Olink NextSeq 2000 வரிசைமுறை அமைப்பை ஆராயுங்கள்

ஆவணக் குறிப்பு

Olink® Explore User manual, doc nr 1153, வழக்கற்றுப் போய்விட்டது, மேலும் பின்வரும் ஆவணங்களால் மாற்றப்பட்டது:

• Olink® Explore Overview பயனர் கையேடு, ஆவண எண் 1187
• Olink® Explore 384 User Manual, doc nr 1188
• Olink® Explore 4 x 384 User Manual, doc nr 1189
• Olink® Explore 1536 & விரிவாக்க பயனர் கையேடு, doc nr 1190
• Olink® Explore 3072 User Manual, doc nr 1191
• Olink® NextSeq 550 பயனர் கையேடு, doc nr 1192 ஐப் பயன்படுத்தி வரிசைமுறையை ஆராயுங்கள்
• Olink® NextSeq 2000 பயனர் கையேடு, doc nr 1193 ஐப் பயன்படுத்தி வரிசைமுறையை ஆராயுங்கள்
• Olink® NovaSeq 6000 பயனர் கையேடு, doc nr 1194 ஐப் பயன்படுத்தி வரிசைமுறையை ஆராயுங்கள்

அறிமுகம்

நோக்கம் கொண்ட பயன்பாடு

Olink® Explore என்பது மனித புரத பயோமார்க்கர் கண்டுபிடிப்புக்கான மல்டிபிளக்ஸ் இம்யூனோஅசே தளமாகும். தயாரிப்பு ஆராய்ச்சி பயன்பாட்டிற்காக மட்டுமே வடிவமைக்கப்பட்டுள்ளது, மற்றும் கண்டறியும் நடைமுறைகளில் பயன்படுத்தப்படாது. ஆய்வகப் பணிகள் பயிற்சி பெற்ற ஆய்வக ஊழியர்களால் மட்டுமே நடத்தப்படும். பயிற்சி பெற்ற பணியாளர்களால் மட்டுமே தரவு செயலாக்கம் மேற்கொள்ளப்படும். முடிவுகள் மற்ற மருத்துவ அல்லது ஆய்வக கண்டுபிடிப்புகளுடன் இணைந்து ஆராய்ச்சியாளர்களால் பயன்படுத்தப்பட வேண்டும்.

இந்த கையேடு பற்றி

இந்த பயனர் கையேடு Illumina® NextSeq™ 2000 இல் Olink® Explore Libraries வரிசைப்படுத்த தேவையான வழிமுறைகளை வழங்குகிறது. வழிமுறைகள் கண்டிப்பாகவும் வெளிப்படையாகவும் பின்பற்றப்பட வேண்டும். ஆய்வகப் படிகள் முழுவதும் ஏதேனும் விலகல்கள் குறைபாடுள்ள தரவுகளுக்கு வழிவகுக்கும். ஆய்வகப் பணியைத் தொடங்குவதற்கு முன், Olink® Explore Over ஐப் பார்க்கவும்view இயங்குதளத்தை அறிமுகம் செய்வதற்கான பயனர் கையேடு, வினைப்பொருட்கள் பற்றிய தகவல்கள், உபகரணங்கள் மற்றும் தேவையான ஆவணங்கள், ஒரு ஓவர்view பணிப்பாய்வு, அத்துடன் ஆய்வக வழிகாட்டுதல்கள். Olink® Explore Reagent Kits எவ்வாறு இயக்குவது என்பது குறித்த வழிமுறைகளுக்கு, பொருந்தும் Olink® Explore User Manual ஐப் பார்க்கவும். Olink® Explore வரிசை முடிவுகளின் தரவு செயலாக்கம் மற்றும் பகுப்பாய்வுக்கு, Olink® MyData கிளவுட் பயனர் வழிகாட்டியைப் பார்க்கவும். இந்த உள்ளடக்கத்தில் உள்ள அனைத்து வர்த்தக முத்திரைகள் மற்றும் பதிப்புரிமைகள் Olink® Proteomics AB இன் சொத்து, வேறுவிதமாகக் கூறப்படாவிட்டால்.

தொழில்நுட்ப ஆதரவு

தொழில்நுட்ப ஆதரவுக்கு, Olink Proteomics ஐ இங்கு தொடர்பு கொள்ளவும்: support@olink.com.

ஆய்வக வழிமுறைகள்

இந்த அத்தியாயம் NextSeq™ 2000/1000 P2000 ரீஜென்ட்கள் (2 சுழற்சிகள்) v100 ஐப் பயன்படுத்தி NextSeq™ 3 இல் Olink நூலகங்களை எவ்வாறு வரிசைப்படுத்துவது என்பது குறித்த வழிமுறைகளை வழங்குகிறது. வரிசைப்படுத்துவதற்குப் பயன்படுத்தப்படும் நெறிமுறை Illumina® NextSeq™ 2000 க்கான Illumina® நிலையான NGS பணிப்பாய்வு தழுவலாகும். வரிசைப்படுத்துவதற்கு முன், சுத்திகரிக்கப்பட்ட Olink நூலகத்தின் தரம் சரிபார்க்கப்பட்டுள்ளதா என்பதை உறுதிப்படுத்திக் கொள்ளுங்கள். தரக் கட்டுப்பாடு பற்றிய வழிமுறைகளுக்கு பொருந்தக்கூடிய Olink Explore பயனர் கையேட்டைப் பார்க்கவும்.

வரிசைமுறை ஓட்டத்தைத் திட்டமிடுங்கள்

ஒரு Olink நூலகத்தை NextSeq™ 2000 P2 ஓட்ட செல் மற்றும் ஒரு ரன்னுக்கு வரிசைப்படுத்தலாம். வெவ்வேறு Olink Explore Reagent Kitகளை வரிசைப்படுத்த தேவையான P2 ஓட்ட செல்கள் மற்றும் ரன்களின் எண்ணிக்கை அட்டவணை 1 இல் விவரிக்கப்பட்டுள்ளது. ஒன்றுக்கு மேற்பட்ட ரன் தேவைப்பட்டால், இந்த கையேட்டில் விவரிக்கப்பட்டுள்ள வழிமுறைகளை மீண்டும் செய்யவும்.

அட்டவணை 1. வரிசைப்படுத்துதல் ரன் திட்டமிடல்

Olink® Explore Reagent Kit	ஒலிங்க் நூலகங்களின் எண்ணிக்கை	ஓட்டம் செல்(கள்) மற்றும் ரன்(கள்) எண்ணிக்கை
Olink® Explore 384 Reagent Kit	1	1
Olink® Explore 4 x 384 Reagent Kit	4	4
Olink® Explore 1536 Reagent Kit	4	4
Olink® எக்ஸ்ப்ளோர் எக்ஸ்பான்ஷன் ரீஜென்ட் கிட்	4	4
Olink® Explore 3072 Reagent Kit	8	8

Olink® தனிப்பயன் செய்முறையை நிறுவவும்

Olink தனிப்பயன் செய்முறை xml-ஐ சேமிக்கவும்-file பொருத்தமான கருவி கோப்புறையில் Olink_NSQ2K_P2_V1.

குறிப்பு: Olink தனிப்பயன் செய்முறையானது NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 கிட் மற்றும் NextSeq™ 1000/2000 கட்டுப்பாட்டு மென்பொருள் v1.2 அல்லது v1.4 உடன் மட்டுமே வேலை செய்யும்.

வரிசைப்படுத்துதல் உலைகளைத் தயார் செய்யவும்

இந்தப் படிநிலையின் போது, ​​கிளஸ்டரிங் மற்றும் வரிசைப்படுத்தும் வினைப்பொருட்களைக் கொண்ட வினைப்பொருள் பொதியுறை உருகப்பட்டு, ஓட்டக் கலம் தயாரிக்கப்படுகிறது.

எச்சரிக்கை: ரியாஜெண்ட் கார்ட்ரிட்ஜில் அபாயகரமான இரசாயனங்கள் உள்ளன. போதுமான பாதுகாப்பு உபகரணங்களை அணியுங்கள் மற்றும் பொருந்தக்கூடிய தரநிலைகளின்படி பயன்படுத்தப்பட்ட வினைகளை நிராகரிக்கவும். மேலும் தகவலுக்கு, Illumina NextSeq 1000 மற்றும் 2000 கணினி வழிகாட்டியைப் பார்க்கவும் (ஆவணம் #1000000109376).

மறுஉருவாக்கம் கெட்டி தயார்

திறக்கப்படாத கெட்டியை கரைப்பது மூன்று வெவ்வேறு முறைகளைப் பயன்படுத்தி செய்யப்படலாம்: அறை வெப்பநிலையில், கட்டுப்படுத்தப்பட்ட நீர் குளியல் அல்லது குளிர்சாதன பெட்டியில்.

பெஞ்ச் தயார்

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ரீஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜ் (100 சுழற்சிகள்)

வழிமுறைகள்

1. அட்டவணை 2 இல் விவரிக்கப்பட்டுள்ளபடி மறுஉருவாக்கம் கெட்டியைக் கரைக்கவும்.

அட்டவணை 2. ரீஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜ் தாவிங் முறைகள்

தாவிங் முறை	வழிமுறைகள்
அறை வெப்பநிலையில்	வெள்ளிப் படலப் பையைத் திறக்காமல், உறைந்த ரியாஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜை பெஞ்சில் வைத்து, அறை வெப்பநிலையில் 9 மணி நேரம் கரைக்கவும். 16 மணி நேரத்திற்கு மேல் ஆகக்கூடாது. பை லேபிள் மேல்நோக்கி இருப்பதையும், கெட்டியைச் சுற்றி காற்று சுழலக்கூடியதையும் உறுதிப்படுத்திக் கொள்ளுங்கள்.
தண்ணீர் குளியல்	வெள்ளிப் படலப் பையைத் திறக்காமல், உறைந்த ரியாஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜை 25 °C வெப்பநிலையில் கட்டுப்படுத்தப்பட்ட நீர் குளியலில் பாதி மூழ்கடித்து 6 மணி நேரம் கரைய விடவும். 8 மணி நேரத்திற்கு மேல் விட வேண்டாம். பை லேபிள் மேல்நோக்கி இருப்பதையும், கார்ட்ரிட்ஜ் உருகும்போது தலைகீழாக மாறாமல் இருப்பதையும் உறுதிப்படுத்திக் கொள்ளுங்கள். ஒரு காகித துண்டுடன் கெட்டியை நன்கு உலர வைக்கவும்.
குளிர்சாதன பெட்டியில்	வெள்ளிப் படலப் பையைத் திறக்காமல், கெட்டியை பெஞ்சில் வைத்து அறை வெப்பநிலையில் 6 மணி நேரம் கரைக்கவும். பை லேபிள் மேல்நோக்கி இருப்பதையும், கெட்டியைச் சுற்றி காற்று சுழலக்கூடியதையும் உறுதிப்படுத்திக் கொள்ளுங்கள். 12 மணி நேரம் குளிர்சாதன பெட்டியில் கெட்டியை உருக்கி முடிக்கவும். 72 மணி நேரத்திற்கு மேல் விட வேண்டாம். ஓடுவதற்கு முன், குளிர்சாதன பெட்டியிலிருந்து கரைந்த திறக்கப்படாத கார்ட்ரிட்ஜை அகற்றி, குறைந்தபட்சம் 15 நிமிடங்களுக்கு அறை வெப்பநிலையை அடைய அனுமதிக்கவும், ஆனால் 1 மணி நேரத்திற்கு மேல் இல்லை.

குறிப்பு: கரைக்கப்பட்ட தோட்டாக்களை மீண்டும் உறைய வைக்க முடியாது மற்றும் அதிகபட்சமாக 4 மணிநேரத்திற்கு 72 °C வெப்பநிலையில் சேமிக்கப்பட வேண்டும்.

ஓட்டம் செல் தயார்

பெஞ்ச் தயார்

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ஃப்ளோ செல்

வழிமுறைகள்

1. 10-15 நிமிடங்களுக்கு குளிரூட்டப்பட்ட ஓட்ட கலத்தை அறை வெப்பநிலைக்கு கொண்டு வாருங்கள்.

வரிசைப்படுத்துவதற்கு Olink® நூலகத்தைத் தயாரிக்கவும்

இந்தப் படிநிலையின் போது, ​​சுத்திகரிக்கப்பட்ட மற்றும் தரக் கட்டுப்பாட்டுடன் கூடிய Olink நூலகம் இறுதி ஏற்றுதல் செறிவுக்கு நீர்த்தப்படுகிறது. நூலகக் குறைப்பு கருவியில் தானாகவே செய்யப்படுகிறது என்பதை நினைவில் கொள்ளவும்.

பெஞ்ச் தயார்

• Lib Tube, பொருந்தும் Olink Explore User Manual இன் படி தயாரிக்கப்பட்டது
• 1x RSB உடன் ட்வீன் 20
• MilliQ தண்ணீர்
• 2x மைக்ரோசென்ட்ரிஃப்யூஜ் குழாய்கள் (1.5 மிலி)
• கையேடு பைப்பெட் (10, 100 மற்றும் 1000 μL)
• வடிகட்டி பைப்பெட் குறிப்புகள்

நீங்கள் தொடங்குவதற்கு முன்

• லிப் ட்யூப் உறைந்திருந்தால் கரைக்கவும்.
• அறை வெப்பநிலையில் 20 நிமிடங்களுக்கு ட்வீன் 10 உடன் உறைந்த RSB ஐ கரைக்கவும். பயன்படுத்தும் வரை +4 °C இல் சேமிக்கவும்.
• இரண்டு புதிய 1.5 மிலி மைக்ரோசென்ட்ரிஃப்யூஜ் குழாய்களை பின்வருமாறு குறிக்கவும்:
  • ஒரு குழாயை "தில்" எனக் குறிக்கவும் (1:100 நீர்த்த நூலகத்திற்கு)
  • ஒரு குழாயை “Seq” எனக் குறிக்கவும் (நூலகத்தை ஏற்றுவதற்குத் தயாராக உள்ளது)

வழிமுறைகள்

1. தில் குழாயில் 495 μL MilliQ தண்ணீரைச் சேர்க்கவும்.
2. லிப் குழாயை சுழற்றி சுருக்கமாக சுழற்றவும்.
3. லிப் ட்யூப்பில் இருந்து தில் டியூபிற்கு 5 μL கைமுறையாக மாற்றவும்.
4. தில் குழாயை சுழற்றி சுருக்கமாக சுழற்றவும்.
5. 20 μL RBS உடன் Tween 20 உடன் Seq Tube இல் சேர்க்கவும்.
6. கைமுறையாக 20 μL ஐ தில் குழாயிலிருந்து Seq குழாய்க்கு மாற்றவும்.
7. Seq குழாயை சுழற்றி சுருக்கமாக சுழற்றவும்.
8. உடனடியாக 2.5 க்கு தொடரவும், ஃப்ளோ செல் மற்றும் Olink® லைப்ரரியை ரியாஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜில் ஏற்றவும்.

குறிப்பு: லிப் ட்யூப்(களை) -20 °C இல் சேமித்து வைக்கவும்.

ஃப்ளோ செல் மற்றும் ஒலிங்க்® லைப்ரரியை ரியாஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜில் ஏற்றவும்

இந்த படிநிலையின் போது, ​​ஓட்டம் செல் மற்றும் நீர்த்த ஒலிங்க் லைப்ரரி ஆகியவை thawed regent cartridge இல் ஏற்றப்படுகின்றன.

பெஞ்ச் தயார்

• 1x உருகிய NextSeq™ 1000/2000 P2 ரீஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜ் (100 சுழற்சிகள்), முந்தைய படியில் தயாரிக்கப்பட்டது.
• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ஃப்ளோ செல், முந்தைய படியில் தயாரிக்கப்பட்டது.
• முந்தைய படியில் தயாரிக்கப்பட்ட Seq குழாய் (நீர்த்த Olink நூலகத்தை ஏற்றத் தயாராக உள்ளது)
• கையேடு குழாய் (100 μL)
• குழாய் முனை (1 மிலி)

கெட்டி தயார்

1. வெள்ளி தகடு பையில் இருந்து கெட்டியை அகற்றவும்.
2. கெட்டியை பத்து முறை கவிழ்த்து உள்ளே உள்ள கரைந்த வினைகளை நன்கு கலக்கவும்.

குறிப்பு: உள் உறுப்புகள் ஒலிப்பது இயல்பானது.

கார்ட்ரிட்ஜில் ஓட்ட கலத்தை ஏற்றவும்

1. கார்ட்ரிட்ஜில் ஓட்டக் கலத்தை ஏற்றுவதற்குத் தயாரானதும், தொகுப்பிலிருந்து ஃப்ளோ கலத்தை அகற்றவும். ஃப்ளோ கலத்தை சாம்பல் தாவலின் மூலம் பிடித்து, தாவலில் உள்ள லேபிளை மேலே நோக்கிப் பிடிக்கவும். ஓட்டக் கலத்தின் கண்ணாடி மேற்பரப்பை மாசுபடுத்துவதைத் தவிர்க்க புதிய தூள் இல்லாத கையுறைகளைப் பயன்படுத்தவும்.
2. கார்ட்ரிட்ஜின் முன்புறத்தில் உள்ள ஃப்ளோ செல் ஸ்லாட்டில் ஃப்ளோ கலத்தைச் செருகவும். கேட்கக்கூடிய கிளிக் ஓட்டம் செல் சரியாக வைக்கப்பட்டுள்ளதைக் குறிக்கிறது.
3. சாம்பல் தாவலை வெளியே இழுப்பதன் மூலம் அகற்றவும்.

ஒலிங்க் ® நூலகத்தை கார்ட்ரிட்ஜில் ஏற்றவும்

1. சுத்தமான 1 மில்லி பைப்பெட் முனையுடன் நூலக நீர்த்தேக்கத்தைத் துளைக்கவும்.
2. 20 μL ஒலிங்க் லைப்ரரியை Seq குழாயிலிருந்து நூலக நீர்த்தேக்கத்தின் அடிப்பகுதியில் ஏற்றவும்.

Olink® சீக்வென்சிங் ரன் செய்யவும்

இந்த படிநிலையின் போது, ​​ஏற்றப்பட்ட ஃப்ளோ செல் மற்றும் ஒலிங்க் லைப்ரரியுடன் கூடிய பஃபர் கார்ட்ரிட்ஜ் NextSeq™ 2000 இல் ஏற்றப்படுகிறது, மேலும் ஒலிங்க் செய்முறையைப் பயன்படுத்தி வரிசைப்படுத்தல் ரன் தொடங்கப்படுகிறது.

பெஞ்ச் தயார்

• முந்தைய படியில் தயாரிக்கப்பட்ட NextSeq™ 1/1000 P2000 ரீஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜ் (2 சுழற்சிகள்) NextSeq™ 100/1000 P2000 ஃப்ளோ செல் மற்றும் நீர்த்த Olink நூலகத்துடன் ஏற்றப்பட்டது.

ரன் பயன்முறையை உள்ளமைக்கவும்

1. கட்டுப்பாட்டு மென்பொருள் மெனுவிலிருந்து, அமைப்புகளைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
2. BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support என்பதன் கீழ், Local Run Setup என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
3. கூடுதல் அமைப்புகளாக செயலில் உள்ள ஆதரவை மட்டும் தேர்ந்தெடுக்கவும். இந்தச் செயல்பாட்டிற்கு இணைய இணைப்பு தேவை.
4. உங்கள் தரவுக்கான ஹோஸ்டிங் இருப்பிடத்தைத் தேர்ந்தெடுக்கவும். ஹோஸ்டிங் இருப்பிடம் உங்கள் பிராந்தியத்தில் அல்லது அருகில் இருக்க வேண்டும்.
5. தற்போதைய ரன் ரா தரவுக்கான வெளியீட்டு கோப்புறை இருப்பிடத்தை அமைக்கவும். செல்லவும் தேர்வு செய்யவும் மற்றும் வெளியீட்டு கோப்புறையைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
6. கருவியில் உள்ள நூலகத்தை தானாகக் குறைத்து நீர்த்துப்போகச் செய்ய டெனாச்சர் மற்றும் டியூட் ஆன் போர்டு தேர்வுப்பெட்டியைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
7. கார்ட்ரிட்ஜின் செலவழிக்கப்பட்ட ரியாஜென்ட் பெட்டியில் பயன்படுத்தப்படாத ரியாஜெண்டுகளை தானாகவே சுத்தப்படுத்த, பர்ஜ் ரீஜென்ட் கார்ட்ரிட்ஜ் தேர்வுப்பெட்டியைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
8. மென்பொருள் புதுப்பிப்புகளைத் தானாகச் சரிபார்க்க, மென்பொருள் புதுப்பிப்புகளுக்கான தானியங்குச் சரிபார்ப்புப் பெட்டியைத் தேர்ந்தெடுக்கவும் (விரும்பினால்). இந்தச் செயல்பாட்டிற்கு இணைய இணைப்பு தேவை.
9. சேமி என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

இயக்க அளவுருக்களை அமைக்கவும்

குறிப்பு: இந்த அறிவுறுத்தல் NextSeq™ 1.4/1000 கட்டுப்பாட்டு மென்பொருளின் பதிப்பு 2000 க்கு பொருந்தும். பதிப்பு v1.2 ஐப் பயன்படுத்தும் போது கீழே விவரிக்கப்பட்டுள்ள சில படிகள் வேறுபட்டிருக்கலாம்

1. கட்டுப்பாட்டு மென்பொருள் மெனுவிலிருந்து, தொடங்கு என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
2. புதிய இயக்கத்தை கைமுறையாக அமை என்பதைத் தேர்ந்தெடுத்து அமைவை அழுத்தவும்.
3. ரன் அமைவு பக்கத்தில், ரன் அளவுருக்களை பின்வருமாறு அமைக்கவும்:
   • இயக்கு பெயர் புலத்தில், தனிப்பட்ட பரிசோதனை ஐடியை உள்ளிடவும்.
   • வாசிப்பு வகை கீழ்தோன்றும் பட்டியலில், ஒற்றை வாசிப்பு விருப்பத்தைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
   • சுழற்சிகளின் எண்ணிக்கையை பின்வருமாறு உள்ளிடவும்:
     • படிக்கவும் 1: 24
     • அட்டவணை 1: 0
     • அட்டவணை 2: 0
     • படிக்கவும் 2: 0

குறிப்பு: Read 1 ஐ 24 ஆக அமைப்பது மிகவும் முக்கியம், இல்லையெனில் முழு இயக்கமும் தோல்வியடையும். சுழற்சிகளின் எண்ணிக்கையை உள்ளிடும்போது எச்சரிக்கை செய்திகளைப் புறக்கணிக்கவும்.

• Custom Primer Wells கீழ்தோன்றும் பட்டியலில், எண் என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
• தனிப்பயன் செய்முறை (விரும்பினால்) புலத்தில், வழிசெலுத்துவதற்கு தேர்ந்தெடு என்பதைத் தேர்ந்தெடுத்து தனிப்பயன் செய்முறை XML ஐத் தேர்ந்தெடுக்கவும் file Olink_NSQ2K_P2_V1. திற என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
• S ஐ இறக்குமதி செய்ய வேண்டாம்ample தாள்.
• வெளியீட்டு கோப்புறையின் இருப்பிடம் சரியானது என்பதை உறுதிப்படுத்தவும். இல்லையெனில், வழிசெலுத்துவதற்கு தேர்ந்தெடு என்பதைத் தேர்ந்தெடுத்து, விரும்பிய வெளியீட்டு கோப்புறை இருப்பிடத்தைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
• Denature மற்றும் Dilute Onboard புலத்தில், கீழ்தோன்றும் பட்டியலில் இருந்து இயக்கப்பட்டது என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
• தயாரிப்பைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.

ஏற்றப்பட்ட கெட்டியை ஏற்றவும்

1. ஏற்றுவதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும். கருவி விசர் திறக்கிறது மற்றும் தட்டு வெளியேற்றப்படுகிறது.
2. ஏற்றப்பட்ட பொதியுறையை லேபிளை மேலே எதிர்கொள்ளும் வகையில் தட்டில் வைக்கவும் மற்றும் கருவியின் உள்ளே ஓட்டம் செல்.
3. மூடு என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
4. கார்ட்ரிட்ஜ் சரியாக ஏற்றப்பட்டவுடன், ரன் அளவுருக்களை சரிபார்த்து, வரிசையைத் தேர்ந்தெடுக்கவும். கருவி மற்றும் திரவத்திற்கான முன்-இயக்க சோதனைகளை கருவி செய்கிறது.
   • குறிப்பு: திரவ சோதனையின் போது, ​​அது பல உறுத்தும் ஒலிகளைக் கேட்கும் என்று எதிர்பார்க்கப்படுகிறது.
5. தானியங்கு முன்-இயக்கச் சரிபார்ப்புகள் (~15 நிமிடங்கள்) முடிந்ததும் ரன் தொடங்குவதை உறுதிசெய்யவும். வரிசைமுறை இயக்க நேரம் தோராயமாக 10h30 நிமிடம்.
   • குறிப்பு: ஏதேனும் முன்-செயல்பாட்டு சோதனை தோல்விகளுக்கு, உற்பத்தியாளரின் வழிமுறைகளைப் பார்க்கவும். வரிசைமுறை இயக்கத்தின் போது NextSeq™ 2000 இல் மோதவோ அல்லது வேறுவிதமாக தொந்தரவு செய்யவோ கூடாது என்பதில் கவனமாக இருங்கள். கருவி அதிர்வுகளுக்கு உணர்திறன் கொண்டது.
6. வேலை செய்யும் பகுதியை சுத்தம் செய்யவும்.

ரன் முன்னேற்றத்தை கண்காணிக்கவும்

s இல் கொடுக்கப்பட்ட புரதத்தின் செறிவை மதிப்பிடுவதற்காக அறியப்பட்ட வரிசையின் அளவைக் கணக்கிடுவதற்கு ஒலிங்க் NGS ஐ ரீட்அவுட்டாகப் பயன்படுத்துகிறது.ampலெஸ் (மற்றவற்றுடன் தொடர்புடையதுamples). ஒவ்வொரு எக்ஸ்ப்ளோர் சீக்வென்சிங் ரன்களிலிருந்தும் தரவின் தரம் முக்கியமாக ஒலிங்க் தொழில்நுட்பத்திற்கு தனித்துவமான QC அளவுருக்களால் தீர்மானிக்கப்படுகிறது. எனவே, Q-ஸ்கோர் போன்ற வழக்கமான NGS இல் பயன்படுத்தப்படும் நிலையான தரக் கட்டுப்பாட்டு அளவீடுகள் குறைவான முக்கியமானவை.

ஓட்டத்திற்குப் பிறகு கெட்டியை வெளியேற்றி நிராகரிக்கவும்

எச்சரிக்கை: இந்த வினைப்பொருள்களின் தொகுப்பில் அபாயகரமான இரசாயனங்கள் உள்ளன. போதுமான பாதுகாப்பு உபகரணங்களை அணியுங்கள் மற்றும் பொருந்தக்கூடிய தரநிலைகளின்படி பயன்படுத்தப்பட்ட வினைகளை நிராகரிக்கவும். மேலும் தகவலுக்கு, Illumina NextSeq 1000 மற்றும் 2000 கணினி வழிகாட்டியைப் பார்க்கவும் (ஆவணம் #1000000109376).

1. ரன் முடிந்ததும், கார்ட்ரிட்ஜை வெளியேற்று என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
   • குறிப்பு: ஃப்ளோ செல் உட்பட பயன்படுத்தப்பட்ட கெட்டியை அடுத்த ரன் வரை இடத்தில் விடலாம், ஆனால் 3 நாட்களுக்கு மேல் இல்லை.
2. தட்டில் இருந்து கெட்டியை அகற்றவும்.
3. பொருந்தக்கூடிய தரநிலைகளுக்கு ஏற்ப உலைகளை அப்புறப்படுத்துங்கள்.
4. மூடு கதவைத் தேர்ந்தெடுக்கவும். தட்டு மீண்டும் ஏற்றப்பட்டது.
5. முகப்புத் திரைக்குத் திரும்ப முகப்பு என்பதைத் தேர்ந்தெடுக்கவும்.
   • குறிப்பு: கார்ட்ரிட்ஜில் கணினியை இயக்குவதற்கான அனைத்து வழிமுறைகளும், அதே போல் பயன்படுத்தப்பட்ட வினைப்பொருட்களை சேகரிக்க ஒரு நீர்த்தேக்கமும் இருப்பதால், ஓட்டத்திற்குப் பிறகு ஒரு கருவியைக் கழுவ வேண்டிய அவசியமில்லை.

சரிபார்ப்பு வரலாறு

பதிப்பு	தேதி	விளக்கம்
1.0	2021-12-01	புதியது

www.olink.com

ஆராய்ச்சி பயன்பாட்டிற்கு மட்டுமே. நோயறிதல் நடைமுறைகளில் பயன்படுத்துவதற்கு அல்ல.

இந்த தயாரிப்பு Olink தயாரிப்புகளின் வணிகரீதியான பயன்பாட்டிற்கான உரிமத்தை உள்ளடக்கியது. வணிக பயனர்களுக்கு கூடுதல் உரிமங்கள் தேவைப்படலாம். விவரங்களுக்கு Olink Proteomics AB ஐத் தொடர்பு கொள்ளவும். இந்த விளக்கத்திற்கு அப்பால் நீட்டிக்கப்படும் எந்தவொரு உத்தரவாதமும் வெளிப்படுத்தப்படவில்லை அல்லது மறைமுகமாக இல்லை. இந்த தயாரிப்பால் ஏற்படும் சொத்து சேதம், தனிப்பட்ட காயம் அல்லது பொருளாதார இழப்புக்கு Olink Proteomics AB பொறுப்பேற்காது. பின்வரும் வர்த்தக முத்திரை Olink Proteomics AB க்கு சொந்தமானது: Olink®. இந்த தயாரிப்பு பல காப்புரிமைகள் மற்றும் காப்புரிமை விண்ணப்பங்களால் மூடப்பட்டுள்ளது. https://www.olink.com/patents/.

© பதிப்புரிமை 2021 Olink Proteomics AB. அனைத்து மூன்றாம் தரப்பு வர்த்தக முத்திரைகளும் அந்தந்த உரிமையாளர்களின் சொத்து.

ஒலிங்க் புரோட்டியோமிக்ஸ், டாக் ஹம்மர்ஸ்க்ஜோல்ட்ஸ் väg 52B , SE-752 37 உப்சாலா, ஸ்வீடன்

1193, v1.0, 2021-12-01

ஆவணங்கள் / ஆதாரங்கள்

Olink NextSeq 2000 வரிசைமுறை அமைப்பை ஆராயுங்கள் [pdf] பயனர் கையேடு NextSeq 2000, வரிசைமுறை அமைப்பை ஆராயுங்கள், NextSeq 2000 வரிசைமுறை அமைப்பை ஆராயுங்கள்

குறிப்புகள்

• பயனர் கையேடு