Olink NextSeq 2000 એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ સિસ્ટમ

દસ્તાવેજ નોંધ

Olink® એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલ, doc nr 1153, અપ્રચલિત છે, અને તેને નીચેના દસ્તાવેજો દ્વારા બદલવામાં આવ્યું છે:

• Olink® અન્વેષણ ઓવરview વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, દસ્તાવેજ એનઆર 1187
• ઓલિંક® એક્સપ્લોર 384 યુઝર મેન્યુઅલ, દસ્તાવેજ એનઆર 1188
• Olink® એક્સપ્લોર 4 x 384 વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, દસ્તાવેજ nr 1189
• ઓલિંક® એક્સપ્લોર 1536 અને વિસ્તરણ વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, દસ્તાવેજ એનઆર 1190
• ઓલિંક® એક્સપ્લોર 3072 યુઝર મેન્યુઅલ, દસ્તાવેજ એનઆર 1191
• Olink® NextSeq 550 વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, doc nr 1192 નો ઉપયોગ કરીને ક્રમનું અન્વેષણ કરો
• Olink® NextSeq 2000 વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, doc nr 1193 નો ઉપયોગ કરીને ક્રમનું અન્વેષણ કરો
• Olink® NovaSeq 6000 યુઝર મેન્યુઅલ, doc nr 1194 નો ઉપયોગ કરીને ક્રમનું અન્વેષણ કરો

પરિચય

હેતુપૂર્વક ઉપયોગ

ઓલિંક® એક્સપ્લોર એ માનવ પ્રોટીન બાયોમાર્કરની શોધ માટે મલ્ટિપ્લેક્સ ઇમ્યુનોસે પ્લેટફોર્મ છે. ઉત્પાદનનો હેતુ માત્ર સંશોધનના ઉપયોગ માટે છે, અને ડાયગ્નોસ્ટિક પ્રક્રિયાઓમાં ઉપયોગ માટે નથી. લેબોરેટરીનું કામ માત્ર પ્રશિક્ષિત લેબોરેટરી સ્ટાફ દ્વારા જ ચલાવવામાં આવશે. ડેટા પ્રોસેસિંગ માત્ર પ્રશિક્ષિત સ્ટાફ દ્વારા જ કરવામાં આવશે. પરિણામો સંશોધકો દ્વારા અન્ય ક્લિનિકલ અથવા લેબોરેટરી તારણો સાથે ઉપયોગમાં લેવાના છે.

આ માર્ગદર્શિકા વિશે

આ વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા Illumina® NextSeq™ 2000 પર Olink® એક્સપ્લોર લાઇબ્રેરીઓને અનુક્રમિત કરવા માટે જરૂરી સૂચનાઓ પ્રદાન કરે છે. સૂચનાઓનું સખત અને સ્પષ્ટપણે પાલન કરવું આવશ્યક છે. પ્રયોગશાળાના તમામ પગલાઓમાં કોઈપણ વિચલનો ક્ષતિગ્રસ્ત ડેટામાં પરિણમી શકે છે. લેબોરેટરી વર્કફ્લો શરૂ કરતા પહેલા, ઓલિંક® એક્સપ્લોર ઓવરની સલાહ લોview પ્લેટફોર્મના પરિચય માટે વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, જેમાં રીએજન્ટ્સ, સાધનો અને જરૂરી દસ્તાવેજો વિશેની માહિતીનો સમાવેશ થાય છે.view વર્કફ્લો, તેમજ લેબોરેટરી માર્ગદર્શિકા તરીકે. Olink® એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ્સ કેવી રીતે ચલાવવી તે અંગેની સૂચનાઓ માટે, લાગુ પડતા Olink® એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલનો સંદર્ભ લો. ઓલિંક® એક્સપ્લોર સિક્વન્સ પરિણામોના ડેટા પ્રોસેસિંગ અને વિશ્લેષણ માટે, ઓલિંક® માયડેટા ક્લાઉડ વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકાનો સંદર્ભ લો. આ સામગ્રીમાં સમાવિષ્ટ તમામ ટ્રેડમાર્ક્સ અને કૉપિરાઇટ્સ Olink® Proteomics AB ની મિલકત છે, સિવાય કે અન્યથા જણાવ્યું હોય.

ટેકનિકલ સપોર્ટ

તકનીકી સપોર્ટ માટે, ઓલિંક પ્રોટીઓમિક્સનો અહીં સંપર્ક કરો: support@olink.com.

લેબોરેટરી સૂચનાઓ

આ પ્રકરણ NextSeq™ 2000/1000 P2000 રીએજન્ટ્સ (2 સાયકલ) v100 નો ઉપયોગ કરીને NextSeq™ 3 પર ઓલિંક લાઇબ્રેરીઓને કેવી રીતે અનુક્રમિત કરવી તે અંગેની સૂચનાઓ પ્રદાન કરે છે. સિક્વન્સિંગ માટે વપરાતો પ્રોટોકોલ એ Illumina® NextSeq™ 2000 માટે Illumina® સ્ટાન્ડર્ડ NGS વર્કફ્લોનું અનુકૂલન છે. ક્રમમાં આગળ વધતા પહેલા, ખાતરી કરો કે શુદ્ધ કરેલ ઓલિંક લાઇબ્રેરીની ગુણવત્તા ચકાસવામાં આવી છે. ગુણવત્તા નિયંત્રણ વિશેની સૂચનાઓ માટે લાગુ ઓલિંક એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલનો સંદર્ભ લો.

સિક્વન્સિંગ રનની યોજના બનાવો

એક ઓલિંક લાઇબ્રેરી નેક્સ્ટસેક™ 2000 P2 ફ્લો સેલ અને રન દીઠ અનુક્રમિત કરી શકાય છે. વિવિધ ઓલિંક એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ્સને અનુક્રમિત કરવા માટે જરૂરી P2 ફ્લો સેલ અને રનની સંખ્યા કોષ્ટક 1 માં વર્ણવેલ છે. જો એક કરતા વધુ રન જરૂરી હોય, તો આ માર્ગદર્શિકામાં વર્ણવેલ સૂચનાઓનું પુનરાવર્તન કરો.

કોષ્ટક 1. સિક્વન્સિંગ રન પ્લાનિંગ

ઓલિંક® એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ	ઓલિંક પુસ્તકાલયોની સંખ્યા	ફ્લો સેલ(કો) અને રન(ઓ) ની સંખ્યા
Olink® એક્સપ્લોર 384 રીએજન્ટ કિટ	1	1
ઓલિંક® એક્સપ્લોર 4 x 384 રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સપ્લોર 1536 રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સ્પ્લોર એક્સ્પાન્સન રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સપ્લોર 3072 રીએજન્ટ કિટ	8	8

Olink® કસ્ટમ રેસીપી ઇન્સ્ટોલ કરો

સેવ કરો ઓલિંક કસ્ટમ રેસીપી xml-file યોગ્ય સાધન ફોલ્ડરમાં Olink_NSQ2K_P2_V1.

નોંધ: ઓલિંક કસ્ટમ રેસીપી ફક્ત NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 કિટ અને NextSeq™ 1000/2000 કંટ્રોલ સોફ્ટવેર v1.2 અથવા v1.4 સાથે જ કામ કરશે.

સિક્વન્સિંગ રીએજન્ટ્સ તૈયાર કરો

આ પગલા દરમિયાન, ક્લસ્ટરિંગ અને સિક્વન્સિંગ રીએજન્ટ્સ ધરાવતા રીએજન્ટ કારતૂસને પીગળવામાં આવે છે અને ફ્લો સેલ તૈયાર થાય છે.

ચેતવણી: રીએજન્ટ કારતૂસમાં સંભવિત જોખમી રસાયણો હોય છે. પર્યાપ્ત રક્ષણાત્મક સાધનો પહેરો અને લાગુ ધોરણો અનુસાર વપરાયેલ રીએજન્ટ્સનો ત્યાગ કરો. વધુ માહિતી માટે, Illumina NextSeq 1000 અને 2000 સિસ્ટમ માર્ગદર્શિકા (દસ્તાવેજ #1000000109376) નો સંદર્ભ લો.

રીએજન્ટ કારતૂસ તૈયાર કરો

ન ખોલેલા કારતૂસને પીગળવું ત્રણ અલગ અલગ પદ્ધતિઓનો ઉપયોગ કરીને કરી શકાય છે: ઓરડાના તાપમાને, નિયંત્રિત પાણીના સ્નાનમાં અથવા રેફ્રિજરેટરમાં.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 રીએજન્ટ કારતૂસ (100 ચક્ર)

સૂચનાઓ

1. કોષ્ટક 2 માં વર્ણવ્યા મુજબ રીએજન્ટ કારતૂસને પીગળી દો.

કોષ્ટક 2. રીએજન્ટ કારતૂસ પીગળવાની પદ્ધતિઓ

પીગળવાની પદ્ધતિ	સૂચનાઓ
ઓરડાના તાપમાને	સિલ્વર ફોઇલ બેગ ખોલ્યા વિના, બેન્ચ પર સ્થિર રીએજન્ટ કારતૂસ મૂકો અને તેને ઓરડાના તાપમાને 9 કલાક સુધી પીગળી દો. 16 કલાકથી વધુ નહીં. ખાતરી કરો કે બેગનું લેબલ ઉપરનું છે અને તે હવા કારતૂસની આસપાસ ફરે છે.
પાણીના સ્નાનમાં	ચાંદીના વરખની થેલી ખોલ્યા વિના, સ્થિર રીએજન્ટ કારતૂસને અડધી ડૂબીને નિયંત્રિત 25 °C પાણીના સ્નાનમાં મૂકો અને તેને 6 કલાક સુધી ઓગળવા દો. 8 કલાકથી વધુ નહીં. ખાતરી કરો કે બેગનું લેબલ ઉપરનું હોય અને કારતૂસ પીગળતી વખતે ઊંધી ન જાય. કાગળના ટુવાલથી કારતૂસને સારી રીતે સૂકવી દો.
રેફ્રિજરેટરમાં	સિલ્વર ફોઇલ બેગ ખોલ્યા વિના, કારતૂસને બેન્ચ પર મૂકો અને તેને ઓરડાના તાપમાને 6 કલાક સુધી પીગળી દો. ખાતરી કરો કે બેગનું લેબલ ઉપરનું છે અને તે હવા કારતૂસની આસપાસ ફરે છે. કારતૂસને 12 કલાક માટે રેફ્રિજરેટરમાં પીગળવાનું સમાપ્ત કરો. 72 કલાકથી વધુ નહીં. દોડતા પહેલા, રેફ્રિજરેટરમાંથી ઓગળેલા ન ખોલેલા કારતૂસને દૂર કરો અને તેને ઓછામાં ઓછા 15 મિનિટ દરમિયાન ઓરડાના તાપમાને પહોંચવા દો, પરંતુ 1 કલાકથી વધુ નહીં.

નોંધ: ઓગળેલા કારતુસને ફરી સ્થિર કરી શકાતું નથી અને મહત્તમ 4 કલાક માટે 72 °C તાપમાને સંગ્રહિત કરવું આવશ્યક છે.

ફ્લો સેલ તૈયાર કરો

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ફ્લો સેલ

સૂચનાઓ

1. રેફ્રિજરેટેડ ફ્લો સેલને ઓરડાના તાપમાને 10-15 મિનિટ માટે લાવો.

સિક્વન્સિંગ માટે ઓલિંક® લાઇબ્રેરી તૈયાર કરો

આ પગલા દરમિયાન, શુદ્ધ અને ગુણવત્તા નિયંત્રિત ઓલિંક લાઇબ્રેરીને અંતિમ લોડિંગ સાંદ્રતામાં પાતળું કરવામાં આવે છે. નોંધ કરો કે લાઇબ્રેરી ડિનેચરેશન ઓનબોર્ડ ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટમાં આપમેળે કરવામાં આવે છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• લિબ ટ્યુબ, લાગુ ઓલિંક એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલ અનુસાર તૈયાર
• ટ્વીન 1 સાથે 20x RSB
• MilliQ પાણી
• 2x માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (1.5 એમએલ)
• મેન્યુઅલ પીપેટ (10, 100 અને 1000 μL)
• ફિલ્ટર પીપેટ ટીપ્સ

તમે શરૂ કરો તે પહેલાં

• લિબ ટ્યુબ થીજી જાય તો પીગળી લો.
• સ્થિર RSB ને ટ્વીન 20 વડે ઓરડાના તાપમાને 10 મિનિટ સુધી પીગળી લો. ઉપયોગ થાય ત્યાં સુધી +4 °C પર સ્ટોર કરો.
• બે નવી 1.5 એમએલ માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબને નીચે પ્રમાણે ચિહ્નિત કરો:
  • એક ટ્યુબ "દિલ" ચિહ્નિત કરો (1:100 પાતળી લાઇબ્રેરી માટે)
  • એક ટ્યુબ "Seq" ચિહ્નિત કરો (લાઇબ્રેરી લોડ કરવા માટે તૈયાર માટે)

સૂચનાઓ

1. દિલ ટ્યુબમાં 495 μL MilliQ પાણી ઉમેરો.
2. લિબ ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
3. લિબ ટ્યુબમાંથી દિલ ટ્યુબમાં 5 μL મેન્યુઅલી ટ્રાન્સફર કરો.
4. દિલ ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
5. સેક ટ્યુબમાં ટ્વીન 20 સાથે 20 μL RBS ઉમેરો.
6. મેન્યુઅલી 20 μL દિલ ટ્યુબમાંથી સેક ટ્યુબમાં ટ્રાન્સફર કરો.
7. સેક ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
8. તરત જ 2.5 લોડ ફ્લો સેલ અને ઓલિંક® લાઇબ્રેરીને રીએજન્ટ કારતૂસમાં ચાલુ રાખો.

નોંધ: સંભવિત પુનઃરચના કિસ્સામાં લિબ ટ્યુબને -20 ડિગ્રી સેલ્સિયસ પર સ્ટોર કરો.

ફ્લો સેલ અને ઓલિંક® લાઇબ્રેરીને રીએજન્ટ કારતૂસમાં લોડ કરો

આ પગલા દરમિયાન, ફ્લો સેલ અને ઓલિંક લાઇબ્રેરીને ઓગળેલા રીએજન્ટ કારતૂસમાં લોડ કરવામાં આવે છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x ઓગળેલું NextSeq™ 1000/2000 P2 રીએજન્ટ કારતૂસ (100 ચક્ર), અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ફ્લો સેલ, અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• Seq ટ્યુબ (ઓલિંક લાઇબ્રેરીને પાતળું લોડ કરવા માટે તૈયાર સાથે), અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• મેન્યુઅલ પીપેટ (100 μL)
• પીપેટ ટીપ (1 એમએલ)

કારતૂસ તૈયાર કરો

1. સિલ્વર ફોઇલ બેગમાંથી કારતૂસ દૂર કરો.
2. અંદર ઓગળેલા રીએજન્ટ્સને સારી રીતે મિશ્રિત કરવા માટે કારતૂસને દસ વખત ઉલટાવો.

નોંધ: આંતરિક ઘટકોની ઝણઝણાટી સાંભળવી સામાન્ય છે.

કારતૂસમાં ફ્લો સેલ લોડ કરો

1. જ્યારે કારતૂસમાં ફ્લો સેલ લોડ કરવા માટે તૈયાર હોય, ત્યારે ફ્લો સેલને પેકેજમાંથી દૂર કરો. ટેબ પરના લેબલને ઉપર તરફ રાખીને, ગ્રે ટેબ દ્વારા ફ્લો સેલને પકડી રાખો. ફ્લો સેલની કાચની સપાટીને દૂષિત ન કરવા માટે નવા પાવડર ફ્રી મોજાનો ઉપયોગ કરો.
2. કારતૂસના આગળના ભાગમાં ફ્લો સેલ સ્લોટમાં ફ્લો સેલ દાખલ કરો. એક શ્રાવ્ય ક્લિક સૂચવે છે કે ફ્લો સેલ યોગ્ય રીતે મૂકવામાં આવ્યો છે.
3. ગ્રે ટેબને ખેંચીને દૂર કરો.

કારતૂસમાં Olink® લાઇબ્રેરી લોડ કરો

1. લાઇબ્રેરીના જળાશયને સ્વચ્છ 1 એમએલ પીપેટ ટીપથી વીંધો.
2. ઓલિંક લાઇબ્રેરીના 20 μLને Seq ટ્યુબમાંથી લાઇબ્રેરીના જળાશયના તળિયે લોડ કરો.

Olink® સિક્વન્સિંગ રન કરો

આ પગલા દરમિયાન, લોડ કરેલ ફ્લો સેલ અને ઓલિંક લાઇબ્રેરી સાથેનું બફર કારતૂસ નેક્સ્ટસેક™ 2000 માં લોડ કરવામાં આવે છે, અને ઓલિંક રેસીપીનો ઉપયોગ કરીને સિક્વન્સિંગ રન શરૂ થાય છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 રીએજન્ટ કારતૂસ (100 સાયકલ) નેક્સ્ટસેક™ 1000/2000 P2 ફ્લો સેલ અને પાછલા પગલામાં તૈયાર કરેલ ઓલિંક લાઇબ્રેરી સાથે લોડ થયેલ છે.

રન મોડને ગોઠવો

1. કંટ્રોલ સોફ્ટવેર મેનૂમાંથી, સેટિંગ્સ પસંદ કરો.
2. BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support હેઠળ, લોકલ રન સેટઅપ પસંદ કરો.
3. પ્રોએક્ટિવ સપોર્ટ ફક્ત વધારાના સેટિંગ્સ તરીકે પસંદ કરો. આ કાર્યને ઇન્ટરનેટ કનેક્શનની જરૂર છે.
4. તમારા ડેટા માટે હોસ્ટિંગ સ્થાન પસંદ કરો. હોસ્ટિંગ સ્થાન તમારા પ્રદેશમાં અથવા તેની નજીક હોવું જોઈએ.
5. વર્તમાન રન કાચા ડેટા માટે આઉટપુટ ફોલ્ડર સ્થાન સેટ કરો. નેવિગેટ કરવા માટે પસંદ કરો પસંદ કરો અને આઉટપુટ ફોલ્ડર પસંદ કરો.
6. ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટ ઓનબોર્ડ લાઇબ્રેરીને આપમેળે ડિનેચર અને પાતળું કરવા માટે ડેનેચર અને ડિલ્યુટ ઓન બોર્ડ ચેકબોક્સ પસંદ કરો.
7. કારતૂસના ખર્ચાયેલા રીએજન્ટ કમ્પાર્ટમેન્ટમાં ન વપરાયેલ રીએજન્ટ્સને આપમેળે શુદ્ધ કરવા માટે પર્જ રીએજન્ટ કારતૂસ ચેકબોક્સ પસંદ કરો.
8. સૉફ્ટવેર અપડેટ્સ (વૈકલ્પિક) માટે આપમેળે તપાસવા માટે સૉફ્ટવેર અપડેટ્સ માટે ઑટોચેક ચેકબોક્સ પસંદ કરો. આ કાર્યને ઇન્ટરનેટ કનેક્શનની જરૂર છે.
9. સાચવો પસંદ કરો.

રન પરિમાણો સેટ કરો

નોંધ: આ સૂચના NextSeq™ 1.4/1000 કંટ્રોલ સૉફ્ટવેરના સંસ્કરણ 2000 પર લાગુ થાય છે. સંસ્કરણ v1.2 નો ઉપયોગ કરતી વખતે નીચે વર્ણવેલ કેટલાક પગલાં અલગ હોઈ શકે છે

1. કંટ્રોલ સોફ્ટવેર મેનૂમાંથી, સ્ટાર્ટ પસંદ કરો.
2. મેન્યુઅલી સેટ અપ ન્યૂ રન પસંદ કરો અને સેટઅપ દબાવો.
3. રન સેટઅપ પેજમાં, રન પેરામીટર્સ નીચે પ્રમાણે સેટ કરો:
   • Run Name ફીલ્ડમાં, એક અનન્ય પ્રયોગ ID દાખલ કરો.
   • રીડ ટાઈપ ડ્રોપ-ડાઉન લિસ્ટમાં, સિંગલ રીડ વિકલ્પ પસંદ કરો.
   • નીચે પ્રમાણે ચક્રની સંખ્યા દાખલ કરો:
     • વાંચો 1: 24
     • અનુક્રમણિકા 1: 0
     • અનુક્રમણિકા 2: 0
     • વાંચો 2: 0

નોંધ: તે નિર્ણાયક છે કે રીડ 1 24 પર સેટ છે, અન્યથા સમગ્ર રન નિષ્ફળ જશે. ચક્રની સંખ્યા દાખલ કરતી વખતે ચેતવણી સંદેશાઓને અવગણો.

• કસ્ટમ પ્રાઈમર વેલ્સ ડ્રોપ-ડાઉન સૂચિમાં, નંબર પસંદ કરો.
• કસ્ટમ રેસીપી (વૈકલ્પિક) ફીલ્ડમાં, નેવિગેટ કરવા માટે પસંદ કરો પસંદ કરો અને કસ્ટમ રેસીપી XML પસંદ કરો file Olink_NSQ2K_P2_V1. ઓપન પસંદ કરો.
• એસ આયાત કરશો નહીંampલે શીટ.
• ખાતરી કરો કે આઉટપુટ ફોલ્ડર સ્થાન સાચું છે. નહિંતર, નેવિગેટ કરવા માટે પસંદ કરો પસંદ કરો અને ઇચ્છિત આઉટપુટ ફોલ્ડર સ્થાન પસંદ કરો.
• ડેનેચર અને ડિલ્યુટ ઓનબોર્ડ ફીલ્ડમાં, ડ્રોપ-ડાઉન સૂચિમાંથી સક્ષમ પસંદ કરો.
• તૈયારી પસંદ કરો.

લોડ કરેલ કારતૂસ લોડ કરો

1. લોડ પસંદ કરો. ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટ વિઝર ખુલે છે અને ટ્રે બહાર નીકળી જાય છે.
2. લોડ કરેલા કારતૂસને ટ્રે પર લેબલની તરફ અને સાધનની અંદર ફ્લો સેલ સાથે મૂકો.
3. બંધ કરો પસંદ કરો.
4. એકવાર કારતૂસ યોગ્ય રીતે લોડ થઈ જાય, પછી રન પેરામીટર્સ ચકાસો અને ક્રમ પસંદ કરો. સાધન સાધન અને પ્રવાહી માટે પ્રી-રન તપાસ કરે છે.
   • નોંધ: ફ્લુડિક્સ તપાસ દરમિયાન, તે ઘણા પોપિંગ અવાજો સાંભળવાની અપેક્ષા છે.
5. ખાતરી કરો કે ઑટોમેટિક પ્રી-રન ચેક્સ પૂર્ણ થયા પછી રન શરૂ થાય છે (~15 મિનિટ). સિક્વન્સિંગ રન ટાઇમ આશરે 10h30 મિનિટ છે.
   • નોંધ: કોઈપણ પ્રી-રન ચેક નિષ્ફળતા માટે, ઉત્પાદકની સૂચનાઓનો સંદર્ભ લો. સિક્વન્સિંગ રન દરમિયાન NextSeq™ 2000 સાથે ટક્કર ન થાય અથવા અન્યથા ખલેલ ન પહોંચે તેની કાળજી રાખો. સાધન સ્પંદનો પ્રત્યે સંવેદનશીલ છે.
6. કાર્યક્ષેત્રને સાફ કરો.

રન પ્રોગ્રેસનું નિરીક્ષણ કરો

ઓલિંક s માં આપેલ પ્રોટીનની સાંદ્રતાનો અંદાજ કાઢવા માટે જાણીતા ક્રમની માત્રાને માપવા માટે રીડઆઉટ તરીકે NGS નો ઉપયોગ કરે છે.ampલેસ (અન્ય s સાથે સંબંધિતampલેસ). દરેક એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ રનમાંથી ડેટા ગુણવત્તા મુખ્યત્વે ઓલિંક ટેક્નોલોજી માટે વિશિષ્ટ QC પરિમાણો દ્વારા નક્કી કરવામાં આવે છે. તેથી, પરંપરાગત NGS માં વપરાતા પ્રમાણભૂત ગુણવત્તા નિયંત્રણ મેટ્રિક્સ, જેમ કે Q-સ્કોર, ઓછા મહત્વપૂર્ણ છે.

દોડ્યા પછી કારતૂસને બહાર કાઢો અને કાઢી નાખો

ચેતવણી: રીએજન્ટ્સના આ સમૂહમાં સંભવિત જોખમી રસાયણો હોય છે. પર્યાપ્ત રક્ષણાત્મક સાધનો પહેરો અને લાગુ ધોરણો અનુસાર વપરાયેલ રીએજન્ટ્સનો ત્યાગ કરો. વધુ માહિતી માટે, Illumina NextSeq 1000 અને 2000 સિસ્ટમ માર્ગદર્શિકા (દસ્તાવેજ #1000000109376) નો સંદર્ભ લો.

1. જ્યારે રન પૂર્ણ થાય, ત્યારે કારતૂસને બહાર કાઢો પસંદ કરો.
   • નોંધ: ફ્લો સેલ સહિત વપરાયેલ કારતૂસને આગલા રન સુધી જગ્યાએ છોડી શકાય છે, પરંતુ 3 દિવસથી વધુ નહીં.
2. ટ્રેમાંથી કારતૂસ દૂર કરો.
3. લાગુ ધોરણો અનુસાર રીએજન્ટ્સનો નિકાલ કરો.
4. ક્લોઝ ડોર પસંદ કરો. ટ્રે ફરીથી લોડ કરવામાં આવે છે.
5. હોમ સ્ક્રીન પર પાછા ફરવા માટે હોમ પસંદ કરો.
   • નોંધ: કારતૂસમાં સિસ્ટમ ચલાવવા માટેની તમામ પદ્ધતિઓ, તેમજ વપરાયેલ રીએજન્ટ્સ એકત્રિત કરવા માટે એક જળાશય શામેલ હોવાથી, રન કર્યા પછી કોઈ સાધન ધોવાની જરૂર નથી.

પુનરાવર્તન ઇતિહાસ

સંસ્કરણ	તારીખ	વર્ણન
1.0	2021-12-01	નવી

www.olink.com

સંશોધન ઉપયોગ માટે જ. ડાયગ્નોસ્ટિક પ્રક્રિયાઓમાં ઉપયોગ માટે નથી.

આ ઉત્પાદનમાં ઓલિંક ઉત્પાદનોના બિન-વ્યાવસાયિક ઉપયોગ માટેનું લાઇસન્સ શામેલ છે. વાણિજ્યિક વપરાશકર્તાઓને વધારાના લાઇસન્સની જરૂર પડી શકે છે. વિગતો માટે કૃપા કરીને Olink Proteomics AB નો સંપર્ક કરો. ત્યાં કોઈ વોરંટી નથી, વ્યક્ત અથવા ગર્ભિત, જે આ વર્ણનની બહાર વિસ્તરે છે. Olink Proteomics AB આ ઉત્પાદનને કારણે મિલકતના નુકસાન, વ્યક્તિગત ઈજા અથવા આર્થિક નુકસાન માટે જવાબદાર નથી. નીચેના ટ્રેડમાર્કની માલિકી Olink Proteomics AB છે: Olink®. આ પ્રોડક્ટ પર ઉપલબ્ધ અનેક પેટન્ટ અને પેટન્ટ એપ્લિકેશન્સ દ્વારા આવરી લેવામાં આવે છે https://www.olink.com/patents/.

© કૉપિરાઇટ 2021 Olink Proteomics AB. બધા તૃતીય-પક્ષ ટ્રેડમાર્ક્સ તેમના સંબંધિત માલિકોની મિલકત છે.

Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, Sweden

1193, v1.0, 2021-12-01

દસ્તાવેજો / સંસાધનો

Olink NextSeq 2000 એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ સિસ્ટમ [પીડીએફ] વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા NextSeq 2000, અન્વેષણ સિક્વન્સિંગ સિસ્ટમ, NextSeq 2000 એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ સિસ્ટમ

સંદર્ભો

• વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા