FLEX Opentrons Flex Open Source vätskehanteringsrobot

Opentrons Flex

Specifikationer:

  • Allmänna specifikationer: Lorem ipsum dolor sitta
    amet, consectetur adipiscing elit. Sed gör eiusmod tempor incididunt
    ut labore et dolore magna aliqua.
  • Miljöspecifikationer: Lorem ipsum
    dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed gör eiusmod tempor
    incididunt ut labore et dolore magna aliqua.
  • Certifieringar: Lorem ipsum dolor sit amet,
    consectetur adipiscing elit. Sed gör eiusmod tempor incididunt ut
    labore et dolore magna aliqua.
  • Serienummer: XXX-XXXX-XXXX

Produktanvändningsinstruktioner:

1. Instrumentinstallation och kalibrering:

Följ stegen som beskrivs i manualen för pipett och gripare
installation.

2. Omlokalisering:

För korta drag, se avsnitt 2.5 i manualen. För
långdistansförflyttningar, följ de angivna riktlinjerna. Allmän flytt
råd finns också.

3. Anslutningar:

Säkerställ korrekt strömanslutning enligt beskrivningen i manualen.
Anslut USB och extra enheter efter behov. Nätverksanslutningar
bör upprättas enligt instruktionerna.

4. Protokolldesigner:

Förstå kraven för Protocol Designer och lär dig hur
att designa nya protokoll eller modifiera befintliga enligt ditt labb
krav.

5. Python Protocol API:

Utforska att skriva och köra skript med Python Protocol API.
Upptäck Python-exklusiva funktioner för förbättrad funktionalitet.

6. OT-2-protokoll:

Lär dig mer om OT-2 Python-protokoll, OT-2 JSON-protokoll och
Magnetiska modulprotokoll för olika typer av experiment.

Vanliga frågor (FAQ):

F: Hur felsöker jag om roboten inte rör sig som
förväntat?

A: Kontrollera strömanslutningen, se till att den är korrekt kalibrerad
instrument och verifiera att det inte finns några hinder i
robotens väg.

F: Kan jag använda anpassade pipetter med Opentrons Flex?

S: Opentrons rekommenderar att du använder kompatibla pipetter för optimal
prestanda och noggrannhet.

"`

Opentrons Flex
Instruktionsmanual
Opentrons Labworks Inc.
december 2023

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Registrerade namn, varumärken etc. som används i detta dokument, även när de inte är specifikt markerade som sådana, ska inte anses vara oskyddade enligt lag.

Innehållsförteckning
Förord ​​. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Denna handboks uppbyggnad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Anmärkningar och varningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Kapitel 1: Inledning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Välkommen till Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Vad är nytt i Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flexarbetsplatser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Säkerhetsinformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Säkerhetssymboler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elsäkerhetsvarningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Ytterligare säkerhetsvarningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Säkerhetsföreskrifter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologisk säkerhet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Giftiga ångor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Brandfarliga vätskor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Regelefterlevnad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Säkerhet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetisk kompatibilitet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC-varningar och anmärkningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kanada ISED-efterlevnad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Miljövarning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi-förcertifiering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Kapitel 2: Installation och flytt . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Säkerhets- och driftskrav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Placering av Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Strömförbrukning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Miljöförhållanden . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Uppackning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Ansträngning och tid som krävs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Lådor och förpackningsmaterial . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Produktelement . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Del 1: Ta bort lådan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Del 2: Släpp flexen. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Del 3: Slutmontering och ström på . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 Första körningen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Ström på . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Anslut till ett nätverk eller en dator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Installera programuppdateringar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Fäst nödstoppshängare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Ge din robot ett namn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instrumentinstallation och kalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipettinstallation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Installation av gripdon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Omlokalisering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Korta drag. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Långdistansrörelser . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Allmänna flyttråd . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Sista tankar om att flytta. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Kapitel 3: Systembeskrivning. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fysiska komponenter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Ram och kapsling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Däck och arbetsområde . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging område. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Däcksarmatur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Avfallsnedkast. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging area slitsar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Rörelsesystem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Pekskärm och LED-skärmar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipetter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipettspecifikationer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipettkalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipettspets rackadapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Hämtning av partiell dricks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipettsensorer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipettera firmwareuppdateringar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Gripdon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Gripspecifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibrering av gripdon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripper firmwareuppdateringar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Nödstoppslampa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 När ska nödstoppet användas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Aktivera och släppa nödstoppet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Anslutningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Strömanslutning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB- och extraanslutningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Nätverksanslutningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Systemspecifikationer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Allmänna specifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Miljöspecifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certifieringar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serienummer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Kapitel 4: Moduler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Moduler som stöds . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modulcaddiesystem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Modulkalibrering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 När moduler ska kalibreras . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Hur man kalibrerar moduler . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Heater-Shaker Modul GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker funktioner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker-specifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetblock GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetblocksfunktioner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specifikationer för magnetblock . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperaturmodul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperaturmodulfunktioner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperaturmodulspecifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Termocyklermodul GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Termocyklerfunktioner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Termocyklerspecifikationer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Kapitel 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Labware-koncept. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware som hårdvara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware som data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Anpassad labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Reservoarer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer med en brunn . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer med flera brunnar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoarer och API-definitioner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Anpassad reservoar labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Brunnsplattor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

6-brunnars tallrikar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-brunnars tallrikar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-brunnars tallrikar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-brunnars tallrikar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-brunnars tallrikar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-brunnars tallrikar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Brunnsplatta adaptrar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Brunnsplattor och API-definitioner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Anpassad brunnsplatta labware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Spetsar och spetsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Spetsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tippipette-kompatibilitet . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adapter för spetsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Rör och rörställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinationer av rör och stativ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6-rörsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 st 10-rörsställ. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15-rörsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24-rörsställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 API-definitioner för rörställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Anpassad laboratorieutrustning för rörställ . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminiumblock . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Platt bottenplatta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-brunnars aluminiumblock . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-brunnars aluminiumblock . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Fristående adaptrar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinationer av aluminiumblock . . . . . . . . . . . . . . . .94 24-brunnars kombinationer av laboratoriematerial av aluminiumblock . . . . . . . . .95 96-brunnars kombinationer av laboratoriematerial av aluminiumblock . . . . . . . . .95 5.7 Labware och Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Anpassade definitioner av labbprogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Skapa anpassade definitioner av labbprogram . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON labware-schema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON labware definitioner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Kapitel 6: Protokollutveckling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Färdiga protokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protokollbibliotek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Service för utveckling av anpassade protokoll . . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Protokolldesigner. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolldesignerkrav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Designa ett protokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Ändra befintliga protokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Skriva och köra skript . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Python-exklusiva funktioner . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2-protokoll. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python-protokoll. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON-protokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetmodulprotokoll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Kapitel 7: Programvara och drift. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Pekskärmsdrift. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Robotinstrumentpanel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protokollhantering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protokolldetaljer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Kör installationen . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Labware positionskontroll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Körförlopp. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Slutförande av körning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Instrumenthantering. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Robotinställningar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Däckkonfiguration . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Appinstallation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Överföra protokoll till Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Modulstatus och kontroller . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Senaste protokollkörningar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Avancerad användning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Kommandoradsoperation över SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Kapitel 8: Underhåll och service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Rengöra din Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Innan du börjar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Vad du kan rengöra . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Rengöringslösningar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Rengöring av karm och fönsterpanel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Däcksrengöring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Gantry rengöring. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Rengöring av avfallsnedkast. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Rengöring av pipetter och spetsar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pipettsanering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Rengöring av pipettspetsar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Rengöring av gripdon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Rengöringsmoduler. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Allmän modulrengöring . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler tätningar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Autoklavsäker labbutrustning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Service Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons tjänster . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Installationskvalifikation och driftkvalifikation . . . 155 Förebyggande underhåll . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garanti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Bilaga A: Ordlista . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Bilaga B: Ytterligare dokumentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API-dokumentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API-referens. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Utvecklardokumentation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Bilaga C: Programvara med öppen källkod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons på GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Andra förvar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Bilaga D: Support och kontaktinformation . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Försäljning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Support . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Företagsinformation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Förord
Välkommen till bruksanvisningen för Opentrons Flex vätskehanteringsrobot. Den här manualen guidar dig genom nästan allt du behöver veta för att ställa in och använda Flex, med fokus på ämnen som är mest relevanta för vardagliga användare av Flex i en labbmiljö.
Denna manuals uppbyggnad
Opentrons Flex är ett komplext system, så det finns många olika vägar till att lära sig allt det kan göra. Hoppa gärna direkt till kapitlet som tar upp vilket ämne du än är nyfiken på! Till exempelample, om du redan har en Flex-inställning i ditt labb, kan du hoppa förbi kapitlet Installation och flytt.
Om du föredrar ett guidat tillvägagångssätt är den här manualen uppbyggd så att du kan följa den från början till slut.
Lär dig mer om Flex. De utmärkande egenskaperna hos Flex listas i kapitel 1: Introduktion. Introduktionen innehåller också viktig information om säkerhet och föreskrifter.
Kom igång med Flex. Om du behöver ställa in din Flex, följ de detaljerade instruktionerna i kapitel 2: Installation och flytt. Bekanta dig sedan med komponenterna i Flex i kapitel 3: Systembeskrivning.
Sätt upp ditt däck. Konfigurering av kortleken möjliggör olika vetenskapliga tillämpningar på Flex. Kapitel 4: Moduler beskriver Opentrons kringutrustning som du kan installera i eller ovanpå däcket för att utföra specifika vetenskapliga uppgifter. Kapitel 5: Labware förklarar hur man arbetar med utrustning för att hålla vätskor.
Kör ett protokoll. Kärnanvändningen av Flex är att köra standardiserade vetenskapliga procedurer, så kallade protokoll. Kapitel 6: Protokollutveckling erbjuder flera sätt att skaffa färdiga protokoll eller designa dem själv. För att köra ditt protokoll, följ instruktionerna i kapitel 7: Programvara och drift, som också innehåller instruktioner för att utföra andra uppgifter och anpassa din robots inställningar.
Håll Flex igång. Följ råden i kapitel 8: Underhåll och service för att hålla din Flex ren och fungera optimalt. Eller registrera dig för någon av Opentrons-tjänsterna som finns listade där och låt oss ta hand om Flex åt dig.
Lär dig ännu mer. Behöver du fortfarande något annat? Se bilagorna. Bilaga A: Ordlista definierar Flex-relaterade termer. Bilaga B: Ytterligare dokumentation pekar på ännu fler resurser för Opentrons produkter och att skriva kod för att styra Flex.

OPENTRONS FLEX

9

FÖRORD
Appendix C: Programvara med öppen källkod förklarar hur Opentrons programvara är värd på GitHub som en resurs för både utvecklare och icke-utvecklare.
Bilaga D: Support och kontaktinformation listar hur du kommer i kontakt med Opentrons om du behöver hjälp utöver vad vår dokumentation tillhandahåller.
Anteckningar och varningar
I den här handboken hittar du specialformaterade antecknings- och varningsblock. Anteckningar ger användbar information som kanske inte är uppenbar under den vanliga användningen av Flex. Var särskilt uppmärksam på varningar – de används endast i situationer där du löper risk för personskador, skador på utrustning, förlust eller förstörelse av s.ampfiler eller reagens, dataförlust eller annan skada. Anteckningar och varningar ser ut så här:
Sample Notera: Detta är något du borde veta, men det utgör ingen fara.
Sample Varning: Detta är något du behöver veta eftersom det finns risker med det.

10

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1
Introduktion

Det här kapitlet introducerar dig till Opentrons Flex-ekosystemet, inklusive den övergripande systemdesignen och tillgängliga arbetsstationskonfigurationer. Den innehåller också viktig efterlevnads- och säkerhetsinformation, som du bör se omview innan du ställer in din Opentrons Flex-robot. För mer information om funktionerna hos Opentrons Flex, se kapitlet Systembeskrivning.

1.1 Välkommen till Opentrons Flex
Opentrons Flex är en vätskehanteringsrobot designad för hög genomströmning och komplexa arbetsflöden. Flex-roboten är basen i ett modulärt system som inkluderar pipetter, en gripare för laboratorier, däcksfixturer, moduler på däck och labware – allt som du kan byta ut själv. Flex är designad med en pekskärm så att du kan arbeta med den direkt vid labbbänken, eller så kan du styra den från hela ditt labb med Opentrons-appen eller våra API:er med öppen källkod.
Flex-arbetsstationer levereras med all utrustning – robot, hårdvara och labware – som du behöver för att komma igång med att automatisera vanliga labbuppgifter. För andra applikationer körs Opentrons Flex på helt öppen källkod och firmware, och är reagens- och labware-agnostisk, vilket ger dig kontroll över hur du designar och kör dina protokoll.

Vad är nytt i Flex
Opentrons Flex är en del av Opentrons vätskehanteringsserie av robotar. Användare av Opentrons Flex kanske känner till Opentrons OT-2, vår personliga pipetteringsrobot. Flex går utöver OT-2:s möjligheter inom flera nyckelområden och ger högre genomströmning och gångtid.

Funktion Pipettgenomströmning
Pipett- och spetskapacitet

Beskrivning
Flexpipetter har 1, 8 eller 96 kanaler. 96-kanalspipetten fungerar på 12 gånger så många brunnar på en gång som den största OT-2-pipetten.
Flexpipetter har större volymområden (1 µL, 50 5 µL) och kan alla fungera med vilken volym som helst av Opentrons Flex-spetsar. Detta är en förbättring jämfört med OT-1000-pipetter, som har mindre intervall och måste använda spetsar med ett matchande volymintervall.

OPENTRONS FLEX

11

KAPITEL 1: INLEDNING

Gripper Automatiserad kalibrering Pekskärm Modulcaddies Däcksplatskoordinater Flyttbart skräp Storlek och vikt

Opentrons Flex Gripper plockar upp och flyttar labware runt däcket automatiskt, utan användaringripande. Griparen möjliggör mer komplexa arbetsflöden inom en enda protokollkörning.
Positionskalibrering av Flex-pipetter och griparen är helt automatiserad. Tryck på en knapp så flyttas instrumentet till precisionsbearbetade punkter på däcket för att bestämma dess exakta position och sparar dessa data för användning i dina protokoll.
Flex har ett eget pekskärmsgränssnitt som låter dig styra det direkt, förutom att använda Opentrons App. Använd pekskärmen för att starta protokollkörningar, kontrollera jobbstatus och ändra inställningar direkt på roboten.
Flexmoduler passar in i caddies som tar plats under däck. Caddies placerar din laboratorieutrustning närmare däcksytan och möjliggör kabeldragning under däck. Caddies möjliggör ännu fler modul- och laboratoriekonfigurationer på däcket.
Däcksluckor på Flex är numrerade med ett koordinatsystem (A1D4) som liknar hur brunnar numreras på labb.
Papperskorgen kan placeras på flera däcksplatser på Flex. Standardplatsen (fack A3) är den rekommenderade positionen. Du kan också använda griparen för att slänga skräp i den valfria avfallsnedkastet.
Flex är lite större och mycket tyngre än OT-2. Installationsuppgifter på Flex kräver hjälp av en labbpartner.

En detaljerad jämförelse av robotens tekniska specifikationer finns på Opentrons webplats.
Både Flex- och OT-2-robotar körs på vår programvara med öppen källkod, och Opentrons-appen kan styra båda typerna av robotar samtidigt. Även om OT-2-protokoll inte kan köras direkt på Flex, är det enkelt att anpassa dem (se avsnittet OT-2-protokoll i kapitlet Protocol Development för detaljer).

Flex arbetsstationer
Opentrons Flex-arbetsstationer inkluderar Flex-roboten, tillbehör, pipetter och gripdon, moduler på däck och labware som behövs för att automatisera en viss applikation. Alla arbetsstationskomponenter är modulära. Om du behöver ändra applikationer kan du lägga till eller byta in annan Flex-hårdvara och kompatibla förbrukningsartiklar.

12

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1: INLEDNING
NGS WORKSTATION
Opentrons Flex NGS Workstation automatiserar NGS-biblioteksförberedelser. Den kan automatisera försekvenseringsarbetsflöden med hjälp av alla ledande reagenssystem, inklusive fragmenterings- och tagmentionsbaserad biblioteksförberedelse.
Förutom Flex-roboten innehåller NGS Workstation:
Gripare Val av pipettkonfiguration
Två 8-kanals pipetter (1 µL och 50 5 µL) 1000-kanals pipett (96 5 µL) avfallsrör magnetblock temperaturmodul termocyklermodul Labware kit med filterspetsar, mikrocentrifugrör, reservoarer och PCR-plattor
PCR-ARBETSSTATION
Opentrons Flex PCR Workstation automatiserar PCR-inställning och termocykliska arbetsflöden i upp till 96 samples. Den kan alikvotera kylda reagenser och sampin i en 96-brunnars PCR-platta. Med tillägget av den automatiserade Thermocycler-modulen, använd griparen för att ladda plattan i Thermocycler och kör sedan ditt valda PCR-program.
Förutom Flex-roboten innehåller PCR-arbetsstationen:
Gripare Val av pipettkonfiguration
1-kanals pipett (1 µL) och 50-kanals pipett (8 µL) 1-kanals pipett (50 96 µL) avloppsrörstemperaturmodul Labware-kit med filterspetsar, mikrocentrifugrör, reservoarer och PCR-plattor

OPENTRONS FLEX

13

KAPITEL 1: INLEDNING
ARBETSSTATION FÖR EXTRAKTION AV NUKLEINSYRA
Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation automatiserar DNA/RNA-isolering och rening. Den använder magnetblocket för separation av magnetiska pärlor och Heater-Shaker för s.ample lys och resuspension av magnetiska pärlor.
Förutom Flex-roboten inkluderar Nucleic Acid Extraction Workstation:
Gripare Val av pipettkonfiguration
1-kanals pipett (5 1000 µL) och 8-kanals pipett (5 1000 µL) 96-kanals pipett (5 1000 µL) Magnetic Block Heater-Shaker Modul för avfallsrör med filterspetsar, reservoarer, PCR-plattor och plattor med djupa brunnar
MAGNETISK PÄRLPROTEINRENINGSARBETSSTATION
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatiserar småskalig proteinrening och proteomicsampFörbered dig i upp till 96 samples. Den är kompatibel med många populära magnetiska pärlor-baserade reagenser.
Förutom Flex-roboten inkluderar Protein Purification Workstation:
Gripare Val av pipettkonfiguration
1-kanals pipett (5 1000 µL) och 8-kanals pipett (5 1000 µL) 96-kanals pipett (5 1000 µL) Magnetic Block Heater-Shaker Modul för avfallsrör med filterspetsar, reservoarer, PCR-plattor och plattor med djupa brunnar
FLEX PREP WORKSTATION
Opentrons Flex Prep Workstation automatiserar enkla pipetteringsarbetsflöden. Konfigurera arbetsstationen med 1-kanals- och 8-kanalspipetter för att utföra uppgifter som t.ex.ample överlåtelse, sample dubbelarbete, och

14

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1: INLEDNING
reagensalikvotering. Konfigurera arbetsstationen med 96-kanalspipetten för att utföra reagensalikvotering med hög genomströmning och plattstämplingamping.
Förutom Flex-roboten innehåller Flex Prep Workstation:
Val av pipettkonfiguration: 1-kanalspipett (5 1000 µL) och 8-kanalspipett (5 1000 µL) 96-kanalspipett (5 1000 µL)
Labware kit med filterspetsar, mikrocentrifugrör och reservoarer
PLASMID PREP ARBETSSTATION
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatiserar magnetiska pärlor-baserade plasmidextraktion och reningsarbetsflöden. Denna arbetsstation är utrustad med pipetter med hög volym, en Heater-Shaker-modul och ett magnetiskt block för att rymma de flesta pärlbaserade kemi.
Förutom Flex-roboten innehåller Plasmid Prep Workstation:
Gripper 1-kanalspipett (5 1000 µL) och 8-kanals pipett (5 1000 µL) Magnetic Block Heater-Shaker Module Labware kit med filterspetsar, mikrocentrifugrör, reservoarer, PCR-plattor och djupbrunnsplattor
SYNBIO WORKSTATION
Opentrons Flex SynBio Workstation automatiserar en mängd olika syntetiska biologiska arbetsflöden som DNA-syntes och kloning. Den använder magnetblocket och temperaturmodulen för att stödja det mesta av pärlbaserad kemi. Lägg till Thermocycler-modulen för att utföra uppvärmda lockinkubationer och amplifikationer.
Förutom Flex-roboten innehåller SynBio Workstation:
Gripper 1-kanalspipett (5 1000 µL) och 8-kanals pipett (5 1000 µL) magnetblockstemperaturmodul

OPENTRONS FLEX

15

KAPITEL 1: INLEDNING

Labware-kit med vanliga och filterspetsar, mikrocentrifugrör, reservoarer, PCR-plattor och plattor med djupa brunnar

1.2 Säkerhetsinformation
Opentrons Flex vätskehanteringsrobot har designats för säker drift. Se specifikationerna och efterlevnadsriktlinjerna i detta avsnitt för att säkerställa säker användning av din Flex. Dessa riktlinjer täcker säker användning av in- och utgångsanslutningar för produkten, inklusive ström- och dataanslutningar, samt varningsetiketter som finns på Flex-roboten och relaterad hårdvara. Användning av enheten på ett annat sätt än de som anges i denna handbok kan utsätta användaren och utrustningen för fara.

Säkerhetssymboler
Olika etiketter på Flex och i denna manual varnar dig för källor till potentiell skada eller skada.

Symbol

Beskrivning
Varning: Varnar användare för potentiellt farliga förhållanden. Åtgärder som kan leda till personskada eller dödsfall.
Varning: Varnar användare för skador på utrustningen. Förlorad eller skadad data. Oåterställningsbart avbrott av operationen som utförs.
Elektrisk stöt: Identifierar instrumentkomponenter som kan utgöra en risk för elektriska stötar om instrumentet hanteras felaktigt.

Het yta: Identifierar instrumentkomponenter som utgör en risk för personskada på grund av hög värme/temperaturer om instrumentet hanteras felaktigt.

Klämpunkt: Identifierar instrumentkomponenter som kan utgöra en risk för personskador när de är i rörelse.

16

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1: INLEDNING

Du hittar följande etiketter på Flex:
Etiketter för immateriella rättigheter Lagliga överensstämmelseetiketter (t.ex. ETL) Elektriska faroetiketter Allmänna varningsetiketter Produktetiketter Nyppunktsetiketter Hög volymtage-etiketter Effektetiketter

Elsäkerhetsvarningar
Observera alltid följande elektriska säkerhetsvarningar:

Symbol

Beskrivning
Anslut roboten till en jordad klass 1-krets. Se avsnittet Strömanslutning i kapitlet Systembeskrivning.

Anslut inte (koppla in), koppla ur (koppla ur) eller använd nätkablar om: Kabeln är sliten eller skadad. Andra anslutna kablar, sladdar eller uttag är slitna eller skadade.
Användning av skadade nätsladdar kan orsaka risk för elektriska stötar som kan leda till allvarliga skador eller skada på roboten.
Byt inte ut nätkabeln om inte i riktning av Opentrons Support.

För mer information om elektriska krav, se avsnittet Strömförbrukning i kapitlet Installation och flytt.

OPENTRONS FLEX

17

KAPITEL 1: INLEDNING

Ytterligare säkerhetsvarningar
Observera alltid följande ytterligare säkerhetsvarningar:

Symbol

Beskrivning
Opentrons Flex har inte certifierats för användning med explosiva eller brandfarliga vätskor. Ladda inte plåtar, rör eller flaskor som innehåller explosiva eller brandfarliga vätskor i roboten och använd inte instrumentet på annat sätt med explosiva eller brandfarliga vätskor i höljet.
Använd god laboratoriepraxis och följ tillverkarens försiktighetsåtgärder när du arbetar med kemikalier. Opentrons är inte ansvarigt eller ansvarigt för några skador på grund av, eller till följd av, användning av farliga kemikalier.

Flex väger 88.5 kg (195 lbs). Som ett resultat krävs två personer för att lyfta och flytta den på ett säkert sätt. Se avsnittet Flytt i kapitlet Installation och flytt.

Flex bör placeras på en yta som kan bära dess vikt på 88.5 kg (195 lbs) med tillräcklig yta för att rymma roboten plus dess minsta spelavstånd (20 cm/8 tum). Se avsnittet Säkerhets- och driftskrav i kapitlet Installation och flytt.
Flex kan avge vibrationer under drift. Placera roboten på en yta som är stabil, jämn och vattentät med tvärstag eller svetsade fogar. Se avsnittet Säkerhets- och driftskrav i kapitlet Installation och flytt.

Säkerhetsföreskrifter
Följ dessa försiktighetsåtgärder för att skydda Flex från skador:

18

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1: INLEDNING

Symbol

Beskrivning
Använd labware som är ANSI/SLAS-kompatibel eller godkänd av Opentrons. Se kapitlet Labware.
Håll frätande material, medel eller andra skadliga material borta från roboten.

Biologisk säkerhet
Behandla prover och reagenser som innehåller material som tagits från människor som potentiellt smittämnen. Opentrons rekommenderar att du använder säkra laboratorieprocedurer som förklaras i Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6:e upplagan.
Under normala omständigheter skapar Flex inte detekterbara aerosoler från källvätskor. Men under vissa förhållanden är det möjligt att generera aerosoler från källvätskor. När du arbetar med biosäkerhetsnivå 2 eller högre vätskor, överväg att vidta försiktighetsåtgärder mot aerosolexponering, i enlighet med dina lokala tillsynsmyndigheter. För att minimera den potentiella risken för aerosolexponering från roboten, se till att du:
Utför underhåll enligt beskrivningen i kapitlet Underhåll och service. Installera och säkra alla instrumenthöljen, pipetter, moduler och laboratorieutrustning korrekt. Använd korrekt pipetteringsteknik för att hjälpa till att lindra aerosoler.
Giftiga ångor
Om du arbetar med flyktiga lösningsmedel eller giftiga ämnen, använd ett effektivt laboratorieventilationssystem för att avlägsna eventuella ångor som kan produceras.
Brandfarliga vätskor
Flex har inte utvärderats för användning med brandfarliga vätskor och bör inte användas med brandfarliga vätskor.

OPENTRONS FLEX

19

KAPITEL 1: INLEDNING

1.3 Regelefterlevnad
Opentrons Flex uppfyller alla tillämpliga krav i följande säkerhets- och elektromagnetiska standarder.

Säkerhet
Regel-ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Titel
Säkerhetskrav för elektrisk utrustning för mätning, kontroll och laboratorieanvändning Del 1: Allmänna krav
Särskilda krav på laboratorieutrustning för blandning och omrörning

Elektromagnetisk kompatibilitet

Regel-ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Part 15 Subpart B Klass A IC ICES-003

Titel
Elektrisk utrustning för mätning, kontroll och laboratorieanvändning EMC-krav Del 1: Allmänna krav Oavsiktliga radiatorer
Spektrumhantering och telekommunikationsstörningar Orsakande utrustning Standardinformationsteknikutrustning (inklusive digital utrustning)

FCC-varningar och anmärkningar
Varning: Ändringar eller modifieringar av denna enhet som inte uttryckligen godkänts av Opentrons kan upphäva användarens behörighet att använda utrustningen.
Denna enhet uppfyller del 15 av FCC-reglerna. Driften är föremål för följande:

20

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 1: INLEDNING
Denna enhet får inte orsaka skadliga störningar. Denna enhet måste acceptera alla mottagna störningar, inklusive störningar som kan orsaka oönskade
drift.
Obs: Denna utrustning har testats och befunnits överensstämma med gränserna för en digital enhet av klass A, i enlighet med del 15 av FCC-reglerna. Dessa gränser är utformade för att ge rimligt skydd mot skadliga störningar när utrustningen används i en kommersiell miljö. Denna utrustning genererar, använder och kan utstråla radiofrekvensenergi och kan, om den inte installeras och används i enlighet med bruksanvisningen, orsaka skadliga störningar på radiokommunikation. Användning av denna utrustning i ett bostadsområde kommer sannolikt att orsaka skadliga störningar, i vilket fall användaren måste korrigera störningen på egen bekostnad.
Kanada ISED-efterlevnad
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Denna produkt uppfyller de tillämpliga tekniska specifikationerna för Kanada för innovation, vetenskap och ekonomisk utveckling.
Le present produit est conforme aux specifications techniques applys d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Miljövarning
Varning: Cancer och reproduktionsskador www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi förcertifiering
Wi-Fi-modulen är förcertifierad för användning i många regioner:
USA (FCC): FCC Identifier UAY-W8997-M1216 Europeiska ekonomiska samarbetsområdet (CE): Ingen offentlig identifierare (självdeklaration) Kanada (IC): Maskinvaruversionens identifieringsnummer W8997-M1216 Japan (TELEC): Certifierat nummer 020-170034 Indien (WPC): Registreringsnummer ETA-SD-20191005525 (självdeklaration)

OPENTRONS FLEX

21

KAPITEL 2
Installation och flytt
Det här kapitlet beskriver hur du förbereder ditt labb för Opentrons Flex, hur du ställer in roboten och hur du flyttar den vid behov. Innan du tar emot din Flex, se till att ditt labb eller anläggning uppfyller alla kriterier i avsnittet Säkerhets- och driftskrav. När det är dags att få igång din Flex, följ de detaljerade instruktionerna i avsnitten Unboxing, First Run, och Instrumentinstallation och Kalibrering, eller använd Opentrons Support Setup-tjänsten på plats. Och om du någonsin behöver flytta din Flex till en ny plats, nära eller långt bort, följ stegen i avsnittet Flytt.
2.1 Säkerhets- och driftskrav
Var ska man placera Opentrons Flex
Utrymmet är en värdefull vara i nästan varje labb. Din Flex kommer att behöva lite – men inte för mycket, eftersom den är designad för att passa på hälften av en vanlig labbbänk. Se till att du har ett utrymme som uppfyller följande kriterier.
Bänkyta: Stationär, stadig, jämn, vattentät yta. Bord eller bänkar med hjul (även låsande hjul) rekommenderas inte. Flex rör sig snabbt och har mycket massa, vilket kan skaka eller obalansera lätta eller rörliga bord.
Viktbärande: Enbart roboten väger 88.5 kg (195 lb) och bör endast lyftas av två personer som arbetar tillsammans. Placera roboten på en yta som lätt kan bära dess vikt plus vikten av eventuella moduler, labbutrustning, vätskor eller annan labbutrustning som ska användas i dina applikationer.
Driftutrymme: Robotens basmått är 87 cm B x 69 cm D x 84 cm H (cirka 34″ x 27″ x 33″). Flex behöver 20 cm (8 tum) sido- och bakavstånd för kablar, USB-anslutningar och för att avleda avgaser från moduler som värmer och kyler.
Varning: Placera inte sidorna eller baksidan av Flex mot en vägg.

22

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING

84 cm 33 tum

87 cm 34 tum
Opentrons Flex basmått.

69 cm 27 tum

20 cm 8 tum

20 cm 8 tum

20 cm 8 tum

Bästa view av Opentrons Flex, som visar minsta sido- och ryggspel.

OPENTRONS FLEX

23

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING

Energiförbrukning
Opentrons Flex ska anslutas till ett vägguttag vid eller i närheten av bänkplatsen där du installerar den. Anslut endast Flex till kretsar som klarar dess maximala strömförbrukning:
Ineffekt: 36 VDC, 6.1 A Tomgångsförbrukning: 30 W Typisk förbrukning: 40 W (vid protokollkörning) Maximal förbrukning: Cirka 50 W
Exakt strömförbrukning beror på:
Mängden och typen av rörelse som utförs under ett protokoll. Den tid som roboten är inaktiv. Status för lamporna på roboten. Hur många instrument är anslutna.
Kom ihåg att ta hänsyn till annan elektronik som förbrukar ström på samma krets, inklusive Flex-moduler med egen strömförsörjning. Till exempelampt.ex. har Thermocycler-modulen en maximal strömförbrukning (630 W) som är mycket större än själva Flex-roboten. Rådfråga vid behov chefen för din anläggning för att se till att den uppfyller din utrustnings strömkrav.

Miljöförhållanden
Miljöförhållandena för rekommenderad användning, acceptabel användning och lagring varierar:

Rekommenderas för systemdrift

Acceptabel för systemdrift

Omgivningstemperatur +20 till +25 °C

+2 till +40 °C

Relativ luftfuktighet Höjd

40%, icke-kondenserande
Cirka 500 m över havet

30 %, icke-kondenserande (under 80 °C)
Upp till 2000 m över havet

Förvaring och transport
-10 till +60 °C
10 %, icke-kondenserande (under 85 °C)
Upp till 2000 m över havet

24

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Opentrons har validerat prestanda hos Opentrons Flex under de förhållanden som rekommenderas för systemdrift, och drift under dessa förhållanden bör ge optimala resultat. Flex är säkert att använda under förhållanden som är acceptabla för systemdrift, men resultaten kan variera. Slå inte på eller använd inte Flex under förhållanden utanför dessa gränser. Lagrings- och transportvillkoren gäller endast när roboten är helt frånkopplad från ström och annan utrustning.
2.2 Unboxing
Grattis! Din Opentrons Flex har anlänt och du har förberett en plats för den i ditt labb. Låt oss öppna monsterlådan, ta bort roboten och förbereda den för drift. Informationen i det här avsnittet innehåller en reservdelslista och instruktioner som leder dig genom stegen som krävs för att få Flex uppackad, konfigurerad och redo för användning. Vi har delat in installationsproceduren i tre delar:
Del 1 handlar om demontering av lådan. Del 2 handlar om att ta loss Flex från lådan och flytta den till en slutmonteringsplats. Del 3 omfattar slutmontering och start av roboten för första gången.
Ansträngning och tid som krävs
Du bör be en labbpartner att hjälpa till med uppackning, lyft, flyttning och montering. Du måste budgetera cirka 30 minuter till en timme för denna ansträngning.
Obs: Flex kräver två personer för att lyfta den ordentligt. Att lyfta och bära Flex i handtagen är också det bästa sättet att flytta roboten.
Låda och förpackningsmaterial
Att packa upp en Flex ger dig en fantastisk robot, men du har också flera stora backpaneler tillsammans med diverse fraktkomponenter och stoppning. Även om du kan slänga detta material, rekommenderar vi att du behåller dessa föremål om det finns lagringsutrymme. Förpackningen är återanvändbar, vilket hjälper till att förbereda din Flex för leverans om du någonsin behöver skicka den någon annanstans (t.ex. till en konferens eller en ny anläggning) i framtiden.

OPENTRONS FLEX

25

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Produktelement
Flex levereras med komponenterna som anges nedan. Pipetter, gripdon och moduler kommer i separata förpackningar från Flex-huvudlådan, även om du köpte dem tillsammans som en arbetsstation.

(1) Opentrons Flex-robot

(1) USB -kabel

(1) Strömkabel

(1) Ethernet-kabel

(5) L-nycklar (12 mm sexkant, 1.5 mm sexkant, 2.5 mm sexkant, 3 mm sexkant,
T10 Torx)

(1) Nödstoppshängare

(1) Däckspår med klämmor för labb

(4) Reservklämmor för labb

(1) Pipettkalibreringssond

(4) Bärhandtag och mössor

(1) Övre fönsterpanel

(4) Sidofönsterpaneler

(1) 2.5 mm sexkantskruvmejsel

(1) 19 mm skiftnyckel

(16 + reservdelar) Fönsterskruvar (M4x8 mm platt huvud)
26

(10) Reservdäcksskruvar (M4x10 mm insexhuvud)

(12) Reservdäcksklämmor (M3x6 mm insexhuvud)

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Del 1: Ta bort lådan
Opentrons skickar din Flex i en robust plywoodlåda. Fraktlådan använder krok och spärr clamps för att fästa topp-, sido- och bottenpanelerna ihop. Att använda spärrar, istället för spikar eller skruvar, betyder att du inte behöver en kofot (eller mycket kraft) för att demontera lådan, och du kan återmontera den senare, om det behövs.
Obs: Lådkanterna kan bli grova under frakt. Du kanske vill använda arbetshandskar för att skydda händerna från träsplitter.
För att frigöra spärrarna, fäll spärrfliken uppåt och vrid den åt vänster (moturs). Denna åtgärd flyttar clamp armen ut ur motsvarande fäste. Du kan sedan fälla spärrarmen bort från lådan.
1 Lås upp de åtta spärrarna som håller toppen åt sidorna.

2 Ta bort topppanelen efter att ha släppt spärrarna.

OPENTRONS FLEX

27

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING 3 Skär upp den blå fraktväskan, ta bort dessa föremål från stoppningen och lägg dem åt sidan:
User Kit Ström-, Ethernet- och USB-kablar Nödstoppshängare
4 Ta bort den översta delen av skumstoppningen för att exponera fönsterpanelerna. Vadderingen skyddar sido- och topppanelerna.
5 Ta bort fönsterpanelerna och lägg dem åt sidan. Du bifogar dessa senare.

28

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
6 Lås upp de återstående 16 spärrarna som håller sidopanelerna mot varandra och lådans bas. 7 Ta bort sidopanelerna och lägg dem åt sidan.
Del 2: Släpp Flex
Efter att ha slutfört stegen i del 1, bör du nu se en robot som är i en skyddspåse och fäst vid orange stålmonteringskomponenter. Väskan omsluter roboten och skyddar den från omgivningen. Stålfästen fäster roboten i botten av lådan. Två fraktramar stödjer roboten, fördelar dess vikt jämnt och håller den styv så att den inte blir skev under transport. Fortsätt att packa upp Flex och ta bort den från lådans bas.
8 Använd 19 mm skiftnyckeln från User Kit, lossa fästena från lådans botten. Du kan kassera fästena eller spara dem för framtida bruk.

OPENTRONS FLEX

29

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING 9 Dra eller rulla fraktväskan hela vägen ner för att exponera hela roboten.
10 Med hjälp av din laboratoriepartner tar du tag i handtagen i de orangea transportramarna på vardera sidan av robotens bas, lyfter Flex från lådans bas och ställer ner den på golvet. Spara eller kassera lådans bas och fraktram.

30

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING 11 Använd den 12 mm sexkantsnyckeln från användarsatsen, ta bort de fyra bultarna som håller transportramarna till
Flex. Spara eller kassera ramarna och bultarna.
12 Ta bort de fyra aluminiumhandtagen från användarsatsen. Skruva fast handtagen på samma ställen som 12 mm transportramsbultarna hölls.

OPENTRONS FLEX

31

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
13 Med hjälp av din labbpartner lyfter du Flex i dess bärhandtag och flyttar den till en arbetsbänk för slutmontering.

Del 3: Slutmontering och ström på
Efter att ha flyttat Flex till ett tillfälligt arbetsområde, eller dess permanenta hem, är det dags att lägga sista handen på din nya robot.
14 Om du har flyttat roboten till dess slutliga arbetsplats, ta bort bärhandtagen och ersätt dem med efterbehandlingslocken. Kepsarna stänger handtagsöppningarna i ramen och ger roboten ett rent utseende. Lägg tillbaka handtagen till User Kit för förvaring.

32

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
15 Ta ut topp- och sidopanelerna från packningsskummet du ställt åt sidan efter att ha tagit bort lådans topp.
16 Montera fönsterpanelerna på Flex genom att följa märkningsinformationen på den främre skyddsfilmen. Ta sedan bort skyddsfilmen.
17 Använd de avfasade fönsterskruvarna och 2.5 mm skruvmejseln från User Kit, fäst fönsterpanelerna på Flex. Se till att de avfasade (V-formade) hålen i fönsterpanelerna är vända ut (mot dig). Detta gör att skruvarna kan passa i jämnhöjd med fönstrets yta.

Varning: Felaktig orientering av panelerna kan leda till skador. Överdrivet skruvmoment kan spricka panelerna. Dra åt skruvarna för hand tills fönsterpanelerna är någorlunda säkra. Detta är inte en kraftprövning.

OPENTRONS FLEX

33

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING 18 Använd en 2.5 mm skruvmejsel från användarsatsen för att ta bort låsskruvarna från portalen. Dessa
skruvar hindrar portalen från att röra sig under transport. Portens låsskruvar är placerade: På vänster sidoskena nära framsidan av roboten. Under den vertikala portalarmen. På höger sidoskena nära framsidan av roboten i en orange konsol. Det finns två skruvar här.
Portalen rör sig lätt för hand efter att alla transportskruvar har tagits bort. 19 Klipp och ta bort de två gummibanden som håller papperskorgen på plats under transporten.

34

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
20 Anslut nätsladden till Flex och anslut den till vägguttaget. Se till att däcksområdet är fritt från hinder. Vänd på strömbrytaren på baksidan till vänster på roboten. När portalen väl är påslagen flyttas den till sin hemplats och pekskärmen visar ytterligare konfigurationsinstruktioner.

Nu när din Flex är ur kartongen och redo att gå, fortsätt till avsnittet Första körningen nedan.
2.3 Första körningen
Utför grundläggande inställningar på pekskärmen innan du ansluter någon annan hårdvara till din Flex. Roboten guidar dig genom att ansluta till ditt labbnätverk, uppdatera till den senaste programvaran och anpassa Flex genom att ge den ett namn.
Ström på
När du slår på Flex kommer Opentrons logotyp att visas på pekskärmen. Efter några ögonblick visas skärmen "Välkommen till din Opentrons Flex".
Opentrons Flex välkomstskärm. Du bör bara se den här skärmen när du startar din Flex för första gången.

OPENTRONS FLEX

35

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Anslut till ett nätverk eller en dator
Följ anvisningarna på pekskärmen för att ansluta din robot så att den kan söka efter programuppdateringar och ta emot protokoll files. Det finns tre anslutningsmetoder: Wi-Fi, Ethernet och USB.

Alternativ för nätverksanslutning. Du måste ha internetanslutning för att ställa in Flex. Wi-Fi: Använd pekskärmen för att ansluta till Wi-Fi-nätverk som är säkrade med WPA2 Personlig autentisering (de flesta nätverk som bara kräver ett lösenord för att ansluta faller under denna kategori).
Obs: Flex stöder inte captive-portaler (nätverk som inte har ett lösenord men laddar en websida för att autentisera användare efter anslutning).
Du kan också ansluta till ett öppet Wi-Fi-nätverk, men detta rekommenderas inte.
Varning: Om du ansluter till ett öppet Wi-Fi-nätverk kan alla inom räckhåll för nätverkssignalen styra din Opentrons Flex-robot utan autentisering.

Om du behöver ansluta till ett Wi-Fi-nätverk som använder företagsautentisering (inklusive "eduroam" och liknande akademiska nätverk som kräver ett användarnamn och lösenord), anslut först till Opentrons-appen via Ethernet eller USB för att slutföra den första installationen. Anslut sedan till företagets Wi-Fi-nätverk i nätverksinställningarna för din Flex. För att komma åt nätverksinställningarna:

36

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
1. Klicka på Enheter i den vänstra sidofältet i Opentrons-appen. 2. Klicka på menyn med tre punkter () för din Flex och välj Robotinställningar. 3. Klicka på fliken Nätverk.
Välj ditt nätverk från rullgardinsmenyn eller välj "Gå med i annat nätverk..." och ange dess SSID. Välj den företagsautentiseringsmetod som ditt nätverk använder. De metoder som stöds är:
EAP-TTLS med TLS EAP-TTLS med MS-CHAP v2 EAP-TTLS med MD5 EAP-PEAP med MS-CHAP v2 EAP-TLS
Var och en av dessa metoder kräver ett användarnamn och lösenord, och beroende på din exakta nätverkskonfiguration kan det krävas certifikat files eller andra alternativ. Se din anläggnings IT-dokumentation eller kontakta din IT-chef för information om din nätverkskonfiguration.
Ethernet: Anslut din robot till en nätverksswitch eller hubb med en Ethernet-kabel. Du kan också ansluta direkt till Ethernet-porten på din dator, från och med robotsystemversion 7.1.0.
USB: Anslut den medföljande USB A-till-B-kabeln till robotens USB-B-port och en öppen port på din dator. Använd en USB B-till-C-kabel eller en USB A-till-C-adapter om din dator inte har en USB-A-port.
För att fortsätta med installationen måste den anslutna datorn ha Opentrons-appen installerad och igång. Mer information om hur du installerar Opentrons-appen finns i avsnittet Appinstallation i kapitlet Programvara och drift.
Installera programuppdateringar
Nu när du har anslutit till ett nätverk eller en dator kan roboten söka efter uppdateringar av programvara och firmware och ladda ner dem om det behövs. Om det finns en uppdatering kan det ta några minuter att installera. När uppdateringen är klar kommer roboten att starta om.

OPENTRONS FLEX

37

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Fäst nödstoppshänget
Anslut den medföljande nödstoppshängaren (Nödstopp) till en extra port (AUX-1 eller AUX-2) på baksidan av roboten.

Före och efter anslutning av nödstoppshängaren.
Att fästa och aktivera nödstoppet är obligatoriskt för att fästa instrument och köra protokoll på Flex. För mer information om hur du använder nödstoppet under robotdrift, se avsnittet Nödstopp i kapitlet Systembeskrivning.
Ge din robot ett namn
Genom att namnge din robot kan du enkelt identifiera den i din labbmiljö. Om du har flera Opentrons-robotar i ditt nätverk, se till att ge dem unika namn. När du har bekräftat din robots namn kommer du att tas till din Opentrons Flex Dashboard. Nästa steg du vill ta är troligen att fästa instrument, vilket beskrivs i nästa avsnitt.
2.4 Instrumentinstallation och kalibrering
Efter den första robotinställningen är nästa steg att fästa instrument på roboten och kalibrera dem.
För att installera ett instrument, tryck först på Instrument på pekskärmen eller gå till avsnittet Pipetter och moduler på enhetens detaljskärm i Opentrons-appen. Välj ett tomt fäste och välj antingen Attach Pipette eller Attach Gripper. Om fästet du vill använda redan är upptaget måste du först ta loss pipetten eller griparen.

38

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Obs: Den övergripande installationsprocessen är densamma oavsett om du använder pekskärmen eller Opentrons-appen. Vilken enhet du än börjar på kommer att styra installationsprocessen tills du slutför eller avbryter den.
Om du börjar på pekskärmen kommer appen att visa roboten som "upptagen". Om du börjar i appen kommer pekskärmen att visa en modal som indikerar att instrumentinstallationen pågår.
Den exakta installationsprocessen varierar beroende på instrumentet du ansluter, vilket beskrivs i avsnitten nedan. Alla instrument har en automatiserad kalibreringsprocedur, som du bör utföra direkt efter installationen.
Installation av pipett
När du installerar en pipett kommer du att guidas genom följande steg på pekskärmen eller i Opentrons-appen.
1. VÄLJ PIPETTSTYP Välj mellan 1- eller 8-kanalspipett och 96-kanalspipett. Att fästa 96-kanalspipetten kräver några ytterligare steg eftersom den fästs på en speciell monteringsplatta som sträcker sig över båda pipettfästena.
2. FÖRBEREDA FÖR INSTALLATION Ta bort laboratorieartiklar från däcket och rensa upp arbetsområdet för att göra fastsättning och kalibrering enklare. Samla också den nödvändiga utrustningen, såsom kalibreringsproben, sexkantskruvmejseln och monteringsplattan (för 96-kanalspipetten).
3. ANSLUT OCH FÄSTA PIPETTEN Portalen flyttas till robotens framsida så att du kan fästa pipetten.
1- och 8-kanalspipetter ansluts direkt till ett pipettfäste. 96-kanalspipetten kräver en monteringsplatta. För att fästa monteringsplattan måste du först koppla bort z-axelvagnen för det högra pipettfästet.

OPENTRONS FLEX

39

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Anslut pipetten till det valda pipettfästet och fäst skruvarna.
4. KÖR AUTOMATISK KALIBRERING För att kalibrera pipetten, fäst kalibreringsproben på lämpligt pipettmunstycke. Pipetten kommer automatiskt att röra sig vid vissa punkter på däcket och spara dessa kalibreringsvärden för framtida användning. När kalibreringen är klar och du har tagit bort sonden kommer pipetten att vara klar för användning i protokoll.
Montering av gripdon
När du installerar griparen kommer du att guidas genom följande steg på pekskärmen eller i Opentrons-appen.
1. FÖRBEREDA FÖR INSTALLATION Ta bort laboratorieartiklar från däcket och rensa upp arbetsområdet för att göra fastsättning och kalibrering enklare. Samla även den nödvändiga sexkantskruvmejseln och se till att kalibreringsstiftet är i sitt förvaringsområde på griparen.
2. ANSLUT OCH FÄSTA gripdonet. Porten flyttas till robotens framsida så att du kan fästa griparen. Anslut griparen till förlängningsfästet och fäst skruvarna.
3. KÖR AUTOMATISK KALIBRERING För att kalibrera griparen, sätt in kalibreringsstiftet i den främre käften. Griparen kommer automatiskt att röra sig vid vissa punkter på däcket och spara dessa kalibreringsvärden för framtida bruk. Upprepa sedan samma process med kalibreringsstiftet i bakre käken. När kalibreringen är klar och du har satt tillbaka stiftet på förvaringsplatsen kommer griparen att vara redo att användas i protokoll.
2.5 Omlokalisering
Det här avsnittet ger råd och instruktioner om hur du flyttar din Opentrons Flex-robot över korta och långa avstånd.

40

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Korta drag
En kort flytt sträcker sig över ett antal avstånd från "låt oss bara flytta det över lite" till över labbet, ner i korridoren eller en annan våning i din byggnad. I dessa fall kan du flytta din Flex för hand. Att transportera den på en handvagn är också ett bra alternativ.
Varning: Flex väger 88.5 kg. Som ett resultat krävs två personer för att lyfta och flytta den på ett säkert sätt.
Sätt tillbaka lyfthandtagen för att flytta din Flex till en ny, närliggande plats. Att lyfta och bära Flex i handtagen är det rätta sättet att flytta roboten korta sträckor. Ta bort handtagen och förvara dem i User Kit efter att flytten är klar. För att förhindra att roboten skadas, använd alltid lyfthandtagen för att plocka upp och flytta den. Ta inte tag i ramen för att lyfta eller flytta din robot.
Långdistansrörelser
En flytt på långa avstånd transporterar din Flex från ditt universitet, din anläggning eller institution. Över staden, till en ny stad, stat, provins eller land är alla exampläser av en långdistansrörelse. I det här fallet måste du packa Flex för att skydda den från väder och vind, stötar och grova rörelser som kan uppstå under transporten.
Om du har behållit fraktlådan och de interna stöden som följde med din Flex, kan du packa om den i dessa material för en långväga flytt. Följ uppackningsstegen i omvänd ordning för att förbereda din Flex för ett långdistansdrag. I grund och botten bör du:
Koppla bort ström- och nätverkskabeln, om den är ansluten. Ta bort all ansluten hårdvara och labware. Sätt tillbaka däckplattorna. Lås portalen (se avsnittet Allmänna flyttråd nedan). Ta bort och förvara fönsterpanelerna.
Om du behöll originallådan:
Sätt tillbaka transportramen på Flex och fäst den vid pallbasen med hjälp av L-fästena. Lägg till stoppning och sätt tillbaka fraktlådan.

OPENTRONS FLEX

41

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Om du inte har originallådan och tillhörande material, kontakta ett välrenommerat fraktföretag. De kan hantera packning, transport och leveransprocess åt dig.
Allmänna flyttråd
KOPPLA UR STRÖM- OCH NÄTVERKSKABLAR Innan du flyttar din Flex, glöm inte att: Stänga av strömmen och koppla ur den från strömförsörjningen. Koppla bort Ethernet- eller USB-kabeln, om den används.
LÅS GANTRY Innan du flyttar din Flex, sätt tillbaka låsskruvarna för att hålla portalen på plats. Portens låspunkter är placerade: På vänster sidoskena nära robotens framsida. Under den vertikala portalarmen. På höger sida nära framsidan av roboten. Att låsa denna del av portalen kräver det lilla
orange fäste och två låsskruvar.

42

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
HEM GANTRY Du kanske inte vill låsa portalen om du bara flyttar roboten till en närliggande plats. Om du bestämmer dig för att inte låsa den, använd åtminstone pekskärmen eller Opentrons-appen för att skicka portalen till sin hemposition innan du stänger av den. För att ta hem portalen via pekskärmen, tryck på menyn med tre punkter () och tryck sedan på Hem portal. För att ta hem portalen via Opentrons-appen: Klicka på Enheter. Klicka på din Flex i enhetslistan. Klicka på menyn med tre punkter () och klicka sedan på Hemportal.
BORT MODULER Däcksmoduler och andra tillbehör ger extra tyngd till din Flex. De påverkar också robotens tyngdpunkt, vilket kan få den att kännas "spetsig" när den lyfts. För att underlätta och balansera roboten, ta bort alla anslutna instrument och laboratorieartiklar innan du tar upp den.
ÅTERINSTALLERA DÄCKSPÅRRNA Vi rekommenderar att du sätter tillbaka däcksöppningarna för en långdistansförflyttning. Att säkra spåren på deras ursprungliga platser hjälper till att förhindra oavsiktlig förlust. Det är valfritt att sätta tillbaka korta öppningar för korta rörelser i labbet.
OMKALIBRERING EFTER FLYTTNING Du bör kalibrera om alla instrument och moduler efter att du har installerat om dem. För mer information om modulkalibrering, se kapitlet Moduler.

OPENTRONS FLEX

43

KAPITEL 2: INSTALLATION OCH FLYTTNING
Sista tankar om att flytta
Din Flex är en robust och välbyggd maskin, men det är också ett exakt vetenskapligt instrument utformat för höga toleranser. Därför bör du behandla den med försiktighet när du flyttar den inom ditt lokala arbetsområde eller skickar den över landet. Det innebär att följa vägledningen som ges här och använda ditt eget sunda förnuft om hur man transporterar en dyr laboratorieutrustning. Summa summarum: när du flyttar din Flex, var försiktig och extra stoppning.
Om du har frågor eller funderingar om att flytta din Flex, kontakta oss på support@opentrons.com.

44

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3
Systembeskrivning

Det här kapitlet beskriver hårdvarusystemen för Opentrons Flex, som ligger till grund för dess centrala labbautomationsfunktioner. Däck, portal och instrumentfästen på Opentrons Flex möjliggör användning av precisionskomponenter för vätske- och laboratoriehantering. Pekskärmen på enheten gör det möjligt att köra protokoll och kontrollera robotens status utan att behöva ta med din dator till labbbänken. Trådbunden och trådlös anslutning möjliggör ytterligare kontroll från Opentrons-appen (se kapitlet Programvara och drift för mer information) och utökar systemets funktioner genom att ansluta kringutrustning (se kapitlet Moduler).

3.1 Fysiska komponenter

Kamera

Statuslampa

Pekskärm

Ram

Gantry Deck
Ytterdörr
Platser för de fysiska komponenterna i Opentrons Flex.

Sidofönsterhandtagslock

OPENTRONS FLEX

45

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Ram och hölje
Ramen på Opentrons Flex-roboten ger styvhet och strukturellt stöd för dess däck och portal. Alla de mekaniska delsystemen är placerade på och monterade på huvudramen. Ramen är konstruerad i huvudsak av plåt och aluminiumprofiler.
Metallramen har öppningar för sidofönster och en ytterdörr av transparent polykarbonat som låter dig se vad som händer inuti Flex. Ytterdörrens gångjärn öppnas för åtkomst till systemets insida. Med ytterdörren öppen kan du fästa instrument, moduler och däcksarmatur; förbered däcket innan ett protokoll; eller manipulera däckets tillstånd under ett protokoll.
Vita LED-remsor på insidan av ramens övre kanter ger mjukvarukontrollerbar omgivningsbelysning. En 2-megapixelkamera kan fotografera däcket och arbetsområdet för inspelning och spårning av protokollexekvering.

Däck och arbetsområde
Däcket är den bearbetade aluminiumytan på vilken automatiserade vetenskapliga protokoll exekveras. Däcket har 12 huvudplatser i ANSI/SLAS-format som kan omkonfigureras för att hålla labb, moduler och förbrukningsmaterial. Däcksluckorna identifieras av ett koordinatsystem, med öppning A1 längst bak till vänster och öppning D3 längst fram till höger.

Expansionsspår (för Thermocycler) Arbetsområde

Staging område

Områden på däcket inom Flex.

46

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
Arbetsområdet är det fysiska utrymmet ovanför däck som är tillgängligt för pipettering. Labbartiklar placerade i skårorna A1 till D3 finns i arbetsområdet.
Opentrons Flex kommer med löstagbara kortplatser för alla 12 positioner i arbetsområdet. Varje kortplats har hörnklämmor för laboratorieartiklar för att säkert placera laboratorieartiklar på däcket.
Du kan konfigurera om däcket genom att ersätta kortplatserna med andra däckfixturer, inklusive den rörliga papperskorgen, avfallsrännan och modulcaddies. Expansionsfacket bakom A1 används endast för att göra ytterligare utrymme för Thermocycler-modulen, som upptar plats A1 och B1.
Obs: Däckfack är utbytbara inom en kolumn (1, 2 eller 3) men inte över kolumner; spalterna i kolumn 1 och kolumn 3 är distinkta delar trots sin liknande storlek. Du kan se vilken kolumn en plats går i genom att orientera den blå labbutrustningen bakåt till vänster.
Du bör lämna kortplatser installerade på platser där du vill placera fristående laboratorieutrustning. Däcket och föremål som placeras på det förblir statiska, såvida de inte flyttas av griparen eller manuellt ingrepp.
Stagområde
Stagingområdet är extra utrymme längs däckets högra sida. Du kan lagra labware på den här platsen efter installationen av staging area slitsar. Labware placerade i fack A4 till D4 finns i staging område. Flexpipetter kan inte nå in i stagingområdet, men griparen kan plocka upp och flytta laboratorieutrustning till och från denna plats. Att lägga till extra fack hjälper till att hålla arbetsområdet tillgängligt för utrustningen som används i dina automatiserade protokoll.
Staging area slots ingår i vissa arbetsstationskonfigurationer och kan även köpas från https://shop.opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

47

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Stagområde med slitsar installerade

Däck fixturer
Fixturer är hårdvara som ersätter vanliga kortplatser. De låter dig anpassa däcklayouten och lägga till funktionalitet till din Flex. För närvarande inkluderar däcksarmaturerna stagöppningar i området, den interna papperskorgen och den externa avfallsnedkastet. Du kan bara installera fixturer i ett fåtal specifika kortplatser. Följande tabell listar däckets placeringar för varje fixtur.

Fixtur Stagskåror för soptunnor Avfallsnedkast Avfallsnedkast med staging area slot

Fack A3D3 A1D1 och A3-D3 Endast D3 endast D3

Armaturer är strömlösa. De innehåller inte elektroniska eller mekaniska komponenter som kommunicerar deras nuvarande tillstånd och däcksposition till roboten. Det betyder att du måste använda däckskonfigurationsfunktionen för att låta Flex veta vilka fixturer som är fästa på däcket och var de är placerade.

48

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Du kan komma åt däckets konfigurationsinställningar från pekskärmen via menyn med tre punkter () och från Opentrons-appen. Se avsnittet Däckkonfiguration i kapitlet Programvara och drift för information om hur du konfigurerar däcket från pekskärmen.

Avfallsnedkast
Opentrons Flex Waste Chute överför vätskor, spetsar, tippställ och brunnsplattor från Flex-höljet till ett sopkärl placerat under dess yttre öppning. Avfallsrännan fästs på en däcksplattaadapter som passar i skåra D3. Den kommer också med en speciell fönsterhalvpanel som låter rännan sträcka sig ut från framsidan av roboten.
Komponenter i avfallsnedkastet.

Adapter för täckdäcksplatta

Avfallsnedkast
Däckplattaadapter med Staging område

Staging area slitsar
Staging area slots är ANSI/SLAS-kompatibla däckdelar som ersätter standardplatser i kolumn 3 och lägger till nya slots tilltaging area — allt utan att tappa utrymme i arbetsområdet. Du kan installera en enda kortplats eller maximalt fyra platser för att skapa en ny kolumn (A4 till D4) längs höger sida av kortleken. Observera dock att byte av kortplats A3 kräver att papperskorgen flyttas. Genom att lägga till stagMed ytor på däcket kan din Flex-robot lagra mer laboratorieutrustning och arbeta mer effektivt.

OPENTRONS FLEX

Flex staging area slot.
49

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
INSTALLATION AV SLOT
För att installera, ta bort skruvarna som fäster ett standarduttag på däcket och ersätt det med staging area slot. Efter installationen använder du pekskärmen eller Opentrons-appen för att tala om för roboten du har lagt till somtagöppningsområde till däcket.
Installerar somtaging area slot.

SLOTKOMPATIBILITET Staging area slots är kompatibla med Flex-instrument, moduler och labbutrustning som listas nedan.

Flexkomponent Gripper Pipetter Moduler
Labware

Stagkompatibilitet inom området
Flex Gripper kan flytta labware till eller från staging area slitsar.
Flexpipetter kan inte nå staging område. Använd griparen för att flytta spetsställ och laboratorieartiklar från stagning området till arbetsområdet innan pipettering.
Magnetblocket GEN1 kan placeras i kolumn 3 ovanpå astaging area slot. Moduler stöds inte i kolumn 4.
Motordrivna moduler som Heater-Shaker och Temperature Module passar i caddies som kan placeras i kolumn 3. Du kan inte lägga till somtaging area slot till en position som upptas av en modulcaddie.
Staging area slots har samma ANSI/SLAS dimensioner som standard kortplatser. Använd griper-kompatibel laboratorieutrustning i stageller manuellt lägga till och ta bort labbutrustning från den här platsen.

50

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
Rörelsesystem
Fäst på ramen sitter portalen, som är robotens rörelse- och positioneringssystem. Gantryt rör sig separat längs x- och y-axeln för att placera pipetterna och griparen på exakta ställen för utförande av protokoll. Rörelsen längs dessa axlar är exakt till närmaste 0.1 mm. Portalen styrs av 36 VDC hybrid bipolära stegmotorer. I sin tur är pipettfästena och förlängningsfästet fästa vid portalen. Dessa rör sig längs z-axeln för att placera pipetterna och griparen på exakta platser för protokollutförande. Rörelse längs denna axel styrs av 36 VDC hybrid bipolära stegmotorer. Elektroniken i portalen tillhandahåller 36 VDC-ström och kommunikation till pipetterna och griparen när den är ansluten.
Brygga

Pipettfästen

Förlängningsfäste

Placering av instrumentfästen på Flex.

Pekskärm och LED-displayer
Det primära användargränssnittet är den 7-tums LCD-pekskärmen, placerad på framsidan till höger på roboten. Pekskärmen är täckt med Gorilla Glass 3 för rep- och skador. Få tillgång till många funktioner i Flex direkt på pekskärmen, inklusive:

OPENTRONS FLEX

51

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Protokollhantering Protokollinställning, exekvering och övervakning Labwarehantering Robotinställningar Systemprogramvara och firmwareuppdateringar Driftloggar och felmeddelanden
För mer information om hur du använder Flex via pekskärmen, se avsnittet Användning av pekskärm i kapitlet Programvara och användning.
Statuslampan är en remsa med lysdioder längs den övre fronten av roboten som ger snabb information om roboten. Olika färger och mönster av belysning kan kommunicera olika framgång, misslyckande eller viloläge:

LED-färg Vit Neutrala tillstånd
Grön Normal anges
Blå Obligatoriska tillstånd Gul Onormala tillstånd Röda Nödlägen

LED-mönster Solid Pulserande
Blinkar två gånger
Fast pulserande pulserande

Robotstatus
Slås på och kör inte ett protokoll Roboten är upptagen (t.ex. uppdaterar programvara eller firmware, ställer in protokollkörning, avbryter protokollkörning) Åtgärden är klar (t.ex. protokoll lagrat, programvara uppdaterad, instrument anslutet eller lossat) Protokoll körs Protokollet är klart Protokollet är pausat

Fast

Programvarufel

Blinkar tre gånger, upprepade gånger

Fysiskt fel (t.ex. instrumentkrasch)

Statuslampan kan också stängas av i robotinställningarna.

52

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
3.2 Pipetter
Opentrons pipetter är konfigurerbara enheter som används för att flytta vätskor genom hela arbetsområdet under utförande av protokoll. Det finns flera Opentrons Flex-pipetter, som kan hantera volymer från 1 µL till 1000 µL i 1, 8 eller 96 kanaler:
Opentrons Flex 1-kanalspipett (1 µL) Opentrons Flex 50-kanalspipett (1 5 µL) Opentrons Flex 1000-kanalspipett (8 µL) Opentrons Flex 1-kanalspipett (50 8 µL) Opentrons Flex 5-kanalspipett (µL)
Pipetter fästs på portalen med hjälp av skruvar på framsidan av pipetten. 1-kanals och 8-kanalspipetter upptar vardera ett pipettfäste (vänster eller höger); 96-kanalspipetten upptar båda fästena. För detaljer om installation av pipetter, se Instrumentinstallation och kalibrering.

Fångsfäste
Skruvar

Fästskruvar

Ejektor

Munstycken (utbytbara O-ringar)

Munstycken (fasta O-ringar)

Placering av komponenter i 1-, 8- och 96-kanalspipetter.

Ejektor

OPENTRONS FLEX

53

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Pipetterna plockar upp engångsplastspetsar genom att trycka dem på pipettmunstyckena och sedan använda spetsarna för att suga upp och dispensera vätskor. Mängden total kraft som krävs för upptagning ökar när fler spetsar plockas upp samtidigt. För mindre antal spetsar fäster pipetten spetsar genom att trycka ner varje pipettmunstycke i en spets. För att uppnå den nödvändiga kraften för att plocka upp ett helt ställ med spetsar, drar 96-kanalspipetten även spetsarna uppåt på munstyckena. Denna dragning kräver att spetsställen placeras i en spetsställsadapter, snarare än direkt i en kortplats. För att kassera spetsar (eller föra tillbaka dem till deras ställ), trycker pipettutkastarmekanismen bort spetsarna från munstyckena.

Pipettspecifikationer
Opentrons Flex-pipetter är designade för att hantera ett brett spektrum av volymer. På grund av deras breda övergripande utbud kan de använda spetsar i flera storlekar, vilket påverkar deras vätskehanteringsegenskaper. Opentrons har testat Flex-pipetter för noggrannhet och precision i ett antal spets- och vätskevolymkombinationer:

Pipett
Flex 1-kanal
50 µL
Flex 1-kanal
1000 µL
Flex 8-kanal
50 µL
Flex 8-kanal
1000 µL

Spetskapacitet 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL

Testad volym 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Noggrannhet %D 8.00 % 1.50 % 1.25 % 5.00 % 0.50 % 0.50 % 0.50 % 10.00 % 2.50 % 1.25 % 8.00 % 2.50 % 1.00 % 0.70 %

Precision %CV 7.00 % 0.50 % 0.40 % 2.50 % 0.30 % 0.15 % 0.15 % 8.00 % 1.00 % 0.60 % 4.00 % 0.60 % 0.25 % 0.15 %

54

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Flex 96-kanal
1000 µL

50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Ha denna noggrannhetsinformation i åtanke när du väljer tips för din pipett. I allmänhet, för bästa resultat bör du använda de minsta tipsen som uppfyller behoven i ditt protokoll.

Obs: Opentrons utför volymetrisk testning av Flex-pipetter för att säkerställa att de uppfyller noggrannhets- och precisionsspecifikationerna som anges ovan. Du behöver inte kalibrera volymen som dina pipetter dispenserar före användning. Du behöver bara utföra positionskalibrering. Se nästa avsnitt, samt avsnittet Pipettinstallation i kapitlet Installation och flytt, för detaljer.
Tjänsterna Opentrons Care och Opentrons Care Plus inkluderar årlig pipettbyte och kalibreringscertifikat. Se avsnittet Service Flex i kapitlet Underhåll och service för detaljer.

Pipettkalibrering
Användarsatsen innehåller en metallpipettkalibreringsprob, som du använder under positionskalibrering. Under protokollkörningar, förvara sonden på ett säkert sätt på den magnetiska hållaren på robotens främre pelare. Under kalibreringsprocessen fäster du sonden på lämpligt munstycke och låser den på plats. Roboten flyttar sonden till kalibreringspunkter på däcket för att mäta pipettens exakta position.
Adapter för pipettspetsställ
Opentrons Flex 96-kanalspipetten levereras med fyra spetsadaptrar. Dessa är precisionsformade aluminiumfästen som du placerar på däck. Adaptrarna rymmer Flex 50 L, 200 L och 1000 µL spetsställ.

OPENTRONS FLEX

55

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
På grund av den inblandade kraften kräver 96-kanalspipetten en adapter för att fästa ett ställ med full spets ordentligt. Under fastsättningsproceduren rör sig pipetten över adaptern, sänker sig själv på monteringsstiften och drar spetsar på pipetterna genom att lyfta adaptern och spetsstället. Att dra i spetsarna, snarare än att trycka, ger den hävstångseffekt som behövs för att fästa spetsarna på pipetterna och förhindrar att däckets yta blir skev. När den är klar sänker 96-kanalspipetten ner adaptern och tömt spetsstället på däcket. Se avsnittet Tips och spetsställ i kapitlet Labware för mer information.
Delvis tipsupphämtning
96-kanalspipetten kan plocka upp ett helt ställ med spetsar eller ett mindre antal spetsar. Detta ökar antalet applikationer du kan utföra med 96-kanalspipetten, eftersom den upptar båda pipettfästena.
För närvarande stöder 96-kanalspipetten partiell spetsupptagning för 8 spetsar i en kolumnlayout. I den här konfigurationen använder pipetten antingen sina munstycken längst till vänster för att plocka upp spetsar från höger till vänster från ett spetsställ, eller sina munstycken längst till höger för att plocka upp spetsar från vänster till höger från ett spetsställ.
När du plockar upp färre än 96 spetsar från ett spetsställ måste stativet placeras direkt på däcket, inte i spetsställets adapter.
Pipettsensorer
Opentrons Flex-pipetter har ett antal sensorer som upptäcker och registrerar data om pipettens status och eventuella spetsar som den har plockat upp.
KAPACITANS SENSORER
I kombination med en metallsond eller ledande spets upptäcker kapacitanssensorerna när pipetten kommer i kontakt med något. Detektering av kontakt mellan metallsonden och däcket används i den automatiska pipettkalibreringen och modulkalibreringsprocesserna.
1-kanalspipetter har en kapacitanssensor, medan flerkanalspipetter har två: på kanalerna 1 och 8 av 8-kanalspipetter och på kanalerna 1 och 96 (positionerna A1 och H12) på 96-kanalspipetten.

56

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

OPTISKA SPETS NÄRVARO SENSORER
En fotoavbrottsomkopplare detekterar positionen för pipettens spetsejektormekanism, vilket bekräftar om spetsarna lyckades plockas upp eller tappades. 1-kanals, 8-kanals och 96-kanals pipetter har alla en enda optisk sensor som övervakar spetsfästning över alla kanaler.
Pipettera firmwareuppdateringar
Opentrons Flex uppdaterar automatiskt pipettfirmware för att hålla den synkroniserad med robotens mjukvaruversion. Pipettuppdateringar av firmware är vanligtvis snabba och inträffar närhelst:
Du fäster en pipett. Roboten startar om.
Om, av någon anledning, din pipettfirmware och robotmjukvaruversionerna inte är synkroniserade kan du uppdatera den fasta programvaran manuellt i Opentrons-appen.
1. Klicka på Enheter. 2. Klicka på din Flex i enhetslistan. 3. Under Instrument och moduler kommer pipetten som inte är synkroniserad att visa en varningsbanner
"Firmware-uppdatering tillgänglig." Klicka på Uppdatera nu för att påbörja uppdateringen.
Du kan view den för närvarande installerade firmwareversionen av en ansluten pipett. På pekskärmen, gå till Instrument och tryck på pipettens namn. I Opentrons-appen hittar du pipettkortet under Instrument och moduler, klickar på menyn med tre punkter () och klickar sedan på Om pipett.

3.3 Gripare
Griparen flyttar laboratorieartiklar genom hela arbetsområdet och stagområde under utförande av protokoll. Griparen fästs vid förlängningsfästet, som är skilt från pipettfästena; griparen kan användas med valfri pipettkonfiguration. För detaljer om installation av griparen, se Instrumentinstallation och kalibrering.
Griparen kan flytta laboratorieartiklar över däcket och till eller från moduler. Griparen kan manipulera vissa brunnsplattor med helt sockel, plattor med djupa brunnar och spetsställ. För mer information om vilken labware griparen kan flytta, se avsnittet Labware och Opentrons Flex Gripper i kapitlet Labware, eller konsultera Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

57

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Grip specifikationer
Käftarna utför griparens primära rörelse, vilket är att öppna eller stänga två parallella skovlar för att applicera eller släppa kraft på sidorna av laboratorieartiklar. Käftarnas rörelse styrs av en 36 VDC borstad motor ansluten till ett kugghjulssystem.
För att flytta en bit labbgods som har gripits av käftarna, lyfter portalen griparen längs z-axeln, flyttar den i sidled och sänker den sedan till laboratorieutrustningens nya position.
Placering av komponenter i griparen.

Fästskruvar
Kalibreringsstift Jaws Paddlar

Kalibrering av gripdon
Griparen inkluderar en metallkalibreringsstift. Kalibreringsstiftet är placerat i ett försänkt förvaringsutrymme på den nedre delen av griparen. En magnet håller stiftet på plats. Ta bort kalibreringsstiftet genom att ta tag i det med fingrarna och dra försiktigt. För att byta ut stiftet, sätt tillbaka det i förvaringsfacket. Du vet att den är säker när den snäpper på plats.
När du kalibrerar griparen, fäst stiftet i varje käft i tur och ordning. Roboten flyttar stiftet till kalibreringspunkter på däcket för att mäta griparens exakta position.
Under protokollkörningar, placera stiftet i dess förvaringsområde för förvaring. Kontakta oss på support@opentrons.com om du tappar kalibreringsstiftet.

Gripper firmware uppdateringar
Opentrons Flex uppdaterar automatiskt griparens firmware för att hålla den synkroniserad med robotens mjukvaruversion. Grippers firmwareuppdateringar är vanligtvis snabba och sker närhelst:

58

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
Du fäster griparen. Roboten startar om.
Om, av någon anledning, din gripper-firmware och robotprogramvara inte är synkroniserad, kan du manuellt uppdatera firmwaren i Opentrons-appen.
1. Klicka på Enheter. 2. Klicka på din Flex i enhetslistan. 3. Under Instrument och moduler kommer den osynkroniserade griparen att visa en varningsbanner
"Firmware-uppdatering tillgänglig." Klicka på Uppdatera nu för att påbörja uppdateringen.
Du kan view den för närvarande installerade firmwareversionen av griparen. På pekskärmen, gå till Instrument och tryck på griparen. I Opentrons-appen, leta reda på griparkortet under Instrument och moduler, klicka på menyn med tre punkter () och klicka sedan på Om griparen.
3.4 Nödstoppshängare
Emergency Stop Pendant (Nödstopp) är en dedikerad hårdvaruknapp för att snabbt stoppa robotens rörelse. Opentrons Flex kräver att ett funktionellt, urkopplat nödstopp alltid är monterat. När du trycker på stoppknappen avbryter Flex alla körprotokoll eller inställningsarbetsflöden så snabbt som möjligt och förhindrar de flesta robotrörelser.
När ska nödstoppet användas
Du kan behöva trycka på nödstoppet:
När det finns överhängande risk för skada eller skada på en användare. När det finns överhängande risk för skada på roboten eller annan hårdvara. När sampämnen eller reagenser är i överhängande fara för kontaminering. Efter en hårdvarukollision.
Helst ska du aldrig behöva trycka på nödstoppet (förutom under sällsynta hårdvarukvalitetstestningar).
Använd inte nödstoppet för att avbryta normala, förväntade operationer. Använd istället mjukvaruknappen på pekskärmen eller i Opentrons-appen. Genom att pausa via programvaran kan du återuppta eller avbryta ditt protokoll, medan ett tryck på nödstoppet alltid avbryter protokollet omedelbart.

OPENTRONS FLEX

59

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Aktivera och släppa nödstoppet
Nödstoppet har en mekanism för att trycka in och vrida för att släppa.
Aktivera: Tryck ned den röda knappen bestämt. Flex kommer att gå in i stoppat tillstånd. Lös: När det har stoppats, åtgärda säkert eventuella problem i arbetsområdet, såsom att rensa spill,
ta bort labware eller flytta portalen (den ska röra sig fritt och lätt för hand). Släpp: Vrid knappen medurs. Den kommer att dyka upp till sitt urkopplade läge. Återställ: På pekskärmen eller i Opentrons-appen bekräftar du att du är redo att återuppta Flex
rörelse. Portalen kommer att återgå till sin utgångsposition och modulaktiviteten kommer att återupptas.
I det stoppade tillståndet kommer Flex och ansluten hårdvara att bete sig enligt följande:

Hårdvara Gantry Pipetter
Gripare
Värmare-Shaker Modul
Temperaturmodul Thermocycler Modul Statuslampa Pekskärm

Beteende
Automatisk horisontell rörelse stoppas. Manuell horisontell rörelse är tillåten.
Vertikal rörelse av pipetter stoppas. Motorbromsarna på vertikala axlar är inkopplade för att förhindra
pipetter från att falla. Kolvrörelse och spetsupptagning stoppas.
Vertikal rörelse av griparen stoppas. Motorbromsen på den vertikala axeln är inkopplad för att förhindra
griparen från att falla. Käftmotorerna som utövar gripkraft förblir aktiverade, så
griparen tappar inte laboratorieartiklar som den kan bära.
Shakern stannar och går hem. Labware-spärren öppnas. Uppvärmning är inaktiverad.
Värme eller kyla är inaktiverat.
Värme eller kyla är inaktiverat.
Ljuset blir rött.
Ett avbokningsmeddelande tar över skärmen. En indikator på skärmen visar när du har lyckats
kopplade ur stoppknappen.

60

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
3.5 Anslutningar

På/av-brytare

Sidokåpor

USB-A-portar

IEC strömingång

Portar AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Strömanslutning
Opentrons Flex ansluts till en strömkälla via ett standard IEC-C14-intag. Roboten innehåller en intern full-range AC/DC-strömförsörjning, som accepterar 100 VAC, 240/50 Hz ingång och omvandlar den till 60 VDC. All annan intern elektronik drivs av 36 VDC-matningen.

Varning: Använd endast nätsladden som medföljer roboten. Använd inte en nätsladd med otillräcklig ström eller volymtage betyg.
Håll nätsladden fri från hinder så att du kan ta bort den vid behov.

Det finns också ett CR1220 knappcellsbatteri för att driva robotens realtidsklocka när den inte är ansluten till elnätet. Batteriet är placerat inuti pekskärmshöljet. Kontakta Opentrons support för mer information om du tror att du behöver byta ut batteriet.

OPENTRONS FLEX

61

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING
USB och extra anslutningar
Opentrons Flex har totalt 10 USB-portar placerade i olika delar av roboten, som tjänar olika syften.
De 8 bakre USB-A-portarna (numrerade USB-1 till USB-8) och 2 extraportar (M12-kontakter numrerade AUX-1 och AUX-2) är för anslutning av Opentrons moduler och tillbehör. Se kapitlet Moduler för mer information om hur du ansluter dessa enheter och använder dem i dina protokoll. Den bakre USB-B-porten är till för att ansluta roboten till en bärbar eller stationär dator, för att upprätta kommunikation med Opentrons-appen som körs på den anslutna datorn. Den främre USB-A-porten (USB-9), som finns under pekskärmsskärmen, har samma funktionalitet som de bakre USB-A-portarna.
Obs: USB-portarna är strömbegränsade för att skydda roboten och anslutna enheter. Strömleveransen är uppdelad internt i tre portgrupper: de vänstra bakre USB-A-portarna (USB-1 till USB-4), de högra bakre USB-A-portarna (USB-5 till USB-8) och de främre USB-A hamn. Var och en av dessa grupper kommer att leverera maximalt 500 mA till anslutna USB 2.0-kompatibla enheter.
Nätverksanslutningar
Opentrons Flex kan ansluta till ett lokalt nätverk via en trådbunden (Ethernet) eller trådlös (Wi-Fi) anslutning.
Ethernet-porten är placerad på baksidan av roboten. Anslut den till en Ethernet-hubb eller slå på ditt nätverk. Eller, med början i robotsystemversion 7.1.0, anslut den direkt till en Ethernet-port på din dator. Den interna Wi-Fi-modulen stöder 802.11 ac/a/b/g/n-nätverk med en dubbelbandsantenn på 2.4/5 GHz.

62

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

3.6 Systemspecifikationer

Allmänna specifikationer

Mått Vikt Däckfack
Pekskärm
Wi-Fi Ethernet USB
Kamera Robot strömingång
Nätförsörjning voltage fluktuation Nätförsörjning frekvens fluktuation Distributionssystem Kortslutning matningsström Ramsammansättning Fönstersammansättning Ventilationskrav

87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 tum (B, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-kompatibla spår i arbetsområdet
(tillgänglig för pipetter) 4 extra fack för staging tips och labware
(endast tillgänglig för griparen) 7-tums LCD-pekskärm med rep- och skadatålig Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n dubbelband (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A-portar 1 USB-B-port USB 2.0-hastighet
2 MP, foto och video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10 %
±5 %
TN-S
6.3 A
Styvt stål och CNC-aluminiumdesign
Avtagbara sidofönster i polykarbonat och ytterdörr Minst 20 cm / 8 mellan enheten och en vägg

OPENTRONS FLEX

63

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Krav på ansluten PC

Opentrons-appen körs på: Windows 10 eller senare macOS 10.10 eller senare Ubuntu 12.04 eller senare

Miljöspecifikationer

Miljöförhållanden Omgivningstemperatur Relativ luftfuktighet Föroreningsgrad

Endast inomhusbruk +20 till +25 °C (rekommenderas) 40%, icke-kondenserande (rekommenderas) 60 (endast icke-ledande föroreningar)

För ytterligare information om acceptabla miljöförhållanden för användning och transport, se avsnittet Miljöförhållanden i kapitlet Installation och flytt.

Certifieringar

Certifieringar kompletta Ej certifierad/validerad

CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP

En sammanfattning av certifieringsinformationen är tryckt på en etikett på baksidan av Flex, nära på/av-knappen. För detaljerad certifierings- och efterlevnadsinformation, se avsnittet om efterlevnad av föreskrifter i introduktionen.

Serienummer
Varje Flex har ett unikt serienummer. Formatet på serienumret ger ytterligare information, inklusive robotens produktionsdatum. Till exempelample, skulle serienumret FLXA1020231007001 indikera:

64

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 3: SYSTEMBESKRIVNING

Tecken FLX A10 2023 10 07 001

Kategori Modell Version År Månad Dag Enhet

Betydelse Roboten är en Opentrons Flex. En kod för produktionsversionen av roboten. Roboten tillverkades 2023. Roboten tillverkades i oktober. Roboten tillverkades den 7:e dagen i månaden. Ett unikt nummer för robotar tillverkade en viss dag.

Du hittar serienumret för din Flex:
På certifieringsdekalen på baksidan av Flex, nära på/av-knappen. På baksidan av pekskärmen (mot arbetsområdet). I Opentrons-appen under Enheter > din Flex > Robotinställningar > Avancerat.

OPENTRONS FLEX

65

KAPITEL 4
Moduler
Opentrons Flex integreras med ett antal Opentrons hårdvarumoduler. Alla moduler är kringutrustning som upptar däckplatser, och de flesta styrs av roboten via en USB-anslutning.
Det här kapitlet beskriver funktioner och fysiska specifikationer för moduler som är kompatibla med Opentrons Flex-systemet, samt hur man fäster och kalibrerar dem. För ytterligare information om modulinställning och användning, se manualerna för de enskilda modulerna. För detaljer om hur du integrerar moduler i dina protokoll, se avsnittet Protocol Designer i kapitlet Protocol Development eller online-dokumentationen för Python Protocol API.
4.1 Moduler som stöds
Opentrons Flex är kompatibel med fyra typer av Opentrons-moduler på däck:
Heater-Shaker-modulen ger uppvärmning på däck och omloppsskakning. Modulen kan värmas till 95 °C och kan skaka sampfrån 200 till 3000 rpm.
Magnetblocket är en passiv enhet som håller laboratorieartiklar nära sina höghållfasta neodymmagneter. OT-2 Magnetic Module GEN1 och GEN2, som aktivt flyttar sina magneter upp och ner i förhållande till labware, stöds inte på Opentrons Flex.
Temperaturmodulen är en varm- och kallplattamodul som kan upprätthålla konstanta temperaturer mellan 4 och 95 °C.
Thermocycler-modulen tillhandahåller helautomatisk termocykling på däck, vilket möjliggör automatisering av uppströms och nedströms arbetsflödessteg. Thermocycler GEN2 är helt kompatibel med griparen. Thermocycler GEN1 kan inte användas med griparen och stöds därför inte på Opentrons Flex.
Vissa moduler som ursprungligen designats för OT-2 är kompatibla med Flex, som sammanfattas i tabellen nedan. En bock anger kompatibilitet och ett X anger inkompatibilitet.

66

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER

Enhetstyp och generation Heater-Shaker Module GEN1 Magnetic Module GEN1 Magnetic Module GEN2 Magnetic Block GEN1 Temperatur Module GEN1 Temperature Module GEN2 Thermocycler Module GEN1 Thermocycler Module GEN2 HEPA Module

OT-2

Böja

×

×

×

×

×

×

4.2 Modulcaddiesystem
Kompatibla moduler är designade för att passa in i caddies som upptar utrymme under däck. Detta system gör det möjligt för laboratorieutrustning ovanpå moduler att förbli närmare däcksytan, och det möjliggör även kabeldragning under däck så att däcket förblir snyggt under dina protokollkörningar.

Caddies för Heater-Shaker-, Temperatur- och Thermocycler-modulerna.

OPENTRONS FLEX

67

KAPITEL 4: MODULER
För att montera en modul i däcksytan måste den först placeras i motsvarande modulcaddie. Varje typ av kompatibel modul har sin egen caddiedesign som justerar modulen och laboratorieutrustningen exakt med det omgivande däcket. (Undantaget är magnetblocket, som inte kräver strömförsörjning eller USB-kabeldragning och därför sitter direkt på däcksytan.) Caddies för moduler som upptar en enda plats kan placeras var som helst i kolumn 1 eller 3; Thermocycler kan endast placeras i fack A1 och B1 samtidigt.
I allmänhet, för att installera en modulcaddie:
1. Ta bort eventuella kortplatser från platsen där modulen ska gå. 2. Sätt in modulen i dess förvaringsbox och dra åt dess ankare. 3. Dra modulens ström- och USB-kablar genom sidokåporna, upp genom den tomma kortplatsen och
fäst dem på modulen. 4. Sätt in modulhållaren i skåran och skruva fast den.
För exakta installationsinstruktioner, se snabbstartsguiden eller bruksanvisningen för den specifika modulen. Kabelanslutningar och sätt att fästa på caddien varierar beroende på modul.
4.3 Modulkalibrering
När du först installerar en modul på Flex måste du köra automatisk positionskalibrering. Denna process liknar positionskalibrering för instrument och säkerställer att Flex flyttas till exakt korrekta platser för optimal protokollprestanda. Under kalibreringen kommer Flex att flytta till platser på en modulkalibreringsadapter, som liknar kalibreringsrutorna som är en del av löstagbara kortplatser.

Kalibreringsadaptrar för Heater-Shaker-, Temperatur- och Thermocycler-modulerna.
Modulkalibrering krävs för alla moduler som installeras via en caddie: Heater-Shaker-, Temperatur- och Thermocycler-modulerna. Det magnetiska blocket kräver ingen kalibrering och är redo att användas så snart du placerar det på däck.

68

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER
När man ska kalibrera moduler
Flex uppmanar dig automatiskt att utföra kalibrering när du ansluter och slår på en modul som inte har några lagrade kalibreringsdata. (Du kan avvisa denna prompt, men du kommer inte att kunna köra protokoll med modulen förrän du har kalibrerat den.)
När du har slutfört kalibreringen lagrar Flex kalibreringsdata och modulens serienummer för framtida bruk. Flex kommer inte att uppmana dig att kalibrera om om du inte tar bort kalibreringsdata för den modulen i robotinställningarna. Du kan fritt slå på och stänga av din modul, eller till och med flytta den till en annan kortplats utan att behöva kalibrera om. Om du vill kalibrera om kan du när som helst påbörja processen från modulkortet i Opentrons App. (Omkalibrering är inte tillgänglig från pekskärmen.)
Hur man kalibrerar moduler
Instruktioner på pekskärmen eller i Opentrons-appen guidar dig genom kalibreringsproceduren. I allmänhet är stegen:
1. Samla den nödvändiga utrustningen, inklusive modulkalibreringsadaptern och pipettkalibreringsproben. 2. Placera kalibreringsadaptern på modulytan och se till att den är helt jämn.
Vissa moduler kan kräva att du fäster adaptern på modulen. 3. Fäst kalibreringsproben på en pipett. 4. Flex kommer automatiskt att röra vid vissa punkter på kalibreringsadaptern och spara dessa
kalibreringsvärden för framtida användning.
När kalibreringen är klar och du har tagit bort adaptern och sonden är modulen redo att användas i protokoll.
När som helst kan du view och hantera dina modulkalibreringsdata i Opentrons-appen. Gå till Robotinställningar för din Flex och klicka på fliken Kalibrering.

OPENTRONS FLEX

69

KAPITEL 4: MODULER
4.4 Heater-Shaker Modul GEN1

Heater-Shaker funktioner
UPPVÄRMNING OCH SKAKNING
Heater-Shaker ger uppvärmning på däck och skakning i omloppsbanan. Modulen kan värmas till 95 °C, med följande temperaturprofile:
Temperaturområde: 37 °C Temperaturnoggrannhet: ±95 °C vid 0.5 °C Temperaturjämnhet: ±55 °C vid 0.5 °CRamp hastighet: 10 °C/min
Modulen kan skaka sampfrån 200 till 3000 rpm, med följande skakprofile:
Orbital diameter: 2.0 mm Orbital riktning: Medurs Hastighetsområde: 200 rpm Hastighetsnoggrannhet: ±3000 rpm
Modulen har en strömförsedd labbspärr för att fästa plattorna på modulen innan den skakas.

70

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER
TERMISK ADAPTER En kompatibel värmeadapter krävs för att lägga till laboratorieutrustning till Heater-Shakern. Adaptrar kan köpas direkt från Opentrons på https://shop.opentrons.com. För närvarande tillgängliga termiska adaptrar inkluderar:

Universal platt adapter

PCR-adapter

Djupbrunnsadapter

96 Flat Bottenadapter

PROGRAMVARAKONTROLL
Heater-Shaker är helt programmerbar i Protocol Designer och Python Protocol API. Python API tillåter dessutom att andra protokollsteg kan utföras parallellt medan Heater-Shaker är aktiv. Se Icke-blockerande kommandon i API-dokumentationen för detaljer om hur du lägger till parallella steg i dina protokoll.
Utanför protokoll kan Opentrons-appen visa den aktuella statusen för Heater-Shaker och kan direkt styra värmaren, shakern och labware-spärren.

OPENTRONS FLEX

71

KAPITEL 4: MODULER

Heater-Shaker specifikationer

Mått Vikt Modul strömingång Strömadapteringång Nätaggregat voltage fluktuation Övervoltage Strömförbrukning

152 × 90 × 82 mm (L/B/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60 % Kategori II Tomgång: 10 W

Typiskt: Skakning: 4 W Uppvärmning: 11 W Uppvärmning och skakning: 10 W

Miljöförhållanden Omgivningstemperatur Relativ luftfuktighet Höjd Föroreningsgrad

Max: 125 W Endast inomhusbruk 130 °C Upp till 20 %, icke-kondenserande Upp till 25 80 m över havet 2,000

72

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER
4.5 Magnetblock GEN1

Magnetiska blockfunktioner
Opentrons magnetblock GEN1 är en magnetisk platthållare med 96 brunnar. Magnetiska block används i protokoll som förlitar sig på magnetism för att dra ut partiklar ur suspensionen och hålla kvar dem i brunnsplattor under tvättning, sköljning eller andra elueringsprocedurer. Till exempelample, automatiserad NGS-förberedelse; rening av genomiskt och mitokondriellt DNA, RNA eller proteiner; och andra extraktionsprocedurer är alla användningsfall som kan involvera magnetiska block.
MAGNETISKA KOMPONENTER
Magnetblocket är strömlöst, innehåller inga elektroniska komponenter och flyttar inte magnetiska pärlor upp eller ner i lösning. Brunnarna består av 96 höghållfasta neodymringmagneter fästa på en fjäderbelastad bädd, vilket hjälper till att upprätthålla toleranser mellan blocket och pipetter samtidigt som automatiserade protokoll körs.
PROGRAMVARAKONTROLL
Det magnetiska blocket GEN1 är fullt programmerbart i Protocol Designer och Python Protocol API.

OPENTRONS FLEX

73

KAPITEL 4: MODULER

Utanför protokoll är dock pekskärmen och Opentrons-appen inte medvetna om och kan inte visa den aktuella statusen för magnetblocket GEN1. Detta är en strömlös modul. Den innehåller inte elektroniska eller mekaniska komponenter som kan kommunicera med Flex-roboten. Du "kontrollerar" det magnetiska blocket via protokoll som använder Opentrons Flex Gripper för att lägga till och ta bort labware från denna modul.

Specifikationer för magnetblock

Mått Vikt Moduleffekt Magnetkvalitet Miljöförhållanden Omgivningstemperatur Relativ luftfuktighet Höjd Föroreningsgrad

136 × 94 × 45 mm (L/B/H) 1.13 kg Ingen, modulen är utan ström N52 neodym Endast för inomhusbruk 20 °C 25%, icke-kondenserande Upp till 30 m över havet 80

74

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER
4.6 Temperaturmodul GEN2

Temperaturmodulfunktioner
UPPVÄRMNING OCH KYLNING
Opentrons temperaturmodul GEN2 är en varm- och kallplattamodul. Det används ofta i protokoll som kräver uppvärmning, kylning eller temperaturförändringar. Modulen kan nå och bibehålla temperaturer från 4 °C till 95 °C inom några minuter, beroende på modulens konfiguration och innehåll.
TERMISKA BLOCK
För att hålla labware vid temperatur använder modulen termiska aluminiumblock. Modulen kommer med 24-brunnars och 96-brunnars termiska block. Temperaturmodulen kommer med ett djupt brunnsblock och ett platt bottenblock designat för användning med Flex Gripper. Blocken rymmer 1.5 mL och 2.0 mL rör, 96-brunnars PCR-plattor, PCR-remsor, djupa brunnsplattor och plattbottenplattor.

OPENTRONS FLEX

75

KAPITEL 4: MODULER
Obs: Modulen levereras också med ett platt bottenblock för OT-2. Använd inte OT-2-blocket med Flex. Det platta bottenblocket för Flex har orden "Opentrons Flex" på sin övre yta. Den för OT-2 gör det inte.

24-brunnars termiskt block

96-brunnars termiskt block

Djupt brunns termiskt block

Termoblock med platt botten för Flex

VATTENBAD OCH VÄRME
Eftersom luft är en bra värmeisolator kan luckor mellan laboratorieutrustning och ett termiskt block påverka temperaturmodulens prestanda tid till temperatur. Att placera lite vatten i 24- eller 96-brunnars termiska block eliminerar luftgap och förbättrar uppvärmningseffektiviteten. Den idealiska mängden vatten beror på termoblocket och laboratorieutrustningen. Se temperaturmodulens vitbok för ytterligare rekommendationer.

PROGRAMVARAKONTROLL
Temperaturmodulen är helt programmerbar i Protocol Designer och Python Protocol API.
Utanför protokoll kan Opentrons-appen visa aktuell status för temperaturmodulen och kan direkt styra temperaturen på ytplattan.

76

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER

Temperaturmodulspecifikationer

Mått Vikt Modul effekt
Miljöförhållanden Omgivningstemperatur Relativ luftfuktighet Höjd Föroreningsgrad

194 × 90 × 84 mm (L/B/H) 1.5 kg Ingång: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Utgång: 4.0 VDC, 36 A, max 6.1 W Endast för inomhusbruk <219.6 °C (rekommenderas för optimal kylning) ) Upp till 22 %, icke-kondenserande Upp till 60 m över havet 2000

4.7 Termocyklermodul GEN2

OPENTRONS FLEX

77

KAPITEL 4: MODULER
Thermocycler funktioner
Opentrons Thermocycler Module GEN2 är en helautomatisk termocykler på däck, som ger handsfree PCR i ett 96-brunnars plattformat. Dess uppvärmda lock och engångsförsegling passar tätt över plattan, vilket säkerställer effektivampuppvärmning och minimal avdunstning.
VÄRMNING OCH KYLNING Thermocycler-blocket kan värma och kyla, och dess lock kan värma, med följande temperaturprofile: Termoblock temperaturområde: 4 °C Termoblock maximal uppvärmning ramp hastighet: 4.25 °C/s från GEN2 omgivningstemperatur till 95 °C Termiskt block maximal kylning ramp hastighet: 2.0 °C/s från 95 °C till omgivningstemperatur Lockets temperaturområde: 37 °C Lockets temperaturnoggrannhet: ±110 °C Det automatiska locket kan öppnas eller stängas efter behov under protokollexekvering.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler kan köra profiles: automatiskt cykla genom en sekvens av blocktemperaturer för att utföra värmekänsliga reaktioner.
AUTOMATISK TÄTNING AV GUMMI Thermocyclern levereras med automatiska gummitätningar för att minska avdunstning. Varje tätning måste steriliseras före användning och kan användas i flera körningar. Ytterligare tätningar kan köpas direkt från Opentrons på https://shop.opentrons.com.
PROGRAMVARAKONTROLL Thermocycler är helt programmerbar i Protocol Designer och Python Protocol API. Utanför protokoll kan Opentrons-appen visa aktuell status för Thermocycler och kan direkt styra blocktemperaturen, lockets temperatur och lockets position.

78

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 4: MODULER

Termocykler specifikationer

Mått (lock öppet) Mått (lock stängt) Vikt (inklusive bakre kanal) Strömadapter vol.tage Strömadapterström Övervoltage Miljöförhållanden Omgivningstemperatur Relativ luftfuktighet Höjd Ventilationskrav

244.95 × 172 × 310.1 mm (L/B/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/B/H) 8.4 kg 100 V vid 240/50 Hz 60 A Kategori II Inomhusbruk endast 8.5 °C; 5 °C (acceptabelt) 20%, icke-kondenserande Upp till 25 m över havet Minst 2 cm / 40 mellan enheten och en vägg

OPENTRONS FLEX

79

KAPITEL 5
Labware
Det här kapitlet täcker objekt i Opentrons Labware Library som du kan använda med Opentrons Flex och Opentrons Flex Gripper. Den täcker också anpassad labware och, för våra avancerade användare, länkar labware-komponenter till deras motsvarande JSON file definitioner.
Du kan köpa labware från tillverkarna av originalutrustning eller från Opentrons butik på https://shop.opentrons.com. Och Opentrons arbetar alltid med att verifiera nya labware-definitioner. Se Labware Library (länkat ovan) för de senaste listorna.
5.1 Labware-koncept
Labware omfattar mer än bara de objekt som placeras på däcket och används i ett protokoll. För att hjälpa dig förstå Opentrons labware, låt oss undersöka detta ämne från tre olika perspektiv. För Opentrons Flex inkluderar labware objekt i vårt Labware Library, data som definierar varje del av labware och anpassad labware.
Labware som hårdvara
Labware-biblioteket innehåller allt du kan använda som standard med Opentrons Flex. Dessa är hållbara komponenter och förbrukningsartiklar som du arbetar med, återanvänder eller kasserar medan du kör ett protokoll. Du behöver inte vidta några speciella åtgärder för att arbeta med objekten i Labware Library. Flex-roboten vet hur man arbetar med allt i biblioteket automatiskt.
Labware som data
Labware-information lagras i Javascript-objektnotation (JSON) files med .json file förlängningar. En JSON file inkluderar rumsliga dimensioner (längd, bredd, höjd), volymetrisk kapacitet (L, mL) och andra mått som definierar ytegenskaper, deras former och platser. När du kör ett protokoll läser Flex dessa .json files att veta vilken labware som finns på däcket och hur man arbetar med den.

80

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL
Anpassad labware
Custom labware är labware som inte ingår i Labware Library eller är labware skapad av Custom Labware Creator. Men ibland kommer idén om anpassad labware tyngd av föreställningar om komplexitet, kostnad eller svårighet. Men anpassad labware borde inte vara svår att förstå eller skapa. Låt oss ta en stund för att packa upp konceptet med anpassad labware.
Som example, Opentrons Labware Library inkluderar 96-brunnars plattor (200 L) från Corning och BioRad, men andra tillverkare gör dessa brunnsplattor också. Och tack vare allmänt accepterade industristandarder är skillnaderna mellan dessa allestädes närvarande labartiklar små. Men en vanlig 200 L, 96-brunnars platta från Stellar Scientific, Oxford Lab eller Krackeler Scientific (eller någon annan leverantör för den delen) är "anpassad labware" för Flex eftersom den inte är fördefinierad i vårt Labware Library . Dessutom kan mindre skillnader i labware dimensioner ha en drastisk inverkan på framgången för din protokollkörning. Av denna anledning är det viktigt att ha en korrekt definition av labbprogram för varje labbprogram du vill använda i ditt protokoll.
Även om anpassade labware kan vara ett esoteriskt, engångspaket, är det för det mesta bara spetsarna, tallrikarna, rören och ställen som används varje dag i labb över hela världen. Återigen, den enda skillnaden mellan Opentrons labware och anpassade labware är att den nya artikeln inte är fördefinierad i programvaran som driver roboten. Flex kan och fungerar med andra grundläggande labware-artiklar eller något unikt, men du måste registrera objektets egenskaper i en labware-definition JSON file och importera dessa data till Opentrons-appen. Se avsnittet Custom Labware Definitions nedan för mer information.
Sammanfattningsvis inkluderar labware:
Allt i Opentrons Labware Library. Labware-definitioner: data i en JSON file som definierar former, storlekar och möjligheter för enskilda föremål
som brunnsplattor, spetsar, reservoarer, etc. Anpassad labware, som är föremål som inte ingår i Labware Library.
Efter reviewmed dessa viktiga koncept, låt oss undersöka kategorierna och objekten i Opentrons Labware Library. Efter det avslutar vi kapitlet med en överview av datakomponenterna i en labware file och sammanfatta Opentrons funktioner och tjänster som hjälper dig att skapa anpassad labware.

OPENTRONS FLEX

81

KAPITEL 5: LABARTIKEL

5.2 Reservoarer
Opentrons Flex fungerar som standard med reservoarerna med en och flera brunnar som anges nedan. Att använda dessa reservoarer hjälper till att minska ditt förberedande arbete eftersom de är automationsfärdiga direkt ur lådan. Reservoarinformation finns också tillgänglig i Opentrons Labware Library.

Reservoarer med en brunn

Tillverkarens specifikationer

Agilent

290 mL V botten

Axygen

90 ml platt botten

BO

195 ml platt botten

290 mL V botten

API-laddningsnamn
agilient_1_ reservoar_290ml
axygen_1_ reservoar_90ml
bo_1_ reservoar_195 ml
bo_1_ reservoar_290 ml

Reservoarer med flera brunnar

Tillverkarens specifikationer

BO

12 brunnar 15 mL/brunn V botten

USA Scientific

12 brunnar 22 mL/brunn V botten

API-belastningsnamn nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoar_22ml

82

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL
Reservoarer och API-definitioner
Opentrons Labware Library definierar egenskaperna för reservoarerna som listas ovan i separat JSON files. Roboten och Opentrons Python API förlitar sig på dessa JSON-definitioner för att fungera med labware som används av dina protokoll. Till exempelample, när du arbetar med API:t accepterar funktionen ProtocolContext.load_labware dessa labware-namn som giltiga parametrar i din kod. Länkade API-belastningsnamn ansluter till reservoarlabware-definitionerna i Opentrons GitHub-förvaret.
Anpassad reservoar labware
Försök att skapa en anpassad labware-definition med Opentrons Labware Creator om en reservoar du vill använda inte finns med här. En anpassad definition kombinerar alla dimensioner, metadata, former, volymetrisk kapacitet och annan information i en JSON file. Opentrons Flex behöver denna information för att förstå hur man arbetar med din anpassade labware. Se avsnittet Custom Labware Definitions för mer information.
5.3 Brunnsplattor
Opentrons Flex fungerar som standard med brunnplattor som anges nedan. Att använda dessa brunnsplattor hjälper till att minska ditt förberedande arbete eftersom de är automationsfärdiga direkt ur lådan. Brunnsplattainformation finns också tillgänglig i Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

83

KAPITEL 5: LABARTIKEL

6-brunnars tallrikar
Tillverkare Corning

Specifikationer
6 brunnar 16.8 mL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten

API-belastningsnamn corning_6_wellplate_16.8ml_flat

12-brunnars tallrikar
Tillverkare Corning

Specifikationer
12 brunnar 6.9 mL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten

API-belastningsnamn corning_12_wellplate_6.9ml_flat

24-brunnars tallrikar
Tillverkare Corning

Specifikationer
24 brunnar 3.4 mL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten

API-belastningsnamn corning_24_wellplate_3.4ml_flat

48-brunnars tallrikar
Tillverkare Corning

Specifikationer
48 brunnar 1.6 mL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten

API-belastningsnamn corning_48_wellplate_1.6ml_flat

84

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL

96-brunnars tallrikar
Tillverkare Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific

Specifikationer
96 brunnar 200 µL/brunn Cirkulära brunnar, V-botten
96 brunnar 360 µL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten
96 brunnar 100 µL/brunn Cirkulära brunnar, V-botten PCR hel kjol
96 brunnar 200 µL/brunn Cirkulära brunnar, platt botten
96 djupa brunnar 2000 µL/brunn Fyrkantiga brunnar, V-botten
Tuff 96 brunnar 200 µL/brunn Cirkulära brunnar, V-botten PCR hel kjol
Nunc 96 djupa brunnar 1300 µL/brunn Cirkulära brunnar, U-botten
Nunc 96 djupa brunnar 2000 µL/brunn Cirkulära brunnar, U-botten
96 djupa brunnar 2.4 mL/brunn Fyrkantiga brunnar, U-botten

API-belastningsnamn biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ kjol
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul termovetenskaplignunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

OPENTRONS FLEX

85

KAPITEL 5: LABARTIKEL

384-brunnars tallrikar

Tillverkare Applied Biosystems Bio-Rad
Corning

Specifikationer
384 brunnar 40 µL/brunn Cirkulära brunnar, V-botten
384 brunnar 50 µL/brunn Cirkulära brunnar, V-botten
384 brunnar 112 µL/brunn Fyrkantiga brunnar, platt botten

API-belastningsnamn tillämpat biosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Brunnsplatta adaptrar
Aluminiumplåtarna nedan är termiska adaptrar för Opentrons Heater-Shaker GEN1-modul. Du kan använda dessa fristående adapterdefinitioner för att ladda Opentrons verifierade eller anpassade labbvaror ovanpå Heater-Shakern.

Adaptertyp Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter Opentrons 96 Flat Botten Heater-Shaker Adapter

API-belastningsnamn opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Du kan också ladda både adaptern och labware med en enda definition. Vårt Labware-bibliotek innehåller flera förkonfigurerade termiska adapter och kombinationer av laboratorieprodukter som gör Heater-Shakern redo att användas direkt ur kartongen.

86

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL

Obs: Använd inte en kombinerad definition om du behöver flytta labware till eller från Heater-Shaker under ditt protokoll, antingen med griparen eller manuellt. Använd en fristående adapterdefinition istället.

Adapter/labware kombination

API-laddningsnamn

Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter med NEST Deep Well Plate 2 mL

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep

Opentrons 96 Flat Botten Heater-Shaker Adapter med NEST 96 Well Plate 200 µL Flat

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat

Opentrons 96 PCR Heater-Shaker Adapter med NEST Well Plate 100 µL

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt

Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter med Corning 384 Well Plate 112 µL Flat

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat

Adaptrar kan köpas direkt från Opentrons på https://shop.opentrons.com.

Brunnsplattor och API-definitioner
Opentrons Labware Library definierar egenskaperna för brunnsplattorna som anges ovan i separat JSON files. Flex-roboten och Opentrons Python API förlitar sig på dessa JSON-definitioner för att fungera med labware som används av dina protokoll. Till exempelample, när du arbetar med API:t accepterar funktionen ProtocolContext.load_labware dessa labware-namn som giltiga parametrar i din kod. Länkade API-belastningsnamn ansluter till brunnsplattans laboratoriedefinitioner i Opentrons GitHub-förvaret.

Anpassad brunnsplatta labware
Prova att använda Opentrons Labware Creator för att skapa en anpassad definition av laboratorieprodukter om en brunnsplatta du vill använda inte finns med här. En anpassad definition kombinerar alla dimensioner, metadata, former, volymetrisk kapacitet och annan information i en JSON file. Opentrons Flex läser den här informationen för att förstå hur du arbetar med din anpassade labware. Se avsnittet Custom Labware Definitions för mer information.

OPENTRONS FLEX

87

KAPITEL 5: LABARTIKEL

5.4 Spetsar och spetsställ
Opentrons Flex-spetsar finns i storlekarna 50 µL, 200 µL och 1000 µL. Dessa är genomskinliga, icke-ledande polypropenspetsar som finns med eller utan filter. De är sterila förpackade i ställ som rymmer 96 spetsar och är fria från DNas, RNas, proteas, pyrogener, humant DNA, endotoxiner och PCR-hämmare. Rack inkluderar även lotnummer och utgångsdatum.
Flexpipettspetsar fungerar med Opentrons Flex 50 µL och 1000 µL pipetter i 1-, 8- och 96-kanalskonfigurationerna. Även om du kan placera vilken som helst av Flex-spetsarna på 50 L- och 1000 L-pipetten, försök att matcha spetsen till pipettens nominella kapacitet. Till exempelample, det kan vara konstigt att sätta en 1000 L spets på 50 L pipetten. För 1000 L pipetten kan du säkert använda en 50 L, 200 L eller 1000 L spets.

Spetsställ
Ofiltrerade och filtrerade spetsar buntas ihop i ett ställ som består av en återanvändbar bottenplatta, en mittplatta som rymmer 96 spetsar och ett lock.

Spetsställ efter volym 50 µL 200 µL 1000 µL

API-laddningsnamn
Ofiltrerad: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrerad: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Ofiltrerad: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrerad: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Ofiltrerad: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrerad: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

För att underlätta identifieringen är spetsställets mittplåtar färgkodade baserat på spetsstorlek:
50 µL: magenta 200 L: gul 1000 µL: blå

88

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL

Vid beställning eller ombeställning kommer tips och ställ i två olika förpackade konfigurationer:
Ställar: Består av separat krymplindade spetsställ (bottenplatta, mittplatta med spetsar och lock). Rackade konfigurationer är bäst när renlighet är av största vikt, för att undvika korskontaminering eller när dina protokoll inte tillåter återanvändning av basplatta eller komponent.
Påfyllning: Består av ett komplett spetsställ (bottenplatta, mittplatta med spetsar och lock) och individuella spetsbehållare. Påfyllningskonfigurationer är bäst när dina protokoll tillåter återanvändning av basplatta eller komponent.
Tippipette-kompatibilitet
Flexpipettspetsar är designade för Opentrons Flex-pipetter. Flexspetsar är inte bakåtkompatibla med Opentrons OT-2-pipetter, och du kan inte heller använda OT-2-spetsar på Flex-pipetter.
Andra branschstandardspetsar kan fungera med Flex-pipetter, men detta rekommenderas inte. För att säkerställa optimal prestanda bör du endast använda Opentrons Flex-spetsar med Flex-pipetter.
Spetsställadapter
96-kanalspipetten kräver en adapter för att fästa ett helt ställ med spetsar ordentligt. Under fastsättningsproceduren rör sig pipetten över adaptern, sänker sig själv på monteringsstiften och drar spetsar på pipetterna genom att lyfta adaptern och spetsstället.

OPENTRONS FLEX

89

KAPITEL 5: LABARTIKEL

Obs: Använd endast spetsställsadaptern när du plockar upp ett helt ställ med spetsar på en gång. Placera spetsställ direkt på däcket när du plockar upp färre spetsar.
Varning: Risk för klämpunkter. Håll händerna borta från spetsställsadaptern medan pipetten fäster pipettspetsarna.

Adaptertyp Opentrons Flex 96 Tips Rack Adapter

API-laddningsnamn opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Spetsställsadaptern är kompatibel med Opentrons Flex Gripper. Du kan använda griparen för att placera nya spetsställ på adaptern eller för att plocka upp och flytta använda spetsställ i avfallsnedkastet.

5.5 Rör och rörställ

Opentrons 4-i-1 Tube Rack-system fungerar som standard med Opentrons Flex. Att använda 4-i-1-rörstället hjälper till att minska ditt förberedande arbete eftersom kombinationerna det ger är automationsfärdiga direkt ur lådan. Mer information finns också i Opentrons Labware Library.

90

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL
Kombinationer av rör och ställ
Opentrons 4-i-1 rörställ stöder en mängd olika rörstorlekar, var för sig eller i kombinationer av olika storlekar (volymer). Dessa inkluderar ett: 6-rörsställ för 50 mL rör (6 x 50 mL). Kombinationsställ med 10 rör för fyra 50 mL-rör och sex 15 mL-rör (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). 15-rörsställ för 15 mL rör (15 x 15 mL). 24-rörsställ för 0.5 mL, 1.5 mL eller 2 mL rör (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Obs: Alla rör är cylindriska med V-formad (konisk) botten om inget annat anges.

6-rörsställ
Rör typ 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-rörsställ
Rör typ 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL

API-belastningsnamn opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

OPENTRONS FLEX

91

KAPITEL 5: LABARTIKEL

15-rörsställ
Rör typ 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL

API-belastningsnamn opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

24-rörsställ

Rörtyp
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, U-formad botten 24 generisk 2 mL skruvkork 24 NEST 0.5 mL skruvkork 24 NEST 1.5 mL skruvkork 24 NEST 1.5 mL snäpplock 24 NEST 2 mL NEST 24 mL snäpplock, U-formad botten

API-belastningsnamn opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

API-definitioner för rörställ
Opentrons Labware Library definierar egenskaperna hos rörställen som anges ovan i separat JSON files. Flex-roboten och Opentrons Python API förlitar sig på dessa JSON-definitioner för att fungera med labware som används av dina protokoll. Till exempelample, när du arbetar med API:t accepterar funktionen ProtocolContext.load_labware dessa labware-namn som giltiga parametrar i din kod. Länkade API-belastningsnamn ansluter till tubrackets laboratorievarudefinitioner i Opentrons GitHub-förvaret.

92

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL
Specialanpassad laboratorieutrustning för rörställ
Försök att skapa en anpassad labware-definition med Opentrons Labware Creator om en kombination av rör och rack som du vill använda inte finns med här. En anpassad definition kombinerar alla dimensioner, metadata, former, volymetrisk kapacitet och annan information i en JSON file. Opentrons Flex läser den här informationen för att förstå hur du arbetar med din anpassade labware. Se avsnittet Custom Labware Definitions för mer information.
5.6 Aluminiumblock
Aluminiumblock levereras med temperaturmodulen GEN2 och kan köpas separat som ett set i tre delar. Setet innehåller en platt bottenplatta, ett 24-brunnars block och ett 96-brunnars block.
Opentrons Flex använder aluminiumblock för att hålla samprör och brunnsplattor på temperaturmodulen eller direkt på däck. När de används med temperaturmodulen kan aluminiumblocken behålla din sample-rör, PCR-remsor eller plattor vid en konstant temperatur mellan 4 °C och 95 °C.
Platt bottenplatta
Den platta bottenplattan för Flex levereras med temperaturmodulens caddie och är kompatibel med olika ANSI/SLAS-standardbrunnsplattor. Denna platta platta skiljer sig från plattan som levereras med själva temperaturmodulen eller den separata tredelade uppsättningen. Den har en bredare arbetsyta och avfasade hörnklämmor. Dessa funktioner hjälper till att förbättra prestandan hos Opentrons Flex Gripper när du flyttar labware till eller från plattan.
Du kan se vilken platt bottenplatta du har eftersom den för Flex har orden "Opentrons Flex" på sin ovansida. Den för OT-2 gör det inte.

OPENTRONS FLEX

93

KAPITEL 5: LABARTIKEL

24-brunnars aluminiumblock
Blocket med 24 brunnar används med individuella sample flaskor. Till exempelample, den accepterar sample flaskor som:
Har V-formad eller U-formad botten. Säkra innehållet med snäpplock eller skruvlock. Håll vätska i en kapacitet på 0.5 mL, 1.5 mL och 2 mL.

96-brunnars aluminiumblock
Blocket med 96 brunnar stöder en mängd olika typer av brunnsplattor. Till exempelample, den accepterar brunnsplattor som är:
Från stora tillverkare av brunnplåtar som Bio-Rad och NEST.
Designad med V-formad botten, U-formad botten eller platt botten.
Designad med 100 µL eller 200 µL brunnar.
Den är också kompatibel med generiska PCR-remsor.

Fristående adaptrar
Termoblock Flex platt bottenplatta 24-brunnars aluminiumblock 96-brunnars aluminiumblock

API-belastningsnamn opentrons_aluminium_flat_bottom_plate Se kombinationer av laboratorieprodukter nedan. opentrons_96_well_aluminium_block

Kombinationer av laboratoriematerial av aluminiumblock
Opentrons Labware Library stöder följande kombinationer av block, flaskor och brunnsplattor, som också definieras i separat JSON-labwaredefinition files. Flex-roboten och Opentrons Python API

94

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL
lita på dessa JSON-definitioner för att fungera med labware som används av dina protokoll. Till exempelample, när du arbetar med API:t accepterar funktionen ProtocolContext.load_labware dessa labware-namn som giltiga parametrar i din kod. Tabellerna nedan listar standardblock/behållarekombinationer och relaterade API-belastningsnamn. Länkar ansluter till motsvarande JSON-definitioner i Opentrons GitHub-förvaret.
Obs: Alla rör har V-formad botten om inget annat anges.

24-brunnars kombinationer av laboratoriematerial av aluminiumblock

24-brunnars blockinnehåll Generiskt 2 mL skruvlock NEST 0.5 mL skruvlock NEST 1.5 mL skruvlock NEST 1.5 mL snäpplock NEST 2 mL skruvlock NEST 2 mL snäpplock, U-formad botten

API-belastningsnamn opentrons_24_aluminiumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminiumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminiumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminiumblock_nest_1.5ml_luminum_capnest _24_aluminiumblock_nest_2ml_snapcap

96-brunnars kombinationer av laboratoriematerial av aluminiumblock

96-brunnars blockinnehåll Bio-Rad-brunnsplatta 200 µL Generisk PCR-remsa 200 µL NEST-brunnsplatta 100 µL

API-belastningsnamn opentrons_96_aluminiumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminiumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminiumblock_nest_wellplate_100uL

OPENTRONS FLEX

95

KAPITEL 5: LABARTIKEL

5.7 Labware och Opentrons Flex Gripper
Även om Opentrons Flex fungerar med alla inventarier i Labware Library, är Opentrons Flex Gripper endast kompatibel med specifika laboratorieartiklar. För närvarande är Gripper optimerad för användning med följande laboratorieartiklar.

Labware kategori Djupa brunnsplattor Helkjolar 96 brunnsplattor
Spetsställ (ofiltrerade och filtrerade spetsar)

Varumärken
NEST 96 Deep Well Plate 2 mL
Opentrons Tough 96 Well Plate 200 µL PCR Full Skirt NEST 96 Well Plate 200 µL Platt
Opentrons Flex 96 Tips Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tips Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tips Rack 1000 µL

Obs: För bästa resultat, använd Flex Gripper endast med den laboratorieutrustning som anges ovan. Flex Gripper kan fungera med andra ANSI/SLAS automationskompatibla labbprogram, men detta rekommenderas inte.

5.8 Anpassade definitioner av labbprogram
Som diskuterades i början av det här kapitlet, är anpassad labbprogram labbprogram som inte finns med i Opentrons Labware-bibliotek. Du kan använda andra vanliga eller unika laboratorieartiklar med Flex genom att noggrant mäta och registrera egenskaperna för det objektet och spara dessa data i en JSON file. När de importeras till appen använder Flex och API den JSON-datan för att interagera med din labware. Opentrons tillhandahåller verktyg och tjänster, som vi kommer att undersöka nedan, för att hjälpa dig använda Flex med anpassad labware.

96

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL

Skapa anpassade labware definitioner
Opentrons verktyg och tjänster hjälper dig att få anpassad labware inom räckhåll. Dessa funktioner rymmer olika kompetensnivåer och arbetssätt. Att skapa din egen labware och använda den med Opentrons Flex, hjälper till att göra roboten till ett mångsidigt och kraftfullt tillägg till ditt lab.

SKAPARE AV ANPASSAD LABVAROR
Custom Labware Creator är en kodfri, web-baserat verktyg som använder ett grafiskt gränssnitt för att hjälpa dig skapa en definition av labbprogram file. Labware Creator producerar en JSON-labwaredefinition file som du importerar till Opentrons-appen. Efter det är din anpassade labware tillgänglig för Flex-roboten och Python API.

ANPASSAD LABBVARUSERVICE
Kontakta oss om labware du vill använda inte finns i biblioteket, om du inte kan skapa dina egna definitioner eller för att ett anpassat objekt innehåller olika former, storlekar eller andra oegentligheter som beskrivs nedan.

Labware du kan definiera i Labware Creator
; Brunnar och rör är enhetliga och identiska. ; Alla rader är jämnt fördelade
(avståndet mellan raderna är lika).
; Alla kolumner är jämnt fördelade (avståndet mellan kolumnerna är lika).
; Passar perfekt i en kortplats.

Labware Opentrons måste definiera ; Brunnar och rörformer varierar. ; Raderna är inte jämnt fördelade.
; Kolumnerna är inte jämnt fördelade.
; Mindre än en kortplats (kräver adapter) eller sträcker sig över flera kortplatser.

OPENTRONS FLEX

97

KAPITEL 5: LABARTIKEL
Här är några diagram som hjälper dig att visualisera exetampsom beskrivits ovan. Normal Alla kolumner är jämnt fördelade och alla rader är jämnt fördelade. Kolumner behöver inte ha samma avstånd som rader.
Vanligt Rutnätet behöver inte vara i mitten av labware.
Oregelbundna rader är jämnt fördelade men kolumner är inte jämnt fördelade.
Oregelbundna kolumner/rader är jämnt fördelade men brunnarna är inte identiska.
Oregelbundet Det finns mer än ett rutnät.
Vårt labware-team kommer att arbeta för att förstå dina behov och designa anpassade labware-definitioner för dig. Se supportartiklarna Request a Custom Labware Definition och Custom Labware Request-formuläret för mer information. Detta är en avgiftsbelagd tjänst.

98

OPENTRONS FLEX

KAPITEL 5: LABARTIKEL

PYTHON API
Även om du inte kan skapa anpassad labware med vårt API, kan du använda anpassad labware med de tillgängliga API-metoderna. Du måste dock först definiera din anpassade labware och importera den till Opentrons-appen. När du har lagt till din labware till Opentrons-appen är den tillgänglig för Python API och roboten. Se avsnittet Custom Labware Definitions i Python API-dokumentationen för mer information. För information om hur du skriver protokollskript med API:t, se avsnittet Python Protocol API i kapitlet Protocol Development.
JSON labware-schema
En JSON file är ritningen för Opentrons standard och anpassade labware. Detta file innehåller och organiserar labware-data enligt designspecifikationerna som anges av standardschemat.
Ett schema är en ram

Dokument/resurser

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex vätskehanteringsrobot med öppen källkod [pdf] Bruksanvisning
FLEX Opentrons Flex vätskehanteringsrobot med öppen källkod, FLEX, Opentrons Flex vätskehanteringsrobot med öppen källkod, Flex vätskehanteringsrobot med öppen källkod, vätskehanteringsrobot med öppen källkod, vätskehanteringsrobot med öppen källkod, vätskehanteringsrobot, hanteringsrobot, robot

Referenser

Lämna en kommentar

Din e-postadress kommer inte att publiceras. Obligatoriska fält är markerade *