FLEX Opentrons Flex Робот за обработка на течности с отворен код
“
Opentrons Flex
Спецификации:
- Общи спецификации: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Екологични спецификации: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Сертификати: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Сериен номер: XXX-XXXX-XXXX
Инструкции за употреба на продукта:
1. Инсталиране и калибриране на инструмента:
Следвайте стъпките, описани в ръководството за пипета и захващане
монтаж.
2. Преместване:
За кратки ходове вижте раздел 2.5 в ръководството. За
премествания на дълги разстояния, следвайте предоставените указания. Общо преместване
съвет също е наличен.
3. Връзки:
Осигурете правилно захранване, както е описано в ръководството.
Свържете USB и спомагателни устройства, ако е необходимо. Интернет връзка
трябва да се установи следвайки инструкциите.
4. Дизайнер на протоколи:
Разберете изискванията за Protocol Designer и научете как
да проектирате нови протоколи или да модифицирате съществуващи според вашата лаборатория
изисквания.
5. API на Python Protocol:
Разгледайте писането и изпълнението на скриптове с помощта на API на Python Protocol.
Открийте ексклузивни функции на Python за подобрена функционалност.
6. OT-2 протоколи:
Научете за протоколите OT-2 Python, протоколите OT-2 JSON и
Протоколи на магнитния модул за различни видове експерименти.
Често задавани въпроси (FAQ):
Въпрос: Как да отстраня проблема, ако роботът не се движи както
очакван?
О: Проверете захранващата връзка, осигурете правилно калибриране на
инструменти и проверете дали няма препятствия в
пътя на робота.
Въпрос: Мога ли да използвам персонализирани пипети с Opentrons Flex?
О: Opentrons препоръчва използването на съвместими пипети за оптимално
производителност и точност.
„`
Opentrons Flex
Ръководство за употреба
Opentrons Labworks Inc.
декември 2023 г
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Регистрирани имена, търговски марки и т.н., използвани в този документ, дори когато не са изрично отбелязани като такива, не трябва да се считат за незащитени от закона.
Съдържание
Предговор. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Структура на това ръководство . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Бележки и предупреждения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Глава 1 Въведение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Добре дошли в Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Какво е новото във Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 работни станции Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Информация за безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Символи за безопасност. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Предупреждения за електрическа безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Допълнителни предупреждения за безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Предупреждения за безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Биологична безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Токсични изпарения . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Запалими течности . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Съответствие с нормативната уредба . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Безопасност . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Електромагнитна съвместимост . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Предупреждения и бележки на FCC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Канада ISED съответствие . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Предупреждение за околната среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Предварителна сертификация за Wi-Fi . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Глава 2: Инсталиране и преместване . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Изисквания за безопасност и работа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Къде да поставите Opentrons Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Консумация на енергия . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Условия на околната среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Разопаковане . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Необходими усилия и време . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Сандък и опаковъчен материал . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Продуктови елементи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Част 1: Отстранете сандъка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Част 2: Освободете гъвкавостта. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Част 3: Окончателно сглобяване и включване . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Първо бягане. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Включване . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Свързване към мрежа или компютър . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Инсталиране на софтуерни актуализации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Прикрепете висулка за аварийно спиране . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Дайте име на своя робот . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Инсталиране и калибриране на инструмента . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Инсталиране на пипета . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Монтаж на грайфер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Преместване . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Кратки движения. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Премествания на дълги разстояния . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Общи съвети за преместване . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Последни мисли за преместването. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Глава 3: Описание на системата. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Физически компоненти . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Рамка и корпус . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Палуба и работна зона . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging област. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Приспособления за палуба. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Улей за отпадъци. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging области слотове. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Система за движение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Сензорни и LED дисплеи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Пипети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Спецификации на пипетата. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Калибриране на пипета . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Адаптер за поставка за върха на пипетата. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Частично прихващане на върха . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Сензори за пипети. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Актуализации на фърмуера на пипетата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Грайфер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Спецификации на грайфера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Калибриране на грайфера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Актуализации на фърмуера на Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Висулка за аварийно спиране . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Кога да използвате E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Активиране и освобождаване на E-stop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Връзки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Захранване . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB и спомагателни връзки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Мрежови връзки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Системни спецификации. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Общи спецификации . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Спецификации на околната среда . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Сертификати. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Сериен номер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Глава 4: Модули . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Поддържани модули . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Модулна кади система . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Калибриране на модула . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Кога да се калибрират модули. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Как да калибрирате модули . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Модул нагревател-шейкър GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Характеристики на нагревател-шейкър. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Спецификации на нагревател-шейкър . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Магнитен блок GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Характеристики на магнитния блок. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Спецификации на магнитния блок . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Температурен модул GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Характеристики на температурния модул . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Спецификации на температурния модул . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Термоциклиращ модул GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Характеристики на термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Спецификации на термоциклера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Глава 5: Лабораторен софтуер. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Концепции за лабораторен софтуер. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторен софтуер като хардуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Лабораторен софтуер като данни . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Персонализиран лабораторен софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Резервоари . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Резервоари с един кладенец . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Резервоари с множество кладенци. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Дефиниции на резервоари и API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Лабораторен уред за персонализирани резервоари. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Плаки с ямки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-ямкови плаки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-ямкови плаки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-ямкови плаки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-ямкови плаки. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-ямкови плаки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-ямкови плаки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Адаптери за ямкови плочи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Плаки с ямки и дефиниции на API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Лабораторен уред за плака с гнезда по поръчка. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Накрайници и поставки за накрайници . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Стелажи за съвети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Съвместимост с накрайници . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Адаптер за стойка за накрайници . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Епруветки и поставки за епруветки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Комбинации от тръби и стелажи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Стойки с 6 тръби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 стойки с 10 тръби. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 Стойки с 15 тръби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Стойки с 24 тръби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Дефиниции на API за тръбна стойка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Персонализирана лабораторна стойка за епруветки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Алуминиеви блокове . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Плоска долна плоча . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Алуминиев блок с 24 ямки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Алуминиев блок с 96 ямки . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Самостоятелни адаптери . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Комбинации от лабораторни прибори от алуминиев блок . . . . . . . . . . . . . . . .94 Лабораторни комбинации от алуминиев блок с 24 ямки . . . . . . . . .95 Лабораторни комбинации от алуминиев блок с 96 ямки . . . . . . . . .95 5.7 Лабораторен софтуер и Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Персонализирани дефиниции на лабораторен софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Създаване на персонализирани дефиниции на лабораторен софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON схема на лабораторния софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON дефиниции на лабораторен софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Глава 6: Разработване на протокол . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Предварително направени протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Библиотека с протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Услуга за разработка на потребителски протокол . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Дизайнер на протоколи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Изисквания към дизайнера на протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Проектиране на протокол . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Модифициране на съществуващи протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Писане и изпълнение на скриптове . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Ексклузивни функции на Python . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 протоколи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python протоколи. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Протоколи за магнитен модул . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Глава 7: Софтуер и работа. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Работа със сензорен екран. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Табло за роботи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Управление на протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Подробности за протокола . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Стартирайте настройката . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Проверка на позицията на лабораторния софтуер . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Напредък на бягане. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Завършване на изпълнение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Управление на инструменти. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Настройки на робота. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Конфигурация на палубата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons App. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Инсталиране на приложение . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Прехвърляне на протоколи към Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Състояние и контроли на модула . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Скорошни изпълнения на протоколи . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Разширена работа . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Тетрадка на Юпитер. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Операции от командния ред през SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Глава 8: Поддръжка и сервиз . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Почистване на вашия Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Преди да започнете . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Какво можете да почистите . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Почистващи разтвори. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Почистване на дограми и панели . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Почистване на палубата . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Почистване на портали. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Почистване на улея за отпадъци. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Почистване на пипети и накрайници . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Обеззаразяване на пипети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Почистващи накрайници за пипети . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Почистване на грайфера . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Модули за почистване. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Общо почистване на модула . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Уплътнения за термоциклери. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Лабораторен уред, безопасен за автоклав . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Обслужване на Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Услуги на Opentrons . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Квалификация за инсталиране и квалификация за работа . . . 155 Превантивна поддръжка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Гаранция . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Приложение A: Речник . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Приложение B: Допълнителна документация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Документация за API на Python Protocol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API справка. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Документация за разработчици . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Приложение C: Софтуер с отворен код . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons в GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Други хранилища . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Приложение D: Информация за поддръжка и контакт . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Продажби . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Поддръжка . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Бизнес информация . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Предговор
Добре дошли в ръководството с инструкции за робота за работа с течности Opentrons Flex. Това ръководство ви води през почти всичко, което трябва да знаете, за да настроите и използвате Flex, като се фокусира върху теми, които са най-подходящи за ежедневните потребители на Flex в лабораторна среда.
Структура на това ръководство
Opentrons Flex е сложна система, така че има много различни пътища за изучаване на всичко, което може да прави. Чувствайте се свободни да преминете направо към главата, която засяга каквато и тема да ви интересува! Напримерample, ако вече имате инсталиран Flex във вашата лаборатория, можете да пропуснете главата за инсталиране и преместване.
Ако предпочитате ръководен подход, това ръководство е структурирано така, че да можете да го следвате от началото до края.
Научете за Flex. Отличителните характеристики на Flex са изброени в Глава 1: Въведение. Въведението също така включва важна информация за безопасност и нормативна информация.
Започнете с Flex. Ако трябва да настроите своя Flex, следвайте подробните инструкции в Глава 2: Инсталиране и преместване. След това се запознайте с компонентите на Flex в Глава 3: Описание на системата.
Настройте колодата си. Конфигурирането на колодата позволява различни научни приложения на Flex. Глава 4: Модули описва периферните устройства на Opentrons, които можете да инсталирате в или върху палубата, за да изпълнявате конкретни научни задачи. Глава 5: Лабораторен софтуер обяснява как да работите с оборудване за задържане на течности.
Стартирайте протокол. Основната употреба на Flex е изпълнението на стандартизирани научни процедури, известни като протоколи. Глава 6: Разработване на протокол предлага няколко начина да получите готови протоколи или да ги проектирате сами. За да стартирате вашия протокол, следвайте инструкциите в Глава 7: Софтуер и работа, която също съдържа инструкции за изпълнение на други задачи и персонализиране на настройките на вашия робот.
Поддържайте Flex работещ. Следвайте съветите в Глава 8: Поддръжка и обслужване, за да поддържате вашия Flex чист и да работи оптимално. Или се регистрирайте за една от изброените там услуги на Opentrons и ни оставете да се погрижим за Flex вместо вас.
Научете още повече. Все още имате нужда от нещо друго? Консултирайте се с приложенията. Приложение A: Речник дефинира термини, свързани с Flex. Приложение Б: Допълнителна документация ви насочва към още повече ресурси за продукти на Opentrons и писане на код за управление на Flex.
OPENTRONS FLEX
9
ПРЕДГОВОР
Приложение C: Софтуер с отворен код обяснява как софтуерът Opentrons се хоства на GitHub като ресурс както за разработчици, така и за неразработчици.
Приложение D: Поддръжка и информация за контакт изброява как да се свържете с Opentrons, ако имате нужда от помощ извън това, което предоставя нашата документация.
Забележки и предупреждения
В това ръководство ще намерите специално форматирани блокове за бележки и предупреждения. Бележките предоставят полезна информация, която може да не е очевидна при обичайното използване на Flex. Обърнете специално внимание на предупрежденията – те се използват само в ситуации, в които рискувате да получите нараняване, повреда на оборудването, загуба или разваляне наampфайлове или реагенти, загуба на данни или други щети. Бележките и предупрежденията изглеждат така:
Sample Забележка: Това е нещо, което трябва да знаете, но не представлява никаква опасност.
Sample Предупреждение: Това е нещо, което трябва да знаете, защото има риск, свързан с него.
10
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1
Въведение
Тази глава ви запознава с екосистемата Opentrons Flex, включително цялостния дизайн на системата и наличните конфигурации на работни станции. Той също така включва важна информация за съответствие и безопасност, която трябва да прегледатеview преди да настроите своя робот Opentrons Flex. За повече подробности относно функциите на Opentrons Flex вижте главата Описание на системата.
1.1 Добре дошли в Opentrons Flex
Opentrons Flex е робот за обработка на течности, проектиран за висока производителност и сложни работни процеси. Роботът Flex е основата на модулна система, която включва пипети, хващач за лабораторен уред, приспособления за палуба, модули на палубата и лабораторен уред - всички от които можете да сменяте сами. Flex е проектиран със сензорен екран, така че можете да работите с него директно на лабораторната маса или можете да го управлявате от цялата си лаборатория с приложението Opentrons или нашите API с отворен код.
Работните станции Flex се доставят с цялото оборудване — робот, хардуер и лабораторен софтуер — от което се нуждаете, за да започнете да автоматизирате обичайните лабораторни задачи. За други приложения Opentrons Flex работи на софтуер и фърмуер с напълно отворен код и е независим от реагенти и лабораторен софтуер, което ви дава контрол върху това как проектирате и изпълнявате вашите протоколи.
Какво е новото във Flex
Opentrons Flex е част от серията роботи Opentrons за обработка на течности. Потребителите на Opentrons Flex може би са запознати с Opentrons OT-2, нашия личен пипетиращ робот. Flex надхвърля възможностите на OT-2 в няколко ключови области, осигурявайки по-висока пропускателна способност и време за преминаване.
Характеристика Пропускателна способност на пипетата
Капацитет на пипета и накрайник
Описание
Гъвкавите пипети имат 1, 8 или 96 канала. 96-каналната пипета работи на 12 пъти повече ямки наведнъж от най-голямата пипета OT-2.
Гъвкавите пипети имат по-големи обемни диапазони (1 µL, 50 5 µL) и могат да работят с всякакъв обем накрайници Opentrons Flex. Това е подобрение спрямо пипетите OT-1000, които имат по-малки обхвати и трябва да използват накрайници със съответстващ обхват на обема.
OPENTRONS FLEX
11
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
Грайфер Автоматично калибриране Сензорен екран Модул кеди Координати на слотовете на палубата Подвижен боклук Размер и тегло
Opentrons Flex Gripper вдига и премества лабораторни прибори около палубата автоматично, без намесата на потребителя. Гриперът позволява по-сложни работни потоци в рамките на едно изпълнение на протокола.
Позиционното калибриране на пипетите Flex и грайфера е напълно автоматизирано. Натиснете един бутон и инструментът ще се придвижи до прецизно обработени точки на палубата, за да определи точната си позиция, запазвайки тези данни за използване във вашите протоколи.
Flex има собствен сензорен интерфейс, който ви позволява да го управлявате директно, в допълнение към използването на приложението Opentrons. Използвайте сензорния екран, за да стартирате изпълнение на протокол, да проверите състоянието на заданието и да промените настройките направо на робота.
Гъвкавите модули се вписват в кедита, които заемат място под палубата. Caddies поставят вашето лабораторно оборудване по-близо до повърхността на палубата и позволяват прокарване на кабели под палубата. Caddies позволяват още повече конфигурации на модули и лабораторен софтуер на палубата.
Слотовете за палуби на Flex са номерирани с координатна система (A1D4), която е подобна на това как се номерират ямките на лабораторния уред.
Кошчето за боклук може да бъде поставено на различни места на тесте на Flex. Местоположението по подразбиране (слот A3) е препоръчителната позиция. Можете също да използвате хващача, за да изхвърлите боклука в опционалния улей за отпадъци.
Flex е малко по-голям и много по-тежък от OT-2. Инсталационните задачи на Flex изискват помощта на лабораторен партньор.
Подробно сравнение на техническите спецификации на робота е достъпно на Opentrons webсайт.
Роботите Flex и OT-2 работят с нашия софтуер с отворен код, а приложението Opentrons може да контролира и двата типа роботи едновременно. Въпреки че протоколите OT-2 не могат да се изпълняват директно на Flex, лесно е да ги адаптирате (вижте раздела Протоколи OT-2 в главата Разработка на протоколи за подробности).
Гъвкави работни станции
Работните станции Opentrons Flex включват робота Flex, аксесоари, пипети и захват, модули на палубата и лабораторен софтуер, необходим за автоматизиране на конкретно приложение. Всички компоненти на работната станция са модулни. Ако трябва да промените приложенията, можете да добавите или замените друг хардуер Flex и съвместими консумативи.
12
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
РАБОТНА СТАНЦИЯ NGS
Работната станция Opentrons Flex NGS автоматизира подготовката на NGS библиотека. Той може да автоматизира работните потоци за предварително секвениране, като използва всяка водеща реагентна система, включително фрагментиране и tagmentation-based библиотека prep.
В допълнение към робота Flex, NGS Workstation включва:
Хващач Избор на конфигурация на пипетата
Две 8-канални пипети (1 µL и 50 µL) 5-канална пипета (1000 µL) Улей за отпадъци Магнитен блок Температурен модул Термоциклиращ модул Лабораторен комплект с филтърни накрайници, микроцентрофужни епруветки, резервоари и PCR плаки
PCR РАБОТНА СТАНЦИЯ
Работната станция Opentrons Flex PCR автоматизира PCR настройката и работните процеси на термоциклиране за до 96 sampлес. Може да разделя охладени реагенти и samples в 96-ямкова PCR плака. С добавянето на автоматизирания модул Thermocycler, използвайте хващача, за да заредите плаката в Thermocycler и след това стартирайте избраната от вас PCR програма.
В допълнение към робота Flex, PCR работната станция включва:
Хващач Избор на конфигурация на пипетата
1-канална пипета (1 µL) и 50-канална пипета (8 µL) 1-канална пипета (50 µL) Температурен модул за улей за отпадъци Лабораторен комплект с филтърни накрайници, микроцентрофужни епруветки, резервоари и PCR плаки
OPENTRONS FLEX
13
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
РАБОТНА СТАНЦИЯ ЗА ЕКСТРАКЦИЯ НА НУКЛЕИНОВИ КИСЕЛИНИ
Работната станция Opentrons Flex за екстракция на нуклеинови киселини автоматизира изолирането и пречистването на ДНК/РНК. Той използва магнитния блок за отделяне на магнитни перли и нагревателя-шейкър за сampлизис и ресуспендиране на магнитни перли.
В допълнение към робота Flex, работната станция за екстракция на нуклеинови киселини включва:
Хващач Избор на конфигурация на пипетата
1-канална пипета (5 µL) и 1000-канална пипета (8 µL) 5-канална пипета (1000 µL) Улей за отпадъци Магнитен блок Нагревател-шейкър Модул Лабораторен комплект с филтърни накрайници, резервоари, PCR плочи и плочи с дълбоки ямки
РАБОТНА СТАНЦИЯ ЗА ПРЕЧИСТВАНЕ НА ПРОТЕИН С МАГНИТНИ ЗЪРНА
Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation автоматизира дребномащабно пречистване на протеини и протеомикаampподготовка за до 96 sampлес. Съвместим е с много популярни реагенти на основата на магнитни перли.
В допълнение към робота Flex, работната станция за пречистване на протеини включва:
Хващач Избор на конфигурация на пипетата
1-канална пипета (5 µL) и 1000-канална пипета (8 µL) 5-канална пипета (1000 µL) Улей за отпадъци Магнитен блок Нагревател-шейкър Модул Лабораторен комплект с филтърни накрайници, резервоари, PCR плочи и плочи с дълбоки ямки
РАБОТНА СТАНЦИЯ FLEX PREP
Opentrons Flex Prep Workstation автоматизира прости работни процеси за пипетиране. Конфигурирайте работната станция с 1-канални и 8-канални пипети за изпълнение на задачи като sample transfer, sample дублиране и
14
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
аликвотиране на реагенти. Конфигурирайте работната станция с 96-каналната пипета, за да извършвате високопроизводително аликвотиране на реагенти и плакиampинж.
В допълнение към робота Flex, работната станция Flex Prep включва:
Избор на конфигурация на пипетата: 1-канална пипета (5 µL) и 1000-канална пипета (8 µL) 5-канална пипета (1000 µL)
Лабораторен комплект с филтърни накрайници, микроцентрофужни епруветки и резервоари
РАБОТНА СТАНЦИЯ ЗА ПОДГОТОВКА НА ПЛАЗМИДИ
Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation автоматизира работните потоци за извличане и пречистване на плазмиди, базирани на магнитни перли. Тази работна станция е оборудвана с пипети с голям обем, нагревател-шейкър модул и магнитен блок за поемане на повечето химикали, базирани на топчета.
В допълнение към робота Flex, работната станция Plasmid Prep включва:
Грипер 1-канална пипета (5 µL) и 1000-канална пипета (8 µL) Улей за отпадъци Магнитен блок Нагревател-шейкър Модул Лабораторен комплект с филтърни накрайници, микроцентрофужни епруветки, резервоари, PCR плаки и плаки с дълбоки ямки
SYNBIO РАБОТНА СТАНЦИЯ
Работната станция Opentrons Flex SynBio автоматизира различни работни потоци на синтетична биология, като ДНК синтез и клониране. Той използва магнитния блок и температурния модул, за да поддържа повечето химикали, базирани на перли. Добавете модула Thermocycler, за да извършвате инкубации с нагрят капак и ampлификации.
В допълнение към робота Flex, работната станция SynBio включва:
Грипер 1-канална пипета (5 µL) и 1000-канална пипета (8 µL) Магнитен блок Температурен модул
OPENTRONS FLEX
15
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
Лабораторен комплект с обикновени и филтърни накрайници, микроцентрофужни епруветки, резервоари, PCR плаки и плаки с дълбоки ямки
1.2 Информация за безопасност
Роботът за работа с течности Opentrons Flex е проектиран за безопасна работа. Обърнете се към спецификациите и указанията за съответствие в този раздел, за да осигурите безопасно използване на вашия Flex. Тези насоки обхващат безопасно използване на входни и изходни връзки за продукта, включително връзки за захранване и данни, както и предупредителни етикети, намиращи се на робота Flex и свързания хардуер. Използването на устройството по начин, различен от посочения в това ръководство, може да изложи на риск потребителя и оборудването.
Символи за безопасност
Различни етикети на Flex и в това ръководство ви предупреждават за източници на потенциално нараняване или вреда.
Символ
Описание
Предупреждение: Предупреждава потребителите за потенциално опасни условия. Действия, които могат да доведат до нараняване или смърт.
Внимание: Предупреждава потребителите срещу повреда на оборудването. Загубени или повредени данни. Невъзстановимо прекъсване на извършваната операция.
Токов удар: Идентифицира компонентите на инструмента, които могат да представляват риск от токов удар, ако инструментът се борави неправилно.
Гореща повърхност: Идентифицира компоненти на инструмента, които представляват риск от нараняване поради висока топлина/температури, ако инструментът се борави неправилно.
Точка на прищипване: Идентифицира компонентите на инструмента, които могат да представляват риск от нараняване, когато са в движение.
16
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
На Flex ще намерите следните етикети:
Етикети за интелектуална собственост Етикети за съответствие с нормативните изисквания (напр. ETL) Етикети за електрически опасност Етикети с общо предупреждение Етикети за продукти Етикети за точка на прищипване Висок обемtage етикети Етикети за номинална мощност
Предупреждения за електрическа безопасност
Винаги спазвайте следните предупреждения за електрическа безопасност:
Символ
Описание
Включете робота в заземена верига от клас 1. Вижте раздела Свързване на захранването в главата Описание на системата.
Не свързвайте (включвайте), изключвайте (изключвайте) или използвайте захранващи кабели за променлив ток, ако: Кабелът е протрит или повреден. Други свързани кабели, кабели или гнезда са протрити или повредени.
Използването на повредени захранващи кабели може да причини опасност от токов удар, което да доведе до сериозно нараняване или повреда на робота.
Не подменяйте захранващия кабел за променлив ток, освен по указание на поддръжката на Opentrons.
За повече информация относно електрическите изисквания вижте раздела Консумация на енергия в главата Инсталиране и преместване.
OPENTRONS FLEX
17
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
Допълнителни предупреждения за безопасност
Винаги спазвайте следните допълнителни предупреждения за безопасност:
Символ
Описание
Opentrons Flex не е сертифициран за употреба с експлозивни или запалими течности. Не зареждайте пластини, епруветки или флакони, съдържащи експлозивни или запалими течности, в робота и не работете по друг начин с инструмента с експлозивни или запалими течности в корпуса.
Използвайте добри лабораторни практики и спазвайте предпазните мерки на производителя при работа с химикали. Opentrons не носи отговорност за щети поради или в резултат на използването на опасни химикали.
Flex тежи 88.5 kg (195 lbs). В резултат на това са необходими двама души, за да го повдигнат и преместят безопасно. Вижте раздела Преместване в главата Инсталиране и Преместване.
Flex трябва да бъде поставен върху повърхност, способна да издържи теглото му от 88.5 kg (195 lbs) с достатъчна повърхност, за да побере робота плюс минималното му свободно разстояние (20 cm/8 in). Вижте раздела Изисквания за безопасност и работа в главата Инсталиране и преместване.
Flex може да излъчва вибрации, докато работи. Поставете робота върху повърхност, която е здрава, равна и водоустойчива с напречни скоби или заварени съединения. Вижте раздела Изисквания за безопасност и работа в главата Инсталиране и преместване.
Предупреждения за безопасност
За да защитите Flex от повреда, следвайте тези предпазни мерки:
18
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
Символ
Описание
Използвайте лабораторен софтуер, който е съвместим с ANSI/SLAS или одобрен от Opentrons. Вижте главата Лабораторен софтуер.
Дръжте корозивни материали, агенти или други увреждащи материали далеч от робота.
Биологична безопасност
Третирайте проби и реагенти, съдържащи материали, взети от хора, като потенциално инфекциозни агенти. Opentrons препоръчва използването на безопасни лабораторни процедури, както е обяснено в Биобезопасност в микробиологични и биомедицински лаборатории (BMBL), 6-то издание.
При нормални обстоятелства Flex не създава откриваеми аерозоли от изходни течности. Въпреки това, при определени условия е възможно да се генерират аерозоли от изходни течности. Когато работите с изходни течности от ниво 2 на биобезопасност или по-високо, обмислете вземането на предпазни мерки срещу излагане на аерозол, в съответствие с местните регулаторни органи. За да сведете до минимум потенциалния риск от излагане на аерозол от робота, уверете се, че:
Извършете поддръжка, както е описано в глава Поддръжка и сервиз. Правилно инсталирайте и закрепете всички капаци на инструментите, пипети, модули и лабораторни прибори. Използвайте подходяща техника за пипетиране, за да помогнете за смекчаването на аерозолите.
Токсични изпарения
Ако работите с летливи разтворители или токсични вещества, използвайте ефективна лабораторна вентилационна система, за да отстраните всякакви изпарения, които могат да се отделят.
Запалими течности
Flex не е оценен за употреба със запалими течности и не трябва да се използва със запалими течности.
OPENTRONS FLEX
19
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
1.3 Съответствие на нормативната уредба
Opentrons Flex отговаря на всички приложими изисквания на следните стандарти за безопасност и електромагнитни стандарти.
Безопасност
Правило ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Заглавие
Изисквания за безопасност за електрическо оборудване за измерване, контрол и лабораторна употреба Част 1: Общи изисквания
Специфични изисквания за лабораторно оборудване за смесване и разбъркване
Електромагнитна съвместимост
Правило ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR част 15 подчаст B клас A IC ICES-003
Заглавие
Електрическо оборудване за измерване, контрол и лабораторна употреба. Изисквания за електромагнитна съвместимост, част 1: Общи изисквания. Непреднамерени радиатори
Оборудване за управление на спектъра и телекомуникационни смущения Стандартно оборудване за информационни технологии (включително цифрови апарати)
Предупреждения и бележки на FCC
Предупреждение: Промени или модификации на това устройство, които не са изрично одобрени от Opentrons, могат да анулират правото на потребителя да работи с оборудването.
Това устройство е в съответствие с част 15 от правилата на FCC. Операцията е предмет на следното:
20
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 1 ВЪВЕДЕНИЕ
Това устройство може да не причинява вредни смущения. Това устройство трябва да приема всякакви получени смущения, включително смущения, които могат да причинят нежелани
операция.
Забележка: Това оборудване е тествано и е установено, че отговаря на ограниченията за цифрово устройство от клас A, съгласно част 15 от правилата на FCC. Тези ограничения са предназначени да осигурят разумна защита срещу вредни смущения, когато оборудването работи в търговска среда. Това оборудване генерира, използва и може да излъчва радиочестотна енергия и, ако не е инсталирано и използвано в съответствие с ръководството за употреба, може да причини вредни смущения в радиокомуникациите. Работата на това оборудване в жилищен район има вероятност да причини вредни смущения, в който случай потребителят ще трябва да коригира смущенията за своя сметка.
Канада ISED съответствие
Канада ICES-003(A) / NMB-003(A)
Този продукт отговаря на приложимите технически спецификации на Канада за иновации, наука и икономическо развитие.
Le pésent produit est conforme aux spécifications техники приложими за иновации, наука и развитие économique Канада.
Предупреждение за околната среда
Предупреждение: Рак и репродуктивни вреди www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi предварителна сертификация
Wi-Fi модулът е предварително сертифициран за използване в много региони:
Съединени щати (FCC): FCC идентификатор UAY-W8997-M1216 Европейска икономическа зона (CE): Няма публичен идентификатор (самодекларация) Канада (IC): Идентификационен номер на хардуерна версия W8997-M1216 Япония (TELEC): Сертификационен номер 020-170034 Индия (WPC): Регистрационен номер ETA-SD-20191005525 (самостоятелна декларация)
OPENTRONS FLEX
21
ГЛАВА 2
Монтаж и преместване
Тази глава описва как да подготвите вашата лаборатория за Opentrons Flex, как да настроите робота и как да го преместите, ако е необходимо. Преди да приемете доставката на вашия Flex, уверете се, че вашата лаборатория или съоръжение отговаря на всички критерии в раздела Изисквания за безопасност и работа. Когато дойде време да стартирате вашия Flex, следвайте подробните инструкции в разделите Разопаковане, Първо пускане и Инсталиране и калибриране на инструмента или използвайте услугата Opentrons Onsite Support Set Up. И ако някога се наложи да преместите своя Flex на ново място, близо или далеч, следвайте стъпките в раздела Преместване.
2.1 Изисквания за безопасност и работа
Къде да поставите Opentrons Flex
Пространството е ценна стока в почти всяка лаборатория. Вашият Flex ще се нуждае от малко, но не прекалено много, тъй като е проектиран да се побере на половината от стандартна лабораторна маса. Уверете се, че имате място, което отговаря на следните критерии.
Повърхност на пейката: Стационарна, здрава, равна, водоустойчива повърхност. Не се препоръчват маси или пейки с колела (дори заключващи се колела). Flex се движи бързо и има голяма маса, която може да разклати или дисбалансира леки или подвижни маси.
Носеща тежест: Само роботът тежи 88.5 kg (195 lb) и трябва да се повдига само от двама души, работещи заедно. Поставете робота върху повърхност, която може лесно да издържи теглото му плюс теглото на всякакви модули, лабораторни прибори, течности или друго лабораторно оборудване, което ще използвате във вашите приложения.
Работно пространство: Основните размери на робота са 87 cm W x 69 cm D x 84 cm H (около 34″ x 27″ x 33″). Flex се нуждае от 20 cm (8″) пространство отстрани и отзад за кабели, USB връзки и за разсейване на изгорелите газове от модули, които загряват и охлаждат.
Предупреждение: Не поставяйте страните или гърба на Flex изравнени със стена.
22
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
84 см 33″
87 см 34″
Размери на основата на Opentrons Flex.
69 см 27″
20 см 8″
20 см 8″
20 см 8″
Топ view на Opentrons Flex, показващ минимален страничен и заден просвет.
OPENTRONS FLEX
23
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Консумирана мощност
Opentrons Flex трябва да бъде свързан към стенен контакт на или близо до мястото на пейката, където го инсталирате. Свързвайте Flex само към вериги, които могат да поемат неговата максимална мощност:
Входяща мощност: 36 VDC, 6.1 A Консумация на празен ход: 30 W Типична консумация: 40 W (по време на изпълнение на протокол) Максимална консумация: Приблизително 50 W
Точната консумация на енергия зависи от:
Количеството и вида на движението, извършено по време на протокол. Времето, което роботът прекарва бездействащ. Състоянието на светлините на робота. Колко инструмента са прикачени.
Не забравяйте да вземете предвид друга електроника, която консумира енергия в същата верига, включително модули Flex със собствени захранвания. Напримерample, модулът Thermocycler има максимална консумация на енергия (630 W), която е много по-голяма от тази на самия робот Flex. Ако е необходимо, консултирайте се с управителя на вашия обект, за да се уверите, че отговаря на изискванията за захранване на вашето оборудване.
Условия на околната среда
Условията на околната среда за препоръчителна употреба, приемлива употреба и съхранение варират:
Препоръчва се за системна работа
Приемливо за работа на системата
Околна температура +20 до +25 °C
+2 до +40 °C
Относителна влажност Надморска височина
40%, без конденз
Приблизително 500 м надморска височина
30%, без кондензация (под 80 °C)
До 2000 м надморска височина
Съхранение и транспортиране
-10 до +60 °C
10%, без кондензация (под 85 °C)
До 2000 м надморска височина
24
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Opentrons потвърди производителността на Opentrons Flex в условията, препоръчани за работа на системата, и работата при тези условия трябва да осигури оптимални резултати. Flex е безопасен за използване при условия, приемливи за работа на системата, но резултатите може да варират. Не включвайте и не използвайте Flex при условия извън тези граници. Условията за съхранение и транспортиране се прилагат само когато роботът е напълно изключен от захранването и друго оборудване.
2.2 Разопаковане
Честито! Вашият Opentrons Flex пристигна и вие сте подготвили място за него във вашата лаборатория. Нека отворим този сандък с чудовища, да премахнем робота и да го подготвим за работа. Информацията в този раздел предоставя списък с части и инструкции, които ви превеждат през стъпките, необходими, за да разопаковате Flex, да го настроите и да бъде готов за употреба. Разделихме процедурата по настройка на три части:
Част 1 обхваща разглобяването на щайгата. Част 2 обхваща отделянето на Flex от щайгата и преместването му до място за окончателно сглобяване. Част 3 обхваща окончателното сглобяване и включването на робота за първи път.
Необходими усилия и време
Добре е да помолите партньор от лабораторията да ви помогне с процеса на разопаковане, повдигане, преместване и сглобяване. Ще трябва да отделите около 30 минути до един час за това усилие.
Забележка: Flex изисква двама души, за да го повдигнат правилно. Освен това повдигането и носенето на Flex за дръжките е най-добрият начин за преместване на робота.
Щайга и опаковъчен материал
Разопаковането на Flex ви дава страхотен робот, но също така оставате с няколко големи панела за щайги заедно с разнообразни транспортни компоненти и подложки. Въпреки че можете да изхвърлите този материал, препоръчваме ви да запазите тези елементи, ако има налично място за съхранение. Опаковката е за многократна употреба, което помага да подготвите вашия Flex за изпращане, ако някога трябва да го изпратите някъде другаде (напр. на конференция или ново съоръжение) в бъдеще.
OPENTRONS FLEX
25
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Продуктови елементи
Flex се доставя с компонентите, изброени по-долу. Пипетите, захващащото устройство и модулите се доставят в отделна опаковка от основната каса Flex, дори ако сте ги закупили заедно като работна станция.
(1) Робот Opentrons Flex
(1) USB кабел
(1) Захранващ кабел
(1) Ethernet кабел
(5) L-образни ключове (12 mm шестограм, 1.5 mm шестограм, 2.5 mm шестограм, 3 mm шестограм,
T10 Torx)
(1) Висулка за аварийно спиране
(1) Слот за палуба с щипки за лабораторни прибори
(4) Резервни скоби за лабораторни прибори
(1) Сонда за калибриране на пипетата
(4) Дръжки и капачки за носене
(1) Горен панел на прозореца
(4) Панели на страничните прозорци
(1) 2.5 mm шестостенна отвертка
(1) гаечен ключ 19 мм
(16 + резервни части) Винтове за прозорци (M4x8 mm плоска глава)
26
(10) Резервни винтове за слот на палубата (M4x10 mm вътрешен ключ)
(12) Резервни винтове за скоби за палубата (M3x6 mm вътрешен ключ)
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Част 1: Отстранете щайгата
Opentrons доставя вашия Flex в здрава щайга от шперплат. Сандъкът за транспортиране използва кука и резе clamps за закрепване на горния, страничния и долния панел заедно. Използването на ключалки вместо пирони или винтове означава, че няма да имате нужда от лост (или много сила), за да разглобите щайгата и можете да я сглобите отново по-късно, ако е необходимо.
Забележка: Краищата на щайгата могат да се нагрубят по време на транспортиране. Може да искате да използвате работни ръкавици, за да предпазите ръцете си от дървени трески.
За да освободите ключалките, обърнете резето нагоре и го завъртете наляво (обратно на часовниковата стрелка). Това действие премества клamp рамото от съответната му задържаща скоба. След това можете да обърнете рамото на резето настрани от щайгата.
1 Отключете осемте ключалки, държащи горната част отстрани.
2 Отстранете горния панел, след като освободите ключалките.
OPENTRONS FLEX
27
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ 3 Разрежете синята торбичка за транспортиране, отстранете тези елементи от подплатата и ги оставете настрана:
Потребителски комплект Захранване, Ethernet и USB кабели Висулка за аварийно спиране
4 Отстранете горната част от подложката от пяна, за да изложите панелите на прозореца. Подложката предпазва страничните и горните панели.
5 Отстранете панелите на прозореца и ги оставете настрани. Ще ги прикачите по-късно.
28
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
6 Отключете останалите 16 ключалки, държащи страничните панели един към друг и основата на щайгата. 7 Отстранете страничните панели и ги оставете настрана.
Част 2: Освободете гъвкавостта
След като завършите стъпките в част 1, сега трябва да видите робот, който е в защитна чанта и е прикрепен към оранжеви стоманени монтажни компоненти. Чантата обхваща робота и го предпазва от външната среда. Стоманени скоби закрепват робота към дъното на щайгата. Две рамки за транспортиране поддържат робота, като разпределят теглото му равномерно и го поддържат твърд, така че да не се деформира по време на транспортиране. Продължете да разопаковате Flex и да го извадите от основата на кашона.
8 Като използвате 19 мм гаечен ключ от потребителския комплект, развийте скобите от дъното на касата. Можете да изхвърлите скобите или да ги запазите за бъдеща употреба.
OPENTRONS FLEX
29
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ 9 Издърпайте или навийте транспортната чанта докрай надолу, за да видите целия робот.
10 С помощта на вашия лабораторен партньор хванете дръжките в оранжевите транспортни рамки от двете страни на основата на робота, повдигнете Flex от основата на щайгата и го поставете на пода. Запазете или изхвърлете основата на щайгата и рамката за транспортиране.
30
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ 11 С помощта на 12 mm шестоъгълен L-ключ от потребителския комплект отстранете четирите болта, държащи транспортните рамки към
на Flex. Запазете или изхвърлете рамките и болтовете.
12 Отстранете четирите алуминиеви дръжки от потребителския комплект. Завийте дръжките на същите места, където държаха 12 mm болтовете на транспортната рамка.
OPENTRONS FLEX
31
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
13 С помощта на вашия лабораторен партньор повдигнете Flex за дръжките за носене и го преместете на работна маса за окончателно сглобяване.
Част 3: Окончателно сглобяване и включване
След като преместите Flex във временна работна зона или постоянен дом, е време да поставите финалните щрихи на вашия нов робот.
14 Ако сте преместили робота до крайното му работно място, отстранете дръжките за носене и ги сменете с довършителните капачки. Капачките затварят отворите на дръжката в рамката и придават на робота чист вид. Върнете дръжките в потребителския комплект за съхранение.
32
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
15 Вземете горния и страничните панели от опаковъчната пяна, която сте оставили настрана, след като сте свалили горната част на щайгата.
16 Поставете панелите на прозореца към Flex, като следвате информацията за етикетиране на предния защитен филм. След това отстранете защитното фолио.
17 С помощта на скосените винтове за прозорци и 2.5 mm отвертка от потребителския комплект прикрепете панелите на прозорците към Flex. Уверете се, че скосените (V-образни) отвори в панелите на прозореца са обърнати навън (към вас). Това позволява на винтовете да паснат наравно с повърхността на прозореца.
Предупреждение: Неправилното ориентиране на панелите може да доведе до повреда. Прекомерният момент на затягане на винта може да напука панелите. Ръчно затегнете винтовете, докато панелите на прозореца са достатъчно сигурни. Това не е изпитание на силите.
OPENTRONS FLEX
33
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ 18 С помощта на 2.5 мм отвертка от потребителския комплект отстранете заключващите винтове от портала. Тези
винтовете предотвратяват движението на портала по време на транспортиране. Заключващите винтове на портала са разположени: На лявата странична релса близо до предната част на робота. Под вертикалното рамо на портала. На дясната странична релса близо до предната част на робота в оранжева скоба. Тук има два винта.
Порталът се движи лесно на ръка след отстраняване на всички транспортни винтове. 19 Отрежете и отстранете двете гумени ленти, които държат кошчето за боклук на място по време на транспортиране.
34
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
20 Прикрепете захранващия кабел към Flex и го включете в контакта. Уверете се, че на палубата няма препятствия. Завъртете превключвателя на захранването отзад вляво на робота. След като бъде включен, порталът се премества в началното си местоположение и сензорният екран показва допълнителни инструкции за конфигуриране.
Сега, когато вашият Flex е изваден от кутията и готов за работа, продължете към раздела за първо изпълнение по-долу.
2.3 Първо бягане
Извършете основна настройка на сензорния екран, преди да свържете друг хардуер към вашия Flex. Роботът ще ви преведе през свързването към вашата лабораторна мрежа, актуализирането до най-новия софтуер и персонализирането на Flex, като му даде име.
Включване
Когато включите Flex, логото на Opentrons ще се появи на сензорния екран. След няколко минути ще се покаже екранът „Добре дошли във вашия Opentrons Flex“.
Поздравителният екран на Opentrons Flex. Трябва да видите този екран само когато стартирате своя Flex за първи път.
OPENTRONS FLEX
35
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Свържете се към мрежа или компютър
Следвайте подканите на сензорния екран, за да свържете своя робот, за да може да проверява за софтуерни актуализации и да получава протокол fileс. Има три метода на свързване: Wi-Fi, Ethernet и USB.
Опции за мрежова връзка. Трябва да имате интернет връзка, за да настроите Flex. Wi-Fi: Използвайте сензорния екран, за да се свържете с Wi-Fi мрежи, които са защитени с WPA2 лично удостоверяване (повечето мрежи, които изискват само парола за присъединяване, попадат в тази категория).
Забележка: Flex не поддържа портали за прихващане (мрежи, които нямат парола, но зареждат a webстраница за удостоверяване на потребителите след свързване).
Можете също да се свържете към отворена Wi-Fi мрежа, но това не се препоръчва.
Предупреждение: Свързването към отворена Wi-Fi мрежа ще позволи на всеки в обхвата на мрежовия сигнал да контролира вашия робот Opentrons Flex без удостоверяване.
Ако трябва да се свържете към Wi-Fi мрежа, която използва корпоративно удостоверяване (включително „eduroam“ и подобни академични мрежи, които изискват потребителско име и парола), първо се свържете с приложението Opentrons чрез Ethernet или USB, за да завършите първоначалната настройка. След това се свържете с корпоративната Wi-Fi мрежа в мрежовите настройки за вашия Flex. За достъп до мрежовите настройки:
36
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
1. Щракнете върху Устройства в лявата странична лента на приложението Opentrons. 2. Щракнете върху менюто с три точки () за вашия Flex и изберете Настройки на робота. 3. Щракнете върху раздела Работа в мрежа.
Изберете вашата мрежа от падащото меню или изберете „Присъединете се към друга мрежа…“ и въведете нейния SSID. Изберете корпоративния метод за удостоверяване, който използва вашата мрежа. Поддържаните методи са:
EAP-TTLS с TLS EAP-TTLS с MS-CHAP v2 EAP-TTLS с MD5 EAP-PEAP с MS-CHAP v2 EAP-TLS
Всеки от тези методи изисква потребителско име и парола и в зависимост от вашата точна мрежова конфигурация може да изисква сертификат files или други опции. Консултирайте се с ИТ документацията на вашето съоръжение или се свържете с вашия ИТ мениджър за подробности относно настройката на вашата мрежа.
Ethernet: Свържете вашия робот към мрежов комутатор или хъб с Ethernet кабел. Можете също така да се свържете директно към Ethernet порта на вашия компютър, като започнете от версия на системата за роботи 7.1.0.
USB: Свържете предоставения USB A-към-B кабел към USB-B порта на робота и отворен порт на вашия компютър. Използвайте USB B-към-C кабел или USB A-към-C адаптер, ако вашият компютър няма USB-A порт.
За да продължите с настройката, свързаният компютър трябва да има инсталирано и работещо приложение Opentrons. За подробности относно инсталирането на приложението Opentrons вижте раздела Инсталиране на приложението в главата Софтуер и работа.
Инсталирайте софтуерни актуализации
Сега, след като сте се свързали с мрежа или компютър, роботът може да проверява за актуализации на софтуера и фърмуера и да ги изтегли, ако е необходимо. Ако има актуализация, инсталирането може да отнеме няколко минути. След като актуализацията приключи, роботът ще се рестартира.
OPENTRONS FLEX
37
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Прикрепете висулка за аварийно спиране
Свържете включената висулка за аварийно спиране (E-stop) към допълнителен порт (AUX-1 или AUX-2) на гърба на робота.
Преди и след свързване на висулката за аварийно спиране.
Прикачването и активирането на E-stop е задължително за свързване на инструменти и изпълнение на протоколи на Flex. За повече информация относно използването на E-stop по време на работа на робота вижте раздела Висулка за аварийно спиране в главата Описание на системата.
Дайте име на своя робот
Наименуването на вашия робот ви позволява лесно да го идентифицирате във вашата лабораторна среда. Ако имате няколко робота Opentrons във вашата мрежа, не забравяйте да им дадете уникални имена. След като потвърдите името на своя робот, ще бъдете отведени до таблото за управление на Opentrons Flex. Вероятно следващата стъпка, която ще искате да предприемете, е прикрепването на инструменти, което е разгледано в следващия раздел.
2.4 Инсталиране и калибриране на инструмента
След първоначалната настройка на робота, следващата стъпка е да прикрепите инструменти към робота и да ги калибрирате.
За да инсталирате инструмент, първо докоснете Инструменти на сензорния екран или отидете в секцията Пипети и модули на екрана с подробности за устройството в приложението Opentrons. Изберете празен монтаж и изберете Прикрепете пипета или Прикрепете захващане. Ако стойката, която искате да използвате, вече е заета, първо трябва да откачите пипетата или хващача.
38
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Забележка: Цялостният процес на инсталиране е един и същ, независимо дали използвате сензорния екран или приложението Opentrons. Каквото и устройство да започнете, ще контролира процеса на инсталиране, докато не го завършите или отмените.
Ако започнете от сензорния екран, приложението ще покаже на робота като „зает“. Ако започнете в приложението, сензорният екран ще покаже модал, показващ, че инсталирането на инструмента е в ход.
Точният процес на инсталиране варира в зависимост от инструмента, който прикрепяте, както е описано в разделите по-долу. Всички инструменти имат автоматична процедура за калибриране, която трябва да извършите веднага след инсталирането.
Пипетен монтаж
Когато инсталирате пипета, ще бъдете водени през следните стъпки на сензорния екран или в приложението Opentrons.
1. ИЗБЕРЕТЕ ТИП ПИПЕТА Изберете между 1- или 8-канална пипета и 96-канална пипета. Закрепването на 96-каналната пипета изисква няколко допълнителни стъпки, тъй като тя се прикрепя към специална монтажна плоча, която обхваща двете стойки за пипети.
2. ПОДГОТВЕТЕ ЗА ИНСТАЛИРАНЕ Отстранете лабораторното оборудване от палубата и почистете работната зона, за да улесните закрепването и калибрирането. Също така съберете необходимото оборудване, като сонда за калибриране, шестостенна отвертка и монтажна плоча (за 96-каналната пипета).
3. СВЪРЖЕТЕ И ЗАКРИПЕТЕ ПИПЕТАТА Порталът ще се премести към предната част на робота, за да можете да прикрепите пипетата.
1- и 8-каналните пипети се свързват директно към стойка за пипета. 96-каналната пипета изисква монтажна плоча. За да прикрепите монтажната плоча, първо трябва да откачите каретката на оста z за дясната стойка на пипетата.
OPENTRONS FLEX
39
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Свържете пипетата към избраната стойка за пипета и затегнете нейните винтове.
4. ИЗПЪЛНЕТЕ АВТОМАТИЗИРАНО КАЛИБРИРАНЕ За да калибрирате пипетата, прикрепете сондата за калибриране към подходящия накрайник на пипетата. Пипетата автоматично ще се премести, за да докосне определени точки на тестето и ще запази тези стойности за калибриране за бъдеща употреба. След като калибрирането приключи и сте извадили сондата, пипетата ще бъде готова за използване в протоколи.
Монтаж на грайфер
Когато инсталирате грайфера, ще бъдете водени през следните стъпки на сензорния екран или в приложението Opentrons.
1. ПОДГОТВЕТЕ ЗА ИНСТАЛИРАНЕ Отстранете лабораторното оборудване от палубата и почистете работната зона, за да улесните закрепването и калибрирането. Също така вземете необходимата шестостенна отвертка и се уверете, че щифтът за калибриране е в зоната за съхранение на ръкохватката.
2. СВЪРЖЕТЕ И ЗАСИПЕТЕ ЗАХВАЩАТЕЛЯ. Порталът ще се премести към предната част на робота, за да можете да прикрепите захващащия елемент. Свържете ръкохватката към удължителя и затегнете винтовете му.
3. ИЗПЪЛНЕТЕ АВТОМАТИЗИРАНО КАЛИБРИРАНЕ За да калибрирате грайфера, поставете щифта за калибриране в предната челюст. Грайферът автоматично ще се премести, за да докосне определени точки на палубата и ще запази тези стойности за калибриране за бъдеща употреба. След това повторете същия процес с щифта за калибриране в задната челюст. След като калибрирането приключи и поставите щифта обратно на мястото му за съхранение, грайферът ще бъде готов за използване в протоколи.
2.5 Преместване
Този раздел предоставя съвети и инструкции как да преместите своя робот Opentrons Flex на къси и дълги разстояния.
40
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Кратки движения
Едно кратко преместване обхваща диапазон от разстояния от „нека просто го преместим малко“ до другия край на лабораторията, надолу по коридора или друг етаж във вашата сграда. В тези случаи можете да преместите вашия Flex на ръка. Транспортирането му на ръчна количка също е добър вариант.
Предупреждение: Flex тежи 88.5 кг. В резултат на това са необходими двама души, за да го повдигнат и преместят безопасно.
Прикрепете отново дръжките за повдигане, за да преместите вашия Flex на ново, близко място. Повдигането и носенето на Flex за дръжките е правилният начин за преместване на робота на къси разстояния. Отстранете дръжките и ги съхранявайте в потребителския комплект, след като преместването приключи. За да предотвратите повреда на робота, винаги използвайте дръжките за повдигане, за да го вземете и преместите. Не хващайте рамката, за да повдигнете или преместите своя робот.
Движения на дълги разстояния
Преместване на дълги разстояния транспортира вашия Flex извън територията на вашия университет, съоръжение или институция. От другата страна на града, в нов град, щат, провинция или страна са бившиampлесен за преместване на дълги разстояния. В този случай ще трябва да опаковате Flex, за да го предпазите от елементи, удари и груби движения, които могат да възникнат по време на транспортиране.
Ако сте запазили кутията за транспортиране и вътрешните опори, доставени с вашия Flex, можете да го преопаковате в тези материали за преместване на дълги разстояния. Следвайте стъпките за разопаковане в обратен ред, за да подготвите вашия Flex за преместване на дълги разстояния. По принцип трябва:
Изключете захранващия и мрежовия кабел, ако е свързан. Отстранете целия прикрепен хардуер и лабораторен софтуер. Поставете отново плочите на палубата. Заключете портала (вижте раздела Общи съвети за преместване по-долу). Отстранете и съхранявайте панелите на прозореца.
Ако сте запазили оригиналния сандък:
Прикрепете отново рамката за транспортиране към Flex и я закрепете към основата на палета с помощта на L-скобите. Добавете подложка и сглобете отново щайгата за транспортиране.
OPENTRONS FLEX
41
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Ако нямате оригиналния сандък и свързания с него материал, свържете се с реномирана транспортна компания. Те могат да управляват процеса на опаковане, транспортиране и доставка вместо вас.
Общи съвети за преместване
ИЗКЛЮЧВАЙТЕ ЗАХРАНВАЩИТЕ И МРЕЖОВИТЕ КАБЕЛИ Преди да преместите вашия Flex, не забравяйте да: Изключите захранването и да го извадите от захранването. Изключете Ethernet или USB кабела, ако се използва.
ЗАКЛЮЧВАНЕ НА ПОРТАЛА Преди да преместите вашия Flex, поставете отново заключващите винтове, за да задържите портала на място. Точките за заключване на портала са разположени: На лявата странична релса близо до предната част на робота. Под вертикалното рамо на портала. На дясната странична релса близо до предната част на робота. Заключването на тази част от портала изисква малкия
оранжева скоба и два заключващи винта.
42
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
ВЪРНЕТЕ В ДОМАШНОСТ ПАРТНЕРА Може да не искате да заключвате портала, ако само премествате робота на близко място. Ако решите да не го заключвате, използвайте поне сензорния екран или приложението Opentrons, за да изпратите портала в начална позиция, преди да го изключите. За да започнете портала чрез сензорния екран, докоснете менюто с три точки () и след това докоснете Начало портал. За да приберете портала чрез приложението Opentrons: Щракнете върху Устройства. Кликнете върху вашия Flex в списъка с устройства. Щракнете върху менюто с три точки () и след това щракнете върху Начален портал.
ПРЕМАХНЕТЕ МОДУЛИ Модулите в палубата и други приставки добавят допълнително тегло към вашия Flex. Те също така влияят на центъра на тежестта на робота, което може да го накара да се чувства „напрегнат“, когато го повдига. За да облекчите и балансирате робота, отстранете всички прикрепени инструменти и лабораторни прибори, преди да го вземете.
ПРЕСТАНОВЕТЕ СЛОТОВЕТЕ НА ПАЛУДА Препоръчваме да закрепите отново слотовете на палубата за преместване на дълги разстояния. Закрепването на слотовете на първоначалните им места помага за предотвратяване на случайна загуба. Повторното закрепване на слотовете на палубата за кратки премествания из лабораторията не е задължително.
РЕКАЛИБРИРАНЕ СЛЕД ПРЕМЕСТВАНЕ Трябва да калибрирате повторно всички инструменти и модули, след като ги инсталирате отново. За повече подробности относно калибрирането на модула вижте глава Модули.
OPENTRONS FLEX
43
ГЛАВА 2: ИНСТАЛИРАНЕ И ПРЕМЕСТВАНЕ
Последни мисли за преместване
Вашият Flex е здрава и добре изградена машина, но също така е и прецизен научен инструмент, проектиран за строги допуски. В резултат на това трябва да се отнасяте внимателно към него, когато го премествате в рамките на местната работна зона или го изпращате в цялата страна. Това означава да следвате предоставените тук указания и да използвате собствения си здрав разум за това как да транспортирате скъпо лабораторно оборудване. В крайна сметка: когато местите вашия Flex, бъдете внимателни и вземете допълнителна подложка.
Ако имате въпроси или притеснения относно преместването на вашия Flex, свържете се с нас на support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3
Описание на системата
Тази глава описва хардуерните системи на Opentrons Flex, които са в основата на неговите основни функции за лабораторна автоматизация. Палубата, порталът и стойките за инструменти на Opentrons Flex позволяват използването на прецизни компоненти за работа с течности и лабораторен софтуер. Сензорният екран на устройството позволява стартиране на протоколи и проверка на състоянието на робота, без да е необходимо да донасяте компютъра си до лабораторната маса. Кабелната и безжичната връзка позволява допълнителен контрол от приложението Opentrons (вижте главата Софтуер и работа за повече подробности) и разширяване на функциите на системата чрез свързване на периферни устройства (вижте главата Модули).
3.1 Физически компоненти
Камера
Светлина за състоянието
Сензорен екран
Рамка
Портална палуба
Входна врата
Местоположение на физическите компоненти на Opentrons Flex.
Капачки за дръжките на страничните прозорци
OPENTRONS FLEX
45
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Рамка и корпус
Рамката на робота Opentrons Flex осигурява твърдост и структурна опора за неговата платформа и портал. Всички механични подсистеми са разположени и монтирани към основната рамка. Рамката е изградена предимно от ламарина и алуминиеви профили.
Металната рамка има отвори за странични прозорци и предна врата от прозрачен поликарбонат, които ви позволяват да видите какво се случва във Flex. Пантите на предната врата се отварят за достъп до вътрешността на системата. С отворена предна врата можете да прикрепите инструменти, модули и палубни приспособления; подготви тестето преди протокол; или манипулирайте състоянието на тестето по време на протокол.
Белите LED ленти във вътрешните горни ръбове на рамката осигуряват софтуерно контролирано околно осветление. 2-мегапикселова камера може да снима палубата и работната зона за запис и проследяване на изпълнението на протокола.
Палуба и работна зона
Палубата е машинно обработена алуминиева повърхност, върху която се изпълняват автоматизирани научни протоколи. Декът има 12 основни гнезда във формат ANSI/SLAS, които могат да бъдат преконфигурирани, за да държат лабораторен софтуер, модули и консумативи. Слотовете на палубата се идентифицират чрез координатна система, като слот A1 е отзад вляво и слот D3 отпред вдясно.
Разширителен слот (за термоциклер) Работна зона
Staging зона
Области на тестето във Flex.
46
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Работната зона е физическото пространство над палубата, което е достъпно за пипетиране. Лабораторният уред, поставен в слотове A1 до D3, е в работната зона.
Opentrons Flex се доставя с подвижни слотове за дека за всички 12 позиции в работната зона. Всеки слот на палубата има ъглови скоби за лабораторни прибори за сигурно поставяне на лабораторни прибори на палубата.
Можете да преконфигурирате палубата, като замените слотовете с други приспособления за палубата, включително подвижния кош за боклук, улея за отпадъци и модулните кадита. Слотът за разширение зад A1 се използва само за създаване на допълнително място за модула Thermocycler, който заема слотовете A1 и B1.
Забележка: Слотовете за колода са взаимозаменяеми в колона (1, 2 или 3), но не и между колони; слотовете за колона 1 и колона 3 са различни части въпреки сходния им размер. Можете да разберете в коя колона влиза даден слот, като ориентирате синята лабораторна скоба отзад вляво.
Трябва да оставите слотовете за палуби инсталирани на местата, където искате да поставите самостоятелен лабораторен софтуер. Палубата и предметите, поставени върху нея, остават статични, освен ако не бъдат преместени от хващача или ръчна намеса.
Stagинж. зона
В staging area е допълнително пространство от дясната страна на палубата. Можете да съхранявате лабораторен софтуер на това място, след като инсталирате staging области слотове. Лабораторният уред, поставен в слотове A4 до D4, е в staging област. Гъвкавите пипети не могат да достигнат до staging зона, но захващащото устройство може да вземе и премести лабораторни прибори от и до това място. Добавянето на допълнителни слотове помага да се запази работната площ на разположение за оборудването, използвано във вашите автоматизирани протоколи.
Stagслотовете за ing area са включени в определени конфигурации на работни станции и също са достъпни за закупуване от https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Staging зона с инсталирани слотове
Приспособления за палуба
Приспособленията са хардуерни елементи, които заместват стандартните слотове за палуби. Те ви позволяват да персонализирате оформлението на палубата и да добавите функционалност към вашия Flex. В момента оборудването на палубата включва stagслотове за зона, вътрешното кошче за боклук и външния улей за отпадъци. Можете да инсталирате приспособления само в няколко специфични слота за колода. Следващата таблица изброява местоположенията на тестетата за всяко приспособление.
Приспособление Staging площ слотове Кофа за боклук Улей за отпадъци Улей за отпадъци с stagслот за зона
Слотове A3D3 A1D1 и A3-D3 D3 само D3 само
Осветителните тела са без ток. Те не съдържат електронни или механични компоненти, които съобщават на робота тяхното текущо състояние и местоположение на палубата. Това означава, че трябва да използвате функцията за конфигуриране на палубата, за да уведомите Flex какви приспособления са прикрепени към палубата и къде се намират.
48
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Можете да получите достъп до настройките за конфигурация на палубата от сензорния екран чрез менюто с три точки () и от приложението Opentrons. Вижте раздела Конфигурация на дека в главата Софтуер и работа за информация как да конфигурирате дека от сензорния екран.
Улей за отпадъци
Улейът за отпадъци Opentrons Flex прехвърля течности, накрайници, стелажи за накрайници и ямкови плочи от кутията Flex към контейнер за боклук, поставен под външния отвор. Улейът за отпадъци се прикрепя към адаптер за палубна плоча, който пасва в слот D3. Той също така идва със специален полупанел на прозореца, който позволява на улея да излиза от предната част на робота.
Компоненти на улея за отпадъци.
Адаптер за покривна плоча
Улей за отпадъци
Адаптер за палубна плоча със Staging зона
Staging области слотове
Stagслотовете за ing area са съвместими с ANSI/SLAS части от палубата, които заместват стандартните слотове в колона 3 и добавят нови слотове към staging зона — всичко това без загуба на пространство в работната зона. Можете да инсталирате един слот или максимум четири слота, за да създадете нова колона (A4 до D4) от дясната страна на тестето. Обърнете внимание обаче, че смяната на слот за тесте A3 изисква преместване на кошчето за боклук. Чрез добавяне на stagдобавяйки слотове за площ към палубата, вашият робот Flex може да съхранява повече лабораторен софтуер и да работи по-ефективно.
OPENTRONS FLEX
Flex stagслот за зона.
49
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
СЛОТОВА ИНСТАЛАЦИЯ
За да инсталирате, премахнете винтовете, които прикрепят стандартен слот към палубата и го сменете с stagслот за зона. След инсталирането използвайте сензорния екран или приложението Opentrons, за да кажете на робота, който сте добавили катоtagслот за зона към палубата.
Инсталиране катоtagслот за зона.
СЪВМЕСТИМОСТ СЛОТОВЕ Stagслотовете за зона са съвместими с инструментите, модулите и лабораторния софтуер Flex, изброени по-долу.
Модули за пипети с гъвкави компоненти
Лабораторен софтуер
Staging зона съвместимост
Flex Gripper може да премества лабораторни прибори към или от staging области слотове.
Гъвкавите пипети не могат да достигнат staging област. Използвайте хващача, за да преместите поставките за накрайници и лабораторните прибори от staging зона към работната зона преди пипетиране.
Магнитният блок GEN1 може да бъде поставен в колона 3 отгоре на astagслот за зона. Модулите не се поддържат в колона 4.
Захранвани модули като нагревател-шейкър и температурен модул се побират в кадита, които могат да бъдат поставени в колона 3. Не можете да добавяте катоtaging зона слот до позиция, заета от модул кеди.
Stagслотовете за площи за инсталация имат същите размери ANSI/SLAS като стандартните слотове за палуби. Използвайте лабораторен софтуер, съвместим с захващане, в stagили ръчно добавяне и премахване на лабораторен софтуер от това местоположение.
50
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Система за движение
Към рамката е прикрепен порталът, който е система за движение и позициониране на робота. Порталът се движи отделно по оста x и y, за да позиционира пипетите и захващащото устройство на точни места за изпълнение на протокола. Движението по тези оси е прецизно с точност до 0.1 mm. Порталът се управлява от 36 VDC хибридни биполярни стъпкови двигатели. На свой ред към портала са прикрепени стойките за пипети и удължителната стойка. Те се движат по оста z, за да позиционират пипетите и хващача на точни места за изпълнение на протокола. Движението по тази ос се управлява от 36 VDC хибридни биполярни стъпкови двигатели. Електрониката, съдържаща се в портала, осигурява 36 VDC захранване и комуникации към пипетите и хващача, когато са прикрепени.
Портална
Стойки за пипети
Удължителен монтаж
Местоположение на стойките за инструменти на Flex.
Тъчскрийн и LED дисплеи
Основният потребителски интерфейс е 7-инчовият LCD сензорен екран, разположен отпред вдясно на робота. Сензорният екран е покрит с Gorilla Glass 3 за устойчивост на надраскване и повреди. Достъп до много функции на Flex направо на сензорния екран, включително:
OPENTRONS FLEX
51
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Управление на протоколи Настройка, изпълнение и мониторинг на протоколи Управление на лабораторен софтуер Настройки на роботи Системен софтуер и актуализации на фърмуера Операционни регистрационни файлове и известия за грешки
За повече информация относно използването на Flex чрез сензорния екран вижте раздела Работа със сензорен екран в главата Софтуер и работа.
Светлината за състоянието е лента от светодиоди по горната предна част на робота, която предоставя информация за робота с един поглед. Различните цветове и модели на осветяване могат да съобщават различни състояния на успех, неуспех или неактивност:
LED цвят Бял Неутрални състояния
Зелено Нормални състояния
Синьо Задължителни състояния Жълто Ненормални състояния Червено Спешни състояния
LED шаблон Постоянно пулсиращ
Мига два пъти
Плътно пулсиращо Пулсиращо
Състояние на робота
Включен и не изпълнява протокол. Роботът е зает (напр. актуализира софтуер или фърмуер, настройва изпълнение на протокол, отменя изпълнение на протокол) Действието е завършено (напр. протоколът е съхранен, софтуерът е актуализиран, инструментът е прикачен или откачен) Протоколът работи Протоколът е завършен Протоколът е на пауза
Твърди
Софтуерна грешка
Мига три пъти, многократно
Физическа грешка (напр. срив на инструмента)
Индикаторът за състоянието може също да бъде деактивиран в настройките на робота.
52
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
3.2 Пипети
Пипетите Opentrons са конфигурируеми устройства, използвани за преместване на течности в работната зона по време на изпълнение на протоколи. Има няколко пипети Opentrons Flex, които могат да обработват обеми от 1 µL до 1000 µL в 1, 8 или 96 канала:
Opentrons Flex 1-канална пипета (1 µL) Opentrons Flex 50-канална пипета (1 µL) Opentrons Flex 5-канална пипета (1000 µL) Opentrons Flex 8-канална пипета (1 µL) Opentrons Flex 50-канална пипета (8 µL)
Пипетите се прикрепят към портала с помощта на закрепващи винтове отпред на пипетата. 1-каналните и 8-каналните пипети заемат една стойка за пипета (ляво или дясно); 96-каналната пипета заема и двете стойки. За подробности относно инсталирането на пипети вижте Инсталиране и калибриране на инструмента.
Затворен прикачен файл
Винтове
Винтове за захващане
ежектор
Дюзи (сменяеми О-пръстени)
Дюзи (фиксирани О-пръстени)
Местоположение на компонентите на 1-, 8- и 96-каналните пипети.
ежектор
OPENTRONS FLEX
53
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Пипетите захващат пластмасовите накрайници за еднократна употреба, като ги натискат върху дюзите на пипетата и след това използват накрайниците за аспириране и дозиране на течности. Размерът на общата сила, необходима за прихващане, се увеличава, тъй като повече връхчета се хващат едновременно. За по-малък брой накрайници, пипетата прикрепя накрайници, като натиска всяка дюза на пипетата надолу във върха. За постигане на необходимата сила за поемане на цяла стойка с накрайници, 96-каналната пипета също издърпва накрайниците нагоре към дюзите. Това действие на издърпване изисква поставяне на стойките за върхове в адаптер за стойка за накрайници, а не директно в слота на палубата. За да изхвърлите накрайниците (или да ги върнете в стойката им), механизмът за изхвърляне на пипетата избутва върховете от дюзите.
Спецификации на пипетата
Пипетите Opentrons Flex са проектирани да работят с широк диапазон от обеми. Поради широката си цялостна гама, те могат да използват множество размери накрайници, които влияят върху характеристиките им за работа с течности. Opentrons тества пипетите Flex за точност и прецизност в редица комбинации от накрайници и обем на течността:
Пипета
Flex 1-канален
50 µL
Flex 1-канален
1000 µL
Flex 8-канален
50 µL
Flex 8-канален
1000 µL
Капацитет на накрайника 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Тестван обем 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Точност %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Точност %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Flex 96-канален
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Имайте предвид тази информация за точност, когато избирате накрайници за вашата пипета. Като цяло, за най-добри резултати трябва да използвате най-малките накрайници, които отговарят на нуждите на вашия протокол.
Забележка: Opentrons извършва обемно тестване на пипети Flex, за да гарантира, че отговарят на спецификациите за точност и прецизност, изброени по-горе. Не е необходимо да калибрирате обема, който дозират вашите пипети преди употреба. Трябва само да извършите позиционно калибриране. Вижте следващия раздел, както и раздела Инсталиране на пипетата в главата Инсталиране и преместване за подробности.
Услугите Opentrons Care и Opentrons Care Plus включват годишна подмяна на пипети и сертификати за калибриране. Вижте раздела Обслужване на Flex в главата Поддръжка и обслужване за подробности.
Калибриране на пипета
Потребителският комплект включва метална сонда за калибриране на пипета, която използвате по време на позиционно калибриране. По време на изпълнение на протокол, безопасно съхранявайте сондата върху магнитния държач на предната колона на робота. По време на процеса на калибриране прикрепете сондата към подходящата дюза и я заключете на място. Роботът премества сондата до точките за калибриране на палубата, за да измери точната позиция на пипетата.
Адаптер за стойка за върха на пипетата
96-каналната пипета Opentrons Flex се доставя с четири адаптера за стойка за накрайници. Това са прецизно оформени алуминиеви скоби, които поставяте на палубата. Адаптерите поддържат поставки за накрайници Flex 50 L, 200 L и 1000 µL.
OPENTRONS FLEX
55
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Поради включената сила, 96-каналната пипета изисква адаптер, за да прикрепи правилно стойката с пълен накрайник. По време на процедурата за закрепване, пипетата се движи над адаптера, спуска се върху монтажните щифтове и издърпва накрайниците върху пипетите, като повдига адаптера и стойката за накрайници. Издърпването на накрайниците, вместо натискането, осигурява лоста, необходим за фиксиране на накрайниците към пипетите и предотвратява изкривяването на повърхността на палубата. Когато приключи, 96-каналната пипета спуска адаптера и празната поставка за накрайници върху платформата. Вижте раздела Съвети и стелажи за накрайници в главата Лабораторен софтуер за повече информация.
Частично прибиране на върха
96-каналната пипета може да поеме пълен багажник с накрайници или по-малък брой накрайници. Това увеличава броя на приложенията, които можете да извършвате с 96-каналната пипета, тъй като тя заема и двете стойки за пипети.
Понастоящем 96-каналната пипета поддържа частично прихващане на върха за 8 накрайника в оформление на колона. В тази конфигурация пипетата или използва най-левите си дюзи, за да вземе връхчетата отдясно наляво от поставката за накрайници, или най-десните си дюзи, за да поеме накрайниците отляво надясно от поставката за накрайници.
Когато вземете по-малко от 96 съвета от стойка за бакшиши, стойката трябва да бъде поставена директно върху тестето, а не в адаптера за стойка за бакшиши.
Сензори за пипети
Пипетите Opentrons Flex имат редица сензори, които откриват и записват данни за състоянието на пипетата и всякакви накрайници, които е уловила.
КАПАЦИТЕТНИ СЕНЗОРИ
В комбинация с метална сонда или проводящ накрайник, сензорите за капацитет откриват кога пипетата влиза в контакт с нещо. Откриването на контакт между металната сонда и дека се използва в процесите на автоматизирано калибриране на пипетата и калибриране на модула.
1-каналните пипети имат един сензор за капацитет, докато многоканалните пипети имат два: на канали 1 и 8 на 8-каналните пипети и на канали 1 и 96 (позиции A1 и H12) на 96-каналната пипета.
56
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
ОПТИЧНИ СЕНЗОРИ ЗА НАЛИЧИЕ НА НАВЪРХА
Превключвател за фотопрекъсване открива позицията на механизма за изхвърляне на върха на пипетата, потвърждавайки дали върховете са били успешно повдигнати или изпуснати. 1-каналните, 8-каналните и 96-каналните пипети имат един оптичен сензор, който следи закрепването на върха във всички канали.
Актуализации на фърмуера на пипетата
Opentrons Flex автоматично актуализира фърмуера на пипетата, за да го поддържа в синхрон с версията на софтуера на робота. Актуализациите на фърмуера на пипетата обикновено са бързи и се случват винаги, когато:
Прикрепяте пипета. Роботът се рестартира.
Ако по някаква причина вашите версии на фърмуера на пипетата и софтуера на робота се разпаднат в синхрон, можете ръчно да актуализирате фърмуера в приложението Opentrons.
1. Щракнете върху Устройства. 2. Щракнете върху вашия Flex в списъка с устройства. 3. Под „Инструменти и модули“ несинхронизираната пипета ще покаже предупредителен банер
„Налична е актуализация на фърмуера.“ Щракнете върху Актуализиране сега, за да започнете актуализацията.
Вие можете view текущо инсталираната версия на фърмуера на всяка прикрепена пипета. На сензорния екран отидете на Инструменти и докоснете името на пипетата. В приложението Opentrons намерете картата на пипетата под Инструменти и модули, щракнете върху менюто с три точки () и след това щракнете върху Относно пипетата.
3.3 Грайфер
Хващачът премества лабораторните прибори в работната зона и staging зона по време на изпълнение на протоколи. Грайферът се прикрепя към удължителната стойка, която е отделна от стойките на пипетата; захващащото устройство може да се използва с всяка конфигурация на пипетата. За подробности относно инсталирането на грайфера вижте Инсталиране и калибриране на инструмента.
Хващачът може да премества лабораторни прибори през палубата и върху или извън модулите. Грайферът може да манипулира определени гнездови плочи с напълно облицовка, дълбоки ямкови плочи и стелажи за накрайници. За повече подробности относно това какъв лабораторен софтуер може да движи захващащото устройство, вижте раздела Labware и Opentrons Flex Gripper в главата Labware или се консултирайте с Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
57
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Спецификации на грайфера
Челюстите извършват основното движение на захващащото устройство, което е да отварят или затварят две успоредни лопатки, за да приложат или освободят сила върху страните на лабораторния прибор. Движението на челюстите се контролира от 36 VDC двигател с четка, свързан към система с рейка и пиньон.
За да преместите парче лабораторен прибор, който е бил захванат от челюстите, порталът повдига захващащото устройство по оста z, премества го странично и след това го спуска в новата позиция на лабораторния прибор.
Местоположение на компонентите на грайфера.
Винтове за закрепване
Щифт за калибриране Jaws Paddles
Калибриране на грайфера
Грайферът включва метален щифт за калибриране. Щифтът за калибриране се намира във вдлъбната зона за съхранение в долната част на грайфера. Магнит държи щифта на място. За да премахнете щифта за калибриране, хванете го с пръсти и издърпайте внимателно. За да смените щифта, поставете го обратно в слота за съхранение. Ще разберете, че е сигурно, когато щракне на място.
Когато калибрирате грайфера, прикрепете щифта към всяка челюст последователно. Роботът премества щифта към точките за калибриране на палубата, за да измери точната позиция на грайфера.
По време на изпълнение на протокола поставете щифта в зоната за съхранение за безопасно съхранение. Свържете се с нас на support@opentrons.com, ако загубите щифта за калибриране.
Актуализации на фърмуера на Gripper
Opentrons Flex автоматично актуализира фърмуера на грайфера, за да го поддържа в синхрон с версията на софтуера на робота. Актуализациите на фърмуера на Gripper обикновено са бързи и се случват, когато:
58
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Прикрепяте грайфера. Роботът се рестартира.
Ако по някаква причина фърмуерът на вашия грайфер и софтуерните версии на робота се разпаднат в синхрон, можете ръчно да актуализирате фърмуера в приложението Opentrons.
1. Щракнете върху Устройства. 2. Щракнете върху вашия Flex в списъка с устройства. 3. Под Инструменти и модули, несинхронизираният грайфер ще покаже предупредителен банер
„Налична е актуализация на фърмуера.“ Щракнете върху Актуализиране сега, за да започнете актуализацията.
Вие можете view текущо инсталираната версия на фърмуера на грайфера. На сензорния екран отидете на Инструменти и докоснете ръкохватката. В приложението Opentrons намерете картата за захващане под Инструменти и модули, щракнете върху менюто с три точки () и след това щракнете върху Относно захвата.
3.4 Висулка за аварийно спиране
Висулката за аварийно спиране (E-stop) е специален хардуерен бутон за бързо спиране на движението на робота. Opentrons Flex изисква функционален, незацепен E-stop да бъде прикрепен по всяко време. Когато натиснете бутона за спиране, Flex отменя всеки работещ протокол или работен поток за настройка възможно най-бързо и предотвратява движението на повечето роботи.
Кога да използвате E-stop
Може да се наложи да натиснете E-stop:
Когато има непосредствен риск от нараняване или увреждане на потребителя. Когато има непосредствен риск от повреда на робота или друг хардуер. Когато sampфайловете или реагентите са в непосредствена опасност от замърсяване. След хардуерен сблъсък.
В идеалния случай никога не трябва да натискате E-stop (освен по време на рядко тестване на качеството на хардуера).
Не използвайте E-stop за отмяна на нормални, очаквани операции. Вместо това използвайте софтуерния бутон на сензорния екран или в приложението Opentrons. Паузата чрез софтуер ще ви позволи да възобновите или отмените своя протокол, докато натискането на E-stop винаги отменя протокола незабавно.
OPENTRONS FLEX
59
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Включване и освобождаване на E-stop
E-stop има механизъм за натискане за захващане, завъртане за освобождаване.
Захващане: Натиснете силно червения бутон. Flex ще влезе в спряно състояние. Разрешаване: След като спрете, отстранете безопасно всички проблеми в работната зона, като например почистване на разливи,
премахване на лабораторни прибори или преместване на портала (трябва да се движи свободно и лесно на ръка). Освобождаване: Завъртете бутона по посока на часовниковата стрелка. Той ще изскочи до освободеното си положение. Нулиране: На сензорния екран или в приложението Opentrons потвърдете, че сте готови за възобновяване на Flex
движение. Порталът ще се върне в началната си позиция и дейността на модула ще се възобнови.
В спряно състояние Flex и свързаният хардуер ще се държат по следния начин:
Хардуерни портални пипети
Грайфер
Модул нагревател-шейкър
Температурен модул Термоциклиращ модул Индикатор за състоянието Сензорен екран
Поведение
Автоматичното хоризонтално движение е спряно. Разрешено е ръчно хоризонтално движение.
Вертикалното движение на пипетите е спряно. Моторните спирачки на вертикалните оси са включени, за да предотвратят
пипети от падане. Движението на буталото и прихващането на върха са спрени.
Вертикалното движение на грайфера е спряно. Спирачката на двигателя на вертикалната ос е включена, за да предотврати
грайфер от падане. Челюстните двигатели, които упражняват сила на захващане, остават активирани, така че
захващащото устройство няма да изпусне лабораторни прибори, които може да носи.
Шейкърът спира и се прибира. Резето на лабораторния уред се отваря. Отоплението е деактивирано.
Отоплението или охлаждането е деактивирано.
Отоплението или охлаждането е деактивирано.
Светлината става червена.
Съобщение за отмяна заема екрана. Индикатор на екрана показва, когато сте успели
освободи бутона за спиране.
60
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
3.5 Връзки
Ключ за включване/изключване
Странични корици
USB-A портове
IEC вход за захранване
Портове AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Захранване
Opentrons Flex се свързва към източник на захранване чрез стандартен IEC-C14 вход. Роботът съдържа вътрешно AC/DC захранване с пълен обхват, което приема 100 VAC, 240/50 Hz вход и го преобразува в 60 VDC. Цялата друга вътрешна електроника се захранва от 36 VDC захранване.
Предупреждение: Използвайте само захранващия кабел, предоставен с робота. Не използвайте захранващ кабел с недостатъчен ток или обемtage оценки.
Пазете захранващия кабел свободен от препятствия, за да можете да го извадите, ако е необходимо.
Има също CR1220 клетъчна батерия с монета за захранване на часовника в реално време на робота, когато не е свързан към електрическата мрежа. Батерията се намира вътре в корпуса на сензорния екран. Свържете се с поддръжката на Opentrons за повече информация, ако смятате, че трябва да смените батерията.
OPENTRONS FLEX
61
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
USB и спомагателни връзки
Opentrons Flex има общо 10 USB порта, разположени в различни области на робота, които служат за различни цели.
8-те задни USB-A порта (номерирани от USB-1 до USB-8) и 2 спомагателни порта (конектори M12, номерирани AUX-1 и AUX-2) са за свързване на модули и аксесоари на Opentrons. Вижте главата Модули за повече информация относно свързването на тези устройства и използването им във вашите протоколи. Задният USB-B порт е за свързване на робота към лаптоп или настолен компютър, за установяване на комуникация с приложението Opentrons, работещо на свързания компютър. Предният USB-A порт (USB-9), разположен под сензорния дисплей, има същата функционалност като задните USB-A портове.
Забележка: USB портовете са с ограничена мощност, за да предпазят робота и свързаните устройства. Захранването е разделено вътрешно на три групи портове: левите задни USB-A портове (USB-1 до USB-4), десните задни USB-A портове (USB-5 до USB-8) и предните USB-A порт. Всяка от тези групи ще достави максимум 500 mA към свързани устройства, съвместими с USB 2.0.
Мрежови връзки
Opentrons Flex може да се свързва към локална мрежа чрез кабелна (Ethernet) или безжична (Wi-Fi) връзка.
Ethernet портът се намира на гърба на робота. Свържете го към Ethernet хъб или включете вашата мрежа. Или, започвайки от версия 7.1.0 на роботизираната система, свържете я директно към Ethernet порт на вашия компютър. Вътрешният Wi-Fi модул поддържа 802.11 ac/a/b/g/n мрежи с двулентова 2.4/5 GHz антена.
62
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
3.6 Системни спецификации
Общи спецификации
Размери Тегло Слотове за колода
Сензорен екран
Wi-Fi Ethernet USB
Захранване на Camera Robot
Мрежово захранване обtage флуктуация Флуктуация на честотата на мрежовото захранване Разпределителна система Захранващ ток на късо съединение Състав на рамката Състав на прозорец Изисквания за вентилация
87 × 69 × 84 см / 34.25 × 27 × 33 инча (Ш, Д, В)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-съвместими слота в работната зона
(достъпни за пипети) 4 допълнителни гнезда за stagсъвети и лабораторен уред
(достъпен само за захващане) 7-инчов LCD сензорен екран с устойчиво на надраскване и повреди Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n двулентов (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A порта 1 USB-B порт USB 2.0 скорост
2MP, фото и видео 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 А
Твърда стоманена и CNC алуминиева конструкция
Подвижни поликарбонатни странични прозорци и предна врата Най-малко 20 cm / 8 в между модула и стената
OPENTRONS FLEX
63
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Изисквания за свързан компютър
Приложението Opentrons работи на: Windows 10 или по-нова версия macOS 10.10 или по-нова версия Ubuntu 12.04 или по-нова версия
Екологични спецификации
Условия на околната среда Температура на околната среда Относителна влажност Степен на замърсяване
Използване само на закрито +20 до +25 °C (препоръчително) 40%, без кондензация (препоръчително) 60 (само непроводимо замърсяване)
За допълнителна информация относно приемливите условия на околната среда за използване и транспорт вижте раздела Условия на околната среда на главата Инсталиране и преместване.
Сертификати
Завършени сертификати Не е сертифициран/валидиран
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
Обобщение на информацията за сертифициране е отпечатано върху стикер на гърба на Flex, близо до превключвателя за включване/изключване. За подробна информация за сертифициране и съответствие вижте раздела Съответствие с нормативните изисквания във Въведението.
Сериен номер
Всеки Flex има уникален сериен номер. Форматът на серийния номер предоставя допълнителна информация, включително датата на производство на робота. Напримерample, серийният номер FLXA1020231007001 ще показва:
64
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 3: ОПИСАНИЕ НА СИСТЕМАТА
Символи FLX A10 2023 10 07 001
Категория Модел Версия Година Месец Ден Единица
Значение Роботът е Opentrons Flex. Код за производствената версия на робота. Роботът е направен през 2023 г. Роботът е направен през октомври. Роботът е направен на 7-ия ден от месеца. Уникален номер за роботи, направени на определен ден.
Можете да намерите серийния номер за вашия Flex:
На стикера за сертифициране на гърба на Flex, близо до превключвателя за включване/изключване. На обратната страна на сензорния екран (към работната зона). В приложението Opentrons под Устройства > вашият Flex > Настройки на робота > Разширени.
OPENTRONS FLEX
65
ГЛАВА 4
Модули
Opentrons Flex се интегрира с редица хардуерни модули Opentrons. Всички модули са периферни устройства, които заемат слотове на палубата и повечето се управляват от робота чрез USB връзка.
Тази глава описва функциите и физическите спецификации на модулите, които са съвместими със системата Opentrons Flex, както и как да ги прикрепите и калибрирате. За допълнителни подробности относно настройката и употребата на модула вижте ръководствата за отделните модули. За подробности относно интегрирането на модули във вашите протоколи вижте раздела „Дизайнер на протоколи“ в главата „Разработка на протоколи“ или онлайн документацията за API на Python Protocol.
4.1 Поддържани модули
Opentrons Flex е съвместим с четири типа модули Opentrons на палубата:
Модулът Heater-Shaker осигурява отопление на палубата и орбитално разклащане. Модулът може да се нагрява до 95 °C и може да се разклащаampот 200 до 3000 оборота в минута.
Магнитният блок е пасивно устройство, което държи лабораторни прибори близо до неговите високоякостни неодимови магнити. Магнитният модул OT-2 GEN1 и GEN2, който активно движи своите магнити нагоре и надолу спрямо лабораторния софтуер, не се поддържа от Opentrons Flex.
Температурният модул е модул за топла и студена плоча, който може да поддържа постоянни температури между 4 и 95 °C.
Модулът Thermocycler осигурява на палубата, напълно автоматизирано термоциклиране, което позволява автоматизиране на стъпките на работния процес нагоре и надолу по веригата. Thermocycler GEN2 е напълно съвместим с грайфера. Thermocycler GEN1 не може да се използва с грайфера и следователно не се поддържа от Opentrons Flex.
Някои модули, първоначално проектирани за OT-2, са съвместими с Flex, както е обобщено в таблицата по-долу. Отметката показва съвместимост, а X показва несъвместимост.
66
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Тип и поколение устройство Модул нагревател-шейкър GEN1 Магнитен модул GEN1 Магнитен модул GEN2 Магнитен блок GEN1 Температурен модул GEN1 Температурен модул GEN2 Модул термоциклер GEN1 Модул термоциклер GEN2 HEPA модул
ОТ-2
Flex
×
×
×
×
×
×
4.2 Модулна кеди система
Съвместимите модули са проектирани да се поберат в кедита, които заемат място под палубата. Тази система позволява на лабораторния софтуер върху модулите да остане по-близо до повърхността на палубата и също така позволява прокарване на кабели под палубата, така че палубата да остане подредена по време на вашите протоколи.
Калъфи за модулите за нагревател-шейкър, температура и термоциклер.
OPENTRONS FLEX
67
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
За да поставите модул в повърхността на палубата, той трябва първо да бъде поставен в съответния модулен кади. Всеки тип съвместим модул има собствен дизайн на кадита, който подравнява модула и лабораторния уред прецизно със заобикалящата палуба. (Изключение прави магнитният блок, който не изисква захранване или прокарване на USB кабел и по този начин стои директно върху повърхността на палубата.) Кади за модули, които заемат единичен слот, могат да бъдат поставени навсякъде в колона 1 или 3; Thermocycler може да бъде поставен само в слотове A1 и B1 едновременно.
Като цяло, за да инсталирате модул caddy:
1. Отстранете всички слотове на палубата от мястото, където ще бъде поставен модулът. 2. Поставете модула в неговата опора и затегнете анкерите му. 3. Прекарайте захранващия и USB кабела на модула през страничните капаци, нагоре през празния слот на палубата и
прикрепете ги към модула. 4. Поставете модула в гнездото и го завийте на място.
За точни инструкции за инсталиране се консултирайте с ръководството за бързо стартиране или ръководството с инструкции за конкретния модул. Кабелните връзки и методът на закрепване към кедито варират според модула.
4.3 Калибриране на модула
Когато за първи път инсталирате модул на Flex, трябва да стартирате автоматизирано позиционно калибриране. Този процес е подобен на позиционното калибриране за инструменти и гарантира, че Flex се придвижва до точните правилни места за оптимална работа на протокола. По време на калибриране, Flex ще се премести на места в адаптер за калибриране на модула, който изглежда подобно на квадратите за калибриране, които са част от слотовете за подвижни палуби.
Калибриращи адаптери за модулите нагревател-шейкър, температура и термоциклер.
Калибрирането на модула е необходимо за всички модули, които се инсталират чрез кеди: модулите нагревател-шейкър, температура и термоциклер. Магнитният блок не изисква калибриране и е готов за употреба веднага щом го поставите на палубата.
68
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Кога да се калибрират модулите
Flex автоматично ви подканва да извършите калибриране, когато свържете и включите модул, който няма съхранени данни за калибриране. (Можете да отхвърлите тази подкана, но няма да можете да изпълнявате протоколи с модула, докато не го калибрирате.)
След като завършите калибрирането, Flex съхранява данните за калибриране и серийния номер на модула за бъдеща употреба. Flex няма да ви подкани да калибрирате повторно, освен ако не изтриете данните за калибриране за този модул в настройките на робота. Можете свободно да включвате и изключвате вашия модул или дори да го преместите в друг слот на дека, без да е необходимо да калибрирате отново. Ако искате да калибрирате отново, можете да започнете процеса по всяко време от картата на модула в приложението Opentrons. (Рекалибрирането не е достъпно от сензорния екран.)
Как да калибрирате модули
Инструкциите на сензорния екран или в приложението Opentrons ще ви насочат през процедурата за калибриране. Като цяло стъпките са:
1. Съберете необходимото оборудване, включително адаптера за калибриране на модула и сондата за калибриране на пипетата. 2. Поставете адаптера за калибриране върху повърхността на модула и се уверете, че е напълно нивелиран.
Някои модули може да изискват да закрепите адаптера към модула. 3. Прикрепете сондата за калибриране към пипета. 4. Flex автоматично ще се премести, за да докосне определени точки на адаптера за калибриране и ще ги запази
калибровъчни стойности за бъдеща употреба.
След като калибрирането приключи и сте премахнали адаптера и сондата, модулът ще бъде готов за използване в протоколи.
По всяко време можете view и управлявайте вашите данни за калибриране на модула в приложението Opentrons. Отидете в Настройки на робота за вашия Flex и щракнете върху раздела Калибриране.
OPENTRONS FLEX
69
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.4 Модул нагревател-шейкър GEN1
Характеристики на нагревател-шейкър
ЗАГРЯВАНЕ И ТЪРСЕНЕ
Heater-Shaker осигурява отопление на палубата и орбитално разклащане. Модулът може да се нагрее до 95 °C със следната температурна пропорцияfile:
Температурен диапазон: 37 °C Точност на температурата: ±95 °C при 0.5 °C Еднородност на температурата: ±55 °C при 0.5 °CRamp скорост: 10 °C/мин
Модулът може да разклати sampот 200 до 3000 оборота в минута, със следното разклащане проfile:
Диаметър на орбитата: 2.0 mm Посока на орбитата: по посока на часовниковата стрелка Обхват на скоростта: 200 rpm Точност на скоростта: ±3000 rpm
Модулът има задвижван лабораторен ключ за закрепване на плочите към модула преди разклащане.
70
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
ТЕРМАЛИЧНИ АДАПТЕРИ Необходим е съвместим термичен адаптер за добавяне на лабораторни прибори към нагревателя-шейкър. Адаптерите могат да бъдат закупени директно от Opentrons на адрес https://shop.opentrons.com. Наличните в момента термични адаптери включват:
Универсален плосък адаптер
PCR адаптер
Адаптер за дълбок кладенец
96 Адаптер с плоско дъно
СОФТУЕРЕН КОНТРОЛ
Heater-Shaker е напълно програмируем в Protocol Designer и Python Protocol API. API на Python допълнително позволява други стъпки на протокола да се изпълняват паралелно, докато Heater-Shaker е активен. Вижте Неблокиращи команди в документацията на API за подробности относно добавянето на паралелни стъпки към вашите протоколи.
Извън протоколите, приложението Opentrons може да показва текущото състояние на нагревателя-шейкър и може директно да контролира нагревателя, шейкъра и ключалката на лабораторния софтуер.
OPENTRONS FLEX
71
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Спецификации на нагревател-шейкър
Размери Тегло Входна мощност на модула Вход на захранващ адаптер Обtage флуктуация Overvoltage Консумирана мощност
152 × 90 × 82 мм (Д/Ш/В) 1.34 кг 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Категория II на празен ход: 10 W
Типично: Разклащане: 4 W Нагряване: 11 W Нагряване и разклащане: 10 W
Условия на околната среда Температура на околната среда Относителна влажност Надморска височина Степен на замърсяване
Максимум: 125 W Използване само на закрито 130 °C До 20%, без конденз До 25 m надморска височина 80
72
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.5 Магнитен блок GEN1
Характеристики на магнитния блок
Магнитният блок Opentrons GEN1 е магнитен държач за плака с 96 ямки. Магнитните блокове се използват в протоколи, които разчитат на магнетизма, за да изтеглят частиците от суспензията и да ги задържат в ямковите плочи по време на измиване, изплакване или други процедури на елуиране. Напримерample, автоматизирана подготовка на NGS; пречистване на геномна и митохондриална ДНК, РНК или протеини; и други процедури за извличане са случаи на употреба, които могат да включват магнитни блокове.
МАГНИТНИ КОМПОНЕНТИ
Магнитният блок е без захранване, не съдържа никакви електронни компоненти и не движи магнитните перли нагоре или надолу в разтвора. Ямките се състоят от 96 високоякостни неодимови пръстеновидни магнити, фиксирани към пружинно легло, което помага да се поддържат толеранси между блока и пипетите, докато се изпълняват автоматизирани протоколи.
СОФТУЕРЕН КОНТРОЛ
Магнитният блок GEN1 е напълно програмируем в Protocol Designer и Python Protocol API.
OPENTRONS FLEX
73
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Извън протоколите обаче сензорният екран и приложението Opentrons не знаят и не могат да покажат текущото състояние на магнитния блок GEN1. Това е модул без захранване. Той не съдържа електронни или механични компоненти, които могат да комуникират с робота Flex. Вие „контролирате“ магнитния блок чрез протоколи, които използват Opentrons Flex Gripper за добавяне и премахване на лабораторен софтуер от този модул.
Спецификации на магнитния блок
Размери Тегло Мощност на модула Клас на магнита Условия на околната среда Температура на околната среда Относителна влажност Надморска височина Степен на замърсяване
136 × 94 × 45 mm (Д/Ш/В) 1.13 kg Няма, модулът е без захранване N52 неодимов Използване само на закрито 20 °C 25%, без конденз До 30 m надморска височина 80
74
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
4.6 Температурен модул GEN2
Функции на температурния модул
ОТОПЛЕНИЕ И ОХЛАЖДАНЕ
Температурният модул Opentrons GEN2 е модул за топла и студена плоча. Често се използва в протоколи, които изискват нагряване, охлаждане или температурни промени. Модулът може да достигне и поддържа температури в диапазона от 4 °C до 95 °C в рамките на минути, в зависимост от конфигурацията и съдържанието на модула.
ТЕРМОБЛОКОВЕ
За поддържане на лабораторни съдове при температура, модулът използва алуминиеви термоблокове. Модулът се предлага с 24-ямкови и 96-ямкови термоблокове. Кадито за температурен модул се доставя с блок с дълбоко гнездо и блок с плоско дъно, предназначени за използване с Flex Gripper. Блоковете съдържат епруветки от 1.5 mL и 2.0 mL, 96-ямкови PCR плаки, PCR ленти, дълбоки ямкови плаки и плаки с плоско дъно.
OPENTRONS FLEX
75
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Забележка: Модулът също се доставя с блок с плоско дъно за OT-2. Не използвайте блока OT-2 с Flex. Плоският долен блок за Flex има думите „Opentrons Flex“ на горната си повърхност. Тази за ОТ-2 не става.
24-ямков термоблок
96-ямков термоблок
Термоблок с дълбок кладенец
Термоблок с плоско дъно за Flex
ВОДНИ БАНИ И ЗАГРЯВАНЕ
Тъй като въздухът е добър термичен изолатор, пролуките между лабораторните прибори и термичния блок могат да повлияят на производителността на температурния модул във времето за достигане на температура. Поставянето на малко вода в 24- или 96-ямковите термични блокове елиминира въздушните междини и подобрява ефективността на отоплението. Идеалното количество вода зависи от термоблока и лабораторното оборудване. Вижте Бялата книга за температурния модул за допълнителни препоръки.
СОФТУЕРЕН КОНТРОЛ
Температурният модул е напълно програмируем в Protocol Designer и Python Protocol API.
Извън протоколите, приложението Opentrons може да показва текущото състояние на температурния модул и може директно да контролира температурата на повърхностната плоча.
76
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Спецификации на температурния модул
Размери Тегло Мощност на модула
Условия на околната среда Температура на околната среда Относителна влажност Надморска височина Степен на замърсяване
194 × 90 × 84 mm (Д/Ш/В) 1.5 kg Вход: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Изход: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W макс. Използване само на закрито <219.6 °C (препоръчва се за оптимално охлаждане) ) До 22%, без конденз До 60 m надморска височина 2000
4.7 Термоциклиращ модул GEN2
OPENTRONS FLEX
77
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Характеристики на термоциклера
Opentrons Thermocycler Module GEN2 е напълно автоматизиран палубен термоциклер, осигуряващ PCR без ръце във формат на 96-ямкова плака. Неговият отопляем капак и уплътнение за еднократна употреба прилягат плътно върху чинията, осигурявайки ефективни sample нагряване и минимално изпарение.
НАГРЯВАНЕ И ОХЛАЖДАНЕ Блокът на Thermocycler може да нагрява и охлажда, а капакът му може да нагрява със следната температурна пропорцияfile: Температурен диапазон на термичния блок: 4 °C Термичен блок максимално нагряване ramp скорост: 4.25 °C/s от GEN2 околна температура до 95 °C Термичен блок максимално охлаждане ramp скорост: 2.0 °C/s от 95 °C до температура на околната среда Диапазон на температурата на капака: 37 °C Точност на температурата на капака: ±110 °C Автоматизираният капак може да се отваря или затваря според нуждите по време на изпълнение на протокола.
ТЕРМОЦИКЛЕР ПРОFILES Thermocycler може да изпълни проfiles: автоматично преминаване през последователност от блокови температури за извършване на чувствителни към топлина реакции.
ГУМЕНИ УПЛЪТНЕНИЯ ЗА АВТОМАТИЗАЦИЯ Thermocycler се предлага с гумени уплътнения за автоматизация, които помагат за намаляване на изпарението. Всяка пломба трябва да се стерилизира преди употреба и може да се използва за няколко серии. Допълнителни уплътнения могат да бъдат закупени директно от Opentrons на адрес https://shop.opentrons.com.
СОФТУЕРЕН КОНТРОЛ Thermocycler е напълно програмируем в Protocol Designer и Python Protocol API. Извън протоколите, приложението Opentrons може да показва текущото състояние на Thermocycler и може директно да контролира температурата на блока, температурата на капака и позицията на капака.
78
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 4: МОДУЛИ
Спецификации на термоциклера
Размери (отворен капак) Размери (затворен капак) Тегло (включително заден канал) Обем на захранващия адаптерtage Ток на захранващия адаптер Overvoltage Условия на околната среда Температура на околната среда Относителна влажност Надморска височина Изисквания за вентилация
244.95 × 172 × 310.1 mm (Д/Ш/В) 244.95 × 172 × 170.35 mm (Д/Ш/В) 8.4 kg 100 V при 240/50 Hz 60 A Категория II Използване само на закрито 8.5 °C (идеално); 5 °C (приемливо) 20%, без кондензация До 25 m надморска височина Най-малко 2 cm / 40 между модула и стената
OPENTRONS FLEX
79
ГЛАВА 5
Лабораторен софтуер
Тази глава обхваща елементи от Opentrons Labware Library, които можете да използвате с Opentrons Flex и Opentrons Flex Gripper. Той също така обхваща персонализиран лабораторен софтуер и, за нашите опитни потребители, свързва компонентите на лабораторния софтуер към съответния им JSON file дефиниции.
Можете да закупите лабораторен софтуер от производителите на оригинално оборудване или от магазина на Opentrons на адрес https://shop.opentrons.com. И Opentrons винаги работи за проверка на нови дефиниции на лабораторен софтуер. Вижте Labware Library (с връзка по-горе) за най-новите списъци.
5.1 Концепции за лабораторен софтуер
Лабораторният софтуер обхваща повече от обектите, поставени на палубата и използвани в протокол. За да ви помогнем да разберете лабораторния софтуер на Opentrons, нека разгледаме тази тема от три различни гледни точки. За Opentrons Flex лабораторният софтуер включва елементи в нашата библиотека за лабораторен софтуер, данни, които дефинират всяка част от лабораторния софтуер и персонализиран лабораторен софтуер.
Лабораторен софтуер като хардуер
Лабораторната библиотека включва всичко, което можете да използвате по подразбиране с Opentrons Flex. Това са трайни компоненти и консумативи, с които работите, използвате повторно или изхвърляте, докато изпълнявате протокол. Не е необходимо да предприемате специални стъпки, за да работите с елементите в Labware Library. Роботът Flex знае как да работи автоматично с всичко в библиотеката.
Лабораторен софтуер като данни
Информацията за лабораторния софтуер се съхранява в Javascript обектна нотация (JSON) files с .json file разширения. JSON file включва пространствени измерения (дължина, ширина, височина), обемен капацитет (L, mL) и други показатели, които определят характеристиките на повърхността, техните форми и местоположения. Когато изпълнява протокол, Flex чете тези .json fileда знае какво лабораторно оборудване има на палубата и как да работи с него.
80
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Лабораторен софтуер по поръчка
Персонализираният лабораторен софтуер е лабораторен софтуер, който не е включен в Labware Library или е лабораторен софтуер, създаден от Custom Labware Creator. Понякога обаче идеята за персонализиран лабораторен софтуер е обременена от понятия за сложност, разходи или трудност. Но персонализираният лабораторен софтуер не трябва да бъде труден за разбиране или създаване. Нека отделим малко време, за да разопаковаме концепцията за персонализиран лабораторен софтуер.
Като бившample, Opentrons Labware Library включва 96-ямкови плаки (200 L) от Corning и BioRad, но други производители също правят тези ямкови плаки. И благодарение на общоприетите индустриални стандарти, разликите между тези вездесъщи лабораторни артикули са незначителни. Въпреки това, обикновена плака с 200 ямки от 96 L от Stellar Scientific, Oxford Lab или Krackeler Scientific (или всеки друг доставчик по този въпрос) е „персонализиран лабораторен софтуер“ за Flex, защото не е предварително дефиниран в нашата Labware Library . Освен това незначителни разлики в размерите на лабораторния софтуер могат да имат драстично въздействие върху успеха на изпълнението на вашия протокол. Поради тази причина е важно да имате точна дефиниция на лабораторен софтуер за всеки лабораторен софтуер, който искате да използвате във вашия протокол.
Също така, макар персонализираният лабораторен уред да може да бъде езотеричен, еднократен комплект, през повечето време това са само накрайници, плочи, епруветки и стелажи, използвани всеки ден в лаборатории по целия свят. Отново, единствената разлика между лабораторния софтуер Opentrons и персонализирания лабораторен софтуер е, че новият елемент не е предварително дефиниран в софтуера, който захранва робота. Flex може и работи с други основни елементи на лабораторен софтуер или нещо уникално, но трябва да запишете характеристиките на този елемент в дефиниция на лабораторен софтуер JSON file и импортирайте тези данни в приложението Opentrons. Вижте раздела Дефиниции на персонализирания лабораторен софтуер по-долу за повече информация.
За да обобщим, лабораторният софтуер включва:
Всичко в Opentrons Labware Library. Дефиниции на лабораторен софтуер: данни в JSON file който определя формите, размерите и възможностите на отделните елементи
като плочи за кладенци, накрайници, резервоари и т.н. Персонализиран лабораторен софтуер, които са елементи, които не са включени в библиотеката за лабораторен софтуер.
След повторноviewСледвайки тези важни понятия, нека разгледаме категориите и елементите в Opentrons Labware Library. След това ще завършим главата с надписview на компонентите за данни на лабораторен софтуер file и обобщете функциите и услугите на Opentrons, които ви помагат да създавате персонализиран лабораторен софтуер.
OPENTRONS FLEX
81
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
5.2 Резервоари
Opentrons Flex работи по подразбиране с резервоарите с едно и няколко ямки, изброени по-долу. Използването на тези резервоари помага за намаляване на тежестта на подготвителната ви работа, тъй като те са готови за автоматизация веднага след изваждане от кутията. Информацията за резервоара също е достъпна в Opentrons Labware Library.
Еднокладенци
Спецификации на производителя
Agilent
290 мл V дъно
Кислород
90 мл Плоско дъно
ГНЕЗДО
195 мл Плоско дъно
290 мл V дъно
Име на зареждане на API
agilient_1_ резервоар_290мл
кислород_1_ резервоар_90мл
гнездо_1_ резервоар_195мл
гнездо_1_ резервоар_290мл
Многокладенни резервоари
Спецификации на производителя
ГНЕЗДО
12 ямки 15 mL/ямка V дъно
USA Scientific
12 ямки 22 mL/ямка V дъно
API име на зареждане nest_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ резервоар_22мл
82
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Дефиниции на резервоари и API
Opentrons Labware Library дефинира характеристиките на резервоарите, изброени по-горе, в отделен JSON fileс. Роботът и Opentrons Python API разчитат на тези JSON дефиниции, за да работят с лабораторен софтуер, използван от вашите протоколи. Напримерample, когато работите с API, функцията ProtocolContext.load_labware приема тези имена на лабораторен софтуер като валидни параметри във вашия код. Свързаните имена на зареждане на API се свързват с дефинициите на лабораторния софтуер на резервоара в хранилището на Opentrons GitHub.
Лабораторен уред за персонализирани резервоари
Опитайте да създадете персонализирана дефиниция на лабораторен софтуер с Opentrons Labware Creator, ако резервоар, който искате да използвате, не е посочен тук. Персонализираната дефиниция съчетава всички измерения, метаданни, форми, обемен капацитет и друга информация в JSON file. Opentrons Flex се нуждае от тази информация, за да разбере как да работи с вашия персонализиран лабораторен софтуер. Вижте раздела за дефиниции на потребителски лабораторен софтуер за повече информация.
5.3 Плаки с кладенци
Opentrons Flex работи по подразбиране с плаки с ямки, изброени по-долу. Използването на тези плочи с ямки помага за намаляване на тежестта на подготвителната ви работа, тъй като те са готови за автоматизация веднага след изваждане от кутията. Информацията за ямковите плочи също е достъпна в Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
83
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
6-ямкови плаки
Производител Corning
Спецификации
6 ямки 16.8 mL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
Име на зареждане на API corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12-ямкови плаки
Производител Corning
Спецификации
12 ямки 6.9 mL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
Име на зареждане на API corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24-ямкови плаки
Производител Corning
Спецификации
24 ямки 3.4 mL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
Име на зареждане на API corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48-ямкови плаки
Производител Corning
Спецификации
48 ямки 1.6 mL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
Име на зареждане на API corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
96-ямкови плаки
Производител Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
USA Scientific
Спецификации
96 ямки 200 µL/ямка Кръгли ямки, V дъно
96 ямки 360 µL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
96 ямки 100 µL/ямка Кръгли ямки, V дъно PCR пълна пола
96 ямки 200 µL/ямка Кръгли ямки, плоско дъно
96 дълбоки ямки 2000 µL/ямка Квадратни ямки, V дъно
Издръжливи 96 ямки 200 µL/ямка Кръгли ямки, V дъно PCR пълна пола
Nunc 96 дълбоки ямки 1300 µL/ямка Кръгли ямки, U дъно
Nunc 96 дълбоки ямки 2000 µL/ямка Кръгли ямки, U дъно
96 дълбоки ямки 2.4 mL/ямка Квадратни ямки, U дъно
Име на зареждане на API biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_flat
nest_96_wellplate_100ul_pcr_пълна_пола
nest_96_wellplate_200ul_flat
nest_96_wellplate_2ml_deep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_пълна_ пола
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul thermoscientificnunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
384-ямкови плаки
Производител Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Спецификации
384 ямки 40 µL/ямка Кръгли ямки, V дъно
384 ямки 50 µL/ямка Кръгли ямки, V дъно
384 ямки 112 µL/ямка Квадратни ямки, плоско дъно
API зареждане име applybiosystemsmicroamp_384_ платка за кладенци_40ul biorad_384_плочка за ямки_50ul
corning_384_wellplate_112ul_flat
Адаптери за кладенци
Алуминиевите плочи, изброени по-долу, са термични адаптери за модула Opentrons Heater-Shaker GEN1. Можете да използвате тези дефиниции на самостоятелни адаптери, за да заредите проверен Opentrons или персонализиран лабораторен софтуер върху нагревателя-шейкър.
Тип адаптер Opentrons Универсален плосък адаптер за нагревател-шейкър Opentrons 96 PCR адаптер за нагревател-шейкър Opentrons 96 Адаптер за дълбок нагревател-шейкър Opentrons 96 Адаптер за нагревател-шейкър с плоско дъно
Име на зареждане на API opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Можете също така да заредите както адаптера, така и лабораторния софтуер с една дефиниция. Нашата библиотека за лабораторен софтуер включва няколко предварително конфигурирани комбинации от термичен адаптер и лабораторен софтуер, които правят нагревателя-шейкър готов за използване веднага след изваждането от кутията.
86
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Забележка: Не използвайте комбинирана дефиниция, ако трябва да преместите лабораторни прибори върху или от нагревателя-шейкър по време на вашия протокол, било с хващача, или ръчно. Вместо това използвайте дефиниция на самостоятелен адаптер.
Комбинация адаптер/лабораторен софтуер
Име на зареждане на API
Адаптер за нагревател-шейкър за дълбоки ямки Opentrons 96 с плака за дълбоки ямки NEST 2 ml
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Адаптер за нагревател-шейкър Opentrons 96 с плоско дъно с NEST 96 ямкова плоча 200 µL плоска
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Адаптер за нагревател-шейкър Opentrons 96 PCR с ямкова плака NEST 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Адаптер за универсален плосък нагревател-шейкър Opentrons с Corning 384 ямкова плоча 112 µL плоска
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Адаптерите могат да бъдат закупени директно от Opentrons на адрес https://shop.opentrons.com.
Плаки за кладенци и дефиниции на API
Opentrons Labware Library дефинира характеристиките на плаките с ямки, изброени по-горе, в отделен JSON fileс. Роботът Flex и Opentrons Python API разчитат на тези JSON дефиниции, за да работят с лабораторен софтуер, използван от вашите протоколи. Напримерample, когато работите с API, функцията ProtocolContext.load_labware приема тези имена на лабораторен софтуер като валидни параметри във вашия код. Свързаните имена на зареждане на API се свързват с дефинициите на лабораторния софтуер на плаките с ямки в хранилището на Opentrons GitHub.
Персонализирана лабораторна посуда за ямки
Опитайте да използвате Opentrons Labware Creator, за да направите персонализирана дефиниция на лабораторен софтуер, ако плака с ямка, която искате да използвате, не е посочена тук. Персонализираната дефиниция съчетава всички измерения, метаданни, форми, обемен капацитет и друга информация в JSON file. Opentrons Flex чете тази информация, за да разбере как да работи с вашия персонализиран лабораторен софтуер. Вижте раздела Персонализирани лабораторни дефиниции за повече информация.
OPENTRONS FLEX
87
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
5.4 Накрайници и поставки за накрайници
Накрайниците Opentrons Flex се предлагат в размери от 50 µL, 200 µL и 1000 µL. Това са прозрачни, непроводими полипропиленови накрайници, които се предлагат със или без филтри. Те са опаковани стерилно в стелажи, които съдържат 96 накрайника и не съдържат ДНКаза, РНКаза, протеаза, пирогени, човешка ДНК, ендотоксини и PCR инхибитори. Стелажите също включват партидни номера и дати на изтичане.
Гъвкавите накрайници за пипети работят с пипети Opentrons Flex 50 µL и 1000 µL в 1-, 8- и 96-канални конфигурации. Въпреки че можете да поставите който и да е от накрайниците Flex на пипети от 50 L и 1000 L, опитайте се да съобразите върха с номиналния капацитет на пипетата. Напримерample, може да е странно да поставите накрайник от 1000 L на пипетата от 50 L. За пипетата от 1000 L със сигурност можете да използвате накрайник от 50 L, 200 L или 1000 L.
Стелажи за съвети
Нефилтрираните и филтрираните накрайници са пакетирани в поставка, която се състои от основна плоча за многократна употреба, средна плоча, която побира 96 накрайника, и капак.
Поставка за накрайници по обем 50 µL 200 µL 1000 µL
Име на зареждане на API
Нефилтриран: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Филтриран: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Нефилтриран: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Филтриран: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Нефилтриран: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Филтриран: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
За да помогнат при идентифицирането, средните плочи на стойката за накрайници са цветно кодирани въз основа на размера на накрайника:
50 µL: магента 200 L: жълто 1000 µL: синьо
88
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
При поръчка или повторна поръчка накрайниците и стелажите се предлагат в две различни опаковани конфигурации:
Стелажи: Състои се от отделно опаковани в термосвиваеми опаковки накрайници (основна плоча, средна плоча с накрайници и капак). Ракетните конфигурации са най-добри, когато чистотата е от първостепенно значение, за да се избегне кръстосано замърсяване или когато вашите протоколи не позволяват повторна употреба на основна плоча или компонент.
Пълнители: Състои се от една пълна поставка за накрайници (основна плоча, средна плоча с накрайници и капак) и отделни контейнери за накрайници. Конфигурациите за презареждане са най-добри, когато вашите протоколи позволяват повторна употреба на основна плоча или компонент.
Съвместимост с накрайници
Гъвкавите накрайници за пипети са предназначени за пипетите Opentrons Flex. Накрайниците Flex не са обратно съвместими с пипети Opentrons OT-2, нито можете да използвате накрайници OT-2 на пипети Flex.
Други индустриални стандартни накрайници може да работят с пипети Flex, но това не се препоръчва. За да осигурите оптимална производителност, трябва да използвате само накрайници Opentrons Flex с Flex пипети.
Адаптер за стойка за накрайници
96-каналната пипета изисква адаптер, за да прикрепи правилно пълна стойка с накрайници. По време на процедурата за закрепване, пипетата се движи над адаптера, спуска се върху монтажните щифтове и издърпва накрайниците върху пипетите, като повдига адаптера и стойката за накрайници.
OPENTRONS FLEX
89
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Забележка: Използвайте само адаптера за стойка за накрайници, когато взимате цяла стойка с накрайници наведнъж. Поставете поставките за бакшиши директно върху тестето, когато събирате по-малко бакшиши.
Предупреждение: Опасност от прищипване. Дръжте ръцете си далеч от адаптера на стойката за накрайници, докато пипетата прикрепя върховете на пипетата.
Тип адаптер Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
Име на зареждане на API opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Адаптерът за стойка за върха е съвместим с Opentrons Flex Gripper. Можете да използвате захващащото устройство, за да поставите свежи поставки за накрайници върху адаптера или да вземете и преместите използвани поставки за накрайници в улея за отпадъци.
5.5 Епруветки и поставки за епруветки
Системата Opentrons 4-in-1 Tube Rack работи с Opentrons Flex по подразбиране. Използването на стойката за туби 4 в 1 помага за намаляване на натоварването ви от подготвителната работа, тъй като комбинациите, които предоставя, са готови за автоматизация веднага след изваждането от кутията. Повече информация е достъпна и в Opentrons Labware Library.
90
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Комбинации от тръби и стелажи
Поставката за тръби Opentrons 4 в 1 поддържа голямо разнообразие от размери на тръби, поотделно или в различни комбинации от размери (обем). Те включват: поставка с 6 епруветки за епруветки от 50 ml (6 x 50 ml). Комбинирана стойка с 10 епруветки за четири епруветки от 50 ml и шест епруветки от 15 ml (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). Поставка за 15 епруветки за 15 mL епруветки (15 x 15 mL). Стойка с 24 епруветки за епруветки от 0.5 mL, 1.5 mL или 2 mL (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Забележка: Всички тръби са цилиндрични с V-образни (конични) дъна, освен ако не е посочено друго.
6-тръбни стелажи
Туба тип 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-тръбни стелажи
Тип туба 4 Falcon 50 ml 6 Falcon 15 ml 4 NEST 50 ml 6 NEST 15 ml
Име на зареждане на API opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
15-тръбни стелажи
Туба тип 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
Име на зареждане на API opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24-тръбни стелажи
Тип на тръбата
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 ml 24 Eppendorf Safe-Lock 2 ml, U-образно дъно 24 общи 2 ml капачка на винт 24 NEST 0.5 ml капачка на винт 24 NEST 1.5 ml капачка на винт 24 NEST 1.5 ml капачка на винт 24 NEST 2 ml капачка на винт 24 NEST 2 ml капачка с щракване, U-образно дъно
Име на зареждане на API opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Дефиниции на API за тръбна стойка
Opentrons Labware Library дефинира характеристиките на стелажите за тръби, изброени по-горе, в отделен JSON fileс. Роботът Flex и Opentrons Python API разчитат на тези JSON дефиниции, за да работят с лабораторен софтуер, използван от вашите протоколи. Напримерample, когато работите с API, функцията ProtocolContext.load_labware приема тези имена на лабораторен софтуер като валидни параметри във вашия код. Свързаните имена на зареждане на API се свързват с дефинициите на лабораторния софтуер на стелажа за тръби в хранилището на Opentrons GitHub.
92
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Персонализирана лабораторна стойка за епруветки
Опитайте да създадете персонализирана дефиниция на лабораторен софтуер с помощта на Opentrons Labware Creator, ако комбинация от тръба и стелаж, която искате да използвате, не е посочена тук. Персонализираната дефиниция съчетава всички измерения, метаданни, форми, обемен капацитет и друга информация в JSON file. Opentrons Flex чете тази информация, за да разбере как да работи с вашия персонализиран лабораторен софтуер. Вижте раздела за дефиниции на потребителски лабораторен софтуер за повече информация.
5.6 Алуминиеви блокове
Алуминиевите блокове се доставят с температурния модул GEN2 и могат да бъдат закупени отделно като комплект от три части. Комплектът включва плака с плоско дъно, 24-ямков блок и 96-ямков блок.
Opentrons Flex използва алуминиеви блокове за задържане на sample епруветки и ямкови плочи върху температурния модул или директно върху палубата. Когато се използват с температурния модул, алуминиевите блокове могат да запазят вашите sample епруветки, PCR ленти или плаки при постоянна температура между 4 °C и 95 °C.
Плоска долна плоча
Плоската дънна плоча за Flex се доставя с кутията на температурния модул и е съвместима с различни ANSI/SLAS стандартни плочи за ямки. Тази плоска плоча се различава от плочата, която се доставя със самия температурен модул или отделния комплект от три части. Той разполага с по-широка работна повърхност и скосени ъглови скоби. Тези функции помагат за подобряване на производителността на Opentrons Flex Gripper при преместване на лабораторни прибори върху или от плочата.
Можете да разберете коя плоча с плоско дъно имате, защото тази за Flex има думите „Opentrons Flex“ на горната си повърхност. Тази за ОТ-2 не става.
OPENTRONS FLEX
93
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Алуминиев блок с 24 ямки
Блокът с 24 ямки се използва с отделни sampле флакони. Напримерample, приема sampфлакони, които:
Имат V-образно или U-образно дъно. Закрепете съдържанието с капачка с щракване или капачка на винт. Съхранявайте течност в вместимости от 0.5 mL, 1.5 mL и 2 mL.
Алуминиев блок с 96 ямки
Блокът с 96 ямки поддържа голямо разнообразие от типове ямкови плаки. Напримерample, той приема добре плочи, които са:
От големи производители на плочки като Bio-Rad и NEST.
Проектиран с V-образно дъно, U-образно дъно или плоско дъно.
Проектиран с 100 µL или 200 µL ямки.
Също така е съвместим с генерични PCR ленти.
Самостоятелни адаптери
Термичен блок Плака с плоско дъно Flex 24-ямков алуминиев блок 96-ямков алуминиев блок
Име на зареждане на API opentrons_aluminum_flat_bottom_plate Вижте комбинациите от лабораторен софтуер по-долу. opentrons_96_well_aluminium_block
Комбинации от лабораторни прибори от алуминиев блок
Opentrons Labware Library поддържа следните комбинации от блокове, флакони и плаки с ямки, които също са дефинирани в отделна JSON дефиниция за лабораторен софтуер fileс. Роботът Flex и Opentrons Python API
94
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
разчитайте на тези JSON дефиниции, за да работите с лабораторен софтуер, използван от вашите протоколи. Напримерample, когато работите с API, функцията ProtocolContext.load_labware приема тези имена на лабораторен софтуер като валидни параметри във вашия код. Таблиците по-долу изброяват комбинациите блок/контейнер по подразбиране и свързаните имена на зареждане на API. Връзките се свързват със съответните JSON дефиниции в хранилището на Opentrons GitHub.
Забележка: Всички тръби имат V-образно дъно, освен ако не е посочено друго.
Комбинации от лабораторни прибори с 24 гнезда от алуминиев блок
Съдържание на блок с 24 ямки Generic 2 mL капачка на винт NEST 0.5 mL капачка на винт NEST 1.5 mL капачка на винт NEST 1.5 mL капачка на винт NEST 2 mL капачка на винт NEST 2 mL капачка на винт, U-образно дъно
Име на зареждане на API opentrons_24_aluminumblock_generic_2ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml _screwcap opentrons_24_aluminumblock_nest_2ml_snapcap
Комбинации от лабораторни прибори с 96 гнезда от алуминиев блок
Съдържание на 96-ямков блок Плака с ямки Bio-Rad 200 µL Generic PCR лента 200 µL Плака с ямки NEST 100 µL
Име на зареждане на API opentrons_96_aluminumblock_biorad_wellplate_200uL opentrons_96_aluminumblock_generic_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminumblock_nest_wellplate_100uL
OPENTRONS FLEX
95
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
5.7 Лабораторен софтуер и Opentrons Flex Gripper
Въпреки че Opentrons Flex работи с целия инвентар в Labware Library, Opentrons Flex Gripper е съвместим само със специфични лабораторни елементи. В момента Gripper е оптимизиран за използване със следните лабораторни елементи.
Категория на лабораторни прибори Плочи с дълбоки ямки Пълно покрити плочи с 96 ямки
Стойки за накрайници (нефилтрирани и филтрирани накрайници)
Марки
NEST 96 Плата с дълбоки ямки 2 ml
Opentrons Tough 96 ямкова плака 200 µL PCR пълна пола NEST 96 ямкова плака 200 µL плоска
Поставка за накрайници Opentrons Flex 96 50 µL Поставка за накрайници Opentrons Flex 96 200 µL Поставка за накрайници Opentrons Flex 96 1000 µL
Забележка: За най-добри резултати използвайте Flex Gripper само с лабораторния софтуер, изброен по-горе. Flex Gripper може да работи с друг съвместим с ANSI/SLAS лабораторен софтуер за автоматизация, но това не се препоръчва.
5.8 Персонализирани дефиниции на лабораторен софтуер
Както беше обсъдено в началото на тази глава, персонализираният лабораторен софтуер е лабораторен софтуер, който не е изброен в Opentrons Labware Library. Можете да използвате други обичайни или уникални лабораторни елементи с Flex чрез точно измерване и записване на характеристиките на този обект и запазване на тези данни в JSON file. Когато се импортират в приложението, Flex и API използват тези JSON данни, за да взаимодействат с вашия лабораторен софтуер. Opentrons предоставя инструменти и услуги, които ще разгледаме по-долу, за да ви помогне да използвате Flex с персонализиран лабораторен софтуер.
96
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Създаване на персонализирани дефиниции на лабораторен софтуер
Инструментите и услугите на Opentrons помагат да поставите персонализиран лабораторен софтуер във вашия обсег. Тези функции се адаптират към различни нива на умения и начини на работа. Създаването на собствен лабораторен софтуер и използването му с Opentrons Flex помага да направите робота универсално и мощно допълнение към вашата лаборатория.
ПЕРСОНАЛИЗИРАН ЛАБОРАТОРЕН СЪЗДАТЕЛ
Custom Labware Creator е без код, web-базиран инструмент, който използва графичен интерфейс, за да ви помогне да създадете дефиниция на лабораторен софтуер file. Labware Creator създава JSON дефиниция на лабораторен софтуер file които импортирате в приложението Opentrons. След това вашият персонализиран лабораторен софтуер е достъпен за робота Flex и API на Python.
ОБСЛУЖВАНЕ НА ЛАБОРАТОРЕН КОМПЮТЪР ПО ПОРЪЧКА
Свържете се с нас, ако лабораторният уред, който искате да използвате, не е наличен в библиотеката, ако не можете да създадете свои собствени дефиниции или защото персонализиран артикул включва различни форми, размери или други нередности, описани по-долу.
Лабораторен софтуер, който можете да дефинирате в Labware Creator
; Ямките и епруветките са еднакви и идентични. ; Всички редове са равномерно разположени
(разстоянието между редовете е равно).
; Всички колони са равномерно разположени (разстоянието между колоните е еднакво).
; Пасва идеално в един слот за тесте.
Labware Opentrons трябва да дефинира ; Формите на ямките и тръбите варират. ; Редовете не са равномерно разположени.
; Колоните не са разположени равномерно.
; По-малък от един слот за колода (изисква адаптер) или обхваща няколко слота за колода.
OPENTRONS FLEX
97
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
Ето няколко диаграми, които ви помагат да си представите бившияampописани по-горе. Редовен Всички колони са равномерно разположени и всички редове са равномерно разположени. Не е необходимо колоните да имат същото разстояние като редовете.
Редовно Решетката не трябва да е в центъра на лабораторния уред.
Неправилните редове са равномерно разположени, но колоните не са равномерно разположени.
Неправилните колони/редове са равномерно разположени, но ямките не са идентични.
Неправилен Има повече от една мрежа.
Нашият екип за лабораторен софтуер ще работи, за да разбере вашите нужди и да създаде персонализирани дефиниции за лабораторен софтуер за вас. Вижте статиите за поддръжка Заявяване на персонализирана дефиниция на лабораторен софтуер и формуляра за заявка на персонализиран лабораторен софтуер за повече информация. Това е услуга, която се заплаща.
98
OPENTRONS FLEX
ГЛАВА 5: ЛАБОРАТОРНО ОБОРУДВАНЕ
API на PYTHON
Въпреки че не можете да създавате персонализиран лабораторен софтуер с нашия API, можете да използвате персонализиран лабораторен софтуер с наличните API методи. Трябва обаче първо да дефинирате своя персонализиран лабораторен софтуер и да го импортирате в приложението Opentrons. След като добавите своя лабораторен софтуер към приложението Opentrons, той е достъпен за Python API и робота. Вижте раздела Персонализирани дефиниции на лабораторен софтуер на документацията на Python API за повече информация. За информация относно писането на протоколни скриптове с API вижте раздела Python Protocol API в главата Разработка на протоколи.
JSON схема на лабораторния софтуер
JSON file е планът за стандартен и персонализиран лабораторен софтуер на Opentrons. Това file съдържа и организира лабораторни данни според спецификациите на дизайна, определени от схемата по подразбиране.
Схемата е рамка
Документи / Ресурси
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Open Source Робот за обработка на течности [pdf] Ръководство за употреба FLEX Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, FLEX, Opentrons Flex Open Source Liquid Handling Robot, Flex Open Source Liquid Handling Robot, Open Source Liquid Handling Robot, Source Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, Robot |