestades need andmed teie protokollides kasutamiseks.
Flexil on oma puuteekraaniga liides, mis võimaldab seda lisaks Opentronsi rakenduse kasutamisele ka otse juhtida. Kasutage puuteekraani, et alustada protokolli käitamist, kontrollida töö olekut ja muuta seadeid otse robotis.
Flex-moodulid sobivad kastidesse, mis võtavad ruumi teki all. Caddies asetavad teie laborinõud teki pinnale lähemale ja võimaldavad teki all oleva kaabli suunamist. Caddid võimaldavad tekil veelgi rohkem moodulite ja laborivara konfiguratsioone.
Flexi tekipesad on nummerdatud koordinaatsüsteemiga (A1D4), mis on sarnane laborinõude kaevude nummerdamisega.
Prügikast võib Flexis minna mitmesse tekikohta. Vaikimisi asukoht (pesa A3) on soovitatav asukoht. Haaratrit saate kasutada ka prügi viskamiseks valikulisesse prügirenni.
Flex on natuke suurem ja palju raskem kui OT-2. Flexi paigaldustööde tegemiseks on vaja laboripartneri abi.
Roboti tehniliste spetsifikatsioonide üksikasjalik võrdlus on saadaval Opentronides websaidile.
Nii Flex kui ka OT-2 robotid töötavad meie avatud lähtekoodiga tarkvaraga ja Opentronsi rakendus saab juhtida mõlemat tüüpi roboteid korraga. Kuigi OT-2 protokolle ei saa Flexis otse käivitada, on neid lihtne kohandada (üksikasju vt protokolli arendamise peatüki jaotisest OT-2 protokollid).
Flexi tööjaamad
Opentrons Flexi tööjaamad sisaldavad Flexi robotit, tarvikuid, pipete ja haaratsit, tekil olevaid mooduleid ja laborivara, mida on vaja konkreetse rakenduse automatiseerimiseks. Kõik tööjaama komponendid on modulaarsed. Kui teil on vaja rakendusi muuta, saate lisada või vahetada muud Flexi riistvara ja ühilduvaid tarvikuid.
12
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
NGS TÖÖJAAM
Opentrons Flex NGS Workstation automatiseerib NGS-i raamatukogu ettevalmistamise. See võib automatiseerida eelsekveneerimise töövooge, kasutades mis tahes juhtivat reaktiivisüsteemi, sealhulgas killustamis- ja tagmentatsioonipõhine raamatukogu ettevalmistus.
Lisaks Flexi robotile sisaldab NGS Workstation:
Haarats Pipeti konfiguratsiooni valik
Kaks 8-kanalilist pipetti (1 µL ja 50 5 µL) 1000-kanaliline pipett (96 5 µL) jäätmerenni magnetploki temperatuurimooduli termotsükleri moodul Labware komplekt filtriotsikute, mikrotsentrifuugitorude, reservuaaride ja PCR plaadiga
PCR TÖÖJAAM
Opentrons Flex PCR tööjaam automatiseerib PCR seadistamise ja termotsükli töövooge kuni 96 sekundiksampvähem. See võib alikvootida jahutatud reaktiive ja samp96-süvendilisele PCR-plaadile. Automaatse Thermocycleri mooduli lisamisega kasutage haaratsit plaadi Thermocyclerisse laadimiseks ja seejärel käivitage valitud PCR-programm.
Lisaks Flexi robotile sisaldab PCR tööjaam:
Haarats Pipeti konfiguratsiooni valik
Ühe kanaliga pipeti (1 µL) ja 1 kanaliga pipetiga (50 µL) 8 kanaliga pipetiga (1 50 µL) jäätmerenni temperatuurimoodul Labware komplekt filtriotsikute, mikrotsentrifuugitorude, reservuaaride ja PCR-plaatidega
OPENTRONS FLEX
13
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
NULEIINHAPPE EKSTRAKTERIMISE TÖÖJAAM
Nukleiinhappe ekstraheerimise tööjaam Opentrons Flex automatiseerib DNA/RNA eraldamise ja puhastamise. See kasutab magnethelmeste eraldamiseks magnetplokki ja kuumutusloksutajat.ampmagnethelmeste lüüs ja resuspendeerimine.
Lisaks Flexi robotile sisaldab nukleiinhappe ekstraheerimise tööjaam:
Haarats Pipeti konfiguratsiooni valik
1-kanaliline pipett (5 µL) ja 1000-kanaliline pipett (8 µL) 5 kanaliga pipett (1000 µL) jäätmerenni magnetploki soojendaja-raputi moodul Labware komplekt filtriotsikute, reservuaaride ja sügavate PCR-plaatidega
MAGNETHELMESTE VALGIDE PUHASTAMISE TÖÖJAAM
Opentrons Flex Magnetic Bead valgu puhastamise tööjaam automatiseerib väikesemahulist valkude puhastamist ja proteoomikat.ample prep kuni 96 sampvähem. See ühildub paljude populaarsete magnethelmeste reaktiividega.
Lisaks Flexi robotile sisaldab Protein Purification Workstation:
Haarats Pipeti konfiguratsiooni valik
1-kanaliline pipett (5 µL) ja 1000-kanaliline pipett (8 µL) 5 kanaliga pipett (1000 µL) jäätmerenni magnetploki soojendaja-raputi moodul Labware komplekt filtriotsikute, reservuaaride ja sügavate PCR-plaatidega
FLEX PREP TÖÖJAAM
Opentrons Flex Prep Workstation automatiseerib lihtsaid pipeteerimise töövooge. Konfigureerige tööjaam 1- ja 8-kanaliliste pipetitega, et täita selliseid ülesandeid nagu sample ülekanne, sample dubleerimine ja
14
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
reaktiivi alikvootmine. Konfigureerige tööjaam 96-kanalilise pipetiga, et teostada suure läbilaskevõimega reaktiivi alikvootimist ja plaadi stamping.
Lisaks Flexi robotile sisaldab Flex Prep Workstation:
Pipeti konfiguratsiooni valik: 1-kanaliline pipett (5 µL) ja 1000 kanaliga pipett (8 µL) 5 kanaliga pipett (1000 µL)
Laborivarustuse komplekt filtriotsikute, mikrotsentrifuugitorude ja reservuaaridega
PLASMIIDIDE ETTEVALMISTAMISE TÖÖJAAM
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatiseerib magnethelmestel põhineva plasmiidi ekstraheerimise ja puhastamise töövooge. See tööjaam on varustatud suuremahuliste pipettide, kuumutus-raputi mooduli ja magnetplokiga, et mahutada enamikku helmestel põhinevat keemiat.
Lisaks Flexi robotile sisaldab Plasmid Prep Workstation:
Haarats ühe kanaliga pipeti (1 5 µL) ja 1000 kanaliga pipetiga (8 5 µL) jäätmerenni magnetplokiga soojendus-shakeri moodul Labware komplekt filtriotsikute, mikrotsentrifuugitorude, reservuaaride, PCR plaatide ja sügavate süvenditega plaatidega
SYNBIO TÖÖJAAM
Opentrons Flex SynBio Workstation automatiseerib mitmesuguseid sünteetilise bioloogia töövooge, nagu DNA süntees ja kloonimine. See kasutab magnetplokki ja temperatuurimoodulit, et toetada enamikku helmestel põhinevat keemiat. Lisage Thermocycler Module, et teostada kuumutatud kaanega inkubatsioone ja amplifikatsioonid.
Lisaks Flexi robotile sisaldab SynBio Workstation:
Ühe kanaliga pipeti (1 5 µL) ja 1000 kanaliga pipetiga (8 5 µL) magnetploki temperatuurimoodul
OPENTRONS FLEX
15
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
Laborikomplekt tavaliste ja filtriotsikute, mikrotsentrifuugitorude, reservuaaride, PCR-plaatide ja sügavate süvenditega plaatidega
1.2 Ohutusalane teave
Opentrons Flex vedeliku käitlemise robot on loodud ohutuks kasutamiseks. Flexi ohutu kasutamise tagamiseks vaadake selle jaotise spetsifikatsioone ja vastavusjuhiseid. Need juhised hõlmavad toote sisend- ja väljundühenduste, sealhulgas toite- ja andmeühenduste ohutut kasutamist, samuti Flexi roboti ja sellega seotud riistvara hoiatussilte. Seadme kasutamine muul viisil kui selles juhendis kirjeldatu võib seada ohtu kasutaja ja seadmed.
Ohutussümbolid
Erinevad sildid Flexil ja selles juhendis hoiatavad teid võimalike vigastuste või kahjustuste allikate eest.
Sümbol
Kirjeldus
Hoiatus: hoiatab kasutajaid potentsiaalselt ohtlike tingimuste eest. Toimingud, mis võivad põhjustada kehavigastusi või surma.
Ettevaatust: hoiatab kasutajaid seadme kahjustamise eest. Andmed on kadunud või rikutud. Teostatava operatsiooni taastumatu katkestus.
Elektrilöök: tuvastab instrumendi komponendid, mis võivad seadme ebaõige käsitsemise korral põhjustada elektrilöögi ohtu.
Kuum pind: tuvastab instrumendi komponendid, mis kujutavad endast kõrge kuumuse/temperatuuri tõttu kehavigastuse ohtu, kui instrumenti käsitsetakse valesti.
Pinch point: identifitseerib instrumendi komponendid, mis võivad liikumisel põhjustada kehavigastusi.
16
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
Flexilt leiate järgmised sildid:
Intellektuaalomandi märgised Regulatiivsetele nõuetele vastavuse märgised (nt ETL) Elektriohu märgised Üldised hoiatussildid Tootesildid Haardepunktide sildid Kõrge volüümtage sildid Võimsussildid
Elektriohutuse hoiatused
Järgige alati järgmisi elektriohutuse hoiatusi:
Sümbol
Kirjeldus
Ühendage robot maandatud 1. klassi vooluringiga. Vaadake jaotist Toiteühendus peatükis Süsteemi kirjeldus.
Ärge ühendage (ühendage), ühendage lahti (lahutage) ega kasutage vahelduvvoolu toitekaableid, kui: Kaabel on kulunud või kahjustatud. Teised ühendatud kaablid, juhtmed või pistikupesad on kulunud või kahjustatud.
Kahjustatud toitejuhtmete kasutamine võib põhjustada elektrilöögiohu, mille tulemuseks on tõsine vigastus või roboti kahjustamine.
Ärge vahetage vahelduvvoolu toitekaablit välja arvatud Opentronsi toe juhiste kohaselt.
Lisateavet elektrinõuete kohta leiate peatüki Paigaldamine ja ümberpaigutamine jaotisest Energiatarve.
OPENTRONS FLEX
17
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
Täiendavad ohutushoiatused
Järgige alati järgmisi täiendavaid ohutusalaseid hoiatusi:
Sümbol
Kirjeldus
Opentrons Flex ei ole sertifitseeritud kasutamiseks plahvatusohtlike või tuleohtlike vedelikega. Ärge laadige robotisse plahvatusohtlikke või tuleohtlikke vedelikke sisaldavaid plaate, torusid ega viaale ega kasutage seadet muul viisil, kui korpuses on plahvatusohtlikke või tuleohtlikke vedelikke.
Kasutage kemikaalidega töötamisel häid laboritavasid ja järgige tootja ettevaatusabinõusid. Opentrons ei vastuta ohtlike kemikaalide kasutamisest või sellest tulenevate kahjude eest.
Flex kaalub 88.5 kg (195 naela). Seetõttu on selle ohutuks tõstmiseks ja teisaldamiseks vaja kahte inimest. Vaadake jaotist Ümberpaigutamine peatükis Paigaldamine ja ümberpaigutamine.
Flex tuleks asetada pinnale, mis suudab taluda selle 88.5 kg (195 naela) raskust ja millel on piisav pindala roboti mahutamiseks pluss selle minimaalne vahekaugus (20 cm/8 tolli). Vaadake jaotist Ohutus- ja kasutusnõuded peatükis Paigaldamine ja ümberpaigutamine.
Flex võib töötamise ajal tekitada vibratsiooni. Asetage robot tugevale, tasasele ja veekindlale risttugede või keevisliidetega pinnale. Vaadake jaotist Ohutus- ja kasutusnõuded peatükis Paigaldamine ja ümberpaigutamine.
Ohutusnõuded
Flexi kahjustuste eest kaitsmiseks järgige neid ettevaatusabinõusid.
18
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
Sümbol
Kirjeldus
Kasutage laborivara, mis on ANSI/SLAS-ühilduv või Opentronsi poolt heaks kiidetud. Vaadake peatükki Labware.
Hoidke söövitavad materjalid, ained või muul viisil kahjustavad materjalid robotist eemal.
Bioloogiline ohutus
Käsitlege inimestelt võetud materjale sisaldavaid proove ja reaktiive potentsiaalselt nakkusetekitajatena. Opentrons soovitab kasutada ohutuid laboriprotseduure, nagu on selgitatud väljaandes Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6. väljaanne.
Tavaolukorras ei tekita Flex lähtevedelikest tuvastatavaid aerosoole. Siiski on teatud tingimustel võimalik tekitada lähtevedelikest aerosoole. Kui töötate bioohutuse taseme 2 või kõrgema allikaga vedelikega, võtke vastavalt kohalikele reguleerivatele asutustele ettevaatusabinõusid aerosooliga kokkupuute vältimiseks. Roboti aerosooliga kokkupuute võimaliku ohu minimeerimiseks veenduge, et:
Tehke hooldust, nagu on kirjeldatud peatükis Hooldus ja teenindus. Paigaldage ja kinnitage korralikult kõik instrumendi kaaned, pipetid, moodulid ja laborinõud. Kasutage aerosoolide vähendamiseks õiget pipeteerimistehnikat.
Mürgised aurud
Kui töötate lenduvate lahustite või mürgiste ainetega, kasutage võimalike aurude eemaldamiseks tõhusat laboriventilatsioonisüsteemi.
Tuleohtlikud vedelikud
Flexi ei ole hinnatud tuleohtlike vedelikega kasutamiseks ja seda ei tohiks kasutada koos tuleohtlike vedelikega.
OPENTRONS FLEX
19
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
1.3 Vastavus eeskirjadele
Opentrons Flex vastab kõikidele järgmiste ohutus- ja elektromagnetiliste standardite kohaldatavatele nõuetele.
Ohutus
Reegli ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Pealkiri
Ohutusnõuded mõõte-, juhtimis- ja laboriseadmete elektriseadmetele, 1. osa: üldnõuded
Erinõuded segamise ja segamise laboriseadmetele
Elektromagnetiline ühilduvus
Reegel ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR osa 15 B-alajao A-klassi IC ICES-003
Pealkiri
Mõõtmis-, juhtimis- ja laboriseadmete elektriseadmed EMC-nõuded 1. osa: Üldnõuded Tahtmatud radiaatorid
Spektrihaldus ja telekommunikatsiooni häireid põhjustavad seadmed Standardsed infotehnoloogiaseadmed (sh digitaalseadmed)
FCC hoiatused ja märkused
Hoiatus: selle seadme muudatused või modifikatsioonid, mida Opentrons pole sõnaselgelt heaks kiitnud, võivad tühistada kasutaja volitused seadet kasutada.
See seade vastab FCC reeglite 15. osale. Operatsioon sõltub järgmistest tingimustest:
20
OPENTRONS FLEX
1. PEATÜKK: SISSEJUHATUS
See seade ei tohi põhjustada kahjulikke häireid. See seade peab vastu võtma kõik vastuvõetud häired, sealhulgas häired, mis võivad põhjustada soovimatuid
operatsiooni.
Märkus. Seda seadet on testitud ja leitud, et see vastab FCC reeglite 15. osale A-klassi digitaalseadmetele kehtestatud piirangutele. Need piirangud on loodud pakkuma mõistlikku kaitset kahjulike häirete eest, kui seadet kasutatakse ärikeskkonnas. See seade genereerib, kasutab ja võib kiirata raadiosageduslikku energiat ning kui seda ei paigaldata ega kasutata vastavalt kasutusjuhendile, võib see põhjustada raadiosides kahjulikke häireid. Selle seadme kasutamine elamurajoonis põhjustab tõenäoliselt kahjulikke häireid, mille puhul kasutaja peab häired oma kulul kõrvaldama.
Kanada ISED vastavus
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
See toode vastab kehtivatele Kanada innovatsiooni, teaduse ja majandusarengu tehnilistele spetsifikatsioonidele.
Le present produit est conforme aux pécifications techniques d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Keskkonnahoiatus
Hoiatus: vähk ja reproduktiivkahjustus www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi eelsertifikaat
Wi-Fi-moodul on sertifitseeritud kasutamiseks paljudes piirkondades:
Ameerika Ühendriigid (FCC): FCC identifikaator UAY-W8997-M1216 Euroopa Majanduspiirkond (CE): avalik identifikaator puudub (enesedeklaratsioon) Kanada (IC): riistvara versiooni identifitseerimisnumber W8997-M1216 Jaapan (TELEC): sertifitseeritud number 020-170034 India (WPC): registreerimisnumber ETA-SD-20191005525 (enesedeklaratsioon)
OPENTRONS FLEX
21
2. PEATÜKK
Paigaldamine ja ümberpaigutamine
Selles peatükis kirjeldatakse, kuidas oma laborit Opentrons Flexi jaoks ette valmistada, kuidas robotit seadistada ja kuidas seda vajadusel liigutada. Enne Flexi kohaletoimetamist veenduge, et teie labor või rajatis vastab kõigile jaotise Ohutus- ja kasutusnõuded kriteeriumidele. Kui on aeg oma Flex tööle panna, järgige üksikasjalikke juhiseid jaotistes Lahtipakkimine, Esimene käitamine ja Seadme paigaldamine ja kalibreerimine või kasutage Opentronsi kohapealse toe seadistamise teenust. Ja kui teil on kunagi vaja oma Flex lähedale või kaugele uude asukohta teisaldada, järgige jaotises Ümberpaigutamine toodud juhiseid.
2.1 Ohutus- ja töönõuded
Kuhu Opentrons Flex paigutada
Ruum on peaaegu igas laboris väärtuslik kaup. Teie Flex vajab natuke, kuid mitte liiga palju, kuna see on loodud mahtuma poolele tavalisest laboripingist. Veenduge, et teil oleks ruum, mis vastab järgmistele kriteeriumidele.
Pingi pind: Statsionaarne, vastupidav, tasane, veekindel pind. Ratastega (isegi lukustatavate ratastega) laudu või pinke ei soovitata kasutada. Flex liigub kiiresti ja sellel on palju massi, mis võib kergeid või teisaldatavaid laudu raputada või tasakaalustada.
Kandevõime: robot üksi kaalub 88.5 kg (195 naela) ja seda tohivad tõsta ainult kaks koos töötavat inimest. Asetage robot pinnale, mis talub hõlpsalt selle raskust, millele lisandub teie rakendustes kasutatavate moodulite, laborinõude, vedelike või muude laboriseadmete kaal.
Tööruum: roboti aluse mõõtmed on 87 cm L x 69 cm D x 84 cm K (umbes 34" x 27" x 33"). Flex vajab 20 cm (8″) vaba ruumi küljelt ja tagaküljelt kaablite, USB-ühenduste jaoks ning kütvate ja jahutavate moodulite heitgaaside hajutamiseks.
Hoiatus: Ärge asetage Flexi külgi ega tagakülgi vastu seina.
22
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
84 cm 33"
87 cm 34"
Opentrons Flex aluse mõõdud.
69 cm 27"
20 cm 8"
20 cm 8"
20 cm 8"
Üles view Opentrons Flex, mis näitab minimaalset külg- ja tagakliirensit.
OPENTRONS FLEX
23
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Energiatarve
Opentrons Flex tuleb ühendada seinakontakti pingi asukohas või selle lähedal, kuhu te selle paigaldate. Ühendage Flex ainult selliste vooluringidega, mis mahutavad selle maksimaalset võimsust:
Sisendvõimsus: 36 VDC, 6.1 A Tühikäigutarbimine: 30 W Tüüpiline tarbimine: 40 W (protokolli töötamise ajal) Maksimaalne tarbimine: umbes 50 W
Täpne energiatarve sõltub:
Protokolli ajal sooritatud liikumise maht ja tüüp. Aeg, mille robot jõude veedab. Roboti tulede olek. Mitu instrumenti on kinnitatud.
Ärge unustage arvestada muu elektroonikaga, mis tarbivad energiat samas vooluringis, sealhulgas Flexi moodulid koos oma toiteallikaga. NäiteksampLe, Thermocycler Module'i maksimaalne energiatarve (630 W) on palju suurem kui Flex robotil endal. Vajadusel konsulteerige oma rajatise juhatajaga, et veenduda, et see vastab teie seadme võimsusnõuetele.
Keskkonnatingimused
Soovitatava kasutuse, vastuvõetava kasutuse ja ladustamise keskkonnatingimused on erinevad:
Soovitatav süsteemi tööks
Süsteemi tööks vastuvõetav
Ümbritseva õhu temperatuur +20 kuni +25 °C
+2 kuni +40 °C
Suhteline õhuniiskus Kõrgus
40%, mittekondenseeruv
Umbes 500 m kõrgusel merepinnast
30%, mittekondenseeruv (alla 80 °C)
Kuni 2000 m üle merepinna
Ladustamine ja transport
-10 kuni +60 °C
10%, mittekondenseeruv (alla 85 °C)
Kuni 2000 m üle merepinna
24
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Opentrons on valideerinud Opentrons Flexi toimimise süsteemi tööks soovitatud tingimustes ja nendes tingimustes töötamine peaks andma optimaalseid tulemusi. Flexi kasutamine on süsteemi tööks vastuvõetavates tingimustes ohutu, kuid tulemused võivad erineda. Ärge lülitage Flexi sisse ega kasutage nendest piiridest väljaspool asuvates tingimustes. Ladustamise ja transpordi tingimused kehtivad ainult siis, kui robot on täielikult vooluvõrgust ja muudest seadmetest lahti ühendatud.
2.2 Karbist lahtivõtmine
Palju õnne! Teie Opentrons Flex on saabunud ja olete selle jaoks oma laboris ruumi ette valmistanud. Avame selle koletise kasti, eemaldame roboti ja valmistame selle tööks ette. Selles jaotises olev teave sisaldab osade loendit ja juhiseid, mis juhendavad teid Flexi karbist lahtivõtmiseks, seadistamiseks ja kasutusvalmis saamiseks vajalike toimingutega. Oleme jaganud seadistusprotseduuri kolmeks osaks:
1. osa hõlmab kasti lahtivõtmist. Osa 2 hõlmab Flexi eemaldamist kastist ja selle viimist lõplikku kokkupanekukohta. Osa 3 hõlmab lõplikku kokkupanekut ja roboti esmakordset sisselülitamist.
Nõutav pingutus ja aeg
Võite paluda laboripartneril abi karbist lahtivõtmisel, tõstmisel, teisaldamisel ja kokkupanekul. Selle pingutuse jaoks peate kulutama umbes 30 minutit kuni tund.
Märkus. Flexi õigeks tõstmiseks on vaja kahte inimest. Samuti on Flexi tõstmine ja kandmine selle käepidemetest parim viis roboti liigutamiseks.
Kast ja pakkematerjal
Flexi lahtipakkimine annab teile suurepärase roboti, kuid teile jääb ka mitu suurt kastipaneeli koos erinevate transpordikomponentide ja polsterdustega. Kuigi võite selle materjali ära visata, soovitame teil need esemed alles jätta, kui hoiuruumi on saadaval. Pakend on korduvkasutatav, mis aitab teie Flexi tarnimiseks ette valmistada, kui peate selle tulevikus mujale saatma (nt konverentsile või uude kohta).
OPENTRONS FLEX
25
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Toote elemendid
Flex tarnitakse koos allpool loetletud komponentidega. Pipetid, haarats ja moodulid on Flexi põhikastist eraldi pakendis, isegi kui ostsite need koos tööjaamana.
(1) Opentrons Flex robot
(1) USB-kaabel
(1) Toitekaabel
(1) Ethernet-kaabel
(5) L-võtmed (12 mm kuuskant, 1.5 mm kuuskant, 2.5 mm kuuskant, 3 mm kuuskant,
T10 Torx)
(1) Hädaseiskamise ripats
(1) Laborinõude klambritega tekipesa
(4) Varulaborinõude klambrid
(1) Pipeti kalibreerimissond
(4) Kandesangad ja -korgid
(1) Ülemine aknapaneel
(4) Külgakende paneelid
(1) 2.5 mm kuuskantkruvikeeraja
(1) 19 mm mutrivõti
(16+ varuosad) Aknakruvid (M4x8 mm lamepea)
26
(10) Varuteki pilu kruvid (M4x10 mm pesapea)
(12) Varuteki klambrikruvid (M3x6 mm pesapea)
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
1. osa: eemaldage kast
Opentrons tarnib teie Flexi tugevas vineerkastis. Saatekastis kasutatakse konksu ja riivi clamps ülemise, külgmise ja alumise paneeli kokku kinnitamiseks. Riivide kasutamine naelte või kruvide asemel tähendab, et te ei vaja kasti lahtivõtmiseks raudkangi (või palju jõudu) ja saate selle hiljem vajadusel uuesti kokku panna.
Märkus. Kasti servad võivad tarnimise ajal karedaks muutuda. Võite kasutada töökindaid, et kaitsta oma käsi puidukildude eest.
Riivide vabastamiseks keerake riivi sakk üles ja keerake seda vasakule (vastupäeva). See toiming liigutab clamp õla vastavast kinnitusklambrist välja. Seejärel saate riivi kastist eemale pöörata.
1 Avage kaheksa riivi, mis hoiavad ülaosa külgedel.
2 Pärast riivide vabastamist eemaldage ülemine paneel.
OPENTRONS FLEX
27
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜMBERPAIGUTAMINE 3 Lõigake sinine saatekott lahti, eemaldage need esemed polstrist ja asetage kõrvale:
Kasutajakomplekti toite-, Etherneti- ja USB-kaablid Hädaseiskamisripats
4 Eemaldage ülemine vahtpolster, et aknapaneelid paljastada. Polsterdus kaitseb külg- ja ülemist paneele.
5 Eemaldage aknapaneelid ja asetage need kõrvale. Lisate need hiljem.
28
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
6 Avage ülejäänud 16 riivi, mis hoiavad külgpaneele üksteise ja kasti aluse küljes. 7 Eemaldage külgpaneelid ja asetage need kõrvale.
2. osa: vabastage Flex
Pärast 1. osas kirjeldatud toimingute sooritamist peaksite nüüd nägema robotit, mis on kaitsekotis ja on kinnitatud oranžide terasest kinnitusdetailide külge. Kott ümbritseb robotit ja kaitseb seda väliskeskkonna eest. Terasklambrid kinnitavad roboti kasti põhja külge. Kaks transpordiraami toetavad robotit, jaotades selle raskuse ühtlaselt ja hoides seda jäigana, et see transportimise ajal ei kõverduks. Jätkake Flexi lahtipakkimist ja eemaldage see kasti aluselt.
8 Kasutades kasutajakomplekti kuuluvat 19 mm mutrivõtit, keerake kasti põhja kronsteinid lahti. Saate sulgudest loobuda või salvestada need edaspidiseks kasutamiseks.
OPENTRONS FLEX
29
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜMBERASUTAMINE 9 Tõmmake või rullige paki kott lõpuni alla, et paljastada kogu robot.
10. Võtke oma laboripartneri abiga kinni roboti aluse mõlemal küljel asuvatest oranžidest transpordiraamidest käepidemed, tõstke Flex kasti aluselt ja asetage see põrandale. Salvestage või visake ära kasti alus ja tarneraam.
30
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜMBERASUTAMINE 11 Kasutades kasutajakomplekti kuuluvat 12 mm kuuskantvõtit, eemaldage neli polti, mis hoiavad transpordiraame
Flex. Salvestage või visake ära raamid ja poldid.
12 Eemaldage kasutajakomplektist neli alumiiniumist käepidet. Kruvige käepidemed samadesse kohtadesse, kus hoidsid 12 mm tarneraami polte.
OPENTRONS FLEX
31
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
13 Tõstke Flex oma laboripartneri abiga selle kandesäepidemetest üles ja viige see lõplikuks kokkupanekuks töölauale.
Osa 3: Lõplik kokkupanek ja sisselülitamine
Pärast Flexi ajutisse tööpiirkonda või selle alalisse koju viimist on aeg oma uuele robotile viimane lihv anda.
14 Kui olete viinud roboti lõplikku töökohta, eemaldage kandesangad ja asendage need viimistluskorkidega. Korgid sulgevad käepideme avad raamis ja annavad robotile puhta välimuse. Pange käepidemed ladustamiseks tagasi kasutajakomplekti.
32
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
15 Võtke ülemine ja külgpaneelid pakkevahust välja, mille olete pärast kasti ülaosa eemaldamist kõrvale pannud.
16 Paigaldage aknapaneelid Flexi külge, järgides eesmise kaitsekilega märgistusteavet. Seejärel eemaldage kaitsekile.
17 Kasutades kaldakna kruvisid ja 2.5 mm kruvikeerajat kasutajakomplektist, kinnitage aknapaneelid Flexi külge. Veenduge, et kaldsed (V-kujulised) avad aknapaneelides oleksid väljapoole (teie poole). See võimaldab kruvidel sobituda akna pinnaga tasa.
Hoiatus: paneelide vale suunamine võib põhjustada kahjustusi. Kruvi liigne pöördemoment võib paneelid pragundada. Pingutage kruvisid käsitsi, kuni aknapaneelid on piisavalt kinnitatud. See ei ole jõuproov.
OPENTRONS FLEX
33
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA Ümberpaigutamine 18 Kasutades kasutajakomplekti kuuluvat 2.5 mm kruvikeerajat, eemaldage portaali lukustuskruvid. Need
kruvid takistavad portaali liikumist transpordi ajal. Portaali lukustuskruvid asuvad: Vasakpoolsel siinil roboti esiosa lähedal. Vertikaalse portaali käe all. Paremal külgsiinil roboti esiosa lähedal oranžis kronsteinis. Siin on kaks kruvi.
Pukk liigub pärast kõigi transpordikruvide eemaldamist hõlpsalt käsitsi. 19 Lõigake ja eemaldage kaks kummiriba, mis hoiavad prügikasti transpordi ajal paigal.
34
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
20 Ühendage toitejuhe Flexiga ja ühendage see seinakontakti. Veenduge, et tekialal ei oleks takistusi. Pöörake roboti taga vasakul asuvat toitelülitit. Pärast sisselülitamist liigub portaal oma kodukohta ja puuteekraanil kuvatakse täiendavad seadistusjuhised.
Nüüd, kui teie Flex on karbist väljas ja kasutamiseks valmis, jätkake alloleva jaotisega Esimene käitamine.
2.3 Esimene jooks
Enne Flexiga muu riistvara ühendamist tehke puuteekraanil põhiseadistus. Robot juhendab teid laborivõrguga ühenduse loomisel, uusimale tarkvarale värskendamisel ja Flexi isikupärastamisel, andes sellele nime.
Toide sisse
Kui lülitate Flexi sisse, ilmub puuteekraanile Opentronsi logo. Mõne hetke pärast kuvatakse ekraanil "Tere tulemast teie Opentrons Flexi".
Opentrons Flexi tervituskuva. Seda ekraani peaksite nägema ainult Flexi esmakordsel käivitamisel.
OPENTRONS FLEX
35
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Ühendage võrgu või arvutiga
Roboti ühendamiseks järgige puuteekraanil kuvatavaid juhiseid, et see saaks tarkvaravärskendusi kontrollida ja protokolle vastu võtta files. Ühendusmeetodeid on kolm: Wi-Fi, Ethernet ja USB.
Võrguühenduse valikud. Flexi seadistamiseks peab teil olema Interneti-ühendus. Wi-Fi: kasutage puuteekraani ühenduse loomiseks Wi-Fi võrkudega, mis on kaitstud WPA2 isikliku autentimisega (enamik võrke, mis nõuavad liitumiseks ainult parooli, kuuluvad sellesse kategooriasse).
Märkus. Flex ei toeta suletud portaale (võrgud, millel pole parooli, kuid mis laadivad a webleht kasutajate autentimiseks pärast ühenduse loomist).
Saate ühenduse luua ka avatud Wi-Fi võrguga, kuid see pole soovitatav.
Hoiatus: avatud Wi-Fi võrguga ühenduse loomine võimaldab kõigil võrgusignaali levialas olevatel inimestel teie Opentrons Flexi robotit ilma autentimiseta juhtida.
Kui teil on vaja luua ühendus WiFi-võrguga, mis kasutab ettevõtte autentimist (sealhulgas eduroam ja sarnased akadeemilised võrgud, mis nõuavad kasutajanime ja parooli), looge esmase seadistuse lõpuleviimiseks esmalt ühendus Opentronsi rakendusega Etherneti või USB kaudu. Seejärel looge Flexi võrguseadetes ühendus ettevõtte Wi-Fi võrguga. Võrguseadetele juurdepääsemiseks tehke järgmist.
36
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
1. Klõpsake rakenduse Opentrons vasakpoolsel külgribal valikul Seadmed. 2. Klõpsake oma Flexi kolme punktiga menüüd () ja valige Roboti sätted. 3. Klõpsake vahekaarti Networking.
Valige rippmenüüst oma võrk või valige „Liitu teise võrguga…” ja sisestage selle SSID. Valige ettevõtte autentimismeetod, mida teie võrk kasutab. Toetatud meetodid on järgmised:
EAP-TTLS koos TLS-iga EAP-TTLS koos MS-CHAP v2-ga EAP-TTLS koos MD5-ga EAP-PEAP koos MS-CHAP v2 EAP-TLS-iga
Kõik need meetodid nõuavad kasutajanime ja parooli ning olenevalt teie täpsest võrgukonfiguratsioonist võidakse nõuda sertifikaati files või muid valikuid. Võrgu seadistamise üksikasjade saamiseks vaadake oma asutuse IT-dokumentatsiooni või võtke ühendust IT-juhiga.
Ethernet: ühendage oma robot Etherneti kaabli abil võrgulüliti või jaoturiga. Saate ühendada ka otse arvuti Etherneti porti, alustades robotsüsteemi versioonist 7.1.0.
USB: ühendage kaasasolev USB A-B kaabel roboti USB-B porti ja arvuti avatud porti. Kasutage USB B-C-kaablit või USB-A-C-adapterit, kui teie arvutil pole USB-A-porti.
Seadistamise jätkamiseks peab ühendatud arvutis olema installitud ja töötav rakendus Opentrons. Lisateavet Opentronsi rakenduse installimise kohta leiate peatüki Tarkvara ja kasutamine jaotisest Rakenduse installimine.
Installige tarkvaravärskendused
Nüüd, kui olete võrgu või arvutiga ühenduse loonud, saab robot otsida tarkvara ja püsivara värskendusi ning neid vajadusel alla laadida. Kui värskendus on olemas, võib selle installimine võtta paar minutit. Kui värskendamine on lõppenud, käivitub robot uuesti.
OPENTRONS FLEX
37
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Kinnitage hädaseiskamise ripats
Ühendage kaasasolev hädaseiskamisripats (E-stop) roboti tagaküljel asuva lisapordiga (AUX-1 või AUX-2).
Enne ja pärast hädaseiskamisripatsi ühendamist.
E-stopi kinnitamine ja lubamine on kohustuslik instrumentide kinnitamiseks ja Flexi protokollide käitamiseks. Lisateavet E-stopi kasutamise kohta roboti töötamise ajal leiate peatüki Süsteemi kirjeldus jaotisest Hädaseiskamise ripats.
Andke oma robotile nimi
Roboti nime andmine võimaldab teil seda oma laborikeskkonnas hõlpsalt tuvastada. Kui teie võrgus on mitu Opentroni robotit, pange neile kindlasti kordumatud nimed. Kui olete oma roboti nime kinnitanud, suunatakse teid Opentrons Flexi armatuurlauale. Tõenäoliselt on järgmine samm, mida soovite teha, instrumentide kinnitamine, mida käsitletakse järgmises jaotises.
2.4 Seadme paigaldamine ja kalibreerimine
Pärast esialgset roboti seadistamist on järgmiseks sammuks instrumentide kinnitamine robotile ja nende kalibreerimine.
Instrumendi installimiseks puudutage esmalt puuteekraanil valikut Instrumendid või minge Opentronsi rakenduses seadme üksikasjade ekraani jaotisesse Pipetid ja moodulid. Valige tühi kinnitus ja valige kas Attach Pipette või Attach Gripper. Kui alus, mida soovite kasutada, on juba hõivatud, peate esmalt eemaldama pipeti või haaratsi.
38
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Märkus. Üldine installiprotsess on sama sõltumata sellest, kas kasutate puuteekraani või rakendust Opentrons. Ükskõik, millise seadmega alustate, juhib installiprotsessi kuni selle lõpuleviimiseni või tühistamiseni.
Kui alustate puuteekraanilt, näitab rakendus, et robot on hõivatud. Kui alustate rakendusest, kuvatakse puuteekraanil modaal, mis näitab, et instrumendi installimine on pooleli.
Täpne paigaldusprotsess erineb olenevalt ühendatavast instrumendist, nagu on kirjeldatud allolevates jaotistes. Kõikidel instrumentidel on automaatne kalibreerimisprotseduur, mille peaksite tegema kohe pärast paigaldamist.
Pipeti paigaldamine
Pipeti paigaldamisel juhendatakse teid puuteekraanil või rakenduses Opentrons järgmiste sammudega.
1. VALI PIPETI TÜÜP Valige 1- või 8-kanalilise pipeti ja 96-kanalilise pipeti vahel. 96-kanalilise pipeti kinnitamine nõuab mõningaid täiendavaid samme, kuna see kinnitub spetsiaalse kinnitusplaadi külge, mis ulatub mõlema pipeti kinnituse külge.
2. ETTEVALMISTAMINE PAIGALDAMISEKS Eemaldage laborinõud tekilt ja puhastage tööala, et hõlbustada kinnitamist ja kalibreerimist. Koguge kokku ka vajalikud seadmed, nagu kalibreerimissond, kuuskantkruvikeeraja ja kinnitusplaat (96-kanalilise pipeti jaoks).
3. ÜHENDAGE JA KINNITAGE PIPETI Pukk liigub roboti ette, et saaksite pipeti kinnitada.
1- ja 8-kanalilised pipetid ühendatakse otse pipetikinnitusega. 96 kanaliga pipeti jaoks on vaja kinnitusplaati. Paigaldusplaadi kinnitamiseks peate esmalt lahti ühendama õige pipeti kinnituse z-telje kelgu.
OPENTRONS FLEX
39
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Ühendage pipett valitud pipeti kinnitusega ja kinnitage selle kruvid.
4. KÄIVITAGE AUTOMAATNE KALIBREERIMINE Pipeti kalibreerimiseks kinnitage kalibreerimissond vastava pipetiotsiku külge. Pipett liigub automaatselt, et puudutada teki teatud punkte ja salvestada need kalibreerimisväärtused edaspidiseks kasutamiseks. Kui kalibreerimine on lõppenud ja olete sondi eemaldanud, on pipett protokollides kasutamiseks valmis.
Haaratsi paigaldus
Haaratsi paigaldamisel juhendatakse teid puuteekraanil või rakenduses Opentrons järgmiste sammude kaudu.
1. ETTEVALMISTAMINE PAIGALDAMISEKS Eemaldage laborinõud tekilt ja puhastage tööala, et hõlbustada kinnitamist ja kalibreerimist. Koguge kokku ka vajalik kuuskantkruvikeeraja ja veenduge, et kalibreerimistihvt oleks haaratsi hoiukohas.
2. ÜHENDAGE JA KINNITAGE HAARIDUS Pukk liigub roboti ette, et saaksite haaratsi kinnitada. Ühendage haarats pikenduskinnitusega ja kinnitage selle kruvid.
3. KÄITA AUTOMAATNE KALIBREERIMINE Haarde kalibreerimiseks sisestage kalibreerimistihvt eesmisse lõualuu. Haarats liigub automaatselt, et puudutada teki teatud punkte ja salvestada need kalibreerimisväärtused edaspidiseks kasutamiseks. Seejärel korrake sama protsessi tagalõualuu kalibreerimistihvtiga. Kui kalibreerimine on lõppenud ja olete tihvti hoiukohta tagasi pannud, on haarats protokollides kasutamiseks valmis.
2.5 Ümberpaigutamine
See jaotis annab nõuandeid ja juhiseid Opentrons Flexi roboti liigutamiseks lühikeste ja pikkade vahemaade tagant.
40
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Lühikesed käigud
Lühike liigutamine hõlmab erinevaid vahemaid, alates "liigutame seda natuke" kuni üle labori, koridori või mõne teise korruse teie hoones. Sellistel juhtudel saate oma Flexi käsitsi liigutada. Hea võimalus on ka seda käsikärus transportida.
Hoiatus: Flex kaalub 88.5 kg. Seetõttu on selle ohutuks tõstmiseks ja teisaldamiseks vaja kahte inimest.
Flexi uude lähedalasuvasse kohta teisaldamiseks kinnitage uuesti tõstuki käepidemed. Flexi tõstmine ja kandmine käepidemetest on õige viis roboti liigutamiseks lühikesi vahemaid. Eemaldage käepidemed ja hoidke need pärast teisaldamist kasutajakomplektis. Roboti kahjustamise vältimiseks kasutage selle tõstmiseks ja teisaldamiseks alati tõstekangi. Ärge haarake roboti tõstmiseks või liigutamiseks raamist kinni.
Kaugkäigud
Pikamaa kolimine viib teie Flexi teie ülikooli, rajatise või asutuse territooriumilt välja. Üle linna, uude linna, osariiki, provintsi või riiki on kõik endisedamples pikamaa kolimisest. Sel juhul peate Flexi pakkima, et kaitsta seda transpordi ajal tekkida võivate elementide, põrutuste ja konarlike liikumiste eest.
Kui olete Flexiga kaasas olnud tarnekasti ja sisemised toed alles jätnud, saate selle pikamaa kolimiseks nendesse materjalidesse ümber pakkida. Järgige lahtipakkimise samme vastupidises järjekorras, et valmistada Flex ette pikamaa liikumiseks. Põhimõtteliselt peaksite:
Ühendage lahti toite- ja võrgukaabel, kui need on ühendatud. Eemaldage kogu ühendatud riist- ja laborivara. Kinnitage tekiplaadid uuesti. Lukustage portaal (vt allpool jaotist Üldised kolimisnõuanded). Eemaldage ja hoidke aknapaneelid.
Kui säilitasite originaalkasti:
Kinnitage transpordiraam uuesti Flexi külge ja kinnitage see L-klambrite abil kaubaaluse aluse külge. Lisage polster ja pange saatekast uuesti kokku.
OPENTRONS FLEX
41
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Kui teil pole originaalkasti ja sellega seotud materjali, võtke ühendust maineka laevandusettevõttega. Nad saavad teie eest pakkimis-, transpordi- ja kohaletoimetamisprotsessi hallata.
Üldised kolimisnõuanded
TOITE- JA VÕRGUKAABELITE ÜHENDAMINE Enne Flexi teisaldamist ärge unustage järgmist: Lülitage toide välja ja eemaldage see vooluvõrgust. Ühendage lahti Etherneti- või USB-kaabel, kui seda kasutatakse.
LUKUSTAGE PULK Enne Flexi teisaldamist sisestage portaali paigal hoidmiseks uuesti lukustuskruvid. Portaali lukustuspunktid asuvad: Vasakpoolsel külgsiinil roboti esiosa lähedal. Vertikaalse portaali käe all. Paremal külgsiinil roboti esiosa lähedal. Selle portaali osa lukustamiseks on vaja väikest
oranž kronstein ja kaks lukustuskruvi.
42
OPENTRONS FLEX
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
AVALEHT PUKKUL Kui liigutate robotit ainult lähedalasuvasse kohta, ei pruugi te soovida portaali lukustada. Kui otsustate seda mitte lukustada, kasutage vähemalt puuteekraani või rakendust Opentrons, et saata portaal enne selle väljalülitamist algasendisse. Portaali avamiseks puuteekraani kaudu puudutage kolme punktiga menüüd () ja seejärel puudutage Kodupukk. Portaali avamine Opentronsi rakenduse kaudu: klõpsake nuppu Seadmed. Klõpsake seadmete loendis oma Flexi. Klõpsake kolme punktiga menüüd () ja seejärel nuppu Kodupukk.
EEMALDA MOODULID Tekisisesed moodulid ja muud lisaseadmed lisavad teie Flexile lisaraskust. Need mõjutavad ka roboti raskuskeset, mis võib tekitada selle tõstmisel “kallutamise”. Roboti kergendamiseks ja tasakaalustamiseks eemaldage enne selle ülesvõtmist kõik ühendatud instrumendid ja laborinõud.
TEKI PISUDE TAASPAIGALDAMINE Pikamaa liikumiseks soovitame teki pesad uuesti kinnitada. Pesade kinnitamine nende algsesse asukohta aitab vältida juhuslikku kadumist. Teki pesade uuesti kinnitamine laboris lühikeste liikumiste jaoks on vabatahtlik.
LIIKUMISEJÄRGNE REKALIBRERIMINE Peaksite kõik instrumendid ja moodulid pärast uuesti paigaldamist uuesti kalibreerima. Lisateavet mooduli kalibreerimise kohta leiate peatükist Moodulid.
OPENTRONS FLEX
43
2. PEATÜKK: PAIGALDAMINE JA ÜLEMINE
Viimased mõtted kolimisest
Teie Flex on vastupidav ja hästi ehitatud masin, kuid see on ka täpne teadusinstrument, mis on loodud rangete tolerantside jaoks. Seetõttu peaksite seda oma kohalikus tööpiirkonnas ümber paigutades või üle riigi saatmisel suhtuma sellesse ettevaatlikult. See tähendab siin toodud juhiste järgimist ja oma tervet mõistust kalli laboriseadme transportimisel. Alumine rida: Flexi liigutamisel olge ettevaatlik ja lisage polsterdus.
Kui teil on Flexi ümberpaigutamise kohta küsimusi või muresid, võtke meiega ühendust aadressil support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK
Süsteemi kirjeldus
Selles peatükis kirjeldatakse Opentrons Flexi riistvarasüsteeme, mis on selle labori automatiseerimise põhifunktsioonide aluseks. Opentrons Flexi tekk, pukk ja instrumendi alused võimaldavad kasutada täpseid vedelike ja laborinõude käsitsemise komponente. Seadmes olev puuteekraan võimaldab käivitada protokolle ja kontrollida roboti olekut, ilma et peaksite arvutit laboripingile tooma. Juhtmega ja traadita ühenduvus võimaldab täiendavat juhtimist Opentronsi rakendusest (vt täpsemalt peatükist Tarkvara ja kasutamine) ning süsteemi funktsioonide laiendamist välisseadmete külge (vt peatükki Moodulid).
3.1 Füüsilised komponendid
Kaamera
Olekutuli
Puuteekraan
Raam
Pukk-tekk
Esiuks
Opentrons Flexi füüsiliste komponentide asukohad.
Külgmiste akende käepidemekatted
OPENTRONS FLEX
45
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Raam ja korpus
Opentrons Flexi roboti raam tagab jäikuse ja struktuurse toe oma tekile ja pukkile. Kõik mehaanilised alamsüsteemid asuvad põhiraamil ja on selle külge kinnitatud. Raam on valmistatud peamiselt lehtmetallist ja alumiiniumist ekstrusioonist.
Metallraamil on avad küljeakendele ja läbipaistvast polükarbonaadist välisuks, mis lasevad näha, mis Flexi sees toimub. Esiuste hinged avanevad, et pääseda süsteemi sisemusse. Kui esiuks on avatud, saate kinnitada instrumente, mooduleid ja tekiseadmeid; valmistada tekk enne protokolli; või manipuleerida protokolli ajal teki olekuga.
Valged LED-ribad raami sisemistes ülemistes servades pakuvad tarkvaraga juhitavat ümbritsevat valgustust. 2-megapiksline kaamera suudab pildistada tekki ja tööala, et salvestada ja jälgida protokolli täitmist.
Tekk ja tööala
Tekk on töödeldud alumiiniumpind, millel täidetakse automatiseeritud teadusprotokolle. Tekil on 12 peamist ANSI/SLAS-vormingus pesa, mida saab ümber seadistada laborivara, moodulite ja kulumaterjalide hoidmiseks. Teki pesad on identifitseeritud koordinaatide süsteemi abil, kus pesa A1 on taga vasakul ja pilus D3 ees paremal.
Laienduspesa (termocycleri jaoks) tööala
Stagpiirkond
Teki alad Flexi piires.
46
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Tööala on teki kohal olev füüsiline ruum, kuhu pääseb pipeteerimiseks. Pesudesse A1 kuni D3 paigutatud laborinõud on tööpiirkonnas.
Opentrons Flex on varustatud eemaldatavate tekipesadega kõigi 12 positsiooni jaoks tööpiirkonnas. Igal tekipesal on nurgaklambrid, et laborinõud tekile kindlalt asetada.
Tekki saate ümber konfigureerida, asendades pesad teiste teki kinnitusdetailidega, sealhulgas teisaldatava prügikasti, jäätmerenni ja moodulikorpustega. A1 taga olevat laienduspesa kasutatakse ainult selleks, et teha lisaruumi Thermocycler Module'ile, mis võtab enda alla pesad A1 ja B1.
Märkus: tekipesad on vahetatavad veerus (1, 2 või 3), kuid mitte veergude vahel; veeru 1 ja veeru 3 pilud on vaatamata nende sarnasele suurusele erinevad tükid. Saate määrata, millisesse veergu pesa läheb, kui suunate sinise laborinõu klambri taha vasakule.
Peaksite jätma tekipesad paigaldatud kohtadesse, kuhu soovite paigutada eraldiseisvaid laborinõusid. Tekk ja sellele asetatud esemed jäävad staatiliseks, välja arvatud juhul, kui neid liigutata haaratsi või käsitsi sekkumise tõttu.
Stagala
Stagala on lisaruum teki paremal küljel. Pärast s installimist saate selles kohas hoida laborivaratagala pilud. Pesadesse A4 kuni D4 paigutatud laborinõud on stagala. Flex pipetid ei ulatu s-itagala, kuid haarats võib laborinõusid üles võtta ja sellesse kohta teisaldada. Lisapesade lisamine aitab hoida tööala teie automatiseeritud protokollides kasutatavate seadmete jaoks kättesaadavana.
Stagala pesad sisalduvad teatud tööjaama konfiguratsioonides ja neid saab osta ka aadressilt https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Stagpaigaldatud pesadega ala
Teki inventar
Kinnitused on riistvaraelemendid, mis asendavad standardseid tekipesasid. Need võimaldavad teil kohandada teki paigutust ja lisada oma Flexile funktsioone. Praegu kuuluvad tekiseadmete hulka stagala pilud, sisemine prügikast ja välimine prügirenn. Seadmeid saate paigaldada ainult mõnesse kindlasse tekipesasse. Järgmises tabelis on loetletud iga kinnituse teki asukohad.
Armatuur Stagala pilud Prügikast Prügikast Prügirenn Prügirenn koos stagala pesa
Ainult pesad A3D3 A1D1 ja A3-D3 D3 ainult D3
Armatuurid on vooluta. Need ei sisalda elektroonilisi ega mehaanilisi komponente, mis edastavad robotile nende hetkeoleku ja teki asukoha. See tähendab, et peate kasutama teki konfiguratsioonifunktsiooni, et anda Flexile teada, millised kinnitused tekile on kinnitatud ja kus need asuvad.
48
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Teki konfiguratsiooniseadetele pääsete juurde puuteekraanilt kolme punktiga () menüü ja rakenduse Opentrons kaudu. Lisateavet teki konfigureerimise kohta puuteekraanilt leiate peatüki Tarkvara ja kasutamine jaotisest Teki konfigureerimine.
Jäätmete renn
Opentrons Flex Waste Chute kannab vedelikud, otsikud, otsariiulid ja kaevuplaadid Flexi korpusest selle välise ava alla asetatud prügianumasse. Jäätmerenn kinnitub tekiplaadi adapteri külge, mis sobib pessa D3. Sellel on ka spetsiaalne aknapoolpaneel, mis laseb rennil roboti esiosast välja ulatuda.
Jäätmerenni komponendid.
Katteplaadi plaadi adapter
Jäätmerenn
Tekiplaadi adapter koos S-gatagpiirkond
Stagala pilud
Stagala pesad on ANSI/SLAS-iga ühilduvad tekitükid, mis asendavad standardseid pesasid veerus 3 ja lisavad pesadele uusi pesasid.tagtööala — kõik tööpiirkonnas ruumi kaotamata. Saate paigaldada ühe pesa või maksimaalselt neli pesa, et luua uus veerg (A4 kuni D4) teki paremasse serva. Pange tähele, et teki pesa A3 asendamine nõuab prügikasti teisaldamist. Lisades stagTekkides pesad, saab teie Flexi robot salvestada rohkem laborinõusid ja töötada tõhusamalt.
OPENTRONS FLEX
Flex stagala pesa.
49
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
pesa PAIGALDAMINE
Paigaldamiseks eemaldage kruvid, mis kinnitavad standardse pilu teki külge, ja asendage see s-igatagala pesa. Pärast installimist kasutage puuteekraani või rakendust Opentrons, et öelda robotile, mille olete lisanudtagpesa tekile.
Installimine kuitagala pesa.
pesa ühilduvus Stagala pesad ühilduvad allpool loetletud Flexi instrumentide, moodulite ja laborivaraga.
Paindkomponentide haaratspipettide moodulid
Laborinõud
Stagpiirkonna ühilduvus
Flex Gripper saab laborinõusid teisaldada s-i või sealt väljatagala pilud.
Flex pipetid ei ulatu s-nitagala. Kasutage haaratsit, et teisaldada otsariiulid ja laborinõud s-sttagenne pipeteerimist tööalale.
Magnetploki GEN1 saab paigutada veergu 3 as-i pealetagala pesa. Veerus 4 mooduleid ei toetata.
Toiteallikaga moodulid, nagu näiteks Heater-Shaker ja Temperature Module, sobivad kastidesse, mille saab paigutada veergu 3. Te ei saa lisadatagpesa asukohta, mille hõivab mooduli korpus.
Stagala pesadel on samad ANSI/SLAS mõõtmed kui tavalistel tekipesadel. Kasutage haaratsiga ühilduvaid laborinõusidtagpiirkonnas või käsitsi laborivara lisamine ja eemaldamine sellest asukohast.
50
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Liikumissüsteem
Raami külge on kinnitatud pukk, mis on roboti liikumis- ja positsioneerimissüsteem. Pukk liigub eraldi piki x- ja y-telge, et paigutada pipetid ja haarats protokolli täitmiseks täpsetesse kohtadesse. Liikumine mööda neid telgi on 0.1 mm täpsusega. Portaali juhitakse 36 VDC hübriidsete bipolaarsete samm-mootoritega. Portaali külge on omakorda kinnitatud pipeti kinnitused ja pikenduskinnitus. Need liiguvad piki z-telge, et paigutada pipetid ja haarats protokolli täitmiseks täpsetesse kohtadesse. Liikumist mööda seda telge juhivad 36 VDC hübriid bipolaarsed samm-mootorid. Portaalis olev elektroonika tagab 36 V alalisvoolu ja side pipettide ja haaratsiga, kui need on kinnitatud.
Pukk
Pipeti kinnitused
Pikenduskinnitus
Instrumentide kinnituste asukoht Flexil.
Puuteekraan ja LED-ekraanid
Peamine kasutajaliides on 7-tolline LCD-puuteekraan, mis asub roboti esiküljel paremal. Puuteekraan on kriimustus- ja kahjustuskindluse tagamiseks kaetud Gorilla Glass 3 klaasiga. Juurdepääs paljudele Flexi funktsioonidele otse puuteekraanil, sealhulgas:
OPENTRONS FLEX
51
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Protokollihaldus Protokolli seadistamine, täitmine ja jälgimine Labvarahaldus Roboti sätted Süsteemi tarkvara ja püsivara värskendused Toimingute logid ja veateated
Lisateavet Flexi puuteekraani kaudu kasutamise kohta leiate peatüki Tarkvara ja kasutamine jaotisest Puuteekraani kasutamine.
Olekutuli on LED-riba piki roboti esiosa ülemist osa, mis annab ühe pilguga teavet roboti kohta. Erinevad valgustusvärvid ja -mustrid võivad edastada erinevaid edu-, ebaõnnestumis- või jõudeolekuid:
LED värv Valge Neutraalsed olekud
Roheline Normaalsed olekud
Sinine Kohustuslikud olekud Kollane Ebanormaalsed olekud Punane Hädaseisundid
LED muster Solid Pulsing
Vilgub kaks korda
Tahke pulseeriv pulseerimine
Roboti olek
See on sisse lülitatud ja protokolli ei tööta Robot on hõivatud (nt tarkvara või püsivara värskendamine, protokolli käitamise seadistamine, protokolli käitamise tühistamine) Toiming on lõpetatud (nt protokoll on salvestatud, tarkvara värskendatud, instrument on ühendatud või eemaldatud) Protokoll töötab Protokoll on lõpetatud Protokoll on peatatud
Tahke
Tarkvara viga
Vilgub kolm korda, korduvalt
Füüsiline viga (nt instrumendi krahh)
Olekutule saab ka roboti seadetes välja lülitada.
52
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
3.2 Pipetid
Opentronsi pipetid on konfigureeritavad seadmed, mida kasutatakse vedelike liigutamiseks kogu tööpiirkonnas protokollide täitmise ajal. On mitmeid Opentrons Flex pipette, mis suudavad töödelda 1, 1000 või 1 kanalis 8 µL kuni 96 µL mahtusid:
Opentrons Flex 1-kanaliline pipett (1 µL) Opentrons Flex 50-kanaliline pipett (1 µL) Opentrons Flex 5-kanaliline pipett (1000 µL) Opentrons Flex Flex 8-kanaliline pipett (1 µl, 50 µL) 8 µL)
Pipetid kinnitatakse portaali külge pipeti esiküljel olevate kinnituskruvide abil. 1- ja 8-kanalilised pipetid hõivavad mõlemad ühe pipetialuse (vasakul või paremal); 96-kanaliline pipett võtab enda alla mõlemad alused. Lisateavet pipettide paigaldamise kohta leiate jaotisest Seadme paigaldamine ja kalibreerimine.
Vangistatud manus
Kruvid
Kinnituskruvid
Väljutaja
Düüsid (vahetatavad O-rõngad)
Düüsid (fikseeritud O-rõngad)
1-, 8- ja 96-kanaliliste pipettide komponentide asukohad.
Väljutaja
OPENTRONS FLEX
53
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Pipetid võtavad üles ühekordselt kasutatavad plastikotsad, vajutades need pipetiotsikutele, ning seejärel kasutavad otsikuid vedelike aspireerimiseks ja väljastamiseks. Korjamiseks vajalik kogujõud suureneb, kui korraga võetakse üles rohkem otsikuid. Väiksema arvu otsikute korral kinnitab pipeti otsad, surudes iga pipetiotsiku otsa alla. Täieliku otsikute kogumiseks vajaliku jõu saavutamiseks tõmbab 96-kanaliline pipett otsad ka ülespoole düüside külge. See tõmbamistegevus nõuab otsariiulite asetamist otsariiuli adapterisse, mitte otse teki pilusse. Otsikute äraviskamiseks (või riiulile tagastamiseks) lükkab pipeti väljatõmbemehhanism otsikud düüside küljest lahti.
Pipeti tehnilised andmed
Opentrons Flex pipetid on mõeldud mitmesuguste mahtude käsitlemiseks. Oma laia üldvaliku tõttu saavad nad kasutada erineva suurusega otsikuid, mis mõjutavad nende vedeliku käitlemise omadusi. Opentrons on katsetanud Flexi pipettide täpsust ja täpsust mitmes otsa ja vedeliku mahu kombinatsioonis:
Pipetti
Flex 1-Channel
50 µL
Flex 1-Channel
1000 µL
Flex 8-Channel
50 µL
Flex 8-Channel
1000 µL
Otsik Mahutavus 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL
Testitud maht 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Täpsus % D 8.00 % 1.50 % 1.25 % 5.00 % 0.50 % 0.50 % 0.50 % 10.00 % 2.50 % 1.25 % 8.00 % 2.50 % 1.00 % 0.70 %
Täpsus % CV 7.00 % 0.50 % 0.40 % 2.50 % 0.30 % 0.15 % 0.15 % 8.00 % 1.00 % 0.60 % 4.00 % 0.60 % 0.25 % 0.15 %
54
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Flex 96-Channel
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Pipeti otsikuid valides pidage seda täpsusteavet meeles. Üldiselt peaksite parimate tulemuste saavutamiseks kasutama väikseimaid näpunäiteid, mis vastavad teie protokolli vajadustele.
Märkus. Opentrons viib läbi Flexi pipettide mahutesti, et tagada nende vastavus ülaltoodud täpsus- ja täpsusnõuetele. Enne kasutamist ei pea te pipettide kogust kalibreerima. Peate tegema ainult asendi kalibreerimise. Vaadake üksikasju järgmisest jaotisest, samuti peatüki Paigaldamine ja ümberpaigutamine jaotisest Pipeti paigaldamine.
Opentrons Care ja Opentrons Care Plus teenused hõlmavad pipeti iga-aastast vahetust ja kalibreerimissertifikaate. Üksikasjalikumat teavet leiate peatüki Hooldus ja teenindus jaotisest Service Flex.
Pipeti kalibreerimine
Kasutajakomplekt sisaldab metallist pipetiga kalibreerimissondi, mida kasutate asendi kalibreerimisel. Protokolli käitamise ajal hoidke sond turvaliselt roboti esisambal magnethoidikus. Kalibreerimisprotsessi ajal kinnitage sond vastava otsiku külge ja lukustage see oma kohale. Robot liigutab sondi tekil asuvatesse kalibreerimispunktidesse, et mõõta pipeti täpset asukohta.
Pipetiotsa riiuli adapter
Opentrons Flex 96-kanaliline pipett tarnitakse nelja otsariiuli adapteriga. Need on täppisvormitud alumiiniumklambrid, mille asetate tekile. Adapterid mahutavad Flex 50 l, 200 l ja 1000 µl otsariiulid.
OPENTRONS FLEX
55
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Kasutatava jõu tõttu vajab 96-kanaliline pipett adapterit, et kogu otsaku riiuli korralikult kinnitada. Kinnitusprotseduuri ajal liigub pipett üle adapteri, langeb kinnitustihvtide peale ja tõmbab otsikud pipettide külge, tõstes adapterit ja otsariiulit. Otsikute tõmbamine, mitte lükkamine, annab hoova, mis on vajalik otste pipettide külge kinnitamiseks ja hoiab ära teki pinna kõverdumise. Kui olete lõpetanud, langetab 96-kanaliline pipett adapteri ja tühja otsaku resti tekile. Lisateabe saamiseks vaadake Labware peatüki jaotist Otsad ja otsikuriiulid.
Osaline jootraha korjamine
96-kanaliline pipett võib koguda terve riiuli otsikuid või väiksema arvu otsikuid. See suurendab rakenduste arvu, mida saate 96-kanalilise pipetiga teha, kuna see võtab enda alla mõlemad pipetialused.
Praegu toetab 96-kanaliline pipett 8 otsiku osalist kogumist kolonni paigutuses. Selles konfiguratsioonis kasutab pipett kas vasakpoolseimaid düüse, et korjata otsikute riiulilt paremalt vasakule, või kõige parempoolsemaid otsikuid, et korjata otsikute riiulilt vasakult paremale.
Kui korjate otsariiulilt alla 96 otsiku, tuleb hammas asetada otse tekile, mitte otsariiuli adapterisse.
Pipetiandurid
Opentrons Flex pipettidel on mitmeid andureid, mis tuvastavad ja salvestavad andmeid pipeti oleku ja kõigi pipetiotsikute kohta.
MAHTUVUSANDURID
Koos metallist sondi või juhtiva otsaga tuvastavad mahtuvusandurid, millal pipett millegagi kokku puutub. Metallist sondi ja teki vahelise kontakti tuvastamist kasutatakse pipeti automatiseeritud kalibreerimisel ja mooduli kalibreerimisel.
1 kanaliga pipetidel on üks mahtuvusandur, mitme kanaliga pipetidel aga kaks: 1 kanaliga pipetidel 8 ja 8 ning 1 kanaliga pipeti kanalitel 96 ja 1 (positsioonid A12 ja H96).
56
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
OPTILISED OTSIKOHALEMISE ANDURID
Fotokatkestav lüliti tuvastab pipeti otsa väljatõmbemehhanismi asukoha, kinnitades, kas otsikute ülesvõtmine või kukkumine õnnestus. 1 kanaliga, 8 kanaliga ja 96 kanaliga pipetidel on kõigil üks optiline andur, mis jälgib otsiku kinnitust kõigis kanalites.
Pipeteerige püsivara värskendusi
Opentrons Flex värskendab automaatselt pipeti püsivara, et hoida seda roboti tarkvara versiooniga sünkroonis. Pipeti püsivara värskendused on tavaliselt kiired ja toimuvad alati, kui:
Kinnitate pipeti. Robot käivitub uuesti.
Kui pipeti püsivara ja roboti tarkvaraversioonid mingil põhjusel sünkroonist väljuvad, saate püsivara käsitsi Opentronsi rakenduses värskendada.
1. Klõpsake Devices (Seadmed). 2. Klõpsake seadmete loendis oma Flexi. 3. Jaotises Instrumendid ja moodulid kuvab sünkroonist väljas pipett hoiatusbänneri näit
"Saadaval on püsivara värskendus." Värskendamise alustamiseks klõpsake nuppu Värskenda kohe.
Saab küll view mis tahes ühendatud pipeti praegu installitud püsivara versioon. Avage puuteekraanil Instrumendid ja puudutage pipeti nime. Leidke Opentronsi rakenduses jaotises Instrumendid ja moodulid pipetikaart, klõpsake kolme punktiga menüüd () ja seejärel valikut Teave pipeti kohta.
3.3 Haarats
Haarats liigutab laborinõusid kogu tööpiirkonnas ja stagprotokollide täitmise ajal. Haarats kinnitub pikenduskinnituse külge, mis on pipeti kinnitustest eraldi; haaratsit saab kasutada mis tahes pipetikonfiguratsiooniga. Lisateavet haaratsi paigaldamise kohta leiate jaotisest Seadme paigaldamine ja kalibreerimine.
Haarats suudab laborinõusid üle teki ja moodulitele peale või sealt maha tõsta. Haarats võib manipuleerida teatud täielikult ääristatud kaevuplaatidega, sügavate süvenditega plaatidega ja otsariiulitega. Lisateavet selle kohta, millist laborivara haarats saab liigutada, vaadake Labware peatüki jaotistest Labware ja Opentrons Flex Gripper või vaadake Opentronsi laboriraamatukogu.
OPENTRONS FLEX
57
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Haaratsi spetsifikatsioonid
Lõuad teostavad haaratsi esmast liikumist, milleks on kahe paralleelse laba avamine või sulgemine, et rakendada või vabastada jõud laborinõude külgedele. Lõugade liikumist juhib 36 V alalisvoolu harjatud mootor, mis on ühendatud hammaslatt-käigukastiga.
Lõugade külge haaratud laborinõu teisaldamiseks tõstab pukk haaratsit mööda z-telge, liigutab seda külgsuunas ja langetab seejärel laborinõu uude asendisse.
Haaratsi komponentide asukohad.
Kinnituskruvid
Kalibreerimistihvt Jaws Paddles
Haaratsi kalibreerimine
Haarats sisaldab metallist kalibreerimistihvti. Kalibreerimistihvt asub haaratsi alumises osas süvistatud panipaigas. Magnet hoiab tihvti paigal. Kalibreerimistihvti eemaldamiseks võtke sellest sõrmedega kinni ja tõmmake õrnalt. Tihvti vahetamiseks pange see tagasi hoiupessa. Saate teada, et see on turvaline, kui see paika klõpsab.
Haarde kalibreerimisel kinnitage tihvt kordamööda iga lõualuu külge. Robot liigutab tihvti tekil asuvatesse kalibreerimispunktidesse, et mõõta haaratsi täpset asukohta.
Protokolli käitamise ajal asetage tihvt selle hoidmiseks hoiukohta. Kui kaotate kalibreerimisnõela, võtke meiega ühendust aadressil support@optrons.com.
Gripperi püsivara värskendused
Opentrons Flex värskendab automaatselt haaratsi püsivara, et hoida seda roboti tarkvara versiooniga sünkroonis. Gripperi püsivara värskendused on tavaliselt kiired ja toimuvad alati, kui:
58
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Kinnitate haaratsi. Robot käivitub uuesti.
Kui teie haaratsi püsivara ja roboti tarkvaraversioonid lähevad mingil põhjusel sünkroonist välja, saate Opentronsi rakenduses püsivara käsitsi värskendada.
1. Klõpsake Devices (Seadmed). 2. Klõpsake seadmete loendis oma Flexi. 3. Jaotises Instrumendid ja moodulid kuvab sünkroonist väljas haarats hoiatusbänneri näitu
"Saadaval on püsivara värskendus." Värskendamise alustamiseks klõpsake nuppu Värskenda kohe.
Saab küll view haaratsi praegu installitud püsivara versioon. Avage puuteekraanil Instrumendid ja puudutage haaratsit. Otsige Opentronsi rakenduses jaotisest Instrumendid ja moodulid üles haaratsikaart, klõpsake kolme punktiga menüüd () ja seejärel nuppu Teave haaratsist.
3.4 Hädaseiskamise ripats
Hädaseiskamisripats (E-stop) on spetsiaalne riistvaranupp roboti liikumise kiireks peatamiseks. Opentrons Flex vajab funktsionaalset, lahtiühendatud E-stopi, mis peab olema alati kinnitatud. Kui vajutate stopp-nuppu, tühistab Flex kõik töötava protokolli või seadistamise töövoo nii kiiresti kui võimalik ja takistab enamiku roboti liikumisest.
Millal E-peatust kasutada
Võimalik, et peate vajutama E-stopi:
Kui on vahetu oht kasutajat vigastada või kahjustada. Kui on otsene oht robotit või muud riistvara kahjustada. Kui samples või reaktiivid on otseses saastumise ohus. Pärast riistvara kokkupõrget.
Ideaalis ei peaks te kunagi vajutama E-stoppi (välja arvatud harvadel riistvarakvaliteedi testimisel).
Ärge kasutage kiirpeatust tavapäraste eeldatavate toimingute tühistamiseks. Selle asemel kasutage tarkvara nuppu puuteekraanil või rakenduses Opentrons. Tarkvara kaudu peatamine võimaldab teil oma protokolli jätkata või tühistada, samas kui E-stop vajutamine tühistab protokolli alati kohe.
OPENTRONS FLEX
59
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
E-peatuse sisselülitamine ja vabastamine
E-stopil on kinnivajutav, keeratav ja vabastav mehhanism.
Sisselülitamine: vajutage punast nuppu tugevalt alla. Flex läheb peatatud olekusse. Lahendus: kui olete peatanud, lahendage ohutult kõik tööpiirkonnas esinevad probleemid, näiteks eemaldage lekked,
laborivarustuse eemaldamine või portaali liigutamine (see peaks käsitsi vabalt ja hõlpsalt liikuma). Vabastamine: keerake nuppu päripäeva. See hüppab välja oma väljalülitatud asendisse. Lähtestage: puuteekraanil või rakenduses Opentrons kinnitage, et olete Flexi jätkamiseks valmis
liikumine. Pukk naaseb oma algasendisse ja mooduli tegevus jätkub.
Peatatud olekus käituvad Flex ja ühendatud riistvara järgmiselt.
Riistvaralised portaalipipetid
Haarats
Soojendi-shakeri moodul
Temperatuurimooduli termotsükli mooduli olekutuli Puuteekraan
Käitumine
Automaatne horisontaalne liikumine on peatatud. Käsitsi horisontaalne liikumine on lubatud.
Pipettide vertikaalne liikumine on peatatud. Mootoripidurid vertikaaltelgedel on sisse lülitatud, et vältida
pipetid kukkumise eest. Kolvi liikumine ja otsa korjamine on peatatud.
Haarde vertikaalne liikumine on peatatud. Mootori pidur vertikaalteljel on sisse lülitatud, et vältida
haarats kukkumise eest. Haardejõudu avaldavad lõuamootorid jäävad sisselülitatuks, seega
haarats ei kuku maha laborinõusid, mida see võib kaasas kanda.
Shaker peatub ja läheb koju. Laborinõude riiv avaneb. Küte on keelatud.
Küte või jahutamine on keelatud.
Küte või jahutamine on keelatud.
Tuli läheb punaseks.
Ekraani võtab üle tühistamisteade. Ekraanil kuvatav indikaator näitab, kui olete edukalt teinud
lülitas stopp-nupu välja.
60
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
3.5 Ühendused
Sisse/välja lüliti
Küljekatted
USB-A pordid
IEC toite sisend
Portid AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Toiteühendus
Opentrons Flex ühendub toiteallikaga standardse IEC-C14 sisendi kaudu. Robot sisaldab sisemist täisvahemikku AC/DC toiteallikat, mis võtab vastu 100 VAC, 240/50 Hz sisendit ja teisendab selle 60 V alalisvooluks. Kogu ülejäänud sisemine elektroonika saab toite 36 V alalisvoolu toitest.
Hoiatus: kasutage ainult robotiga kaasasolevat toitejuhet. Ärge kasutage ebapiisava voolu või voolutugevusega toitejuhettage hinnangud.
Hoidke toitejuhe takistusteta, et saaksite selle vajadusel eemaldada.
Samuti on olemas CR1220 mündipatarei, mis toidab roboti reaalajas kella, kui see pole vooluvõrku ühendatud. Aku asub puuteekraani korpuse sees. Kui arvate, et peate aku välja vahetama, võtke lisateabe saamiseks ühendust Opentronsi toega.
OPENTRONS FLEX
61
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
USB ja lisaühendused
Opentrons Flexil on kokku 10 USB-porti, mis asuvad roboti erinevates piirkondades ja mis teenivad erinevaid eesmärke.
8 tagumist USB-A porti (numbritega USB-1 kuni USB-8) ja 2 lisaporti (M12 pistikud numbritega AUX-1 ja AUX-2) on mõeldud Opentronsi moodulite ja tarvikute ühendamiseks. Lisateavet nende seadmete ühendamise ja nende protokollides kasutamise kohta leiate peatükist Moodulid. Tagumine USB-B-port on mõeldud roboti ühendamiseks sülearvuti või lauaarvutiga, et luua side ühendatud arvutis töötava Opentronsi rakendusega. Puuteekraani all asuval eesmisel USB-A-pordil (USB-9) on samad funktsioonid kui tagumised USB-A-pordid.
Märkus: USB-portide võimsus on piiratud, et kaitsta robotit ja ühendatud seadmeid. Toiteedastus on sisemiselt jagatud kolme pordirühma: tagumised vasakpoolsed USB-A-pordid (USB-1 kuni USB-4), paremad tagumised USB-A-pordid (USB-5 kuni USB-8) ja eesmised USB-A-pordid. sadamasse. Kõik need rühmad edastavad ühendatud USB 500-ga ühilduvatele seadmetele maksimaalselt 2.0 mA.
Võrguühendused
Opentrons Flex saab ühenduda kohtvõrguga juhtmega (Ethernet) või juhtmevaba (Wi-Fi) ühenduse kaudu.
Etherneti port asub roboti tagaküljel. Ühendage see Etherneti jaoturiga või lülitage võrk sisse. Või alustades robotsüsteemi versioonist 7.1.0, ühendage see otse arvuti Etherneti porti. Sisemine Wi-Fi-moodul toetab kaheribalise 802.11/2.4 GHz antenniga 5 ac/a/b/g/n võrke.
62
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
3.6 Süsteemi spetsifikatsioonid
Üldised spetsifikatsioonid
Mõõdud Kaal Teki pesad
Puuteekraan
Wi-Fi Ethernet USB
Kaamera Roboti toitesisend
Toiteallikas voltage kõikumine Elektrivõrgu sageduse kõikumine Jaotussüsteem Lühise toitevool Raami koostis Akna koostis Ventilatsiooninõuded
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 tolli (L, D, K)
88.5 kg / 195 naela 12 ANSI/SLAS-ühilduv pesa tööpiirkonnas
(juurdepääs pipettidele) 4 lisapesa s jaokstagnäpunäiteid ja laborinõusid
(juurdepääs ainult haaratsile) 7-tolline LCD-puuteekraan kriimustus- ja kahjustuskindla Gorilla Glass 3-ga
802.11 ac/a/b/g/n kaheribaline (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A porti 1 USB-B porti USB 2.0 kiirus
2MP, foto ja video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Jäik terasest ja CNC-alumiiniumist disain
Eemaldatavad polükarbonaadist küljeaknad ja välisuks Seadme ja seina vahel vähemalt 20 cm/8
OPENTRONS FLEX
63
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Ühendatud arvuti nõuded
Rakendus Opentrons töötab: Windows 10 või uuem macOS 10.10 või uuem Ubuntu 12.04 või uuem
Keskkonnaspetsifikatsioonid
Keskkonnatingimused Keskkonna temperatuur Suhteline õhuniiskus Saasteaste
Kasutamine ainult siseruumides +20 kuni +25 °C (soovitatav) 40%, mittekondenseeruv (soovitatav) 60 (ainult mittejuhtiv saaste)
Lisateavet kasutamiseks ja transportimiseks vastuvõetavate keskkonnatingimuste kohta leiate peatüki Paigaldamine ja ümberpaigutamine jaotisest Keskkonnatingimused.
Sertifikaadid
Sertifikaadid on täidetud Pole sertifitseeritud/valideeritud
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Sertifitseerimisteabe kokkuvõte on trükitud kleebisele Flexi tagaküljel, sisse/välja lüliti lähedal. Üksikasjaliku sertifitseerimise ja vastavuse teabe saamiseks vaadake sissejuhatuse jaotist Regulatiivnõuetele vastavus.
Seerianumber
Igal Flexil on ainulaadne seerianumber. Seerianumbri vorming annab lisateavet, sealhulgas roboti tootmiskuupäeva. Näiteksample, seerianumber FLXA1020231007001 näitab:
64
OPENTRONS FLEX
3. PEATÜKK: SÜSTEEMI KIRJELDUS
Tegelased FLX A10 2023 10 07 001
Kategooria Mudel Versioon Aasta Kuu Päev Ühik
Tähendus Robot on Opentrons Flex. Kood roboti tootmisversiooni jaoks. Robot on valmistatud aastal 2023. Robot valmis oktoobris. Robot valmis kuu 7. päeval. Unikaalne number kindlal päeval valmistatud robotitele.
Oma Flexi seerianumbri leiate:
Sertifitseerimiskleebisel Flexi tagaküljel sisse/välja lüliti lähedal. Puuteekraani tagaküljel (tööpiirkonna poole). Opentronsi rakenduse jaotises Seadmed > teie Flex > Roboti sätted > Täpsemalt.
OPENTRONS FLEX
65
4. PEATÜKK
Moodulid
Opentrons Flex integreerub paljude Opentronsi riistvaramoodulitega. Kõik moodulid on välisseadmed, mis hõivavad tekipesasid ja enamikku juhib robot USB-ühenduse kaudu.
Selles peatükis kirjeldatakse Opentrons Flex süsteemiga ühilduvate moodulite funktsioone ja füüsilisi tehnilisi andmeid, samuti nende kinnitamist ja kalibreerimist. Mooduli seadistamise ja kasutamise kohta lisateabe saamiseks vaadake üksikute moodulite juhendeid. Lisateavet moodulite protokollidesse integreerimise kohta leiate peatüki Protokolli arendamine jaotisest Protokolli kujundaja või Pythoni protokolli API veebidokumentatsioonist.
4.1 Toetatud moodulid
Opentrons Flex ühildub nelja tüüpi tekil asuvate Opentronsi moodulitega:
Heater-Shaker moodul pakub tekil soojendamist ja orbitaalset raputamist. Moodulit saab kuumutada temperatuurini 95 °C ja see võib loksutada sampvähem 200 kuni 3000 pööret minutis.
Magnetic Block on passiivne seade, mis hoiab laborinõusid oma ülitugevate neodüümmagnetite läheduses. Opentrons Flex ei toeta OT-2 magnetmooduleid GEN1 ja GEN2, mis liigutavad oma magneteid laborivara suhtes aktiivselt üles ja alla.
Temperatuurimoodul on kuuma ja külma plaadi moodul, mis suudab hoida püsivat temperatuuri vahemikus 4 kuni 95 °C.
Thermocycler Module pakub tekil täielikult automatiseeritud termotsüklit, mis võimaldab automatiseerida üles- ja allavoolu töövoo etappe. Thermocycler GEN2 ühildub täielikult haaratsiga. Thermocycler GEN1 ei saa koos haaratsiga kasutada ja seetõttu Opentrons Flex seda ei toeta.
Mõned algselt OT-2 jaoks loodud moodulid ühilduvad Flexiga, nagu on kokkuvõtlikult esitatud allolevas tabelis. Linnuke näitab ühilduvust ja X tähistab ühildumatust.
66
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
Seadme tüüp ja põlvkond Soojendi-raputi moodul GEN1 magnetmoodul GEN1 magnetmoodul GEN2 magnetplokk GEN1 temperatuurimoodul GEN1 temperatuurimoodul GEN2 termotsükleri moodul GEN1 termotsükleri moodul GEN2 HEPA moodul
OT-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Moodulkorpuse süsteem
Ühilduvad moodulid on loodud sobituma kabiinidesse, mis võtavad teki all ruumi. See süsteem võimaldab moodulite peal asuvatel laborivaradel jääda teki pinnale lähemale ning see võimaldab ka teki all olevaid kaableid suunata, et tekk püsiks protokolli töötamise ajal korras.
Korpused kütte-raputi, temperatuuri ja termotsükleri moodulitele.
OPENTRONS FLEX
67
4. PEATÜKK: MOODULID
Mooduli paigaldamiseks teki pinnale tuleb see esmalt asetada vastavasse mooduli korpusesse. Igal ühilduval mooduli tüübil on oma korpuse disain, mis joondab mooduli ja laboritarvikud täpselt ümbritseva tekiga. (Erandiks on magnetplokk, mis ei vaja toite- ega USB-kaabli marsruutimist ja asub seega otse teki pinnal.) Ühes pesas asuvate moodulite korpused saab paigutada ükskõik kuhu veerus 1 või 3; Thermocyclerit saab paigutada ainult pesadesse A1 ja B1 korraga.
Moodulikorpuse paigaldamiseks toimige üldiselt järgmiselt.
1. Eemaldage kõik tekipesad kohast, kuhu moodul läheb. 2. Asetage moodul oma korpusesse ja pingutage selle ankrud. 3. Juhtige mooduli toite- ja USB-kaablid läbi külgkatete, üles läbi tühja teki pesa ja
kinnitage need mooduli külge. 4. Asetage mooduli korpus pessa ja keerake see kohale.
Täpsed paigaldusjuhised leiate konkreetse mooduli kiirjuhendist või kasutusjuhendist. Kaablite ühendused ja kinnitusviis on mooduliti erinevad.
4.3 Mooduli kalibreerimine
Kui installite mooduli esmakordselt Flexi, peate käivitama automaatse positsioonikalibreerimise. See protsess sarnaneb instrumentide positsioonikalibreerimisega ja tagab, et Flex liigub protokolli optimaalseks toimimiseks täpselt õigetesse kohtadesse. Kalibreerimise ajal liigub Flex asukohtadesse mooduli kalibreerimisadapteril, mis näeb välja sarnane kalibreerimisruutudega, mis on osa eemaldatavatest tekipesadest.
Kalibreerimisadapterid Heater-Shaker, Temperature ja Thermocycler moodulite jaoks.
Mooduli kalibreerimine on nõutav kõigi moodulite jaoks, mis paigaldatakse läbi caddy: Heater-Shaker, Temperature ja Thermocycler moodulid. Magnetplokk ei vaja kalibreerimist ja on kasutamiseks valmis kohe, kui selle tekile asetate.
68
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
Millal mooduleid kalibreerida
Flex palub teil automaatselt kalibreerida, kui ühendate ja lülitate sisse mooduli, millel pole salvestatud kalibreerimisandmeid. (Saate sellest viipast loobuda, kuid te ei saa mooduliga protokolle käitada enne, kui olete selle kalibreerinud.)
Kui olete kalibreerimise lõpetanud, salvestab Flex kalibreerimisandmed ja mooduli seerianumbri edaspidiseks kasutamiseks. Flex ei palu teil uuesti kalibreerida, kui te ei kustuta selle mooduli kalibreerimisandmeid roboti seadetes. Saate oma mooduli vabalt sisse ja välja lülitada või isegi teisaldada teise tekipesa, ilma et peaksite uuesti kalibreerima. Kui soovite uuesti kalibreerida, saate protsessi igal ajal alustada Opentronsi rakenduse moodulikaardilt. (Taaskalibreerimine pole puuteekraanilt saadaval.)
Kuidas mooduleid kalibreerida
Puuteekraanil või rakenduses Opentrons olevad juhised juhendavad teid läbi kalibreerimisprotseduuri. Üldiselt on sammud järgmised:
1. Koguge kokku vajalik varustus, sealhulgas mooduli kalibreerimisadapter ja pipeti kalibreerimissond. 2. Asetage kalibreerimisadapter mooduli pinnale ja veenduge, et see on täiesti tasane.
Mõned moodulid võivad nõuda adapteri kinnitamist mooduli külge. 3. Kinnitage kalibreerimissond pipeti külge. 4. Flex liigub automaatselt, et puudutada kalibreerimisadapteri teatud punkte ja salvestada need
kalibreerimisväärtused edaspidiseks kasutamiseks.
Kui kalibreerimine on lõppenud ja olete adapteri ja sondi eemaldanud, on moodul protokollides kasutamiseks valmis.
Igal ajal saate view ja hallata oma mooduli kalibreerimisandmeid rakenduses Opentrons. Avage oma Flexi roboti sätted ja klõpsake vahekaarti Kalibreerimine.
OPENTRONS FLEX
69
4. PEATÜKK: MOODULID
4.4 Soojendi-raputi moodul GEN1
Heater-Shaker omadused
KUJENDAMINE JA RAPUTAMINE
Heater-Shaker pakub tekil soojendamist ja orbitaalset raputamist. Moodulit saab soojendada 95 °C-ni järgmise temperatuuri profile:
Temperatuurivahemik: 37 °C Temperatuuri täpsus: ±95 °C temperatuuril 0.5 °C Temperatuuri ühtlus: ±55 °C temperatuuril 0.5 °CRamp kiirus: 10 °C/min
Moodul võib raputada samples 200 kuni 3000 p/min järgmise raputamise profile:
Orbiidi läbimõõt: 2.0 mm Orbiidi suund: päripäeva Kiiruste vahemik: 200 p/min Kiiruse täpsus: ±3000 p/min
Moodulil on toitega laboririiv plaatide kinnitamiseks mooduli külge enne raputamist.
70
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
TERMAADAPTERID Laborinõude lisamiseks Heater-Shakerile on vaja ühilduvat termoadapterit. Adaptereid saab osta otse Opentronsist aadressil https://shop.opentrons.com. Praegu saadaval olevad termoadapterid on järgmised:
Universaalne lameadapter
PCR-adapter
Süvakaevu adapter
96 Lamedapõhjaline adapter
TARKVARA JUHTIMINE
Heater-Shaker on Protocol Designeris ja Python Protocol API-s täielikult programmeeritav. Pythoni API võimaldab lisaks teha muid protokolli samme paralleelselt, kui Heater-Shaker on aktiivne. Protokollidesse paralleelsete sammude lisamise üksikasju leiate API dokumentatsiooni jaotisest Mitteblokeerivad käsud.
Väljaspool protokolle saab Opentronsi rakendus kuvada Heater-Shakeri hetkeoleku ja juhtida otse kütteseadet, loksutit ja laborivara riivi.
OPENTRONS FLEX
71
4. PEATÜKK: MOODULID
Heater-Shakeri tehnilised andmed
Mõõdud Kaal Mooduli toitesisend Toiteadapteri sisend Toiteallika mahttage kõikumine Overvoltage Energiatarve
152 × 90 × 82 mm (P/L/K) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% II kategooria tühikäik: 10 W
Tüüpiline: raputamine: 4 W Kuumutamine: 11 W Kuumutamine ja raputamine: 10 W
Keskkonnatingimused Keskkonna temperatuur Suhteline õhuniiskus Kõrgus Saasteaste
Maksimaalne: 125 W Sisekasutus ainult 130 °C Kuni 20%, mittekondenseeruv Kuni 25 m üle merepinna 80
72
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
4.5 Magnetplokk GEN1
Magnetploki omadused
Opentrons Magnetic Block GEN1 on magnetiline 96 süvendiga plaadihoidja. Magnetplokke kasutatakse protokollides, mis põhinevad magnetismil osakeste suspensioonist väljatõmbamiseks ja nende hoidmiseks kaevuplaatidel pesemise, loputamise või muude elueerimisprotseduuride ajal. Näiteksample, automatiseeritud NGS ettevalmistamine; genoomse ja mitokondriaalse DNA, RNA või valkude puhastamine; ja muud ekstraheerimisprotseduurid on kõik kasutusjuhud, mis võivad hõlmata magnetplokke.
MAGNETIKOMPONENDID
Magnetplokk on ilma toiteta, ei sisalda elektroonilisi komponente ega liiguta lahuses magnethelmeid üles ega alla. Kaevud koosnevad 96 ülitugevast neodüümrõngasmagnetist, mis on kinnitatud vedruga sängi külge, mis aitab säilitada tolerantsid ploki ja pipettide vahel automaatsete protokollide käitamise ajal.
TARKVARA JUHTIMINE
Magnetplokk GEN1 on Protocol Designeris ja Python Protocol API-s täielikult programmeeritav.
OPENTRONS FLEX
73
4. PEATÜKK: MOODULID
Väljaspool protokolle ei ole puuteekraan ja rakendus Opentrons aga magnetploki GEN1 hetkeolekust teadlikud ega suuda kuvada. See on vooluta moodul. See ei sisalda elektroonilisi ega mehaanilisi komponente, mis suudavad Flexi robotiga suhelda. Magnetic Blocki juhite protokollide kaudu, mis kasutavad Opentrons Flex Gripperit laborivara lisamiseks ja eemaldamiseks sellest moodulist.
Magnetploki tehnilised andmed
Mõõdud Kaal Mooduli võimsus Magnetklass Keskkonnatingimused Keskkonna temperatuur Suhteline õhuniiskus Kõrgus Saasteaste
136 × 94 × 45 mm (L/L/K) 1.13 kg Puudub, moodul on vooluta N52 neodüüm Sisekasutus ainult 20 °C 25%, mittekondenseeruv Kuni 30 m üle merepinna 80
74
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
4.6 Temperatuurimoodul GEN2
Temperatuurimooduli omadused
KÜTE JA JAHUTAMINE
Opentrons Temperature Module GEN2 on kuuma ja külma plaadi moodul. Seda kasutatakse sageli protokollides, mis nõuavad kuumutamist, jahutamist või temperatuurimuutusi. Sõltuvalt mooduli konfiguratsioonist ja sisust suudab moodul mõne minuti jooksul saavutada ja hoida temperatuuri vahemikus 4 °C kuni 95 °C.
TERMOPLOKID
Laborinõude temperatuuril hoidmiseks kasutab moodul alumiiniumist termoplokke. Moodul on varustatud 24- ja 96-süvendiliste termoplokkidega. Temperatuurimooduli korpusel on sügav kaevuplokk ja lameda põhjaga plokk, mis on mõeldud kasutamiseks koos Flex Gripperiga. Plokid mahutavad 1.5 ml ja 2.0 ml katsutid, 96-süvendilised PCR-plaadid, PCR-ribad, sügava süvendiga plaadid ja lamedapõhjalised plaadid.
OPENTRONS FLEX
75
4. PEATÜKK: MOODULID
Märkus: moodul tarnitakse OT-2 jaoks ka lameda põhjaplokiga. Ärge kasutage OT-2 plokki koos Flexiga. Flexi lameda põhjaploki ülemisel pinnal on kiri "Opentrons Flex". OT-2 jaoks mõeldud mitte.
24-kaevuga termoplokk
96-kaevuga termoplokk
Sügavkaevu termoplokk
Lamedapõhjaline termoplokk Flexi jaoks
VEEVANNID JA KÜTE
Kuna õhk on hea soojusisolaator, võivad lüngad laborinõude ja termoploki vahel mõjutada temperatuurimooduli toimivust aja ja temperatuuri vahel. 24- või 96-süvendilistesse termoplokkidesse vähese vee asetamine kõrvaldab õhuvahed ja parandab kütte efektiivsust. Ideaalne veekogus sõltub termoplokist ja laborinõudest. Täiendavate soovituste saamiseks vaadake temperatuurimooduli valget raamatut.
TARKVARA JUHTIMINE
Temperatuurimoodul on Protocol Designeris ja Python Protocol API-s täielikult programmeeritav.
Väljaspool protokolle saab Opentronsi rakendus kuvada temperatuurimooduli hetkeoleku ja juhtida otse pinnaplaadi temperatuuri.
76
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
Temperatuurimooduli spetsifikatsioonid
Mõõdud Kaal Mooduli võimsus
Keskkonnatingimused Keskkonna temperatuur Suhteline õhuniiskus Kõrgus Saasteaste
194 × 90 × 84 mm (L/L/K) 1.5 kg Sisend: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Väljund: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Sisekasutus ainult <219.6 °C (soovitatav optimaalseks jahutuseks ) Kuni 22%, mittekondenseeruv Kuni 60 m üle merepinna 2000
4.7 Termotsükleri moodul GEN2
OPENTRONS FLEX
77
4. PEATÜKK: MOODULID
Termoratta omadused
Opentrons Thermocycler Module GEN2 on täielikult automatiseeritud tekil olev termotsükkel, mis pakub vabakäe-PCR-i 96-süvendilise plaadi formaadis. Selle soojendusega kaas ja ühekordne tihend sobivad tihedalt üle plaadi, tagades tõhusa sample kuumutamine ja minimaalne aurustumine.
KÜTE JA JAHUTAMINE Thermocycleri plokk saab soojendada ja jahutada ning selle kaas soojendada järgmise temperatuuri profile: Termoploki temperatuurivahemik: 4 °C Termoploki maksimaalne soojendus ramp kiirus: 4.25 °C/s alates GEN2 ümbritsevast temperatuurist kuni 95 °C Termobloki maksimaalne jahutus ramp kiirus: 2.0 °C/s alates 95 °C kuni ümbritseva õhuni Kaane temperatuurivahemik: 37 °C Kaane temperatuuri täpsus: ±110 °C Automatiseeritud kaant saab vastavalt vajadusele protokolli täitmise ajal avada või sulgeda.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler suudab käivitada profiles: automaatne tsükliline tsükliline ploki temperatuuride jada, et sooritada kuumustundlikke reaktsioone.
KUMMIST AUTOMAATTIHENDID Thermocycler on varustatud kummist automaattihenditega, mis aitavad vähendada aurustumist. Iga tihend tuleb enne kasutamist steriliseerida ja seda saab kasutada mitu korda. Täiendavaid tihendeid saab osta otse Opentronsist aadressil https://shop.optrons.com.
TARKVARA JUHTIMINE Thermocycler on Protocol Designeris ja Python Protocol API-s täielikult programmeeritav. Väljaspool protokolle saab Opentronsi rakendus kuvada Thermocycleri hetkeoleku ja juhtida otse ploki temperatuuri, kaane temperatuuri ja kaane asendit.
78
OPENTRONS FLEX
4. PEATÜKK: MOODULID
Termotsakli tehnilised andmed
Mõõdud (kaas avatud) Mõõdud (kaas suletud) Kaal (kaasa arvatud tagumine kanal) Toiteadapteri mahttage Toiteadapteri vool Ülevoltage Keskkonnatingimused Keskkonna temperatuur Suhteline õhuniiskus Kõrgus Ventilatsiooninõuded
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/L/K) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/L/K) 8.4 kg 100 V sagedusel 240/50 Hz 60 A II kategooria Sisekasutus ainult sisetingimustes (ideaalne 8.5 °C); 5 °C (vastuvõetav) 20%, mittekondenseeruv Kuni 25 m üle merepinna Seadme ja seina vahel vähemalt 2 cm/40
OPENTRONS FLEX
79
5. PEATÜKK
Laborinõud
See peatükk hõlmab Opentrons Labware Library üksusi, mida saate kasutada Opentrons Flexi ja Opentrons Flex Gripperiga. See hõlmab ka kohandatud laborivara ja meie tõhusate kasutajate jaoks seob laborivara komponendid vastava JSON-iga file määratlused.
Laboritarvikuid saate osta originaalseadmete tootjatelt või Opentronsi poest aadressil https://shop.opentrons.com. Ja Opentrons töötab alati uute laborivara määratluste kontrollimise nimel. Viimaste loendite saamiseks vaadake Labware Library (lingitud ülalpool).
5.1 Labware mõisted
Labware hõlmab enamat kui ainult tekile asetatud ja protokollis kasutatavaid objekte. Opentroni laborivara mõistmiseks uurime seda teemat kolmest erinevast vaatenurgast. Opentrons Flexi jaoks sisaldab laborivara üksusi meie laborivarakogus, andmeid, mis määratlevad iga laborivara osa, ja kohandatud laborivara.
Labware kui riistvara
Labware Library sisaldab kõike, mida saate Opentrons Flexiga vaikimisi kasutada. Need on vastupidavad komponendid ja kulumaterjalid, millega töötate, kasutate uuesti või viskate ära protokolli käitamise ajal. Labware Library üksustega töötamiseks ei pea te tegema mingeid erimeetmeid. Flexi robot teab, kuidas kõigega raamatukogus automaatselt töötada.
Labware kui andmed
Laborateave salvestatakse Javascripti objektide märgistuses (JSON) files failiga .json file laiendused. JSON file hõlmab ruumilisi mõõtmeid (pikkus, laius, kõrgus), mahutavust (L, ml) ja muid mõõdikuid, mis määratlevad pinnaomadused, nende kuju ja asukoha. Protokolli käitamisel loeb Flex neid json-faile files teada, mis laborinõud tekil on ja kuidas sellega töötada.
80
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Kohandatud laborinõud
Kohandatud laborivara on laborivara, mis ei sisaldu Labware Librarys või on Custom Labware Creatori loodud laborivara. Kuid mõnikord koormavad kohandatud laborivara ideed keerukuse, kulu või keerukuse mõisted. Kuid kohandatud laborivara ei tohiks olla raske mõista ega luua. Võtame hetke, et lahti pakkida kohandatud laborivara kontseptsioon.
Nagu endineampOpentrons Labware Library sisaldab 96 süvendiga plaate (200 L) firmadelt Corning ja BioRad, kuid ka teised tootjad valmistavad neid kaevuplaate. Ja tänu üldtunnustatud tööstusstandarditele on erinevused nende üldlevinud laboriüksuste vahel väikesed. Kuid tavaline 200-liitrine 96-süvendiline plaat firmadelt Stellar Scientific, Oxford Lab või Krackeler Scientific (või mis tahes muu tarnija) on Flexi jaoks kohandatud laborivara, kuna see pole meie laborivarakogus eelnevalt määratletud. . Lisaks võivad väikesed erinevused laborivara mõõtmetes teie protokolli käitamise edule drastiliselt mõjuda. Sel põhjusel on oluline, et iga laborivara jaoks, mida soovite oma protokollis kasutada, oleks täpne laborivara määratlus.
Lisaks, kuigi kohandatud laborivara võib olla esoteeriline, ühekordne komplekt, on enamasti tegemist vaid otsikutega, taldrikutega, torudega ja nagidega, mida kasutatakse iga päev laborites üle kogu maailma. Jällegi, ainus erinevus Opentroni laborivara ja kohandatud laborivara vahel on see, et uus üksus ei ole robotit toitavas tarkvaras eelnevalt määratletud. Flex saab ja töötab koos muude põhiliste laborivaraüksustega või millegi ainulaadsega, kuid peate salvestama selle üksuse omadused laborivara definitsiooni JSON-i. file ja importige need andmed rakendusse Opentrons. Lisateabe saamiseks vaadake allolevat jaotist Kohandatud laborivara definitsioonid.
Kokkuvõtteks võib öelda, et laborivara sisaldab järgmist:
Kõik Opentronsi laboriraamatukogus. Labware määratlused: andmed JSON-is file mis määrab üksikute esemete kuju, suuruse ja võimalused
nagu kaevuplaadid, otsikud, reservuaarid jne. Kohandatud laborivara, mis on üksused, mis ei sisaldu Labware Librarys.
Pärast reviewNende oluliste mõistete käsitlemisel uurime Opentronsi laboriraamatukogu kategooriaid ja üksusi. Pärast seda lõpetame peatüki lõpugaview laborivara andmekomponentidest file ja tehke kokkuvõte Opentroni funktsioonidest ja teenustest, mis aitavad teil kohandatud laborivara luua.
OPENTRONS FLEX
81
5. PEATÜKK: LABVARA
5.2 Veehoidlad
Opentrons Flex töötab vaikimisi allpool loetletud ühe- ja mitme süvendiga reservuaaridega. Nende reservuaaride kasutamine aitab vähendada teie ettevalmistustööde koormust, kuna need on kohe karbist välja võttes automatiseerimiseks valmis. Veehoidla teave on saadaval ka Opentronsi laboriraamatukogus.
Ühekaevud reservuaarid
Tootja spetsifikatsioonid
Agilent
290 ml V põhjaga
Axygen
90 ml Lamedapõhjaline
PESA
195 ml Lamedapõhjaline
290 ml V põhjaga
API laadimise nimi
agilient_1_ reservuaar_290ml
axygen_1_ reservuaar_90ml
pesa_1_ reservuaar_195ml
pesa_1_ reservuaar_290ml
Mitme süvendiga reservuaarid
Tootja spetsifikatsioonid
PESA
12 süvend 15 ml süvendi kohta V põhi
USA teaduslik
12 süvend 22 ml süvendi kohta V põhi
API laadimise nimi nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservuaar_22ml
82
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Reservuaarid ja API määratlused
Opentrons Labware Library määratleb ülaltoodud reservuaaride omadused eraldi JSON-is files. Robot ja Opentrons Python API tuginevad nendele JSON-i määratlustele, et töötada koos teie protokollide kasutatava laborivaraga. Näiteksample, API-ga töötades aktsepteerib funktsioon ProtocolContext.load_labware neid laborivara nimesid teie koodi kehtivate parameetritena. Lingitud API laadimisnimed loovad ühenduse Opentronsi GitHubi hoidlas oleva reservuaari laborivara definitsioonidega.
Kohandatud reservuaari laborinõud
Kui reservuaari, mida soovite kasutada, pole siin loetletud, proovige luua kohandatud laborivara määratlus Opentrons Labware Creatoriga. Kohandatud definitsioon ühendab JSON-is kõik mõõtmed, metaandmed, kujundid, mahutavuse ja muu teabe file. Opentrons Flex vajab seda teavet, et mõista, kuidas teie kohandatud laborivaraga töötada. Lisateabe saamiseks vaadake jaotist Kohandatud laborivara definitsioonid.
5.3 Kaevuplaadid
Opentrons Flex töötab vaikimisi allpool loetletud kaevuplaatidega. Nende kaevuplaatide kasutamine aitab vähendada teie ettevalmistustööde koormust, sest need on kohe karbist välja võttes automatiseerimiseks valmis. Kaevuplaadi teave on saadaval ka Opentronsi laboriraamatukogus.
OPENTRONS FLEX
83
5. PEATÜKK: LABVARA
6 süvendiga plaadid
Tootja Corning
Tehnilised andmed
6 süvend 16.8 ml/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
API laadimise nimi corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12 süvendiga plaadid
Tootja Corning
Tehnilised andmed
12 süvend 6.9 ml/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
API laadimise nimi corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24 süvendiga plaadid
Tootja Corning
Tehnilised andmed
24 süvend 3.4 ml/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
API laadimise nimi corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48 süvendiga plaadid
Tootja Corning
Tehnilised andmed
48 süvend 1.6 ml/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
API laadimise nimi corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
96 süvendiga plaadid
Tootja Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA teaduslik
Tehnilised andmed
96 süvend 200 µL/süvend Ringikujulised süvendid, V põhi
96 süvend 360 µL/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
96 süvendit 100 µl/süvend Ringikujulised süvendid, V-põhjaline PCR täisääris
96 süvend 200 µL/süvend Ringikujulised, lameda põhjaga süvendid
96 sügavat süvendit 2000 µl/süvend Ruudukujulised süvendid, V põhi
Tugev 96 süvendiga 200 µl/süvend Ringikujulised süvendid, V põhjaga PCR täisääris
Nunc 96 sügavat süvendit 1300 µL süvendi kohta Ringikujulised süvendid, U põhi
Nunc 96 sügavat süvendit 2000 µL süvendi kohta Ringikujulised süvendid, U põhi
96 sügavat süvendit 2.4 ml/süvend Ruudukujulised süvendid, U-põhi
API laadimise nimi biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_seelik
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ seelik
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
5. PEATÜKK: LABVARA
384 süvendiga plaadid
Tootja Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Tehnilised andmed
384 süvend 40 µL/süvend Ringikujulised süvendid, V põhi
384 süvend 50 µL/süvend Ringikujulised süvendid, V põhi
384 süvendit 112 µl/süvend Nelinurksed süvendid, lame põhi
Rakendatud API laadimisnimibiosystemsmicroamp_384_ kaevuplaat_40ul biorad_384_kaevuplaat_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Kaevuplaadi adapterid
Allpool loetletud alumiiniumplaadid on Opentrons Heater-Shaker GEN1 mooduli termoadapterid. Neid eraldiseisvaid adapteri määratlusi saate kasutada Opentroni kontrollitud või kohandatud laborivara laadimiseks Heater-Shakeri peale.
Adapteri tüüp Opentrons Universaalne lame soojendi-shakeri adapter Opentrons 96 PCR soojendi-shakeri adapter Opentrons 96 sügava kaevuga soojendi-shakeri adapter Opentrons 96 lameda põhjaga kütte-shakeri adapter
API laadimise nimi opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Samuti saate laadida nii adapteri kui ka laborivara ühe määratlusega. Meie Labware Library sisaldab mitmeid eelkonfigureeritud termoadapteri ja laborivara kombinatsioone, mis muudavad Heater-Shakeri kohe karbist võttes kasutusvalmis.
86
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Märkus. Ärge kasutage kombineeritud määratlust, kui peate protokolli ajal kas haaratsiga või käsitsi laborivara Heater-Shakerile liigutama või sellelt maha võtma. Kasutage selle asemel eraldiseisvat adapteri määratlust.
Adapteri/laborivara kombinatsioon
API laadimise nimi
Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter NEST Deep Well plaadiga 2 ml
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 lamedapõhjaline soojendi-raputi adapter NEST 96 süvendiga plaadiga, 200 µl lame
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR kuumutus-shakeri adapter NEST süvendiplaadiga 100 µl
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentronsi universaalne lame kütte-shakeri adapter Corningi 384 süvendiga plaadiga 112 µl lame
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adaptereid saab osta otse Opentronsist aadressil https://shop.opentrons.com.
Kaevude plaadid ja API määratlused
Opentrons Labware Library määratleb ülaltoodud kaevuplaatide omadused eraldi JSON-is files. Flexi robot ja Opentrons Python API tuginevad nendele JSON-i määratlustele, et töötada koos teie protokollide kasutatava laborivaraga. Näiteksample, API-ga töötades aktsepteerib funktsioon ProtocolContext.load_labware neid laborivara nimesid teie koodi kehtivate parameetritena. Lingitud API laadimisnimed ühenduvad Opentronsi GitHubi hoidlas oleva kaevuplaadi laborivara määratlustega.
Kohandatud kaevuplaadi laborinõud
Proovige kasutada Opentrons Labware Creatorit, et teha kohandatud laborivara definitsioon, kui kaevuplaati, mida soovite kasutada, pole siin loetletud. Kohandatud definitsioon ühendab JSON-is kõik mõõtmed, metaandmed, kujundid, mahutavuse ja muu teabe file. Opentrons Flex loeb seda teavet, et mõista, kuidas teie kohandatud laborivaraga töötada. Lisateabe saamiseks vaadake jaotist Kohandatud laborivara definitsioonid.
OPENTRONS FLEX
87
5. PEATÜKK: LABVARA
5.4 Otsikud ja otsariiulid
Opentrons Flexi otsikud on 50 µL, 200 µL ja 1000 µL suurustes. Need on läbipaistvad, mittejuhtivad polüpropüleenotsad, mis on saadaval filtritega või ilma. Need on pakendatud steriilselt riiulitesse, millel on 96 otsa ja mis ei sisalda DNaasi, RNaasi, proteaasi, pürogeene, inimese DNA-d, endotoksiine ega PCR inhibiitoreid. Riiulitel on ka partii numbrid ja aegumiskuupäevad.
Flexi pipetiotsad töötavad Opentrons Flex 50 µL ja 1000 µL pipettidega 1-, 8- ja 96-kanalilistes konfiguratsioonides. Kuigi võite 50 l ja 1000 l pipettide külge panna mis tahes Flexi otsikuid, proovige ots sobitada pipeti nimimahuga. Näiteksamp1000 L otsiku panemine 50 L pipetile võib olla veider. 1000 L pipeti jaoks võiks kindlasti kasutada 50 L, 200 L või 1000 L otsikut.
Otsariiulid
Filtreerimata ja filtreeritud otsikud on komplekteeritud riiulisse, mis koosneb korduvkasutatavast alusplaadist, 96 otsikut mahutavast keskplaadist ja kaanest.
Otsiriiul mahu järgi 50 µL 200 µL 1000 µL
API laadimise nimi
Filtreerimata: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtreeritud: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Filtreerimata: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtreeritud: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Filtreerimata: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtreeritud: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Identifitseerimise hõlbustamiseks on otsikuriiuli keskplaadid värvikoodiga vastavalt otsa suurusele:
50 µL: magenta 200 l: kollane 1000 µL: sinine
88
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Tellimisel või ümbertellimisel on otsikud ja nagid kahes erinevas pakendatud konfiguratsioonis:
Riiulid: koosnevad eraldi kokkutõmbunud otsteriiulitest (alusplaat, otstega keskplaat ja kaas). Rack-konfiguratsioonid on parimad, kui puhtus on ülimalt tähtis, et vältida ristsaastumist või kui teie protokollid ei võimalda alusplaadi või komponentide korduskasutamist.
Täitematerjalid: koosnevad ühest täielikust otsakuriiulist (alusplaat, keskplaat koos otstega ja kaanega) ja üksikutest otsikukonteinerid. Täitmise konfiguratsioonid on parimad, kui teie protokollid võimaldavad alusplaadi või komponentide taaskasutamist.
Tippette ühilduvus
Flex pipetiotsad on mõeldud Opentrons Flex pipettide jaoks. Flexi otsikud ei ühildu Opentronsi OT-2 pipettidega, samuti ei saa Flex pipettide puhul kasutada OT-2 otsikuid.
Flexi pipettide puhul võivad töötada ka teised tööstusstandarditele vastavad otsad, kuid see pole soovitatav. Optimaalse jõudluse tagamiseks peaksite koos Flex pipettidega kasutama ainult Opentrons Flex otsikuid.
Otsaraami adapter
96 kanaliga pipeti jaoks on vaja adapterit, et korralikult kinnitada kogu otsikute riiulit. Kinnitusprotseduuri ajal liigub pipett üle adapteri, langeb kinnitustihvtide peale ja tõmbab otsikud pipettide külge, tõstes adapterit ja otsariiulit.
OPENTRONS FLEX
89
5. PEATÜKK: LABVARA
Märkus. Kasutage otsakuriiuli adapterit ainult siis, kui korjate korraga üles terve otsakuriiuli. Kui võtate vähem otsikuid, asetage otsikuriiulid otse tekile.
Hoiatus: muljumise oht. Pipetti pipetiotsikute kinnitamise ajal hoidke käed otsariiuli adapterist eemal.
Adapteri tüüp Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
API laadimise nimi opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Otsaraami adapter ühildub Opentrons Flex Gripperiga. Haaratsit saab kasutada värskete otsariiulite asetamiseks adapterile või kasutatud otsariiulite korjamiseks ja prügirenni teisaldamiseks.
5.5 Torud ja toruriiulid
Opentrons 4-in-1 Tube Rack süsteem töötab vaikimisi Opentrons Flexiga. 4-in-1 toruriiuli kasutamine aitab vähendada teie ettevalmistustööde koormust, sest selle pakutavad kombinatsioonid on kohe karbist võttes automatiseerimiseks valmis. Lisateavet leiate ka Opentronsi laboriraamatukogust.
90
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Toru ja riiuli kombinatsioonid
Opentrons 4-in-1 toruriiul toetab mitmesuguseid torude suurusi, üksikult või erineva suuruse (mahu) kombinatsioonina. Nende hulka kuuluvad: 6 katsutiga riiul 50 ml katsutidele (6 x 50 ml). 10 katsutiga kombineeritud riiul neljale 50 ml katsutile ja kuuele 15 ml katsutile (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). 15 katsutiga riiul 15 ml katsutitele (15 x 15 ml). 24 katsutiga raam 0.5 ml, 1.5 ml või 2 ml tuubi jaoks (24 x 0.5 ml, 1.5 ml, 2 ml).
Märkus. Kõik torud on silindrilised V-kujulise (koonilise) põhjaga, kui pole märgitud teisiti.
6-torulised nagid
Toru tüüp 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-torulised nagid
Toru tüüp 4 Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml
API laadimise nimi opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
5. PEATÜKK: LABVARA
15-torulised nagid
Toru tüüp 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
API laadimise nimi opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24-torulised nagid
Toru tüüp
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, U-kujuline põhi 24 üldine 2 ml keeratav kork 24 NEST 0.5 ml keeratav kork 24 NEST 1.5 ml keeratav kork 24 NEST 1.5 ml keeratav kork 24 NEST2 mL keeratav kork NEST 24 ml klõpsuga kork, U-kujuline põhi
API laadimise nimi opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Toruriiuli API määratlused
Opentrons Labware Library määratleb ülaltoodud toruriiulite omadused eraldi JSON-is files. Flexi robot ja Opentrons Python API tuginevad nendele JSON-i määratlustele, et töötada koos teie protokollide kasutatava laborivaraga. Näiteksample, API-ga töötades aktsepteerib funktsioon ProtocolContext.load_labware neid laborivara nimesid teie koodi kehtivate parameetritena. Lingitud API laadimisnimed ühenduvad Opentronsi GitHubi hoidlas oleva toruriiuli laborivara definitsioonidega.
92
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Kohandatud toruriiuli laborinõud
Proovige luua kohandatud laborivara definitsioon Opentrons Labware Creatori abil, kui soovitud toru ja riiuli kombinatsiooni pole siin loetletud. Kohandatud definitsioon ühendab JSON-is kõik mõõtmed, metaandmed, kujundid, mahutavuse ja muu teabe file. Opentrons Flex loeb seda teavet, et mõista, kuidas teie kohandatud laborivaraga töötada. Lisateabe saamiseks vaadake jaotist Kohandatud laborivara definitsioonid.
5.6 Alumiiniumplokid
Alumiiniumplokid tarnitakse koos temperatuurimooduliga GEN2 ja neid saab osta eraldi kolmeosalise komplektina. Komplekt sisaldab lameda põhjaga plaati, 24 süvendiga plokki ja 96 süvendiga plokki.
Opentrons Flex kasutab s hoidmiseks alumiiniumplokkeample torud ja kaevuplaadid temperatuurimoodulil või otse tekil. Temperatuurimooduliga kasutamisel võivad alumiiniumplokid hoida teie samptuubid, PCR-ribad või plaadid konstantsel temperatuuril vahemikus 4 °C kuni 95 °C.
Lameda põhjaga plaat
Flexi tasapinnaline plaat tarnib koos temperatuurimooduli korpusega ja ühildub erinevate ANSI/SLAS standardsete kaevuplaatidega. See tasane plaat erineb plaadist, mis tarnitakse koos temperatuurimooduli enda või eraldi kolmeosalise komplektiga. Sellel on laiem tööpind ja faasitud nurgaklambrid. Need funktsioonid aitavad parandada Opentrons Flex Gripperi jõudlust laborinõu plaadile või sellelt eemaldamisel.
Saate aru, milline lame põhjaplaat teil on, sest Flexi jaoks mõeldud plaadi ülemisel pinnal on kiri "Opentrons Flex". OT-2 jaoks mõeldud mitte.
OPENTRONS FLEX
93
5. PEATÜKK: LABVARA
24 süvendiga alumiiniumplokk
24 süvendiga plokki kasutatakse üksikute sample viaalid. Näiteksample, see aktsepteerib sampviaalid, mis:
V-kujulise või U-kujulise põhjaga. Kinnitage sisu klõpsatava või keeratava korgiga. Hoidke vedelikku mahuga 0.5 ml, 1.5 ml ja 2 ml.
96 süvendiga alumiiniumplokk
96-süvendiline plokk toetab mitmesuguseid kaevuplaatide tüüpe. Näiteksample, see võtab vastu kaevuplaate, mis on:
Suurematelt kaevuplaatide tootjatelt nagu Bio-Rad ja NEST.
Disainitud V-kujulise põhjaga, U-kujulise põhjaga või lameda põhjaga.
Kavandatud 100 µL või 200 µL süvenditega.
See ühildub ka üldiste PCR-ribadega.
Eraldiseisvad adapterid
Termoplokk Flex lamedapõhjaline plaat 24 süvendiga alumiiniumplokk 96 süvendiga alumiiniumplokk
API laadimise nimi opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Vaadake allpool laborivara kombinatsioone. opentrons_96_well_alumiiniumplokk
Alumiiniumplokkide laborinõude kombinatsioonid
Opentrons Labware Library toetab järgmisi plokkide, viaalide ja kaevuplaatide kombinatsioone, mis on samuti määratletud eraldi JSON-laborivara definitsioonis files. Flexi robot ja Opentrons Python API
94
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
toetuge nendele JSON-i määratlustele, et töötada koos teie protokollides kasutatava laborivaraga. Näiteksample, API-ga töötades aktsepteerib funktsioon ProtocolContext.load_labware neid laborivara nimesid teie koodi kehtivate parameetritena. Allolevates tabelites on loetletud ploki/konteineri vaikekombinatsioonid ja nendega seotud API laadimisnimed. Lingid ühenduvad vastavate JSON-i definitsioonidega Opentronsi GitHubi hoidlas.
Märkus. Kõikidel torudel on V-kujuline põhi, kui pole märgitud teisiti.
24 süvendiga alumiiniumplokkidest laborinõude kombinatsioonid
24 süvendiga ploki sisu Üldine 2 ml keeratav kork NEST 0.5 ml keeratav kork NEST 1.5 ml keeratav kork NEST 1.5 ml keeratav kork NEST 2 ml keeratav kork NEST 2 ml keeratav kork, U-kujuline põhi
API laadimisnimi opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_aluminumblock_nest_24ml. kruvikork opentrons_2_aluminumblock_nest_24ml_snapcap
96 süvendiga alumiiniumplokkidest laborinõude kombinatsioonid
96-augulise ploki sisu Bio-Rad süvendi plaat 200 µL üldine PCR riba 200 µL NEST süvendi plaat 100 µL
API laadimise nimi opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
5. PEATÜKK: LABVARA
5.7 Labware ja Opentrons Flex Gripper
Kuigi Opentrons Flex töötab kogu Labware Library'i varuga, ühildub Opentrons Flex Gripper ainult teatud laborivaraüksustega. Praegu on Gripper optimeeritud kasutamiseks järgmiste laboritarvikutega.
Laboratooriumi kategooria Sügavad kaevuplaadid Täielikult seelikuga 96 kaevuplaadid
Otsahoidjad (filtrimata ja filtreeritud otsikud)
Kaubamärgid
NEST 96 sügava kaevu plaat 2 ml
Opentrons Tough 96 süvendiga plaat 200 µL PCR täisseelik NEST 96 süvendiga plaat 200 µL lame
Opentrons Flex 96 otsik, 50 µL Opentrons Flex 96 otsik, 200 µL Opentrons Flex 96 otsaku 1000 µL
Märkus. Parimate tulemuste saavutamiseks kasutage Flex Gripperit ainult ülaltoodud laborivarustusega. Flex Gripper võib töötada koos muu ANSI/SLAS automatiseerimisega ühilduva laborivaraga, kuid see pole soovitatav.
5.8 Kohandatud laborivara määratlused
Nagu selle peatüki alguses arutatud, on kohandatud laborivara laborivara, mida Opentronsi laboriraamatukogus pole loetletud. Saate Flexiga kasutada muid levinud või ainulaadseid laborivaraüksusi, mõõtes ja salvestades täpselt selle objekti omadused ning salvestades need andmed JSON-i. file. Rakendusse importimisel kasutavad Flex ja API neid JSON-andmeid teie laborivaraga suhtlemiseks. Opentrons pakub tööriistu ja teenuseid, mida me allpool uurime, et aidata teil kasutada Flexi kohandatud laborivaraga.
96
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
Kohandatud laborivara määratluste loomine
Opentroni tööriistad ja teenused aitavad kohandatud laborivara teie käeulatusse viia. Need funktsioonid vastavad erinevatele oskuste tasemetele ja tööviisidele. Oma laborivara loomine ja selle kasutamine koos Opentrons Flexiga aitab muuta robotist teie labori mitmekülgseks ja võimsaks lisandiks.
KOHALDATUD LABVARA LOOJA
Custom Labware Creator on koodivaba, web-põhine tööriist, mis kasutab graafilist liidest, mis aitab teil laborivara määratlust luua file. Labware Creator loob JSON-laborivara definitsiooni file mille impordite rakendusse Opentrons. Pärast seda on teie kohandatud laborivara saadaval Flexi robotile ja Pythoni API-le.
KOHALDATUD LABVARA TEENUS
Võtke meiega ühendust, kui laborivara, mida soovite kasutada, pole teegis saadaval, kui te ei saa ise definitsioone luua või kui kohandatud üksus sisaldab erineva kuju, suurusega või muid allpool kirjeldatud ebakorrapärasusi.
Labware Creatoris määratletav laborivara
; Kaevud ja torud on ühtlased ja identsed. ; Kõik read on ühtlaselt paigutatud
(ridade vaheline ruum on võrdne).
; Kõik veerud on võrdsete vahedega (veergude vaheline ruum on võrdne).
; Mahub ideaalselt ühte tekipesasse.
Labware Opentrons peab defineerima ; Kaevude ja torude kuju on erinev. ; Ridad pole ühtlaselt paigutatud.
; Veerud ei ole ühtlaselt paigutatud.
; Väiksem kui üks tekipesa (vajab adapterit) või hõlmab mitut tekipesa.
OPENTRONS FLEX
97
5. PEATÜKK: LABVARA
Siin on mõned diagrammid, mis aitavad teil endist visualiseeridaampvähem kirjeldatud eespool. Tavaline Kõik veerud on võrdsete vahedega ja kõik read on võrdsete vahedega. Veergudel ei pea olema sama vahekaugust kui ridadel.
Tavaline Võre ei pea olema laborinõude keskel.
Ebakorrapärased read on ühtlaselt paigutatud, kuid veerud pole võrdsete vahedega.
Ebakorrapärased Veerud/read on ühtlaselt paigutatud, kuid süvendid ei ole identsed.
Ebaregulaarne Võrgustikku on rohkem kui üks.
Meie laborivara meeskond töötab selle nimel, et mõista teie vajadusi ja kujundada teie jaoks kohandatud laborivara määratlused. Lisateabe saamiseks vaadake tugiartikleid Kohandatud laborivara definitsiooni taotlemine ja kohandatud laborivara taotluse vormi. See on tasuline teenus.
98
OPENTRONS FLEX
5. PEATÜKK: LABVARA
PYTHON API
Kuigi te ei saa meie API-ga kohandatud laborivara luua, saate kohandatud laborivara kasutada saadaolevate API-meetoditega. Siiski peate esmalt määratlema oma kohandatud laborivara ja importima selle Opentronsi rakendusse. Kui olete oma laborivara Opentronsi rakendusse lisanud, on see Pythoni API-le ja robotile saadaval. Lisateabe saamiseks vaadake Pythoni API dokumentatsiooni jaotist Kohandatud labori definitsioonid. Lisateavet API-ga protokolliskriptide kirjutamise kohta leiate peatüki Protokolli arendus jaotisest Pythoni protokolli API.
JSONi laborivara skeem
JSON file on Opentroni standardse ja kohandatud laborivara plaan. See file sisaldab ja korraldab laborivara andmeid vastavalt vaikeskeemiga määratud disaini spetsifikatsioonidele.
Skeem on raam
Dokumendid / Ressursid
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex avatud lähtekoodiga vedelikukäitlusrobot [pdfKasutusjuhend FLEX Opentrons Flex avatud lähtekoodiga vedeliku käitlemise robot, FLEX, Opentrons Flex avatud lähtekoodiga vedelike käitlemise robot, Flex avatud lähtekoodiga vedeliku käitlemise robot, avatud lähtekoodiga vedeliku käitlemise robot, allika vedeliku käitlemise robot, vedeliku käitlemise robot, käitlemisrobot, robot |