Robot de manipulare a lichidelor FLEX Opentrons Flex Open Source
“
Opentrons Flex
Specificatii:
- Specificatii generale: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Specificații de mediu: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Certificari: Lorem ipsum dolor este o experiență plăcută,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Număr de serie: XXX-XXXX-XXXX
Instrucțiuni de utilizare a produsului:
1. Instalarea și calibrarea instrumentului:
Urmați pașii descriși în manualul pentru pipetă și prindere
instalare.
2. Relocare:
Pentru mișcări scurte, consultați secțiunea 2.5 din manual. Pentru
mișcări pe distanțe lungi, urmați instrucțiunile furnizate. Mișcare generală
sfaturi sunt de asemenea disponibile.
3. Conexiuni:
Asigurați-vă conexiunea corectă la alimentare, așa cum este detaliat în manual.
Conectați dispozitivele USB și auxiliare după cum este necesar. Conexiuni de retea
trebuie stabilite urmând instrucțiunile.
4. Proiectant de protocol:
Înțelegeți cerințele pentru Protocol Designer și aflați cum
pentru a proiecta noi protocoale sau a modifica pe cele existente conform laboratorului dvs
cerințe.
5. API-ul Python Protocol:
Explorați scrierea și rularea scripturilor folosind API-ul Python Protocol.
Descoperiți funcții exclusive Python pentru funcționalitate îmbunătățită.
6. Protocoale OT-2:
Aflați despre protocoalele OT-2 Python, protocoalele OT-2 JSON și
Protocoale modulului magnetic pentru diferite tipuri de experimente.
Întrebări frecvente (FAQ):
Î: Cum depanez dacă robotul nu se mișcă ca
așteptat?
R: Verificați conexiunea de alimentare, asigurați-vă că este calibrată corect
instrumente și verificați dacă nu există obstacole în
calea robotului.
Î: Pot folosi pipete personalizate cu Opentrons Flex?
R: Opentrons recomandă utilizarea pipetelor compatibile pentru optim
performanță și precizie.
„`
Opentrons Flex
Manual de instructiuni
Opentrons Labworks Inc.
decembrie 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Numele înregistrate, mărcile comerciale etc. utilizate în acest document, chiar dacă nu sunt marcate în mod specific ca atare, nu trebuie considerate neprotejate de lege.
Cuprins
Prefață . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Structura acestui manual . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Note și avertismente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Capitolul 1 Introducere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Bine ați venit la Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Ce este nou în Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Stații de lucru Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Informaţii de siguranţă . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Simboluri de siguranță. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Avertismente de siguranță electrică . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Avertismente suplimentare de siguranță . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Măsuri de siguranță . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Siguranța biologică . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Vapuri toxice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Lichide inflamabile . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Conformitatea cu reglementările . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Siguranța . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Compatibilitate electromagnetică . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Avertismente și note FCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Conformitatea ISED Canada . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Avertizare de mediu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Precertificarea Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Capitolul 2: Instalare și relocare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Cerințe de siguranță și operare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Unde se plasează Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Consumul de energie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Condiții de mediu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Unboxing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Efort și timp necesar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Ladă și material de ambalare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elemente de produs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Partea 1: Scoateți cutia . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Partea 2: Eliberați Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Partea 3: Asamblarea finală și pornirea . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Prima rulare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Pornire . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Conectarea la o rețea sau la un computer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Instalarea actualizărilor de software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Atașarea suspendului pentru oprire de urgență . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Dați un nume robotului dvs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instalarea și calibrarea instrumentului . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Instalarea pipetei . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Instalarea prindere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Relocare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Mișcări scurte. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Mișcări pe distanțe lungi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Sfaturi generale privind mutarea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Gânduri finale despre mutare. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Capitolul 3: Descrierea sistemului. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Componente fizice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Cadru și carcasă . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Puntea și zona de lucru . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Stagzona ing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Fixare punte. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Tobogan pentru deșeuri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Stagsloturi din zonă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sistemul de mișcare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Ecran tactil și afișaj LED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Specificații pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Calibrarea pipetei . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adaptor pentru suport pentru vârfuri de pipetă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Ridicarea parțială a vârfului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Senzori cu pipetă. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Actualizări de firmware pentru pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Specificații prindere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Calibrarea prindere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Actualizări firmware Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Suspensie pentru oprire de urgență . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Când să utilizați oprirea de urgență . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Activarea și eliberarea opritorului de urgență . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Conexiuni . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Conexiune la alimentare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB și conexiuni auxiliare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Conexiuni la rețea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Specificații de sistem. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specificații generale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specificații de mediu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certificari. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Număr de serie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Capitolul 4: Module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Module acceptate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Sistem caddy modul . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Calibrarea modulului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Când să calibrați modulele. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Cum să calibrați modulele . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul încălzitor-agitator GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Caracteristici Heater-Shaker. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specificații încălzitor-shaker . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Bloc magnetic GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Caracteristicile blocului magnetic. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specificații bloc magnetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Modulul de temperatură GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Caracteristicile modulului de temperatură . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specificațiile modulului de temperatură . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modulul termociclor GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Caracteristicile termociclorului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specificații termociclor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Capitolul 5: Produse de laborator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Concepte de laborator. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Produse de laborator ca hardware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Produse de laborator ca date . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Produse de laborator personalizate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Rezervoare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoare cu un singur puț . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoare cu mai multe sonde. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoare și definiții API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Produse de laborator personalizate pentru rezervor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Plăci de puțuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
plăci cu 6 godeuri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 plăci cu 12 godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 plăci cu 24 godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 plăci cu 48 de godeuri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 plăci cu 96 godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 plăci cu 384 godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Adaptoare pentru plăci de puțuri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Plăci de puțuri și definiții API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Ustensile de laborator personalizate pentru plăci de puțuri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Vârfuri și suporturi pentru vârfuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Rafturi pentru vârfuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Compatibilitate tippipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adaptor suport pentru vârfuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Tuburi și suporturi pentru tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Combinații de tuburi și suporturi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rafturi cu 6 tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 rafturi cu 10 tuburi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Rafturi cu 15 tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Rafturi cu 24 de tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Definiții API pentru suport pentru tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Articole de laborator personalizate pentru suport pentru tuburi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Blocuri de aluminiu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Placă cu fund plat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Bloc de aluminiu cu 24 de godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Bloc de aluminiu cu 96 de godeuri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Adaptoare independente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Combinații de articole de laborator din bloc de aluminiu . . . . . . . . . . . . . . . .94 Combinații de articole de laborator cu bloc de aluminiu cu 24 de godeuri . . . . . . . . .95 Combinații de articole de laborator cu bloc de aluminiu cu 96 de godeuri . . . . . . . . .95 5.7 Produse de laborator și prindere Flex Opentrons . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Definiții personalizate de laborator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Crearea de definiții personalizate de laborator . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 Schema de laborator JSON . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Definiții JSON de laborator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Capitolul 6: Dezvoltarea protocolului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Protocoale prefabricate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Biblioteca de protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Serviciul de dezvoltare personalizat a protocolului . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Proiectant de protocol. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Cerințe pentru Protocol Designer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Proiectarea unui protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Modificarea protocoalelor existente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API-ul Python Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Scrierea și rularea scripturilor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Caracteristici exclusive pentru Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 Protocoale OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 Protocoale Python OT-2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 Protocoale JSON OT-2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protocoale modulului magnetic . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Capitolul 7: Software și operare. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Operarea ecranului tactil. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Tabloul de bord robot . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Managementul protocolului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Detalii protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Rulați configurarea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Verificarea poziţiei materialelor de laborator . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Progresul rulării. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Finalizarea executării . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Managementul instrumentelor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Setări robot. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Configurarea punții . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Aplicația Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalarea aplicației . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Transferarea protocoalelor către Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Starea și comenzile modulului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Rulări recente de protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Operare avansată . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operarea liniei de comandă prin SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Capitolul 8: Întreținere și service . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Curăţarea Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Înainte de a începe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Ce poți curăța . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Soluții de curățare. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Curăţarea tocului şi a panourilor ferestrelor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Curăţarea punţii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Curățarea portalului. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Curățarea jgheabului deșeurilor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Curăţarea pipetelor şi a vârfurilor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Decontaminarea pipetei . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Curăţarea vârfurilor pipetei . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Curăţarea prinderii . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Curăţarea modulelor. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Curăţarea generală a modulului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Garnituri termociclu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Articole de laborator sigure pentru autoclave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Întreţinerea Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Servicii Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Calificarea instalării și calificarea funcționării . . . 155 Întreținere preventivă . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garanție . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Anexa A: Glosar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Anexa B: Documentație suplimentară . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Documentația API-ului Python Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Referință API HTTP Opentrons. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Documentația dezvoltatorului . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Anexa C: Software open-source . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons pe GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Alte depozite . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Anexa D: Asistență și informații de contact . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Vânzări . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Suport . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Informații comerciale . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Prefaţă
Bine ați venit la manualul de instrucțiuni pentru robotul de manipulare a lichidelor Opentrons Flex. Acest manual vă ghidează prin aproape tot ce trebuie să știți pentru a configura și utiliza Flex, concentrându-se pe subiectele care sunt cele mai relevante pentru utilizatorii obișnuiți ai Flex într-un mediu de laborator.
Structura acestui manual
Opentrons Flex este un sistem complex, așa că există multe căi diferite pentru a învăța tot ceea ce poate face. Simțiți-vă liber să sari direct la capitolul care abordează orice subiect de care ești curios! De exampDacă aveți deja un Flex configurat în laborator, puteți sări peste capitolul Instalare și Relocare.
Dacă preferați o abordare ghidată, acest manual este structurat astfel încât să îl puteți urma de la început până la sfârșit.
Aflați despre Flex. Caracteristicile distinctive ale Flex sunt enumerate în Capitolul 1: Introducere. Introducerea include, de asemenea, informații importante privind siguranța și reglementările.
Începeți cu Flex. Dacă trebuie să configurați Flex, urmați instrucțiunile detaliate din Capitolul 2: Instalare și mutare. Apoi familiarizați-vă cu componentele Flex din Capitolul 3: Descrierea sistemului.
Configurați-vă puntea. Configurarea punții permite diferite aplicații științifice pe Flex. Capitolul 4: Module descrie perifericele Opentrons pe care le puteți instala în sau deasupra platformei pentru a efectua sarcini științifice specifice. Capitolul 5: Produse de laborator explică cum să lucrezi cu echipamente pentru păstrarea lichidelor.
Rulați un protocol. Utilizarea de bază a Flex este rularea de proceduri științifice standardizate, cunoscute sub numele de protocoale. Capitolul 6: Dezvoltarea protocolului oferă mai multe modalități de a obține protocoale gata făcute sau de a le proiecta singur. Pentru a rula protocolul, urmați instrucțiunile din Capitolul 7: Software și operare, care conține și instrucțiuni pentru efectuarea altor sarcini și personalizarea setărilor robotului.
Continuați să funcționeze Flex. Urmați sfaturile din Capitolul 8: Întreținere și service pentru a vă menține Flexul curat și funcțional optim. Sau înscrieți-vă pentru unul dintre serviciile Opentrons enumerate acolo și lăsați-ne să ne ocupăm de Flex pentru dvs.
Aflați și mai multe. Mai ai nevoie de altceva? Consultați anexele. Anexa A: Glosarul definește termenii legați de Flex. Anexa B: Documentația suplimentară vă indică și mai multe resurse pentru produsele Opentrons și scrierea codului pentru a controla Flex.
OPENTRONS FLEX
9
PREFAŢĂ
Anexa C: Software-ul Open-Source explică modul în care software-ul Opentrons este găzduit pe GitHub ca resursă atât pentru dezvoltatori, cât și pentru non-dezvoltatori.
Anexa D: Informații de asistență și contact listează cum să intrați în contact cu Opentrons dacă aveți nevoie de asistență în afara ceea ce oferă documentația noastră.
Note și avertismente
În acest manual, veți găsi note formatate special și blocuri de avertizare. Notele oferă informații utile care pot să nu fie evidente în cursul obișnuit al utilizării Flex. Acordați o atenție deosebită avertismentelor – acestea sunt utilizate numai în situații în care riscați rănirea personală, deteriorarea echipamentului, pierderea sau deteriorareaampfișiere sau reactivi, pierderi de date sau alte daune. Notele și avertismentele arată astfel:
Sample Notă: Acesta este ceva ce ar trebui să știți, dar nu reprezintă niciun pericol.
SampAvertisment: Acesta este ceva ce trebuie să știți, deoarece există riscuri asociate cu acesta.
10
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1
Introducere
Acest capitol vă prezintă ecosistemul Opentrons Flex, inclusiv designul general al sistemului și configurațiile disponibile ale stației de lucru. Include, de asemenea, informații importante privind conformitatea și siguranța, pe care ar trebui să le consultațiview înainte de a configura robotul Opentrons Flex. Pentru mai multe detalii despre caracteristicile Opentrons Flex, consultați capitolul Descrierea sistemului.
1.1 Bine ați venit la Opentrons Flex
Opentrons Flex este un robot de manipulare a lichidelor proiectat pentru debit ridicat și fluxuri de lucru complexe. Robotul Flex este baza unui sistem modular care include pipete, un dispozitiv de prindere de laborator, accesorii pentru punte, module pe punte și articole de laborator - toate pe care le puteți schimba singur. Flex este proiectat cu un ecran tactil, astfel încât să puteți lucra cu acesta direct la banca de laborator sau să îl puteți controla din întregul laborator cu aplicația Opentrons sau API-urile noastre open-source.
Stațiile de lucru Flex vin cu toate echipamentele - robot, hardware și materiale de laborator - de care aveți nevoie pentru a începe automatizarea sarcinilor comune de laborator. Pentru alte aplicații, Opentrons Flex rulează pe software și firmware complet open-source și este independent de reactiv și de laborator, oferindu-vă control asupra modului în care proiectați și rulați protocoalele.
Ce este nou în Flex
Opentrons Flex face parte din seria de roboți Opentrons Liquid Handler. Utilizatorii Opentrons Flex pot fi familiarizați cu Opentrons OT-2, robotul nostru personal de pipetare. Flex depășește capacitățile OT-2 în mai multe domenii cheie, oferind un randament mai mare și timp de trecere.
Caracteristică Debitul pipetei
Capacitate de pipetă și vârf
Descriere
Pipetele Flex au 1, 8 sau 96 de canale. Pipeta cu 96 de canale operează pe de 12 ori mai multe godeuri simultan decât cea mai mare pipetă OT-2.
Pipetele Flex au intervale de volum mai mari (1 µL, 50 µL) și toate pot funcționa cu orice volum de vârfuri Opentrons Flex. Aceasta este o îmbunătățire față de pipetele OT-5, care au intervale mai mici și trebuie să utilizeze vârfuri cu un interval de volum potrivit.
OPENTRONS FLEX
11
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Gripper Calibrare automată Ecran tactil Caddie pentru module Coordonatele slotului puntei Coș de gunoi mobil Dimensiunea și greutatea
Opentrons Flex Gripper preia și mută automat articolele de laborator pe punte, fără intervenția utilizatorului. Gripperul permite fluxuri de lucru mai complexe într-un singur protocol.
Calibrarea pozițională a pipetelor Flex și a gripperului este complet automatizată. Apăsați un buton, iar instrumentul se va deplasa la punctele prelucrate cu precizie de pe punte pentru a-și determina poziția exactă, salvând acele date pentru a fi utilizate în protocoalele dvs.
Flex are propria interfață cu ecran tactil care vă permite să îl controlați direct, pe lângă utilizarea aplicației Opentrons. Utilizați ecranul tactil pentru a porni rulările de protocol, pentru a verifica starea lucrării și pentru a modifica setările chiar pe robot.
Modulele flexibile se potrivesc în caddie care ocupă spațiu sub punte. Caderiile vă plasează ustensilele de laborator mai aproape de suprafața punții și permit rutarea cablurilor sub punte. Caddiile permit și mai multe configurații de module și de laborator pe punte.
Fantele pentru punte de pe Flex sunt numerotate cu un sistem de coordonate (A1D4) care este similar cu modul în care sunt numerotate puțurile pe materialele de laborator.
Coșul de gunoi poate merge în mai multe locații pe punte pe Flex. Locația implicită (slot A3) este poziția recomandată. De asemenea, puteți utiliza prinderea pentru a arunca gunoiul în toboganul de deșeuri opțional.
Flex este puțin mai mare și mult mai greu decât OT-2. Sarcinile de instalare pe Flex necesită asistența unui partener de laborator.
O comparație detaliată a specificațiilor tehnice ale robotului este disponibilă pe Opentrons website-ul.
Atât roboții Flex, cât și OT-2 rulează pe software-ul nostru open-source, iar aplicația Opentrons poate controla ambele tipuri de roboți simultan. Deși protocoalele OT-2 nu pot fi rulate direct pe Flex, este simplu să le adaptați (consultați secțiunea Protocoale OT-2 din capitolul Dezvoltarea protocolului pentru detalii).
Stații de lucru flexibile
Stațiile de lucru Opentrons Flex includ robotul Flex, accesorii, pipete și gripper, module de pe punte și materiale de laborator necesare pentru automatizarea unei anumite aplicații. Toate componentele stației de lucru sunt modulare. Dacă trebuie să schimbați aplicațiile, puteți adăuga sau schimba alt hardware Flex și consumabile compatibile.
12
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
STAȚIE DE LUCRU NGS
Stația de lucru Opentrons Flex NGS automatizează pregătirea bibliotecii NGS. Poate automatiza fluxurile de lucru de pre-secvențiere folosind orice sistem de reactiv de vârf, inclusiv fragmentarea și tagpregătirea bibliotecii bazată pe mențiune.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru NGS include:
Gripper Alegerea configurației pipetei
Două pipete cu 8 canale (1 µL și 50 µL) Pipetă cu 5 canale (1000 µL) Jgheab pentru deșeuri Modul de temperatură bloc magnetic Modul termociclator Kit de laborator cu vârfuri de filtru, tuburi de microcentrifugă, rezervoare și plăci PCR
STAȚIE DE LUCRU PCR
Stația de lucru Opentrons Flex PCR automatizează configurarea PCR și fluxurile de lucru de termociclare timp de până la 96 de secundeamples. Se poate alicota reactivi refrigerați și sampintr-o placă PCR cu 96 de godeuri. Odată cu adăugarea modulului termociclator automat, utilizați prinderea pentru a încărca placa în termociclator, apoi rulați programul PCR ales.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru PCR include:
Gripper Alegerea configurației pipetei
Pipetă cu 1 canal (1 µL) și pipetă cu 50 canale (8 µL) Pipetă cu 1 canale (50 µL) Kit de laborator pentru modulul de temperatură a jgheabului de deșeuri cu vârfuri de filtru, tuburi de microcentrifugă, rezervoare și plăci PCR
OPENTRONS FLEX
13
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
STAȚIE DE LUCRU EXTRACȚIE ACID NUCLEIC
Stația de lucru pentru extracția acidului nucleic Opentrons Flex automatizează izolarea și purificarea ADN/ARN. Folosește blocul magnetic pentru separarea margelelor magnetice și agitatorul de încălzire pentru sample liza și resuspendarea granulelor magnetice.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru pentru extracția acidului nucleic include:
Gripper Alegerea configurației pipetei
Pipetă cu 1 canal (5 µL) și pipetă cu 1000 canale (8 µL) Pipetă cu 5 canale (1000 µL) Jgheab pentru deșeuri Modul magnetic de încălzire-agitator Kit de laborator cu vârfuri de filtru, rezervoare, plăci pentru godeuri PCR și
STAȚIE DE LUCRU DE PURIFICARE A PROTEINELOR DE BILLE MAGNETICE
Stația de lucru Opentrons Flex Magnetic Bead pentru purificarea proteinelor automatizează purificarea proteinelor la scară mică și proteomicaample prep pentru până la 96 samples. Este compatibil cu mulți reactivi populari pe bază de margele magnetice.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru pentru purificarea proteinelor include:
Gripper Alegerea configurației pipetei
Pipetă cu 1 canal (5 µL) și pipetă cu 1000 canale (8 µL) Pipetă cu 5 canale (1000 µL) Jgheab pentru deșeuri Modul magnetic de încălzire-agitator Kit de laborator cu vârfuri de filtru, rezervoare, plăci pentru godeuri PCR și
STAȚIE DE LUCRU FLEX PREP
Stația de lucru Opentrons Flex Prep automatizează fluxurile de lucru simple de pipetare. Configurați stația de lucru cu pipete cu 1 și 8 canale pentru a efectua sarcini precum sample transfer, sample duplicare, și
14
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
alicotarea reactivilor. Configurați stația de lucru cu pipeta cu 96 de canale pentru a efectua alicote de reactiv de mare randament și stări de placăamping.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru Flex Prep include:
Alegerea configurației pipetei: pipetă cu 1 canal (5 µL) și pipetă cu 1000 canale (8 µL) pipetă cu 5 canale (1000 µL)
Trusă de laborator cu vârfuri de filtru, tuburi de microcentrifugă și rezervoare
STAȚIE DE LUCRU DE PREGĂTIRE A PLASMIDELOR
Stația de lucru Opentrons Flex Plasmid Prep automatizează fluxurile de lucru de extracție și purificare a plasmidelor pe bază de perle magnetice. Această stație de lucru este echipată cu pipete de mare volum, un modul de încălzire-shaker și un bloc magnetic pentru a găzdui majoritatea chimiei bazate pe bile.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru Plasmid Prep include:
Pipetă Gripper cu 1 canal (5 µL) și pipetă cu 1000 canale (8 µL) Jgheab pentru deșeuri Bloc magnetic încălzitor-modul agitator Kit de laborator cu vârfuri de filtru, tuburi de microcentrifugă, rezervoare, plăci PCR și plăci pentru puțuri adânci
STAȚIE DE LUCRU SYNBIO
Stația de lucru Opentrons Flex SynBio automatizează o varietate de fluxuri de lucru de biologie sintetică, cum ar fi sinteza și clonarea ADN-ului. Utilizează blocul magnetic și modulul de temperatură pentru a susține majoritatea chimiei bazate pe margele. Adăugați modulul Thermocycler pentru a efectua incubarea capacului încălzit și amplificări.
Pe lângă robotul Flex, stația de lucru SynBio include:
Modulul de temperatură pentru bloc magnetic cu pipetă cu 1 canal (5 µL) și pipetă cu 1000 canale (8 µL)
OPENTRONS FLEX
15
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Kit de laborator cu vârfuri obișnuite și cu filtru, tuburi de microcentrifugă, rezervoare, plăci PCR și plăci pentru puțuri adânci
1.2 Informații de siguranță
Robotul de manipulare a lichidelor Opentrons Flex a fost proiectat pentru o funcționare în siguranță. Consultați specificațiile și instrucțiunile de conformitate din această secțiune pentru a asigura utilizarea în siguranță a Flex. Aceste instrucțiuni acoperă utilizarea în siguranță a conexiunilor de intrare și ieșire pentru produs, inclusiv conexiunile de alimentare și de date, precum și etichetele de avertizare găsite pe robotul Flex și pe hardware-ul aferent. Utilizarea dispozitivului într-un mod diferit de cel specificat în acest manual poate pune utilizatorul și echipamentul în pericol.
Simboluri de siguranță
Diverse etichete de pe Flex și din acest manual vă avertizează cu privire la sursele potențiale de rănire sau vătămări.
Simbol
Descriere
Avertisment: Avertizează utilizatorii cu privire la condiții potențial periculoase. Acțiuni care pot duce la vătămări corporale sau deces.
Atenție: Avertizează utilizatorii împotriva deteriorării echipamentului. Date pierdute sau corupte. Întreruperea irecuperabilă a operațiunii în curs de desfășurare.
Soc electric: Identifică componentele instrumentului care ar putea prezenta un risc de electrocutare dacă instrumentul este manipulat necorespunzător.
Suprafață fierbinte: identifică componentele instrumentului care prezintă un risc de vătămare corporală din cauza căldurii/temperaturile ridicate dacă instrumentul este manipulat necorespunzător.
Punct de strângere: identifică componentele instrumentului care pot prezenta un risc de vătămare corporală atunci când sunt în mișcare.
16
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Veți găsi următoarele etichete pe Flex:
Etichete de proprietate intelectuală Etichete de conformitate cu reglementările (de exemplu, ETL) Etichete de pericol electric Etichete de avertizare generală Etichete de produs Etichete cu puncte de prindere Vol. maretage etichete Etichete de putere
Avertismente de siguranță electrică
Respectați întotdeauna următoarele avertismente de siguranță electrică:
Simbol
Descriere
Conectați robotul la un circuit împământat de Clasa 1. Consultați secțiunea Conexiune la alimentare din capitolul Descrierea sistemului.
Nu conectați (conectați), nu deconectați (dezconectați) și nu utilizați cabluri de alimentare CA dacă: Cablul este uzat sau deteriorat. Alte cabluri, cabluri sau prize atașate sunt uzate sau deteriorate.
Utilizarea cablurilor de alimentare deteriorate poate provoca un pericol de electrocutare, care poate duce la răniri grave sau deteriorarea robotului.
Nu înlocuiți cablul de alimentare CA decât în direcția asistenței Opentrons.
Pentru mai multe informații despre cerințele electrice, consultați secțiunea Consumul de energie din capitolul Instalare și relocare.
OPENTRONS FLEX
17
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Avertismente suplimentare de siguranță
Respectați întotdeauna următoarele avertismente suplimentare de siguranță:
Simbol
Descriere
Opentrons Flex nu a fost certificat pentru utilizare cu lichide explozive sau inflamabile. Nu încărcați plăci, tuburi sau flacoane care conțin lichide explozive sau inflamabile în robot și nu utilizați instrumentul în alt mod cu lichide explozive sau inflamabile în carcasă.
Folosiți bune practici de laborator și respectați măsurile de precauție ale producătorului atunci când lucrați cu substanțe chimice. Opentrons nu este responsabil pentru nicio daune cauzate sau ca urmare a utilizării de substanțe chimice periculoase.
Flex cântărește 88.5 kg (195 lbs). Ca urmare, este nevoie de două persoane pentru a-l ridica și a muta în siguranță. Consultați secțiunea Relocare din capitolul Instalare și relocare.
Flex ar trebui să fie plasat pe o suprafață capabilă să-și susțină greutatea de 88.5 kg (195 lbs) cu o suprafață suficientă pentru a găzdui robotul plus distanța minimă a acestuia (20 cm/8 inchi). Consultați secțiunea Cerințe de siguranță și operare din capitolul Instalare și mutare.
Flex poate emite vibrații în timpul funcționării. Așezați robotul pe o suprafață solidă, plană și rezistentă la apă, cu contravântuiri sau îmbinări sudate. Consultați secțiunea Cerințe de siguranță și operare din capitolul Instalare și mutare.
Măsuri de siguranță
Pentru a proteja Flex de deteriorare, urmați aceste măsuri de precauție:
18
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Simbol
Descriere
Utilizați materiale de laborator care sunt conforme cu ANSI/SLAS sau aprobate de Opentrons. Consultați capitolul Labware.
Țineți materialele corozive, agenții sau materialele dăunătoare în alt mod departe de robot.
Siguranța biologică
Tratați probele și reactivii care conțin materiale prelevate de la oameni ca agenți potențial infecțioși. Opentrons recomandă utilizarea procedurilor de laborator sigure, așa cum este explicat în Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) Ediția a 6-a.
În circumstanțe normale, Flex nu creează aerosoli detectabili din lichide surse. Cu toate acestea, în anumite condiții, este posibil să se genereze aerosoli din lichide surse. Când operați cu lichide sursă de nivel de biosecuritate 2 sau mai mare, luați în considerare măsurile de precauție împotriva expunerii la aerosoli, în conformitate cu organismele locale de reglementare. Pentru a minimiza riscul potențial de expunere la aerosoli de la robot, asigurați-vă că:
Efectuați întreținerea așa cum este descris în capitolul Întreținere și service. Instalați și fixați corect toate capacele instrumentelor, pipetele, modulele și materialele de laborator. Utilizați tehnica adecvată de pipetare pentru a ajuta la diminuarea aerosolilor.
Fumuri toxice
Dacă lucrați cu solvenți volatili sau substanțe toxice, utilizați un sistem eficient de ventilație de laborator pentru a elimina orice vapori care ar putea fi produși.
Lichide inflamabile
Flex nu a fost evaluat pentru utilizare cu lichide inflamabile și nu trebuie utilizat cu lichide inflamabile.
OPENTRONS FLEX
19
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
1.3 Conformitatea cu reglementările
Opentrons Flex respectă toate cerințele aplicabile ale următoarelor standarde de siguranță și electromagnetice.
Siguranţă
ID regulă IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Titlu
Cerințe de siguranță pentru echipamentele electrice pentru măsurare, control și utilizare în laborator Partea 1: cerințe generale
Cerințe speciale pentru echipamentele de laborator pentru amestecare și agitare
Compatibilitate electromagnetică
ID regulă EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Partea 15 Subpartea B Clasa A IC ICES-003
Titlu
Echipamente electrice pentru măsurare, control și utilizare în laborator Cerințe EMC Partea 1: Cerințe generale Radiatoare neintenționate
Managementul spectrului și echipamentele care cauzează interferențe în telecomunicații Echipamente standard pentru tehnologia informației (inclusiv aparate digitale)
Avertismente și note FCC
Avertisment: Schimbările sau modificările aduse acestei unități neaprobate în mod expres de Opentrons ar putea anula autoritatea utilizatorului de a opera echipamentul.
Acest dispozitiv respectă partea 15 a regulilor FCC. Funcționarea este supusă următoarelor condiții:
20
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 1 INTRODUCERE
Acest dispozitiv nu poate cauza interferențe dăunătoare. Acest dispozitiv trebuie să accepte orice interferență primită, inclusiv interferențe care pot cauza nedorite
operare.
Notă: Acest echipament a fost testat și s-a constatat că respectă limitele pentru un dispozitiv digital de clasă A, în conformitate cu Partea 15 a regulilor FCC. Aceste limite sunt concepute pentru a oferi o protecție rezonabilă împotriva interferențelor dăunătoare atunci când echipamentul este utilizat într-un mediu comercial. Acest echipament generează, utilizează și poate radia energie de frecvență radio și, dacă nu este instalat și utilizat în conformitate cu manualul de instrucțiuni, poate provoca interferențe dăunătoare comunicațiilor radio. Utilizarea acestui echipament într-o zonă rezidențială poate cauza interferențe dăunătoare, caz în care utilizatorului i se va cere să corecteze interferența pe cheltuiala sa.
Conformitatea ISED Canada
Canada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Acest produs îndeplinește specificațiile tehnice aplicabile Innovation, Science and Economic Development Canada.
Produsul prezent este conform cu specificațiile tehnice aplicabile pentru Inovare, Științe și Dezvoltare Economică Canada.
Avertizare de mediu
Avertisment: Cancer și daune asupra reproducerii www.P65Warnings.ca.gov
Precertificare Wi-Fi
Modulul Wi-Fi este precertificat pentru utilizare în multe regiuni:
Statele Unite ale Americii (FCC): Identificator FCC UAY-W8997-M1216 Spațiul Economic European (CE): Fără identificator public (autodeclarare) Canada (IC): Număr de identificare al versiunii hardware W8997-M1216 Japonia (TELEC): Număr certificat 020-170034 India (WPC): Număr de înregistrare ETA-SD-20191005525 (autodeclarație)
OPENTRONS FLEX
21
CAPITOLUL 2
Instalare și relocare
Acest capitol descrie cum să vă pregătiți laboratorul pentru Opentrons Flex, cum să configurați robotul și cum să-l mutați dacă este necesar. Înainte de a primi livrarea Flex, asigurați-vă că laboratorul sau instalația dvs. îndeplinesc toate criteriile din secțiunea Cerințe de siguranță și operare. Când este timpul să vă puneți în funcțiune Flex, urmați instrucțiunile detaliate din secțiunile Unboxing, First Run și Instalarea și calibrarea instrumentelor sau utilizați serviciul Opentrons Onsite Support Setup. Și dacă vreodată trebuie să mutați Flex într-o locație nouă, aproape sau departe, urmați pașii din secțiunea Relocare.
2.1 Cerințe de siguranță și operare
Unde să plasați Opentrons Flex
Spațiul este o marfă valoroasă în aproape fiecare laborator. Flexul dumneavoastră va avea nevoie de ceva – dar nu prea mult, deoarece este proiectat să se potrivească pe jumătate dintr-o bancă standard de laborator. Asigurați-vă că aveți un spațiu care îndeplinește următoarele criterii.
Suprafața bancului: Suprafață staționară, robustă, plană, rezistentă la apă. Mesele sau băncile cu roți (chiar și roțile blocate) nu sunt recomandate. Flex se mișcă rapid și are multă masă, ceea ce poate zgudui sau dezechilibrează mesele ușoare sau mobile.
Suportul greutății: numai robotul cântărește 88.5 kg (195 lb) și ar trebui să fie ridicat doar de două persoane care lucrează împreună. Așezați robotul pe o suprafață care poate susține cu ușurință greutatea acestuia plus greutatea oricăror module, articole de laborator, lichide sau alte echipamente de laborator care vor fi utilizate în aplicațiile dvs.
Spațiu de operare: Dimensiunile de bază ale robotului sunt 87 cm l x 69 cm D x 84 cm H (aproximativ 34″ x 27″ x 33″). Flex are nevoie de 20 cm (8″) de spațiu liber lateral și din spate pentru cabluri, conexiuni USB și pentru a disipa evacuarea de la modulele care se încălzesc și se răcesc.
Avertisment: Nu poziționați părțile laterale sau din spate ale dispozitivului Flex la nivel de un perete.
22
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
84 cm 33 ″
87 cm 34 ″
Dimensiunile bazei Opentrons Flex.
69 cm 27 ″
20 cm 8 ″
20 cm 8 ″
20 cm 8 ″
Top view de Opentrons Flex, arătând spațiul minim lateral și spate.
OPENTRONS FLEX
23
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Consumul de energie
Opentrons Flex ar trebui să fie conectat la o priză de perete la sau în apropierea locului unde îl instalați. Conectați Flex numai la circuite care pot găzdui consumul maxim de putere:
Putere de intrare: 36 VDC, 6.1 A Consum inactiv: 30 W Consum tipic: 40 W (în timpul rulării protocolului) Consum maxim: Aproximativ 50 W
Consumul exact de energie depinde de:
Cantitatea și tipul de mișcare executată în timpul unui protocol. Cantitatea de timp pe care robotul o petrece inactiv. Starea luminilor de pe robot. Câte instrumente sunt atașate.
Nu uitați să luați în considerare alte componente electronice care consumă energie pe același circuit, inclusiv modulele Flex cu propriile surse de alimentare. De exampModulul Thermocycler are un consum maxim de energie (630 W) mult mai mare decât robotul Flex în sine. Dacă este necesar, consultați managerul unității dumneavoastră pentru a vă asigura că îndeplinește cerințele de putere ale echipamentului dumneavoastră.
Condiții de mediu
Condițiile de mediu pentru utilizarea recomandată, utilizarea acceptabilă și depozitarea variază:
Recomandat pentru funcționarea sistemului
Acceptabil pentru funcționarea sistemului
Temperatura ambiantă +20 până la +25 °C
+2 până la +40 °C
Umiditate relativă Altitudine
40%, fără condensare
Aproximativ 500 m deasupra nivelului mării
30%, fără condensare (sub 80 °C)
Până la 2000 m deasupra nivelului mării
Depozitare si transport
-10 până la +60 °C
10%, fără condensare (sub 85 °C)
Până la 2000 m deasupra nivelului mării
24
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Opentrons a validat performanța Opentrons Flex în condițiile recomandate pentru funcționarea sistemului, iar funcționarea în acele condiții ar trebui să ofere rezultate optime. Flex este sigur de utilizat în condiții acceptabile pentru funcționarea sistemului, dar rezultatele pot varia. Nu porniți și nu utilizați Flex în condiții în afara acestor limite. Condițiile de depozitare și transport se aplică numai atunci când robotul este complet deconectat de la curent și alte echipamente.
2.2 Unboxing
Felicitări! Opentrons Flex a sosit și i-ați pregătit un spațiu în laboratorul dumneavoastră. Să deschidem acea ladă monstroasă, să scoatem robotul și să-l pregătim pentru funcționare. Informațiile din această secțiune oferă o listă de piese și instrucțiuni care vă ghidează prin pașii necesari pentru a scoate Flexul, configurat și gata de utilizare. Am împărțit procedura de configurare în trei părți:
Partea 1 se referă la dezasamblarea cutiei. Partea 2 acoperă detașarea Flexului din ladă și mutarea lui într-o locație finală de asamblare. Partea 3 acoperă asamblarea finală și pornirea robotului pentru prima dată.
Efort și timp necesar
Veți dori să cereți unui partener de laborator să vă asiste cu procesul de despachetare, ridicare, mutare și asamblare. Va trebui să bugetați aproximativ 30 de minute până la o oră pentru acest efort.
Notă: Flex necesită două persoane pentru a-l ridica corect. De asemenea, ridicarea și transportul Flex prin mânere este cea mai bună modalitate de a muta robotul.
Ladă și material de ambalare
Despachetarea unui Flex îți oferă un robot minunat, dar rămâi și cu mai multe panouri mari de lăzi împreună cu componente de transport și umplutură asortate. Deși puteți arunca acest material, vă încurajăm să păstrați aceste articole dacă este disponibil spațiu de depozitare. Ambalajul este reutilizabil, ceea ce vă ajută să vă pregătiți Flexul pentru expediere dacă trebuie vreodată să-l trimiteți în altă parte (de exemplu, la o conferință sau la o nouă unitate) în viitor.
OPENTRONS FLEX
25
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Elemente de produs
Flex este livrat cu componentele enumerate mai jos. Pipetele, prinderea și modulele vin în ambalaje separate de lada principală Flex, chiar dacă le-ați achiziționat împreună ca stație de lucru.
(1) Robot Opentrons Flex
(1) Cablu USB
(1) Cablu de alimentare
(1) Cablu Ethernet
(5) chei în L (hexagonal de 12 mm, hexagonal de 1.5 mm, hexagonal de 2.5 mm, hexagonal de 3 mm,
T10 Torx)
(1) Pandantiv pentru oprire de urgență
(1) Slot pentru punte cu cleme pentru articole de laborator
(4) Cleme de schimb pentru articole de laborator
(1) Sondă de calibrare a pipetei
(4) Mânere de transport și capace
(1) Panoul superior al ferestrei
(4) Panouri laterale pentru ferestre
(1) șurubelniță hexagonală de 2.5 mm
(1) cheie de 19 mm
(16 + piese de schimb) Șuruburi pentru ferestre (cap plat M4x8 mm)
26
(10) Șuruburi de rezervă pentru fantă pentru punte (cap mufa M4x10 mm)
(12) Șuruburi de rezervă pentru cleme pentru punte (cap mufa M3x6 mm)
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Partea 1: Scoateți cutia
Opentrons vă livrează Flex într-o ladă robustă din placaj. Cutia de transport folosește cârlig și zăvor clamps pentru a fixa panourile de sus, laterale și de jos împreună. Folosind zăvoare, în loc de cuie sau șuruburi, înseamnă că nu veți avea nevoie de o rangă (sau de multă forță) pentru a dezasambla lada și o puteți reasambla mai târziu, dacă este necesar.
Notă: Marginile lăzilor se pot deforma în timpul transportului. Poate doriți să folosiți mănuși de lucru pentru a vă proteja mâinile de așchiile de lemn.
Pentru a elibera zăvoarele, răsturnați clapeta zăvorului în sus și rotiți-o spre stânga (în sens invers acelor de ceasornic). Această acțiune mută clamp brațul din suportul său de reținere corespunzător. Apoi puteți întoarce brațul de blocare departe de ladă.
1 Deblocați cele opt zăvoare care țin partea superioară în lateral.
2 Scoateți panoul superior după eliberarea zăvoarelor.
OPENTRONS FLEX
27
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE 3 Deschideți punga albastră de transport, scoateți aceste articole din căptușeală și puneți-le deoparte:
Kit utilizator Cabluri de alimentare, Ethernet și USB Suspensie pentru oprire de urgență
4 Scoateți partea superioară a căptușelii din spumă pentru a expune panourile ferestrelor. Căptușeala protejează panourile laterale și superioare.
5 Scoateți panourile ferestrelor și puneți-le deoparte. Le vei atașa mai târziu.
28
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
6 Deblocați celelalte 16 zăvoare care țin panourile laterale unul de celălalt și baza cutiei. 7 Scoateți panourile laterale și puneți-le deoparte.
Partea 2: Eliberați Flex
După ce ați finalizat pașii din partea 1, ar trebui să vedeți acum un robot care se află într-o pungă de protecție și atașat la componentele de montare din oțel portocaliu. Geanta închide robotul și îl protejează de mediul exterior. Suporturile de oțel fixează robotul pe fundul cutiei. Două cadre de transport susțin robotul, distribuindu-i greutatea în mod uniform și menținându-l rigid, astfel încât să nu se deformeze în timpul transportului. Continuați să despachetați Flex și să-l scoateți de pe baza cutiei.
8 Folosind cheia de 19 mm din kitul utilizatorului, desfaceți suporturile de pe fundul cutiei. Puteți arunca parantezele sau le puteți salva pentru utilizare ulterioară.
OPENTRONS FLEX
29
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE 9 Trageți sau rotiți punga de transport până la capăt pentru a expune întregul robot.
10 Cu ajutorul partenerului dvs. de laborator, apucați mânerele din ramele portocalii de transport de pe ambele părți ale bazei robotului, ridicați Flexul de pe baza lăzii și așezați-l pe podea. Salvați sau aruncați baza cutiei și cadrul de transport.
30
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE 11 Folosind cheia hexagonală în L de 12 mm din kitul utilizatorului, scoateți cele patru șuruburi care țin ramele de transport la
Flexul. Salvați sau aruncați cadrele și șuruburile.
12 Scoateți cele patru mânere de aluminiu din kitul utilizator. Înșurubați mânerele în aceleași locații în care au ținut șuruburile cadrului de transport de 12 mm.
OPENTRONS FLEX
31
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
13 Cu ajutorul partenerului dumneavoastră de laborator, ridicați Flex de mânerele sale de transport și mutați-l pe un banc de lucru pentru asamblarea finală.
Partea 3: Asamblare finală și pornire
După ce mutați Flex într-o zonă de lucru temporară sau acasă permanentă, este timpul să puneți ultimele retușuri noului dvs. robot.
14 Dacă ați mutat robotul în locul final de lucru, scoateți mânerele de transport și înlocuiți-le cu capacele de finisare. Capacele închid deschiderile mânerului din cadru și conferă robotului un aspect curat. Returnați mânerele în kitul utilizator pentru depozitare.
32
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
15 Preluați panourile superioare și laterale din spuma de ambalare pe care ați lăsat-o deoparte după îndepărtarea capacului cutiei.
16 Montați panourile ferestrelor pe Flex, urmând informațiile de pe etichetă de pe folia de protecție frontală. Apoi îndepărtați folia de protecție.
17 Folosind șuruburile teșite pentru ferestre și șurubelnița de 2.5 mm din setul de utilizator, atașați panourile ferestrelor la Flex. Asigurați-vă că orificiile teșite (în formă de V) din panourile ferestrelor sunt orientate spre exterior (spre dvs.). Acest lucru permite șuruburilor să se potrivească la același nivel cu suprafața ferestrei.
Avertisment: Orientarea incorectă a panourilor poate duce la deteriorare. Un cuplu excesiv al șuruburilor poate crăpa panourile. Strângeți manual șuruburile până când panourile ferestrelor sunt sigure în mod rezonabil. Aceasta nu este o încercare de forță.
OPENTRONS FLEX
33
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE 18 Folosind șurubelnița de 2.5 mm din setul utilizator, scoateți șuruburile de blocare din portal. Aceste
șuruburile împiedică mișcarea portalului în timpul transportului. Șuruburile de blocare a portalului sunt amplasate: Pe șina laterală din stânga, lângă partea din față a robotului. Sub brațul portalului vertical. Pe șina din partea dreaptă, lângă partea din față a robotului, într-un suport portocaliu. Sunt două șuruburi aici.
Portalul se mișcă ușor cu mâna după îndepărtarea tuturor șuruburilor de transport. 19 Tăiați și îndepărtați cele două benzi de cauciuc care țin coșul de gunoi în loc în timpul transportului.
34
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
20 Atașați cablul de alimentare la Flex și conectați-l la priza de perete. Asigurați-vă că zona punții este liberă de obstacole. Întoarceți comutatorul de alimentare din partea din spate din stânga robotului. Odată pornit, portalul se mută în locația sa de acasă, iar ecranul tactil afișează instrucțiuni suplimentare de configurare.
Acum că Flexul dvs. a ieșit din cutie și este gata de plecare, continuați la secțiunea First Run de mai jos.
2.3 Prima rulare
Efectuați configurarea de bază pe ecranul tactil înainte de a conecta orice alt hardware la Flex. Robotul vă va ghida prin conectarea la rețeaua de laborator, actualizarea la cel mai recent software și personalizarea Flex, dându-i un nume.
Porniți
Când porniți Flex, sigla Opentrons va apărea pe ecranul tactil. După câteva momente, va afișa ecranul „Bine ați venit la Opentrons Flex”.
Ecranul de bun venit Opentrons Flex. Ar trebui să vedeți acest ecran numai când porniți Flexul pentru prima dată.
OPENTRONS FLEX
35
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Conectați-vă la o rețea sau un computer
Urmați instrucțiunile de pe ecranul tactil pentru a conecta robotul, astfel încât să poată verifica actualizările software și să primească protocolul files. Există trei metode de conectare: Wi-Fi, Ethernet și USB.
Opțiuni de conectare la rețea. Trebuie să aveți conexiune la internet pentru a configura Flex. Wi-Fi: utilizați ecranul tactil pentru a vă conecta la rețele Wi-Fi care sunt securizate cu autentificare personală WPA2 (majoritatea rețelelor care necesită doar o parolă pentru a se alătura se încadrează în această categorie).
Notă: Flex nu acceptă portaluri captive (rețele care nu au o parolă, dar care încarcă a webpagina pentru autentificarea utilizatorilor după conectare).
De asemenea, vă puteți conecta la o rețea Wi-Fi deschisă, dar acest lucru nu este recomandat.
Avertisment: Conectarea la o rețea Wi-Fi deschisă va permite oricui din raza de acțiune a semnalului rețelei să controleze robotul Opentrons Flex fără autentificare.
Dacă trebuie să vă conectați la o rețea Wi-Fi care utilizează autentificarea întreprinderii (inclusiv „eduroam” și rețele academice similare care necesită un nume de utilizator și o parolă), mai întâi conectați-vă la aplicația Opentrons prin Ethernet sau USB pentru a finaliza configurarea inițială. Apoi conectați-vă la rețeaua Wi-Fi de companie în setările de rețea pentru Flex. Pentru a accesa setările de rețea:
36
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
1. Faceți clic pe Dispozitive în bara laterală din stânga a aplicației Opentrons. 2. Faceți clic pe meniul cu trei puncte () pentru Flex și alegeți Setări robot. 3. Faceți clic pe fila Rețea.
Selectați rețeaua dvs. din meniul drop-down sau alegeți „Alăturați-vă altei rețele…” și introduceți SSID-ul acesteia. Alegeți metoda de autentificare întreprindere pe care o folosește rețeaua dvs. Metodele suportate sunt:
EAP-TTLS cu TLS EAP-TTLS cu MS-CHAP v2 EAP-TTLS cu MD5 EAP-PEAP cu MS-CHAP v2 EAP-TLS
Fiecare dintre aceste metode necesită un nume de utilizator și o parolă și, în funcție de configurația exactă a rețelei, poate necesita un certificat files sau alte opțiuni. Consultați documentația IT a unității dumneavoastră sau contactați managerul IT pentru detalii despre configurarea rețelei.
Ethernet: conectați robotul la un comutator de rețea sau un hub cu un cablu Ethernet. De asemenea, vă puteți conecta direct la portul Ethernet de pe computer, începând cu versiunea 7.1.0 a sistemului de robot.
USB: Conectați cablul USB A-la-B furnizat la portul USB-B al robotului și la un port deschis de pe computer. Utilizați un cablu USB B-la-C sau un adaptor USB A-la-C dacă computerul nu are un port USB-A.
Pentru a continua cu configurarea, computerul conectat trebuie să aibă aplicația Opentrons instalată și rulată. Pentru detalii despre instalarea aplicației Opentrons, consultați secțiunea Instalare aplicație din capitolul Software și operare.
Instalați actualizări de software
Acum că v-ați conectat la o rețea sau un computer, robotul poate verifica dacă există actualizări de software și firmware și le poate descărca dacă este necesar. Dacă există o actualizare, instalarea poate dura câteva minute. Odată ce actualizarea este finalizată, robotul va reporni.
OPENTRONS FLEX
37
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Atașați pandantivul pentru oprire de urgență
Conectați dispozitivul de oprire de urgență inclus (oprire de urgență) la un port auxiliar (AUX-1 sau AUX-2) de pe spatele robotului.
Înainte și după conectarea pandantivului de oprire de urgență.
Atașarea și activarea opririi de urgență este obligatorie pentru atașarea instrumentelor și rularea protocoalelor pe Flex. Pentru mai multe informații despre utilizarea opritorului de urgență în timpul funcționării robotului, consultați secțiunea Suspensie pentru oprire de urgență din capitolul Descrierea sistemului.
Dați un nume robotului dvs
Numirea robotului vă permite să-l identificați cu ușurință în mediul de laborator. Dacă aveți mai mulți roboți Opentrons în rețea, asigurați-vă că le oferiți nume unice. După ce ați confirmat numele robotului dvs., veți fi dus la tabloul de bord Opentrons Flex. Probabil următorul pas pe care veți dori să-l faceți este atașarea instrumentelor, care este tratat în secțiunea următoare.
2.4 Instalarea și calibrarea instrumentului
După configurarea inițială a robotului, următorul pas este atașarea instrumentelor la robot și calibrarea acestora.
Pentru a instala un instrument, apăsați mai întâi pe Instrumente de pe ecranul tactil sau accesați secțiunea Pipete și module a ecranului cu detaliile dispozitivului din aplicația Opentrons. Alegeți un suport gol și selectați fie Atașați pipeta, fie Atașați prindere. Dacă suportul pe care doriți să îl utilizați este deja ocupat, trebuie să detașați mai întâi pipeta sau gripperul.
38
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Notă: Procesul general de instalare este același, indiferent dacă utilizați ecranul tactil sau aplicația Opentrons. Orice dispozitiv pe care începeți va controla procesul de instalare până când îl finalizați sau îl anulați.
Dacă începeți pe ecranul tactil, aplicația va afișa robotul ca fiind „ocupat”. Dacă începeți în aplicație, ecranul tactil va afișa un modal care indică faptul că instalarea instrumentului este în curs.
Procesul exact de instalare variază în funcție de instrumentul pe care îl atașați, așa cum este descris în secțiunile de mai jos. Toate instrumentele au o procedură de calibrare automată, pe care ar trebui să o efectuați imediat după instalare.
Instalarea pipetei
Când instalați o pipetă, veți fi ghidat prin următorii pași pe ecranul tactil sau în aplicația Opentrons.
1. ALEGEȚI TIPUL DE PIPETA Alegeți între pipetă cu 1 sau 8 canale și pipetă cu 96 canale. Atașarea pipetei cu 96 de canale necesită câțiva pași suplimentari, deoarece se atașează la o placă specială de montare care se întinde pe ambele monturi de pipetă.
2. PREGĂTIȚI-VĂ PENTRU INSTALARE Scoateți obiectele de laborator de pe punte și curățați zona de lucru pentru a facilita atașarea și calibrarea. De asemenea, adunați echipamentul necesar, cum ar fi sonda de calibrare, șurubelnița hexagonală și placa de montare (pentru pipeta cu 96 de canale).
3. CONECTAȚI ȘI SIGURAȚI PIPETA Portalul se va deplasa în fața robotului, astfel încât să puteți atașa pipeta.
Pipetele cu 1 și 8 canale se conectează direct la un suport pentru pipetă. Pipeta cu 96 de canale necesită o placă de montare. Pentru a atașa placa de montare, trebuie mai întâi să deconectați căruciorul axei Z pentru suportul potrivit pentru pipetă.
OPENTRONS FLEX
39
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Conectați pipeta la suportul pentru pipetă ales și fixați-i șuruburile.
4. RELAȚI CALIBRAREA AUTOMATĂ Pentru a calibra pipeta, atașați sonda de calibrare la duza adecvată a pipetei. Pipeta se va muta automat pentru a atinge anumite puncte de pe punte și va salva aceste valori de calibrare pentru utilizare ulterioară. Odată ce calibrarea este finalizată și ați scos sonda, pipeta va fi gata de utilizare în protocoale.
Instalare prindere
Când instalați prinderea, veți fi ghidat prin următorii pași pe ecranul tactil sau în aplicația Opentrons.
1. PREGĂTIȚI-VĂ PENTRU INSTALARE Scoateți obiectele de laborator de pe punte și curățați zona de lucru pentru a facilita atașarea și calibrarea. De asemenea, strângeți șurubelnița hexagonală necesară și asigurați-vă că știftul de calibrare se află în zona sa de depozitare a graperului.
2. CONECTAȚI ȘI SIGURAȚI GRIPPERUL Portalul se va deplasa în fața robotului, astfel încât să puteți atașa prinderea. Conectați prinderea la suportul de extensie și fixați-i șuruburile.
3. REZULTAȚI CALIBRAREA AUTOMATĂ Pentru a calibra prinderea, introduceți știftul de calibrare în falca frontală. Gripperul se va muta automat pentru a atinge anumite puncte de pe punte și va salva aceste valori de calibrare pentru utilizare ulterioară. Apoi repetați același proces cu știftul de calibrare în falca din spate. Odată ce calibrarea este finalizată și ați pus știftul înapoi în locația sa de depozitare, prinderea va fi gata de utilizare în protocoale.
2.5 Relocare
Această secțiune oferă sfaturi și instrucțiuni despre cum să vă mutați robotul Opentrons Flex pe distanțe scurte și lungi.
40
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Mișcări scurte
O mișcare scurtă se întinde pe o gamă de distanțe de la „să o mișcăm puțin” până la peste laborator, pe hol sau pe un alt etaj al clădirii tale. În aceste cazuri, puteți muta Flexul cu mâna. Transportul acestuia pe un cărucior de mână este, de asemenea, o opțiune bună.
Avertisment: Flex cântărește 88.5 kg. Ca urmare, este nevoie de două persoane pentru a-l ridica și a muta în siguranță.
Reatașați mânerele de ridicare pentru a muta dispozitivul Flex într-o locație nouă, din apropiere. Ridicarea și transportul Flex prin mânere este modalitatea corectă de a muta robotul pe distanțe scurte. Scoateți mânerele și depozitați-le în kitul utilizatorului după ce mutarea este finalizată. Pentru a preveni deteriorarea robotului, folosiți întotdeauna mânerele de ridicare pentru a-l ridica și a-l muta. Nu apucați cadrul pentru a ridica sau a muta robotul.
Mutări pe distanțe lungi
O mutare pe distanțe lungi vă transportă Flexul de pe terenul universității, al unității sau al instituției dvs. Dincolo de oraș, către un nou oraș, stat, provincie sau țară sunt toate exampa unei mișcări pe distanțe lungi. În acest caz, va trebui să împachetați Flexul pentru a-l proteja de elemente, șocuri și mișcări bruște care pot apărea în timpul tranzitului.
Dacă ați păstrat cutia de transport și suporturile interne care au venit împreună cu Flexul dvs., o puteți reambala în aceste materiale pentru o mutare pe distanțe lungi. Urmați pașii de despachetare în ordine inversă pentru a vă pregăti Flexul pentru o mișcare pe distanțe lungi. Practic, ar trebui să:
Deconectați cablul de alimentare și de rețea, dacă este atașat. Îndepărtați tot hardware-ul și materialele de laborator atașate. Reatașați plăcile punții. Blocați portalul (consultați secțiunea Sfaturi generale privind mutarea de mai jos). Scoateți și depozitați panourile ferestrelor.
Dacă ai păstrat cutia originală:
Reatașați cadrul de transport la Flex și fixați-l pe baza paletului folosind suporturile în L. Adăugați căptușeală și reasamblați cutia de transport.
OPENTRONS FLEX
41
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Dacă nu aveți cutia originală și materialul aferent, contactați o companie de transport cu renume. Ei pot gestiona procesul de ambalare, transport și livrare pentru dvs.
Sfaturi generale de mutare
DECONECTAȚI CABLURILE DE ALIMENTARE ȘI DE REȚEA Înainte de a muta Flexul, nu uitați să: Opriți alimentarea și deconectați-l de la sursa de alimentare. Deconectați cablul Ethernet sau USB, dacă este utilizat.
BLOCAȚI PORTICUL Înainte de a muta dispozitivul Flex, reintroduceți șuruburile de blocare pentru a menține portalul în poziție. Punctele de blocare a portalului sunt situate: Pe șina laterală stângă, lângă partea din față a robotului. Sub brațul portalului vertical. Pe șina din partea dreaptă, lângă partea din față a robotului. Blocarea acestei părți a portalului necesită un mic
suport portocaliu și două șuruburi de blocare.
42
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
ACASA PORTICUL Este posibil să nu doriți să blocați portalul dacă mutați robotul doar într-o locație din apropiere. Dacă decideți să nu îl blocați, folosiți cel puțin ecranul tactil sau aplicația Opentrons pentru a trimite portalul în poziția sa de start înainte de a-l opri. Pentru a porni prin intermediul ecranului tactil, atingeți meniul cu trei puncte () și apoi atingeți Acasă portal. Pentru a așeza portalul prin aplicația Opentrons: Faceți clic pe Dispozitive. Faceți clic pe Flex din lista de dispozitive. Faceți clic pe meniul cu trei puncte () și apoi faceți clic pe Acasă portal.
ELIMINAȚI MODULELE Modulele de pe punte și alte atașamente adaugă greutate suplimentară Flexului dumneavoastră. Ele afectează, de asemenea, centrul de greutate al robotului, ceea ce îl poate face să se simtă „bătut” atunci când îl ridicați. Pentru a ajuta la ușurarea și echilibrarea robotului, îndepărtați orice instrumente atașate și articole de laborator înainte de a-l ridica.
REINSTALARE FANTELE PUNTEI Vă recomandăm să reatașați fantele punții pentru o mișcare pe distanțe lungi. Securizarea sloturilor în locațiile lor originale ajută la prevenirea pierderii accidentale. Reatașarea fantelor punții pentru mișcări scurte în laborator este opțională.
RECALIBRAREA POST-MUTARE Ar trebui să recalibrați orice instrumente și module după ce le reinstalați. Pentru mai multe detalii despre calibrarea modulelor, consultați capitolul Module.
OPENTRONS FLEX
43
CAPITOLUL 2: INSTALARE ȘI RELOCARE
Gânduri finale despre mutare
Flexul dumneavoastră este o mașină robustă și bine construită, dar este și un instrument științific precis, conceput pentru toleranțe exigente. Ca urmare, ar trebui să îl tratați cu grijă atunci când îl mutați în zona de lucru locală sau îl trimiteți în țară. Aceasta înseamnă să urmați îndrumările furnizate aici și să folosiți propriul simț comun despre cum să transportați un echipament scump de laborator. Concluzie: atunci când mutați Flexul, greșiți din partea precauției și a căptușelii suplimentare.
Dacă aveți întrebări sau nelămuriri cu privire la relocarea dvs. Flex, contactați-ne la support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3
Descrierea sistemului
Acest capitol descrie sistemele hardware ale Opentrons Flex, care stau la baza caracteristicilor sale principale de automatizare a laboratorului. Suporturile pentru punte, portal și instrumente ale Opentrons Flex permit utilizarea de precizie a componentelor lichide și de manipulare a materialelor de laborator. Ecranul tactil de pe dispozitiv permite rularea protocoalelor și verificarea stării robotului fără a fi nevoie să vă aduceți computerul pe banca de laborator. Conectivitatea prin cablu și fără fir permite control suplimentar din aplicația Opentrons (consultați capitolul Software și operare pentru mai multe detalii) și extinderea caracteristicilor sistemului prin atașarea perifericelor (consultați capitolul Module).
3.1 Componente fizice
Camera foto
Lumină de stare
Touch screen
Cadru
Puntea portalului
Ușa din față
Locațiile componentelor fizice ale Opentrons Flex.
Capace pentru mânerul geamurilor laterale
OPENTRONS FLEX
45
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Cadru și carcasă
Cadrul robotului Opentrons Flex oferă rigiditate și suport structural pentru puntea și portalul său. Toate subsistemele mecanice sunt situate și montate pe cadrul principal. Cadrul este construit în principal din tablă și aluminiu extrudat.
Cadrul metalic are deschideri pentru geamurile laterale și o ușă din față din policarbonat transparent care vă lasă să vedeți ce se întâmplă în interiorul Flex. Balamalele ușii din față se deschid pentru acces la interiorul sistemului. Cu ușa din față deschisă, puteți atașa instrumente, module și accesorii de punte; pregătiți puntea înainte de un protocol; sau manipulați starea punții în timpul unui protocol.
Benzile LED albe de pe marginile superioare interioare ale cadrului oferă iluminare ambientală controlabilă de software. O cameră de 2 megapixeli poate fotografia puntea și zona de lucru pentru înregistrarea și urmărirea executării protocolului.
Puntea si zona de lucru
Puntea este suprafața din aluminiu prelucrată pe care sunt executate protocoale științifice automatizate. Deck-ul are 12 sloturi principale în format ANSI/SLAS care pot fi reconfigurate pentru a stoca materiale de laborator, module și consumabile. Fantele punții sunt identificate printr-un sistem de coordonate, cu fanta A1 în stânga spate și slotul D3 în dreapta față.
Zona de lucru cu fantă de expansiune (pentru termociclator).
Stagzonă
Zonele punții din Flex.
46
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Zona de lucru este spațiul fizic de deasupra punții care este accesibil pentru pipetare. Articolele de laborator plasate în sloturile de la A1 la D3 sunt în zona de lucru.
Opentrons Flex vine cu sloturi detașabile pentru toate cele 12 poziții din zona de lucru. Fiecare slot pentru punte are cleme de colț pentru articole de laborator pentru așezarea în siguranță a articolelor de laborator pe punte.
Puteți reconfigura puntea înlocuind sloturile cu alte dispozitive de fixare pentru punte, inclusiv coșul de gunoi mobil, toboganul pentru deșeuri și suporturile pentru module. Slotul de expansiune din spatele A1 este folosit doar pentru a face spațiu suplimentar pentru modulul Thermocycler, care ocupă sloturile A1 și B1.
Notă: Sloturile pentru punte sunt interschimbabile în cadrul unei coloane (1, 2 sau 3), dar nu între coloane; Fantele pentru coloana 1 și coloana 3 sunt piese distincte, în ciuda dimensiunilor lor similare. Puteți spune în ce coloană intră un slot orientând clema albastră pentru articole de laborator în stânga spate.
Ar trebui să lăsați sloturile pentru punte instalate în locații în care doriți să plasați materiale de laborator de sine stătătoare. Puntea și obiectele așezate pe ea rămân statice, cu excepția cazului în care sunt mutate de prindere sau de intervenția manuală.
Stagzona de ing
Stagzona este spațiu suplimentar de-a lungul părții drepte a punții. Puteți stoca materiale de laborator în această locație după instalarea stagsloturi din zonă. Articolele de laborator plasate în sloturile A4 până la D4 sunt în stagzona de ing. Pipetele flexibile nu pot ajunge în stagîn zonă, dar pinza poate ridica și muta obiectele de laborator în și dinspre această locație. Adăugarea de sloturi suplimentare vă ajută să păstrați zona de lucru disponibilă pentru echipamentele utilizate în protocoalele dvs. automatizate.
Stagsloturile din zonă sunt incluse în anumite configurații de stație de lucru și sunt disponibile și pentru achiziționare de la https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Stagzonă cu sloturi instalate
Fixare de punte
Fixările sunt articole hardware care înlocuiesc sloturile standard pentru punte. Acestea vă permit să personalizați aspectul punții și să adăugați funcționalitate Flex. În prezent, dispozitivele de pe punte includ stagfantele din zona de alimentare, coșul de gunoi intern și jgheabul extern de gunoi. Puteți instala dispozitive numai în câteva sloturi specifice pentru punte. Următorul tabel listează locațiile punții pentru fiecare dispozitiv.
Fixare Staging area slots Coș de gunoi Tobog de deșeuri Tobog de deșeuri cu stagslot de zonă
Sloturile A3D3 A1D1 și A3-D3 D3 numai D3 numai
Corpurile de iluminat nu sunt alimentate. Nu conțin componente electronice sau mecanice care să comunice robotului starea lor curentă și locația punții. Aceasta înseamnă că trebuie să utilizați funcția de configurare a puntei pentru a informa Flexul ce dispozitive sunt atașate la punte și unde sunt amplasate.
48
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Puteți accesa setările de configurare a punții de pe ecranul tactil prin meniul cu trei puncte () și din aplicația Opentrons. Consultați secțiunea Configurare punte din capitolul Software și operare pentru informații despre cum să configurați puntea de pe ecranul tactil.
Tobogan pentru deșeuri
Jgheabul pentru deșeuri Opentrons Flex transferă lichide, vârfuri, suporturi pentru vârfuri și plăci pentru puțuri din carcasa Flex într-un recipient de gunoi plasat sub deschiderea sa externă. Jgheabul pentru deșeuri se atașează la un adaptor pentru placă de punte care se potrivește în fanta D3. De asemenea, vine cu o jumătate de panou special pentru fereastră care permite jgheabului să se extindă din partea frontală a robotului.
Componentele jgheabului de deșeuri.
Adaptor pentru placa de acoperire
Jgheab pentru deșeuri
Adaptor pentru placa de punte cu Stagzonă
Stagsloturi din zonă
Stagsloturile din zonă sunt piese de punte compatibile ANSI/SLAS care înlocuiesc sloturile standard din coloana 3 și adaugă noi sloturi la staging area — totul fără a pierde spațiu în zona de lucru. Puteți instala un singur slot sau maximum patru sloturi pentru a crea o nouă coloană (A4 până la D4) de-a lungul părții drepte a platformei. Rețineți, totuși, că înlocuirea fantei A3 necesită mutarea coșului de gunoi. Prin adăugarea stagCu fantele din zonă pe punte, robotul dumneavoastră Flex poate stoca mai multe articole de laborator și poate funcționa mai eficient.
OPENTRONS FLEX
Flex staging zona slot.
49
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
INSTALARE FANTA
Pentru a instala, scoateți șuruburile care atașează un slot standard pe punte și înlocuiți-l cu stagslot de zonă. După instalare, utilizați ecranul tactil sau aplicația Opentrons pentru a spune robotului pe care l-ați adăugattaging zona slot la punte.
Instalarea cataging zona slot.
COMPATIBILITATE SLOT Stagsloturile din zonă sunt compatibile cu instrumentele, modulele și materialele de laborator Flex enumerate mai jos.
Module de pipete de prindere cu componente flexibile
Articole de laborator
Stagcompatibilitatea zonei
Flex Gripper poate muta obiectele de laborator către sau dinspre stagsloturi din zonă.
Pipetele flexibile nu pot ajunge la stagzona de ing. Utilizați prinderea pentru a muta suporturile pentru vârfuri și articolele de laborator din stagzona de transfer spre zona de lucru înainte de pipetare.
Blocul magnetic GEN1 poate fi plasat în coloana 3 deasupra cataging zona slot. Modulele nu sunt acceptate în coloana 4.
Modulele alimentate, cum ar fi Heater-Shaker și Modulul de temperatură se potrivesc în caddie care pot fi plasate în coloana 3. Nu puteți adăuga catagslotul zonei de transfer într-o poziție ocupată de un caddy de module.
Stagsloturile din zonă au aceleași dimensiuni ANSI/SLAS ca și sloturile standard pentru punte. Folosiți materiale de laborator compatibile cu prindere în stagsau adăugați și eliminați manual materiale de laborator din această locație.
50
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Sistem de mișcare
Atașat de cadru este portalul, care este sistemul de mișcare și poziționare al robotului. Portalul se deplasează separat de-a lungul axelor x și y pentru a poziționa pipetele și dispozitivul de prindere în locații precise pentru execuția protocolului. Mișcarea de-a lungul acestor axe este precisă cu cel mai apropiat 0.1 mm. Portalul este controlat de motoare pas cu pas bipolare hibride de 36 VDC. La rândul lor, atașate de portal sunt suporturile pentru pipetă și suportul de extensie. Acestea se deplasează de-a lungul axei z pentru a poziționa pipetele și dispozitivul de prindere în locații precise pentru execuția protocolului. Mișcarea de-a lungul acestei axe este controlată de motoare pas cu pas bipolare hibride de 36 VDC. Elementele electronice conținute în portal furnizează alimentare de 36 VDC și comunicații către pipete și prindere, atunci când sunt atașate.
Gantry
Suporturi pentru pipete
Suport extensie
Amplasarea suporturilor instrumentelor pe Flex.
Ecran tactil și afișaj LED
Interfața principală cu utilizatorul este ecranul tactil LCD de 7 inchi, situat în partea dreaptă față a robotului. Ecranul tactil este acoperit cu Gorilla Glass 3 pentru rezistență la zgârieturi și deteriorare. Accesați multe funcții ale Flex chiar pe ecranul tactil, inclusiv:
OPENTRONS FLEX
51
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Gestionarea protocolului Configurarea, execuția și monitorizarea protocolului Gestionarea materialelor de laborator Setări robot Actualizări de software și firmware de sistem Jurnale de operare și notificări de eroare
Pentru mai multe informații despre utilizarea Flex prin intermediul ecranului tactil, consultați secțiunea Operarea ecranului tactil din capitolul Software și operare.
Ledul de stare este o bandă de LED-uri de-a lungul părții frontale superioare a robotului, care oferă informații dintr-o privire despre robot. Diferitele culori și modele de iluminare pot comunica diverse stări de succes, eșec sau inactiv:
Culoare LED Alb Stări neutre
Verde Stari normale
Albastru Stări obligatorii Galben Stări anormale Roșu Stări de urgență
Model LED Pulsare continuă
Clipește de două ori
Pulsare Solidă Pulsare
Stare robot
Pornit și nu rulează un protocol Robotul este ocupat (de exemplu, actualizează software-ul sau firmware-ul, configurarea rulării protocolului, anularea rulării protocolului) Acțiunea este finalizată (de exemplu, protocolul stocat, software-ul actualizat, instrumentul atașat sau detașat) Protocolul rulează Protocolul este complet Protocolul este întrerupt
Solid
Eroare software
Clipește de trei ori, în mod repetat
Eroare fizică (de exemplu, accident de instrument)
Lumina de stare poate fi dezactivată și în setările robotului.
52
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
3.2 Pipete
Pipetele Opentrons sunt dispozitive configurabile utilizate pentru deplasarea lichidelor în zona de lucru în timpul executării protocoalelor. Există mai multe pipete Opentrons Flex, care pot gestiona volume de la 1 µL la 1000 µL în 1, 8 sau 96 de canale:
Pipetă Opentrons Flex cu 1 canal (1 µL) Pipetă Opentrons Flex cu 50 canal (1 µL) Pipetă Opentrons Flex cu 5 canale (1000 µL) Pipetă Opentrons Flex cu 8 canale (1 µL) Pipetă Opentrons Flex 50-µL8
Pipetele se atașează la portal folosind șuruburi captive pe partea din față a pipetei. Pipetele cu 1 canal și 8 canale ocupă fiecare câte un suport de pipetă (stânga sau dreapta); pipeta cu 96 de canale ocupă ambele monturi. Pentru detalii despre instalarea pipetelor, consultați Instalarea și calibrarea instrumentului.
Atașamentul captiv
Șuruburi
Șuruburi de atașare captive
Ejector
Duze (Inele O înlocuibile)
Duze (Inele O-fixe)
Locațiile componentelor pipetelor cu 1, 8 și 96 de canale.
Ejector
OPENTRONS FLEX
53
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Pipetele preiau vârfuri de plastic de unică folosință prin apăsarea lor pe duzele pipetei și apoi folosesc vârfurile pentru a aspira și distribui lichide. Cantitatea de forță totală necesară pentru ridicare crește pe măsură ce mai multe vârfuri sunt ridicate simultan. Pentru un număr mai mic de vârfuri, pipeta atașează vârfurile împingând fiecare duză de pipetă în jos într-un vârf. Pentru a obține forța necesară pentru a ridica un suport plin de vârfuri, pipeta cu 96 de canale trage, de asemenea, vârfurile în sus pe duze. Această acțiune de tragere necesită plasarea suporturilor pentru vârfuri într-un adaptor pentru suport pentru vârfuri, mai degrabă decât direct într-un slot pentru punte. Pentru a arunca vârfurile (sau a le readuce în suport), mecanismul de evacuare a pipetei împinge vârfurile de pe duze.
Specificațiile pipetei
Pipetele Opentrons Flex sunt proiectate pentru a gestiona o gamă largă de volume. Datorită gamei lor largi, pot folosi mai multe dimensiuni de vârfuri, care le afectează caracteristicile de manipulare a lichidelor. Opentrons a testat pipetele Flex pentru acuratețe și precizie într-o serie de combinații de vârf și volum de lichid:
Pipetă
Flex 1-Canal
50 µL
Flex 1-Canal
1000 µL
Flex 8-Canal
50 µL
Flex 8-Canal
1000 µL
Capacitate vârf 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Volumul testat 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Precizie %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Precizie %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Flex 96-Canal
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Țineți cont de aceste informații de acuratețe atunci când alegeți vârfurile pentru pipetă. În general, pentru cele mai bune rezultate, ar trebui să utilizați cele mai mici sfaturi care corespund nevoilor protocolului dvs.
Notă: Opentrons efectuează teste volumetrice ale pipetelor Flex pentru a se asigura că acestea îndeplinesc specificațiile de acuratețe și precizie enumerate mai sus. Nu trebuie să calibrați volumul pe care pipetele dumneavoastră îl distribuie înainte de utilizare. Trebuie doar să efectuați calibrarea pozițională. Consultați secțiunea următoare, precum și secțiunea Instalarea pipetei din capitolul Instalare și relocare, pentru detalii.
Serviciile Opentrons Care și Opentrons Care Plus includ înlocuirea anuală a pipetei și certificate de calibrare. Consultați secțiunea Service Flex din capitolul Întreținere și service pentru detalii.
Calibrarea pipetei
Setul utilizator include o sondă de calibrare cu pipetă metalică, pe care o utilizați în timpul calibrării poziționale. În timpul rulărilor de protocol, depozitați în siguranță sonda pe suportul magnetic de pe stâlpul frontal al robotului. În timpul procesului de calibrare, atașați sonda la duza corespunzătoare și blocați-o pe loc. Robotul mută sonda în punctele de calibrare de pe punte pentru a măsura poziția exactă a pipetei.
Adaptor pentru suport pentru vârfuri de pipetă
Pipeta Opentrons Flex cu 96 de canale este livrată cu patru adaptoare pentru suport pentru vârfuri. Acestea sunt suporturi din aluminiu formate cu precizie pe care le așezi pe punte. Adaptoarele țin suporturi pentru vârfuri Flex 50 L, 200 L și 1000 µL.
OPENTRONS FLEX
55
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Din cauza forței implicate, pipeta cu 96 de canale necesită un adaptor pentru a atașa corect un suport cu vârf complet. În timpul procedurii de atașare, pipeta se deplasează peste adaptor, se coboară pe știfturile de montare și trage vârfurile pe pipete prin ridicarea adaptorului și a suportului pentru vârfuri. Tragerea vârfurilor, mai degrabă decât împingerea, oferă pârghia necesară pentru a fixa vârfurile de pipetă și previne deformarea suprafeței punții. Când ați terminat, pipeta cu 96 de canale coboară adaptorul și golește suportul pentru vârfuri pe punte. Consultați secțiunea Sfaturi și suporturi pentru vârfuri din capitolul Produse de laborator pentru mai multe informații.
Ridicare parțială a vârfului
Pipeta cu 96 de canale poate ridica un suport plin de vârfuri sau un număr mai mic de vârfuri. Acest lucru crește numărul de aplicații pe care le puteți efectua cu pipeta cu 96 de canale, deoarece ocupă ambele suporturi de pipetă.
În prezent, pipeta cu 96 de canale acceptă preluarea parțială a vârfurilor pentru 8 vârfuri într-o coloană. În această configurație, pipeta fie folosește duzele cele mai din stânga pentru a ridica vârfurile de la dreapta la stânga dintr-un suport pentru vârfuri, fie duzele din partea din dreapta pentru a ridica vârfurile de la stânga la dreapta dintr-un suport pentru vârfuri.
Când ridicați mai puțin de 96 de vârfuri dintr-un suport pentru vârfuri, suportul trebuie așezat direct pe punte, nu în adaptorul pentru suport pentru vârfuri.
Senzori cu pipetă
Pipetele Opentrons Flex au o serie de senzori care detectează și înregistrează date despre starea pipetei și orice vârfuri pe care le-a captat.
SENSORI DE CAPACITATE
În combinație cu o sondă metalică sau un vârf conductiv, senzorii de capacitate detectează când pipeta intră în contact cu ceva. Detectarea contactului dintre sonda metalică și punte este utilizată în procesele automate de calibrare a pipetei și calibrare a modulelor.
Pipetele cu 1 canal au un senzor de capacitate, în timp ce pipetele multicanal au două: pe canalele 1 și 8 ale pipetelor cu 8 canale și pe canalele 1 și 96 (pozițiile A1 și H12) ale pipetei cu 96 de canale.
56
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
SENSORI OPTIC DE PREZENTA TIPILOR
Un comutator fotoîntrerupător detectează poziția mecanismului de ejectare a vârfurilor pipetei, confirmând dacă vârfurile au fost ridicate sau scăpate cu succes. Pipetele cu 1 canal, 8 canale și 96 de canale au toate un singur senzor optic care monitorizează atașarea vârfurilor pe toate canalele.
Actualizări de firmware cu pipete
Opentrons Flex actualizează automat firmware-ul pipetei pentru a-l menține sincronizat cu versiunea software-ului robotului. Actualizările firmware-ului pipetei sunt de obicei rapide și apar oricând:
Atașați o pipetă. Robotul repornește.
Dacă, din orice motiv, firmware-ul pipetei și versiunile software-ului robotului nu se sincronizează, puteți actualiza manual firmware-ul în aplicația Opentrons.
1. Faceți clic pe Dispozitive. 2. Faceți clic pe Flex din lista de dispozitive. 3. Sub Instrumente și module, pipeta nesincronizată va afișa un banner de avertizare.
„Actualizare firmware disponibilă.” Faceți clic pe Actualizare acum pentru a începe actualizarea.
Puteți view versiunea firmware instalată în prezent a oricărei pipete atașate. Pe ecranul tactil, accesați Instrumente și atingeți numele pipetei. În aplicația Opentrons, găsiți cardul pipetei sub Instrumente și module, faceți clic pe meniul cu trei puncte (), apoi faceți clic pe Despre pipetă.
3.3 Gripper
Gripperul mută articolele de laborator în întreaga zonă de lucru și stagzona de ing în timpul executării protocoalelor. Gripperul se atașează la suportul de extensie, care este separat de suporturile pipetei; gripperul poate fi utilizat cu orice configurație de pipetă. Pentru detalii despre instalarea prinderii, consultați Instalarea și calibrarea instrumentului.
Gripperul poate muta obiectele de laborator pe punte și pe sau în afara modulelor. Gripper-ul poate manipula anumite plăci de puțuri cu borduri complet, plăci de puțuri adânci și suporturi pentru vârfuri. Pentru mai multe detalii despre materialele de laborator pe care gripperul poate muta, consultați secțiunea Labware și Opentrons Flex Gripper din capitolul Labware sau consultați Biblioteca Opentrons Labware.
OPENTRONS FLEX
57
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Specificații ale cleștelui
Fălcile efectuează mișcarea principală a prinderii, care este de a deschide sau închide două palete paralele pentru a aplica sau elibera forța pe părțile laterale ale articolelor de laborator. Mișcarea fălcilor este controlată de un motor cu perii de 36 VDC conectat la un sistem de angrenaj cu cremalieră și pinion.
Pentru a muta o bucată de obiecte de laborator care a fost prinsă de fălci, portalul ridică dispozitivul de prindere de-a lungul axei Z, îl mișcă lateral și apoi îl coboară în noua poziție a articolelor de laborator.
Locațiile componentelor gripperului.
Șuruburi de fixare
Pin de calibrare Jaws Paddles
Calibrare prindere
Gripperul include un știft de calibrare metalic. Pinul de calibrare este amplasat într-o zonă de depozitare îngropată pe partea inferioară a prinderii. Un magnet ține știftul pe loc. Pentru a scoate știftul de calibrare, prindeți-l cu degetele și trageți ușor. Pentru a înlocui știftul, puneți-l înapoi în slotul de stocare. Veți ști că este sigur când se fixează la loc.
Când calibrați prinderea, atașați pe rând știftul la fiecare falcă. Robotul mută știftul în punctele de calibrare de pe punte pentru a măsura poziția exactă a prinderii.
În timpul desfășurării protocolului, plasați știftul în zona sa de depozitare pentru păstrare în siguranță. Contactați-ne la support@opentrons.com dacă pierdeți pinul de calibrare.
Actualizări de firmware pentru Gripper
Opentrons Flex actualizează automat firmware-ul gripei pentru a-l menține sincronizat cu versiunea software-ului robotului. Actualizările firmware-ului Gripper sunt de obicei rapide și apar oricând:
58
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Atașați prinderea. Robotul repornește.
În cazul în care, din orice motiv, versiunile de firmware ale gripei și software-ul robotului nu se sincronizează, puteți actualiza manual firmware-ul în aplicația Opentrons.
1. Faceți clic pe Dispozitive. 2. Faceți clic pe Flex din lista de dispozitive. 3. Sub Instrumente și module, dispozitivul de prindere nesincronizat va afișa un banner de avertizare.
„Actualizare firmware disponibilă.” Faceți clic pe Actualizare acum pentru a începe actualizarea.
Puteți view versiunea de firmware instalată în prezent a gripperului. Pe ecranul tactil, accesați Instrumente și atingeți prinderea. În aplicația Opentrons, găsiți cardul de prindere sub Instrumente și module, faceți clic pe meniul cu trei puncte (), apoi faceți clic pe Despre graperă.
3.4 Suspensie pentru oprire de urgență
Suportul pentru oprire de urgență (E-stop) este un buton hardware dedicat pentru oprirea rapidă a mișcării robotului. Opentrons Flex necesită atașarea permanentă a unui opritor de urgență funcțional, decuplat. Când apăsați butonul de oprire, Flex anulează orice protocol de rulare sau flux de lucru de configurare cât mai repede posibil și previne majoritatea mișcării robotului.
Când să utilizați oprirea de urgență
Poate fi necesar să apăsați oprirea de urgență:
Când există un risc iminent de rănire sau vătămare a utilizatorului. Când există un risc iminent de deteriorare a robotului sau a altor componente hardware. Cand esteamplurile sau reactivii sunt în pericol iminent de contaminare. După o coliziune hardware.
În mod ideal, nu trebuie să apăsați niciodată opritorul de urgență (cu excepția testelor rare de calitate a hardware-ului).
Nu utilizați oprirea de urgență pentru a anula operațiunile normale, așteptate. În schimb, utilizați butonul software de pe ecranul tactil sau din aplicația Opentrons. Întreruperea prin intermediul software-ului vă va permite să vă reluați sau să anulați protocolul, în timp ce apăsarea opririi de urgență anulează întotdeauna protocolul imediat.
OPENTRONS FLEX
59
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Activarea și eliberarea opririi de urgență
Oprirea de urgență are un mecanism de apăsare pentru cuplare, răsucire pentru eliberare.
Activare: Apăsați ferm butonul roșu. Flex va intra în starea oprită. Rezolvare: Odată oprit, rezolvați în siguranță orice probleme din zona de lucru, cum ar fi curățarea scurgerilor,
îndepărtarea materialelor de laborator sau mutarea portalului (ar trebui să se miște liber și ușor cu mâna). Eliberare: răsuciți butonul în sensul acelor de ceasornic. Se va ridica în poziția sa decuplată. Resetare: Pe ecranul tactil sau în aplicația Opentrons, confirmați că sunteți gata pentru reluarea Flex
mişcare. Gantry-ul va reveni la poziția sa de origine și activitatea modulului se va relua.
În starea oprită, Flex și hardware-ul conectat se vor comporta după cum urmează:
Hardware Pipete Gantry
Gripper
Modul de încălzire-shaker
Modul de temperatură Modul termociclator Lumină de stare Ecran tactil
Comportament
Mișcarea orizontală automată este oprită. Mișcarea manuală orizontală este permisă.
Mișcarea verticală a pipetelor este oprită. Frânele motorului de pe axele verticale sunt cuplate pentru a preveni
pipetele din cădere. Mișcarea pistonului și ridicarea vârfului sunt oprite.
Mișcarea verticală a prinderii este oprită. Frâna motorului de pe axa verticală este cuplată pentru a preveni
prindere de la cădere. Motoarele cu falci care exercită forță de prindere rămân activate, așadar
prinderea nu va scăpa articolele de laborator pe care le poate transporta.
Agitatorul se oprește și acasă. Se deschide zăvorul pentru articole de laborator. Încălzirea este dezactivată.
Încălzirea sau răcirea este dezactivată.
Încălzirea sau răcirea este dezactivată.
Lumina devine roșie.
Un mesaj de anulare preia ecranul. Un indicator pe ecran arată când ați reușit
a decuplat butonul de oprire.
60
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
3.5 Conexiuni
Comutator Pornit/Oprit
Huse laterale
Porturi USB-A
Priză de alimentare IEC
Porturi AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Conexiune de alimentare
Opentrons Flex se conectează la o sursă de alimentare printr-o intrare standard IEC-C14. Robotul conține o sursă de alimentare internă AC/DC, acceptând 100 VAC, intrare 240/50 Hz și transformându-l la 60 VDC. Toate celelalte electronice interne sunt alimentate de sursa de 36 VDC.
Avertisment: Folosiți numai cablul de alimentare furnizat împreună cu robotul. Nu utilizați un cablu de alimentare cu curent sau volum inadecvattage ratinguri.
Păstrați cablul de alimentare fără obstacole, astfel încât să îl puteți îndepărta dacă este necesar.
Există, de asemenea, o baterie tip monedă CR1220 pentru a alimenta ceasul în timp real al robotului atunci când nu este conectat la rețea. Bateria se află în interiorul carcasei ecranului tactil. Contactați asistența Opentrons pentru mai multe informații dacă credeți că trebuie să înlocuiți bateria.
OPENTRONS FLEX
61
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
USB și conexiuni auxiliare
Opentrons Flex are un total de 10 porturi USB situate în diferite zone ale robotului, care servesc diferite scopuri.
Cele 8 porturi USB-A din spate (numerotate USB-1 prin USB-8) și 2 porturi auxiliare (conectori M12 numerotate AUX-1 și AUX-2) sunt pentru conectarea modulelor și accesoriilor Opentrons. Consultați capitolul Module pentru mai multe informații despre conectarea acestor dispozitive și utilizarea lor în protocoalele dvs. Portul USB-B din spate este pentru conectarea robotului la un laptop sau computer desktop, pentru a stabili comunicarea cu aplicația Opentrons care rulează pe computerul conectat. Portul USB-A frontal (USB-9), situat sub ecranul tactil, are aceeași funcționalitate ca și porturile USB-A din spate.
Notă: Porturile USB sunt limitate la putere pentru a proteja robotul și dispozitivele conectate. Livrarea energiei este împărțită intern în trei grupuri de porturi: porturile USB-A din spate stânga (USB-1 prin USB-4), porturile USB-A din spate drept (USB-5 prin USB-8) și porturile USB-A din față port. Fiecare dintre aceste grupuri va furniza maximum 500 mA dispozitivelor compatibile USB 2.0 conectate.
Conexiuni la rețea
Opentrons Flex se poate conecta la o rețea locală printr-o conexiune cu fir (Ethernet) sau fără fir (Wi-Fi).
Portul Ethernet este situat în partea din spate a robotului. Conectați-l la un hub Ethernet sau porniți rețeaua. Sau, începând cu versiunea 7.1.0 a sistemului de robot, conectați-l direct la un port Ethernet de pe computer. Modulul Wi-Fi intern acceptă rețele 802.11 ac/a/b/g/n cu o antenă cu bandă duală de 2.4/5 GHz.
62
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
3.6 Specificații de sistem
Specificații generale
Dimensiuni Greutate Fante pentru punte
Touch screen
Wi-Fi Ethernet USB
Cameră de intrare robot
Volumul de alimentare cu rețeatagFluctuație Fluctuația frecvenței rețelei de alimentare Sistem de distribuție Curent de alimentare în scurtcircuit Compoziția cadrului Compoziția ferestrei Cerințe de ventilație
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 in (L, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 sloturi compatibile ANSI/SLAS în zona de lucru
(accesibile la pipete) 4 sloturi suplimentare pentru stagsfaturi și articole de laborator
(accesibil numai pentru prindere) Ecran tactil LCD de 7 inchi cu Gorilla Glass 3 rezistent la zgârieturi și deteriorare
802.11 ac/a/b/g/n dual band (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 porturi USB-A 1 port USB-B Viteză USB 2.0
2MP, foto și video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Design rigid din oțel și aluminiu CNC
Geamuri laterale și ușă din față detașabile din policarbonat La cel puțin 20 cm / 8 in între unitate și un perete
OPENTRONS FLEX
63
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Cerințe pentru PC conectat
Aplicația Opentrons rulează pe: Windows 10 sau o versiune ulterioară macOS 10.10 sau o versiune ulterioară Ubuntu 12.04 sau o versiune ulterioară
Specificații de mediu
Conditii de mediu Temperatura ambianta Umiditate relativa Grad de poluare
Numai utilizare în interior +20 până la +25 °C (recomandat) 40%, fără condensare (recomandat) 60 (doar poluare neconductivă)
Pentru informații suplimentare despre condițiile de mediu acceptabile pentru utilizare și transport, consultați secțiunea Condiții de mediu din capitolul Instalare și mutare.
Certificari
Certificari complete Necertificat/validat
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Un rezumat al informațiilor de certificare este imprimat pe un autocolant de pe spatele lui Flex, lângă comutatorul de pornire/oprire. Pentru informații detaliate despre certificare și conformitate, consultați secțiunea Conformitatea cu reglementările din Introducere.
Număr de serie
Fiecare Flex are un număr de serie unic. Formatul numărului de serie oferă informații suplimentare, inclusiv data de producție a robotului. De example, numărul de serie FLXA1020231007001 ar indica:
64
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 3: DESCRIEREA SISTEMULUI
Personaje FLX A10 2023 10 07 001
Categorie Model Versiune An Luna Zi Unitate
Semnificație Robotul este un Opentrons Flex. Un cod pentru versiunea de producție a robotului. Robotul a fost fabricat în 2023. Robotul a fost fabricat în octombrie. Robotul a fost realizat în a 7-a zi a lunii. Un număr unic pentru roboții fabricați într-o anumită zi.
Puteți găsi numărul de serie pentru Flex:
Pe autocolantul de certificare de pe spatele lui Flex, lângă comutatorul de pornire/oprire. Pe partea din spate a ecranului tactil (spre zona de lucru). În aplicația Opentrons, sub Dispozitive > Flexul dvs. > Setări robot > Avansat.
OPENTRONS FLEX
65
CAPITOLUL 4
Module
Opentrons Flex se integrează cu o serie de module hardware Opentrons. Toate modulele sunt periferice care ocupă sloturi pentru punte, iar majoritatea sunt controlate de robot printr-o conexiune USB.
Acest capitol descrie funcțiile și specificațiile fizice ale modulelor care sunt compatibile cu sistemul Opentrons Flex, precum și modul de atașare și calibrare a acestora. Pentru mai multe detalii despre configurarea și utilizarea modulelor, consultați manualele modulelor individuale. Pentru detalii despre integrarea modulelor în protocoalele dvs., consultați secțiunea Protocol Designer din capitolul Dezvoltare protocol sau documentația online Python Protocol API.
4.1 Module acceptate
Opentrons Flex este compatibil cu patru tipuri de module Opentrons de pe punte:
Modulul Heater-Shaker oferă încălzire pe punte și agitare orbitală. Modulul poate fi încălzit la 95 °C și poate agita sampde la 200 la 3000 rpm.
Blocul magnetic este un dispozitiv pasiv care ține obiectele de laborator aproape de magneții săi de neodim de înaltă rezistență. Modulele magnetice OT-2 GEN1 și GEN2, care își mută activ magneții în sus și în jos în raport cu materialele de laborator, nu sunt acceptate pe Opentrons Flex.
Modulul de temperatură este un modul de placă caldă și rece care este capabil să mențină temperaturi de stare stabilă între 4 și 95 °C.
Modulul Thermocycler oferă termociclare complet automatizată pe punte, permițând automatizarea etapelor fluxului de lucru din amonte și din aval. Thermocycler GEN2 este pe deplin compatibil cu prinderea. Thermocycler GEN1 nu poate fi utilizat cu prinderea și, prin urmare, nu este acceptat pe Opentrons Flex.
Unele module concepute inițial pentru OT-2 sunt compatibile cu Flex, așa cum este rezumat în tabelul de mai jos. O bifă indică compatibilitatea, iar un X indică incompatibilitate.
66
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
Tipul și generarea dispozitivului Modul încălzitor-agitator Modulul magnetic GEN1 Modulul magnetic GEN1 Modulul magnetic GEN2 Blocul magnetic GEN1 Modulul de temperatură GEN1 Modulul de temperatură GEN2 Modulul termociclor GEN1 Modulul termociclorul GEN2 Modulul HEPA GENXNUMX
OT-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Sistem caddy modul
Modulele compatibile sunt proiectate pentru a se potrivi în caddie care ocupă spațiu sub punte. Acest sistem permite ca materialele de laborator de deasupra modulelor să rămână mai aproape de suprafața punții și permite, de asemenea, rutarea cablurilor sub punte, astfel încât puntea să rămână ordonată în timpul rulării protocolului.
Caddie pentru modulele de încălzire-shaker, temperatură și termociclu.
OPENTRONS FLEX
67
CAPITOLUL 4: MODULE
Pentru a monta un modul în suprafața punții, acesta trebuie mai întâi plasat în suportul corespunzător pentru module. Fiecare tip de modul compatibil are propriul design caddy care aliniază modulul și materialele de laborator precis cu puntea din jur. (Excepția este blocul magnetic, care nu necesită alimentare sau dirijarea cablului USB și astfel se așează direct pe suprafața punții.) Cadrele pentru modulele care ocupă un singur slot pot fi plasate oriunde în coloana 1 sau 3; termociclorul poate fi plasat doar în sloturile A1 și B1 simultan.
În general, pentru a instala un caddy de module:
1. Îndepărtați orice fante pentru punte din locația în care va merge modulul. 2. Așezați modulul în suportul său și strângeți-i ancorele. 3. Treceți cablurile de alimentare și USB ale modulului prin capacele laterale, în sus prin slotul gol al punții și
atașați-le la modul. 4. Așezați suportul modulului în fantă și înșurubați-l la loc.
Pentru instrucțiuni exacte de instalare, consultați Ghidul de pornire rapidă sau Manualul de instrucțiuni pentru modulul specific. Conexiunile cablurilor și metoda de atașare la caddy variază în funcție de modul.
4.3 Calibrarea modulului
Când instalați pentru prima dată un modul pe Flex, trebuie să executați calibrarea pozițională automată. Acest proces este similar cu calibrarea pozițională pentru instrumente și asigură că Flex se deplasează în locațiile exacte corecte pentru o performanță optimă a protocolului. În timpul calibrării, Flex se va muta în locații de pe un adaptor de calibrare pentru modul, care arată similar cu pătratele de calibrare care fac parte din sloturile detașabile ale punții.
Adaptoare de calibrare pentru modulele Heater-Shaker, Temperature și Thermocycler.
Calibrarea modulului este necesară pentru toate modulele care se instalează prin intermediul unui caddy: modulele Heater-Shaker, Temperature și Thermocycler. Blocul magnetic nu necesită calibrare și este gata de utilizare de îndată ce îl așezați pe punte.
68
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
Când să calibrați modulele
Flex vă solicită automat să efectuați calibrarea atunci când conectați și porniți un modul care nu are date de calibrare stocate. (Puteți închide această solicitare, dar nu veți putea rula protocoale cu modulul până când nu îl calibrați.)
Odată ce ați finalizat calibrarea, Flex stochează datele de calibrare și numărul de serie al modulului pentru utilizare ulterioară. Flex nu vă va cere să recalibrați decât dacă ștergeți datele de calibrare pentru modulul respectiv din setările robotului. Vă puteți porni și opri modulul în mod liber sau chiar îl puteți muta într-un alt slot pentru punte, fără a fi nevoie să îl recalibrați. Dacă doriți să recalibrați, puteți începe procesul în orice moment de pe cardul modulului din aplicația Opentrons. (Recalibrarea nu este disponibilă de pe ecranul tactil.)
Cum să calibrați modulele
Instrucțiunile de pe ecranul tactil sau din aplicația Opentrons vă vor ghida prin procedura de calibrare. În general, pașii sunt:
1. Adunați echipamentul necesar, inclusiv adaptorul de calibrare al modulului și sonda de calibrare a pipetei. 2. Așezați adaptorul de calibrare pe suprafața modulului și asigurați-vă că este complet nivelat.
Este posibil ca unele module să necesite fixarea adaptorului la modul. 3. Atașați sonda de calibrare la o pipetă. 4. Flex se va muta automat pentru a atinge anumite puncte de pe adaptorul de calibrare și le va salva
valorile de calibrare pentru utilizare ulterioară.
Odată ce calibrarea este finalizată și ați scos adaptorul și sonda, modulul va fi gata de utilizare în protocoale.
În orice moment, poți view și gestionați datele de calibrare a modulului în aplicația Opentrons. Accesați Setările robotului pentru Flex și faceți clic pe fila Calibrare.
OPENTRONS FLEX
69
CAPITOLUL 4: MODULE
4.4 Modul de încălzire-shaker GEN1
Caracteristici Heater-Shaker
Încălzire și scuturare
Heater-Shaker oferă încălzire pe punte și agitare orbitală. Modulul poate fi încălzit la 95 °C, cu următoarea temperatură profile:
Interval de temperatură: 37 °C Precizia temperaturii: ±95 °C la 0.5 °C Uniformitate temperaturii: ±55 °C la 0.5 °CRamp viteza: 10 °C/min
Modulul poate agita sampde la 200 la 3000 rpm, cu următoarea agitare profile:
Diametrul orbital: 2.0 mm Direcția orbitală: în sensul acelor de ceasornic Interval de viteză: 200 rpm Precizia vitezei: ±3000 rpm
Modulul are un dispozitiv de blocare alimentat pentru laborator pentru fixarea plăcilor pe modul înainte de agitare.
70
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
ADAPTĂRI TERMICI Un adaptor termic compatibil este necesar pentru adăugarea articolelor de laborator la Heater-Shaker. Adaptoarele pot fi achiziționate direct de la Opentrons la https://shop.opentrons.com. Adaptoarele termice disponibile în prezent includ:
Adaptor plat universal
Adaptor PCR
Adaptor Deep Well
96 Adaptor cu fund plat
CONTROL SOFTWARE
Heater-Shaker este complet programabil în Protocol Designer și Python Protocol API. API-ul Python permite, în plus, efectuarea altor pași de protocol în paralel în timp ce Heater-Shaker este activ. Consultați Comenzi fără blocare din documentația API pentru detalii despre adăugarea de pași paraleli la protocoalele dvs.
În afara protocoalelor, aplicația Opentrons poate afișa starea curentă a Heater-Shaker și poate controla direct încălzitorul, agitatorul și dispozitivul de blocare pentru laborator.
OPENTRONS FLEX
71
CAPITOLUL 4: MODULE
Specificații Heater-Shaker
Dimensiuni Greutate Modul de alimentare Intrare adaptor de alimentare Voltage fluctuație Overvoltage Consumul de energie
152 × 90 × 82 mm (L/L/Î) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Categoria II Inactiv: 10 W
Tipic: Agitație: 4 W Încălzire: 11 W Încălzire și agitare: 10 W
Condiții de mediu Temperatura ambiantă Umiditate relativă Altitudine Grad de poluare
Maxim: 125 W Numai pentru utilizare în interior 130 °C Până la 20%, fără condensare Până la 25 m deasupra nivelului mării 80
72
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
4.5 Bloc magnetic GEN1
Caracteristicile blocului magnetic
Blocul magnetic Opentrons GEN1 este un suport magnetic pentru plăci cu 96 de godeuri. Blocurile magnetice sunt folosite în protocoale care se bazează pe magnetism pentru a scoate particulele din suspensie și a le reține în plăci de godeuri în timpul spălării, clătirii sau altor proceduri de eluare. De example, pregătirea automată a NGS; purificarea ADN-ului, ARN-ului sau proteinelor genomic și mitocondrial; și alte proceduri de extracție sunt toate cazuri de utilizare care pot implica blocuri magnetice.
COMPONENTE MAGNETICE
Blocul magnetic nu este alimentat, nu conține componente electronice și nu mișcă margele magnetice în sus sau în jos în soluție. Sondele constau din 96 de magneți cu inele de neodim de înaltă rezistență fixați pe un pat încărcat cu arc, ceea ce ajută la menținerea toleranțelor între bloc și pipete în timp ce rulează protocoale automate.
CONTROL SOFTWARE
Blocul magnetic GEN1 este complet programabil în Protocol Designer și API-ul Python Protocol.
OPENTRONS FLEX
73
CAPITOLUL 4: MODULE
În afara protocoalelor, totuși, ecranul tactil și aplicația Opentrons nu cunosc și nu pot afișa starea curentă a blocului magnetic GEN1. Acesta este un modul nealimentat. Nu conține componente electronice sau mecanice care pot comunica cu robotul Flex. „Controlați” blocul magnetic prin protocoale care utilizează Opentrons Flex Gripper pentru a adăuga și elimina materiale de laborator din acest modul.
Specificații bloc magnetic
Dimensiuni Greutate Puterea modulului Calitatea magnetică Condiții de mediu Temperatura ambiantă Umiditate relativă Altitudine Grad de poluare
136 × 94 × 45 mm (L/L/Î) 1.13 kg Niciunul, modulul nu este alimentat Neodim N52 Utilizare în interior numai 20 °C 25%, fără condensare Până la 30 m deasupra nivelului mării 80
74
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
4.6 Modulul de temperatură GEN2
Caracteristicile modulului de temperatură
INCALZIND SI RACIND
Modulul de temperatură Opentrons GEN2 este un modul cu placă caldă și rece. Este adesea folosit în protocoale care necesită încălzire, răcire sau schimbări de temperatură. Modulul poate atinge și menține temperaturi cuprinse între 4 °C și 95 °C în câteva minute, în funcție de configurația și conținutul modulului.
BLOCURI TERMICE
Pentru a menține obiectele de laborator la temperatură, modulul folosește blocuri termice din aluminiu. Modulul vine cu blocuri termice cu 24 și 96 de godeuri. Carcasa pentru modulul de temperatură vine cu un bloc pentru puțuri adânci și un bloc cu fund plat conceput pentru a fi utilizat cu Flex Gripper. Blocurile dețin tuburi de 1.5 ml și 2.0 ml, plăci PCR cu 96 de godeuri, benzi PCR, plăci cu godeuri adânci și plăci cu fund plat.
OPENTRONS FLEX
75
CAPITOLUL 4: MODULE
Notă: Modulul este livrat și cu un bloc cu fund plat pentru OT-2. Nu utilizați blocul OT-2 cu Flex. Blocul cu fund plat pentru Flex are cuvintele „Opentrons Flex” pe suprafața sa superioară. Cel pentru OT-2 nu.
Bloc termic cu 24 de puturi
Bloc termic cu 96 de puturi
Bloc termic puț adânc
Bloc termic cu fund plat pentru Flex
BĂI DE APĂ ȘI ÎNCĂLZIRE
Deoarece aerul este un bun izolator termic, golurile dintre articolele de laborator și un bloc termic pot afecta performanța timpului până la temperatură a modulului de temperatură. Plasarea puțină apă în blocurile termice cu 24 sau 96 de godeuri elimină golurile de aer și îmbunătățește eficiența încălzirii. Cantitatea ideală de apă depinde de blocul termic și de articolele de laborator. Consultați Cartea albă pentru modulul de temperatură pentru recomandări suplimentare.
CONTROL SOFTWARE
Modulul de temperatură este complet programabil în Protocol Designer și Python Protocol API.
În afara protocoalelor, aplicația Opentrons poate afișa starea curentă a modulului de temperatură și poate controla direct temperatura plăcii de suprafață.
76
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
Specificațiile modulului de temperatură
Dimensiuni Greutate Putere modul
Condiții de mediu Temperatura ambiantă Umiditate relativă Altitudine Grad de poluare
194 × 90 × 84 mm (L/L/H) 1.5 kg Intrare: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Ieșire: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Utilizare în interior numai <219.6 °C (recomandat pentru răcire optimă ) Până la 22%, fără condensare Până la 60 m deasupra nivelului mării 2000
4.7 Modulul termociclor GEN2
OPENTRONS FLEX
77
CAPITOLUL 4: MODULE
Caracteristicile termociclorului
Modulul Opentrons Thermocycler GEN2 este un termociclator complet automatizat pe punte, care oferă PCR fără mâini într-un format de placă cu 96 de godeuri. Capacul său încălzit și sigiliul de unică folosință se potrivesc strâns peste farfurie, asigurând sample încălzire și evaporare minimă.
ÎNCĂLZIRE ȘI RĂCIRE Blocul termociclorului poate încălzi și răci, iar capacul său se poate încălzi, cu următoarea temperatură profile: Interval de temperatură a blocului termic: 4 °C Încălzire maximă a blocului termic ramp Rată: 4.25 °C/s de la GEN2 mediu la 95 °C Răcire maximă a blocului termicamp Rată: 2.0 °C/s de la 95 °C până la mediu Interval de temperatură a capacului: 37 °C Precizia temperaturii capacului: ±110 °C Capacul automat poate fi deschis sau închis după cum este necesar în timpul executării protocolului.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler poate executa profiles: parcurge automat o secvență de blocuri de temperaturi pentru a efectua reacții sensibile la căldură.
GARNIȚII DE AUTOMATIZARE din cauciuc Thermocycler-ul vine cu etanșări de automatizare din cauciuc pentru a ajuta la reducerea evaporării. Fiecare sigiliu trebuie sterilizat înainte de utilizare și poate fi folosit pentru mai multe execuții. Sigilii suplimentare pot fi achiziționate direct de la Opentrons la https://shop.opentrons.com.
CONTROL SOFTWARE Thermocycler este complet programabil în Protocol Designer și Python Protocol API. În afara protocoalelor, aplicația Opentrons poate afișa starea curentă a termociclorului și poate controla direct temperatura blocului, temperatura capacului și poziția capacului.
78
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 4: MODULE
Specificații termociclor
Dimensiuni (capac deschis) Dimensiuni (capac închis) Greutate (inclusiv conducta din spate) Voltage Curentul adaptorului de alimentare Overvoltage Condiții de mediu Temperatura ambiantă Umiditate relativă Altitudine Cerințe de ventilație
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/L/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/L/H) 8.4 kg 100 V la 240/50 Hz 60 A Categoria II Utilizare în interior °C (doar 8.5); 5 °C (acceptabil) 20%, fără condensare Până la 25 m deasupra nivelului mării Cel puțin 2 cm / 40 in între unitate și un perete
OPENTRONS FLEX
79
CAPITOLUL 5
Articole de laborator
Acest capitol acoperă elementele din Biblioteca Opentrons Labware pe care le puteți utiliza cu Opentrons Flex și Opentrons Flex Gripper. Acesta acoperă, de asemenea, materiale de laborator personalizate și, pentru utilizatorii noștri cu putere, leagă componentele de laborator la JSON corespunzător file definiții.
Puteți achiziționa materiale de laborator de la producătorii de echipamente originale sau de la magazinul Opentrons la https://shop.opentrons.com. Și, Opentrons lucrează mereu pentru a verifica noile definiții de laborator. Consultați Biblioteca Labware (legată mai sus) pentru cele mai recente listări.
5.1 Concepte de produse de laborator
Produsele de laborator cuprind mai mult decât obiectele plasate pe punte și utilizate într-un protocol. Pentru a vă ajuta să înțelegeți software-ul de laborator Opentrons, să examinăm acest subiect din trei perspective diferite. Pentru Opentrons Flex, materialele de laborator includ articole din Biblioteca noastră de produse de laborator, date care definesc fiecare produs de laborator și materiale de laborator personalizate.
Produse de laborator ca hardware
Biblioteca Labware include tot ce puteți utiliza în mod implicit cu Opentrons Flex. Acestea sunt componente durabile și articole consumabile cu care lucrați, reutilizați sau aruncați în timp ce rulați un protocol. Nu trebuie să faceți niciun pas special pentru a lucra cu articolele din Biblioteca Labware. Robotul Flex știe să lucreze automat cu tot ce se află în bibliotecă.
Produse de laborator ca date
Informațiile de laborator sunt stocate în notația obiect Javascript (JSON) files cu .json file extensii. Un JSON file include dimensiunile spațiale (lungime, lățime, înălțime), capacitatea volumetrică (L, ml) și alte valori care definesc caracteristicile suprafeței, formele și locațiile acestora. Când rulează un protocol, Flex citește aceste .json files să știți ce obiecte de laborator sunt pe punte și cum să lucrați cu ele.
80
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Produse de laborator personalizate
Produsele de laborator personalizate sunt produse de laborator care nu sunt incluse în Biblioteca Labware sau sunt produse de laborator create de Custom Labware Creator. Cu toate acestea, uneori ideea de produse de laborator personalizate vine împovărată de noțiuni de complexitate, cheltuială sau dificultate. Dar, materialele de laborator personalizate nu ar trebui să fie greu de înțeles sau creat. Să luăm un moment pentru a despacheta conceptul de produse de laborator personalizate.
Ca un exampBiblioteca Opentrons Labware include plăci cu 96 de godeuri (200 L) de la Corning și BioRad, dar și alți producători produc aceste plăci pentru puțuri. Și, datorită standardelor industriale acceptate în mod obișnuit, diferențele dintre aceste articole de laborator omniprezente sunt minore. Cu toate acestea, o placă obișnuită de 200 L, cu 96 de godeuri de la Stellar Scientific, Oxford Lab sau Krackeler Scientific (sau orice alt furnizor de altfel) este „produse de laborator personalizate” pentru Flex, deoarece nu este predefinită în Biblioteca noastră de laborator. . În plus, diferențele minore în dimensiunile materialelor de laborator pot avea un impact drastic asupra succesului rulării protocolului. Din acest motiv, este important să aveți o definiție exactă pentru fiecare produs de laborator pe care doriți să îl utilizați în protocolul dvs.
De asemenea, în timp ce articolele de laborator personalizate ar putea fi un set ezoteric, unic, de cele mai multe ori sunt doar vârfurile, plăcile, tuburile și suporturile folosite în fiecare zi în laboratoarele din întreaga lume. Din nou, singura diferență dintre produsele de laborator Opentrons și cele personalizate este că noul element nu este predefinit în software-ul care alimentează robotul. Flex poate și funcționează cu alte articole de bază de laborator sau ceva unic, dar trebuie să înregistrați caracteristicile acelui articol într-o definiție JSON de laborator. file și importați acele date în aplicația Opentrons. Consultați secțiunea Definiții personalizate de laborator de mai jos pentru mai multe informații.
Pentru a rezuma, materialele de laborator includ:
Totul din Biblioteca Opentrons Labware. Definiții de laborator: date într-un JSON file care definește formele, dimensiunile și capacitățile articolelor individuale
precum plăci de puțuri, vârfuri, rezervoare etc. Articole de laborator personalizate, care sunt articole care nu sunt incluse în Biblioteca de produse de laborator.
După reviewLuând în considerare aceste concepte importante, să examinăm categoriile și articolele din Biblioteca Opentrons Labware. După aceea, vom termina capitolul cu un overview a componentelor de date ale unui software de laborator file și rezumați caracteristicile și serviciile Opentrons care vă ajută să creați produse de laborator personalizate.
OPENTRONS FLEX
81
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
5.2 Rezervoare
Opentrons Flex funcționează implicit cu rezervoarele cu un singur și mai multe puțuri enumerate mai jos. Utilizarea acestor rezervoare vă ajută să vă reduceți sarcina muncii de pregătire, deoarece sunt gata de automatizare imediat din cutie. Informațiile despre rezervoare sunt, de asemenea, disponibile în Biblioteca Opentrons Labware.
Rezervoare cu un singur puț
Specificatiile producatorului
Agilent
290 ml V fund
Axigen
90 ml fund plat
CUIB
195 ml fund plat
290 ml V fund
Nume de încărcare API
agilient_1_ rezervor_290ml
axygen_1_ rezervor_90ml
nest_1_ rezervor_195ml
nest_1_ rezervor_290ml
Rezervoare cu mai multe puțuri
Specificatiile producatorului
CUIB
12 godeuri 15 ml/godeu V fund
SUA Științifice
12 godeuri 22 ml/godeu V fund
Nume de încărcare API nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml
82
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Rezervoare și definiții API
Biblioteca Opentrons Labware definește caracteristicile rezervoarelor enumerate mai sus în JSON separat files. Robotul și API-ul Opentrons Python se bazează pe aceste definiții JSON pentru a lucra cu software-ul de laborator utilizat de protocoalele dvs. De exampcând lucrezi cu API, funcția ProtocolContext.load_labware acceptă aceste nume de labware ca parametri validi în codul tău. Numele de încărcare API conectate se conectează la definițiile de laborator de rezervor din depozitul Opentrons GitHub.
Produse de laborator personalizate pentru rezervor
Încercați să creați o definiție personalizată a produsului de laborator cu Opentrons Labware Creator dacă un rezervor pe care doriți să-l utilizați nu este listat aici. O definiție personalizată combină toate dimensiunile, metadatele, formele, capacitatea volumetrică și alte informații dintr-un JSON file. Opentrons Flex are nevoie de aceste informații pentru a înțelege cum să lucrezi cu materialele de laborator personalizate. Consultați secțiunea Definiții personalizate de laborator pentru mai multe informații.
5.3 Plăci de puțuri
Opentrons Flex funcționează implicit cu plăcile de puțuri enumerate mai jos. Folosirea acestor plăci de puț vă ajută să vă reduceți sarcina muncii de pregătire, deoarece sunt gata de automatizare imediat din cutie. Informațiile despre plăcile de puț sunt, de asemenea, disponibile în Biblioteca Opentrons Labware.
OPENTRONS FLEX
83
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
plăci cu 6 godeuri
Producator Corning
Specificații
6 godeuri 16.8 mL/godeu Godeuri circulare, fund plat
Numele de încărcare API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
plăci cu 12 godeuri
Producator Corning
Specificații
12 godeuri 6.9 mL/godeu Godeuri circulare, fund plat
Numele de încărcare API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
plăci cu 24 godeuri
Producator Corning
Specificații
24 godeuri 3.4 mL/godeu Godeuri circulare, fund plat
Numele de încărcare API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
plăci cu 48 godeuri
Producator Corning
Specificații
48 godeuri 1.6 mL/godeu Godeuri circulare, fund plat
Numele de încărcare API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
plăci cu 96 godeuri
Producator Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
SUA Științifice
Specificații
96 godeuri 200 µL/godeu Godeuri circulare, fund V
96 godeuri 360 µL/godeu Godeuri circulare, fund plat
96 godeuri 100 µL/godeu Godeuri circulare, partea de jos PCR în V
96 godeuri 200 µL/godeu Godeuri circulare, fund plat
96 godeuri adânci 2000 µL/godeu Godeuri pătrate, fund V
Rezistent 96 godeuri 200 µL/godeu Godeuri circulare, manta plina PCR cu fund V
Nunc 96 godeuri adânci 1300 µL/godeu Godeuri circulare, fund U
Nunc 96 godeuri adânci 2000 µL/godeu Godeuri circulare, fund U
96 godeuri adânci 2.4 mL/godeu Godeuri pătrate, fund U
Nume de încărcare API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ skirt
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
plăci cu 384 godeuri
Producator Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Specificații
384 godeuri 40 µL/godeu Godeuri circulare, fund V
384 godeuri 50 µL/godeu Godeuri circulare, fund V
384 godeuri 112 µL/godeu Godeuri pătrate, fund plat
Nume de încărcare API applybiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Adaptoare pentru plăci de bine
Plăcile de aluminiu enumerate mai jos sunt adaptoare termice pentru modulul Opentrons Heater-Shaker GEN1. Puteți utiliza aceste definiții de adaptoare independente pentru a încărca produse de laborator verificate sau personalizate Opentrons deasupra Heater-Shaker.
Tip adaptor Opentrons Adaptor universal pentru încălzitor-agitator plat Opentrons 96 PCR Adaptor pentru încălzitor-agitator Opentrons 96 Adaptor pentru încălzitor-agitator pentru puțuri adânci Opentrons 96 Adaptor pentru încălzitor-agitator cu fund plat
Nume de încărcare API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
De asemenea, puteți încărca atât adaptorul, cât și materialele de laborator cu o singură definiție. Biblioteca noastră de produse de laborator include mai multe adaptoare termice preconfigurate și combinații de materiale de laborator care fac ca Heater-Shaker să fie gata de utilizare imediat din cutie.
86
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Notă: Nu utilizați o definiție combinată dacă trebuie să mutați obiectele de laborator pe sau în afara dispozitivului de încălzire-shaker în timpul protocolului dvs., fie cu prinderea, fie manual. Utilizați în schimb o definiție de adaptor independent.
Combinație adaptor/material de laborator
Nume de încărcare API
Adaptor pentru încălzitor-shaker Opentrons 96 Deep Well cu placă NEST Deep Well 2 ml
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Adaptor pentru încălzitor-agitator cu fund plat Opentrons 96 cu placă NEST cu 96 godeuri 200 µL plat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Adaptor Heater-Shaker cu placă NEST Well 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Adaptor universal pentru încălzitor-agitator plat Opentrons cu placă Corning cu 384 godeuri plată de 112 µL
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adaptoarele pot fi achiziționate direct de la Opentrons la https://shop.opentrons.com.
Plăci de puțuri și definiții API
Biblioteca Opentrons Labware definește caracteristicile plăcilor de puțuri enumerate mai sus în JSON separat files. Robotul Flex și API-ul Opentrons Python se bazează pe aceste definiții JSON pentru a lucra cu materiale de laborator utilizate de protocoalele dvs. De exampcând lucrezi cu API, funcția ProtocolContext.load_labware acceptă aceste nume de labware ca parametri validi în codul tău. Numele de încărcare API conectate se conectează la definițiile de laborator pentru plăcile de puț din depozitul Opentrons GitHub.
Ustensile de laborator personalizate pentru plăci de puțuri
Încercați să utilizați Opentrons Labware Creator pentru a crea o definiție personalizată a materialelor de laborator dacă o placă de puț pe care doriți să o utilizați nu este listată aici. O definiție personalizată combină toate dimensiunile, metadatele, formele, capacitatea volumetrică și alte informații dintr-un JSON file. Opentrons Flex citește aceste informații pentru a înțelege cum să lucrezi cu materialele de laborator personalizate. Consultați secțiunea Definiții personalizate de laborator pentru mai multe informații.
OPENTRONS FLEX
87
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
5.4 Vârfuri și suporturi pentru vârfuri
Vârfurile Opentrons Flex sunt disponibile în dimensiuni de 50 µL, 200 µL și 1000 µL. Acestea sunt vârfuri din polipropilenă clare, neconductoare, care sunt disponibile cu sau fără filtre. Sunt ambalate steril în rafturi care dețin 96 de vârfuri și nu conțin DNază, RNază, protează, pirogeni, ADN uman, endotoxine și inhibitori PCR. Rafturile includ, de asemenea, numere de lot și date de expirare.
Vârfurile de pipetă Flex funcționează cu pipetele Opentrons Flex 50 µL și 1000 µL în configurațiile cu 1, 8 și 96 de canale. Deși puteți pune oricare dintre vârfurile Flex pe pipetele de 50 L și 1000 L, încercați să potriviți vârful la capacitatea nominală a pipetei. De example, ar putea fi ciudat să pui un vârf de 1000 L pe pipeta de 50 L. Pentru pipeta de 1000 L, puteți folosi cu siguranță un vârf de 50 L, 200 L sau 1000 L.
Rafturi pentru vârfuri
Vârfurile nefiltrate și filtrate sunt împachetate într-un suport care constă dintr-o placă de bază reutilizabilă, o placă intermediară care conține 96 de vârfuri și un capac.
Raft de vârf după volum 50 µL 200 µL 1000 µL
Nume de încărcare API
Nefiltrat: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrat: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Nefiltrat: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrat: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Nefiltrat: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrat: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Pentru a ajuta la identificare, plăcile din mijlocul suportului pentru vârfuri sunt codificate cu culori în funcție de dimensiunea vârfului:
50 µL: magenta 200 L: galben 1000 µL: albastru
88
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Atunci când comandați sau reordonați, vârfurile și rafturile vin în două configurații diferite ambalate:
Rack-uri: constau din rafturi pentru vârfuri ambalate separat (placă de bază, placa de mijloc cu vârfuri și capac). Configurațiile în rafturi sunt cele mai bune atunci când curățenia este primordială, pentru a evita contaminarea încrucișată sau când protocoalele dvs. nu permit reutilizarea plăcii de bază sau a componentelor.
Reumplere: Constă dintr-un suport complet pentru vârfuri (placă de bază, placă intermediară cu vârfuri și capac) și recipiente individuale pentru vârfuri. Configurațiile de umplere sunt cele mai bune atunci când protocoalele dvs. permit reutilizarea plăcii de bază sau a componentelor.
Compatibilitate tippipette
Vârfurile de pipetă Flex sunt proiectate pentru pipetele Opentrons Flex. Vârfurile Flex nu sunt compatibile cu pipetele Opentrons OT-2 și nici nu puteți utiliza vârfurile OT-2 pe pipetele Flex.
Alte sfaturi standard din industrie pot funcționa cu pipetele Flex, dar acest lucru nu este recomandat. Pentru a asigura o performanță optimă, ar trebui să utilizați doar vârfuri Opentrons Flex cu pipete Flex.
Adaptor suport pentru vârfuri
Pipeta cu 96 de canale necesită un adaptor pentru a atașa corect un suport complet de vârfuri. În timpul procedurii de atașare, pipeta se deplasează peste adaptor, se coboară pe știfturile de montare și trage vârfurile pe pipete prin ridicarea adaptorului și a suportului pentru vârfuri.
OPENTRONS FLEX
89
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Notă: Folosiți adaptorul pentru suport pentru vârfuri numai când ridicați un suport plin de vârfuri deodată. Așezați suporturile pentru vârfuri direct pe punte când ridicați mai puține vârfuri.
Avertisment: Pericol de strângere. Țineți mâinile departe de adaptorul suportului pentru vârfuri în timp ce pipeta atașează vârfurile pipetei.
Tip adaptor Opentrons Flex 96 Tip Rack Adaptor
Numele de încărcare API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Adaptorul pentru suport pentru vârfuri este compatibil cu Opentrons Flex Gripper. Puteți folosi prinderea pentru a plasa suporturi pentru vârfuri proaspete pe adaptor sau pentru a ridica și muta suporturile pentru vârfuri uzate în jgheabul de deșeuri.
5.5 Tuburi și suporturi pentru tuburi
Sistemul Opentrons 4-in-1 Tube Rack funcționează implicit cu Opentrons Flex. Utilizarea suportului pentru tuburi 4 în 1 vă ajută să vă reduceți sarcina de pregătire, deoarece combinațiile pe care le oferă sunt gata de automatizare imediat din cutie. Mai multe informații sunt disponibile și în Biblioteca Opentrons Labware.
90
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Combinații de tuburi și suporturi
Raft-ul pentru tuburi 4 în 1 Opentrons acceptă o mare varietate de dimensiuni de tuburi, individual sau în combinații de dimensiuni (volum) diferite. Acestea includ: un suport cu 6 tuburi pentru tuburi de 50 ml (6 x 50 ml). Raft combinat cu 10 tuburi pentru patru tuburi de 50 ml și șase tuburi de 15 ml (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). Raft cu 15 tuburi pentru tuburi de 15 ml (15 x 15 ml). Raft cu 24 de tuburi pentru tuburi de 0.5 ml, 1.5 ml sau 2 ml (24 x 0.5 ml, 1.5 ml, 2 ml).
Notă: Toate tuburile sunt cilindrice, cu fundul în formă de V (conic), dacă nu se indică altfel.
Rafturi cu 6 tuburi
Tub tip 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
Rafturi cu 10 tuburi
Tub tip 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 NEST 50 mL 6 NEST 15 mL
Nume de încărcare API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Rafturi cu 15 tuburi
Tub tip 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
Nume de încărcare API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
Rafturi cu 24 tuburi
Tip tub
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, fund în formă de U 24 capac cu filet generic de 2 ml 24 NEST 0.5 ml capac filetat 24 NEST 1.5 ml capac filetat 24 NEST 1.5 ml capac cu filet 24 mL 2 N capac cu filet 24 mL NEST 2 ml capac cu închidere, fund în formă de U
Nume de încărcare API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Definiții API pentru suport pentru tuburi
Biblioteca Opentrons Labware definește caracteristicile suporturilor pentru tuburi enumerate mai sus în JSON separat files. Robotul Flex și API-ul Opentrons Python se bazează pe aceste definiții JSON pentru a lucra cu materiale de laborator utilizate de protocoalele dvs. De exampcând lucrezi cu API, funcția ProtocolContext.load_labware acceptă aceste nume de labware ca parametri validi în codul tău. Numele de încărcare API conectate se conectează la definițiile de laborator pentru rack pentru tuburi din depozitul Opentrons GitHub.
92
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Raft pentru tuburi personalizat
Încercați să creați o definiție personalizată a produsului de laborator folosind Opentrons Labware Creator dacă o combinație de tub și suport pe care doriți să o utilizați nu este listată aici. O definiție personalizată combină toate dimensiunile, metadatele, formele, capacitatea volumetrică și alte informații dintr-un JSON file. Opentrons Flex citește aceste informații pentru a înțelege cum să lucrezi cu materialele de laborator personalizate. Consultați secțiunea Definiții personalizate de laborator pentru mai multe informații.
5.6 Blocuri de aluminiu
Blocurile de aluminiu sunt livrate cu modulul de temperatură GEN2 și pot fi achiziționate separat ca set din trei piese. Setul include o placă cu fund plat, un bloc cu 24 de godeuri și un bloc cu 96 de godeuri.
Opentrons Flex folosește blocuri de aluminiu pentru a ține sampLe tuburi și plăci de puțuri pe modulul de temperatură sau direct pe punte. Când sunt utilizate cu modulul de temperatură, blocurile de aluminiu vă pot mențineamptuburi, benzi PCR sau plăci la o temperatură constantă între 4 °C și 95 °C.
Placă cu fund plat
Placa cu fund plat pentru Flex se livrează cu suportul pentru modulul de temperatură și este compatibilă cu diferite plăci pentru puțuri standard ANSI/SLAS. Această placă plată diferă de placa care se livrează împreună cu Modulul de temperatură în sine sau cu setul separat din trei piese. Are o suprafață de lucru mai largă și cleme de colț teșite. Aceste caracteristici ajută la îmbunătățirea performanței Opentrons Flex Gripper la mutarea articolelor de laborator pe sau în afara plăcii.
Puteți spune ce placă de fund plat aveți, deoarece cea pentru Flex are cuvintele „Opentrons Flex” pe suprafața sa superioară. Cel pentru OT-2 nu.
OPENTRONS FLEX
93
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Bloc de aluminiu cu 24 de godeuri
Blocul cu 24 de godeuri este utilizat cu s-uri individualeample fiole. De example, acceptă sample fiole care:
Au fundul în formă de V sau U. Asigurați conținutul cu capac de închidere sau cu șurub. Țineți lichid în capacități de 0.5 ml, 1.5 ml și 2 ml.
Bloc de aluminiu cu 96 de godeuri
Blocul cu 96 de godeuri acceptă o mare varietate de tipuri de plăci de puțuri. De example, acceptă bine plăci care sunt:
De la producători importanți de plăci de puțuri precum Bio-Rad și NEST.
Proiectat cu fund în formă de V, fund în formă de U sau fund plat.
Proiectat cu godeuri de 100 µL sau 200 µL.
Este, de asemenea, compatibil cu benzi PCR generice.
Adaptoare independente
Bloc termic Placă cu fund plat Flex Bloc de aluminiu cu 24 de godeuri Bloc de aluminiu cu 96 de godeuri
Nume de încărcare API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Vedeți mai jos combinațiile de produse de laborator. opentrons_96_well_aluminum_block
Combinații de articole de laborator din bloc de aluminiu
Biblioteca Opentrons Labware acceptă următoarele combinații de blocuri, fiole și plăci de godeu, care sunt, de asemenea, definite în definiția separată a produsului de laborator JSON files. Robotul Flex și API-ul Opentrons Python
94
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
bazați-vă pe aceste definiții JSON pentru a lucra cu software-ul de laborator utilizat de protocoalele dvs. De exampcând lucrezi cu API, funcția ProtocolContext.load_labware acceptă aceste nume de labware ca parametri validi în codul tău. Tabelele de mai jos listează combinațiile implicite de bloc/container și numele de încărcare API aferente. Legăturile se conectează la definițiile JSON corespunzătoare din depozitul Opentrons GitHub.
Notă: Toate tuburile au fundul în formă de V, dacă nu se indică altfel.
Combinații de articole de laborator cu bloc de aluminiu cu 24 de godeuri
Conținut bloc cu 24 de godeuri Capac cu șurub generic de 2 mL NEST 0.5 mL capac cu șurub NEST 1.5 mL capac cu șurub NEST 1.5 mL capac cu șurub NEST 2 mL capac cu șurub NEST 2 mL capac cu închidere, fund în formă de U
Nume de încărcare API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_nest_nest_nest1.5ml_screwcap24ml crewcap opentrons_2_aluminumblock_nest_24ml_snapcap
Combinații de articole de laborator cu bloc de aluminiu cu 96 de godeuri
Conținut bloc cu 96 de godeuri Placă pentru godeuri Bio-Rad 200 µL Bandă PCR generică 200 µL Placă pentru godeuri NEST 100 µL
Nume de încărcare API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
5.7 Produse de laborator și prindere Flex Opentrons
Deși Opentrons Flex funcționează cu tot inventarul din Biblioteca de produse de laborator, Opentrons Flex Gripper este compatibil numai cu articole specifice de laborator. În prezent, Gripper-ul este optimizat pentru utilizare cu următoarele articole de laborator.
Categoria articolelor de laborator Deep Well Plates Fully Skirted 96 Well Plates
Suporturi pentru vârfuri (varfuri nefiltrate și filtrate)
Mărci
NEST 96 Deep Well Plate 2 ml
Opentrons Tough 96 Well Plate 200 µL PCR Full Skirt NEST 96 Well Plate 200 µL Plat
Opentrons Flex 96 Tip Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 1000 µL
Notă: Pentru cele mai bune rezultate, utilizați Flex Gripper numai cu materialele de laborator enumerate mai sus. Flex Gripper poate funcționa cu alte produse de laborator compatibile cu automatizarea ANSI/SLAS, dar acest lucru nu este recomandat.
5.8 Definiții personalizate pentru materiale de laborator
După cum sa discutat la începutul acestui capitol, software-ul de laborator personalizat este un produs de laborator care nu este listat în Biblioteca Opentrons Labware. Puteți utiliza alte articole de laborator comune sau unice cu Flex, măsurând și înregistrând cu precizie caracteristicile acelui obiect și salvând acele date într-un JSON file. Când sunt importate în aplicație, Flex și API-ul utilizează acele date JSON pentru a interacționa cu materialele de laborator. Opentrons oferă instrumente și servicii, pe care le vom examina mai jos, pentru a vă ajuta să utilizați Flex cu materiale de laborator personalizate.
96
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Crearea de definiții personalizate pentru materiale de laborator
Instrumentele și serviciile Opentrons vă ajută să puneți la îndemâna dumneavoastră materialele de laborator personalizate. Aceste caracteristici se potrivesc cu diferite niveluri de calificare și moduri de lucru. Crearea propriilor articole de laborator și utilizarea lui cu Opentrons Flex ajută la transformarea robotului într-un plus versatil și puternic pentru laboratorul dumneavoastră.
CREATOR DE LABORATOR PERSONALIZAT
Personalizat Labware Creator este un fără cod, webinstrument bazat pe care utilizează o interfață grafică pentru a vă ajuta să creați o definiție de laborator file. Labware Creator produce o definiție de labware JSON file pe care le importați în aplicația Opentrons. După aceea, materialele de laborator personalizate sunt disponibile pentru robotul Flex și pentru API-ul Python.
SERVICIU PERSONALIZAT DE LABORATOR
Luați legătura cu noi dacă materialele de laborator pe care doriți să le utilizați nu sunt disponibile în bibliotecă, dacă nu vă puteți crea propriile definiții sau pentru că un articol personalizat include diferite forme, dimensiuni sau alte nereguli descrise mai jos.
Produse de laborator pe care le puteți defini în Labware Creator
; Puțurile și tuburile sunt uniforme și identice. ; Toate rândurile sunt distanțate uniform
(spațiul dintre rânduri este egal).
; Toate coloanele sunt distanțate uniform (spațiul dintre coloane este egal).
; Se potrivește perfect într-un singur slot pentru punte.
Labware Opentrons trebuie să definească ; Puțurile și formele tuburilor variază. ; Rândurile nu sunt distanțate uniform.
; Coloanele nu sunt distanțate uniform.
; Mai mic decât un slot pentru punte (necesită adaptor) sau se întinde pe mai multe sloturi pentru punte.
OPENTRONS FLEX
97
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
Iată câteva diagrame care vă ajută să vizualizați example-urile descrise mai sus. Regular Toate coloanele sunt uniform distanțate și toate rândurile sunt uniform distanțate. Coloanele nu trebuie să aibă aceeași distanță ca și rândurile.
Obișnuit Grila nu trebuie să fie în centrul obiectelor de laborator.
Rândurile neregulate sunt distanțate uniform, dar coloanele nu sunt distanțate uniform.
Coloanele/rândurile neregulate sunt distanțate uniform, dar godeurile nu sunt identice.
Neregulat Există mai multe grile.
Echipa noastră de produse de laborator va lucra pentru a vă înțelege nevoile și va crea definiții personalizate pentru dvs. Pentru mai multe informații, consultați articolele de asistență Solicitarea unei definiții personalizate de laborator și formularul de solicitare personalizat. Acesta este un serviciu contra cost.
98
OPENTRONS FLEX
CAPITOLUL 5: PRODUSE DE LABORATOR
PYTHON API
Deși nu puteți crea materiale de laborator personalizate cu API-ul nostru, puteți utiliza materiale de laborator personalizate cu metodele API disponibile. Cu toate acestea, mai întâi trebuie să definiți materialele de laborator personalizate și să le importați în aplicația Opentrons. După ce ați adăugat materialele de laborator în aplicația Opentrons, acestea sunt disponibile pentru API-ul Python și pentru robot. Consultați secțiunea Definiții personalizate de laborator din documentația API-ului Python pentru mai multe informații. Pentru informații despre scrierea scripturilor de protocol cu API, consultați secțiunea Python Protocol API din capitolul Dezvoltarea protocolului.
Schema de laborator JSON
Un JSON file este modelul pentru produsele de laborator standard și personalizate Opentrons. Acest file conține și organizează datele de laborator conform specificațiilor de proiectare stabilite de schema implicită.
O schemă este un cadru
Documente/Resurse
![]() |
opentrons FLEX FLEX Robot de manipulare a lichidelor Opentrons Flex Open Source [pdfManual de instrucțiuni Robot de manipulare a lichidelor cu sursă deschisă FLEX Opentrons Flex, FLEX, Robot de manipulare a lichidelor cu sursă deschisă Opentrons, Robot de manipulare a lichidelor cu sursă deschisă Flex, Robot de manipulare a lichidelor cu sursă deschisă, Robot de manipulare a lichidelor, Robot de manipulare a lichidelor, Robot de manipulare, robot |