Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing System
Fa'amatalaga pepa
O le Olink® Explore User manual, doc nr 1153, ua le toe aoga, ma ua suia i pepa nei:
- Olink® Su'esu'e I lugaview Tusi Taiala, doc nr 1187
- Olink® Explore 384 User Manual, doc nr 1188
- Olink® Su'esu'e 4 x 384 Tusi Taiala, doc nr 1189
- Olink® Explore 1536 & Expansion User Manual, doc nr 1190
- Olink® Explore 3072 User Manual, doc nr 1191
- Olink® Explore Sequencing e fa'aaoga ai le NextSeq 550 User Manual, doc nr 1192
- Olink® Explore Sequencing e fa'aaoga ai le NextSeq 2000 User Manual, doc nr 1193
- Olink® Su'esu'e Fa'asologa e fa'aaoga ai le NovaSeq 6000 User Manual, doc nr 1194
Folasaga
Fa'aaogā fa'amoemoe
Olink® Explore ose multix immunoassay platform mo le su'esu'eina o meaola fa'aola ole polotini a le tagata. O le oloa e fa'amoemoe mo su'esu'ega na'o le fa'aoga, ae le mo le fa'aogaina i faiga fa'ata'ita'iga. O galuega su'esu'e e na'o tagata faigaluega su'esu'e ua a'oa'oina. E na'o le aufaigaluega ua a'oa'oina le fa'agaioiina o fa'amaumauga. O fa'ai'uga e fa'atatau e fa'aoga e tagata su'esu'e fa'atasi ma isi su'esu'ega ile falema'i po'o su'esu'ega.
E uiga i lenei tusi lesona
O lenei Tusi Taiala e tu'uina atu ai fa'atonuga e mana'omia e fa'asologa ai le Olink® Explore Libraries i le Illumina® NextSeq™ 2000. O fa'atonuga e tatau ona mulimulita'ia ma le manino. So'o se 'ese'ese i la'asaga uma ile falesu'esu'e e ono fa'aletonu fa'amaumauga. A'o le'i amataina le galuega su'esu'e, fa'afeso'ota'i le Olink® Explore Overview User Manual mo se folasaga i le tulaga, e aofia ai faʻamatalaga e uiga i reagents, meafaigaluega ma faʻamaumauga e manaʻomia, faʻamutainaview o le fa'asologa o galuega, fa'apea fo'i ta'iala mo falesu'esu'e. Mo fa'atonuga ile faiga ole Olink® Explore Reagent Kits, tagai ile Olink® Explore User Manual. Mo fa'amaumauga ma au'ili'iliga o fa'ai'uga fa'asologa o le Olink® Explore, fa'asino ile Olink® MyData Cloud User Guide. O fa'ailoga uma ma puletaofia o lo'o i totonu o lenei mea o mea ia a Olink® Proteomics AB, se'i vagana ua ta'ua.
Fesoasoani fa'apitoa
Mo fesoasoani fa'apitoa, fa'afeso'ota'i le Olink proteomics ile: support@olink.com.
Fa'atonuga a le fale su'esu'e
O lenei mataupu o loʻo tuʻuina atu ai faʻatonuga ile faʻasologa o Olink Libraries ile NextSeq™ 2000 e faʻaaoga ai le NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3. O le faʻasalalauga faʻaogaina mo le faʻasologa o se fetuutuunaiga o le Illumina® standard NGS workflow mo Illumina® NextSeq™ 2000. Aʻo leʻi faʻagasolo i le faʻasologa, ia mautinoa ua faʻamaonia le lelei o le Faletusi Olink mama. Va'ai ile Olink Explore User Manual mo fa'atonuga e uiga ile fa'atonuga lelei.
Fuafua le faasologa o le faasologa
E tasi le Faletusi o Olink e mafai ona fa'asologa i le NextSeq™ 2000 P2 fa'agasolo cell ma ta'avale. Ole numera ole P2 fa'agasolo sela ma ta'avale e mana'omia e fa'asologa ai le Olink Explore Reagent Kits o lo'o fa'amatalaina ile Laulau 1. Afai e sili atu ma le tasi le ta'avale, toe fai fa'atonuga o lo'o fa'amatalaina i lenei tusi lesona.
Fuafuaga 1. Fa'asologa o le fa'asologa o fuafuaga
| Olink® Su'esu'e Reagent Kit | Numera o Olink Libraries | Numera o sela (s) tafe ma ta'e(s) |
| Olink® Su'esu'e 384 Reagent Kit | 1 | 1 |
| Olink® Su'esu'e 4 x 384 Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Su'esu'e 1536 Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Su'esu'e Fa'alautele Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Su'esu'e 3072 Reagent Kit | 8 | 8 |
Fa'apipi'i le fua masani a le Olink®
Faasaoina le fua masani a le Olink xml-file Olink_NSQ2K_P2_V1 i totonu o se pusa meafaigaluega talafeagai.
FAAMANATU: Ole fua masani ole Olink ole a na'o le NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 kit ma le NextSeq™ 1000/2000 control software v1.2 po'o le v1.4.
Sauni sequencing reagents
I le laasaga lea, o le pusa faʻafefete o loʻo i ai le faʻapipiʻiina ma le faʻasologa o mea faʻasolosolo e faʻafefe ma saunia le sela tafe.
LAPATAIGA: O lo'o i ai i totonu o le kesi fa'a'ave'ese vaila'au e ono lamatia ai. Fa'aofu ia lava mea e puipui ai ma lafoa'i mea fa'aoga fa'aaoga e tusa ai ma tulaga fa'atatau. Mo nisi faʻamatalaga, vaʻai ile Illumina NextSeq 1000 ma le 2000 System Guide (pepa #1000000109376).
Sauni kesi fa'ama'i
O le fa'afefeteina o le kesi e le'i tatalaina e mafai ona faia e fa'aaoga ai auala eseese e tolu: i le vevela o le potu, i totonu o se vai ta'ele, po'o totonu o le pusaaisa.
Sauni nofoa
- 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 taamilosaga)
Faatonuga
- Fa'asusu le kesi fa'afefe e pei ona fa'amatalaina i le Laulau 2.
Fuafuaga 2. auala e fa'afefeteina ai pusa fa'a
| Auala fa'afefete | Faatonuga |
| I le vevela o le potu |
|
| I totonu o se vai taele |
|
| I totonu o le pusaaisa |
|
FAAMANATU: E le mafai ona fa'a'aisa pusa ua liu ma e tatau ona teuina i le 4 °C, mo le maualuga o le 72 itula.
Saunia sela tafe
Sauni nofoa
- 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell
Faatonuga
- Aumai le pusaaisa o le tafe i le vevela potu mo le 10-15 minute.
Saunia le Faletusi Olink® mo le fa'asologa
I le taimi o lenei laasaga, o le faʻamamaina ma le lelei o le Olink Library o loʻo faʻafefe i le faʻatonuga mulimuli. Manatua o le denaturation o le Faletusi e otometi lava ona faia i luga o le meafaigaluega.
Sauni nofoa
- Lib Tube, saunia e tusa ai ma le Olink Explore User Manual
- 1x RSB ma le va o le 20
- MiliQ vai
- 2x Microcentrifuge paipa (1.5 mL)
- Paipa tusilima (10, 100 ma le 1000 μL)
- Fa'amama fa'utu'uga paipa
Ae e te le'i amataina
- Fa'amalo le Lip Tube pe a aisa.
- Fa'amalo le RSB fa'aaisa ile Tween 20 ile vevela ole potu mo le 10 minute. Teu i le +4 °C se'ia fa'aoga.
- Faailoga le lua 1.5 mL microcentrifuge paipa fou e pei ona taua i lalo:
- Faailoga le tasi faagaau “Dil” (mo le Faletusi ua fa'afefeteina 1:100)
- Faailoga le tasi faagaau “Seq” (mo le sauni e utaina le Faletusi)
Faatonuga
- Faaopopo le 495 μL o le MilliQ vai i le Dil Tube.
- Vortex le Lib Tube ma vili i lalo puupuu.
- Fa'afeiloa'i ma le lima le 5 μL mai le Lib Tube i le Dil Tube.
- Vortex le Dil Tube ma vili i lalo puupuu.
- Faaopopo le 20 μL o le RBS ma le Tween 20 i le Seq Tube.
- Faʻafeiloaʻi ma le lima le 20 μL mai le Dil Tube i le Seq Tube.
- Vortex le Seq Tube ma vili i lalo puupuu.
- Fa'aauau pea i le 2.5 U'u le sela o le tafe ma le Faletusi o Olink® i totonu o le kesi reagent.
FAAMANATU: Teu le Lip Tube(s) i le -20 °C i le tulaga e ono toe fa'aaoga.
Tu'u le sela o le tafe ma le Faletusi o le Olink® i totonu o le pusa fa'afo'i
I le taimi o lenei laasaga, o loʻo faʻapipiʻiina le potu tafe ma le Olink Library ua faʻafefeteina i totonu o le pusa faʻafefete.
Sauni nofoa
- 1x liusua NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 taamilosaga), saunia i le laasaga muamua
- 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell, saunia i le laasaga muamua
- Seq Tube (ma sauni e utaina le Olink Library), saunia i le laasaga muamua
- paipa tusilima (100 μL)
- I'uga paipa (1 mL)
Saunia le pusa
- Aveese le kesi mai le taga pepa pepa siliva.
- Su'e fa'asefulu taimi e fa'afefiloi lelei ai mea fa'afefete i totonu.
FAAMANATU: E masani le fa'alogoina o vaega i totonu o le tagitagi.
U'u le sela tafe i totonu o le kesi
- A sauni e uta le sela tafe i totonu o le pusa, aveese le sela tafe mai le afifi. Taofi le sela fa'afefe i tafatafa o le fa'ailoga lanu efuefu, ma le fa'ailoga i luga o le fa'ailoga fa'asaga i luga. Fa'aaogā totigilima fou e leai se pauta e 'alofia ai le fa'aleagaina o le mata tioata o le sela tafe.
- Fa'aofi le sela o le tafe i totonu o le slot sela i luma o le pusa. O se kiliki fa'alogo e ta'u mai ai o lo'o sa'o le tu'u o le cell flow.
- Aveese le fa'ailoga lanu efuefu e ala i le toso i fafo.
U'u le Faletusi Olink® i totonu o le pusa
- Tu'ia le faatanoa o le Faletusi i se pito mama 1 mL paipa.
- Uta le 20 μL o le Faletusi o Olink mai le Seq Tube i le pito i lalo ole faatanoa faletusi.
Fa'atino le fa'asologa o le Olink®
I le laasaga lea, o le pusa Paʻu faʻatasi ma le faʻapipiʻiina o le tafega ma le Olink Library o loʻo faʻapipiʻiina i le NextSeq™ 2000, ma amata ai le faʻasologa o le faʻaogaina o le fua o le Olink.
Sauni nofoa
- 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 cycles) fa'atumuina i le NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell ma le Olink Library ua fa'afefeteina, saunia i le laasaga muamua.
Fa'atonu le Faiga Fa'agasolo
- Mai le lisi o polokalama faakomepiuta pulea, filifili Seti.
- I lalo o le BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support, filifili Fa'atonu Fa'alotoifale.
- Filifili Na'o le Proactive Support e fai ma fa'aopoopoga fa'aopoopo. O lenei galuega e mana'omia se feso'ota'iga initaneti.
- Filifili le Nofoaga talimalo mo au faʻamatalaga. Nofoaga talimalo e tatau ona i totonu pe latalata i lau itulagi.
- Seti le nofoaga o le Output Folder mo fa'amaumauga mata'utia o lo'o iai nei. Filifili Filifili e faʻafeiloaʻi ma filifili le faila faila.
- Filifili le pusa siaki Denature ma Dilute On Board e otometi ai ona fa'amuta ma fa'asusu le Faletusi i luga o le meafaigaluega.
- Filifili le Pusa Reagent Cartridge siaki pusa e otometi ai ona fufulu reagents e le'i fa'aaogaina i le vaega fa'aalu fa'aalu o le kesi.
- Filifili le Autocheck for software updates checkbox e otometi ai ona siaki mo faafouga polokalama (filifiliga). O lenei galuega e mana'omia se feso'ota'iga initaneti.
- Filifili Save.
Seti ta'aloga ta'avale
FAAMANATU: O lenei faatonuga e faatatau i le version 1.4 o le NextSeq™ 1000/2000 control software. O nisi o laasaga o loʻo faʻamatalaina i lalo atonu e ese pe a faʻaaogaina le v1.2
- Mai le lisi o polokalama faakomepiuta pulea, filifili Amata.
- Filifili ma le Manually Set Up New Run ma fetaomi Setup.
- I le itulau Run Setup, seti le taʻavale taʻavale e pei ona taua i lalo:
- I le Run Name field, ulufale i se ID fa'ata'ita'iga tulaga ese.
- I totonu o le Read Type drop-down list, filifili le filifiliga Faitau Tasi.
- Tu'u le numera o ta'amilosaga fa'apea:
- Faitau 1: 24
- Fa'asinomaga 1: 0
- Fa'asinomaga 2: 0
- Faitau 2: 0
FAAMANATU: E taua tele le Faitau 1 e seti i le 24, a leai o le a le manuia le tamoe atoa. Le amana'ia fe'au lapata'i pe a ulufale i le numera o ta'amilosaga.
- I le lisi pa'ū i lalo Custom Primer Wells, filifili Nu.
- I totonu o le Faʻailoga Faʻapitoa (filifiliga) fanua, filifili Filifili e faʻatautaia ma filifili le fua masani XML file Olink_NSQ2K_P2_V1. Filifili Tatala.
- Aua le faaulufaleina mai se Sample Pepa.
- Ia mautinoa o lo'o sa'o le nofoaga o le Output Folder. A leai, filifili Filifili e faʻafeiloaʻi ma filifili le nofoaga o loʻo manaʻomia.
- I le Denature ma Dilute Onboard fanua, filifili Enabled mai le lisi pa'ū.
- Filifili Sauniuniga.
U'u le kesi ua utaina
- Filifili uta. E matala le visor o mea faifa'aili ma o'o i fafo le fata.
- Tuu le kasini uta i luga o le fata ma le igoa e faasaga i luga ma le sela tafe i totonu o le meafaigaluega.
- Filifili Tapuni.
- O le taimi lava e utaina lelei ai le kesi, faʻamaonia le taʻavale taʻavale ma filifili Sequence. E faia e le meafaifa'amea su'esu'ega a'o le'i ta'e mo le meafaigaluega ma le vai.
- FAAMANATU: I le taimi o le su'ega o le fluidics, e fa'amoemoe e fa'alogoina le tele o leo pa'u.
- Ia mautinoa e amata le tamo'e pe a mae'a siaki otometi mua'i ta'e (~15 minute). Ole taimi ole fa'asologa ole taimi e tusa ole 10h30 min.
- FAAMANATU: Mo so'o se fa'aletonu siaki a'o le'i ta'e, va'ai ile fa'atonuga a le gaosi oloa. Fa'aeteete 'aua ne'i oso i totonu pe fa'alavelaveina le NextSeq™ 2000 a'o fa'agasolo le fa'asologa. O le meafaigaluega e maaleale i tetete.
- Fa'amama le nofoaga faigaluega.
Mata'ituina le Alualu i Luma
Olink e faʻaaoga le NGS e fai ma faitau e faʻatatau le aofaʻi o se faʻasologa iloa ina ia mafai ai ona faʻatusatusa le faʻaogaina o se porotini tuʻuina i le s.amples (faatatau i isi samples). O le lelei o fa'amaumauga mai fa'asologa fa'asologa o Su'esu'e ta'itasi e fa'amautu e fa'amaufa'ailoga QC fa'apitoa ile tekonolosi a Olink. O le mea lea, o fua fa'atatau o le lelei o lo'o fa'aaogaina i NGS masani, e pei o le Q-score, e le taua tele.
Aveese ma tia'i le kesi pe a uma le tamo'e
LAPATAIGA: O lenei seti o reagents o lo'o i ai ni vaila'au mata'utia. Fa'aofu ia lava mea e puipui ai ma lafoa'i mea fa'aoga fa'aaoga e tusa ai ma tulaga fa'atatau. Mo nisi fa'amatalaga, va'ai ile Illumina NextSeq 1000 ma le 2000 System Guide (pepa #1000000109376).
- A maeʻa le taʻavale, filifili Eject Cartridge.
- FAAMANATU: O le kesi fa'aaogaina e aofia ai le sela e mafai ona tu'u i le nofoaga se'ia o'o i le isi ta'avale, ae le sili atu i le 3 aso.
- Aveese le kesi mai le fata.
- Lafoa'i mea fa'afofoga e tusa ai ma tulaga fa'atatau.
- Filifili Tapuni Faitotoa. Ua toe uta le fata.
- Filifili le Fale e toe fo'i i le mata o le Fale.
- FAAMANATU: Talu ai o le kesi o loʻo i ai mea uma e faʻatautaia ai le faiga, faʻapea foʻi ma se faatanoa e aoina ai reagents faʻaaogaina, e leai se manaʻoga mo se mea faigaluega fufulu pe a uma le taʻavale.
Toe iloilo tala'aga
| Fa'aliliuga | Aso | Fa'amatalaga |
| 1.0 | 2021-12-01 | Fou |
Mo Na'o Su'esu'ega Fa'aaogā. E le mo le Fa'aaogaina i Faiga Fa'ata'ita'iga.
O lenei oloa e aofia ai se laisene mo le fa'aogaina e le fa'apisinisi o oloa Olink. E ono mana'omia e tagata fa'apisinisi ni laisene fa'aopoopo. Fa'amolemole fa'afeso'ota'i le Olink proteomics AB mo fa'amatalaga. E leai ni fa'amaoniga, fa'aalia pe fa'aalia, e fa'alautele atu i tua atu o lenei fa'amatalaga. Olink Proteomics AB e le noatia mo le faaleagaina o meatotino, manu'a a le tagata lava ia, poʻo le gau o le tamaoaiga e mafua mai i lenei oloa. O le fa'ailoga o lo'o mulimuli mai o lo'o umia e Olink Proteomics AB: Olink®. O lenei oloa e ufiufi e le tele o pateni ma talosaga pateni o loʻo maua i https://www.olink.com/patents/.
© Puletaofia 2021 Olink proteomics AB. O fa'ailoga tau fefa'ataua'iga uma a isi vaega o le meatotino a latou tagata e ona.
Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, Suetena
1193, v1.0, 2021-12-01
Pepa / Punaoa
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Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing System [pdf] Tusi Taiala NextSeq 2000, Su'esu'e Faiga Fa'asologa, NextSeq 2000 Su'esu'e Fa'asologa Fa'asologa |
