FLEX Opentrons Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka Flex

Opentron Fleksibel

Spesifikasi:

  • Spesifikasi Umum: Lorem ipsum sakit parah
    amet, membentuk elit yang unggul. Sed do eiusmod tempor kejadian
    ut labore dan dolore magna aliqua.
  • Spesifikasi Lingkungan: Lorem ipsum
    dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod temporer
    insiden ut labore dan dolore magna aliqua.
  • Sertifikasi: Lorem ipsum dolor sit amet,
    membentuk elit adipiscing. Sed do eiusmod temporer kejadiannya
    labore dan dolore magna aliqua.
  • Nomor seri: XXX-XXXX-XXXX

Petunjuk Pemakaian Produk:

1. Pemasangan dan Kalibrasi Instrumen:

Ikuti langkah-langkah yang diuraikan dalam manual pipet dan gripper
instalasi.

2. Relokasi:

Untuk gerakan pendek, lihat bagian 2.5 dalam manual. Untuk
pergerakan jarak jauh, ikuti pedoman yang diberikan. Pergerakan umum
saran juga tersedia.

3. Koneksi:

Pastikan sambungan daya yang benar seperti yang dijelaskan secara rinci dalam manual.
Hubungkan USB dan perangkat tambahan sesuai kebutuhan. Koneksi jaringan
harus ditetapkan mengikuti instruksi.

4. Perancang Protokol:

Pahami persyaratan untuk Perancang Protokol dan pelajari caranya
untuk merancang protokol baru atau memodifikasi protokol yang sudah ada sesuai lab Anda
persyaratan.

5. API Protokol Python:

Jelajahi menulis dan menjalankan skrip menggunakan Python Protocol API.
Temukan fitur eksklusif Python untuk meningkatkan fungsionalitas.

6. Protokol OT-2:

Pelajari tentang protokol OT-2 Python, protokol OT-2 JSON, dan
Protokol Modul Magnetik untuk berbagai jenis eksperimen.

Pertanyaan yang Sering Diajukan (FAQ):

T: Bagaimana cara mengatasi masalah jika robot tidak bergerak seperti
mengharapkan?

J: Periksa sambungan listrik, pastikan kalibrasi yang benar
instrumen, dan pastikan tidak ada penghalang di dalamnya
jalur robot.

T: Dapatkah saya menggunakan pipet khusus dengan Opentrons Flex?

J: Opentrons merekomendasikan penggunaan pipet yang kompatibel agar optimal
kinerja dan akurasi.

Opentron Fleksibel
Manual Instruksi
Opentrons Labworks Inc.
Desember 2023

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Nama terdaftar, merek dagang, dll. yang digunakan dalam dokumen ini, meskipun tidak ditandai secara khusus, tidak dianggap tidak dilindungi oleh hukum.

Daftar isi
Kata Pengantar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktur manual ini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Catatan dan peringatan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Bab 1 PENDAHULUAN . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Selamat Datang di Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Apa yang baru di Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 stasiun kerja fleksibel. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Informasi keselamatan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Simbol keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Peringatan keselamatan listrik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Peringatan keselamatan tambahan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Peringatan keselamatan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Keamanan biologis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Asap beracun . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Cairan mudah terbakar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Kepatuhan terhadap peraturan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Keamanan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kompatibilitas elektromagnetik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Peringatan dan catatan FCC. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kepatuhan ISED Kanada. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Peringatan lingkungan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Prasertifikasi Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Bab 2: Instalasi dan Relokasi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Persyaratan keselamatan dan pengoperasian . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Di mana menempatkan Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Konsumsi daya. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Kondisi lingkungan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Membuka Kotak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Upaya dan waktu yang dibutuhkan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Peti dan bahan pengemas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elemen produk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Bagian 1: Lepaskan peti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Bagian 2: Lepaskan Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Bagian 3: Perakitan akhir dan penyalaan . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 Jalankan pertama kali. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Nyalakan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Menyambungkan ke jaringan atau komputer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Instal pembaruan perangkat lunak. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Pasang Liontin Berhenti Darurat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Beri nama pada robot Anda. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Pemasangan dan kalibrasi instrumen. . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pemasangan pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Pemasangan gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Relokasi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Gerakan pendek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Gerakan jarak jauh. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Saran umum untuk pindah . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Pikiran terakhir tentang pindah. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Bab 3: Deskripsi Sistem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Komponen fisik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Rangka dan penutup. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Dek dan area kerja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 haltagdaerah. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Perlengkapan dek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Saluran pembuangan limbah. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 49 haltagslot area. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sistem pergerakan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Layar sentuh dan tampilan LED. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Spesifikasi pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Kalibrasi pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adaptor rak ujung pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pengambilan ujung sebagian . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Sensor pipet. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pembaruan firmware pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Pencengkeram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Spesifikasi pencengkeram. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibrasi gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Pembaruan firmware gripper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Liontin Berhenti Darurat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kapan menggunakan E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Melibatkan dan melepaskan E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Koneksi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Sambungan listrik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Koneksi USB dan tambahan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Koneksi jaringan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Spesifikasi sistem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Spesifikasi umum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Spesifikasi lingkungan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sertifikasi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Nomor seri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Bab 4: Modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Modul yang didukung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Sistem caddy modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Kalibrasi modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kapan mengkalibrasi modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Cara mengkalibrasi modul. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul Pengocok Pemanas GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Fitur Pengocok Pemanas. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Spesifikasi Pengocok Pemanas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Blok Magnetik GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Fitur Blok Magnetik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Spesifikasi Blok Magnetik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Modul Suhu GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Fitur Modul Suhu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Spesifikasi Modul Suhu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modul Termocycler GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Fitur termocycler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Spesifikasi termosikler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 79
Bab 5: Perangkat Lab. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Konsep perangkat laboratorium. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware sebagai perangkat keras. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware sebagai data. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Peralatan laboratorium khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Waduk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoir sumur tunggal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoir multi-sumur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Definisi reservoir dan API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Peralatan laboratorium reservoir khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Pelat sumur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

pelat 6 lubang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 pelat 12 lubang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 pelat 24 lubang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 pelat 48 sumur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 pelat 96 lubang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 pelat 384 lubang. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Adaptor pelat sumur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Pelat sumur dan definisi API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Peralatan laboratorium pelat sumur khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Tip dan rak tip . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Rak ujung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Kompatibilitas tippipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adaptor rak ujung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Tabung dan rak tabung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinasi tabung dan rak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 rak 6 tabung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 rak 10 tabung. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 rak 15 tabung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 rak 24 tabung . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Definisi API rak tabung. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Peralatan laboratorium rak tabung khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Balok aluminium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Pelat bawah datar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 blok aluminium 24 sumur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 blok aluminium 96 sumur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Adaptor mandiri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinasi peralatan lab blok aluminium. . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinasi peralatan lab blok aluminium 24 sumur. . . . . . . . .95 Kombinasi peralatan lab blok aluminium 96 sumur. . . . . . . . .95 5.7 Labware dan Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Definisi perangkat lab khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Membuat definisi perangkat lab khusus. . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 skema labware JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Definisi perangkat lab JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Bab 6: Pengembangan Protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Protokol yang telah dibuat sebelumnya. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Perpustakaan Protokol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Layanan Pengembangan Protokol Kustom. . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Perancang Protokol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Persyaratan Perancang Protokol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Merancang protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Memodifikasi protokol yang ada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API Protokol Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Menulis dan menjalankan skrip. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 fitur eksklusif Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Protokol OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 protokol Python OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 protokol JSON OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 protokol Modul Magnetik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Bab 7: Perangkat Lunak dan Pengoperasian. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Pengoperasian layar sentuh. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Dasbor robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Manajemen protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Rincian protokol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Jalankan pengaturan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Pemeriksaan Posisi Labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Jalankan kemajuan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Jalankan penyelesaian. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Manajemen instrumen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Pengaturan robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfigurasi dek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Aplikasi Opentron. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalasi aplikasi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Mentransfer protokol ke Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Status dan kontrol modul . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Protokol terbaru berjalan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Pengoperasian lanjutan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Buku Catatan Jupyter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operasi baris perintah melalui SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Bab 8: Pemeliharaan dan Servis. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Membersihkan Flex Anda. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Sebelum Anda mulai. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Apa yang bisa kamu bersihkan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Larutan pembersih. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Pembersihan kusen dan panel jendela . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Pembersihan dek. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Pembersihan gantri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pembersihan saluran pembuangan limbah. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Membersihkan pipet dan tipnya . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminasi pipet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Ujung pipet pembersih . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Membersihkan gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Modul pembersihan. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Pembersihan modul umum . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Segel termosiklik. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Peralatan laboratorium yang aman dalam autoklaf . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Servis Fleksibel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 layanan Opentron. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kualifikasi instalasi dan kualifikasi pengoperasian. . . 155 Pemeliharaan preventif . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garansi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Lampiran A: Glosarium . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Lampiran B: Dokumentasi Tambahan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Pusat Pengetahuan Opentron. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentasi API Protokol Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Referensi HTTP API Opentron. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentasi pengembang . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Lampiran C: Perangkat Lunak Sumber Terbuka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentron di GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentron monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Repositori lainnya . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Lampiran D: Informasi Dukungan dan Kontak . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Penjualan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Dukungan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Informasi bisnis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Kata pengantar
Selamat datang di manual instruksi untuk robot penanganan cairan Opentrons Flex. Panduan ini memandu Anda melalui segala hal yang perlu Anda ketahui untuk menyiapkan dan menggunakan Flex, dengan fokus pada topik yang paling relevan bagi pengguna Flex sehari-hari di lingkungan lab.
Struktur manual ini
Opentrons Flex adalah sistem yang kompleks, jadi ada banyak jalur berbeda untuk mempelajari segala hal yang dapat dilakukannya. Jangan ragu untuk langsung membuka bab yang membahas topik apa pun yang membuat Anda penasaran! Misalnyaampmisalnya, jika Anda sudah menyiapkan Flex di lab Anda, Anda dapat melewati bab Instalasi dan Relokasi.
Jika Anda lebih menyukai pendekatan terpandu, panduan ini disusun sehingga Anda dapat mengikutinya dari awal hingga akhir.
Pelajari tentang Fleksibel. Fitur-fitur yang membedakan Flex tercantum dalam Bab 1: Pendahuluan. Pendahuluan juga mencakup informasi keselamatan dan peraturan yang penting.
Mulailah dengan Fleksibel. Jika Anda perlu mengatur Flex Anda, ikuti petunjuk rinci di Bab 2: Instalasi dan Relokasi. Kemudian biasakan diri Anda dengan komponen Flex di Bab 3: Deskripsi Sistem.
Siapkan dek Anda. Mengonfigurasi dek memungkinkan aplikasi ilmiah yang berbeda di Flex. Bab 4: Modul menjelaskan periferal Opentron yang dapat Anda pasang ke dalam atau di atas dek untuk melakukan tugas ilmiah tertentu. Bab 5: Labware menjelaskan cara bekerja dengan peralatan untuk menampung cairan.
Jalankan protokol. Penggunaan inti Flex adalah menjalankan prosedur ilmiah standar, yang dikenal sebagai protokol. Bab 6: Pengembangan Protokol menawarkan beberapa cara untuk mendapatkan protokol siap pakai atau merancangnya sendiri. Untuk menjalankan protokol Anda, ikuti instruksi di Bab 7: Perangkat Lunak dan Pengoperasian, yang juga berisi instruksi untuk melakukan tugas lain dan menyesuaikan pengaturan robot Anda.
Biarkan Flex tetap berjalan. Ikuti saran di Bab 8: Perawatan dan Servis agar Flex Anda tetap bersih dan berfungsi optimal. Atau daftar ke salah satu layanan Opentrons yang terdaftar di sana dan biarkan kami mengurus Flex untuk Anda.
Pelajari lebih lanjut. Masih membutuhkan sesuatu yang lain? Lihat lampiran. Lampiran A: Glosarium mendefinisikan istilah-istilah terkait Flex. Lampiran B: Dokumentasi Tambahan mengarahkan Anda ke lebih banyak sumber daya untuk produk Opentrons dan menulis kode untuk mengontrol Flex.

FLEKSI TERBUKA

9

KATA PENGANTAR
Lampiran C: Perangkat Lunak Sumber Terbuka menjelaskan bagaimana perangkat lunak Opentrons dihosting di GitHub sebagai sumber daya untuk pengembang dan non-pengembang.
Lampiran D: Informasi Dukungan dan Kontak mencantumkan cara menghubungi Opentrons jika Anda memerlukan bantuan di luar apa yang disediakan dokumentasi kami.
Catatan dan peringatan
Sepanjang manual ini, Anda akan menemukan catatan dan blok peringatan yang diformat khusus. Catatan memberikan informasi berguna yang mungkin tidak terlihat jelas dalam penggunaan Flex biasa. Berikan perhatian khusus pada peringatan – peringatan hanya digunakan dalam situasi di mana Anda menghadapi risiko cedera diri, kerusakan peralatan, kehilangan atau pembusukan.ample atau reagen, kehilangan data, atau bahaya lainnya. Catatan dan peringatan terlihat seperti ini:
Sample Catatan: Ini adalah sesuatu yang harus Anda ketahui, tetapi tidak menimbulkan bahaya apa pun.
Sample Peringatan: Ini adalah sesuatu yang perlu Anda ketahui karena ada risiko yang terkait dengannya.

10

FLEKSI TERBUKA

BAB 1
Perkenalan

Bab ini memperkenalkan Anda pada ekosistem Opentrons Flex, termasuk desain sistem secara keseluruhan dan konfigurasi stasiun kerja yang tersedia. Ini juga mencakup informasi kepatuhan dan keselamatan penting, yang harus Anda ingat kembaliview sebelum menyiapkan robot Opentrons Flex Anda. Untuk rincian lebih lanjut tentang fitur Opentrons Flex, lihat bab Deskripsi Sistem.

1.1 Selamat datang di Opentrons Flex
Opentrons Flex adalah robot penanganan cairan yang dirancang untuk throughput tinggi dan alur kerja yang kompleks. Robot Flex adalah dasar dari sistem modular yang mencakup pipet, gripper peralatan lab, perlengkapan dek, modul di dek, dan peralatan lab — yang semuanya dapat Anda tukar sendiri. Flex dirancang dengan layar sentuh sehingga Anda dapat mengerjakannya langsung di meja lab, atau Anda dapat mengontrolnya dari seluruh lab Anda dengan Aplikasi Opentrons atau API sumber terbuka kami.
Stasiun kerja Flex dilengkapi dengan semua peralatan — robot, perangkat keras, dan peralatan lab — yang Anda perlukan untuk mulai mengotomatiskan tugas-tugas umum di laboratorium. Untuk aplikasi lain, Opentrons Flex berjalan pada perangkat lunak dan firmware sumber terbuka sepenuhnya, dan tidak bergantung pada reagen dan perangkat lab, sehingga memberi Anda kendali atas cara Anda merancang dan menjalankan protokol.

Apa yang baru di Flex
Opentrons Flex adalah bagian dari seri robot pengendali cairan Opentrons. Pengguna Opentrons Flex mungkin akrab dengan Opentrons OT-2, robot pemipetan pribadi kami. Flex melampaui kemampuan OT-2 di beberapa bidang utama, memberikan throughput dan waktu berjalan yang lebih tinggi.

Menampilkan throughput Pipet
Kapasitas pipet dan tip

Keterangan
Pipet fleksibel memiliki 1, 8, atau 96 saluran. Pipet 96 saluran beroperasi pada sumur 12 kali lebih banyak sekaligus dibandingkan pipet OT-2 terbesar.
Pipet fleksibel memiliki rentang volume yang lebih besar (1 µL, 50 µL) dan semuanya dapat bekerja dengan volume tip Opentrons Flex berapa pun. Ini merupakan peningkatan dibandingkan pipet OT-5, yang memiliki rentang lebih kecil dan harus menggunakan ujung dengan rentang volume yang sesuai.

FLEKSI TERBUKA

11

BAB 1: PENDAHULUAN

Gripper Kalibrasi otomatis Caddies Modul Layar Sentuh Slot dek mengoordinasikan Sampah yang dapat dipindahkan Ukuran dan berat

Opentrons Flex Gripper mengambil dan memindahkan peralatan lab di sekitar dek secara otomatis, tanpa campur tangan pengguna. Gripper memungkinkan alur kerja yang lebih kompleks dalam satu protokol yang dijalankan.
Kalibrasi posisi pipet Flex dan gripper sepenuhnya otomatis. Tekan satu tombol, dan instrumen akan berpindah ke titik-titik yang dikerjakan secara presisi di dek untuk menentukan posisi tepatnya, menyimpan data tersebut untuk digunakan dalam protokol Anda.
Flex memiliki antarmuka layar sentuh sendiri yang memungkinkan Anda mengontrolnya secara langsung, selain menggunakan Aplikasi Opentrons. Gunakan layar sentuh untuk memulai menjalankan protokol, memeriksa status pekerjaan, dan mengubah pengaturan langsung di robot.
Modul fleksibel masuk ke dalam caddies yang menempati ruang di bawah dek. Caddies menempatkan peralatan lab Anda lebih dekat ke permukaan dek dan memungkinkan perutean kabel di bawah dek. Caddies memungkinkan lebih banyak lagi konfigurasi modul dan peralatan lab di dek.
Slot dek pada Flex diberi nomor dengan sistem koordinat (A1D4) yang mirip dengan penomoran sumur pada labware.
Tempat sampah dapat ditempatkan di beberapa lokasi dek di Flex. Lokasi default (slot A3) adalah posisi yang direkomendasikan. Anda juga dapat menggunakan gripper untuk membuang sampah ke saluran pembuangan opsional.
Flex sedikit lebih besar dan lebih berat dari OT-2. Tugas instalasi di Flex memerlukan bantuan mitra lab.

Perbandingan detail spesifikasi teknis robot tersedia di Opentrons weblokasi.
Robot Flex dan OT-2 berjalan pada perangkat lunak sumber terbuka kami, dan Aplikasi Opentrons dapat mengontrol kedua jenis robot sekaligus. Meskipun protokol OT-2 tidak dapat dijalankan langsung di Flex, Anda dapat dengan mudah mengadaptasinya (lihat bagian Protokol OT-2 pada bab Pengembangan Protokol untuk detailnya).

Stasiun kerja fleksibel
Stasiun kerja Opentrons Flex mencakup robot Flex, aksesori, pipet dan gripper, modul di dek, dan peralatan laboratorium yang diperlukan untuk mengotomatisasi aplikasi tertentu. Semua komponen stasiun kerja bersifat modular. Jika Anda perlu mengubah aplikasi, Anda dapat menambah atau menukar perangkat keras Flex lain dan bahan habis pakai yang kompatibel.

12

FLEKSI TERBUKA

BAB 1: PENDAHULUAN
STASIUN KERJA NGS
Opentrons Flex NGS Workstation mengotomatiskan persiapan perpustakaan NGS. Ini dapat mengotomatiskan alur kerja pra-pengurutan menggunakan sistem reagen terkemuka apa pun, termasuk fragmentasi- dan tagpersiapan perpustakaan berbasis mentoring.
Selain robot Flex, NGS Workstation meliputi:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
Dua Pipet 8 Saluran (1 µL dan 50 µL) Pipet 5 Saluran (1000 µL) Saluran Limbah Modul Suhu Blok Magnetik Modul Thermocycler Kit laboratorium dengan ujung filter, tabung mikrosentrifugasi, reservoir, dan pelat PCR
STASIUN KERJA PCR
Opentrons Flex PCR Workstation mengotomatiskan pengaturan PCR dan alur kerja thermocycling hingga 96 detikamples. Ini dapat menggunakan reagen dingin dan sampfile ke dalam pelat PCR 96-sumur. Dengan tambahan Modul Thermocycler otomatis, gunakan gripper untuk memasukkan pelat ke dalam Thermocycler, lalu jalankan program PCR pilihan Anda.
Selain robot Flex, PCR Workstation meliputi:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
Pipet 1 Saluran (1 µL) dan Pipet 50 Saluran (8 µL) Pipet 1 Saluran (50 µL) Modul Suhu Saluran Limbah Kit laboratorium dengan ujung filter, tabung mikrosentrifugasi, reservoir, dan pelat PCR

FLEKSI TERBUKA

13

BAB 1: PENDAHULUAN
WORKSTATION EKSTRAKSI ASAM NUKLAT
Stasiun Kerja Ekstraksi Asam Nukleat Opentrons Flex mengotomatiskan isolasi dan pemurnian DNA/RNA. Ia menggunakan Blok Magnetik untuk pemisahan manik-manik magnetik, dan Pengocok Pemanas untuk sample lisis dan resuspensi manik-manik magnetik.
Selain robot Flex, Stasiun Kerja Ekstraksi Asam Nukleat meliputi:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
Pipet 1 Saluran (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Pipet 5 Saluran (1000 µL) Saluran Limbah Modul Pemanas-Pengocok Blok Magnetik Kit lab dengan ujung filter, reservoir, pelat PCR, dan pelat sumur dalam
WORKSTATION PEMURNIAN PROTEIN MANIK MAGNETIK
Stasiun Kerja Pemurnian Protein Manik Magnetik Opentrons Flex mengotomatiskan pemurnian protein skala kecil dan proteomikample persiapan hingga 96 detikamples. Ini kompatibel dengan banyak reagen berbasis manik magnetik yang populer.
Selain robot Flex, Stasiun Kerja Pemurnian Protein meliputi:
Gripper Pilihan konfigurasi pipet
Pipet 1 Saluran (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Pipet 5 Saluran (1000 µL) Saluran Limbah Modul Pemanas-Pengocok Blok Magnetik Kit lab dengan ujung filter, reservoir, pelat PCR, dan pelat sumur dalam
STASIUN KERJA PERSIAPAN FLEX
Opentrons Flex Prep Workstation mengotomatiskan alur kerja pemipetan sederhana. Konfigurasikan stasiun kerja dengan Pipet 1 Saluran dan 8 Saluran untuk melakukan tugas seperti sample transfer, sample duplikasi, dan

14

FLEKSI TERBUKA

BAB 1: PENDAHULUAN
alikuot reagen. Konfigurasikan stasiun kerja dengan Pipet 96 Saluran untuk melakukan aliquoting reagen throughput tinggi dan st pelatamping.
Selain robot Flex, Flex Prep Workstation meliputi:
Pilihan konfigurasi pipet: Pipet 1 Saluran (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Pipet 5 Saluran (1000 µL)
Kit peralatan lab dengan ujung filter, tabung mikrosentrifugasi, dan reservoir
STASIUN KERJA PERSIAPAN PLASMID
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation mengotomatiskan alur kerja ekstraksi dan pemurnian plasmid berbasis manik magnetik. Stasiun kerja ini dilengkapi dengan pipet bervolume tinggi, Modul Pengocok Pemanas, dan Blok Magnetik untuk mengakomodasi sebagian besar bahan kimia berbasis manik.
Selain robot Flex, Stasiun Kerja Persiapan Plasmid meliputi:
Pipet 1 Saluran Gripper (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Kit Labware Modul Pengocok Pemanas Blok Magnetik Saluran Limbah dengan ujung filter, tabung mikrosentrifugasi, reservoir, pelat PCR, dan pelat sumur dalam
STASIUN KERJA SYNBIO
Opentrons Flex SynBio Workstation mengotomatiskan berbagai alur kerja biologi sintetik seperti sintesis dan kloning DNA. Ia menggunakan Blok Magnetik dan Modul Suhu untuk mendukung sebagian besar kimia berbasis manik. Tambahkan Modul Thermocycler untuk melakukan inkubasi tutup yang dipanaskan dan amplifikasi.
Selain robot Flex, SynBio Workstation mencakup:
Pipet 1 Saluran Gripper (5 µL) dan Pipet 1000 Saluran (8 µL) Modul Suhu Blok Magnetik

FLEKSI TERBUKA

15

BAB 1: PENDAHULUAN

Kit peralatan lab dengan tip reguler dan filter, tabung mikrosentrifugasi, reservoir, pelat PCR, dan pelat sumur dalam

1.2 Informasi keselamatan
Robot penanganan cairan Opentrons Flex telah dirancang untuk pengoperasian yang aman. Lihat spesifikasi dan pedoman kepatuhan di bagian ini untuk memastikan penggunaan Flex Anda secara aman. Pedoman ini mencakup penggunaan koneksi input dan output yang aman untuk produk, termasuk koneksi daya dan data, serta label peringatan yang terdapat pada robot Flex dan perangkat keras terkait. Menggunakan perangkat dengan cara selain yang ditentukan dalam manual ini dapat membahayakan pengguna dan peralatan.

Simbol keselamatan
Berbagai label pada Flex dan dalam manual ini memperingatkan Anda tentang sumber potensi cedera atau bahaya.

Simbol

Keterangan
Peringatan: Memperingatkan pengguna akan kondisi yang berpotensi berbahaya. Tindakan yang dapat mengakibatkan cedera atau kematian.
Perhatian: Memperhatikan pengguna terhadap Kerusakan pada peralatan. Data hilang atau rusak. Gangguan yang tidak dapat dipulihkan pada operasi yang sedang dilakukan.
Sengatan listrik: Mengidentifikasi komponen instrumen yang mungkin menimbulkan risiko sengatan listrik jika instrumen tidak ditangani dengan benar.

Permukaan panas: Mengidentifikasi komponen instrumen yang menimbulkan risiko cedera diri akibat panas/suhu tinggi jika instrumen tidak ditangani dengan benar.

Titik jepit: Mengidentifikasi komponen instrumen yang dapat menimbulkan risiko cedera saat bergerak.

16

FLEKSI TERBUKA

BAB 1: PENDAHULUAN

Anda akan menemukan label berikut di Flex:
Label kekayaan intelektual Label kepatuhan terhadap peraturan (misalnya, ETL) Label bahaya listrik Label peringatan umum Label produk Label titik jepit Vol tinggitage label Label peringkat daya

Peringatan keselamatan listrik
Selalu perhatikan peringatan keselamatan listrik berikut:

Simbol

Keterangan
Hubungkan robot ke sirkuit Kelas 1 yang diarde. Lihat bagian Sambungan Daya di bab Deskripsi Sistem.

Jangan menyambung (menyambung), mencabut (mencabut), atau menggunakan kabel listrik AC jika: Kabel terkoyak atau rusak. Kabel, kabel, atau stopkontak lain yang terpasang terkelupas atau rusak.
Penggunaan kabel listrik yang rusak dapat menyebabkan bahaya sengatan listrik yang mengakibatkan cedera serius atau kerusakan pada robot.
Jangan mengganti kabel daya AC kecuali atas arahan Dukungan Opentrons.

Untuk informasi lebih lanjut mengenai kebutuhan kelistrikan, lihat bagian Konsumsi Daya pada bab Instalasi dan Relokasi.

FLEKSI TERBUKA

17

BAB 1: PENDAHULUAN

Peringatan keselamatan tambahan
Selalu perhatikan peringatan keselamatan tambahan berikut:

Simbol

Keterangan
Opentrons Flex belum disertifikasi untuk digunakan dengan cairan yang mudah meledak atau mudah terbakar. Jangan memuat pelat, tabung, atau botol berisi cairan yang mudah meledak atau mudah terbakar ke dalam robot atau mengoperasikan instrumen dengan cairan yang mudah meledak atau mudah terbakar di dalam wadahnya.
Gunakan praktik laboratorium yang baik dan ikuti tindakan pencegahan pabrik saat bekerja dengan bahan kimia. Opentrons tidak bertanggung jawab atau berkewajiban atas segala kerusakan karena, atau akibat dari, penggunaan bahan kimia berbahaya.

Flex memiliki berat 88.5 kg (195 lbs). Alhasil, dibutuhkan dua orang untuk mengangkat dan memindahkannya dengan aman. Lihat bagian Relokasi pada bab Instalasi dan Relokasi.

Flex harus ditempatkan pada permukaan yang mampu menopang beratnya sebesar 88.5 kg (195 lbs) dengan luas permukaan yang cukup untuk menampung robot ditambah jarak jarak minimum (20 cm/8 inci). Lihat bagian Persyaratan Keselamatan dan Pengoperasian di bab Pemasangan dan Relokasi.
Flex dapat mengeluarkan getaran saat beroperasi. Tempatkan robot pada permukaan yang kokoh, rata, dan kedap air dengan penyangga silang atau sambungan las. Lihat bagian Persyaratan Keselamatan dan Pengoperasian di bab Pemasangan dan Relokasi.

Peringatan keselamatan
Untuk membantu melindungi Flex dari kerusakan, ikuti tindakan pencegahan berikut:

18

FLEKSI TERBUKA

BAB 1: PENDAHULUAN

Simbol

Keterangan
Gunakan perangkat lab yang sesuai dengan ANSI/SLAS atau disetujui oleh Opentrons. Lihat bab Labware.
Jauhkan bahan korosif, bahan, atau bahan merusak lainnya dari robot.

Keamanan biologis
Perlakukan spesimen dan reagen yang mengandung bahan yang diambil dari manusia sebagai agen yang berpotensi menularkan. Opentrons merekomendasikan penggunaan prosedur laboratorium yang aman seperti yang dijelaskan dalam Keamanan Hayati di Laboratorium Mikrobiologi dan Biomedis (BMBL) Edisi ke-6.
Dalam keadaan normal, Flex tidak menghasilkan aerosol yang terdeteksi dari cairan sumber. Namun, dalam kondisi tertentu, aerosol dapat dihasilkan dari cairan sumber. Saat mengoperasikan dengan sumber cairan dengan tingkat keamanan hayati 2 atau lebih tinggi, pertimbangkan untuk mengambil tindakan pencegahan terhadap paparan aerosol, sesuai dengan badan pengawas setempat. Untuk meminimalkan potensi risiko paparan aerosol dari robot, pastikan Anda:
Lakukan perawatan seperti yang dijelaskan dalam bab Perawatan dan Servis. Pasang dan amankan semua penutup instrumen, pipet, modul, dan peralatan lab dengan benar. Gunakan teknik pemipetan yang tepat untuk membantu mitigasi aerosol.
Asap beracun
Jika Anda bekerja dengan pelarut yang mudah menguap atau zat beracun, gunakan sistem ventilasi laboratorium yang efisien untuk menghilangkan uap yang mungkin dihasilkan.
Cairan yang mudah terbakar
Flex belum dievaluasi untuk digunakan dengan cairan yang mudah terbakar dan tidak boleh digunakan dengan cairan yang mudah terbakar.

FLEKSI TERBUKA

19

BAB 1: PENDAHULUAN

1.3 Kepatuhan terhadap peraturan
Opentrons Flex mematuhi semua persyaratan yang berlaku dari standar keselamatan dan elektromagnetik berikut.

Keamanan
ID Aturan IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Judul
Persyaratan Keselamatan Peralatan Listrik untuk Pengukuran, Pengendalian, dan Penggunaan Laboratorium Bagian 1: Persyaratan Umum
Persyaratan khusus untuk peralatan laboratorium untuk pencampuran dan pengadukan

Kompatibilitas elektromagnetik

ID Peraturan EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Bagian 15 Subbagian B Kelas A IC ICES-003

Judul
Peralatan Listrik untuk Pengukuran, Pengendalian, dan Penggunaan Laboratorium Persyaratan EMC Bagian 1: Persyaratan Umum Radiator yang Tidak Disengaja
Manajemen Spektrum dan Interferensi Telekomunikasi yang Menyebabkan Peralatan Standar Peralatan Teknologi Informasi (Termasuk Aparatur Digital)

Peringatan dan catatan FCC
Peringatan: Perubahan atau modifikasi pada unit ini yang tidak disetujui secara tegas oleh Opentrons dapat membatalkan kewenangan pengguna untuk mengoperasikan peralatan.
Perangkat ini mematuhi Bagian 15 peraturan FCC. Pengoperasiannya tunduk pada hal-hal berikut:

20

FLEKSI TERBUKA

BAB 1: PENDAHULUAN
Perangkat ini tidak boleh menyebabkan interferensi berbahaya. Perangkat ini harus menerima setiap interferensi yang diterima, termasuk interferensi yang dapat menimbulkan hal yang tidak diinginkan
operasi.
Catatan: Peralatan ini telah diuji dan terbukti memenuhi batasan perangkat digital Kelas A, sesuai dengan Bagian 15 peraturan FCC. Batasan ini dirancang untuk memberikan perlindungan yang wajar terhadap interferensi berbahaya ketika peralatan dioperasikan di lingkungan komersial. Peralatan ini menghasilkan, menggunakan, dan dapat memancarkan energi frekuensi radio dan, jika tidak dipasang dan digunakan sesuai dengan petunjuk penggunaan, dapat menyebabkan interferensi berbahaya pada komunikasi radio. Pengoperasian peralatan ini di area pemukiman kemungkinan besar akan menimbulkan interferensi berbahaya, sehingga pengguna harus memperbaiki interferensi tersebut atas biaya sendiri.
Kepatuhan ISED Kanada
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Produk ini memenuhi spesifikasi teknis Inovasi, Sains, dan Pengembangan Ekonomi Kanada yang berlaku.
Le présent produit est conforme aux spesifikasi teknik yang berlaku d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Peringatan lingkungan
Peringatan: Kanker dan Bahaya Reproduksi www.P65Warnings.ca.gov
Prasertifikasi Wi-Fi
Modul Wi-Fi telah diprasertifikasi untuk digunakan di banyak wilayah:
Amerika Serikat (FCC): Pengidentifikasi FCC UAY-W8997-M1216 Wilayah Ekonomi Eropa (CE): Tidak ada pengenal publik (deklarasi mandiri) Kanada (IC): Nomor Identifikasi Versi Perangkat Keras W8997-M1216 Jepang (TELEC): Nomor bersertifikat 020-170034 India (WPC): Nomor registrasi ETA-SD-20191005525 (deklarasi mandiri)

FLEKSI TERBUKA

21

BAB 2
Instalasi dan Relokasi
Bab ini menjelaskan cara mempersiapkan lab Anda untuk Opentrons Flex, cara menyiapkan robot, dan cara memindahkannya jika diperlukan. Sebelum menerima pengiriman Flex Anda, pastikan lab atau fasilitas Anda memenuhi semua kriteria di bagian Persyaratan Keselamatan dan Pengoperasian. Ketika tiba waktunya untuk mengaktifkan dan menjalankan Flex Anda, ikuti instruksi terperinci di bagian Membuka Kotak, Pengoperasian Pertama, dan Instalasi dan Kalibrasi Instrumen, atau gunakan layanan Pengaturan Dukungan di Lokasi Opentrons. Dan jika Anda perlu memindahkan Flex Anda ke lokasi baru, dekat atau jauh, ikuti langkah-langkah di bagian Relokasi.
2.1 Persyaratan keselamatan dan pengoperasian
Di mana menempatkan Opentrons Flex
Ruang angkasa adalah komoditas berharga di hampir setiap laboratorium. Flex Anda akan memerlukannya – tetapi tidak terlalu banyak, karena dirancang untuk muat di setengah bangku laboratorium standar. Pastikan Anda memiliki ruangan yang memenuhi kriteria berikut.
Permukaan bangku: Permukaan stasioner, kokoh, rata, dan tahan air. Meja atau bangku beroda (bahkan roda pengunci) tidak disarankan. Flex bergerak cepat dan memiliki banyak massa, yang dapat mengguncang atau membuat meja ringan atau bergerak menjadi tidak seimbang.
Bantalan beban: Robot ini sendiri memiliki berat 88.5 kg (195 lb) dan hanya boleh diangkat oleh dua orang yang bekerja bersama. Tempatkan robot pada permukaan yang dapat menopang bobotnya ditambah bobot modul, peralatan lab, cairan, atau peralatan lab lainnya yang akan digunakan dalam aplikasi Anda.
Ruang pengoperasian: Dimensi dasar robot adalah 87 cm L x 69 cm D x 84 cm H (sekitar 34″ x 27″ x 33″). Flex memerlukan jarak samping dan belakang sebesar 20 cm (8″) untuk kabel, sambungan USB, dan untuk membuang gas buang dari modul yang panas dan dingin.
Peringatan: Jangan letakkan bagian samping atau belakang Flex menempel ke dinding.

22

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI

84cm 33″

87cm 34″
Dimensi dasar Opentrons Flex.

69cm 27″

20cm 8″

20cm 8″

20cm 8″

Atas view dari Opentrons Flex, menunjukkan jarak bebas samping dan belakang minimum.

FLEKSI TERBUKA

23

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI

Konsumsi daya
Opentrons Flex harus dihubungkan ke stopkontak di atau dekat lokasi bangku tempat Anda memasangnya. Hanya sambungkan Flex ke sirkuit yang dapat mengakomodasi penggunaan daya maksimum:
Daya input: 36 VDC, 6.1 A Konsumsi idle: 30 W Konsumsi tipikal: 40 W (selama menjalankan protokol) Konsumsi maksimum: Sekitar 50 W
Konsumsi daya yang tepat bergantung pada:
Jumlah dan jenis pergerakan yang dilakukan selama suatu protokol. Jumlah waktu yang dihabiskan robot untuk menganggur. Status lampu pada robot. Berapa banyak instrumen yang terpasang.
Ingatlah untuk memperhitungkan perangkat elektronik lain yang mengonsumsi daya di sirkuit yang sama, termasuk modul Flex dengan catu dayanya sendiri. MisalnyaampMisalnya, Modul Thermocycler memiliki konsumsi daya maksimum (630 W) yang jauh lebih besar dibandingkan robot Flex itu sendiri. Jika perlu, konsultasikan dengan manajer fasilitas Anda untuk memastikan fasilitas tersebut memenuhi kebutuhan daya peralatan Anda.

Kondisi lingkungan
Kondisi lingkungan untuk penggunaan yang disarankan, penggunaan yang dapat diterima, dan penyimpanan bervariasi:

Direkomendasikan untuk pengoperasian sistem

Dapat diterima untuk pengoperasian sistem

Suhu sekitar +20 hingga +25 °C

+2 hingga +40 °C

Kelembaban relatif Ketinggian

40%, tanpa kondensasi
Kurang lebih 500 m di atas permukaan laut

30%, tanpa kondensasi (di bawah 80 °C)
Hingga 2000 m di atas permukaan laut

Penyimpanan dan transportasi
-10 hingga +60 °C
10%, tanpa kondensasi (di bawah 85 °C)
Hingga 2000 m di atas permukaan laut

24

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Opentrons telah memvalidasi kinerja Opentrons Flex dalam kondisi yang direkomendasikan untuk pengoperasian sistem, dan pengoperasian dalam kondisi tersebut akan memberikan hasil yang optimal. Flex aman digunakan dalam kondisi yang dapat diterima untuk pengoperasian sistem, namun hasilnya mungkin berbeda. Jangan menghidupkan atau menggunakan Flex dalam kondisi di luar batas tersebut. Ketentuan penyimpanan dan pengangkutan hanya berlaku bila robot benar-benar terputus dari listrik dan peralatan lainnya.
2.2 Membuka Kotak
Selamat! Opentrons Flex Anda telah tiba dan Anda telah menyiapkan tempat untuk itu di lab Anda. Mari kita buka peti monster itu, keluarkan robotnya, dan persiapkan untuk dioperasikan. Informasi di bagian ini menyediakan daftar suku cadang dan instruksi yang memandu Anda melalui langkah-langkah yang diperlukan untuk membuka kotak Flex, menyiapkan, dan siap digunakan. Kami telah membagi prosedur pengaturan menjadi tiga bagian:
Bagian 1 mencakup pembongkaran peti. Bagian 2 meliputi pelepasan Flex dari peti dan memindahkannya ke lokasi perakitan akhir. Bagian 3 mencakup perakitan akhir dan menyalakan robot untuk pertama kalinya.
Dibutuhkan usaha dan waktu
Anda sebaiknya meminta rekan lab untuk membantu proses membuka kotak, mengangkat, memindahkan, dan merakit. Anda perlu menganggarkan sekitar 30 menit hingga satu jam untuk upaya ini.
Catatan: Flex memerlukan dua orang untuk mengangkatnya dengan benar. Selain itu, mengangkat dan membawa Flex pada pegangannya adalah cara terbaik untuk menggerakkan robot.
Bahan peti dan pengepakan
Membongkar Flex memberi Anda robot yang luar biasa, tetapi Anda juga memiliki beberapa panel peti besar bersama dengan berbagai macam komponen pengiriman dan bantalan. Meskipun Anda dapat membuang bahan ini, kami menganjurkan Anda untuk menyimpan barang-barang ini jika ruang penyimpanan tersedia. Kemasannya dapat digunakan kembali, sehingga membantu mempersiapkan Flex Anda untuk pengiriman jika Anda perlu mengirimkannya ke tempat lain (misalnya, ke konferensi atau fasilitas baru) di masa mendatang.

FLEKSI TERBUKA

25

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Elemen produk
Flex dikirimkan dengan komponen yang tercantum di bawah ini. Pipet, gripper, dan modul hadir dalam kemasan terpisah dari peti Flex utama, meskipun Anda membelinya bersama-sama sebagai tempat kerja.

(1) Robot Fleksibel Opentron

(1) kabel USB

(1) kabel daya

(1) Kabel Ethernet

(5) Tombol L (hex 12 mm, hex 1.5 mm, hex 2.5 mm, hex 3 mm,
T10 Torx)

(1) Liontin Berhenti Darurat

(1) Slot dek dengan klip peralatan lab

(4) Klip peralatan laboratorium cadangan

(1) Pemeriksaan kalibrasi pipet

(4) Pegangan dan penutup pembawa

(1) Panel jendela atas

(4) Panel jendela samping

(1) Obeng segi enam 2.5 mm

(1) Kunci pas 19 mm

(16 + suku cadang) Sekrup jendela (kepala datar M4x8 mm)
26

(10) Sekrup slot dek cadangan (kepala soket M4x10 mm)

(12) Sekrup klip dek cadangan (kepala soket M3x6 mm)

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Bagian 1: Lepaskan petinya
Opentrons mengirimkan Flex Anda dalam peti kayu lapis yang kokoh. Peti pengiriman menggunakan kait dan kait clamps untuk mengencangkan panel atas, samping, dan bawah secara bersamaan. Menggunakan kait, bukan paku atau sekrup, berarti Anda tidak memerlukan linggis (atau tenaga yang besar) untuk membongkar peti, dan Anda dapat memasangnya kembali nanti, jika diperlukan.
Catatan: Tepi peti dapat menjadi kasar selama pengiriman. Anda mungkin ingin menggunakan sarung tangan kerja untuk melindungi tangan Anda dari serpihan kayu.
Untuk melepaskan kait, balikkan tab kait ke atas dan putar ke kiri (berlawanan arah jarum jam). Tindakan ini menggerakkan clamp lengan keluar dari braket penahan yang sesuai. Anda kemudian dapat membalikkan lengan kait dari peti.
1 Buka kunci delapan kait yang menahan bagian atas ke samping.

2 Lepaskan panel atas setelah melepaskan kaitnya.

FLEKSI TERBUKA

27

BAB 2: PEMASANGAN DAN RELOKASI 3 Buka kantong pengiriman berwarna biru, keluarkan barang-barang berikut dari bantalannya, dan sisihkan:
Kit Pengguna Kabel Daya, Ethernet, dan USB Liontin Berhenti Darurat
4 Lepaskan bagian atas bantalan busa agar panel jendela terlihat. Bantalan melindungi panel samping dan atas.
5 Lepaskan panel jendela dan sisihkan. Anda akan melampirkannya nanti.

28

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
6 Buka kunci 16 kait tersisa yang menahan panel samping satu sama lain dan ke dasar peti. 7 Lepaskan panel samping dan sisihkan.
Bagian 2: Lepaskan Flex
Setelah menyelesaikan langkah-langkah di Bagian 1, Anda sekarang akan melihat robot yang berada di dalam tas pelindung dan terpasang pada komponen pemasangan baja berwarna oranye. Tas membungkus robot dan melindunginya dari lingkungan luar. Braket baja mengamankan robot ke bagian bawah peti. Dua rangka pengiriman menopang robot, mendistribusikan bobotnya secara merata, dan menjaganya tetap kaku agar tidak melengkung selama pengiriman. Lanjutkan membongkar Flex dan mengeluarkannya dari dasar peti.
8 Dengan menggunakan kunci pas 19 mm dari User Kit, buka baut braket dari bagian bawah peti. Anda dapat membuang tanda kurung tersebut, atau menyimpannya untuk digunakan di lain waktu.

FLEKSI TERBUKA

29

BAB 2: PEMASANGAN DAN RELOKASI 9 Tarik atau gulung tas pengiriman sepenuhnya ke bawah hingga seluruh robot terlihat.
10 Dengan bantuan rekan lab Anda, pegang pegangan pada bingkai pengiriman berwarna oranye di kedua sisi alas robot, angkat Flex dari alas peti, dan letakkan di lantai. Simpan atau buang alas peti dan rangka pengiriman.

30

FLEKSI TERBUKA

BAB 2: PEMASANGAN DAN RELOKASI 11 Dengan menggunakan kunci L hex 12 mm dari Kit Pengguna, lepaskan keempat baut yang menahan rangka pengiriman ke
yang Fleksibel. Simpan atau buang rangka dan bautnya.
12 Lepaskan keempat pegangan aluminium dari Kit Pengguna. Kencangkan pegangan ke lokasi yang sama dengan tempat menahan baut rangka pengiriman 12 mm.

FLEKSI TERBUKA

31

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
13 Dengan bantuan rekan lab Anda, angkat Flex dengan pegangan pembawanya dan pindahkan ke meja kerja untuk perakitan akhir.

Bagian 3: Perakitan akhir dan penyalaan
Setelah memindahkan Flex ke area kerja sementara, atau rumah permanennya, sekarang saatnya memberikan sentuhan akhir pada robot baru Anda.
14 Jika Anda telah memindahkan robot ke lokasi kerjanya yang terakhir, lepaskan pegangan pembawa dan ganti dengan penutup akhir. Tutupnya menutup bukaan pegangan pada rangka dan memberikan tampilan yang bersih pada robot. Kembalikan pegangan ke Kit Pengguna untuk disimpan.

32

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
15 Ambil panel atas dan samping dari busa pengepakan yang Anda sisihkan setelah melepas bagian atas peti.
16 Pasang panel jendela ke Flex dengan mengikuti informasi pelabelan pada lapisan pelindung depan. Kemudian lepaskan film pelindung.
17 Dengan menggunakan sekrup jendela miring dan obeng 2.5 mm dari Kit Pengguna, pasang panel jendela ke Flex. Pastikan lubang miring (berbentuk V) pada panel jendela menghadap keluar (ke arah Anda). Hal ini memungkinkan sekrup terpasang rata dengan permukaan jendela.

Peringatan: Orientasi panel yang salah dapat menyebabkan kerusakan. Torsi sekrup yang berlebihan dapat memecahkan panel. Kencangkan sekrup dengan tangan hingga panel jendela cukup aman. Ini bukanlah uji kekuatan.

FLEKSI TERBUKA

33

BAB 2: PEMASANGAN DAN RELOKASI 18 Dengan menggunakan obeng 2.5 mm dari Kit Pengguna, lepaskan sekrup pengunci dari gantri. Ini
sekrup mencegah gantri bergerak saat dalam perjalanan. Sekrup pengunci gantri terletak: Di rel sisi kiri dekat bagian depan robot. Di bawah lengan gantry vertikal. Di rel sisi kanan dekat bagian depan robot dalam braket oranye. Ada dua sekrup di sini.
Gantri dapat dipindahkan dengan mudah dengan tangan setelah melepas semua sekrup pengiriman. 19 Potong dan lepaskan kedua karet gelang yang menahan tempat sampah pada tempatnya selama pengiriman.

34

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
20 Pasang kabel daya ke Flex dan colokkan ke stopkontak di dinding. Pastikan area dek bebas dari penghalang. Balikkan sakelar daya di kiri belakang robot. Setelah dinyalakan, gantry berpindah ke lokasi asalnya dan layar sentuh menampilkan instruksi konfigurasi tambahan.

Sekarang Flex Anda sudah siap digunakan dan siap digunakan, lanjutkan ke bagian Pengoperasian Pertama di bawah.
2.3 Jalankan pertama
Lakukan pengaturan dasar pada layar sentuh sebelum menghubungkan perangkat keras lain ke Flex Anda. Robot akan memandu Anda dalam menghubungkan ke jaringan lab Anda, memperbarui ke perangkat lunak terbaru, dan mempersonalisasi Flex dengan memberinya nama.
Nyalakan daya
Saat Anda menghidupkan Flex, logo Opentrons akan muncul di layar sentuh. Setelah beberapa saat, layar “Selamat datang di Opentrons Flex Anda” akan ditampilkan.
Layar selamat datang Opentrons Flex. Anda seharusnya hanya melihat layar ini saat Anda memulai Flex untuk pertama kalinya.

FLEKSI TERBUKA

35

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Hubungkan ke jaringan atau komputer
Ikuti petunjuk di layar sentuh untuk menghubungkan robot Anda sehingga dapat memeriksa pembaruan perangkat lunak dan menerima protokol fileS. Ada tiga metode koneksi: Wi-Fi, Ethernet, dan USB.

Opsi koneksi jaringan. Anda harus memiliki konektivitas internet untuk mengatur Flex. Wi-Fi: Gunakan layar sentuh untuk menyambung ke jaringan Wi-Fi yang diamankan dengan autentikasi Pribadi WPA2 (sebagian besar jaringan yang hanya memerlukan kata sandi untuk bergabung termasuk dalam kategori ini).
Catatan: Flex tidak mendukung portal captive (jaringan yang tidak memiliki kata sandi tetapi memuat a webhalaman untuk mengautentikasi pengguna setelah terhubung).
Anda juga dapat menyambung ke jaringan Wi-Fi terbuka, namun hal ini tidak disarankan.
Peringatan: Menghubungkan ke jaringan Wi-Fi terbuka akan memungkinkan siapa pun dalam jangkauan sinyal jaringan untuk mengontrol robot Opentrons Flex Anda tanpa otentikasi.

Jika Anda perlu terhubung ke jaringan Wi-Fi yang menggunakan otentikasi perusahaan (termasuk “eduroam” dan jaringan akademik serupa yang memerlukan nama pengguna dan kata sandi), sambungkan terlebih dahulu ke Aplikasi Opentrons melalui Ethernet atau USB untuk menyelesaikan pengaturan awal. Kemudian sambungkan ke jaringan Wi-Fi perusahaan di pengaturan jaringan untuk Flex Anda. Untuk mengakses pengaturan jaringan:

36

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
1. Klik Perangkat di sidebar kiri Aplikasi Opentrons. 2. Klik menu tiga titik () untuk Flex Anda dan pilih Pengaturan Robot. 3. Klik tab Jaringan.
Pilih jaringan Anda dari menu tarik-turun atau pilih “Gabung jaringan lain…” dan masukkan SSID-nya. Pilih metode autentikasi perusahaan yang digunakan jaringan Anda. Metode yang didukung adalah:
EAP-TTLS dengan TLS EAP-TTLS dengan MS-CHAP v2 EAP-TTLS dengan MD5 EAP-PEAP dengan MS-CHAP v2 EAP-TLS
Masing-masing metode ini memerlukan nama pengguna dan kata sandi, dan bergantung pada konfigurasi jaringan Anda, mungkin memerlukan sertifikat files atau opsi lain. Konsultasikan dokumentasi TI fasilitas Anda atau hubungi manajer TI Anda untuk rincian pengaturan jaringan Anda.
Ethernet: Hubungkan robot Anda ke sakelar atau hub jaringan dengan kabel Ethernet. Anda juga dapat terhubung langsung ke port Ethernet di komputer Anda, mulai dari sistem robot versi 7.1.0.
USB: Hubungkan kabel USB A-ke-B yang disediakan ke port USB-B robot dan port terbuka di komputer Anda. Gunakan kabel USB B-ke-C atau adaptor USB A-ke-C jika komputer Anda tidak memiliki port USB-A.
Untuk melanjutkan pengaturan, komputer yang terhubung harus menginstal dan menjalankan Aplikasi Opentrons. Untuk detail tentang cara menginstal Aplikasi Opentrons, lihat bagian Instalasi Aplikasi pada bab Perangkat Lunak dan Pengoperasian.
Instal pembaruan perangkat lunak
Sekarang Anda telah terhubung ke jaringan atau komputer, robot dapat memeriksa pembaruan perangkat lunak dan firmware dan mengunduhnya jika diperlukan. Jika ada pembaruan, mungkin diperlukan waktu beberapa menit untuk menginstal. Setelah pembaruan selesai, robot akan restart.

FLEKSI TERBUKA

37

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Pasang Liontin Berhenti Darurat
Hubungkan Emergency Stop Pendant (E-stop) yang disertakan ke port tambahan (AUX-1 atau AUX-2) di bagian belakang robot.

Sebelum dan sesudah menyambungkan Liontin Berhenti Darurat.
Memasang dan mengaktifkan E-stop adalah wajib untuk memasang instrumen dan menjalankan protokol di Flex. Untuk informasi lebih lanjut tentang penggunaan E-stop selama pengoperasian robot, lihat bagian Emergency Stop Pendant pada bab Deskripsi Sistem.
Beri nama pada robot Anda
Memberi nama pada robot memungkinkan Anda mengidentifikasinya dengan mudah di lingkungan lab Anda. Jika Anda memiliki beberapa robot Opentron di jaringan Anda, pastikan untuk memberi mereka nama yang unik. Setelah Anda mengonfirmasi nama robot Anda, Anda akan dibawa ke Dasbor Opentrons Flex Anda. Kemungkinan langkah selanjutnya yang ingin Anda ambil adalah memasang instrumen, yang akan dibahas di bagian selanjutnya.
2.4 Pemasangan dan kalibrasi instrumen
Setelah pengaturan awal robot, langkah selanjutnya adalah memasang instrumen ke robot dan mengkalibrasinya.
Untuk memasang instrumen, pertama-tama ketuk Instrumen pada layar sentuh atau buka bagian Pipet dan Modul pada layar detail perangkat di Aplikasi Opentrons. Pilih dudukan kosong dan pilih Lampirkan Pipet atau Pasang Gripper. Jika dudukan yang ingin digunakan sudah terpasang, Anda perlu melepaskan pipet atau gripper terlebih dahulu.

38

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Catatan: Proses instalasi keseluruhannya sama terlepas dari apakah Anda menggunakan layar sentuh atau Aplikasi Opentrons. Perangkat apa pun yang Anda gunakan untuk memulai akan mengontrol proses instalasi hingga Anda menyelesaikan atau membatalkannya.
Jika Anda memulai di layar sentuh, aplikasi akan menampilkan robot sedang “sibuk”. Jika Anda memulai di aplikasi, layar sentuh akan menampilkan modal yang menunjukkan bahwa instalasi instrumen sedang berlangsung.
Proses pemasangan yang tepat bervariasi tergantung pada instrumen yang Anda pasang, seperti yang dibahas pada bagian di bawah ini. Semua instrumen memiliki prosedur kalibrasi otomatis, yang harus Anda lakukan segera setelah pemasangan.
Pemasangan pipet
Saat Anda memasang pipet, Anda akan dipandu melalui langkah-langkah berikut pada layar sentuh atau di Aplikasi Opentrons.
1. PILIH JENIS PIPET Pilih antara Pipet 1 atau 8 Saluran dan Pipet 96 Saluran. Memasang Pipet 96 Saluran memerlukan beberapa langkah tambahan karena dipasang pada pelat pemasangan khusus yang membentang di kedua dudukan pipet.
2. PERSIAPAN UNTUK PEMASANGAN Lepaskan peralatan lab dari dek dan bersihkan area kerja untuk memudahkan pemasangan dan kalibrasi. Kumpulkan juga peralatan yang diperlukan, seperti probe kalibrasi, obeng hex, dan pelat pemasangan (untuk Pipet 96 Saluran).
3. SAMBUNGKAN DAN AMANKAN PIPET Gantri akan bergerak ke bagian depan robot sehingga Anda dapat memasang pipet.
Pipet 1 dan 8 Saluran terhubung langsung ke dudukan pipet. Pipet 96 Saluran memerlukan pelat pemasangan. Untuk memasang pelat pemasangan, Anda harus terlebih dahulu melepaskan sambungan kereta sumbu z untuk dudukan pipet kanan.

FLEKSI TERBUKA

39

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Hubungkan pipet ke dudukan pipet yang dipilih dan kencangkan sekrupnya.
4. JALANKAN KALIBRASI OTOMATIS Untuk mengkalibrasi pipet, pasang probe kalibrasi ke nozel pipet yang sesuai. Pipet akan secara otomatis bergerak menyentuh titik-titik tertentu di dek dan menyimpan nilai kalibrasi ini untuk digunakan di masa mendatang. Setelah kalibrasi selesai dan Anda melepaskan probe, pipet akan siap digunakan dalam protokol.
Pemasangan gripper
Saat Anda memasang gripper, Anda akan dipandu melalui langkah-langkah berikut pada layar sentuh atau di Aplikasi Opentrons.
1. PERSIAPAN PEMASANGAN Lepaskan peralatan lab dari dek dan bersihkan area kerja untuk memudahkan pemasangan dan kalibrasi. Kumpulkan juga obeng segi enam yang diperlukan dan pastikan pin kalibrasi berada di tempat penyimpanannya pada gripper.
2. MENGHUBUNGKAN DAN MENGAMANKAN GRIPPER Gantry akan berpindah ke bagian depan robot sehingga Anda dapat memasang gripper. Hubungkan gripper ke dudukan ekstensi dan kencangkan sekrupnya.
3. JALANKAN KALIBRASI OTOMATIS Untuk mengkalibrasi gripper, masukkan pin kalibrasi ke rahang depan. Gripper akan secara otomatis bergerak menyentuh titik-titik tertentu di dek dan menyimpan nilai kalibrasi tersebut untuk digunakan di masa mendatang. Kemudian ulangi proses yang sama dengan pin kalibrasi di rahang belakang. Setelah kalibrasi selesai dan Anda mengembalikan pin ke lokasi penyimpanannya, gripper akan siap digunakan dalam protokol.
2.5 Relokasi
Bagian ini memberikan saran dan instruksi tentang cara menggerakkan robot Opentrons Flex Anda dalam jarak pendek dan jauh.

40

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Gerakan pendek
Pergerakan singkat mencakup rentang jarak mulai dari “mari kita pindahkan sedikit” ke seberang lab, menyusuri lorong, atau lantai lain di gedung Anda. Dalam kasus ini, Anda dapat menggerakkan Flex dengan tangan. Mengangkutnya dengan kereta tangan juga merupakan pilihan yang baik.
Peringatan: Flex memiliki berat 88.5 kg. Alhasil, dibutuhkan dua orang untuk mengangkat dan memindahkannya dengan aman.
Pasang kembali pegangan pengangkat untuk memindahkan Flex Anda ke lokasi baru yang terdekat. Mengangkat dan membawa Flex pada pegangannya adalah cara yang tepat untuk menggerakkan robot dalam jarak dekat. Lepaskan pegangan dan simpan di Kit Pengguna setelah pemindahan selesai. Untuk mencegah kerusakan pada robot, selalu gunakan pegangan pengangkat untuk mengangkat dan memindahkannya. Jangan memegang rangka untuk mengangkat atau memindahkan robot Anda.
Pindahan jarak jauh
Perpindahan jarak jauh membawa Flex Anda keluar dari universitas, fasilitas, atau institusi Anda. Lintas kota, ke kota baru, negara bagian, provinsi, atau negara semuanya examples dari gerakan jarak jauh. Dalam hal ini, Anda harus mengemas Flex untuk melindunginya dari cuaca buruk, guncangan, dan gerakan kasar yang mungkin terjadi saat dalam perjalanan.
Jika Anda menyimpan peti pengiriman dan penyangga internal yang disertakan dengan Flex, Anda dapat mengemasnya kembali dalam bahan-bahan ini untuk perpindahan jarak jauh. Ikuti langkah-langkah membuka kotak dalam urutan terbalik untuk mempersiapkan Flex Anda untuk perpindahan jarak jauh. Pada dasarnya, Anda harus:
Cabut kabel daya dan jaringan, jika terpasang. Hapus semua perangkat keras dan labware yang terpasang. Pasang kembali pelat dek. Kunci gantri (lihat bagian Saran Umum Pemindahan di bawah). Lepas dan simpan panel jendela.
Jika Anda menyimpan peti aslinya:
Pasang kembali rangka pengiriman ke Flex dan kencangkan ke dasar palet menggunakan braket L. Tambahkan bantalan dan pasang kembali peti pengiriman.

FLEKSI TERBUKA

41

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Jika Anda tidak memiliki peti asli dan bahan terkait, hubungi perusahaan pelayaran yang memiliki reputasi baik. Mereka dapat mengatur proses pengepakan, transportasi, dan pengiriman untuk Anda.
Saran umum untuk pindah
MEMUTUSKAN KABEL DAYA DAN JARINGAN Sebelum memindahkan Flex Anda, jangan lupa untuk: Matikan daya dan cabut dari stopkontak. Cabut kabel Ethernet atau USB, jika digunakan.
KUNCI GANTRY Sebelum memindahkan Flex Anda, masukkan kembali sekrup pengunci untuk menahan gantry pada tempatnya. Titik penguncian gantri terletak: Di rel sisi kiri dekat bagian depan robot. Di bawah lengan gantri vertikal. Di rel sisi kanan dekat bagian depan robot. Mengunci bagian gantry ini memerlukan si kecil
braket oranye dan dua sekrup pengunci.

42

FLEKSI TERBUKA

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
BERANDA GANTRY Anda mungkin tidak ingin mengunci gantri jika Anda hanya memindahkan robot ke lokasi terdekat. Jika Anda memutuskan untuk tidak menguncinya, setidaknya gunakan layar sentuh atau Aplikasi Opentrons untuk mengirim gantri ke posisi asalnya sebelum mematikannya. Untuk memasang gantry melalui layar sentuh, tap menu tiga titik () lalu tap Home gantry. Untuk memasang gantry melalui Aplikasi Opentrons: Klik Perangkat. Klik Flex Anda di daftar perangkat. Klik menu titik tiga () lalu klik Home gantry.
HAPUS MODUL Modul dalam dek dan perlengkapan lainnya menambah bobot ekstra pada Flex Anda. Hal ini juga mempengaruhi pusat gravitasi robot, yang dapat membuatnya terasa “goncang” saat diangkat. Untuk membantu meringankan dan menyeimbangkan robot, lepaskan semua instrumen dan peralatan laboratorium yang terpasang sebelum Anda mengambilnya.
PASANG KEMBALI SLOT DEK Kami menyarankan untuk memasang kembali slot dek untuk perpindahan jarak jauh. Mengamankan slot di lokasi aslinya membantu mencegah kehilangan yang tidak disengaja. Memasang kembali slot dek untuk pergerakan singkat di sekitar lab adalah opsional.
KALIBRASI ULANG PASCA PINDAH Anda harus mengkalibrasi ulang semua instrumen dan modul setelah memasangnya kembali. Untuk rincian lebih lanjut tentang kalibrasi modul, lihat bab Modul.

FLEKSI TERBUKA

43

BAB 2 : INSTALASI DAN RELOKASI
Pikiran terakhir tentang pindah
Flex Anda adalah mesin yang kokoh dan dibuat dengan baik, namun juga merupakan instrumen ilmiah presisi yang dirancang untuk memenuhi toleransi. Oleh karena itu, Anda harus memperlakukannya dengan hati-hati saat memindahkannya ke wilayah kerja lokal Anda atau mengirimnya ke seluruh negeri. Ini berarti mengikuti panduan yang diberikan di sini dan menggunakan akal sehat Anda tentang cara mengangkut peralatan laboratorium yang mahal. Intinya: saat memindahkan Flex Anda, lakukan kesalahan dengan hati-hati dan bantalan ekstra.
Jika Anda memiliki pertanyaan atau kekhawatiran tentang relokasi Flex Anda, hubungi kami di support@opentrons.com.

44

FLEKSI TERBUKA

BAB 3
Deskripsi Sistem

Bab ini menjelaskan sistem perangkat keras Opentrons Flex, yang mendasari fitur inti otomatisasi labnya. Dek, gantri, dan dudukan instrumen Opentrons Flex memungkinkan penggunaan komponen penanganan cairan dan peralatan laboratorium yang presisi. Layar sentuh pada perangkat memungkinkan menjalankan protokol dan memeriksa status robot tanpa perlu membawa komputer Anda ke meja lab. Konektivitas kabel dan nirkabel memungkinkan kontrol tambahan dari Aplikasi Opentrons (lihat bab Perangkat Lunak dan Pengoperasian untuk lebih jelasnya) dan memperluas fitur sistem dengan memasang periferal (lihat bab Modul).

3.1 Komponen fisik

Kamera

Lampu Status

Layar sentuh

Bingkai

Dek Gantri
Pintu Depan
Lokasi komponen fisik Opentrons Flex.

Tutup Gagang Jendela Samping

FLEKSI TERBUKA

45

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Bingkai dan penutup
Rangka robot Opentrons Flex memberikan kekakuan dan dukungan struktural untuk dek dan gantrinya. Semua subsistem mekanis ditempatkan dan dipasang pada rangka utama. Rangkanya dibuat terutama dari lembaran logam dan ekstrusi aluminium.
Rangka logamnya memiliki bukaan untuk jendela samping dan pintu depan yang terbuat dari polikarbonat transparan sehingga Anda dapat melihat apa yang terjadi di dalam Flex. Engsel pintu depan terbuka untuk akses ke bagian dalam sistem. Dengan pintu depan terbuka, Anda dapat memasang instrumen, modul, dan perlengkapan dek; mempersiapkan dek sebelum protokol; atau memanipulasi keadaan dek selama protokol.
Strip LED putih di bagian dalam tepi atas bingkai memberikan pencahayaan sekitar yang dapat dikontrol perangkat lunak. Kamera 2 megapiksel dapat memotret dek dan area kerja untuk perekaman dan pelacakan pelaksanaan protokol.

Dek dan area kerja
Dek adalah permukaan aluminium mesin tempat protokol sains otomatis dijalankan. Dek memiliki 12 slot format ANSI/SLAS utama yang dapat dikonfigurasi ulang untuk menampung peralatan laboratorium, modul, dan bahan habis pakai. Slot dek diidentifikasi dengan sistem koordinat, dengan slot A1 di kiri belakang dan slot D3 di kanan depan.

Area Kerja Slot Ekspansi (untuk Thermocycler).

StagArea ing

Area dek dalam Flex.

46

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
Area kerja adalah ruang fisik di atas dek yang dapat diakses untuk pemipetan. Peralatan lab ditempatkan pada slot A1 sampai D3 berada pada area kerja.
Opentrons Flex dilengkapi dengan slot dek yang dapat dilepas untuk 12 posisi di area kerja. Setiap slot dek memiliki klip peralatan lab sudut untuk menempatkan peralatan lab dengan aman di dek.
Anda dapat mengkonfigurasi ulang dek dengan mengganti slot dengan perlengkapan dek lainnya, termasuk tempat sampah bergerak, saluran sampah, dan wadah modul. Slot ekspansi di belakang A1 hanya digunakan untuk memberi ruang tambahan pada Modul Thermocycler yang menempati slot A1 dan B1.
Catatan: Slot dek dapat dipertukarkan dalam satu kolom (1, 2, atau 3) tetapi tidak antar kolom; slot kolom 1 dan kolom 3 merupakan bagian yang berbeda meskipun ukurannya serupa. Anda dapat mengetahui di kolom mana sebuah slot masuk dengan mengarahkan klip peralatan lab berwarna biru ke kiri belakang.
Anda harus membiarkan slot dek terpasang di lokasi di mana Anda ingin meletakkan peralatan lab mandiri. Dek dan barang-barang yang diletakkan di atasnya tetap statis, kecuali jika digerakkan oleh gripper atau intervensi manual.
Stagdaerah ing
Stagarea ing adalah ruang tambahan di sepanjang sisi kanan geladak. Anda dapat menyimpan labware di lokasi ini setelah menginstal stagslot area. Labware ditempatkan pada slot A4 sampai D4 yang berada di stagdaerah. Pipet fleksibel tidak dapat menjangkau ke dalam stagarea tersebut, namun gripper dapat mengambil dan memindahkan peralatan lab ke dan dari lokasi ini. Menambahkan slot tambahan membantu menjaga area kerja tetap tersedia untuk peralatan yang digunakan dalam protokol otomatis Anda.
Stagslot area termasuk dalam konfigurasi stasiun kerja tertentu dan juga tersedia untuk dibeli dari https://shop.opentrons.com.

FLEKSI TERBUKA

47

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

StagArea dengan Slot Terpasang

Perlengkapan dek
Perlengkapan adalah item perangkat keras yang menggantikan slot dek standar. Mereka memungkinkan Anda menyesuaikan tata letak dek dan menambahkan fungsionalitas ke Flex Anda. Saat ini, perlengkapan dek termasuk stagslot area, tempat sampah internal, dan saluran sampah eksternal. Anda hanya dapat memasang perlengkapan di beberapa slot dek tertentu. Tabel berikut mencantumkan lokasi dek untuk setiap perlengkapan.

Perlengkapan Stagslot area Tempat Sampah Saluran sampah Saluran sampah dengan stagslot area

Slot A3D3 A1D1 dan A3-D3 D3 hanya D3 saja

Perlengkapan tidak diberi daya. Mereka tidak mengandung komponen elektronik atau mekanis yang mengkomunikasikan keadaan saat ini dan lokasi deknya ke robot. Ini berarti Anda harus menggunakan fitur konfigurasi dek agar Flex mengetahui perlengkapan apa yang dipasang ke dek dan di mana lokasinya.

48

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Anda dapat mengakses pengaturan konfigurasi dek dari layar sentuh melalui menu tiga titik () dan dari Aplikasi Opentrons. Lihat bagian Konfigurasi Dek pada bab Perangkat Lunak dan Pengoperasian untuk informasi tentang cara mengonfigurasi dek dari layar sentuh.

Saluran pembuangan limbah
Opentrons Flex Waste Chute memindahkan cairan, tip, rak tip, dan pelat sumur dari wadah Flex ke wadah sampah yang ditempatkan di bawah bukaan luarnya. Saluran limbah terpasang ke adaptor pelat dek yang sesuai dengan slot D3. Ia juga dilengkapi dengan setengah panel jendela khusus yang memungkinkan saluran keluar dari bagian depan robot.
Komponen saluran pembuangan limbah.

Adaptor Pelat Dek Penutup

Saluran Pembuangan Sampah
Adaptor Pelat Dek dengan StagArea ing

Stagslot area
Stagslot area ing adalah potongan dek yang kompatibel dengan ANSI/SLAS yang menggantikan slot standar di kolom 3 dan menambahkan slot baru ke stagarea kerja — semuanya tanpa kehilangan ruang di area kerja. Anda dapat memasang satu slot atau maksimal empat slot untuk membuat kolom baru (A4 hingga D4) di sepanjang sisi kanan dek. Namun perlu diperhatikan bahwa penggantian slot dek A3 memerlukan pemindahan tempat sampah. Dengan menambahkan stagDengan memasukkan slot area ke dek, robot Flex Anda dapat menyimpan lebih banyak peralatan lab dan beroperasi dengan lebih efisien.

FLEKSI TERBUKA

Fleksibel stagslot area.
49

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
INSTALASI SLOT
Untuk memasang, lepaskan sekrup yang memasang slot standar ke dek dan ganti dengan stagslot area. Setelah instalasi, gunakan layar sentuh atau Aplikasi Opentrons untuk memberi tahu robot yang Anda tambahkantagslot area ke dek.
Menginstal sebagaitagslot area.

KOMPATIBILITAS SLOT Stagslot area ing kompatibel dengan instrumen, modul, dan peralatan lab Flex yang tercantum di bawah.

Modul Pipet Gripper komponen fleksibel
Peralatan laboratorium

Stagkompatibilitas area
Flex Gripper dapat memindahkan peralatan laboratorium ke atau dari stagslot area.
Pipet fleksibel tidak dapat mencapai stagdaerah. Gunakan gripper untuk memindahkan rak ujung dan peralatan lab dari stagarea kerja ke area kerja sebelum pemipetan.
Blok Magnetik GEN1 dapat ditempatkan di kolom 3 di atas astagslot area. Modul tidak didukung di kolom 4.
Modul bertenaga seperti Heater-Shaker dan Temperature Module masuk ke dalam wadah yang dapat ditempatkan di kolom 3. Anda tidak dapat menambahkan sebagaitagslot area ke posisi yang ditempati oleh caddy modul.
Stagslot area memiliki dimensi ANSI/SLAS yang sama dengan slot dek standar. Gunakan peralatan lab yang kompatibel dengan gripper di stagarea, atau secara manual menambah dan menghapus labware dari lokasi ini.

50

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
Sistem pergerakan
Pada rangkanya terpasang gantry, yaitu sistem pergerakan dan penentuan posisi robot. Gantri bergerak secara terpisah di sepanjang sumbu x dan y untuk memposisikan pipet dan gripper di lokasi yang tepat untuk pelaksanaan protokol. Pergerakan sepanjang sumbu ini tepat hingga 0.1 mm. Gantry dikendalikan oleh motor stepper bipolar hybrid 36 VDC. Pada gilirannya, terpasang pada gantry adalah dudukan pipet dan dudukan ekstensi. Ini bergerak sepanjang sumbu z untuk memposisikan pipet dan gripper pada lokasi yang tepat untuk pelaksanaan protokol. Pergerakan sepanjang sumbu ini dikendalikan oleh motor stepper bipolar hybrid 36 VDC. Perangkat elektronik yang terdapat di gantry menyediakan daya 36 VDC dan komunikasi ke pipet dan gripper, jika dipasang.
Gerbang

Pemasangan Pipet

Pemasangan Ekstensi

Lokasi pemasangan instrumen di Flex.

Layar sentuh dan tampilan LED
Antarmuka pengguna utama adalah layar sentuh LCD 7 inci, yang terletak di kanan depan robot. Layar sentuhnya dilapisi Gorilla Glass 3 agar tahan gores dan rusak. Akses banyak fitur Flex langsung di layar sentuh, termasuk:

FLEKSI TERBUKA

51

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Manajemen protokol Pengaturan, eksekusi, dan pemantauan protokol Manajemen perangkat lab Pengaturan robot Pembaruan perangkat lunak dan firmware sistem Log operasi dan pemberitahuan kesalahan
Untuk informasi lebih lanjut tentang penggunaan Flex melalui layar sentuh, lihat bagian Pengoperasian Layar Sentuh pada bab Perangkat Lunak dan Pengoperasian.
Lampu status adalah strip LED di sepanjang bagian depan atas robot yang memberikan informasi sekilas tentang robot. Warna dan pola pencahayaan yang berbeda dapat mengkomunikasikan berbagai keberhasilan, kegagalan, atau kondisi menganggur:

Warna LED Putih Netral
Hijau Keadaan normal
Status Wajib Biru Status Abnormal Kuning Status Darurat Merah

Pola LED Berdenyut Padat
Berkedip dua kali
Pulsa Berdenyut Padat

Status robotnya
Protokol dihidupkan dan tidak dijalankan Robot sedang sibuk (misalnya, memperbarui perangkat lunak atau firmware, menyiapkan protokol yang dijalankan, membatalkan pengoperasian protokol) Tindakan selesai (misalnya, protokol disimpan, perangkat lunak diperbarui, instrumen dipasang atau dilepas) Protokol sedang berjalan Protokol selesai Protokol dijeda

Padat

Kesalahan perangkat lunak

Berkedip tiga kali, berulang kali

Kesalahan fisik (misalnya, instrumen crash)

Lampu status juga dapat dinonaktifkan di pengaturan robot.

52

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
3.2 Pipet
Pipet Opentrons adalah perangkat yang dapat dikonfigurasi yang digunakan untuk memindahkan cairan ke seluruh area kerja selama pelaksanaan protokol. Ada beberapa pipet Opentrons Flex, yang dapat menangani volume dari 1 µL hingga 1000 µL dalam 1, 8, atau 96 saluran:
Opentrons Flex 1-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 5-Channel Pipette (1000 µL) Opentrons Flex 8-Channel Pipette (1 µL) Opentrons Flex 50-Channel Pipette (8 µL)
Pipet dipasang ke gantri menggunakan sekrup penahan di bagian depan pipet. Pipet 1 saluran dan 8 saluran masing-masing menempati satu dudukan pipet (kiri atau kanan); pipet 96 saluran menempati kedua dudukan. Untuk detail tentang pemasangan pipet, lihat Pemasangan dan Kalibrasi Instrumen.

Keterikatan Tawanan
Sekrup

Sekrup Lampiran Tawanan

Ejector

Nozel (O-ring yang dapat diganti)

Nozel (O-ring Tetap)

Lokasi komponen pipet 1, 8, dan 96 saluran.

Ejector

FLEKSI TERBUKA

53

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Pipet mengambil ujung plastik sekali pakai dengan menekannya ke nozel pipet, lalu menggunakan ujung tersebut untuk menyedot dan mengeluarkan cairan. Jumlah gaya total yang diperlukan untuk pengambilan meningkat seiring dengan semakin banyaknya tip yang diambil secara bersamaan. Untuk jumlah ujung yang lebih kecil, pipet menempelkan ujung dengan mendorong setiap nosel pipet ke bawah hingga ke ujungnya. Untuk mencapai kekuatan yang diperlukan untuk mengambil satu rak penuh ujung pipet, pipet 96 saluran juga menarik ujung tersebut ke atas menuju nozel. Tindakan penarikan ini memerlukan penempatan rak ujung ke dalam adaptor rak ujung, bukan langsung ke dalam slot dek. Untuk membuang ujung pipet (atau mengembalikannya ke raknya), mekanisme ejektor pipet mendorong ujung pipet keluar dari nosel.

Spesifikasi pipet
Pipet Opentrons Flex dirancang untuk menangani berbagai volume. Karena jangkauan keseluruhannya yang luas, alat ini dapat menggunakan berbagai ukuran tip, yang mempengaruhi karakteristik penanganan cairannya. Opentrons telah menguji keakuratan dan presisi pipet Flex dalam sejumlah kombinasi ujung dan volume cairan:

Pipet
Fleksibel 1 Saluran
50 µL
Fleksibel 1 Saluran
1000 µL
Fleksibel 8 Saluran
50 µL
Fleksibel 8 Saluran
1000 µL

Kapasitas Tip 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Volume yang Diuji 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 L 1000 L
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Akurasi %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%

Presisi %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%

54

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Fleksibel 96 Saluran
1000 µL

50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Ingatlah informasi akurasi ini saat memilih tip untuk pipet Anda. Secara umum, untuk hasil terbaik Anda harus menggunakan tip terkecil yang memenuhi kebutuhan protokol Anda.

Catatan: Opentron melakukan pengujian volumetrik pada pipet Flex untuk memastikan bahwa pipet tersebut memenuhi spesifikasi akurasi dan presisi yang tercantum di atas. Anda tidak perlu mengkalibrasi volume yang dikeluarkan pipet sebelum digunakan. Anda hanya perlu melakukan kalibrasi posisi. Lihat bagian selanjutnya, serta bagian Pemasangan Pipet pada bab Pemasangan dan Relokasi, untuk detailnya.
Layanan Opentrons Care dan Opentrons Care Plus mencakup penggantian pipet tahunan dan sertifikat kalibrasi. Lihat bagian Servis Fleksibel pada bab Pemeliharaan dan Servis untuk detailnya.

Kalibrasi pipet
Kit Pengguna mencakup probe kalibrasi pipet logam, yang Anda gunakan selama kalibrasi posisi. Selama protokol berjalan, simpan probe dengan aman pada dudukan magnet di pilar depan robot. Selama proses kalibrasi, pasang probe ke nosel yang sesuai dan kunci pada tempatnya. Robot menggerakkan probe ke titik kalibrasi di dek untuk mengukur posisi pipet secara tepat.
Adaptor rak ujung pipet
Pipet Opentrons Flex 96 saluran dikirimkan bersama adaptor rak empat ujung. Ini adalah braket aluminium berbentuk presisi yang Anda tempatkan di dek. Adaptor ini menampung rak ujung Flex 50 L, 200 L, dan 1000 µL.

FLEKSI TERBUKA

55

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
Karena adanya gaya yang diperlukan, pipet 96 saluran memerlukan adaptor untuk memasang rak ujung penuh dengan benar. Selama prosedur pemasangan, pipet bergerak melewati adaptor, menurunkan dirinya ke pin pemasangan, dan menarik ujungnya ke pipet dengan mengangkat adaptor dan rak ujung. Menarik ujung pipet, bukan mendorong, memberikan daya ungkit yang diperlukan untuk mengamankan ujung pipet dan mencegah melengkungnya permukaan dek. Setelah selesai, pipet 96 saluran menurunkan adaptor dan rak ujung kosong ke dek. Lihat bagian Tip dan rak tip pada bab Labware untuk informasi lebih lanjut.
Pengambilan tip sebagian
Pipet 96 saluran dapat mengambil satu rak ujung atau ujung yang lebih sedikit. Hal ini meningkatkan jumlah aplikasi yang dapat Anda lakukan dengan pipet 96 saluran, karena pipet tersebut menempati kedua dudukan pipet.
Saat ini, pipet 96 saluran mendukung pengambilan sebagian ujung untuk 8 ujung dalam tata letak kolom. Dalam konfigurasi ini, pipet menggunakan nosel paling kiri untuk mengambil ujung pipet dari kanan ke kiri dari rak ujung, atau nosel paling kanan untuk mengambil ujung kiri ke kanan dari rak ujung.
Saat mengambil kurang dari 96 tip dari rak tip, rak harus ditempatkan langsung di dek, bukan di adaptor rak tip.
Sensor pipet
Pipet Opentrons Flex memiliki sejumlah sensor yang mendeteksi dan mencatat data tentang status pipet dan tip apa pun yang diambilnya.
SENSOR KAPASITAN
Dikombinasikan dengan probe logam atau ujung konduktif, sensor kapasitansi mendeteksi ketika pipet melakukan kontak dengan sesuatu. Deteksi kontak antara probe logam dan dek digunakan dalam proses kalibrasi pipet dan kalibrasi modul otomatis.
Pipet 1 saluran memiliki satu sensor kapasitansi, sedangkan pipet multi saluran memiliki dua: pada saluran 1 dan 8 dari pipet 8 saluran, dan pada saluran 1 dan 96 (posisi A1 dan H12) dari pipet 96 saluran.

56

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

SENSOR KEHADIRAN TIP OPTIK
Sakelar fotointeruptor mendeteksi posisi mekanisme ejektor ujung pipet, memastikan apakah ujungnya berhasil diambil atau dijatuhkan. Pipet 1 saluran, 8 saluran, dan 96 saluran semuanya memiliki sensor optik tunggal yang memantau pemasangan ujung di semua saluran.
Pembaruan firmware pipet
Opentrons Flex secara otomatis memperbarui firmware pipet agar tetap sinkron dengan versi perangkat lunak robot. Pembaruan firmware pipet biasanya berlangsung cepat dan terjadi setiap kali:
Anda memasang pipet. Robot dimulai ulang.
Jika, karena alasan apa pun, versi firmware pipet dan perangkat lunak robot Anda tidak sinkron, Anda dapat memperbarui firmware secara manual di Aplikasi Opentrons.
1. Klik Perangkat. 2. Klik Flex Anda di daftar perangkat. 3. Di bawah Instrumen dan Modul, pipet yang tidak sinkron akan menampilkan spanduk peringatan
“Pembaruan firmware tersedia.” Klik Perbarui sekarang untuk memulai pembaruan.
Kamu bisa view versi firmware yang saat ini terinstal dari setiap pipet yang terpasang. Di layar sentuh, buka Instrumen dan ketuk nama pipet. Di Aplikasi Opentrons, temukan kartu pipet di bawah Instrumen dan Modul, klik menu tiga titik (), lalu klik Tentang pipet.

3.3 Genggaman
Gripper memindahkan peralatan lab ke seluruh area kerja dan stagarea selama pelaksanaan protokol. Gripper dipasang pada dudukan ekstensi, yang terpisah dari dudukan pipet; gripper dapat digunakan dengan konfigurasi pipet apa pun. Untuk detail tentang pemasangan gripper, lihat Pemasangan dan Kalibrasi Instrumen.
Gripper dapat memindahkan peralatan lab melintasi dek dan masuk atau keluar modul. Gripper dapat memanipulasi pelat sumur tertentu, pelat sumur dalam, dan rak ujung tertentu. Untuk rincian lebih lanjut tentang labware apa yang dapat dipindahkan oleh gripper, lihat bagian Labware dan Opentrons Flex Gripper pada bab Labware, atau lihat Perpustakaan Opentrons Labware.

FLEKSI TERBUKA

57

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Spesifikasi gripper
Rahang melakukan gerakan utama gripper, yaitu membuka atau menutup dua dayung paralel untuk menerapkan atau melepaskan gaya pada sisi peralatan lab. Pergerakan rahang dikendalikan oleh motor sikat 36 VDC yang terhubung ke sistem roda gigi rack-and-pinion.
Untuk memindahkan peralatan lab yang telah dicengkeram oleh rahangnya, gantry mengangkat gripper sepanjang sumbu z, menggerakkannya kesamping, lalu menurunkannya ke posisi baru peralatan lab tersebut.
Lokasi komponen gripper.

Sekrup lampiran
Pin kalibrasi Jaws Paddles

Kalibrasi gripper
Gripper dilengkapi pin kalibrasi logam. Pin kalibrasi terletak di tempat penyimpanan tersembunyi di bagian bawah gripper. Sebuah magnet menahan pin pada tempatnya. Untuk melepaskan pin kalibrasi, pegang dengan jari Anda dan tarik perlahan. Untuk mengganti pin, masukkan kembali ke dalam slot penyimpanan. Anda akan tahu bahwa itu aman ketika terpasang pada tempatnya.
Saat mengkalibrasi gripper, pasang pin ke setiap rahang secara bergantian. Robot menggerakkan pin ke titik kalibrasi di dek untuk mengukur posisi gripper secara tepat.
Selama protokol berjalan, letakkan pin di tempat penyimpanannya untuk diamankan. Hubungi kami di support@opentrons.com jika Anda kehilangan pin kalibrasi.

Pembaruan firmware gripper
Opentrons Flex secara otomatis memperbarui firmware gripper agar tetap sinkron dengan versi perangkat lunak robot. Pembaruan firmware gripper biasanya cepat, dan terjadi kapan saja:

58

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
Anda memasang gripper. Robot dimulai ulang.
Jika, karena alasan apa pun, versi firmware gripper dan perangkat lunak robot Anda tidak sinkron, Anda dapat memperbarui firmware secara manual di Aplikasi Opentrons.
1. Klik Perangkat. 2. Klik Flex Anda di daftar perangkat. 3. Di bawah Instrumen dan Modul, gripper yang tidak sinkron akan menampilkan pembacaan spanduk peringatan
“Pembaruan firmware tersedia.” Klik Perbarui sekarang untuk memulai pembaruan.
Kamu bisa view versi firmware gripper yang saat ini diinstal. Di layar sentuh, buka Instrumen dan ketuk gripper. Di Aplikasi Opentrons, temukan kartu gripper di bawah Instrumen dan Modul, klik menu tiga titik (), lalu klik Tentang gripper.
3.4 Liontin Berhenti Darurat
Emergency Stop Pendant (E-stop) adalah tombol perangkat keras khusus untuk menghentikan gerakan robot dengan cepat. Opentrons Flex memerlukan E-stop yang berfungsi dan tidak terhubung untuk dipasang setiap saat. Saat Anda menekan tombol stop, Flex membatalkan protokol apa pun yang sedang berjalan atau alur kerja pengaturan secepat mungkin dan mencegah sebagian besar gerakan robot.
Kapan menggunakan E-stop
Anda mungkin perlu menekan E-stop:
Ketika ada risiko cedera atau bahaya pada pengguna. Ketika ada risiko kerusakan pada robot atau perangkat keras lainnya. Kapan sampfile atau reagen berada dalam bahaya kontaminasi. Setelah tabrakan perangkat keras.
Idealnya Anda tidak perlu menekan E-stop (kecuali selama pengujian kualitas perangkat keras yang jarang dilakukan).
Jangan gunakan E-stop untuk membatalkan pengoperasian normal yang diharapkan. Sebagai gantinya, gunakan tombol perangkat lunak pada layar sentuh atau di Aplikasi Opentrons. Menjeda melalui perangkat lunak akan memungkinkan Anda melanjutkan atau membatalkan protokol Anda, sedangkan menekan E-stop selalu membatalkan protokol dengan segera.

FLEKSI TERBUKA

59

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Melibatkan dan melepaskan E-stop
E-stop memiliki mekanisme tekan untuk mengaktifkan dan memutar untuk melepaskan.
Mengaktifkan: Tekan tombol merah dengan kuat. Flex akan memasuki keadaan berhenti. Penyelesaian: Setelah dihentikan, atasi masalah apa pun di area kerja dengan aman, seperti membersihkan tumpahan,
melepas peralatan lab, atau memindahkan gantry (peralatan tersebut harus dapat digerakkan secara bebas dan mudah dengan tangan). Melepaskan: Putar tombol searah jarum jam. Ini akan muncul ke posisi terlepas. Reset: Pada layar sentuh atau di Aplikasi Opentrons, konfirmasikan bahwa Anda siap untuk melanjutkan Flex
gerakan. Gantry akan kembali ke posisi semula dan aktivitas modul akan dilanjutkan.
Dalam keadaan berhenti, perangkat keras Flex dan tersambung akan berperilaku sebagai berikut:

Pipet Gantri Perangkat Keras
Penjepit
Modul Pengocok Pemanas
Modul Suhu Modul Thermocycler Lampu status Layar sentuh

Perilaku
Gerakan horizontal otomatis dihentikan. Gerakan horizontal manual diperbolehkan.
Gerakan vertikal pipet terhenti. Rem motor pada sumbu vertikal diaktifkan untuk mencegah
pipet agar tidak jatuh. Gerakan pendorong dan pengambilan ujung dihentikan.
Gerakan vertikal gripper dihentikan. Rem motor pada sumbu vertikal diaktifkan untuk mencegah
gripper agar tidak jatuh. Motor rahang yang memberikan gaya cengkeraman tetap diaktifkan
gripper tidak akan menjatuhkan peralatan lab yang mungkin dibawanya.
Pengocok berhenti dan pulang. Kait peralatan lab terbuka. Pemanasan dinonaktifkan.
Pemanasan atau pendinginan dinonaktifkan.
Pemanasan atau pendinginan dinonaktifkan.
Lampu berubah menjadi merah.
Pesan pembatalan mengambil alih layar. Indikator di layar menunjukkan kapan Anda berhasil
mematikan tombol stop.

60

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
3.5 Koneksi

Sakelar Hidup/Mati

Penutup samping

Port USB-A

Inlet Daya IEC

Port AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Koneksi daya
Opentrons Flex terhubung ke sumber listrik melalui saluran masuk IEC-C14 standar. Robot ini berisi catu daya AC/DC internal lengkap, menerima 100 VAC, input 240/50 Hz dan mengubahnya menjadi 60 VDC. Semua elektronik internal lainnya ditenagai oleh pasokan 36 VDC.

Peringatan: Hanya gunakan kabel listrik yang disediakan bersama robot. Jangan gunakan kabel listrik dengan arus atau vol yang tidak memadaitage peringkat.
Jaga agar kabel daya bebas dari penghalang sehingga Anda dapat melepasnya jika perlu.

Terdapat juga baterai sel berbentuk koin CR1220 untuk memberi daya pada jam real-time robot saat tidak tersambung ke listrik. Baterai terletak di dalam penutup layar sentuh. Hubungi Dukungan Opentrons untuk informasi lebih lanjut jika Anda merasa perlu mengganti baterai.

FLEKSI TERBUKA

61

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM
Koneksi USB dan tambahan
Opentrons Flex memiliki total 10 port USB yang terletak di area berbeda pada robot, yang melayani tujuan berbeda.
8 port USB-A belakang (bernomor USB-1 hingga USB-8) dan 2 port tambahan (konektor M12 bernomor AUX-1 dan AUX-2) digunakan untuk menyambungkan modul dan aksesori Opentrons. Lihat bab Modul untuk informasi lebih lanjut tentang menghubungkan perangkat ini dan menggunakannya dalam protokol Anda. Port USB-B belakang untuk menghubungkan robot ke laptop atau komputer desktop, untuk menjalin komunikasi dengan Aplikasi Opentrons yang berjalan di komputer yang terhubung. Port USB-A depan (USB-9), yang terletak di bawah layar sentuh, memiliki fungsi yang sama dengan port USB-A belakang.
Catatan: Port USB dibatasi dayanya untuk melindungi robot dan perangkat yang terhubung. Pengiriman daya dibagi secara internal menjadi tiga grup port: port USB-A belakang kiri (USB-1 hingga USB-4), port USB-A belakang kanan (USB-5 hingga USB-8), dan USB-A depan pelabuhan. Masing-masing grup ini akan mengirimkan maksimum 500 mA ke perangkat kompatibel USB 2.0 yang terhubung.
Koneksi jaringan
Opentrons Flex dapat terhubung ke jaringan area lokal melalui koneksi kabel (Ethernet) atau nirkabel (Wi-Fi).
Port Ethernet terletak di bagian belakang robot. Hubungkan ke hub Ethernet atau aktifkan jaringan Anda. Atau, mulai dari sistem robot versi 7.1.0, sambungkan langsung ke port Ethernet di komputer Anda. Modul Wi-Fi internal mendukung jaringan 802.11 ac/a/b/g/n dengan antena dual-band 2.4/5 GHz.

62

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

3.6 Spesifikasi sistem

Spesifikasi umum

Dimensi Slot Dek Berat
Layar sentuh
USB Ethernet Wi-Fi
Masukan daya Robot Kamera
Volume pasokan listriktage fluktuasi Fluktuasi frekuensi suplai listrik Sistem distribusi Arus suplai hubung singkat Komposisi rangka Komposisi jendela Persyaratan ventilasi

87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 inci (L, D, T)
88.5 kg / 195 lb 12 slot yang kompatibel dengan ANSI/SLAS di area kerja
(dapat diakses oleh pipet) 4 slot tambahan untuk stagtip dan peralatan laboratorium
(hanya dapat diakses oleh gripper) Layar sentuh LCD 7 inci dengan Gorilla Glass 3 yang tahan gores dan rusak
802.11 ac/a/b/g/n pita ganda (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 port USB-A 1 port USB-B kecepatan USB 2.0
2MP, foto dan video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 Sebuah
Desain baja kaku dan aluminium CNC
Jendela samping polikarbonat yang dapat dilepas dan pintu depan Setidaknya 20 cm / 8 inci antara unit dan dinding

FLEKSI TERBUKA

63

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Persyaratan PC yang terhubung

Aplikasi Opentrons berjalan di: Windows 10 atau lebih baru macOS 10.10 atau lebih baru Ubuntu 12.04 atau lebih baru

Spesifikasi lingkungan

Kondisi lingkungan Suhu lingkungan Kelembapan relatif Derajat polusi

Hanya digunakan di dalam ruangan +20 hingga +25 °C (disarankan) 40%, tanpa kondensasi (disarankan) 60 (hanya polusi non-konduktif)

Untuk informasi tambahan mengenai kondisi lingkungan yang dapat diterima untuk penggunaan dan pengangkutan, lihat bagian Kondisi Lingkungan pada bab Instalasi dan Relokasi.

Sertifikasi

Sertifikasi selesai Tidak bersertifikat/validasi

CE, ETL, FCC, ISO 9001IVD, GMP

Ringkasan informasi sertifikasi dicetak pada stiker di bagian belakang Flex, dekat tombol on/off. Untuk informasi sertifikasi dan kepatuhan yang terperinci, lihat bagian Kepatuhan Terhadap Peraturan di Pendahuluan.

Nomor seri
Setiap Flex memiliki nomor seri unik. Format nomor seri memberikan informasi tambahan, termasuk tanggal produksi robot. Misalnyaample, nomor seri FLXA1020231007001 akan menunjukkan:

64

FLEKSI TERBUKA

BAB 3 : DESKRIPSI SISTEM

Karakter FLX A10 2023 10 07 001

Kategori Model Versi Tahun Bulan Hari Satuan

Artinya Robot tersebut adalah Opentrons Flex. Kode untuk versi produksi robot. Robot tersebut dibuat pada tahun 2023. Robot tersebut dibuat pada bulan Oktober. Robot tersebut dibuat pada hari ke 7 setiap bulannya. Nomor unik untuk robot yang dibuat pada hari tertentu.

Anda dapat menemukan nomor seri Flex Anda:
Pada stiker sertifikasi di bagian belakang Flex, dekat tombol on/off. Di sisi belakang layar sentuh (menuju area kerja). Di Aplikasi Opentrons di bawah Perangkat > Flex Anda > Pengaturan robot > Lanjutan.

FLEKSI TERBUKA

65

BAB 4
Modul
Opentrons Flex terintegrasi dengan sejumlah modul perangkat keras Opentrons. Semua modul merupakan periferal yang menempati slot dek, dan sebagian besar dikendalikan oleh robot melalui koneksi USB.
Bab ini menjelaskan fungsi dan spesifikasi fisik modul yang kompatibel dengan sistem Opentrons Flex, serta cara memasang dan mengkalibrasinya. Untuk rincian lebih lanjut tentang pengaturan dan penggunaan modul, lihat manual masing-masing modul. Untuk detail tentang pengintegrasian modul ke dalam protokol Anda, lihat bagian Perancang Protokol pada bab Pengembangan Protokol atau dokumentasi online Python Protocol API.
4.1 Modul yang didukung
Opentrons Flex kompatibel dengan empat jenis modul Opentrons on-deck:
Modul Heater-Shaker menyediakan pemanasan di dek dan guncangan orbital. Modul dapat dipanaskan hingga 95 °C, dan dapat diguncangampkecepatan dari 200 hingga 3000 rpm.
Blok Magnetik adalah perangkat pasif yang mendekatkan peralatan laboratorium dengan magnet neodymium berkekuatan tinggi. Modul Magnetik OT-2 GEN1 dan GEN2, yang secara aktif menggerakkan magnetnya ke atas dan ke bawah relatif terhadap peralatan laboratorium, tidak didukung di Opentrons Flex.
Modul Suhu adalah modul pelat panas dan dingin yang mampu mempertahankan suhu stabil antara 4 dan 95 °C.
Modul Thermocycler menyediakan thermocycling yang sepenuhnya otomatis di dek, memungkinkan otomatisasi langkah-langkah alur kerja hulu dan hilir. Thermocycler GEN2 sepenuhnya kompatibel dengan gripper. Thermocycler GEN1 tidak dapat digunakan dengan gripper, dan oleh karena itu tidak didukung pada Opentrons Flex.
Beberapa modul yang awalnya dirancang untuk OT-2 kompatibel dengan Flex, seperti dirangkum dalam tabel di bawah. Tanda centang menunjukkan kompatibilitas, dan tanda X menunjukkan ketidakcocokan.

66

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL

Jenis dan generasi perangkat Modul Pengocok Pemanas GEN1 Modul Magnetik GEN1 Modul Magnetik GEN2 Blok Magnetik GEN1 Modul Suhu GEN1 Modul Suhu GEN2 Modul Thermocycler GEN1 Modul Thermocycler GEN2 Modul HEPA

OT-2

Melenturkan

×

×

×

×

×

×

4.2 Sistem caddy modul
Modul yang kompatibel dirancang agar sesuai dengan caddies yang menempati ruang di bawah dek. Sistem ini memungkinkan peralatan laboratorium di atas modul tetap berada lebih dekat ke permukaan dek, dan juga memungkinkan perutean kabel di bawah dek sehingga dek tetap rapi selama protokol Anda dijalankan.

Caddies untuk Modul Heater-Shaker, Temperature, dan Thermocycler.

FLEKSI TERBUKA

67

BAB 4: MODUL
Untuk memasang modul ke permukaan dek, modul tersebut harus ditempatkan terlebih dahulu ke dalam wadah modul yang sesuai. Setiap jenis modul yang kompatibel memiliki desain caddy tersendiri yang menyelaraskan modul dan peralatan lab secara tepat dengan dek di sekitarnya. (Pengecualiannya adalah Blok Magnetik, yang tidak memerlukan daya atau perutean kabel USB sehingga ditempatkan langsung di permukaan dek.) Caddies untuk modul yang menempati satu slot dapat ditempatkan di mana saja di kolom 1 atau 3; Thermocycler hanya dapat ditempatkan pada slot A1 dan B1 secara bersamaan.
Secara umum, untuk memasang modul caddy:
1. Lepaskan semua slot dek dari lokasi penempatan modul. 2. Pasang modul ke dalam wadahnya dan kencangkan jangkarnya. 3. Rutekan kabel daya modul dan USB melalui penutup samping, ke atas melalui slot dek yang kosong, dan
lampirkan ke modul. 4. Tempatkan wadah modul ke dalam slot dan kencangkan hingga terpasang pada tempatnya.
Untuk petunjuk pemasangan yang tepat, lihat Panduan Memulai Cepat atau Instruksi Manual untuk modul tertentu. Sambungan kabel dan metode pemasangan ke caddy bervariasi berdasarkan modul.
4.3 Kalibrasi modul
Saat pertama kali memasang modul di Flex, Anda perlu menjalankan kalibrasi posisi otomatis. Proses ini mirip dengan kalibrasi posisi untuk instrumen, dan memastikan bahwa Flex berpindah ke lokasi yang tepat untuk kinerja protokol yang optimal. Selama kalibrasi, Flex akan berpindah ke lokasi pada adaptor kalibrasi modul, yang terlihat mirip dengan kotak kalibrasi yang merupakan bagian dari slot dek yang dapat dilepas.

Adaptor kalibrasi untuk Modul Heater-Shaker, Temperature, dan Thermocycler.
Kalibrasi modul diperlukan untuk semua modul yang dipasang melalui caddy: Modul Pengocok Pemanas, Suhu, dan Thermocycler. Blok Magnetik tidak memerlukan kalibrasi, dan siap digunakan segera setelah Anda meletakkannya di dek.

68

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL
Kapan mengkalibrasi modul
Flex secara otomatis meminta Anda untuk melakukan kalibrasi saat Anda menyambungkan dan menghidupkan modul yang tidak memiliki data kalibrasi tersimpan. (Anda dapat mengabaikan permintaan ini, namun Anda tidak akan dapat menjalankan protokol dengan modul sampai Anda mengkalibrasinya.)
Setelah Anda menyelesaikan kalibrasi, Flex menyimpan data kalibrasi dan nomor seri modul untuk penggunaan di masa mendatang. Flex tidak akan meminta Anda untuk mengkalibrasi ulang kecuali Anda menghapus data kalibrasi untuk modul tersebut di pengaturan robot. Anda dapat dengan bebas menghidupkan dan mematikan modul, atau bahkan memindahkannya ke slot dek lain, tanpa perlu mengkalibrasi ulang. Jika Anda ingin mengkalibrasi ulang, Anda dapat memulai proses kapan saja dari kartu modul di Aplikasi Opentrons. (Kalibrasi ulang tidak tersedia dari layar sentuh.)
Cara mengkalibrasi modul
Petunjuk pada layar sentuh atau Aplikasi Opentrons akan memandu Anda melalui prosedur kalibrasi. Secara umum langkah-langkahnya adalah:
1. Kumpulkan peralatan yang diperlukan, termasuk adaptor kalibrasi modul dan probe kalibrasi pipet. 2. Tempatkan adaptor kalibrasi pada permukaan modul dan pastikan posisinya benar-benar rata.
Beberapa modul mungkin mengharuskan Anda mengencangkan adaptor ke modul. 3. Pasang probe kalibrasi ke pipet. 4. Flex akan secara otomatis bergerak menyentuh titik-titik tertentu pada adaptor kalibrasi dan menyimpannya
nilai kalibrasi untuk penggunaan masa depan.
Setelah kalibrasi selesai dan Anda melepaskan adaptor dan probe, modul akan siap digunakan dalam protokol.
Kapan saja Anda bisa view dan kelola data kalibrasi modul Anda di Aplikasi Opentrons. Buka Pengaturan Robot untuk Flex Anda dan klik pada tab Kalibrasi.

FLEKSI TERBUKA

69

BAB 4: MODUL
4.4 Modul Pengocok Pemanas GEN1

Fitur Pengocok Pemanas
PEMANASAN DAN GETARAN
Heater-Shaker menyediakan pemanasan di dek dan guncangan orbital. Modul dapat dipanaskan hingga 95 °C, dengan suhu pro sebagai berikutfile:
Kisaran suhu: 37 °C Akurasi suhu: ±95 °C pada 0.5 °C Keseragaman suhu: ±55 °C pada 0.5 °CRamp kecepatan: 10 °C/menit
Modul dapat mengguncang samples dari 200 hingga 3000 rpm, dengan pengocokan berikutfile:
Diameter orbital: 2.0 mm Arah orbital: Searah jarum jam Rentang kecepatan: 200 rpm Akurasi kecepatan: ±3000 rpm
Modul ini memiliki kait peralatan laboratorium bertenaga untuk mengamankan pelat ke modul sebelum diguncang.

70

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL
ADAPTOR TERMAL Adaptor termal yang kompatibel diperlukan untuk menambahkan peralatan laboratorium ke Heater-Shaker. Adaptor dapat dibeli langsung dari Opentrons di https://shop.opentrons.com. Adaptor Termal yang tersedia saat ini meliputi:

Adaptor Datar Universal

Adaptor PCR

Adaptor Sumur Dalam

96 Adaptor Bawah Datar

KONTROL PERANGKAT LUNAK
Heater-Shaker sepenuhnya dapat diprogram dalam Protocol Designer dan Python Protocol API. API Python juga memungkinkan langkah-langkah protokol lain dilakukan secara paralel saat Heater-Shaker aktif. Lihat Perintah non-pemblokiran dalam dokumentasi API untuk detail tentang menambahkan langkah paralel ke protokol Anda.
Di luar protokol, Aplikasi Opentrons dapat menampilkan status Heater-Shaker saat ini dan dapat langsung mengontrol pemanas, pengocok, dan kait peralatan lab.

FLEKSI TERBUKA

71

BAB 4: MODUL

Spesifikasi Pengocok Pemanas

Dimensi Berat Modul input daya Input adaptor daya Catu daya listrik voltage fluktuasi Berlebihantage Konsumsi daya

152 × 90 × 82 mm (P/L/T) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategori II Idle: 10 W

Khas: Gemetar: 4 W Pemanasan: 11 W Pemanasan dan guncangan: 10 W

Kondisi lingkungan Suhu lingkungan Kelembaban relatif Ketinggian Derajat polusi

Maksimum: 125 W Penggunaan di dalam ruangan saja 130 °C Hingga 20%, tanpa kondensasi Hingga 25 m di atas permukaan laut 80

72

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL
4.5 Blok Magnetik GEN1

Fitur Blok Magnetik
Opentrons Magnetic Block GEN1 adalah dudukan pelat magnetik 96 sumur. Blok magnetik digunakan dalam protokol yang mengandalkan magnet untuk menarik partikel keluar dari suspensi dan menahannya di pelat sumur selama prosedur pencucian, pembilasan, atau elusi lainnya. Misalnyaample, persiapan NGS otomatis; memurnikan DNA, RNA, atau protein genomik dan mitokondria; dan prosedur ekstraksi lainnya merupakan kasus penggunaan yang dapat melibatkan blok magnetik.
KOMPONEN MAGNETIK
Blok Magnetik tidak memiliki daya, tidak mengandung komponen elektronik apa pun, dan tidak menggerakkan manik-manik magnet ke atas atau ke bawah dalam larutan. Sumur tersebut terdiri dari 96 magnet cincin neodymium berkekuatan tinggi yang dipasang pada alas pegas, yang membantu menjaga toleransi antara blok dan pipet saat menjalankan protokol otomatis.
KONTROL PERANGKAT LUNAK
Blok Magnetik GEN1 sepenuhnya dapat diprogram dalam Perancang Protokol dan API Protokol Python.

FLEKSI TERBUKA

73

BAB 4: MODUL

Namun, di luar protokol, layar sentuh dan Aplikasi Opentrons tidak mengetahui dan tidak dapat menampilkan status terkini dari Blok Magnetik GEN1. Ini adalah modul tanpa daya. Itu tidak mengandung komponen elektronik atau mekanik yang dapat berkomunikasi dengan robot Flex. Anda “mengontrol” Blok Magnetik melalui protokol yang menggunakan Opentrons Flex Gripper untuk menambah dan menghapus labware dari modul ini.

Spesifikasi Blok Magnetik

Dimensi Berat Modul daya Kelas magnet Kondisi lingkungan Suhu lingkungan Kelembapan relatif Ketinggian Derajat polusi

136 × 94 × 45 mm (L/W/H) 1.13 kg Tidak ada, modul tidak diberi daya N52 neodymium Penggunaan di dalam ruangan hanya 20 °C 25%, tanpa kondensasi Hingga 30 m di atas permukaan laut 80

74

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL
4.6 Modul Suhu GEN2

Fitur Modul Suhu
PEMANASAN DAN PENDINGINAN
Modul Suhu Opentrons GEN2 adalah modul pelat panas dan dingin. Ini sering digunakan dalam protokol yang memerlukan pemanasan, pendinginan, atau perubahan suhu. Modul ini dapat mencapai dan mempertahankan suhu mulai dari 4 °C hingga 95 °C dalam hitungan menit, tergantung pada konfigurasi dan konten modul.
BLOK TERMAL
Untuk menahan peralatan laboratorium pada suhu tertentu, modul ini menggunakan blok termal aluminium. Modul ini dilengkapi dengan blok termal 24 sumur dan 96 sumur. Caddy Modul Suhu dilengkapi dengan blok sumur dalam dan blok dasar datar yang dirancang untuk digunakan dengan Flex Gripper. Blok tersebut menampung tabung 1.5 mL dan 2.0 mL, pelat PCR 96 sumur, strip PCR, pelat sumur dalam, dan pelat dasar datar.

FLEKSI TERBUKA

75

BAB 4: MODUL
Catatan: Modul ini juga dikirimkan dengan blok bawah datar untuk OT-2. Jangan gunakan blok OT-2 dengan Flex. Blok bawah datar untuk Flex memiliki tulisan "Opentrons Flex" di permukaan atasnya. Yang untuk OT-2 tidak.

Blok termal 24 sumur

Blok termal 96 sumur

Blok termal sumur dalam

Blok termal bawah datar untuk Flex

MANDI AIR DAN PEMANASAN
Karena udara merupakan isolator termal yang baik, celah antara peralatan laboratorium dan blok termal dapat memengaruhi kinerja Modul Suhu dari waktu ke waktu. Menempatkan sedikit air di blok termal 24 atau 96 sumur menghilangkan celah udara dan meningkatkan efisiensi pemanasan. Jumlah air yang ideal bergantung pada blok termal dan peralatan laboratorium. Lihat Buku Putih Modul Suhu untuk rekomendasi lebih lanjut.

KONTROL PERANGKAT LUNAK
Modul Suhu sepenuhnya dapat diprogram dalam Protocol Designer dan Python Protocol API.
Di luar protokol, Aplikasi Opentrons dapat menampilkan status Modul Suhu saat ini dan dapat langsung mengontrol suhu pelat permukaan.

76

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL

Spesifikasi Modul Suhu

Dimensi Kekuatan Modul Berat
Kondisi lingkungan Suhu lingkungan Kelembaban relatif Ketinggian Derajat polusi

194 × 90 × 84 mm (L/W/H) 1.5 kg Input: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Output: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks Hanya penggunaan di dalam ruangan <219.6 °C (direkomendasikan untuk pendinginan optimal ) Hingga 22%, tanpa kondensasi Hingga 60 m di atas permukaan laut 2000

4.7 Modul Termocycler GEN2

FLEKSI TERBUKA

77

BAB 4: MODUL
Fitur termocycler
Opentrons Thermocycler Module GEN2 adalah thermocycler on-deck yang sepenuhnya otomatis, menyediakan PCR hands-free dalam format pelat 96 sumur. Tutupnya yang berpemanas dan segel sekali pakai terpasang erat di atas pelat, memastikan efisiensiample pemanasan dan penguapan minimal.
PEMANASAN DAN PENDINGINAN Blok Thermocycler dapat memanas dan mendinginkan, dan tutupnya dapat memanas, dengan suhu pro sebagai berikutfile: Kisaran suhu blok termal: 4 °C Pemanasan maksimum blok termal ramp laju: 4.25 °C/s dari lingkungan GEN2 hingga 95 °C Pendinginan maksimum blok termal ramp kecepatan: 2.0 °C/s dari 95 °C hingga ambien Kisaran suhu tutup: 37 °C Akurasi suhu tutup: ±110 °C Tutup otomatis dapat dibuka atau ditutup sesuai kebutuhan selama pelaksanaan protokol.
TERMOSIKLER PROFILES Thermocycler dapat menjalankan profiles: secara otomatis menelusuri urutan suhu blok untuk melakukan reaksi peka panas.
SEGEL OTOMATISASI KARET Thermocycler dilengkapi dengan segel otomasi karet untuk membantu mengurangi penguapan. Setiap segel harus disterilkan sebelum digunakan dan dapat digunakan untuk beberapa kali proses. Segel tambahan dapat dibeli langsung dari Opentrons di https://shop.opentrons.com.
KONTROL PERANGKAT LUNAK Thermocycler sepenuhnya dapat diprogram dalam Perancang Protokol dan API Protokol Python. Di luar protokol, Aplikasi Opentrons dapat menampilkan status Thermocycler saat ini dan dapat langsung mengontrol suhu blok, suhu tutup, dan posisi tutup.

78

FLEKSI TERBUKA

BAB 4: MODUL

Spesifikasi termosiklik

Dimensi (tutup terbuka) Dimensi (tutup tertutup) Berat (termasuk saluran belakang) Adaptor daya voltage Arus adaptor daya Berlebihantage Kondisi lingkungan Suhu sekitar Kelembaban relatif Ketinggian Persyaratan ventilasi

244.95 × 172 × 310.1 mm (L/W/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/W/H) 8.4 kg 100 V pada 240/50 Hz 60 A Kategori II Penggunaan di dalam ruangan hanya 8.5 °C (ideal); 5 °C (dapat diterima) 20%, tanpa kondensasi Hingga 25 m di atas permukaan laut Setidaknya 2 cm / 40 inci antara unit dan dinding

FLEKSI TERBUKA

79

BAB 5
Peralatan laboratorium
Bab ini membahas item di Perpustakaan Opentrons Labware yang dapat Anda gunakan dengan Opentrons Flex dan Opentrons Flex Gripper. Ini juga mencakup perangkat lab khusus dan, bagi pengguna tingkat lanjut kami, menautkan komponen perangkat lab ke JSON yang sesuai file definisi.
Anda dapat membeli peralatan lab dari produsen peralatan asli atau dari toko Opentrons di https://shop.opentrons.com. Dan, Opentrons selalu berupaya memverifikasi definisi labware baru. Lihat Perpustakaan Labware (tertaut di atas) untuk daftar terbaru.
5.1 Konsep perangkat laboratorium
Labware mencakup lebih dari sekedar objek yang ditempatkan di dek dan digunakan dalam suatu protokol. Untuk membantu Anda memahami labware Opentrons, mari kita periksa topik ini dari tiga perspektif berbeda. Untuk Opentrons Flex, perangkat lab mencakup item di Perpustakaan Labware kami, data yang mendefinisikan setiap perangkat lab, dan perangkat lab khusus.
Labware sebagai perangkat keras
Perpustakaan Labware mencakup semua yang dapat Anda gunakan secara default dengan Opentrons Flex. Ini adalah komponen tahan lama dan barang habis pakai yang Anda gunakan, gunakan kembali, atau buang saat menjalankan protokol. Anda tidak perlu mengambil langkah khusus apa pun untuk bekerja dengan item di Perpustakaan Labware. Robot Flex mengetahui cara bekerja dengan semua yang ada di perpustakaan secara otomatis.
Perangkat laboratorium sebagai data
Informasi labware disimpan dalam notasi objek Javascript (JSON) files dengan .json file ekstensi. Sebuah JSON file mencakup dimensi spasial (panjang, lebar, tinggi), kapasitas volumetrik (L, mL), dan metrik lain yang menentukan fitur permukaan, bentuk, dan lokasinya. Saat menjalankan protokol, Flex membaca .json ini fileKita perlu mengetahui labware apa yang ada di dek dan cara menggunakannya.

80

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB
Peralatan laboratorium khusus
Custom labware adalah labware yang tidak termasuk dalam Labware Library atau merupakan labware yang dibuat oleh Custom Labware Creator. Namun, terkadang gagasan tentang peralatan laboratorium khusus terbebani oleh kompleksitas, biaya, atau kesulitan. Namun, labware khusus seharusnya tidak sulit untuk dipahami atau dibuat. Mari luangkan waktu sejenak untuk membongkar konsep labware khusus.
Sebagai mantanampMisalnya, Perpustakaan Opentrons Labware mencakup pelat 96 lubang (200 L) dari Corning dan BioRad, namun produsen lain juga membuat pelat lubang ini. Dan, berkat standar industri yang diterima secara umum, perbedaan di antara item-item laboratorium yang ada di mana-mana ini sangatlah kecil. Namun, pelat biasa berukuran 200 L, 96 lubang dari Stellar Scientific, Oxford Lab, atau Krackeler Scientific (atau pemasok lainnya) adalah “peralatan lab khusus” untuk Flex karena belum ditentukan sebelumnya di Perpustakaan Labware kami . Selain itu, perbedaan kecil dalam dimensi perangkat laboratorium dapat berdampak drastis pada keberhasilan protokol Anda dijalankan. Oleh karena itu, penting untuk memiliki definisi perangkat lab yang akurat untuk setiap perangkat lab yang ingin Anda gunakan dalam protokol Anda.
Selain itu, meskipun peralatan laboratorium khusus dapat menjadi perangkat yang hanya dimiliki satu kali saja, sebagian besar hanya berupa ujung, pelat, tabung, dan rak yang digunakan setiap hari di laboratorium di seluruh dunia. Sekali lagi, satu-satunya perbedaan antara labware Opentrons dan labware khusus adalah item baru tersebut tidak ditentukan sebelumnya dalam perangkat lunak yang menggerakkan robot. Flex dapat, dan berfungsi, dengan item perangkat lab dasar lainnya atau sesuatu yang unik, namun Anda perlu mencatat karakteristik item tersebut dalam definisi perangkat lab JSON file dan impor data tersebut ke Aplikasi Opentrons. Lihat bagian Definisi Labware Khusus di bawah untuk informasi lebih lanjut.
Singkatnya, labware meliputi:
Segala sesuatu di Perpustakaan Labware Opentrons. Definisi Labware: data dalam JSON file yang mendefinisikan bentuk, ukuran, dan kemampuan masing-masing item
seperti pelat sumur, tip, reservoir, dll. Peralatan lab khusus, yang merupakan item yang tidak disertakan dalam Perpustakaan Labware.
Setelah kembaliviewMengingat konsep penting ini, mari kita periksa kategori dan item di Opentrons Labware Library. Setelah itu, kita akan menyelesaikan bab ini dengan selesaiview komponen data dari perangkat laboratorium file dan merangkum fitur dan layanan Opentrons yang membantu Anda membuat labware khusus.

FLEKSI TERBUKA

81

BAB 5: PERANGKAT LAB

5.2 Waduk
Opentrons Flex bekerja secara default dengan reservoir sumur tunggal dan multi yang tercantum di bawah. Menggunakan reservoir ini membantu mengurangi beban pekerjaan persiapan Anda karena reservoir ini sudah siap diotomatisasi. Informasi reservoir juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.

Reservoir sumur tunggal

Spesifikasi Pabrikan

Agilent

290 mL V bagian bawah

Aksigen

90 mL Dasar rata

SARANG

195 mL Dasar rata

290 mL V bagian bawah

Nama pemuatan API
agilient_1_ reservoir_290ml
oksigen_1_ reservoir_90ml
sarang_1_ reservoir_195ml
sarang_1_ reservoir_290ml

Reservoir multi-sumur

Spesifikasi Pabrikan

SARANG

12 lubang 15 mL/lubang V dasar

Ilmiah AS

12 lubang 22 mL/lubang V dasar

Nama pemuatan API nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml

82

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB
Definisi reservoir dan API
Perpustakaan Labware Opentrons mendefinisikan karakteristik reservoir yang tercantum di atas dalam JSON terpisah fileS. Robot dan Opentrons Python API mengandalkan definisi JSON ini untuk bekerja dengan perangkat lab yang digunakan oleh protokol Anda. Misalnyaampmisalnya, saat bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama labware ini sebagai parameter valid dalam kode Anda. Nama beban API tertaut terhubung ke definisi labware reservoir di repositori Opentrons GitHub.
Peralatan laboratorium reservoir khusus
Coba buat definisi labware khusus dengan Opentrons Labware Creator jika reservoir yang ingin Anda gunakan tidak tercantum di sini. Definisi khusus menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasitas volumetrik, dan informasi lainnya dalam JSON file. Opentrons Flex memerlukan informasi ini untuk memahami cara bekerja dengan labware khusus Anda. Lihat bagian Definisi Labware Khusus untuk informasi lebih lanjut.
5.3 Pelat sumur
Opentrons Flex bekerja secara default dengan pelat sumur yang tercantum di bawah. Menggunakan pelat sumur ini membantu mengurangi beban pekerjaan persiapan Anda karena sudah siap diotomatisasi. Informasi pelat sumur juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.

FLEKSI TERBUKA

83

BAB 5: PERANGKAT LAB

pelat 6 lubang
Produsen Corning

Spesifikasi
6 lubang 16.8 mL/sumur Sumur melingkar, dasar rata

Nama pemuatan API corning_6_wellplate_16.8ml_flat

pelat 12 lubang
Produsen Corning

Spesifikasi
12 lubang 6.9 mL/sumur Sumur melingkar, dasar rata

Nama pemuatan API corning_12_wellplate_6.9ml_flat

pelat 24 lubang
Produsen Corning

Spesifikasi
24 lubang 3.4 mL/sumur Sumur melingkar, dasar rata

Nama pemuatan API corning_24_wellplate_3.4ml_flat

pelat 48 lubang
Produsen Corning

Spesifikasi
48 lubang 1.6 mL/sumur Sumur melingkar, dasar rata

Nama pemuatan API corning_48_wellplate_1.6ml_flat

84

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB

pelat 96 lubang
Produsen Bio-Rad Corning NEST
Opentron Termo Ilmiah
Ilmiah AS

Spesifikasi
96 sumur 200 µL/sumur Sumur melingkar, dasar V
96 sumur 360 µL/sumur Sumur melingkar, dasar rata
96 sumur 100 µL/sumur Sumur melingkar, rok penuh PCR bawah V
96 sumur 200 µL/sumur Sumur melingkar, dasar rata
96 sumur dalam 2000 µL/sumur Sumur persegi, dasar V
Tangguh 96 sumur 200 µL/sumur Sumur melingkar, rok penuh PCR bawah V
Nunc 96 sumur dalam 1300 µL/sumur Sumur melingkar, dasar U
Nunc 96 sumur dalam 2000 µL/sumur Sumur melingkar, dasar U
96 sumur dalam 2.4 mL/sumur Sumur persegi, bagian bawah U

Nama pemuatan API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
sarang_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ rok
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

FLEKSI TERBUKA

85

BAB 5: PERANGKAT LAB

pelat 384 lubang

Produsen Biosistem Terapan Bio-Rad
Corning

Spesifikasi
384 sumur 40 µL/sumur Sumur melingkar, dasar V
384 sumur 50 µL/sumur Sumur melingkar, dasar V
384 sumur 112 µL/sumur Sumur berbentuk persegi, dasar rata

Nama beban API diterapkanbiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Adaptor pelat sumur
Pelat aluminium yang tercantum di bawah ini adalah adaptor termal untuk modul Opentrons Heater-Shaker GEN1. Anda dapat menggunakan definisi adaptor mandiri ini untuk memuat perangkat lab terverifikasi atau kustom Opentron di atas Heater-Shaker.

Tipe adaptor Opentrons Adaptor Pengocok Pemanas Datar Universal Opentrons 96 Adaptor Pengocok Pemanas PCR Opentrons 96 Adaptor Pengocok Pemanas Sumur Dalam Opentrons 96 Adaptor Pengocok Pemanas Bawah Datar

Nama pemuatan API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Anda juga dapat memuat adaptor dan labware dengan satu definisi. Perpustakaan Labware kami mencakup beberapa adaptor termal dan kombinasi labware pra-konfigurasi yang membuat Heater-Shaker siap digunakan langsung.

86

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB

Catatan: Jangan gunakan definisi gabungan jika Anda perlu memindahkan peralatan lab ke dalam atau ke luar Heater-Shaker selama protokol Anda, baik dengan gripper atau secara manual. Gunakan definisi adaptor mandiri sebagai gantinya.

Kombinasi adaptor/peralatan laboratorium

Nama pemuatan API

Opentrons 96 Adaptor Pengocok Pemanas Sumur Dalam dengan Pelat Sumur Dalam NEST 2 mL

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep

Opentrons 96 Adaptor Pengocok Pemanas Bawah Datar dengan Pelat Sumur NEST 96 200 µL Datar

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat

Adaptor Pengocok Pemanas PCR Opentrons 96 dengan Pelat Sumur NEST 100 µL

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt

Adaptor Pengocok Pemanas Datar Universal Opentrons dengan Pelat Sumur Corning 384 Datar 112 µL

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat

Adaptor dapat dibeli langsung dari Opentrons di https://shop.opentrons.com.

Pelat sumur dan definisi API
Perpustakaan Labware Opentrons mendefinisikan karakteristik pelat sumur yang tercantum di atas dalam JSON terpisah fileS. Robot Flex dan Opentrons Python API mengandalkan definisi JSON ini untuk bekerja dengan perangkat lab yang digunakan oleh protokol Anda. Misalnyaampmisalnya, saat bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama labware ini sebagai parameter valid dalam kode Anda. Nama muatan API yang tertaut terhubung ke definisi perangkat laboratorium pelat sumur di repositori Opentrons GitHub.

Peralatan laboratorium pelat sumur khusus
Coba gunakan Opentrons Labware Creator untuk membuat definisi labware khusus jika pelat sumur yang ingin Anda gunakan tidak tercantum di sini. Definisi khusus menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasitas volumetrik, dan informasi lainnya dalam JSON file. Opentrons Flex membaca informasi ini untuk memahami cara bekerja dengan labware khusus Anda. Lihat bagian Definisi Labware Khusus untuk informasi lebih lanjut.

FLEKSI TERBUKA

87

BAB 5: PERANGKAT LAB

5.4 Tip dan rak tip
Tip Opentrons Flex tersedia dalam ukuran 50 µL, 200 µL, dan 1000 µL. Ini adalah ujung polipropilen non-konduktif bening yang tersedia dengan atau tanpa filter. Mereka dikemas steril dalam rak yang menampung 96 ujung dan bebas dari DNase, RNase, protease, pirogen, DNA manusia, endotoksin, dan inhibitor PCR. Rak juga mencantumkan nomor lot dan tanggal kedaluwarsa.
Ujung pipet fleksibel berfungsi dengan pipet Opentrons Flex 50 µL dan 1000 µL dalam konfigurasi 1, 8, dan 96 saluran. Meskipun Anda dapat memasang salah satu ujung Flex pada pipet 50 L dan 1000 L, cobalah mencocokkan ujung tersebut dengan kapasitas tetapan pipet. Misalnyaampya, mungkin aneh jika memasang ujung pipet 1000 L pada pipet 50 L. Untuk pipet 1000 L tentunya bisa menggunakan tip 50 L, 200 L, atau 1000 L.

Rak ujung
Tip yang tidak difilter dan difilter digabungkan ke dalam rak yang terdiri dari pelat dasar yang dapat digunakan kembali, pelat tengah yang menampung 96 tip, dan penutup.

Rak ujung berdasarkan volume 50 µL 200 µL 1000 µL

Nama pemuatan API
Tanpa filter: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Difilter: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Tanpa filter: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Difilter: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Tanpa filter: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Difilter: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

Untuk membantu identifikasi, pelat tengah rak ujung diberi kode warna berdasarkan ukuran ujung:
50 µL: magenta 200 L: kuning 1000 µL: biru

88

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB

Saat memesan atau menyusun ulang, tip dan rak tersedia dalam dua konfigurasi paket berbeda:
Rak: Terdiri dari rak ujung yang dibungkus susut secara terpisah (pelat dasar, pelat tengah dengan ujung, dan penutup). Konfigurasi rak paling baik dilakukan ketika kebersihan adalah hal terpenting, untuk menghindari kontaminasi silang, atau ketika protokol Anda tidak mengizinkan penggunaan kembali pelat dasar atau komponen.
Isi ulang: Terdiri dari satu rak ujung lengkap (pelat dasar, pelat tengah dengan ujung, dan penutup) dan wadah ujung tersendiri. Konfigurasi isi ulang paling baik dilakukan jika protokol Anda mengizinkan penggunaan kembali pelat dasar atau komponen.
Kompatibilitas tippipet
Ujung pipet fleksibel dirancang untuk pipet Opentrons Flex. Tip fleksibel tidak kompatibel dengan pipet Opentrons OT-2, Anda juga tidak dapat menggunakan tip OT-2 pada pipet Flex.
Tip standar industri lainnya mungkin dapat digunakan dengan pipet Flex, namun hal ini tidak disarankan. Untuk memastikan kinerja optimal, Anda sebaiknya hanya menggunakan tip Opentrons Flex dengan pipet Flex.
Adaptor rak ujung
Pipet 96 saluran memerlukan adaptor untuk memasang seluruh rak ujung pipet dengan benar. Selama prosedur pemasangan, pipet bergerak melewati adaptor, menurunkan dirinya ke pin pemasangan, dan menarik ujungnya ke pipet dengan mengangkat adaptor dan rak ujung.

FLEKSI TERBUKA

89

BAB 5: PERANGKAT LAB

Catatan: Hanya gunakan adaptor rak ujung saat mengambil seluruh rak ujung sekaligus. Tempatkan rak tip langsung di dek saat mengambil lebih sedikit tip.
Peringatan: Bahaya titik terjepit. Jauhkan tangan dari adaptor rak ujung saat pipet sedang memasang ujung pipet.

Tipe adaptor Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter

Nama beban API opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Adaptor rak ujung kompatibel dengan Opentrons Flex Gripper. Anda dapat menggunakan gripper untuk meletakkan rak ujung yang baru pada adaptor atau untuk mengambil dan memindahkan rak ujung yang sudah digunakan ke dalam saluran pembuangan.

5.5 Tabung dan rak tabung

Sistem Rak Tabung Opentrons 4-in-1 bekerja dengan Opentrons Flex secara default. Menggunakan rak tabung 4-in-1 membantu mengurangi beban kerja persiapan Anda karena kombinasi yang disediakan sudah siap diotomatisasi. Informasi lebih lanjut juga tersedia di Perpustakaan Opentrons Labware.

90

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB
Kombinasi tabung dan rak
Rak tabung Opentrons 4-in-1 mendukung berbagai ukuran tabung, sendiri-sendiri atau dalam kombinasi ukuran (volume) yang berbeda. Ini termasuk: rak 6 tabung untuk tabung 50 mL (6 x 50 mL). Rak kombinasi 10 tabung untuk empat tabung 50 mL dan enam tabung 15 mL (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). Rak 15 tabung untuk tabung 15 mL (15 x 15 mL). Rak 24 tabung untuk tabung 0.5 mL, 1.5 mL, atau 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Catatan: Semua tabung berbentuk silinder dengan dasar berbentuk V (kerucut) kecuali dinyatakan lain.

rak 6 tabung
Tipe tabung 6 Falcon 50 mL 6 SARANG 50 mL
rak 10 tabung
Tipe tabung 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 SARANG 50 mL 6 SARANG 15 mL

Nama pemuatan API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

FLEKSI TERBUKA

91

BAB 5: PERANGKAT LAB

rak 15 tabung
Tipe tabung 15 Falcon 15 mL 15 SARANG 15 mL

Nama pemuatan API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

rak 24 tabung

Jenis tabung
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, bagian bawah berbentuk U 24 tutup ulir generik 2 mL 24 NEST 0.5 mL tutup ulir 24 NEST 1.5 mL tutup ulir 24 NEST 1.5 mL tutup ulir 24 NEST 2 mL tutup ulir 24 Tutup jepret NEST 2 mL, bagian bawah berbentuk U

Nama pemuatan API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

Definisi API rak tabung
Perpustakaan Labware Opentrons mendefinisikan karakteristik rak tabung yang tercantum di atas dalam JSON terpisah fileS. Robot Flex dan Opentrons Python API mengandalkan definisi JSON ini untuk bekerja dengan perangkat lab yang digunakan oleh protokol Anda. Misalnyaampmisalnya, saat bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama labware ini sebagai parameter valid dalam kode Anda. Nama beban API tertaut terhubung ke definisi labware rak tabung di repositori Opentrons GitHub.

92

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB
Peralatan laboratorium rak tabung khusus
Coba buat definisi labware khusus menggunakan Opentrons Labware Creator jika kombinasi tabung dan rak yang ingin Anda gunakan tidak tercantum di sini. Definisi khusus menggabungkan semua dimensi, metadata, bentuk, kapasitas volumetrik, dan informasi lainnya dalam JSON file. Opentrons Flex membaca informasi ini untuk memahami cara bekerja dengan labware khusus Anda. Lihat bagian Definisi Labware Khusus untuk informasi lebih lanjut.
5.6 Blok aluminium
Blok aluminium dikirimkan bersama Modul Suhu GEN2 dan dapat dibeli secara terpisah sebagai satu set tiga bagian. Set ini mencakup pelat bawah datar, blok 24 sumur, dan blok 96 sumur.
Opentrons Flex menggunakan balok aluminium untuk menampung sample tabung dan pelat sumur pada Modul Suhu atau langsung di dek. Saat digunakan dengan Modul Suhu, balok aluminium dapat menjaga suhu Anda tetap dinginample tabung, strip PCR, atau pelat pada suhu konstan antara 4 °C dan 95 °C.
Pelat bawah datar
Pelat bawah datar untuk Flex dikirimkan dengan caddy Modul Suhu dan kompatibel dengan berbagai pelat sumur standar ANSI/SLAS. Pelat datar ini berbeda dengan pelat yang dikirimkan bersama Modul Suhu itu sendiri atau set tiga bagian terpisah. Ini memiliki permukaan kerja yang lebih luas dan klip sudut yang dilubangi. Fitur-fitur ini membantu meningkatkan kinerja Opentrons Flex Gripper saat memindahkan peralatan lab ke dalam atau ke luar pelat.
Anda dapat mengetahui pelat bawah datar mana yang Anda miliki karena pelat untuk Flex memiliki tulisan “Opentrons Flex” di permukaan atasnya. Yang untuk OT-2 tidak.

FLEKSI TERBUKA

93

BAB 5: PERANGKAT LAB

Blok aluminium 24 sumur
Blok 24 sumur digunakan dengan s individuampbotol kecil. Misalnyaample, ia menerima sample botol yang:
Memiliki bawahan berbentuk V atau U. Amankan isinya dengan penutup snap atau penutup sekrup. Menampung cairan dalam kapasitas 0.5 mL, 1.5 mL, dan 2 mL.

Blok aluminium 96 sumur
Blok 96 sumur mendukung berbagai jenis pelat sumur. Misalnyaample, ia menerima pelat dengan baik yaitu:
Dari produsen pelat sumur besar seperti Bio-Rad dan NEST.
Didesain dengan bawahan berbentuk V, bawahan berbentuk U, atau bawahan datar.
Dirancang dengan sumur 100 µL atau 200 µL.
Ini juga kompatibel dengan strip PCR generik.

Adaptor mandiri
Blok termal Pelat bawah datar fleksibel Blok aluminium 24 lubang Blok aluminium 96 lubang

Nama pemuatan API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Lihat kombinasi perangkat lab di bawah. opentrons_96_well_aluminium_block

Kombinasi peralatan lab blok aluminium
Perpustakaan Labware Opentrons mendukung kombinasi blok, vial, dan pelat sumur berikut, yang juga ditentukan dalam definisi labware JSON terpisah fileS. Robot Flex dan Opentrons Python API

94

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB
andalkan definisi JSON ini untuk bekerja dengan perangkat lab yang digunakan oleh protokol Anda. Misalnyaampmisalnya, saat bekerja dengan API, fungsi ProtocolContext.load_labware menerima nama labware ini sebagai parameter valid dalam kode Anda. Tabel di bawah mencantumkan kombinasi blok/kontainer default dan nama pemuatan API terkait. Tautan terhubung ke definisi JSON yang sesuai di repositori Opentrons GitHub.
Catatan: Semua tabung memiliki bagian bawah berbentuk V kecuali dinyatakan lain.

Kombinasi peralatan lab blok aluminium 24 sumur

Isi blok 24 lubang Tutup ulir 2 mL generik NEST 0.5 mL tutup ulir NEST 1.5 mL tutup ulir NEST 1.5 mL tutup ulir NEST 2 mL tutup ulir NEST 2 mL tutup ulir, bagian bawah berbentuk U

Nama pemuatan API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_ nest_2ml_snapcap

Kombinasi peralatan lab blok aluminium 96 sumur

Isi blok 96 sumur Pelat sumur Bio-Rad 200 µL Strip PCR Generik 200 µL Pelat sumur NEST 100 µL

Nama pemuatan API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL

FLEKSI TERBUKA

95

BAB 5: PERANGKAT LAB

5.7 Labware dan Opentrons Flex Gripper
Meskipun Opentrons Flex berfungsi dengan semua inventaris di Perpustakaan Labware, Opentrons Flex Gripper hanya kompatibel dengan item labware tertentu saja. Saat ini, Gripper dioptimalkan untuk digunakan dengan item labware berikut.

Kategori Labware Pelat Sumur Dalam Sepenuhnya Dikelilingi 96 Pelat Sumur
Tip Racks (tip tanpa filter dan filter)

Merek
NEST 96 Pelat Sumur Dalam 2 mL
Opentrons Tough 96 Pelat Sumur 200 µL PCR Rok Penuh NEST 96 Pelat Sumur 200 µL Datar
Opentrons Flex 96 Tip Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 1000 µL

Catatan: Untuk hasil terbaik, gunakan Flex Gripper hanya dengan peralatan lab yang tercantum di atas. Flex Gripper dapat bekerja dengan perangkat lab lain yang sesuai dengan otomatisasi ANSI/SLAS, namun hal ini tidak disarankan.

5.8 Definisi peralatan lab khusus
Seperti yang dibahas di awal bab ini, labware khusus adalah labware yang tidak terdaftar di Opentrons Labware Library. Anda dapat menggunakan item peralatan lab umum atau unik lainnya dengan Flex dengan mengukur dan mencatat karakteristik objek tersebut secara akurat dan menyimpan data tersebut dalam JSON file. Saat diimpor ke aplikasi, Flex dan API menggunakan data JSON tersebut untuk berinteraksi dengan labware Anda. Opentrons menyediakan alat dan layanan, yang akan kita periksa di bawah, untuk membantu Anda menggunakan Flex dengan labware khusus.

96

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB

Membuat definisi labware khusus
Alat dan layanan Opentrons membantu menempatkan perangkat lab khusus dalam jangkauan Anda. Fitur-fitur ini mengakomodasi tingkat keahlian dan cara kerja yang berbeda. Membuat peralatan lab Anda sendiri, dan menggunakannya dengan Opentrons Flex, membantu menjadikan robot ini sebagai tambahan yang serbaguna dan kuat untuk lab Anda.

PENCIPTA PERANGKAT LAB KHUSUS
Pembuat Labware Khusus adalah pembuat perangkat lunak tanpa kode, webalat berbasis yang menggunakan antarmuka grafis untuk membantu Anda membuat definisi perangkat lab file. Labware Creator menghasilkan definisi labware JSON file yang Anda impor ke Aplikasi Opentrons. Setelah itu, labware khusus Anda tersedia untuk robot Flex dan API Python.

LAYANAN PERANGKAT LAB KUSTOM
Hubungi kami jika perangkat lab yang ingin Anda gunakan tidak tersedia di perpustakaan, jika Anda tidak dapat membuat definisi sendiri, atau karena item khusus memiliki bentuk, ukuran, atau kelainan lain yang berbeda seperti yang dijelaskan di bawah.

Labware yang dapat Anda tentukan di Labware Creator
; Sumur dan tabung seragam dan identik. ; Semua baris diberi jarak yang sama
(jarak antar baris sama).
; Semua kolom diberi jarak yang sama (jarak antar kolom sama).
; Sangat cocok di satu slot dek.

Labware Opentrons perlu mendefinisikan; Bentuk sumur dan tabung bermacam-macam. ; Jarak baris tidak merata.
; Jarak antar kolom tidak sama.
; Lebih kecil dari satu slot dek (memerlukan adaptor) atau mencakup beberapa slot dek.

FLEKSI TERBUKA

97

BAB 5: PERANGKAT LAB
Berikut beberapa diagram yang membantu Anda memvisualisasikan mantanampyang dijelaskan di atas. Reguler Semua kolom diberi jarak yang sama dan semua baris diberi jarak yang sama. Kolom tidak harus memiliki jarak yang sama dengan baris.
Reguler Grid tidak harus berada di tengah-tengah peralatan lab.
Baris Tidak Beraturan memiliki jarak yang sama tetapi kolom tidak memiliki jarak yang sama.
Tidak beraturan Kolom/baris mempunyai jarak yang sama tetapi lubang-lubangnya tidak sama.
Tidak Beraturan Terdapat lebih dari satu grid.
Tim labware kami akan bekerja untuk memahami kebutuhan Anda dan merancang definisi labware khusus untuk Anda. Lihat artikel dukungan Meminta Definisi Labware Khusus dan formulir Permintaan Labware Khusus untuk informasi lebih lanjut. Ini adalah layanan berbasis biaya.

98

FLEKSI TERBUKA

BAB 5: PERANGKAT LAB

API PYTHON
Meskipun Anda tidak dapat membuat perangkat lab khusus dengan API kami, Anda dapat menggunakan perangkat lab khusus dengan metode API yang tersedia. Namun, Anda perlu menentukan labware khusus Anda terlebih dahulu dan mengimpornya ke Aplikasi Opentrons. Setelah Anda menambahkan perangkat lab Anda ke Aplikasi Opentrons, perangkat tersebut tersedia untuk API Python dan robot. Lihat bagian Definisi Labware Khusus pada dokumentasi Python API untuk informasi lebih lanjut. Untuk informasi tentang penulisan skrip protokol dengan API, lihat bagian API Protokol Python di bab Pengembangan Protokol.
Skema peralatan laboratorium JSON
JSON file adalah cetak biru untuk perangkat laboratorium standar dan khusus Opentron. Ini file berisi dan mengatur data peralatan laboratorium sesuai dengan spesifikasi desain yang ditetapkan oleh skema default.
Skema adalah sebuah bingkai

Dokumen / Sumber Daya

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka [Bahasa Indonesia:] Panduan Instruksi
FLEX Opentrons Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka Fleksibel, FLEX, Opentrons Flex Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka, Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka Fleksibel, Robot Penanganan Cairan Sumber Terbuka, Robot Penanganan Cairan Sumber, Robot Penanganan Cairan, Robot Penanganan, Robot

Referensi

Tinggalkan komentar

Alamat email Anda tidak akan dipublikasikan. Bidang yang wajib diisi ditandai *