FLEX Opentrons Flex с открытым исходным кодом робот для обработки жидкостей
“
Опентроны Flex
Технические характеристики:
- Общие характеристики: Lorem ipsum dolor сидеть
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor Incididunt
ut Labore et Dolore Magna Aliqua. - Экологические характеристики: Lorem ipsum
скорбь сидит амет, консектетур адиписцинг элит. Sed do eiusmod tempor
Incididunt ut Labore et dolore magna aliqua. - Сертификации: Lorem ipsum dolor sit amet,
консектетур адиписцинг элит. Sed do eiusmod tempor Incididunt ut
Labore et Dolore Magna Aliqua. - Серийный номер: ХХХ-ХХХХ-ХХХХ
Инструкция по применению продукта:
1. Установка и калибровка прибора:
Выполните действия, описанные в руководстве для пипетки и захвата.
установка.
2. Переезд:
Для коротких ходов обратитесь к разделу 2.5 в руководстве. Для
при переездах на большие расстояния следуйте приведенным рекомендациям. Генеральный переезд
также доступна консультация.
3.Соединения:
Обеспечьте правильное подключение к сети, как описано в руководстве.
Подключите USB и вспомогательные устройства по мере необходимости. Сетевые соединения
следует устанавливать согласно инструкции.
4. Дизайнер протоколов:
Поймите требования к дизайнеру протоколов и узнайте, как
разработать новые протоколы или изменить существующие в соответствии с вашей лабораторией
требования.
5. API протокола Python:
Изучите написание и запуск сценариев с использованием API протокола Python.
Откройте для себя эксклюзивные возможности Python для расширения функциональности.
6. Протоколы ОТ-2:
Узнайте о протоколах Python OT-2, протоколах JSON OT-2 и
Протоколы магнитного модуля для различных типов экспериментов.
Часто задаваемые вопросы (FAQ):
Вопрос: Как устранить неполадку, если робот не движется должным образом?
ожидал?
О: Проверьте подключение к сети, убедитесь в правильной калибровке
приборов и убедитесь в отсутствии препятствий в
путь робота.
Вопрос: Могу ли я использовать специальные пипетки с Opentrons Flex?
О: Компания Opentrons рекомендует использовать совместимые дозаторы для оптимального
производительность и точность.
«`
Опентроны Flex
Руководство по эксплуатации
Опентронс Лаборатории Инк.
Декабрь 2023 г.
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Зарегистрированные названия, товарные знаки и т. д., используемые в этом документе, даже если они специально не отмечены как таковые, не должны считаться незащищенными законом.
Оглавление
Предисловие. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Структура настоящего руководства . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Примечания и предупреждения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Глава 1 Введение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Добро пожаловать в Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Что нового во Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 гибких рабочих станций. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Информация по безопасности. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 символов безопасности. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Предупреждения по электробезопасности. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Дополнительные предупреждения по безопасности. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Меры безопасности . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Биологическая безопасность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Токсичные пары. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Легковоспламеняющиеся жидкости . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Соответствие нормативным требованиям . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Безопасность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Электромагнитная совместимость . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Предупреждения и примечания Федеральной комиссии связи США . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Соответствие Канаде ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Экологическое предупреждение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Предварительная сертификация Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Глава 2: Установка и перемещение. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Требования безопасности и эксплуатации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Где разместить Opentron Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Потребляемая мощность . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Условия окружающей среды . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Распаковка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Требуемые усилия и время . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Ящик и упаковочный материал . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Элементы продукта . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Часть 1. Снимите ящик . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Часть 2. Отпустите гибкий конец. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Часть 3. Окончательная сборка и включение питания . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Первый запуск. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Включите питание. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Подключитесь к сети или компьютеру. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Установите обновления программного обеспечения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Прикрепите подвеску аварийной остановки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Дайте своему роботу имя. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Установка и калибровка прибора. . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Установка пипетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Установка захвата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Переезд. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Короткие ходы. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Переезды на дальние расстояния. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Общие советы по переезду. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Заключительные мысли о переезде. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Глава 3: Описание системы. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Физические компоненты . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Каркас и корпус . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Палуба и рабочая зона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 46 с.tagобласть . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Палубное оборудование. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Мусоропровод. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Сtagслоты области. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Система движения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Сенсорный экран и светодиодные дисплеи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Пипетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Технические характеристики пипетки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Калибровка пипетки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Адаптер штатива для наконечников для пипеток. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Частичный сбор наконечников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Датчики-пипетки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Обновления встроенного ПО пипеток . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Захват . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Технические характеристики захвата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Калибровка захвата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Обновления прошивки захвата. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Пульт аварийной остановки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Когда использовать аварийный останов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Включение и отпускание аварийного останова . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Соединения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Подключение питания . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB и дополнительные соединения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Сетевые подключения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Технические характеристики системы. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Общие характеристики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Экологические характеристики . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Сертификаты. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Серийный номер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Глава 4: Модули. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Поддерживаемые модули . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Система контейнеров для модулей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Калибровка модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Когда калибровать модули. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Как калибровать модули . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Модуль нагревателя-шейкера GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Особенности нагревателя-шейкера. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Технические характеристики нагревателя-шейкера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Магнитный блок GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Характеристики магнитного блока. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Технические характеристики магнитного блока . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Температурный модуль GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Возможности температурного модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Технические характеристики температурного модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Модуль термоциклера GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Характеристики термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Технические характеристики термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Глава 5: Лабораторное оборудование. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Концепции лабораторного оборудования. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторное оборудование как оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторное оборудование как данные . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Нестандартное лабораторное оборудование . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Резервуары . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Односкважинные резервуары . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Многоскважинные резервуары. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Определения резервуаров и API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Лабораторное оборудование с резервуарами на заказ. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Планшеты с лунками . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-луночные планшеты. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-луночных планшета. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-луночных планшета. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-луночных планшета. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-луночных планшета. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-луночных планшета. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Адаптеры луночных планшетов. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Планшеты с лунками и определения API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Лабораторное оборудование для луночных планшетов, изготовленное по индивидуальному заказу. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Наконечники и стойки для наконечников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Стойки для наконечников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Совместимость с типпипетками . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Адаптер стойки для наконечников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Пробирки и штативы для пробирок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Комбинации пробирок и штативов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 штатив на 6 пробирок. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 штатив по 10 пробирок. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 штатив на 15 пробирок. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Штативы на 24 пробирки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Определения API штатива для пробирок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Лабораторное оборудование для штативов по индивидуальному заказу. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Алюминиевые блоки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Плоская нижняя пластина . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Алюминиевый блок на 24 лунки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Алюминиевый блок на 96 лунки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Автономные адаптеры . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Комбинации лабораторной посуды из алюминиевых блоков . . . . . . . . . . . . . . . .94 комбинации лабораторного оборудования с 24-луночными алюминиевыми блоками. . . . . . . . .95 комбинации лабораторного оборудования с 96-луночными алюминиевыми блоками. . . . . . . . .95 5.7 Лабораторное оборудование и гибкий захват Opentrons . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Определения пользовательского лабораторного оборудования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Создание пользовательских определений лабораторного оборудования . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Схема лабораторного оборудования в формате JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Определения лабораторного оборудования в формате JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Глава 6: Разработка протокола . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Готовые протоколы . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Библиотека протоколов. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Служба разработки пользовательских протоколов . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Дизайнер протоколов. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Требования к конструктору протоколов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Разработка протокола. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Изменение существующих протоколов. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API протокола Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Написание и запуск скриптов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 эксклюзивных функций Python. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Протоколы ОТ-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 протоколов Python OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 протоколов OT-2 JSON. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 протоколов магнитного модуля. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Глава 7: Программное обеспечение и эксплуатация. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Работа с сенсорным экраном. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Приборная панель робота . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Управление протоколом. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Подробности протокола. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Запустите установку. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Проверка положения лабораторного оборудования . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Ход выполнения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Завершение пробега. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Управление приборами. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Настройки робота. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Конфигурация деки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Приложение Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Установка приложения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Перенос протоколов во Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Состояние модуля и элементы управления . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Последние запуски протокола. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Расширенные операции . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Блокнот Jupyter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Операции из командной строки через SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Глава 8: Техническое обслуживание и сервис . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Очистка Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Прежде чем начать. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Что можно почистить . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Чистящие растворы. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Чистка рам и оконных панелей . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Чистка палубы. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Очистка порталов. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Чистка мусоропровода. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Очистка пипеток и наконечников . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Обеззараживание пипеток. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Очистка наконечников пипеток. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Очистка захвата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Очистка модулей. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Общая чистка модуля . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Уплотнения термоциклера. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Лабораторное оборудование, безопасное для автоклавирования. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Гибкое обслуживание . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 услуг Опентронс. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Квалификация монтажа и эксплуатационная квалификация. . . 155 Профилактическое обслуживание . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Гарантия. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Приложение А: Глоссарий. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Приложение Б: Дополнительная документация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Центр знаний по Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Документация по API протокола Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Справочник по HTTP API Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Б.4 Документация разработчика . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Приложение C: Программное обеспечение с открытым исходным кодом . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons на GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Монорепозиторий опентронов . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Другие хранилища . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Приложение D: Поддержка и контактная информация . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Продажи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Поддержка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Деловая информация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Предисловие
Добро пожаловать в руководство по эксплуатации робота для работы с жидкостями Opentrons Flex. В этом руководстве вы узнаете практически все, что вам нужно знать для настройки и использования Flex, уделяя особое внимание темам, которые наиболее актуальны для повседневных пользователей Flex в лабораторной среде.
Структура данного руководства
Opentrons Flex — сложная система, поэтому существует много разных способов изучить все, на что она способна. Не стесняйтесь сразу переходить к главе, посвященной любой интересующей вас теме! Для бывшегоampНапример, если в вашей лаборатории уже настроен Flex, вы можете пропустить главу «Установка и перемещение».
Если вы предпочитаете пошаговый подход, структура этого руководства позволяет вам следовать ему от начала до конца.
Узнайте о Флексе. Отличительные особенности Flex перечислены в Главе 1: Введение. Введение также включает важную информацию о безопасности и нормативной информации.
Начните работу с Flex. Если вам необходимо настроить Flex, следуйте подробным инструкциям в Главе 2: Установка и перемещение. Затем ознакомьтесь с компонентами Flex в Главе 3: Описание системы.
Настройте свою колоду. Настройка колоды позволяет использовать Flex для различных научных приложений. Глава 4: Модули описывает периферийные устройства Opentron, которые можно установить на платформу или поверх нее для выполнения конкретных научных задач. Глава 5: Лабораторное оборудование объясняет, как работать с оборудованием для хранения жидкостей.
Запустите протокол. Основное использование Flex — выполнение стандартизированных научных процедур, известных как протоколы. Глава 6: Разработка протоколов предлагает несколько способов получить готовые протоколы или разработать их самостоятельно. Чтобы запустить протокол, следуйте инструкциям в Главе 7: Программное обеспечение и эксплуатация, в которой также содержатся инструкции по выполнению других задач и настройке параметров вашего робота.
Продолжайте работу Flex. Следуйте советам в Главе 8: Техническое обслуживание и ремонт, чтобы поддерживать чистоту и оптимальную работу вашего Flex. Или зарегистрируйтесь в одной из перечисленных там услуг Opentrons, и позвольте нам позаботиться о Flex за вас.
Узнайте еще больше. Еще нужно что-то еще? Обратитесь к приложениям. Приложение A: Глоссарий содержит определения терминов, связанных с Flex. Приложение B: Дополнительная документация содержит еще больше ресурсов для продуктов Opentron и написания кода для управления Flex.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
9
ПРЕДИСЛОВИЕ
Приложение C: Программное обеспечение с открытым исходным кодом объясняет, как программное обеспечение Opentrons размещается на GitHub в качестве ресурса как для разработчиков, так и для неразработчиков.
В приложении D: Поддержка и контактная информация указано, как связаться с Opentrons, если вам нужна помощь, выходящая за рамки нашей документации.
Примечания и предупреждения
В этом руководстве вы найдете специально отформатированные блоки примечаний и предупреждений. Примечания содержат полезную информацию, которая может быть неочевидна при обычном использовании Flex. Обратите особое внимание на предупреждения – они используются только в ситуациях, когда вы рискуете получить травму, повредить оборудование, утратить или испортить оборудование.ampфайлов или реагентов, потерю данных или другой вред. Примечания и предупреждения выглядят следующим образом:
SampПримечание: вам следует это знать, но это не представляет никакой опасности.
Sample Предупреждение: вам необходимо это знать, поскольку это сопряжено с риском.
10
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1
Введение
В этой главе вы познакомитесь с экосистемой Opentrons Flex, включая общую конструкцию системы и доступные конфигурации рабочих станций. Он также содержит важную информацию о соответствии требованиям и безопасности, которую вам следуетview перед настройкой робота Opentrons Flex. Более подробную информацию о функциях Opentrons Flex см. в главе «Описание системы».
1.1 Добро пожаловать в Opentrons Flex
Opentrons Flex — это робот для обработки жидкостей, предназначенный для высокой производительности и сложных рабочих процессов. Робот Flex представляет собой основу модульной системы, включающей пипетки, захват для лабораторного оборудования, крепления для платформы, модули на платформе и лабораторное оборудование — все это вы можете заменить самостоятельно. Flex оснащен сенсорным экраном, поэтому вы можете работать с ним непосредственно на лабораторном столе или управлять им со всей лаборатории с помощью приложения Opentrons или наших API с открытым исходным кодом.
Рабочие станции Flex поставляются со всем оборудованием (роботами, оборудованием и лабораторным оборудованием), необходимым для того, чтобы начать автоматизировать типичные лабораторные задачи. Что касается других приложений, Opentrons Flex работает на программном обеспечении и прошивке с полностью открытым исходным кодом и не зависит от реагентов и лабораторного оборудования, что дает вам контроль над тем, как вы разрабатываете и запускаете свои протоколы.
Что нового во Flex
Opentrons Flex является частью серии роботов Opentrons для обработки жидкостей. Пользователи Opentrons Flex могут быть знакомы с Opentrons OT-2, нашим персональным роботом для дозирования. Flex превосходит возможности OT-2 в нескольких ключевых областях, обеспечивая более высокую пропускную способность и время работы.
Производительность пипетки
Емкость пипеток и наконечников
Описание
Пипетки Flex имеют 1, 8 или 96 каналов. 96-канальный дозатор одновременно обрабатывает в 12 раз больше лунок, чем самый большой дозатор ОТ-2.
Пипетки Flex имеют больший диапазон объемов (1 мкл, 50 5 мкл) и могут работать с наконечниками Opentron Flex любого объема. Это улучшение по сравнению с пипетками OT-1000, которые имеют меньший диапазон измерения и должны использовать наконечники с соответствующим диапазоном объема.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
11
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
Захват Автоматическая калибровка Сенсорный экран Контейнеры для модулей Координаты слотов на деке Передвижной мусор Размер и вес
Flex Gripper Opentrons поднимает и перемещает лабораторное оборудование по столу автоматически, без вмешательства пользователя. Захват позволяет выполнять более сложные рабочие процессы в рамках одного протокола.
Позиционная калибровка пипеток Flex и захвата полностью автоматизирована. Нажмите одну кнопку, и инструмент переместится к точно обработанным точкам на деке, чтобы определить его точное положение, сохраняя эти данные для использования в ваших протоколах.
Flex имеет собственный интерфейс с сенсорным экраном, который позволяет вам управлять им напрямую, а также использовать приложение Opentrons. Используйте сенсорный экран для запуска выполнения протокола, проверки статуса задания и изменения настроек прямо на роботе.
Модули Flex помещаются в контейнеры, занимающие пространство под палубой. Тележки размещают ваше лабораторное оборудование ближе к поверхности палубы и позволяют прокладывать кабели под палубой. Кэдди позволяют разместить на платформе еще больше конфигураций модулей и лабораторного оборудования.
Слоты деки на Flex пронумерованы в системе координат (A1D4), аналогичной нумерации лунок в лабораторном оборудовании.
Контейнер для мусора можно разместить в нескольких местах на Flex. Местоположение по умолчанию (слот A3) является рекомендуемым. Вы также можете использовать захват для выбрасывания мусора в дополнительный мусоропровод.
Flex немного больше и намного тяжелее, чем OT-2. Задачи установки Flex требуют помощи партнера по лаборатории.
Подробное сравнение технических характеристик роботов доступно на сайте Opentrons. webсайт.
Роботы Flex и OT-2 работают на нашем программном обеспечении с открытым исходным кодом, а приложение Opentrons может управлять обоими типами роботов одновременно. Хотя протоколы OT-2 нельзя запускать непосредственно во Flex, их легко адаптировать (подробности см. в разделе «Протоколы OT-2» главы «Разработка протоколов»).
Гибкие рабочие станции
Рабочие станции Opentrons Flex включают робота Flex, аксессуары, пипетки и захваты, встроенные модули и лабораторное оборудование, необходимое для автоматизации конкретного применения. Все компоненты рабочей станции являются модульными. Если вам нужно изменить приложения, вы можете добавить или заменить другое оборудование Flex и совместимые расходные материалы.
12
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
РАБОЧАЯ СТАНЦИЯ НГС
Рабочая станция Opentrons Flex NGS автоматизирует подготовку библиотеки NGS. Он может автоматизировать рабочие процессы предварительного секвенирования с использованием любой ведущей системы реагентов, включая фрагментацию и tagподготовка библиотеки на основе мышления.
Помимо робота Flex, рабочая станция NGS включает в себя:
Захват Выбор конфигурации пипетки
Две 8-канальные пипетки (1 мкл и 50 5 мкл) 1000-канальная пипетка (96 5 мкл) Желоб для отходов Магнитный блок Температурный модуль Модуль термоциклера Комплект лабораторного оборудования с наконечниками для фильтров, микроцентрифужными пробирками, резервуарами и планшетами для ПЦР
РАБОЧАЯ СТАНЦИЯ ПЦР
Рабочая станция Opentrons Flex PCR автоматизирует настройку ПЦР и рабочие процессы термоциклирования за 96 с.ampле. Он может аликвотировать охлажденные реагенты иampфайлы в 96-луночный ПЦР-планшет. При добавлении автоматизированного модуля термоциклера используйте захват для загрузки планшета в термоциклер, а затем запустите выбранную вами программу ПЦР.
Помимо робота Flex, рабочая станция ПЦР включает в себя:
Захват Выбор конфигурации пипетки
1-канальная пипетка (1 мкл) и 50-канальная пипетка (8 мкл) 1-канальная пипетка (50 96 мкл) Температурный модуль желоба для отходов Лабораторный комплект с наконечниками с фильтром, микроцентрифужными пробирками, резервуарами и планшетами для ПЦР
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
13
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
СТАНЦИЯ ЭКСТРАКЦИИ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ
Рабочая станция для экстракции нуклеиновых кислот Opentrons Flex автоматизирует выделение и очистку ДНК/РНК. Он использует магнитный блок для разделения магнитных шариков и нагреватель-шейкер для разделения.ample лизис и ресуспендирование магнитных шариков.
Помимо робота Flex, рабочая станция для экстракции нуклеиновых кислот включает в себя:
Захват Выбор конфигурации пипетки
1-канальная пипетка (5 1000 мкл) и 8-канальная пипетка (5 1000 мкл) 96-канальная пипетка (5 1000 мкл) Желоб для отходов Магнитный блок Модуль нагревателя-шейкера Комплект лабораторного оборудования с наконечниками для фильтров, резервуарами, планшетами для ПЦР и планшетами с глубокими лунками
МАГНИТНАЯ СТАНЦИЯ ДЛЯ ОЧИСТКИ БЕЛКОВ
Рабочая станция для очистки белков с магнитными шариками Opentrons Flex автоматизирует мелкомасштабную очистку белков и протеомику.ample prep до 96 сampле. Он совместим со многими популярными реагентами на основе магнитных шариков.
Помимо робота Flex, рабочая станция для очистки протеинов включает в себя:
Захват Выбор конфигурации пипетки
1-канальная пипетка (5 1000 мкл) и 8-канальная пипетка (5 1000 мкл) 96-канальная пипетка (5 1000 мкл) Желоб для отходов Магнитный блок Модуль нагревателя-шейкера Комплект лабораторного оборудования с наконечниками для фильтров, резервуарами, планшетами для ПЦР и планшетами с глубокими лунками
РАБОЧАЯ СТАНЦИЯ ДЛЯ ПОДГОТОВКИ ФЛЕКС
Рабочая станция Opentrons Flex Prep автоматизирует простые рабочие процессы пипетирования. Настройте рабочую станцию с 1-канальными и 8-канальными пипетками для выполнения таких задач, какampле трансфер, сampдублирование, и
14
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
аликвотирование реагентов. Настройте рабочую станцию с помощью 96-канальной пипетки для высокопроизводительного аликвотирования реагентов и расстановки планшетов.ampинж.
Помимо робота Flex, рабочая станция Flex Prep включает в себя:
Выбор конфигурации пипетки: 1-канальная пипетка (5 1000 мкл) и 8-канальная пипетка (5 1000 мкл) 96-канальная пипетка (5 1000 мкл)
Комплект лабораторного оборудования с наконечниками с фильтром, микроцентрифужными пробирками и резервуарами.
СТАНЦИЯ ПОДГОТОВКИ ПЛАЗМИД
Рабочая станция подготовки плазмид Opentrons Flex автоматизирует рабочие процессы экстракции и очистки плазмид с помощью магнитных шариков. Эта рабочая станция оснащена пипетками большого объема, модулем нагревателя-шейкера и магнитным блоком для работы с большинством химических веществ на основе шариков.
Помимо робота Flex, рабочая станция подготовки плазмид включает в себя:
Захват 1-канальная пипетка (5 1000 мкл) и 8-канальная пипетка (5 1000 мкл) Желоб для отходов Магнитный блок Модуль нагревателя-шейкера Комплект лабораторного оборудования с наконечниками с фильтром, микроцентрифужными пробирками, резервуарами, планшетами для ПЦР и планшетами с глубокими лунками
СИНБИО РАБОЧАЯ СТАНЦИЯ
Рабочая станция Opentrons Flex SynBio автоматизирует различные рабочие процессы синтетической биологии, такие как синтез и клонирование ДНК. Он использует магнитный блок и температурный модуль для поддержки большинства химических процессов на основе шариков. Добавьте модуль термоциклера для проведения инкубаций с подогреваемой крышкой и ampлификации.
Помимо робота Flex, рабочая станция SynBio включает в себя:
1-канальная пипетка с захватом (5 1000 мкл) и 8-канальная пипетка (5 1000 мкл) Температурный модуль с магнитным блоком
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
15
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
Комплект лабораторного оборудования с обычными наконечниками и наконечниками с фильтром, микроцентрифужными пробирками, резервуарами, планшетами для ПЦР и планшетами с глубокими лунками.
1.2 Информация по технике безопасности
Робот для работы с жидкостями Opentrons Flex был разработан для безопасной эксплуатации. Ознакомьтесь со спецификациями и рекомендациями по обеспечению соответствия в этом разделе, чтобы обеспечить безопасное использование вашего Flex. Эти рекомендации охватывают безопасное использование входных и выходных соединений продукта, включая соединения питания и передачи данных, а также предупреждающие надписи, расположенные на роботе Flex и соответствующем оборудовании. Использование устройства способами, отличными от указанных в данном руководстве, может подвергнуть риску пользователя и оборудование.
Символы безопасности
Различные надписи на Flex и в данном руководстве предупреждают вас об источниках потенциальных травм или вреда.
Символ
Описание
Предупреждение: предупреждает пользователей о потенциально опасных условиях. Действия, которые могут привести к травмам или смерти.
Внимание: предостерегает пользователей от повреждения оборудования. Потеряны или повреждены данные. Невосстановимое прерывание выполняемой операции.
Поражение электрическим током. Обозначает компоненты прибора, которые могут представлять опасность поражения электрическим током при неправильном обращении с прибором.
Горячая поверхность: определяет компоненты инструмента, которые представляют опасность получения травмы из-за высокой температуры/высоких температур при неправильном обращении с инструментом.
Точка защемления: определяет компоненты инструмента, которые могут представлять опасность получения травмы при движении.
16
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
На Flex вы найдете следующие этикетки:
Этикетки интеллектуальной собственности. Ярлыки соответствия нормативным требованиям (например, ETL). Этикетки об опасности поражения электрическим током. Этикетки с общими предупреждениями. Этикетки на продукции. Этикетки с точками защемления. Высокое содержание летучих веществ.tagЭтикетки e Этикетки с номинальной мощностью
Предупреждения по электробезопасности
Всегда соблюдайте следующие предупреждения по электробезопасности:
Символ
Описание
Подключите робота к заземленной цепи класса 1. См. раздел «Подключение питания» главы «Описание системы».
Не подключайте (подключайте), не отключайте (отключайте) и не используйте кабели питания переменного тока, если: Кабель изношен или поврежден. Другие подключенные кабели, шнуры или розетки изношены или повреждены.
Использование поврежденных шнуров питания может привести к поражению электрическим током, что приведет к серьезной травме или повреждению робота.
Не заменяйте кабель питания переменного тока без указания службы поддержки Opentrons.
Дополнительную информацию о требованиях к электропитанию см. в разделе «Потребляемая мощность» главы «Установка и перемещение».
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
17
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
Дополнительные предупреждения по безопасности
Всегда соблюдайте следующие дополнительные предупреждения по технике безопасности:
Символ
Описание
Opentrons Flex не сертифицирован для использования со взрывоопасными или легковоспламеняющимися жидкостями. Не загружайте в робот пластины, пробирки или флаконы, содержащие взрывоопасные или легковоспламеняющиеся жидкости, и не эксплуатируйте прибор иным образом, если в корпусе находятся взрывоопасные или легковоспламеняющиеся жидкости.
Используйте передовую лабораторную практику и соблюдайте меры предосторожности производителя при работе с химикатами. Компания Opentrons не несет ответственности за любой ущерб, возникший в результате использования опасных химикатов.
Flex весит 88.5 кг (195 фунтов). В результате для его безопасного подъема и перемещения требуются два человека. См. раздел «Перемещение» в главе «Установка и перемещение».
Flex следует размещать на поверхности, способной выдержать его вес 88.5 кг (195 фунтов), с достаточной площадью поверхности для размещения робота плюс минимальное расстояние до него (20 см/8 дюймов). См. раздел «Требования к безопасности и эксплуатации» в главе «Установка и перемещение».
Flex может излучать вибрации во время работы. Разместите робота на прочной, ровной и водонепроницаемой поверхности с поперечными распорками или сварными соединениями. См. раздел «Требования к безопасности и эксплуатации» в главе «Установка и перемещение».
Меры предосторожности
Чтобы защитить Flex от повреждений, соблюдайте следующие меры предосторожности:
18
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
Символ
Описание
Используйте лабораторное оборудование, совместимое с ANSI/SLAS или одобренное Opentrons. См. главу «Лабораторное оборудование».
Держите коррозийные материалы, агенты или другие повреждающие материалы подальше от робота.
Биологическая безопасность
Обращайтесь с образцами и реагентами, содержащими материалы, взятые у людей, как с потенциально инфекционными агентами. Компания Opentrons рекомендует использовать безопасные лабораторные процедуры, как описано в документе «Биобезопасность в микробиологических и биомедицинских лабораториях» (BMBL), 6-е издание.
В обычных условиях Flex не создает обнаруживаемых аэрозолей из исходных жидкостей. Однако при определенных условиях из исходных жидкостей можно генерировать аэрозоли. При работе с исходными жидкостями уровня биобезопасности 2 или выше рассмотрите возможность принятия мер предосторожности против воздействия аэрозолей в соответствии с местными регулирующими органами. Чтобы свести к минимуму потенциальный риск воздействия аэрозоля от робота, убедитесь, что вы:
Выполните техническое обслуживание, как описано в главе «Техническое и сервисное обслуживание». Правильно установите и закрепите все крышки инструментов, пипетки, модули и лабораторное оборудование. Используйте правильную технику пипетирования, чтобы уменьшить выброс аэрозолей.
Токсичные пары
Если вы работаете с летучими растворителями или токсичными веществами, используйте эффективную лабораторную систему вентиляции для удаления любых образующихся паров.
Легковоспламеняющиеся жидкости
Flex не был протестирован для использования с легковоспламеняющимися жидкостями и не должен использоваться с легковоспламеняющимися жидкостями.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
19
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
1.3 Соблюдение нормативных требований
Opentrons Flex соответствует всем применимым требованиям следующих стандартов безопасности и электромагнитных стандартов.
Безопасность
Идентификатор правила IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Заголовок
Требования безопасности к электрооборудованию для измерений, контроля и лабораторного применения. Часть 1. Общие требования.
Частные требования к лабораторному оборудованию для смешивания и перемешивания
Электромагнитная совместимость
Идентификатор правила EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR, часть 15, подраздел B, класс A IC ICES-003
Заголовок
Электрооборудование для измерения, управления и лабораторного использования. Требования ЭМС. Часть 1. Общие требования. Непреднамеренные излучатели.
Управление использованием спектра и телекоммуникационное оборудование, вызывающее помехи Стандартное оборудование информационных технологий (включая цифровое оборудование)
Предупреждения и примечания FCC
Предупреждение: Изменения или модификации данного устройства, не одобренные Opentrons, могут лишить пользователя права управлять оборудованием.
Данное устройство соответствует части 15 правил FCC. Эксплуатация осуществляется при соблюдении следующих условий:
20
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 1: ВВЕДЕНИЕ
Данное устройство не может создавать вредных помех. Это устройство должно принимать любые принимаемые помехи, включая помехи, которые могут вызвать нежелательные
операция.
Примечание. Данное оборудование было протестировано и признано соответствующим ограничениям для цифровых устройств класса А согласно части 15 правил FCC. Эти ограничения предназначены для обеспечения разумной защиты от вредных помех при эксплуатации оборудования в коммерческой среде. Данное оборудование генерирует, использует и может излучать радиочастотную энергию и, если оно установлено и используется не в соответствии с руководством по эксплуатации, может создавать вредные помехи для радиосвязи. Эксплуатация этого оборудования в жилом помещении может вызвать вредные помехи, и в этом случае пользователю придется устранять помехи за свой счет.
Соответствие требованиям ISED Канады
Канада ICES-003(A) / NMB-003(A)
Данный продукт соответствует действующим техническим спецификациям Министерства инноваций, науки и экономического развития Канады.
Настоящая продукция соответствует технологиям, применяемым в области инноваций, науки и экономического развития Канады.
Экологическое предупреждение
Предупреждение: рак и репродуктивный вред www.P65Warnings.ca.gov
Предварительная сертификация Wi-Fi
Модуль Wi-Fi предварительно сертифицирован для использования во многих регионах:
США (FCC): Идентификатор FCC UAY-W8997-M1216 Европейская экономическая зона (CE): Нет общедоступного идентификатора (самодекламация) Канада (IC): Идентификационный номер версии оборудования W8997-M1216 Япония (TELEC): Сертифицированный номер 020-170034 Индия (WPC): регистрационный номер ETA-SD-20191005525 (самодекларация).
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
21
ГЛАВА 2
Установка и перемещение
В этой главе описывается, как подготовить лабораторию к использованию Opentrons Flex, как настроить робота и как при необходимости переместить его. Прежде чем принять Flex, убедитесь, что ваша лаборатория или предприятие соответствует всем критериям, указанным в разделе «Требования к безопасности и эксплуатации». Когда придет время запустить Flex, следуйте подробным инструкциям в разделах «Распаковка», «Первый запуск», «Установка и калибровка прибора» или воспользуйтесь услугой настройки поддержки Opentrons на месте. А если вам когда-нибудь понадобится переместить Flex в новое место, близкое или далекое, следуйте инструкциям в разделе «Переезд».
2.1 Требования безопасности и эксплуатации
Где разместить Opentrons Flex
Пространство — ценный товар почти в каждой лаборатории. Вашему Flex понадобится немного, но не слишком много, поскольку он рассчитан на половину стандартного лабораторного стола. Убедитесь, что у вас есть пространство, соответствующее следующим критериям.
Поверхность скамейки: Стационарная, прочная, ровная, водостойкая поверхность. Столы и скамейки на колесах (даже с блокировкой) использовать не рекомендуется. Flex движется быстро и имеет большую массу, что может привести к тряске или дисбалансу легких или подвижных столов.
Весовая нагрузка: сам робот весит 88.5 кг (195 фунтов), и его могут поднимать только два человека, работающие вместе. Разместите робота на поверхности, которая сможет легко выдержать его вес, а также вес любых модулей, лабораторной посуды, жидкостей или другого лабораторного оборудования, которое будет использоваться в ваших приложениях.
Рабочее пространство: базовые размеры робота составляют 87 см Ш x 69 см Г x 84 см В (около 34 x 27 x 33 дюйма). Flex необходимо 20 см (8 дюймов) свободного пространства сбоку и сзади для кабелей, USB-подключений и для отвода выхлопных газов от модулей, которые нагреваются и охлаждаются.
Предупреждение: Не располагайте боковые или заднюю часть Flex впритык к стене.
22
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
84 см 33 ″
87 см 34 ″
Базовые размеры Opentrons Flex.
69 см 27 ″
20 см 8 ″
20 см 8 ″
20 см 8 ″
Вершина view Opentrons Flex с минимальным боковым и задним зазором.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
23
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Потребляемая мощность
Opentrons Flex следует подключать к сетевой розетке на столе или рядом с ним, где вы его устанавливаете. Подключайте Flex только к цепям, которые могут обеспечить максимальную потребляемую мощность:
Входная мощность: 36 В постоянного тока, 6.1 А. Потребление в режиме ожидания: 30 Вт. Типичное потребление: 40 50 Вт (во время работы протокола). Максимальное потребление: примерно 100 Вт.
Точная потребляемая мощность зависит от:
Количество и тип движений, выполняемых во время протокола. Количество времени, которое робот проводит без дела. Состояние индикаторов на роботе. Сколько инструментов прилагается.
Не забудьте учитывать другую электронику, потребляющую энергию в той же цепи, включая модули Flex с собственными источниками питания. Для бывшегоampТо есть модуль термоциклера имеет максимальную потребляемую мощность (630 Вт), что намного больше, чем у самого робота Flex. При необходимости проконсультируйтесь с менеджером вашего предприятия, чтобы убедиться, что оно соответствует требованиям к электропитанию вашего оборудования.
Условия окружающей среды
Условия окружающей среды для рекомендуемого, допустимого использования и хранения различаются:
Рекомендуется для работы системы
Приемлемо для работы системы
Температура окружающей среды от +20 до +25 °C
от +2 до +40 °С
Относительная влажность Высота над уровнем моря
40%, без конденсации
Примерно 500 м над уровнем моря
30%, без конденсации (ниже 80 °C)
До 2000 м над уровнем моря
Хранение и транспортировка
от -10 до +60 °С
10%, без конденсации (ниже 85 °C)
До 2000 м над уровнем моря
24
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Компания Opentrons подтвердила эффективность Opentrons Flex в условиях, рекомендованных для работы системы, и работа в этих условиях должна обеспечивать оптимальные результаты. Flex безопасно использовать в условиях, приемлемых для работы системы, но результаты могут отличаться. Не включайте и не используйте Flex в условиях, выходящих за эти рамки. Условия хранения и транспортировки применяются только в том случае, если робот полностью отключен от электропитания и другого оборудования.
2.2 Распаковка
Поздравляем! Ваш Opentrons Flex прибыл, и вы подготовили для него место в своей лаборатории. Давайте откроем этот ящик с монстром, вытащим робота и подготовим его к работе. Информация в этом разделе содержит список деталей и инструкции, которые помогут вам выполнить действия, необходимые для распаковки, настройки и готовности Flex к использованию. Мы разделили процедуру установки на три части:
Часть 1 посвящена разборке ящика. Часть 2 посвящена отсоединению Flex от ящика и перемещению его к месту окончательной сборки. В части 3 рассказывается об окончательной сборке и первом включении робота.
Требуемые усилия и время
Вам нужно попросить партнера по лаборатории помочь с процессом распаковки, подъема, перемещения и сборки. На эти усилия вам понадобится от 30 минут до часа.
Примечание. Чтобы правильно поднять Flex, требуется два человека. Кроме того, подъем и переноска Flex за ручки — лучший способ перемещения робота.
Ящик и упаковочный материал
Распаковав Flex, вы получите потрясающего робота, но у вас также останется несколько больших панелей ящика, а также различные транспортировочные компоненты и набивка. Хотя вы можете выбросить этот материал, мы рекомендуем вам сохранить его, если есть место для хранения. Упаковка является многоразовой, что помогает подготовить Flex к отправке, если вам когда-нибудь понадобится отправить его куда-нибудь еще (например, на конференцию или в новое учреждение) в будущем.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
25
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Элементы продукта
Flex поставляется с компонентами, перечисленными ниже. Пипетки, захват и модули поставляются в отдельной упаковке от основного ящика Flex, даже если вы приобрели их вместе в качестве рабочей станции.
(1) Робот Opentrons Flex
(1) USB-кабель
(1) Кабель питания
(1) кабель Ethernet
(5) Г-образные ключи (шестигранные 12 мм, шестигранные 1.5 мм, шестигранные 2.5 мм, шестигранные 3 мм,
Т10 Торкс)
(1) Подвеска аварийной остановки
(1) Разъем для деки с зажимами для лабораторного оборудования
(4) Запасные зажимы для лабораторного оборудования
(1) Калибровочный зонд пипетки
(4) Ручки для переноски и крышки.
(1) Верхняя оконная панель
(4) Боковые оконные панели
(1) Шестигранная отвертка 2.5 мм.
(1) ключ на 19 мм
(16 + запасные части) Винты для окон (с плоской головкой M4x8 мм)
26
(10) Винты с прорезями для запасной деки (головка с торцовым ключом M4x10 мм)
(12) Винты запасного зажима деки (головка с торцовым ключом M3x6 мм)
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Часть 1: Снимите ящик
Компания Opentrons отправляет ваш Flex в прочном фанерном ящике. В транспортировочном ящике используются крючок и защелка cl.amps, чтобы скрепить вместе верхнюю, боковую и нижнюю панели. Использование защелок вместо гвоздей или шурупов означает, что вам не понадобится лом (или большая сила), чтобы разобрать ящик, и при необходимости вы сможете собрать его позже.
Примечание. Края ящика могут поцарапаться во время транспортировки. Вы можете использовать рабочие перчатки, чтобы защитить руки от деревянных осколков.
Чтобы освободить защелки, поднимите язычок защелки вверх и поверните его влево (против часовой стрелки). Это действие перемещает clamp рычаг из соответствующего крепежного кронштейна. Затем вы можете откинуть рычаг защелки от ящика.
1 Разблокируйте восемь защелок, удерживающих верхнюю часть по бокам.
2 Снимите верхнюю панель, освободив защелки.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
27
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ 3 Разрежьте синюю транспортировочную упаковку, извлеките из набивки следующие предметы и отложите их в сторону:
Комплект пользователя Кабели питания, Ethernet и USB Подвеска аварийного останова
4 Снимите верхнюю часть пенопластовой прокладки, чтобы открыть оконные панели. Набивка защищает боковые и верхнюю панели.
5 Снимите оконные панели и отложите их в сторону. Вы прикрепите их позже.
28
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
6 Разблокируйте оставшиеся 16 защелок, скрепляющих боковые панели друг с другом и с основанием ящика. 7 Снимите боковые панели и отложите их в сторону.
Часть 2: Освободите гибкость
После выполнения шагов части 1 вы должны увидеть робота, который находится в защитном пакете и прикреплен к оранжевым стальным монтажным компонентам. Сумка закрывает робота и защищает его от внешней среды. Стальные кронштейны крепят робота к нижней части ящика. Две транспортировочные рамы поддерживают робота, равномерно распределяя его вес и сохраняя его жесткость, чтобы он не деформировался во время транспортировки. Продолжайте распаковывать Flex и снимать его с основания ящика.
8 Используя гаечный ключ на 19 мм из пользовательского комплекта, открутите кронштейны от нижней части ящика. Вы можете выбросить скобки или сохранить их для использования в будущем.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
29
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ 9 Потяните или сверните транспортировочную сумку до конца вниз, чтобы обнажить весь робот.
10 С помощью партнера по лаборатории возьмитесь за поручни в оранжевых транспортировочных рамах по обе стороны от основания робота, снимите Flex с основания ящика и поставьте его на пол. Сохраните или выбросьте основание ящика и транспортировочную раму.
30
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ 11 Используя шестигранный Г-образный ключ на 12 мм из пользовательского комплекта, открутите четыре болта, удерживающие транспортировочные рамы на
Флекс. Сохраните или выбросьте рамы и болты.
12 Снимите четыре алюминиевые ручки из пользовательского комплекта. Прикрутите ручки в те же места, где крепились 12-миллиметровые болты транспортировочной рамы.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
31
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
13 С помощью партнера по лаборатории поднимите Flex за ручки для переноски и переместите его на верстак для окончательной сборки.
Часть 3. Окончательная сборка и включение питания.
После перемещения Flex во временное рабочее место или постоянное место жительства пришло время внести последние штрихи в вашего нового робота.
14 Если вы переместили робота в его окончательное рабочее место, снимите ручки для переноски и замените их декоративными заглушками. Колпачки закрывают отверстия для ручек в раме и придают роботу аккуратный вид. Верните ручки в комплект пользователя на хранение.
32
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
15 Извлеките верхнюю и боковые панели из упаковочного пенопласта, который вы отложили после снятия верхней части ящика.
16 Установите оконные панели на Flex, следуя указаниям на маркировке на передней защитной пленке. Затем снимите защитную пленку.
17 С помощью шурупов со скошенной кромкой и отвертки 2.5 мм из пользовательского комплекта прикрепите оконные панели к Flex. Убедитесь, что скошенные (V-образные) отверстия в оконных панелях обращены наружу (к вам). Это позволяет шурупам прилегать к поверхности окна заподлицо.
Предупреждение: Неправильная ориентация панелей может привести к повреждению. Чрезмерный момент затяжки винтов может привести к растрескиванию панелей. Вручную затягивайте винты до тех пор, пока оконные панели не будут надежно закреплены. Это не испытание сил.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
33
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ 18 С помощью отвертки 2.5 мм из пользовательского комплекта выверните стопорные винты из портала. Эти
винты предотвращают перемещение портала во время транспортировки. Стопорные винты портала расположены: На левой боковой направляющей рядом с передней частью робота. Под вертикальным портальным рычагом. На правой боковой направляющей возле передней части робота в оранжевом кронштейне. Здесь есть два винта.
Портал легко перемещается вручную после удаления всех транспортировочных винтов. 19 Разрежьте и снимите две резиновые ленты, которые удерживают мусорное ведро на месте во время транспортировки.
34
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
20 Подсоедините шнур питания к Flex и вставьте его в розетку. Убедитесь, что на палубе нет препятствий. Нажмите выключатель питания на задней левой стороне робота. После включения портал перемещается в исходное положение, а на сенсорном экране отображаются дополнительные инструкции по настройке.
Теперь, когда ваш Flex готов к работе, перейдите к разделу «Первый запуск» ниже.
2.3 Первый запуск
Выполните базовую настройку на сенсорном экране перед подключением любого другого оборудования к Flex. Робот поможет вам подключиться к лабораторной сети, обновить программное обеспечение до последней версии и персонализировать Flex, присвоив ему имя.
Включить питание
При включении Flex на сенсорном экране появится логотип Opentrons. Через несколько секунд появится экран «Добро пожаловать в Opentrons Flex».
Экран приветствия Opentrons Flex. Вы должны увидеть этот экран только при первом запуске Flex.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
35
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Подключитесь к сети или компьютеру
Следуйте инструкциям на сенсорном экране, чтобы подключить робота, чтобы он мог проверять наличие обновлений программного обеспечения и получать протокол. fileс. Существует три способа подключения: Wi-Fi, Ethernet и USB.
Варианты подключения к сети. Для настройки Flex вам необходимо подключение к Интернету. Wi-Fi: используйте сенсорный экран для подключения к сетям Wi-Fi, защищенным личной аутентификацией WPA2 (большинство сетей, для подключения к которым требуется только пароль, подпадают под эту категорию).
Примечание. Flex не поддерживает авторизованные порталы (сети, в которых нет пароля, но загружается webстраница для аутентификации пользователей после подключения).
Вы также можете подключиться к открытой сети Wi-Fi, но это не рекомендуется.
Предупреждение. Подключение к открытой сети Wi-Fi позволит любому человеку, находящемуся в зоне действия сетевого сигнала, управлять вашим роботом Opentrons Flex без аутентификации.
Если вам необходимо подключиться к сети Wi-Fi, использующей корпоративную аутентификацию (включая «eduroam» и аналогичные академические сети, требующие имя пользователя и пароль), сначала подключитесь к приложению Opentrons через Ethernet или USB, чтобы завершить первоначальную настройку. Затем подключитесь к корпоративной сети Wi-Fi в настройках сети вашего Flex. Чтобы получить доступ к настройкам сети:
36
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
1. Нажмите «Устройства» на левой боковой панели приложения Opentrons. 2. Нажмите трехточечное меню () вашего Flex и выберите «Настройки робота». 3. Откройте вкладку Сеть.
Выберите свою сеть из раскрывающегося меню или выберите «Присоединиться к другой сети…» и введите ее SSID. Выберите метод корпоративной аутентификации, который использует ваша сеть. Поддерживаемые методы:
EAP-TTLS с TLS EAP-TTLS с MS-CHAP v2 EAP-TTLS с MD5 EAP-PEAP с MS-CHAP v2 EAP-TLS
Для каждого из этих методов требуются имя пользователя и пароль, и в зависимости от конкретной конфигурации сети может потребоваться сертификат. fileили другие варианты. Ознакомьтесь с ИТ-документацией вашего предприятия или обратитесь к своему ИТ-менеджеру для получения подробной информации о настройке вашей сети.
Ethernet: подключите робота к сетевому коммутатору или концентратору с помощью кабеля Ethernet. Вы также можете подключиться напрямую к порту Ethernet на вашем компьютере, начиная с версии робототехнической системы 7.1.0.
USB: Подключите прилагаемый кабель USB A-B к порту USB-B робота и открытому порту вашего компьютера. Используйте кабель USB B-C или адаптер USB A-C, если на вашем компьютере нет порта USB-A.
Чтобы продолжить настройку, на подключенном компьютере должно быть установлено и запущено приложение Opentrons. Подробную информацию об установке приложения Opentrons см. в разделе «Установка приложения» главы «Программное обеспечение и эксплуатация».
Установить обновления программного обеспечения
Теперь, когда вы подключены к сети или компьютеру, робот может проверять наличие обновлений программного обеспечения и прошивки и при необходимости загружать их. Если есть обновление, установка может занять несколько минут. После завершения обновления робот перезагрузится.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
37
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Прикрепите подвеску аварийной остановки
Подключите входящий в комплект подвесной пульт аварийной остановки (E-stop) к вспомогательному порту (AUX-1 или AUX-2) на задней панели робота.
До и после подключения подвески аварийной остановки.
Подключение и включение аварийного останова является обязательным для подключения инструментов и выполнения протоколов на Flex. Дополнительную информацию об использовании аварийного останова во время работы робота см. в разделе «Подвеска аварийного останова» главы «Описание системы».
Дайте своему роботу имя
Дав своему роботу имя, вы сможете легко идентифицировать его в лабораторной среде. Если в вашей сети есть несколько роботов Opentrons, обязательно дайте им уникальные имена. Как только вы подтвердите имя своего робота, вы попадете на панель управления Opentrons Flex. Вероятно, следующим шагом, который вам нужно будет сделать, будет прикрепление инструментов, о чем рассказывается в следующем разделе.
2.4 Установка и калибровка прибора
После первоначальной настройки робота следующим шагом будет прикрепление к роботу инструментов и их калибровка.
Чтобы установить прибор, сначала нажмите «Инструменты» на сенсорном экране или перейдите в раздел «Пипетки и модули» на экране сведений об устройстве в приложении Opentrons. Выберите пустое крепление и выберите «Прикрепить пипетку» или «Прикрепить захват». Если крепление, которое вы хотите использовать, уже занято, сначала необходимо отсоединить пипетку или захват.
38
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Примечание. Общий процесс установки одинаков, независимо от того, используете ли вы сенсорный экран или приложение Opentrons. На каком бы устройстве вы ни начали, процесс установки будет контролироваться до тех пор, пока вы не завершите или не отмените его.
Если вы начнете с сенсорного экрана, приложение покажет робота как «занятого». Если вы начнете работу в приложении, на сенсорном экране отобразится модальное окно, указывающее, что выполняется установка прибора.
Точный процесс установки зависит от подключаемого прибора, как описано в разделах ниже. Все приборы имеют процедуру автоматической калибровки, которую необходимо выполнить сразу после установки.
Установка пипетки
При установке пипетки вам будут предложены следующие шаги на сенсорном экране или в приложении Opentrons.
1. ВЫБЕРИТЕ ТИП ПИПЕТКИ Выберите между 1- или 8-канальной пипеткой или 96-канальной пипеткой. Для крепления 96-канальной пипетки требуется несколько дополнительных действий, поскольку она крепится к специальной монтажной пластине, охватывающей оба крепления для пипеток.
2. ПОДГОТОВКА К УСТАНОВКЕ Уберите лабораторное оборудование с платформы и очистите рабочую зону, чтобы облегчить установку и калибровку. Также соберите необходимое оборудование, такое как калибровочный зонд, шестигранную отвертку и монтажную пластину (для 96-канальной пипетки).
3. ПОДСОЕДИНИТЕ И ЗАКРЕПИТЕ ПИПЕТКУ Портал переместится в переднюю часть робота, и вы сможете прикрепить пипетку.
1- и 8-канальные пипетки подключаются непосредственно к держателю для пипеток. Для 96-канальной пипетки требуется монтажная пластина. Чтобы прикрепить монтажную пластину, необходимо сначала отсоединить каретку оси Z правого крепления для пипеток.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
39
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Подсоедините пипетку к выбранному креплению для пипеток и закрепите ее винтами.
4. ЗАПУСТИТЕ АВТОМАТИЧЕСКУЮ КАЛИБРОВКУ Чтобы откалибровать пипетку, прикрепите калибровочный зонд к соответствующей насадке пипетки. Пипетка автоматически переместится, коснувшись определенных точек на деке, и сохранит эти калибровочные значения для использования в будущем. После завершения калибровки и снятия зонда пипетка будет готова к использованию в протоколах.
Установка захвата
При установке захвата вам будут предложены следующие шаги на сенсорном экране или в приложении Opentrons.
1. ПОДГОТОВКА К УСТАНОВКЕ Уберите лабораторное оборудование с платформы и очистите рабочую зону, чтобы облегчить установку и калибровку. Также возьмите необходимую шестигранную отвертку и убедитесь, что калибровочный штифт находится в месте хранения на захвате.
2. ПОДСОЕДИНИТЕ И ЗАКРЕПИТЕ ЗАХВАТ. Портал переместится к передней части робота, и вы сможете прикрепить захват. Подсоедините захват к удлинителю и закрепите его винтами.
3. ВЫПОЛНИТЕ АВТОМАТИЧЕСКУЮ КАЛИБРОВКУ Чтобы откалибровать захват, вставьте калибровочный штифт в переднюю губку. Захват автоматически переместится, коснувшись определенных точек на платформе, и сохранит эти значения калибровки для использования в будущем. Затем повторите тот же процесс с калибровочным штифтом в задней челюсти. После завершения калибровки и возвращения штифта на место хранения захват будет готов к использованию в протоколах.
2.5 Переезд
В этом разделе представлены советы и инструкции о том, как перемещать робота Opentrons Flex на короткие и длинные расстояния.
40
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Короткие ходы
Короткое перемещение охватывает диапазон расстояний: от «давайте немного переместим» до пересечения лаборатории, коридора или другого этажа вашего здания. В этих случаях вы можете переместить Flex вручную. Транспортировка на ручной тележке также является хорошим вариантом.
Внимание: Flex весит 88.5 кг. В результате для его безопасного подъема и перемещения требуются два человека.
Снова прикрепите подъемные ручки, чтобы переместить Flex в новое, ближайшее место. Подъем и переноска Flex за ручки — правильный способ перемещения робота на короткие расстояния. После завершения перемещения снимите ручки и сохраните их в пользовательском комплекте. Чтобы не повредить робот, всегда используйте подъемные ручки, чтобы поднять и переместить его. Не хватайтесь за раму, чтобы поднять или переместить робота.
Переезды на большие расстояния
Переезд на дальнее расстояние доставит ваш Flex за пределы вашего университета, учреждения или учреждения. Через город, в новый город, штат, провинцию или страну — все этоampо переезде на дальние расстояния. В этом случае вам необходимо упаковать Flex, чтобы защитить его от непогоды, ударов и резких движений, которые могут возникнуть во время транспортировки.
Если вы сохранили транспортировочный ящик и внутренние опоры, прилагаемые к вашему Flex, вы можете переупаковать его в эти материалы для транспортировки на большие расстояния. Выполните действия по распаковке в обратном порядке, чтобы подготовить Flex к переезду на большие расстояния. По сути, вам следует:
Отсоедините кабель питания и сетевой кабель, если он подключен. Удалите все подключенное оборудование и лабораторное оборудование. Снова прикрепите пластины палубы. Заблокируйте портал (см. раздел «Общие рекомендации по переезду» ниже). Снимите и храните оконные панели.
Если вы сохранили оригинальный ящик:
Снова прикрепите транспортировочную раму к Flex и закрепите ее на основании поддона с помощью L-образных кронштейнов. Добавьте набивку и соберите транспортировочный ящик.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
41
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Если у вас нет оригинального ящика и сопутствующих материалов, обратитесь в надежную транспортную компанию. Они могут организовать для вас процесс упаковки, транспортировки и доставки.
Общие советы по переезду
ОТКЛЮЧИТЕ ПИТАНИЕ И СЕТЕВЫЕ КАБЕЛИ. Перед перемещением Flex не забудьте: Выключить питание и отсоединить его от источника питания. Отсоедините кабель Ethernet или USB, если он используется.
ЗАКРЫТЬ ПОРТАЛЬ Прежде чем перемещать Flex, повторно вставьте стопорные винты, чтобы зафиксировать портал на месте. Точки фиксации портала расположены: На левой боковой направляющей рядом с передней частью робота. Под вертикальным портальным рычагом. На правой боковой направляющей возле передней части робота. Для блокировки этой части портала требуется небольшой
оранжевый кронштейн и два стопорных винта.
42
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
ДОМАШНИЙ ПОРТ Возможно, вы не захотите блокировать портал, если вы просто перемещаете робота в ближайшее место. Если вы решите не блокировать его, по крайней мере, воспользуйтесь сенсорным экраном или приложением Opentrons, чтобы отправить портал в исходное положение, прежде чем выключать его. Чтобы вернуть портал в исходное положение с помощью сенсорного экрана, коснитесь трехточечного меню (), а затем коснитесь «Исходный портал». Чтобы разместить гентри через приложение Opentrons: нажмите «Устройства». Нажмите на свой Flex в списке устройств. Нажмите трехточечное меню () и выберите «Главный портал».
СНИМИТЕ МОДУЛИ Модули, установленные на палубе, и другие приспособления увеличивают вес вашего Flex. Они также влияют на центр тяжести робота, из-за чего при подъеме он может чувствовать себя «неповоротливым». Чтобы облегчить и сбалансировать робота, снимите с него все прикрепленные инструменты и лабораторное оборудование, прежде чем брать его в руки.
ПЕРЕУСТАНОВИТЕ СЛОТЫ ДЛЯ ДЕКИ Мы рекомендуем повторно присоединить слоты для колоды при переезде на большие расстояния. Закрепление слотов на их исходных местах помогает предотвратить случайную потерю. Повторное присоединение слотов для колоды для коротких перемещений по лаборатории не является обязательным.
ПЕРЕКАЛИБРОВКА ПОСЛЕ ПЕРЕМЕЩЕНИЯ Вам следует выполнить повторную калибровку любых инструментов и модулей после их переустановки. Более подробную информацию о калибровке модулей см. в главе «Модули».
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
43
ГЛАВА 2: УСТАНОВКА И ПЕРЕМЕЩЕНИЕ
Заключительные мысли о переезде
Ваш Flex — это прочная и хорошо сконструированная машина, но также и точный научный инструмент, разработанный с соблюдением строгих допусков. Поэтому вам следует обращаться с ним с осторожностью при перемещении в пределах вашего местного рабочего места или отправке через всю страну. Это означает, что необходимо следовать приведенным здесь рекомендациям и руководствоваться собственным здравым смыслом при транспортировке дорогостоящего лабораторного оборудования. Итог: при перемещении Flex соблюдайте осторожность и используйте дополнительные набивки.
Если у вас есть вопросы или сомнения по поводу перемещения вашего Flex, свяжитесь с нами по адресу support@opentrons.com.
44
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3
Описание системы
В этой главе описываются аппаратные системы Opentrons Flex, которые лежат в основе ее основных функций автоматизации лаборатории. Платформа, портал и крепления для приборов Opentrons Flex позволяют использовать прецизионные компоненты для работы с жидкостями и лабораторным оборудованием. Сенсорный экран на устройстве позволяет запускать протоколы и проверять состояние робота без необходимости подносить компьютер к лабораторному столу. Проводное и беспроводное подключение обеспечивает дополнительное управление с помощью приложения Opentrons (более подробную информацию см. в главе «Программное обеспечение и эксплуатация») и расширение функций системы за счет подключения периферийных устройств (см. главу «Модули»).
3.1 Физические компоненты
Камера
Индикатор состояния
Сенсорный экран
Рамка
Портальная палуба
Входная дверь
Расположение физических компонентов Opentrons Flex.
Накладки на ручки боковых окон
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
45
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Каркас и корпус
Рама робота Opentrons Flex обеспечивает жесткость и структурную поддержку платформы и портала. Все механические подсистемы расположены на основной раме и закреплены на ней. Каркас изготовлен в основном из листового металла и алюминиевых профилей.
В металлическом каркасе имеются проемы для боковых окон и входная дверь из прозрачного поликарбоната, позволяющая видеть, что происходит внутри Flex. Петли передней дверцы открываются для доступа к внутренней части системы. Открыв переднюю дверь, вы можете прикрепить инструменты, модули и палубное оборудование; подготовить колоду перед протоколом; или манипулировать состоянием колоды во время протокола.
Белые светодиодные ленты на внутренних верхних краях рамы обеспечивают программно управляемое окружающее освещение. 2-мегапиксельная камера может фотографировать деку и рабочую зону для записи и отслеживания выполнения протокола.
Палуба и рабочая зона
Палуба представляет собой обработанную алюминиевую поверхность, на которой выполняются автоматизированные научные протоколы. Платформа имеет 12 основных слотов формата ANSI/SLAS, которые можно переконфигурировать для хранения лабораторного оборудования, модулей и расходных материалов. Слоты деки идентифицируются системой координат: слот A1 находится сзади слева, а слот D3 - спереди справа.
Слот расширения (для термоциклера) Рабочая зона
Staging Площадь
Области колоды внутри Flex.
46
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Рабочая зона — это физическое пространство над декой, доступное для пипетирования. Лабораторное оборудование, размещенное в слотах от A1 до D3, находится в рабочей зоне.
Opentrons Flex поставляется со съемными слотами для всех 12 позиций в рабочей зоне. В каждом слоте платформы имеются угловые зажимы для лабораторного оборудования, позволяющие надежно разместить лабораторное оборудование на платформе.
Вы можете переконфигурировать террасу, заменив слоты другими приспособлениями, включая передвижной мусоропровод, мусоропровод и контейнеры для модулей. Слот расширения за A1 используется только для того, чтобы освободить место для модуля термоциклера, который занимает слоты A1 и B1.
Примечание. Слоты для колод взаимозаменяемы внутри столбца (1, 2 или 3), но не между столбцами; Слоты столбца 1 и столбца 3 представляют собой разные части, несмотря на их одинаковый размер. Вы можете определить, в каком столбце находится слот, ориентируя синий зажим для лабораторного оборудования слева сзади.
Вам следует оставить слоты для деки в тех местах, где вы хотите разместить отдельное лабораторное оборудование. Палуба и размещенные на ней предметы остаются статичными, если их не перемещать захватом или вручную.
Stagобласть
СtagРабочая зона — дополнительное пространство вдоль правой стороны палубы. Вы можете хранить лабораторное оборудование в этом месте после установкиtagслоты области. Лабораторное оборудование, размещенное в слотах от A4 до D4, находится вtagобласть. Гибкие пипетки не могут проникнуть вtagобласть, но захват может поднимать и перемещать лабораторное оборудование туда и обратно. Добавление дополнительных слотов помогает сохранить рабочую зону доступной для оборудования, используемого в ваших автоматизированных протоколах.
StagСлоты рабочей зоны включены в некоторые конфигурации рабочих станций, а также их можно приобрести на сайте https://shop.opentrons.com.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
47
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
StagЗона с установленными слотами
Палубные светильники
Светильники — это аппаратные средства, которые заменяют стандартные слоты для колоды. Они позволяют вам настроить макет колоды и добавить функциональность вашему Flex. В настоящее время палубное оборудование включает в себяtagместа для мусора, внутренний мусорный бак и внешний мусоропровод. Вы можете установить светильники только в несколько определенных слотов палубы. В следующей таблице указано расположение колод для каждого прибора.
Светильник СtagПрорези в зоне Мусорное ведро Желоб для мусора Желоб для мусора сtagслот области
Слоты A3D3 A1D1 и A3-D3 Только D3 Только D3
Светильники обесточены. Они не содержат электронных или механических компонентов, которые сообщают роботу о своем текущем состоянии и местонахождении платформы. Это означает, что вам необходимо использовать функцию конфигурации деки, чтобы сообщить Flex, какие приспособления прикреплены к деке и где они расположены.
48
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Вы можете получить доступ к настройкам конфигурации деки с сенсорного экрана через трехточечное меню () или из приложения Opentrons. См. раздел «Конфигурация деки» главы «Программное обеспечение и эксплуатация» для получения информации о том, как настроить деку с сенсорного экрана.
Мусоропровод
Отходной лоток Opentrons Flex передает жидкости, наконечники, штативы для наконечников и планшеты с лунками из корпуса Flex в контейнер для мусора, расположенный под его внешним отверстием. Желоб для мусора крепится к адаптеру пластины настила, который вставляется в слот D3. Он также поставляется со специальной полупанелью окна, которая позволяет желобу выходить за пределы передней части робота.
Компоненты мусоропровода.
Адаптер пластины крышки
Мусоропровод
Адаптер палубной пластины с Staging Площадь
Stagслоты области
StagСлоты области — это части колоды, совместимые с ANSI/SLAS, которые заменяют стандартные слоты в столбце 3 и добавляют новые слоты кtagРабочая зона — и все это без потери места в рабочей зоне. Вы можете установить один слот или максимум четыре слота, чтобы создать новый столбец (от A4 до D4) вдоль правой стороны колоды. Однако учтите, что замена слота A3 требует перемещения мусорного бака. Добавив с.tagИмея специальные слоты на платформе, ваш робот Flex может хранить больше лабораторного оборудования и работать более эффективно.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
Гибкий сtagслот области.
49
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
УСТАНОВКА СЛОТОВ
Для установки открутите винты, которыми стандартный слот крепится к деке, и замените его слотом s.tagслот области. После установки используйте сенсорный экран или приложение Opentrons, чтобы сообщить роботу, которого вы добавили в качествеtaging область слота на колоду.
Установка какtagслот области.
СЛОТОВАЯ СОВМЕСТИМОСТЬ StagСлоты рабочей области совместимы с приборами, модулями и лабораторным оборудованием Flex, перечисленными ниже.
Гибкие компоненты Модули пипеток с захватами
лабораторное оборудование
StagСовместимость по регионам
Flex Gripper позволяет перемещать лабораторное оборудование в помещение или из него.tagслоты области.
Гибкие пипетки не могут достичьtagобласть. Используйте захват для перемещения штативов с наконечниками и лабораторного оборудования изtagПеред пипетированием переместите зону в рабочую зону.
Магнитный блок GEN1 можно разместить в столбце 3 поверхtagслот области. Модули в столбце 4 не поддерживаются.
Модули с питанием, такие как нагреватель-шейкер и температурный модуль, помещаются в контейнеры, которые можно разместить в столбце 3. Вы не можете добавить какtaging область слота в позицию, занятую контейнером модуля.
StagСлоты рабочей зоны имеют те же размеры ANSI/SLAS, что и стандартные слоты деки. Используйте лабораторное оборудование, совместимое с захватами, вtagобласть или вручную добавлять и удалять лабораторное оборудование из этого места.
50
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Система движения
К раме прикреплен портал, который представляет собой систему перемещения и позиционирования робота. Портал перемещается отдельно вдоль осей X и Y, позиционируя пипетки и захваты в точных местах для выполнения протокола. Перемещение по этим осям осуществляется с точностью до 0.1 мм. Портал управляется гибридными биполярными шаговыми двигателями постоянного тока напряжением 36 В. В свою очередь, к гентри прикреплены крепления для пипеток и удлинитель. Они перемещаются вдоль оси Z, позиционируя пипетки и захваты в точных местах для выполнения протокола. Движение по этой оси контролируется гибридными биполярными шаговыми двигателями постоянного тока 36 В. Электроника, содержащаяся в гентри, обеспечивает питание 36 В постоянного тока и связь с пипетками и захватами, когда они прикреплены.
Портал
Крепления для пипеток
Удлинительное крепление
Расположение креплений приборов на Flex.
Сенсорные и светодиодные дисплеи
Основным пользовательским интерфейсом является 7-дюймовый сенсорный ЖК-экран, расположенный в передней правой части робота. Сенсорный экран покрыт стеклом Gorilla Glass 3, устойчивым к царапинам и повреждениям. Получите доступ ко многим функциям Flex прямо на сенсорном экране, в том числе:
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
51
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Управление протоколами Настройка, выполнение и мониторинг протоколов Управление лабораторным оборудованием Настройки роботов Обновления системного программного обеспечения и встроенного ПО Журналы операций и уведомления об ошибках
Дополнительную информацию об использовании Flex с помощью сенсорного экрана см. в разделе «Работа с сенсорным экраном» главы «Программное обеспечение и работа».
Индикатор состояния представляет собой полосу светодиодов вдоль верхней передней части робота, которая предоставляет краткую информацию о роботе. Различные цвета и узоры освещения могут сообщать о различных состояниях успеха, неудачи или простоя:
Цвет светодиода Белый Нейтральные состояния
Зеленый Нормальные состояния
Синий Обязательные состояния Желтый Аномальные состояния Красный Аварийные состояния
Схема расположения светодиодов Непрерывный Пульсирующий
Мигает дважды
Сплошной Пульсирующий Пульсирующий
Статус робота
Включено питание, но протокол не выполняется Робот занят (например, обновление программного обеспечения или встроенного ПО, настройка запуска протокола, отмена запуска протокола) Действие завершено (например, протокол сохранен, программное обеспечение обновлено, прибор подключен или отсоединен) Протокол работает Протокол завершен Протокол приостановлен
Твердый
Ошибка программного обеспечения
Мигает три раза подряд
Физическая ошибка (например, сбой прибора)
Индикатор состояния также можно отключить в настройках робота.
52
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
3.2 Пипетки
Пипетки Opentrons — это настраиваемые устройства, используемые для перемещения жидкостей по рабочей зоне во время выполнения протоколов. Существует несколько пипеток Opentrons Flex, которые могут обрабатывать объемы от 1 до 1000 мкл по 1, 8 или 96 каналам:
1-канальная пипетка Opentrons Flex (1 мкл) 50-канальная пипетка Opentrons Flex (1 5 мкл) 1000-канальная пипетка Opentrons Flex (8 мкл) 1-канальная пипетка Opentrons Flex (50 8 мкл) 5-канальная пипетка Opentrons Flex (1000 96 мкл)
Пипетки прикрепляются к порталу с помощью невыпадающих винтов на передней части пипетки. 1-канальные и 8-канальные пипетки занимают одно крепление для пипеток (левое или правое); 96-канальная пипетка занимает оба крепления. Подробную информацию об установке пипеток см. в разделе «Установка и калибровка прибора».
Плененная привязанность
Винты
Невыпадающие крепежные винты
эжектор
Форсунки (сменные уплотнительные кольца)
Форсунки (фиксированные уплотнительные кольца)
Расположение компонентов 1-, 8- и 96-канальных пипеток.
эжектор
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
53
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Пипетки захватывают одноразовые пластиковые наконечники, прижимая их к насадкам пипеток, а затем используют наконечники для аспирации и дозирования жидкостей. Суммарная сила, необходимая для захвата, увеличивается по мере одновременного захвата большего количества наконечников. При меньшем количестве наконечников пипетка прикрепляет наконечники, вставляя каждое сопло пипетки в наконечник. Чтобы добиться необходимой силы для захвата полной стойки с наконечниками, 96-канальная пипетка также подтягивает наконечники вверх к соплам. Это вытягивание требует установки штативов с наконечниками в адаптер штатива для наконечников, а не непосредственно в паз деки. Чтобы выбросить наконечники (или вернуть их в стойку), механизм выталкивания пипеток выталкивает наконечники из сопел.
Характеристики пипетки
Пипетки Opentrons Flex предназначены для работы с широким диапазоном объемов. Благодаря широкому ассортименту они могут использовать наконечники разных размеров, что влияет на их характеристики работы с жидкостью. Компания Opentrons протестировала пипетки Flex на точность и точность в ряде комбинаций наконечника и объема жидкости:
Пипетка
Гибкий 1-канальный
50 мкл
Гибкий 1-канальный
1000 мкл
Гибкий 8-канальный
50 мкл
Гибкий 8-канальный
1000 мкл
Емкость наконечника 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл
Тестируемый объем 1 мкл 10 мкл 50 мкл 5 мкл 50 мкл
200 мкл 1000 мкл
1 мкл 10 мкл 50 мкл 5 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл
Точность %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Точность %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Гибкий 96-канальный
1000 мкл
50 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл
5 мкл 50 мкл 200 мкл 1000 мкл
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Учитывайте эту информацию о точности при выборе насадок для пипетки. В общем, для достижения наилучших результатов вам следует использовать самые маленькие наконечники, соответствующие потребностям вашего протокола.
Примечание. Компания Opentrons проводит объемное тестирование пипеток Flex, чтобы убедиться в их соответствии указанным выше характеристикам точности и прецизионности. Вам не нужно калибровать объем, который дозируют пипетки перед использованием. Вам нужно только выполнить позиционную калибровку. Подробные сведения см. в следующем разделе, а также в разделе «Установка пипетки» главы «Установка и перемещение».
Услуги Opentrons Care и Opentrons Care Plus включают ежегодную замену дозаторов и сертификаты калибровки. Подробную информацию см. в разделе «Гибкое обслуживание» главы «Техническое и сервисное обслуживание».
Калибровка пипетки
В комплект пользователя входит металлический калибровочный зонд для пипетки, который можно использовать во время позиционной калибровки. Во время выполнения протокола безопасно храните датчик на магнитном держателе на передней стойке робота. Во время процесса калибровки прикрепите зонд к соответствующему соплу и зафиксируйте его на месте. Робот перемещает зонд к калибровочным точкам на платформе, чтобы измерить точное положение пипетки.
Адаптер штатива для наконечников для пипеток
96-канальная пипетка Opentrons Flex поставляется с четырьмя адаптерами для штативов для наконечников. Это алюминиевые кронштейны точной формы, которые можно разместить на палубе. Адаптеры предназначены для штативов для наконечников Flex на 50 л, 200 л и 1000 мкл.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
55
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Из-за приложенной силы для 96-канальной пипетки требуется адаптер для правильного прикрепления полной стойки с наконечниками. Во время процедуры крепления пипетка перемещается по адаптеру, опускается на монтажные штифты и натягивает наконечники на пипетки, поднимая адаптер и стойку для наконечников. Вытягивание наконечников, а не нажатие, обеспечивает рычаг, необходимый для закрепления наконечников на пипетках, и предотвращает деформацию поверхности деки. По завершении 96-канальная пипетка опускает адаптер и пустой штатив для наконечников на деку. Дополнительную информацию см. в разделе «Наконечники и штативы для наконечников» главы «Лабораторное оборудование».
Частичный сбор чаевых
96-канальная пипетка позволяет использовать как полную стойку с наконечниками, так и меньшее количество наконечников. Это увеличивает количество операций, которые можно выполнить с помощью 96-канальной пипетки, поскольку она занимает оба крепления для пипеток.
В настоящее время 96-канальный дозатор поддерживает частичный захват наконечников для 8 наконечников в виде колонки. В этой конфигурации пипетка использует либо самые левые сопла для сбора наконечников со стойки для наконечников справа налево, либо крайние правые сопла для сбора наконечников со стойки с наконечниками слева направо.
При сборе менее 96 наконечников со стойки для наконечников ее следует размещать непосредственно на деке, а не в адаптере стойки для наконечников.
Датчики-пипетки
Пипетки Opentrons Flex оснащены рядом датчиков, которые обнаруживают и записывают данные о состоянии пипетки и любых насадках, которые она взяла.
ЕМКОСТНЫЕ ДАТЧИКИ
В сочетании с металлическим зондом или проводящим наконечником емкостные датчики обнаруживают контакт пипетки с чем-либо. Обнаружение контакта между металлическим зондом и декой используется в процессах автоматической калибровки пипеток и модулей.
У 1-канальных пипеток имеется один емкостный датчик, а у многоканальных - два: на каналах 1 и 8 у 8-канальных пипеток и на каналах 1 и 96 (позиции А1 и Н12) у 96-канальных пипеток.
56
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
ОПТИЧЕСКИЕ ДАТЧИКИ ПРИСУТСТВИЯ НАКОНЕЧНИКОВ
Переключатель фотопрерывателя определяет положение механизма сбрасывания наконечников пипетки, проверяя, были ли наконечники успешно подняты или опущены. 1-канальные, 8-канальные и 96-канальные дозаторы оснащены одним оптическим датчиком, который контролирует крепление наконечника по всем каналам.
Обновления прошивки пипеток
Opentrons Flex автоматически обновляет прошивку дозатора, чтобы обеспечить ее синхронизацию с версией программного обеспечения робота. Обновления встроенного ПО пипеток обычно происходят быстро и происходят в следующих случаях:
Вы прикрепляете пипетку. Робот перезапускается.
Если по какой-либо причине версии прошивки вашего дозатора и программного обеспечения робота не синхронизируются, вы можете вручную обновить прошивку в приложении Opentrons.
1. Нажмите «Устройства». 2. Нажмите на свой Flex в списке устройств. 3. В разделе «Инструменты и модули» на рассинхронизированном дозаторе отобразится предупреждающий баннер:
«Доступно обновление прошивки». Нажмите «Обновить сейчас», чтобы начать обновление.
Ты можешь view текущая версия прошивки любой подключенной пипетки. На сенсорном экране перейдите в раздел «Инструменты» и коснитесь названия пипетки. В приложении Opentrons найдите карту пипетки в разделе «Инструменты и модули», щелкните трехточечное меню (), а затем нажмите «О пипетке».
3.3 Захват
Захват перемещает лабораторное оборудование по всей рабочей зоне и позволяетtagзона во время исполнения протоколов. Захват прикрепляется к удлинителю, который отделен от креплений для пипеток; захват можно использовать с любой конфигурацией пипеток. Подробную информацию об установке захвата см. в разделе «Установка и калибровка прибора».
Захват позволяет перемещать лабораторное оборудование по платформе, а также устанавливать его на модули или снимать с них. Захват может манипулировать некоторыми планшетами с лунками с полной юбкой, планшетами с глубокими лунками и штативами для наконечников. Для получения более подробной информации о том, какое лабораторное оборудование может перемещать захват, см. раздел «Лабораторное оборудование и гибкий захват Opentrons» главы «Лабораторное оборудование» или обратитесь к библиотеке лабораторного оборудования Opentrons.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
57
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Характеристики захвата
Челюсти выполняют основное движение захвата, которое заключается в открытии или закрытии двух параллельных лопастей для приложения или ослабления силы по бокам лабораторного оборудования. Движение кулачков контролируется щеточным двигателем на 36 В постоянного тока, соединенным с реечной передачей.
Чтобы переместить часть лабораторного оборудования, захваченного челюстями, портал поднимает захват вдоль оси Z, перемещает его вбок, а затем опускает в новое положение лабораторного оборудования.
Расположение компонентов захвата.
Крепежные винты
Калибровочный штифт Челюсти Лопасти
Калибровка захвата
В комплект захвата входит металлический калибровочный штифт. Калибровочный штифт расположен в углублении для хранения в нижней части захвата. Магнит удерживает булавку на месте. Чтобы снять калибровочный штифт, возьмите его пальцами и осторожно потяните. Чтобы заменить штифт, вставьте его обратно в слот для хранения. Вы поймете, что он надежен, когда он встанет на место.
При калибровке захвата поочередно прикрепите штифт к каждой губке. Робот перемещает штифт к калибровочным точкам на платформе, чтобы измерить точное положение захвата.
Во время выполнения протокола поместите булавку в место хранения для безопасного хранения. Свяжитесь с нами по адресу support@opentrons.com, если вы потеряете калибровочный штифт.
Обновления прошивки захвата
Opentrons Flex автоматически обновляет прошивку захвата, чтобы обеспечить ее синхронизацию с версией программного обеспечения робота. Обновления встроенного ПО Gripper обычно происходят быстро и происходят всякий раз, когда:
58
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Вы прикрепляете захват. Робот перезапускается.
Если по какой-либо причине версии прошивки вашего захвата и программного обеспечения робота не синхронизируются, вы можете вручную обновить прошивку в приложении Opentrons.
1. Нажмите «Устройства». 2. Нажмите на свой Flex в списке устройств. 3. В разделе «Приборы и модули» на рассинхронизированном захвате отобразится предупреждающий баннер:
«Доступно обновление прошивки». Нажмите «Обновить сейчас», чтобы начать обновление.
Ты можешь view текущая версия прошивки захвата. На сенсорном экране перейдите в раздел «Инструменты» и коснитесь захвата. В приложении Opentrons найдите карту захвата в разделе «Приборы и модули», щелкните трехточечное меню (), а затем нажмите «О захвате».
3.4 Пульт аварийной остановки
Подвеска аварийной остановки (E-stop) — это специальная аппаратная кнопка для быстрой остановки движения робота. Opentrons Flex требует, чтобы постоянно был подключен функциональный, отключенный аварийный стопор. Когда вы нажимаете кнопку остановки, Flex максимально быстро отменяет любой запущенный протокол или рабочий процесс настройки и предотвращает большую часть движений робота.
Когда использовать аварийный останов
Возможно, вам придется нажать кнопку аварийного останова:
Когда существует неизбежный риск получения травмы или причинения вреда пользователю. Когда существует неизбежный риск повреждения робота или другого оборудования. Когда сampфайлы или реагенты находятся в непосредственной опасности загрязнения. После аппаратного столкновения.
В идеале вам никогда не придется нажимать кнопку аварийного останова (за исключением нечастых проверок качества оборудования).
Не используйте аварийный останов для отмены обычных ожидаемых операций. Вместо этого используйте программную кнопку на сенсорном экране или в приложении Opentrons. Приостановка с помощью программного обеспечения позволит вам возобновить или отменить протокол, тогда как нажатие аварийной остановки всегда немедленно отменяет протокол.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
59
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Включение и отпускание аварийного останова
Аварийный стопор имеет механизм нажатия и поворота.
Включение: Сильно нажмите красную кнопку. Flex перейдет в остановленное состояние. Решение: после остановки безопасно решать любые проблемы в рабочей зоне, например, устранять разливы,
удаление лабораторного оборудования или перемещение гентри (он должен свободно и легко перемещаться вручную). Отпуск: поверните кнопку по часовой стрелке. Он поднимется в свободное положение. Сброс: на сенсорном экране или в приложении Opentrons подтвердите, что вы готовы к возобновлению работы Flex.
движение. Портал вернется в исходное положение, и работа модуля возобновится.
В остановленном состоянии Flex и подключенное оборудование будут вести себя следующим образом:
Аппаратные портальные пипетки
Захват
Модуль нагревателя-шейкера
Модуль температуры Модуль термоциклера Индикатор состояния Сенсорный экран
Поведение
Автоматическое горизонтальное движение прекращается. Допускается ручное горизонтальное перемещение.
Вертикальное движение пипеток прекращается. Тормоза двигателя на вертикальных осях включены, чтобы предотвратить
пипетки от падения. Движение плунжера и захват наконечника прекращаются.
Вертикальное движение захвата прекращается. Тормоз двигателя на вертикальной оси включен, чтобы предотвратить
захват от падения. Двигатели челюстей, создающие силу захвата, остаются включенными, поэтому
захват не уронит лабораторное оборудование, которое он может нести.
Шейкер останавливается и возвращается домой. Защелка лабораторного оборудования открывается. Отопление отключено.
Нагрев или охлаждение отключены.
Нагрев или охлаждение отключены.
Свет становится красным.
На экране появится сообщение об отмене. Индикатор на экране показывает, когда вы успешно
отключил кнопку остановки.
60
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
3.5 Связи
Переключатель Вкл/Выкл
Боковые крышки
Порты USB-A
Вход питания IEC
Порты AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Подключение питания
Opentrons Flex подключается к источнику питания через стандартный вход IEC-C14. Робот оснащен внутренним полнодиапазонным источником питания переменного/постоянного тока, принимающим входное напряжение 100 В переменного тока, 240/50 Гц и преобразующим его в 60 В постоянного тока. Вся остальная внутренняя электроника питается от источника питания 36 В постоянного тока.
Предупреждение. Используйте только шнур питания, входящий в комплект поставки робота. Не используйте шнур питания с недостаточным током или напряжением.tagе рейтинги.
Следите за тем, чтобы шнур питания не был заблокирован, чтобы при необходимости его можно было отсоединить.
Также имеется батарейка типа «таблетка» CR1220 для питания часов реального времени робота, когда они не подключены к электросети. Батарея расположена внутри корпуса сенсорного экрана. Если вы считаете, что вам необходимо заменить батарею, обратитесь в службу поддержки Opentrons для получения дополнительной информации.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
61
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
USB и вспомогательные соединения
Opentrons Flex имеет 10 USB-портов, расположенных в разных частях робота и служащих разным целям.
8 задних портов USB-A (с номерами от USB-1 до USB-8) и 2 вспомогательных порта (разъемы M12 с номерами AUX-1 и AUX-2) предназначены для подключения модулей и аксессуаров Opentrons. См. главу «Модули» для получения дополнительной информации о подключении этих устройств и их использовании в ваших протоколах. Задний порт USB-B предназначен для подключения робота к ноутбуку или настольному компьютеру для установления связи с приложением Opentrons, работающим на подключенном компьютере. Передний порт USB-A (USB-9), расположенный под сенсорным дисплеем, имеет те же функции, что и задние порты USB-A.
Примечание. Порты USB имеют ограничение по мощности для защиты робота и подключенных устройств. Подача питания внутри разделена на три группы портов: левые задние порты USB-A (от USB-1 до USB-4), правые задние порты USB-A (от USB-5 до USB-8) и передние порты USB-A. порт. Каждая из этих групп будет подавать максимум 500 мА на подключенные устройства, совместимые с USB 2.0.
Сетевые соединения
Opentrons Flex может подключаться к локальной сети через проводное (Ethernet) или беспроводное (Wi-Fi) соединение.
Порт Ethernet расположен на задней панели робота. Подключите его к концентратору Ethernet или включите сеть. Или, начиная с версии робототехнической системы 7.1.0, подключите его напрямую к порту Ethernet на вашем компьютере. Внутренний модуль Wi-Fi поддерживает сети 802.11 ac/a/b/g/n с двухдиапазонной антенной 2.4/5 ГГц.
62
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
3.6 Технические характеристики системы
Общие характеристики
Размеры Вес Слоты для деки
Сенсорный экран
Wi-Fi Ethernet USB
Входная мощность робота-камеры
Напряжение питания от сетиtagКолебания e Колебания частоты сети электропитания Распределительная система Ток короткого замыкания Состав рамы Состав окон Требования к вентиляции
87 × 69 × 84 см / 34.25 × 27 × 33 дюйма (Ш, Г, В)
88.5 кг / 195 фунтов 12 ANSI/SLAS-совместимых слотов в рабочей зоне
(доступно для пипеток) 4 дополнительных слота дляtagсоветы и лабораторное оборудование
(доступен только с помощью захвата) 7-дюймовый сенсорный ЖК-экран со устойчивым к царапинам и повреждениям стеклом Gorilla Glass 3
Двухдиапазонный 802.11 ac/a/b/g/n (2.4/5 ГГц)
100 Мбит/с 9 портов USB-A 1 порт USB-B Скорость USB 2.0
2 МП, фото и видео 100 В переменного тока, 240 Гц, 50 60 А/1 В переменного тока, 4.0 А/115 В переменного тока
±10%
±5%
TN-S
6.3 А
Жесткая стальная и алюминиевая конструкция с ЧПУ
Съемные боковые окна и передняя дверь из поликарбоната Расстояние не менее 20 см / 8 дюймов между устройством и стеной.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
63
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Требования к подключенному ПК
Приложение Opentrons работает на: Windows 10 или новее; MacOS 10.10 или новее; Ubuntu 12.04 или новее.
Экологические характеристики
Условия окружающей среды Температура окружающей среды Относительная влажность Степень загрязнения
Только для внутреннего использования от +20 до +25 °C (рекомендуется) 40–60 %, без конденсации (рекомендуется) 2 (только непроводящее загрязнение)
Дополнительную информацию о приемлемых условиях окружающей среды для использования и транспортировки см. в разделе «Условия окружающей среды» главы «Установка и перемещение».
Сертификаты
Сертификация завершена. Не сертифицирована/подтверждена.
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Сводная информация о сертификации напечатана на наклейке на задней стороне Flex, рядом с переключателем включения/выключения. Подробную информацию о сертификации и соответствии требованиям см. в разделе «Соответствие нормативным требованиям» во Введении.
Серийный номер
Каждый Flex имеет уникальный серийный номер. Формат серийного номера предоставляет дополнительную информацию, включая дату производства робота. Для бывшегоample, серийный номер FLXA1020231007001 будет означать:
64
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ СИСТЕМЫ
Символы FLX A10 2023 10 07 001
Категория Модель Версия Год Месяц День Единица измерения
Значение: Робот представляет собой Opentrons Flex. Код серийной версии робота. Робот изготовлен в 2023 году. Робот изготовлен в октябре. Робот был изготовлен 7-го числа месяца. Уникальный номер для роботов, сделанный в определенный день.
Вы можете найти серийный номер вашего Flex:
На наклейке сертификации на задней стороне Flex, рядом с переключателем включения/выключения. На обратной стороне тачскрина (в сторону рабочей области). В приложении Opentrons выберите «Устройства» > «Ваш Flex» > «Настройки робота» > «Дополнительно».
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
65
ГЛАВА 4
Модули
Opentrons Flex интегрируется с рядом аппаратных модулей Opentrons. Все модули представляют собой периферийные устройства, занимающие слоты на плате, и большинство из них управляются роботом через USB-соединение.
В этой главе описаны функции и физические характеристики модулей, совместимых с системой Opentrons Flex, а также способы их подключения и калибровки. Более подробную информацию о настройке и использовании модулей можно найти в руководствах к отдельным модулям. Подробную информацию об интеграции модулей в ваши протоколы см. в разделе «Конструктор протоколов» главы «Разработка протоколов» или в онлайн-документации API протокола Python.
4.1 Поддерживаемые модули
Opentrons Flex совместим с четырьмя типами палубных модулей Opentrons:
Модуль нагревателя-шейкера обеспечивает нагрев на палубе и орбитальную тряску. Модуль можно нагревать до 95 °C и встряхивать.ampот 200 до 3000 об/мин.
Магнитный блок — это пассивное устройство, которое удерживает лабораторное оборудование вблизи высокопрочных неодимовых магнитов. Магнитные модули OT-2 GEN1 и GEN2, которые активно перемещают свои магниты вверх и вниз относительно лабораторного оборудования, не поддерживаются Opentrons Flex.
Температурный модуль представляет собой модуль горячей и холодной пластины, который способен поддерживать стабильную температуру от 4 до 95 °C.
Модуль термоциклера обеспечивает полностью автоматизированный термоциклирование на палубе, что позволяет автоматизировать этапы рабочего процесса на входе и выходе. Термоциклер GEN2 полностью совместим с захватом. Термоциклер GEN1 нельзя использовать с захватом, поэтому он не поддерживается Opentrons Flex.
Некоторые модули, изначально разработанные для OT-2, совместимы с Flex, как показано в таблице ниже. Галочка указывает на совместимость, а X — на несовместимость.
66
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Тип и поколение устройства Модуль нагревателя-шейкера GEN1 Магнитный модуль GEN1 Магнитный модуль GEN2 Магнитный блок GEN1 Температурный модуль GEN1 Температурный модуль GEN2 Модуль термоциклера GEN1 Модуль термоциклера GEN2 Модуль HEPA
ОТ-2
Флекс
×
×
×
×
×
×
4.2 Система контейнеров для модулей
Совместимые модули предназначены для установки в контейнеры, занимающие пространство под палубой. Эта система позволяет лабораторному оборудованию поверх модулей оставаться ближе к поверхности платформы, а также позволяет прокладывать кабели под палубой, чтобы платформа оставалась аккуратной во время выполнения протокола.
Контейнеры для модулей нагревателя-шейкера, температуры и термоциклера.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
67
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Чтобы установить модуль на поверхность палубы, его сначала необходимо поместить в соответствующий отсек для модулей. Каждый тип совместимого модуля имеет собственную конструкцию контейнера, которая позволяет точно совмещать модуль и лабораторное оборудование с окружающей поверхностью. (Исключением является магнитный блок, который не требует прокладки кабеля питания или USB-кабеля и поэтому располагается непосредственно на поверхности деки.) Картеры для модулей, занимающих один слот, можно размещать в любом месте столбца 1 или 3; Термоциклер можно устанавливать только в слоты A1 и B1 одновременно.
В общем, чтобы установить модуль caddy:
1. Удалите все слоты платформы из того места, где будет располагаться модуль. 2. Установите модуль в контейнер и затяните его крепления. 3. Проложите кабели питания и USB-кабели модуля через боковые крышки, вверх через пустой слот деки и
прикрепите их к модулю. 4. Установите корпус модуля в слот и привинтите его на место.
Точные инструкции по установке см. в руководстве по быстрому запуску или в руководстве по эксплуатации для конкретного модуля. Кабельные соединения и способ крепления к тележке различаются в зависимости от модуля.
4.3 Калибровка модуля
Когда вы впервые устанавливаете модуль на Flex, вам необходимо запустить автоматическую позиционную калибровку. Этот процесс аналогичен позиционной калибровке инструментов и гарантирует, что Flex перемещается в нужные места для оптимальной работы протокола. Во время калибровки Flex перемещается в места на калибровочном адаптере модуля, которые похожи на калибровочные квадраты, являющиеся частью съемных слотов деки.
Калибровочные адаптеры для модулей нагревателя-шейкера, температуры и термоциклера.
Калибровка модуля требуется для всех модулей, которые устанавливаются через контейнер: модулей нагревателя-шейкера, температуры и термоциклера. Магнитный блок не требует калибровки и готов к использованию, как только вы поместите его на деку.
68
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Когда калибровать модули
Flex автоматически предлагает вам выполнить калибровку при подключении и включении модуля, на котором нет сохраненных данных калибровки. (Вы можете закрыть это сообщение, но вы не сможете запускать протоколы с модулем, пока не откалибруете его.)
После завершения калибровки Flex сохраняет данные калибровки и серийный номер модуля для использования в будущем. Flex не предложит вам выполнить повторную калибровку, если вы не удалите данные калибровки для этого модуля в настройках робота. Вы можете свободно включать и выключать свой модуль или даже перемещать его в другой слот деки без необходимости повторной калибровки. Если вы хотите выполнить повторную калибровку, вы можете начать процесс в любое время с карты модуля в приложении Opentrons. (Повторная калибровка недоступна с сенсорного экрана.)
Как калибровать модули
Инструкции на сенсорном экране или в приложении Opentrons помогут вам выполнить процедуру калибровки. В целом шаги следующие:
1. Соберите необходимое оборудование, включая адаптер для калибровки модуля и зонд для калибровки пипетки. 2. Поместите калибровочный адаптер на поверхность модуля и убедитесь, что он абсолютно горизонтален.
Для некоторых модулей может потребоваться прикрепить адаптер к модулю. 3. Прикрепите калибровочный зонд к пипетке. 4. Flex автоматически прикоснется к определенным точкам калибровочного адаптера и сохранит их.
калибровочные значения для будущего использования.
После завершения калибровки и снятия адаптера и зонда модуль будет готов к использованию в протоколах.
В любое время вы можете view и управляйте данными калибровки вашего модуля в приложении Opentrons. Перейдите в настройки робота для вашего Flex и нажмите вкладку «Калибровка».
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
69
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.4 Модуль нагревателя-шейкера GEN1
Особенности нагревателя-шейкера
НАГРЕВАНИЕ И ВСТРЯХИВАНИЕ
Нагреватель-шейкер обеспечивает нагрев на палубе и орбитальную тряску. Модуль можно нагревать до 95 °C при следующих температурах:file:
Температурный диапазон: 37 °C. Точность температуры: ±95 °C при 0.5 °C. Равномерность температуры: ±55 °C при 0.5 °C.amp скорость: 10 °C/мин
Модуль может трястиampле с 200 до 3000 об/мин, со следующей тряской проfile:
Диаметр орбиты: 2.0 мм Направление орбиты: по часовой стрелке Диапазон скоростей: 200 об/мин Точность скорости: ±3000 об/мин
Модуль оснащен защелкой для лабораторного оборудования с электроприводом, позволяющей прикреплять планшеты к модулю перед встряхиванием.
70
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
ТЕРМАЛЬНЫЕ АДАПТЕРЫ Для добавления лабораторного оборудования к нагревателю-шейкеру требуется совместимый термоадаптер. Адаптеры можно приобрести непосредственно в Opentrons по адресу https://shop.opentrons.com. В настоящее время доступны следующие термоадаптеры:
Универсальный плоский адаптер
ПЦР-адаптер
Адаптер для глубоких скважин
96 Адаптер с плоским дном
УПРАВЛЕНИЕ ПРОГРАММНЫМ ОБЕСПЕЧЕНИЕМ
Нагреватель-шейкер полностью программируется в дизайнере протоколов и API протокола Python. API Python дополнительно позволяет выполнять другие шаги протокола параллельно, пока активен нагреватель-шейкер. Подробную информацию о добавлении параллельных шагов в ваши протоколы см. в разделе «Неблокирующие команды» в документации API.
Помимо протоколов, приложение Opentrons может отображать текущее состояние нагревателя-шейкера и напрямую управлять нагревателем, шейкером и защелкой лабораторного оборудования.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
71
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Технические характеристики нагревателя-шейкера
Размеры Вес Входная мощность модуля Вход адаптера питания Объём электропитанияtagе колебание OvervoltagПотребляемая мощность
152 × 90 × 82 мм (Д/Ш/В) 1.34 кг 36 В постоянного тока, 6.1 А 100 240 В переменного тока, 50/60 Гц ±10 % Категория II В режиме ожидания: 3 Вт
Типичное: Встряхивание: 4 Вт Нагрев: 11 Вт Нагрев и встряхивание: 10 Вт
Условия окружающей среды Температура окружающей среды Относительная влажность Высота над уровнем моря Степень загрязнения
Максимум: 125 130 Вт Только для использования в помещении 20 °C До 25 %, без конденсации До 80 2,000 м над уровнем моря 2
72
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.5 Магнитный блок GEN1
Особенности магнитного блока
Магнитный блок Opentrons GEN1 представляет собой магнитный держатель 96-луночного планшета. Магнитные блоки используются в протоколах, основанных на магнетизме для извлечения частиц из суспензии и удержания их в планшетах с лунками во время промывки, ополаскивания или других процедур элюирования. Для бывшегоample, автоматизированная подготовка NGS; очистка геномной и митохондриальной ДНК, РНК или белков; и другие процедуры извлечения — все это варианты использования, которые могут включать магнитные блоки.
МАГНИТНЫЕ КОМПОНЕНТЫ
Магнитный блок не питается, не содержит никаких электронных компонентов и не перемещает магнитные шарики вверх или вниз в растворе. Лунки состоят из 96 высокопрочных неодимовых кольцевых магнитов, прикрепленных к подпружиненному основанию, что помогает поддерживать допуски между блоком и пипетками при выполнении автоматических протоколов.
УПРАВЛЕНИЕ ПРОГРАММНЫМ ОБЕСПЕЧЕНИЕМ
Магнитный блок GEN1 полностью программируется в дизайнере протоколов и API протокола Python.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
73
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Однако вне протоколов сенсорный экран и приложение Opentrons не знают и не могут отображать текущий статус магнитного блока GEN1. Это модуль без питания. Он не содержит электронных или механических компонентов, которые могут взаимодействовать с роботом Flex. Вы «управляете» магнитным блоком с помощью протоколов, которые используют гибкий захват Opentrons для добавления и удаления лабораторного оборудования из этого модуля.
Характеристики магнитного блока
Размеры Вес Мощность модуля Класс магнита Условия окружающей среды Температура окружающей среды Относительная влажность Высота над уровнем моря Степень загрязнения
136 × 94 × 45 мм (Д/Ш/В) 1.13 кг Нет, модуль не питается N52 неодимовый Только для использования в помещении 20 °C 25 %, без конденсации До 30 м над уровнем моря 80
74
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.6 Температурный модуль GEN2
Возможности температурного модуля
ОТОПЛЕНИЕ И ОХЛАЖДЕНИЕ
Температурный модуль Opentrons GEN2 представляет собой модуль с горячей и холодной пластиной. Он часто используется в протоколах, требующих нагрева, охлаждения или изменения температуры. Модуль может достигать и поддерживать температуру в диапазоне от 4 °C до 95 °C в течение нескольких минут, в зависимости от конфигурации и содержимого модуля.
ТЕРМОБЛОКИ
Для поддержания температуры лабораторного оборудования в модуле используются алюминиевые термоблоки. Модуль поставляется с термоблоками на 24 и 96 лунок. В комплект поставки контейнера для температурного модуля входят блок с глубокими лунками и блок с плоским дном, предназначенные для использования с захватом Flex Gripper. Блоки вмещают пробирки емкостью 1.5 мл и 2.0 мл, 96-луночные ПЦР-планшеты, ПЦР-стрипы, планшеты с глубокими лунками и планшеты с плоским дном.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
75
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Примечание. В комплект поставки модуля также входит блок с плоским дном для OT-2. Не используйте блок OT-2 с Flex. На верхней поверхности плоского нижнего блока Flex имеется надпись «Opentrons Flex». У ОТ-2 нет.
24-луночный термоблок
96-луночный термоблок
Глубокий термоблок
Термоблок с плоским дном для Flex
ВОДЯНЫЕ БАННИ И ОТОПЛЕНИЕ
Поскольку воздух является хорошим теплоизолятором, зазоры между лабораторным оборудованием и термоблоком могут повлиять на время достижения температуры температурного модуля. Размещение небольшого количества воды в термоблоках с 24 или 96 лунками устраняет воздушные зазоры и повышает эффективность нагрева. Идеальное количество воды зависит от термоблока и лабораторной посуды. Дополнительные рекомендации см. в официальном документе по температурному модулю.
УПРАВЛЕНИЕ ПРОГРАММНЫМ ОБЕСПЕЧЕНИЕМ
Модуль температуры полностью программируется в дизайнере протоколов и API протокола Python.
Помимо протоколов, приложение Opentrons может отображать текущее состояние температурного модуля и напрямую контролировать температуру поверхностной пластины.
76
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Технические характеристики модуля температуры
Размеры Вес Мощность модуля
Условия окружающей среды Температура окружающей среды Относительная влажность Высота над уровнем моря Степень загрязнения
194 × 90 × 84 мм (Д/Ш/В) 1.5 кг Вход: 100 В переменного тока, 240/50 Гц, 60 А Выход: 4.0 В постоянного тока, 36 А, макс. 6.1 Вт Использование в помещении только при температуре <219.6 °C (рекомендуется для оптимального охлаждения) ) До 22 %, без конденсации До 60 м над уровнем моря 2000
4.7 Модуль термоциклера GEN2
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
77
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Особенности термоциклера
Модуль термоциклера Opentrons GEN2 — это полностью автоматизированный термоциклер, устанавливаемый на палубе, обеспечивающий ПЦР без помощи рук в формате 96-луночного планшета. Его подогреваемая крышка и одноразовый уплотнитель плотно прилегают к тарелке, обеспечивая эффективную работу.ample нагрев и минимальное испарение.
НАГРЕВ И ОХЛАЖДЕНИЕ Блок термоциклера может нагреваться и охлаждаться, а его крышка может нагреваться при следующей температуре:file: Диапазон температур термоблока: 4 °C Максимальный нагрев термоблока ramp скорость: 4.25 °C/с от температуры окружающей среды GEN2 до 95 °C Максимальное охлаждение термоблока ramp скорость: 2.0 °C/с от 95 °C до температуры окружающей среды. Диапазон температур крышки: 37 110 °C. Точность температуры крышки: ±1 °C. Автоматическую крышку можно открывать или закрывать по мере необходимости во время выполнения протокола.
ТЕРМОЦИКЛЕР ПРОFILES Термоциклер может выполнятьfiles: автоматическое переключение последовательности температур блока для выполнения термочувствительных реакций.
РЕЗИНОВЫЕ УПЛОТНЕНИЯ ДЛЯ АВТОМАТИКИ Термоциклер поставляется с резиновыми уплотнениями для автоматизации, помогающими уменьшить испарение. Каждое уплотнение должно быть стерилизовано перед использованием и может использоваться в течение нескольких циклов. Дополнительные печати можно приобрести непосредственно в Opentrons по адресу https://shop.opentrons.com.
ПРОГРАММНОЕ УПРАВЛЕНИЕ Термоциклер полностью программируется с помощью дизайнера протоколов и API протокола Python. Помимо протоколов, приложение Opentrons может отображать текущее состояние термоциклера и напрямую контролировать температуру блока, температуру крышки и положение крышки.
78
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Технические характеристики термоциклера
Размеры (крышка открыта) Размеры (крышка закрыта) Вес (включая задний воздуховод) Объем адаптера питанияtage Ток адаптера питания Overvoltage Условия окружающей среды Температура окружающей среды Относительная влажность Высота над уровнем моря Требования к вентиляции
244.95 × 172 × 310.1 мм (Д/Ш/В) 244.95 × 172 × 170.35 мм (Д/Ш/В) 8.4 кг 100 В при 240/50 Гц 60 A Категория II Только для использования в помещении 8.5 °C (идеально); 5 °C (приемлемо) 20 %, без конденсации До 25 м над уровнем моря Не менее 2 см / 40 дюймов между устройством и стеной
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
79
ГЛАВА 5
лабораторное оборудование
В этой главе описаны элементы библиотеки лабораторного оборудования Opentrons, которые можно использовать с Opentrons Flex и Opentrons Flex Gripper. Он также охватывает специальное лабораторное оборудование и, для наших опытных пользователей, связывает компоненты лабораторного оборудования с соответствующими им JSON. file определения.
Вы можете приобрести лабораторное оборудование у производителей оригинального оборудования или в магазине Opentrons по адресу https://shop.opentrons.com. Кроме того, Opentrons всегда работает над проверкой новых определений лабораторного оборудования. Последние списки см. в библиотеке лабораторного оборудования (ссылка выше).
5.1 Концепции лабораторного оборудования
Лабораторное оборудование — это больше, чем просто объекты, размещенные на столе и используемые в протоколе. Чтобы помочь вам понять лабораторное оборудование Opentron, давайте рассмотрим эту тему с трех разных точек зрения. Лабораторное оборудование Opentrons Flex включает в себя элементы из нашей библиотеки лабораторного оборудования, данные, определяющие каждую часть лабораторного оборудования, а также специальное лабораторное оборудование.
Лабораторное оборудование как оборудование
Библиотека лабораторного оборудования включает в себя все, что вы можете использовать по умолчанию с Opentrons Flex. Это долговечные компоненты и расходные материалы, с которыми вы работаете, повторно используете или выбрасываете во время выполнения протокола. Для работы с элементами Библиотеки лабораторного оборудования не требуется предпринимать никаких специальных действий. Робот Flex умеет работать со всем в библиотеке автоматически.
Лабораторное оборудование как данные
Информация о лабораторном оборудовании хранится в нотации объектов Javascript (JSON). files с .json file расширения. JSON file включает пространственные размеры (длину, ширину, высоту), объемную емкость (л, мл) и другие показатели, определяющие особенности поверхности, их форму и расположение. При запуске протокола Flex читает эти файлы .json. fileНужно знать, какое лабораторное оборудование находится на палубе и как с ним работать.
80
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Лабораторное оборудование на заказ
Специальное лабораторное оборудование — это лабораторное оборудование, которое не включено в Библиотеку лабораторного оборудования или лабораторное оборудование, созданное Создателем индивидуального лабораторного оборудования. Однако иногда идея индивидуального лабораторного оборудования отягощена понятиями сложности, затрат или затруднений. Но нестандартное лабораторное оборудование не должно быть трудным для понимания или создания. Давайте раскроем концепцию индивидуального лабораторного оборудования.
Как бывшийampНапример, в библиотеку лабораторного оборудования Opentrons входят 96-луночные планшеты (200 л) от Corning и BioRad, но такие планшеты производят и другие производители. И благодаря общепринятым отраслевым стандартам различия между этими вездесущими лабораторными приборами незначительны. Однако обычный 200-луночный планшет объемом 96 л от Stellar Scientific, Oxford Lab или Krackeler Scientific (или любого другого поставщика в этом отношении) является «индивидуальным лабораторным оборудованием» для Flex, поскольку он не указан заранее в нашей библиотеке лабораторного оборудования. . Кроме того, незначительные различия в размерах лабораторного оборудования могут существенно повлиять на успех выполнения вашего протокола. По этой причине важно иметь точное определение лабораторного оборудования для каждого лабораторного оборудования, которое вы хотите использовать в своем протоколе.
Кроме того, хотя специальное лабораторное оборудование может представлять собой эзотерический одноразовый комплект, в большинстве случаев это просто наконечники, планшеты, пробирки и штативы, которые ежедневно используются в лабораториях по всему миру. Опять же, единственная разница между лабораторным оборудованием Opentron и индивидуальным лабораторным оборудованием заключается в том, что новый элемент не определен заранее в программном обеспечении, на котором работает робот. Flex может работать и работает с другими базовыми предметами лабораторного оборудования или чем-то уникальным, но вам необходимо записать характеристики этого предмета в определении лабораторного оборудования JSON. file и импортируйте эти данные в приложение Opentrons. Дополнительную информацию см. в разделе «Определения пользовательского лабораторного оборудования» ниже.
Подводя итог, лабораторное оборудование включает в себя:
Все в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons. Определения лабораторного оборудования: данные в формате JSON file который определяет формы, размеры и возможности отдельных предметов
например планшеты с лунками, наконечники, резервуары и т. д. Специальное лабораторное оборудование, которое не включено в Библиотеку лабораторного оборудования.
После повторногоviewИспользуя эти важные понятия, давайте рассмотрим категории и элементы в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons. После этого мы закончим главу овер-view компонентов данных лабораторного оборудования file и кратко изложим функции и услуги Opentrons, которые помогут вам создавать индивидуальное лабораторное оборудование.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
81
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
5.2 Резервуары
Opentrons Flex по умолчанию работает с одно- и многоскважинными коллекторами, перечисленными ниже. Использование этих резервуаров помогает снизить нагрузку на подготовительную работу, поскольку они готовы к автоматизации прямо из коробки. Информация о резервуаре также доступна в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons.
Односкважинные коллекторы
Технические характеристики производителя
Аджилент
290 мл V дно
Аксиген
90 мл Плоское дно
ГНЕЗДО
195 мл Плоское дно
290 мл V дно
Имя загрузки API
agilient_1_ резервуар_290мл
axygen_1_ резервуар_90мл
гнездо_1_ резервуар_195мл
гнездо_1_ резервуар_290мл
Многоскважинные коллекторы
Технические характеристики производителя
ГНЕЗДО
12 лунок 15 мл/лунка V дно
США Научный
12 лунок 22 мл/лунка V дно
Имя загрузки API нест_12_ резервуар_15мл
usascientific_12_ резервуар_22 мл
82
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Определения резервуаров и API
Библиотека лабораторного оборудования Opentrons определяет характеристики перечисленных выше резервуаров в отдельном формате JSON. fileс. Робот и API Python Opentrons используют эти определения JSON для работы с лабораторным оборудованием, используемым вашими протоколами. Для бывшегоampНапример, при работе с API функция ProtocolContext.load_labware принимает эти имена лабораторного оборудования в качестве допустимых параметров в вашем коде. Связанные имена загрузки API связаны с определениями лабораторного оборудования резервуара в репозитории Opentrons GitHub.
Лабораторное оборудование для резервуаров на заказ
Попробуйте создать собственное определение лабораторного оборудования с помощью Opentrons Labware Creator, если резервуар, который вы хотите использовать, здесь не указан. Пользовательское определение объединяет все размеры, метаданные, формы, объемную емкость и другую информацию в формате JSON. file. Opentrons Flex нуждается в этой информации, чтобы понять, как работать с вашим индивидуальным лабораторным оборудованием. Дополнительную информацию см. в разделе «Определения пользовательского лабораторного оборудования».
5.3 Луночные планшеты
Opentrons Flex по умолчанию работает с планшетами с лунками, перечисленными ниже. Использование этих луночных планшетов помогает снизить нагрузку на подготовительную работу, поскольку они готовы к автоматизации прямо из коробки. Информация о луночных планшетах также доступна в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
83
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
6-луночные планшеты
Производитель Корнинг
Технические характеристики
6 лунок по 16.8 мл/лунка Круглые лунки, плоское дно
Имя загрузки API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12-луночные планшеты
Производитель Корнинг
Технические характеристики
12 лунок по 6.9 мл/лунка Круглые лунки, плоское дно
Имя загрузки API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24-луночные планшеты
Производитель Корнинг
Технические характеристики
24 лунок по 3.4 мл/лунка Круглые лунки, плоское дно
Имя загрузки API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48-луночные планшеты
Производитель Корнинг
Технические характеристики
48 лунок по 1.6 мл/лунка Круглые лунки, плоское дно
Имя загрузки API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
96-луночные планшеты
Производитель Bio-Rad Corning NEST
Опентроны Thermo Scientific
США Научный
Технические характеристики
96 лунок 200 мкл/лунка Круглые лунки, V-образное дно
96 лунок 360 мкл/лунка Круглые лунки, плоское дно
96 лунок 100 мкл/лунка Круглые лунки, V-образное дно, полная юбка для ПЦР
96 лунок 200 мкл/лунка Круглые лунки, плоское дно
96 глубоких лунок 2000 мкл/лунка Квадратные лунки, V-образное дно
Tough 96 лунок 200 мкл/лунка Круглые лунки, V-образное дно, полная юбка для ПЦР
Nunc 96 глубоких лунок 1300 мкл/лунка Круглые лунки, U-образное дно
Nunc 96 глубоких лунок 2000 мкл/лунка Круглые лунки, U-образное дно
96 глубоких лунок 2.4 мл/лунка Квадратные лунки, U-образное дно
Имя загрузки API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_квартира
гнездо_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
гнездо_96_wellplate_200ul_квартира
гнездо_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ юбка
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300 мкл thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000 мкл usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
85
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
384-луночные планшеты
Производитель прикладных биосистем Bio-Rad
Корнинг
Технические характеристики
384 лунок 40 мкл/лунка Круглые лунки, V-образное дно
384 лунок 50 мкл/лунка Круглые лунки, V-образное дно
384 лунки 112 мкл/лунка Квадратные лунки, плоское дно
Имя загрузки API применяетсябиосистеммикроamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_квартира
Адаптеры луночных планшетов
Перечисленные ниже алюминиевые пластины являются термоадаптерами для модуля Opentrons Heater-Shaker GEN1. Вы можете использовать эти автономные определения адаптера для загрузки проверенного Opentrons или специального лабораторного оборудования поверх нагревателя-шейкера.
Тип адаптера Opentrons Универсальный плоский адаптер «нагреватель-шейкер» Opentrons 96 Адаптер «нагреватель-шейкер» для ПЦР Opentrons 96 Адаптер «нагреватель-шейкер для глубоких лунок» Opentrons 96 Адаптер «нагреватель-шейкер с плоским дном»
Имя загрузки API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Вы также можете загрузить адаптер и лабораторное оборудование с помощью одного определения. Наша библиотека лабораторного оборудования включает в себя несколько предварительно настроенных комбинаций термоадаптеров и лабораторного оборудования, которые делают нагреватель-шейкер готовым к использованию прямо из коробки.
86
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Примечание. Не используйте комбинированное определение, если вам нужно переместить лабораторное оборудование на нагреватель-шейкер или снять его во время протокола либо с помощью захвата, либо вручную. Вместо этого используйте определение автономного адаптера.
Комбинация адаптера и лабораторного оборудования
Имя загрузки API
Opentrons 96 Адаптер для нагревателя и шейкера глубоких лунок с планшетом для глубоких лунок NEST 2 мл
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 Адаптер с нагревателем и шейкером с плоским дном и 96-луночным планшетом NEST на 200 мкл, плоский
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Адаптер Opentrons 96 для ПЦР-нагревателя-шейкера с луночным планшетом NEST 100 мкл
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Универсальный плоский адаптер Opentrons для нагревателя и шейкера с 384-луночным планшетом Corning, 112 мкл, плоский
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Адаптеры можно приобрести непосредственно в Opentrons по адресу https://shop.opentrons.com.
Планшеты лунок и определения API
Библиотека лабораторного оборудования Opentrons определяет характеристики луночных планшетов, перечисленных выше, в отдельном формате JSON. fileс. Робот Flex и API Python Opentrons используют эти определения JSON для работы с лабораторным оборудованием, используемым вашими протоколами. Для бывшегоampНапример, при работе с API функция ProtocolContext.load_labware принимает эти имена лабораторного оборудования в качестве допустимых параметров в вашем коде. Связанные имена загрузки API связаны с определениями лабораторного оборудования луночных планшетов в репозитории Opentrons GitHub.
Лабораторное оборудование для луночных планшетов на заказ
Попробуйте использовать Opentrons Labware Creator, чтобы создать собственное определение лабораторного оборудования, если луночного планшета, который вы хотели бы использовать, здесь нет в списке. Пользовательское определение объединяет все размеры, метаданные, формы, объемную емкость и другую информацию в формате JSON. file. Opentrons Flex считывает эту информацию, чтобы понять, как работать с вашим индивидуальным лабораторным оборудованием. Дополнительную информацию см. в разделе «Определения пользовательского лабораторного оборудования».
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
87
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
5.4 Наконечники и держатели для наконечников
Наконечники Opentrons Flex выпускаются в размерах 50 мкл, 200 мкл и 1000 мкл. Это прозрачные наконечники из непроводящего полипропилена, доступные с фильтрами или без них. Они стерильно упакованы в штативы на 96 наконечников и не содержат ДНКазы, РНКазы, протеазы, пирогенов, человеческой ДНК, эндотоксинов и ингибиторов ПЦР. На стойках также указаны номера партий и сроки годности.
Наконечники для пипеток Flex совместимы с пипетками Opentrons Flex на 50 и 1000 мкл в 1-, 8- и 96-канальных конфигурациях. Хотя на пипетки объемом 50 и 1000 л можно надеть любой наконечник Flex, постарайтесь подобрать наконечник в соответствии с номинальной вместимостью пипетки. Для бывшегоampНапример, было бы странно надевать наконечник объемом 1000 л на пипетку объемом 50 л. Для пипетки объемом 1000 л вы, безусловно, можете использовать наконечник объемом 50, 200 или 1000 л.
Стойки для наконечников
Нефильтрованные и фильтрованные насадки упакованы в стойку, состоящую из многоразовой базовой пластины, средней пластины, вмещающей 96 насадок, и крышки.
Штатив для наконечников по объему 50 мкл 200 мкл 1000 мкл
Имя загрузки API
Без фильтра: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Фильтрованное: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Без фильтра: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Фильтрованное: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Без фильтра: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Фильтрованное: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Чтобы облегчить идентификацию, средние пластины держателя наконечников имеют цветовую маркировку в зависимости от размера наконечника:
50 мкл: пурпурный 200 л: желтый 1000 мкл: синий
88
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
При заказе или повторном заказе насадки и стойки поставляются в двух разных конфигурациях упаковки:
Стойки: Состоят из отдельно упакованных штативов для наконечников (основание, средняя пластина с наконечниками и крышка). Конфигурации со стойками лучше всего подходят, когда чистота имеет первостепенное значение, чтобы избежать перекрестного загрязнения или когда ваши протоколы не допускают повторного использования базовой платы или компонентов.
Запасные части: состоят из одной полной стойки для наконечников (опорная пластина, средняя пластина с наконечниками и крышка) и отдельных контейнеров для наконечников. Конфигурации с дозаправкой лучше всего подходят, когда ваши протоколы допускают повторное использование опорной плиты или компонентов.
Совместимость с типпипетками
Наконечники Flex предназначены для пипеток Opentrons Flex. Наконечники Flex не имеют обратной совместимости с пипетками Opentrons OT-2, и вы не можете использовать наконечники OT-2 с пипетками Flex.
Другие наконечники, соответствующие отраслевым стандартам, могут работать с пипетками Flex, но это не рекомендуется. Для обеспечения оптимальной производительности следует использовать только наконечники Opentrons Flex с пипетками Flex.
Адаптер для стойки наконечника
Для 96-канальной пипетки требуется адаптер для правильного крепления полной стойки с наконечниками. Во время процедуры крепления пипетка перемещается по адаптеру, опускается на монтажные штифты и натягивает наконечники на пипетки, поднимая адаптер и стойку для наконечников.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
89
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Примечание. Используйте адаптер стойки для наконечников только в том случае, если одновременно берете полную стойку с наконечниками. Если вы собираете меньше наконечников, поместите подставки для наконечников прямо на палубу.
Предупреждение: опасность защемления. Держите руки подальше от адаптера стойки для наконечников, пока на пипетке прикрепляются наконечники.
Тип адаптера Адаптер для стойки наконечника Opentrons Flex 96
Имя загрузки API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Адаптер стойки для наконечников совместим с гибким захватом Opentrons. Вы можете использовать захват для установки штативов со свежими наконечниками на адаптер или для захвата и перемещения использованных штативов с наконечниками в мусоропровод.
5.5 Пробирки и штативы для пробирок
Система Opentrons 4-в-1 Tube Rack по умолчанию работает с Opentrons Flex. Использование штатива для пробирок 4-в-1 помогает снизить нагрузку на подготовительную работу, поскольку предоставляемые им комбинации готовы к автоматизации прямо из коробки. Дополнительную информацию также можно найти в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons.
90
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Комбинации пробирок и штативов
Стойка для пробирок Opentrons 4-в-1 поддерживает пробирки самых разных размеров, по отдельности или в комбинациях разных размеров (объемов). К ним относятся: Штатив на 6 пробирок для пробирок емкостью 50 мл (6 x 50 мл). Комбинированный штатив на 10 пробирок для четырех пробирок по 50 мл и шести пробирок по 15 мл (4 x 50 мл, 6 x 15 мл). Штатив на 15 пробирок для пробирок объемом 15 мл (15 x 15 мл). Штатив на 24 пробирки для пробирок объемом 0.5 мл, 1.5 мл или 2 мл (24 x 0.5 мл, 1.5 мл, 2 мл).
Примечание. Все пробирки имеют цилиндрическую форму с V-образным (коническим) дном, если не указано иное.
штативы на 6 пробирок
Тип пробирки 6 Falcon 50 мл 6 NEST 50 мл
штативы на 10 пробирок
Тип пробирки 4 Falcon 50 мл 6 Falcon 15 мл 4 NEST 50 мл 6 NEST 15 мл
Имя загрузки API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
91
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
штативы на 15 пробирок
Тип пробирки 15 Falcon 15 мл 15 NEST 15 мл
Имя загрузки API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
штативы на 24 пробирок
Тип трубы
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 мл 24 Eppendorf Safe-Lock 2 мл, U-образное дно 24 Обычная завинчивающаяся крышка 2 мл 24 Завинчивающаяся крышка NEST 0.5 мл 24 Завинчивающаяся крышка NEST 1.5 мл 24 Защелкивающаяся крышка NEST 1.5 мл 24 Завинчивающаяся крышка NEST 2 мл 24 NEST защелкивающаяся крышка, 2 мл, U-образное дно
Имя загрузки API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Определения API штатива для пробирок
Библиотека лабораторного оборудования Opentrons определяет характеристики штативов для пробирок, перечисленных выше, в отдельном формате JSON. fileс. Робот Flex и API Python Opentrons используют эти определения JSON для работы с лабораторным оборудованием, используемым вашими протоколами. Для бывшегоampНапример, при работе с API функция ProtocolContext.load_labware принимает эти имена лабораторного оборудования в качестве допустимых параметров в вашем коде. Связанные имена загрузки API связаны с определениями лабораторного оборудования штатива для пробирок в репозитории Opentrons GitHub.
92
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Лабораторное оборудование для штатива для пробирок на заказ
Попробуйте создать собственное определение лабораторного оборудования с помощью Opentrons Labware Creator, если комбинация пробирки и штатива, которую вы хотели бы использовать, здесь не указана. Пользовательское определение объединяет все размеры, метаданные, формы, объемную емкость и другую информацию в формате JSON. file. Opentrons Flex считывает эту информацию, чтобы понять, как работать с вашим индивидуальным лабораторным оборудованием. Дополнительную информацию см. в разделе «Определения пользовательского лабораторного оборудования».
5.6 Алюминиевые блоки
Алюминиевые блоки поставляются с температурным модулем GEN2 и могут быть приобретены отдельно в виде набора из трех частей. В комплект входят планшет с плоским дном, блок на 24 лунки и блок на 96 лунок.
В Opentrons Flex используются алюминиевые блоки для удержанияampРазмещайте пробирки и планшеты с лунками на температурном модуле или непосредственно на платформе. При использовании с температурным модулем алюминиевые блоки сохранят вашу температуру.ampИспользуйте пробирки, ПЦР-стрипы или планшеты при постоянной температуре от 4 °C до 95 °C.
Плоская нижняя пластина
Планшет с плоским дном для Flex поставляется с контейнером температурного модуля и совместим с различными планшетами со стандартными лунками ANSI/SLAS. Эта плоская пластина отличается от пластины, поставляемой с самим температурным модулем или отдельным комплектом из трех частей. Он имеет более широкую рабочую поверхность и скошенные угловые зажимы. Эти функции помогают улучшить производительность захвата Opentrons Flex Gripper при перемещении лабораторного оборудования на пластину или снятии с нее.
Вы можете определить, какая у вас плоская нижняя пластина, потому что на верхней поверхности пластины Flex имеется надпись «Opentrons Flex». У ОТ-2 нет.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
93
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
24-луночный алюминиевый блок
Блок на 24 лунки используется с отдельнымиampле флаконы. Для бывшегоample, он принимает sampфлаконы, которые:
Низ имеют V-образную или U-образную форму. Закрепите содержимое защелкивающейся крышкой или завинчивающейся крышкой. Храните жидкость в емкостях емкостью 0.5 мл, 1.5 мл и 2 мл.
96-луночный алюминиевый блок
Блок на 96 лунок поддерживает широкий спектр типов луночных планшетов. Для бывшегоample, он принимает луночные планшеты, которые:
От крупных производителей луночных планшетов, таких как Bio-Rad и NEST.
Модель с V-образным дном, U-образным дном или плоским дном.
Разработан с лунками емкостью 100 мкл или 200 мкл.
Он также совместим с обычными ПЦР-стрипами.
Автономные адаптеры
Термоблок Гибкая пластина с плоским дном Алюминиевый блок с 24 лунками Алюминиевый блок с 96 лунками
Имя загрузки API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate См. комбинации лабораторного оборудования ниже. opentrons_96_well_aluminum_block
Комбинации лабораторной посуды из алюминиевых блоков
Библиотека лабораторного оборудования Opentrons поддерживает следующие комбинации блоков, флаконов и луночных планшетов, которые также определены в отдельном определении лабораторного оборудования JSON. fileс. Робот Flex и API Opentrons Python
94
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
используйте эти определения JSON для работы с лабораторным оборудованием, используемым вашими протоколами. Для бывшегоampНапример, при работе с API функция ProtocolContext.load_labware принимает эти имена лабораторного оборудования в качестве допустимых параметров в вашем коде. В таблицах ниже перечислены комбинации блоков/контейнеров по умолчанию и соответствующие имена загрузки API. Ссылки ведут к соответствующим определениям JSON в репозитории Opentrons GitHub.
Примечание. Все пробирки имеют дно V-образной формы, если не указано иное.
Комбинации лабораторного оборудования с 24-луночными алюминиевыми блоками
Содержимое блока на 24 лунки Обычная завинчивающаяся крышка емкостью 2 мл NEST Завинчивающаяся крышка 0.5 мл NEST Завинчивающаяся крышка 1.5 мл NEST Защелкивающаяся крышка 1.5 мл NEST Завинчивающаяся крышка 2 мл NEST Защелкивающаяся крышка 2 мл, U-образное дно
Имя загрузки API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_screwcap_24_aluminumblock_n est_2ml_snapcap
Комбинации лабораторного оборудования с 96-луночными алюминиевыми блоками
Содержимое 96-луночного блока Планшет с лунками Bio-Rad 200 мкл Стандартный ПЦР-стрип 200 мкл Планшет с лунками NEST 100 мкл
Имя нагрузки API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
95
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
5.7 Лабораторное оборудование и гибкий захват Opentrons
Хотя Opentrons Flex работает со всем инвентарем в библиотеке лабораторного оборудования, захват Opentrons Flex совместим только с определенными предметами лабораторного оборудования. В настоящее время Gripper оптимизирован для использования со следующим лабораторным оборудованием.
Категория лабораторного оборудования Планшеты с глубокими лунками 96-луночные планшеты с полной юбкой
Стойки для наконечников (нефильтрованные и фильтрованные наконечники)
Бренды
Планшет с глубокими лунками NEST 96, 2 мл
96-луночный планшет Opentrons Tough 200 мкл ПЦР с полной юбкой NEST 96-луночный планшет 200 мкл плоский
Штатив для наконечников Opentrons Flex 96, 50 мкл Штатив для наконечников Opentrons Flex 96, 200 мкл Штатив для наконечников Opentrons Flex 96, 1000 мкл
Примечание. Для достижения наилучших результатов используйте Flex Gripper только с перечисленным выше лабораторным оборудованием. Flex Gripper может работать с другим лабораторным оборудованием, совместимым с системами автоматизации ANSI/SLAS, но это не рекомендуется.
5.8 Пользовательские определения лабораторного оборудования
Как обсуждалось в начале этой главы, специальное лабораторное оборудование — это лабораторное оборудование, которого нет в библиотеке лабораторного оборудования Opentrons. Вы можете использовать с Flex другие распространенные или уникальные предметы лабораторного оборудования, точно измеряя и записывая характеристики этого объекта и сохраняя эти данные в формате JSON. file. При импорте в приложение Flex и API используют эти данные JSON для взаимодействия с вашим лабораторным оборудованием. Opentrons предоставляет инструменты и услуги, которые мы рассмотрим ниже, которые помогут вам использовать Flex со специальным лабораторным оборудованием.
96
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Создание пользовательских определений лабораторного оборудования
Инструменты и услуги Opentrons помогают сделать индивидуальное лабораторное оборудование доступным для вас. Эти функции соответствуют различным уровням навыков и способам работы. Создание собственного лабораторного оборудования и использование его с Opentrons Flex поможет сделать робота универсальным и мощным дополнением к вашей лаборатории.
СОЗДАТЕЛЬ ИНДИВИДУАЛЬНОГО ЛАБОРАТОРНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ
Custom Labware Creator — это программа без кода, web- инструмент, использующий графический интерфейс, который поможет вам создать определение лабораторного оборудования. file. Labware Creator создает определение лабораторного оборудования в формате JSON. file которые вы импортируете в приложение Opentrons. После этого ваше специальное лабораторное оборудование станет доступно роботу Flex и API Python.
СЕРВИС ИНДИВИДУАЛЬНОГО ЛАБОРАТОРНОГО ОБЕСПЕЧЕНИЯ
Свяжитесь с нами, если лабораторное оборудование, которое вы хотели бы использовать, недоступно в библиотеке, если вы не можете создать свои собственные определения или если индивидуальный элемент включает в себя разные формы, размеры или другие нарушения, описанные ниже.
Лабораторное оборудование, которое вы можете определить в Labware Creator
; Лунки и трубки однородны и идентичны. ; Все ряды расположены равномерно
(пространство между строками одинаковое).
; Все столбцы расположены равномерно (пространство между столбцами одинаковое).
; Идеально помещается в один слот деки.
Лабораторное оборудование Opentrons должно определить; Формы лунок и трубок различаются. ; Ряды расположены неравномерно.
; Столбцы расположены неравномерно.
; Меньше одного слота деки (требуется адаптер) или охватывает несколько слотов деки.
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
97
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
Вот несколько диаграмм, которые помогут вам визуализировать бывшегоampле описанные выше. Обычный Все столбцы расположены на одинаковом расстоянии друг от друга, а все строки — на одинаковом расстоянии. Столбцы не обязательно должны иметь тот же интервал, что и строки.
Обычный Решетка не обязательно должна находиться в центре лабораторного оборудования.
Нерегулярные строки расположены на равном расстоянии друг от друга, но столбцы расположены неравномерно.
Нерегулярные Столбцы/строки расположены на одинаковом расстоянии друг от друга, но ячейки не идентичны.
Нерегулярная Существует более одной сетки.
Наша команда по лабораторному оборудованию постарается понять ваши потребности и разработать для вас индивидуальные определения лабораторного оборудования. Дополнительную информацию см. в статьях службы поддержки «Запрос на определение индивидуального лабораторного оборудования» и «Форма запроса на индивидуальное лабораторное оборудование». Это платная услуга.
98
ОПЕНТРОНС ФЛЕКС
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ
ПИТОН API
Хотя вы не можете создавать собственное лабораторное оборудование с помощью нашего API, вы можете использовать собственное лабораторное оборудование с помощью доступных методов API. Однако сначала вам необходимо определить собственное лабораторное оборудование и импортировать его в приложение Opentrons. После того как вы добавили свое лабораторное оборудование в приложение Opentrons, оно становится доступным для API Python и робота. Дополнительную информацию см. в разделе «Определения пользовательского лабораторного оборудования» документации API Python. Информацию о написании сценариев протоколов с помощью API см. в разделе API протокола Python в главе «Разработка протоколов».
Схема лабораторного оборудования JSON
JSON file — это образец стандартного и специального лабораторного оборудования Opentron. Этот file содержит и систематизирует данные о лабораторном оборудовании в соответствии со спецификациями проекта, установленными схемой по умолчанию.
Схема — это рамка
Документы/Ресурсы
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Робот для обработки жидкостей с открытым исходным кодом [pdf] Руководство по эксплуатации FLEX Opentrons Flex Робот для обработки жидкостей с открытым исходным кодом, FLEX, Opentrons Flex Робот для работы с жидкостью с открытым исходным кодом, Flex Робот для работы с жидкостью с открытым исходным кодом, Робот для обработки жидкости с открытым исходным кодом, Робот для обработки жидкости Source, Робот для обработки жидкости, Робот для обработки жидкости, Робот |