မာတိကာ ပုန်း

Olink-LOGO

Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing စနစ်

Olink-NextSeq-2000-Explore-Sequenci-PRODUCT

မှတ်တမ်းမှတ်စု

Olink® Explore အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1153 သည် အသုံးမပြုတော့ဘဲ အောက်ပါစာရွက်စာတမ်းများဖြင့် အစားထိုးထားသည်-

  • Olink® တွင် စူးစမ်းလေ့လာပါ။view အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1187
  • Olink® Explore 384 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1188
  • Olink® Explore 4 x 384 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1189
  • Olink® Explore 1536 & တိုးချဲ့အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1190
  • Olink® Explore 3072 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1191
  • NextSeq 550 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1192 ကို အသုံးပြု၍ Olink® Sequencing ကိုစူးစမ်းပါ
  • NextSeq 2000 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1193 ကို အသုံးပြု၍ Olink® Sequencing ကိုစူးစမ်းပါ
  • Olink® NovaSeq 6000 အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊ doc nr 1194 ကိုအသုံးပြု၍ စီစစ်ခြင်းစူးစမ်းခြင်း

နိဒါန်း

ရည်ရွယ်အသုံးပြုခြင်း။

Olink® Explore သည် လူ့ပရိုတင်းဇီဝမှတ်စုရှာဖွေတွေ့ရှိမှုအတွက် multiplex immunoassay ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုဖြစ်သည်။ ထုတ်ကုန်သည် သုတေသနပြုလုပ်ရန်အတွက်သာ ရည်ရွယ်ပြီး ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ငန်းစဉ်များတွင် အသုံးပြုရန်မဟုတ်ပါ။ ဓာတ်ခွဲခန်းလုပ်ငန်းကို လေ့ကျင့်သင်ကြားထားသော ဓာတ်ခွဲခန်းဝန်ထမ်းများကသာ လုပ်ဆောင်ရမည်။ Data processing ကို လေ့ကျင့်သင်ကြားထားသော ဝန်ထမ်းများမှသာ လုပ်ဆောင်ရပါမည်။ ရလဒ်များကို အခြားလက်တွေ့ သို့မဟုတ် ဓာတ်ခွဲခန်းတွေ့ရှိချက်များနှင့် တွဲဖက်၍ သုတေသီများက အသုံးပြုရန် ရည်ရွယ်သည်။

ဒီလက်စွဲစာအုပ်အကြောင်း

ဤအသုံးပြုသူလက်စွဲစာအုပ်သည် Illumina® NextSeq™ 2000 ရှိ Olink® Explore Libraries များကို စီစဥ်ရန် လိုအပ်သော ညွှန်ကြားချက်များကို ပေးဆောင်ပါသည်။ ညွှန်ကြားချက်များကို တင်းတင်းကျပ်ကျပ် ပြတ်သားစွာ လိုက်နာရပါမည်။ ဓာတ်ခွဲခန်းအဆင့်များတစ်လျှောက် သွေဖည်မှုများသည် ဒေတာချို့ယွင်းမှုဖြစ်စေနိုင်သည်။ ဓာတ်ခွဲခန်းအလုပ်အသွားအလာမစတင်မီ Olink® Explore Over ကို တိုင်ပင်ပါ။view ဓါတ်ကူပစ္စည်း၊ စက်ကိရိယာနှင့် လိုအပ်သောစာရွက်စာတမ်းများအကြောင်း အချက်အလက်အပါအဝင် ပလက်ဖောင်းကို မိတ်ဆက်ရန်အတွက် အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊view အလုပ်အသွားအလာနှင့် ဓာတ်ခွဲခန်းလမ်းညွှန်ချက်များ။ Olink® Explore Reagent Kits ကို မည်သို့လည်ပတ်ရမည်နည်း လမ်းညွှန်ချက်များအတွက် သက်ဆိုင်ရာ Olink® Explore User Manual အား ကိုးကားပါ။ Olink® Explore sequence ရလဒ်များကို ဒေတာလုပ်ဆောင်ခြင်းနှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအတွက် Olink® MyData Cloud အသုံးပြုသူလမ်းညွှန်ကို ကိုးကားပါ။ ဤပစ္စည်းတွင်ပါရှိသော ကုန်အမှတ်တံဆိပ်နှင့် မူပိုင်ခွင့်များအားလုံးသည် Olink® Proteomics AB ၏ ပိုင်ဆိုင်မှုဖြစ်သည်၊

နည်းပညာနှင့်ပတ်သက်သောအထောက်အပံ့

နည်းပညာဆိုင်ရာ ပံ့ပိုးကူညီမှုအတွက်၊ Olink Proteomics ကို ဆက်သွယ်ပါ- support@olink.com.

ဓာတ်ခွဲခန်းညွှန်ကြားချက်

NextSeq™ 2000/1000 P2000 Reagents (2 Cycles) v100 ကို အသုံးပြု၍ NextSeq™ 3 တွင် Olink Libraries များကို စီစဥ်ပုံဆိုင်ရာ လမ်းညွှန်ချက်များ ပေးထားပါသည်။ စီစစ်ရန်အတွက် အသုံးပြုသည့် ပရိုတိုကောသည် Illumina® NextSeq™ 2000 အတွက် Illumina® စံ NGS အလုပ်အသွားအလာကို လိုက်လျောညီထွေဖြစ်စေသည်။ စီစဉ်သို့မဆက်မီ၊ သန့်စင်ထားသော Olink Library ၏ အရည်အသွေးကို စစ်ဆေးပြီးဖြစ်ကြောင်း သေချာပါစေ။ အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုဆိုင်ရာ ညွှန်ကြားချက်များအတွက် သက်ဆိုင်ရာ Olink Explore User Manual အား ကိုးကားပါ။

Sequencing Run ကို စီစဉ်ပါ။

Olink Library တစ်ခုအား NextSeq™ 2000 P2 စီးဆင်းမှုဆဲလ်တစ်ခုနှင့် လည်ပတ်မှုတစ်ခုစီတွင် စီတန်းနိုင်ပါသည်။ မတူညီသော Olink Explore Reagent Kits များကို စီစဥ်ရန် လိုအပ်သော P2 ​​စီးဆင်းမှုဆဲလ် အရေအတွက်နှင့် လည်ပတ်မှုများကို ဇယား 1 တွင် ဖော်ပြထားပါသည်။ တစ်ခုထက်ပို၍ လုပ်ဆောင်ရန် လိုအပ်ပါက၊ ဤလက်စွဲတွင် ဖော်ပြထားသည့် ညွှန်ကြားချက်များကို ပြန်လုပ်ပါ။

ဇယား 1. Sequencing run planning

Olink® Explore Reagent Kit Olink Libraries အရေအတွက် စီးဆင်းမှုဆဲလ်(များ) နှင့် run(s) အရေအတွက်
Olink® Explore 384 Reagent Kit 1 1
Olink® Explore 4 x 384 Reagent Kit 4 4
Olink® Explore 1536 Reagent Kit 4 4
Olink® Expansion Reagent Kit ကိုစူးစမ်းပါ။ 4 4
Olink® Explore 3072 Reagent Kit 8 8

Olink® စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းကို ထည့်သွင်းပါ။

Olink စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်း xml- ကိုသိမ်းဆည်းပါ။file သင့်လျော်သော တူရိယာဖိုင်တွဲတစ်ခုရှိ Olink_NSQ2K_P2_V1။

မှတ်ချက်: Olink စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းသည် NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 အစုံနှင့် NextSeq™ 1000/2000 ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲ v1.2 သို့မဟုတ် v1.4 တို့နှင့်သာ အလုပ်လုပ်ပါမည်။

sequencing ဓာတ်ပစ္စည်းများကို ပြင်ဆင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ အစုလိုက်အပြုံလိုက်နှင့် အစီအမံပါဝင်သည့် ဓာတ်ပစ္စည်းများပါဝင်သော ယမ်းတောင့်ကို သုတ်ပြီး စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ပြင်ဆင်သည်။

သတိပေးချက်- ယမ်းတောင့်တွင် အန္တရာယ်ဖြစ်စေနိုင်သော ဓာတုပစ္စည်းများ ပါဝင်ပါသည်။ လုံလောက်သော အကာအကွယ်ပစ္စည်းများကို ဝတ်ဆင်ပြီး သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အသုံးပြုထားသော ဓာတ်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။ ပိုမိုသိရှိလိုပါက၊ Illumina NextSeq 1000 နှင့် 2000 စနစ်လမ်းညွှန် (document #1000000109376) ကို ကိုးကားပါ။

ယမ်းတောင့်ကို ပြင်ဆင်ပါ။

မဖွင့်ရသေးသော ယမ်းတောင့်ကို အခန်းအပူချိန်တွင်၊ ထိန်းချုပ်ထားသော ရေချိုးခန်းထဲတွင် သို့မဟုတ် ရေခဲသေတ္တာထဲတွင် နည်းလမ်းသုံးမျိုးဖြင့် သုတ်နိုင်သည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

  • 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 cycles)

ညွှန်ကြားချက်များ

  1. ဇယား 2 တွင်ဖော်ပြထားသည့်အတိုင်း ဓါတ်ဆေးတောင့်ကို သုတ်ပါ။

ဇယား 2. ဓါတ်ဆေးတောင့် ယမ်းတောင့် ဖျော်နည်းများ

သုတ်နည်း ညွှန်ကြားချက်များ
အခန်းအပူချိန်မှာ
  • ငွေရောင်သတ္တုပါးအိတ်ကို မဖွင့်ဘဲ အေးခဲထားသော ယမ်းတောင့်ကို ခုံတန်းလျားပေါ်တွင် ထားကာ အခန်းအပူချိန်တွင် ၉ နာရီကြာအောင် ထားပါ။ 9 နာရီထက်မပိုပါစေနှင့်။
  • အိတ်တံဆိပ်ကို မျက်နှာမူပြီး လေသည် ယမ်းတောင့်တစ်ဝိုက်တွင် ပျံ့နှံ့နိုင်သည်ကို သေချာပါစေ။
ရေချိုးခန်းထဲမှာ
  • ငွေရောင်သတ္တုပါးအိတ်ကို မဖွင့်ဘဲ၊ အေးခဲထားသော ဓါတ်ဆေးတောင့်ကို ထိန်းချုပ်ထားသော 25°C ရေချိုးခန်းထဲတွင် တစ်ဝက်မြုပ်အောင်ထားကာ 6 နာရီကြာအောင်ထားပါ။ ၈ နာရီထက် မပိုစေရပါ။
  • အိတ်အညွှန်းသည် မျက်နှာပေါ်ရှိစေပြီး ယမ်းတောင့်သည် ပျော့သွားချိန်တွင် ပြောင်းပြန်မဖြစ်အောင် သေချာပါစေ။
  • ယမ်းတောင့်ကို စက္ကူသုတ်ပဝါဖြင့် သေချာအခြောက်ခံပါ။
ရေခဲသေတ္တာထဲမှာ
  • ငွေရောင်သတ္တုပါးအိတ်ကို မဖွင့်ဘဲ ယမ်းတောင့်ကို ခုံတန်းရှည်ပေါ်တွင် ထားကာ အခန်းအပူချိန်တွင် ၆ နာရီကြာအောင် ထားပါ။
  • အိတ်တံဆိပ်ကို မျက်နှာမူပြီး လေသည် ယမ်းတောင့်တစ်ဝိုက်တွင် ပျံ့နှံ့နိုင်သည်ကို သေချာပါစေ။
  • ယမ်းတောင့်ကို ရေခဲသေတ္တာထဲတွင် ၁၂ နာရီကြာအောင် ရောထည့်လိုက်ပါ။ ၇၂ နာရီထက် မပိုစေရပါ။
  • မပြေးမီ၊ ရေခဲသေတ္တာမှ သုတ်ထားသော မဖွင့်ရသေးသော ယမ်းတောင့်ကို ဖယ်ရှားပြီး အနည်းဆုံး 15 မိနစ်အတွင်း အခန်းအပူချိန်သို့ ရောက်အောင် ထားနိုင်သော်လည်း 1 နာရီထက် မပိုစေရ။

မှတ်ချက်: ရောထားသော ယမ်းတောင့်များကို အေးခဲ၍မရပါ၊ အမြင့်ဆုံးအချိန် 4 နာရီအထိ 72°C တွင် သိမ်းဆည်းထားရပါမည်။

flow cell ကို ပြင်ဆင်ပါ။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

  • 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 စီးဆင်းမှုဆဲလ်

ညွှန်ကြားချက်များ

  1. အအေးခန်းထဲရှိ flow cell ကို အခန်းအပူချိန်သို့ 10-15 မိနစ်ခန့်ထားပါ။
စီစီခြင်းအတွက် Olink® Library ကို ပြင်ဆင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ သန့်စင်ပြီး အရည်အသွေးထိန်းချုပ်ထားသော Olink စာကြည့်တိုက်ကို နောက်ဆုံးတင်ပေးသည့်အာရုံစူးစိုက်မှုအဖြစ် မှေးမှိန်သွားပါသည်။ ဒစ်ဂျစ်တယ်အသွင်အပြင်ကို တူရိယာပေါ်တွင် အလိုအလျောက်လုပ်ဆောင်ကြောင်း သတိပြုပါ။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

  • သက်ဆိုင်ရာ Olink Explore အသုံးပြုသူလက်စွဲအတိုင်း ပြင်ဆင်ထားသည့် Lib Tube
  • Tween 1 ဖြင့် 20x RSB
  • MilliQ ရေ
  • 2x Microcentrifuge ပြွန်များ (1.5 mL)
  • Manual pipette (10၊ 100 နှင့် 1000 μL)
  • pipette အကြံပြုချက်များကို စစ်ထုတ်ပါ။

မစတင်မီ

  • အေးနေပါက Lib Tube ကို သုတ်ပါ။
  • အေးခဲထားသော RSB ကို Tween 20 ဖြင့် အခန်းအပူချိန်တွင် ၁၀ မိနစ်ကြာအောင် ရောပေးပါ။ အသုံးပြုသည်အထိ +10 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်သိမ်းဆည်းပါ။
  • 1.5 mL microcentrifuge ပြွန်အသစ်နှစ်ခုကို အောက်ပါအတိုင်း အမှတ်အသားပြုပါ။
    • တစ်ပြွန် “Dil” (1:100 မှေးမှိန်သော စာကြည့်တိုက်အတွက်)
    • တစ်ပြွန် “Seq” (ဒစ်ဂျစ်တိုက်ကို ဖွင့်ရန်အဆင်သင့်အတွက်)

ညွှန်ကြားချက်များ

  1. MilliQ ရေ 495 μL ကို Dil Tube သို့ထည့်ပါ။
  2. Vortex သည် Lib Tube နှင့် ၎င်းကို တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။
  3. Lib Tube မှ 5 μL ကို Dil Tube သို့ ကိုယ်တိုင် လွှဲပြောင်းပါ။
  4. Vortex သည် Dil Tube ကို ခေတ္တမျှ လှည့်ပတ်ပါ။
  5. Tween 20 ဖြင့် RBS 20 μL ကို Seq Tube သို့ထည့်ပါ။
  6. Dil Tube မှ 20 μL ကို Seq Tube သို့ ကိုယ်တိုင် လွှဲပြောင်းပါ။
  7. Seq Tube ကို Vortex လုပ်ပြီး တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။
  8. 2.5 Load flow cell နှင့် Olink® Library ကို ဓါတ်ခဲယမ်းထဲသို့ ချက်ခြင်းဆက်သွားပါ။

မှတ်ချက်: ပြန်လည်လည်ပတ်နိုင်ခြေရှိသောအခါတွင် Lib Tube(များ) ကို -20°C တွင် သိမ်းဆည်းပါ။

flow cell နှင့် Olink® Library ကို ဓါတ်ခဲယမ်းထဲသို့ ထည့်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ flow cell နှင့် diluted Olink Library ကို thawed reagent cartridge ထဲသို့ ထည့်ထားသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

  • ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသော 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ဓာတ်ပြုခံပုံး (100 cycles) ၊
  • 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell၊ ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသည်။
  • ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသော Seq Tube (မှေးမှိန်နေသော Olink စာကြည့်တိုက်ကို ဖွင့်ရန်အဆင်သင့်ပါ)
  • Manual pipette (100 μL)
  • ပိုက်ထိပ်ဖျား (1 mL)

ယမ်းတောင့်ကို ပြင်ဆင်ပါ။

  1. ငွေရောင်သတ္တုပြားအိတ်မှ ယမ်းတောင့်ကို ဖယ်ရှားပါ။
  2. အတွင်းမှ ဖျော်ထားသော ဖျော်ရည်များကို သေချာရောနှောရန် ယမ်းတောင့်ကို ဆယ်ကြိမ်ပြောင်းလိုက်ပါ။

မှတ်ချက်: အတွင်းပိုင်း အစိတ်အပိုင်းများ တုန်ခါသံကို ကြားရသည်မှာ ပုံမှန်ဖြစ်သည်။

flow cell ကို ယမ်းတောင့်ထဲသို့ ထည့်ပါ။
  1. ယမ်းတောင့်ထဲသို့ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို တင်ရန်အဆင်သင့်ဖြစ်သောအခါ၊ အထုပ်ထဲမှ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ဖယ်ရှားပါ။ တက်ဘ်ပေါ်ရှိ အညွှန်းကို မျက်နှာမူကာ မီးခိုးရောင်တဘ်ဖြင့် စီးဆင်းနေသောဆဲလ်ကို ကိုင်ထားပါ။ Flow cell ၏ဖန်မျက်နှာပြင်ကို မညစ်ညမ်းစေရန် အမှုန့်ကင်းသော လက်အိတ်အသစ်ကို အသုံးပြုပါ။
  2. ကျည်တောင့်၏အရှေ့ဘက်ရှိ စီးဆင်းမှုဆဲလ်အပေါက်ထဲသို့ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ထည့်သွင်းပါ။ ကြားနိုင်သော ကလစ်တစ်ခုသည် စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို မှန်ကန်စွာ နေရာချထားကြောင်း ဖော်ပြသည်။
  3. ၎င်းကိုဆွဲထုတ်ခြင်းဖြင့် မီးခိုးရောင်တက်ဘ်ကို ဖယ်ရှားပါ။

Olink® Library ကို ယမ်းတောင့်ထဲသို့ ထည့်ပါ။

  1. သန့်ရှင်းသော 1 mL pipette ထိပ်ဖျားဖြင့် စာကြည့်တိုက်ရေလှောင်ကန်ကို ဖောက်ပါ။
  2. Seq Tube မှ Olink Library ၏ 20 μL ကို စာကြည့်တိုက်လှောင်ကန်၏အောက်ခြေသို့ တင်ပါ။
Olink® ဆင့်ကဲလုပ်ဆောင်ခြင်းကို လုပ်ဆောင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ loaded flow cell နှင့် Olink Library ပါရှိသော Buffer cartridge ကို NextSeq™ 2000 သို့ တင်ဆောင်ပြီး sequencing run ကို Olink စာရွက်ကို အသုံးပြုပြီး စတင်ပါသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

  • 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 cycles) ကို NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell နှင့် ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသော အရောဝင်ထားသော Olink Library ဖြင့် တင်ဆောင်ပါသည်။

Run Mode ကို Configure လုပ်ပါ။

  1. ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲမီနူးမှ ဆက်တင်များကို ရွေးချယ်ပါ။
  2. BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support အောက်ရှိ Local Run Setup ကို ရွေးပါ။
  3. နောက်ထပ်ဆက်တင်များအဖြစ် Proactive Support Only ကိုရွေးချယ်ပါ။ ဤလုပ်ဆောင်ချက်သည် အင်တာနက်ချိတ်ဆက်မှု လိုအပ်သည်။
  4. သင့်ဒေတာအတွက် Hosting တည်နေရာကို ရွေးပါ။ Hosting Location သည် သင့်ဒေသအတွင်း သို့မဟုတ် နီးကပ်နေသင့်သည်။
  5. လက်ရှိထွက်နေသော ဒေတာအကြမ်းအတွက် အထွက်ဖိုင်တွဲတည်နေရာကို သတ်မှတ်ပါ။ သွားလာရန် ရွေးချယ်ပါ ကိုရွေးချယ်ပြီး အထွက်ဖိုင်တွဲကို ရွေးချယ်ပါ။
  6. တူရိယာပေါ်ရှိ စာကြည့်တိုက်ကို အလိုအလျောက် သန့်စင်ပြီး မှေးမှိန်ရန် Denature and Dilute On Board အမှတ်ခြစ်ကို ရွေးပါ။
  7. ယမ်းတောင့်၏ ကုန်ဆုံးသွားသော ဓါတ်ကူပစ္စည်းအကန့်သို့ အသုံးမပြုသော ဓာတ်ပစ္စည်းများကို အလိုအလျောက် ဖယ်ရှားရှင်းလင်းရန် Purge Reagent Cartridge အမှတ်ခြစ်ကို ရွေးပါ။
  8. ဆော့ဖ်ဝဲအပ်ဒိတ်များအတွက် အလိုအလျောက်စစ်ဆေးရန် ဆော့ဖ်ဝဲအပ်ဒိတ်များအတွက် Autocheck အမှတ်ခြစ်ကို ရွေးပါ။ ဤလုပ်ဆောင်ချက်သည် အင်တာနက်ချိတ်ဆက်မှု လိုအပ်သည်။
  9. Save ကို ရွေးပါ။
လည်ပတ်မှုဘောင်များကို သတ်မှတ်ပါ။

မှတ်ချက်: ဤညွှန်ကြားချက်သည် NextSeq™ 1.4/1000 ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲ၏ ဗားရှင်း 2000 နှင့် သက်ဆိုင်ပါသည်။ ဗားရှင်း v1.2 ကိုအသုံးပြုသောအခါတွင် အချို့သောအဆင့်များသည် ကွဲပြားနိုင်ပါသည်။

  1. ထိန်းချုပ်ဆော့ဖ်ဝဲမီနူးမှ Start ကိုရွေးချယ်ပါ။
  2. Manually Set Up New Run ကိုရွေးချယ်ပြီး Setup ကိုနှိပ်ပါ။
  3. Run Setup စာမျက်နှာတွင်၊ run parameters များကို အောက်ပါအတိုင်းသတ်မှတ်ပါ။
    • Run Name အကွက်တွင်၊ ထူးခြားသောစမ်းသပ်မှု ID ကိုထည့်ပါ။
    • Read Type drop-down list တွင်၊ Single Read option ကို ရွေးပါ။
    • အောက်ပါအတိုင်း သံသရာအရေအတွက်ကို ထည့်ပါ-
      • 1 ကိုဖတ်ပါ 24
      • အညွှန်း 1- 0
      • အညွှန်း 2- 0
      • 2 ကိုဖတ်ပါ 0

မှတ်ချက်: Read 1 ကို 24 ဟုသတ်မှတ်ထားရန် အရေးကြီးသည်၊ သို့မဟုတ်ပါက run တစ်ခုလုံးပျက်သွားမည်ဖြစ်သည်။ သံသရာအရေအတွက်ကိုထည့်သွင်းသောအခါသတိပေးစာများကိုလျစ်လျူရှုပါ။

  • စိတ်ကြိုက် Primer Wells drop-down list တွင် No ကို ရွေးပါ။
  • စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်း (ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်) အကွက်တွင်၊ လမ်းညွှန်ရန် ရွေးချယ်ပြီး စိတ်ကြိုက်ချက်နည်း XML ကို ရွေးချယ်ပါ။ file Olink_NSQ2K_P2_V1။ Open ကို ရွေးပါ။
  • S မတင်သွင်းပါနှင့်ample Sheet
  • Output Folder တည်နေရာမှန်ကန်ကြောင်း သေချာပါစေ။ သို့မဟုတ်ပါက၊ သွားလာရန်ရွေးချယ်ရန် ရွေးချယ်ပြီး အလိုရှိသော အထွက်ဖိုင်တွဲတည်နေရာကို ရွေးချယ်ပါ။
  • Denature and Dilute Onboard အကွက်တွင်၊ drop-down list မှ Enabled ကို ရွေးပါ။
  • Prep ကို ရွေးပါ။

တင်ထားသော ယမ်းတောင့်ကို တင်ပါ။

  1. Load ကို ရွေးပါ။ တူရိယာ visor ပွင့်လာပြီး ဗန်းကို ထုတ်ပစ်လိုက်သည်။
  2. ထုပ်ပိုးထားသော ယမ်းတောင့်ကို ဗန်းပေါ်တွင် တံဆိပ်အပေါ်သို့ မျက်နှာမူကာ ကိရိယာအတွင်းရှိ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ထားရှိပါ။
  3. Close ကို ရွေးပါ။
  4. ကျည်တောင့်ကို မှန်ကန်စွာ တင်ပြီးသည်နှင့်၊ run parameters များကို စစ်ဆေးပြီး Sequence ကို ရွေးချယ်ပါ။ တူရိယာသည် ကိရိယာနှင့် အရည်အတွက် အကြိုစစ်ဆေးမှုများကို လုပ်ဆောင်သည်။
    • မှတ်ချက်: fluidics စစ်ဆေးစဉ်အတွင်း၊ ထွက်ပေါ်လာသောအသံများစွာကို ကြားရမည်ဟု မျှော်လင့်ရသည်။
  5. အလိုအလျောက် အကြိုစစ်ဆေးမှုများ ပြီးမြောက်ပြီးနောက် (~15 မိနစ်) ပြေးစတင်ကြောင်း သေချာပါစေ။ Sequencing run time သည် ခန့်မှန်းခြေအားဖြင့် 10h30 min ဖြစ်သည်။
    • မှတ်ချက်: ကြိုတင်စစ်ဆေးခြင်း ချို့ယွင်းမှုများအတွက်၊ ထုတ်လုပ်သူ၏ ညွှန်ကြားချက်များကို ကိုးကားပါ။ ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်နေစဉ်တွင် NextSeq™ 2000 ကို ဝင်မတိုက်မိစေရန် သတိထားပါ။ ကိရိယာသည် တုန်ခါမှုကို ခံနိုင်ရည်ရှိသည်။
  6. အလုပ်ဧရိယာကို သန့်ရှင်းရေးလုပ်ပါ။

Run Progress ကို စောင့်ကြည့်ပါ။

Olink သည် s တွင်ပေးထားသောပရိုတိန်း၏အာရုံစူးစိုက်မှုကိုခန့်မှန်းရန်အတွက်လူသိများသော sequence ပမာဏကိုတွက်ချက်ရန် NGS ကိုအသုံးပြုသည်amples (အခြား s နှင့်ဆက်စပ်amples)။ Explore sequencing run တစ်ခုစီမှ ဒေတာအရည်အသွေးကို Olink နည်းပညာ၏ သီးခြား QC ကန့်သတ်ဘောင်များဖြင့် ဆုံးဖြတ်သည်။ ထို့ကြောင့် Q-score ကဲ့သို့သော သမားရိုးကျ NGS တွင်အသုံးပြုသည့် စံအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုမက်ထရစ်များသည် အရေးပါမှုနည်းပါးသည်။

ပြေးပြီးနောက် ယမ်းတောင့်ကို ထုတ်ပြီး လွှင့်ပစ်ပါ။

သတိပေးချက်- ဤဓာတ်ပစ္စည်းအစုံတွင် အန္တရာယ်ဖြစ်စေနိုင်သော ဓာတုပစ္စည်းများပါရှိသည်။ လုံလောက်သော အကာအကွယ်ပစ္စည်းများကို ဝတ်ဆင်ပြီး သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အသုံးပြုထားသော ဓာတ်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။ ပိုမိုသိရှိလိုပါက၊ Illumina NextSeq 1000 နှင့် 2000 စနစ်လမ်းညွှန် (document #1000000109376) ကို ကိုးကားပါ။

  1. Run ပြီးပါက Eject Cartridge ကိုရွေးချယ်ပါ။
    • မှတ်ချက်: flow cell အပါအဝင် အသုံးပြုထားသော ယမ်းတောင့်ကို နောက်တစ်ကြိမ် လည်ပတ်သည်အထိ ထားနိုင်သော်လည်း 3 ရက်ထက် မပိုစေရ။
  2. ယမ်းတောင့်ကို ဗန်းထဲမှ ဖယ်ရှားပါ။
  3. သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ ဓာတ်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။
  4. Close Door ကို ရွေးပါ။ ဗန်းကို ပြန်တင်သည်။
  5. ပင်မစာမျက်နှာသို့ ပြန်သွားရန် ပင်မကို ရွေးပါ။
    • မှတ်ချက်: ယမ်းတောင့်တွင် စနစ်လည်ပတ်ရန် ယန္တရားများအားလုံးအပြင် အသုံးပြုပြီးသား ဓာတ်ပစ္စည်းများ စုဆောင်းရန် လှောင်ကန်တစ်ခုပါရှိသောကြောင့် လည်ပတ်ပြီးနောက် ဆေးကြောရန် ကိရိယာမလိုအပ်ပါ။

ပြန်လည်ပြင်ဆင်မှုမှတ်တမ်း

ဗားရှင်း ရက်စွဲ ဖော်ပြချက်
1.0 ၇၃၆-၇၈၄-၆၀၉၄ အသစ်

www.olink.com

သုတေသနအတွက်သာ အသုံးပြုရန်။ ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ထုံးလုပ်နည်းများတွင် အသုံးပြုရန်မဟုတ်ပါ။

ဤထုတ်ကုန်တွင် Olink ထုတ်ကုန်များကို စီးပွားဖြစ်မဟုတ်သော အသုံးပြုမှုအတွက် လိုင်စင်တစ်ခု ပါဝင်သည်။ ကူးသန်းရောင်းဝယ်ရေးအသုံးပြုသူများသည် နောက်ထပ်လိုင်စင်များ လိုအပ်နိုင်ပါသည်။ အသေးစိတ်အချက်အလက်များအတွက် Olink Proteomics AB သို့ ဆက်သွယ်ပါ။ ဤဖော်ပြချက်ထက် ကျော်လွန်သော အာမခံချက်များ၊ ဖော်ပြခြင်း သို့မဟုတ် အဓိပ္ပာယ်ဖွင့်ဆိုခြင်း မရှိပါ။ Olink Proteomics AB သည် ဤထုတ်ကုန်ကြောင့် ဖြစ်ပေါ်လာသော ပစ္စည်းပျက်စီးမှု၊ ကိုယ်ရေးကိုယ်တာ ထိခိုက်ဒဏ်ရာရမှု သို့မဟုတ် စီးပွားရေးဆုံးရှုံးမှုများအတွက် တာဝန်မကင်းပါ။ အောက်ပါကုန်အမှတ်တံဆိပ်ကို Olink Proteomics AB: Olink® မှပိုင်ဆိုင်သည်။ ဤထုတ်ကုန်တွင် ရရှိနိုင်သော မူပိုင်ခွင့်များနှင့် မူပိုင်ခွင့်လျှောက်လွှာများစွာဖြင့် အကျုံးဝင်ပါသည်။ https://www.olink.com/patents/.

© မူပိုင်ခွင့် 2021 Olink Proteomics AB ပြင်ပကုမ္ပဏီ အမှတ်တံဆိပ်များအားလုံးသည် ၎င်းတို့၏ သက်ဆိုင်ရာပိုင်ရှင်များ၏ ပိုင်ဆိုင်မှုဖြစ်သည်။

Olink Proteomics၊ Dag Hammarskjölds väg 52B ၊ SE-752 37 Uppsala၊ ဆွီဒင်

1193, v1.0, 2021-12-01

စာရွက်စာတမ်းများ / အရင်းအမြစ်များ

Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing စနစ် [pdf] အသုံးပြုသူလက်စွဲ
NextSeq 2000၊ Explore Sequencing System၊ NextSeq 2000 Explore Sequencing System

ကိုးကား

မှတ်ချက်တစ်ခုချန်ထားပါ။

သင့်အီးမေးလ်လိပ်စာကို ထုတ်ပြန်မည်မဟုတ်ပါ။ လိုအပ်သောအကွက်များကို အမှတ်အသားပြုထားသည်။ *