FLEX Opentrons Flex Open Source vloeistofbehandelingsrobot
“
Opentron Flex
Specificaties:
- Algemene specificaties: Lorem ipsum pijn sit
amet, consectetur adipiscing elit. Het kan gebeuren dat er een incident is
ut labore et dolore magna aliqua. - Omgevingsspecificaties: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Doe het eiusmod tempor
incidenten zijn arbeidsintensief en dolore magna aliqua. - Certificeringen: Lorem ipsum pijn sit amet,
consectetur adipiscing elit. Doe dit tijdens het incident
labore en dolore magna aliqua. - Serienummer: XXX-XXXX-XXXX
Instructies voor productgebruik:
1. Instrumentinstallatie en kalibratie:
Volg de stappen in de handleiding voor pipet en grijper
installatie.
2. Verhuizing:
Voor korte bewegingen zie paragraaf 2.5 in de handleiding. Voor
bij verplaatsingen over lange afstanden dient u de gegeven richtlijnen te volgen. Algemene verhuizing
advies is ook mogelijk.
3. Verbindingen:
Zorg voor een goede stroomaansluiting, zoals beschreven in de handleiding.
Sluit indien nodig USB-apparaten en externe apparaten aan. Netwerk connecties
moet worden ingesteld volgens de instructies.
4. Protocolontwerper:
Begrijp de vereisten voor Protocol Designer en leer hoe
om nieuwe protocollen te ontwerpen of bestaande aan te passen volgens uw laboratorium
vereisten.
5. Python-protocol-API:
Ontdek het schrijven en uitvoeren van scripts met behulp van de Python Protocol API.
Ontdek exclusieve Python-functies voor verbeterde functionaliteit.
6. OT-2-protocollen:
Leer meer over OT-2 Python-protocollen, OT-2 JSON-protocollen en
Magnetische moduleprotocollen voor verschillende soorten experimenten.
Veelgestelde vragen (FAQ):
Vraag: Hoe kan ik problemen oplossen als de robot niet beweegt?
verwacht?
A: Controleer de stroomaansluiting en zorg voor een juiste kalibratie
instrumenten en controleer of er zich geen obstakels in de
robotpad.
Vraag: Kan ik aangepaste pipetten gebruiken met Opentrons Flex?
A: Opentrons raadt aan compatibele pipetten te gebruiken voor optimale resultaten
prestaties en nauwkeurigheid.
“`
Opentron Flex
Gebruiksaanwijzing
Opentrons Labworks Inc.
December 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Geregistreerde namen, handelsmerken enz. die in dit document worden gebruikt, zelfs als ze niet specifiek als zodanig zijn gemarkeerd, mogen niet als onbeschermd door de wet worden beschouwd.
Inhoudsopgave
Voorwoord . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Structuur van deze handleiding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Opmerkingen en waarschuwingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Hoofdstuk 1 Introductie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Welkom bij Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Wat is er nieuw in Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flexwerkplekken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Veiligheidsinformatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Veiligheidssymbolen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elektrische veiligheidswaarschuwingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Aanvullende veiligheidswaarschuwingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Veiligheidsmaatregelen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologische veiligheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Giftige dampen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Ontvlambare vloeistoffen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Naleving van regelgeving . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Veiligheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetische compatibiliteit . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC-waarschuwingen en opmerkingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 ISED-naleving in Canada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Milieuwaarschuwing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi-precertificering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Hoofdstuk 2: Installatie en verplaatsing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Veiligheids- en operationele eisen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Waar Opentrons Flex plaatsen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Stroomverbruik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Omgevingsomstandigheden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Uitpakken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Inspanning en tijd vereist . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Krat- en verpakkingsmateriaal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Productelementen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Deel 1: Verwijder de krat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Deel 2: Laat de Flex los. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Deel 3: Eindmontage en inschakelen . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Eerste run. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Inschakelen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Verbinding maken met een netwerk of computer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Software-updates installeren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Noodstophanger bevestigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Geef je robot een naam. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instrumentinstallatie en kalibratie. . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipetinstallatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Grijperinstallatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Verhuizing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Korte zetten. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Bewegingen over lange afstanden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Algemeen verhuisadvies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Laatste gedachten over verhuizen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Hoofdstuk 3: Systeembeschrijving. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fysieke componenten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Frame en behuizing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Dek en werkgebied . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staggebied. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Dekbevestigingen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Afvalgoot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagslots in het gebied. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Bewegingssysteem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Touchscreen en LED-displays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipetten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipetspecificaties. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipetkalibratie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipettiprekadapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Gedeeltelijke tipopname . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetsensoren. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetfirmware-updates . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Grijper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Grijperspecificaties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Grijperkalibratie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Firmware-updates van de grijper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Noodstophanger . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Wanneer moet u de noodstop gebruiken? . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 De noodstop in- en uitschakelen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Verbindingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Stroomaansluiting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB- en extra aansluitingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Netwerkverbindingen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Systeemspecificaties. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Algemene specificaties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Omgevingsspecificaties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certificeringen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serienummer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Hoofdstuk 4: Modules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Ondersteunde modules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modulecaddy-systeem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Modulekalibratie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Wanneer modules kalibreren. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Modules kalibreren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Verwarmings-schuddermodule GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker-functies. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specificaties verwarming-schudder . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetisch blok GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetische blokfuncties. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specificaties magnetische blokken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperatuurmodule GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Kenmerken temperatuurmodule . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specificaties temperatuurmodule . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Thermocycler-module GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Kenmerken van de thermocycler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specificaties thermocycler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Hoofdstuk 5: Laboratoriumbenodigdheden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Laboratoriumbenodigdhedenconcepten. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratoriumbenodigdheden als hardware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratoriumbenodigdheden als gegevens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratoriumbenodigdheden op maat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Reservoirs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoirs met één put . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoirs met meerdere putten. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoirs en API-definities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Laboratoriumbenodigdheden voor aangepaste reservoirs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Wellplaten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
Platen met 6 putjes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 platen met 12 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 platen met 24 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 platen met 48 putjes. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 platen met 96 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 platen met 384 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Wellplaatadapters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Wellplaten en API-definities. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Laboratoriumbenodigdheden voor putplaten op maat. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Tips en tiprekken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tiprekken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Compatibiliteit met tippipetten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Tiprekadapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Buizen en buizenrekken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Buis- en rekcombinaties . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rekken met 6 buizen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rekken voor 10 buizen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rekken met 15 buizen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Rekken voor 24 buizen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 API-definities voor buizenrek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Laboratoriumbenodigdheden op maat voor buizenrek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminium blokken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Platte bodemplaat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Aluminium blok met 24 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Aluminium blok met 96 putjes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Standalone-adapters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Combinaties van laboratoriumbenodigdheden met aluminium blokken . . . . . . . . . . . . . . . .94 Laboratoriumbenodigdhedencombinaties met 24 wells aluminium blokken . . . . . . . . .95 Laboratoriumbenodigdhedencombinaties met 96 wells aluminium blokken . . . . . . . . .95 5.7 Laboratoriumbenodigdheden en de Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Aangepaste labware-definities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Aangepaste labware-definities maken . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON labware-schema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON-labware-definities . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Hoofdstuk 6: Protocolontwikkeling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Vooraf gemaakte protocollen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protocolbibliotheek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Dienst voor ontwikkeling van aangepaste protocollen . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protocolontwerper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Vereisten voor protocolontwerpers . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Een protocol ontwerpen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Bestaande protocollen wijzigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python-protocol-API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Scripts schrijven en uitvoeren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Exclusieve functies voor Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2-protocollen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python-protocollen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON-protocollen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetische moduleprotocollen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Hoofdstuk 7: Software en bediening. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Bediening touchscreen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Robotdashboard . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protocolbeheer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protocoldetails . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Configuratie uitvoeren . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Laboratoriumbenodigdheden Positiecontrole . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Voortgang uitvoeren. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Voltooiing van de run . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Instrumentbeheer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Robotinstellingen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Dekconfiguratie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons-app. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 App-installatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Protocollen overbrengen naar Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Modulestatus en bedieningselementen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Recente protocoluitvoeringen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Geavanceerde bediening . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter-notitieboekje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Commandoregelbediening via SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Hoofdstuk 8: Onderhoud en service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Uw Flex reinigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Voordat u begint . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Wat u kunt schoonmaken . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Reinigingsoplossingen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Frame- en raampanelen reinigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Dekreiniging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Portaal schoonmaken. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Afvalgoot reinigen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Pipetten en tips reinigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pipetontsmetting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Pipettips reinigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Grijper reinigen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Reinigingsmodules. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Algemene modulereiniging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler-afdichtingen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Autoclaafveilig laboratoriumgerei . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Onderhoud Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons-diensten . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Installatiekwalificatie en bedieningskwalificatie . . . 155 Preventief onderhoud . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garantie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Bijlage A: Woordenlijst . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Bijlage B: Aanvullende documentatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Kennishub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API-documentatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API-referentie. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Documentatie voor ontwikkelaars . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Bijlage C: Open source-software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons op GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Andere opslagplaatsen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Bijlage D: Ondersteuning en contactinformatie . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Omzet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Ondersteuning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Bedrijfsinformatie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Voorwoord
Welkom bij de handleiding voor de Opentrons Flex vloeistofbehandelingsrobot. Deze handleiding begeleidt u bij vrijwel alles wat u moet weten om Flex in te stellen en te gebruiken, waarbij de nadruk ligt op onderwerpen die het meest relevant zijn voor dagelijkse gebruikers van Flex in een laboratoriumomgeving.
Structuur van deze handleiding
Opentrons Flex is een complex systeem, dus er zijn veel verschillende manieren om alles te leren wat het kan. Ga gerust meteen naar het hoofdstuk waarin het onderwerp wordt behandeld waar je nieuwsgierig naar bent! BijvoorbeeldampAls u al een Flex in uw laboratorium heeft geïnstalleerd, kunt u het hoofdstuk Installatie en verplaatsing overslaan.
Als u de voorkeur geeft aan een begeleide aanpak, is deze handleiding zo opgebouwd dat u deze van begin tot eind kunt volgen.
Leer meer over Flex. De onderscheidende kenmerken van Flex worden opgesomd in Hoofdstuk 1: Inleiding. De inleiding bevat ook belangrijke informatie over veiligheid en regelgeving.
Ga aan de slag met Flex. Als u uw Flex moet instellen, volgt u de gedetailleerde instructies in Hoofdstuk 2: Installatie en verhuizing. Maak uzelf dan vertrouwd met de componenten van Flex in Hoofdstuk 3: Systeembeschrijving.
Zet je deck op. Door het deck te configureren, zijn verschillende wetenschappelijke toepassingen op Flex mogelijk. Hoofdstuk 4: Modules beschrijft Opentrons-randapparatuur die u in of bovenop het deck kunt installeren om specifieke wetenschappelijke taken uit te voeren. Hoofdstuk 5: Laboratoriumbenodigdheden legt uit hoe u kunt werken met apparatuur voor het vasthouden van vloeistoffen.
Voer een protocol uit. Het kerngebruik van Flex is het uitvoeren van gestandaardiseerde wetenschappelijke procedures, ook wel protocollen genoemd. Hoofdstuk 6: Protocolontwikkeling biedt verschillende manieren om kant-en-klare protocollen te krijgen of deze zelf te ontwerpen. Om uw protocol uit te voeren, volgt u de instructies in Hoofdstuk 7: Software en bediening, waarin ook instructies staan voor het uitvoeren van andere taken en het aanpassen van de instellingen van uw robot.
Houd Flex actief. Volg het advies in Hoofdstuk 8: Onderhoud en service om uw Flex schoon en optimaal te laten werken. Of meld u aan voor een van de daar genoemde Opentrons-diensten en laat Flex voor u regelen.
Leer nog meer. Toch nog iets anders nodig? Raadpleeg de bijlagen. Bijlage A: Woordenlijst definieert Flex-gerelateerde termen. Bijlage B: Aanvullende documentatie verwijst u naar nog meer bronnen voor Opentrons-producten en het schrijven van code om Flex te besturen.
OPENTRONS FLEX
9
VOORWOORD
Bijlage C: Open-Source Software legt uit hoe Opentrons-software wordt gehost op GitHub als een bron voor zowel ontwikkelaars als niet-ontwikkelaars.
Bijlage D: Ondersteunings- en contactinformatie geeft aan hoe u contact kunt opnemen met Opentrons als u hulp nodig heeft die verder gaat dan wat onze documentatie biedt.
Opmerkingen en waarschuwingen
In deze handleiding vindt u speciaal opgemaakte notitie- en waarschuwingsblokken. Opmerkingen bieden nuttige informatie die misschien niet voor de hand ligt bij het normale gebruik van Flex. Besteed speciale aandacht aan waarschuwingen; deze worden alleen gebruikt in situaties waarin u het risico loopt op persoonlijk letsel, schade aan apparatuur, verlies of bederf van apparatuur.ampbestanden of reagentia, gegevensverlies of andere schade. Opmerkingen en waarschuwingen zien er als volgt uit:
SampLet op: Dit is iets dat u moet weten, maar het vormt geen enkel gevaar.
Sample Waarschuwing: Dit is iets dat u moet weten omdat er risico's aan verbonden zijn.
10
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1
Invoering
In dit hoofdstuk maakt u kennis met het Opentrons Flex-ecosysteem, inclusief het algehele systeemontwerp en de beschikbare werkstationconfiguraties. Het bevat ook belangrijke nalevings- en veiligheidsinformatie, die u dient te raadplegenview voordat u uw Opentrons Flex-robot instelt. Voor meer details over de kenmerken van Opentrons Flex, zie het hoofdstuk Systeembeschrijving.
1.1 Welkom bij Opentrons Flex
Opentrons Flex is een vloeistofverwerkingsrobot die is ontworpen voor hoge doorvoer en complexe workflows. De Flex-robot is de basis van een modulair systeem dat bestaat uit pipetten, een labware-grijper, dekbevestigingen, modules op het dek en labware – die u allemaal zelf kunt verwisselen. Flex is ontworpen met een touchscreen, zodat u er rechtstreeks op de laboratoriumtafel mee kunt werken, of u kunt het vanuit uw hele laboratorium bedienen met de Opentrons-app of onze open-source API's.
Flexwerkstations worden geleverd met alle apparatuur (robot, hardware en labware) die u nodig heeft om aan de slag te gaan met het automatiseren van algemene laboratoriumtaken. Voor andere toepassingen draait Opentrons Flex op volledig open-source software en firmware, en is reagens- en laboratoriumware-agnostisch, waardoor u controle krijgt over hoe u uw protocollen ontwerpt en uitvoert.
Wat is er nieuw in Flex
Opentrons Flex maakt deel uit van de Opentrons vloeistofhandlerserie robots. Gebruikers van Opentrons Flex zijn wellicht bekend met de Opentrons OT-2, onze persoonlijke pipetteerrobot. Flex gaat op een aantal belangrijke gebieden verder dan de mogelijkheden van OT-2 en levert een hogere doorvoer en looptijd op.
Functie Pipetdoorvoer
Pipet- en tipcapaciteiten
Beschrijving
Flexpipetten hebben 1, 8 of 96 kanalen. De 96-kanaalspipet werkt op 12 keer zoveel putten tegelijk als de grootste OT-2-pipet.
Flex-pipetten hebben een groter volumebereik (1 µL, 50 µL) en kunnen allemaal werken met elk volume Opentrons Flex-tips. Dit is een verbetering ten opzichte van OT-5-pipetten, die een kleiner bereik hebben en tips met een passend volumebereik moeten gebruiken.
OPENTRONS FLEX
11
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Grijper Automatische kalibratie Touchscreen Modulecaddies Deksleufcoördinaten Verplaatsbaar afval Grootte en gewicht
De Opentrons Flex Gripper pakt laboratoriummateriaal automatisch op en verplaatst het over het dek, zonder tussenkomst van de gebruiker. De grijper maakt complexere workflows mogelijk binnen één enkele protocolrun.
Positionele kalibratie van Flex-pipetten en de grijper is volledig geautomatiseerd. Druk op één knop en het instrument beweegt naar nauwkeurig bewerkte punten op het dek om de exacte positie te bepalen, en slaat die gegevens op voor gebruik in uw protocollen.
Flex heeft een eigen touchscreen-interface waarmee je hem direct kunt bedienen, naast het gebruik van de Opentrons-app. Gebruik het touchscreen om programmaruns te starten, de taakstatus te controleren en instellingen rechtstreeks op de robot te wijzigen.
Flexmodules passen in caddies die ruimte onder het dek innemen. Caddies plaatsen uw laboratoriumbenodigdheden dichter bij het dekoppervlak en maken kabelgeleiding onder het dek mogelijk. Caddies maken nog meer module- en labware-configuraties op het dek mogelijk.
Dekgleuven op Flex zijn genummerd met een coördinatensysteem (A1D4) dat vergelijkbaar is met de nummering van putten op laboratoriummateriaal.
De prullenbak kan op meerdere decklocaties op Flex worden geplaatst. De standaardlocatie (sleuf A3) is de aanbevolen positie. Je kunt de grijper ook gebruiken om afval in de optionele afvalgoot te gooien.
Flex is iets groter en veel zwaarder dan OT-2. Voor installatietaken op Flex is de hulp van een laboratoriumpartner vereist.
Een gedetailleerde vergelijking van de technische specificaties van de robot is beschikbaar op de Opentrons webplaats.
Zowel Flex- als OT-2-robots draaien op onze open-source software, en de Opentrons-app kan beide soorten robots tegelijk besturen. Hoewel OT-2-protocollen niet rechtstreeks op Flex kunnen worden uitgevoerd, is het eenvoudig om ze aan te passen (zie de sectie OT-2-protocollen in het hoofdstuk Protocolontwikkeling voor details).
Flexwerkplekken
Opentrons Flex-werkstations omvatten de Flex-robot, accessoires, pipetten en grijpers, modules op het dek en laboratoriummateriaal dat nodig is om een bepaalde toepassing te automatiseren. Alle werkplekcomponenten zijn modulair. Als u van applicatie moet wisselen, kunt u andere Flex-hardware en compatibele verbruiksartikelen toevoegen of omruilen.
12
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
NGS-WERKSTATION
Het Opentrons Flex NGS-werkstation automatiseert de voorbereiding van de NGS-bibliotheek. Het kan pre-sequencing-workflows automatiseren met behulp van elk toonaangevend reagenssysteem, inclusief fragmentatie- en tagop mentatie gebaseerde bibliotheekvoorbereiding.
Naast de Flex-robot omvat het NGS Werkstation:
Grijper Keuze uit pipetconfiguratie
Twee 8-kanaalspipetten (1 µL en 50 µL) 5-kanaalspipet (1000 µL) Afvalgoot Magnetisch blok Temperatuurmodule Thermocycler-module Laboratoriumset met filtertips, microcentrifugebuisjes, reservoirs en PCR-platen
PCR-WERKSTATION
Het Opentrons Flex PCR-werkstation automatiseert de PCR-installatie en thermocycling-workflows gedurende maximaal 96 secondenamples. Het kan gekoelde reagentia en s aliquoterenampin een PCR-plaat met 96 putjes. Met de toevoeging van de geautomatiseerde Thermocycler-module gebruikt u de grijper om de plaat in de Thermocycler te laden en voert u vervolgens het door u gekozen PCR-programma uit.
Naast de Flex-robot omvat het PCR-werkstation:
Grijper Keuze uit pipetconfiguratie
1-kanaalspipet (1 µL) en 50-kanaalspipet (8 µL) 1-kanaalspipet (50 µL) Afvalgoot-temperatuurmodule Laboratoriumset met filtertips, microcentrifugebuisjes, reservoirs en PCR-platen
OPENTRONS FLEX
13
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
NUCLEENZUUREXTRACTIE WERKSTATION
Het Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation automatiseert DNA/RNA-isolatie en -zuivering. Het maakt gebruik van het magnetische blok voor het scheiden van magnetische kralen, en de Heater-Shaker voor sample lyse en resuspensie van magnetische kralen.
Naast de Flex-robot omvat het Nucleic Acid Extraction Workstation:
Grijper Keuze uit pipetconfiguratie
1-kanaalspipet (5 µL) en 1000-kanaalspipet (8 µL) 5-kanaalspipet (1000 µL) Afvalgoot Magnetische blokverwarmer-schudmodule Laboratoriumkit met filtertips, reservoirs, PCR-platen en deepwell-platen
MAGNETISCHE KRALEN EIWITZUIVERINGSWERKSTATION
Het Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatiseert kleinschalige eiwitzuivering en proteomicsample prep voor maximaal 96 samples. Het is compatibel met veel populaire reagentia op basis van magnetische kralen.
Naast de Flex-robot omvat het Protein Purification Workstation:
Grijper Keuze uit pipetconfiguratie
1-kanaalspipet (5 µL) en 1000-kanaalspipet (8 µL) 5-kanaalspipet (1000 µL) Afvalgoot Magnetische blokverwarmer-schudmodule Laboratoriumkit met filtertips, reservoirs, PCR-platen en deepwell-platen
FLEX PREP-WERKSTATION
Het Opentrons Flex Prep Workstation automatiseert eenvoudige pipetteerworkflows. Configureer het werkstation met 1-kanaals- en 8-kanaalspipetten om taken uit te voeren zoalsample overdracht, sampduplicatie, en
14
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
aliquotering van reagentia. Configureer het werkstation met de 96-kanaalspipet voor het aliquoteren van reagentia met hoge doorvoer en plaatbewerkingampind.
Naast de Flex-robot omvat het Flex Prep Workstation:
Keuze uit pipetconfiguratie: 1-kanaalspipet (5 µL) en 1000-kanaalspipet (8 µL) 5-kanaalspipet (1000 µL)
Laboratoriumset met filtertips, microcentrifugebuisjes en reservoirs
PLASMID PREP-WERKSTATION
Het Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatiseert op magnetische kralen gebaseerde plasmide-extractie- en zuiveringsworkflows. Dit werkstation is uitgerust met pipetten met een hoog volume, een Heater-Shaker-module en een magnetisch blok voor de meeste op kralen gebaseerde chemie.
Naast de Flex-robot omvat het Plasmid Prep Workstation:
Grijper 1-kanaalspipet (5 µL) en 1000-kanaalspipet (8 µL) Afvalgoot Magnetische blokverwarmer-schudmodule Laboratoriumset met filtertips, microcentrifugebuisjes, reservoirs, PCR-platen en deepwell-platen
SYNBIO-WERKSTATION
Het Opentrons Flex SynBio Workstation automatiseert een verscheidenheid aan synthetische biologie-workflows, zoals DNA-synthese en klonen. Het maakt gebruik van het magnetische blok en de temperatuurmodule om de meeste op kralen gebaseerde chemie te ondersteunen. Voeg de Thermocycler-module toe om incubaties met verwarmde deksels uit te voeren amplificaties.
Naast de Flex-robot omvat het SynBio Werkstation:
Grijper 1-kanaalspipet (5 µL) en 1000-kanaalspipet (8 µL) Magnetische bloktemperatuurmodule
OPENTRONS FLEX
15
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Laboratoriumbenodigdhedenset met standaard- en filtertips, microcentrifugebuisjes, reservoirs, PCR-platen en deepwell-platen
1.2 Veiligheidsinformatie
De Opentrons Flex vloeistofbehandelingsrobot is ontworpen voor een veilige werking. Raadpleeg de specificaties en nalevingsrichtlijnen in dit gedeelte om een veilig gebruik van uw Flex te garanderen. Deze richtlijnen hebben betrekking op het veilige gebruik van invoer- en uitvoerverbindingen voor het product, inclusief de stroom- en gegevensverbindingen, evenals waarschuwingslabels die te vinden zijn op de Flex-robot en gerelateerde hardware. Als u het apparaat op een andere manier gebruikt dan aangegeven in deze handleiding, kan dit de gebruiker en de apparatuur in gevaar brengen.
Veiligheidssymbolen
Verschillende labels op de Flex en in deze handleiding waarschuwen u voor bronnen van mogelijk letsel of schade.
Symbool
Beschrijving
Waarschuwing: Waarschuwt gebruikers voor potentieel gevaarlijke omstandigheden. Handelingen die kunnen leiden tot persoonlijk letsel of de dood.
Let op: Waarschuwt gebruikers tegen schade aan de apparatuur. Verloren of beschadigde gegevens. Onherstelbare onderbreking van de uitgevoerde bewerking.
Elektrische schok: Identificeert instrumentonderdelen die een risico op een elektrische schok kunnen vormen als het instrument onjuist wordt gehanteerd.
Heet oppervlak: Identificeert instrumentonderdelen die een risico op persoonlijk letsel vormen als gevolg van hoge hitte/temperaturen als het instrument onjuist wordt gehanteerd.
Knelpunt: Identificeert instrumentonderdelen die tijdens beweging een risico op persoonlijk letsel kunnen vormen.
16
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Op de Flex vindt u de volgende labels:
Labels voor intellectueel eigendom Etiketten voor naleving van de regelgeving (bijv. ETL) Etiketten voor elektrische gevaren Algemene waarschuwingslabels Productlabels Knijppuntlabels Hoog volumetage-labels Vermogenslabels
Elektrische veiligheidswaarschuwingen
Neem altijd de volgende elektrische veiligheidswaarschuwingen in acht:
Symbool
Beschrijving
Sluit de robot aan op een geaard circuit van klasse 1. Zie het gedeelte Stroomaansluiting in het hoofdstuk Systeembeschrijving.
Sluit geen voedingskabels aan (aansluiten, loskoppelen) en gebruik geen wisselstroomkabels als: De kabel gerafeld of beschadigd is. Andere aangesloten kabels, snoeren of stopcontacten zijn gerafeld of beschadigd.
Het gebruik van beschadigde netsnoeren kan een elektrische schok veroorzaken, wat kan leiden tot ernstig letsel of schade aan de robot.
Vervang de wisselstroomkabel alleen op aanwijzing van Opentrons Support.
Voor meer informatie over elektrische vereisten, zie het gedeelte Stroomverbruik in het hoofdstuk Installatie en verplaatsing.
OPENTRONS FLEX
17
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Extra veiligheidswaarschuwingen
Neem altijd de volgende aanvullende veiligheidswaarschuwingen in acht:
Symbool
Beschrijving
Opentrons Flex is niet gecertificeerd voor gebruik met explosieve of ontvlambare vloeistoffen. Laad geen platen, buizen of flesjes met explosieve of ontvlambare vloeistoffen in de robot en bedien het instrument niet op andere wijze met explosieve of ontvlambare vloeistoffen in de behuizing.
Gebruik goede laboratoriumpraktijken en volg de voorzorgsmaatregelen van de fabrikant bij het werken met chemicaliën. Opentrons is niet verantwoordelijk of aansprakelijk voor enige schade als gevolg van of als gevolg van het gebruik van gevaarlijke chemicaliën.
De Flex weegt 88.5 kg (195 lbs). Daarom zijn er twee mensen nodig om hem veilig op te tillen en te verplaatsen. Zie de sectie Verplaatsen in het hoofdstuk Installatie en verplaatsing.
De Flex moet op een oppervlak worden geplaatst dat zijn gewicht van 88.5 kg (195 lbs) kan dragen met voldoende oppervlakte om de robot te huisvesten, plus de minimale vrije afstand (20 cm/8 inch). Zie het gedeelte Veiligheids- en bedieningsvereisten in het hoofdstuk Installatie en verplaatsing.
De Flex kan tijdens bedrijf trillingen afgeven. Plaats de robot op een stevig, vlak en waterbestendig oppervlak met kruisverstevigingen of lasverbindingen. Zie het gedeelte Veiligheids- en bedieningsvereisten in het hoofdstuk Installatie en verplaatsing.
Veiligheidsmaatregelen
Volg deze voorzorgsmaatregelen om de Flex tegen schade te beschermen:
18
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Symbool
Beschrijving
Gebruik laboratoriummateriaal dat ANSI/SLAS-compatibel is of is goedgekeurd door Opentrons. Zie het hoofdstuk Laboratoriumbenodigdheden.
Houd bijtende materialen, middelen of anderszins schadelijke materialen uit de buurt van de robot.
Biologische veiligheid
Behandel specimens en reagentia die materialen bevatten die van mensen zijn afgenomen, als potentieel infectieuze agentia. Opentrons beveelt het gebruik van veilige laboratoriumprocedures aan, zoals uitgelegd in Bioveiligheid in microbiologische en biomedische laboratoria (BMBL), 6e editie.
Onder normale omstandigheden creëert de Flex geen detecteerbare aërosolen uit bronvloeistoffen. Onder bepaalde omstandigheden is het echter mogelijk om aërosolen te genereren uit bronvloeistoffen. Wanneer u werkt met bronvloeistoffen van bioveiligheidsniveau 2 of hoger, overweeg dan om voorzorgsmaatregelen te nemen tegen blootstelling aan aerosolen, in overeenstemming met uw plaatselijke regelgevende instanties. Om het potentiële risico op blootstelling aan aerosolen van de robot te minimaliseren, moet u ervoor zorgen dat u:
Voer het onderhoud uit zoals beschreven in het hoofdstuk Onderhoud en service. Installeer en bevestig alle instrumentafdekkingen, pipetten, modules en laboratoriumbenodigdheden op de juiste manier. Gebruik de juiste pipetteertechniek om aerosolen te helpen beperken.
Giftige dampen
Als u met vluchtige oplosmiddelen of giftige stoffen werkt, gebruik dan een efficiënt laboratoriumventilatiesysteem om eventueel geproduceerde dampen te verwijderen.
Brandbare vloeistoffen
De Flex is niet beoordeeld voor gebruik met ontvlambare vloeistoffen en mag niet worden gebruikt met ontvlambare vloeistoffen.
OPENTRONS FLEX
19
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
1.3 Naleving van regelgeving
Opentrons Flex voldoet aan alle toepasselijke eisen van de volgende veiligheids- en elektromagnetische normen.
Veiligheid
Regel-ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Titel
Veiligheidseisen voor elektrische apparatuur voor metingen, controle en laboratoriumgebruik Deel 1: Algemene vereisten
Bijzondere eisen voor laboratoriumapparatuur voor mengen en roeren
Elektromagnetische compatibiliteit
Regel-ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Deel 15 Subdeel B Klasse A IC ICES-003
Titel
Elektrische apparatuur voor metingen, controle en laboratoriumgebruik EMC-vereisten Deel 1: Algemene vereisten Onbedoelde radiatoren
Spectrumbeheer en telecommunicatie-interferentie veroorzakende apparatuur Standaard informatietechnologieapparatuur (inclusief digitale apparatuur)
FCC-waarschuwingen en opmerkingen
Waarschuwing: Wijzigingen of aanpassingen aan dit apparaat die niet uitdrukkelijk zijn goedgekeurd door Opentrons kunnen de bevoegdheid van de gebruiker om de apparatuur te bedienen ongeldig maken.
Dit apparaat voldoet aan Deel 15 van de FCC-regels. De bediening is afhankelijk van het volgende:
20
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 1: INLEIDING
Dit apparaat mag geen schadelijke interferentie veroorzaken. Dit apparaat moet alle ontvangen interferentie accepteren, inclusief interferentie die ongewenste gevolgen kan hebben
operatie.
Opmerking: Deze apparatuur is getest en voldoet aan de limieten voor een digitaal apparaat van Klasse A, overeenkomstig Deel 15 van de FCC-regels. Deze limieten zijn bedoeld om redelijke bescherming te bieden tegen schadelijke interferentie wanneer de apparatuur in een commerciële omgeving wordt gebruikt. Deze apparatuur genereert, gebruikt en kan radiofrequentie-energie uitstralen en kan, indien niet geïnstalleerd en gebruikt in overeenstemming met de instructiehandleiding, schadelijke interferentie aan radiocommunicatie veroorzaken. Het gebruik van deze apparatuur in een woonwijk zal waarschijnlijk schadelijke interferentie veroorzaken. In dat geval zal de gebruiker verplicht zijn de interferentie op eigen kosten te corrigeren.
ISED-naleving van Canada
Canada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Dit product voldoet aan de toepasselijke technische specificaties van Innovation, Science and Economic Development Canada.
Het huidige product is conform de specificaties van de toegepaste technieken op het gebied van innovatie, wetenschappen en economische ontwikkeling in Canada.
Milieuwaarschuwing
Waarschuwing: kanker en reproductieve schade www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi-precertificering
De Wi-Fi-module is vooraf gecertificeerd voor gebruik in veel regio's:
Verenigde Staten (FCC): FCC-identificatienummer UAY-W8997-M1216 Europese Economische Ruimte (CE): Geen openbare identificatie (eigen verklaring) Canada (IC): Hardwareversie-identificatienummer W8997-M1216 Japan (TELEC): Gecertificeerd nummer 020-170034 India (WPC): Registratienummer ETA-SD-20191005525 (eigen verklaring)
OPENTRONS FLEX
21
HOOFDSTUK 2
Installatie en verhuizing
In dit hoofdstuk wordt beschreven hoe u uw laboratorium kunt voorbereiden op Opentrons Flex, hoe u de robot moet opstellen en hoe u deze indien nodig kunt verplaatsen. Voordat u uw Flex in ontvangst neemt, moet u ervoor zorgen dat uw laboratorium of faciliteit voldoet aan alle criteria in het gedeelte Veiligheid en gebruiksvereisten. Wanneer het tijd is om uw Flex aan de slag te krijgen, volgt u de gedetailleerde instructies in de secties Uitpakken, Eerste gebruik en Instrumentinstallatie en kalibratie, of gebruikt u de Opentrons Onsite Support Set Up-service. En als u uw Flex ooit naar een nieuwe locatie moet verplaatsen, dichtbij of ver weg, volgt u de stappen in het gedeelte Verhuizen.
2.1 Veiligheids- en bedieningsvereisten
Waar Opentrons Flex plaatsen
Ruimte is in bijna elk laboratorium een waardevol goed. Je Flex heeft er wat van nodig, maar niet te veel, want hij is ontworpen om op de helft van een standaard laboratoriumbank te passen. Zorg ervoor dat u een ruimte heeft die aan de volgende criteria voldoet.
Bankoppervlak: Stationair, stevig, vlak, waterbestendig oppervlak. Tafels of banken met wielen (zelfs vergrendelbare wielen) worden niet aanbevolen. Flex beweegt snel en heeft veel massa, waardoor lichtgewicht of verplaatsbare tafels kunnen trillen of uit balans kunnen raken.
Gewichtsbelasting: De robot alleen al weegt 88.5 kg (195 lb) en mag alleen worden opgetild door twee mensen die samenwerken. Plaats de robot op een oppervlak dat gemakkelijk zijn gewicht kan dragen, plus het gewicht van eventuele modules, laboratoriumbenodigdheden, vloeistoffen of andere laboratoriumapparatuur die u in uw toepassingen wilt gebruiken.
Bedrijfsruimte: De basisafmetingen van de robot zijn 87 cm B x 69 cm D x 84 cm H (ongeveer 34″ x 27″ x 33″). Flex heeft 20 cm (8″) ruimte aan de zijkant en achterkant nodig voor kabels, USB-aansluitingen en om uitlaatgassen af te voeren van modules die verwarmen en koelen.
Waarschuwing: Plaats de zijkanten of achterkant van de Flex Flush niet tegen een muur.
22
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
84 cm 33
87 cm 34
Afmetingen van de Opentrons Flex-basis.
69 cm 27
20 cm 8
20 cm 8
20 cm 8
Bovenkant view van Opentrons Flex, met minimale zij- en achterkantspeling.
OPENTRONS FLEX
23
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Stroomverbruik
Opentrons Flex moet worden aangesloten op een stopcontact op of nabij de werkbanklocatie waar u het installeert. Sluit Flex alleen aan op circuits die het maximale stroomverbruik aankunnen:
Ingangsvermogen: 36 VDC, 6.1 A Verbruik in rust: 30 W Typisch verbruik: 40 W (tijdens protocoluitvoering) Maximaal verbruik: ongeveer 50 W
Het exacte energieverbruik is afhankelijk van:
De hoeveelheid en het type beweging dat tijdens een protocol wordt uitgevoerd. De hoeveelheid tijd die de robot inactief is. De status van de lampjes op de robot. Hoeveel instrumenten zijn aangesloten.
Houd rekening met andere elektronica die stroom verbruikt op hetzelfde circuit, inclusief Flex-modules met hun eigen voedingen. BijvoorbeeldampZo heeft de Thermocycler Module een maximaal energieverbruik (630 W) dat veel groter is dan dat van de Flex-robot zelf. Raadpleeg indien nodig de manager van uw locatie om er zeker van te zijn dat deze voldoet aan de stroomvereisten van uw apparatuur.
Omgevingsomstandigheden
Omgevingsomstandigheden voor aanbevolen gebruik, acceptabel gebruik en opslag variëren:
Aanbevolen voor systeembediening
Acceptabel voor systeembediening
Omgevingstemperatuur +20 tot +25 °C
+2 tot +40 °C
Relatieve vochtigheid Hoogte
40%, niet-condenserend
Ongeveer 500 meter boven zeeniveau
30%, niet-condenserend (onder 80 °C)
Tot 2000 m boven zeeniveau
Opslag en transport
-10 tot +60 °C
10%, niet-condenserend (onder 85 °C)
Tot 2000 m boven zeeniveau
24
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Opentrons heeft de prestaties van Opentrons Flex gevalideerd onder de aanbevolen omstandigheden voor systeemwerking, en gebruik onder die omstandigheden zou optimale resultaten moeten opleveren. Flex is veilig te gebruiken onder omstandigheden die acceptabel zijn voor de werking van het systeem, maar de resultaten kunnen variëren. Schakel de Flex niet in en gebruik hem niet in omstandigheden buiten deze grenzen. De opslag- en transportvoorwaarden zijn alleen van toepassing als de robot volledig is losgekoppeld van stroom en andere apparatuur.
2.2 Uitpakken
Gefeliciteerd! Uw Opentrons Flex is gearriveerd en u heeft er een ruimte voor voorbereid in uw laboratorium. Laten we die monsterkrat openen, de robot verwijderen en hem klaarmaken voor gebruik. De informatie in dit gedeelte biedt een onderdelenlijst en instructies die u door de stappen leiden die nodig zijn om de Flex uit de doos te halen, in te stellen en klaar te maken voor gebruik. We hebben de installatieprocedure in drie delen verdeeld:
Deel 1 behandelt het demonteren van de kist. Deel 2 gaat over het losmaken van de Flex van de krat en het verplaatsen naar een eindmontagelocatie. Deel 3 gaat over de eindmontage en het voor de eerste keer inschakelen van de robot.
Inspanning en tijd vereist
U kunt een laboratoriumpartner vragen om te helpen bij het uitpakken, tillen, verplaatsen en monteren. U moet voor deze inspanning ongeveer 30 minuten tot een uur besteden.
Let op: Er zijn twee mensen nodig om de Flex op de juiste manier op te tillen. Bovendien is het optillen en dragen van de Flex aan de handgrepen de beste manier om de robot te verplaatsen.
Krat en verpakkingsmateriaal
Als je een Flex uitpakt, krijg je een geweldige robot, maar je houdt ook een aantal grote kratpanelen over, samen met diverse verzendcomponenten en opvulling. Hoewel u dit materiaal kunt weggooien, raden wij u aan deze items te bewaren als er opslagruimte beschikbaar is. De verpakking is herbruikbaar, waardoor u uw Flex kunt voorbereiden op verzending als u deze in de toekomst ooit ergens anders naartoe moet sturen (bijvoorbeeld naar een conferentie of een nieuwe faciliteit).
OPENTRONS FLEX
25
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Productelementen
De Flex wordt geleverd met de onderstaande componenten. Pipetten, de grijper en modules worden geleverd in een aparte verpakking van het Flex-hoofdkrat, zelfs als u ze samen als werkstation hebt gekocht.
(1) Opentrons Flex-robot
(1) USB-kabel
(1) Stroomkabel
(1) Ethernet-kabel
(5) Stiftsleutels (12 mm inbus, 1.5 mm inbus, 2.5 mm inbus, 3 mm inbus,
T10 Torx)
(1) Noodstophanger
(1) Deksleuf met laboratoriumbenodigdhedenclips
(4) Reserve laboratoriumbenodigdhedenclips
(1) Pipetkalibratiesonde
(4) Handvatten en doppen
(1) Bovenste raampaneel
(4) Zijruitpanelen
(1) 2.5 mm zeskantschroevendraaier
(1) 19 mm sleutel
(16 + reserveonderdelen) Raamschroeven (M4x8 mm platte kop)
26
(10) Reserve deksleufschroeven (M4x10 mm inbus)
(12) Reserve dekclipschroeven (M3x6 mm inbus)
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Deel 1: Verwijder de krat
Opentrons verzendt uw Flex in een stevige multiplexkist. De transportkrat maakt gebruik van haak en grendel clamps om de boven-, zij- en onderpanelen aan elkaar te bevestigen. Door grendels te gebruiken in plaats van spijkers of schroeven, heb je geen koevoet (of veel kracht) nodig om de kist te demonteren, en kun je hem later indien nodig weer in elkaar zetten.
Let op: Kratranden kunnen tijdens het transport ruw worden. Misschien wilt u werkhandschoenen gebruiken om uw handen te beschermen tegen houtsplinters.
Om de vergrendelingen los te maken, klapt u het lipje van de vergrendeling omhoog en draait u deze naar links (tegen de klok in). Deze actie verplaatst de clamp arm uit de bijbehorende bevestigingsbeugel. Vervolgens kunt u de vergrendelingsarm van de kist wegklappen.
1 Ontgrendel de acht grendels waarmee de bovenkant aan de zijkanten vastzit.
2 Verwijder het bovenpaneel nadat u de vergrendelingen hebt losgemaakt.
OPENTRONS FLEX
27
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING 3 Snij de blauwe verzendzak open, verwijder deze items uit de opvulling en leg ze opzij:
Gebruikerskit Voedings-, Ethernet- en USB-kabels Noodstophanger
4 Verwijder het bovenste stuk schuimvulling om de raampanelen bloot te leggen. De vulling beschermt de zij- en bovenpanelen.
5 Verwijder de raampanelen en leg ze opzij. Deze voegt u later toe.
28
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
6 Ontgrendel de resterende 16 grendels waarmee de zijpanelen aan elkaar en aan de onderkant van de krat zijn bevestigd. 7 Verwijder de zijpanelen en leg ze opzij.
Deel 2: Laat de Flex los
Nadat je de stappen in deel 1 hebt voltooid, zou je nu een robot moeten zien die in een beschermende tas zit en is bevestigd aan oranje stalen montagecomponenten. De tas omsluit de robot en beschermt hem tegen de buitenomgeving. Stalen beugels bevestigen de robot aan de bodem van de kist. Twee transportframes ondersteunen de robot, verdelen het gewicht gelijkmatig en houden hem stijf zodat hij tijdens het transport niet kromtrekt. Ga door met het uitpakken van de Flex en haal hem van de kratbasis.
8 Gebruik de 19 mm sleutel uit de gebruikerskit om de beugels van de bodem van de krat los te maken. U kunt de beugels weggooien of bewaren voor toekomstig gebruik.
OPENTRONS FLEX
29
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING 9 Trek of rol de transportzak helemaal naar beneden zodat de hele robot zichtbaar is.
10 Pak met hulp van uw laboratoriumpartner de handgrepen in de oranje transportframes aan weerszijden van de robotbasis, til de Flex van de kratbasis en zet hem op de grond. Bewaar de kratbasis en het verzendframe of gooi deze weg.
30
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING 11 Verwijder met behulp van de 12 mm inbussleutel uit de gebruikerskit de vier bouten waarmee de transportframes aan de
de Flex. Bewaar de frames en bouten of gooi ze weg.
12 Verwijder de vier aluminium handgrepen uit de gebruikerskit. Schroef de handgrepen op dezelfde locaties waar de 12 mm transportframebouten vastzaten.
OPENTRONS FLEX
31
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
13 Til de Flex, met hulp van uw laboratoriumpartner, op aan de handgrepen en verplaats hem naar een werkbank voor de eindmontage.
Deel 3: Eindmontage en inschakelen
Nadat u de Flex naar een tijdelijke werkplek of een permanente woning heeft verplaatst, is het tijd om de laatste hand te leggen aan uw nieuwe robot.
14 Als u de robot naar zijn uiteindelijke werklocatie heeft verplaatst, verwijdert u de draaggrepen en vervangt u deze door de afwerkkappen. De doppen sluiten de handgreepopeningen in het frame af en geven de robot een strak uiterlijk. Plaats de handgrepen terug in de gebruikerskit om ze op te bergen.
32
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
15 Haal de boven- en zijpanelen uit het verpakkingsschuim dat u opzij heeft gelegd nadat u de bovenkant van de krat hebt verwijderd.
16 Monteer de raampanelen op de Flex door de etiketteringsinformatie op de beschermfolie aan de voorkant te volgen. Verwijder vervolgens de beschermfolie.
17 Gebruik de afgeschuinde raamschroeven en de 2.5 mm schroevendraaier uit de gebruikerskit om de raampanelen aan de Flex te bevestigen. Zorg ervoor dat de afgeschuinde (V-vormige) gaten in de raampanelen naar buiten (naar u toe) wijzen. Hierdoor passen de schroeven gelijk met het oppervlak van het raam.
Waarschuwing: Het verkeerd oriënteren van de panelen kan tot schade leiden. Een te hoog schroefkoppel kan de panelen doen barsten. Draai de schroeven met de hand vast totdat de raampanelen redelijk vastzitten. Dit is geen krachtmeting.
OPENTRONS FLEX
33
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING 18 Verwijder met behulp van de 2.5 mm schroevendraaier uit de gebruikerskit de borgschroeven uit het portaal. Deze
schroeven voorkomen dat het portaal beweegt tijdens het transport. De borgschroeven van het portaal bevinden zich: Op de linkerzijrail, vlakbij de voorkant van de robot. Onder de verticale portaalarm. Op de rechterzijrail nabij de voorkant van de robot in een oranje beugel. Er zijn hier twee schroeven.
Het portaal beweegt gemakkelijk met de hand nadat alle transportschroeven zijn verwijderd. 19 Knip en verwijder de twee elastiekjes die de afvalbak tijdens het transport op zijn plaats houden.
34
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
20 Sluit het netsnoer aan op Flex en steek de stekker in het stopcontact. Zorg ervoor dat het dekoppervlak vrij is van obstakels. Zet de aan/uit-schakelaar linksachter op de robot om. Eenmaal ingeschakeld, beweegt het portaal naar zijn thuislocatie en geeft het touchscreen aanvullende configuratie-instructies weer.
Nu uw Flex uit de doos is en klaar voor gebruik, gaat u verder naar het gedeelte Eerste run hieronder.
2.3 Eerste run
Voer de basisinstellingen uit op het touchscreen voordat u andere hardware op uw Flex aansluit. De robot begeleidt u bij het verbinden met uw laboratoriumnetwerk, het updaten naar de nieuwste software en het personaliseren van Flex door het een naam te geven.
Inschakelen
Wanneer u Flex inschakelt, verschijnt het Opentrons-logo op het touchscreen. Na enkele ogenblikken wordt het scherm "Welkom bij uw Opentrons Flex" weergegeven.
Het welkomstscherm van Opentrons Flex. Dit scherm zou je alleen moeten zien als je je Flex voor de eerste keer opstart.
OPENTRONS FLEX
35
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Maak verbinding met een netwerk of computer
Volg de aanwijzingen op het touchscreen om uw robot te verbinden, zodat hij kan controleren op software-updates en een protocol kan ontvangen fileS. Er zijn drie verbindingsmethoden: Wi-Fi, Ethernet en USB.
Netwerkverbindingsopties. Je hebt een internetverbinding nodig om Flex in te stellen. Wi-Fi: Gebruik het touchscreen om verbinding te maken met Wi-Fi-netwerken die zijn beveiligd met WPA2 Persoonlijke authenticatie (de meeste netwerken waarvoor alleen een wachtwoord nodig is om verbinding te maken, vallen onder deze categorie).
Opmerking: Flex ondersteunt geen captive portals (netwerken die geen wachtwoord hebben maar een webpagina om gebruikers te authenticeren nadat ze verbinding hebben gemaakt).
Je kunt ook verbinding maken met een open Wi-Fi-netwerk, maar dit wordt niet aanbevolen.
Waarschuwing: Door verbinding te maken met een open Wi-Fi-netwerk kan iedereen binnen het bereik van het netwerksignaal uw Opentrons Flex-robot besturen zonder authenticatie.
Als u verbinding moet maken met een Wi-Fi-netwerk dat bedrijfsauthenticatie gebruikt (inclusief “eduroam” en soortgelijke academische netwerken waarvoor een gebruikersnaam en wachtwoord vereist zijn), maak dan eerst verbinding met de Opentrons-app via Ethernet of USB om de initiële installatie te voltooien. Maak vervolgens verbinding met het zakelijke Wi-Fi-netwerk in de netwerkinstellingen voor uw Flex. Om toegang te krijgen tot de netwerkinstellingen:
36
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
1. Klik op Apparaten in de linkerzijbalk van de Opentrons-app. 2. Klik op het menu met drie stippen () voor uw Flex en kies Robotinstellingen. 3. Klik op het tabblad Netwerken.
Selecteer uw netwerk in het vervolgkeuzemenu of kies 'Word lid van een ander netwerk...' en voer de SSID in. Kies de bedrijfsverificatiemethode die uw netwerk gebruikt. De ondersteunde methoden zijn:
EAP-TTLS met TLS EAP-TTLS met MS-CHAP v2 EAP-TTLS met MD5 EAP-PEAP met MS-CHAP v2 EAP-TLS
Voor elk van deze methoden zijn een gebruikersnaam en wachtwoord vereist, en afhankelijk van uw exacte netwerkconfiguratie is mogelijk een certificaat vereist files of andere opties. Raadpleeg de IT-documentatie van uw instelling of neem contact op met uw IT-manager voor details over uw netwerkconfiguratie.
Ethernet: Sluit uw robot aan op een netwerkswitch of hub met een Ethernet-kabel. Vanaf robotsysteemversie 7.1.0 kunt u ook rechtstreeks verbinding maken met de Ethernet-poort van uw computer.
USB: Sluit de meegeleverde USB A-naar-B-kabel aan op de USB-B-poort van de robot en op een open poort op uw computer. Gebruik een USB B-naar-C-kabel of een USB A-naar-C-adapter als uw computer geen USB-A-poort heeft.
Om door te gaan met de installatie moet op de aangesloten computer de Opentrons-app geïnstalleerd en actief zijn. Voor details over het installeren van de Opentrons-app, zie de sectie App-installatie van het hoofdstuk Software en bediening.
Software-updates installeren
Nu u verbinding heeft met een netwerk of computer, kan de robot controleren op software- en firmware-updates en deze indien nodig downloaden. Als er een update is, kan het enkele minuten duren om deze te installeren. Zodra de update is voltooid, zal de robot opnieuw opstarten.
OPENTRONS FLEX
37
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Bevestig de noodstophanger
Sluit de meegeleverde noodstophanger (E-stop) aan op een hulppoort (AUX-1 of AUX-2) aan de achterkant van de robot.
Voor en na het aansluiten van de noodstophanger.
Het bevestigen en inschakelen van de noodstop is verplicht voor het bevestigen van instrumenten en het uitvoeren van protocollen op Flex. Voor meer informatie over het gebruik van de noodstop tijdens robotwerking, zie het gedeelte Noodstophanger in het hoofdstuk Systeembeschrijving.
Geef je robot een naam
Door uw robot een naam te geven, kunt u hem gemakkelijk identificeren in uw laboratoriumomgeving. Als u meerdere Opentrons-robots in uw netwerk heeft, zorg er dan voor dat u deze unieke namen geeft. Zodra u de naam van uw robot heeft bevestigd, wordt u naar uw Opentrons Flex Dashboard geleid. Waarschijnlijk is de volgende stap die u wilt nemen het bevestigen van instrumenten, wat in het volgende gedeelte wordt besproken.
2.4 Instrumentinstallatie en kalibratie
Na de eerste installatie van de robot is de volgende stap het bevestigen van instrumenten aan de robot en het kalibreren ervan.
Om een instrument te installeren, tikt u eerst op Instrumenten op het touchscreen of gaat u naar het gedeelte Pipetten en Modules van het apparaatdetailscherm in de Opentrons-app. Kies een lege houder en selecteer Attach Pipette of Attach Gripper. Als de houder die u wilt gebruiken al bezet is, moet u eerst de pipet of grijper losmaken.
38
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Opmerking: het algehele installatieproces is hetzelfde, ongeacht of u het touchscreen of de Opentrons-app gebruikt. Op welk apparaat u ook begint, het installatieproces wordt beheerd totdat u het voltooit of annuleert.
Als je op het touchscreen begint, geeft de app aan dat de robot ‘bezet’ is. Als u in de app begint, toont het touchscreen een modaliteit die aangeeft dat de installatie van het instrument bezig is.
Het exacte installatieproces varieert afhankelijk van het instrument dat u aansluit, zoals beschreven in de onderstaande secties. Alle instrumenten hebben een geautomatiseerde kalibratieprocedure, die u onmiddellijk na installatie moet uitvoeren.
Pipet installatie
Wanneer u een pipet installeert, wordt u op het touchscreen of in de Opentrons App door de volgende stappen geleid.
1. KIES HET PIPETTETYPE Kies tussen een 1- of 8-kanaalspipet en een 96-kanaalspipet. Het bevestigen van de 96-kanaalspipet vereist een paar extra stappen omdat deze wordt bevestigd aan een speciale montageplaat die beide pipetbevestigingen overspant.
2. VOORBEREIDING OP INSTALLATIE Verwijder laboratoriumgerei van het dek en ruim het werkgebied op om bevestiging en kalibratie te vergemakkelijken. Verzamel ook de benodigde apparatuur, zoals de kalibratiesonde, zeskantschroevendraaier en montageplaat (voor de 96-kanaalspipet).
3. Sluit de pipet aan en zet deze vast. Het portaal beweegt naar de voorkant van de robot, zodat u de pipet kunt bevestigen.
1- en 8-kanaalspipetten kunnen rechtstreeks op een pipethouder worden aangesloten. Voor de 96-kanaalspipet is een montageplaat vereist. Om de montageplaat te bevestigen, moet u eerst de z-aswagen voor de rechter pipethouder loskoppelen.
OPENTRONS FLEX
39
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Sluit de pipet aan op de gekozen pipethouder en draai de schroeven vast.
4. Voer een automatische kalibratie uit Om de pipet te kalibreren, sluit u de kalibratiesonde aan op het juiste pipetmondstuk. De pipet beweegt automatisch om bepaalde punten op het dek aan te raken en slaat deze kalibratiewaarden op voor toekomstig gebruik. Zodra de kalibratie is voltooid en u de sonde hebt verwijderd, is de pipet klaar voor gebruik in protocollen.
Grijper installatie
Wanneer u de grijper installeert, wordt u op het touchscreen of in de Opentrons App door de volgende stappen geleid.
1. VOORBEREIDING OP INSTALLATIE Verwijder laboratoriumgerei van het dek en ruim het werkgebied op om bevestiging en kalibratie te vergemakkelijken. Verzamel ook de benodigde zeskantschroevendraaier en zorg ervoor dat de kalibratiepin zich in het opbergvak op de grijper bevindt.
2. DE GRIPPER AANSLUITEN EN BEVESTIGEN Het portaal beweegt naar de voorkant van de robot, zodat u de grijper kunt bevestigen. Sluit de grijper aan op de verlengingssteun en draai de schroeven vast.
3. Voer een automatische kalibratie uit. Om de grijper te kalibreren, steekt u de kalibratiepin in de voorkaak. De grijper beweegt automatisch om bepaalde punten op het dek aan te raken en slaat deze kalibratiewaarden op voor toekomstig gebruik. Herhaal vervolgens hetzelfde proces met de kalibratiepin in de achterkaak. Zodra de kalibratie is voltooid en u de pin terug op de opslaglocatie heeft geplaatst, is de grijper klaar voor gebruik in protocollen.
2.5 Verhuizing
In dit gedeelte vindt u advies en instructies over hoe u uw Opentrons Flex-robot over korte en lange afstanden kunt verplaatsen.
40
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Korte bewegingen
Een korte verplaatsing bestrijkt een reeks afstanden, van “laten we het gewoon een klein stukje verplaatsen” tot aan de andere kant van het laboratorium, door de gang of naar een andere verdieping in uw gebouw. In deze gevallen kunt u uw Flex met de hand verplaatsen. Het vervoeren op een handkar is ook een goede optie.
Waarschuwing: De Flex weegt 88.5 kg. Daarom zijn er twee mensen nodig om hem veilig op te tillen en te verplaatsen.
Bevestig de lifthandgrepen opnieuw om uw Flex naar een nieuwe, nabijgelegen locatie te verplaatsen. Het optillen en dragen van de Flex aan de handgrepen is de juiste manier om de robot over korte afstanden te verplaatsen. Verwijder de handvatten en bewaar ze in de User Kit nadat de verplaatsing is voltooid. Om schade aan de robot te voorkomen, moet u altijd de hefhandgrepen gebruiken om hem op te pakken en te verplaatsen. Pak het frame niet vast om uw robot op te tillen of te verplaatsen.
Verhuizingen over lange afstanden
Bij een verhuizing over lange afstand wordt uw Flex buiten het terrein van uw universiteit, faciliteit of instelling vervoerd. Door de stad, naar een nieuwe stad, staat, provincie of land zijn allemaal examples van een langeafstandsverplaatsing. In dit geval moet je de Flex inpakken om hem te beschermen tegen de elementen, schokken en ruwe bewegingen die tijdens het transport kunnen optreden.
Als u de transportkrat en de interne steunen die bij uw Flex zijn geleverd, heeft bewaard, kunt u deze opnieuw in deze materialen verpakken voor een verhuizing over lange afstand. Volg de stappen voor het uitpakken in omgekeerde volgorde om uw Flex voor te bereiden op een verhuizing over lange afstanden. In principe moet u:
Koppel de stroom- en netwerkkabel los, indien aangesloten. Verwijder alle aangesloten hardware en laboratoriumbenodigdheden. Maak de dekplaten weer vast. Vergrendel het portaal (zie het gedeelte Algemeen verhuisadvies hieronder). Verwijder de raampanelen en berg ze op.
Als je de originele kist hebt bewaard:
Bevestig het verzendframe opnieuw aan de Flex en bevestig het aan de palletbasis met behulp van de L-beugels. Voeg opvulling toe en zet de transportkrat weer in elkaar.
OPENTRONS FLEX
41
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Als u niet over de originele krat en het bijbehorende materiaal beschikt, neem dan contact op met een gerenommeerd transportbedrijf. Zij kunnen het verpakkings-, transport- en leveringsproces voor u beheren.
Algemeen verhuisadvies
ONTKOPPEL DE STROOM- EN NETWERKKABELS Voordat u uw Flex verplaatst, vergeet niet het volgende te doen: Schakel de stroom uit en haal de stekker uit het stopcontact. Koppel de Ethernet- of USB-kabel los, indien gebruikt.
VERGRENDELEN VAN HET portaal Voordat u uw Flex verplaatst, plaatst u de borgschroeven opnieuw om het portaal op zijn plaats te houden. De portaalvergrendelpunten bevinden zich: Op de linkerzijrail, vlakbij de voorkant van de robot. Onder de verticale portaalarm. Op de rechterzijrail, vlak bij de voorkant van de robot. Voor het vergrendelen van dit deel van het portaal is het kleine nodig
oranje beugel en twee borgschroeven.
42
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
THUIS HET portaal Mogelijk wilt u het portaal niet vergrendelen als u de robot alleen naar een nabijgelegen locatie verplaatst. Als u besluit het niet te vergrendelen, gebruik dan in ieder geval het touchscreen of de Opentrons-app om het portaal naar de uitgangspositie te sturen voordat u het uitschakelt. Om het portaal via het touchscreen naar huis te brengen, tikt u op het menu met drie stippen () en vervolgens op Thuisportaal. Om het portaal te huisvesten via de Opentrons-app: Klik op Apparaten. Klik op uw Flex in de apparatenlijst. Klik op het menu met drie stippen () en klik vervolgens op Startportaal.
MODULES VERWIJDEREN Modules in het dek en andere hulpstukken voegen extra gewicht toe aan uw Flex. Ze beïnvloeden ook het zwaartepunt van de robot, waardoor hij bij het optillen een “tippy” gevoel kan krijgen. Om de robot lichter en evenwichtiger te maken, verwijdert u alle aangesloten instrumenten en laboratoriumbenodigdheden voordat u hem oppakt.
PLAATS DE DEK-SLOTS OPNIEUW. We raden aan om de deck-sleuven opnieuw te bevestigen voor verplaatsingen over lange afstanden. Door de sleuven op hun oorspronkelijke locatie vast te zetten, voorkomt u onbedoeld verlies. Het opnieuw bevestigen van de dekgleuven voor korte bewegingen in het lab is optioneel.
HERKALIBRATIE NA DE VERPLAATSING U moet alle instrumenten en modules opnieuw kalibreren nadat u ze opnieuw hebt geïnstalleerd. Voor meer details over modulekalibratie, zie het hoofdstuk Modules.
OPENTRONS FLEX
43
HOOFDSTUK 2: INSTALLATIE EN VERPLAATSING
Laatste gedachten over verhuizen
Uw Flex is een stevige en goed gebouwde machine, maar het is ook een nauwkeurig wetenschappelijk instrument dat is ontworpen met strenge toleranties. Daarom moet u er voorzichtig mee omgaan als u het binnen uw lokale werkgebied verplaatst of naar het hele land verzendt. Dit betekent dat u de hier gegeven richtlijnen volgt en uw eigen gezond verstand gebruikt over het vervoeren van een duur laboratoriumapparaat. Kort gezegd: wees voorzichtig bij het verplaatsen van uw Flex en zorg voor extra vulling.
Als u vragen of opmerkingen heeft over het verplaatsen van uw Flex, neem dan contact met ons op via support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3
Systeembeschrijving
Dit hoofdstuk beschrijft de hardwaresystemen van Opentrons Flex, die ten grondslag liggen aan de belangrijkste functies voor laboratoriumautomatisering. De dek-, portaal- en instrumentsteunen van Opentrons Flex maken het gebruik van precisiecomponenten voor vloeistof- en laboratoriumgerei mogelijk. Met het touchscreen op het apparaat kunt u protocollen uitvoeren en de status van de robot controleren zonder dat u uw computer naar de laboratoriumbank hoeft te brengen. Bekabelde en draadloze connectiviteit maakt extra bediening vanuit de Opentrons-app mogelijk (zie het hoofdstuk Software en bediening voor meer details) en breidt de systeemfuncties uit door randapparatuur aan te sluiten (zie het hoofdstuk Modules).
3.1 Fysieke componenten
Camera
Statuslampje
Aanraakscherm
Kader
Portaaldek
Voordeur
Locaties van de fysieke componenten van Opentrons Flex.
Handgreepkappen voor zijramen
OPENTRONS FLEX
45
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Frame en behuizing
Het frame van de Opentrons Flex-robot biedt stijfheid en structurele ondersteuning voor het dek en het portaal. Alle mechanische subsystemen bevinden zich op en zijn gemonteerd op het hoofdframe. Het frame is voornamelijk opgebouwd uit plaatstaal en aluminium extrusies.
Het metalen frame heeft openingen voor zijruiten en een voordeur van transparant polycarbonaat waardoor je kunt zien wat er in Flex gebeurt. De voordeur scharniert open voor toegang tot de binnenkant van het systeem. Als de voordeur open is, kunt u instrumenten, modules en dekbevestigingen bevestigen; bereid het kaartspel voor op een protocol; of manipuleer de status van het kaartspel tijdens een protocol.
Witte LED-strips aan de binnenzijde van de bovenranden van het frame zorgen voor softwarematig regelbare sfeerverlichting. Een camera van 2 megapixels kan het dek en het werkgebied fotograferen voor het opnemen en volgen van de protocoluitvoering.
Dek en werkruimte
Het dek is het machinaal bewerkte aluminium oppervlak waarop geautomatiseerde wetenschappelijke protocollen worden uitgevoerd. Het deck heeft 12 belangrijke slots in ANSI/SLAS-formaat die opnieuw kunnen worden geconfigureerd voor labware, modules en verbruiksartikelen. De deksleuven worden geïdentificeerd door een coördinatensysteem, met sleuf A1 linksachter en sleuf D3 rechtsvoor.
Uitbreidingssleuf (voor thermocycler) Werkgebied
Staging gebied
Gebieden van het kaartspel binnen Flex.
46
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Het werkgebied is de fysieke ruimte boven het dek die toegankelijk is voor pipetteren. Laboratoriumbenodigdheden die in de sleuven A1 tot en met D3 zijn geplaatst, bevinden zich in het werkgebied.
Opentrons Flex wordt geleverd met verwijderbare dekgleuven voor alle 12 posities in het werkgebied. Elke deksleuf heeft hoekclips voor laboratoriummateriaal om laboratoriumgerei veilig op het dek te plaatsen.
Je kunt het deck opnieuw configureren door sleuven te vervangen door andere deckbevestigingen, waaronder het verplaatsbare afval, de afvalgoot en modulecaddies. Het uitbreidingsslot achter A1 wordt alleen gebruikt om extra ruimte te maken voor de Thermocycler-module, die de slots A1 en B1 in beslag neemt.
Opmerking: Deck-sleuven zijn uitwisselbaar binnen een kolom (1, 2 of 3), maar niet tussen kolommen; kolom 1 en kolom 3 slots zijn verschillende stukken ondanks hun vergelijkbare grootte. U kunt zien in welke kolom een sleuf past door de blauwe labware-clip naar links achter te richten.
U moet deksleuven geïnstalleerd laten op locaties waar u stand-alone laboratoriumapparatuur wilt plaatsen. Het kaartspel en de erop geplaatste items blijven statisch, tenzij ze worden verplaatst door de grijper of handmatige tussenkomst.
Staging gebied
De stagHet werkgebied is extra ruimte langs de rechterkant van het dek. Op deze locatie kunt u laboratoriummateriaal opslaan nadat u stagslots in het gebied. Laboratoriumbenodigdheden geplaatst in sleuven A4 tot en met D4 bevinden zich in de staggebied. Flexpipetten kunnen niet in de s reikentagwerkgebied, maar de grijper kan laboratoriumgerei van en naar deze locatie oppakken en verplaatsen. Door extra slots toe te voegen, blijft het werkgebied beschikbaar voor de apparatuur die in uw geautomatiseerde protocollen wordt gebruikt.
StagIn bepaalde werkstationconfiguraties zijn slots voor ing-gebieden inbegrepen en deze zijn ook te koop via https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Staginggebied met geïnstalleerde sleuven
Dek armaturen
Fixtures zijn hardware-items die standaard deckslots vervangen. Hiermee kunt u de deck-indeling aanpassen en functionaliteit aan uw Flex toevoegen. Momenteel omvatten dekarmaturen de stagsleuven in de afvalruimte, de interne afvalbak en de externe afvalgoot. Je kunt alleen armaturen in een paar specifieke deckslots installeren. De volgende tabel vermeldt de decklocaties voor elk armatuur.
Armatuur Stagsleuven in de ruimte Vuilnisbak Afvalgoot Afvalgoot met staging gebied slot
Sleuven A3D3 A1D1 en A3-D3 Alleen D3 Alleen D3
Armaturen hebben geen stroom. Ze bevatten geen elektronische of mechanische componenten die hun huidige status en deklocatie aan de robot doorgeven. Dit betekent dat je de deckconfiguratiefunctie moet gebruiken om de Flex te laten weten welke armaturen aan het deck zijn bevestigd en waar ze zich bevinden.
48
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
U heeft toegang tot de configuratie-instellingen van het deck vanaf het touchscreen via het menu met drie stippen () en vanuit de Opentrons-app. Zie het gedeelte Deckconfiguratie van het hoofdstuk Software en bediening voor informatie over hoe u het deck kunt configureren vanaf het touchscreen.
Afvalgoot
De Opentrons Flex Waste Chute transporteert vloeistoffen, tips, tiprekken en putplaten van de Flex-behuizing naar een afvalbak die onder de externe opening is geplaatst. De afvalgoot wordt bevestigd aan een maaidekplaatadapter die in sleuf D3 past. Het wordt ook geleverd met een speciaal half vensterpaneel waardoor de parachute uit de voorkant van de robot kan steken.
Onderdelen van de afvalgoot.
Adapter voor afdekplaatplaat
Afvalkoker
Dekplaatadapter met Staging gebied
Stagslots in het gebied
Staging area slots zijn ANSI/SLAS-compatibele kaartspelstukken die de standaard slots in kolom 3 vervangen en nieuwe slots toevoegen aan de stagwerkgebied — en dat allemaal zonder ruimte te verliezen in het werkgebied. U kunt een enkele sleuf of maximaal vier sleuven installeren om een nieuwe kolom (A4 tot D4) langs de rechterkant van het kaartspel te creëren. Houd er echter rekening mee dat voor het vervangen van deksleuf A3 de afvalbak moet worden verplaatst. Door het toevoegen van stagDankzij ruimtegleuven op het dek kan uw Flex-robot meer laboratoriumgerei opslaan en efficiënter werken.
OPENTRONS FLEX
Flex staging gebied slot.
49
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
SLOT-INSTALLATIE
Om te installeren verwijdert u de schroeven waarmee een standaardsleuf aan het deck is bevestigd en vervangt u deze door de staging gebied slot. Gebruik na de installatie het touchscreen of de Opentrons App om aan te geven als welke robot je hebt toegevoegdtaggleuf voor het dek.
Installeren alstaging gebied slot.
SLOTCOMPATIBILITEIT StagSleuven in de bedieningsruimte zijn compatibel met de onderstaande Flex-instrumenten, -modules en laboratoriumbenodigdheden.
Flex-component Grijperpipetten Modules
Laboratoriumbenodigdheden
Stagcompatibiliteit van het gebied
De Flex Gripper kan laboratoriummateriaal van of naar s verplaatsentagslots in het gebied.
Flexpipetten kunnen de s niet bereikentaggebied. Gebruik de grijper om tiprekken en laboratoriumgerei uit de s te verplaatsentaggebied naar het werkgebied voordat u gaat pipetteren.
Het Magnetisch Blok GEN1 kan in kolom 3 bovenop worden geplaatsttaging gebied slot. Modules worden niet ondersteund in kolom 4.
Aangedreven modules zoals de Heater-Shaker en Temperature Module passen in caddies die in kolom 3 geplaatst kunnen worden. Je kunt deze niet toevoegen alstaginggebiedsleuf naar een positie die wordt ingenomen door een modulecaddy.
StagSleuven in het montagegebied hebben dezelfde ANSI/SLAS-afmetingen als standaard deksleuven. Gebruik grijper-compatibele laboratoriumbenodigdheden in de jarentagof handmatig labware toevoegen of verwijderen van deze locatie.
50
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Bewegingssysteem
Aan het frame is het portaal bevestigd, het bewegings- en positioneringssysteem van de robot. Het portaal beweegt afzonderlijk langs de x- en y-as om de pipetten en grijper op precieze locaties te positioneren voor protocoluitvoering. De beweging langs deze assen is nauwkeurig tot op de dichtstbijzijnde 0.1 mm. Het portaal wordt bestuurd door hybride bipolaire stappenmotoren van 36 VDC. Aan het portaal zijn op hun beurt de pipetbevestigingen en de verlengbevestiging bevestigd. Deze bewegen langs de z-as om de pipetten en grijper op precieze locaties te positioneren voor protocoluitvoering. De beweging langs deze as wordt bestuurd door hybride bipolaire stappenmotoren van 36 VDC. De elektronica in het portaal levert 36 VDC-voeding en communicatie met de pipetten en de grijper, indien aangesloten.
Portaal
Pipethouders
Verlenging montage
Locatie van instrumentbevestigingen op Flex.
Touchscreen en LED-displays
De primaire gebruikersinterface is het 7-inch LCD-aanraakscherm, dat zich rechtsvoor op de robot bevindt. Het touchscreen is bedekt met Gorilla Glass 3 voor kras- en beschadigingsbestendigheid. Toegang tot veel functies van Flex rechtstreeks op het touchscreen, waaronder:
OPENTRONS FLEX
51
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Protocolbeheer Protocol instellen, uitvoeren en bewaken Labware-beheer Robotinstellingen Systeemsoftware- en firmware-updates Bedrijfslogboeken en foutmeldingen
Voor meer informatie over het gebruik van Flex via het touchscreen, zie het gedeelte Touchscreenbediening in het hoofdstuk Software en bediening.
Het statuslampje is een strook LED's langs de voorkant van de robot die in één oogopslag informatie over de robot geeft. Verschillende kleuren en patronen van verlichting kunnen verschillende successen, mislukkingen of inactieve toestanden communiceren:
LED-kleur Wit Neutrale toestanden
Groen Normale toestanden
Blauw Verplichte staten Geel Abnormale staten Rood Noodtoestanden
LED-patroon Continu pulserend
Knippert twee keer
Solide pulserend pulserend
Robotstatus
Aangezet en geen protocol uitgevoerd Robot is bezig (bijvoorbeeld software of firmware updaten, protocolrun instellen, protocolrun annuleren) Actie is voltooid (bijvoorbeeld protocol opgeslagen, software bijgewerkt, instrument aangesloten of losgekoppeld) Protocol is actief Protocol is voltooid Het protocol is gepauzeerd
Stevig
Softwarefout
Knippert driemaal herhaaldelijk
Fysieke fout (bijv. instrumentcrash)
Het statuslampje kan ook worden uitgeschakeld in de robotinstellingen.
52
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
3.2 Pipetten
Opentrons-pipetten zijn configureerbare apparaten die worden gebruikt om vloeistoffen door het werkgebied te verplaatsen tijdens de uitvoering van protocollen. Er zijn verschillende Opentrons Flex-pipetten, die volumes van 1 µL tot 1000 µL in 1, 8 of 96 kanalen kunnen verwerken:
Opentrons Flex 1-kanaalspipet (1 µL) Opentrons Flex 50-kanaalspipet (1 µL) Opentrons Flex 5-kanaalspipet (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanaalspipet (1 µL) Opentrons Flex 50-kanaalspipet (8 µL)
Pipetten worden aan het portaal bevestigd met behulp van geborgde schroeven aan de voorkant van de pipet. 1-kanaals- en 8-kanaalspipetten nemen elk één pipethouder in beslag (links of rechts); de 96-kanaalspipet neemt beide steunen in beslag. Voor meer informatie over het installeren van pipetten, zie Instrumentinstallatie en kalibratie.
Gevangen bijlage
Schroeven
Vaste bevestigingsschroeven
ejector
Mondstukken (vervangbare O-ringen)
Mondstukken (vaste O-ringen)
Locaties van componenten van de 1-, 8- en 96-kanaalspipetten.
ejector
OPENTRONS FLEX
53
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
De pipetten pakken wegwerpbare plastic tips op door ze op de pipetmondstukken te drukken en gebruiken de tips vervolgens om vloeistoffen op te zuigen en af te geven. De hoeveelheid totale kracht die nodig is voor het oppakken neemt toe naarmate er meer tips tegelijkertijd worden opgepakt. Voor kleinere aantallen tips bevestigt de pipet de tips door elk pipetmondstuk in een tip te duwen. Om de nodige kracht te bereiken om een vol rek met tips op te pakken, trekt de 96-kanaalspipet de tips ook omhoog op de spuitmondjes. Deze trekactie vereist het plaatsen van tiprekken in een tiprekadapter, in plaats van rechtstreeks in een deksleuf. Om tips weg te gooien (of terug te plaatsen in hun rek), duwt het pipetuitwerpmechanisme de tips van de spuitmondjes.
Pipet specificaties
Opentrons Flex-pipetten zijn ontworpen voor een breed scala aan volumes. Vanwege hun brede bereik kunnen ze tips van meerdere maten gebruiken, wat hun vloeistofhanteringseigenschappen beïnvloedt. Opentrons heeft Flex-pipetten getest op nauwkeurigheid en precisie in een aantal combinaties van tip- en vloeistofvolumes:
Pipet
Flex 1-kanaal
50 µL
Flex 1-kanaal
1000 µL
Flex 8-kanaal
50 µL
Flex 8-kanaal
1000 µL
Tipcapaciteit 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Geteste volume 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µl 1000 µl
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Nauwkeurigheid %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Precisie %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Flex 96-kanaal
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Houd deze nauwkeurigheidsinformatie in gedachten bij het kiezen van tips voor uw pipet. Over het algemeen moet u voor de beste resultaten de kleinste tips gebruiken die voldoen aan de behoeften van uw protocol.
Opmerking: Opentrons voert volumetrische tests uit op Flex-pipetten om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan de hierboven genoemde nauwkeurigheids- en precisiespecificaties. U hoeft het volume dat uw pipetten doseren niet voor gebruik te kalibreren. U hoeft alleen maar een positionele kalibratie uit te voeren. Zie het volgende gedeelte, evenals het gedeelte Pipetinstallatie van het hoofdstuk Installatie en verplaatsing, voor meer informatie.
De diensten van Opentrons Care en Opentrons Care Plus omvatten jaarlijkse pipetvervanging en kalibratiecertificaten. Zie het gedeelte Onderhoud Flex in het hoofdstuk Onderhoud en service voor meer informatie.
Pipetkalibratie
De gebruikerskit bevat een metalen pipetkalibratiesonde, die u gebruikt tijdens positionele kalibratie. Tijdens protocolruns bergt u de sonde veilig op in de magnetische houder op de voorstijl van de robot. Tijdens het kalibratieproces bevestigt u de sonde aan het juiste mondstuk en vergrendelt u deze op zijn plaats. De robot beweegt de sonde naar kalibratiepunten op het dek om de exacte positie van de pipet te meten.
Pipettiprekadapter
De Opentrons Flex 96-kanaalspipet wordt geleverd met vier tiprekadapters. Dit zijn nauwkeurig gevormde aluminium beugels die u op het deck plaatst. De adapters zijn geschikt voor Flex-tiprekken van 50 l, 200 l en 1000 µl.
OPENTRONS FLEX
55
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Vanwege de kracht die ermee gemoeid is, heeft de 96-kanaalspipet een adapter nodig om een volledig tiprek goed te kunnen bevestigen. Tijdens de bevestigingsprocedure beweegt de pipet over de adapter, laat zich op de bevestigingspinnen zakken en trekt de tips op de pipetten door de adapter en het tiprek op te tillen. Door aan de tips te trekken in plaats van te duwen, ontstaat de hefboomwerking die nodig is om de tips aan de pipetten vast te zetten en wordt voorkomen dat het dekoppervlak kromtrekt. Wanneer u klaar bent, laat de 96-kanaalspipet de adapter en het lege tiprek op het dek zakken. Zie het gedeelte Tips en tiprekken in het hoofdstuk Laboratoriumbenodigdheden voor meer informatie.
Gedeeltelijke fooiopname
De 96-kanaalspipet kan een volledig rek met tips of een kleiner aantal tips oppakken. Dit vergroot het aantal toepassingen dat u kunt uitvoeren met de 96-kanaalspipet, aangezien deze beide pipethouders in beslag neemt.
Momenteel ondersteunt de 96-kanaalspipet gedeeltelijke tipopname voor 8 tips in een kolomindeling. In deze configuratie gebruikt de pipet de meest linkse spuitmondjes om tips van rechts naar links op te pakken van een tipsrek, of de meest rechtse spuitmondjes om tips van links naar rechts op te pakken van een tipsrek.
Wanneer u minder dan 96 tips uit een tiprek oppakt, moet het rek direct op het dek worden geplaatst, niet in de tiprekadapter.
Pipetsensoren
Opentrons Flex-pipetten hebben een aantal sensoren die gegevens detecteren en vastleggen over de status van de pipet en eventuele tips die deze heeft opgepikt.
CAPACITEITSSENSOREN
In combinatie met een metalen sonde of geleidende punt detecteren de capaciteitssensoren wanneer de pipet ergens mee in contact komt. Detectie van contact tussen de metalen sonde en het dek wordt gebruikt bij de geautomatiseerde pipetkalibratie- en modulekalibratieprocessen.
1-kanaalspipetten hebben één capaciteitssensor, terwijl meerkanaalspipetten er twee hebben: op kanalen 1 en 8 van 8-kanaalspipetten, en op kanalen 1 en 96 (posities A1 en H12) van de 96-kanaalspipet.
56
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
OPTISCHE TIP-AANWEZIGHEIDSSENSOREN
Een foto-onderbrekerschakelaar detecteert de positie van het tipuitwerpmechanisme van de pipet en bevestigt of de tips met succes zijn opgepakt of gevallen. 1-kanaals-, 8-kanaals- en 96-kanaalspipetten hebben allemaal één enkele optische sensor die de tipbevestiging via alle kanalen controleert.
Updates voor pipetfirmware
Opentrons Flex werkt de pipetfirmware automatisch bij om deze gesynchroniseerd te houden met de robotsoftwareversie. Updates voor pipetfirmware zijn doorgaans snel en vinden plaats wanneer:
Je bevestigt een pipet. De robot start opnieuw op.
Als uw pipetfirmware en robotsoftwareversies om welke reden dan ook niet meer synchroon lopen, kunt u de firmware handmatig bijwerken in de Opentrons-app.
1. Klik op Apparaten. 2. Klik op je Flex in de apparatenlijst. 3. Onder Instrumenten en modules toont de niet-gesynchroniseerde pipet een waarschuwingsbanner
“Firmware-update beschikbaar.” Klik op Nu bijwerken om de update te starten.
Je kan view de momenteel geïnstalleerde firmwareversie van een aangesloten pipet. Ga op het touchscreen naar Instrumenten en tik op de pipetnaam. Zoek in de Opentrons-app de pipetkaart onder Instrumenten en modules, klik op het menu met drie stippen () en klik vervolgens op Over pipet.
3.3 Grijper
De grijper verplaatst laboratoriumgerei door het hele werkgebied en staggebied tijdens de uitvoering van protocollen. De grijper wordt bevestigd aan de verlengingshouder, die gescheiden is van de pipetbevestigingen; de grijper kan met elke pipetconfiguratie worden gebruikt. Voor details over het installeren van de grijper, zie Instrumentinstallatie en kalibratie.
De grijper kan laboratoriummateriaal over het dek en op of van modules verplaatsen. De grijper kan bepaalde wellplaten met volledige omranding, deepwellplaten en tiprekken manipuleren. Voor meer details over welke labware de grijper kan bewegen, zie de sectie Labware en de Opentrons Flex Gripper van het hoofdstuk Labware, of raadpleeg de Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
57
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Grijper specificaties
De kaken voeren de primaire beweging van de grijper uit, namelijk het openen of sluiten van twee parallelle paddles om kracht uit te oefenen of los te laten op de zijkanten van laboratoriumgerei. De beweging van de kaken wordt geregeld door een 36 VDC-borstelmotor die is aangesloten op een tandheugeltandwielsysteem.
Om een stuk laboratoriumgerei dat door de kaken is vastgegrepen te verplaatsen, tilt het portaal de grijper op langs de z-as, verplaatst het lateraal en laat het vervolgens zakken naar de nieuwe positie van het laboratoriumgerei.
Locaties van componenten van de grijper.
Bevestigingsschroeven
Kalibratiepin Kaken Peddels
Grijper kalibratie
De grijper is voorzien van een metalen kalibratiepin. De kalibratiepin bevindt zich in een verzonken opbergruimte aan de onderkant van de grijper. Een magneet houdt de pin op zijn plaats. Om de kalibratiepin te verwijderen, pakt u deze met uw vingers vast en trekt u er voorzichtig aan. Om de pin te vervangen, plaatst u deze terug in de opbergsleuf. Je weet dat hij veilig zit als hij op zijn plaats klikt.
Wanneer u de grijper kalibreert, bevestigt u de pen om de beurt aan elke kaak. De robot verplaatst de pin naar kalibratiepunten op het dek om de exacte positie van de grijper te meten.
Tijdens protocolruns plaatst u de pin in de opslagruimte om deze veilig te bewaren. Neem contact met ons op via support@opentrons.com als u de kalibratiepin kwijtraakt.
Firmware-updates voor de grijper
Opentrons Flex werkt de grijperfirmware automatisch bij om deze gesynchroniseerd te houden met de robotsoftwareversie. Firmware-updates van Gripper zijn doorgaans snel en vinden plaats wanneer:
58
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Je bevestigt de grijper. De robot start opnieuw op.
Als uw grijperfirmware en robotsoftwareversies om welke reden dan ook niet meer synchroon lopen, kunt u de firmware handmatig bijwerken in de Opentrons-app.
1. Klik op Apparaten. 2. Klik op je Flex in de apparatenlijst. 3. Onder Instrumenten en modules toont de niet-gesynchroniseerde grijper een waarschuwingsbanner
“Firmware-update beschikbaar.” Klik op Nu bijwerken om de update te starten.
Je kan view de momenteel geïnstalleerde firmwareversie van de grijper. Ga op het touchscreen naar Instrumenten en tik op de grijper. Zoek in de Opentrons-app de grijperkaart onder Instrumenten en modules, klik op het menu met drie stippen () en klik vervolgens op Over grijper.
3.4 Noodstophanger
De noodstophanger (E-stop) is een speciale hardwareknop waarmee u de beweging van de robot snel kunt stoppen. Opentrons Flex vereist dat er te allen tijde een functionele, uitgeschakelde noodstop is bevestigd. Wanneer u op de stopknop drukt, annuleert Flex elk lopend protocol of de ingestelde workflow zo snel mogelijk en voorkomt het de meeste robotbewegingen.
Wanneer moet u de noodstop gebruiken?
Mogelijk moet u op de E-stop drukken:
Wanneer er een onmiddellijk risico bestaat op letsel of letsel voor een gebruiker. Wanneer er een onmiddellijk risico bestaat op schade aan de robot of andere hardware. Wanneer sampbestanden of reagentia lopen een onmiddellijk gevaar voor besmetting. Na een hardwarebotsing.
Idealiter hoeft u nooit op de E-stop te drukken (behalve tijdens zeldzame tests van de hardwarekwaliteit).
Gebruik de noodstop niet om normale, verwachte handelingen te annuleren. Gebruik in plaats daarvan de softwareknop op het touchscreen of in de Opentrons App. Als u softwarematig pauzeert, kunt u uw protocol hervatten of annuleren, terwijl het indrukken van de E-stop het protocol altijd onmiddellijk annuleert.
OPENTRONS FLEX
59
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
De E-stop in- en uitschakelen
De E-stop heeft een druk-om-in te schakelen en een draai-om los te laten-mechanisme.
Inschakelen: Druk stevig op de rode knop. Flex zal naar de gestopte status gaan. Oplossen: Zodra u bent gestopt, kunt u eventuele problemen in het werkgebied veilig aanpakken, zoals het opruimen van gemorst materiaal,
het verwijderen van laboratoriumgerei of het verplaatsen van het portaal (deze moet vrij en gemakkelijk met de hand kunnen bewegen). Loslaten: Draai de knop met de klok mee. Het zal omhoog springen naar de uitgeschakelde positie. Reset: Bevestig op het touchscreen of in de Opentrons-app dat u klaar bent om Flex te hervatten
beweging. Het portaal keert terug naar zijn uitgangspositie en de moduleactiviteit wordt hervat.
In de gestopte toestand gedragen Flex en aangesloten hardware zich als volgt:
Hardware portaalpipetten
Grijper
Verwarmings-schuddermodule
Temperatuurmodule Thermocycler-module Statuslampje Touchscreen
Gedrag
Geautomatiseerde horizontale beweging wordt stopgezet. Handmatige horizontale beweging is toegestaan.
De verticale beweging van pipetten wordt stopgezet. Om dit te voorkomen worden de motorremmen op de verticale assen ingeschakeld
pipetten vallen niet. De beweging van de plunjer en het oppakken van de tip worden gestopt.
De verticale beweging van de grijper wordt gestopt. De motorrem op de verticale as wordt ingeschakeld om te voorkomen dat de
grijper tegen vallen. De kaakmotoren die grijpkracht uitoefenen blijven dus ingeschakeld
de grijper laat de laboratoriumbenodigdheden die hij eventueel draagt niet vallen.
De shaker stopt en gaat naar huis. De laboratoriumbenodigdhedenvergrendeling gaat open. Verwarming is uitgeschakeld.
Verwarming of koeling is uitgeschakeld.
Verwarming of koeling is uitgeschakeld.
Het licht wordt rood.
Een annuleringsbericht neemt het scherm over. Een indicator op het scherm laat zien wanneer u succesvol bent
de stopknop uitgeschakeld.
60
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
3.5 Verbindingen
Aan/uit schakelaar
Zijkappen
USB-A-poorten
IEC-stroomingang
Poorten AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Stroomaansluiting
Opentrons Flex wordt aangesloten op een stroombron via een standaard IEC-C14-inlaat. De robot bevat een interne AC/DC-voeding met volledig bereik, die een invoer van 100 VAC, 240/50 Hz accepteert en deze omzet naar 60 VDC. Alle overige interne elektronica wordt gevoed door de 36 VDC-voeding.
Waarschuwing: Gebruik alleen het netsnoer dat bij de robot is geleverd. Gebruik geen netsnoer met onvoldoende stroom of volumetage beoordelingen.
Houd het netsnoer vrij van obstakels, zodat u het indien nodig kunt verwijderen.
Er is ook een CR1220-knoopcelbatterij om de realtime klok van de robot van stroom te voorzien wanneer deze niet op het lichtnet is aangesloten. De batterij bevindt zich in de behuizing van het touchscreen. Neem contact op met Opentrons Support voor meer informatie als u denkt dat u de batterij moet vervangen.
OPENTRONS FLEX
61
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
USB- en extra aansluitingen
Opentrons Flex heeft in totaal 10 USB-poorten in verschillende delen van de robot, die verschillende doeleinden dienen.
De 8 USB-A-poorten aan de achterkant (genummerd USB-1 tot en met USB-8) en 2 hulppoorten (M12-connectoren genummerd AUX-1 en AUX-2) zijn voor het aansluiten van Opentrons-modules en accessoires. Zie het hoofdstuk Modules voor meer informatie over het aansluiten van deze apparaten en het gebruik ervan in uw protocollen. De USB-B-poort aan de achterkant is bedoeld om de robot aan te sluiten op een laptop of desktopcomputer, om communicatie tot stand te brengen met de Opentrons-app die op de aangesloten computer draait. De USB-A-poort aan de voorzijde (USB-9), gelegen onder het aanraakscherm, heeft dezelfde functionaliteit als de USB-A-poorten aan de achterzijde.
Opmerking: De USB-poorten zijn stroombeperkt om de robot en aangesloten apparaten te beschermen. De stroomvoorziening is intern opgesplitst in drie poortgroepen: de USB-A-poorten linksachter (USB-1 tot en met USB-4), de USB-A-poorten rechtsachter (USB-5 tot en met USB-8) en de USB-A-poorten aan de voorkant. haven. Elk van deze groepen levert maximaal 500 mA aan aangesloten USB 2.0-compatibele apparaten.
Netwerkverbindingen
Opentrons Flex kan verbinding maken met een lokaal netwerk via een bekabelde (Ethernet) of draadloze (Wi-Fi) verbinding.
De Ethernet-poort bevindt zich aan de achterkant van de robot. Sluit hem aan op een Ethernet-hub of schakel uw netwerk in. Of sluit het, vanaf robotsysteemversie 7.1.0, rechtstreeks aan op een Ethernet-poort op uw computer. De interne Wi-Fi-module ondersteunt 802.11 ac/a/b/g/n-netwerken met een dual-band 2.4/5 GHz antenne.
62
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
3.6 Systeemspecificaties
Algemene specificaties
Afmetingen Gewicht Dekgleuven
Aanraakscherm
Wi-Fi Ethernet-USB
Voedingsingang camerarobot
Netvoeding voltage fluctuatie Fluctuatie van de frequentie van de netvoeding Distributiesysteem Kortsluitvoedingsstroom Framesamenstelling Raamsamenstelling Ventilatievereisten
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 inch (B, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-compatibele sleuven in werkgebied
(toegankelijk voor pipetten) 4 extra sleuven voor stagtips en laboratoriumbenodigdheden
(alleen toegankelijk voor de grijper) 7-inch LCD-touchscreen met kras- en schadebestendig Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n dual-band (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A-poorten 1 USB-B-poort USB 2.0-snelheid
2MP, foto en video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 Een
Ontwerp van stijf staal en CNC-aluminium
Verwijderbare polycarbonaat zijramen en voordeur. Minimaal 20 cm tussen de unit en een muur
OPENTRONS FLEX
63
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Vereisten voor aangesloten pc's
De Opentrons-app draait op: Windows 10 of hoger macOS 10.10 of hoger Ubuntu 12.04 of hoger
Milieuspecificaties
Omgevingsomstandigheden Omgevingstemperatuur Relatieve vochtigheid Vervuilingsgraad
Alleen voor gebruik binnenshuis +20 tot +25 °C (aanbevolen) 40%, niet-condenserend (aanbevolen) 60 (alleen niet-geleidende vervuiling)
Voor aanvullende informatie over acceptabele omgevingsomstandigheden voor gebruik en transport, zie het gedeelte Omgevingsomstandigheden in het hoofdstuk Installatie en verplaatsing.
Certificeringen
Certificeringen compleet Niet gecertificeerd/gevalideerd
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Een samenvatting van de certificeringsinformatie staat op een sticker op de achterkant van Flex, vlakbij de aan/uit-schakelaar. Voor gedetailleerde informatie over certificering en naleving, zie het gedeelte Naleving van regelgeving in de inleiding.
Serienummer
Elke Flex heeft een uniek serienummer. Het formaat van het serienummer biedt aanvullende informatie, waaronder de productiedatum van de robot. Bijvoorbeeldample, het serienummer FLXA1020231007001 zou het volgende aangeven:
64
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 3: SYSTEEMBESCHRIJVING
Tekens FLX A10 2023 10 07 001
Categorie Model Versie Jaar Maand Dag Eenheid
Betekenis De robot is een Opentrons Flex. Een code voor de productieversie van de robot. De robot is gemaakt in 2023. De robot is gemaakt in oktober. De robot is gemaakt op de 7e dag van de maand. Een uniek nummer voor robots die op een bepaalde dag zijn gemaakt.
Het serienummer van uw Flex kunt u vinden:
Op de certificeringssticker op de achterkant van Flex, vlakbij de aan/uit-schakelaar. Aan de achterkant van het touchscreen (in de richting van het werkgebied). In de Opentrons-app onder Apparaten > uw Flex > Robotinstellingen > Geavanceerd.
OPENTRONS FLEX
65
HOOFDSTUK 4
Modulen
Opentrons Flex kan worden geïntegreerd met een aantal Opentrons-hardwaremodules. Alle modules zijn randapparatuur die dekslots bezetten, en de meeste worden door de robot bestuurd via een USB-verbinding.
Dit hoofdstuk beschrijft de functies en fysieke specificaties van modules die compatibel zijn met het Opentrons Flex-systeem, en hoe u ze bevestigt en kalibreert. Raadpleeg de handleidingen van de afzonderlijke modules voor meer informatie over het instellen en gebruiken van modules. Voor details over het integreren van modules in uw protocollen, zie de sectie Protocolontwerper van het hoofdstuk Protocolontwikkeling of de online Python Protocol API-documentatie.
4.1 Ondersteunde modules
Opentrons Flex is compatibel met vier soorten Opentrons-modules op het dek:
De Heater-Shaker Module zorgt voor verwarming op het dek en orbitaal schudden. De module kan worden verwarmd tot 95 °C en kan worden geschudampvan 200 tot 3000 tpm.
Het magnetische blok is een passief apparaat dat laboratoriummateriaal dicht bij de krachtige neodymiummagneten houdt. De OT-2 magnetische module GEN1 en GEN2, die hun magneten actief op en neer bewegen ten opzichte van labware, worden niet ondersteund op Opentrons Flex.
De temperatuurmodule is een hete en koude plaatmodule die een stabiele temperatuur tussen 4 en 95 °C kan handhaven.
De Thermocycler-module biedt volledig geautomatiseerde thermocycling aan dek, waardoor automatisering van upstream- en downstream-workflowstappen mogelijk wordt. Thermocycler GEN2 is volledig compatibel met de grijper. Thermocycler GEN1 kan niet worden gebruikt met de grijper en wordt daarom niet ondersteund op Opentrons Flex.
Sommige modules die oorspronkelijk voor de OT-2 zijn ontworpen, zijn compatibel met Flex, zoals samengevat in de onderstaande tabel. Een vinkje geeft compatibiliteit aan en een X geeft incompatibiliteit aan.
66
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
Apparaattype en generatie Heater-Shaker-module GEN1 magnetische module GEN1 magnetische module GEN2 magnetisch blok GEN1 temperatuurmodule GEN1 temperatuurmodule GEN2 thermocycler-module GEN1 thermocycler-module GEN2 HEPA-module
OT-2
Buigen
×
×
×
×
×
×
4.2 Modulecaddy-systeem
Compatibele modules zijn ontworpen om te passen in caddies die ruimte onder het dek innemen. Met dit systeem kan laboratoriummateriaal bovenop de modules dichter bij het dekoppervlak blijven, en het maakt ook kabelgeleiding onder het dek mogelijk, zodat het dek netjes blijft tijdens uw protocolruns.
Caddies voor de Heater-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules.
OPENTRONS FLEX
67
HOOFDSTUK 4: MODULES
Om een module in het dekoppervlak te passen, moet deze eerst in de bijbehorende modulecaddy worden geplaatst. Elk type compatibele module heeft zijn eigen caddy-ontwerp dat de module en het laboratoriummateriaal nauwkeurig uitlijnt met het omringende dek. (De uitzondering is het magnetische blok, dat geen stroom of USB-kabelgeleiding vereist en dus direct op het dekoppervlak zit.) Caddies voor modules die één slot bezetten, kunnen overal in kolom 1 of 3 worden geplaatst; de Thermocycler kan alleen tegelijkertijd in slots A1 en B1 worden geplaatst.
Over het algemeen gaat u als volgt te werk om een modulecaddy te installeren:
1. Verwijder eventuele deksleuven van de locatie waar de module zal komen. 2. Plaats de module in de houder en draai de ankers vast. 3. Leid de stroom- en USB-kabels van de module door de zijpanelen, omhoog door de lege decksleuf, en
bevestig ze aan de module. 4. Plaats de modulecaddy in de sleuf en schroef deze op zijn plaats.
Raadpleeg voor exacte installatie-instructies de snelstartgids of instructiehandleiding voor de specifieke module. Kabelaansluitingen en wijze van bevestiging aan de caddy variëren per module.
4.3 Modulekalibratie
Wanneer u voor het eerst een module op Flex installeert, moet u een automatische positiekalibratie uitvoeren. Dit proces is vergelijkbaar met positionele kalibratie voor instrumenten en zorgt ervoor dat Flex naar de exact juiste locaties beweegt voor optimale protocolprestaties. Tijdens de kalibratie verplaatst Flex zich naar locaties op een modulekalibratie-adapter, die lijkt op de kalibratievierkanten die deel uitmaken van verwijderbare decksleuven.
Kalibratieadapters voor de Heater-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules.
Modulekalibratie is vereist voor alle modules die via een caddy worden geïnstalleerd: de Heater-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules. Het magnetische blok hoeft niet te worden gekalibreerd en is klaar voor gebruik zodra u het op het deck plaatst.
68
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
Wanneer modules kalibreren
Flex vraagt u automatisch om een kalibratie uit te voeren wanneer u een module aansluit en inschakelt die geen opgeslagen kalibratiegegevens heeft. (U kunt deze prompt negeren, maar u kunt geen protocollen uitvoeren met de module totdat u deze hebt gekalibreerd.)
Zodra u de kalibratie hebt voltooid, slaat Flex de kalibratiegegevens en het serienummer van de module op voor toekomstig gebruik. Flex zal u niet vragen om opnieuw te kalibreren, tenzij u de kalibratiegegevens voor die module verwijdert in de robotinstellingen. U kunt uw module vrijelijk in- en uitschakelen, of zelfs naar een ander deckslot verplaatsen, zonder dat u opnieuw hoeft te kalibreren. Als u opnieuw wilt kalibreren, kunt u het proces op elk gewenst moment starten vanaf de modulekaart in de Opentrons-app. (Herkalibratie is niet beschikbaar via het touchscreen.)
Modules kalibreren
Instructies op het touchscreen of in de Opentrons App begeleiden u door de kalibratieprocedure. Over het algemeen zijn de stappen:
1. Verzamel de benodigde apparatuur, inclusief de modulekalibratie-adapter en pipetkalibratiesonde. 2. Plaats de kalibratieadapter op het moduleoppervlak en zorg ervoor dat deze volledig waterpas staat.
Bij sommige modules moet u mogelijk de adapter aan de module bevestigen. 3. Sluit de kalibratiesonde aan op een pipet. 4. Flex beweegt automatisch om bepaalde punten op de kalibratieadapter aan te raken en deze op te slaan
kalibratiewaarden voor toekomstig gebruik.
Zodra de kalibratie is voltooid en u de adapter en sonde hebt verwijderd, is de module klaar voor gebruik in protocollen.
Op elk moment, kunt u view en beheer uw modulekalibratiegegevens in de Opentrons-app. Ga naar Robotinstellingen voor uw Flex en klik op het tabblad Kalibratie.
OPENTRONS FLEX
69
HOOFDSTUK 4: MODULES
4.4 Verwarmings-schuddermodule GEN1
Heater-Shaker-functies
VERWARMEN EN SCHUDDEN
De Heater-Shaker zorgt voor verwarming op het dek en orbitaal schudden. De module kan worden verwarmd tot 95 °C, met de volgende temperatuurprofile:
Temperatuurbereik: 37 °C Temperatuurnauwkeurigheid: ±95 °C bij 0.5 °C Temperatuuruniformiteit: ±55 °C bij 0.5 °CRamp snelheid: 10 °C/min
De module kan s schuddenamples van 200 tot 3000 tpm, met de volgende schudprofile:
Orbitale diameter: 2.0 mm Orbitale richting: Met de klok mee Snelheidsbereik: 200 rpm Snelheidsnauwkeurigheid: ±3000 rpm
De module is voorzien van een elektrische laboratoriumvergrendeling waarmee de platen vóór het schudden aan de module kunnen worden vastgezet.
70
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
THERMISCHE ADAPTERS Er is een compatibele thermische adapter vereist voor het toevoegen van laboratoriumbenodigdheden aan de Heater-Shaker. Adapters kunnen rechtstreeks bij Opentrons worden gekocht op https://shop.opentrons.com. Momenteel beschikbare thermische adapters zijn onder meer:
Universele platte adapter
PCR-adapter
Diepe putadapter
96 Platte bodemadapter
SOFTWARECONTROLE
De Heater-Shaker is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en de Python Protocol API. Dankzij de Python API kunnen bovendien andere protocolstappen parallel worden uitgevoerd terwijl de Heater-Shaker actief is. Zie Niet-blokkerende opdrachten in de API-documentatie voor details over het toevoegen van parallelle stappen aan uw protocollen.
Buiten de protocollen kan de Opentrons-app de huidige status van de Heater-Shaker weergeven en direct de verwarming, shaker en laboratoriumbenodigdheden bedienen.
OPENTRONS FLEX
71
HOOFDSTUK 4: MODULES
Heater-Shaker-specificaties
Afmetingen Gewicht Module-ingang Voedingsadapteringang Netvoeding voltage fluctuatie Overvoltage Stroomverbruik
152 × 90 × 82 mm (L/B/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Categorie II Inactief: 10 W
Typisch: Schudden: 4 W Verwarming: 11 W Verwarming en schudden: 10 W
Omgevingsomstandigheden Omgevingstemperatuur Relatieve vochtigheid Hoogte Vervuilingsgraad
Maximaal: 125 W Alleen voor gebruik binnenshuis 130 °C Tot 20%, niet-condenserend Tot 25 m boven zeeniveau 80
72
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
4.5 Magnetisch blok GEN1
Magnetische blokfuncties
Het Opentrons Magnetic Block GEN1 is een magnetische plaathouder met 96 wells. Magnetische blokken worden gebruikt in protocollen die afhankelijk zijn van magnetisme om deeltjes uit de suspensie te trekken en ze in putplaten vast te houden tijdens was-, spoel- of andere elutieprocedures. Bijvoorbeeldample, geautomatiseerde NGS-voorbereiding; het zuiveren van genomisch en mitochondriaal DNA, RNA of eiwitten; en andere extractieprocedures zijn allemaal gebruiksscenario's waarbij magnetische blokken betrokken kunnen zijn.
MAGNETISCHE COMPONENTEN
Het magnetische blok heeft geen stroom, bevat geen elektronische componenten en beweegt magnetische kralen niet omhoog of omlaag in oplossing. De putjes bestaan uit 96 zeer sterke neodymium-ringmagneten die zijn bevestigd aan een veerbelast bed, waardoor de toleranties tussen het blok en de pipetten behouden blijven terwijl geautomatiseerde protocollen worden uitgevoerd.
SOFTWARECONTROLE
Het Magnetic Block GEN1 is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en de Python Protocol API.
OPENTRONS FLEX
73
HOOFDSTUK 4: MODULES
Buiten de protocollen zijn het touchscreen en de Opentrons App echter niet op de hoogte van de huidige status van het Magnetic Block GEN1 en kunnen deze deze ook niet weergeven. Dit is een module zonder voeding. Het bevat geen elektronische of mechanische componenten die kunnen communiceren met de Flex-robot. U “bedient” het magnetische blok via protocollen die de Opentrons Flex Gripper gebruiken om labware aan deze module toe te voegen en te verwijderen.
Magnetische blokspecificaties
Afmetingen Gewicht Modulevermogen Magneetkwaliteit Omgevingscondities Omgevingstemperatuur Relatieve vochtigheid Hoogte Vervuilingsgraad
136 × 94 × 45 mm (L/B/H) 1.13 kg Geen, module heeft geen voeding N52 neodymium Alleen gebruik binnenshuis 20 °C 25%, niet-condenserend Tot 30 m boven zeeniveau 80
74
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
4.6 Temperatuurmodule GEN2
Functies van de temperatuurmodule
VERWARMING EN KOELING
De Opentrons Temperatuurmodule GEN2 is een hete en koude plaatmodule. Het wordt vaak gebruikt in protocollen die verwarming, koeling of temperatuurveranderingen vereisen. De module kan binnen enkele minuten temperaturen van 4 °C tot 95 °C bereiken en behouden, afhankelijk van de configuratie en inhoud van de module.
THERMISCHE BLOKKEN
Om laboratoriummateriaal op temperatuur te houden, maakt de module gebruik van aluminium thermische blokken. De module wordt geleverd met thermische blokken van 24 en 96 wells. De temperatuurmodule-caddy wordt geleverd met een diep putblok en een blok met vlakke bodem, ontworpen voor gebruik met de Flex Gripper. De blokken bevatten buisjes van 1.5 ml en 2.0 ml, PCR-platen met 96 putjes, PCR-strips, platen met diepe putjes en platen met platte bodem.
OPENTRONS FLEX
75
HOOFDSTUK 4: MODULES
Let op: De module wordt ook geleverd met een blok met vlakke bodem voor de OT-2. Gebruik het OT-2 blok niet met Flex. Het platte bodemblok voor Flex heeft de woorden “Opentrons Flex” op het bovenoppervlak. Die voor OT-2 niet.
Thermisch blok met 24 putjes
Thermisch blok met 96 putjes
Thermisch blok met diepe put
Thermisch blok met platte bodem voor Flex
WATERBADEN EN VERWARMING
Omdat lucht een goede thermische isolator is, kunnen openingen tussen laboratoriummateriaal en een thermisch blok de prestaties van de temperatuurmodule op het gebied van tijd tot temperatuur beïnvloeden. Door een beetje water in de thermische blokken met 24 of 96 putjes te plaatsen, worden luchtspleten geëlimineerd en wordt de verwarmingsefficiëntie verbeterd. De ideale hoeveelheid water hangt af van het thermische blok en laboratoriummateriaal. Zie het Witboek Temperatuurmodule voor verdere aanbevelingen.
SOFTWARECONTROLE
De temperatuurmodule is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en de Python Protocol API.
Buiten de protocollen kan de Opentrons-app de huidige status van de temperatuurmodule weergeven en direct de temperatuur van de oppervlakteplaat regelen.
76
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
Specificaties temperatuurmodule
Afmetingen Gewicht Modulevermogen
Omgevingsomstandigheden Omgevingstemperatuur Relatieve vochtigheid Hoogte Vervuilingsgraad
194 × 90 × 84 mm (L/B/H) 1.5 kg Ingang: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Uitgang: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Alleen gebruik binnenshuis <219.6 °C (aanbevolen voor optimale koeling ) Tot 22%, niet-condenserend Tot 60 m boven zeeniveau 2000
4.7 Thermocycler-module GEN2
OPENTRONS FLEX
77
HOOFDSTUK 4: MODULES
Thermocycler-functies
De Opentrons Thermocycler Module GEN2 is een volledig geautomatiseerde thermocycler op het dek, die handsfree PCR biedt in een plaatformaat met 96 putjes. Het verwarmde deksel en de wegwerpbare afdichting passen strak over de plaat en zorgen voor een efficiënte werkingamplage verwarming en minimale verdamping.
VERWARMEN EN KOELEN Het blok van de Thermocycler kan verwarmen en koelen, en het deksel kan verwarmen, met de volgende temperatuurprofile: Temperatuurbereik thermisch blok: 4 °C Maximale verwarming thermisch blok ramp snelheid: 4.25 °C/s van GEN2 omgevingstemperatuur tot 95 °C Thermisch blok maximale koeling ramp snelheid: 2.0 °C/s van 95 °C tot omgevingstemperatuur Bereik dekseltemperatuur: 37 °C Nauwkeurigheid dekseltemperatuur: ±110 °C Het geautomatiseerde deksel kan naar behoefte worden geopend of gesloten tijdens de uitvoering van het protocol.
THERMOCYCLER PROFILES De Thermocycler kan pro uitvoerenfiles: automatisch door een reeks bloktemperaturen bladeren om warmtegevoelige reacties uit te voeren.
RUBBEREN AUTOMATISERINGSAFDICHTINGEN De Thermocycler wordt geleverd met rubberen automatiseringsafdichtingen om verdamping te helpen verminderen. Elke afdichting moet vóór gebruik worden gesteriliseerd en kan voor meerdere runs worden gebruikt. Extra afdichtingen kunnen rechtstreeks bij Opentrons worden gekocht op https://shop.opentrons.com.
SOFTWAREBESTURING De Thermocycler is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en de Python Protocol API. Buiten de protocollen kan de Opentrons-app de huidige status van de Thermocycler weergeven en direct de bloktemperatuur, dekseltemperatuur en dekselpositie regelen.
78
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 4: MODULES
Thermocycler-specificaties
Afmetingen (deksel open) Afmetingen (deksel gesloten) Gewicht (inclusief achterkanaal) Voedingsadapter voltage Stroomadapter Overvoltage Omgevingsomstandigheden Omgevingstemperatuur Relatieve vochtigheid Hoogte Ventilatievereisten
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/B/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/B/H) 8.4 kg 100 V bij 240/50 Hz 60 A Categorie II Alleen voor gebruik binnenshuis 8.5 °C (ideaal); 5 °C (aanvaardbaar) 20%, niet-condenserend Tot 25 m boven zeeniveau Minimaal 2 cm / 40 tussen de unit en een muur
OPENTRONS FLEX
79
HOOFDSTUK 5
Laboratoriumbenodigdheden
Dit hoofdstuk behandelt items in de Opentrons Labware Library die u kunt gebruiken met Opentrons Flex en de Opentrons Flex Gripper. Het omvat ook aangepaste labware en, voor onze hoofdgebruikers, koppelt labware-componenten aan hun overeenkomstige JSON file definities.
U kunt laboratoriumbenodigdheden kopen bij de originele apparatuurfabrikanten of in de Opentrons-winkel op https://shop.opentrons.com. En Opentrons werkt altijd aan het verifiëren van nieuwe labware-definities. Zie de Labware Library (hierboven gelinkt) voor de nieuwste lijsten.
5.1 Laboratoriumbenodigdhedenconcepten
Labware omvat meer dan alleen de objecten die op het dek worden geplaatst en in een protocol worden gebruikt. Laten we dit onderwerp vanuit drie verschillende perspectieven bekijken, om u te helpen Opentrons-labware te begrijpen. Voor de Opentrons Flex omvat labware items in onze Labware-bibliotheek, gegevens die elk stuk labware definiëren, en aangepaste labware.
Laboratoriumbenodigdheden als hardware
De Labware Library bevat alles wat u standaard kunt gebruiken met Opentrons Flex. Dit zijn duurzame componenten en verbruiksartikelen waarmee u werkt, hergebruikt of weggooit terwijl u een protocol uitvoert. U hoeft geen speciale stappen te ondernemen om met de items in de Labware Library te werken. De Flex-robot weet automatisch met alles in de bibliotheek om te gaan.
Laboratoriumbenodigdheden als data
Labware-informatie wordt opgeslagen in Javascript-objectnotatie (JSON) files met .json file extensies. Een JSON file omvat ruimtelijke afmetingen (lengte, breedte, hoogte), volumetrische capaciteit (L, ml) en andere statistieken die oppervlaktekenmerken, hun vormen en locaties definiëren. Bij het uitvoeren van een protocol leest de Flex deze .json files om te weten welke laboratoriumbenodigdheden zich op het dek bevinden en hoe u ermee kunt werken.
80
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Aangepaste laboratoriumbenodigdheden
Aangepaste labware is labware die niet is opgenomen in de Labware-bibliotheek of labware is gemaakt door de Custom Labware Creator. Soms wordt het idee van op maat gemaakte laboratoriumapparatuur echter belast door noties van complexiteit, kosten of moeilijkheid. Maar op maat gemaakte labware hoeft niet moeilijk te begrijpen of te maken te zijn. Laten we even de tijd nemen om het concept van op maat gemaakte laboratoriumbenodigdheden uit te leggen.
Als exampZo bevat de Opentrons Labware Library platen met 96 putjes (200 L) van Corning en BioRad, maar andere fabrikanten maken deze putplaten ook. En dankzij algemeen aanvaarde industriestandaarden zijn de verschillen tussen deze alomtegenwoordige laboratoriumartikelen klein. Een gewone plaat van 200 liter en 96 putjes van Stellar Scientific, Oxford Lab of Krackeler Scientific (of welke andere leverancier dan ook) is echter “op maat gemaakte laboratoriumapparatuur” voor de Flex, omdat deze niet vooraf is gedefinieerd in onze Labware-bibliotheek. . Bovendien kunnen kleine verschillen in de afmetingen van laboratoriumapparatuur een drastische invloed hebben op het succes van uw protocoluitvoering. Om deze reden is het belangrijk om een nauwkeurige definitie van laboratoriummateriaal te hebben voor elk laboratoriummateriaal dat u in uw protocol wilt gebruiken.
Hoewel op maat gemaakte laboratoriumbenodigdheden een esoterisch, eenmalig onderdeel kunnen zijn, zijn het meestal alleen de tips, platen, buizen en rekken die dagelijks in laboratoria over de hele wereld worden gebruikt. Nogmaals, het enige verschil tussen Opentrons-labware en aangepaste labware is dat het nieuwe item niet vooraf is gedefinieerd in de software die de robot aandrijft. De Flex kan en werkt ook met andere standaard labware-items of iets unieks, maar u moet de kenmerken van dat item vastleggen in een JSON-labware-definitie file en importeer die gegevens in de Opentrons-app. Zie het gedeelte Aangepaste laboratoriumbenodigdhedendefinities hieronder voor meer informatie.
Samenvattend omvat labware het volgende:
Alles in de Opentrons Labware-bibliotheek. Labware-definities: gegevens in een JSON file die vormen, maten en mogelijkheden van individuele items definieert
zoals putplaten, tips, reservoirs, enz. Aangepaste laboratoriumbenodigdheden, dit zijn items die niet zijn opgenomen in de Labware-bibliotheek.
Na opnieuwviewLaten we, met het oog op deze belangrijke concepten, eens kijken naar de categorieën en items in de Opentrons Labware Library. Daarna sluiten we het hoofdstuk af met een overview van de datacomponenten van een labware file en vat de Opentrons-functies en -services samen die u helpen bij het maken van aangepaste labware.
OPENTRONS FLEX
81
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
5.2 Reservoirs
De Opentrons Flex werkt standaard met de hieronder genoemde single- en multi-well reservoirs. Het gebruik van deze reservoirs helpt u de last van het voorbereidende werk te verminderen, omdat ze direct uit de doos klaar zijn voor automatisering. Reservoirinformatie is ook beschikbaar in de Opentrons Labware Library.
Reservoirs met één put
Fabrikant specificaties
Behendig
290 ml V-bodem
Zuurstof
90 ml Platte bodem
NEST
195 ml Platte bodem
290 ml V-bodem
API-laadnaam
agilient_1_reservoir_290ml
axygen_1_ reservoir_90ml
nest_1_reservoir_195ml
nest_1_reservoir_290ml
Reservoirs met meerdere putten
Fabrikant specificaties
NEST
12 putjes 15 ml/putje V-bodem
VS Wetenschappelijk
12 putjes 22 ml/putje V-bodem
API-ladingsnaam nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml
82
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Reservoirs en API-definities
De Opentrons Labware Library definieert de kenmerken van de hierboven genoemde reservoirs in afzonderlijke JSON fileS. De robot en de Opentrons Python API vertrouwen op deze JSON-definities om te werken met labware die door uw protocollen wordt gebruikt. Bijvoorbeeldample, wanneer u met de API werkt, accepteert de functie ProtocolContext.load_labware deze labware-namen als geldige parameters in uw code. Gekoppelde API-laadnamen maken verbinding met de laboratoriumware-definities van het reservoir in de Opentrons GitHub-repository.
Laboratoriumbenodigdheden op maat
Probeer een aangepaste labware-definitie te maken met de Opentrons Labware Creator als een reservoir dat u wilt gebruiken hier niet wordt vermeld. Een aangepaste definitie combineert alle dimensies, metagegevens, vormen, volumetrische capaciteit en andere informatie in een JSON file. De Opentrons Flex heeft deze informatie nodig om te begrijpen hoe u met uw aangepaste laboratoriumapparatuur kunt werken. Zie de sectie Aangepaste laboratoriumbenodigdhedendefinities voor meer informatie.
5.3 Wellplaten
De Opentrons Flex werkt standaard met onderstaande putplaten. Het gebruik van deze putplaten helpt u de lasten van het voorbereidende werk te verminderen, omdat ze direct uit de doos klaar zijn voor automatisering. Bronplaatinformatie is ook beschikbaar in de Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
83
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Platen met 6 putjes
Fabrikant Corning
Specificaties
6 wells 16.8 ml/well Ronde wells, vlakke bodem
API-belastingsnaam corning_6_wellplate_16.8ml_flat
Platen met 12 putjes
Fabrikant Corning
Specificaties
12 wells 6.9 ml/well Ronde wells, vlakke bodem
API-belastingsnaam corning_12_wellplate_6.9ml_flat
Platen met 24 putjes
Fabrikant Corning
Specificaties
24 wells 3.4 ml/well Ronde wells, vlakke bodem
API-belastingsnaam corning_24_wellplate_3.4ml_flat
Platen met 48 putjes
Fabrikant Corning
Specificaties
48 wells 1.6 ml/well Ronde wells, vlakke bodem
API-belastingsnaam corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Platen met 96 putjes
Fabrikant Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
VS Wetenschappelijk
Specificaties
96 wells 200 µl/well Ronde wells, V-bodem
96 wells 360 µL/well Ronde wells, vlakke bodem
96 putjes 100 µl/putje Ronde putjes, PCR-volledige rok met V-bodem
96 wells 200 µL/well Ronde wells, vlakke bodem
96 diepe putjes 2000 µl/putje Vierkante putjes, V-bodem
Stevige 96 putjes, 200 µl/putje. Ronde putjes, PCR-volledige rok met V-bodem
Nunc 96 diepe putten 1300 µL/well Ronde putten, U-bodem
Nunc 96 diepe putten 2000 µL/well Ronde putten, U-bodem
96 diepe putjes 2.4 ml/putje Vierkante putjes, U-bodem
API-belastingsnaam biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_rok
thermowetenschappelijknunc_96_wellplate_ 1300ul thermowetenschappelijknunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Platen met 384 putjes
Fabrikant Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Specificaties
384 wells 40 µl/well Ronde wells, V-bodem
384 wells 50 µl/well Ronde wells, V-bodem
384 wells 112 µl/well Vierkante wells, vlakke bodem
API-laadnaam toegepastbiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Wellplaatadapters
De onderstaande aluminium platen zijn thermische adapters voor de Opentrons Heater-Shaker GEN1-module. U kunt deze stand-alone adapterdefinities gebruiken om door Opentron geverifieerde of aangepaste labware bovenop de Heater-Shaker te laden.
Adaptertype Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter
API-belastingsnaam opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
U kunt ook zowel de adapter als de labware met één definitie laden. Onze Labware-bibliotheek bevat verschillende vooraf geconfigureerde combinaties van thermische adapters en labware, waardoor de Heater-Shaker direct klaar is voor gebruik.
86
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Opmerking: Gebruik geen gecombineerde definitie als u tijdens uw protocol laboratoriummateriaal op of van de Heater-Shaker moet verplaatsen, met de grijper of handmatig. Gebruik in plaats daarvan een zelfstandige adapterdefinitie.
Adapter/laboratoriumcombinatie
API-laadnaam
Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker-adapter met NEST Deep Well-plaat 2 ml
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 Flat Bottom Heater-Shaker Adapter met NEST 96 Wells Plaat 200 µL Plat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Heater-Shaker-adapter met NEST-wellplaat 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentrons Universele Flat Heater-Shaker Adapter met Corning 384 Wells Plaat 112 µL Plat
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_wellplate_112ul_flat
Adapters kunnen rechtstreeks bij Opentrons worden gekocht op https://shop.opentrons.com.
Wellplaten en API-definities
De Opentrons Labware Library definieert de kenmerken van de hierboven genoemde putplaten in afzonderlijke JSON fileS. De Flex-robot en de Opentrons Python API vertrouwen op deze JSON-definities om te werken met labware die door uw protocollen wordt gebruikt. Bijvoorbeeldample, wanneer u met de API werkt, accepteert de functie ProtocolContext.load_labware deze labware-namen als geldige parameters in uw code. Gekoppelde API-belastingsnamen zijn verbonden met de labware-definities van de putplaten in de Opentrons GitHub-repository.
Op maat gemaakte laboratoriumbenodigdheden voor putplaten
Probeer de Opentrons Labware Creator te gebruiken om een aangepaste labware-definitie te maken als de putplaat die u wilt gebruiken hier niet wordt vermeld. Een aangepaste definitie combineert alle dimensies, metagegevens, vormen, volumetrische capaciteit en andere informatie in een JSON file. De Opentrons Flex leest deze informatie om te begrijpen hoe u met uw aangepaste laboratoriumbenodigdheden kunt werken. Zie de sectie Aangepaste laboratoriumbenodigdhedendefinities voor meer informatie.
OPENTRONS FLEX
87
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
5.4 Fooien en fooienrekken
Opentrons Flex-tips zijn verkrijgbaar in de maten 50 µL, 200 µL en 1000 µL. Dit zijn heldere, niet-geleidende polypropyleen tips die verkrijgbaar zijn met of zonder filters. Ze zijn steriel verpakt in rekken met plaats voor 96 tips en zijn vrij van DNase, RNase, protease, pyrogenen, menselijk DNA, endotoxinen en PCR-remmers. Rekken bevatten ook lotnummers en vervaldata.
Flex-pipettips werken met de Opentrons Flex 50 µL- en 1000 µL-pipetten in de 1-, 8- en 96-kanaalsconfiguraties. Hoewel u elk van de Flex-tips op de pipetten van 50 L en 1000 L kunt plaatsen, moet u proberen de tip aan te passen aan de nominale capaciteit van de pipet. BijvoorbeeldampZo kan het vreemd zijn om een tip van 1000 liter op de pipet van 50 liter te plaatsen. Voor de pipet van 1000 L kunt u zeker een tip van 50 L, 200 L of 1000 L gebruiken.
Fooienrekken
Ongefilterde en gefilterde tips worden gebundeld in een rek dat bestaat uit een herbruikbare basisplaat, een middenplaat met plaats voor 96 tips en een deksel.
Tiprek op volume 50 µL 200 µL 1000 µL
API-laadnaam
Ongefilterd: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Gefilterd: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Ongefilterd: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Gefilterd: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Ongefilterd: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Gefilterd: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Om de identificatie te vergemakkelijken, zijn de middenplaten van het tiprek voorzien van een kleurcode op basis van de tipgrootte:
50 µL: magenta 200 L: geel 1000 µL: blauw
88
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Bij het bestellen of opnieuw bestellen zijn de tips en rekken verkrijgbaar in twee verschillende verpakkingsconfiguraties:
Rekken: Bestaat uit afzonderlijk in krimpfolie verpakte tiprekken (basisplaat, middenplaat met tips en deksel). Configuraties in racks zijn het beste als reinheid van het grootste belang is, om kruisbesmetting te voorkomen, of als uw protocollen hergebruik van de basisplaat of componenten niet toestaan.
Navullingen: Bestaat uit één compleet tiprek (basisplaat, middenplaat met tips en deksel) en individuele tipcontainers. Navulconfiguraties zijn het beste wanneer uw protocollen hergebruik van de basisplaat of componenten toestaan.
Compatibiliteit met tippipetten
Flex pipettips zijn ontworpen voor de Opentrons Flex pipetten. Flex-tips zijn niet achterwaarts compatibel met Opentrons OT-2-pipetten, en u kunt ook geen OT-2-tips gebruiken op Flex-pipetten.
Andere industriestandaard tips kunnen ook werken met Flex-pipetten, maar dit wordt niet aanbevolen. Om optimale prestaties te garanderen, mag u alleen Opentrons Flex-tips met Flex-pipetten gebruiken.
Tiprekadapter
Voor de 96-kanaalspipet is een adapter nodig om een volledig rek met tips goed te kunnen bevestigen. Tijdens de bevestigingsprocedure beweegt de pipet over de adapter, laat zich op de bevestigingspinnen zakken en trekt de tips op de pipetten door de adapter en het tiprek op te tillen.
OPENTRONS FLEX
89
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Let op: Gebruik de tiprekadapter alleen als u een vol rek met tips in één keer oppakt. Plaats de fooienrekken direct op het dek als u minder fooien oppakt.
Waarschuwing: gevaar voor knelpunten. Houd uw handen uit de buurt van de tiprekadapter terwijl de pipet pipettips bevestigt.
Adaptertype Opentrons Flex 96 Tip Rackadapter
API-laadnaam opentrons_flex_96_tiprack_adapter
De tiprekadapter is compatibel met de Opentrons Flex Gripper. U kunt de grijper gebruiken om verse tiprekken op de adapter te plaatsen of om gebruikte tiprekken op te pakken en naar de afvalgoot te verplaatsen.
5.5 Buizen en buizenrekken
Het Opentrons 4-in-1 Tube Rack-systeem werkt standaard met de Opentrons Flex. Het gebruik van het 4-in-1 buizenrek helpt de last van het voorbereidende werk te verminderen, omdat de combinaties die het biedt, direct uit de doos klaar zijn voor automatisering. Meer informatie is ook beschikbaar in de Opentrons Labware Library.
90
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Buis- en rekcombinaties
Het Opentrons 4-in-1 buizenrek ondersteunt een grote verscheidenheid aan buisformaten, afzonderlijk of in verschillende maat- (volume)combinaties. Deze omvatten een: Rek met 6 buisjes voor buisjes van 50 ml (6 x 50 ml). Combinatierek met 10 buisjes voor vier buisjes van 50 ml en zes buisjes van 15 ml (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). Rek met 15 buisjes voor buisjes van 15 ml (15 x 15 ml). Rek met 24 buisjes voor buisjes van 0.5 ml, 1.5 ml of 2 ml (24 x 0.5 ml, 1.5 ml, 2 ml).
Opmerking: Alle buizen zijn cilindrisch met V-vormige (conische) bodems, tenzij anders aangegeven.
Rekken met 6 buizen
Buistype 6 Falcon 50 ml 6 NEST 50 ml
Rekken met 10 buizen
Buistype 4 Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml
API-laadnaam opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Rekken met 15 buizen
Buistype 15 Falcon 15 ml 15 NEST 15 ml
API-laadnaam opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
Rekken met 24 buizen
Tube type
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, U-vormige bodem 24 generieke schroefdop van 2 ml 24 NEST 0.5 ml schroefdop 24 NEST 1.5 ml schroefdop 24 NEST 1.5 ml klikdop 24 NEST 2 ml schroefdop 24 NEST 2 ml klikdop, U-vormige bodem
API-laadnaam opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
API-definities voor buizenrek
De Opentrons Labware Library definieert de kenmerken van de hierboven genoemde buisrekken in afzonderlijke JSON fileS. De Flex-robot en de Opentrons Python API vertrouwen op deze JSON-definities om te werken met labware die door uw protocollen wordt gebruikt. Bijvoorbeeldample, wanneer u met de API werkt, accepteert de functie ProtocolContext.load_labware deze labware-namen als geldige parameters in uw code. Gekoppelde API-belastingsnamen maken verbinding met de labware-definities van het buizenrek in de Opentrons GitHub-repository.
92
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Laboratoriumbenodigdheden op maat voor buizenrek
Probeer een aangepaste labware-definitie te maken met behulp van de Opentrons Labware Creator als de combinatie van buizen en racks die u wilt gebruiken hier niet wordt vermeld. Een aangepaste definitie combineert alle dimensies, metagegevens, vormen, volumetrische capaciteit en andere informatie in een JSON file. De Opentrons Flex leest deze informatie om te begrijpen hoe u met uw aangepaste laboratoriumbenodigdheden kunt werken. Zie de sectie Aangepaste laboratoriumbenodigdhedendefinities voor meer informatie.
5.6 Aluminium blokken
Aluminium blokken worden meegeleverd met de temperatuurmodule GEN2 en kunnen afzonderlijk worden aangeschaft als driedelige set. De set bevat een vlakke bodemplaat, een blok met 24 putjes en een blok met 96 putjes.
De Opentrons Flex maakt gebruik van aluminium blokken om s vast te houdenample buizen en putplaten op de temperatuurmodule of direct op het dek. Bij gebruik met de temperatuurmodule kunnen de aluminium blokken uw s bewarenampbuisjes, PCR-strips of platen bij een constante temperatuur tussen 4 °C en 95 °C.
Platte bodemplaat
De vlakke bodemplaat voor Flex wordt geleverd met de caddy van de temperatuurmodule en is compatibel met verschillende ANSI/SLAS-standaard wellplaten. Deze vlakke plaat verschilt van de plaat die wordt meegeleverd met de Temperatuurmodule zelf of de losse driedelige set. Het beschikt over een breder werkoppervlak en afgeschuinde hoekclips. Deze functies helpen de prestaties van de Opentrons Flex Gripper te verbeteren bij het verplaatsen van laboratoriumgerei naar of van de plaat.
Je kunt zien welke vlakke bodemplaat je hebt, omdat die voor Flex de woorden “Opentrons Flex” op het bovenoppervlak heeft. Die voor OT-2 niet.
OPENTRONS FLEX
93
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Aluminium blok met 24 putjes
Het blok met 24 putjes wordt gebruikt met individuele sampde flesjes. Bijvoorbeeldample, het accepteert sample flesjes die:
Heb V-vormige of U-vormige bodems. Beveilig de inhoud met klik- of schroefdopsluitingen. Houd vloeistof vast in capaciteiten van 0.5 ml, 1.5 ml en 2 ml.
Aluminium blok met 96 putjes
Het blok met 96 putjes ondersteunt een grote verscheidenheid aan typen putplaten. Bijvoorbeeldample, het accepteert putplaten die:
Van grote fabrikanten van putplaten zoals Bio-Rad en NEST.
Ontworpen met V-vormige bodems, U-vormige bodems of platte bodems.
Ontworpen met wells van 100 µl of 200 µl.
Het is ook compatibel met generieke PCR-strips.
Stand-alone adapters
Thermisch blok Flex vlakke bodemplaat Aluminium blok met 24 putjes Aluminium blok met 96 putjes
API-belastingsnaam opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Zie labware-combinaties hieronder. opentrons_96_well_aluminium_block
Laboratoriumcombinaties van aluminium blokken
De Opentrons Labware Library ondersteunt de volgende blok-, vial- en putplaatcombinaties, die ook zijn gedefinieerd in een afzonderlijke JSON-labware-definitie fileS. De Flex-robot en de Opentrons Python API
94
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
vertrouw op deze JSON-definities om te werken met labware die door uw protocollen wordt gebruikt. Bijvoorbeeldample, wanneer u met de API werkt, accepteert de functie ProtocolContext.load_labware deze labware-namen als geldige parameters in uw code. In de onderstaande tabellen worden de standaardblok-/containercombinaties en gerelateerde API-laadnamen vermeld. Links maken verbinding met overeenkomstige JSON-definities in de Opentrons GitHub-repository.
Let op: Alle buizen hebben een V-vormige bodem, tenzij anders aangegeven.
Laboratoriumcombinaties van aluminium blokken met 24 putjes
Inhoud blok met 24 putjes Generieke schroefdop van 2 ml NEST 0.5 ml schroefdop NEST 1.5 ml schroefdop NEST 1.5 ml klikdop NEST 2 ml schroefdop NEST 2 ml klikdop, U-vormige bodem
Naam API-lading opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_n est_2ml_snapcap
Laboratoriumcombinaties van aluminium blokken met 96 putjes
Inhoud blok met 96 putjes Bio-Rad wellplaat 200 µL Generieke PCR-strip 200 µL NEST wellplaat 100 µL
API-belastingsnaam opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
5.7 Laboratoriumbenodigdheden en de Opentrons Flex Gripper
Hoewel de Opentrons Flex werkt met alle inventaris in de Labware-bibliotheek, is de Opentrons Flex Gripper alleen compatibel met specifieke labware-items. Momenteel is de Gripper geoptimaliseerd voor gebruik met de volgende labware-items.
Categorie Laboratoriumbenodigdheden Diepe wellplaten Volledig omrande platen met 96 wells
Tiprekken (ongefilterde en gefilterde tips)
Merken
NEST 96 diepe putplaat 2 ml
Opentrons Tough-plaat met 96 putjes, 200 µl PCR-volledige rok NEST-plaat met 96 putjes, 200 µl plat
Opentrons Flex 96 Tiprek 50 µL Opentrons Flex 96 Tiprek 200 µL Opentrons Flex 96 Tiprek 1000 µL
Opmerking: Voor de beste resultaten gebruikt u de Flex Gripper alleen met het hierboven genoemde laboratoriumgerei. De Flex Gripper werkt mogelijk met andere laboratoriumapparatuur die voldoet aan ANSI/SLAS-automatisering, maar dit wordt niet aanbevolen.
5.8 Aangepaste labware-definities
Zoals aan het begin van dit hoofdstuk is besproken, is aangepaste laboratoriumware laboratoriumware die niet in de Opentrons Labware-bibliotheek staat. U kunt andere veel voorkomende of unieke labware-items gebruiken met de Flex door de kenmerken van dat object nauwkeurig te meten en vast te leggen en die gegevens op te slaan in een JSON file. Wanneer de Flex en de API in de app worden geïmporteerd, gebruiken ze die JSON-gegevens om met uw labware te communiceren. Opentrons biedt tools en diensten, die we hieronder zullen onderzoeken, om u te helpen de Flex te gebruiken met aangepaste laboratoriumapparatuur.
96
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Aangepaste labware-definities maken
De tools en services van Opentron helpen aangepaste laboratoriumapparatuur binnen uw bereik te brengen. Deze functies zijn geschikt voor verschillende vaardigheidsniveaus en manieren van werken. Door uw eigen labware te maken en deze te gebruiken met de Opentrons Flex, wordt de robot een veelzijdige en krachtige aanvulling op uw laboratorium.
AANGEPASTE LABWARE-CREATOR
De Custom Labware Creator is een programma zonder code, web-gebaseerd hulpmiddel dat een grafische interface gebruikt om u te helpen een labware-definitie te maken file. Labware Creator produceert een JSON-labware-definitie file die u importeert in de Opentrons App. Daarna is uw aangepaste labware beschikbaar voor de Flex-robot en de Python API.
AANGEPASTE LABWARE-SERVICE
Neem contact met ons op als de labware die u wilt gebruiken niet beschikbaar is in de bibliotheek, als u niet uw eigen definities kunt maken, of omdat een aangepast item verschillende vormen, maten of andere onregelmatigheden bevat die hieronder worden beschreven.
Labware kunt u definiëren in Labware Creator
; Wells en buizen zijn uniform en identiek. ; Alle rijen zijn gelijkmatig verdeeld
(de ruimte tussen de rijen is gelijk).
; Alle kolommen zijn gelijkmatig verdeeld (de ruimte tussen de kolommen is gelijk).
; Past perfect in één decksleuf.
Labware Opentrons moet definiëren; De vormen van putten en buizen variëren. ; De rijen zijn niet gelijkmatig verdeeld.
; Kolommen zijn niet gelijkmatig verdeeld.
; Kleiner dan één deksleuf (vereist adapter) of omspant meerdere deksleuven.
OPENTRONS FLEX
97
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
Hier zijn enkele diagrammen die u helpen de ex te visualiserenamphierboven beschreven. Normaal Alle kolommen zijn gelijkmatig verdeeld en alle rijen zijn gelijkmatig verdeeld. Kolommen hoeven niet dezelfde afstand te hebben als rijen.
Normaal Het rooster hoeft niet in het midden van de labware te liggen.
Onregelmatige rijen zijn gelijkmatig verdeeld, maar kolommen zijn niet gelijkmatig verdeeld.
Onregelmatig Kolommen/rijen zijn gelijkmatig verdeeld, maar de putten zijn niet identiek.
Onregelmatig Er is meer dan één raster.
Ons labware-team zal proberen uw behoeften te begrijpen en aangepaste labware-definities voor u ontwerpen. Zie de ondersteuningsartikelen Een aangepaste Labware-definitie aanvragen en het Custom Labware-aanvraagformulier voor meer informatie. Dit is een betaalde dienst.
98
OPENTRONS FLEX
HOOFDSTUK 5: LABONDERDELEN
PYTHON-API
Hoewel u geen aangepaste labware kunt maken met onze API, kunt u aangepaste labware gebruiken met de beschikbare API-methoden. U moet echter eerst uw aangepaste labware definiëren en deze in de Opentrons-app importeren. Zodra u uw labware aan de Opentrons-app heeft toegevoegd, is deze beschikbaar voor de Python API en de robot. Zie de sectie Aangepaste Labware-definities van de Python API-documentatie voor meer informatie. Voor informatie over het schrijven van protocolscripts met de API, zie de sectie Python Protocol API in het hoofdstuk Protocolontwikkeling.
JSON labware-schema
Een JSON file is de blauwdruk voor Opentrons standaard en aangepaste labware. Dit file bevat en organiseert labware-gegevens volgens de ontwerpspecificaties die zijn ingesteld door het standaardschema.
Een schema is een frame
Documenten / Bronnen
![]() | opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source vloeistofbehandelingsrobot [pdf] Gebruiksaanwijzing FLEX Opentrons Flex Open Source Robot voor vloeistofbehandeling, FLEX, Opentrons Flex Open Source Robot voor vloeistofbehandeling, Flex Open Source Robot voor vloeistofbehandeling, Open Source Robot voor vloeistofbehandeling, Source Liquid Handling Robot, Robot voor vloeistofbehandeling, Handling Robot, Robot |