FLEX Opentrons Flex Open Source robot za rukovanje tekućinom

Opentrons Flex

specifikacije:

  • Opće specifikacije: Lorem ipsum dolor sit
    amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
    ut labore et dolore magna aliqua.
  • Specifikacije okoliša: Lorem ipsum
    dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
    incididunt ut labore et dolore magna aliqua.
  • Certifikati: Lorem ipsum bolna situacija,
    consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
    labore et dolore magna aliqua.
  • serijski broj: XXX-XXXX-XXXX

Upute za upotrebu proizvoda:

1. Instalacija i kalibracija instrumenta:

Slijedite korake navedene u priručniku za pipetu i hvatač
instalacija.

2. Premještanje:

Za kratke poteze, pogledajte odjeljak 2.5 u priručniku. Za
poteze na velike udaljenosti, slijedite date smjernice. Generalno selidba
savjet je također dostupan.

3. Priključci:

Osigurajte ispravan priključak napajanja kako je detaljno opisano u priručniku.
Po potrebi povežite USB i pomoćne uređaje. Mrežne veze
treba uspostaviti slijedeći uputstva.

4. Dizajner protokola:

Shvatite zahtjeve za Protocol Designer i naučite kako
da dizajnirate nove protokole ili modificirate postojeće prema vašoj laboratoriji
zahtjevi.

5. API Python protokola:

Istražite pisanje i pokretanje skripti koristeći Python Protocol API.
Otkrijte ekskluzivne funkcije za Python za poboljšanu funkcionalnost.

6. OT-2 protokoli:

Saznajte više o OT-2 Python protokolima, OT-2 JSON protokolima i
Protokoli magnetnog modula za različite vrste eksperimenata.

Često postavljana pitanja (FAQ):

P: Kako da riješim problem ako se robot ne kreće kao
očekivano?

O: Provjerite priključak za napajanje, osigurajte pravilnu kalibraciju
instrumente i provjerite da nema prepreka u
putanja robota.

P: Mogu li koristiti prilagođene pipete sa Opentrons Flex-om?

O: Opentrons preporučuje korištenje kompatibilnih pipeta za optimalno
performanse i tačnost.

“`

Opentrons Flex
Uputstvo za upotrebu
Opentrons Labworks Inc.
decembar 2023

© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Registrovani nazivi, žigovi, itd. koji se koriste u ovom dokumentu, čak i kada nisu posebno označeni kao takvi, ne smiju se smatrati nezaštićenim zakonom.

Sadržaj
Predgovor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktura ovog priručnika . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Napomene i upozorenja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Poglavlje 1: Uvod . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Dobrodošli u Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Šta je novo u Flex-u. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Flex radne stanice . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Sigurnosne informacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Sigurnosni simboli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Upozorenja o električnoj sigurnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Dodatna sigurnosna upozorenja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Sigurnosne mjere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biološka sigurnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Toksična isparenja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Zapaljive tečnosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Usklađenost sa propisima . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Sigurnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetna kompatibilnost . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC upozorenja i napomene . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Usklađenost sa Kanadom ISED . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Upozorenje o životnoj sredini . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi pretcertifikacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Poglavlje 2: Instalacija i premještanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Sigurnosni i operativni zahtjevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Gdje postaviti Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Potrošnja energije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Uslovi okoline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Raspakivanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Potreban trud i vrijeme . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Sanduk i materijal za pakovanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Elementi proizvoda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Dio 1: Uklonite sanduk . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Dio 2: Otpustite Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Dio 3: Završno sastavljanje i uključenje . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32

2.3 Prvo pokretanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Uključivanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Povezivanje na mrežu ili računar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Instaliranje ažuriranja softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Pričvršćivanje privjeska za zaustavljanje u nuždi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Dajte svom robotu ime . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instalacija i kalibracija instrumenta . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Instalacija pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Instalacija hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Preseljenje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Kratki potezi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Pokreti na velike udaljenosti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Opći savjeti o selidbi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Završne misli o selidbi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Poglavlje 3: Opis sistema. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fizičke komponente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Okvir i kućište . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Paluba i radni prostor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging area . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Oprema na palubi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Žleb za otpad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging area slots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Sistem kretanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Dodirni i LED ekrani . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Specifikacije pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Kalibracija pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Adapter nosača vrha pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Djelomično podizanje vrha . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Senzori za pipete. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Ažuriranja firmvera pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Hvatalica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Specifikacije hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Kalibracija hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Ažuriranja firmvera hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Privjesak za zaustavljanje u nuždi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Kada koristiti E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Uključivanje i otpuštanje E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60

3.5 Veze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Priključak za napajanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB i pomoćni priključci . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Mrežne veze . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Specifikacije sistema. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Opšte specifikacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Specifikacije okoline . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Certifikati. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Serijski broj . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Poglavlje 4: Moduli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Podržani moduli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Modul caddy sistem . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Kalibracija modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Kada kalibrirati module. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Kako kalibrirati module . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Modul grijača-tresača GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Karakteristike grijača-tresača. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Specifikacije grijača-tresača . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetski blok GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Karakteristike magnetnog bloka. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Specifikacije magnetnog bloka . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperaturni modul GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Karakteristike temperaturnog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Specifikacije temperaturnog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Modul termociklera GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Karakteristike termociklera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Specifikacije termociklera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Poglavlje 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Koncepti laboratorijskog softvera. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labver kao hardver . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware kao podaci . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Prilagođeni laboratorijski pribor . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Rezervoari . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoari sa jednim bunarom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoari sa više bunara. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Rezervoari i definicije API-ja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Prilagođeni laboratorijski pribor za rezervoar. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Ploče za bunare . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83

Ploče sa 6 jažica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče sa 12 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče sa 24 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče sa 48 jažica. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 Ploče sa 96 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 Ploče sa 384 jažica . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Adapteri ploče bunara. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Ploče bunara i definicije API-ja. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Laboratorijski pribor za pločice po mjeri. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Vrhovi i nosači za vrhove . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Stalci za vrhove . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Kompatibilnost tipipeta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Adapter za vrh nosača . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Cijevi i nosači cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Kombinacije cijevi i nosača . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci sa 6 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci od 10 cijevi. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Stalci sa 15 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Stalci od 24 cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 API definicije nosača cijevi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Laboratorijski pribor za stalak za tube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminijski blokovi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Ploča s ravnim dnom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Aluminijski blok sa 24 bunara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Aluminijski blok sa 96 bunara . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Samostalni adapteri . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijumskih blokova . . . . . . . . . . . . . . . .94 Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijumskih blokova sa 24 bunara . . . . . . . . .95 Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijumskih blokova sa 96 bunara . . . . . . . . .95 5.7 Labware i Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Prilagođene definicije laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Kreiranje prilagođenih definicija laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON shema laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 Definicije JSON laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Poglavlje 6: Razvoj protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Unaprijed napravljeni protokoli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Biblioteka protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Usluga razvoja prilagođenog protokola . . . . . . . . . . . . . . . .

6.2 Dizajner protokola. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Zahtjevi dizajnera protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Dizajniranje protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Izmjena postojećih protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 API Python protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Pisanje i pokretanje skripti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Ekskluzivne funkcije za Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 protokoli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python protokoli. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON protokoli . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Protokoli magnetnog modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Poglavlje 7: Softver i rad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Rad sa ekranom osetljivim na dodir. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Nadzorna ploča robota . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Upravljanje protokolom . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Detalji protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Pokreni podešavanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Provjera položaja laboratorijskog softvera . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Napredak pokretanja. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Završetak pokretanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Upravljanje instrumentima. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Postavke robota. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Konfiguracija palube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Instalacija aplikacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Prijenos protokola na Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Status modula i kontrole . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Nedavna izvođenja protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Napredni rad . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notebook . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Operacije komandne linije preko SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Poglavlje 8: Održavanje i servis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Čišćenje vašeg Flex-a . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Prije nego što počnete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Šta možete očistiti . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Rješenja za čišćenje. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čišćenje okvira i prozorske ploče . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Čišćenje palube . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148

Čišćenje portala. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Čišćenje žlijeba za otpad. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Čišćenje pipeta i vrhova . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Dekontaminacija pipete . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Vrhovi pipeta za čišćenje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Čišćenje hvataljke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Moduli za čišćenje. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Generalno čišćenje modula . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Zaptivke termociklera. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Laboratorijski pribor za autoklav . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Flex servisiranje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons usluge . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Kvalifikacija instalacije i kvalifikacija rada . . . 155 Preventivno održavanje . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Garancija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Dodatak A: Pojmovnik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Dodatak B: Dodatna dokumentacija . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons čvorište znanja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Dokumentacija API-ja Python protokola . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API reference. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Dokumentacija za programere . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Dodatak C: Softver otvorenog koda . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons na GitHubu . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Ostala spremišta . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Dodatak D: Podrška i kontakt informacije . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Prodaja . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Podrška . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Poslovne informacije . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177

Predgovor
Dobrodošli u uputstvo za upotrebu Opentrons Flex robota za rukovanje tekućinama. Ovaj priručnik vas vodi kroz gotovo sve što trebate znati za postavljanje i korištenje Flex-a, fokusirajući se na teme koje su najrelevantnije za svakodnevne korisnike Flex-a u laboratorijskom okruženju.
Struktura ovog priručnika
Opentrons Flex je složen sistem, tako da postoji mnogo različitih puteva za učenje svega što može. Slobodno skočite direktno na poglavlje koje se bavi bilo kojom temom koja vas zanima! Za npramppa, ako već imate postavljen Flex u svojoj laboratoriji, možete preskočiti poglavlje Instalacija i premještanje.
Ako više volite vođeni pristup, ovaj priručnik je strukturiran tako da ga možete pratiti od početka do kraja.
Saznajte više o Flexu. Prepoznatljive karakteristike Flex-a su navedene u Poglavlju 1: Uvod. Uvod također uključuje važne sigurnosne i regulatorne informacije.
Započnite sa Flex-om. Ako trebate postaviti svoj Flex, slijedite detaljna uputstva u poglavlju 2: Instalacija i premještanje. Zatim se upoznajte sa komponentama Flex-a u 3. poglavlju: Opis sistema.
Postavite svoju palubu. Konfigurisanje deka omogućava različite naučne primene na Flex-u. Poglavlje 4: Moduli opisuje Opentrons periferne uređaje koje možete instalirati u ili na vrh špila za obavljanje specifičnih naučnih zadataka. Poglavlje 5: Labware objašnjava kako se radi sa opremom za držanje tečnosti.
Pokreni protokol. Osnovna upotreba Flex-a je pokretanje standardizovanih naučnih procedura, poznatih kao protokoli. Poglavlje 6: Razvoj protokola nudi nekoliko načina da dobijete gotove protokole ili ih sami dizajnirate. Da biste pokrenuli svoj protokol, slijedite upute u poglavlju 7: Softver i rad, koje također sadrži upute za obavljanje drugih zadataka i prilagođavanje postavki vašeg robota.
Neka Flex radi. Slijedite savjete u Poglavlju 8: Održavanje i servis kako bi vaš Flex bio čist i optimalno radio. Ili se prijavite za jednu od Opentrons usluga navedenih tamo i prepustite nam da se pobrinemo za Flex umjesto vas.
Naučite još više. Još uvijek trebate nešto drugo? Konsultujte dodatke. Dodatak A: Rečnik definiše termine koji se odnose na Flex. Dodatak B: Dodatna dokumentacija ukazuje na još više resursa za Opentrons proizvode i pisanje koda za kontrolu Flex-a.

OPENTRONS FLEX

9

PREDGOVOR
Dodatak C: Softver otvorenog koda objašnjava kako se Opentrons softver hostuje na GitHubu kao resurs i za programere i za one koji nisu programeri.
Dodatak D: Informacije o podršci i kontaktu navodi kako da stupite u kontakt sa Opentrons-om ako vam je potrebna pomoć izvan onoga što naša dokumentacija pruža.
Napomene i upozorenja
U ovom priručniku ćete pronaći posebno oblikovane bilješke i blokove upozorenja. Bilješke pružaju korisne informacije koje možda neće biti očigledne u uobičajenom toku korištenja Flexa. Obratite posebnu pažnju na upozorenja – ona se koriste samo u situacijama u kojima postoji opasnost od ličnih ozljeda, oštećenja opreme, gubitka ili kvarenja uređaja.ampdatoteke ili reagensi, gubitak podataka ili druge štete. Napomene i upozorenja izgledaju ovako:
Sample Napomena: Ovo je nešto što biste trebali znati, ali ne predstavlja nikakvu opasnost.
Sample Upozorenje: Ovo je nešto što trebate znati jer postoji rizik povezan s tim.

10

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1
Uvod

Ovo poglavlje vas upoznaje sa Opentrons Flex ekosistemom, uključujući cjelokupni dizajn sistema i dostupne konfiguracije radnih stanica. Takođe uključuje važne informacije o usklađenosti i sigurnosti, koje biste trebali pročitatiview prije postavljanja vašeg Opentrons Flex robota. Za više detalja o karakteristikama Opentrons Flexa, pogledajte poglavlje Opis sistema.

1.1 Dobrodošli u Opentrons Flex
Opentrons Flex je robot za rukovanje tekućinama dizajniran za visoku propusnost i složene radne tokove. Flex robot je osnova modularnog sistema koji uključuje pipete, hvataljku za laboratorijski pribor, držače na palubi, module na palubi i laboratorijski pribor — sve to možete sami zamijeniti. Flex je dizajniran sa ekranom osjetljivim na dodir tako da možete raditi s njim direktno na laboratorijskoj klupi ili ga možete kontrolirati iz cijele laboratorije pomoću aplikacije Opentrons ili naših API-ja otvorenog koda.
Flex radne stanice dolaze sa svom opremom — robotom, hardverom i laboratorijskim priborom — koja vam je potrebna da započnete automatizaciju uobičajenih laboratorijskih zadataka. Za druge aplikacije, Opentrons Flex radi na softveru i firmveru potpuno otvorenog koda, a ne zavisi od reagensa i laboratorijskog softvera, dajući vam kontrolu nad načinom na koji dizajnirate i pokrećete svoje protokole.

Šta je novo u Flex-u
Opentrons Flex je dio Opentrons serije robota za rukovanje tekućinama. Korisnici Opentrons Flex-a možda su upoznati sa Opentrons OT-2, našim ličnim robotom za pipetiranje. Flex nadilazi mogućnosti OT-2 u nekoliko ključnih oblasti, pružajući veću propusnost i vrijeme hoda.

Karakteristika Protočnost pipete
Kapacitet pipete i vrha

Opis
Flex pipete imaju 1, 8 ili 96 kanala. 96-kanalna pipeta radi na 12 puta više bunara odjednom nego najveća OT-2 pipeta.
Flex pipete imaju veće opsege zapremine (1 µL, 50 µL) i sve mogu da rade sa bilo kojom zapreminom Opentrons Flex vrhova. Ovo je poboljšanje u odnosu na OT-5 pipete, koje imaju manji domet i moraju koristiti vrhove sa odgovarajućim opsegom zapremine.

OPENTRONS FLEX

11

POGLAVLJE 1: UVOD

Gripper Automatska kalibracija Touchscreen Modul caddies Koordinate utora na palubi Pokretni smeće Veličina i težina

Opentrons Flex Gripper automatski podiže i pomiče laboratorijski pribor po palubi, bez intervencije korisnika. Hvatalica omogućava složenije tokove rada unutar jednog pokretanja protokola.
Pozicijska kalibracija Flex pipeta i hvatača je potpuno automatizirana. Pritisnite jedno dugme i instrument će se pomeriti do precizno obrađenih tačaka na palubi da odredi svoju tačnu poziciju, čuvajući te podatke za upotrebu u vašim protokolima.
Flex ima sopstveni interfejs sa ekranom osetljivim na dodir koji vam omogućava da njime direktno upravljate, pored korišćenja aplikacije Opentrons. Koristite ekran osjetljiv na dodir za pokretanje protokola, provjerite status posla i promijenite postavke direktno na robotu.
Flex moduli se uklapaju u kedije koji zauzimaju prostor ispod palube. Caddies postavljaju vaš laboratorijski pribor bliže površini palube i omogućavaju provođenje kablova ispod palube. Caddies omogućavaju još više modula i konfiguracija laboratorijskog pribora na palubi.
Prorezi na palubi na Flex-u su numerisani koordinatnim sistemom (A1D4) koji je sličan načinu na koji su bunari numerisani na laboratorijskom priboru.
Kanta za smeće može ići na više lokacija na palubi Flex-a. Zadana lokacija (utor A3) je preporučena pozicija. Također možete koristiti hvataljku za odlaganje smeća u opcionalni otvor za otpad.
Flex je malo veći i mnogo teži od OT-2. Zadaci instalacije na Flex-u zahtijevaju pomoć partnera u laboratoriji.

Detaljno poređenje tehničkih specifikacija robota dostupno je na Opentronsu website.
I Flex i OT-2 roboti rade na našem softveru otvorenog koda, a aplikacija Opentrons može kontrolirati obje vrste robota odjednom. Iako se OT-2 protokoli ne mogu pokrenuti direktno na Flex-u, jednostavno ih je prilagoditi (pogledajte odjeljak OT-2 protokoli u poglavlju Razvoj protokola za detalje).

Flex radne stanice
Opentrons Flex radne stanice uključuju Flex robota, pribor, pipete i hvataljke, module na palubi i laboratorijski pribor potreban za automatizaciju određene aplikacije. Sve komponente radne stanice su modularne. Ako trebate promijeniti aplikacije, možete dodati ili zamijeniti drugi Flex hardver i kompatibilni potrošni materijal.

12

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1: UVOD
NGS WORKSTATION
Opentrons Flex NGS radna stanica automatizuje pripremu NGS biblioteke. Može da automatizuje radne tokove prethodnog sekvenciranja koristeći bilo koji vodeći sistem reagensa, uključujući fragmentaciju i tagpriprema biblioteke zasnovana na mentaciji.
Pored Flex robota, NGS radna stanica uključuje:
Gripper Izbor konfiguracije pipete
Dve 8-kanalne pipete (1 µL i 50 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Magnetni blok temperaturni modul Modul termociklera Komplet laboratorijskog pribora sa vrhovima filtera, epruvetama za mikrocentrifugu, rezervoarima za PCR
PCR WORKSTATION
Opentrons Flex PCR radna stanica automatizira PCR postavljanje i termocikliranje radnih tokova do 96 samples. Može alikvotno ohlađene reagense i sampu PCR ploču sa 96 jažica. Uz dodatak automatiziranog modula Thermocycler, koristite hvataljku da ubacite ploču u Thermocycler, a zatim pokrenite odabrani PCR program.
Pored Flex robota, PCR radna stanica uključuje:
Gripper Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (1 µL) i 50-kanalna pipeta (8 µL) 1-kanalna pipeta (50 µL) Temperaturni modul žlijeba za otpad Komplet laboratorijskog pribora s vrhovima filtera, epruvetama za mikrocentrifugu, rezervoarima i PCR pločama

OPENTRONS FLEX

13

POGLAVLJE 1: UVOD
RADNA STANICA ZA VAĐENJE NUKLEINSKIH KISELINE
Opentrons Flex radna stanica za ekstrakciju nukleinskih kiselina automatizira izolaciju i pročišćavanje DNK/RNA. Koristi magnetni blok za odvajanje magnetnih perli, a grijač-tresač za sampliza i resuspenzija magnetnih perli.
Pored Flex robota, radna stanica za ekstrakciju nukleinske kiseline uključuje:
Gripper Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Magnetni blok grijač-modul za protresanje otpadnog žlijeba Komplet laboratorijskog pribora sa vrhovima filtera, PCR pločama, rezervoarima za duboke jažice
MAGNETNA RADNA STANICA ZA PROČIŠĆAVANJE PROTEINA
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation automatizuje malo pročišćavanje proteina i proteomiku.ample prep do 96 samples. Kompatibilan je sa mnogim popularnim reagensima na bazi magnetnih perli.
Pored Flex robota, radna stanica za pročišćavanje proteina uključuje:
Gripper Izbor konfiguracije pipete
1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL) Magnetni blok grijač-modul za protresanje otpadnog žlijeba Komplet laboratorijskog pribora sa vrhovima filtera, PCR pločama, rezervoarima za duboke jažice
FLEX PRIPREMNA RADNA STANICA
Opentrons Flex Prep Workstation automatizuje jednostavne radne tokove pipetiranja. Konfigurirajte radnu stanicu s 1-kanalnim i 8-kanalnim pipetama za obavljanje zadataka kao što su sample transfer, sample dupliciranje, i

14

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1: UVOD
alikvotiranje reagensa. Konfigurirajte radnu stanicu s 96-kanalnom pipetom za izvođenje alikvota reagensa visoke propusnosti i st.amping.
Pored Flex robota, Flex Prep Workstation uključuje:
Izbor konfiguracije pipete: 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) 5-kanalna pipeta (1000 µL)
Komplet laboratorijskog pribora sa vrhovima filtera, epruvetama za mikrocentrifugu i rezervoarima
PLASMID PREP WORKSTATION
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation automatizuje procese ekstrakcije i prečišćavanja plazmida baziranih na magnetnim kuglicama. Ova radna stanica je opremljena pipetama velikog volumena, modulom grijača i tresačom i magnetnim blokom za prilagođavanje većine hemije baziranih na kuglicama.
Pored Flex robota, Plasmid Prep Workstation uključuje:
Gripper 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) Magnetni blok grijač-tresač modula Labware komplet sa filterskim vrhovima, epruvetama za mikrocentrifugu, rezervoarima, PCR pločama i pločama za duboke jažice
SYNBIO WORKSTATION
Opentrons Flex SynBio Workstation automatizuje različite sintetičke biološke tokove rada kao što su sinteza DNK i kloniranje. Koristi magnetni blok i temperaturni modul da podrži većinu hemije zasnovane na perli. Dodajte modul Thermocycler za obavljanje inkubacije zagrijanog poklopca i amplifikacije.
Pored Flex robota, SynBio Workstation uključuje:
Gripper 1-kanalna pipeta (5 µL) i 1000-kanalna pipeta (8 µL) Magnetni blok temperaturni modul

OPENTRONS FLEX

15

POGLAVLJE 1: UVOD

Komplet laboratorijskog pribora sa redovnim i filterskim vrhovima, epruvetama za mikrocentrifugu, rezervoarima, PCR pločama i pločama za duboke jažice

1.2 Sigurnosne informacije
Opentrons Flex robot za rukovanje tekućinama je dizajniran za siguran rad. Pogledajte specifikacije i smjernice usklađenosti u ovom odjeljku kako biste osigurali bezbednu upotrebu vašeg Flex-a. Ove smjernice pokrivaju sigurnu upotrebu ulaznih i izlaznih priključaka za proizvod, uključujući priključke za napajanje i podatke, kao i naljepnice upozorenja koje se nalaze na Flex robotu i povezanom hardveru. Korištenje uređaja na način drugačiji od onih navedenih u ovom priručniku može dovesti korisnika i opremu u opasnost.

Sigurnosni simboli
Različite oznake na Flex-u i u ovom priručniku upozoravaju vas na izvore potencijalnih ozljeda ili ozljeda.

Simbol

Opis
Upozorenje: Upozorava korisnike na potencijalno opasne uslove. Radnje koje mogu dovesti do tjelesnih ozljeda ili smrti.
Oprez: Upozorava korisnike da ne mogu oštetiti opremu. Izgubljeni ili oštećeni podaci. Nepopravljivi prekid operacije koja se izvodi.
Električni udar: Identificira komponente instrumenta koje bi mogle predstavljati rizik od električnog udara ako se instrumentom rukuje nepropisno.

Vruća površina: Identificira komponente instrumenta koje predstavljaju opasnost od ozljeda zbog visoke topline/temperatura ako se instrumentom rukuje na pogrešan način.

Tačka uklještenja: identifikuje komponente instrumenta koje mogu predstavljati rizik od ličnih povreda kada su u pokretu.

16

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1: UVOD

Na Flexu ćete pronaći sljedeće naljepnice:
Oznake intelektualne svojine Naljepnice usklađenosti s propisima (npr. ETL) Oznake opasnosti od električne energije Naljepnice s općim upozorenjima Oznake proizvoda Oznake s tačkama štipanja Visoki voltage naljepnice Naljepnice sa nazivnom snagom

Električna sigurnosna upozorenja
Uvijek se pridržavajte sljedećih električnih sigurnosnih upozorenja:

Simbol

Opis
Uključite robota u uzemljeno kolo klase 1. Pogledajte odeljak Povezivanje napajanja u poglavlju Opis sistema.

Nemojte povezivati ​​(priključiti), isključiti (isključiti) ili koristiti kablove za napajanje naizmeničnom strujom ako je: Kabl izlizan ili oštećen. Ostali priključeni kablovi, kablovi ili utičnice su pohabani ili oštećeni.
Korištenje oštećenih kablova za napajanje može uzrokovati opasnost od strujnog udara što rezultira ozbiljnim ozljedama ili oštećenjem robota.
Nemojte mijenjati kabel za napajanje naizmjeničnom strujom osim ako nije u smjeru Opentrons Support.

Za više informacija o električnim zahtjevima, pogledajte odjeljak Potrošnja energije u poglavlju Instalacija i premještanje.

OPENTRONS FLEX

17

POGLAVLJE 1: UVOD

Dodatna sigurnosna upozorenja
Uvijek se pridržavajte sljedećih dodatnih sigurnosnih upozorenja:

Simbol

Opis
Opentrons Flex nije sertifikovan za upotrebu sa eksplozivnim ili zapaljivim tečnostima. Nemojte stavljati ploče, epruvete ili bočice koje sadrže eksplozivne ili zapaljive tečnosti u robota ili na drugi način upravljati instrumentom sa eksplozivnim ili zapaljivim tečnostima u kućištu.
Koristite dobru laboratorijsku praksu i pridržavajte se mjera opreza proizvođača kada radite s kemikalijama. Opentrons nije odgovoran za bilo kakvu štetu zbog ili kao rezultat upotrebe opasnih hemikalija.

Flex je težak 88.5 kg (195 lbs). Kao rezultat toga, potrebno je dvoje ljudi da ga bezbedno podignu i pomeraju. Pogledajte odjeljak Premještanje u poglavlju Instalacija i premještanje.

Flex bi trebao biti postavljen na površinu koja može izdržati njegovu težinu od 88.5 kg (195 lbs) s dovoljnom površinom za smještaj robota plus njegov minimalni razmak (20 cm/8 in). Pogledajte odjeljak Sigurnosni i operativni zahtjevi u poglavlju Instalacija i premještanje.
Flex može emitovati vibracije tokom rada. Postavite robota na površinu koja je čvrsta, ravna i vodootporna s poprečnim podupiračima ili zavarenim spojevima. Pogledajte odjeljak Sigurnosni i operativni zahtjevi u poglavlju Instalacija i premještanje.

Sigurnosna upozorenja
Kako biste zaštitili Flex od oštećenja, slijedite ove mjere opreza:

18

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1: UVOD

Simbol

Opis
Koristite laboratorijski softver koji je kompatibilan sa ANSI/SLAS ili odobren od strane Opentronsa. Pogledajte poglavlje Labware.
Držite korozivne materijale, agense ili druge štetne materijale dalje od robota.

Biološka sigurnost
Tretirajte uzorke i reagense koji sadrže materijale uzete od ljudi kao potencijalno zarazne agense. Opentrons preporučuje korištenje sigurnih laboratorijskih procedura kao što je objašnjeno u Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6th Edition.
U normalnim okolnostima, Flex ne stvara detektabilne aerosole iz izvornih tečnosti. Međutim, pod određenim uvjetima, moguće je generiranje aerosola iz izvornih tekućina. Kada radite sa izvornim tečnostima nivoa biološke bezbednosti 2 ili više, razmislite o preduzimanju mera predostrožnosti protiv izlaganja aerosolu, u skladu sa vašim lokalnim regulatornim telima. Kako biste sveli na najmanju moguću mjeru potencijalni rizik od izlaganja robotu aerosolu, osigurajte da:
Izvršite održavanje kako je opisano u poglavlju Održavanje i servis. Pravilno instalirajte i osigurajte sve poklopce instrumenata, pipete, module i laboratorijski pribor. Koristite odgovarajuću tehniku ​​pipetiranja kako biste pomogli u ublažavanju aerosola.
Toksična isparenja
Ako radite sa isparljivim rastvaračima ili toksičnim supstancama, koristite efikasan laboratorijski sistem ventilacije da biste uklonili sva isparenja koja se mogu proizvesti.
Zapaljive tečnosti
Flex nije procijenjen za upotrebu sa zapaljivim tečnostima i ne bi se trebao koristiti sa zapaljivim tečnostima.

OPENTRONS FLEX

19

POGLAVLJE 1: UVOD

1.3 Usklađenost sa propisima
Opentrons Flex je usklađen sa svim primjenjivim zahtjevima sljedećih sigurnosnih i elektromagnetnih standarda.

Sigurnost
ID pravila IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051

Naslov
Sigurnosni zahtjevi za električnu opremu za mjerenje, upravljanje i laboratorijsku upotrebu Dio 1: Opšti zahtjevi
Posebni zahtjevi za laboratorijsku opremu za miješanje i miješanje

Elektromagnetna kompatibilnost

ID pravila EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Dio 15 Poddio B Klasa A IC ICES-003

Naslov
Električna oprema za mjerenje, kontrolu i laboratorijsku upotrebu Zahtjevi EMC Dio 1: Opšti zahtjevi Nenamjerni radijatori
Upravljanje spektrom i oprema koja uzrokuje smetnje u telekomunikacijama Standardna oprema informacijske tehnologije (uključujući digitalne aparate)

FCC upozorenja i bilješke
Upozorenje: Promjene ili modifikacije ove jedinice koje Opentrons nije izričito odobrio mogu poništiti korisnikovo ovlaštenje za korištenje opreme.
Ovaj uređaj je u skladu sa dijelom 15 FCC pravila. Operacija je podložna sljedećem:

20

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 1: UVOD
Ovaj uređaj možda neće uzrokovati štetne smetnje. Ovaj uređaj mora prihvatiti sve primljene smetnje, uključujući smetnje koje mogu uzrokovati neželjene
operacija.
Napomena: Ova oprema je testirana i utvrđeno je da je u skladu s ograničenjima za digitalne uređaje klase A, u skladu s dijelom 15 FCC pravila. Ova ograničenja su dizajnirana da pruže razumnu zaštitu od štetnih smetnji kada se oprema koristi u komercijalnom okruženju. Ova oprema stvara, koristi i može emitovati radiofrekvencijsku energiju i, ako nije instalirana i korištena u skladu s uputama za upotrebu, može uzrokovati štetne smetnje radio komunikacijama. Rad ove opreme u stambenom području vjerovatno će uzrokovati štetne smetnje u kom slučaju će korisnik biti dužan da ispravi smetnje o svom trošku.
Kanada ISED usklađenost
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Ovaj proizvod ispunjava važeće tehničke specifikacije Kanade za inovacije, nauku i ekonomski razvoj.
Le présent produit est conforme aux specifications techniques applicables d'Innovation, Sciences et Développement économique Canada.
Upozorenje na životnu sredinu
Upozorenje: Rak i reproduktivna šteta www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi pretcertifikacija
Wi-Fi modul je prethodno certificiran za upotrebu u mnogim regijama:
Sjedinjene Američke Države (FCC): FCC identifikator UAY-W8997-M1216 Evropski ekonomski prostor (CE): Nema javnog identifikatora (samodeklaracija) Kanada (IC): Identifikacioni broj verzije hardvera W8997-M1216 Japan (TELEC): Sertifikovani broj 020-170034 Indija (WPC): Registarski broj ETA-SD-20191005525 (samodeklaracija)

OPENTRONS FLEX

21

POGLAVLJE 2
Instalacija i preseljenje
Ovo poglavlje opisuje kako pripremiti svoju laboratoriju za Opentrons Flex, kako postaviti robota i kako ga premjestiti ako je potrebno. Prije nego što preuzmete svoj Flex, provjerite da li vaša laboratorija ili postrojenje ispunjavaju sve kriterije u odjeljku Sigurnosni i operativni zahtjevi. Kada dođe vrijeme da vaš Flex pokrenete i pokrenete, slijedite detaljna uputstva u odjeljcima Otpakivanje, Prvo pokretanje i Instalacija i kalibracija instrumenta ili koristite uslugu postavljanja podrške na licu mjesta Opentrons. A ako ikada trebate premjestiti svoj Flex na novu lokaciju, blizu ili dalje, slijedite korake u odjeljku Premještanje.
2.1 Sigurnosni i operativni zahtjevi
Gdje postaviti Opentrons Flex
Prostor je vrijedna roba u gotovo svakoj laboratoriji. Vašem Flexu će trebati nešto – ali ne previše, jer je dizajniran da stane na polovinu standardne laboratorijske klupe. Pobrinite se da imate prostor koji ispunjava sljedeće kriterije.
Površina klupe: Stacionarna, čvrsta, ravna, vodootporna površina. Stolovi ili klupe sa točkovima (čak i točkovi sa zaključavanjem) se ne preporučuju. Flex se brzo kreće i ima veliku masu, koja može potresti ili dovesti u neravnotežu lagane ili pokretne stolove.
Nosenje težine: Sam robot teži 88.5 kg (195 lb) i trebaju ga podizati samo dvije osobe koje rade zajedno. Postavite robota na površinu koja može lako izdržati njegovu težinu plus težinu bilo kojeg modula, laboratorijskog pribora, tekućina ili druge laboratorijske opreme koja će se koristiti u vašim aplikacijama.
Radni prostor: Osnovne dimenzije robota su 87 cm Š x 69 cm D x 84 cm V (oko 34″ x 27″ x 33″). Flexu je potrebno 20 cm (8″) bočnog i stražnjeg prostora za kablove, USB veze i za odvođenje izduvnih gasova iz modula koji griju i hlade.
Upozorenje: Ne postavljajte bočne ili stražnje strane Flex flush-a uz zid.

22

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE

84 cm 33 ″

87 cm 34 ″
Opentrons Flex dimenzije baze.

69 cm 27 ″

20 cm 8 ″

20 cm 8 ″

20 cm 8 ″

Top view Opentrons Flex-a, koji pokazuje minimalni bočni i stražnji zazor.

OPENTRONS FLEX

23

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE

Potrošnja energije
Opentrons Flex bi trebao biti spojen na zidnu utičnicu na ili blizu lokacije klupe na kojoj ga instalirate. Spojite Flex samo na kola koja mogu prihvatiti njegovu maksimalnu potrošnju energije:
Ulazna snaga: 36 VDC, 6.1 A Potrošnja u mirovanju: 30 W Tipična potrošnja: 40 W (tokom rada protokola) Maksimalna potrošnja: približno 50 W
Tačna potrošnja energije zavisi od:
Količina i tip pokreta koji se izvršava tokom protokola. Količina vremena koju robot provodi u mirovanju. Status lampica na robotu. Koliko je instrumenata priključeno.
Ne zaboravite uzeti u obzir drugu elektroniku koja troši energiju na istom kolu, uključujući Flex module s vlastitim izvorima napajanja. Za nprampDakle, Thermocycler modul ima maksimalnu potrošnju energije (630 W) koja je mnogo veća od samog Flex robota. Ako je potrebno, konsultujte menadžera vašeg objekta kako biste bili sigurni da ispunjava zahtjeve za napajanje vaše opreme.

Uslovi okoline
Uvjeti okoline za preporučenu upotrebu, prihvatljivu upotrebu i skladištenje variraju:

Preporučuje se za rad sistema

Prihvatljivo za rad sistema

Temperatura okoline +20 do +25 °C

+2 do +40 °C

Relativna vlažnost Visina

40%, bez kondenzacije
Približno 500 m nadmorske visine

30%, bez kondenzacije (ispod 80 °C)
Do 2000 m nadmorske visine

Skladištenje i transport
-10 do +60 °C
10%, bez kondenzacije (ispod 85 °C)
Do 2000 m nadmorske visine

24

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Opentrons je potvrdio performanse Opentrons Flex-a u uslovima preporučenim za rad sistema, a rad u tim uslovima treba da pruži optimalne rezultate. Flex je siguran za upotrebu u uslovima prihvatljivim za rad sistema, ali rezultati mogu varirati. Nemojte uključivati ​​ili koristiti Flex u uvjetima izvan tih granica. Uslovi skladištenja i transporta važe samo kada je robot potpuno isključen iz struje i druge opreme.
2.2 Raspakivanje
Čestitamo! Vaš Opentrons Flex je stigao i pripremili ste prostor za njega u svojoj laboratoriji. Otvorimo taj sanduk čudovišta, izvadimo robota i pripremimo ga za rad. Informacije u ovom odeljku pružaju listu delova i uputstva koja vas vode kroz korake potrebne da biste Flex raspakovali, postavili i pripremili za upotrebu. Podijelili smo proceduru podešavanja na tri dijela:
Prvi dio pokriva rastavljanje sanduka. Dio 1 pokriva odvajanje Flex-a od sanduka i njegovo premještanje na mjesto konačnog sklapanja. Treći dio pokriva završnu montažu i prvo uključivanje robota.
Potreban trud i vrijeme
Zamolićete partnera u laboratoriji da vam pomogne u procesu raspakiranja, podizanja, pomicanja i sastavljanja. Trebat ćete izdvojiti oko 30 minuta do sat vremena za ovaj napor.
Napomena: Flexu su potrebne dvije osobe da ga pravilno podignu. Također, podizanje i nošenje Flex-a za njegove ručke je najbolji način za pomicanje robota.
Sanduk i materijal za pakovanje
Raspakivanje Flex-a daje vam sjajnog robota, ali vam također ostaje nekoliko velikih sanduka zajedno s raznim komponentama za transport i podstavom. Iako možete odbaciti ovaj materijal, preporučujemo vam da zadržite ove predmete ako je dostupan prostor za pohranu. Pakovanje je za višekratnu upotrebu, što pomaže pripremiti vaš Flex za slanje ako ga ikada budete trebali poslati negdje drugdje (npr. na konferenciju ili novi objekat) u budućnosti.

OPENTRONS FLEX

25

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Elementi proizvoda
Flex se isporučuje sa dolje navedenim komponentama. Pipete, hvataljka i moduli dolaze u zasebnom pakovanju od glavnog Flex sanduka, čak i ako ste ih kupili zajedno kao radnu stanicu.

(1) Opentrons Flex robot

(1) USB kabl

(1) Kabl za napajanje

(1) Ethernet kabl

(5) L-ključevi (12 mm hex, 1.5 mm hex, 2.5 mm hex, 3 mm hex,
T10 Torx)

(1) Privjesak za zaustavljanje u nuždi

(1) Utor na palubi sa kopčama za laboratorijski pribor

(4) Rezervne kopče za laboratorijski pribor

(1) Sonda za kalibraciju pipete

(4) Ručke i kape za nošenje

(1) Gornja prozorska ploča

(4) Bočne prozorske ploče

(1) 2.5 mm imbus odvijač

(1) ključ od 19 mm

(16 + rezervni) Vijci za prozor (M4x8 mm ravna glava)
26

(10) Rezervni vijci sa utorima na palubi (M4x10 mm glava utora)

(12) Rezervni šrafovi za palubu (M3x6 mm glava sa utičnicom)

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Dio 1: Uklonite sanduk
Opentrons isporučuje vaš Flex u čvrstom sanduku od šperploče. Sanduk za transport koristi kuku i zasun clamps za pričvršćivanje gornje, bočne i donje ploče zajedno. Korištenje zasuna, umjesto eksera ili šrafova, znači da vam neće trebati poluga (ili puno sile) da rastavite sanduk, a možete ga ponovo sastaviti kasnije, ako je potrebno.
Napomena: Rubovi sanduka mogu biti hrapavi tokom transporta. Možda ćete htjeti koristiti radne rukavice da zaštitite ruke od krhotina drveta.
Da biste otpustili reze, okrenite jezičak zasuna prema gore i okrenite ga ulijevo (u smjeru suprotnom od kazaljke na satu). Ova akcija pomiče clamp ruku iz odgovarajućeg potpornog držača. Zatim možete odvojiti krak zasuna od sanduka.
1 Otključajte osam rezova koji drže vrh sa strane.

2 Uklonite gornju ploču nakon što otpustite reze.

OPENTRONS FLEX

27

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 3 Otvorite plavu vreću za transport, uklonite ove predmete iz podloge i ostavite ih po strani:
Korisnički komplet za napajanje, Ethernet i USB kablovi Privjesak za hitno zaustavljanje
4 Uklonite gornji dio pjenaste obloge kako biste otkrili prozorske ploče. Podstava štiti bočne i gornje ploče.
5 Uklonite prozorske ploče i ostavite ih na stranu. Ovo ćete priložiti kasnije.

28

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
6 Otključajte preostalih 16 rezova koji drže bočne ploče jednu za drugu i dno sanduka. 7 Uklonite bočne ploče i ostavite ih sa strane.
Dio 2: Otpustite Flex
Nakon dovršetka koraka u 1. dijelu, sada biste trebali vidjeti robota koji je u zaštitnoj vrećici i pričvršćen na narandžaste čelične komponente za montažu. Torba zatvara robota i štiti ga od vanjskog okruženja. Čelični nosači pričvršćuju robota na dno sanduka. Dva transportna okvira podržavaju robota, ravnomjerno raspoređujući njegovu težinu i držeći ga krutim kako se ne bi savijao tokom transporta. Nastavite da raspakujete Flex i skinite ga sa baze sanduka.
8 Koristeći ključ od 19 mm iz korisničkog kompleta, odvrnite držače sa dna sanduka. Možete odbaciti zagrade ili ih sačuvati za buduću upotrebu.

OPENTRONS FLEX

29

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 9 Povucite ili zarolajte vreću za transport do kraja kako biste otkrili cijelog robota.
10 Uz pomoć vašeg partnera u laboratoriji, zgrabite rukohvate u narandžastim okvirima za transport sa obe strane baze robota, podignite Flex sa baze sanduka i spustite ga na pod. Sačuvajte ili odbacite bazu sanduka i okvir za transport.

30

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 11 Koristeći 12 mm šesterokutni L-ključ iz korisničkog kompleta, uklonite četiri vijka koji drže transportne okvire za
the Flex. Sačuvajte ili odbacite okvire i vijke.
12 Uklonite četiri aluminijumske ručke iz korisničkog kompleta. Zašrafite ručke na ista mjesta na kojima su držani vijci okvira za transport od 12 mm.

OPENTRONS FLEX

31

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
13 Uz pomoć vašeg partnera u laboratoriji, podignite Flex za njegove ručke za nošenje i premjestite ga na radni sto radi konačnog sastavljanja.

Dio 3: Završno sastavljanje i uključenje
Nakon što premjestite Flex u privremeni radni prostor ili njegov stalni dom, vrijeme je da dovršite svoj novi robot.
14 Ako ste premjestili robota na njegovu konačnu, radnu lokaciju, uklonite ručke za nošenje i zamijenite ih završnim poklopcima. Poklopci zatvaraju otvore ručke u okviru i daju robotu čist izgled. Vratite ručke u korisnički komplet za skladištenje.

32

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
15 Uzmite gornju i bočnu ploču od pjene za pakovanje koju ste odložili nakon uklanjanja vrha sanduka.
16 Postavite panele prozora na Flex prateći informacije o oznakama na prednjoj zaštitnoj foliji. Zatim uklonite zaštitni film.
17 Koristeći zakošene šrafove za prozor i 2.5 mm odvijač iz korisničkog kompleta, pričvrstite prozorske ploče na Flex. Uvjerite se da su zakošene rupe (u obliku slova V) na prozorskim pločama okrenute prema van (prema vama). To omogućava da šrafovi prilegnu u ravninu s površinom prozora.

Upozorenje: Pogrešna orijentacija panela može dovesti do oštećenja. Prevelik moment zavrtnja može da napukne panele. Rukom zategnite zavrtnje sve dok prozorske ploče ne budu razumno učvršćene. Ovo nije ispitivanje snage.

OPENTRONS FLEX

33

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE 18 Koristeći 2.5 mm odvijač iz korisničkog kompleta, uklonite zavrtnje za zaključavanje sa portala. Ove
zavrtnji sprečavaju pomeranje portala dok je u transportu. Vijci za zaključavanje portala nalaze se: Na lijevoj bočnoj šini blizu prednjeg dijela robota. Ispod vertikalnog kraka portala. Na desnoj bočnoj šini blizu prednje strane robota u narandžastom nosaču. Ovdje su dva šrafa.
Portal se lako pomiče rukom nakon uklanjanja svih transportnih vijaka. 19 Odrežite i uklonite dvije gumene trake koje drže kantu za smeće na mjestu tokom transporta.

34

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
20 Priključite kabl za napajanje na Flex i uključite ga u zidnu utičnicu. Uvjerite se da na području palube nema prepreka. Okrenite prekidač za napajanje na stražnjoj lijevoj strani robota. Nakon uključivanja, portal se pomiče na svoju početnu lokaciju, a ekran osjetljiv na dodir prikazuje dodatne upute za konfiguraciju.

Sada kada je vaš Flex već iz kutije i spreman za rad, nastavite na odjeljak First Run u nastavku.
2.3 Prva vožnja
Izvršite osnovno podešavanje na ekranu osjetljivom na dodir prije povezivanja bilo kojeg drugog hardvera na vaš Flex. Robot će vas voditi kroz povezivanje na vašu laboratorijsku mrežu, ažuriranje na najnoviji softver i personalizaciju Flex-a dajući mu ime.
Uključite napajanje
Kada uključite Flex, Opentrons logo će se pojaviti na ekranu osjetljivom na dodir. Nakon nekoliko trenutaka, prikazat će se ekran “Dobro došli u vaš Opentrons Flex”.
Opentrons Flex ekran dobrodošlice. Ovaj ekran biste trebali vidjeti samo kada prvi put pokrenete svoj Flex.

OPENTRONS FLEX

35

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Povežite se na mrežu ili računar
Slijedite upute na ekranu osjetljivom na dodir da povežete svog robota kako bi mogao provjeriti ima li ažuriranja softvera i primiti protokol files. Postoje tri načina povezivanja: Wi-Fi, Ethernet i USB.

Opcije mrežnog povezivanja. Morate imati internet konekciju da biste postavili Flex. Wi-Fi: Koristite ekran osetljiv na dodir za povezivanje na Wi-Fi mreže koje su zaštićene WPA2 ličnom autentifikacijom (većina mreža koje zahtevaju samo lozinku za pridruživanje spadaju u ovu kategoriju).
Napomena: Flex ne podržava zatvorene portale (mreže koje nemaju lozinku, ali učitavaju a webstranica za autentifikaciju korisnika nakon povezivanja).
Možete se povezati i na otvorenu Wi-Fi mrežu, ali to se ne preporučuje.
Upozorenje: Povezivanje na otvorenu Wi-Fi mrežu omogućit će svakome u dometu mrežnog signala da kontrolira vaš Opentrons Flex robot bez autentifikacije.

Ako trebate da se povežete na Wi-Fi mrežu koja koristi autentifikaciju preduzeća (uključujući “eduroam” i slične akademske mreže koje zahtevaju korisničko ime i lozinku), prvo se povežite na Opentrons aplikaciju putem Etherneta ili USB-a da biste dovršili početno podešavanje. Zatim se povežite na Wi-Fi mrežu preduzeća u mrežnim postavkama za vaš Flex. Za pristup mrežnim postavkama:

36

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
1. Kliknite na Uređaji na lijevoj bočnoj traci aplikacije Opentrons. 2. Kliknite na meni sa tri tačke () za vaš Flex i odaberite Robot Settings. 3. Kliknite na karticu Umrežavanje.
Odaberite svoju mrežu iz padajućeg izbornika ili odaberite "Pridruži se drugoj mreži..." i unesite njen SSID. Odaberite metod provjere autentičnosti poduzeća koji koristi vaša mreža. Podržane metode su:
EAP-TTLS sa TLS EAP-TTLS sa MS-CHAP v2 EAP-TTLS sa MD5 EAP-PEAP sa MS-CHAP v2 EAP-TLS
Svaka od ovih metoda zahtijeva korisničko ime i lozinku, a ovisno o vašoj konfiguraciji mreže može biti potreban certifikat files ili druge opcije. Konsultujte IT dokumentaciju vašeg objekta ili kontaktirajte svog IT menadžera za detalje o podešavanju vaše mreže.
Ethernet: Povežite svog robota na mrežni prekidač ili čvorište pomoću Ethernet kabela. Takođe se možete povezati direktno na Ethernet port na vašem računaru, počevši od verzije robotskog sistema 7.1.0.
USB: Povežite priloženi USB A-to-B kabl na USB-B port robota i otvoreni port na vašem računaru. Koristite USB B-to-C kabl ili USB A-to-C adapter ako vaš računar nema USB-A port.
Da biste nastavili sa podešavanjem, povezani računar mora imati instaliranu i pokrenutu aplikaciju Opentrons. Za detalje o instaliranju Opentrons aplikacije, pogledajte odjeljak Instalacija aplikacije u poglavlju Softver i rad.
Instalirajte ažuriranja softvera
Sada kada ste se povezali na mrežu ili računar, robot može provjeriti ima li ažuriranja softvera i firmvera i preuzeti ih ako je potrebno. Ako postoji ažuriranje, može potrajati nekoliko minuta da se instalira. Kada se ažuriranje završi, robot će se ponovo pokrenuti.

OPENTRONS FLEX

37

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Pričvrstite privjesak za zaustavljanje u nuždi
Povežite priloženi privjesak za zaustavljanje u nuždi (E-stop) na pomoćni priključak (AUX-1 ili AUX-2) na stražnjoj strani robota.

Prije i nakon povezivanja privjeska za zaustavljanje u nuždi.
Priključivanje i omogućavanje E-stop je obavezno za priključivanje instrumenata i pokretanje protokola na Flex-u. Za više informacija o korištenju E-stop tokom rada robota, pogledajte odjeljak Privjesak za zaustavljanje u nuždi u poglavlju Opis sistema.
Dajte svom robotu ime
Imenovanje vašeg robota omogućava vam da ga lako prepoznate u svom laboratorijskom okruženju. Ako imate više Opentrons robota na vašoj mreži, obavezno im dajte jedinstvena imena. Nakon što potvrdite ime vašeg robota, bit ćete odvedeni na vašu Opentrons Flex Dashboard. Vjerovatno sljedeći korak koji ćete htjeti poduzeti je pričvršćivanje instrumenata, što je obrađeno u sljedećem odjeljku.
2.4 Instalacija i kalibracija instrumenta
Nakon početnog podešavanja robota, sljedeći korak je pričvršćivanje instrumenata na robota i njihovo kalibriranje.
Da biste instalirali instrument, prvo dodirnite Instruments na ekranu osjetljivom na dodir ili idite na odjeljak Pipete i moduli na ekranu detalja uređaja u aplikaciji Opentrons. Odaberite prazan nosač i odaberite Pričvrsti pipetu ili Pričvrsti hvataljku. Ako je nosač koji želite da koristite već zauzet, prvo morate da odvojite pipetu ili hvataljku.

38

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Napomena: Ukupan proces instalacije je isti bez obzira da li koristite ekran osetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons. Na kojem god uređaju da počnete kontrolirat će proces instalacije sve dok ga ne dovršite ili otkažete.
Ako počnete na ekranu osjetljivom na dodir, aplikacija će prikazati robota kao da je "zauzet". Ako počnete u aplikaciji, ekran osjetljiv na dodir će prikazati modalnu poruku koja označava da je instalacija instrumenta u toku.
Tačan proces instalacije varira u zavisnosti od instrumenta koji pričvršćujete, kao što je pokriveno u odeljcima ispod. Svi instrumenti imaju automatizovanu proceduru kalibracije koju treba izvršiti odmah nakon instalacije.
Ugradnja pipete
Kada instalirate pipetu, bit ćete vođeni kroz sljedeće korake na ekranu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons.
1. ODABERITE TIP PIPETE Odaberite između 1- ili 8-kanalne pipete i 96-kanalne pipete. Pričvršćivanje 96-kanalne pipete zahtijeva nekoliko dodatnih koraka jer se pričvršćuje na specijalnu montažnu ploču koja se proteže na oba držača pipete.
2. PRIPREMITE SE ZA INSTALACIJU Uklonite laboratorijski pribor sa palube i očistite radni prostor kako biste olakšali pričvršćivanje i kalibraciju. Takođe prikupite potrebnu opremu, kao što je sonda za kalibraciju, šestougaoni odvijač i ploča za montažu (za 96-kanalnu pipetu).
3. POVEZITE I OSIGURITE PIPETU Portal će se pomeriti na prednji deo robota kako biste mogli da pričvrstite pipetu.
1- i 8-kanalne pipete se spajaju direktno na držač za pipete. 96-kanalna pipeta zahtijeva montažnu ploču. Da biste pričvrstili montažnu ploču, prvo morate odspojiti nosač z-ose za desni nosač pipete.

OPENTRONS FLEX

39

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Spojite pipetu na odabrani nosač pipete i pričvrstite zavrtnje.
4. POKRENI AUTOMATSKU KALIBRACIJU Da biste kalibrirali pipetu, pričvrstite sondu za kalibraciju na odgovarajuću mlaznicu pipete. Pipeta će se automatski pomaknuti da dodirne određene tačke na palubi i sačuvati ove kalibracione vrijednosti za buduću upotrebu. Kada se kalibracija završi i kada uklonite sondu, pipeta će biti spremna za upotrebu u protokolima.
Ugradnja hvataljke
Kada instalirate hvatač, bit ćete vođeni kroz sljedeće korake na ekranu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons.
1. PRIPREMITE SE ZA INSTALACIJU Uklonite laboratorijsko posuđe sa palube i očistite radni prostor kako biste olakšali pričvršćivanje i kalibraciju. Također skupite potreban šestougaoni odvijač i uvjerite se da je igla za kalibraciju u svom skladišnom prostoru na hvataljci.
2. PRIKLJUČITE I Osigurajte hvataljku Portal će se pomaknuti na prednji dio robota tako da možete pričvrstiti hvataljku. Spojite hvataljku na držač produžetka i pričvrstite njegove vijke.
3. POKRENI AUTOMATSKU KALIBRACIJU Da biste kalibrirali hvataljku, umetnite kalibracijsku iglu u prednju čeljust. Hvatalica će se automatski pomaknuti da dodirne određene točke na palubi i sačuvati ove kalibracijske vrijednosti za buduću upotrebu. Zatim ponovite isti postupak sa kalibracionim klinom u zadnjoj čeljusti. Kada se kalibracija završi i vratite iglu na mjesto skladištenja, hvataljka će biti spremna za upotrebu u protokolima.
2.5 Preseljenje
Ovaj odjeljak pruža savjete i upute o tome kako premjestiti Opentrons Flex robota na kratke i velike udaljenosti.

40

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Kratki potezi
Kratak potez se proteže na niz udaljenosti od „hajde da ga malo pomaknemo“ do preko laboratorije, niz hodnik ili drugi sprat u vašoj zgradi. U tim slučajevima možete ručno pomicati svoj Flex. Prevoz na ručnim kolicima je takođe dobra opcija.
Upozorenje: Flex je težak 88.5 kg. Kao rezultat toga, potrebno je dvoje ljudi da ga bezbedno podignu i pomeraju.
Ponovo pričvrstite ručke za podizanje da premjestite svoj Flex na novu, obližnju lokaciju. Podizanje i nošenje Flex-a za njegove ručke je pravi način za pomicanje robota na kratke udaljenosti. Uklonite ručke i spremite ih u korisnički komplet nakon završetka premještanja. Kako biste spriječili oštećenje robota, uvijek koristite ručke za podizanje da ga podignete i pomjerite. Nemojte hvatati okvir da biste podigli ili pomjerili svog robota.
Selidbe na velike udaljenosti
Selidba na daljinu transportuje vaš Flex sa terena vašeg univerziteta, ustanove ili institucije. Preko grada, u novi grad, državu, pokrajinu ili državu, svi su bivšiampleze na daljinu. U tom slučaju, morat ćete spakovati Flex kako biste ga zaštitili od elemenata, udaraca i grubih pokreta koji se mogu pojaviti tijekom transporta.
Ako ste zadržali sanduk za transport i unutrašnje potpore koje ste dobili uz vaš Flex, možete ga prepakirati u ove materijale za selidbu na velike udaljenosti. Slijedite korake raspakiranja obrnutim redoslijedom kako biste pripremili svoj Flex za selidbu na velike udaljenosti. U osnovi, trebali biste:
Isključite kabl za napajanje i mrežni kabl, ako je priključen. Uklonite sav priključen hardver i laboratorijski pribor. Ponovo pričvrstite palubne ploče. Zaključajte portal (pogledajte odjeljak Opći savjeti za selidbu ispod). Uklonite i spremite prozorske ploče.
Ako ste zadržali originalni sanduk:
Ponovo pričvrstite transportni okvir na Flex i pričvrstite ga za bazu palete pomoću L-nosača. Dodajte podlogu i ponovo sastavite sanduk za transport.

OPENTRONS FLEX

41

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Ako nemate originalni sanduk i pripadajući materijal, kontaktirajte renomiranu špeditersku kompaniju. Oni mogu upravljati procesom pakiranja, transporta i isporuke umjesto vas.
Opšti saveti o selidbi
ISKLJUČITE NAPAJANJE I MREŽNE KABLOVE Prije nego što premjestite svoj Flex, ne zaboravite: Isključite napajanje i izvucite utikač iz napajanja. Odspojite Ethernet ili USB kabel, ako se koristi.
ZAKLJUČAVANJE GANTRYA Pre nego što pomerite svoj Flex, ponovo umetnite zavrtnje za zaključavanje kako biste držali portal na mestu. Tačke za zaključavanje portala nalaze se: Na lijevoj bočnoj šini blizu prednjeg dijela robota. Ispod vertikalnog kraka portala. Na desnoj bočnoj šini blizu prednjeg dijela robota. Za zaključavanje ovog dijela portala potrebno je malo
narandžasti držač i dva zavrtnja za zaključavanje.

42

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
POČETNA GANTRY Možda nećete htjeti zaključati portal ako samo premještate robota na obližnju lokaciju. Ako odlučite da ga ne zaključate, barem koristite ekran osjetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons da pošaljete portal u početnu poziciju prije nego što ga isključite. Da biste vratili kućište preko ekrana osetljivog na dodir, dodirnite meni sa tri tačke (), a zatim tapnite na Home gantry. Da biste vratili portal preko Opentrons aplikacije: Kliknite na Uređaji. Kliknite na vaš Flex na listi uređaja. Kliknite na meni sa tri tačke (), a zatim kliknite na Home gantry.
UKLONITE MODULE Moduli u palubi i drugi dodaci dodaju dodatnu težinu vašem Flexu. Oni također utiču na centar gravitacije robota, zbog čega se može osjećati "na kipu" prilikom podizanja. Kako biste olakšali i izbalansirali robota, uklonite sve priključene instrumente i laboratorijski pribor prije nego što ga podignete.
PONOVNO INSTALACIJTE SLOTS NA PALU Preporučamo da ponovo pričvrstite utore na palubi za kretanje na velike udaljenosti. Osiguravanje utora na njihovim originalnim lokacijama pomaže u sprječavanju slučajnog gubitka. Ponovno pričvršćivanje utora na palubi za kratke pokrete po laboratoriji nije obavezno.
REKALIBRACIJA NAKON PREMJEŠTANJA Trebali biste ponovo kalibrirati sve instrumente i module nakon što ih ponovo instalirate. Za više detalja o kalibraciji modula, pogledajte poglavlje Moduli.

OPENTRONS FLEX

43

POGLAVLJE 2: INSTALACIJA I PREMJEŠTANJE
Završne misli o selidbi
Vaš Flex je čvrsta i dobro izgrađena mašina, ali je takođe i precizan naučni instrument dizajniran za precizne tolerancije. Kao rezultat toga, trebali biste s njim postupati pažljivo kada ga premještate unutar vašeg lokalnog radnog područja ili ga šaljete širom zemlje. To znači slijediti smjernice koje su ovdje navedene i koristiti vlastiti zdrav razum o tome kako transportirati skupi komad laboratorijske opreme. Zaključak: kada pomičete svoj Flex, pogriješite na strani opreza i dodatnih podstava.
Ako imate pitanja ili nedoumica oko premještanja vašeg Flex-a, kontaktirajte nas na support@opentrons.com.

44

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3
Opis sistema

Ovo poglavlje opisuje hardverske sisteme Opentrons Flex-a, koji su u osnovi njegovih osnovnih funkcija automatizacije laboratorije. Nosači za palubu, portal i instrumente Opentrons Flex-a omogućavaju upotrebu preciznih komponenti za rukovanje tekućinom i laboratorijskim priborom. Ekran osjetljiv na dodir na uređaju omogućava pokretanje protokola i provjeru statusa robota bez potrebe da donosite računar na laboratorijsku klupu. Žičano i bežično povezivanje omogućava dodatnu kontrolu iz aplikacije Opentrons (pogledajte poglavlje Softver i rad za više detalja) i proširenje karakteristika sistema priključivanjem perifernih uređaja (pogledajte poglavlje Moduli).

3.1 Fizičke komponente

Kamera

Status Light

Touchscreen

Okvir

Gantry Deck
Prednja vrata
Lokacije fizičkih komponenti Opentrons Flex-a.

Poklopci ručke bočnih prozora

OPENTRONS FLEX

45

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Okvir i kućište
Okvir Opentrons Flex robota pruža krutost i strukturnu podršku za njegovu palubu i portal. Svi mehanički podsistemi su smješteni i montirani na glavni okvir. Okvir je izrađen prvenstveno od limova i aluminijumskih ekstruzija.
Metalni okvir ima otvore za bočne prozore i ulazna vrata od prozirnog polikarbonata koja vam omogućavaju da vidite šta se dešava u Flex-u. Šarke prednjih vrata se otvaraju za pristup unutrašnjosti sistema. Sa otvorenim prednjim vratima, možete pričvrstiti instrumente, module i pribor za palubu; pripremiti špil prije protokola; ili manipulisati stanjem deka tokom protokola.
Bijele LED trake na unutrašnjim gornjim ivicama okvira pružaju softverski kontrolirano ambijentalno osvjetljenje. Kamera od 2 megapiksela može fotografisati palubu i radni prostor za snimanje i praćenje izvršavanja protokola.

Paluba i radni prostor
Paluba je mašinski obrađena aluminijumska površina na kojoj se izvršavaju automatizovani naučni protokoli. Dek ima 12 glavnih slotova ANSI/SLAS formata koji se mogu rekonfigurisati za držanje laboratorijskog pribora, modula i potrošnog materijala. Prorezi na palubi su identifikovani koordinatnim sistemom, sa utorom A1 pozadi levo i utorom D3 napred desno.

Utor za proširenje (za termocikler) Radna površina

Staging area

Područja palube unutar Flexa.

46

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
Radni prostor je fizički prostor iznad palube koji je dostupan za pipetiranje. Laboratorijski pribor postavljen u proreze A1 do D3 nalazi se u radnom području.
Opentrons Flex dolazi sa uklonjivim utorima na palubi za svih 12 pozicija u radnom području. Svaki utor na palubi ima ugaone kopče za laboratorijski pribor za sigurno postavljanje laboratorijskog pribora na palubu.
Možete rekonfigurirati palubu zamjenom utora s drugim elementima na palubi, uključujući pokretno smeće, otvor za otpad i nosače modula. Utor za proširenje iza A1 koristi se samo za stvaranje dodatnog prostora za modul Thermocycler, koji zauzima utore A1 i B1.
Napomena: Prorezi na palubi su zamenljivi unutar kolone (1, 2 ili 3), ali ne i preko kolona; Prorezi stupca 1 i stupca 3 su različiti dijelovi uprkos njihovoj sličnoj veličini. Možete odrediti u koju kolonu ulazi slot tako što ćete orijentirati plavu kopču laboratorijskog pribora pozadi lijevo.
Trebali biste ostaviti utore na palubi instalirane na lokacijama na koje želite postaviti samostalni laboratorijski pribor. Paluba i predmeti postavljeni na nju ostaju statični, osim ako se ne pomaknu hvataljkom ili ručnom intervencijom.
Staging area
The stagPodručje je dodatni prostor uz desnu stranu palube. Na ovoj lokaciji možete pohraniti laboratorijski pribor nakon instalacije stagslotova za područje. Labware postavljen u utore A4 do D4 nalazi se u staging area. Flex pipete ne mogu doprijeti u stagali hvataljka može pokupiti i premjestiti laboratorijski pribor na i sa ove lokacije. Dodavanje dodatnih slotova pomaže da radna oblast bude dostupna za opremu koja se koristi u vašim automatizovanim protokolima.
StagSlotovi za područje uključeni su u određene konfiguracije radnih stanica i također su dostupni za kupovinu na https://shop.opentrons.com.

OPENTRONS FLEX

47

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Staging Area sa instaliranim slotovima

Deck fixtures
Učvršćenja su hardverski elementi koji zamjenjuju standardne utore na palubi. Omogućuju vam da prilagodite raspored palube i dodate funkcionalnost vašem Flexu. Trenutno, oprema na palubi uključuje stagotvore za područje, unutrašnju kantu za smeće i vanjski otvor za otpad. Možete instalirati samo uređaje u nekoliko specifičnih slotova na palubi. Sljedeća tabela navodi lokacije na palubi za svaki uređaj.

Učvršćenje Stagotvore za područje Kanta za smeće Oluk za otpad Oluk za otpad sa stagutor za područje

Slotovi A3D3 A1D1 i A3-D3 D3 samo D3

Uređaji su bez napajanja. Ne sadrže elektronske ili mehaničke komponente koje robotu prenose svoje trenutno stanje i lokaciju na palubi. To znači da morate koristiti funkciju konfiguracije palube kako biste Flexu obavijestili koji su elementi pričvršćeni na palubu i gdje se nalaze.

48

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Postavkama konfiguracije deka možete pristupiti sa ekrana osjetljivog na dodir preko menija s tri tačke () i iz Opentrons aplikacije. Pogledajte odeljak Konfiguracija deka u poglavlju Softver i rad za informacije o tome kako da konfigurišete dek sa ekrana osetljivog na dodir.

Kanal za otpad
Opentrons Flex Waste Chute prenosi tečnosti, vrhove, stalke za vrhove i ploče sa bunarima iz Flex kućišta u kontejner za smeće postavljen ispod njegovog spoljašnjeg otvora. Kanal za otpad se pričvršćuje na adapter palubne ploče koji se uklapa u utor D3. Također dolazi sa posebnim prozorskim polupanelom koji omogućava da se žlijeb proteže iz prednjeg dijela robota.
Komponente žlijeba za otpad.

Adapter za pokrovnu ploču

Waste Chute
Adapter za palubnu ploču sa Staging area

Staging area slotovi
StagUtori za područje su ANSI/SLAS kompatibilni dijelovi palube koji zamjenjuju standardne proreze u koloni 3 i dodaju nove utore u staging area — sve bez gubitka prostora u radnom prostoru. Možete instalirati jedan ili najviše četiri utora da biste kreirali novu kolonu (A4 do D4) duž desne strane špila. Imajte na umu, međutim, da zamjena utora A3 na palubi zahtijeva pomicanje kante za smeće. Dodavanjem stagImajući utore za područje na palubi, vaš Flex robot može pohraniti više laboratorijskog pribora i raditi efikasnije.

OPENTRONS FLEX

Flex stagutor za područje.
49

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
INSTALACIJA SLOTA
Da biste instalirali, uklonite zavrtnje koji pričvršćuju standardni utor na palubu i zamijenite ga stagutor za područje. Nakon instalacije, koristite ekran osjetljiv na dodir ili aplikaciju Opentrons da kažete robotu da ste ga dodali kaotagotvor za područje na palubi.
Instaliranje kaotagutor za područje.

KOMPATIBILNOST SLOTA StagUtori za područje su kompatibilni sa Flex instrumentima, modulima i laboratorijskim priborom navedenim u nastavku.

Flex komponenta Gripper pipete Moduli
Labware

Stagkompatibilnost područja
Flex Gripper može pomicati laboratorijski pribor u ili iz staging area slotovi.
Flex pipete ne mogu doći do staging area. Upotrijebite hvataljku za pomicanje nosača za vrhove i laboratorijskog pribora iz stagu radnom području prije pipetiranja.
Magnetski blok GEN1 se može postaviti u kolonu 3 na vrhu kaotagutor za područje. Moduli nisu podržani u koloni 4.
Moduli sa napajanjem kao što su grijač-tresač i temperaturni modul uklapaju se u nosače koji se mogu postaviti u kolonu 3. Ne možete dodati kaotagutor za područje na poziciju koju zauzima nosač modula.
StagProrezi za područje imaju iste ANSI/SLAS dimenzije kao i standardni slotovi na palubi. Koristite laboratorijski pribor kompatibilan sa hvataljkama u stagili ručno dodajte i uklonite laboratorijski softver sa ove lokacije.

50

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
Sistem kretanja
Na ram je pričvršćen portal, koji je sistem za kretanje i pozicioniranje robota. Portal se pomiče odvojeno duž x- i y-ose kako bi pozicionirao pipete i hvatač na precizne lokacije za izvršavanje protokola. Kretanje duž ovih osa je precizno do najbližih 0.1 mm. Portalom upravljaju 36 VDC hibridni bipolarni koračni motori. Zauzvrat, na portalu su pričvršćeni nosači za pipete i nosač za produžetak. Oni se pomiču duž z-ose kako bi postavili pipete i hvatač na precizne lokacije za izvršavanje protokola. Kretanje duž ove ose kontroliraju 36 VDC hibridni bipolarni koračni motori. Elektronika sadržana u portalu obezbeđuje napajanje od 36 VDC i komunikaciju sa pipetama i hvataljkom, kada su pričvršćeni.
Gantry

Držači za pipete

Extension Mount

Položaj nosača instrumenata na Flexu.

Touchscreen i LED displeji
Primarni korisnički interfejs je 7-inčni LCD ekran osetljiv na dodir, koji se nalazi na prednjoj desnoj strani robota. Ekran osjetljiv na dodir je prekriven Gorilla Glass 3 staklom za otpornost na ogrebotine i oštećenja. Pristupite mnogim funkcijama Flex-a direktno na ekranu osjetljivom na dodir, uključujući:

OPENTRONS FLEX

51

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Upravljanje protokolom Podešavanje, izvršavanje i nadgledanje protokola Upravljanje laboratorijskim softverom Postavke robota Ažuriranja sistemskog softvera i firmvera Dnevnici operacija i obavijesti o greškama
Za više informacija o korišćenju Flex-a preko ekrana osetljivog na dodir, pogledajte odeljak Operacija ekrana osetljivog na dodir u poglavlju Softver i rad.
Statusno svjetlo je traka LED dioda duž gornje prednje strane robota koja pruža informacije o robotu na prvi pogled. Različite boje i obrasci osvjetljenja mogu prenijeti različita stanja uspjeha, neuspjeha ili stanja mirovanja:

LED boja Bijela Neutralna stanja
Zelena Normalna stanja
Plava Obavezna stanja Žuta Abnormalna stanja Crvena Hitna stanja

LED uzorak Solid Pulsing
Trepće dvaput
Čvrsto pulsirajuće pulsiranje

Status robota
Uključen i ne pokreće protokol Robot je zauzet (npr. ažuriranje softvera ili firmvera, postavljanje pokretanja protokola, otkazivanje pokretanja protokola) Radnja je završena (npr. protokol je pohranjen, softver ažuriran, instrument priključen ili odvojen) Protokol je pokrenut Protokol je završen Protokol je pauziran

Solid

Softverska greška

Trepće tri puta, više puta

Fizička greška (npr. pad instrumenta)

Statusno svjetlo se također može onemogućiti u postavkama robota.

52

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
3.2 Pipete
Opentrons pipete su konfigurabilni uređaji koji se koriste za kretanje tečnosti kroz radnu oblast tokom izvršavanja protokola. Postoji nekoliko Opentrons Flex pipeta, koje mogu podnijeti zapremine od 1 µL do 1000 µL u 1, 8 ili 96 kanala:
Opentrons Flex 1-kanalna pipeta (1 µL) Opentrons Flex 50-kanalna pipeta (1 µL) Opentrons Flex 5-kanalna pipeta (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanalna pipeta (1 50 µL) Opentrons Flex 8-kanalna pipeta (5 µL) 1000µL
Pipete se pričvršćuju na portal pomoću šrafova na prednjoj strani pipete. 1-kanalne i 8-kanalne pipete zauzimaju po jedan nosač pipete (lijevo ili desno); 96-kanalna pipeta zauzima oba nosača. Za detalje o instaliranju pipeta pogledajte Instalacija i kalibracija instrumenta.

Captive Attachment
Vijci

Zavrtnji za pričvršćivanje

Ejektor

Mlaznice (zamjenjivi O-prstenovi)

Mlaznice (fiksni O-prstenovi)

Lokacije komponenti 1-, 8- i 96-kanalnih pipeta.

Ejektor

OPENTRONS FLEX

53

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Pipete preuzimaju plastične vrhove za jednokratnu upotrebu tako što ih pritiskaju na mlaznice pipete, a zatim koriste vrhove za aspiraciju i doziranje tekućina. Količina ukupne sile potrebne za podizanje raste kako se više vrhova istovremeno pokupi. Za manji broj vrhova, pipeta pričvršćuje vrhove guranjem svake mlaznice pipete prema dolje u vrh. Da bi se postigla potrebna sila za pokupiti punu stalku vrhova, 96-kanalna pipeta također povlači vrhove prema gore na mlaznice. Ova akcija povlačenja zahtijeva postavljanje stalka za vrhove u adapter stalka za vrhove, a ne direktno u utor na palubi. Da biste odbacili vrhove (ili ih vratili u stalak), mehanizam za izbacivanje pipete gura vrhove sa mlaznica.

Specifikacije pipete
Opentrons Flex pipete su dizajnirane za rad sa širokim rasponom volumena. Zbog svog širokog raspona, mogu koristiti više veličina vrhova, što utiče na njihove karakteristike rukovanja tekućinom. Opentrons je testirao Flex pipete na tačnost i preciznost u brojnim kombinacijama vrha i zapremine tečnosti:

Pipeta
Flex 1-kanalni
50 µL
Flex 1-kanalni
1000 µL
Flex 8-kanalni
50 µL
Flex 8-kanalni
1000 µL

Kapacitet vrha 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Testirani volumen 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

Preciznost %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%

Preciznost %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%

54

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Flex 96-kanalni
1000 µL

50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL

10.00% 2.50% 1.50% 1.50%

5.00% 1.25% 1.25% 1.50%

Imajte na umu ove informacije o točnosti kada birate vrhove za svoju pipetu. Općenito, za najbolje rezultate trebate koristiti najmanje savjete koji zadovoljavaju potrebe vašeg protokola.

Napomena: Opentrons vrši volumetrijsko testiranje Flex pipeta kako bi osigurao da ispunjavaju gore navedene specifikacije za tačnost i preciznost. Ne morate kalibrirati količinu koju vaše pipete doziraju prije upotrebe. Potrebno je samo izvršiti kalibraciju položaja. Pogledajte sljedeći odjeljak, kao i odjeljak Instalacija pipete u poglavlju Instalacija i premještanje, za detalje.
Usluge Opentrons Care i Opentrons Care Plus uključuju godišnju zamjenu pipeta i certifikate o kalibraciji. Za detalje pogledajte odjeljak Servising Flex u poglavlju Održavanje i servis.

Kalibracija pipete
Korisnički komplet uključuje sondu za kalibraciju metalne pipete koju koristite tokom pozicijske kalibracije. Tokom izvođenja protokola, bezbedno odložite sondu na magnetni držač na prednjem stubu robota. Tokom procesa kalibracije, pričvrstite sondu na odgovarajuću mlaznicu i zaključajte je na mjestu. Robot pomiče sondu do kalibracionih tačaka na palubi kako bi izmjerio tačan položaj pipete.
Adapter nosača vrha pipete
Opentrons Flex 96-kanalna pipeta se isporučuje sa četiri adaptera za stalku za vrh. Ovo su precizno oblikovani aluminijumski nosači koje postavljate na palubu. Adapteri drže Flex 50 L, 200 L i 1000 µL nosača za vrhove.

OPENTRONS FLEX

55

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
Zbog uključene sile, 96-kanalnoj pipeti je potreban adapter da bi pravilno pričvrstio stalak za pun vrh. Tokom postupka pričvršćivanja, pipeta se kreće preko adaptera, spušta se na igle za montiranje i povlači vrhove na pipete podizanjem adaptera i nosača za vrhove. Povlačenje vrhova, umjesto guranje, pruža polugu potrebnu za pričvršćivanje vrhova za pipete i sprječava savijanje površine palube. Kada završi, 96-kanalna pipeta spušta adapter i prazan stalak za vrh na palubu. Za više informacija pogledajte odjeljak Savjeti i stalke za savjete u poglavlju Labware.
Djelomično preuzimanje napojnice
96-kanalna pipeta može pokupiti cijeli stalak vrhova ili manji broj vrhova. Ovo povećava broj aplikacija koje možete izvršiti s 96-kanalnom pipetom, budući da zauzima oba držača pipete.
Trenutno, 96-kanalna pipeta podržava djelomično hvatanje vrha za 8 vrhova u kolonskom rasporedu. U ovoj konfiguraciji, pipeta ili koristi svoje krajnje lijeve mlaznice da pokupi vrhove zdesna nalijevo sa stalka za vrh, ili svoje krajnje desne mlaznice da pokupi vrhove slijeva nadesno sa stalka za vrhove.
Kada uzimate manje od 96 vrhova sa stalka za vrhove, stalak se mora postaviti direktno na palubu, a ne u adapter stalka za vrhove.
Senzori za pipete
Opentrons Flex pipete imaju niz senzora koji detektuju i bilježe podatke o statusu pipete i svim savjetima koje je pokupila.
SENZORI KAPACITETA
U kombinaciji s metalnom sondom ili provodljivim vrhom, senzori kapacitivnosti otkrivaju kada pipeta dođe u kontakt s nečim. Detekcija kontakta između metalne sonde i deka se koristi u procesima automatske kalibracije pipete i kalibracije modula.
1-kanalne pipete imaju jedan senzor kapacitivnosti, dok višekanalne pipete imaju dva: na kanalima 1 i 8 8-kanalne pipete i na kanalima 1 i 96 (pozicije A1 i H12) 96-kanalne pipete.

56

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

SENZORI PRISUTNOSTI OPTIČKOG VRHA
Prekidač fotoprekidača detektuje položaj mehanizma za izbacivanje vrha pipete, potvrđujući da li su vrhovi uspešno podignuti ili ispušteni. 1-kanalne, 8-kanalne i 96-kanalne pipete imaju jedan optički senzor koji prati pričvršćenost vrha na svim kanalima.
Ažuriranja firmvera pipete
Opentrons Flex automatski ažurira firmver pipete kako bi bio sinhronizovan sa verzijom softvera robota. Ažuriranja firmvera pipete su obično brza i dešavaju se kad god:
Priključujete pipetu. Robot se ponovo pokreće.
Ako se, iz bilo kojeg razloga, verzije firmvera pipete i softvera robota pokvare, možete ručno ažurirati firmver u aplikaciji Opentrons.
1. Kliknite na Uređaji. 2. Kliknite na vaš Flex na listi uređaja. 3. Pod Instrumenti i moduli, pipeta koja nije sinhronizirana će pokazati natpis upozorenja
“Dostupno ažuriranje firmvera.” Kliknite Ažuriraj sada da započnete ažuriranje.
Možeš view trenutno instaliranu verziju firmvera bilo koje priključene pipete. Na ekranu osjetljivom na dodir idite na Instruments i dodirnite naziv pipete. U aplikaciji Opentrons pronađite karticu za pipetu pod Instrumenti i moduli, kliknite na meni sa tri tačke (), a zatim kliknite na About pipete.

3.3 Hvataljka
Hvatalica pomiče laboratorijski pribor po radnom području i staging oblasti tokom izvršavanja protokola. Hvatalica se pričvršćuje na produžni nosač, koji je odvojen od držača za pipete; hvataljka se može koristiti sa bilo kojom konfiguracijom pipete. Za detalje o instaliranju hvataljke pogledajte Instalacija i kalibracija instrumenta.
Hvatalo može pomicati laboratorijski pribor preko palube i na module ili izvan njih. Hvatalo može manipulisati određenim pločama sa potpuno obloženim bunarima, pločama dubokih bunara i nosačima za vrhove. Za više detalja o tome koji laboratorijski pribor hvataljka može pomicati, pogledajte odjeljak Labware i Opentrons Flex Gripper poglavlja Labware ili konsultujte Opentrons Labware Library.

OPENTRONS FLEX

57

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Specifikacije hvataljke
Čeljusti izvode primarni pokret hvataljke, a to je otvaranje ili zatvaranje dva paralelna lopatica kako bi se primijenila ili oslobodila sila na stranama laboratorijskog pribora. Kretanje čeljusti kontroliše 36 VDC brušeni motor spojen na sistem zupčanika.
Za pomicanje komada laboratorijskog pribora koji je zahvaćen čeljustima, portal podiže hvatač duž z-ose, pomiče ga bočno, a zatim ga spušta u novi položaj laboratorijskog pribora.
Lokacije komponenti hvataljke.

Vijci za pričvršćivanje
Kalibraciona igla Čeljusti lopatica

Kalibracija hvataljke
Hvatalica uključuje metalni kalibracioni klin. Kalibraciona igla se nalazi u udubljenom prostoru za odlaganje na donjem dijelu hvataljke. Magnet drži iglu na mjestu. Da biste uklonili iglu za kalibraciju, uhvatite je prstima i lagano povucite. Da biste zamijenili iglu, vratite je u otvor za pohranu. Znat ćete da je siguran kada sjedne na svoje mjesto.
Kada kalibrirate hvataljku, pričvrstite zatik na svaku čeljust naizmjence. Robot pomiče iglu do kalibracionih tačaka na palubi kako bi izmjerio tačan položaj hvataljke.
Tokom izvođenja protokola, stavite iglu u prostor za skladištenje radi bezbednog čuvanja. Kontaktirajte nas na support@opentrons.com ako izgubite iglu za kalibraciju.

Ažuriranja firmvera hvataljke
Opentrons Flex automatski ažurira firmver hvataljke kako bi bio sinhronizovan sa verzijom softvera robota. Ažuriranja firmvera hvataljke su obično brza i dešavaju se kad god:

58

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
Pričvrstite hvataljku. Robot se ponovo pokreće.
Ako, iz bilo kojeg razloga, verzije firmvera hvataljke i softvera robota ponesu sinhronizirane, možete ručno ažurirati firmver u aplikaciji Opentrons.
1. Kliknite na Uređaji. 2. Kliknite na vaš Flex na listi uređaja. 3. Pod Instrumenti i moduli, hvataljka koja nije sinhronizirana će pokazati natpis upozorenja
“Dostupno ažuriranje firmvera.” Kliknite Ažuriraj sada da započnete ažuriranje.
Možeš view trenutno instaliranu verziju firmvera hvataljke. Na ekranu osjetljivom na dodir idite na Instrumenti i dodirnite hvataljku. U aplikaciji Opentrons pronađite karticu za hvatanje u okviru Instrumenti i moduli, kliknite na meni sa tri tačke (), a zatim kliknite na About gripper.
3.4 Privjesak za zaustavljanje u nuždi
Privjesak za zaustavljanje u nuždi (E-stop) je namjensko hardversko dugme za brzo zaustavljanje kretanja robota. Opentrons Flex zahtijeva funkcionalan, isključen E-stop koji će biti pričvršćen u svakom trenutku. Kada pritisnete dugme za zaustavljanje, Flex poništava bilo koji protokol u toku ili radni tok podešavanja što je brže moguće i sprečava većinu pokreta robota.
Kada koristiti E-stop
Možda ćete morati pritisnuti E-stop:
Kada postoji neposredna opasnost od ozljede ili ozljede korisnika. Kada postoji neposredna opasnost od oštećenja robota ili drugog hardvera. Kada samppredmeti ili reagensi su u neposrednoj opasnosti od kontaminacije. Nakon hardverske kolizije.
Idealno bi bilo da nikada ne morate pritisnuti E-stop (osim tokom retkih testiranja kvaliteta hardvera).
Nemojte koristiti E-stop za otkazivanje normalnih, očekivanih operacija. Umjesto toga, koristite softversko dugme na ekranu osetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons. Pauziranje putem softvera će vam omogućiti da nastavite ili otkažete svoj protokol, dok pritiskom na E-stop uvijek odmah otkazujete protokol.

OPENTRONS FLEX

59

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Uključivanje i otpuštanje E-stop
E-stop ima mehanizam za uključivanje i otpuštanje.
Uključite: Čvrsto pritisnite crveno dugme. Flex će ući u zaustavljeno stanje. Riješite: Jednom zaustavljen, bezbedno rešite sve probleme u radnom području, kao što je čišćenje izlivanja,
uklanjanje laboratorijskog pribora ili pomicanje portala (treba da se kreće slobodno i lako rukom). Otpuštanje: Okrenite dugme u smeru kazaljke na satu. Iskočiće u svoju isključenu poziciju. Resetovanje: Na ekranu osetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons, potvrdite da ste spremni da se Flex nastavi
kretanje. Portal će se vratiti u svoju početnu poziciju i aktivnost modula će se nastaviti.
U zaustavljenom stanju, Flex i povezani hardver će se ponašati na sljedeći način:

Hardverske portalne pipete
Gripper
Modul grijača-tresača
Temperaturni modul Modul termociklera Statusna lampica Ekran na dodir

Ponašanje
Automatsko horizontalno kretanje je zaustavljeno. Dozvoljeno je ručno horizontalno kretanje.
Zaustavljeno je vertikalno kretanje pipeta. Kočnice motora na vertikalnim osovinama su uključene radi sprečavanja
pipete od pada. Zaustavljeno je kretanje klipa i podizanje vrha.
Zaustavljeno je okomito kretanje hvataljke. Motorna kočnica na vertikalnoj osi je uključena kako bi se spriječilo
hvataljka od pada. Motori čeljusti koji vrše silu hvatanja ostaju uključeni, tako da
hvataljka neće ispustiti laboratorijski pribor koji možda nosi.
Šejker se zaustavlja i vraća kući. Zasun za laboratorijski pribor se otvara. Grijanje je isključeno.
Grejanje ili hlađenje je onemogućeno.
Grejanje ili hlađenje je onemogućeno.
Svjetlo postaje crveno.
Poruka o otkazivanju preuzima ekran. Indikator na ekranu pokazuje kada ste uspjeli
isključio dugme za zaustavljanje.

60

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
3.5 Veze

On/Off prekidač

Bočne navlake

USB-A portovi

IEC ulaz za napajanje

Priključci AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet

Priključak za napajanje
Opentrons Flex se povezuje na izvor napajanja preko standardnog IEC-C14 ulaza. Robot sadrži interno napajanje punog dometa AC/DC, koje prihvata 100 VAC, 240/50 Hz ulaz i pretvara ga u 60 VDC. Sva ostala interna elektronika se napaja putem napajanja od 36 VDC.

Upozorenje: Koristite samo kabl za napajanje koji ste dobili uz robota. Nemojte koristiti kabl za napajanje sa neadekvatnom strujom ili zapreminomtage ocjene.
Kabel za napajanje držite bez prepreka kako biste ga po potrebi mogli ukloniti.

Tu je i CR1220 dugmasta baterija za napajanje robotovog sata u realnom vremenu kada nije priključen na električnu mrežu. Baterija se nalazi unutar kućišta ekrana osetljivog na dodir. Kontaktirajte Opentrons podršku za više informacija ako mislite da trebate zamijeniti bateriju.

OPENTRONS FLEX

61

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA
USB i pomoćni priključci
Opentrons Flex ima ukupno 10 USB portova smještenih u različitim dijelovima robota, koji služe različitim namjenama.
8 stražnjih USB-A portova (s brojevima od USB-1 do USB-8) i 2 pomoćna porta (M12 konektori označeni brojevima AUX-1 i AUX-2) služe za povezivanje Opentrons modula i dodatne opreme. Pogledajte poglavlje Moduli za više informacija o povezivanju ovih uređaja i njihovom korištenju u vašim protokolima. Zadnji USB-B port služi za povezivanje robota na laptop ili desktop računar, radi uspostavljanja komunikacije sa Opentrons aplikacijom koja radi na povezanom računaru. Prednji USB-A port (USB-9), koji se nalazi ispod ekrana osetljivog na dodir, ima istu funkcionalnost kao i zadnji USB-A portovi.
Napomena: USB portovi su ograničeni na snagu radi zaštite robota i povezanih uređaja. Isporuka napajanja je interno podijeljena u tri grupe portova: stražnji lijevi USB-A portovi (USB-1 do USB-4), desni stražnji USB-A portovi (USB-5 do USB-8) i prednji USB-A luka. Svaka od ovih grupa će isporučiti maksimalno 500 mA povezanim USB 2.0 kompatibilnim uređajima.
Mrežne veze
Opentrons Flex se može povezati na lokalnu mrežu putem žične (Ethernet) ili bežične (Wi-Fi) veze.
Ethernet port se nalazi na stražnjoj strani robota. Povežite ga na Ethernet čvorište ili uključite svoju mrežu. Ili, počevši od verzije robotskog sistema 7.1.0, povežite ga direktno na Ethernet port na vašem računaru. Interni Wi-Fi modul podržava 802.11 ac/a/b/g/n mreže sa dual-band 2.4/5 GHz antenom.

62

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

3.6 Specifikacije sistema

Opće specifikacije

Dimenzije Težina Deck utori
Touchscreen
Wi-Fi Ethernet USB
Ulaz za napajanje robota kamere
Mrežno napajanje voltage fluktuacija Fluktuacija frekvencije mrežnog napajanja Distributivni sistem Struja napajanja kratkog spoja Sastav okvira Kompozicija prozora Zahtjevi za ventilaciju

87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 in (Š, D, V)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS kompatibilnih utora u radnom području
(dostupno pipetama) 4 dodatna otvora za stagsavjete i laboratorijski pribor
(dostupno samo hvataljci) 7-inčni LCD ekran osetljiv na dodir sa Gorilla Glass 3 otpornim na ogrebotine i oštećenja
802.11 ac/a/b/g/n dvopojasni (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A portova 1 USB-B port USB 2.0 brzina
2MP, foto i video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Čvrsti čelični i CNC aluminijski dizajn
Bočni prozori i prednja vrata od polikarbonata koji se mogu ukloniti Najmanje 20 cm / 8 između jedinice i zida

OPENTRONS FLEX

63

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Zahtjevi za povezani PC

Aplikacija Opentrons radi na: Windows 10 ili noviji macOS 10.10 ili noviji Ubuntu 12.04 ili noviji

Specifikacije okoliša

Uslovi okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Stepen zagađenja

Samo u zatvorenom prostoru +20 do +25 °C (preporučeno) 40%, bez kondenzacije (preporučeno) 60 (samo neprovodno zagađenje)

Za dodatne informacije o prihvatljivim uslovima okoline za upotrebu i transport, pogledajte odeljak Uslovi okoline u poglavlju Instalacija i preseljenje.

Certifikati

Certifikati su završeni Nije certificirano/potvrđeno

CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP

Sažetak informacija o sertifikaciji je odštampan na naljepnici na poleđini Flex-a, blizu prekidača za uključivanje/isključivanje. Za detaljne informacije o sertifikaciji i usklađenosti, pogledajte odjeljak Usklađenost s propisima u Uvodu.

Serijski broj
Svaki Flex ima jedinstveni serijski broj. Format serijskog broja pruža dodatne informacije, uključujući i datum proizvodnje robota. Za nprample, serijski broj FLXA1020231007001 bi označavao:

64

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 3: OPIS SISTEMA

Likovi FLX A10 2023 10 07 001

Kategorija Model Verzija Godina Mjesec Dan Jedinica

Značenje Robot je Opentrons Flex. Kod za proizvodnu verziju robota. Robot je napravljen 2023. Robot je napravljen u oktobru. Robot je napravljen 7. u mjesecu. Jedinstveni broj za robote napravljene na određeni dan.

Serijski broj za svoj Flex možete pronaći:
Na certifikacijskoj naljepnici na poleđini Flex-a, blizu prekidača za uključivanje/isključivanje. Na poleđini ekrana osjetljivog na dodir (prema radnom području). U aplikaciji Opentrons pod Devices > your Flex > Robot settings > Advanced.

OPENTRONS FLEX

65

POGLAVLJE 4
Moduli
Opentrons Flex se integriše sa brojnim Opentrons hardverskim modulima. Svi moduli su periferni uređaji koji zauzimaju slotove na palubi, a većinom ih kontrolira robot preko USB veze.
Ovo poglavlje opisuje funkcije i fizičke specifikacije modula koji su kompatibilni sa Opentrons Flex sistemom, kao i kako ih priključiti i kalibrirati. Za više detalja o podešavanju i upotrebi modula, pogledajte priručnike za pojedinačne module. Za detalje o integraciji modula u vaše protokole, pogledajte odjeljak Dizajner protokola u poglavlju Razvoj protokola ili online dokumentaciju API-ja Python protokola.
4.1 Podržani moduli
Opentrons Flex je kompatibilan sa četiri tipa Opentrons modula na palubi:
Modul grijača-tresača omogućava grijanje na palubi i orbitalno tresenje. Modul se može zagrijati do 95 °C i može se protrestiampod 200 do 3000 o/min.
Magnetski blok je pasivni uređaj koji drži laboratorijski pribor blizu svojih neodimijumskih magneta visoke čvrstoće. OT-2 magnetni modul GEN1 i GEN2, koji aktivno pomeraju svoje magnete gore-dole u odnosu na laboratorijski pribor, nisu podržani na Opentrons Flex-u.
Temperaturni modul je modul tople i hladne ploče koji je u stanju da održava stabilnu temperaturu između 4 i 95 °C.
Thermocycler modul pruža potpuno automatizirano termocikliranje na palubi, omogućavajući automatizaciju koraka radnog toka uzvodno i nizvodno. Thermocycler GEN2 je potpuno kompatibilan sa hvataljkom. Thermocycler GEN1 se ne može koristiti sa hvataljkom i stoga nije podržan na Opentrons Flex-u.
Neki moduli prvobitno dizajnirani za OT-2 su kompatibilni sa Flex-om, kao što je sažeto u tabeli ispod. Kvačica označava kompatibilnost, a X označava nekompatibilnost.

66

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Tip i generacija uređaja Modul grijača-tresača GEN1 Magnetski modul GEN1 Magnetski modul GEN2 Magnetski blok GEN1 Temperaturni modul GEN1 Temperaturni modul GEN2 Modul termociklera GEN1 Modul termociklera GEN2 HEPA modul

OT-2

Flex

×

×

×

×

×

×

4.2 Modul caddy sistem
Kompatibilni moduli su dizajnirani da se uklope u caddies koji zauzimaju prostor ispod palube. Ovaj sistem omogućava laboratorijskom priboru na vrhu modula da ostane bliže površini palube, a takođe omogućava usmeravanje kablova ispod palube kako bi paluba ostala uredna tokom vašeg protokola.

Držači za module grijača-tresača, temperature i termociklera.

OPENTRONS FLEX

67

POGLAVLJE 4: MODULI
Da bi se modul ugradio u površinu palube, prvo se mora postaviti u odgovarajući modulni nosač. Svaki tip kompatibilnog modula ima svoj vlastiti dizajn kućišta koji modul i laboratorijski pribor precizno poravnava s okolnom palubom. (Izuzetak je Magnetic Block, koji ne zahteva strujni ili USB kablovsku liniju i stoga se nalazi direktno na površini palube.) Držači za module koji zauzimaju jedan slot mogu se postaviti bilo gde u koloni 1 ili 3; Termocikler se može postaviti samo u utore A1 i B1 istovremeno.
Općenito, da biste instalirali nosač modula:
1. Uklonite sve utore na palubi s mjesta gdje će modul ići. 2. Postavite modul u njegov nosač i zategnite njegova sidra. 3. Provucite kablove za napajanje modula i USB kablove kroz bočne poklopce, kroz prazan otvor na palubi i
pričvrstite ih na modul. 4. Postavite kućište modula u otvor i zašrafite ga.
Za tačna uputstva za instalaciju, pogledajte Vodič za brzi početak ili Uputstvo za upotrebu za određeni modul. Priključci kablova i način pričvršćivanja na nosač se razlikuju u zavisnosti od modula.
4.3 Kalibracija modula
Kada prvi put instalirate modul na Flex, morate pokrenuti automatsku kalibraciju položaja. Ovaj proces je sličan pozicijskoj kalibraciji za instrumente i osigurava da se Flex pomjeri na točno ispravne lokacije za optimalne performanse protokola. Tokom kalibracije, Flex će se premjestiti na lokacije na adapteru za kalibraciju modula, koji izgleda slično kvadratićima za kalibraciju koji su dio uklonjivih slotova na palubi.

Adapteri za kalibraciju za module grijača-tresača, temperature i termociklera.
Kalibracija modula je potrebna za sve module koji se instaliraju preko nosača: module grijača-tresača, temperature i termociklera. Magnetski blok ne zahtijeva kalibraciju i spreman je za upotrebu čim ga postavite na palubu.

68

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
Kada kalibrirati module
Flex vas automatski traži da izvršite kalibraciju kada povežete i uključite modul koji nema pohranjene podatke o kalibraciji. (Možete odbaciti ovaj upit, ali nećete moći pokretati protokole s modulom dok ga ne kalibrirate.)
Nakon što završite kalibraciju, Flex pohranjuje podatke o kalibraciji i serijski broj modula za buduću upotrebu. Flex vas neće tražiti da izvršite ponovnu kalibraciju osim ako ne izbrišete podatke o kalibraciji za taj modul u postavkama robota. Možete slobodno uključiti i isključiti svoj modul, ili ga čak premjestiti u drugi slot na palubi, bez potrebe za ponovnom kalibracijom. Ako želite ponovo kalibrirati, možete započeti proces u bilo kojem trenutku s kartice modula u aplikaciji Opentrons. (Ponovna kalibracija nije dostupna na ekranu osjetljivom na dodir.)
Kako kalibrirati module
Upute na ekranu osjetljivom na dodir ili u aplikaciji Opentrons će vas voditi kroz postupak kalibracije. Općenito, koraci su:
1. Prikupite potrebnu opremu, uključujući adapter za kalibraciju modula i sondu za kalibraciju pipete. 2. Postavite adapter za kalibraciju na površinu modula i uvjerite se da je potpuno ravan.
Neki moduli mogu zahtijevati da pričvrstite adapter na modul. 3. Pričvrstite sondu za kalibraciju na pipetu. 4. Flex će se automatski pomaknuti da dodirne određene tačke na adapteru za kalibraciju i sačuvati ih
kalibracijske vrijednosti za buduću upotrebu.
Kada se kalibracija završi i kada uklonite adapter i sondu, modul će biti spreman za upotrebu u protokolima.
U svakom trenutku možete view i upravljajte podacima o kalibraciji vašeg modula u aplikaciji Opentrons. Idite na Postavke robota za vaš Flex i kliknite na karticu Kalibracija.

OPENTRONS FLEX

69

POGLAVLJE 4: MODULI
4.4 Modul grijača-tresača GEN1

Karakteristike grijača-tresača
GRIJANJE I TRETANJE
Heater-Shaker omogućava grijanje na palubi i orbitalno tresenje. Modul se može zagrijati do 95 °C, sa sljedećim temperaturnim profile:
Raspon temperature: 37 °C Preciznost temperature: ±95 °C na 0.5 °C Ujednačenost temperature: ±55 °C na 0.5 °CRamp brzina: 10 °C/min
Modul može protresti samples od 200 do 3000 o/min, sa sljedećim protresanjemfile:
Orbitalni promjer: 2.0 mm Orbitalni smjer: U smjeru kazaljke na satu Raspon brzine: 200 o/min Preciznost brzine: ±3000 o/min
Modul ima motornu bravu za laboratorijski pribor za pričvršćivanje ploča na modul prije protresanja.

70

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
TERMALNI ADAPTERI Potreban je kompatibilan termalni adapter za dodavanje laboratorijskog pribora u Heater-Shaker. Adapteri se mogu kupiti direktno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com. Trenutno dostupni termalni adapteri uključuju:

Univerzalni ravni adapter

PCR adapter

Deep Well Adapter

96 Adapter s ravnim dnom

KONTROLA SOFTVERA
Heater-Shaker je u potpunosti programabilan u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju. Python API dodatno omogućava da se drugi koraci protokola izvode paralelno dok je Heater-Shaker aktivan. Pogledajte Komande koje ne blokiraju u API dokumentaciji za detalje o dodavanju paralelnih koraka vašim protokolima.
Izvan protokola, Opentrons aplikacija može prikazati trenutni status grijača-šejkera i može direktno kontrolirati grijač, šejker i bravu za laboratorijski pribor.

OPENTRONS FLEX

71

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije grijača-tresača

Dimenzije Težina Ulaz za napajanje modula Ulaz za adapter za napajanje Mrežno napajanje voltage fluktuacija Overvoltage Potrošnja energije

152 × 90 × 82 mm (D/Š/V) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategorija II u mirovanju: 10 W

Tipično: Protresanje: 4 W Grijanje: 11 W Grijanje i protresanje: 10 W

Uslovi okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Visina Stepen zagađenja

Maksimum: 125 W Samo za unutrašnju upotrebu 130 °C Do 20%, bez kondenzacije Do 25 m nadmorske visine 80

72

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
4.5 Magnetski blok GEN1

Karakteristike magnetnog bloka
Opentrons Magnetic Block GEN1 je magnetni držač ploča sa 96 jažica. Magnetski blokovi se koriste u protokolima koji se oslanjaju na magnetizam za izvlačenje čestica iz suspenzije i zadržavanje u pločama bunara tokom pranja, ispiranja ili drugih postupaka eluiranja. Za nprample, automatizovana priprema NGS; pročišćavanje genomske i mitohondrijalne DNK, RNK ili proteina; i drugi postupci ekstrakcije su svi slučajevi upotrebe koji mogu uključivati ​​magnetne blokove.
MAGNETNE KOMPONENTE
Magnetski blok je bez napajanja, ne sadrži nikakve elektronske komponente i ne pomera magnetne perle gore ili dole u rastvoru. Bužići se sastoje od 96 neodimijumskih prstenastih magneta visoke čvrstoće pričvršćenih na ležište s oprugom, što pomaže u održavanju tolerancije između bloka i pipeta dok se izvršavaju automatizirani protokoli.
KONTROLA SOFTVERA
Magnetski blok GEN1 je u potpunosti programabilan u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju.

OPENTRONS FLEX

73

POGLAVLJE 4: MODULI

Međutim, izvan protokola, ekran osjetljiv na dodir i Opentrons aplikacija nisu svjesni i ne mogu prikazati trenutni status magnetnog bloka GEN1. Ovo je modul bez napajanja. Ne sadrži elektronske ili mehaničke komponente koje mogu komunicirati sa Flex robotom. Magnetski blok „kontrolišete“ putem protokola koji koriste Opentrons Flex Gripper za dodavanje i uklanjanje laboratorijskog softvera iz ovog modula.

Specifikacije magnetnog bloka

Dimenzije Težina Snaga modula Vrsta magneta Uslovi okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Visina Stepen zagađenja

136 × 94 × 45 mm (D/Š/V) 1.13 kg Nema, modul je bez napajanja N52 neodimijum Samo za unutrašnju upotrebu 20 °C 25%, bez kondenzacije Do 30 m nadmorske visine 80

74

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI
4.6 Temperaturni modul GEN2

Karakteristike temperaturnog modula
GRIJANJE I HLAĐENJE
Opentrons temperaturni modul GEN2 je modul tople i hladne ploče. Često se koristi u protokolima koji zahtijevaju grijanje, hlađenje ili promjene temperature. Modul može postići i održavati temperaturu u rasponu od 4 °C do 95 °C u roku od nekoliko minuta, ovisno o konfiguraciji i sadržaju modula.
TERMALNI BLOKOVI
Za održavanje laboratorijskog pribora na temperaturi, modul koristi aluminijske termo blokove. Modul dolazi sa termalnim blokovima sa 24 i 96 jažica. Nosač temperaturnog modula dolazi s blokom dubokog bunara i blokom s ravnim dnom dizajniranim za korištenje sa Flex Gripperom. Blokovi sadrže epruvete od 1.5 mL i 2.0 mL, PCR ploče sa 96 jažica, PCR trake, duboke jažice i ploče s ravnim dnom.

OPENTRONS FLEX

75

POGLAVLJE 4: MODULI
Napomena: Modul se takođe isporučuje sa blokom sa ravnim dnom za OT-2. Nemojte koristiti OT-2 blok sa Flex-om. Blok ravnog dna za Flex ima natpis “Opentrons Flex” na svojoj gornjoj površini. Onaj za OT-2 ne.

Termalni blok sa 24 bunara

Termalni blok sa 96 bunara

Termalni blok dubokog bunara

Termalni blok ravnog dna za Flex

VODENA KUPANJA I GRIJANJE
Budući da je zrak dobar toplinski izolator, praznine između laboratorijskog pribora i termalnog bloka mogu utjecati na performanse temperaturnog modula od vremena do temperature. Stavljanje malo vode u termo blokove sa 24 ili 96 bunara eliminiše zračne praznine i poboljšava efikasnost grijanja. Idealna količina vode zavisi od termalnog bloka i laboratorijskog pribora. Pogledajte Bijelu knjigu temperaturnog modula za daljnje preporuke.

KONTROLA SOFTVERA
Temperaturni modul je u potpunosti programabilan u Protocol Designer-u i Python Protocol API-ju.
Izvan protokola, Opentrons App može prikazati trenutni status temperaturnog modula i može direktno kontrolirati temperaturu površinske ploče.

76

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije temperaturnog modula

Dimenzije Težina Snaga modula
Uslovi okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Visina Stepen zagađenja

194 × 90 × 84 mm (D/Š/V) 1.5 kg Ulaz: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Izlaz: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W max Unutarnja upotreba samo <219.6 °C (preporučeno za optimalno hlađenje ) Do 22%, bez kondenzacije Do 60 m nadmorske visine 2000

4.7 Modul termociklera GEN2

OPENTRONS FLEX

77

POGLAVLJE 4: MODULI
Karakteristike termociklera
Opentrons Thermocycler Module GEN2 je potpuno automatizovani termocikler na palubi, koji obezbeđuje PCR bez upotrebe ruku u formatu ploče sa 96 jažica. Njegov grijani poklopac i jednokratna zaptivka čvrsto pristaju preko ploče, osiguravajući efikasno sampzagrijavanje i minimalno isparavanje.
GRIJANJE I HLAĐENJE Termocikler blok može grijati i hladiti, a njegov poklopac može grijati, sa sljedećim temperaturnim profile: Raspon temperature termo bloka: 4 °C Maksimalno grijanje termalnog bloka ramp brzina: 4.25 °C/s od GEN2 ambijentalne do 95 °C Termalni blok maksimalno hlađenje ramp brzina: 2.0 °C/s od 95 °C do ambijentalne temperature poklopca: 37 °C Preciznost temperature poklopca: ±110 °C Automatski poklopac se može otvoriti ili zatvoriti po potrebi tokom izvršavanja protokola.
THERMOCYCLER PROFILES Thermocycler može izvršiti profiles: automatski kruži kroz niz temperatura bloka radi izvođenja reakcija osjetljivih na toplinu.
GUME ZA AUTOMATIZACIJU Thermocycler dolazi sa gumenim zaptivkama za automatizaciju koje pomažu u smanjenju isparavanja. Svaki pečat mora biti steriliziran prije upotrebe i može se koristiti nekoliko puta. Dodatne zaptivke se mogu kupiti direktno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com.
KONTROLA SOFTVERA Thermocycler je u potpunosti programabilan u Protocol Designer-u i Python protokol API-ju. Izvan protokola, Opentrons aplikacija može prikazati trenutni status Thermocycler-a i može direktno kontrolirati temperaturu bloka, temperaturu poklopca i položaj poklopca.

78

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 4: MODULI

Specifikacije termociklera

Dimenzije (poklopac otvoren) Dimenzije (poklopac zatvoren) Težina (uključujući stražnji kanal) Vol.tage Struja adaptera za napajanje Overvoltage Uslovi okoline Temperatura okoline Relativna vlažnost Visina Zahtjevi za ventilaciju

244.95 × 172 × 310.1 mm (D/Š/V) 244.95 × 172 × 170.35 mm (D/Š/V) 8.4 kg 100 V na 240/50 Hz 60 A Kategorija II Samo za upotrebu u zatvorenom prostoru (idealno 8.5 °C); 5 °C (prihvatljivo) 20%, bez kondenzacije Do 25 m nadmorske visine Najmanje 2 cm / 40 između jedinice i zida

OPENTRONS FLEX

79

POGLAVLJE 5
Labware
Ovo poglavlje pokriva stavke u Opentrons Labware biblioteci koje možete koristiti sa Opentrons Flex-om i Opentrons Flex Gripper-om. Takođe pokriva prilagođeni laboratorijski softver i, za naše napredne korisnike, povezuje komponente laboratorijskog softvera sa njihovim odgovarajućim JSON-om file definicije.
Laboratorijski pribor možete kupiti od proizvođača originalne opreme ili u Opentrons shopu na https://shop.opentrons.com. I, Opentrons uvijek radi na verifikaciji novih definicija laboratorijskog softvera. Pogledajte Biblioteku laboratorijskog softvera (povezanu iznad) za najnovije liste.
5.1 Koncepti laboratorijskog softvera
Labware obuhvata više od samo objekata postavljenih na palubi i korištenih u protokolu. Da bismo vam pomogli da razumete Opentrons laboratorijski softver, hajde da ispitamo ovu temu iz tri različite perspektive. Za Opentrons Flex, laboratorijski softver uključuje stavke u našoj biblioteci laboratorijskog softvera, podatke koji definiraju svaki dio laboratorijskog softvera i prilagođeni laboratorijski softver.
Labware kao hardver
Biblioteka laboratorijskog softvera uključuje sve što po defaultu možete koristiti sa Opentrons Flex-om. Ovo su izdržljive komponente i potrošni materijal sa kojima radite, ponovo ih koristite ili odbacujete dok koristite protokol. Ne morate poduzimati nikakve posebne korake da biste radili sa stavkama u biblioteci Labware. Flex robot zna kako da automatski radi sa svime u biblioteci.
Labware kao podaci
Informacije o laboratorijskom softveru se pohranjuju u Javascript objektnoj notaciji (JSON) files sa .json file ekstenzije. JSON file uključuje prostorne dimenzije (dužina, širina, visina), volumetrijski kapacitet (L, mL) i druge metrike koje definiraju karakteristike površine, njihove oblike i lokacije. Prilikom pokretanja protokola, Flex čita ove .json fileda znate koji je laboratorijski pribor na palubi i kako s njim raditi.

80

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
Custom labware
Prilagođeni laboratorijski softver je laboratorijski softver koji nije uključen u biblioteku laboratorijskog softvera ili je laboratorijski softver kreiran od strane Kreatora prilagođenog laboratorijskog softvera. Međutim, ponekad ideja o prilagođenom laboratorijskom softveru dolazi opterećena pojmovima složenosti, troškova ili poteškoća. Ali, prilagođeni laboratorijski softver ne bi trebao biti težak za razumijevanje ili stvaranje. Odvojimo trenutak da raspakujemo koncept prilagođenog laboratorijskog pribora.
Kao bivšiampDalje, Opentrons Labware Library uključuje ploče sa 96 jažica (200 L) kompanija Corning i BioRad, ali i drugi proizvođači proizvode ove ploče za jažice. A zahvaljujući opšteprihvaćenim industrijskim standardima, razlike među ovim sveprisutnim laboratorijskim predmetima su male. Međutim, obična ploča od 200 L, sa 96 jažica iz Stellar Scientifica, Oxford Lab-a ili Krackeler Scientific-a (ili bilo kojeg drugog dobavljača u tom slučaju) je "laboratorijski softver po mjeri" za Flex jer nije unaprijed definiran u našoj biblioteci laboratorijskog softvera. . Osim toga, manje razlike u dimenzijama laboratorijskog softvera mogu imati drastičan utjecaj na uspjeh izvođenja vašeg protokola. Iz tog razloga, važno je imati tačnu definiciju laboratorijskog softvera za svaki laboratorijski softver koji želite da koristite u svom protokolu.
Takođe, dok bi laboratorijski pribor po narudžbi mogao biti ezoteričan, jednokratni komplet, većinu vremena to su samo vrhovi, ploče, cijevi i stalci koji se svakodnevno koriste u laboratorijama širom svijeta. Opet, jedina razlika između Opentrons laboratorijskog i prilagođenog laboratorijskog softvera je što nova stavka nije unaprijed definirana u softveru koji pokreće robota. Flex može, i radi, s drugim osnovnim laboratorijskim stavkama ili nečim jedinstvenim, ali morate zabilježiti karakteristike te stavke u JSON definiciji laboratorijskog softvera file i uvezite te podatke u Opentrons aplikaciju. Pogledajte odjeljak Prilagođene definicije laboratorijskog softvera u nastavku za više informacija.
Da sumiramo, laboratorijski pribor uključuje:
Sve u Opentrons Labware biblioteci. Definicije laboratorijskog softvera: podaci u JSON-u file koji definira oblike, veličine i mogućnosti pojedinačnih predmeta
kao što su ploče za bunare, vrhovi, rezervoari itd. Prilagođeni laboratorijski pribor, koji su predmeti koji nisu uključeni u biblioteku laboratorijskog softvera.
Nakon reviewU skladu sa ovim važnim konceptima, hajde da ispitamo kategorije i stavke u Opentrons Labware biblioteci. Nakon toga, završićemo poglavlje sa gotovimview komponenti podataka laboratorijskog softvera file i sažeti Opentrons karakteristike i usluge koje vam pomažu da kreirate prilagođeni laboratorijski softver.

OPENTRONS FLEX

81

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

5.2 Rezervoari
Opentrons Flex radi prema zadanim postavkama sa dolje navedenim rezervoarima s jednim i više bunara. Korištenje ovih rezervoara pomaže u smanjenju vašeg pripremnog rada jer su spremni za automatizaciju odmah iz kutije. Informacije o rezervoaru su takođe dostupne u Opentrons Labware biblioteci.

Rezervoari sa jednim bunarom

Specifikacije proizvođača

Agilent

290 mL V dno

Axygen

90 mL Ravno dno

GNJEZDO

195 mL Ravno dno

290 mL V dno

Ime učitavanja API-ja
agilient_1_ rezervoar_290ml
axygen_1_ rezervoar_90ml
gnijezdo_1_ rezervoar_195ml
gnijezdo_1_ rezervoar_290ml

Rezervoari sa više bunara

Specifikacije proizvođača

GNJEZDO

12 jažica 15 mL/bunarić V dno

USA Scientific

12 jažica 22 mL/bunarić V dno

Naziv učitavanja API-ja nest_12_reservoir_15ml
usascientific_12_reservoir_22ml

82

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
Rezervoari i API definicije
Opentrons Labware Library definiše karakteristike rezervoara navedenih gore u zasebnom JSON-u files. Robot i Opentrons Python API se oslanjaju na ove JSON definicije za rad sa laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Za nprampNaime, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao važeće parametre u vašem kodu. Povezana imena učitavanja API-ja povezuju se na definicije laboratorijskog softvera rezervoara u Opentrons GitHub spremištu.
Laboratorijski pribor za rezervoare po meri
Pokušajte kreirati prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera sa Opentrons Labware Creatorom ako rezervoar koji želite da koristite nije naveden ovdje. Prilagođena definicija kombinuje sve dimenzije, metapodatke, oblike, zapreminski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex-u su potrebne ove informacije da bi razumio kako raditi s vašim prilagođenim laboratorijskim softverom. Pogledajte odjeljak Prilagođene definicije laboratorijskog softvera za više informacija.
5.3 Ploče za bunare
Opentrons Flex radi po zadanim postavkama sa dole navedenim pločama za bunare. Upotreba ovih ploča za bunar pomaže vam da smanjite opterećenje pripremnog rada jer su spremne za automatizaciju odmah iz kutije. Informacije o pločicama bunara su takođe dostupne u Opentrons Labware biblioteci.

OPENTRONS FLEX

83

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Ploče sa 6 jažica
Proizvođač Corning

Specifikacije
6 jažica 16.8 mL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna

Naziv učitavanja API-ja corning_6_wellplate_16.8ml_flat

Ploče sa 12 jažica
Proizvođač Corning

Specifikacije
12 jažica 6.9 mL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna

Naziv učitavanja API-ja corning_12_wellplate_6.9ml_flat

Ploče sa 24 jažica
Proizvođač Corning

Specifikacije
24 jažica 3.4 mL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna

Naziv učitavanja API-ja corning_24_wellplate_3.4ml_flat

Ploče sa 48 jažica
Proizvođač Corning

Specifikacije
48 jažica 1.6 mL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna

Naziv učitavanja API-ja corning_48_wellplate_1.6ml_flat

84

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Ploče sa 96 jažica
Proizvođač Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific

Specifikacije
96 jažica 200 µL/bužicu Kružne jažice, V dno
96 jažica 360 µL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna
96 jažica 100 µL/jažici Kružne jažice, V dno PCR puna suknja
96 jažica 200 µL/bunariću Kružne jažice, ravnog dna
96 dubokih jažica 2000 µL/bunariću Kvadratne jažice, V dno
Čvrsto 96 jažica 200 µL/bužicu Kružne jažice, V donji PCR pun okvir
Nunc 96 dubokih jažica 1300 µL/bunariću Kružne jažice, U dno
Nunc 96 dubokih jažica 2000 µL/bunariću Kružne jažice, U dno
96 dubokih jažica 2.4 mL/bunariću Kvadratne jažice, U dno

Naziv učitavanja API-ja biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ suknja
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep

OPENTRONS FLEX

85

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Ploče sa 384 jažica

Proizvođač Applied Biosystems Bio-Rad
Corning

Specifikacije
384 jažica 40 µL/bužicu Kružne jažice, V dno
384 jažica 50 µL/bužicu Kružne jažice, V dno
384 jažice 112 µL/bunarić Kvadratne jažice, ravnog dna

Naziv učitavanja API-ja primijenjenbiosystemsmicroamp_384_ wellplate_40ul biorad_384_wellplate_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat

Adapteri za ploče bunara
Aluminijske ploče navedene u nastavku su termalni adapteri za Opentrons Heater-Shaker GEN1 modul. Možete koristiti ove samostalne definicije adaptera za učitavanje Opentrons verificiranog ili prilagođenog laboratorijskog softvera na vrh Heater-Shakera.

Tip adaptera Opentrons Univerzalni ravni adapter za grijač-tresač Opentrons 96 PCR adapter za grijač-tresač Opentrons 96 Adapter za grijač-tresač za duboke jažice Opentrons 96 Adapter za grijač-tresač s ravnim dnom

Naziv učitavanja API-ja opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter

Također možete učitati i adapter i laboratorijski pribor s jednom definicijom. Naša biblioteka laboratorijskog softvera uključuje nekoliko unapred konfigurisanih termalnih adaptera i kombinacija laboratorijskog pribora koje čine grejač-tresač spremnim za upotrebu odmah iz kutije.

86

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Napomena: Nemojte koristiti kombinovanu definiciju ako trebate da premjestite laboratorijski pribor na ili izvan grijača tokom vašeg protokola, bilo pomoću hvataljke ili ručno. Umjesto toga koristite samostalnu definiciju adaptera.

Kombinacija adaptera/laboratorijskog pribora

Ime učitavanja API-ja

Opentrons 96 Deep Well Heater-Shaker Adapter sa NEST Deep Well Plate 2 mL

opentrons_96_deep_well_adapter_nest_wellplate_2ml_deep

Opentrons 96 Flat Bottom Grijač-Shaker Adapter s NEST 96 Well Ploče 200 µL Flat

opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_wellplate_200ul_flat

Opentrons 96 PCR Heater-Shaker adapter sa NEST pločom za jažice 100 µL

opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt

Opentrons univerzalni plosnati grijač-tresač adapter sa Corning 384 jažicom ploča 112 µL Flat

opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_wellplate_112ul_flat

Adapteri se mogu kupiti direktno od Opentronsa na https://shop.opentrons.com.

Ploče za bunare i definicije API-ja
Opentrons Labware Library definiše karakteristike ploča sa bunarima koje su gore navedene u zasebnom JSON-u files. Flex robot i Opentrons Python API se oslanjaju na ove JSON definicije za rad sa laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Za nprampNaime, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao važeće parametre u vašem kodu. Povezana imena učitavanja API-ja povezuju se sa definicijama laboratorijskog softvera ploča bunara u Opentrons GitHub repozitorijumu.

Laboratorijski pribor za ploče za bunare
Pokušajte koristiti Opentrons Labware Creator da napravite prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera ako ploča bunara koju biste željeli koristiti nije navedena ovdje. Prilagođena definicija kombinuje sve dimenzije, metapodatke, oblike, zapreminski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex čita ove informacije kako bi razumio kako raditi sa vašim prilagođenim laboratorijskim softverom. Pogledajte odjeljak Prilagođene definicije laboratorijskog softvera za više informacija.

OPENTRONS FLEX

87

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

5.4 Vrhovi i stalci za vrhove
Opentrons Flex vrhovi dolaze u veličinama od 50 µL, 200 µL i 1000 µL. Ovo su prozirni, neprovodni polipropilenski vrhovi koji su dostupni sa ili bez filtera. Upakovane su sterilno u police koje drže 96 vrhova i ne sadrže DNazu, RNKazu, proteazu, pirogene, ljudsku DNK, endotoksine i PCR inhibitore. Stalci također sadrže brojeve serija i datume isteka.
Flex vrhovi pipeta rade s Opentrons Flex 50 µL i 1000 µL pipetama u 1-, 8- i 96-kanalnim konfiguracijama. Iako možete staviti bilo koji od Flex vrhova na pipete od 50 L i 1000 L, pokušajte da vrh uskladite s nazivnim kapacitetom pipete. Za nprampLe, možda bi bilo čudno staviti vrh od 1000 L na pipetu od 50 L. Za pipetu od 1000 L svakako možete koristiti vrh od 50 L, 200 L ili 1000 L.

Tip stalci
Nefiltrirani i filtrirani vrhovi su povezani u stalak koji se sastoji od osnovne ploče za višekratnu upotrebu, srednje ploče koja drži 96 vrhova i poklopca.

Stalak za vrh po zapremini 50 µL 200 µL 1000 µL

Ime učitavanja API-ja
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Nefiltrirano: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Filtrirano: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul

Za pomoć pri identifikaciji, srednje ploče nosača vrhova označene su bojama na osnovu veličine vrha:
50 µL: magenta 200 L: žuta 1000 µL: plava

88

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Prilikom naručivanja ili ponovnog naručivanja, vrhovi i stalci dolaze u dvije različite konfiguracije pakiranja:
Stalci: Sastoje se od zasebno skupljajućih nosača za vrhove (osnovna ploča, srednja ploča sa vrhovima i poklopac). Konfiguracije u regalu su najbolje kada je čistoća najvažnija, kako bi se izbjegla unakrsna kontaminacija ili kada vaši protokoli ne dozvoljavaju ponovnu upotrebu osnovne ploče ili komponenti.
Punjenje: Sastoji se od jednog kompletnog stalka za vrh (osnovna ploča, srednja ploča sa vrhovima i poklopac) i pojedinačnih spremnika za vrhove. Konfiguracije punjenja su najbolje kada vaši protokoli dozvoljavaju ponovnu upotrebu osnovne ploče ili komponenti.
Kompatibilnost tippipeta
Flex vrhovi za pipete su dizajnirani za Opentrons Flex pipete. Flex vrhovi nisu kompatibilni sa Opentrons OT-2 pipetama, niti možete koristiti OT-2 vrhove na Flex pipetama.
Drugi industrijski standardni savjeti mogu raditi sa Flex pipetama, ali to se ne preporučuje. Da biste osigurali optimalne performanse, trebali biste koristiti samo Opentrons Flex vrhove sa Flex pipetama.
Adapter za tip stalak
96-kanalnoj pipeti je potreban adapter za pravilno pričvršćivanje pune stalke vrhova. Tokom postupka pričvršćivanja, pipeta se kreće preko adaptera, spušta se na igle za montiranje i povlači vrhove na pipete podizanjem adaptera i nosača za vrhove.

OPENTRONS FLEX

89

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Napomena: Koristite adapter za stalak za vrhove samo kada preuzimate punu stalku vrhova odjednom. Postavite nosače za vrhove direktno na palubu kada uzimate manje vrhova.
Upozorenje: Opasnost od uklještenja. Držite ruke dalje od adaptera nosača vrhova dok pipeta pričvršćuje vrhove pipete.

Tip adaptera Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter

Ime učitavanja API-ja opentrons_flex_96_tiprack_adapter

Adapter za tip stalak je kompatibilan sa Opentrons Flex Gripper-om. Možete koristiti hvataljku za postavljanje svježih nosača vrhova na adapter ili za podizanje i premještanje korištenih nosača za vrhove u otvor za otpad.

5.5 Cijevi i nosači cijevi

Opentrons 4-u-1 Tube Rack sistem radi sa Opentrons Flex po zadanim postavkama. Korištenje stalka za cijevi 4-u-1 pomaže u smanjenju opterećenja pripremnog rada jer su kombinacije koje pruža spremne za automatizaciju odmah iz kutije. Više informacija je također dostupno u Opentrons Labware biblioteci.

90

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
Kombinacije cijevi i nosača
Opentrons 4-u-1 stalak za cijevi podržava širok raspon veličina cijevi, pojedinačno ili u kombinacijama različitih veličina (volumena). To uključuje: stalak sa 6 epruveta za epruvete od 50 mL (6 x 50 mL). Kombinovani stalak od 10 epruveta za četiri epruvete od 50 mL i šest epruveta od 15 mL (4 x 50 mL, 6 x 15 mL). Stalak od 15 epruveta za epruvete od 15 mL (15 x 15 mL). Stalak sa 24 epruvete za epruvete od 0.5 mL, 1.5 mL ili 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Napomena: Sve cijevi su cilindrične s dnom u obliku slova V (konusno), osim ako nije drugačije naznačeno.

Stalci sa 6 cijevi
Tuba tip 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
Stalci sa 10 cijevi
Tip epruvete 4 Falcon 50 mL 6 Falcon 15 mL 4 GNEZDO 50 mL 6 Gnijezdo 15 mL

Naziv učitavanja API-ja opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical

OPENTRONS FLEX

91

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Stalci sa 15 cijevi
Tuba tip 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL

Naziv učitavanja API-ja opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical

Stalci sa 24 cijevi

Tip cevi
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, dno u obliku slova U 24 generički poklopac na navoj od 2 mL 24 NEST 0.5 mL navojni poklopac 24 NEST 1.5 mL navojni poklopac 24 NESTL EST1.5 s 24 m NEST 2 mL zatvarač, dno u obliku slova U

Naziv učitavanja API-ja opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap

Definicije API-ja nosača cijevi
Opentrons Labware Library definira karakteristike nosača cijevi navedenih gore u zasebnom JSON-u files. Flex robot i Opentrons Python API se oslanjaju na ove JSON definicije za rad sa laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Za nprampNaime, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao važeće parametre u vašem kodu. Povezana imena učitavanja API-ja povezuju se na definicije laboratorijskog stalka za cijevi u Opentrons GitHub spremištu.

92

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
Laboratorijski pribor za stalak za cijevi po mjeri
Pokušajte kreirati prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera koristeći Opentrons Labware Creator ako kombinacija cijevi i stalka koju želite koristiti nije navedena ovdje. Prilagođena definicija kombinuje sve dimenzije, metapodatke, oblike, zapreminski kapacitet i druge informacije u JSON-u file. Opentrons Flex čita ove informacije kako bi razumio kako raditi sa vašim prilagođenim laboratorijskim softverom. Pogledajte odjeljak Prilagođene definicije laboratorijskog softvera za više informacija.
5.6 Aluminijski blokovi
Aluminijski blokovi se isporučuju s temperaturnim modulom GEN2 i mogu se kupiti zasebno kao trodijelni set. Set uključuje ploču s ravnim dnom, blok sa 24 jažica i blok sa 96 jažica.
Opentrons Flex koristi aluminijske blokove za držanje sample cijevi i ploče bunara na temperaturnom modulu ili direktno na palubi. Kada se koriste s temperaturnim modulom, aluminijski blokovi mogu zadržati vaše sampepruvete, PCR trake ili ploče na konstantnoj temperaturi između 4 °C i 95 °C.
Ploča sa ravnim dnom
Ploča s ravnim dnom za Flex se isporučuje s nosačem temperaturnog modula i kompatibilna je s različitim ANSI/SLAS standardnim pločama za bunar. Ova ravna ploča razlikuje se od ploče koja se isporučuje sa samim temperaturnim modulom ili zasebnim trodijelnim setom. Ima širu radnu površinu i zakošene ugaone kopče. Ove karakteristike pomažu u poboljšanju performansi Opentrons Flex Gripper-a pri premještanju laboratorijskog pribora na ploču ili van nje.
Možete reći koju ploču ravnog dna imate jer ona za Flex ima natpis “Opentrons Flex” na svojoj gornjoj površini. Onaj za OT-2 ne.

OPENTRONS FLEX

93

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Aluminijski blok sa 24 bunara
Blok sa 24 jažice se koristi sa pojedinačnim sample bočice. Za nprample, prihvata sampbočice koje:
Imaju dno u obliku slova V ili U. Osigurajte sadržaj zatvaračima sa zatvaračem ili poklopcem na navoj. Držite tečnost u kapacitetima od 0.5 mL, 1.5 mL i 2 mL.

Aluminijski blok sa 96 bunara
Blok sa 96 jažica podržava širok izbor tipova ploča za jažice. Za nprample, prihvata dobro ploče koje su:
Od velikih proizvođača ploča za dobro ugradnju kao što su Bio-Rad i NEST.
Dizajniran s donjim dijelom u obliku slova V, donjim dijelom u obliku slova U ili ravnim dnom.
Dizajniran sa jažicama od 100 µL ili 200 µL.
Takođe je kompatibilan sa generičkim PCR trakama.

Samostalni adapteri
Termalni blok Flex ploča sa ravnim dnom 24-bunarski aluminijumski blok 96-bunarski aluminijumski blok

Ime učitavanja API-ja opentrons_aluminium_flat_bottom_plate Pogledajte kombinacije laboratorijskog pribora ispod. opentrons_96_well_aluminium_block

Kombinacije aluminijskih blokova laboratorijskog pribora
Opentrons Labware Library podržava sljedeće kombinacije blokova, bočica i ploča za jažice, koje su također definirane u zasebnoj JSON definiciji laboratorijskog softvera files. Flex robot i Opentrons Python API

94

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
oslanjajte se na ove JSON definicije za rad s laboratorijskim softverom koji koriste vaši protokoli. Za nprampNaime, kada radite s API-jem, funkcija ProtocolContext.load_labware prihvaća ove nazive laboratorijskog softvera kao važeće parametre u vašem kodu. Tablice ispod navode zadane kombinacije blok/kontejner i povezana imena učitavanja API-ja. Veze se povezuju na odgovarajuće JSON definicije u Opentrons GitHub spremištu.
Napomena: Sve cijevi imaju dno u obliku slova V osim ako nije drugačije naznačeno.

Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijumskih blokova sa 24 bunara

Sadržaj bloka od 24 jažice Generička kapa na navoj od 2 mL NEST 0.5 mL navojni poklopac NEST 1.5 mL navojni poklopac NEST 1.5 mL zatvarač NEST 2 mL navojni zatvarač NEST 2 mL zatvarač na zatvaranje, dno u obliku slova U

Naziv za učitavanje API-ja 24ml_screwcap opentrons_2_aluminiumblock_nest_24ml_snapcap

Kombinacije laboratorijskog pribora od aluminijumskih blokova sa 96 bunara

Sadržaj bloka sa 96 jažica Bio-Rad ploča za jažice 200 µL Generička PCR traka 200 µL NEST ploča za jažice 100 µL

Naziv opterećenja API-ja opentrons_96_aluminiumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminiumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminiumblock_nest_wellplate_100uL

OPENTRONS FLEX

95

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

5.7 Labware i Opentrons Flex Gripper
Iako Opentrons Flex radi sa svim inventarom u biblioteci laboratorijskog softvera, Opentrons Flex Gripper je kompatibilan samo sa određenim laboratorijskim stavkama. Trenutno je Gripper optimiziran za upotrebu sa sljedećim laboratorijskim predmetima.

Kategorija laboratorijskog pribora Ploče za duboke jažice sa potpuno obrubljenim pločama od 96 bunara
Stalci za vrhove (nefiltrirani i filtrirani vrhovi)

Brendovi
NEST 96 Deep Well Ploča 2 mL
Opentrons Tough 96 jažica ploča 200 µL PCR puna suknja NEST 96 jažica ploča 200 µL ravna
Opentrons Flex 96 Tip stalak 50 µL Opentrons Flex 96 Tip stalak 200 µL Opentrons Flex 96 Tip Stalak 1000 µL

Napomena: Za najbolje rezultate koristite Flex Gripper samo sa gore navedenim laboratorijskim priborom. Flex Gripper može raditi s drugim laboratorijskim softverom usklađenim sa ANSI/SLAS automatizacijom, ali to se ne preporučuje.

5.8 Prilagođene definicije laboratorijskog softvera
Kao što je objašnjeno na početku ovog poglavlja, prilagođeni laboratorijski softver je laboratorijski softver koji nije naveden u Opentrons Labware biblioteci. Možete koristiti druge uobičajene ili jedinstvene laboratorijske stavke sa Flex-om tako što ćete precizno izmjeriti i zabilježiti karakteristike tog objekta i spremiti te podatke u JSON file. Kada se uvoze u aplikaciju, Flex i API koriste te JSON podatke za interakciju s vašim laboratorijskim softverom. Opentrons pruža alate i usluge, koje ćemo ispitati u nastavku, kako bi vam pomogli da koristite Flex sa prilagođenim laboratorijskim softverom.

96

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

Kreiranje prilagođenih definicija laboratorijskog softvera
Opentrons alati i usluge pomažu da vam prilagođeni laboratorijski pribor bude na dohvat ruke. Ove karakteristike prilagođavaju različite nivoe vještina i načina rada. Kreiranje vlastitog laboratorijskog pribora i njegovo korištenje s Opentrons Flex-om pomaže da robot postane svestran i moćan dodatak vašoj laboratoriji.

CUSTOM LABWARE CREATOR
Custom Labware Creator je bez koda, web-bazirani alat koji koristi grafičko sučelje kako bi vam pomogao da kreirate definiciju laboratorijskog softvera file. Labware Creator proizvodi JSON definiciju laboratorijskog softvera file koje uvezete u aplikaciju Opentrons. Nakon toga, vaš prilagođeni laboratorijski softver je dostupan Flex robotu i Python API-ju.

USLUGA LABWARE
Kontaktirajte nas ako laboratorijski softver koji želite da koristite nije dostupan u biblioteci, ako ne možete da kreirate sopstvene definicije ili zato što prilagođena stavka uključuje različite oblike, veličine ili druge nepravilnosti opisane u nastavku.

Labware koji možete definirati u Labware Creatoru
; Bunari i cijevi su ujednačeni i identični. ; Svi redovi su ravnomjerno raspoređeni
(razmak između redova je jednak).
; Svi stupci su ravnomjerno raspoređeni (razmak između kolona je jednak).
; Savršeno staje u jedan otvor za palubu.

Labware Opentrons treba definirati ; Oblici bunara i cijevi se razlikuju. ; Redovi nisu ravnomjerno raspoređeni.
; Kolone nisu ravnomjerno raspoređene.
; Manji od jednog slota na palubi (zahteva adapter) ili obuhvata više slotova na palubi.

OPENTRONS FLEX

97

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA
Evo nekoliko dijagrama koji vam pomažu da vizualizirate bivšegampgore opisane. Regular Sve kolone su ravnomjerno raspoređene, a svi redovi su ravnomjerno raspoređeni. Kolone ne moraju imati isti razmak kao redovi.
Regular Rešetka ne mora biti u centru laboratorijskog pribora.
Nepravilni redovi su ravnomjerno raspoređeni, ali kolone nisu ravnomjerno raspoređene.
Nepravilne kolone/redovi su ravnomjerno raspoređeni, ali bunari nisu identični.
Nepravilan Postoji više od jedne mreže.
Naš laboratorijski tim će raditi na razumijevanju vaših potreba i dizajnirati prilagođene definicije laboratorijskog softvera za vas. Za više informacija pogledajte članke podrške Zahtjev za prilagođenu definiciju laboratorijskog softvera i obrazac zahtjeva za prilagođeni laboratorijski softver. Ovo je usluga koja se plaća.

98

OPENTRONS FLEX

POGLAVLJE 5: LABORATORIJSKI OPREMA

PYTHON API
Iako ne možete kreirati prilagođeni laboratorijski softver s našim API-jem, možete koristiti prilagođeni laboratorijski softver s dostupnim API metodama. Međutim, prvo morate definirati svoj prilagođeni laboratorijski softver i uvesti ga u Opentrons aplikaciju. Nakon što dodate svoj laboratorijski softver Opentrons aplikaciji, on je dostupan Python API-ju i robotu. Pogledajte odjeljak Prilagođene definicije laboratorijskog softvera u dokumentaciji Python API-ja za više informacija. Za informacije o pisanju skripti protokola s API-jem, pogledajte odjeljak API Python protokola u poglavlju Razvoj protokola.
JSON šema laboratorijskog softvera
JSON file je nacrt za Opentrons standardni i prilagođeni laboratorijski softver. Ovo file sadrži i organizira podatke laboratorijskog softvera prema specifikacijama dizajna postavljenim zadanom šemom.
Šema je okvir

Dokumenti / Resursi

opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source robot za rukovanje tekućinom [pdfUputstvo za upotrebu
FLEX Opentrons Flex Open Source robot za rukovanje tekućinom, FLEX, Opentrons Flex Open Source robot za rukovanje tekućinom, Flex Open Source robot za rukovanje tekućinom, Open Source robot za rukovanje tekućinom, Robot za rukovanje tekućinom izvora, Robot za rukovanje tekućinom, Robot za rukovanje, Robot

Reference

Ostavite komentar

Vaša email adresa neće biti objavljena. Obavezna polja su označena *