FLEX Opentrons Flex otvoreni izvorni robot za rukovanje tekućinama

“

Opentrons Flex

Tehnički podaci:

Opće specifikacije: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua.
Specifikacije zaštite okoliša: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua.

Certifikati: Lorem ipsum bol sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua.
Serijski broj: XXX-XXXX-XXXX

Upute za korištenje proizvoda:

1. Ugradnja i kalibracija instrumenta:

Slijedite korake navedene u priručniku za pipetu i hvataljku
montaža.

2. Premještanje:

Za kratke poteze, pogledajte odjeljak 2.5 u priručniku. Za
selidbe na velike udaljenosti, slijedite navedene smjernice. Generalna selidba
savjet je također dostupan.

3. Veze:

Osigurajte ispravan priključak napajanja kako je opisano u priručniku.
Po potrebi spojite USB i pomoćne uređaje. Mrežne veze
treba uspostaviti prema uputama.

4. Dizajner protokola:

Shvatite zahtjeve za Protocol Designer i naučite kako
za dizajn novih protokola ili modificiranje postojećih prema vašem laboratoriju
zahtjevi.

5. Python Protocol API:

Istražite pisanje i pokretanje skripti pomoću Python Protocol API-ja.
Otkrijte značajke koje su ekskluzivne za Python za poboljšanu funkcionalnost.

6. OT-2 protokoli:

Saznajte više o OT-2 Python protokolima, OT-2 JSON protokolima i
Protokoli magnetskog modula za različite vrste eksperimenata.

Često postavljana pitanja (FAQ):

P: Kako mogu riješiti problem ako se robot ne kreće kao
očekivano?

O: Provjerite priključak napajanja, osigurajte ispravnu kalibraciju
instrumente i provjerite da nema prepreka u
robotov put.

P: Mogu li koristiti prilagođene pipete s Opentrons Flexom?

O: Opentrons preporučuje korištenje kompatibilnih pipeta za optimalno
performanse i točnost.

“`

View Fullscreen

Opentrons Flex
Priručnik s uputama
Opentrons Labworks Inc.
prosinac 2023

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Registrirana imena, zaštitni znakovi itd. korišteni u ovom dokumentu, čak i kada nisu izričito označeni kao takvi, ne smiju se smatrati nezaštićenim zakonom.

Sadržaj
Predgovor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktura ovog priručnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Napomene i upozorenja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
1. poglavlje Uvod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Dobrodošli u Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Što je novo u Flexu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flex radne stanice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Sigurnosne informacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Sigurnosni simboli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Upozorenja o električnoj sigurnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Dodatna sigurnosna upozorenja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Sigurnosne mjere opreza . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biološka sigurnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Otrovni dimovi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Zapaljive tekućine . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Usklađenost s propisima . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Sigurnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetska kompatibilnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC upozorenja i bilješke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Sukladnost Kanade ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Upozorenje za okoliš . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi pretcertifikacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Poglavlje 2: Instalacija i premještanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Zahtjevi za sigurnost i rad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Gdje postaviti Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Potrošnja energije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Uvjeti okoline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Raspakiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Potreban trud i vrijeme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Sanduk i materijal za pakiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elementi proizvoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Dio 1: Uklonite sanduk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Dio 2: Otpustite Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Dio 3: Završna montaža i uključivanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 Prva vožnja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Uključivanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Spajanje na mrežu ili računalo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Instalirajte ažuriranja softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Pričvrstite privjesak za zaustavljanje u nuždi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Dajte svom robotu ime . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instalacija i kalibracija instrumenta . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Ugradnja pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Montaža hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Preseljenje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Kratki potezi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Selidbe na velike udaljenosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Opći savjeti za selidbu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Završne misli o selidbi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Poglavlje 3: Opis sustava. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fizičke komponente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Okvir i kućište . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Paluba i radni prostor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging područje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Oprema za palubu. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Žlijeb za otpad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging area slots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sustav kretanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Zaslon osjetljiv na dodir i LED zaslon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Specifikacije pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Kalibracija pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adapter nosača vrha pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Djelomično podizanje vrha . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Senzori za pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Ažuriranja firmvera pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Hvataljka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Specifikacije hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibracija hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Ažuriranja firmvera hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Privjesak za zaustavljanje u nuždi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kada koristiti E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Uključivanje i otpuštanje E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Veze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Priključak napajanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB i pomoćni priključci . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Mrežne veze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Specifikacije sustava. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Opći podaci . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specifikacije zaštite okoliša . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certifikati. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serijski broj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Poglavlje 4: Moduli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Podržani moduli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modul caddy sustav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Kalibracija modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kada kalibrirati module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Kako kalibrirati module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul grijača-tresača GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Značajke grijača-tresača. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specifikacije grijača-tresilice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetski blok GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Značajke magnetskog bloka. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specifikacije magnetskog bloka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperaturni modul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Značajke temperaturnog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specifikacije temperaturnog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modul termociklera GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Značajke termociklera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specifikacije termociklera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Poglavlje 5: Laboratorijska oprema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Koncepti laboratorijskog softvera. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratorijska oprema kao hardver . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratorijska oprema kao podatak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Laboratorijska oprema po narudžbi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Rezervoari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Ležišta s jednom bušotinom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Ležišta s više bušotina. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoari i API definicije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Laboratorijska oprema spremnika po narudžbi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Ploče s jažicama . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

Ploče sa 6 jažica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče s 12 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče s 24 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče s 48 jažica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče s 96 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 Ploče s 384 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Adapteri za ploče za bunar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Ploče s jažicama i API definicije. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Laboratorijska oprema za ploče s jažicama. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Vrhovi i nosači vrhova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Stalci za savjete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Kompatibilnost tippipeta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adapter za stalak vrhova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Epruvete i stalak za epruvete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinacije cijevi i nosača . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci sa 6 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci od 10 tuba. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci sa 15 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Stalci s 24 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 API definicije stalka za cijevi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Laboratorijska oprema prilagođena stalku za epruvete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminijski blokovi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Ploča s ravnim dnom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Aluminijski blok s 24 jažice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Aluminijski blok s 96 jažice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Samostalni adapteri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinacije laboratorijskog posuđa od aluminijskih blokova . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijskih blokova s 24 jažice . . . . . . . . .95 Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijskih blokova s 96 jažice . . . . . . . . .95 5.7 Laboratorijska oprema i Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Definicije prilagođenog laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Stvaranje prilagođenih definicija laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON shema laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON definicije laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Poglavlje 6: Razvoj protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Unaprijed napravljeni protokoli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Biblioteka protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Usluga razvoja prilagođenog protokola . . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Dizajner protokola. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Zahtjevi dizajnera protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Dizajniranje protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Modificiranje postojećih protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Pisanje i pokretanje skripti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Ekskluzivne značajke za Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 protokoli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python protokoli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON protokoli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protokoli magnetskog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Poglavlje 7: Softver i rad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Rad sa zaslonom osjetljivim na dodir. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Nadzorna ploča robota . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Upravljanje protokolom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Pojedinosti protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Pokreni postavljanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Provjera položaja laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Napredak trčanja. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Završetak trčanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Upravljanje instrumentima. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Postavke robota. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfiguracija palube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalacija aplikacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Prijenos protokola u Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Status i kontrole modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Nedavna izvođenja protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Napredni rad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyterova bilježnica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Rad naredbenog retka preko SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Poglavlje 8: Održavanje i servis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Čišćenje vašeg Flexa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Prije nego počnete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Što možete očistiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Otopine za čišćenje. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čišćenje okvira i prozorskih ploča . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čišćenje palube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Čišćenje portala. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Čišćenje kanala za otpad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Čišćenje pipeta i vrhova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminacija pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Čišćenje vrhova pipeta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Čišćenje hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Moduli za čišćenje. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Općenito čišćenje modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Brtve termociklera. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Laboratorijski pribor siguran za autoklave . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Servisiranje Flexa . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons usluge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kvalifikacija instalacije i radna kvalifikacija . . . 155 Preventivno održavanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Jamstvo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Dodatak A: Rječnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Dodatak B: Dodatna dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API referenca. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentacija programera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Dodatak C: Softver otvorenog koda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons na GitHubu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Ostala spremišta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Dodatak D: Podaci za podršku i kontakt . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Prodaja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Potpora . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Poslovne informacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Predgovor
Dobro došli u priručnik s uputama za Opentrons Flex robot za rukovanje tekućinama. Ovaj priručnik vodi vas kroz gotovo sve što trebate znati za postavljanje i korištenje Flexa, fokusirajući se na teme koje su najrelevantnije svakodnevnim korisnicima Flexa u laboratorijskom okruženju.
Struktura ovog priručnika
Opentrons Flex je složen sustav, tako da postoji mnogo različitih puteva za učenje svega što može učiniti. Slobodno skočite ravno na poglavlje koje se bavi bilo kojom temom koja vas zanima! Na primjerample, ako već imate Flex postavljen u svom laboratoriju, možete preskočiti poglavlje Instalacija i premještanje.
Ako više volite vođeni pristup, ovaj je priručnik strukturiran tako da ga možete pratiti od početka do kraja.
Saznajte više o Flexu. Razlikovne značajke Flexa navedene su u 1. poglavlju: Uvod. Uvod također uključuje važne sigurnosne i regulatorne informacije.
Započnite s Flexom. Ako trebate postaviti svoj Flex, slijedite detaljne upute u Poglavlju 2: Instalacija i premještanje. Zatim se upoznajte s komponentama Flexa u poglavlju 3: Opis sustava.
Postavite svoj špil. Konfiguriranje špila omogućuje različite znanstvene aplikacije na Flexu. Poglavlje 4: Moduli opisuje Opentrons periferne uređaje koje možete instalirati u ili na vrhu palube za obavljanje specifičnih znanstvenih zadataka. Poglavlje 5: Laboratorijska oprema objašnjava kako raditi s opremom za držanje tekućina.
Pokrenite protokol. Osnovna upotreba Flexa je izvođenje standardiziranih znanstvenih postupaka, poznatih kao protokoli. Poglavlje 6: Razvoj protokola nudi nekoliko načina da dobijete gotove protokole ili da ih sami dizajnirate. Da biste pokrenuli svoj protokol, slijedite upute u Poglavlju 7: Softver i rad, koje također sadrži upute za izvođenje drugih zadataka i prilagođavanje postavki vašeg robota.
Neka Flex radi. Slijedite savjete u Poglavlju 8: Održavanje i servis kako bi vaš Flex bio čist i optimalno radio. Ili se prijavite za jednu od tamo navedenih Opentrons usluga i prepustite nam brigu o Flexu umjesto vas.
Naučite još više. Trebate još nešto? Konzultirajte priloge. Dodatak A: Rječnik definira pojmove koji se odnose na Flex. Dodatak B: Dodatna dokumentacija upućuje vas na još više resursa za Opentrons proizvode i pisanje koda za kontrolu Flexa.

OPENTRONS FLEX

PREDGOVOR
Dodatak C: Softver otvorenog koda objašnjava kako se Opentrons softver nalazi na GitHubu kao resurs za programere i one koji to nisu.
Dodatak D: Informacije o podršci i kontaktu navodi kako stupiti u kontakt s Opentronsom ako vam je potrebna pomoć izvan one koju nudi naša dokumentacija.
Napomene i upozorenja
Kroz ovaj priručnik pronaći ćete posebno oblikovane blokove za bilješke i upozorenja. Bilješke pružaju korisne informacije koje možda neće biti očite u uobičajenom tijeku korištenja Flexa. Obratite posebnu pozornost na upozorenja – ona se koriste samo u situacijama u kojima postoji opasnost od ozljeda, oštećenja opreme, gubitka ili kvarenjaampdatoteke ili reagense, gubitak podataka ili drugu štetu. Napomene i upozorenja izgledaju ovako:
Sample Napomena: ovo je nešto što biste trebali znati, ali ne predstavlja nikakvu opasnost.
Sample Upozorenje: ovo je nešto što trebate znati jer postoji rizik povezan s tim.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1
Uvod

Ovo poglavlje vas upoznaje s ekosustavom Opentrons Flex, uključujući cjelokupni dizajn sustava i dostupne konfiguracije radnih stanica. Također uključuje važne informacije o sukladnosti i sigurnosti koje biste trebali pročitatiview prije postavljanja robota Opentrons Flex. Za više detalja o značajkama Opentrons Flexa, pogledajte poglavlje Opis sustava.

1.1 Dobro došli u Opentrons Flex
Opentrons Flex je robot za rukovanje tekućinom dizajniran za visoku propusnost i složene tijekove rada. Robot Flex osnova je modularnog sustava koji uključuje pipete, hvataljku laboratorijskog pribora, učvršćenja na palubi, module na palubi i laboratorijski pribor — sve to možete sami zamijeniti. Flex je dizajniran sa zaslonom osjetljivim na dodir tako da s njim možete raditi izravno na laboratorijskom stolu ili ga možete kontrolirati iz cijelog svog laboratorija pomoću aplikacije Opentrons ili naših API-ja otvorenog koda.
Radne stanice Flex dolaze sa svom opremom — robotom, hardverom i laboratorijskom opremom — koja vam je potrebna za početak automatizacije uobičajenih laboratorijskih zadataka. Za druge aplikacije, Opentrons Flex radi na potpuno otvorenom softveru i firmveru, te je agnostičan za reagense i laboratorijski softver, što vam daje kontrolu nad načinom na koji dizajnirate i pokrećete svoje protokole.

Što je novo u Flexu
Opentrons Flex dio je Opentrons serije robota za rukovanje tekućinama. Korisnici Opentrons Flexa možda su upoznati s Opentrons OT-2, našim osobnim robotom za pipetiranje. Flex nadilazi mogućnosti OT-2 u nekoliko ključnih područja, pružajući veću propusnost i vrijeme hodanja.

Značajka Protok pipete
Kapaciteti pipete i vrha

Opis
Flex pipete imaju 1, 8 ili 96 kanala. 96-kanalna pipeta djeluje na 12 puta više jažica odjednom od najveće OT-2 pipete.
Flex pipete imaju veće raspone volumena (1 µL, 50 µL) i sve mogu raditi s bilo kojim volumenom Opentrons Flex vrhova. Ovo je poboljšanje u odnosu na pipete OT-5, koje imaju manje raspone i moraju koristiti vrhove s odgovarajućim rasponom volumena.

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

Hvataljka Automatska kalibracija Zaslon osjetljiv na dodir Modul nosači Koordinate utora na palubi Pokretni otpad Veličina i težina

Opentrons Flex Gripper preuzima i premješta laboratorijski pribor po palubi automatski, bez intervencije korisnika. Hvataljka omogućuje složenije tijekove rada unutar jednog izvođenja protokola.
Kalibracija položaja Flex pipeta i hvataljke potpuno je automatizirana. Pritisnite jednu tipku i instrument će se pomaknuti na precizno obrađene točke na palubi kako bi odredio svoj točan položaj, spremajući te podatke za upotrebu u vašim protokolima.
Flex ima vlastito sučelje sa zaslonom osjetljivim na dodir koje vam omogućuje izravnu kontrolu, uz korištenje aplikacije Opentrons. Koristite dodirni zaslon za pokretanje protokola, provjeru statusa posla i promjenu postavki izravno na robotu.
Flex moduli se uklapaju u nosače koji zauzimaju prostor ispod palube. Caddies postavlja vaš laboratorijski pribor bliže površini palube i omogućuje provođenje kabela ispod palube. Caddies omogućuje još više konfiguracija modula i laboratorijske opreme na palubi.
Utori na Flexu su numerirani koordinatnim sustavom (A1D4) koji je sličan numeriranju jažica na laboratorijskom priboru.
Kanta za smeće može se staviti na više lokacija na Flexu. Zadana lokacija (utor A3) je preporučena pozicija. Također možete koristiti hvataljku za odlaganje smeća u dodatni žlijeb za otpad.
Flex je malo veći i puno teži od OT-2. Instalacijski zadaci na Flexu zahtijevaju pomoć laboratorijskog partnera.

Detaljna usporedba tehničkih specifikacija robota dostupna je na Opentronsu webmjesto.
I Flex i OT-2 roboti rade na našem softveru otvorenog koda, a aplikacija Opentrons može kontrolirati obje vrste robota odjednom. Iako se OT-2 protokoli ne mogu izvoditi izravno na Flexu, jednostavno ih je prilagoditi (pogledajte odjeljak OT-2 protokola u poglavlju Razvoj protokola za detalje).

Flex radne stanice
Opentrons Flex radne stanice uključuju Flex robota, dodatke, pipete i hvataljke, module na palubi i laboratorijsku opremu potrebnu za automatizaciju određene aplikacije. Sve komponente radne stanice su modularne. Ako trebate promijeniti aplikacije, možete dodati ili zamijeniti drugi Flex hardver i kompatibilne potrošne materijale.

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD
NGS RADNA STANICA
Opentrons Flex NGS Workstation automatizira pripremu NGS knjižnice. Može automatizirati tijek rada pred sekvenciranje korištenjem bilo kojeg vodećeg sustava reagensa, uključujući fragmentaciju i tagknjižnica temeljena na mentaciji prep.
Osim Flex robota, NGS Workstation uključuje:
Hvataljka Izbor konfiguracije pipete
Dvije 8-kanalne pipete (1 µL i 50 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Žlijeb za otpad Magnetski blok Modul temperature Modul termociklera Laboratorijski komplet s vrhovima filtera, mikrocentrifugalnim epruvetama, spremnicima i PCR pločama
PCR RADNA STANICA
Opentrons Flex PCR Workstation automatizira PCR postavljanje i termocikliranje radnih procesa do 96 samples. Može alikvotirati ohlađene reagense i sampu PCR ploču s 96 jažica. Uz dodatak automatiziranog modula Thermocycler, upotrijebite hvataljku za umetanje ploče u Thermocycler, a zatim pokrenite odabrani PCR program.
Osim Flex robota, PCR Workstation uključuje:
Hvataljka Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (1 µL) i 50-kanalna pipeta (8 µL) 1-kanalna pipeta (50 µL) Laboratorijski modul temperaturnog modula žlijeba za otpad Laboratorijski pribor s vrhovima filtera, mikrocentrifugalnim epruvetama, spremnicima i PCR pločama

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD
RADNA STANICA ZA EKSTRAKCIJU NUKLEINSKE KISELINE
Opentrons Flex Radna stanica za ekstrakciju nukleinske kiseline automatizira izolaciju i pročišćavanje DNA/RNA. Koristi magnetski blok za odvajanje magnetskih kuglica i grijač-tresilicu zaample liza i resuspenzija magnetskih kuglica.
Osim robota Flex, radna stanica za ekstrakciju nukleinske kiseline uključuje:
Hvataljka Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Žlijeb za otpad Magnetski blok grijač-modul mućkalice Laboratorijski komplet s vrhovima filtera, spremnicima, PCR pločama i pločama s dubokim jažicama
RADNA STANICA ZA PROČIŠĆAVANJE PROTEINA S MAGNETNIM ZRNCIMA
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatizira malo pročišćavanje proteina i proteomikuample priprema do 96 samples. Kompatibilan je s mnogim popularnim reagensima na bazi magnetskih kuglica.
Osim robota Flex, radna stanica za pročišćavanje proteina uključuje:
Hvataljka Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Žlijeb za otpad Magnetski blok grijač-modul mućkalice Laboratorijski komplet s vrhovima filtera, spremnicima, PCR pločama i pločama s dubokim jažicama
FLEX PREP RADNA STANICA
Opentrons Flex Prep Workstation automatizira jednostavne tijekove rada pipetiranja. Konfigurirajte radnu stanicu s 1-kanalnim i 8-kanalnim pipetama za obavljanje zadataka kao što suampprijenos, sample dupliciranje, i

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD
alikvotiranje reagensa. Konfigurirajte radnu stanicu s 96-kanalnom pipetom za izvođenje alikvotiranja reagensa visoke propusnosti i st.amping.
Osim Flex robota, Flex Prep Workstation uključuje:
Izbor konfiguracije pipete: 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL)
Komplet laboratorijskog posuđa s vrhovima filtera, mikrocentrifugalnim epruvetama i spremnicima
RADNA STANICA ZA PRIPREMU PLAZMIDA
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatizira ekstrakciju i pročišćavanje plazmida na temelju magnetskih kuglica. Ova radna stanica opremljena je pipetama velikog volumena, modulom grijač-tresilica i magnetskim blokom za prilagodbu većini kemijskih pripravaka na bazi kuglica.
Uz Flex robota, Plasmid Prep Workstation uključuje:
Hvataljka 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) Žlijeb za otpad Magnetski blok modul grijača-tresilica Laboratorijski komplet s vrhovima filtera, mikrocentrifugalnim epruvetama, spremnicima, PCR pločama i pločama s dubokim jažicama
SYNBIO RADNA STANICA
Opentrons Flex SynBio Workstation automatizira razne tijekove rada sintetičke biologije kao što su sinteza DNK i kloniranje. Koristi magnetski blok i temperaturni modul za podršku većini kemija temeljenih na kuglicama. Dodajte modul Thermocycler za izvođenje inkubacija s grijanim poklopcem i amplifikacije.
Osim Flex robota, SynBio Workstation uključuje:
Hvataljka 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) Magnetski blok temperaturni modul

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

Komplet laboratorijskog posuđa s običnim i filtarskim vrhovima, mikrocentrifugalnim epruvetama, spremnicima, PCR pločama i pločama s dubokim jažicama

1.2 Sigurnosne informacije
Opentrons Flex robot za rukovanje tekućinama dizajniran je za siguran rad. Pogledajte specifikacije i smjernice za usklađenost u ovom odjeljku kako biste osigurali sigurnu upotrebu svog Flexa. Ove smjernice pokrivaju sigurnu upotrebu ulaznih i izlaznih priključaka za proizvod, uključujući priključke za napajanje i podatke, kao i oznake upozorenja koje se nalaze na robotu Flex i povezanom hardveru. Korištenje uređaja na način koji nije naveden u ovom priručniku može dovesti korisnika i opremu u opasnost.

Sigurnosni simboli
Različite oznake na Flexu i u ovom priručniku upozoravaju vas na izvore potencijalnih ozljeda ili štete.

Simbol

Opis
Upozorenje: upozorava korisnike na potencijalno opasne uvjete. Radnje koje mogu dovesti do ozljeda ili smrti.
Oprez: upozorava korisnike na oštećenje opreme. Izgubljeni ili oštećeni podaci. Nepovratni prekid operacije koja se izvodi.
Strujni udar: Identificira komponente instrumenta koje mogu predstavljati opasnost od strujnog udara ako se instrumentom nepravilno rukuje.

Vruća površina: Identificira komponente instrumenta koje predstavljaju rizik od osobnih ozljeda zbog visoke topline/temperatura ako se instrumentom nepravilno rukuje.

Točka uklještenja: Identificira komponente instrumenta koje mogu predstavljati rizik od osobnih ozljeda kada su u pokretu.

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

Na Flexu ćete pronaći sljedeće oznake:
Oznake intelektualnog vlasništva Oznake usklađenosti s propisima (npr. ETL) Oznake opasnosti od električnog udara Oznake općeg upozorenja Oznake proizvoda Oznake mjesta uboda Visoka vol.tage naljepnice Oznake s nazivnom snagom

Upozorenja o električnoj sigurnosti
Uvijek se pridržavajte sljedećih upozorenja o električnoj sigurnosti:

Simbol

Opis
Uključite robota u uzemljeni strujni krug klase 1. Pogledajte odjeljak Povezivanje napajanja u poglavlju Opis sustava.

Nemojte povezivati (uključivati), odspajati (isključivati) niti koristiti kabele za napajanje izmjeničnom strujom ako: Kabel je pohaban ili oštećen. Drugi priključeni kabeli, žice ili utičnice su pohabani ili oštećeni.
Korištenje oštećenih kabela za napajanje može uzrokovati opasnost od strujnog udara što može dovesti do ozbiljnih ozljeda ili oštećenja robota.
Nemojte mijenjati kabel za napajanje izmjeničnom strujom osim prema uputama Opentrons podrške.

Za više informacija o električnim zahtjevima, pogledajte odjeljak Potrošnja energije u poglavlju Instalacija i premještanje.

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

Dodatna sigurnosna upozorenja
Uvijek se pridržavajte sljedećih dodatnih sigurnosnih upozorenja:

Simbol

Opis
Opentrons Flex nije certificiran za korištenje s eksplozivnim ili zapaljivim tekućinama. Nemojte puniti ploče, cijevi ili bočice koje sadrže eksplozivne ili zapaljive tekućine u robota niti na drugi način raditi s instrumentom s eksplozivnim ili zapaljivim tekućinama u kućištu.
Koristite dobru laboratorijsku praksu i pridržavajte se mjera opreza proizvođača pri radu s kemikalijama. Opentrons nije odgovoran za bilo kakvu štetu zbog ili kao rezultat uporabe opasnih kemikalija.

Flex je težak 88.5 kg (195 lbs). Zbog toga su potrebne dvije osobe da ga sigurno podignu i pomaknu. Pogledajte odjeljak Premještanje u poglavlju Instalacija i premještanje.

Flex treba postaviti na površinu koja može izdržati njegovu težinu od 88.5 kg (195 lbs) s dovoljnom površinom za smještaj robota plus njegovu minimalnu udaljenost (20 cm/8 inča). Pogledajte odjeljak Sigurnosni i radni zahtjevi u poglavlju Instalacija i premještanje.
Flex može emitirati vibracije tijekom rada. Postavite robota na čvrstu, ravnu i vodootpornu površinu s poprečnim ili zavarenim spojevima. Pogledajte odjeljak Sigurnosni i radni zahtjevi u poglavlju Instalacija i premještanje.

Sigurnosna upozorenja
Kako biste zaštitili Flex od oštećenja, slijedite ove mjere opreza:

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

Simbol

Opis
Koristite laboratorijski softver koji je usklađen s ANSI/SLAS-om ili ga je odobrio Opentrons. Pogledajte poglavlje Labware.
Korozivne materijale, sredstva ili druge štetne materijale držite dalje od robota.

Biološka sigurnost
Tretirajte uzorke i reagense koji sadrže materijale uzete od ljudi kao potencijalno zarazne agense. Opentrons preporučuje korištenje sigurnih laboratorijskih postupaka kako je objašnjeno u 6. izdanju Biološke sigurnosti u mikrobiološkim i biomedicinskim laboratorijima (BMBL).
Pod normalnim okolnostima, Flex ne stvara vidljive aerosole iz izvornih tekućina. Međutim, pod određenim uvjetima, moguće je stvoriti aerosole iz izvornih tekućina. Kada radite s izvornim tekućinama razine 2 ili više biološke sigurnosti, razmotrite poduzimanje mjera opreza protiv izlaganja aerosolu, u skladu s lokalnim regulatornim tijelima. Kako biste smanjili potencijalni rizik od izlaganja aerosolu robota, osigurajte sljedeće:
Izvršite održavanje kako je opisano u poglavlju Održavanje i servis. Pravilno postavite i osigurajte sve poklopce instrumenata, pipete, module i laboratorijsku opremu. Upotrijebite odgovarajuću tehniku pipetiranja kako biste pomogli u ublažavanju aerosola.
Otrovne pare
Ako radite s hlapljivim otapalima ili otrovnim tvarima, koristite učinkovit sustav ventilacije laboratorija kako biste uklonili sve pare koje se mogu proizvesti.
Zapaljive tekućine
Flex nije ocijenjen za korištenje sa zapaljivim tekućinama i ne bi se trebao koristiti sa zapaljivim tekućinama.

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD

1.3 Usklađenost s propisima
Opentrons Flex u skladu je sa svim primjenjivim zahtjevima sljedećih sigurnosnih i elektromagnetskih standarda.

Sigurnost
ID pravila IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Titula
Sigurnosni zahtjevi za električnu opremu za mjerenje, kontrolu i laboratorijsku upotrebu, 1. dio: Opći zahtjevi
Posebni zahtjevi za laboratorijsku opremu za miješanje i miješanje

Elektromagnetska kompatibilnost

ID pravila EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Dio 15 Pododjeljak B Klasa A IC ICES-003

Titula
Električna oprema za mjerenje, kontrolu i laboratorijsku upotrebu EMC Zahtjevi Dio 1: Opći zahtjevi Nenamjerni radijatori
Oprema za upravljanje spektrom i telekomunikacijske smetnje Standardna oprema za informacijsku tehnologiju (uključujući digitalne aparate)

FCC upozorenja i napomene
Upozorenje: Promjene ili modifikacije ove jedinice koje Opentrons nije izričito odobrio mogu poništiti korisnikovo ovlaštenje za rukovanje opremom.
Ovaj uređaj u skladu je s dijelom 15 FCC pravila. Rad podliježe sljedećem:

OPENTRONS FLEX

1. POGLAVLJE UVOD
Ovaj uređaj ne smije uzrokovati štetne smetnje. Ovaj uređaj mora prihvatiti sve primljene smetnje, uključujući smetnje koje mogu uzrokovati neželjene
operacija.
Napomena: Ova je oprema testirana i utvrđeno je da je u skladu s ograničenjima za digitalne uređaje klase A, u skladu s dijelom 15 pravila FCC-a. Ova su ograničenja osmišljena kako bi pružila razumnu zaštitu od štetnih smetnji kada oprema radi u komercijalnom okruženju. Ova oprema stvara, koristi i može zračiti radiofrekventnu energiju i, ako nije instalirana i korištena u skladu s uputama za uporabu, može uzrokovati štetne smetnje radijskim komunikacijama. Rad ove opreme u stambenom području vjerojatno će uzrokovati štetne smetnje u kojem će slučaju korisnik morati ispraviti smetnje o vlastitom trošku.
Kanadska usklađenost s ISED-om
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Ovaj proizvod zadovoljava primjenjive tehničke specifikacije Kanade za inovacije, znanost i gospodarski razvoj.
Le pésent produit est conforme aux spécifications tehnike primjenjive za inovacije, znanost i razvoj kanadskog gospodarstva.
Upozorenje o okolišu
Upozorenje: rak i reproduktivna šteta www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi pretcertifikacija
Wi-Fi modul je prethodno certificiran za upotrebu u mnogim regijama:
Sjedinjene Države (FCC): FCC identifikator UAY-W8997-M1216 Europsko gospodarsko područje (CE): Nema javnog identifikatora (samodeklaracija) Kanada (IC): Identifikacijski broj verzije hardvera W8997-M1216 Japan (TELEC): Certificirani broj 020-170034 Indija (WPC): Registarski broj ETA-SD-20191005525 (samostalna izjava)

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2
Montaža i preseljenje
Ovo poglavlje opisuje kako pripremiti svoj laboratorij za Opentrons Flex, kako postaviti robota i kako ga po potrebi premjestiti. Prije preuzimanja vašeg Flexa, provjerite ispunjava li vaš laboratorij ili ustanova sve kriterije u odjeljku Zahtjevi za sigurnost i rad. Kada dođe vrijeme da pokrenete svoj Flex, slijedite detaljne upute u odjeljcima Raspakiranje, Prvo pokretanje i Instalacija i kalibracija instrumenta ili koristite Opentronsovu uslugu postavljanja podrške na licu mjesta. A ako ikada trebate premjestiti svoj Flex na novu lokaciju, blizu ili daleko, slijedite korake u odjeljku Premještanje.
2.1 Zahtjevi za sigurnost i rad
Gdje postaviti Opentrons Flex
Prostor je vrijedna roba u gotovo svakom laboratoriju. Vašem Flexu će trebati nešto – ali ne previše, jer je dizajniran da stane na polovicu standardnog laboratorijskog stola. Provjerite imate li prostor koji zadovoljava sljedeće kriterije.
Površina klupe: nepomična, čvrsta, ravna, vodootporna površina. Ne preporučuju se stolovi ili klupe s kotačima (čak i s kotačima za zaključavanje). Flex se brzo kreće i ima veliku masu, što može potresti ili dovesti u ravnotežu lagane ili pomične stolove.
Nosivost: Sam robot teži 88.5 kg (195 lb) i treba ga podizati samo dvoje ljudi koji rade zajedno. Postavite robota na površinu koja može izdržati njegovu težinu plus težinu svih modula, laboratorijskog posuđa, tekućina ili druge laboratorijske opreme koja će se koristiti u vašim aplikacijama.
Radni prostor: Osnovne dimenzije robota su 87 cm Š x 69 cm D x 84 cm V (oko 34" x 27" x 33"). Flexu je potrebno 20 cm (8 inča) bočnog i stražnjeg prostora za kabele, USB priključke i za raspršivanje ispušnih plinova iz modula koji griju i hlade.
Upozorenje: Nemojte postavljati stranice ili stražnju stranu Flexa u ravninu sa zidom.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE

84 cm 33″

87 cm 34″
Dimenzije baze Opentrons Flex.

69 cm 27″

20 cm 8″

Vrh view Opentrons Flexa, s minimalnim bočnim i stražnjim razmakom.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE

Potrošnja energije
Opentrons Flex treba biti spojen na zidnu utičnicu na ili u blizini mjesta na kojem ga postavljate. Spojite Flex samo na krugove koji mogu primiti njegovu maksimalnu snagu:
Ulazna snaga: 36 VDC, 6.1 A Potrošnja u mirovanju: 30 W Tipična potrošnja: 40 W (tijekom rada protokola) Maksimalna potrošnja: Približno 50 W
Točna potrošnja energije ovisi o:
Količina i vrsta pokreta izvršenih tijekom protokola. Količina vremena koje robot provede u stanju mirovanja. Status svjetala na robotu. Koliko je instrumenata priključeno.
Ne zaboravite uzeti u obzir drugu elektroniku koja troši energiju u istom krugu, uključujući Flex module s vlastitim izvorima napajanja. Na primjerampLe, Thermocycler Module ima maksimalnu potrošnju energije (630 W) koja je puno veća od samog robota Flex. Ako je potrebno, posavjetujte se s upraviteljem svoje ustanove kako biste bili sigurni da zadovoljava zahtjeve vaše opreme za napajanje.

Uvjeti okoliša
Uvjeti okoline za preporučenu upotrebu, prihvatljivu upotrebu i skladištenje variraju:

Preporuča se za rad sustava

Prihvatljivo za rad sustava

Temperatura okoline +20 do +25 °C

+2 do +40 °C

Relativna vlažnost Nadmorska visina

40%, bez kondenzacije
Cca 500 m nadmorske visine

30%, bez kondenzacije (ispod 80 °C)
Do 2000 m nadmorske visine

Skladištenje i transport
-10 do +60 °C
10%, bez kondenzacije (ispod 85 °C)
Do 2000 m nadmorske visine

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Opentrons je potvrdio performanse Opentrons Flexa u uvjetima preporučenim za rad sustava, a rad u tim uvjetima trebao bi dati optimalne rezultate. Flex je siguran za korištenje u uvjetima prihvatljivim za rad sustava, ali rezultati mogu varirati. Nemojte uključivati niti koristiti Flex u uvjetima izvan tih granica. Uvjeti skladištenja i transporta vrijede samo kada je robot potpuno isključen iz struje i druge opreme.
2.2 Raspakiranje
Čestitamo! Vaš Opentrons Flex je stigao i pripremili ste mjesto za njega u svom laboratoriju. Otvorimo taj sanduk čudovišta, uklonimo robota i pripremimo ga za rad. Informacije u ovom odjeljku pružaju popis dijelova i upute koje vas vode kroz korake potrebne da Flex raspakujete, postavite i pripremite za upotrebu. Podijelili smo postupak postavljanja u tri dijela:
Dio 1 pokriva rastavljanje sanduka. Dio 2 pokriva odvajanje Flexa od sanduka i njegovo premještanje na mjesto konačne montaže. Dio 3 pokriva konačno sastavljanje i prvo uključivanje robota.
Potreban trud i vrijeme
Zamolite partnera u laboratoriju da vam pomogne s postupkom raspakiravanja, podizanja, premještanja i sastavljanja. Trebat ćete izdvojiti oko 30 minuta do sat vremena za ovaj napor.
Napomena: Flex zahtijeva dvije osobe da ga ispravno podignu. Također, podizanje i nošenje Flexa za ručke je najbolji način za pomicanje robota.
Sanduk i materijal za pakiranje
Raspakiravanjem Flexa dobivate sjajnog robota, ali također ostajete s nekoliko velikih ploča sanduka zajedno s različitim komponentama za otpremu i podstavom. Iako biste mogli odbaciti ovaj materijal, preporučujemo vam da zadržite ove stavke ako ima prostora za pohranu. Pakiranje se može višekratno koristiti, što pomaže pripremiti vaš Flex za slanje ako ga u budućnosti trebate poslati negdje drugdje (npr. na konferenciju ili u novi objekt).

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Elementi proizvoda
Flex se isporučuje s dolje navedenim komponentama. Pipete, hvataljka i moduli dolaze u zasebnom pakiranju od glavnog Flex sanduka, čak i ako ste ih kupili zajedno kao radnu stanicu.

(1) Opentrons Flex robot

(1) USB kabel

(1) Kabel za napajanje

(1) Ethernet kabel

(5) L-ključevi (12 mm imbus, 1.5 mm imbus, 2.5 mm imbus, 3 mm imbus,
T10 Torx)

(1) Privjesak za zaustavljanje u nuždi

(1) Utor za palubu s kopčama za laboratorijsko posuđe

(4) Rezervne kopče za laboratorijski pribor

(1) Sonda za kalibraciju pipete

(4) Ručke za nošenje i kape

(1) Gornja prozorska ploča

(4) Bočne ploče prozora

(1) šesterokutni odvijač od 2.5 mm

(1) ključ od 19 mm

(16 + rezervni dijelovi) Vijci za prozore (M4x8 mm s ravnom glavom)
26

(10) Rezervni vijci s utorom za palubu (M4x10 mm utičnica)

(12) Rezervni vijci za stezaljke (M3x6 mm utičnica)

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Dio 1: Uklonite sanduk
Opentrons isporučuje vaš Flex u čvrstom sanduku od šperploče. Sanduk za transport koristi kuku i zasun klamps za pričvršćivanje gornje, bočne i donje ploče zajedno. Korištenje zasuna, umjesto čavala ili vijaka, znači da vam neće trebati pajser (ili puno sile) da rastavite sanduk, a kasnije ga možete ponovno sastaviti, ako je potrebno.
Napomena: Rubovi sanduka mogu postati grubi tijekom transporta. Možda ćete htjeti koristiti radne rukavice kako biste zaštitili ruke od iverja drveta.
Za otpuštanje zasuna, okrenite jezičak zasuna prema gore i okrenite ga ulijevo (u smjeru suprotnom od kazaljke na satu). Ova radnja pomiče clamp izvadite ruku iz odgovarajućeg nosača. Zatim možete okrenuti zasun od sanduka.
1 Otključajte osam zasuna koji drže gornji dio sa strane.

2 Uklonite gornju ploču nakon otpuštanja zasuna.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 3 Izrežite plavu vrećicu za slanje, uklonite ove predmete iz podloge i ostavite ih sa strane:
Korisnički komplet Napajanje, Ethernet i USB kabeli Privjesak za zaustavljanje u nuždi
4 Uklonite gornji dio spužvaste podloge kako biste otkrili prozorske ploče. Podstava štiti bočne i gornje stranice.
5 Uklonite prozorske ploče i ostavite ih sa strane. Priložit ćete ih kasnije.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
6 Otključajte preostalih 16 zasuna koji drže bočne stranice jednu za drugu i za bazu sanduka. 7 Uklonite bočne ploče i ostavite ih sa strane.
Dio 2: Otpustite Flex
Nakon dovršetka koraka u 1. dijelu, sada biste trebali vidjeti robota koji je u zaštitnoj vrećici i pričvršćen na narančaste čelične komponente za montažu. Torba obuhvaća robota i štiti ga od vanjskog okruženja. Čelični nosači pričvršćuju robota za dno sanduka. Dva transportna okvira podupiru robota, ravnomjerno raspoređujući njegovu težinu i držeći ga krutim kako se ne bi iskrivio tijekom transporta. Nastavite raspakirati Flex i izvaditi ga s baze sanduka.
8 Pomoću ključa od 19 mm iz korisničkog kompleta odvrnite nosače od dna sanduka. Možete odbaciti zagrade ili ih spremiti za buduću upotrebu.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 9 Povucite ili smotajte transportnu vrećicu do kraja kako biste otkrili cijelog robota.
10 Uz pomoć vašeg partnera u laboratoriju, uhvatite rukohvate u narančastim okvirima za transport s obje strane baze robota, podignite Flex s baze sanduka i stavite ga na pod. Sačuvajte ili odbacite bazu sanduka i okvir za otpremu.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 11 Pomoću šesterokutnog L-ključa od 12 mm iz korisničkog kompleta uklonite četiri vijka koji drže okvire za transport
Flex. Sačuvajte ili odbacite okvire i vijke.
12 Uklonite četiri aluminijske ručke iz korisničkog pribora. Uvrnite ručke na ista mjesta na kojima su držali vijke okvira za transport od 12 mm.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
13 Uz pomoć vašeg partnera u laboratoriju, podignite Flex za ručke za nošenje i premjestite ga na radni stol za konačno sastavljanje.

Dio 3: Završna montaža i uključivanje
Nakon premještanja Flexa u privremeno radno područje ili njegov stalni dom, vrijeme je da doradite svoj novi robot.
14 Ako ste premjestili robota na njegovo konačno, radno mjesto, uklonite ručke za nošenje i zamijenite ih završnim kapama. Poklopci zatvaraju otvore ručke u okviru i daju robotu čist izgled. Vratite ručke u korisnički komplet za pohranu.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
15 Izvadite gornju i bočnu ploču od pjene za pakiranje koju ste ostavili sa strane nakon uklanjanja vrha sanduka.
16 Namjestite prozorske ploče na Flex slijedeći informacije s oznake na prednjoj zaštitnoj foliji. Zatim uklonite zaštitni film.
17 Pomoću skošenih vijaka za prozore i odvijača od 2.5 mm iz korisničkog kompleta pričvrstite prozorske ploče na Flex. Provjerite jesu li zakošene rupe (u obliku slova V) na prozorskim pločama okrenute prema van (prema vama). To omogućuje da vijci prianjaju u ravnini s površinom prozora.

Upozorenje: neispravno usmjerenje ploča može dovesti do oštećenja. Preveliki moment zavrtnja može popucati ploče. Rukom zategnite vijke sve dok prozorske ploče ne budu dovoljno čvrste. Ovo nije ispitivanje snaga.

OPENTRONS FLEX

2. POGLAVLJE: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 18 Pomoću odvijača od 2.5 mm iz korisničkog kompleta uklonite pričvrsne vijke s portala. ove
vijci sprječavaju pomicanje portala tijekom transporta. Vijci za zaključavanje portala nalaze se: Na lijevoj bočnoj tračnici blizu prednjeg dijela robota. Ispod okomite poluge portala. Na desnoj bočnoj tračnici blizu prednjeg dijela robota u narančastoj zagradi. Ovdje su dva vijka.
Portal se lako pomiče rukom nakon uklanjanja svih transportnih vijaka. 19 Izrežite i uklonite dvije gumene trake koje drže kantu za smeće na mjestu tijekom transporta.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
20 Spojite kabel za napajanje na Flex i uključite ga u zidnu utičnicu. Uvjerite se da na palubi nema prepreka. Okrenite prekidač za napajanje na stražnjoj lijevoj strani robota. Nakon uključivanja, portal se pomiče na početnu lokaciju, a zaslon osjetljiv na dodir prikazuje dodatne upute za konfiguraciju.

Sada kada je vaš Flex izvađen iz kutije i spreman za rad, nastavite do odjeljka Prvo pokretanje u nastavku.
2.3 Prva vožnja
Obavite osnovno postavljanje na dodirnom zaslonu prije spajanja bilo kojeg drugog hardvera na vaš Flex. Robot će vas voditi kroz spajanje na vašu laboratorijsku mrežu, ažuriranje na najnoviji softver i personaliziranje Flexa dajući mu naziv.
Uključite napajanje
Kada uključite Flex, logo Opentrons će se pojaviti na ekranu osjetljivom na dodir. Nakon nekoliko trenutaka prikazat će se zaslon "Dobrodošli u svoj Opentrons Flex".
Zaslon dobrodošlice Opentrons Flex. Ovaj biste zaslon trebali vidjeti samo kada prvi put pokrenete svoj Flex.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Spojite se na mrežu ili računalo
Slijedite upute na dodirnom zaslonu da povežete svog robota kako bi mogao provjeriti ima li ažuriranja softvera i primiti protokol files. Postoje tri načina povezivanja: Wi-Fi, Ethernet i USB.

Mogućnosti mrežnog povezivanja. Za postavljanje Flexa morate imati internetsku vezu. Wi-Fi: Koristite zaslon osjetljiv na dodir za povezivanje s Wi-Fi mrežama koje su zaštićene WPA2 osobnom autentifikacijom (većina mreža koje zahtijevaju samo lozinku za pridruživanje spadaju u ovu kategoriju).
Napomena: Flex ne podržava captive portale (mreže koje nemaju lozinku, ali učitavaju a webstranica za provjeru autentičnosti korisnika nakon povezivanja).
Također se možete spojiti na otvorenu Wi-Fi mrežu, ali to se ne preporučuje.
Upozorenje: Spajanje na otvorenu Wi-Fi mrežu omogućit će bilo kome u dometu mrežnog signala da kontrolira vaš Opentrons Flex robot bez autentifikacije.

Ako se trebate spojiti na Wi-Fi mrežu koja koristi autentifikaciju poduzeća (uključujući "eduroam" i slične akademske mreže koje zahtijevaju korisničko ime i lozinku), prvo se povežite s aplikacijom Opentrons putem Etherneta ili USB-a kako biste dovršili početno postavljanje. Zatim se povežite s poslovnom Wi-Fi mrežom u mrežnim postavkama za svoj Flex. Za pristup mrežnim postavkama:

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
1. Pritisnite Uređaji na lijevoj bočnoj traci aplikacije Opentrons. 2. Pritisnite izbornik s tri točke () za vaš Flex i odaberite Postavke robota. 3. Pritisnite karticu Umrežavanje.
Odaberite svoju mrežu s padajućeg izbornika ili odaberite "Pridruži se drugoj mreži..." i unesite njezin SSID. Odaberite metodu provjere autentičnosti poduzeća koju vaša mreža koristi. Podržane metode su:
EAP-TTLS s TLS-om EAP-TTLS s MS-CHAP v2 EAP-TTLS s MD5 EAP-PEAP s MS-CHAP v2 EAP-TLS
Svaka od ovih metoda zahtijeva korisničko ime i lozinku, a ovisno o vašoj točnoj konfiguraciji mreže može zahtijevati certifikat files ili druge opcije. Konzultirajte informatičku dokumentaciju svoje ustanove ili kontaktirajte svog IT upravitelja za pojedinosti o postavljanju vaše mreže.
Ethernet: Spojite svog robota na mrežni prekidač ili čvorište pomoću Ethernet kabela. Također se možete spojiti izravno na Ethernet priključak na vašem računalu, počevši od verzije robotskog sustava 7.1.0.
USB: Spojite priloženi USB A-to-B kabel na USB-B priključak robota i otvoreni priključak na vašem računalu. Koristite USB B-to-C kabel ili USB A-to-C adapter ako vaše računalo nema USB-A priključak.
Da biste nastavili s postavljanjem, povezano računalo mora imati instaliranu i pokrenutu aplikaciju Opentrons. Za pojedinosti o instaliranju aplikacije Opentrons, pogledajte odjeljak Instalacija aplikacije u poglavlju Softver i rad.
Instalirajte ažuriranja softvera
Sada kada ste se povezali s mrežom ili računalom, robot može provjeriti ima li ažuriranja softvera i firmvera te ih preuzeti ako je potrebno. Ako postoji ažuriranje, instalacija može potrajati nekoliko minuta. Nakon završetka ažuriranja, robot će se ponovno pokrenuti.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Pričvrstite privjesak za zaustavljanje u nuždi
Priključite privjesak za hitno zaustavljanje (E-stop) na pomoćni priključak (AUX-1 ili AUX-2) na stražnjoj strani robota.

Prije i nakon spajanja privjeska za zaustavljanje u nuždi.
Priključivanje i omogućavanje E-stopa obavezno je za pričvršćivanje instrumenata i pokretanje protokola na Flexu. Za više informacija o korištenju E-stop tijekom rada robota, pogledajte odjeljak Privjesak za zaustavljanje u nuždi u poglavlju Opis sustava.
Dajte svom robotu ime
Imenovanje vašeg robota omogućuje vam jednostavno prepoznavanje u vašem laboratorijskom okruženju. Ako imate više Opentrons robota na svojoj mreži, svakako im dodijelite jedinstvena imena. Nakon što potvrdite ime svog robota, bit ćete preusmjereni na nadzornu ploču Opentrons Flex. Vjerojatno je sljedeći korak koji ćete htjeti poduzeti pričvršćivanje instrumenata, što je obrađeno u sljedećem odjeljku.
2.4 Instalacija i kalibracija instrumenta
Nakon početnog postavljanja robota, sljedeći korak je priključivanje instrumenata na robota i njihovo kalibriranje.
Da biste instalirali instrument, prvo dodirnite Instrumenti na zaslonu osjetljivom na dodir ili idite na odjeljak Pipete i moduli na zaslonu s detaljima uređaja u aplikaciji Opentrons. Odaberite prazan nosač i odaberite ili Pričvrsti pipetu ili Pričvrsti hvataljku. Ako je držač koji želite koristiti već zauzet, prvo trebate odvojiti pipetu ili hvataljku.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Napomena: cjelokupni postupak instalacije je isti bez obzira na to koristite li zaslon osjetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons. Koji god uređaj na kojem započnete kontrolirat će proces instalacije dok ga ne dovršite ili otkažete.
Ako počnete na dodirnom zaslonu, aplikacija će pokazati da je robot "zauzet". Ako počnete u aplikaciji, zaslon osjetljiv na dodir prikazat će modal koji označava da je instalacija instrumenta u tijeku.
Točan postupak instalacije razlikuje se ovisno o instrumentu koji spajate, kao što je objašnjeno u odjeljcima u nastavku. Svi instrumenti imaju automatiziranu proceduru kalibracije, koju trebate izvršiti odmah nakon instalacije.
Ugradnja pipete
Kada instalirate pipetu, bit ćete vođeni kroz sljedeće korake na zaslonu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons.
1. ODABERITE TIP PIPETE Odaberite između 1- ili 8-kanalne pipete i 96-kanalne pipete. Pričvršćivanje 96-kanalne pipete zahtijeva nekoliko dodatnih koraka jer se pričvršćuje na posebnu montažnu ploču koja obuhvaća oba nosača pipete.
2. PRIPREMA ZA UGRADNJU Uklonite laboratorijsko posuđe s platforme i očistite radni prostor kako biste olakšali pričvršćivanje i kalibraciju. Također prikupite potrebnu opremu, kao što je sonda za kalibraciju, šesterokutni odvijač i montažna ploča (za 96-kanalnu pipetu).
3. POVEŽITE I UČVRSTITE PIPETU Portal će se pomaknuti prema prednjem dijelu robota tako da možete pričvrstiti pipetu.
1- i 8-kanalne pipete spajaju se izravno na nosač pipete. 96-kanalna pipeta zahtijeva montažnu ploču. Kako biste pričvrstili montažnu ploču, prvo morate odvojiti nosač z-osi za desni nosač pipete.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Spojite pipetu na odabrani nosač pipete i pričvrstite njene vijke.
4. POKRENITE AUTOMATIZIRANU KALIBRACIJU Za kalibraciju pipete, pričvrstite sondu za kalibraciju na odgovarajuću mlaznicu pipete. Pipeta će se automatski pomaknuti kako bi dodirnula određene točke na platformi i spremiti te kalibracijske vrijednosti za buduću upotrebu. Nakon što je kalibracija dovršena i kada ste uklonili sondu, pipeta će biti spremna za upotrebu u protokolima.
Ugradnja hvataljki
Kada instalirate hvataljku, bit ćete vođeni kroz sljedeće korake na zaslonu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons.
1. PRIPREMA ZA INSTALIRANJE Uklonite laboratorijski pribor s platforme i očistite radni prostor kako biste olakšali pričvršćivanje i kalibraciju. Također prikupite potrebni šesterokutni odvijač i provjerite je li kalibracijski klin u svom prostoru za pohranu na hvataljci.
2. POVEŽITE I UČVRSTITE HVATALJKU Portal će se pomaknuti prema prednjem dijelu robota tako da možete pričvrstiti hvataljku. Spojite hvataljku na produžni nosač i pričvrstite njegove vijke.
3. POKRENITE AUTOMATIZIRANU KALIBRACIJU Za kalibraciju hvataljke, umetnite kalibracijsku iglu u prednju čeljust. Hvataljka će se automatski pomaknuti kako bi dodirnula određene točke na palubi i spremiti ove kalibracijske vrijednosti za buduću upotrebu. Zatim ponovite isti postupak s kalibracijskom iglom u stražnjoj čeljusti. Nakon što kalibracija završi i vratite iglu na mjesto za pohranu, hvataljka će biti spremna za upotrebu u protokolima.
2.5 Premještanje
Ovaj odjeljak pruža savjete i upute o tome kako premjestiti svoj robot Opentrons Flex na kratke i velike udaljenosti.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Kratki potezi
Kratko premještanje obuhvaća niz udaljenosti od "pomaknimo ga samo malo" do druge strane laboratorija, niz hodnik ili drugi kat u vašoj zgradi. U tim slučajevima svoj Flex možete pomicati rukom. Prijevoz na ručnim kolicima također je dobra opcija.
Upozorenje: Flex je težak 88.5 kg. Zbog toga su potrebne dvije osobe da ga sigurno podignu i pomaknu.
Ponovno pričvrstite ručke za podizanje kako biste premjestili Flex na novo, obližnje mjesto. Podizanje i nošenje Flexa za ručke je pravi način za premještanje robota na kratke udaljenosti. Uklonite ručke i spremite ih u korisnički komplet nakon dovršetka premještanja. Kako biste spriječili oštećenje robota, uvijek koristite ručke za podizanje da ga podignete i pomaknete. Ne hvatajte okvir da podignete ili pomaknete svog robota.
Selidbe na velike udaljenosti
Selidba na velike udaljenosti prenosi vaš Flex izvan terena vašeg sveučilišta, ustanove ili ustanove. Preko grada, u novi grad, državu, pokrajinu ili državu, svi su bivšiamples selidbe na velike udaljenosti. U tom slučaju, morat ćete spakirati Flex kako biste ga zaštitili od vremenskih nepogoda, udaraca i grubih pokreta koji se mogu dogoditi tijekom prijevoza.
Ako ste zadržali transportnu kutiju i unutarnje potpore koje ste dobili s Flexom, možete ga prepakirati u ove materijale za selidbu na velike udaljenosti. Slijedite korake za raspakivanje obrnutim redoslijedom kako biste pripremili svoj Flex za selidbu na velike udaljenosti. U osnovi, trebali biste:
Odspojite strujni i mrežni kabel, ako je priključen. Uklonite sav priključeni hardver i laboratorijsku opremu. Ponovno pričvrstite ploče palube. Zaključajte portal (pogledajte odjeljak Opći savjeti za selidbu u nastavku). Uklonite i spremite prozorske ploče.
Ako ste zadržali originalni sanduk:
Ponovno pričvrstite transportni okvir na Flex i pričvrstite ga na bazu palete pomoću L-nosača. Dodajte podstavu i ponovno sastavite sanduk za transport.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Ako nemate originalni sanduk i pripadajući materijal, kontaktirajte uglednu tvrtku za dostavu. Oni mogu umjesto vas upravljati postupkom pakiranja, prijevoza i isporuke.
Opći savjeti za selidbu
ISKLJUČITE NAPAJNE I MREŽNE KABLOVE Prije premještanja Flexa, nemojte zaboraviti: Isključiti napajanje i odspojiti ga iz napajanja. Odspojite Ethernet ili USB kabel, ako se koristi.
ZAKLJUČAJTE GANTRY Prije pomicanja vašeg Flexa, ponovno umetnite vijke za zaključavanje kako biste držali portal na mjestu. Točke za zaključavanje portala nalaze se: Na lijevoj bočnoj tračnici blizu prednjeg dijela robota. Ispod okomite poluge portala. Na desnoj bočnoj tračnici blizu prednjeg dijela robota. Za zaključavanje ovog dijela portala potrebno je malo
narančasti nosač i dva vijka za zaključavanje.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
POKRETANJE POSTOLJA Možda nećete htjeti zaključati portal ako samo premještate robota na obližnju lokaciju. Ako ga odlučite ne zaključati, barem upotrijebite zaslon osjetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons da pošaljete portal u početni položaj prije nego što ga isključite. Za pokretanje portala putem zaslona osjetljivog na dodir, dodirnite izbornik s tri točke (), a zatim dodirnite Početni portal. Za pokretanje portala putem aplikacije Opentrons: Kliknite Uređaji. Kliknite svoj Flex na popisu uređaja. Pritisnite izbornik s tri točke (), a zatim pritisnite Početni portal.
UKLONITE MODULE Moduli u palubi i drugi dodaci dodaju dodatnu težinu vašem Flexu. Oni također utječu na centar gravitacije robota, zbog čega se može osjećati "pripitom" kada ga podiže. Kako biste olakšali i uravnotežili robota, uklonite sve priključene instrumente i laboratorijsku opremu prije nego što ga podignete.
PONOVNO POSTAVITE UTORE NA PALUBI Preporučujemo ponovno pričvršćivanje utora na palubi za pomicanje na velike udaljenosti. Osiguravanje utora na njihovim izvornim lokacijama pomaže u sprječavanju slučajnog gubitka. Ponovno pričvršćivanje utora za palubu za kratka kretanja po laboratoriju nije obavezno.
PONOVNA KALIBRACIJA NAKON PREMJESTA Trebali biste ponovno kalibrirati sve instrumente i module nakon što ih ponovno instalirate. Za više pojedinosti o kalibraciji modula, pogledajte poglavlje Moduli.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Završne misli o selidbi
Vaš Flex je čvrst i dobro izrađen stroj, ali je također i precizan znanstveni instrument dizajniran za stroge tolerancije. Kao rezultat toga, trebali biste pažljivo postupati s njim kada ga premještate unutar vašeg lokalnog radnog područja ili ga šaljete u drugu državu. To znači slijediti ovdje navedene smjernice i koristiti se vlastitim zdravim razumom o tome kako transportirati skupu laboratorijsku opremu. Zaključak: kada premještate svoj Flex, griješite na strani opreza i dodatne podstave.
Ako imate pitanja ili nedoumica u vezi s premještanjem Flexa, kontaktirajte nas na support@opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3
Opis sustava

Ovo poglavlje opisuje hardverske sustave Opentrons Flexa, koji su u osnovi njegovih osnovnih značajki automatizacije laboratorija. Nosači za palubu, portal i instrumente Opentrons Flexa omogućuju upotrebu preciznih komponenti za rukovanje tekućinama i laboratorijskim priborom. Zaslon osjetljiv na dodir na uređaju omogućuje pokretanje protokola i provjeru statusa robota bez potrebe za donošenjem vašeg računala na laboratorijsku klupu. Žičano i bežično povezivanje omogućuje dodatnu kontrolu iz aplikacije Opentrons (više detalja potražite u poglavlju Softver i rad) i proširenje značajki sustava priključivanjem perifernih uređaja (vidi poglavlje Moduli).

3.1 Fizičke komponente

Fotoaparat

Statusno svjetlo

Zaslon osjetljiv na dodir

Okvir

Portalna paluba
Prednja vrata
Lokacije fizičkih komponenti Opentrons Flexa.

Poklopci ručke bočnih prozora

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Okvir i kućište
Okvir Opentrons Flex robota osigurava krutost i strukturnu potporu za njegovu palubu i portal. Svi mehanički podsustavi smješteni su i montirani na glavni okvir. Okvir je izrađen uglavnom od metalnog lima i aluminijskih ekstruzija.
Metalni okvir ima otvore za bočne prozore i prednja vrata od prozirnog polikarbonata koji vam omogućuju da vidite što se događa unutar Flexa. Šarke prednjih vrata otvaraju se za pristup unutrašnjosti sustava. S otvorenim prednjim vratima možete pričvrstiti instrumente, module i opremu za palubu; pripremiti špil prije protokola; ili manipulirati stanjem špila tijekom protokola.
Bijele LED trake na unutarnjim gornjim rubovima okvira pružaju softverski kontroliranu ambijentalnu rasvjetu. Kamera od 2 megapiksela može fotografirati palubu i radni prostor za snimanje i praćenje izvršenja protokola.

Paluba i radni prostor
Paluba je strojno obrađena aluminijska površina na kojoj se izvršavaju automatizirani znanstveni protokoli. Paluba ima 12 glavnih utora u ANSI/SLAS formatu koji se mogu rekonfigurirati za držanje laboratorijskog softvera, modula i potrošnog materijala. Utori na palubi identificirani su koordinatnim sustavom, s utorom A1 straga lijevo i utorom D3 sprijeda desno.

Utor za proširenje (za termocikler) radno područje

Staging područje

Područja špila unutar Flexa.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
Radni prostor je fizički prostor iznad palube koji je dostupan za pipetiranje. Laboratorijska oprema postavljena u utore od A1 do D3 nalazi se u radnom području.
Opentrons Flex dolazi s uklonjivim utorima za palubu za svih 12 pozicija u radnom području. Svaki utor na platformi ima kutne kopče za laboratorijsko posuđe za sigurno postavljanje laboratorijske opreme na platformu.
Možete rekonfigurirati palubu zamjenom utora drugim elementima za palubu, uključujući pomično smeće, žlijeb za otpad i nosače modula. Utor za proširenje iza A1 koristi se samo za stvaranje dodatnog prostora za modul Thermocycler, koji zauzima utore A1 i B1.
Napomena: Špilovi su zamjenjivi unutar stupca (1, 2 ili 3), ali ne između stupaca; utori stupca 1 i stupca 3 različiti su dijelovi unatoč sličnoj veličini. Možete znati u koji stupac ide utor tako da plavu kopču laboratorijskog pribora orijentirate straga lijevo.
Trebali biste ostaviti utore na palubi instalirane na mjestima gdje želite postaviti samostalni laboratorijski pribor. Ploča i predmeti postavljeni na nju ostaju statični, osim ako se ne pomaknu hvataljkom ili ručnom intervencijom.
Staging područja
Staging area je dodatni prostor duž desne strane palube. Laboratorijski pribor možete pohraniti na ovo mjesto nakon instaliranja staging područja utora. Laboratorijska oprema postavljena u utore od A4 do D4 nalazi se u staging području. Flex pipete ne mogu doseći u staging području, ali hvataljka može pokupiti i premjestiti laboratorijski pribor na i s ovog mjesta. Dodavanje dodatnih utora pomaže da radni prostor bude dostupan za opremu koja se koristi u vašim automatiziranim protokolima.
Stagutori za područje uključeni su u određene konfiguracije radnih stanica, a dostupni su i za kupnju na https://shop.opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Staging područja s instaliranim utorima

Oprema za palubu
Učvršćenja su hardverske stavke koje zamjenjuju standardne utore na špilu. Omogućuju vam da prilagodite izgled palube i dodate funkcionalnost svom Flexu. Trenutačno oprema na palubi uključuje stagutore, unutarnju kantu za smeće i vanjski žlijeb za otpad. Možete instalirati opremu samo u nekoliko određenih utora na palubi. U sljedećoj tablici navedene su lokacije špila za svako učvršćenje.

Učvršćenje Staging area slots Kanta za smeće Žlijeb za otpad Žlijeb za otpad sa stagutor za područje

Utori A3D3 A1D1 i A3-D3 Samo D3 Samo D3

Instalacije su bez struje. Ne sadrže elektroničke ili mehaničke komponente koje robotu prenose svoje trenutno stanje i lokaciju na palubi. To znači da morate koristiti značajku konfiguracije palube kako biste Flexu znali koji su uređaji pričvršćeni na palubu i gdje se nalaze.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Možete pristupiti postavkama konfiguracije palube sa zaslona osjetljivog na dodir putem izbornika s tri točke () i iz aplikacije Opentrons. Pogledajte odjeljak Konfiguracija deka u poglavlju Softver i rad za informacije o tome kako konfigurirati dek sa zaslona osjetljivog na dodir.

Odvod za otpad
Opentrons Flex žlijeb za otpad prenosi tekućine, vrhove, nosače vrhova i ploče s jažicama iz Flex kućišta u posudu za smeće smještenu ispod vanjskog otvora. Žlijeb za otpad se pričvršćuje na adapter za palubnu ploču koji odgovara utoru D3. Također dolazi s posebnom prozorskom polupločom koja dopušta da se padobran pruža izvan prednjeg dijela robota.
Komponente žlijeba za otpad.

Adapter ploče pokrovne palube

Žlijeb za otpad
Adapter za palubnu ploču sa Staging područje

Staging područja utora
Stagutori za područje ing su ANSI/SLAS kompatibilni dijelovi palube koji zamjenjuju standardne utore u stupcu 3 i dodaju nove utore utaging area — sve to bez gubitka prostora u radnom području. Možete instalirati jedan utor ili najviše četiri utora za stvaranje novog stupca (A4 do D4) duž desne strane špila. Međutim, imajte na umu da zamjena utora A3 zahtijeva pomicanje kante za smeće. Dodavanjem stagPostavljanjem prostornih utora na palubu, vaš robot Flex može pohraniti više laboratorijskog pribora i raditi učinkovitije.

OPENTRONS FLEX

Flex stagutor za područje.
49

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
UGRADNJA UTORA
Za instalaciju, uklonite vijke koji pričvršćuju standardni utor na platformu i zamijenite ga stagutor za područje. Nakon instalacije, upotrijebite zaslon osjetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons da kažete robotu kojeg ste dodalitaging area slot na palubu.
Instaliranje kaotagutor za područje.

KOMPATIBILNOST SLOTA Stagutori za područje su kompatibilni s Flex instrumentima, modulima i laboratorijskom opremom navedenim u nastavku.

Moduli pipeta s hvataljkama Flex komponente
Laboratorijska oprema

Stagkompatibilnost područja
Flex Gripper može pomicati laboratorijsko posuđe do ili od staging područja utora.
Flex pipete ne mogu doseći staging području. Upotrijebite hvataljku za pomicanje nosača vrhova i laboratorijskog pribora iz stagprije pipetiranja na radno područje.
Magnetski blok GEN1 može se postaviti u stupac 3 na vrhu astagutor za područje. Moduli nisu podržani u stupcu 4.
Moduli s pogonom kao što su Heater-Shaker i Temperature Module stanu u nosače koji se mogu staviti u stupac 3. Ne možete dodati kaotagpremještanje utora za područje na mjesto koje zauzima nosač modula.
Stagutori za područje imaju iste ANSI/SLAS dimenzije kao i standardni utori na palubi. Koristite laboratorijsku opremu kompatibilnu s hvataljkama u stagili ručno dodajte i uklonite laboratorijski pribor s ove lokacije.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
Sustav kretanja
Na okvir je pričvršćen portal, koji je robotov sustav za kretanje i pozicioniranje. Portal se pomiče odvojeno duž x- i y-osi kako bi se pipete i hvataljka postavili na precizne lokacije za izvođenje protokola. Kretanje duž ovih osi je precizno do najbližih 0.1 mm. Portalom upravljaju 36 VDC hibridni bipolarni koračni motori. S druge strane, na portalu su pričvršćeni nosači za pipete i nastavak za nosače. Oni se pomiču duž z-osi kako bi postavili pipete i hvataljku na točna mjesta za izvođenje protokola. Kretanje po ovoj osi kontroliraju 36 VDC hibridni bipolarni koračni motori. Elektronika sadržana u portalu daje 36 VDC napajanje i komunikaciju s pipetama i hvataljkom, kada su pričvršćeni.
Gantry

Nosači za pipete

Produžni nosač

Položaj nosača instrumenata na Flexu.

Touchscreen i LED zasloni
Primarno korisničko sučelje je 7-inčni LCD zaslon osjetljiv na dodir, koji se nalazi na prednjoj desnoj strani robota. Zaslon osjetljiv na dodir prekriven je Gorilla Glass 3 za otpornost na ogrebotine i oštećenja. Pristupite mnogim značajkama Flexa izravno na dodirnom zaslonu, uključujući:

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Upravljanje protokolom Postavljanje, izvođenje i praćenje protokola Upravljanje laboratorijskim softverom Postavke robota Ažuriranja sistemskog softvera i firmvera Dnevnici rada i obavijesti o pogreškama
Za više informacija o korištenju Flexa putem zaslona osjetljivog na dodir, pogledajte odjeljak Rad zaslona osjetljivog na dodir u poglavlju Softver i rad.
Svjetlo statusa je traka LED dioda duž gornje prednje strane robota koja pruža brze informacije o robotu. Različite boje i obrasci osvjetljenja mogu komunicirati različita stanja uspjeha, neuspjeha ili mirovanja:

LED boja Bijela Neutralna stanja
Zelena Normalna stanja
Plava Obavezna stanja Žuta Nenormalna stanja Crvena Hitna stanja

LED uzorak Stalno pulsira
Trepće dvaput
Pulsirajuće Pulsiranje

Status robota
Uključen i ne izvodi protokol Robot je zauzet (npr. ažuriranje softvera ili firmvera, postavljanje izvođenja protokola, otkazivanje izvođenja protokola) Radnja je dovršena (npr. protokol pohranjen, softver ažuriran, instrument priključen ili odvojen) Protokol radi Protokol je dovršen Protokol je pauziran

Čvrsto

Softverska pogreška

Trepće tri puta, više puta

Fizička pogreška (npr. pad instrumenta)

Svjetlo statusa također se može onemogućiti u postavkama robota.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
3.2 Pipete
Opentrons pipete su konfigurabilni uređaji koji se koriste za pomicanje tekućina po radnom području tijekom izvođenja protokola. Postoji nekoliko Opentrons Flex pipeta koje mogu podnijeti volumene od 1 µL do 1000 µL u 1, 8 ili 96 kanala:
Opentrons Flex 1-kanalna pipeta (1 µL) Opentrons Flex 50-kanalna pipeta (1 µL) Opentrons Flex 5-kanalna pipeta (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanalna pipeta (1 µL) Opentrons Flex 50-kanalna pipeta (8 µL)
Pipete se pričvršćuju na portal pomoću pričvrsnih vijaka na prednjoj strani pipete. 1-kanalne i 8-kanalne pipete zauzimaju po jedan nosač pipete (lijevo ili desno); 96-kanalna pipeta zauzima oba nosača. Za pojedinosti o instaliranju pipeta pogledajte Instalacija i kalibracija instrumenta.

Zarobljeni prilog
Vijci

Vijci za pričvršćenje

izbacivač

Mlaznice (zamjenjivi O-prstenovi)

Mlaznice (fiksni O-prstenovi)

Položaj komponenti pipeta s 1, 8 i 96 kanala.

izbacivač

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Pipete podižu jednokratne plastične vrhove pritiskom na mlaznice pipeta, a zatim koriste vrhove za aspiraciju i doziranje tekućina. Količina ukupne sile koja je potrebna za podizanje se povećava kako se više vrhova skuplja istovremeno. Za manji broj vrhova, pipeta pričvršćuje vrhove guranjem svake mlaznice pipete prema dolje u vrh. Kako bi se postigla potrebna sila da se pokupi cijeli stalak vrhova, 96-kanalna pipeta također povlači vrhove prema gore na mlaznice. Ova akcija povlačenja zahtijeva postavljanje nosača vrhova u adapter nosača vrhova, a ne izravno u utor na palubi. Da biste odbacili vrhove (ili ih vratili u stalak), mehanizam za izbacivanje pipete gura vrhove s mlaznica.

Specifikacije pipete
Opentrons Flex pipete dizajnirane su za rukovanje širokim rasponom volumena. Zbog svog širokog ukupnog raspona, mogu koristiti više veličina vrhova, što utječe na njihove karakteristike rukovanja tekućinom. Opentrons je testirao Flex pipete na točnost i preciznost u brojnim kombinacijama vrha i volumena tekućine:

Pipeta
Flex 1-kanalni
50 µL
Flex 1-kanalni
1000 µL
Flex 8-kanalni
50 µL
Flex 8-kanalni
1000 µL

Kapacitet nastavka 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Ispitani volumen 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Točnost %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%

Preciznost %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Flex 96-kanalni
1000 µL

50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Imajte na umu ove informacije o točnosti kada birate vrhove za svoju pipetu. Općenito, za najbolje rezultate trebali biste koristiti najmanje vrhove koji zadovoljavaju potrebe vašeg protokola.

Napomena: Opentrons provodi volumetrijsko testiranje Flex pipeta kako bi osigurao da ispunjavaju gore navedene specifikacije točnosti i preciznosti. Ne morate kalibrirati volumen koji vaše pipete ispuštaju prije upotrebe. Morate izvršiti samo kalibraciju položaja. Za detalje pogledajte sljedeći odjeljak, kao i odjeljak Instalacija pipete u poglavlju Instalacija i premještanje.
Usluge Opentrons Care i Opentrons Care Plus uključuju godišnju zamjenu pipete i potvrde o kalibraciji. Za detalje pogledajte odjeljak Servisiranje Flexa u poglavlju Održavanje i servis.

Kalibracija pipete
Korisnički komplet uključuje metalnu kalibracijsku sondu pipete koju koristite tijekom kalibracije položaja. Tijekom izvođenja protokola, sigurno pohranite sondu na magnetski držač na prednjem stupu robota. Tijekom procesa kalibracije, pričvrstite sondu na odgovarajuću mlaznicu i zaključajte je na mjestu. Robot pomiče sondu do kalibracijskih točaka na platformi kako bi izmjerio točan položaj pipete.
Adapter za stalak vrha pipete
96-kanalna pipeta Opentrons Flex isporučuje se s četiri adaptera za stalak za vrhove. Ovo su precizno oblikovani aluminijski nosači koje postavljate na palubu. Adapteri drže nosače Flex 50 L, 200 L i 1000 µL vrhova.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
Zbog uključene sile, 96-kanalna pipeta zahtijeva adapter za pravilno pričvršćivanje punog nosača vrha. Tijekom postupka pričvršćivanja, pipeta se pomiče preko adaptera, spušta se na pričvrsne igle i povlači vrhove na pipete podizanjem adaptera i nosača vrhova. Povlačenje vrhova, umjesto guranja, pruža polugu potrebnu za pričvršćivanje vrhova na pipete i sprječava savijanje površine palube. Kada završi, 96-kanalna pipeta spušta adapter i prazan stalak za vrhove na platformu. Za više informacija pogledajte odjeljak Savjeti i stalci za savjete u poglavlju Labware.
Djelomično podizanje vrha
96-kanalna pipeta može pokupiti cijeli stalak vrhova ili manji broj vrhova. Ovo povećava broj primjena koje možete izvesti s 96-kanalnom pipetom, budući da zauzima oba nosača za pipete.
Trenutačno 96-kanalna pipeta podržava djelomično podizanje vrha za 8 vrhova u rasporedu stupca. U ovoj konfiguraciji, pipeta ili koristi svoje krajnje lijeve mlaznice za podizanje vrhova s desna nalijevo s držača vrhova ili svoje krajnje desne mlaznice za skupljanje vrhova slijeva nadesno s nosača vrhova.
Kada uzmete manje od 96 napojnica sa stalka za napojnice, stalak se mora postaviti izravno na špil, a ne u adapter za stalak za napojnice.
Senzori za pipete
Opentrons Flex pipete imaju brojne senzore koji otkrivaju i bilježe podatke o statusu pipete i svim vrhovima koje je pokupila.
SENZORI KAPACITETA
U kombinaciji s metalnom sondom ili vodljivim vrhom, senzori kapacitivnosti detektiraju kada pipeta dođe u kontakt s nečim. Detekcija kontakta između metalne sonde i platforme koristi se u postupcima automatizirane kalibracije pipete i kalibracije modula.
1-kanalne pipete imaju jedan senzor kapacitivnosti, dok višekanalne pipete imaju dva: na kanalima 1 i 8 kod 8-kanalnih pipeta, te na kanalima 1 i 96 (pozicije A1 i H12) kod 96-kanalnih pipeta.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

OPTIČKI SENZORI PRISUTNOSTI NA VRHU
Prekidač fotoprekidača otkriva položaj mehanizma za izbacivanje vrha pipete, potvrđujući jesu li vrhovi uspješno podignuti ili ispušteni. 1-kanalne, 8-kanalne i 96-kanalne pipete imaju jedan optički senzor koji prati pričvršćivanje vrha na svim kanalima.
Ažuriranja firmvera pipete
Opentrons Flex automatski ažurira firmver pipete kako bi bio sinkroniziran s verzijom softvera robota. Ažuriranja firmvera pipete obično su brza i događaju se kad god:
Pričvrstite pipetu. Robot se ponovno pokreće.
Ako, iz bilo kojeg razloga, vaše verzije firmvera pipete i softvera robota ne budu sinkronizirane, možete ručno ažurirati firmver u aplikaciji Opentrons.
1. Pritisnite Uređaji. 2. Kliknite svoj Flex na popisu uređaja. 3. U odjeljku Instrumenti i moduli, pipeta koja nije sinkronizirana prikazat će natpis upozorenja
"Dostupno ažuriranje firmvera." Pritisnite Ažuriraj sada za početak ažuriranja.
možete view trenutno instaliranu verziju firmvera bilo koje priključene pipete. Na dodirnom zaslonu idite na Instrumenti i dodirnite naziv pipete. U aplikaciji Opentrons pronađite karticu pipete pod Instrumenti i moduli, kliknite izbornik s tri točke (), a zatim kliknite O pipeti.

3.3 Hvataljka
Hvataljka pomiče laboratorijsko posuđe po radnom području i staging područja tijekom izvođenja protokola. Hvataljka se pričvršćuje na produžni nosač, koji je odvojen od nosača pipete; hvataljka se može koristiti s bilo kojom konfiguracijom pipete. Za pojedinosti o postavljanju hvataljke pogledajte Instalacija i kalibracija instrumenta.
Hvataljka može pomicati laboratorijski pribor preko palube i na module ili s njih. Hvataljka može manipulirati određenim potpuno obrubljenim pločama s jažicama, pločama s dubokim jažicama i držačima vrhova. Za više pojedinosti o tome koju laboratorijsku opremu hvataljka može pomicati, pogledajte odjeljak Labware i Opentrons Flex Gripper u poglavlju Labware ili konzultirajte Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Specifikacije hvataljke
Čeljusti izvode primarni pokret hvataljke, a to je otvaranje ili zatvaranje dviju paralelnih lopatica za primjenu ili otpuštanje sile na strane laboratorijskog posuđa. Pomicanjem čeljusti upravlja brušeni motor od 36 VDC spojen na sustav zupčanika sa zupčastom letvom i zupčanikom.
Za pomicanje dijela laboratorijskog posuđa koji je zahvaćen čeljustima, portal podiže hvataljku duž z-osi, pomiče ga bočno, a zatim ga spušta u novi položaj laboratorijskog posuđa.
Položaji komponenti hvataljke.

Vijci za pričvršćivanje
Kalibracijski klin Jaws Paddles

Kalibracija hvataljke
Hvataljka uključuje metalnu kalibracijsku iglu. Kalibracijski klin nalazi se u udubljenom prostoru za pohranu na donjem dijelu hvataljke. Magnet drži iglu na mjestu. Za uklanjanje kalibracijske igle, uhvatite je prstima i nježno povucite. Da biste zamijenili iglu, vratite je u utor za pohranu. Znat ćete da je siguran kada sjedne na mjesto.
Prilikom kalibracije hvataljke, pričvrstite iglu na svaku čeljust redom. Robot pomiče iglu do kalibracijskih točaka na platformi kako bi izmjerio točan položaj hvataljke.
Tijekom izvođenja protokola, stavite iglu u prostor za pohranu radi sigurnog čuvanja. Kontaktirajte nas na support@opentrons.com ako izgubite kalibracijsku iglu.

Ažuriranja firmvera hvataljke
Opentrons Flex automatski ažurira firmware hvataljke kako bi bio sinkroniziran s verzijom softvera robota. Ažuriranja firmvera grippera obično su brza i događaju se kad god:

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
Pričvrstite hvataljku. Robot se ponovno pokreće.
Ako, iz bilo kojeg razloga, vaša verzija firmvera hvataljke i softvera robota ne budu sinkronizirani, možete ručno ažurirati firmver u aplikaciji Opentrons.
1. Pritisnite Uređaji. 2. Kliknite svoj Flex na popisu uređaja. 3. U odjeljku Instrumenti i moduli, hvataljka izvan sinkronizacije prikazat će natpis s upozorenjem
"Dostupno ažuriranje firmvera." Pritisnite Ažuriraj sada za početak ažuriranja.
možete view trenutno instaliranu verziju firmvera hvataljke. Na dodirnom zaslonu idite na Instrumenti i dodirnite hvataljku. U aplikaciji Opentrons pronađite karticu hvataljke pod Instrumenti i moduli, kliknite izbornik s tri točke (), a zatim kliknite O hvataljki.
3.4 Privjesak za zaustavljanje u nuždi
Privjesak za hitno zaustavljanje (E-stop) namjenski je hardverski gumb za brzo zaustavljanje kretanja robota. Opentrons Flex zahtijeva funkcionalan, isključen E-stop koji mora biti pričvršćen u svakom trenutku. Kada pritisnete gumb za zaustavljanje, Flex poništava svaki pokrenuti protokol ili radni tijek postavljanja što je brže moguće i sprječava većinu kretanja robota.
Kada koristiti E-stop
Možda ćete morati pritisnuti E-stop:
Kada postoji neposredna opasnost od ozljede ili štete korisniku. Kada postoji neposredna opasnost od oštećenja robota ili drugog hardvera. Kada je sampdatoteke ili reagensi su u neposrednoj opasnosti od kontaminacije. Nakon hardverske kolizije.
U idealnom slučaju nikada ne biste trebali pritisnuti E-stop (osim tijekom rijetkih testiranja kvalitete hardvera).
Nemojte koristiti E-stop za otkazivanje normalnih, očekivanih operacija. Umjesto toga, koristite softversku tipku na dodirnom zaslonu ili u Opentrons aplikaciji. Pauziranje putem softvera omogućit će vam nastavak ili otkazivanje protokola, dok pritiskom na E-stop uvijek odmah otkazujete protokol.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Uključivanje i otpuštanje E-stopa
E-stop ima mehanizam za uključivanje pritiskom, zakretanje za otpuštanje.
Uključivanje: Čvrsto pritisnite crveni gumb. Flex će ući u zaustavljeno stanje. Rješavanje: Nakon zaustavljanja, sigurno riješite sve probleme u radnom području, kao što je čišćenje prolijevanja,
uklanjanje laboratorijskog pribora ili pomicanje portala (trebao bi se pomicati slobodno i lako rukom). Otpuštanje: Okrenite gumb u smjeru kazaljke na satu. Iskočit će u svoj isključeni položaj. Ponovno postavljanje: Na dodirnom zaslonu ili u aplikaciji Opentrons potvrdite da ste spremni za nastavak Flexa
pokret. Portal će se vratiti u svoj početni položaj i aktivnost modula će se nastaviti.
U zaustavljenom stanju Flex i povezani hardver ponašat će se na sljedeći način:

Hardverske portalne pipete
Hvataljka
Modul grijača-tresača
Modul temperature Modul termociklera Svjetlo statusa Zaslon osjetljiv na dodir

Ponašanje
Automatizirano horizontalno kretanje je zaustavljeno. Dopušteno je ručno horizontalno kretanje.
Okomito kretanje pipeta je zaustavljeno. Kočnice motora na okomitim osima su uključene kako bi se spriječilo
pipete od pada. Kretanje klipa i podizanje vrha su zaustavljeni.
Okomito kretanje hvataljke je zaustavljeno. Aktivirana je kočnica motora na okomitoj osi kako bi se spriječilo
hvataljka od pada. Čeljusni motori koji vrše silu stiskanja ostaju uključeni, dakle
hvataljka neće ispustiti laboratorijski pribor koji možda nosi.
Shaker se zaustavlja i vraća se kući. Otvara se zasun laboratorijskog pribora. Grijanje je onemogućeno.
Grijanje ili hlađenje je onemogućeno.
Grijanje ili hlađenje je onemogućeno.
Svjetlo postaje crveno.
Poruka o otkazivanju preuzima zaslon. Indikator na zaslonu pokazuje kada ste uspjeli
isključio gumb za zaustavljanje.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
3.5 Veze

Prekidač za uključivanje/isključivanje

Bočne navlake

USB-A priključci

IEC ulaz za napajanje

Priključci AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Priključak za struju
Opentrons Flex spaja se na izvor napajanja preko standardnog IEC-C14 ulaza. Robot sadrži unutarnje AC/DC napajanje punog raspona, koje prihvaća 100 VAC, 240/50 Hz ulaz i pretvara ga u 60 VDC. Sva ostala unutarnja elektronika napaja se iz 36 VDC napajanja.

Upozorenje: Koristite samo kabel za napajanje koji je isporučen s robotom. Nemojte koristiti kabel za napajanje s neodgovarajućom strujom ili voltage ocjene.
Držite kabel za napajanje bez prepreka kako biste ga mogli ukloniti ako je potrebno.

Tu je i CR1220 dugmasta baterija za napajanje robotovog sata u stvarnom vremenu kada nije spojen na mrežno napajanje. Baterija se nalazi unutar kućišta zaslona osjetljivog na dodir. Kontaktirajte Opentrons podršku za više informacija ako mislite da trebate zamijeniti bateriju.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA
USB i pomoćni priključci
Opentrons Flex ima ukupno 10 USB priključaka smještenih u različitim dijelovima robota, koji služe različitim namjenama.
8 stražnjih USB-A priključaka (označenih brojevima USB-1 do USB-8) i 2 pomoćna priključka (konektori M12 označeni brojevima AUX-1 i AUX-2) služe za povezivanje Opentrons modula i dodatne opreme. Pogledajte poglavlje Moduli za više informacija o povezivanju ovih uređaja i njihovoj upotrebi u vašim protokolima. Stražnji USB-B priključak služi za povezivanje robota s prijenosnim ili stolnim računalom, kako bi se uspostavila komunikacija s aplikacijom Opentrons koja radi na povezanom računalu. Prednji USB-A priključak (USB-9), smješten ispod zaslona osjetljivog na dodir, ima istu funkcionalnost kao i stražnji USB-A priključci.
Napomena: USB priključci imaju ograničenu snagu radi zaštite robota i povezanih uređaja. Isporuka napajanja interno je podijeljena u tri grupe priključaka: lijevi stražnji USB-A priključci (USB-1 do USB-4), desni stražnji USB-A priključci (USB-5 do USB-8) i prednji USB-A luka. Svaka od ovih grupa će isporučiti najviše 500 mA povezanim USB 2.0 kompatibilnim uređajima.
Mrežne veze
Opentrons Flex se može spojiti na lokalnu mrežu putem žične (Ethernet) ili bežične (Wi-Fi) veze.
Ethernet priključak nalazi se na stražnjoj strani robota. Spojite ga na Ethernet čvorište ili uključite svoju mrežu. Ili, počevši od verzije robotskog sustava 7.1.0, spojite ga izravno na Ethernet priključak na vašem računalu. Unutarnji Wi-Fi modul podržava 802.11 ac/a/b/g/n mreže s dvopojasnom 2.4/5 GHz antenom.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

3.6 Specifikacije sustava

Opće specifikacije

Dimenzije Težina Deck utori
Zaslon osjetljiv na dodir
Wi-Fi Ethernet USB
Ulazna snaga Camera Robot
Mrežno napajanje voltage fluktuacija Fluktuacija mrežne frekvencije Distribucijski sustav Opskrbna struja kratkog spoja Sastav okvira Sastav prozora Zahtjevi za ventilaciju

87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 in (Š, D, V)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-kompatibilnih utora u radnom području
(dostupno pipetama) 4 dodatna utora za stagsavjete i laboratorijsku opremu
(dostupan samo hvataljki) 7-inčni LCD zaslon osjetljiv na dodir s Gorilla Glass 3 otpornim na ogrebotine i oštećenja
802.11 ac/a/b/g/n dvopojasni (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A priključaka 1 USB-B priključak Brzina USB 2.0
2MP, foto i video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Čvrsti dizajn od čelika i CNC aluminija
Uklonjivi polikarbonatni bočni prozori i prednja vrata Najmanje 20 cm / 8 između jedinice i zida

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Zahtjevi za povezano računalo

Aplikacija Opentrons radi na: Windows 10 ili novijem macOS 10.10 ili novijem Ubuntu 12.04 ili novijem

Specifikacije zaštite okoliša

Uvjeti okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Stupanj onečišćenja

Samo za unutarnju uporabu +20 do +25 °C (preporučeno) 40%, bez kondenzacije (preporučeno) 60 (samo neprovodljivo zagađenje)

Za dodatne informacije o prihvatljivim uvjetima okoline za korištenje i transport, pogledajte odjeljak Uvjeti okoline u poglavlju Instalacija i premještanje.

Certifikati

Certifikati dovršeni Nije certificirano/potvrđeno

CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP

Sažetak informacija o certifikatu ispisan je na naljepnici na poleđini Flexa, blizu prekidača za uključivanje/isključivanje. Za detaljne informacije o certifikaciji i sukladnosti pogledajte odjeljak Usklađenost s propisima u Uvodu.

Serijski broj
Svaki Flex ima jedinstveni serijski broj. Format serijskog broja pruža dodatne informacije, uključujući datum proizvodnje robota. Na primjerample, serijski broj FLXA1020231007001 značio bi:

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SUSTAVA

Znakovi FLX A10 2023 10 07 001

Kategorija Model Verzija Godina Mjesec Dan Jedinica

Što znači da je robot Opentrons Flex. Kôd za proizvodnu verziju robota. Robot je napravljen 2023. Robot je napravljen u listopadu. Robot je napravljen 7. dana u mjesecu. Jedinstveni broj za robote napravljene na određeni dan.

Možete pronaći serijski broj za svoj Flex:
Na naljepnici certifikata na poleđini Flexa, u blizini prekidača za uključivanje/isključivanje. Na stražnjoj strani zaslona osjetljivog na dodir (prema radnom području). U aplikaciji Opentrons pod Devices > your Flex > Robot settings > Advanced.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4
Moduli
Opentrons Flex integrira se s nizom Opentrons hardverskih modula. Svi moduli su periferne jedinice koje zauzimaju utore na palubi, a većinom ih upravlja robot putem USB veze.
Ovo poglavlje opisuje funkcije i fizičke specifikacije modula koji su kompatibilni sa sustavom Opentrons Flex, kao i kako ih pričvrstiti i kalibrirati. Dodatne pojedinosti o postavljanju i korištenju modula potražite u priručnicima za pojedinačne module. Za pojedinosti o integraciji modula u vaše protokole pogledajte odjeljak Dizajner protokola u poglavlju Razvoj protokola ili online dokumentaciju Python Protocol API.
4.1 Podržani moduli
Opentrons Flex je kompatibilan s četiri vrste Opentrons modula na palubi:
Modul Heater-Shaker omogućuje grijanje na palubi i orbitalno mućkanje. Modul se može zagrijati na 95 °C i može se trestiampod 200 do 3000 okretaja u minuti.
Magnetski blok je pasivni uređaj koji drži laboratorijsko posuđe blizu svojih neodimskih magneta visoke čvrstoće. OT-2 magnetski modul GEN1 i GEN2, koji aktivno pomiču svoje magnete gore-dolje u odnosu na laboratorijski pribor, nisu podržani na Opentrons Flexu.
Temperaturni modul je modul vruće i hladne ploče koji može održavati stalne temperature između 4 i 95 °C.
Modul Thermocycler pruža potpuno automatizirano termocikliranje na palubi, omogućujući automatizaciju koraka tijeka rada uzvodno i nizvodno. Thermocycler GEN2 potpuno je kompatibilan s hvataljkom. Thermocycler GEN1 ne može se koristiti s hvataljkom i stoga nije podržan na Opentrons Flexu.
Neki moduli izvorno dizajnirani za OT-2 kompatibilni su s Flexom, kao što je sažeto u tablici u nastavku. Kvačica označava kompatibilnost, a X nekompatibilnost.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Vrsta uređaja i generacija Modul grijača-tresača GEN1 Magnetski modul GEN1 Magnetski modul GEN2 Magnetski blok GEN1 Temperaturni modul GEN1 Temperaturni modul GEN2 Modul termociklera GEN1 Modul termociklera GEN2 HEPA modul

OT-2

Savijati

4.2 Modul caddy sustav
Kompatibilni moduli dizajnirani su da stanu u nosače koji zauzimaju prostor ispod palube. Ovaj sustav omogućuje da laboratorijska oprema na vrhu modula ostane bliže površini palube, a također omogućuje usmjeravanje kabela ispod palube tako da paluba ostaje uredna tijekom izvođenja protokola.

Spremnici za module grijača-tresača, temperature i termociklera.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
Da biste modul postavili na površinu palube, prvo ga morate postaviti u odgovarajući nosač modula. Svaka vrsta kompatibilnog modula ima vlastiti dizajn nosača koji precizno usklađuje modul i laboratorijsku opremu s okolnom palubom. (Iznimka je magnetski blok, koji ne zahtijeva usmjeravanje strujnog ili USB kabela i stoga se nalazi izravno na površini palube.) Nosići za module koji zauzimaju jedan utor mogu se postaviti bilo gdje u stupcu 1 ili 3; Thermocycler se može postaviti samo u utore A1 i B1 istovremeno.
Općenito, za instaliranje nosača modula:
1. Uklonite sve utore na palubi s mjesta na koje će ići modul. 2. Smjestite modul u njegov nosač i zategnite njegova sidra. 3. Provucite kabl za napajanje modula i USB kroz bočne poklopce, gore kroz prazan utor na palubi i
pričvrstite ih na modul. 4. Postavite nosač modula u utor i pričvrstite ga vijcima na mjesto.
Za točne upute za instalaciju pogledajte Vodič za brzi početak ili Priručnik s uputama za određeni modul. Kabelske veze i način pričvršćivanja na nosač razlikuju se ovisno o modulu.
4.3 Kalibracija modula
Kada prvi put instalirate modul na Flexu, trebate pokrenuti automatsku kalibraciju položaja. Ovaj proces sličan je položajnoj kalibraciji za instrumente i osigurava da se Flex pomiče na točne točne lokacije za optimalnu izvedbu protokola. Tijekom kalibracije, Flex će se pomaknuti na lokacije na adapteru za kalibraciju modula, koji izgleda slično kalibracijskim kvadratima koji su dio utora za deck.

Adapteri za kalibraciju za modul grijača-tresača, temperaturu i termocikler.
Kalibracija modula je potrebna za sve module koji se instaliraju putem nosača: modul grijača-tresača, temperature i termociklera. Magnetski blok ne zahtijeva kalibraciju i spreman je za upotrebu čim ga postavite na palubu.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
Kada kalibrirati module
Flex automatski traži da izvršite kalibraciju kada spojite i uključite modul koji nema pohranjene podatke o kalibraciji. (Možete odbaciti ovaj upit, ali nećete moći pokretati protokole s modulom dok ga ne kalibrirate.)
Nakon što ste dovršili kalibraciju, Flex pohranjuje podatke o kalibraciji i serijski broj modula za buduću upotrebu. Flex vas neće tražiti da ponovno kalibrirate osim ako ne izbrišete podatke o kalibraciji za taj modul u postavkama robota. Možete slobodno uključiti i isključiti svoj modul ili ga čak premjestiti u drugi utor na palubi, bez potrebe za ponovnom kalibracijom. Ako želite ponovno kalibrirati, možete započeti proces u bilo kojem trenutku s kartice modula u aplikaciji Opentrons. (Ponovna kalibracija nije dostupna sa zaslona osjetljivog na dodir.)
Kako kalibrirati module
Upute na zaslonu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons će vas voditi kroz postupak kalibracije. Općenito, koraci su sljedeći:
1. Prikupite potrebnu opremu, uključujući adapter za kalibraciju modula i sondu za kalibraciju pipete. 2. Postavite adapter za kalibraciju na površinu modula i provjerite je li potpuno ravan.
Neki moduli mogu zahtijevati pričvršćivanje adaptera na modul. 3. Spojite kalibracijsku sondu na pipetu. 4. Flex će se automatski pomaknuti kako bi dodirnuo određene točke na adapteru za kalibraciju i spremiti ih
kalibracijske vrijednosti za buduću upotrebu.
Nakon što je kalibracija dovršena i kada ste uklonili adapter i sondu, modul će biti spreman za upotrebu u protokolima.
U svakom trenutku možete view i upravljajte svojim podacima o kalibraciji modula u aplikaciji Opentrons. Idite na Postavke robota za svoj Flex i kliknite na karticu Kalibracija.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
4.4 Modul grijač-tresilica GEN1

Značajke grijača-tresača
GRIJANJE I TRESANJE
Heater-Shaker omogućuje grijanje na palubi i orbitalno mućkanje. Modul se može zagrijati na 95 °C, uz sljedeću temperaturu profile:
Raspon temperature: 37 °C Točnost temperature: ±95 °C na 0.5 °C Ujednačenost temperature: ±55 °C na 0.5 °CRamp brzina: 10 °C/min
Modul može tresti samples od 200 do 3000 o/min, sa sljedećim protresanjemfile:
Promjer orbite: 2.0 mm Smjer orbite: u smjeru kazaljke na satu Raspon brzine: 200 rpm Preciznost brzine: ±3000 rpm
Modul ima zasun s električnim pogonom za pričvršćivanje ploča na modul prije mućkanja.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
TERMALNI ADAPTERI Za dodavanje laboratorijskog pribora u Heater-Shaker potreban je kompatibilni termalni adapter. Adapteri se mogu kupiti izravno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com. Trenutno dostupni termalni adapteri uključuju:

Univerzalni plosnati adapter

PCR adapter

Adapter za duboki bunar

96 Adapter s ravnim dnom

KONTROLA SOFTVERA
Heater-Shaker je potpuno programabilan u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju. Python API dodatno omogućuje paralelno izvođenje drugih koraka protokola dok je Heater-Shaker aktivan. Pogledajte Neblokirajuće naredbe u API dokumentaciji za detalje o dodavanju paralelnih koraka vašim protokolima.
Izvan protokola, Opentrons App može prikazati trenutni status Heater-Shaker-a i može izravno kontrolirati grijač, shaker i zasun laboratorijske opreme.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije grijača-tresilice

Dimenzije Težina Ulaz napajanja modula Ulaz adaptera napajanja Mrežno napajanje voltage fluktuacija Overvoltage Potrošnja energije

152 × 90 × 82 mm (D/Š/V) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategorija II mirovanja: 10 W

Tipično: mućkanje: 4 W grijanje: 11 W grijanje i mućkanje: 10 W

Uvjeti okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Nadmorska visina Stupanj onečišćenja

Maksimalno: 125 W Samo za unutarnju upotrebu 130 °C Do 20%, bez kondenzacije Do 25 m nadmorske visine 80

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
4.5 Magnetski blok GEN1

Značajke magnetskog bloka
Opentrons Magnetic Block GEN1 magnetski je držač ploča s 96 jažica. Magnetski blokovi koriste se u protokolima koji se oslanjaju na magnetizam za izvlačenje čestica iz suspenzije i njihovo zadržavanje u jažičnim pločama tijekom ispiranja, ispiranja ili drugih postupaka eluiranja. Na primjerample, automatizirana priprema NGS-a; pročišćavanje genomske i mitohondrijske DNA, RNA ili proteina; i drugi postupci ekstrakcije su slučajevi upotrebe koji mogu uključivati magnetske blokove.
MAGNETSKE KOMPONENTE
Magnetski blok je bez napajanja, ne sadrži nikakve elektroničke komponente i ne pomiče magnetska zrnca gore ili dolje u otopini. Jažice se sastoje od 96 neodimijskih prstenastih magneta visoke čvrstoće pričvršćenih na ležište s oprugom, što pomaže u održavanju tolerancija između bloka i pipeta tijekom izvođenja automatiziranih protokola.
KONTROLA SOFTVERA
Magnetski blok GEN1 u potpunosti se može programirati u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Izvan protokola, međutim, zaslon osjetljiv na dodir i aplikacija Opentrons nisu svjesni i ne mogu prikazati trenutni status magnetskog bloka GEN1. Ovo je modul bez napajanja. Ne sadrži elektroničke ili mehaničke komponente koje mogu komunicirati s robotom Flex. Vi "kontrolirate" Magnetic Block putem protokola koji koriste Opentrons Flex Gripper za dodavanje i uklanjanje laboratorijskog softvera iz ovog modula.

Specifikacije magnetskog bloka

Dimenzije Težina Snaga modula Stupanj magneta Uvjeti okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Nadmorska visina Stupanj onečišćenja

136 × 94 × 45 mm (D/Š/V) 1.13 kg Nema, modul je bez napajanja N52 neodimijski samo za unutarnju upotrebu 20 °C 25%, bez kondenzacije Do 30 m nadmorske visine 80

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
4.6 Temperaturni modul GEN2

Značajke temperaturnog modula
GRIJANJE I HLAĐENJE
Opentrons temperaturni modul GEN2 je modul vruće i hladne ploče. Često se koristi u protokolima koji zahtijevaju grijanje, hlađenje ili promjene temperature. Modul može postići i održavati temperaturu u rasponu od 4 °C do 95 °C u roku od nekoliko minuta, ovisno o konfiguraciji i sadržaju modula.
TERMO BLOKOVI
Za održavanje temperature laboratorijskog posuđa, modul koristi aluminijske termalne blokove. Modul dolazi s termalnim blokovima s 24 jažice i 96 jažica. Nosač temperaturnog modula dolazi s dubokim blokom i blokom s ravnim dnom dizajniranim za korištenje s Flex Gripperom. Blokovi sadrže epruvete od 1.5 mL i 2.0 mL, PCR ploče s 96 jažica, PCR trake, ploče s dubokim jažicama i ploče s ravnim dnom.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
Napomena: Modul se također isporučuje s blokom s ravnim dnom za OT-2. Ne koristite OT-2 blok s Flexom. Ravni donji blok za Flex ima riječi "Opentrons Flex" na gornjoj površini. Onaj za OT-2 ne.

Termalni blok s 24 jažice

Termalni blok s 96 jažice

Termalni blok dubokog bunara

Termalni blok s ravnim dnom za Flex

VODENE KUPKE I GRIJANJE
Budući da je zrak dobar toplinski izolator, praznine između laboratorijskog posuđa i toplinskog bloka mogu utjecati na performanse temperaturnog modula u odnosu na temperaturu. Stavljanje malo vode u termalne blokove s 24 ili 96 jažica uklanja zračne praznine i poboljšava učinkovitost grijanja. Idealna količina vode ovisi o termobloku i laboratorijskom posuđu. Za dodatne preporuke pogledajte Bijelu knjigu o modulu temperature.

KONTROLA SOFTVERA
Modul temperature u potpunosti se može programirati u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju.
Izvan protokola, Opentrons App može prikazati trenutni status temperaturnog modula i može izravno kontrolirati temperaturu površinske ploče.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije temperaturnog modula

Dimenzije Težina Snaga modula
Uvjeti okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Nadmorska visina Stupanj onečišćenja

194 × 90 × 84 mm (D/Š/V) 1.5 kg Ulaz: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Izlaz: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks. Samo za unutarnju upotrebu <219.6 °C (preporučeno za optimalno hlađenje ) Do 22%, bez kondenzacije Do 60 m nadmorske visine 2000

4.7 Modul termociklera GEN2

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
Značajke termociklera
Opentrons Thermocycler Module GEN2 je potpuno automatizirani termocikler na palubi, koji omogućuje PCR bez upotrebe ruku u formatu ploče s 96 jažica. Njegov grijani poklopac i jednokratna brtva čvrsto prianjaju na tanjur, osiguravajući učinkovite sample zagrijavanje i minimalno isparavanje.
GRIJANJE I HLAĐENJE Blok Thermocycler-a može grijati i hladiti, a njegov poklopac može grijati, uz sljedeću temperaturu profile: Raspon temperature toplinskog bloka: 4 °C Maksimalno grijanje termobloka ramp brzina: 4.25 °C/s od GEN2 okoline do 95 °C Termalni blok maksimalno hlađenje ramp brzina: 2.0 °C/s od 95 °C do temperature okoline Raspon temperature poklopca: 37 °C Točnost temperature poklopca: ±110 °C Automatizirani poklopac može se otvoriti ili zatvoriti po potrebi tijekom izvođenja protokola.
TERMOCIKLER PROFILES Thermocycler može izvršiti profiles: automatski kruži kroz niz blok temperatura za izvođenje reakcija osjetljivih na toplinu.
GUMENE BRTVE ZA AUTOMATIZACIJU Thermocycler dolazi s gumenim brtvama za automatizaciju kako bi se smanjilo isparavanje. Svaka brtva mora se sterilizirati prije upotrebe i može se koristiti u nekoliko ciklusa. Dodatne brtve mogu se kupiti izravno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com.
KONTROLA SOFTVERA Thermocycler je u potpunosti programibilan u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju. Izvan protokola, Opentrons App može prikazati trenutni status Thermocyclera i može izravno kontrolirati temperaturu bloka, temperaturu poklopca i položaj poklopca.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije termociklera

Dimenzije (poklopac otvoren) Dimenzije (poklopac zatvoren) Težina (uključujući stražnji kanal) Vol.tage Struja adaptera za napajanje Overvoltage Uvjeti okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Nadmorska visina Zahtjevi za ventilaciju

244.95 × 172 × 310.1 mm (D/Š/V) 244.95 × 172 × 170.35 mm (D/Š/V) 8.4 kg 100 V pri 240/50 Hz 60 A Kategorija II Samo za unutarnju upotrebu 8.5 °C (idealno); 5 °C (prihvatljivo) 20%, bez kondenzacije Do 25 m nadmorske visine Najmanje 2 cm / 40 između jedinice i zida

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5
Laboratorijska oprema
Ovo poglavlje pokriva stavke u Opentrons Labware Library koje možete koristiti s Opentrons Flex i Opentrons Flex Gripper. Također pokriva prilagođenu laboratorijsku opremu i, za naše napredne korisnike, povezuje komponente laboratorijske opreme s njihovim odgovarajućim JSON-om file definicije.
Laboratorijski pribor možete kupiti od proizvođača originalne opreme ili u Opentrons trgovini na https://shop.opentrons.com. I Opentrons uvijek radi na provjeri novih definicija laboratorijskog softvera. Za najnovije popise pogledajte Labware Library (povezano gore).
5.1 Koncepti laboratorijskog softvera
Laboratorijska oprema obuhvaća više od samih objekata postavljenih na palubu i korištenih u protokolu. Kako bismo vam pomogli razumjeti Opentrons laboratorijski softver, proučimo ovu temu iz tri različite perspektive. Za Opentrons Flex, laboratorijska oprema uključuje stavke u našoj biblioteci laboratorijske opreme, podatke koji definiraju svaki dio laboratorijske opreme i prilagođenu laboratorijsku opremu.
Laboratorijski softver kao hardver
Labware Library uključuje sve što možete koristiti prema zadanim postavkama s Opentrons Flexom. To su trajne komponente i potrošni materijali s kojima radite, ponovno ih koristite ili odbacujete tijekom izvođenja protokola. Ne trebate poduzimati nikakve posebne korake za rad sa stavkama u Labware Library. Robot Flex zna kako automatski raditi sa svime u knjižnici.
Laboratorijska oprema kao podatak
Informacije o laboratorijskom softveru pohranjuju se u Javascript objektnoj notaciji (JSON) files s .json file proširenja. JSON file uključuje prostorne dimenzije (duljina, širina, visina), volumetrijski kapacitet (L, mL) i druge metrike koje definiraju značajke površine, njihove oblike i položaje. Prilikom pokretanja protokola Flex čita ove .json datoteke files da zna koja se laboratorijska oprema nalazi na palubi i kako s njom raditi.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
Prilagođeno laboratorijsko posuđe
Prilagođeni laboratorijski softver je laboratorijski softver koji nije uključen u Labware Library ili je laboratorijski softver koji je stvorio Custom Labware Creator. Međutim, ponekad je ideja o prilagođenom laboratorijskom posuđu opterećena pojmovima složenosti, troškova ili poteškoća. Ali prilagođeni laboratorijski pribor ne bi trebao biti težak za razumijevanje ili izradu. Uzmimo trenutak da raspakiramo koncept prilagođenog laboratorijskog softvera.
Kao bivšiampLe, Opentrons Labware Library uključuje ploče s 96 jažica (200 L) tvrtki Corning i BioRad, ali i drugi proizvođači izrađuju te pločice s jažicama. I, zahvaljujući općeprihvaćenim industrijskim standardima, razlike među ovim sveprisutnim laboratorijskim predmetima su male. Međutim, obična ploča od 200 L s 96 jažica od Stellar Scientific, Oxford Lab ili Krackeler Scientific (ili bilo kojeg drugog dobavljača) je "prilagođena laboratorijska oprema" za Flex jer nije unaprijed definirana u našoj Labware Library . Osim toga, manje razlike u dimenzijama laboratorijskog softvera mogu imati drastičan utjecaj na uspjeh izvođenja vašeg protokola. Iz tog je razloga važno imati točnu definiciju laboratorijskog softvera za svaki laboratorijski softver koji želite koristiti u svom protokolu.
Također, dok prilagođeno laboratorijsko posuđe može biti ezoteričan, jednokratan dio pribora, većinu vremena to su samo vrhovi, ploče, cijevi i stalci koji se svakodnevno koriste u laboratorijima diljem svijeta. Opet, jedina razlika između laboratorijskog softvera Opentrons i prilagođenog laboratorijskog softvera je što nova stavka nije unaprijed definirana u softveru koji pokreće robota. Flex može, i radi, raditi s drugim osnovnim stavkama laboratorijskog softvera ili nečim jedinstvenim, ali morate zabilježiti karakteristike te stavke u definiciji laboratorijskog softvera JSON file i uvesti te podatke u aplikaciju Opentrons. Za više informacija pogledajte odjeljak Definicije prilagođenog laboratorijskog softvera u nastavku.
Ukratko, laboratorijska oprema uključuje:
Sve u biblioteci Opentrons Labware. Definicije laboratorijskog softvera: podaci u JSON-u file koji definira oblike, veličine i mogućnosti pojedinih predmeta
kao što su ploče s bunarima, vrhovi, spremnici itd. Prilagođeni laboratorijski pribor, koji su stavke koje nisu uključene u biblioteku laboratorijskog softvera.
Nakon reviewUz ove važne koncepte, ispitajmo kategorije i stavke u Opentrons Labware Library. Nakon toga, završit ćemo poglavlje s overomview podatkovnih komponenti laboratorijskog softvera file i sažeti Opentrons značajke i usluge koje vam pomažu u stvaranju prilagođenog laboratorijskog softvera.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

5.2 Rezervoari
Opentrons Flex prema zadanim postavkama radi s dolje navedenim rezervoarima s jednom i više jažica. Korištenje ovih spremnika pomaže smanjiti teret pripremnog rada jer su odmah spremni za automatizaciju. Informacije o rezervoaru također su dostupne u Opentrons Labware Library.

Ležišta s jednom bušotinom

Specifikacije proizvođača

Agilent

290 mL V dno

Kisik

90 mL Ravno dno

GNIJEZDO

195 mL Ravno dno

290 mL V dno

Naziv učitavanja API-ja
agilient_1_ rezervoar_290ml
kisik_1_ rezervoar_90ml
gnijezdo_1_ rezervoar_195ml
gnijezdo_1_ rezervoar_290ml

Ležišta s više bušotina

Specifikacije proizvođača

GNIJEZDO

12 jažica 15 mL/jažici V dno

USA Scientific

12 jažica 22 mL/jažici V dno

Naziv opterećenja API-ja nest_12_ rezervoar_15ml
usascientific_12_ rezervoar_22ml

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
Rezervoari i API definicije
Opentrons Labware Library definira karakteristike gore navedenih rezervoara u zasebnom JSON-u files. Robot i Opentrons Python API oslanjaju se na ove JSON definicije za rad s laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Na primjerample, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao valjane parametre u vašem kodu. Povezana imena učitavanja API-ja povezuju se s definicijama laboratorijskog softvera rezervoara u Opentrons GitHub repozitoriju.
Laboratorijska oprema za spremnike po narudžbi
Pokušajte stvoriti prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera s Opentrons Labware Creatorom ako spremnik koji želite koristiti nije ovdje naveden. Prilagođena definicija kombinira sve dimenzije, metapodatke, oblike, volumetrijski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex treba ove informacije kako bi razumio kako raditi s vašim prilagođenim laboratorijskim softverom. Za više informacija pogledajte odjeljak Custom Labware Definitions.
5.3 Ploče s bunarima
Opentrons Flex radi prema zadanim postavkama s dolje navedenim pločama s jažicama. Korištenje ovih ploča s jažicama pomaže u smanjenju tereta pripremnog rada jer su spremne za automatizaciju odmah nakon vađenja iz kutije. Informacije o ploči s bušotinama također su dostupne u Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Ploče sa 6 jažica
Proizvođač Corning

Tehnički podaci
6 jažica 16.8 mL/jažici Okrugle jažice, ravno dno

Naziv učitavanja API-ja corning_6_wellplate_16.8ml_flat

Ploče sa 12 jažica
Proizvođač Corning

Tehnički podaci
12 jažica 6.9 mL/jažici Okrugle jažice, ravno dno

Naziv učitavanja API-ja corning_12_wellplate_6.9ml_flat

Ploče sa 24 jažica
Proizvođač Corning

Tehnički podaci
24 jažica 3.4 mL/jažici Okrugle jažice, ravno dno

Naziv učitavanja API-ja corning_24_wellplate_3.4ml_flat

Ploče sa 48 jažica
Proizvođač Corning

Tehnički podaci
48 jažica 1.6 mL/jažici Okrugle jažice, ravno dno

Naziv učitavanja API-ja corning_48_wellplate_1.6ml_flat

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Ploče sa 96 jažica
Proizvođač Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific

Tehnički podaci
96 jažica 200 µL/jažici Kružne jažice, V dno
96 jažica 360 µL/jažica Okrugle jažice, ravno dno
96 jažica 100 µL/jažici Okrugle jažice, V dno PCR puni rub
96 jažica 200 µL/jažica Okrugle jažice, ravno dno
96 dubokih jažica 2000 µL/jažici Četvrtaste jažice, V dno
Čvrsto 96 jažica 200 µL/jažica Okrugla jažica, V dno PCR puni rub
Nunc 96 dubokih jažica 1300 µL/jažica Kružne jažice, U dno
Nunc 96 dubokih jažica 2000 µL/jažica Kružne jažice, U dno
96 dubokih jažica 2.4 mL/jažici Četvrtaste jažice, U dno

API load name biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_puna_suknja
nest_96_wellplate_200ul_flat
gnijezdo_96_bunarica_2ml_duboka
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_puna_ suknja
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Ploče sa 384 jažica

Proizvođač Applied Biosystems Bio-Rad
Corning

Tehnički podaci
384 jažica 40 µL/jažici Kružne jažice, V dno
384 jažica 50 µL/jažici Kružne jažice, V dno
384 jažice 112 µL/jažici Četvrtaste jažice, ravno dno

Naziv učitavanja API-ja applybiosystemsmicroamp_384_ bušotina_40ul biorad_384_bunarica_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Adapteri za bunarske ploče
Dolje navedene aluminijske ploče su termalni adapteri za modul Opentrons Heater-Shaker GEN1. Možete koristiti ove samostalne definicije adaptera za učitavanje Opentrons provjerenog ili prilagođenog laboratorijskog softvera na vrh Heater-Shaker-a.

Tip adaptera Opentrons Univerzalni adapter za plosnati grijač-tresilicu Opentrons 96 PCR adapter za grijač-tresilicu Opentrons 96 Adapter za duboku bušotinu za mućkalicu Opentrons 96 Adapter za grijač-tresilicu s ravnim dnom

Naziv učitavanja API-ja opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Također možete učitati i adapter i laboratorijsku opremu s jednom definicijom. Naša knjižnica laboratorijske opreme uključuje nekoliko unaprijed konfiguriranih termalnih adaptera i kombinacija laboratorijske opreme koje čine Heater-Shaker spremnim za korištenje čim ga izvadite iz kutije.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Napomena: Nemojte koristiti kombiniranu definiciju ako trebate premjestiti laboratorijsko posuđe na ili s Heater-Shaker-a tijekom vašeg protokola, bilo pomoću hvataljke ili ručno. Umjesto toga upotrijebite definiciju samostalnog adaptera.

Kombinacija adapter/laboratorijski pribor

Naziv učitavanja API-ja

Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter s NEST Deep Well Plate 2 mL

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep

Opentrons 96 Adapter grijača-tresilice s ravnim dnom s NEST 96 jažičnom pločom 200 µL ravna

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat

Opentrons 96 PCR adapter za grijanje-tresilicu s NEST pločom za jažice 100 µL

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_puna_suknja

Opentrons Universal Flat Heater-Shaker Adapter s Corning 384 jažičnom pločom 112 µL Flat

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat

Adapteri se mogu kupiti izravno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com.

Ploče s bušotinama i API definicije
Opentrons Labware Library definira gore navedene karakteristike ploča s jažicama u zasebnom JSON-u files. Flex robot i Opentrons Python API oslanjaju se na ove JSON definicije za rad s laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Na primjerample, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao valjane parametre u vašem kodu. Povezani nazivi učitavanja API-ja povezuju se s definicijama laboratorijskog softvera ploče s bušotinama u repozitoriju Opentrons GitHub.

Laboratorijska oprema za ploče s jažicom
Pokušajte upotrijebiti Opentrons Labware Creator za izradu prilagođene definicije laboratorijskog softvera ako ploča s jažicom koju biste željeli koristiti nije ovdje navedena. Prilagođena definicija kombinira sve dimenzije, metapodatke, oblike, volumetrijski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex čita ove informacije kako bi razumio kako raditi s prilagođenim laboratorijskim softverom. Za više informacija pogledajte odjeljak Custom Labware Definitions.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

5.4 Savjeti i stalci za vrhove
Opentrons Flex vrhovi dolaze u veličinama od 50 µL, 200 µL i 1000 µL. Ovo su prozirni, nevodljivi polipropilenski vrhovi koji su dostupni sa ili bez filtera. Pakirani su sterilno u police koje drže 96 vrhova i ne sadrže DNazu, RNazu, proteazu, pirogene, ljudsku DNK, endotoksine i PCR inhibitore. Stalci također uključuju brojeve serija i datume isteka.
Flex vrhovi za pipete rade s pipetama Opentrons Flex od 50 µL i 1000 µL u konfiguracijama s 1, 8 i 96 kanala. Iako možete staviti bilo koji od Flex vrhova na pipete od 50 L i 1000 L, pokušajte uskladiti vrh s nazivnim kapacitetom pipete. Na primjerample, moglo bi biti čudno staviti vrh od 1000 L na pipetu od 50 L. Za pipetu od 1000 L svakako biste mogli koristiti vrh od 50 L, 200 L ili 1000 L.

Stalci za savjete
Nefiltrirani i filtrirani vrhovi pakirani su u stalak koji se sastoji od temeljne ploče za višekratnu upotrebu, srednje ploče koja drži 96 vrhova i poklopca.

Stalak za savjete po volumenu 50 µL 200 µL 1000 µL

Naziv učitavanja API-ja
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

Radi lakše identifikacije, središnje ploče nosača vrhova označene su bojom na temelju veličine vrha:
50 µL: magenta 200 L: žuta 1000 µL: plava

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Prilikom naručivanja ili ponovnog naručivanja, nastavci i stalci dolaze u dvije različite pakirane konfiguracije:
Nosači: Sastoje se od zasebno omotanih držača vrhova (osnovna ploča, središnja ploča s vrhovima i poklopac). Rack konfiguracije su najbolje kada je čistoća najvažnija, kako bi se izbjegla unakrsna kontaminacija ili kada vaši protokoli ne dopuštaju ponovnu upotrebu osnovne ploče ili komponente.
Dodatna punjenja: Sastoje se od jednog cjelovitog nosača vrhova (osnovna ploča, središnja ploča s vrhovima i poklopac) i pojedinačnih spremnika za vrhove. Konfiguracije ponovnog punjenja su najbolje kada vaši protokoli dopuštaju ponovnu upotrebu osnovne ploče ili komponente.
Kompatibilnost tippipeta
Flex vrhovi za pipete dizajnirani su za Opentrons Flex pipete. Flex vrhovi nisu unazad kompatibilni s Opentrons OT-2 pipetama, niti možete koristiti OT-2 vrhove na Flex pipetama.
Ostali industrijski standardni vrhovi mogu raditi s Flex pipetama, ali to se ne preporučuje. Kako biste osigurali optimalnu učinkovitost, trebali biste koristiti samo Opentrons Flex vrhove s Flex pipetama.
Adapter za držač vrhova
96-kanalna pipeta zahtijeva adapter za ispravno pričvršćivanje punog nosača vrhova. Tijekom postupka pričvršćivanja, pipeta se pomiče preko adaptera, spušta se na pričvrsne igle i povlači vrhove na pipete podizanjem adaptera i nosača vrhova.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Napomena: Adapter stalka za vrhove koristite samo kada uzimate cijeli stalak vrhova odjednom. Postavite police za napojnice izravno na špil kada skupljate manje napojnica.
Upozorenje: opasnost od uklještenja. Držite ruke podalje od adaptera nosača vrhova dok pipeta pričvršćuje vrhove pipeta.

Vrsta adaptera Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter

Naziv učitavanja API-ja opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Adapter nosača vrhova kompatibilan je s Opentrons Flex Gripperom. Hvataljku možete koristiti za stavljanje svježih držača za vrhove na adapter ili za podizanje i premještanje iskorištenih nosača za vrhove u žlijeb za otpad.

5.5 Epruvete i stalci za epruvete

Opentrons 4-u-1 Tube Rack sustav radi s Opentrons Flexom prema zadanim postavkama. Korištenje stalka za epruvete 4-u-1 pomaže u smanjenju tereta pripremnog rada jer su kombinacije koje nudi odmah spremne za automatizaciju. Više informacija također je dostupno u Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
Kombinacije cijevi i nosača
Opentrons 4-u-1 stalak za cijevi podržava širok izbor veličina cijevi, pojedinačno ili u različitim kombinacijama veličine (volumena). To uključuje: stalak sa 6 epruveta za epruvete od 50 mL (6 x 50 mL). Kombinirani stalak s 10 epruveta za četiri epruvete od 50 mL i šest epruveta od 15 mL (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). Stalak za 15 epruveta za 15 mL epruvete (15 x 15 mL). Stalak s 24 epruvete za epruvete od 0.5 mL, 1.5 mL ili 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Napomena: Sve epruvete su cilindrične s dnom u obliku slova V (stožastog) osim ako nije drugačije naznačeno.

Stalci sa 6 cijevi
Tip tube 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
Stalci sa 10 cijevi
Tip tube 4 Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml

Ime učitavanja API-ja opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Stalci sa 15 cijevi
Tip tube 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL

Ime učitavanja API-ja opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

Stalci sa 24 cijevi

Tip cijevi
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, dno u obliku slova U 24 generički 2 mL čep s navojem 24 NEST 0.5 mL čep s navojem 24 NEST 1.5 mL čep s navojem 24 NEST 1.5 mL čep s navojem 24 NEST 2 mL čep s navojem 24 NEST 2 mL zatvarač na pritisak, dno u obliku slova U

Naziv učitavanja API-ja opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

API definicije nosača cijevi
Opentrons Labware Library definira karakteristike gore navedenih nosača cijevi u zasebnom JSON-u files. Flex robot i Opentrons Python API oslanjaju se na ove JSON definicije za rad s laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Na primjerample, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao valjane parametre u vašem kodu. Povezani nazivi učitavanja API-ja povezuju se s definicijama laboratorijskog softvera nosača cijevi u Opentrons GitHub repozitoriju.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
Prilagođeni stalak za epruvete laboratorijsko posuđe
Pokušajte stvoriti prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera koristeći Opentrons Labware Creator ako kombinacija cijevi i stalka koju želite koristiti nije ovdje navedena. Prilagođena definicija kombinira sve dimenzije, metapodatke, oblike, volumetrijski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex čita ove informacije kako bi razumio kako raditi s prilagođenim laboratorijskim softverom. Za više informacija pogledajte odjeljak Custom Labware Definitions.
5.6 Aluminijski blokovi
Aluminijski blokovi isporučuju se s temperaturnim modulom GEN2 i mogu se kupiti zasebno kao trodijelni set. Set uključuje ploču s ravnim dnom, blok s 24 jažice i blok s 96 jažica.
Opentrons Flex koristi aluminijske blokove za držanje sampepruvete i ploče s jažicama na temperaturnom modulu ili izravno na palubi. Kada se koriste s temperaturnim modulom, aluminijski blokovi mogu zadržati vaš sample epruvete, PCR trake ili ploče na konstantnoj temperaturi između 4 °C i 95 °C.
Ploča s ravnim dnom
Ploča s ravnim dnom za Flex isporučuje se s nosačem temperaturnog modula i kompatibilna je s raznim ANSI/SLAS standardnim pločama s jažicama. Ova ravna ploča razlikuje se od ploče koja se isporučuje sa samim temperaturnim modulom ili zasebnim setom od tri dijela. Ima širu radnu površinu i skošene kutne kopče. Ove značajke pomažu u poboljšanju performansi Opentrons Flex Grippera pri pomicanju laboratorijskog pribora na ploču ili s nje.
Možete reći koju ploču s ravnim dnom imate jer ona za Flex ima riječi "Opentrons Flex" na gornjoj površini. Onaj za OT-2 ne.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Aluminijski blok s 24 jažice
Blok s 24 jažice koristi se s pojedinačnim sample bočice. Na primjerample, prihvaća sample bočice koje:
Imaju donji dio u obliku slova V ili U. Osigurajte sadržaj čepom ili zatvaračem s navojem. Držite tekućinu u kapacitetima od 0.5 mL, 1.5 mL i 2 mL.

Aluminijski blok s 96 jažice
Blok s 96 jažica podržava veliki izbor vrsta pločica s jažicama. Na primjerample, dobro prihvaća ploče koje su:
Od velikih proizvođača ploča poput Bio-Rada i NEST-a.
Dizajniran s dnom u obliku slova V, dnom u obliku slova U ili ravnim dnom.
Dizajnirano s jažicama od 100 µL ili 200 µL.
Također je kompatibilan s generičkim PCR trakama.

Samostalni adapteri
Termalni blok Flex ploča s ravnim dnom Aluminijski blok s 24 jažice Aluminijski blok s 96 jažica

Naziv učitavanja API-ja opentrons_aluminium_flat_bottom_plate Pogledajte kombinacije laboratorijskog softvera u nastavku. opentrons_96_well_aluminijski_blok

Kombinacije laboratorijskog posuđa od aluminijskih blokova
Opentrons Labware Library podržava sljedeće kombinacije blokova, bočica i jažičnih ploča, koje su također definirane u zasebnoj JSON definiciji laboratorijskog softvera files. Flex robot i Opentrons Python API

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
oslonite se na ove JSON definicije za rad s laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Na primjerample, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao valjane parametre u vašem kodu. U tablicama ispod navedene su zadane kombinacije blok/spremnik i povezani nazivi učitavanja API-ja. Veze se povezuju na odgovarajuće JSON definicije u Opentrons GitHub repozitoriju.
Napomena: Sve cijevi imaju dno u obliku slova V, osim ako nije drugačije naznačeno.

Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijskih blokova s 24 jažice

Sadržaj bloka s 24 jažice Generički 2 mL navojni čep NEST 0.5 mL navojni čep NEST 1.5 mL navojni čep NEST 1.5 mL navojni čep NEST 2 mL navojni čep NEST 2 mL navojni čep, dno u obliku slova U

Naziv učitavanja API-ja opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml _screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_snapcap

Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijskih blokova s 96 jažice

Sadržaj bloka od 96 jažica Bio-Rad jažična ploča 200 µL Generic PCR strip 200 µL NEST jažična ploča 100 µL

Naziv učitavanja API-ja opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

5.7 Laboratorijska oprema i Opentrons Flex Gripper
Iako Opentrons Flex radi sa svim inventarom u Labware Library, Opentrons Flex Gripper kompatibilan je samo s određenim stavkama laboratorijskog softvera. Trenutačno je hvataljka optimizirana za korištenje sa sljedećim laboratorijskim predmetima.

Kategorija laboratorijske opreme Ploče s dubokim jažicama Potpuno obložene ploče s 96 jažica
Stalci za savjete (nefiltrirani i filtrirani vrhovi)

Marke
NEST 96 ploča s dubokim jažicama 2 mL
Opentrons Tough Ploča s 96 jažica 200 µL PCR Full Skirt NEST Ploča s 96 jažica 200 µL Ravna
Opentrons Flex 96 stalak za vrhove 50 µL Opentrons Flex 96 stalak za vrhove 200 µL Opentrons Flex 96 stalak za vrhove 1000 µL

Napomena: Za najbolje rezultate koristite Flex Gripper samo s gore navedenim laboratorijskim priborom. Flex Gripper može raditi s drugom laboratorijskom opremom koja je usklađena s ANSI/SLAS automatizacijom, ali to se ne preporučuje.

5.8 Definicije prilagođenog laboratorijskog softvera
Kao što je objašnjeno na početku ovog poglavlja, prilagođena laboratorijska oprema je laboratorijska oprema koja nije navedena u Opentrons Labware Library. Možete koristiti druge uobičajene ili jedinstvene stavke laboratorijskog softvera s Flexom točnim mjerenjem i bilježenjem karakteristika tog objekta i spremanjem tih podataka u JSON file. Kada se uvezu u aplikaciju, Flex i API koriste te JSON podatke za interakciju s vašim laboratorijskim softverom. Opentrons pruža alate i usluge, koje ćemo ispitati u nastavku, kako bi vam pomogli koristiti Flex s prilagođenim laboratorijskim softverom.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

Stvaranje prilagođenih definicija laboratorijskog softvera
Opentrons alati i usluge pomažu vam staviti prilagođeni laboratorijski pribor na dohvat ruke. Ove značajke prilagođavaju se različitim razinama vještina i načinima rada. Stvaranje vlastite laboratorijske opreme i njezina uporaba s Opentrons Flexom pomaže da robot postane svestran i moćan dodatak vašem laboratoriju.

KREATOR LABORATORIJSKOG OPREMA PO PRILAGOĐIVANJU
Custom Labware Creator je bez koda, web-baziran alat koji koristi grafičko sučelje kao pomoć pri stvaranju definicije laboratorijskog softvera file. Labware Creator proizvodi JSON definiciju laboratorijskog softvera file koje uvozite u aplikaciju Opentrons. Nakon toga, vaša prilagođena laboratorijska oprema dostupna je Flex robotu i Python API-ju.

SERVIS LABORATORIJSKE OPREME PO NALAZI
Obratite nam se ako laboratorijski pribor koji želite koristiti nije dostupan u knjižnici, ako ne možete izraditi vlastite definicije ili zato što prilagođeni predmet uključuje različite oblike, veličine ili druge nepravilnosti opisane u nastavku.

Labware možete definirati u Labware Creatoru
; Jažice i epruvete su ujednačene i identične. ; Svi redovi su ravnomjerno raspoređeni
(razmak između redova je jednak).
; Svi stupci su ravnomjerno raspoređeni (razmak između stupaca je jednak).
; Savršeno pristaje u jedan utor na palubi.

Labware Opentrons treba definirati ; Oblici jažica i cijevi variraju. ; Redovi nisu ravnomjerno raspoređeni.
; Stupci nisu ravnomjerno raspoređeni.
; Manji od jednog utora za špil (zahtijeva adapter) ili obuhvaća više utora za špil.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA
Evo nekoliko dijagrama koji vam pomažu da vizualizirate bivšegampgore opisano. Regular Svi stupci su ravnomjerno raspoređeni i svi reci su ravnomjerno raspoređeni. Stupci ne moraju imati isti razmak kao reci.
Regular Rešetka ne mora biti u središtu laboratorijskog pribora.
Nepravilni redovi su ravnomjerno raspoređeni, ali stupci nisu ravnomjerno raspoređeni.
Nepravilni stupci/redovi ravnomjerno su raspoređeni, ali jažice nisu identične.
Nepravilan Postoji više od jedne mreže.
Naš tim za laboratorijsku opremu radit će na razumijevanju vaših potreba i izraditi prilagođene definicije laboratorijske opreme za vas. Za više informacija pogledajte članke podrške Zahtjev za definicijom prilagođene laboratorijske opreme i Obrazac zahtjeva za prilagođenu laboratorijsku opremu. Ovo je usluga koja se naplaćuje.

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORSKA OPREMA

PYTHON API
Iako ne možete izraditi prilagođenu laboratorijsku opremu s našim API-jem, možete koristiti prilagođenu laboratorijsku opremu s dostupnim API metodama. Međutim, najprije trebate definirati svoj prilagođeni laboratorijski pribor i uvesti ga u aplikaciju Opentrons. Nakon što dodate laboratorijsku opremu u aplikaciju Opentrons, ona je dostupna Python API-ju i robotu. Za više informacija pogledajte odjeljak Custom Labware Definitions u Python API dokumentaciji. Za informacije o pisanju skripti protokola s API-jem, pogledajte odjeljak Python Protocol API u poglavlju Razvoj protokola.
JSON shema laboratorijskog softvera
JSON file je nacrt za Opentrons standardnu i prilagođenu laboratorijsku opremu. Ovaj file sadrži i organizira laboratorijske podatke prema specifikacijama dizajna postavljenim zadanom shemom.
Shema je okvir

Dokumenti / Resursi

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source robot za rukovanje tekućinama [pdf] Upute za uporabu
FLEX Opentrons Flex Open Source Robot za rukovanje tekućinama, FLEX, Opentrons Flex Open Source Robot za rukovanje tekućinama, Flex Open Source Robot za rukovanje tekućinama, Open Source Robot za rukovanje tekućinama, Izvorni robot za rukovanje tekućinama, Robot za rukovanje tekućinama, Robot za rukovanje, Robot

Reference

korisnički priručnik

FLEX Opentrons Flex otvoreni izvorni robot za rukovanje tekućinama

Opentrons Flex

Tehnički podaci:

Upute za korištenje proizvoda:

1. Ugradnja i kalibracija instrumenta:

2. Premještanje:

3. Veze:

4. Dizajner protokola:

5. Python Protocol API:

6. OT-2 protokoli:

Često postavljana pitanja (FAQ):

P: Kako mogu riješiti problem ako se robot ne kreće kao
očekivano?

P: Mogu li koristiti prilagođene pipete s Opentrons Flexom?

Dokumenti / Resursi

Reference

Ostavite komentar

Odustani od odgovora

FLEX Opentrons Flex otvoreni izvorni robot za rukovanje tekućinama

Opentrons Flex

Tehnički podaci:

Upute za korištenje proizvoda:

1. Ugradnja i kalibracija instrumenta:

2. Premještanje:

3. Veze:

4. Dizajner protokola:

5. Python Protocol API:

6. OT-2 protokoli:

Često postavljana pitanja (FAQ):

P: Kako mogu riješiti problem ako se robot ne kreće kao očekivano?

P: Mogu li koristiti prilagođene pipete s Opentrons Flexom?

Dokumenti / Resursi

Reference

Povezani postovi

Ostavite komentar

Odustani od odgovora

P: Kako mogu riješiti problem ako se robot ne kreće kao
očekivano?