FLEX Opentrons Flex Oopbron Vloeistofhanteringsrobot
“
Opentrons Flex
Spesifikasies:
- Algemene spesifikasies: Lorem ipsum dolor sit
amet, consectetur adipiscing elit. Sed do eiusmod tempor incididunt
ut labore et dolore magna aliqua. - Omgewingsspesifikasies: Lorem ipsum
dolor sit amet, consectetur adipiscing elit. Sed doen eiusmod tempor
incididunt ut labore et dolore magna aliqua. - Sertifiserings: Lorem ipsum dolor sit amet,
consectetur adipiscing elit. Sed doen eiusmod tempor incididunt ut
labore et dolore magna aliqua. - Reeksnommer: XXX-XXXX-XXXX
Produkgebruiksinstruksies:
1. Instrument installasie en kalibrasie:
Volg die stappe uiteengesit in die handleiding vir pipet en grijper
installasie.
2. Hervestiging:
Vir kort bewegings, verwys na afdeling 2.5 in die handleiding. Vir
langafstandbewegings, volg die riglyne wat verskaf word. Algemene verhuising
advies is ook beskikbaar.
3. Verbindings:
Verseker behoorlike kragverbinding soos uiteengesit in die handleiding.
Koppel USB en hulptoestelle soos nodig. Netwerkverbindings
moet ingestel word volgens die instruksies.
4. Protokolontwerper:
Verstaan die vereistes vir Protocol Designer en leer hoe
om nuwe protokolle te ontwerp of bestaande te wysig volgens jou laboratorium
vereistes.
5. Python Protocol API:
Verken die skryf en uitvoer van skrifte met Python Protocol API.
Ontdek Python-eksklusiewe kenmerke vir verbeterde funksionaliteit.
6. OT-2-protokolle:
Kom meer te wete oor OT-2 Python-protokolle, OT-2 JSON-protokolle, en
Magnetiese Module-protokolle vir verskillende tipes eksperimente.
Gereelde Vrae (Gereelde Vrae):
V: Hoe spoor ek probleme op as die robot nie beweeg nie
verwag?
A: Gaan die kragverbinding na, verseker behoorlike kalibrasie van
instrumente, en verifieer dat daar geen obstruksies in die
robot se pad.
V: Kan ek pasgemaakte pipette met Opentrons Flex gebruik?
A: Opentrons beveel aan om versoenbare pipette te gebruik vir optimale
prestasie en akkuraatheid.
"`
Opentrons Flex
Instruksie Handleiding
Opentrons Labworks Inc.
Desember 2023
© OPENTRONS 2023 Opentrons FlexTM (Opentrons Labworks, Inc.) Geregistreerde name, handelsmerke, ens. wat in hierdie dokument gebruik word, selfs wanneer dit nie spesifiek as sodanig gemerk is nie, moet nie deur wetgewing as onbeskermd beskou word nie.
Inhoudsopgawe
Voorwoord . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .9 Struktuur van hierdie handleiding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9 Notas en waarskuwings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 10
Hoofstuk 1: Inleiding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 1.1 Welkom by Opentrons Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Wat is nuut in Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 11 Buig werkstasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 12 1.2 Veiligheidsinligting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Veiligheidsimbole. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 16 Elektriese veiligheidswaarskuwings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 17 Bykomende veiligheidswaarskuwings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Veiligheidsmaatreëls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .18 Biologiese veiligheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Giftige dampe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 Vlambare vloeistowwe . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 19 1.3 Reguleringsnakoming . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Veiligheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Elektromagnetiese verenigbaarheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 FCC waarskuwings en notas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .20 Kanada ISED-nakoming . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Omgewingswaarskuwing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21 Wi-Fi-voorsertifisering . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 21
Hoofstuk 2: Installasie en Verskuiwing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 22 2.1 Veiligheids- en bedryfsvereistes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Waar om Opentrons Flex te plaas . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .22 Kragverbruik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 Omgewingstoestande . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .24 2.2 Uitboks . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Moeite en tyd benodig . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Krat en verpakkingsmateriaal . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .25 Produkelemente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .26 Deel 1: Verwyder die krat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .27 Deel 2: Los die Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .29 Deel 3: Finale samestelling en krag aan . . . . . . . . . . . . . . . . . . .32
2.3 Eerste lopie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Krag aan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 35 Koppel aan 'n netwerk of rekenaar . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .36 Installeer sagteware-opdaterings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .37 Heg noodstophangertjie aan . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Gee jou robot 'n naam . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 38
2.4 Instrument installasie en kalibrasie . . . . . . . . . . . . . . . . . 38 Pipetinstallasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .39 Gripper installasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40
2.5 Hervestiging . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .40 Kort bewegings. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Langafstandbewegings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 41 Algemene verhuisingsadvies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .42 Finale gedagtes oor verhuising. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .44
Hoofstuk 3: Stelselbeskrywing. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 45 3.1 Fisiese komponente . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .45 Raam en omhulsel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Dek en werksarea . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .46 Staging gebied. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .47 Dek toebehore. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 48 Afvalguit. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Staging area slots . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .49 Bewegingstelsel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 Raakskerm en LED-skerms . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .51 3.2 Pipette . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 53 Pipet spesifikasies. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 54 Pipetkalibrasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Pipetpunt rek adapter. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 55 Gedeeltelike fooibakkie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipetsensors. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .56 Pipet-firmware-opdaterings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 3.3 Gripper . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .57 Gripper spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripper kalibrasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 Gripper-firmware-opdaterings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 58 3.4 Noodstophanger . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Wanneer om die E-stop te gebruik . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .59 Betrek en vrystelling van die noodstop . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .60
3.5 Verbindings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 Kragverbinding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 61 USB- en hulpverbindings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62 Netwerkverbindings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .62
3.6 Stelsel spesifikasies. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Algemene spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .63 Omgewingsspesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Sertifiserings. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64 Reeksnommer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .64
Hoofstuk 4: Modules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 66 4.1 Ondersteunde modules . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .66 4.2 Module caddy-stelsel . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 4.3 Module-kalibrasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .68 Wanneer om modules te kalibreer. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 Hoe om modules te kalibreer . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .69 4.4 Verwarmer-skudmodule GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker kenmerke. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .70 Heater-Shaker spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .72 4.5 Magnetiese blok GEN1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetiese blok kenmerke. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .73 Magnetiese blok spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .74 4.6 Temperatuurmodule GEN2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatuurmodule kenmerke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .75 Temperatuurmodule spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 4.7 Thermocycler Module GEN2. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .77 Thermocycler-kenmerke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .78 Thermocycler spesifikasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .79
Hoofstuk 5: Labware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 80 5.1 Labware-konsepte. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware as hardeware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Labware as data . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .80 Pasgemaakte laboratoriumware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .81 5.2 Reservoirs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Enkelputreservoirs . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Meerputte reservoirs. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .82 Reservoirs en API-definisies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 Pasgemaakte reservoir laboratoriumware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83 5.3 Putplate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 83
6-put borde. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 12-put plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 24-put plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 48-put plate. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 84 96-put plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 85 384-put plate . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Put plaat adapters. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .86 Putplate en API-definisies. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 Pasgemaakte putplaat laboratoriumware. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .87 5.4 Spenke en puntrakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tiprakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 88 Tippipette-versoenbaarheid . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 Tiprakadapter . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 89 5.5 Buise en buisrakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .90 Buis- en rakkombinasies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 6-buis rakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 10-buis rakke. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 91 15-buis rakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 24-buis rakke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Buisrek API definisies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .92 Pasgemaakte buisrek-laboratoriumware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 5.6 Aluminiumblokke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 Plat bodemplaat . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .93 24-put aluminium blok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 96-put aluminium blok . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Selfstandige adapters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .94 Aluminium blok laboratoriumware kombinasies . . . . . . . . . . . . . . . .94 24-put aluminium blok laboratoriumware kombinasies . . . . . . . . .95 96-put aluminium blok laboratoriumware kombinasies . . . . . . . . .95 5.7 Labware en die Opentrons Flex Gripper . . . . . . . . . . . . . . .96 5.8 Pasgemaakte laboratoriumware definisies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .96 Skep pasgemaakte laboratoriumware-definisies . . . . . . . . . . . . . . . . . . .97 JSON laboratoriumware skema . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .99 JSON-laboratoriumware-definisies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 104 Hoofstuk 6: Protokolontwikkeling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .105 6.1 Voorafgemaakte protokolle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Protokolbiblioteek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 105 Pasgemaakte Protokol Ontwikkelingsdiens . . . . . . . . . . . . . . . .
6.2 Protokolontwerper. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Protokolontwerpervereistes . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 109 Ontwerp 'n protokol . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 110 Wysiging van bestaande protokolle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 114
6.3 Python Protocol API. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Skryf en uitvoer van skrifte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 115 Python-eksklusiewe kenmerke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 116
6.4 OT-2 protokolle. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 117 OT-2 Python-protokolle. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 118 OT-2 JSON-protokolle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120 Magnetiese Module-protokolle . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 120
Hoofstuk 7: Sagteware en werking. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 7.1 Raakskermwerking. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Robot dashboard . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 121 Protokolbestuur . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 122 Protokolbesonderhede . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 124 Begin opstelling . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 127 Labware Posisiekontrole . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 128 Loopvordering. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 130 Loop voltooiing . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 131 Instrumentbestuur. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 132 Robotinstellings. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 133 Dekkonfigurasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 136 7.2 Opentrons Toep. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Toepassingsinstallasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 139 Oordrag van protokolle na Flex. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 140 Modulestatus en kontroles . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 142 Onlangse protokollopies . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 143 7.3 Gevorderde werking . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Jupyter Notaboek . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 144 Opdragreëlbewerking oor SSH . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 145
Hoofstuk 8: Onderhoud en Diens . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .147 8.1 Maak jou Flex skoon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Voor jy begin . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Wat jy kan skoonmaak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 147 Skoonmaakoplossings. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Raam- en vensterpaneelskoonmaak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148 Dek skoonmaak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 148
Gantry skoonmaak. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Skoonmaak van vullisgeut. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 8.2 Skoonmaak van pipette en punte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 149 Pipetontsmetting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 150 Skoonmaak pipetpunte . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 151 8.3 Maak die gryper skoon . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 152 8.4 Skoonmaakmodules. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Algemene module skoonmaak . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 153 Thermocycler seëls. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.5 Outoklaaf-veilige laboratoriumware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 154 8.6 Diens Flex . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Opentrons dienste . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 155 Installasiekwalifikasie en bedryfskwalifikasie . . . 155 Voorkomende instandhouding . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 156 Waarborg . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 157 Bylaag A: Woordelys . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .158 Bylaag B: Bykomende dokumentasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .170 B.1 Opentrons Knowledge Hub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.2 Python Protocol API dokumentasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 170 B.3 Opentrons HTTP API verwysing. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 B.4 Ontwikkelaardokumentasie . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 171 Bylaag C: Oopbronsagteware . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .172 C.1 Opentrons op GitHub . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 172 C.2 Opentrons monorepo . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 173 C.3 Ander bewaarplekke . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 175 Bylaag D: Ondersteuning en Kontakinligting . . . . . . . . . . . . . . .176 D.1 Verkope . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.2 Ondersteuning . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 176 D.3 Besigheidsinligting . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 177
Voorwoord
Welkom by die instruksiehandleiding vir die Opentrons Flex-vloeistofhanteringsrobot. Hierdie handleiding lei jou deur omtrent alles wat jy moet weet om Flex op te stel en te gebruik, en fokus op onderwerpe wat die meeste relevant is vir alledaagse gebruikers van Flex in 'n laboratoriumomgewing.
Struktuur van hierdie handleiding
Opentrons Flex is 'n komplekse stelsel, so daar is baie verskillende paaie om alles te leer wat dit kan doen. Spring gerus reguit na die hoofstuk wat aanspreek watter onderwerp ook al waaroor jy nuuskierig is! Byvoorbeeldample, as jy reeds 'n Flex opgestel het in jou laboratorium, kan jy verby die Installasie en Hervestiging hoofstuk slaan.
As jy 'n geleide benadering verkies, is hierdie handleiding so gestruktureer dat jy dit van begin tot einde kan volg.
Kom meer te wete oor Flex. Die onderskeidende kenmerke van Flex word in Hoofstuk 1: Inleiding gelys. Die inleiding sluit ook belangrike veiligheids- en regulatoriese inligting in.
Begin met Flex. As jy jou Flex moet opstel, volg die gedetailleerde instruksies in Hoofstuk 2: Installasie en Hervestiging. Maak jouself dan vertroud met die komponente van Flex in Hoofstuk 3: Stelselbeskrywing.
Stel jou dek op. Die opstel van die dek maak verskillende wetenskaplike toepassings op Flex moontlik. Hoofstuk 4: Modules beskryf Opentrons-randapparatuur wat jy in of bo-op die dek kan installeer om spesifieke wetenskaplike take uit te voer. Hoofstuk 5: Labware verduidelik hoe om met toerusting te werk om vloeistowwe te hou.
Begin 'n protokol. Die kerngebruik van Flex is die uitvoer van gestandaardiseerde wetenskaplike prosedures, bekend as protokolle. Hoofstuk 6: Protokolontwikkeling bied verskeie maniere om klaargemaakte protokolle te kry of self te ontwerp. Om jou protokol uit te voer, volg die instruksies in Hoofstuk 7: Sagteware en werking, wat ook instruksies het om ander take uit te voer en jou robot se instellings te pasmaak.
Hou Flex aan die gang. Volg die raad in Hoofstuk 8: Onderhoud en Diens om jou Flex skoon te hou en optimaal te laat loop. Of teken in vir een van die Opentrons-dienste wat daar gelys word en laat ons vir Flex sorg.
Leer selfs meer. Het jy nog iets anders nodig? Raadpleeg die bylaes. Bylaag A: Woordelys definieer Flex-verwante terme. Bylaag B: Bykomende dokumentasie wys jou op nog meer hulpbronne vir Opentrons-produkte en die skryf van kode om Flex te beheer.
OPENTRONS FLEX
9
VOORWOORD
Bylaag C: Oopbronsagteware verduidelik hoe Opentrons-sagteware op GitHub gehuisves word as 'n hulpbron vir beide ontwikkelaars en nie-ontwikkelaars.
Bylaag D: Ondersteuning en Kontakinligting lys hoe om met Opentrons in aanraking te kom as jy hulp nodig het verder as wat ons dokumentasie verskaf.
Notas en waarskuwings
Regdeur hierdie handleiding sal jy spesiaal geformateerde nota- en waarskuwingsblokke vind. Notas verskaf nuttige inligting wat dalk nie voor die hand liggend is tydens die gewone gebruik van Flex nie. Gee spesiale aandag aan waarskuwings – dit word slegs gebruik in situasies waar jy die risiko loop van persoonlike besering, skade aan toerusting, verlies of bederf van samplese of reagense, verlies van data of ander skade. Notas en waarskuwings lyk soos volg:
SampLet wel: Dit is iets wat jy behoort te weet, maar dit hou geen gevaar in nie.
Sample Waarskuwing: Dit is iets wat jy moet weet, want daar is risiko daaraan verbonde.
10
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1
Inleiding
Hierdie hoofstuk stel jou bekend aan die Opentrons Flex-ekosisteem, insluitend die algehele stelselontwerp en beskikbare werkstasie-konfigurasies. Dit sluit ook belangrike voldoenings- en veiligheidsinligting in, wat u moet hersienview voordat jy jou Opentrons Flex-robot opstel. Vir meer besonderhede oor die kenmerke van Opentrons Flex, sien die Stelselbeskrywing hoofstuk.
1.1 Welkom by Opentrons Flex
Opentrons Flex is 'n vloeistofhanteringsrobot wat ontwerp is vir hoë deurset en komplekse werkvloeie. Die Flex-robot is die basis van 'n modulêre stelsel wat pipette, 'n laboratoriumware-gryper, dektoebehore, modules op die dek en laboratoriumware insluit - wat jy alles self kan uitruil. Flex is ontwerp met 'n raakskerm sodat jy direk by die laboratoriumbank daarmee kan werk, of jy kan dit van regoor jou laboratorium beheer met die Opentrons-toepassing of ons oopbron-API's.
Flex-werkstasies kom met al die toerusting - robot, hardeware en laboratoriumware - wat jy nodig het om te begin met die outomatisering van algemene laboratoriumtake. Vir ander toepassings loop Opentrons Flex op volledig oopbronsagteware en -firmware, en is reagens- en laboratoriumware-agnosties, wat jou beheer gee oor hoe jy jou protokolle ontwerp en bestuur.
Wat is nuut in Flex
Opentrons Flex is deel van die Opentrons vloeistof hanteerder reeks robotte. Gebruikers van Opentrons Flex is dalk bekend met die Opentrons OT-2, ons persoonlike pipet robot. Flex gaan verder as die vermoëns van OT-2 in verskeie sleutelareas, en lewer hoër deurset en wegbreektyd.
Kenmerk Pipet deurvoer
Pipet- en puntkapasiteit
Beskrywing
Buigpipette het 1, 8 of 96 kanale. Die 96-kanaal pipet werk op 12 keer soveel putte op een slag as die grootste OT-2 pipet.
Flex-pipette het groter volumereekse (1 µL, 50 µL) en kan almal met enige volume Opentrons Flex-punte werk. Dit is 'n verbetering teenoor OT-5-pipette, wat kleiner reekse het en punte met 'n ooreenstemmende volumereeks moet gebruik.
OPENTRONS FLEX
11
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Gripper Outomatiese kalibrasie Raakskerm Module caddies Dekgleufkoördinate Beweegbare asblik Grootte en gewig
Die Opentrons Flex Gripper tel outomaties laboratoriumware om die dek op en skuif dit sonder gebruikersingryping. Die gryper maak meer komplekse werkvloeie binne 'n enkele protokollopie moontlik.
Posisionele kalibrasie van Flex-pipette en die gryper is ten volle outomaties. Druk een knoppie, en die instrument sal beweeg na presisie-gemasjineerde punte op die dek om sy presiese posisie te bepaal, en stoor daardie data vir gebruik in jou protokolle.
Flex het sy eie raakskerm-koppelvlak waarmee jy dit direk kan beheer, benewens die gebruik van die Opentrons-toepassing. Gebruik die raakskerm om protokollopies te begin, werkstatus na te gaan en instellings direk op die robot te verander.
Buigmodules pas in caddies wat ruimte onder die dek in beslag neem. Caddies plaas jou laboratoriumware nader aan die dekoppervlak en maak voorsiening vir kabelroetering onder die dek. Caddies maak selfs meer module- en laboratoriumware-konfigurasies op die dek moontlik.
Dekgleuwe op Flex is genommer met 'n koördinaatstelsel (A1D4) wat soortgelyk is aan hoe putte op laboratoriumware genommer is.
Die asblik kan in verskeie dekplekke op Flex gaan. Die verstekligging (gleuf A3) is die aanbevole posisie. Jy kan ook die gryper gebruik om vullis in die opsionele vullisgeut weg te gooi.
Flex is 'n bietjie groter en baie swaarder as OT-2. Installasietake op Flex vereis die bystand van 'n laboratoriumvennoot.
'n Gedetailleerde vergelyking van robot tegniese spesifikasies is beskikbaar op die Opentrons webwebwerf.
Beide Flex- en OT-2-robotte werk op ons oopbronsagteware, en die Opentrons-toepassing kan albei soorte robotte gelyktydig beheer. Alhoewel OT-2-protokolle nie direk op Flex uitgevoer kan word nie, is dit eenvoudig om dit aan te pas (sien die OT-2-protokolle-afdeling van die Protokolontwikkeling-hoofstuk vir besonderhede).
Buig werkstasies
Opentrons Flex-werkstasies sluit in die Flex-robot, bykomstighede, pipette en grijper, modules op die dek en laboratoriumware wat nodig is om 'n spesifieke toepassing te outomatiseer. Alle werkstasie komponente is modulêr. As jy toepassings moet verander, kan jy ander Flex-hardeware en versoenbare verbruiksgoedere byvoeg of omruil.
12
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1: INLEIDING
NGS WERKSTASIE
Die Opentrons Flex NGS-werkstasie outomatiseer NGS-biblioteekvoorbereiding. Dit kan vooraf-volgorde-werkvloeie outomatiseer met behulp van enige toonaangewende reagensisteem, insluitend fragmentasie- en tagmentasie-gebaseerde biblioteekvoorbereiding.
Benewens die Flex-robot, bevat die NGS-werkstasie:
Gripper Keuse van pipetkonfigurasie
Twee 8-kanaal pipette (1 µL en 50 5 µL) 1000-kanaal pipet (96 5 µL) Magnetiese Blok Temperatuur Module Thermocycler Module Labware-stel met filterpunte, mikrosentrifugeerbuise, reservoirs en PCR-plate
PCR WERKSTASIE
Die Opentrons Flex PCR-werkstasie outomatiseer PCR-opstelling en termocycling-werkvloei vir tot 96 s.amples. Dit kan verkoelde reagense en samples in 'n 96-put PCR-plaat. Met die byvoeging van die outomatiese Thermocycler-module, gebruik die gryper om die plaat in die Thermocycler te laai, en voer dan jou gekose PCR-program uit.
Benewens die Flex-robot, sluit die PCR-werkstasie in:
Gripper Keuse van pipetkonfigurasie
1-kanaal pipet (1 µL) en 50-kanaal pipet (8 µL) 1-kanaal pipet (50 96 µL) Afvalgat temperatuur Module Labware-stel met filterpunte, mikrosentrifugeerbuise, reservoirs en PCR-plate
OPENTRONS FLEX
13
HOOFSTUK 1: INLEIDING
NUKLEÏENSUUR EKSTRAKSIE WERKSTASIE
Die Opentrons Flex Nucleic Acid Extraction Workstation outomatiseer DNA/RNA isolasie en suiwering. Dit gebruik die Magnetiese Blok vir die skeiding van magnetiese krale, en die Heater-Shaker vir sample lysis en hersuspensie van magnetiese krale.
Benewens die Flex-robot, sluit die Nukleïensuur-ekstraksiewerkstasie in:
Gripper Keuse van pipetkonfigurasie
1-kanaal pipet (5 1000 µL) en 8-kanaal pipet (5 1000 µL) 96-kanaal pipet (5 1000 µL) Magnetiese blokverwarmer-skudmodule Labware-stel met filterpunte, reservoirs, PCR-plate en diepputplate
MAGNETIESE KRAAL PROTEÏEN SUIVERINGSWERKSTASIE
Die Opentrons Flex Magnetic Bead Protein Purification Workstation outomatiseer kleinskaalse proteïensuiwering en proteomika sampdie voorbereiding vir tot 96 samples. Dit is versoenbaar met baie gewilde magnetiese kraal-gebaseerde reagense.
Benewens die Flex-robot, bevat die Proteïensuiweringswerkstasie:
Gripper Keuse van pipetkonfigurasie
1-kanaal pipet (5 1000 µL) en 8-kanaal pipet (5 1000 µL) 96-kanaal pipet (5 1000 µL) Magnetiese blokverwarmer-skudmodule Labware-stel met filterpunte, reservoirs, PCR-plate en diepputplate
FLEX PREP WERKSTASIE
Die Opentrons Flex Prep Workstation outomatiseer eenvoudige pipetteerwerkstrome. Konfigureer die werkstasie met 1-kanaal en 8-kanaal pipette om take uit te voer soos sample oordrag, sample duplisering, en
14
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1: INLEIDING
reagens aliquotering. Konfigureer die werkstasie met die 96-kanaal pipet om hoë-deurvloei reagens aliquoting en plaat st uit te voeramping.
Benewens die Flex-robot, sluit die Flex Prep-werkstasie in:
Keuse van pipetkonfigurasie: 1-kanaal pipet (5 1000 µL) en 8-kanaal pipet (5 1000 µL) 96-kanaal pipet (5 1000 µL)
Labware-stel met filterpunte, mikrosentrifugeerbuise en reservoirs
PLASMID VOORBEREIDINGSWERKSTASIE
Die Opentrons Flex Plasmid Prep Workstation outomatiseer magnetiese kraal-gebaseerde plasmied ekstraksie en suiwering werkstrome. Hierdie werkstasie is toegerus met hoëvolume pipette, 'n verwarmer-skudmodule en 'n magnetiese blok om die meeste krale-gebaseerde chemie te akkommodeer.
Benewens die Flex-robot, sluit die Plasmid Prep-werkstasie in:
Gripper 1-kanaal pipet (5 1000 µL) en 8-kanaal pipet (5 1000 µL) Afvalgoot Magnetiese blokverwarmer-skudmodule Labware-stel met filterpunte, mikrosentrifugeerbuise, reservoirs, PCR-plate en diepputplate
SYNBIO WERKSTASIE
Die Opentrons Flex SynBio Workstation outomatiseer 'n verskeidenheid sintetiese biologie-werkstrome soos DNA-sintese en kloning. Dit gebruik die magnetiese blok en temperatuurmodule om die meeste krale-gebaseerde chemie te ondersteun. Voeg die Thermocycler Module by om verhitte dekselinkubasies en uit te voer amplifikasies.
Benewens die Flex-robot, bevat die SynBio-werkstasie:
Gripper 1-kanaal pipet (5 µL) en 1000-kanaal pipet (8 5 µL) magnetiese blok temperatuur module
OPENTRONS FLEX
15
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Labware-stel met gereelde en filterpunte, mikrosentrifugeerbuise, reservoirs, PCR-plate en diepputplate
1.2 Veiligheidsinligting
Die Opentrons Flex-vloeistofhanteringsrobot is ontwerp vir veilige werking. Verwys na die spesifikasies en voldoeningsriglyne in hierdie afdeling om veilige gebruik van jou Flex te verseker. Hierdie riglyne dek veilige gebruik van toevoer- en uitsetverbindings vir die produk, insluitend die krag- en dataverbindings, sowel as waarskuwingsetikette wat op die Flex-robot en verwante hardeware gevind word. Die gebruik van die toestel op 'n ander manier as dié wat in hierdie handleiding gespesifiseer word, kan die gebruiker en toerusting in gevaar stel.
Veiligheid simbole
Verskeie etikette op die Flex en in hierdie handleiding waarsku jou oor bronne van moontlike besering of skade.
Simbool
Beskrywing
Waarskuwing: Waarsku gebruikers oor potensieel gevaarlike toestande. Optrede wat tot persoonlike besering of dood kan lei.
Waarskuwing: Waarsku gebruikers teen skade aan die toerusting. Verlore of korrupte data. Onherstelbare onderbreking van die operasie wat uitgevoer word.
Elektriese skok: Identifiseer instrumentkomponente wat 'n risiko van elektriese skok kan inhou as die instrument onbehoorlik hanteer word.
Warm oppervlak: Identifiseer instrumentkomponente wat 'n risiko van persoonlike besering inhou as gevolg van hoë hitte/temperature as die instrument onbehoorlik hanteer word.
Knyppunt: Identifiseer instrumentkomponente wat 'n risiko van persoonlike besering kan inhou wanneer dit in beweging is.
16
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Jy sal die volgende etikette op die Flex vind:
Intellektuele eiendom etikette Regulerende voldoeningsetikette (bv. ETL) Elektriese gevaaretikette Algemene waarskuwingsetikette Produketikette Knyppuntetikette High voltage etikette Kraggradering etikette
Elektriese veiligheidswaarskuwings
Neem altyd die volgende elektriese veiligheidswaarskuwings in ag:
Simbool
Beskrywing
Prop die robot in 'n geaarde, Klas 1 stroombaan. Sien die Kragverbinding-afdeling in die Stelselbeskrywing-hoofstuk.
Moenie koppel (inprop), ontkoppel (ontkoppel) of AC-kragkabels gebruik as: Die kabel gerafeld of beskadig is nie. Ander aangehegte kabels, toue of houers is gerafeld of beskadig.
Die gebruik van beskadigde kragdrade kan 'n elektriese skokgevaar veroorsaak wat lei tot ernstige besering of skade aan die robot.
Moenie die AC-kragkabel vervang nie, tensy in die rigting van Opentrons Support.
Vir meer inligting oor elektriese vereistes, sien die Kragverbruik afdeling van die Installasie en Hervestiging hoofstuk.
OPENTRONS FLEX
17
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Bykomende veiligheidswaarskuwings
Neem altyd die volgende bykomende veiligheidswaarskuwings in ag:
Simbool
Beskrywing
Opentrons Flex is nie gesertifiseer vir gebruik met plofbare of vlambare vloeistowwe nie. Moenie plate, buise of flessies wat plofbare of vlambare vloeistowwe bevat in die robot laai of die instrument andersins met plofbare of vlambare vloeistowwe in die omhulsel gebruik nie.
Gebruik goeie laboratoriumpraktyke en volg die vervaardiger se voorsorgmaatreëls wanneer jy met chemikalieë werk. Opentrons is nie verantwoordelik of aanspreeklik vir enige skade as gevolg van, of as gevolg van, die gebruik van gevaarlike chemikalieë nie.
Die Flex weeg 88.5 kg (195 lbs). Dit het gevolglik twee mense nodig om dit veilig op te lig en te skuif. Sien die Verskuiwing afdeling in die Installasie en Verskuiwing hoofstuk.
Die Flex moet geplaas word op 'n oppervlak wat in staat is om sy gewig van 88.5 kg (195 lbs) te dra met voldoende oppervlak om die robot te akkommodeer plus sy minimum vrye afstand (20 cm/8 duim). Sien die afdeling Veiligheid en Bedryfsvereistes in die Installasie en Hervestiging hoofstuk.
Die Flex kan vibrasies uitstraal terwyl dit in werking is. Plaas die robot op 'n oppervlak wat stewig, gelyk en waterbestand is met kruisverstuwing of gelaste lasse. Sien die afdeling Veiligheid en Bedryfsvereistes in die Installasie en Hervestiging hoofstuk.
Veiligheidswaarskuwings
Om te help om die Flex teen skade te beskerm, volg hierdie voorsorgmaatreëls:
18
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Simbool
Beskrywing
Gebruik laboratoriumware wat aan ANSI/SLAS voldoen of deur Opentrons goedgekeur is. Sien die Labware-hoofstuk.
Hou korrosiewe materiale, middels of ander skadelike materiale weg van die robot.
Biologiese veiligheid
Behandel monsters en reagense wat materiaal bevat wat van mense geneem is as potensieel aansteeklike middels. Opentrons beveel aan om veilige laboratoriumprosedures te gebruik soos verduidelik in Biosafety in Microbiological and Biomedical Laboratories (BMBL) 6de uitgawe.
Onder normale omstandighede skep die Flex nie waarneembare aërosols uit bronvloeistowwe nie. Onder sekere omstandighede is dit egter moontlik om aërosols uit bronvloeistowwe te genereer. Wanneer u met bioveiligheidsvlak 2 of hoër bronvloeistowwe werk, oorweeg dit om voorsorgmaatreëls teen aërosolblootstelling te tref, in ooreenstemming met u plaaslike regulatoriese liggame. Om die potensiële risiko van aërosolblootstelling deur die robot te verminder, maak seker dat jy:
Voer instandhouding uit soos beskryf in die Onderhoud en Diens hoofstuk. Installeer en maak alle instrumentdeksels, pipette, modules en laboratoriumware behoorlik vas. Gebruik behoorlike pipettegniek om te help met die versagting van aërosols.
Giftige dampe
As jy met vlugtige oplosmiddels of giftige stowwe werk, gebruik 'n doeltreffende laboratoriumventilasiestelsel om enige dampe wat geproduseer kan word, te verwyder.
Vlambare vloeistowwe
Die Flex is nie geëvalueer vir gebruik met vlambare vloeistowwe nie en moet nie met vlambare vloeistowwe gebruik word nie.
OPENTRONS FLEX
19
HOOFSTUK 1: INLEIDING
1.3 Reguleringsnakoming
Opentrons Flex voldoen aan alle toepaslike vereistes van die volgende veiligheids- en elektromagnetiese standaarde.
Veiligheid
Reël ID IEC/UL/CSA 61010-1 IEC/UL/CSA 61010-2-051
Titel
Veiligheidsvereistes vir elektriese toerusting vir meting, beheer en laboratoriumgebruik Deel 1: Algemene vereistes
Besondere vereistes vir laboratoriumtoerusting vir meng en roer
Elektromagnetiese verenigbaarheid
Reël ID EN/BSI 61326-1
FCC 47 CFR Deel 15 Subdeel B Klas A IC ICES-003
Titel
Elektriese toerusting vir meting, beheer en laboratoriumgebruik EMK-vereistes Deel 1: Algemene vereistes Onbedoelde verkoelers
Spektrumbestuur en telekommunikasie-interferensie wat toerusting veroorsaak Standaard inligtingstegnologie-toerusting (insluitend digitale apparaat)
FCC waarskuwings en notas
Waarskuwing: Veranderinge of wysigings aan hierdie eenheid wat nie uitdruklik deur Opentrons goedgekeur is nie, kan die gebruiker se magtiging om die toerusting te gebruik, vernietig.
Hierdie toestel voldoen aan Deel 15 van die FCC-reëls. Werking is onderhewig aan die volgende:
20
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 1: INLEIDING
Hierdie toestel mag nie skadelike steurings veroorsaak nie. Hierdie toestel moet enige steuring wat ontvang word aanvaar, insluitend steuring wat ongewenste kan veroorsaak
operasie.
Let wel: Hierdie toerusting is getoets en gevind dat dit voldoen aan die limiete vir 'n Klas A digitale toestel, ingevolge Deel 15 van die FCC-reëls. Hierdie limiete is ontwerp om redelike beskerming teen skadelike inmenging te bied wanneer die toerusting in 'n kommersiële omgewing gebruik word. Hierdie toerusting genereer, gebruik en kan radiofrekwensie-energie uitstraal en, indien dit nie in ooreenstemming met die instruksiehandleiding geïnstalleer en gebruik word nie, kan dit skadelike steurings vir radiokommunikasie veroorsaak. Die gebruik van hierdie toerusting in 'n woongebied sal waarskynlik skadelike steurings veroorsaak, in welke geval daar van die gebruiker verwag sal word om die steuring op eie koste reg te stel.
Kanada ISED-nakoming
Kanada ICES-003(A) / NMB-003(A)
Hierdie produk voldoen aan die toepaslike Innovasie, Wetenskap en Ekonomiese Ontwikkeling Kanada tegniese spesifikasies.
Die huidige produk is in ooreenstemming met spesifikasiestegnieke van toepassing op Innovation, Sciences en Development économique Kanada.
Omgewingswaarskuwing
Waarskuwing: Kanker en Reproduktiewe Skade www.P65Warnings.ca.gov
Wi-Fi voorafsertifisering
Die Wi-Fi-module is vooraf gesertifiseer vir gebruik in baie streke:
Verenigde State (FCC): FCC Identifiseerder UAY-W8997-M1216 Europese Ekonomiese Ruimte (CE): Geen publieke identifiseerder (selfverklaring) Kanada (IC): Hardeware Weergawe Identifikasienommer W8997-M1216 Japan (TELEC): Gesertifiseerde nommer 020-170034 Indië (WPC): Registrasienommer ETA-SD-20191005525 (selfverklaring)
OPENTRONS FLEX
21
HOOFSTUK 2
Installasie en hervestiging
Hierdie hoofstuk beskryf hoe om jou laboratorium vir Opentrons Flex voor te berei, hoe om die robot op te stel en hoe om dit te skuif indien nodig. Voordat jy jou Flex in ontvangs neem, maak seker dat jou laboratorium of fasiliteit aan al die kriteria in die afdeling Veiligheid en Bedryfsvereistes voldoen. Wanneer dit tyd is om jou Flex aan die gang te kry, volg die gedetailleerde instruksies in die Uitboks, Eerste Loop, en Instrument Installasie en Kalibrasie afdelings, of gebruik die Opentrons Ter plaatse Ondersteuning Opstelling diens. En as jy ooit jou Flex na 'n nuwe ligging moet skuif, naby of ver, volg die stappe in die Verskuiwing-afdeling.
2.1 Veiligheids- en bedryfsvereistes
Waar om Opentrons Flex te plaas
Ruimte is 'n waardevolle kommoditeit in byna elke laboratorium. Jou Flex gaan 'n bietjie nodig hê - maar nie te veel nie, want dit is ontwerp om op die helfte van 'n standaard laboratoriumbank te pas. Maak seker dat jy 'n spasie het wat aan die volgende kriteria voldoen.
Bankoppervlak: Stilstaande, stewige, gelyke, waterbestande oppervlak. Tafels of banke met wiele (selfs sluit wiele) word nie aanbeveel nie. Flex beweeg vinnig en het baie massa, wat liggewig of beweegbare tafels kan skud of wanbalanseer.
Gewigdraer: Die robot alleen weeg 88.5 kg (195 lb) en moet net opgelig word deur twee mense wat saamwerk. Plaas die robot op 'n oppervlak wat maklik sy gewig plus die gewig van enige modules, laboratoriumware, vloeistowwe of ander laboratoriumtoerusting kan dra wat in jou toepassings gebruik kan word.
Bedryfspasie: Die robot se basisafmetings is 87 cm B x 69 cm D x 84 cm H (ongeveer 34″ x 27″ x 33″). Flex benodig 20 cm (8″) sy- en agterspeling vir kabels, USB-verbindings en om uitlaat van modules wat verhit en afkoel, te verwyder.
Waarskuwing: Moenie die kante of agterkant van die Flex gelyk teen 'n muur plaas nie.
22
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
84 cm 33 duim
87 cm 34 duim
Opentrons Flex basis afmetings.
69 cm 27 duim
20 cm 8 duim
20 cm 8 duim
20 cm 8 duim
Top view van Opentrons Flex, wat minimum sy- en rugspeling toon.
OPENTRONS FLEX
23
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Kragverbruik
Opentrons Flex moet gekoppel word aan 'n muuraansluiting by of naby die bankplek waar jy dit installeer. Koppel Flex net aan stroombane wat sy maksimum kragverbruik kan akkommodeer:
Insetkrag: 36 VDC, 6.1 A Rustige verbruik: 30 W Tipiese verbruik: 40 W (tydens protokolloop) Maksimum verbruik: Ongeveer 50 W
Presiese kragverbruik hang af van:
Die hoeveelheid en tipe beweging wat tydens 'n protokol uitgevoer word. Die hoeveelheid tyd wat die robot ledig spandeer. Die status van die ligte op die robot. Hoeveel instrumente is aangeheg.
Onthou om rekening te hou met ander elektronika wat krag op dieselfde stroombaan verbruik, insluitend Flex-modules met hul eie kragbronne. Byvoorbeeldample, die Thermocycler-module het 'n maksimum kragverbruik (630 W) wat baie groter is as die Flex-robot self. Indien nodig, raadpleeg die bestuurder van jou fasiliteit om seker te maak dit voldoen aan jou toerusting se kragvereistes.
Omgewingstoestande
Omgewingstoestande vir aanbevole gebruik, aanvaarbare gebruik en berging verskil:
Aanbeveel vir stelselwerking
Aanvaarbaar vir stelselwerking
Omgewingstemperatuur +20 tot +25 °C
+2 tot +40 °C
Relatiewe humiditeit Hoogte
40%, nie-kondenserend
Ongeveer 500 m bo seespieël
30%, nie-kondenserend (onder 80 °C)
Tot 2000 m bo seespieël
Berging en vervoer
-10 tot +60 °C
10%, nie-kondenserend (onder 85 °C)
Tot 2000 m bo seespieël
24
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Opentrons het die werkverrigting van Opentrons Flex bekragtig in die toestande wat aanbeveel word vir stelselwerking, en werking in daardie toestande behoort optimale resultate te lewer. Flex is veilig om te gebruik in toestande wat aanvaarbaar is vir stelselwerking, maar resultate kan verskil. Moenie Flex aanskakel of gebruik in toestande buite daardie perke nie. Die bergings- en vervoervoorwaardes geld slegs wanneer die robot heeltemal van krag en ander toerusting ontkoppel is.
2.2 Ontboks
Baie geluk! Jou Opentrons Flex het gekom en jy het 'n spasie daarvoor in jou laboratorium voorberei. Kom ons maak daardie monsterkrat oop, verwyder die robot en berei dit voor vir werking. Die inligting in hierdie afdeling verskaf 'n onderdelelys en instruksies wat jou deur die stappe lei wat nodig is om die Flex uitgepak, opgestel en gereed vir gebruik te kry. Ons het die opstelprosedure in drie dele verdeel:
Deel 1 handel oor die demontering van die krat. Deel 2 handel oor die losmaak van die Flex van die krat en die verskuiwing daarvan na 'n finale monteerplek. Deel 3 dek finale montering en die aanskakeling van die robot vir die eerste keer.
Inspanning en tyd benodig
Jy sal 'n laboratoriumvennoot wil vra om te help met die uitpak-, op-, verskuif- en monteerproses. Jy sal ongeveer 30 minute tot 'n uur vir hierdie poging moet begroot.
Let wel: Die Flex benodig twee mense om dit behoorlik op te lig. Om die Flex aan sy handvatsels op te lig en te dra, is ook die beste manier om die robot te beweeg.
Krat en verpakkingsmateriaal
Om 'n Flex uit te pak gee jou 'n ongelooflike robot, maar jy het ook verskeie groot kratpanele saam met 'n verskeidenheid versendingskomponente en vulling. Alhoewel jy hierdie materiaal kan weggooi, moedig ons jou aan om hierdie items te hou as daar stoorplek beskikbaar is. Die verpakking is herbruikbaar, wat help om jou Flex voor te berei vir versending as jy dit ooit iewers anders heen moet stuur (bv. na 'n konferensie of 'n nuwe fasiliteit) in die toekoms.
OPENTRONS FLEX
25
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Produk elemente
Die Flex word saam met die komponente hieronder gelys. Pipette, die gryper en modules kom in aparte verpakking van die hoof Flex-krat, selfs al het jy dit saam as 'n werkstasie gekoop.
(1) Opentrons Flex-robot
(1) USB-kabel
(1) Kragkabel
(1) Ethernet-kabel
(5) L-sleutels (12 mm heks, 1.5 mm heks, 2.5 mm heks, 3 mm heks,
T10 Torx)
(1) Noodstophangertjie
(1) Dekgleuf met laboratoriumware-knipsels
(4) Spaar laboratoriumware clips
(1) Pipetkalibrasiesonde
(4) Dra handvatsels en doppies
(1) Bo-vensterpaneel
(4) Syvensterpanele
(1) 2.5 mm seskantskroewedraaier
(1) 19 mm-sleutel
(16 + onderdele) Vensterskroewe (M4x8 mm plat kop)
26
(10) Reservedekgleufskroewe (M4x10 mm-sokkop)
(12) Reservedekklemskroewe (M3x6 mm-sokkop)
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Deel 1: Verwyder die krat
Opentrons stuur jou Flex in 'n stewige laaghoutkrat. Die versendingskrat gebruik haak en grendel clamps om die boonste, sy- en onderpanele aan mekaar vas te maak. Die gebruik van grendels, in plaas van spykers of skroewe, beteken dat jy nie 'n koevoet (of baie krag) nodig het om die krat uitmekaar te haal nie, en jy kan dit later weer aanmekaarsit, indien nodig.
Let wel: Kratrande kan tydens versending grof raak. Jy sal dalk werkhandskoene wil gebruik om jou hande teen houtsplinters te beskerm.
Om die grendels los te maak, draai die grendeloortjie op en draai dit na links (teenkloksgewys). Hierdie aksie beweeg die clamp arm uit sy ooreenstemmende houbeugel. Jy kan dan die grendelarm van die krat af wegdraai.
1 Ontsluit die agt grendels wat die bokant na die kante hou.
2 Verwyder die boonste paneel nadat jy die grendels losgemaak het.
OPENTRONS FLEX
27
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING 3 Sny die blou versendingsak oop, verwyder hierdie items van die vulling en sit dit eenkant:
Gebruikersstel Krag-, Ethernet- en USB-kabels Noodstophanger
4 Verwyder die boonste stuk skuimvulling om die vensterpanele bloot te lê. Die vulling beskerm die sy- en boonste panele.
5 Verwyder die vensterpanele en sit dit eenkant. Jy sal dit later aanheg.
28
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
6 Ontsluit die oorblywende 16 grendels wat die sypanele aan mekaar en die basis van die krat hou. 7 Verwyder die sypanele en sit dit eenkant.
Deel 2: Laat die Flex los
Nadat jy die stappe in Deel 1 voltooi het, behoort jy nou 'n robot te sien wat in 'n beskermende sak is en aan oranje staal monteerkomponente geheg is. Die sak omsluit die robot en beskerm dit teen die buite-omgewing. Staalhakies maak die robot aan die onderkant van die krat vas. Twee versendingrame ondersteun die robot, versprei sy gewig eweredig en hou dit styf sodat dit nie kromtrek tydens versending nie. Gaan voort om die Flex uit te pak en haal dit van die kratbasis af.
8 Gebruik die 19 mm-sleutel van die gebruikersstel en los die hakies van die krat se bodem los. Jy kan die hakies weggooi of dit stoor vir toekomstige gebruik.
OPENTRONS FLEX
29
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING 9 Trek of rol die versendingsak heeltemal af om die hele robot bloot te lê.
10 Met die hulp van jou laboratoriummaat, gryp die handvatsels in die oranje versendingrame aan weerskante van die robot se basis, lig die Flex van die kratbasis af en sit dit op die vloer neer. Stoor of gooi die kratbasis en versendingsraam weg.
30
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERSKUIWING 11 Gebruik die 12 mm-hex L-sleutel uit die gebruikersstel, verwyder die vier boute wat die versendingsrame vashou aan
die Flex. Stoor of gooi die rame en boute weg.
12 Verwyder die vier aluminium handvatsels uit die User Kit. Skroef die handvatsels op dieselfde plekke as wat die 12 mm-verskepingsraamboute vasgehou het.
OPENTRONS FLEX
31
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
13 Met die hulp van jou laboratoriummaat, lig die Flex aan sy drahandvatsels op en skuif dit na 'n werkbank vir finale montering.
Deel 3: Finale montering en krag aan
Nadat jy die Flex na ’n tydelike werkarea, of sy permanente tuiste, geskuif het, is dit tyd om die laaste hand aan jou nuwe robot te sit.
14 As jy die robot na sy finale, werkende plek geskuif het, verwyder die drahandvatsels en vervang dit met die afwerkingdoppies. Die pette maak die handvatselopeninge in die raam toe en gee die robot 'n skoon voorkoms. Bring die handvatsels terug na die User Kit vir berging.
32
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
15 Haal die bo- en sypanele uit die verpakkingskuim wat jy eenkant gesit het nadat jy die kratblad verwyder het.
16 Pas die vensterpanele aan die Flex deur die etiketinligting op die voorste beskermende film te volg. Verwyder dan die beskermende film.
17 Gebruik die skuins vensterskroewe en die 2.5 mm-skroewedraaier van die User Kit, heg die vensterpanele aan die Flex. Maak seker dat die skuins (V-vormige) gate in die vensterpanele na buite wys (na jou toe). Dit laat die skroewe gelyk met die oppervlak van die venster pas.
Waarskuwing: Verkeerde oriëntering van die panele kan lei tot skade. Oormatige skroefwringkrag kan die panele kraak. Draai die skroewe met die hand vas totdat die vensterpanele redelik veilig is. Dit is nie 'n beproewing van krag nie.
OPENTRONS FLEX
33
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERSKUIWING 18 Gebruik die 2.5 mm-skroewedraaier van die gebruikersstel en verwyder die sluitskroewe van die portaal. Hierdie
skroewe verhoed dat die portaal beweeg terwyl dit vervoer word. Die gantry-sluitskroewe is geleë: Aan die linkerkantse reling naby die voorkant van die robot. Onder die vertikale portaalarm. Aan die regterkant spoor naby die voorkant van die robot in 'n oranje hakie. Hier is twee skroewe.
Die portaal beweeg maklik met die hand nadat al die versendingskroewe verwyder is. 19 Sny en verwyder die twee rekkies wat die asblik in plek hou tydens versending.
34
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
20 Heg die kragkabel aan Flex en prop dit in die muurprop. Maak seker dat die dek area vry is van obstruksies. Draai die kragskakelaar links agter op die robot. Sodra dit aangeskakel word, beweeg die portaal na sy tuisligging en die raakskerm vertoon bykomende konfigurasie-instruksies.
Noudat jou Flex uit die boks is en gereed is om te gaan, gaan voort na die First Run-afdeling hieronder.
2.3 Eerste lopie
Voer basiese opstelling op die raakskerm uit voordat jy enige ander hardeware aan jou Flex koppel. Die robot sal jou lei deur aan jou laboratoriumnetwerk te koppel, na die nuutste sagteware op te dateer en Flex te verpersoonlik deur dit 'n naam te gee.
Krag aan
Wanneer jy Flex aanskakel, sal die Opentrons-logo op die raakskerm verskyn. Na 'n paar oomblikke sal dit die "Welkom by jou Opentrons Flex"-skerm wys.
Die Opentrons Flex-verwelkomingsskerm. Jy behoort hierdie skerm eers te sien wanneer jy jou Flex vir die eerste keer begin.
OPENTRONS FLEX
35
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Koppel aan 'n netwerk of rekenaar
Volg die aanwysings op die raakskerm om jou robot aan te sluit sodat dit vir sagteware-opdaterings kan kyk en protokol kan ontvang files. Daar is drie verbindingsmetodes: Wi-Fi, Ethernet en USB.
Netwerkverbinding opsies. Jy moet internetverbinding hê om Flex op te stel. Wi-Fi: Gebruik die raakskerm om aan Wi-Fi-netwerke te koppel wat met WPA2 Persoonlike stawing beveilig is (die meeste netwerke wat net 'n wagwoord benodig om aan te sluit, val onder hierdie kategorie).
Let wel: Flex ondersteun nie gevange-portale nie (netwerke wat nie 'n wagwoord het nie, maar laai 'n webbladsy om gebruikers te verifieer nadat hulle gekoppel is).
Jy kan ook aan 'n oop Wi-Fi-netwerk koppel, maar dit word nie aanbeveel nie.
Waarskuwing: Deur aan 'n oop Wi-Fi-netwerk te koppel, sal enigiemand binne die bereik van die netwerksein jou Opentrons Flex-robot sonder verifikasie kan beheer.
As jy aan 'n Wi-Fi-netwerk moet koppel wat ondernemingstawing gebruik (insluitend "eduroam" en soortgelyke akademiese netwerke wat 'n gebruikersnaam en wagwoord vereis), koppel eers aan die Opentrons-toepassing met Ethernet of USB om aanvanklike opstelling te voltooi. Koppel dan aan die onderneming se Wi-Fi-netwerk in die netwerkinstellings vir jou Flex. Om toegang tot die netwerkinstellings te verkry:
36
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
1. Klik Toestelle in die linkerkantbalk van die Opentrons-toepassing. 2. Klik op die driekolkieslys () vir jou Flex en kies Robotinstellings. 3. Klik op die Netwerk-oortjie.
Kies jou netwerk uit die aftreklys of kies "Sluit aan by ander netwerk ..." en voer sy SSID in. Kies die ondernemingstawingmetode wat jou netwerk gebruik. Die ondersteunde metodes is:
EAP-TTLS met TLS EAP-TTLS met MS-CHAP v2 EAP-TTLS met MD5 EAP-PEAP met MS-CHAP v2 EAP-TLS
Elkeen van hierdie metodes vereis 'n gebruikersnaam en wagwoord, en afhangende van jou presiese netwerkopstelling kan sertifikaat vereis word files of ander opsies. Raadpleeg jou fasiliteit se IT-dokumentasie of kontak jou IT-bestuurder vir besonderhede van jou netwerkopstelling.
Ethernet: Koppel jou robot aan 'n netwerkskakelaar of -hub met 'n Ethernet-kabel. Jy kan ook direk aan die Ethernet-poort op jou rekenaar koppel, vanaf robotstelselweergawe 7.1.0.
USB: Koppel die meegeleverde USB A-tot-B-kabel aan die robot se USB-B-poort en 'n oop poort op jou rekenaar. Gebruik 'n USB B-tot-C-kabel of 'n USB A-to-C-adapter as jou rekenaar nie 'n USB-A-poort het nie.
Om met die opstelling voort te gaan, moet die Opentrons-toepassing op die gekoppelde rekenaar geïnstalleer en aan die gang wees. Vir besonderhede oor die installering van die Opentrons-toepassing, sien die toepassingsinstallasie-afdeling van die Sagteware en Bedryf-hoofstuk.
Installeer sagteware-opdaterings
Noudat jy aan 'n netwerk of rekenaar gekoppel het, kan die robot kyk vir sagteware en firmware-opdaterings en dit aflaai indien nodig. As daar 'n opdatering is, kan dit 'n paar minute neem om te installeer. Sodra die opdatering voltooi is, sal die robot herbegin.
OPENTRONS FLEX
37
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Heg noodstophangertjie aan
Koppel die ingeslote noodstophanger (E-stop) aan 'n hulppoort (AUX-1 of AUX-2) aan die agterkant van die robot.
Voor en na die koppeling van die noodstophanger.
Om die E-stop aan te heg en te aktiveer is verpligtend vir die heg van instrumente en hardloop protokolle op Flex. Vir meer inligting oor die gebruik van die noodstop tydens robotbedryf, sien die Noodstophanger-afdeling van die Stelselbeskrywing-hoofstuk.
Gee jou robot 'n naam
Deur jou robot te benoem, kan jy dit maklik in jou laboratoriumomgewing identifiseer. As jy verskeie Opentrons-robotte op jou netwerk het, maak seker dat jy hulle unieke name gee. Sodra jy jou robot se naam bevestig het, sal jy na jou Opentrons Flex Dashboard geneem word. Waarskynlik is die volgende stap wat jy sal wil neem om instrumente aan te heg, wat in die volgende afdeling behandel word.
2.4 Instrument installasie en kalibrasie
Na die aanvanklike robotopstelling is die volgende stap om instrumente aan die robot te heg en dit te kalibreer.
Om 'n instrument te installeer, tik eers op Instrumente op die raakskerm of gaan na die Pipette en Modules-afdeling van die toestelbesonderhedeskerm in die Opentrons-toepassing. Kies 'n leë montering en kies óf Heg pipet aan óf Heg Gripper aan. As die houer wat jy wil gebruik reeds beset is, moet jy eers die pipet of gryper losmaak.
38
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Let wel: Die algehele installasieproses is dieselfde, ongeag of jy die raakskerm of die Opentrons-toepassing gebruik. Met watter toestel jy ook al begin, sal die installasieproses beheer word totdat jy dit voltooi of kanselleer.
As jy op die raakskerm begin, sal die toepassing wys dat die robot “besig” is. As jy in die toepassing begin, sal die raakskerm 'n modaal wys wat aandui dat instrumentinstallasie aan die gang is.
Die presiese installasieproses wissel na gelang van die instrument wat jy aanheg, soos gedek in die afdelings hieronder. Alle instrumente het 'n outomatiese kalibrasieprosedure, wat u onmiddellik na installasie moet uitvoer.
Pipet installasie
Wanneer jy 'n pipet installeer, sal jy deur die volgende stappe op die raakskerm of in die Opentrons-toepassing gelei word.
1. KIES PIPETTIPE Kies tussen 1- of 8-Kanaal-pipet en 96-Kanaal-pipet. Die heg van die 96-kanaal pipet vereis 'n paar bykomende stappe, want dit heg aan 'n spesiale monteerplaat wat oor beide pipet mounts strek.
2. BEREI VOOR VIR INSTALLASIE Verwyder laboratoriumware van die dek en maak die werkarea skoon om aanhegting en kalibrering makliker te maak. Versamel ook die nodige toerusting, soos die kalibrasiesonde, seskantskroewedraaier en monteerplaat (vir die 96-kanaal-pipet).
3. KOOP EN BEVEILIG DIE PIPET Die portaal sal na die voorkant van die robot beweeg sodat jy die pipet kan heg.
1- en 8-kanaal pipette verbind direk aan 'n pipet mount. Die 96-kanaal pipet benodig 'n monteerplaat. Om die monteerplaat te heg, moet jy eers die z-as-wa vir die regte pipetmontering ontkoppel.
OPENTRONS FLEX
39
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Koppel die pipet aan die gekose pipetmontering en maak sy skroewe vas.
4. LOOP OUTOMATIESE KALIBRASIE Om die pipet te kalibreer, heg die kalibrasiesonde aan die toepaslike pipetspuitstuk. Die pipet sal outomaties beweeg om sekere punte op die dek aan te raak en hierdie kalibrasiewaardes te stoor vir toekomstige gebruik. Sodra kalibrasie voltooi is en jy die sonde verwyder het, sal die pipet gereed wees vir gebruik in protokolle.
Gripper installasie
Wanneer jy die gryper installeer, sal jy deur die volgende stappe op die raakskerm of in die Opentrons-toepassing gelei word.
1. BEREID VIR INSTALLASIE Verwyder laboratoriumware van die dek af en maak die werkarea skoon om aanhegting en kalibrering makliker te maak. Maak ook die nodige seskantige skroewedraaier bymekaar en maak seker dat die kalibrasiepen in sy stoorarea op die gryper is.
2. KOPPEL EN BEVEILIG DIE GRIPPER Die portaal sal na die voorkant van die robot beweeg sodat jy die gryper kan heg. Koppel die gryper aan die verlengstuk en maak sy skroewe vas.
3. LOOP OUTOMATIESE KALIBRASIE Om die gryper te kalibreer, steek die kalibrasiepen in die voorkaak. Die gryper sal outomaties beweeg om sekere punte op die dek aan te raak en hierdie kalibrasiewaardes te stoor vir toekomstige gebruik. Herhaal dan dieselfde proses met die kalibrasiepen in die agterkaak. Sodra kalibrasie voltooi is en jy die pen terug in sy stoorplek geplaas het, sal die gryper gereed wees vir gebruik in protokolle.
2.5 Hervestiging
Hierdie afdeling verskaf raad en instruksies oor hoe om jou Opentrons Flex-robot oor kort en lang afstande te beweeg.
40
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Kort bewegings
'n Kort skuif strek oor 'n reeks afstande van "kom ons skuif dit net 'n bietjie oor" tot oor die laboratorium, in die gang af of 'n ander vloer in jou gebou. In hierdie gevalle kan jy jou Flex met die hand beweeg. Om dit op 'n handkar te vervoer is ook 'n goeie opsie.
Waarskuwing: Die Flex weeg 88.5 kg. Dit het gevolglik twee mense nodig om dit veilig op te lig en te skuif.
Heg die hyshandvatsels weer aan om jou Flex na 'n nuwe nabygeleë plek te skuif. Om die Flex aan sy handvatsels op te lig en te dra, is die regte manier om die robot kort afstande te beweeg. Verwyder die handvatsels en stoor dit in die User Kit nadat die skuif voltooi is. Om te voorkom dat die robot beskadig word, gebruik altyd die hyshandvatsels om dit op te tel en te skuif. Moenie die raam gryp om jou robot op te lig of te skuif nie.
Langafstandbewegings
'n Langafstandskuif vervoer jou Flex van die terrein van jou universiteit, fasiliteit of instelling af. Regoor die stad, na 'n nuwe stad, staat, provinsie of land is almal eksamples van 'n langafstandbeweging. In hierdie geval sal jy die Flex moet pak om dit te beskerm teen die elemente, skokke en growwe bewegings wat mag voorkom tydens vervoer.
As jy die verskepingskrat en interne stutte wat saam met jou Flex gekom het, gehou het, kan jy dit in hierdie materiaal herverpak vir 'n langafstandskuif. Volg die uitpakstappe in omgekeerde volgorde om jou Flex vir 'n langafstandskuif voor te berei. Basies moet jy:
Ontkoppel die krag- en netwerkkabel, indien aangeheg. Verwyder alle aangehegte hardeware en laboratoriumware. Heg die dekplate weer aan. Sluit die portaal (sien die Algemene Bewegingsadvies-afdeling hieronder). Verwyder en stoor die vensterpanele.
As jy die oorspronklike krat gehou het:
Heg die versendingsraam weer aan die Flex en bevestig dit aan die paletbasis met behulp van die L-hakies. Voeg vulsel by en monteer die versendingkrat weer.
OPENTRONS FLEX
41
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
As jy nie die oorspronklike krat en verwante materiaal het nie, kontak 'n betroubare versendingsmaatskappy. Hulle kan die verpakking, vervoer en afleweringsproses vir jou bestuur.
Algemene verhuisingsadvies
SKAKEL KRAG- EN NETWERKKABELS AF Voordat jy jou Flex skuif, moenie vergeet om: Die krag af te skakel en dit van die kragtoevoer te ontkoppel nie. Ontkoppel die Ethernet- of USB-kabel, indien gebruik.
SLUIT DIE GANTRY Voordat jy jou Flex beweeg, sit die sluitskroewe weer in om die portaal in plek te hou. Die portaal-sluitpunte is geleë: Aan die linkerkantse reling naby die voorkant van die robot. Onder die vertikale portaalarm. Aan die regterkant spoor naby die voorkant van die robot. Om hierdie deel van die portaal te sluit, vereis die klein
oranje bracket en twee sluitskroewe.
42
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
TUIS DIE GANTRY Jy sal dalk nie die portaal wil sluit as jy net die robot na 'n nabygeleë plek skuif nie. As jy besluit om dit nie te sluit nie, gebruik ten minste die raakskerm of die Opentrons-toepassing om die portaal na sy tuisposisie te stuur voordat jy dit afskakel. Om die portaal via die raakskerm te huisves, tik die driekolkieslys () en tik dan Tuisportaal. Om die portaal te huisves via die Opentrons-toepassing: Klik op Toestelle. Klik op jou Flex in die toestellys. Klik op die drie-kol kieslys () en klik dan op Home gantry.
VERWYDER MODULES In-dek modules en ander aanhegsels voeg ekstra gewig by jou Flex. Hulle beïnvloed ook die robot se swaartepunt, wat dit kan laat voel dat dit “tipagtig” is wanneer dit opgelig word. Om te help om die robot ligter te maak en te balanseer, verwyder enige aangehegte instrumente en laboratoriumware voordat jy dit optel.
HERINSTALLEER DEKKLEWE Ons beveel aan om die dekgleuwe weer aan te heg vir 'n langafstandbeweging. Deur die gleuwe op hul oorspronklike plekke vas te maak, help dit om toevallige verlies te voorkom. Om die dekgleuwe weer vas te maak vir kort bewegings om die laboratorium is opsioneel.
HERKALIBRASIE NA-SKUIF Jy moet enige instrumente en modules herkalibreer nadat jy dit weer geïnstalleer het. Vir meer besonderhede oor module-kalibrasie, sien die Modules-hoofstuk.
OPENTRONS FLEX
43
HOOFSTUK 2: INSTALLASIE EN VERHUISING
Finale gedagtes oor verhuising
Jou Flex is 'n stewige en goedgeboude masjien, maar dit is ook 'n presiese wetenskaplike instrument wat ontwerp is vir hoë toleransies. Gevolglik moet jy dit versigtig hanteer wanneer jy dit binne jou plaaslike werksarea verplaas of dit regoor die land stuur. Dit beteken om die leiding wat hier verskaf word te volg en jou eie gesonde verstand te gebruik oor hoe om 'n duur stuk laboratoriumtoerusting te vervoer. Bottom line: wanneer jy jou Flex beweeg, moet jy versigtig wees en ekstra vulling.
As jy vrae of bekommernisse het oor die hervestiging van jou Flex, kontak ons by support@opentrons.com.
44
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3
Stelselbeskrywing
Hierdie hoofstuk beskryf die hardeware stelsels van Opentrons Flex, wat onderliggend is aan sy kern laboratorium outomatisering kenmerke. Die dek-, portaal- en instrumentmonterings van Opentrons Flex maak die gebruik van presisie-vloeistof- en laboratoriumware-hanteringskomponente moontlik. Die raakskerm op die toestel maak dit moontlik om protokolle te laat loop en die robot se status na te gaan sonder om jou rekenaar na die laboratoriumbank te bring. Bedrade en draadlose konneksie maak bykomende beheer vanaf die Opentrons-toepassing moontlik (sien die Sagteware en Bedryf-hoofstuk vir meer besonderhede) en die uitbreiding van die stelsel se kenmerke deur randapparatuur aan te heg (sien die Modules-hoofstuk).
3.1 Fisiese komponente
Kamera
Status lig
Raakskerm
Raam
Portaaldek
Voordeur
Liggings van die fisiese komponente van Opentrons Flex.
Syvensters se handvatsels
OPENTRONS FLEX
45
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Raam en omhulsel
Die raam van die Opentrons Flex-robot bied rigiditeit en strukturele ondersteuning vir sy dek en portaal. Al die meganiese substelsels is op en gemonteer aan die hoofraam. Die raam is hoofsaaklik van plaatmetaal en aluminium-ekstrusies gemaak.
Die metaalraam het openinge vir syvensters en ’n voordeur van deursigtige polikarbonaat wat jou laat sien wat binne Flex aangaan. Die voordeur skarnier oop vir toegang tot die binnekant van die stelsel. Met die voordeur oop, kan jy instrumente, modules en dektoebehore aanheg; voorberei die dek voor 'n protokol; of manipuleer die toestand van die dek tydens 'n protokol.
Wit LED-stroke aan die binnekant van die boonste rande van die raam verskaf sagteware-beheerbare omgewingsbeligting. 'n 2-megapixel-kamera kan die dek en werkarea fotografeer vir opname en naspoor van protokoluitvoering.
Dek en werksarea
Die dek is die gemasjineerde aluminiumoppervlak waarop geoutomatiseerde wetenskapprotokolle uitgevoer word. Die dek het 12 hoof ANSI/SLAS-formaat gleuwe wat herkonfigureer kan word om laboratoriumware, modules en verbruiksgoedere te hou. Die dekgleuwe word geïdentifiseer deur 'n koördinaatstelsel, met gleuf A1 links agter en gleuf D3 regs voor.
Uitbreidingsgleuf (vir Thermocycler) Werksarea
Staging gebied
Gebiede van die dek binne Flex.
46
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Die werkarea is die fisiese ruimte bo die dek wat toeganklik is vir pipettering. Labware wat in gleuwe A1 tot D3 geplaas is, is in die werkarea.
Opentrons Flex kom met verwyderbare dekgleuwe vir al 12 posisies in die werkarea. Elke dekgleuf het hoek-laboratoriumware-klemme om laboratoriumware veilig op die dek te plaas.
Jy kan die dek herkonfigureer deur gleuwe te vervang met ander dek-toebehore, insluitend die verskuifbare asblik, vullisgeut en modulehouers. Die uitbreidinggleuf agter A1 word slegs gebruik om bykomende plek te maak vir die Thermocycler-module, wat gleuwe A1 en B1 beset.
Let wel: Dekgleuwe is uitruilbaar binne 'n kolom (1, 2 of 3), maar nie oor kolomme nie; kolom 1 en kolom 3 gleuwe is verskillende stukke ten spyte van hul soortgelyke grootte. Jy kan sien in watter kolom 'n gleuf gaan deur die blou laboratoriumware-knip na links agter te oriënteer.
Jy moet dekgleuwe geïnstalleer laat op plekke waar jy selfstandige laboratoriumware wil plaas. Die dek en items wat daarop geplaas word, bly staties, tensy dit deur die gryper of handmatige ingryping beweeg word.
Staging gebied
Die stagDie area is bykomende spasie langs die regterkant van die dek. U kan laboratoriumware op hierdie plek stoor nadat u staging area slots. Labware geplaas in gleuwe A4 tot D4 is in die staging gebied. Buigpipette kan nie in die s bereik nietaging area, maar die grijper kan laboratoriumware na en van hierdie plek optel en skuif. Die byvoeging van ekstra gleuwe help om die werkarea beskikbaar te hou vir die toerusting wat in jou outomatiese protokolle gebruik word.
Staging area slots is ingesluit in sekere werkstasie konfigurasies en is ook beskikbaar vir aankoop by https://shop.opentrons.com.
OPENTRONS FLEX
47
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Staging Area met gleuwe geïnstalleer
Dek toebehore
Toebehore is hardeware items wat standaard dekgleuwe vervang. Hulle laat jou die dekuitleg aanpas en funksionaliteit by jou Flex voeg. Tans sluit dektoebehore die s intaggleuwe in die area, die interne asblik en die eksterne vullisgeut. Jy kan net toebehore in 'n paar spesifieke dekgleuwe installeer. Die volgende tabel lys die dekliggings vir elke wedstryd.
Toestel Staging area slots Asblik Afval geut Afval geut met staging area slot
Slots A3D3 A1D1 en A3-D3 Slegs D3 D3
Toebehore is sonder krag. Hulle bevat nie elektroniese of meganiese komponente wat hul huidige toestand en dekligging aan die robot kommunikeer nie. Dit beteken dat jy die dekkonfigurasiefunksie moet gebruik om die Flex te laat weet watter toebehore aan die dek geheg is en waar dit geleë is.
48
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Jy kan toegang tot die dekkonfigurasie-instellings kry vanaf die raakskerm via die drie-kol ()-kieslys en vanaf die Opentrons-toepassing. Sien die Dekkonfigurasie-afdeling van die Sagteware en Bediening-hoofstuk vir inligting oor hoe om die dek vanaf die raakskerm op te stel.
Afvalstort
Die Opentrons Flex Waste Chute dra vloeistowwe, punte, puntrakke en putplate oor vanaf die Flex-omhulsel na 'n asblikhouer wat onder sy buite-opening geplaas is. Die vullisgeut heg aan 'n dekplaatadapter wat in gleuf D3 pas. Dit kom ook met 'n spesiale vensterhalfpaneel wat die geut uit die voorkant van die robot laat uitsteek.
Komponente van die vullisgeut.
Dekdekplaatadapter
Afvalstort
Dekplaatadapter met Staging gebied
Staging area slots
Staging area slots is ANSI/SLAS-versoenbare dekstukke wat standaardgleuwe in kolom 3 vervang en nuwe gleuwe by die s voegtaging area — alles sonder om spasie in die werksarea te verloor. Jy kan 'n enkele gleuf of 'n maksimum van vier gleuwe installeer om 'n nuwe kolom (A4 tot D4) langs die regterkant van die dek te skep. Let egter daarop dat die vervanging van dekgleuf A3 vereis dat die asblik geskuif word. Deur by te voeg stagMet areagleuwe aan die dek kan jou Flex-robot meer laboratoriumware stoor en doeltreffender werk.
OPENTRONS FLEX
Buig staging area slot.
49
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
SLOT INSTALLASIE
Om te installeer, verwyder die skroewe wat 'n standaardgleuf aan die dek heg en vervang dit met die staging area slot. Na installasie, gebruik die raakskerm of Opentrons-toepassing om die robot te vertel as wat jy bygevoeg hettaging area gleuf na die dek.
Installeer astaging area slot.
SLOT VERENIGBAARHEID Staging area slots is versoenbaar met die Flex instrumente, modules en laboratoriumware hieronder gelys.
Flex komponent Gripper Pipette Modules
Labware
Staging area verenigbaarheid
Die Flex Gripper kan laboratoriumware na of van staging area slots.
Buigpipette kan nie die s bereik nietaging gebied. Gebruik die gryper om puntrakke en laboratoriumware van die s af te skuiftaging area na die werk area voor pipettering.
Die Magnetiese Blok GEN1 kan in kolom 3 bo-op as geplaas wordtaging area slot. Modules word nie in kolom 4 ondersteun nie.
Aangedrewe modules soos die Heater-Shaker en Temperatuur Module pas in caddies wat in kolom 3 geplaas kan word. Jy kan nie as byvoeg astaging area slot na 'n posisie wat deur 'n module caddy beset word.
Staging area slots het dieselfde ANSI/SLAS dimensies as standaard dek slots. Gebruik grijper-versoenbare laboratoriumware in die staging area, of voeg handmatig laboratoriumware van hierdie ligging by en verwyder dit.
50
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Bewegingstelsel
Aan die raam is die portaal vasgemaak, wat die robot se beweging- en posisioneringstelsel is. Die portaal beweeg afsonderlik langs die x- en y-as om die pipette en grijper op presiese plekke vir protokoluitvoering te plaas. Beweging langs hierdie asse is presies tot die naaste 0.1 mm. Die portaal word beheer deur 36 VDC hibriede bipolêre stapmotors. Op hul beurt is die pipetmonterings en die verlengstuk aan die portaal vasgemaak. Hierdie beweeg langs die z-as om die pipette en grijper op presiese plekke te plaas vir protokoluitvoering. Beweging langs hierdie as word beheer deur 36 VDC hibriede bipolêre stapmotors. Die elektronika vervat in die portaal verskaf 36 VDC krag en kommunikasie aan die pipette en gryper, wanneer dit aangeheg is.
Portaal
Pipet Mounts
Uitbreiding Mount
Plek van instrumentmonterings op Flex.
Raakskerm en LED-skerms
Die primêre gebruikerskoppelvlak is die 7-duim LCD-raakskerm, regs voor op die robot. Die raakskerm is bedek met Gorilla Glass 3 vir krap- en skadeweerstand. Kry toegang tot baie kenmerke van Flex direk op die raakskerm, insluitend:
OPENTRONS FLEX
51
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Protokolbestuur Protokolopstelling, uitvoering en monitering Labware-bestuur Robotinstellings Stelselsagteware en firmware-opdaterings Operasielogboeke en foutkennisgewings
Vir meer inligting oor die gebruik van Flex via die raakskerm, sien die Raakskerm Bediening afdeling van die Sagteware en Bediening hoofstuk.
Die statuslig is 'n strook LED's langs die boonste voorkant van die robot wat in 'n oogopslag inligting oor die robot verskaf. Verskillende kleure en patrone van beligting kan verskeie sukses, mislukking of ledige toestande kommunikeer:
LED kleur Wit Neutrale toestande
Groen Normaal state
Blou Verpligte state Geel Abnormale state Rooi Noodtoestande
LED-patroon Solid Pulsing
Knipper twee keer
Vaste pulserende pulserende
Robot status
Aangeskakel en nie 'n protokol loop nie Robot is besig (bv. opdatering van sagteware of firmware, stel protokolloop op, kanselleer protokolloop) Aksie is voltooi (bv. protokol gestoor, sagteware opgedateer, instrument aangeheg of losgemaak) Protokol loop Protokol is voltooi Protokol word onderbreek
Solied
Sagteware fout
Knipper drie keer, herhaaldelik
Fisiese fout (bv. instrumentongeluk)
Die statuslig kan ook in die robotinstellings gedeaktiveer word.
52
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
3.2 Pipette
Opentrons pipette is konfigureerbare toestelle wat gebruik word om vloeistowwe deur die werksarea te beweeg tydens die uitvoering van protokolle. Daar is verskeie Opentrons Flex-pipette wat volumes van 1 µL tot 1000 µL in 1, 8 of 96 kanale kan hanteer:
Opentrons Flex 1-kanaal pipet (1 µL) Opentrons Flex 50-kanaal pipet (1 µL) Opentrons Flex 5-kanaal pipet (1000 µL) Opentrons Flex 8-kanaal pipet (1 50 µL) Opentrons 8 kanaal pipet 5-kanaal (1000 kanaal pipet)
Pipette word aan die portaal vasgemaak met behulp van vasskroewe aan die voorkant van die pipet. 1-kanaal en 8-kanaal pipette beslaan elk een pipetmontering (links of regs); die 96-kanaal pipet beslaan beide mounts. Vir besonderhede oor die installering van pipette, sien Instrument Installasie en Kalibrasie.
Gevange Aanhangsel
Skroewe
Gevange aanhegselskroewe
ejector
Spuitkoppe (Vervangbare O-ringe)
Spuitkoppe (Vaste O-ringe)
Plek van komponente van die 1-, 8- en 96-kanaal pipette.
ejector
OPENTRONS FLEX
53
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Die pipette tel weggooibare plastiekpunte op deur dit op die pipetspuitpunte te druk, en gebruik dan die punte om vloeistowwe te aspireer en af te gee. Die hoeveelheid totale krag wat benodig word vir bakkie neem toe namate meer punte gelyktydig opgetel word. Vir kleiner getalle punte, heg die pipet punte aan deur elke pipetspuitstuk af in 'n punt te druk. Om die nodige krag te verkry om 'n volle rek punte op te tel, trek die 96-kanaal pipet ook die punte opwaarts na die spuitpunte. Hierdie trekaksie vereis dat puntrakke in 'n puntrakadapter geplaas word, eerder as direk in 'n dekgleuf. Om punte weg te gooi (of terug te keer na hul rek), druk die pipetuitwerpmeganisme die punte van die spuitpunte af.
Pipet spesifikasies
Opentrons Flex-pipette is ontwerp om 'n wye reeks volumes te hanteer. As gevolg van hul wye algehele reeks, kan hulle verskeie groottes punte gebruik, wat hul vloeistofhanteringseienskappe beïnvloed. Opentrons het Flex-pipette getoets vir akkuraatheid en akkuraatheid in 'n aantal punt- en vloeistofvolume-kombinasies:
Pipet
Buig 1-kanaal
50 µL
Buig 1-kanaal
1000 µL
Buig 8-kanaal
50 µL
Buig 8-kanaal
1000 µL
Wenkkapasiteit 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 50 µL 200 µL
Getoetste volume 1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL
200 µL 1000 µL
1 µL 10 µL 50 µL 5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
Akkuraatheid %D 8.00% 1.50% 1.25% 5.00% 0.50% 0.50% 0.50% 10.00% 2.50% 1.25% 8.00% 2.50% 1.00% 0.70%
Presisie %CV 7.00% 0.50% 0.40% 2.50% 0.30% 0.15% 0.15% 8.00% 1.00% 0.60% 4.00% 0.60% 0.25% 0.15%
54
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Buig 96-kanaal
1000 µL
50 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
5 µL 50 µL 200 µL 1000 µL
10.00% 2.50% 1.50% 1.50%
5.00% 1.25% 1.25% 1.50%
Hou hierdie akkuraatheidsinligting in gedagte wanneer jy wenke vir jou pipet kies. Oor die algemeen, vir die beste resultate moet jy die kleinste wenke gebruik wat aan die behoeftes van jou protokol voldoen.
Let wel: Opentrons voer volumetriese toetsing van Flex-pipette uit om te verseker dat hulle voldoen aan die akkuraatheid en presisie spesifikasies hierbo gelys. Jy hoef nie die volume wat jou pipette uitdeel voor gebruik te kalibreer nie. Jy hoef net posisionele kalibrasie uit te voer. Sien die volgende afdeling, sowel as die Pipetinstallasie-afdeling van die Installasie en Hervestiging hoofstuk, vir besonderhede.
Die Opentrons Care- en Opentrons Care Plus-dienste sluit jaarlikse pipetvervanging en kalibrasiesertifikate in. Sien die Service Flex-afdeling van die Onderhoud en Diens-hoofstuk vir besonderhede.
Pipetkalibrasie
Die gebruikersstel bevat 'n metaalpipetkalibrasiesonde wat jy tydens posisionele kalibrasie gebruik. Tydens protokollopies, berg die sonde veilig op die magnetiese houer op die voorste pilaar van die robot. Heg die sonde tydens die kalibrasieproses aan die toepaslike spuitkop vas en sluit dit in plek. Die robot beweeg die sonde na kalibrasiepunte op die dek om die pipet se presiese posisie te meet.
Pipetpuntrakadapter
Die Opentrons Flex 96-kanaal pipet word met vier punt rek adapters gestuur. Dit is presisie gevormde aluminium hakies wat jy op die dek plaas. Die adapters hou Flex 50 L, 200 L en 1000 µL puntrakke.
OPENTRONS FLEX
55
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
As gevolg van die krag wat betrokke is, benodig die 96-kanaal pipet 'n adapter om 'n volpuntrak behoorlik vas te maak. Tydens die aanhegtingsprosedure beweeg die pipet oor die adapter, laat sak homself op die monteerpenne en trek punte op die pipette deur die adapter en puntrak op te lig. Om die punte te trek, eerder as om te druk, bied die hefboom wat nodig is om punte aan die pipette vas te maak en voorkom dat die dekoppervlak skeefgetrek word. Wanneer dit klaar is, laat die 96-kanaal pipet die adapter en leë puntrak op die dek sak. Sien die afdeling Wenke en puntrakke van die Labware-hoofstuk vir meer inligting.
Gedeeltelike fooibakkie
Die 96-kanaal pipet kan 'n volle rek punte of 'n kleiner aantal punte optel. Dit verhoog die aantal toepassings wat jy met die 96-kanaal pipet kan uitvoer, aangesien dit albei pipetbevestigings beslaan.
Tans ondersteun die 96-kanaal pipet gedeeltelike puntoptel vir 8 punte in 'n kolomuitleg. In hierdie konfigurasie gebruik die pipet óf sy spuitpunte aan die linkerkant om punte regs na links van 'n puntrak op te tel, óf sy spuitpunte heel regs om punte van links na regs van 'n puntrak op te tel.
Wanneer minder as 96 punte van 'n puntrak optel, moet die rak direk op die dek geplaas word, nie in die puntrakadapter nie.
Pipet sensors
Opentrons Flex-pipette het 'n aantal sensors wat data oor die status van die pipet en enige punte wat dit opgetel het, opspoor en aanteken.
KAPASITANSIE SENSORS
In kombinasie met 'n metaalsonde of geleidende punt, bespeur die kapasitansiesensors wanneer die pipet kontak maak met iets. Opsporing van kontak tussen die metaalsonde en die dek word gebruik in die outomatiese pipetkalibrasie- en modulekalibrasieprosesse.
1-kanaal pipette het een kapasitansie sensor, terwyl multi-kanaal pipette twee het: op kanale 1 en 8 van 8-kanaal pipette, en op kanale 1 en 96 (posisies A1 en H12) van die 96-kanaal pipet.
56
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
OPTIESE WENK TEENWOORDIGHEIDSENSORS
'n Foto-onderbrekerskakelaar bespeur die posisie van die pipet se puntuitwerpmeganisme, wat bevestig of punte suksesvol opgetel of laat val is. 1-kanaal, 8-kanaal, en 96-kanaal pipette het almal 'n enkele optiese sensor wat punt aanhegting oor alle kanale monitor.
Pipet-firmware-opdaterings
Opentrons Flex dateer pipet-firmware outomaties op om dit gesinchroniseer te hou met die robotsagtewareweergawe. Pipet-firmware-opdaterings is tipies vinnig en vind plaas wanneer:
Jy heg 'n pipet aan. Die robot herbegin.
As jou pipet-firmware en robotsagteware-weergawes om enige rede nie gesinchroniseer word nie, kan jy die firmware handmatig in die Opentrons-toepassing opdateer.
1. Klik Toestelle. 2. Klik op jou Flex in die toestellys. 3. Onder Instrumente en Modules sal die uit-gesinkroniseerde pipet 'n waarskuwingsbanierlesing wys
"Fermware-opdatering beskikbaar." Klik Werk nou op om die opdatering te begin.
Jy kan view die tans geïnstalleerde firmware weergawe van enige aangehegte pipet. Op die raakskerm, gaan na Instrumente en tik die pipetnaam. In die Opentrons-toepassing, vind die pipetkaart onder Instrumente en Modules, klik op die driekolkieslys (), en klik dan Oor pipet.
3.3 Gripper
Die grijper beweeg laboratoriumware deur die werkarea en staging area tydens die uitvoering van protokolle. Die gryper heg aan die verlengstuk, wat apart van die pipetmonterings is; die gryper kan met enige pipetkonfigurasie gebruik word. Vir besonderhede oor die installering van die gryper, sien Instrument Installasie en Kalibrasie.
Die grijper kan laboratoriumware oor die dek en op of af van modules beweeg. Die grijper kan sekere putplate, diepputplate en puntrakke manipuleer. Vir meer besonderhede oor watter laboratoriumware die grijper kan beweeg, sien die Labware en die Opentrons Flex Gripper afdeling van die Labware hoofstuk, of raadpleeg die Opentrons Labware Library.
OPENTRONS FLEX
57
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Gripper spesifikasies
Die kake voer die primêre beweging van die gryper uit, wat is om twee parallelle spane oop of toe te maak om krag aan die kante van laboratoriumware toe te pas of vry te laat. Beweging van die kake word beheer deur 'n 36 VDC geborselde motor wat aan 'n tandstang-en-ratkas-ratstelsel gekoppel is.
Om 'n stuk laboratoriumware wat deur die kake vasgegryp is, te skuif, lig die portaal die grijper langs die z-as, skuif dit lateraal en laat dit dan in die laboratoriumware se nuwe posisie sak.
Plek van komponente van die gryper.
Aanhegsel skroewe
Kalibrasiepen Jaws Paddles
Gripper kalibrasie
Die gryper bevat 'n metaalkalibrasiepen. Die kalibrasiepen is in 'n ingeboude stoorarea op die onderste deel van die gryper geleë. ’n Magneet hou die pen in plek. Om die kalibrasiepen te verwyder, gryp dit met jou vingers en trek liggies. Om die pen te vervang, sit dit terug in die stoorgleuf. Jy sal weet dit is veilig wanneer dit in plek klap.
Wanneer jy die gryper kalibreer, heg die pen om die beurt aan elke kakebeen. Die robot beweeg die pen na kalibrasiepunte op die dek om die gryper se presiese posisie te meet.
Tydens protokollopies, plaas die pen in sy stoorarea vir veilige bewaring. Kontak ons by support@opentrons.com as jy die kalibrasiepen verloor.
Gripper-firmware-opdaterings
Opentrons Flex dateer outomaties die grijper-firmware op om dit gesinchroniseer te hou met die robotsagtewareweergawe. Gripper-firmware-opdaterings is tipies vinnig en vind plaas wanneer:
58
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Jy heg die gryper aan. Die robot herbegin.
As, om enige rede, jou gryp-firmware en robotsagteware-weergawes nie gesinchroniseer word nie, kan jy die firmware handmatig in die Opentrons-toepassing opdateer.
1. Klik Toestelle. 2. Klik op jou Flex in die toestellys. 3. Onder Instrumente en Modules sal die gryper wat nie gesinkroniseer is nie, 'n waarskuwingsbanierlesing wys
"Fermware-opdatering beskikbaar." Klik Werk nou op om die opdatering te begin.
Jy kan view die tans geïnstalleerde firmware-weergawe van die gripper. Gaan op die raakskerm na Instrumente en tik op die gryper. In die Opentrons-toepassing, vind die grypkaart onder Instrumente en Modules, klik die driekolkieslys (), en klik dan Oor gryper.
3.4 Noodstophanger
Die noodstophanger (E-stop) is 'n toegewyde hardeware-knoppie om robotbeweging vinnig te stop. Opentrons Flex vereis dat 'n funksionele, ontkoppelde E-stop te alle tye aangeheg moet word. Wanneer jy die stopknoppie druk, kanselleer Flex enige lopende protokol of opstelwerkvloei so vinnig as moontlik en verhoed die meeste robotbeweging.
Wanneer om die E-stop te gebruik
Jy sal dalk die E-stop moet druk:
Wanneer daar 'n dreigende risiko van besering of skade aan 'n gebruiker is. Wanneer daar 'n dreigende risiko van skade aan die robot of ander hardeware is. Wanneer samplese of reagense is in die dreigende gevaar van kontaminasie. Na 'n hardeware botsing.
Ideaal gesproke moet jy nooit die E-stop hoef te druk nie (behalwe tydens ongereelde hardeware kwaliteit toetsing).
Moenie die E-stop gebruik om normale, verwagte bedrywighede te kanselleer nie. Gebruik eerder die sagtewareknoppie op die raakskerm of in die Opentrons-toepassing. Deur te onderbreek via sagteware sal jy jou protokol kan hervat of kanselleer, terwyl die druk van die E-stop altyd die protokol onmiddellik kanselleer.
OPENTRONS FLEX
59
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Betrek en vrystelling van die E-stop
Die E-stop het 'n druk-om-in te skakel, draai-om-los-meganisme.
Betrek: Druk die rooi knoppie stewig af. Flex sal die gestopte toestand betree. Los op: Sodra dit gestop is, spreek enige probleme in die werkarea veilig aan, soos die skoonmaak van stortings,
die verwydering van laboratoriumware, of die beweging van die portaal (dit moet vrylik en maklik met die hand beweeg). Loslaat: Draai die knoppie kloksgewys. Dit sal opduik na sy ontkoppelde posisie. Herstel: Op die raakskerm of in die Opentrons-toepassing, bevestig dat jy gereed is vir Flex om te hervat
beweging. Die portaal sal na sy tuisposisie terugkeer en module-aktiwiteit sal hervat word.
In die gestopte toestand sal Flex en gekoppelde hardeware soos volg optree:
Hardeware Gantry Pipette
Gripper
Verwarmer-skudmodule
Temperatuurmodule-termofietsryer-modulestatuslig Raakskerm
Gedrag
Outomatiese horisontale beweging word gestop. Handmatige horisontale beweging word toegelaat.
Vertikale beweging van pipette word gestop. Die motorremme op vertikale asse word aangeskakel om te voorkom
pipette om te val. Suikerbeweging en puntbakkie word gestop.
Vertikale beweging van die gryper word gestop. Die motorrem op die vertikale as is aangeskakel om die
gryper van val. Die kakebeenmotors wat grypkrag uitoefen, bly dus geaktiveer
die grijper sal nie laboratoriumware laat val wat dit dalk dra nie.
Die shaker stop en huis toe. Die laboratoriumware-grendel maak oop. Verhitting is gedeaktiveer.
Verhitting of verkoeling is gedeaktiveer.
Verhitting of verkoeling is gedeaktiveer.
Die lig word rooi.
'n Kansellasieboodskap neem die skerm oor. 'n Aanwyser op die skerm wys wanneer jy suksesvol is
het die stopknoppie ontkoppel.
60
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
3.5 Verbindings
Aan/af skakelaar
Sybedekkings
USB-A-poorte
IEC-kraginlaat
Poorte AUX-1, AUX-2, USB-B, Ethernet
Kragverbinding
Opentrons Flex koppel aan 'n kragbron via 'n standaard IEC-C14-inlaat. Die robot bevat 'n interne volreeks AC/DC-kragbron wat 100 VAC, 240/50 Hz-insette aanvaar en dit omskakel na 60 VDC. Alle ander interne elektronika word deur die 36 VDC-toevoer aangedryf.
Waarskuwing: Gebruik slegs die kragkabel wat by die robot voorsien is. Moenie 'n kragkoord met onvoldoende stroom of voltage graderings.
Hou die kragkabel vry van obstruksies sodat jy dit kan verwyder indien nodig.
Daar is ook 'n CR1220 muntselbattery om die robot se intydse horlosie aan te dryf wanneer dit nie aan hoofkrag gekoppel is nie. Die battery is binne die raakskerm-omhulsel geleë. Kontak Opentrons Ondersteuning vir meer inligting as jy dink jy moet die battery vervang.
OPENTRONS FLEX
61
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
USB- en hulpverbindings
Opentrons Flex het 10 totale USB-poorte wat in verskillende areas van die robot geleë is, wat verskillende doeleindes dien.
Die 8 agterste USB-A-poorte (genom USB-1 tot USB-8) en 2 hulppoorte (M12-verbindings genommer AUX-1 en AUX-2) is vir die koppeling van Opentrons-modules en -bykomstighede. Sien die Modules-hoofstuk vir meer inligting oor die koppeling van hierdie toestelle en die gebruik daarvan in jou protokolle. Die agterste USB-B-poort is om die robot aan 'n skootrekenaar of tafelrekenaar te koppel, om kommunikasie te bewerkstellig met die Opentrons-toepassing wat op die gekoppelde rekenaar loop. Die voorste USB-A-poort (USB-9), geleë onder die raakskermskerm, het dieselfde funksionaliteit as die agterste USB-A-poorte.
Let wel: Die USB-poorte is kragbeperk om die robot en gekoppelde toestelle te beskerm. Kraglewering word intern in drie poortgroepe verdeel: die linker-agterste USB-A-poorte (USB-1 tot USB-4), die regter agterste USB-A-poorte (USB-5 deur USB-8), en die voorste USB-A hawe. Elkeen van hierdie groepe sal 'n maksimum van 500 mA aan gekoppelde USB 2.0-versoenbare toestelle lewer.
Netwerkverbindings
Opentrons Flex kan aan 'n plaaslike area netwerk koppel deur 'n bedrade (Ethernet) of draadlose (Wi-Fi) verbinding.
Die Ethernet-poort is aan die agterkant van die robot geleë. Koppel dit aan 'n Ethernet-hub of skakel jou netwerk aan. Of, begin in robotstelsel weergawe 7.1.0, koppel dit direk aan 'n Ethernet-poort op jou rekenaar. Die interne Wi-Fi-module ondersteun 802.11 ac/a/b/g/n-netwerke met 'n dubbelband 2.4/5 GHz-antenna.
62
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
3.6 Stelsel spesifikasies
Algemene spesifikasies
Afmetings Gewig Dek slots
Raakskerm
Wi-Fi Ethernet USB
Kamera Robot kragtoevoer
Hoofaanvoer voltage fluktuasie Hooftoevoer frekwensie fluktuasie Verspreiding stelsel Kortsluit toevoer stroom Raam samestelling Venster samestelling Ventilasie vereistes
87 × 69 × 84 cm / 34.25 × 27 × 33 duim (B, D, H)
88.5 kg / 195 lb 12 ANSI/SLAS-versoenbare gleuwe in werkarea
(toeganklik vir pipette) 4 bykomende gleuwe vir stagwenke en laboratoriumware
(slegs toeganklik vir gryper) 7-duim LCD-raakskerm met kras- en skadebestande Gorilla Glass 3
802.11 ac/a/b/g/n dubbelband (2.4/5 GHz)
100 Mbps 9 USB-A-poorte 1 USB-B-poort USB 2.0-spoed
2MP, foto en video 100 VAC, 240 Hz, 50 60 A/1 VAC, 4.0 A/115 VAC
±10%
±5%
TN-S
6.3 A
Rigiede staal en CNC aluminium ontwerp
Verwyderbare polikarbonaatsyvensters en voordeur Ten minste 20 cm / 8 tussen die eenheid en 'n muur
OPENTRONS FLEX
63
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Vereistes vir gekoppelde rekenaars
Die Opentrons-toepassing werk op: Windows 10 of later macOS 10.10 of later Ubuntu 12.04 of later
Omgewingsspesifikasies
Omgewingstoestande Omgewingstemperatuur Relatiewe humiditeit Besoedelingsgraad
Slegs binnenshuise gebruik +20 tot +25 °C (aanbeveel) 40%, nie-kondenserend (aanbeveel) 60 (slegs nie-geleidende besoedeling)
Vir bykomende inligting oor aanvaarbare omgewingstoestande vir gebruik en vervoer, sien die afdeling Omgewingstoestande van die Installasie en Hervestiging hoofstuk.
Sertifiserings
Sertifisering voltooi Nie gesertifiseer/gevalideer nie
CE, ETL, FCC, ISO 9001 IVD, GMP
'n Opsomming van sertifiseringsinligting is op 'n plakker aan die agterkant van Flex, naby die aan/af-skakelaar, gedruk. Vir gedetailleerde sertifisering- en voldoeningsinligting, sien die Regulerende Nakoming-afdeling in die Inleiding.
Reeksnommer
Elke Flex het 'n unieke reeksnommer. Die formaat van die reeksnommer verskaf bykomende inligting, insluitend die robot se produksiedatum. Byvoorbeeldample, die reeksnommer FLXA1020231007001 sal aandui:
64
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 3: STELSELBESKRYWING
Karakters FLX A10 2023 10 07 001
Kategorie Model Weergawe Jaar Maand Dag Eenheid
Betekenis Die robot is 'n Opentrons Flex. 'n Kode vir die produksieweergawe van die robot. Die robot is gemaak in 2023. Die robot is in Oktober gemaak. Die robot is op die 7de dag van die maand gemaak. 'n Unieke nommer vir robotte wat op 'n sekere dag gemaak is.
Jy kan die reeksnommer vir jou Flex vind:
Op die sertifiseringsplakker op die agterkant van Flex, naby die aan/af-skakelaar. Aan die agterkant van die raakskerm (in die rigting van die werkarea). In die Opentrons-toepassing onder Toestelle > jou Flex > Robotinstellings > Gevorderd.
OPENTRONS FLEX
65
HOOFSTUK 4
Modules
Opentrons Flex integreer met 'n aantal Opentrons hardeware modules. Alle modules is randapparatuur wat dekgleuwe beset, en die meeste word deur die robot oor 'n USB-verbinding beheer.
Hierdie hoofstuk beskryf die funksies en fisiese spesifikasies van modules wat versoenbaar is met die Opentrons Flex-stelsel, asook hoe om dit aan te heg en te kalibreer. Vir verdere besonderhede oor module-opstelling en -gebruik, raadpleeg die handleidings vir die individuele modules. Vir besonderhede oor die integrasie van modules in jou protokolle, sien die Protocol Designer-afdeling van die Protocol Development-hoofstuk of die aanlyn Python Protocol API-dokumentasie.
4.1 Ondersteunde modules
Opentrons Flex is versoenbaar met vier tipes Opentrons-modules op die dek:
Die Heater-Shaker Module bied verhitting op die dek en orbitale skud. Die module kan verhit word tot 95 °C, en kan samples van 200 tot 3000 rpm.
Die Magnetiese Blok is 'n passiewe toestel wat laboratoriumware naby sy hoësterkte neodymiummagnete hou. Die OT-2 Magnetiese Module GEN1 en GEN2, wat aktief hul magnete op en af beweeg relatief tot laboratoriumware, word nie op Opentrons Flex ondersteun nie.
Die temperatuurmodule is 'n warm- en koueplaatmodule wat bestendige toestandtemperature tussen 4 en 95 °C kan handhaaf.
Die Thermocycler Module bied op die dek, ten volle outomatiese termosietrying, wat outomatisering van stroomop- en stroomaf-werkvloeistappe moontlik maak. Thermocycler GEN2 is ten volle versoenbaar met die gripper. Thermocycler GEN1 kan nie saam met die gryper gebruik word nie, en word dus nie op Opentrons Flex ondersteun nie.
Sommige modules wat oorspronklik vir die OT-2 ontwerp is, is versoenbaar met Flex, soos opgesom in die tabel hieronder. 'n Regmerkie dui versoenbaarheid aan, en 'n X dui onversoenbaarheid aan.
66
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
Toesteltipe en generasie Verwarmer-skudmodule GEN1 Magnetiese Module GEN1 Magnetiese Module GEN2 Magnetiese Blok GEN1 Temperatuurmodule GEN1 Temperatuurmodule GEN2 Termofietsmodule GEN1 Termofietsmodule GEN2 HEPA-module
OT-2
Buig
×
×
×
×
×
×
4.2 Module caddy stelsel
Versoenbare modules is ontwerp om in te pas in caddies wat ruimte onder die dek beslaan. Hierdie stelsel laat laboratoriumware bo-op modules toe om nader aan die dekoppervlak te bly, en dit maak ook voorsiening vir kabelroetering onder die dek sodat die dek netjies bly tydens jou protokollopies.
Caddies vir die Verwarmer-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules.
OPENTRONS FLEX
67
HOOFSTUK 4: MODULES
Om 'n module in die dekoppervlak te pas, moet dit eers in die ooreenstemmende modulehouer geplaas word. Elke tipe versoenbare module het sy eie caddy-ontwerp wat die module en laboratoriumware presies in lyn bring met die omliggende dek. (Die uitsondering is die Magnetiese Blok, wat nie krag- of USB-kabelroetering benodig nie en dus direk op die dekoppervlak sit.) Caddies vir modules wat 'n enkele gleuf beset, kan enige plek in kolom 1 of 3 geplaas word; die Thermocycler kan net gelyktydig in gleuwe A1 en B1 geplaas word.
In die algemeen, om 'n module caddy te installeer:
1. Verwyder enige dekgleuwe van die plek waar die module gaan. 2. Sit die module in sy houer en draai sy ankers vas. 3. Lei die modulekrag- en USB-kabels deur die sydeksels, op deur die leë dekgleuf, en
heg dit aan die module. 4. Plaas die modulehouer in die gleuf en skroef dit vas.
Vir presiese installasie-instruksies, raadpleeg die Quickstart Guide of Instruction Manual vir die spesifieke module. Kabelverbindings en metode van aanhegting aan die caddy verskil volgens module.
4.3 Module kalibrasie
Wanneer jy die eerste keer 'n module op Flex installeer, moet jy outomatiese posisionele kalibrasie uitvoer. Hierdie proses is soortgelyk aan posisionele kalibrasie vir instrumente, en verseker dat Flex na die presiese korrekte liggings beweeg vir optimale protokolprestasie. Tydens kalibrasie sal Flex na plekke op 'n module-kalibrasieadapter beweeg, wat soortgelyk lyk aan die kalibrasievierkante wat deel is van verwyderbare dekgleuwe.
Kalibrasie-adapters vir die Verwarmer-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules.
Module-kalibrasie word vereis vir alle modules wat via 'n caddy geïnstalleer word: die Heater-Shaker-, Temperatuur- en Thermocycler-modules. Die Magnetiese Blok benodig nie kalibrasie nie, en is gereed vir gebruik sodra jy dit op die dek plaas.
68
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
Wanneer om modules te kalibreer
Flex vra jou outomaties om kalibrasie uit te voer wanneer jy 'n module koppel en aanskakel wat nie enige gestoorde kalibrasiedata het nie. (Jy kan hierdie opdrag afwys, maar jy sal nie protokolle met die module kan laat loop voordat jy dit gekalibreer het nie.)
Sodra jy kalibrasie voltooi het, stoor Flex die kalibrasiedata en modulereeksnommer vir toekomstige gebruik. Flex sal jou nie vra om te herkalibreer nie, tensy jy die kalibrasiedata vir daardie module in die robotinstellings uitvee. Jy kan jou module vrylik aan- en afskakel, of dit selfs na 'n ander dekgleuf skuif, sonder om te herkalibreer. As jy wil herkalibreer, kan jy die proses enige tyd vanaf die modulekaart in die Opentrons-toepassing begin. (Herkalibrasie is nie vanaf die raakskerm beskikbaar nie.)
Hoe om modules te kalibreer
Instruksies op die raakskerm of in die Opentrons-toepassing sal jou deur die kalibrasieprosedure lei. Oor die algemeen is die stappe:
1. Versamel die vereiste toerusting, insluitend die module-kalibrasie-adapter en pipetkalibrasie-sonde. 2. Plaas die kalibrasie-adapter op die module-oppervlak en maak seker dat dit heeltemal gelyk is.
Sommige modules mag vereis dat jy die adapter aan die module vasmaak. 3. Heg die kalibrasiesonde aan 'n pipet. 4. Flex sal outomaties beweeg om sekere punte op die kalibrasieadapter aan te raak en dit te stoor
kalibrasiewaardes vir toekomstige gebruik.
Sodra kalibrasie voltooi is en jy die adapter en sonde verwyder het, sal die module gereed wees vir gebruik in protokolle.
Jy kan enige tyd view en bestuur jou module-kalibrasiedata in die Opentrons-toepassing. Gaan na Robotinstellings vir jou Flex en klik op die Kalibrasie-oortjie.
OPENTRONS FLEX
69
HOOFSTUK 4: MODULES
4.4 Verwarmer-skudmodule GEN1
Heater-Shaker kenmerke
VERWARMING EN SKUD
Die Heater-Shaker sorg vir verhitting op die dek en orbitale skud. Die module kan tot 95 °C verhit word, met die volgende temperatuurprofile:
Temperatuurreeks: 37 °C Temperatuur akkuraatheid: ±95 °C by 0.5 °C Temperatuur eenvormigheid: ±55 °C by 0.5 °CRamp tempo: 10 °C/min
Die module kan skud samples van 200 tot 3000 rpm, met die volgende skud profile:
Orbitale deursnee: 2.0 mm Orbitale rigting: Kloksgewys Spoedreeks: 200 rpm Spoed akkuraatheid: ±3000 rpm
Die module het 'n aangedrewe laboratoriumware-grendel om plate aan die module vas te maak voordat dit geskud word.
70
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
TERMIESE ADAPTERS 'n Versoenbare termiese adapter word benodig om laboratoriumware by die Heater-Shaker te voeg. Adapters kan direk by Opentrons by https://shop.opentrons.com gekoop word. Tans beskikbare termiese adapters sluit in:
Universele plat adapter
PCR Adapter
Diepputadapter
96 Plat bodem Adapter
SAGTEWAREBEHEER
Die Heater-Shaker is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en die Python Protocol API. Die Python API laat ook toe dat ander protokolstappe parallel uitgevoer kan word terwyl die Heater-Shaker aktief is. Sien nie-blokkerende opdragte in die API-dokumentasie vir besonderhede oor die byvoeging van parallelle stappe by jou protokolle.
Buite protokolle kan die Opentrons-toepassing die huidige status van die Heater-Shaker vertoon en kan die verwarmer, shaker en laboratoriumware-grendel direk beheer.
OPENTRONS FLEX
71
HOOFSTUK 4: MODULES
Heater-Shaker spesifikasies
Afmetings Gewig Module-kraginvoer Kragadapter-invoer Hooftoevoer voltage fluktuasie Overvoltage Kragverbruik
152 × 90 × 82 mm (L/B/H) 1.34 kg 36 VDC, 6.1 A 100 VAC, 240/50 Hz ±60% Kategorie II Idle: 10 W
Tipies: Skud: 4 W Verhitting: 11 W Verhitting en skud: 10 W
Omgewingstoestande Omgewingstemperatuur Relatiewe humiditeit Hoogte Besoedelingsgraad
Maksimum: 125 W Slegs binnenshuise gebruik 130 °C Tot 20%, nie-kondenserend Tot 25 80 m bo seespieël 2,000
72
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
4.5 Magnetiese blok GEN1
Magnetiese blok kenmerke
Die Opentrons Magnetiese Blok GEN1 is 'n magnetiese 96-put plaathouer. Magnetiese blokke word gebruik in protokolle wat op magnetisme staatmaak om deeltjies uit suspensie te trek en dit in putplate te hou tydens was-, spoel- of ander elueringsprosedures. Byvoorbeeldample, outomatiese NGS voorbereiding; die suiwering van genomiese en mitochondriale DNA, RNA of proteïene; en ander onttrekkingsprosedures is almal gebruiksgevalle wat magnetiese blokke kan behels.
MAGNETIESE KOMPONENTE
Die Magnetiese Blok is sonder krag, bevat geen elektroniese komponente nie, en beweeg nie magnetiese krale op of af in oplossing nie. Die putte bestaan uit 96 hoësterkte neodymiumringmagnete wat aan 'n veerbelaaide bed vasgemaak is, wat help om toleransies tussen die blok en pipette te handhaaf terwyl geoutomatiseerde protokolle uitgevoer word.
SAGTEWAREBEHEER
Die Magnetiese Blok GEN1 is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en die Python Protocol API.
OPENTRONS FLEX
73
HOOFSTUK 4: MODULES
Buiten protokolle is die raakskerm en die Opentrons-toepassing egter nie bewus van en kan nie die huidige status van die Magnetiese Blok GEN1 vertoon nie. Dit is 'n onaangedrewe module. Dit bevat nie elektroniese of meganiese komponente wat met die Flex-robot kan kommunikeer nie. Jy "beheer" die Magnetiese Blok via protokolle wat die Opentrons Flex Gripper gebruik om laboratoriumware van hierdie module by te voeg en te verwyder.
Magnetiese blok spesifikasies
Afmetings Gewig Module-krag Magneetgraad Omgewingstoestande Omgewingstemperatuur Relatiewe humiditeit Hoogte Besoedelingsgraad
136 × 94 × 45 mm (L/W/H) 1.13 kg Geen, module is nie aangedryf N52 neodymium Slegs binnenshuise gebruik 20 °C 25%, nie-kondenserend Tot 30 m bo seespieël 80
74
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
4.6 Temperatuurmodule GEN2
Temperatuur Module kenmerke
VERWARMING EN VERKOELING
Die Opentrons Temperatuur Module GEN2 is 'n warm en koue plaat module. Dit word dikwels gebruik in protokolle wat verhitting, verkoeling of temperatuurveranderinge vereis. Die module kan temperature wat wissel van 4 °C tot 95 °C binne minute bereik en handhaaf, afhangende van die module se opset en inhoud.
TERMIESE BLOKKE
Om laboratoriumware by temperatuur te hou, gebruik die module aluminium termiese blokke. Die module kom met 24-put en 96-put termiese blokke. Die Temperatuur Module caddy kom met 'n diep put blok en 'n plat bodem blok ontwerp vir gebruik met die Flex Gripper. Die blokke hou 1.5 ml en 2.0 ml buise, 96-put PCR plate, PCR stroke, diep put plate en plat bodem plate.
OPENTRONS FLEX
75
HOOFSTUK 4: MODULES
Let wel: Die module word ook met 'n plat onderste blok vir die OT-2 gestuur. Moenie die OT-2-blok met Flex gebruik nie. Die plat onderste blok vir Flex het die woorde "Opentrons Flex" op sy boonste oppervlak. Die een vir OT-2 nie.
24-put termiese blok
96-put termiese blok
Diep goed termiese blok
Platbodem termiese blok vir Flex
WATERBAD EN VERWARMING
Omdat lug 'n goeie termiese isolator is, kan gapings tussen laboratoriumware en 'n termiese blok die tyd-tot-temperatuur-prestasie van die temperatuurmodule beïnvloed. Die plasing van 'n bietjie water in die 24- of 96-put termiese blokke elimineer luggapings en verbeter verwarmingsdoeltreffendheid. Die ideale hoeveelheid water hang af van die termiese blok en laboratoriumware. Sien die Temperatuur Module Witskrif vir verdere aanbevelings.
SAGTEWAREBEHEER
Die temperatuurmodule is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en die Python Protocol API.
Buiten protokolle kan die Opentrons-toepassing die huidige status van die temperatuurmodule vertoon en kan die temperatuur van die oppervlakplaat direk beheer.
76
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
Temperatuur Module spesifikasies
Afmetings Gewig Module krag
Omgewingstoestande Omgewingstemperatuur Relatiewe humiditeit Hoogte Besoedelingsgraad
194 × 90 × 84 mm (L/W/H) 1.5 kg Inset: 100 VAC, 240/50 Hz, 60 A Uitset: 4.0 VDC, 36 A, 6.1 W maks. Binnegebruik slegs <219.6 °C (aanbeveel vir optimale verkoeling) ) Tot 22%, nie-kondenserend Tot 60 m bo see vlak 2000
4.7 Thermocycler Module GEN2
OPENTRONS FLEX
77
HOOFSTUK 4: MODULES
Thermocycler kenmerke
Die Opentrons Thermocycler Module GEN2 is 'n ten volle geoutomatiseerde termofietsryer op die dek, wat handvrye PCR in 'n 96-put plaatformaat verskaf. Sy verhitte deksel en weggooibare seël pas styf oor die plaat, wat doeltreffende s versekerample verhitting en minimale verdamping.
VERWARMING EN VERKOEL Die Thermocycler se blok kan verhit en afkoel, en sy deksel kan verhit, met die volgende temperatuur profile: Termiese blok temperatuur reeks: 4 °C Termiese blok maksimum verwarming ramp tempo: 4.25 °C/s vanaf GEN2 omgewing tot 95 °C Termiese blok maksimum verkoeling ramp tempo: 2.0 °C/s vanaf 95 °C tot omgewing Dekseltemperatuurreeks: 37 °C Dekseltemperatuurakkuraatheid: ±110 °C Die outomatiese deksel kan oop- of toegemaak word soos nodig tydens protokoluitvoering.
TERMOCYCLER PROFILES Die Thermocycler kan pro uitvoerfiles: fiets outomaties deur 'n reeks bloktemperature om hitte-sensitiewe reaksies uit te voer.
RUBBER-OUTOMASIE-SEËLS Die Thermocycler kom met rubber-outomatiseringseëls om verdamping te help verminder. Elke seël moet voor gebruik gesteriliseer word en kan vir verskeie lopies gebruik word. Bykomende seëls kan direk by Opentrons by https://shop.opentrons.com gekoop word.
SAGTEWAREBEHEER Die Thermocycler is volledig programmeerbaar in Protocol Designer en die Python Protocol API. Buiten protokolle kan die Opentrons-toepassing die huidige status van die Thermocycler vertoon en kan die bloktemperatuur, dekseltemperatuur en dekselposisie direk beheer.
78
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 4: MODULES
Thermocycler spesifikasies
Afmetings (deksel oop) Afmetings (deksel toe) Gewig (insluitend agterste kanaal) Kragadapter voltage Kragadapter stroom Oorvoltage Omgewingstoestande Omgewingstemperatuur Relatiewe humiditeit Hoogte Ventilasievereistes
244.95 × 172 × 310.1 mm (L/B/H) 244.95 × 172 × 170.35 mm (L/B/H) 8.4 kg 100 V by 240/50 Hz 60 A Kategorie II Binnegebruik slegs 8.5 °C; 5 °C (aanvaarbaar) 20%, nie-kondenserend Tot 25 m bo seespieël Minstens 2 cm / 40 tussen die eenheid en 'n muur
OPENTRONS FLEX
79
HOOFSTUK 5
Labware
Hierdie hoofstuk dek items in die Opentrons Labware-biblioteek wat jy met Opentrons Flex en die Opentrons Flex Gripper kan gebruik. Dit dek ook pasgemaakte laboratoriumware en, vir ons kraggebruikers, koppel laboratoriumware-komponente aan hul ooreenstemmende JSON file definisies.
Jy kan laboratoriumware by die oorspronklike toerustingvervaardigers koop of by die Opentrons-winkel by https://shop.opentrons.com. En Opentrons werk altyd daaraan om nuwe laboratoriumware-definisies te verifieer. Sien die Labware-biblioteek (hierbo gekoppel) vir die jongste lyste.
5.1 Labware konsepte
Labware sluit meer in as net die voorwerpe wat op die dek geplaas en in 'n protokol gebruik word. Om jou te help om Opentrons-laboratoriumware te verstaan, kom ons ondersoek hierdie onderwerp vanuit drie verskillende perspektiewe. Vir die Opentrons Flex sluit laboratoriumware items in ons Labware-biblioteek, data wat elke stuk laboratoriumware definieer, en pasgemaakte laboratoriumware in.
Labware as hardeware
Die Labware-biblioteek bevat alles wat jy by verstek met Opentrons Flex kan gebruik. Dit is duursame komponente en verbruikbare items waarmee jy werk, hergebruik of weggooi terwyl jy 'n protokol bestuur. Jy hoef geen spesiale stappe te neem om met die items in die Labware-biblioteek te werk nie. Die Flex-robot weet hoe om outomaties met alles in die biblioteek te werk.
Labware as data
Labware-inligting word gestoor in Javascript-objeknotasie (JSON) files met .json file uitbreidings. 'n JSON file sluit ruimtelike afmetings (lengte, breedte, hoogte), volumetriese kapasiteit (L, mL) en ander metrieke in wat oppervlakkenmerke, hul vorms en liggings definieer. Wanneer 'n protokol uitgevoer word, lees die Flex hierdie .json files om te weet watter laboratoriumware op die dek is en hoe om daarmee te werk.
80
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Pasgemaakte laboratoriumware
Pasgemaakte laboratoriumware is laboratoriumware wat nie by die Labware-biblioteek ingesluit is nie of is laboratoriumware wat deur die Custom Labware Creator geskep is. Soms word die idee van pasgemaakte laboratoriumware egter belas deur idees van kompleksiteit, koste of moeilikheid. Maar pasgemaakte laboratoriumware behoort nie moeilik te wees om te verstaan of te skep nie. Kom ons neem 'n oomblik om die konsep van pasgemaakte laboratoriumware uit te pak.
As eksampDie Opentrons Labware-biblioteek bevat 96-put-plate (200 L) van Corning en BioRad, maar ander vervaardigers maak ook hierdie putplate. En danksy algemeen aanvaarde industriestandaarde is die verskille tussen hierdie alomteenwoordige laboratoriumitems gering. 'n Gewone 200 L, 96-put plaat van Stellar Scientific, Oxford Lab, of Krackeler Scientific (of enige ander verskaffer vir die saak) is egter "pasgemaakte laboratoriumware" vir die Flex omdat dit nie vooraf in ons Labware-biblioteek gedefinieer is nie. . Boonop kan geringe verskille in laboratoriumware-afmetings 'n drastiese impak hê op die sukses van u protokolloop. Om hierdie rede is dit belangrik om 'n akkurate laboratoriumware-definisie te hê vir elke laboratoriumware wat jy in jou protokol wil gebruik.
Ook, terwyl pasgemaakte laboratoriumware 'n esoteriese, eenmalige stuk kit kan wees, is dit meestal net die punte, borde, buise en rakke wat elke dag in laboratoriums regoor die wêreld gebruik word. Weereens, die enigste verskil tussen Opentrons laboratoriumware en pasgemaakte laboratoriumware is dat die nuwe item nie vooraf gedefinieer is in die sagteware wat die robot aandryf nie. Die Flex kan en werk met ander basiese laboratoriumware-items of iets unieks, maar jy moet daardie item se kenmerke in 'n laboratoriumware-definisie JSON aanteken file en voer daardie data in die Opentrons-toepassing in. Sien die Custom Labware-definisies-afdeling hieronder vir meer inligting.
Om op te som, laboratoriumware sluit in:
Alles in die Opentrons Labware-biblioteek. Labware-definisies: data in 'n JSON file wat vorms, groottes en vermoëns van individuele items definieer
soos putplate, punte, reservoirs, ens. Pasgemaakte laboratoriumware, wat items is wat nie by die Labware-biblioteek ingesluit is nie.
Na reviewmet hierdie belangrike konsepte, kom ons ondersoek die kategorieë en items in die Opentrons Labware-biblioteek. Daarna sal ons die hoofstuk afsluit met 'n verbyview van die datakomponente van 'n laboratoriumware file en som die Opentrons-kenmerke en -dienste op wat jou help om pasgemaakte laboratoriumware te skep.
OPENTRONS FLEX
81
HOOFSTUK 5: LABOWARE
5.2 Reservoirs
Die Opentrons Flex werk by verstek met die enkel- en multiput-reservoirs wat hieronder gelys word. Die gebruik van hierdie reservoirs help om jou voorbereidingswerklas te verminder omdat hulle reg uit die boks gereed is vir outomatisering. Reservoirinligting is ook beskikbaar in die Opentrons Labware Library.
Enkelput reservoirs
Vervaardiger spesifikasies
Behendig
290 ml V onderkant
Suurstof
90 ml Plat bodem
NES
195 ml Plat bodem
290 ml V onderkant
API-laainaam
behendig_1_ reservoir_290ml
suurstof_1_ reservoir_90ml
nes_1_ reservoir_195ml
nes_1_ reservoir_290ml
Meerputte reservoirs
Vervaardiger spesifikasies
NES
12 putte 15 ml/put V onderkant
VSA Wetenskaplike
12 putte 22 ml/put V onderkant
API-laainaam nes_12_ reservoir_15ml
usascientific_12_ reservoir_22ml
82
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Reservoirs en API definisies
Die Opentrons Labware-biblioteek definieer die kenmerke van die reservoirs wat hierbo in aparte JSON gelys is files. Die robot en die Opentrons Python API maak staat op hierdie JSON-definisies om te werk met laboratoriumware wat deur jou protokolle gebruik word. Byvoorbeeldample, wanneer jy met die API werk, aanvaar die ProtocolContext.load_labware-funksie hierdie laboratoriumware-name as geldige parameters in jou kode. Gekoppelde API-ladingsname verbind met die reservoir-laboratoriumware-definisies in die Opentrons GitHub-bewaarplek.
Pasgemaakte reservoir laboratoriumware
Probeer om 'n pasgemaakte laboratoriumware-definisie met die Opentrons Labware Creator te skep as 'n reservoir wat jy wil gebruik nie hier gelys is nie. 'n Pasgemaakte definisie kombineer al die dimensies, metadata, vorms, volumetriese kapasiteit en ander inligting in 'n JSON file. Die Opentrons Flex het hierdie inligting nodig om te verstaan hoe om met jou pasgemaakte laboratoriumware te werk. Sien die afdeling vir Gepasmaakte Labware-definisies vir meer inligting.
5.3 Putplate
Die Opentrons Flex werk by verstek met putplate wat hieronder gelys word. Die gebruik van hierdie putplate help om jou voorbereidingswerklas te verminder, want hulle is reg uit die boks gereed vir outomatisering. Putplaatinligting is ook beskikbaar in die Opentrons Labware-biblioteek.
OPENTRONS FLEX
83
HOOFSTUK 5: LABOWARE
6-put borde
Vervaardiger Corning
Spesifikasies
6 putte 16.8 ml/put Sirkelvormige putte, plat bodem
API-laainaam corning_6_wellplate_16.8ml_flat
12-put borde
Vervaardiger Corning
Spesifikasies
12 putte 6.9 ml/put Sirkelvormige putte, plat bodem
API-laainaam corning_12_wellplate_6.9ml_flat
24-put borde
Vervaardiger Corning
Spesifikasies
24 putte 3.4 ml/put Sirkelvormige putte, plat bodem
API-laainaam corning_24_wellplate_3.4ml_flat
48-put borde
Vervaardiger Corning
Spesifikasies
48 putte 1.6 ml/put Sirkelvormige putte, plat bodem
API-laainaam corning_48_wellplate_1.6ml_flat
84
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
96-put borde
Vervaardiger Bio-Rad Corning NEST
Opentrons Thermo Scientific
VSA Wetenskaplike
Spesifikasies
96 putte 200 µL/put Sirkelvormige putte, V onderkant
96 putte 360 µL/put Sirkelvormige putte, plat bodem
96 putte 100 µL/put Sirkelvormige putte, V-onderste PCR vol romp
96 putte 200 µL/put Sirkelvormige putte, plat bodem
96 diep putte 2000 µL/put Vierkantige putte, V onderkant
Taai 96 putte 200 µL/put Sirkelvormige putte, V-onderste PCR vol romp
Nunc 96 diep putte 1300 µL/put Sirkelvormige putte, U onderkant
Nunc 96 diep putte 2000 µL/put Sirkelvormige putte, U onderkant
96 diep putte 2.4 ml/put Vierkantige putte, U onderkant
API-laainaam biorad_96_wellplate_200ul_pcr
corning_96_wellplate_360ul_plat
nes_96_wellplate_100ul_pcr_full_skirt
nes_96_putplaat_200ul_plat
nes_96_putplaat_2ml_diep
opentrons_96_wellplate_200ul_pcr_full_ romp
thermoscientificnunc_96_wellplate_ 1300ul termowetenskaplikenunc_96_wellplate_ 2000ul usascientific_96_wellplate_2.4ml_deep
OPENTRONS FLEX
85
HOOFSTUK 5: LABOWARE
384-put borde
Vervaardiger Applied Biosystems Bio-Rad
Corning
Spesifikasies
384 putte 40 µL/put Sirkelvormige putte, V onderkant
384 putte 50 µL/put Sirkelvormige putte, V onderkant
384 putte 112 µL/put Vierkantige putte, plat bodem
API-laainaam toegepas biosystemsmicroamp_384_ putplaat_40ul biorad_384_putplaat_50ul
corning_384_wellplate_112ul_plat
Put plaat adapters
Die aluminiumplate wat hieronder gelys word, is termiese adapters vir die Opentrons Heater-Shaker GEN1-module. Jy kan hierdie selfstandige adapterdefinisies gebruik om Opentrons-geverifieerde of pasgemaakte laboratoriumware bo-op die Heater-Shaker te laai.
Adapter tipe Opentrons Universele Plat Verwarmer-Shaker Adapter Opentrons 96 PCR Verwarmer-Shaker Adapter Opentrons 96 Diepput Verwarmer-Shaker Adapter Opentrons 96 Platbodem Verwarmer-Shaker Adapter
API-laainaam opentrons_universal_flat_adapter opentrons_96_pcr_adapter opentrons_96_deep_well_adapter opentrons_96_flat_bottom_adapter
Jy kan ook beide die adapter en laboratoriumware met 'n enkele definisie laai. Ons Labware-biblioteek bevat verskeie voorafgekonfigureerde termiese adapter- en laboratoriumware-kombinasies wat die Heater-Shaker reg uit die boks gereed maak om te gebruik.
86
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Let wel: Moenie 'n gekombineerde definisie gebruik as jy laboratoriumware op of van die Heater-Shaker moet skuif tydens jou protokol, hetsy met die gryper of met die hand nie. Gebruik eerder 'n selfstandige adapterdefinisie.
Adapter/laboratoriumware kombinasie
API-laainaam
Opentrons 96 Deep Well Verwarmer-Shaker Adapter met NEST Deep Well Plaat 2 mL
opentrons_96_deep_well_adapter_nest_ wellplate_2ml_deep
Opentrons 96 platbodem verwarmer-skud-adapter met NEST 96 putplaat 200 µL plat
opentrons_96_flat_bottom_adapter_nest_ wellplate_200ul_flat
Opentrons 96 PCR Verwarmer-Shaker Adapter met NEST Well Plaat 100 µL
opentrons_96_pcr_adapter_nest_wellplate_ 100ul_pcr_full_skirt
Opentrons Universele Plat Verwarmer-Shaker Adapter met Corning 384 Well Plaat 112 µL Plat
opentrons_universal_flat_adapter_corning_384_ wellplate_112ul_flat
Adapters kan direk by Opentrons by https://shop.opentrons.com gekoop word.
Putplate en API-definisies
Die Opentrons Labware-biblioteek definieer die kenmerke van die putplate wat hierbo in aparte JSON gelys is files. Die Flex-robot en die Opentrons Python API maak staat op hierdie JSON-definisies om te werk met laboratoriumware wat deur jou protokolle gebruik word. Byvoorbeeldample, wanneer jy met die API werk, aanvaar die ProtocolContext.load_labware-funksie hierdie laboratoriumware-name as geldige parameters in jou kode. Gekoppelde API-ladingsname verbind met die putplaat-laboratoriumware-definisies in die Opentrons GitHub-bewaarplek.
Pasgemaakte putplaat laboratoriumware
Probeer om die Opentrons Labware Creator te gebruik om 'n pasgemaakte laboratoriumware-definisie te maak as 'n putplaat wat jy wil gebruik nie hier gelys is nie. 'n Pasgemaakte definisie kombineer al die afmetings, metadata, vorms, volumetriese kapasiteit en ander inligting in 'n JSON file. Die Opentrons Flex lees hierdie inligting om te verstaan hoe om met jou pasgemaakte laboratoriumware te werk. Sien die Custom Labware-definisies-afdeling vir meer inligting.
OPENTRONS FLEX
87
HOOFSTUK 5: LABOWARE
5.4 Spenke en puntrakke
Opentrons Flex-punte kom in groottes van 50 µL, 200 µL en 1000 µL. Dit is duidelike, nie-geleidende polipropileenpunte wat beskikbaar is met of sonder filters. Hulle word steriel verpak in rakke wat 96 punte bevat en is vry van DNase, RNase, protease, pirogene, menslike DNA, endotoksiene en PCR-inhibeerders. Rekke sluit ook lotnommers en vervaldatums in.
Flex pipetpunte werk saam met die Opentrons Flex 50 µL en 1000 µL pipette in die 1-, 8- en 96-kanaal konfigurasies. Terwyl jy enige van die Flex-punte op die 50 L- en 1000 L-pipette kan plaas, probeer om die punt by die pipet se gegradeerde kapasiteit te pas. Byvoorbeeldampdit is dalk vreemd om 'n 1000 L-punt op die 50 L-pipet te sit. Vir die 1000 L pipet kan jy beslis 'n 50 L, 200 L of 1000 L punt gebruik.
Wenk rakke
Ongefiltreerde en gefiltreerde punte word saamgevoeg in 'n rek wat bestaan uit 'n herbruikbare basisplaat, 'n middelplaat wat 96 punte bevat, en 'n deksel.
Wenkrak volgens volume 50 µL 200 µL 1000 µL
API-laainaam
Ongefiltreer: opentrons_flex_96_tiprack_50ul Gefiltreer: opentrons_flex_96_filtertiprack_50ul
Ongefiltreer: opentrons_flex_96_tiprack_200ul Gefiltreer: opentrons_flex_96_filtertiprack_200ul
Ongefiltreer: opentrons_flex_96_tiprack_1000ul Gefiltreer: opentrons_flex_96_filtertiprack_1000ul
Om te help met identifikasie, is die puntrak-middelplate kleurgekodeer op grond van puntgrootte:
50 µL: magenta 200 L: geel 1000 µL: blou
88
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Wanneer jy bestel of herbestel, kom wenke en rakke in twee verskillende verpakte konfigurasies:
Rakke: Bestaan uit afsonderlike krimp-toegedraaide puntrakke (basisplaat, middelplaat met punte en deksel). Rack-konfigurasies is die beste wanneer netheid uiters belangrik is, om kruisbesmetting te vermy, of wanneer jou protokolle nie voorsiening maak vir hergebruik van basisplaat of komponent nie.
Hervul: Bestaan uit een volledige puntrak (basisplaat, middelplaat met punte, en deksel) en individuele punthouers. Hervul-konfigurasies is die beste wanneer jou protokolle voorsiening maak vir hergebruik van basisplaat of komponent.
Tippipette-versoenbaarheid
Flex pipetpunte is ontwerp vir die Opentrons Flex pipette. Flex-punte is nie agtertoe versoenbaar met Opentrons OT-2-pipette nie, en jy kan ook nie OT-2-punte op Flex-pipette gebruik nie.
Ander industriestandaardwenke kan met Flex-pipette werk, maar dit word nie aanbeveel nie. Om optimale werkverrigting te verseker, moet jy net Opentrons Flex-punte met Flex-pipette gebruik.
Tip rek adapter
Die 96-kanaal pipet benodig 'n adapter om 'n volle rek met punte behoorlik vas te maak. Tydens die aanhegtingsprosedure beweeg die pipet oor die adapter, laat sak homself op die monteerpenne en trek punte op die pipette deur die adapter en puntrak op te lig.
OPENTRONS FLEX
89
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Let wel: Gebruik net die puntrakadapter wanneer jy 'n vol rak met punte op een slag optel. Plaas puntrakke direk op die dek wanneer jy minder punte optel.
Waarskuwing: Knyppuntgevaar. Hou hande weg van die puntrakadapter terwyl die pipet pipetpunte vasmaak.
Adapter tipe Opentrons Flex 96 Tip Rack Adapter
API-laainaam opentrons_flex_96_tiprack_adapter
Die puntrakadapter is versoenbaar met die Opentrons Flex Gripper. Jy kan die gryper gebruik om vars puntrakke op die adapter te plaas of om gebruikte puntrakke op te tel en in die vullisgeut te skuif.
5.5 Buise en buisrakke
Die Opentrons 4-in-1 Tube Rack-stelsel werk by verstek met die Opentrons Flex. Die gebruik van die 4-in-1-buisrak help om jou voorbereidingswerklas te verminder, want die kombinasies wat dit verskaf, is reg uit die boks outomatiseringsgereed. Meer inligting is ook beskikbaar in die Opentrons Labware-biblioteek.
90
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Buis en rek kombinasies
Die Opentrons 4-in-1 buisrak ondersteun 'n wye verskeidenheid buisgroottes, alleen of in verskillende grootte (volume) kombinasies. Dit sluit in 'n: 6-buisrak vir 50 ml buise (6 x 50 ml). 10-buis kombinasie rek vir vier 50 ml buise en ses 15 ml buise (4 x 50 ml, 6 x 15 ml). 15-buisrak vir 15 ml buise (15 x 15 ml). 24-buisrak vir 0.5 mL, 1.5 mL of 2 mL buise (24 x 0.5 mL, 1.5 mL, 2 mL).
Let wel: Alle buise is silindries met V-vormige (koniese) bodems, tensy anders aangedui.
6-buis rakke
Buis tipe 6 Falcon 50 mL 6 NEST 50 mL
10-buis rakke
Buis tipe 4 Valk 50 mL 6 Valk 15 mL 4 NES 50 mL 6 NES 15 mL
API-laainaam opentrons_6_tuberack_falcon_50ml_conical opentrons_6_tuberack_nest_50ml_conical
API load name opentrons_10_tuberack_falcon_4x50ml_6x15ml_conical opentrons_10_tuberack_nest_4x50ml_6x15ml_conical
OPENTRONS FLEX
91
HOOFSTUK 5: LABOWARE
15-buis rakke
Buis tipe 15 Falcon 15 mL 15 NEST 15 mL
API-laainaam opentrons_15_tuberack_falcon_15ml_conical opentrons_15_tuberack_nest_15ml_conical
24-buis rakke
Buis tipe
24 Eppendorf Safe-Lock 1.5 mL 24 Eppendorf Safe-Lock 2 mL, U-vormige onderkant 24 generiese 2 mL skroefdop 24 NEST 0.5 mL skroefdop 24 NEST 1.5 mL skroefdop 24 NEST 1.5 mL snapdop 24 NEST 2L NEST 24 mL klikdop, U-vormige bodem
API-laainaam opentrons_24_tuberack_eppendorf_1.5ml_safelock_snapcap opentrons_24_tuberack_eppendorf_2ml_safelock_snapcap
opentrons_24_tuberack_generic_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_0.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_screwcap opentrons_24_tuberack_nest_2ml_snapcap
Buis rek API definisies
Die Opentrons Labware Library definieer die kenmerke van die buisrakke wat hierbo gelys is in aparte JSON files. Die Flex-robot en die Opentrons Python API maak staat op hierdie JSON-definisies om te werk met laboratoriumware wat deur jou protokolle gebruik word. Byvoorbeeldample, wanneer daar met die API gewerk word, aanvaar die ProtocolContext.load_labware-funksie hierdie laboratoriumware-name as geldige parameters in jou kode. Gekoppelde API-ladingsname verbind met die buisrek-laboratoriumware-definisies in die Opentrons GitHub-bewaarplek.
92
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Pasgemaakte buisrek laboratoriumware
Probeer om 'n pasgemaakte laboratoriumware-definisie te skep deur die Opentrons Labware Creator te gebruik as 'n buis- en rakkombinasie wat jy graag wil gebruik, nie hier gelys word nie. 'n Pasgemaakte definisie kombineer al die afmetings, metadata, vorms, volumetriese kapasiteit en ander inligting in 'n JSON file. Die Opentrons Flex lees hierdie inligting om te verstaan hoe om met jou pasgemaakte laboratoriumware te werk. Sien die afdeling vir Gepasmaakte Labware-definisies vir meer inligting.
5.6 Aluminiumblokke
Aluminiumblokke word saam met die temperatuurmodule GEN2 gestuur en kan apart as 'n driestukstel gekoop word. Die stel bevat 'n plat bodemplaat, 'n 24-put-blok en 'n 96-put-blok.
Die Opentrons Flex gebruik aluminiumblokke om s te houample buise en putplate op die temperatuurmodule of direk op die dek. Wanneer dit saam met die temperatuurmodule gebruik word, kan die aluminiumblokke jou s houample-buise, PCR-stroke of plate by 'n konstante temperatuur tussen 4 °C en 95 °C.
Plat bodemplaat
Die plat bodemplaat vir Flex word saam met die Temperatuur Module se caddy gestuur en is versoenbaar met verskeie ANSI/SLAS standaard putplate. Hierdie plat plaat verskil van die plaat wat saam met die temperatuurmodule self of die afsonderlike drie-stuk stel gestuur word. Dit het 'n breër werkoppervlak en afgeskuinsde hoekknippe. Hierdie kenmerke help om die werkverrigting van die Opentrons Flex Gripper te verbeter wanneer laboratoriumware op of van die plaat af geskuif word.
Jy kan sien watter plat bodemplaat jy het, want die een vir Flex het die woorde "Opentrons Flex" op sy boonste oppervlak. Die een vir OT-2 nie.
OPENTRONS FLEX
93
HOOFSTUK 5: LABOWARE
24-put aluminium blok
Die 24-put blok word gebruik met individuele sample flessies. Byvoorbeeldample, dit aanvaar sample flessies wat:
Het V-vormige of U-vormige onderkante. Beveilig die inhoud met drukdop- of skroefdop-sluitings. Hou vloeistof in 'n kapasiteit van 0.5 ml, 1.5 ml en 2 ml.
96-put aluminium blok
Die 96-put blok ondersteun 'n wye verskeidenheid van put plaat tipes. Byvoorbeeldample, dit aanvaar putplate wat is:
Van groot plaatvervaardigers soos Bio-Rad en NEST.
Ontwerp met V-vormige onderkante, U-vormige onderkante of plat onderkante.
Ontwerp met 100 µL of 200 µL putte.
Dit is ook versoenbaar met generiese PCR-stroke.
Selfstandige adapters
Termiese blok Flex plat bodemplaat 24-put aluminiumblok 96-put aluminiumblok
API-laainaam opentrons_aluminium_flat_bottom_plate Sien laboratoriumware-kombinasies hieronder. opentrons_96_well_aluminium_block
Aluminium blok laboratoriumware kombinasies
Die Opentrons Labware Library ondersteun die volgende blok-, fles- en putplaatkombinasies, wat ook in aparte JSON-laboratoriumware-definisie gedefinieer word files. Die Flex-robot en die Opentrons Python API
94
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
staatmaak op hierdie JSON-definisies om te werk met laboratoriumware wat deur u protokolle gebruik word. Byvoorbeeldample, wanneer jy met die API werk, aanvaar die ProtocolContext.load_labware-funksie hierdie laboratoriumware-name as geldige parameters in jou kode. Die tabelle hieronder lys die verstek blok/houer kombinasies en verwante API laai name. Skakels verbind met ooreenstemmende JSON-definisies in die Opentrons GitHub-bewaarplek.
Let wel: Alle buise het V-vormige bodems, tensy anders aangedui.
24-put aluminium blok laboratoriumware kombinasies
24-put blokinhoud Generiese 2 mL skroefdop NEST 0.5 mL skroefdop NEST 1.5 mL skroefdop NEST 1.5 mL snapdop NEST 2 mL skroefdop NEST 2 mL snapdop, U-vormige onderkant
API-laainaam opentrons_24_aluminiumblok_generies_2ml_skroefdop opentrons_24_aluminiumblok_nes_0.5ml_skroefdop opentrons_24_aluminiumblok_nes_1.5ml_skroefdop opentrons_24_aluminiumblok_nest_1.5ml_snapcap opentrons_24_aluminiumblok_nes_2ml_skroefdop opentrons_24_aluminiumblok_nes_2ml_snapcap
96-put aluminium blok laboratoriumware kombinasies
96-put blok inhoud Bio-Rad put plaat 200 µL Generiese PCR strook 200 µL NEST put plaat 100 µL
API-ladingsnaam opentrons_96_aluminiumblok_biorad_putplaat_200uL opentrons_96_aluminiumblok_generiese_pcr_strip_200uL opentrons_96_aluminiumblok_nes_putplaat_100uL
OPENTRONS FLEX
95
HOOFSTUK 5: LABOWARE
5.7 Labware en die Opentrons Flex Gripper
Alhoewel die Opentrons Flex met al die voorraad in die Labware-biblioteek werk, is die Opentrons Flex Gripper slegs versoenbaar met spesifieke laboratoriumware-items. Tans is die Gripper geoptimaliseer vir gebruik met die volgende laboratoriumware-items.
Labware kategorie Diepputplate volledig omring 96 putplate
Wenk rakke (ongefiltreerde en gefiltreerde wenke)
Handelsmerke
NEST 96 Diepputplaat 2 ml
Opentrons Tough 96 Well Plaat 200 µL PCR Full Skirt NEST 96 Well Plaat 200 µL Plat
Opentrons Flex 96 Tip Rack 50 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 200 µL Opentrons Flex 96 Tip Rack 1000 µL
Let wel: Vir die beste resultate, gebruik die Flex Gripper slegs met die laboratoriumware hierbo gelys. Die Flex Gripper kan werk met ander ANSI/SLAS outomatisering voldoen laboratoriumware, maar dit word nie aanbeveel nie.
5.8 Pasgemaakte laboratoriumware-definisies
Soos bespreek aan die begin van hierdie hoofstuk, is pasgemaakte laboratoriumware laboratoriumware wat nie in die Opentrons Labware-biblioteek gelys word nie. Jy kan ander algemene of unieke laboratoriumware-items met die Flex gebruik deur die eienskappe van daardie voorwerp akkuraat te meet en op te teken en daardie data in 'n JSON te stoor file. Wanneer dit in die toepassing ingevoer word, gebruik die Flex en die API daardie JSON-data om met jou laboratoriumware te kommunikeer. Opentrons verskaf gereedskap en dienste, wat ons hieronder sal ondersoek, om jou te help om die Flex met pasgemaakte laboratoriumware te gebruik.
96
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Skep pasgemaakte laboratoriumware-definisies
Opentrons gereedskap en dienste help om pasgemaakte laboratoriumware binne jou bereik te plaas. Hierdie kenmerke akkommodeer verskillende vaardigheidsvlakke en maniere van werk. Om jou eie laboratoriumware te skep en dit saam met die Opentrons Flex te gebruik, help om die robot 'n veelsydige en kragtige toevoeging tot jou laboratorium te maak.
SKEPPERS VAN GEDOENEERDE LABWARE
Die Custom Labware Creator is 'n geen-kode, web-gebaseerde instrument wat 'n grafiese koppelvlak gebruik om jou te help om 'n laboratoriumware-definisie te skep file. Labware Creator produseer 'n JSON-laboratoriumware-definisie file wat jy in die Opentrons-toepassing invoer. Daarna is u pasgemaakte laboratoriumware beskikbaar vir die Flex-robot en die Python API.
GEPASTE LABWARE DIENS
Kom in kontak met ons as die laboratoriumware wat jy wil gebruik nie in die biblioteek beskikbaar is nie, as jy nie jou eie definisies kan skep nie, of omdat 'n pasgemaakte item verskillende vorms, groottes of ander onreëlmatighede insluit wat hieronder beskryf word.
Labware wat jy in Labware Creator kan definieer
; Putte en buise is eenvormig en identies. ; Alle rye is eweredig gespasieer
(die spasie tussen rye is gelyk).
; Alle kolomme is eweredig gespasieer (die spasie tussen kolomme is gelyk).
; Pas perfek in een dekgleuf.
Labware Opentrons moet definieer; Putte en buisvorms verskil. ; Rye is nie eweredig gespasieer nie.
; Kolomme is nie eweredig gespasieer nie.
; Kleiner as een dekgleuf (benodig adapter) of strek oor verskeie dekgleuwe.
OPENTRONS FLEX
97
HOOFSTUK 5: LABOWARE
Hier is 'n paar diagramme wat jou help om die eks te visualiseeramples hierbo beskryf. Gereelde Alle kolomme is eweredig gespasieer en alle rye is eweredig gespasieer. Kolomme hoef nie dieselfde spasiëring as rye te hê nie.
Gereelde Die rooster hoef nie in die middel van laboratoriumware te wees nie.
Onreëlmatige rye is eweredig gespasieer, maar kolomme is nie eweredig gespasieer nie.
Onreëlmatige Kolomme/rye is eweredig gespasieer, maar putte is nie identies nie.
Onreëlmatig Daar is meer as een rooster.
Ons laboratoriumware-span sal werk om jou behoeftes te verstaan en pasgemaakte laboratoriumware-definisies vir jou te ontwerp. Sien die ondersteuningsartikels Request a Custom Labware Definition en die Custom Labware Request-vorm vir meer inligting. Dit is 'n fooi-gebaseerde diens.
98
OPENTRONS FLEX
HOOFSTUK 5: LABOWARE
PYTHON API
Alhoewel jy nie pasgemaakte laboratoriumware met ons API kan skep nie, kan jy pasgemaakte laboratoriumware met die beskikbare API-metodes gebruik. U moet egter eers u pasgemaakte laboratoriumware definieer en dit in die Opentrons-toepassing invoer. Sodra jy jou laboratoriumware by die Opentrons-toepassing gevoeg het, is dit beskikbaar vir die Python API en die robot. Sien die Custom Labware Definitions-afdeling van die Python API-dokumentasie vir meer inligting. Vir inligting oor die skryf van protokolskrifte met die API, sien die Python Protocol API afdeling in die Protocol Development hoofstuk.
JSON laboratoriumware skema
'n JSON file is die bloudruk vir Opentrons standaard en pasgemaakte laboratoriumware. Hierdie file bevat en organiseer laboratoriumdata volgens die ontwerpspesifikasies wat deur die verstekskema gestel word.
'n Skema is 'n raam
Dokumente / Hulpbronne
![]() |
opentrons FLEX FLEX Opentrons Flex Oopbron Vloeistofhanteringsrobot [pdf] Instruksiehandleiding FLEX Opentrons Flex Oopbron Vloeistofhanteringsrobot, FLEX, Opentrons Flex Oopbron Vloeistofhanteringsrobot, Flex Oopbron Vloeistofhanteringsrobot, Oopbron Vloeistofhanteringsrobot, Bron Vloeistofhanteringsrobot, Vloeistofhanteringsrobot, Hanteringsrobot, Robot |