Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing System

ບັນທຶກເອກະສານ

ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Olink® Explore, doc nr 1153, ແມ່ນລ້າສະໄຫມ, ແລະໄດ້ຖືກປ່ຽນແທນໂດຍເອກະສານຕໍ່ໄປນີ້:

• Olink® ສຳຫຼວດເບິ່ງview ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1187
• Olink® Explore 384 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1188
• Olink® Explore 4 x 384 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1189
• Olink® Explore 1536 & ຄູ່ມືການຂະຫຍາຍຜູ້ໃຊ້, doc nr 1190
• Olink® Explore 3072 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1191
• Olink® Explore Sequencing ໂດຍໃຊ້ NextSeq 550 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1192
• Olink® Explore Sequencing ໂດຍໃຊ້ NextSeq 2000 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1193
• Olink® Explore Sequencing ໂດຍໃຊ້ NovaSeq 6000 ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້, doc nr 1194

ແນະນຳ

ຈຸດປະສົງການນໍາໃຊ້

Olink® Explore ແມ່ນແພລະຕະຟອມ immunoassay multiplex ສໍາລັບການຄົ້ນພົບ biomarker ທາດໂປຼຕີນຂອງມະນຸດ. ຜະລິດຕະພັນແມ່ນມີຈຸດປະສົງສໍາລັບການນໍາໃຊ້ການຄົ້ນຄວ້າເທົ່ານັ້ນ, ແລະບໍ່ແມ່ນສໍາລັບການນໍາໃຊ້ໃນຂັ້ນຕອນການວິນິດໄສ. ວຽກງານຫ້ອງທົດລອງຈະຕ້ອງດໍາເນີນການໂດຍພະນັກງານຫ້ອງທົດລອງທີ່ໄດ້ຮັບການຝຶກອົບຮົມເທົ່ານັ້ນ. ການປະມວນຜົນຂໍ້ມູນຈະຕ້ອງຖືກປະຕິບັດໂດຍພະນັກງານທີ່ໄດ້ຮັບການຝຶກອົບຮົມເທົ່ານັ້ນ. ຜົນໄດ້ຮັບແມ່ນຫມາຍຄວາມວ່າຈະຖືກນໍາໃຊ້ໂດຍນັກຄົ້ນຄວ້າໂດຍສົມທົບກັບການຄົ້ນພົບທາງດ້ານຄລີນິກຫຼືຫ້ອງທົດລອງອື່ນໆ.

ກ່ຽວກັບຄູ່ມືນີ້

ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ນີ້ໃຫ້ຄໍາແນະນໍາທີ່ຈໍາເປັນເພື່ອຈັດລໍາດັບOlink® Explore Libraries ໃນ Illumina® NextSeq™ 2000. ຄໍາແນະນໍາຕ້ອງປະຕິບັດຕາມຢ່າງເຂັ້ມງວດແລະຊັດເຈນ. ການບ່ຽງເບນໃດໆໃນທົ່ວຂັ້ນຕອນຂອງຫ້ອງທົດລອງອາດຈະເຮັດໃຫ້ຂໍ້ມູນເສຍຫາຍ. ກ່ອນທີ່ຈະເລີ່ມຂັ້ນຕອນການເຮັດວຽກຂອງຫ້ອງທົດລອງ, ໃຫ້ປຶກສາ Olink® Explore Overview ຄູ່​ມື​ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ສໍາ​ລັບ​ການ​ແນະ​ນໍາ​ກັບ​ເວ​ທີ​, ລວມ​ທັງ​ຂໍ້​ມູນ​ກ່ຽວ​ກັບ reagents​, ອຸ​ປະ​ກອນ​ແລະ​ເອ​ກະ​ສານ​ທີ່​ຈໍາ​ເປັນ​, ສໍາ​ລັບ​ການ​view ຂອງຂະບວນການເຮັດວຽກ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບຄໍາແນະນໍາຫ້ອງທົດລອງ. ສໍາລັບຄໍາແນະນໍາກ່ຽວກັບວິທີການດໍາເນີນການ Olink® Explore Reagent Kits, ເບິ່ງຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Olink® Explore ທີ່ໃຊ້ໄດ້. ສໍາລັບການປະມວນຜົນຂໍ້ມູນ ແລະການວິເຄາະຜົນລໍາດັບOlink® Explore, ເບິ່ງຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Olink® MyData Cloud. ເຄື່ອງໝາຍການຄ້າ ແລະລິຂະສິດທັງໝົດທີ່ມີຢູ່ໃນເອກະສານນີ້ແມ່ນເປັນຊັບສິນຂອງOlink® Proteomics AB, ເວັ້ນເສຍແຕ່ໄດ້ລະບຸໄວ້ເປັນຢ່າງອື່ນ.

ສະຫນັບສະຫນູນດ້ານວິຊາການ

ສໍາລັບການຊ່ວຍເຫຼືອດ້ານວິຊາການ, ຕິດຕໍ່ Olink Proteomics ທີ່: support@olink.com.

ຄໍາແນະນໍາຫ້ອງທົດລອງ

ບົດນີ້ໃຫ້ຄໍາແນະນໍາກ່ຽວກັບວິທີການຈັດລໍາດັບ Olink Libraries ໃນ NextSeq™ 2000 ໂດຍໃຊ້ NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3. ໂປໂຕຄອນທີ່ໃຊ້ສໍາລັບການຈັດລໍາດັບແມ່ນການປັບຕົວຂອງຂັ້ນຕອນການເຮັດວຽກມາດຕະຖານ Illumina® NGS ສໍາລັບ Illumina® NextSeq™ 2000. ກ່ອນທີ່ຈະດໍາເນີນການຕາມລໍາດັບ, ໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າຄຸນນະພາບຂອງຫ້ອງສະຫມຸດ Olink ບໍລິສຸດໄດ້ຖືກກວດສອບແລ້ວ. ເບິ່ງຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Olink Explore ທີ່ໃຊ້ໄດ້ສໍາລັບຄໍາແນະນໍາກ່ຽວກັບການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບ.

ວາງແຜນການແລ່ນລໍາດັບ

One Olink Library ສາມາດຖືກຈັດລໍາດັບຕໍ່ເຊລການໄຫຼ NextSeq™ 2000 P2 ແລະຕໍ່ໄລຍະ. ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ P2 flow cells ແລະ​ການ​ແລ່ນ​ທີ່​ຕ້ອງ​ການ​ເພື່ອ​ຈັດ​ລໍາ​ດັບ Olink Explore Reagent Kits ທີ່​ແຕກ​ຕ່າງ​ກັນ​ໄດ້​ອະ​ທິ​ບາຍ​ໃນ​ຕາ​ຕະ​ລາງ 1. ຖ້າ​ຫາກ​ວ່າ​ຕ້ອງ​ການ​ຫຼາຍ​ກ​່​ວາ​ຫນຶ່ງ​ແລ່ນ​, ເຮັດ​ເລ​ື້ມ​ຄືນ​ຄໍາ​ແນະ​ນໍາ​ທີ່​ອະ​ທິ​ບາຍ​ໃນ​ຄູ່​ມື​ນີ້​.

ຕາຕະລາງ 1. ການວາງແຜນການແລ່ນຕາມລຳດັບ

Olink® Explore Reagent Kit	ຈຳນວນຫ້ອງສະໝຸດ Olink	ຈໍາ​ນວນ​ຂອງ flow cell(s​) ແລະ run(s​)
Olink® Explore 384 Reagent Kit	1	1
Olink® Explore 4 x 384 ຊຸດ Reagent	4	4
Olink® Explore 1536 Reagent Kit	4	4
Olink® Explore Expansion Reagent Kit	4	4
Olink® Explore 3072 Reagent Kit	8	8

ຕິດຕັ້ງສູດ Olink® ແບບກຳນົດເອງ

ບັນທຶກ Olink ສູດ custom xml-file Olink_NSQ2K_P2_V1 ໃນໂຟນເດີເຄື່ອງມືທີ່ເຫມາະສົມ.

ໝາຍເຫດ: ສູດແບບກຳນົດເອງ Olink ຈະໃຊ້ໄດ້ກັບຊຸດ NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 ແລະ ຊອບແວຄວບຄຸມ NextSeq™ 1000/2000 v1.2 ຫຼື v1.4.

ກະກຽມ reagents ລໍາດັບ

ໃນລະຫວ່າງຂັ້ນຕອນນີ້, ໄສ້ຕອງ reagent ບັນຈຸມີ clustering ແລະ sequencing reagents ໄດ້ຖືກ thawed ແລະຈຸລັງໄຫຼໄດ້ຖືກກະກຽມ.

ຄຳເຕືອນ: ໄສ້ຕອງ reagent ມີສານເຄມີທີ່ອາດຈະເປັນອັນຕະລາຍ. ໃສ່ອຸປະກອນປ້ອງກັນທີ່ພຽງພໍ ແລະປະຖິ້ມທາດປະຕິກອນທີ່ໃຊ້ແລ້ວຕາມມາດຕະຖານທີ່ນຳໃຊ້. ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ, ເບິ່ງຄູ່ມືລະບົບ Illumina NextSeq 1000 ແລະ 2000 (ເອກະສານ #1000000109376).

ກະກຽມໄສ້ຕອງ reagent

ການຖອກຖັງທີ່ບໍ່ໄດ້ເປີດສາມາດເຮັດໄດ້ໂດຍໃຊ້ສາມວິທີທີ່ແຕກຕ່າງກັນ: ໃນອຸນຫະພູມຫ້ອງ, ໃນອາບນ້ໍາຄວບຄຸມ, ຫຼືໃນຕູ້ເຢັນ.

ກະກຽມ bench

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 ຮອບ)

ຄໍາແນະນໍາ

1. ຖອກໃສ່ໄສ້ຕອງ reagent ຕາມທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນຕາຕະລາງ 2.

ຕາຕະລາງ 2. ວິທີການ thawing cartridge reagent

ວິທີການຖອກ	ຄໍາແນະນໍາ
ຢູ່ທີ່ອຸນຫະພູມຫ້ອງ	ໂດຍບໍ່ມີການເປີດຖົງ foil ເງິນ, ເອົາໄສ້ຕອງ reagent frozen ສຸດ bench ແລະ thaw ມັນຢູ່ໃນອຸນຫະພູມຫ້ອງສໍາລັບ 9 ຊົ່ວໂມງ. ບໍ່ເກີນ 16 ຊົ່ວໂມງ. ໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າປ້າຍກະເປົ໋າຫັນໜ້າຂຶ້ນ ແລະ ອາກາດນັ້ນສາມາດໄຫຼວຽນໄປມາຮອບໆໄສ້ຕອງໄດ້.
ໃນອາບນ້ໍາ	ໂດຍບໍ່ເປີດກະເປົ໋າເງິນ, ເອົາໄສ້ຕອງທີ່ແຊ່ແຂງໄວ້ເຄິ່ງໜຶ່ງໃນອ່າງອາບນ້ຳທີ່ຄວບຄຸມອຸນຫະພູມ 25 ອົງສາ ແລະ ປະໄວ້ 6 ຊົ່ວໂມງ. ບໍ່ເກີນ 8 ຊົ່ວໂມງ. ໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າປ້າຍຂອງຖົງຫັນຫນ້າຂຶ້ນແລະວ່າ cartridge ບໍ່ invert ໃນລະຫວ່າງການ thawing. ເຊັດຕະຫລັບຫມຶກຢ່າງລະອຽດດ້ວຍຜ້າເຈ້ຍ.
ໃນຕູ້ເຢັນ	ໂດຍບໍ່ມີການເປີດຖົງ foil ເງິນ, ເອົາ cartridge ເທິງ bench ແລະ thaw ມັນຢູ່ໃນອຸນຫະພູມຫ້ອງສໍາລັບ 6 ຊົ່ວໂມງ. ໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າປ້າຍກະເປົ໋າຫັນໜ້າຂຶ້ນ ແລະ ອາກາດນັ້ນສາມາດໄຫຼວຽນໄປມາຮອບໆໄສ້ຕອງໄດ້. ສໍາເລັດການ thawing cartridge ໃນຕູ້ເຢັນສໍາລັບ 12 ຊົ່ວໂມງ. ບໍ່ເກີນ 72 ຊົ່ວໂມງ. ກ່ອນທີ່ຈະແລ່ນ, ເອົາໄສ້ຕອງທີ່ບໍ່ໄດ້ເປີດອອກຈາກຕູ້ເຢັນແລະປ່ອຍໃຫ້ມັນສາມາດບັນລຸອຸນຫະພູມຫ້ອງໃນເວລາຢ່າງຫນ້ອຍ 15 ນາທີ, ແຕ່ບໍ່ເກີນ 1 ຊົ່ວໂມງ.

ໝາຍເຫດ: ໄສ້ຕອງທີ່ແຊ່ແຂງບໍ່ສາມາດແຊ່ເຢັນໄດ້ ແລະຕ້ອງເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ 4 °C, ເປັນເວລາສູງສຸດ 72 ຊົ່ວໂມງ.

ກະກຽມເຊລການໄຫຼ

ກະກຽມ bench

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell

ຄໍາແນະນໍາ

1. ເອົາຫ້ອງນ້ໍາໃນຕູ້ເຢັນເຂົ້າໄປໃນອຸນຫະພູມຫ້ອງສໍາລັບ 10-15 ນາທີ.

ກະກຽມຫໍສະຫມຸດOlink®ສໍາລັບການຈັດລໍາດັບ

ໃນລະຫວ່າງຂັ້ນຕອນນີ້, ຫໍສະຫມຸດ Olink ທີ່ຖືກຄວບຄຸມຢ່າງບໍລິສຸດແລະມີຄຸນນະພາບແມ່ນເຈືອຈາງໄປສູ່ຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງການໂຫຼດສຸດທ້າຍ. ຈື່ໄວ້ວ່າການປ່ຽນສີໃນຫ້ອງສະໝຸດແມ່ນເຮັດໂດຍອັດຕະໂນມັດຢູ່ເທິງເຄື່ອງ.

ກະກຽມ bench

• Lib Tube, ກະກຽມອີງຕາມຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Olink Explore ທີ່ໃຊ້ໄດ້
• 1x RSB ກັບ Tween 20
• ນ້ໍາ MilliQ
• 2x ທໍ່ Microcentrifuge (1.5 ມລ)
• pipette ຄູ່ມື (10, 100 ແລະ 1000 μL)
• ຄໍາແນະນໍາການກັ່ນຕອງ pipette

ກ່ອນທີ່ທ່ານຈະເລີ່ມຕົ້ນ

• ທາທໍ່ Lib ຖ້າຖືກແຊ່ແຂງ.
• ເທ RSB ແຊ່ແຂງດ້ວຍ Tween 20 ຢູ່ທີ່ອຸນຫະພູມຫ້ອງສໍາລັບ 10 ນາທີ. ເກັບຮັກສາໄວ້ທີ່ +4 ° C ຈົນກ່ວາການນໍາໃຊ້.
• ໝາຍໃສ່ທໍ່ຈຸນລະພາກຂະໜາດ 1.5 ມລ ໃໝ່ສອງອັນດັ່ງນີ້:
  • ຫມາຍໃສ່ທໍ່ຫນຶ່ງ "Dil" (ສໍາລັບຫໍສະຫມຸດເຈືອຈາງ 1:100)
  • ໝາຍໃສ່ໜຶ່ງທໍ່ “Seq” (ສຳລັບຫ້ອງສະໝຸດພ້ອມທີ່ຈະໂຫລດ)

ຄໍາແນະນໍາ

1. ຕື່ມນ້ໍາ 495 μLຂອງ MilliQ ເຂົ້າໄປໃນທໍ່ Dil.
2. Vortex ທໍ່ Lib ແລະຫມຸນມັນລົງສັ້ນໆ.
3. ໂອນ 5 μL ດ້ວຍຕົນເອງຈາກທໍ່ Lib ໄປຫາທໍ່ Dil.
4. Vortex ທໍ່ Dil ແລະຫມຸນມັນລົງສັ້ນໆ.
5. ເພີ່ມ 20 μLຂອງ RBS ກັບ Tween 20 ກັບ Seq Tube.
6. ໂອນ 20 μLດ້ວຍຕົນເອງຈາກທໍ່ Dil ໄປຫາທໍ່ Seq.
7. Vortex the Seq Tube ແລະປັ່ນມັນລົງສັ້ນໆ.
8. ທັນທີສືບຕໍ່ໄປຫາ 2.5 Load flow cell ແລະOlink® Library ເຂົ້າໄປໃນໄສ້ຕອງ reagent.

ໝາຍເຫດ: ເກັບຮັກສາທໍ່ Lib Tube(s) ໄວ້ທີ່ -20 °C ໃນກໍລະນີທີ່ມີທ່າແຮງ rerun(s).

ໂຫຼດ flow cell ແລະ Olink® Library ເຂົ້າໄປໃນຕະຫລັບ reagent

ໃນລະຫວ່າງຂັ້ນຕອນນີ້, ເຊນໄຫຼແລະຫ້ອງສະຫມຸດ Olink ທີ່ເຈືອຈາງຈະຖືກໂຫລດເຂົ້າໄປໃນໄສ້ຕອງ reagent thawed.

ກະກຽມ bench

• 1x thawed NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 ຮອບ), ກະກຽມໃນຂັ້ນຕອນທີ່ຜ່ານມາ
• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell, ກະກຽມໃນຂັ້ນຕອນກ່ອນໜ້າ
• Seq Tube (ພ້ອມແລ້ວທີ່ຈະໂຫຼດຫໍສະຫມຸດ Olink diluted), ການກະກຽມໃນຂັ້ນຕອນທີ່ຜ່ານມາ
• pipette ຄູ່ມື (100 μL)
• ປາຍທໍ່ (1 ມລ)

ກະກຽມໄສ້ຕອງ

1. ເອົາ cartridge ອອກຈາກຖົງ foil ເງິນ.
2. ປີ້ນໄສ້ຕອງສິບເທື່ອເພື່ອປະສົມທາດປະສົມທີ່ທາແລ້ວເຂົ້າກັນຢ່າງລະອຽດ.

ໝາຍເຫດ: ມັນເປັນເລື່ອງປົກກະຕິທີ່ຈະໄດ້ຍິນອົງປະກອບພາຍໃນ jingling.

ໂຫຼດຕາລາງການໄຫຼເຂົ້າໄປໃນໄສ້ຕອງ

1. ເມື່ອພ້ອມທີ່ຈະໂຫລດ flow cell ເຂົ້າໄປໃນ cartridge, ເອົາ flow cell ອອກຈາກຊຸດ. ຖືຕາລາງການໄຫຼເຂົ້າໂດຍແຖບສີເທົາ, ໂດຍມີປ້າຍກຳກັບຢູ່ແຖບນັ້ນຫັນໜ້າຂຶ້ນ. ໃຊ້ຖົງມືທີ່ບໍ່ມີຝຸ່ນໃຫມ່ເພື່ອຫຼີກເວັ້ນການປົນເປື້ອນພື້ນແກ້ວຂອງຈຸລັງໄຫຼ.
2. ແຊກເຊລການໄຫຼເຂົ້າໃສ່ຊ່ອງຊ່ອງໄຫຼຢູ່ດ້ານໜ້າຂອງໄສ້ຕອງ. ການຄລິກທີ່ໄດ້ຍິນໄດ້ສະແດງໃຫ້ເຫັນວ່າເຊລການໄຫຼຖືກວາງຢ່າງຖືກຕ້ອງ.
3. ເອົາແຖບສີຂີ້ເຖົ່າອອກໂດຍການດຶງມັນອອກ.

ໂຫລດOlink® Library ເຂົ້າໄປໃນໄສ້ຕອງ

1. ເຈາະອ່າງເກັບນ້ຳຫ້ອງສະໝຸດດ້ວຍປາຍທໍ່ນ້ຳສະອາດ 1 ມລ.
2. ໂຫຼດ 20 μLຂອງຫໍສະຫມຸດ Olink ຈາກ Seq Tube ເຂົ້າໄປໃນລຸ່ມຂອງອ່າງເກັບນຫ້ອງສະຫມຸດ.

ດໍາເນີນການຈັດລໍາດັບOlink®

ໃນລະຫວ່າງຂັ້ນຕອນນີ້, Buffer cartridge ທີ່ມີຕາລາງການໄຫຼທີ່ຖືກໂຫລດແລະ Olink Library ຈະຖືກໂຫລດເຂົ້າໄປໃນ NextSeq™ 2000, ແລະການແລ່ນລໍາດັບແມ່ນເລີ່ມຕົ້ນໂດຍໃຊ້ສູດ Olink.

ກະກຽມ bench

• 1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 cycles) loaded with the NextSeq™ 1000/2000 P2 Flow Cell and the diluted Olink Library, ກະກຽມໃນຂັ້ນຕອນທີ່ຜ່ານມາ.

ຕັ້ງຄ່າໂໝດການແລ່ນ

1. ຈາກເມນູຊອບແວການຄວບຄຸມ, ເລືອກ Settings.
2. ພາຍໃຕ້ BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support, ເລືອກ Local Run Setup.
3. ເລືອກ Proactive Support ພຽງແຕ່ເປັນການຕັ້ງຄ່າເພີ່ມເຕີມ. ຟັງຊັນນີ້ຕ້ອງການການເຊື່ອມຕໍ່ອິນເຕີເນັດ.
4. ເລືອກສະຖານທີ່ໂຮດຕິ້ງສໍາລັບຂໍ້ມູນຂອງທ່ານ. ສະຖານທີ່ໂຮດຕິ້ງຄວນຈະຢູ່ໃນຫຼືໃກ້ກັບພາກພື້ນຂອງທ່ານ.
5. ຕັ້ງຄ່າທີ່ຕັ້ງໂຟນເດີ Output ສໍາລັບຂໍ້ມູນດິບທີ່ແລ່ນປະຈຸບັນ. ເລືອກ​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ທາງ​ແລະ​ເລືອກ​ເອົາ​ໂຟນ​ເດີ​ຜົນ​ຜະ​ລິດ​ໄດ້​.
6. ເລືອກກ່ອງກາໝາຍ Denature and Dilute On Board ເພື່ອອັດຕະໂນມັດ ແລະເຈືອຈາງຫໍສະໝຸດເທິງເຄື່ອງ.
7. ເລືອກກ່ອງກາໝາຍ Purge Reagent Cartridge ເພື່ອລຶບລ້າງທາດປະຕິກອນທີ່ບໍ່ໄດ້ໃຊ້ໄປໃສ່ຊ່ອງບັນຈຸທາດປະຕິກອນທີ່ໃຊ້ແລ້ວຂອງຕະຫລັບຫມຶກ.
8. ເລືອກກ່ອງໝາຍ Autocheck ສໍາລັບການປັບປຸງຊອບແວເພື່ອກວດສອບການອັບເດດຊອບແວໂດຍອັດຕະໂນມັດ (ທາງເລືອກ). ຟັງຊັນນີ້ຕ້ອງການການເຊື່ອມຕໍ່ອິນເຕີເນັດ.
9. ເລືອກ Save.

ຕັ້ງຄ່າຕົວກໍານົດການແລ່ນ

ໝາຍເຫດ: ຄໍາແນະນໍານີ້ໃຊ້ກັບເວີຊັນ 1.4 ຂອງຊອບແວຄວບຄຸມ NextSeq™ 1000/2000. ບາງຂັ້ນຕອນທີ່ອະທິບາຍຂ້າງລຸ່ມນີ້ອາດຈະແຕກຕ່າງກັນເມື່ອໃຊ້ເວີຊັນ v1.2

1. ຈາກ​ເມ​ນູ​ຊອບ​ແວ​ຄວບ​ຄຸມ​, ເລືອກ​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​.
2. ເລືອກຕັ້ງຄ່າການແລ່ນໃໝ່ດ້ວຍຕົນເອງ ແລະກົດ Setup.
3. ໃນ​ຫນ້າ​ການ​ຕັ້ງ​ຄ່າ​ການ​ດໍາ​ເນີນ​ງານ​, ຕັ້ງ​ຄ່າ​ການ​ດໍາ​ເນີນ​ການ​ດັ່ງ​ຕໍ່​ໄປ​ນີ້​:
   • ໃນຊ່ອງ Run Name, ໃສ່ ID ການທົດລອງທີ່ເປັນເອກະລັກ.
   • ໃນ​ບັນ​ຊີ​ລາຍ​ການ​ເລື່ອນ​ລົງ​ປະ​ເພດ​ການ​ອ່ານ​, ເລືອກ​ເອົາ​ທາງ​ເລືອກ​ການ​ອ່ານ​ດຽວ​.
   • ໃສ່ຈໍານວນຮອບວຽນດັ່ງຕໍ່ໄປນີ້:
     • ອ່ານ 1: 24
     • ດັດຊະນີ 1: 0
     • ດັດຊະນີ 2: 0
     • ອ່ານ 2: 0

ໝາຍເຫດ: ມັນເປັນສິ່ງສໍາຄັນທີ່ Read 1 ຖືກກໍານົດເປັນ 24, ຖ້າບໍ່ດັ່ງນັ້ນການແລ່ນທັງຫມົດຈະລົ້ມເຫລວ. ບໍ່ສົນໃຈຂໍ້ຄວາມເຕືອນເມື່ອໃສ່ຈໍານວນຮອບວຽນ.

• ໃນລາຍການເລື່ອນລົງ Custom Primer Wells, ເລືອກ No.
• ໃນ Custom Recipe (ທາງເລືອກ) ພາກສະຫນາມ, ເລືອກ ເລືອກທີ່ຈະນໍາທາງແລະເລືອກ XML ສູດ custom file Olink_NSQ2K_P2_V1. ເລືອກ Open.
• ຫ້າມ​ນຳ​ເຂົ້າ Sample Sheet.
• ໃຫ້ແນ່ໃຈວ່າສະຖານທີ່ໂຟນເດີຜົນໄດ້ຮັບແມ່ນຖືກຕ້ອງ. ຖ້າ​ບໍ່​ດັ່ງ​ນັ້ນ​, ເລືອກ​ທີ່​ຈະ​ນໍາ​ທາງ​ແລະ​ເລືອກ​ທີ່​ຕັ້ງ​ໂຟ​ເດີ​ຜົນ​ຜະ​ລິດ​ທີ່​ຕ້ອງ​ການ​.
• ໃນພາກສະຫນາມ Denature ແລະເຈືອຈາງ Onboard, ເລືອກ Enabled ຈາກບັນຊີລາຍຊື່ເລື່ອນລົງ.
• ເລືອກ Prep.

ໃສ່ໄສ້ຕອງທີ່ໂຫລດ

1. ເລືອກ Load. ຝາອັດປາກມົດເຄື່ອງເປີດ ແລະຖາດຖືກຖອດອອກ.
2. ວາງຖັງໃສ່ຖາດໃສ່ຖາດດ້ວຍປ້າຍກຳກັບທີ່ຫັນໜ້າຂຶ້ນ ແລະ ຊ່ອງໄຫຼພາຍໃນເຄື່ອງໃຊ້.
3. ເລືອກປິດ.
4. ເມື່ອ cartridge ໄດ້ຖືກໂຫລດຢ່າງຖືກຕ້ອງ, ກວດສອບຕົວກໍານົດການແລ່ນແລະເລືອກລໍາດັບ. ເຄື່ອງ​ມື​ເຮັດ​ການ​ກວດ​ສອບ​ກ່ອນ​ການ​ແລ່ນ​ສໍາ​ລັບ​ເຄື່ອງ​ມື​ແລະ fluidics ໄດ້​.
   • ໝາຍເຫດ: ໃນລະຫວ່າງການກວດກາທາດແຫຼວ, ຄາດວ່າຈະໄດ້ຍິນສຽງດັງຫຼາຍຄັ້ງ.
5. ໃຫ້​ແນ່​ໃຈວ່​າ​ການ​ແລ່ນ​ໄດ້​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​ຫຼັງ​ຈາກ​ການ​ກວດ​ສອບ​ການ​ແລ່ນ​ກ່ອນ​ອັດ​ຕະ​ໂນ​ມັດ​ສໍາ​ເລັດ (~15 ນາ​ທີ​)​. ເວລາແລ່ນຕາມລຳດັບແມ່ນປະມານ 10h30 ນາທີ.
   • ໝາຍເຫດ: ສໍາລັບຄວາມລົ້ມເຫຼວຂອງການກວດສອບລ່ວງຫນ້າໃດໆ, ເບິ່ງຄໍາແນະນໍາຂອງຜູ້ຜະລິດ. ລະວັງບໍ່ໃຫ້ຕຳ ຫຼື ລົບກວນ NextSeq™ 2000 ໃນລະຫວ່າງການແລ່ນຕາມລຳດັບ. ເຄື່ອງມືມີຄວາມອ່ອນໄຫວຕໍ່ກັບການສັ່ນສະເທືອນ.
6. ເຮັດຄວາມສະອາດພື້ນທີ່ເຮັດວຽກ.

ຕິດຕາມກວດກາຄວາມຄືບຫນ້າການດໍາເນີນການ

Olink ໃຊ້ NGS ເປັນການອ່ານເພື່ອປະເມີນປະລິມານຂອງລໍາດັບທີ່ຮູ້ຈັກເພື່ອຄາດຄະເນຄວາມເຂັ້ມຂົ້ນຂອງທາດໂປຼຕີນທີ່ໃຫ້ຢູ່ໃນ s.amples (ທຽບກັບ s ອື່ນໆamples). ຄຸນນະພາບຂໍ້ມູນຈາກການດໍາເນີນການລໍາດັບການສໍາຫຼວດແຕ່ລະຄັ້ງສ່ວນໃຫຍ່ແມ່ນຖືກກໍານົດໂດຍຕົວກໍານົດການ QC ທີ່ເປັນເອກະລັກຂອງເຕັກໂນໂລຢີ Olink. ດັ່ງນັ້ນ, ມາດຕະການຄວບຄຸມຄຸນນະພາບມາດຕະຖານທີ່ໃຊ້ໃນ NGS ທໍາມະດາ, ເຊັ່ນ Q-score, ແມ່ນມີຄວາມສໍາຄັນຫນ້ອຍ.

ຖອດອອກ ແລະຖິ້ມໄສ້ຕອງ ຫຼັງຈາກແລ່ນ

ຄຳເຕືອນ: ຊຸດຂອງ reagents ນີ້ປະກອບດ້ວຍສານເຄມີທີ່ອາດຈະເປັນອັນຕະລາຍ. ໃສ່ອຸປະກອນປ້ອງກັນທີ່ພຽງພໍ ແລະປະຖິ້ມທາດປະຕິກອນທີ່ໃຊ້ແລ້ວຕາມມາດຕະຖານທີ່ນຳໃຊ້. ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ, ເບິ່ງຄູ່ມືລະບົບ Illumina NextSeq 1000 ແລະ 2000 (ເອກະສານ #1000000109376).

1. ເມື່ອການແລ່ນສຳເລັດແລ້ວ, ໃຫ້ເລືອກ Eject Cartridge.
   • ໝາຍເຫດ: ໄສ້ຕອງທີ່ໃຊ້ແລ້ວລວມທັງ flow cell ສາມາດຖືກປະໄວ້ຢູ່ບ່ອນຈົນກ່ວາການແລ່ນຕໍ່ໄປ, ແຕ່ບໍ່ເກີນ 3 ມື້.
2. ເອົາໄສ້ຕອງອອກຈາກຖາດ.
3. ຖິ້ມທາດໃສ່ຢາຕາມມາດຕະຖານທີ່ນຳໃຊ້ໄດ້.
4. ເລືອກປິດປະຕູ. ຖາດຖືກໂຫຼດຄືນໃໝ່.
5. ເລືອກໜ້າຫຼັກເພື່ອກັບຄືນຫາໜ້າຈໍຫຼັກ.
   • ໝາຍເຫດ: ເນື່ອງຈາກຖັງບັນຈຸມີກົນໄກທັງຫມົດໃນການເຮັດວຽກຂອງລະບົບ, ເຊັ່ນດຽວກັນກັບອ່າງເກັບນ້ໍາເພື່ອເກັບກໍາ reagents ທີ່ໃຊ້ແລ້ວ, ບໍ່ຈໍາເປັນຕ້ອງມີການລ້າງເຄື່ອງມືຫຼັງຈາກແລ່ນ.

ປະຫວັດການແກ້ໄຂ

ຮຸ່ນ	ວັນທີ	ລາຍລະອຽດ
1.0	2021-12-01	ໃໝ່

www.olink.com

ສໍາລັບການນໍາໃຊ້ການຄົ້ນຄວ້າເທົ່ານັ້ນ. ບໍ່ແມ່ນສໍາລັບການນໍາໃຊ້ໃນຂັ້ນຕອນການວິນິດໄສ.

ຜະລິດຕະພັນນີ້ປະກອບມີໃບອະນຸຍາດສໍາລັບການນໍາໃຊ້ທີ່ບໍ່ແມ່ນການຄ້າຂອງຜະລິດຕະພັນ Olink. ຜູ້ໃຊ້ການຄ້າອາດຈະຕ້ອງການໃບອະນຸຍາດເພີ່ມເຕີມ. ກະລຸນາຕິດຕໍ່ Olink Proteomics AB ສໍາລັບລາຍລະອຽດ. ບໍ່​ມີ​ການ​ຮັບ​ປະ​ກັນ​, ສະ​ແດງ​ອອກ​ຫຼື​ໂດຍ​ຄວາມ​ຫມາຍ​, ທີ່​ຂະ​ຫຍາຍ​ນອກ​ເຫນືອ​ການ​ອະ​ທິ​ບາຍ​ນີ້​. Olink Proteomics AB ບໍ່ຮັບຜິດຊອບຕໍ່ຄວາມເສຍຫາຍຂອງຊັບສິນ, ການບາດເຈັບສ່ວນບຸກຄົນ, ຫຼືການສູນເສຍທາງດ້ານເສດຖະກິດທີ່ເກີດຈາກຜະລິດຕະພັນນີ້. ເຄື່ອງຫມາຍການຄ້າຕໍ່ໄປນີ້ແມ່ນເປັນເຈົ້າຂອງໂດຍ Olink Proteomics AB: Olink®. ຜະ​ລິດ​ຕະ​ພັນ​ນີ້​ແມ່ນ​ກວມ​ເອົາ​ໂດຍ​ສິດ​ທິ​ບັດ​ຈໍາ​ນວນ​ຫນຶ່ງ​ແລະ​ຄໍາ​ຮ້ອງ​ສະ​ຫມັກ​ສິດ​ທິ​ບັດ​ທີ່​ມີ​ຢູ່​ໃນ https://www.olink.com/patents/.

© ສະຫງວນລິຂະສິດ 2021 Olink Proteomics AB. ເຄື່ອງໝາຍການຄ້າຂອງພາກສ່ວນທີສາມທັງໝົດແມ່ນເປັນຊັບສິນຂອງເຈົ້າຂອງທີ່ກ່ຽວຂ້ອງ.

Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, ສວີເດນ

1193, v1.0, 2021-12-01

ເອກະສານ / ຊັບພະຍາກອນ

Olink NextSeq 2000 Explore Sequencing System [pdf] ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ NextSeq 2000, Explore Sequencing System, NextSeq 2000 Explore Sequencing System

ເອກະສານອ້າງອີງ

• ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້