NextSeq 550 ကို အသုံးပြု၍ Olink Explore Sequencing

နိဒါန်း

ရည်ရွယ်အသုံးပြုခြင်း။
Olink® Explore သည် လူ့ပရိုတင်းဇီဝမှတ်စုရှာဖွေတွေ့ရှိမှုအတွက် multiplex immunoassay ပလပ်ဖောင်းတစ်ခုဖြစ်သည်။ ထုတ်ကုန်သည် သုတေသနပြုလုပ်ရန်အတွက်သာ ရည်ရွယ်ပြီး ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ငန်းစဉ်များတွင် အသုံးပြုရန်မဟုတ်ပါ။ ဓာတ်ခွဲခန်းလုပ်ငန်းကို လေ့ကျင့်သင်ကြားထားသော ဓာတ်ခွဲခန်းဝန်ထမ်းများကသာ လုပ်ဆောင်ရမည်။ Data processing ကို လေ့ကျင့်သင်ကြားထားသော ဝန်ထမ်းများမှသာ လုပ်ဆောင်ရပါမည်။ ရလဒ်များကို အခြားလက်တွေ့ သို့မဟုတ် ဓာတ်ခွဲခန်းတွေ့ရှိချက်များနှင့် တွဲဖက်၍ သုတေသီများက အသုံးပြုရန် ရည်ရွယ်သည်။

ဒီလက်စွဲစာအုပ်အကြောင်း
ဤအသုံးပြုသူလက်စွဲစာအုပ်သည် Illumina® NextSeq™ 550 ရှိ Olink® Explore Libraries များကို စီစဥ်ရန် လိုအပ်သော ညွှန်ကြားချက်များကို ပေးဆောင်ပါသည်။ ညွှန်ကြားချက်များကို တင်းတင်းကျပ်ကျပ် ပြတ်သားစွာ လိုက်နာရပါမည်။ ဓာတ်ခွဲခန်းအဆင့်များတစ်လျှောက် သွေဖည်မှုများသည် ဒေတာချို့ယွင်းမှုဖြစ်စေနိုင်သည်။ ဓာတ်ခွဲခန်းအလုပ်အသွားအလာမစတင်မီ Olink® Explore Over ကို တိုင်ပင်ပါ။view ဓါတ်ကူပစ္စည်း၊ စက်ကိရိယာနှင့် လိုအပ်သောစာရွက်စာတမ်းများအကြောင်း အချက်အလက်အပါအဝင် ပလက်ဖောင်းကို မိတ်ဆက်ရန်အတွက် အသုံးပြုသူလက်စွဲ၊view အလုပ်အသွားအလာနှင့် ဓာတ်ခွဲခန်းလမ်းညွှန်ချက်များ။ Olink® Explore Reagent Kits ကို မည်သို့လည်ပတ်ရမည်နည်း လမ်းညွှန်ချက်များအတွက် သက်ဆိုင်ရာ Olink® Explore User Manual အား ကိုးကားပါ။ Olink® Explore sequence ရလဒ်များကို ဒေတာလုပ်ဆောင်ခြင်းနှင့် ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအတွက် Olink® MyData Cloud အသုံးပြုသူလမ်းညွှန်ကို ကိုးကားပါ။ ဤပစ္စည်းတွင်ပါရှိသော ကုန်အမှတ်တံဆိပ်နှင့် မူပိုင်ခွင့်များအားလုံးသည် Olink® Proteomics AB ၏ ပိုင်ဆိုင်မှုဖြစ်သည်၊

နည်းပညာနှင့်ပတ်သက်သောအထောက်အပံ့
နည်းပညာပံ့ပိုးမှုအတွက်၊ Olink Proteomics တွင် ဆက်သွယ်ပါ။ support@olink.com.

ဓာတ်ခွဲခန်းညွှန်ကြားချက်

NextSeq™ 550/500 High Output Kit v550 (2.5 Cycles) ကို အသုံးပြု၍ NextSeq™ 75 တွင် Olink Libraries များကို စီတန်းရန် ဤအခန်းတွင် လမ်းညွှန်ချက်များ ပေးထားပါသည်။ စီစစ်ရန်အတွက်အသုံးပြုသည့်ပရိုတိုကောသည် Illumina® NextSeq™ 550 အတွက် Illumina® စံ NGS အလုပ်အသွားအလာကို လိုက်လျောညီထွေဖြစ်စေသည်။ စီစစ်ခြင်းမပြုမီ၊ သန့်စင်ထားသောစာကြည့်တိုက်၏ အရည်အသွေးကို စစ်ဆေးပြီးဖြစ်ကြောင်း သေချာပါစေ။ အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုဆိုင်ရာ ညွှန်ကြားချက်များအတွက် သက်ဆိုင်ရာ Olink Explore User Manual အား ကိုးကားပါ။

Sequencing Run ကို စီစဉ်ပါ။
Olink Library တစ်ခုအား NextSeq™ 550 High Output flow cell နှင့် run မှုတစ်ခုစီတွင် စီတန်းနိုင်ပါသည်။ မတူညီသော Olink Explore Reagent Kits များကို ဇယား 1 တွင်ဖော်ပြထားသော စီစဥ်ရန် လိုအပ်သော High Output စီးဆင်းမှုဆဲလ်အရေအတွက်နှင့် လည်ပတ်မှုများသည် ဇယား XNUMX တွင်ဖော်ပြထားသည်။ တစ်ခုထက်ပို၍ လုပ်ဆောင်ရန် လိုအပ်ပါက၊ ဤလက်စွဲတွင်ဖော်ပြထားသည့် ညွှန်ကြားချက်များကို ပြန်လုပ်ပါ။

ဇယား 1.Sequencing run planning-

Olink® Explore Reagent Kit	Olink Libraries အရေအတွက်	စီးဆင်းမှုဆဲလ်(များ) နှင့် run(s) အရေအတွက်
Olink® Explore 384 Reagent Kit	1	1
Olink® Explore 4 x 384 Reagent Kit	4	4
Olink® Explore 1536 Reagent Kit	4	4
Olink® Expansion Reagent Kit ကိုစူးစမ်းပါ။	4	4
Olink® Explore 3072 Reagent Kit	8	8

Olink® စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းကို ထည့်သွင်းပါ။
ဤအဆင့်တွင်၊ Olink® စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းကို NextSeq™ 550 တွင် ထည့်သွင်းထားသည်။ ပထမအကြိမ် Olink sequencing လုပ်ဆောင်ခြင်း မလုပ်ဆောင်မီ ဤအဆင့်ကို တစ်ကြိမ်သာ လုပ်ဆောင်ရန် လိုအပ်သည်။
မှတ်ချက်: Olink စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းသည် NextSeq™ 500/550 High Output Kits နှင့် NextSeq™ Control Software 4.0 တို့နှင့်သာ အလုပ်လုပ်ပါမည်။

1. ဇစ်ဖွင့်ပြီး Olink စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်း Olink_NSQ550_HighOutput_V1 ကို NextSeq™ 550 တူရိယာ၏အောက်ပါဖိုင်တွဲတွင် နေရာချပါ- C:\Program Files\Illumina\NextSeq ထိန်းချုပ်ရေးဆော့ဖ်ဝဲ\Recipe\Custom\High\။
2. စနစ်စိတ်ကြိုက်ပြင်ဆင်ခြင်း > ကိရိယာကို စီမံပါ အောက်တွင် စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းများကို ဖွင့်ပါ။ မရွေးချယ်ပါက၊ စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းရွေးချယ်ခွင့်ကို စတင်ထည့်သွင်းစဉ်အတွင်း ပေါ်လာမည်မဟုတ်ပါ။

မှတ်ချက်: NCS 4.0 ဆော့ဖ်ဝဲဗားရှင်းတွင်၊ အစောပိုင်းစနစ်ထည့်သွင်းမှုစာမျက်နှာတွင်မဟုတ်ဘဲ ဓါတ်ကူပုံးတင်ပြီးနောက်မှသာ စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းကို ရွေးချယ်ရန် ရွေးချယ်ခွင့်သည် ဖြစ်ပေါ်လာမည်ဖြစ်သည်။
မှတ်ချက်: စိတ်ကြိုက်ချက်ပြုတ်နည်းများကိုခွင့်ပြုရန် လည်ပတ်မှုကို လူကိုယ်တိုင်မုဒ်တွင် သတ်မှတ်ရပါမည်။

sequencing ဓာတ်ပစ္စည်းများကို ပြင်ဆင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ အစုလိုက်အပြုံလိုက်နှင့် အစီအမံပါဝင်သည့် ဓာတ်ပစ္စည်းများပါဝင်သော ယမ်းတောင့်ကို သုတ်ပြီး စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ပြင်ဆင်သည်။

ယမ်းတောင့်ကို ပြင်ဆင်ပါ။
သတိပေးချက်- ယမ်းတောင့်တွင် အန္တရာယ်ဖြစ်စေနိုင်သော ဓာတုပစ္စည်းများ ပါဝင်ပါသည်။ လုံလောက်သော အကာအကွယ်ပစ္စည်းများကို ဝတ်ဆင်ပြီး သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အသုံးပြုထားသော ဓာတ်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။ ပိုမိုသိရှိလိုပါက၊ Illumina NextSeq 550 စနစ်လမ်းညွှန် (document #15069765) ကို ကိုးကားပါ။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2 (75 cycles)။

ညွှန်ကြားချက်များ

1. အေးခဲထားသော ဓါတ်ဆေးတောင့်ကို အခန်းပူရေထဲတွင် တစ်ဝက်မြုပ်အောင်ထားကာ 1 နာရီကြာအောင် နွေးပါစေ။ ယမ်းတောင့်များ ၏ ဓါတ်ဆေး လှောင်ကန်များ အားလုံးကို လုံးလုံး ဖြူစင်အောင် သေချာအောင် လုပ်ပါ။
   မှတ်ချက်: အဆင်ပြေစေရန်အတွက် ယမ်းတောင့်ကို မနေ့ က သုတ်ပြီး 4°C တွင် တစ်ည သိမ်းဆည်းပါ။ ဤအပူချိန်တွင်၊ ဓာတ်ပစ္စည်းများသည် တစ်ပတ်အထိ တည်ငြိမ်သည်။
2. ကျည်တောင့်အောက်ခြေကို စက္ကူသုတ်ပဝါဖြင့် သေချာအခြောက်ခံပြီး လိုအပ်ပါက သတ္တုပြားအလုံအလောက်များကို နီရဲခြင်းမရှိသော တစ်ရှူးဖြင့် ခြောက်အောင်သုတ်ပါ။
3. အတွင်းမှ ဖျော်ထားသော ဖျော်ရည်များကို သေချာရောနှောရန် ယမ်းတောင့်ကို ဆယ်ကြိမ်ပြောင်းလိုက်ပါ။
4. လေပူဖောင်းများကို ဖယ်ရှားရန် ထိုင်ခုံပေါ်ရှိ ယမ်းတောင့်ကို ညင်သာစွာ နှိပ်ပါ။ ကျည်တောင့်ကို ၄ နာရီအတွင်း အသုံးပြုမည်ဆိုပါက အခန်းအပူချိန်တွင် သိမ်းဆည်းပါ။

flow cell ကို ပြင်ဆင်ပါ။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• 1x NextSeq™ 500/550 မြင့်မားသော Output Flow Cell v2.5။

ညွှန်ကြားချက်များ

1.  အအေးခန်းထဲထည့်ထားတဲ့ flow cell ကို အခန်းအပူချိန်မှာ မိနစ် 30 ထားပါ။
2.  အမှုန့်ကင်းသော လက်အိတ်အသစ်များ ဝတ်ဆင်ပါ (Flow cell ၏ဖန်မျက်နှာပြင်ကို မညစ်ညမ်းစေရန်)။
3.  ကိရိယာထဲသို့ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို တင်ရန် အဆင်သင့်ဖြစ်သောအခါ၊ အထုပ်နှင့် ပလပ်စတစ် clamshell တို့မှ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို ဖယ်ရှားပါ။
4.  စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကိုစစ်ဆေးပါ။ အမှုန်အမွှားများ သို့မဟုတ် ဖုန်မှုန့်များကို ဖန်မျက်နှာပြင်တစ်ခုခုတွင် မြင်ပါက၊ အသုံးပြုနိုင်သော မျက်နှာပြင်ကို ပျဉ်းမကပ်သော isopropyl alcohol ဖြင့် ဆေးကြောသန့်စင်ပြီး အလင်းမွှားသော ဓာတ်ခွဲခန်းတစ်ရှူးဖြင့် အခြောက်ခံပါ။

စီစီခြင်းအတွက် Olink® Library ကို ပြင်ဆင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ NaOH နှင့် Tris-HCl အရောအနှောများကို ပြင်ဆင်ထားပြီး၊ သန့်စင်ပြီး အရည်အသွေးထိန်းချုပ်ထားသော Olink Library ကို ဆင့်ကဲအဆင့်များတွင် ရောနှောပြီး denature ပြုလုပ်ထားသည်။

NaOH dilution ကိုပြင်ဆင်ပါ။
Libraries များကို ထူထဲအောင်ပြုလုပ်ရန် NaOH မှေးမှိန်ခြင်းကို အသုံးပြုသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• 1 N NaOH စတော့ရှယ်ယာ
• MilliQ ရေ
• 1x Microcentrifuge tube (1.5 mL)
• Manual pipette (10-100 μL)
• pipette အကြံပြုချက်များကို စစ်ထုတ်ပါ။

မစတင်မီ
microcentrifuge tube “NaOH” ကို အမှတ်အသားပြုပါ။

ညွှန်ကြားချက်များ

1. ဇယား 0.2 အရ NaOH Tube တွင် 2 N NaOH ဖျော်ရည်ကို ပြင်ဆင်ပါ။
2. Vortex သည် NaOH Tube ကို နှိုက်နှိုက်ချွတ်ချွတ်နှင့် အောက်သို့ လှည့်ပတ်ပါ။ 12 နာရီအတွင်းအသုံးပြုပါ။

ဇယား 2. 0.2 N NaOH dilution

ဓါတ်ဆေး	ထုထည် (μL)
MilliQ ရေ	80
1 N NaOH စတော့ရှယ်ယာ	20

2.4.2 Tris-HCl ဖျော်ရည်ကို ပြင်ဆင်ပါ။
Tris-HCl မှေးမှိန်ခြင်းအား denaturated Library ကို ဖျက်ရန် အသုံးပြုသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• 1 M Tris-HCl pH 7.0 စတော့ရှယ်ယာ (Trizma® ဟိုက်ဒရိုကလိုရိုက်ဖြေရှင်းချက်)
• MilliQ ရေ
• 1x Microcentrifuge tube (1.5 mL)
• Manual pipette (10-100 μL)
• pipette အကြံပြုချက်များကို စစ်ထုတ်ပါ။

မစတင်မီ

• Microcentrifuge tube “Tris-HCl” ကို အမှတ်အသားပြုပါ။

ညွှန်ကြားချက်များ

1. ဇယား 200 အရ Tris-HCl Tube တွင် 3 mM Tris-HCl ဖျော်ရည်ကို ပြင်ဆင်ပါ။
2. Vortex Tris-HCl Tube ကို နှိုက်နှိုက်ချွတ်ချွတ် လုပ်ပြီး အောက်သို့ လှည့်ပါ။

ဇယား 3. 200 mM Tris-HCl ဖျော်ရည်-

ဓါတ်ဆေး	ထုထည် (μL)
MilliQ ရေ	80
1M Tris-HCl pH 7.0 စတော့ရှယ်ယာ (Trizma® ဟိုက်ဒရိုကလိုရိုက်ဖြေရှင်းချက်)	20

Olink® စာကြည့်တိုက်များကို မှေးမှိန်လိုက်ပါ။
ဤအဆင့်တွင်၊ သန့်စင်ပြီး အရည်အသွေးထိန်းချုပ်ထားသော Olink စာကြည့်တိုက်သည် 1:33 ကို မှေးမှိန်သွားစေသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• သက်ဆိုင်ရာ Olink Explore အသုံးပြုသူလက်စွဲအတိုင်း ပြင်ဆင်ထားသည့် Lib Tube
• MilliQ ရေ
• 1x Microcentrifuge tube (1.5 mL)
• Manual pipettes (0.5-10 နှင့် 100-1000 μL)
• pipette အကြံပြုချက်များကို စစ်ထုတ်ပါ။

မစတင်မီ

• အေးနေပါက Lib Tube ကို သုတ်ပါ။
• microcentrifuge tube အသစ်ကို အမှတ်အသားပြုပါ- “Dil”။

ညွှန်ကြားချက်များ

1. MilliQ ရေ 96 μL ကို Dil Tube သို့ထည့်ပါ။
2. Vortex သည် Lib Tube နှင့် ၎င်းကို တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။
3. 3 μL ကို Lib Tube မှ Dil Tube သို့ လွှဲပြောင်းပါ။
4. Vortex သည် Dil Tube ကို ခေတ္တမျှ လှည့်ပတ်ပါ။

Denature နှင့် Olink® Library ကို နောက်ဆုံးတင်ပေးသည့် အာရုံစူးစိုက်မှုသို့ မှေးမှိန်စေပါသည်။
ဤအဆင့်တွင်၊ မှေးမှိန်သွားသော Olink Library သည် အသွင်ပြောင်းသွားပြီး နောက်ဆုံး loading အာရုံစူးစိုက်မှုသို့ ထပ်ပြီး မှေးမှိန်သွားပါသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသော Dil Tube
• ယခင်အဆင့်တွင် အသစ်ပြင်ဆင်ထားသော 0.2 N NaOH ဖျော်ရည်
• 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) ဖျော်ရည်၊ ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသည်။
• NextSeq™ Accessory Box v1 တွင် ပါဝင်သော ပေါင်းစပ်ထည့်သွင်းမှု ကြားခံ 1 (HT2)
• 2x Microcentrifuge ပြွန်များ (1.5 mL နှင့် 2 mL)
• Manual pipettes (0.5-10 နှင့် 100-1000 μL)
• pipette အကြံပြုချက်များကို စစ်ထုတ်ပါ။

မစတင်မီ

• အေးခဲထားသော HT1 ကြားခံကို အခန်းအပူချိန်တွင် ရောထားပါ။ အသုံးပြုသည်အထိ +4 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်သိမ်းဆည်းပါ။
• 1.5 mL မိုက်ခရိုဝေ့ဖ်သုံးပြွန်အသစ်ကို အမှတ်အသားပြုပါ- "Den" (အသွင်ပြောင်းစာကြည့်တိုက်အတွက်)။
• 2 mL microcentrifuge tube အသစ်ကို အမှတ်အသားပြုပါ- "Seq" (Library ကိုဖွင့်ရန်အဆင်သင့်အတွက်)။

ညွှန်ကြားချက်များ

1. 5 μL ကို Dil Tube မှ Den Tube သို့ လွှဲပြောင်းပါ။
2. 5 N NaOH ၏ 0.2 μL ကို Den Tube သို့ထည့်ပါ။
3. Vortex the Den Tube နှင့် ၎င်းကို တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။
4. စာကြည့်တိုက်ကို ခိုင်ခံ့စေရန် အခန်းအပူချိန်တွင် 5 မိနစ်ခန့် ဖန်သားပေါက်ကို မီးဖုတ်ပါ။
5. တုံ့ပြန်မှုကို ပျက်ပြယ်စေရန် 5 mM Tris-HCl (pH 200) ၏ 7.0 μL ကို Den Tube ထဲသို့ ထည့်ပါ။
6. Vortex the Den Tube နှင့် ၎င်းကို တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။
7. သန့်စင်ထားသော HT985 ၏ 1 μL ကို Den Tube သို့ထည့်ပါ။
8. Vortex the Den Tube နှင့် ၎င်းကို တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပါ။ အဆိုပါ tube ကို (တစ်နေ့တည်း) အသုံးပြုသည်အထိ +4 ဒီဂရီစင်တီဂရိတ်တွင်သိမ်းဆည်းထားနိုင်သည်။
9. Den Tube မှ 205 μL ကို Seq Tube သို့ လွှဲပြောင်းပါ။
10. ကြိုတင်ပြုလုပ်ထားသော HT1095 ၏ 1 μL ကို Seq Tube သို့ထည့်ပါ။
11. ဓာတ်ပစ္စည်းများကို ရောနှောပြီး တိုတိုတုတ်တုတ် လှည့်ပတ်ရန် Seq Tube ကို ပြောင်းလိုက်ပါ။ နောက်ဆုံး loading volume သည် 1.3 mL ဖြစ်သည်။
12. 2.5 တွင် Olink® စီတန်းစီခြင်းကို လုပ်ဆောင်ရန် ချက်ခြင်း ဆက်လက်လုပ်ဆောင်ပါ။

Olink® ဆင့်ကဲလုပ်ဆောင်ခြင်းကို လုပ်ဆောင်ပါ။

ဤအဆင့်တွင်၊ ကြားခံကျည်တောင့်၊ စီးဆင်းမှုဆဲလ်နှင့် Olink Library ပါရှိသော ပြင်ဆင်ထားသော ဓါတ်ပုံးကို NextSeq 550 ထဲသို့ ထည့်သွင်းပြီး ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်ခြင်းကို Olink စိတ်ကြိုက်စာရွက်ကို အသုံးပြု၍ စတင်ပါသည်။

ခုံတန်းရှည်ပြင်ဆင်ပါ။

• ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသည့် Seq Tube (Library ကို တင်ရန်အဆင်သင့်ပါ)
• 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2၊ ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသည်
• 1x NextSeq™ 500/550 High Output Flow Cell v2.5၊ ယခင်အဆင့်တွင် ပြင်ဆင်ထားသည်
• အခန်းအပူချိန်တွင် 1x NextSeq™ 500/550 Buffer Cartridge v2 (75 cycles)

ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်ခြင်း ဘောင်များကို သတ်မှတ်ပါ။
ဤအဆင့်တွင် NextSeq™ 550 တွင် ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်သည့် ကန့်သတ်ဘောင်များကို ရွေးထားသည်။

1. NextSeq™ 550 ပင်မစခရင်တွင် စမ်းသပ်မှုကို ရွေးချယ်ပါ။
2. Select Assay မျက်နှာပြင်တွင်၊ Sequence ကိုရွေးချယ်ပါ။
3. Run Setup စာမျက်နှာတွင်၊ Manual run mode ကိုရွေးချယ်ပြီး Next ကိုရွေးချယ်ပါ။
4. ပြေးဘောင်များကို အောက်ပါအတိုင်း သတ်မှတ်ပါ။
   • Run Name အကွက်တွင်၊ ထူးခြားသောစမ်းသပ်မှု ID ကိုထည့်ပါ။
   • စာကြည့်တိုက် ID အကွက်တွင် သင်အသုံးပြုနေသည့် စာကြည့်တိုက် ID ကို ထည့်ပါ (ချန်လှပ်ထားနိုင်သည်)။
   • Read Type အကွက်တွင်၊ Single Read option ကို ရွေးပါ။
   • အောက်ပါအတိုင်း သံသရာအရေအတွက်ကို ထည့်ပါ-
     • ၁:၂၄ ကိုဖတ်ပါ။
     • အညွှန်း ၁:၀
     • အညွှန်း ၁:၀
     • ၁:၂၄ ကိုဖတ်ပါ။
   • စိတ်ကြိုက် primer များကို ရွေးချယ်မထားသည့် အမှတ်ခြစ်ကွက်ကို ထားပါ။
   • လက်ရှိအသုံးပြုနေသည့် ဒေတာအကြမ်းအတွက် အထွက်ဖိုင်တွဲတည်နေရာကို သတ်မှတ်ပါ။ အထွက်ဖိုင်တွဲတည်နေရာကို ပြောင်းလဲရန် Browse ကိုရွေးချယ်ပါ။
5. S မသတ်မှတ်ပါနှင့်ample Sheet
6. ဤလုပ်ဆောင်မှုအတွက် Purge consumables ကို ရွေးပါ။
7. Next ကို ရွေးပါ။

NextSeq™ 550 သို့ စီးဆင်းမှုဆဲလ်ကို တင်ပါ။

1. အသုံးပြုထားသော flow cell ကို ယခင် run မှ ဖယ်ရှားပါ။
2. ပြင်ဆင်ထားသော flow cell အသစ်ကို s ပေါ်တွင် ထားလိုက်ပါ။tage.
3. Load ကို ရွေးပါ။ တံခါးက အလိုအလျောက် ပိတ်သွားသည် ။
4. flow cell ID သည် စခရင်ပေါ်တွင် ပေါ်လာပြီး အာရုံခံကိရိယာများကို အစိမ်းရောင်ဖြင့် အမှန်ခြစ်ထားသောအခါ၊ Next ကို ရွေးပါ။

ဓါတ်ဆေးဘူးကို ဗလာ
သတိပေးချက်- ဤဓာတ်ပစ္စည်းအစုံတွင် အန္တရာယ်ဖြစ်စေနိုင်သော ဓာတုပစ္စည်းများပါရှိသည်။ လုံလောက်သော အကာအကွယ်ပစ္စည်းများကို ဝတ်ဆင်ပြီး သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အသုံးပြုထားသော ဓာတ်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။ ပိုမိုသိရှိလိုပါက၊ Illumina NextSeq 550 စနစ်လမ်းညွှန်ကို ကိုးကားပါ။

1. ကြားခံခန်း၏တံခါးကိုဖွင့်ပါ၊ သုံးစွဲပြီးသားဓာတ်ပစ္စည်းများကို အောက်ခန်းမှဖယ်ရှားကာ သက်ဆိုင်ရာစံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ ပါဝင်ပစ္စည်းများကို စွန့်ပစ်ပါ။
2. လွတ်နေသော ဓါတ်ဆေးထည့်သည့် ကွန်တိန်နာကို အောက်ဘက်ကြားခံခန်းသို့ ပြန်ရွှေ့ပါ။ ကွန်တိန်နာကို မှန်ကန်စွာ နေရာချထားကြောင်း ကလစ်ဖြင့် ညွှန်ပြသည်။

ကြားခံကျည်တောင့်ကို တင်ပါ။

1. အသုံးပြုထားသော ကြားခံကျည်တောင့်ကို အပေါ်ပိုင်းကြားခံအကန့်မှ ဖယ်ရှားပြီး သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အကြောင်းအရာကို စွန့်ပစ်ပါ။
2. ကြားခံကျည်တောင့်အသစ်ကို အပေါ်ပိုင်းကြားခံအကန့်ထဲသို့ ပွတ်ဆွဲပါ။ အသံဖြင့် ကလစ်တစ်ချက်နှိပ်ခြင်းသည် ယမ်းတောင့်ကို မှန်ကန်စွာချထားကြောင်း ညွှန်ပြသည်။ ကြားခံကျည်တောင့် ID သည် စခရင်ပေါ်တွင် ပေါ်လာပြီး အာရုံခံကိရိယာများကို အစိမ်းရောင်ဖြင့် စစ်ဆေးထားကြောင်း သေချာပါစေ။
3. ကြားခံခန်း၏တံခါးကိုပိတ်ပြီး Next ကိုရွေးချယ်ပါ။

ဓါတ်ဆေးတောင့်ကို တင်ပါ။

1. ဓါတ်ဆေးခန်း၏ တံခါးကိုဖွင့်ပါ၊ အသုံးပြုထားသော ဓါတ်ခဲယမ်းတောင့်ကို ဖယ်ရှားကာ သက်ဆိုင်ရာ စံချိန်စံညွှန်းများနှင့်အညီ အသုံးမပြုသော အကြောင်းအရာများကို စွန့်ပစ်ပါ။ အန္တရာယ်ကင်းစွာ စွန့်ပစ်ရန်လွယ်ကူစေရန် အနေအထား 6 ရှိ ရေလှောင်ကန်အား ဖယ်ရှားနိုင်သည်။
2. သန့်ရှင်းသော 10 mL ပိုက်အစွန်အဖျားဖြင့် “Load Library Here” ဟု တံဆိပ်ကပ်ထားသော ရေလှောင်ကန်အမှတ် 1 ၏တံဆိပ်ကို ဖောက်ပါ။
3. Seq Tube မှ Olink Library ကို 1.3 mL ကို "Load Library Here" ဟုတံဆိပ်တပ်ထားသော #10 ရေလှောင်ကန်ထဲသို့ထည့်ပါ။
4. ဓါတ်ဆေးတောင့်အသစ်ကို ဓါတ်ဆေးခန်းထဲသို့ ပွတ်ဆွဲပြီး ဓါတ်ဆေးခန်းတံခါးကို ပိတ်ပါ။
5. Load ကိုရွေးချယ်ပြီး ဖန်သားပြင်ပေါ်တွင် တုံ့ပြန်ဆေးတောင့် ID ပေါ်လာပြီး အာရုံခံကိရိယာများကို အစိမ်းရောင်ဖြင့် စစ်ပြီးသည်အထိ ~30 စက္ကန့်စောင့်ပါ။
6. ချက်ပြုတ်နည်း drop-down စာရင်းမှ၊ [စိတ်ကြိုက်] “Olink_NSQ550_HighOutput_V1” ဟင်းချက်နည်းရွေးချယ်မှုကို ရွေးပါ။
7. Next ကို ရွေးပါ။

Sequencing Run ကို စတင်ပါ။

1. Re တွင်ပြသထားသော run parameters များကိုအတည်ပြုပါ။view မျက်နှာပြင်။ မည်သည့်ဘောင်များကိုမဆို တည်းဖြတ်ရန် Back ကိုနှိပ်ပြီး Run Setup မျက်နှာပြင်သို့ ပြန်သွားပါ။
2. Next ကို ရွေးပါ။ အလိုအလျောက် အကြိုစစ်ဆေးပြီးနောက် ပြေးခြင်းစတင်သည်။ Sequencing run time သည် ခန့်မှန်းခြေအားဖြင့် 7h30 min ဖြစ်သည်။
3. အလုပ်ဧရိယာကို သန့်ရှင်းရေးလုပ်ပါ။

မှတ်ချက်: ဆက်တိုက်လုပ်ဆောင်ခြင်းပြီးမြောက်သောအခါ၊ ဆော့ဖ်ဝဲသည် ကြားခံကျည်တောင့်တွင် ပေးထားသည့် ဆေးကြောခြင်းဖြေရှင်းချက်များနှင့် ဓါတ်ခဲတောင့်တွင် ပေးထားသည့် NaOCl ကို အသုံးပြု၍ ဆော့ဖ်ဝဲသည် အလိုအလျောက်လည်ပတ်ပြီးသည့်ရေဆေးကို စတင်သည်။ ဤဆေးကြောမှုသည် မိနစ် 90 ခန့်ကြာသည်။ ဆေးကြောခြင်းပြီးသည်နှင့် ပင်မခလုတ်သည် အသက်ဝင်ပါသည်။ အသုံးပြုထားသော ကျည်တောင့်များနှင့် စီးဆင်းမှုဆဲလ်များကို နောက်တစ်ကြိမ်လုပ်ဆောင်သည့်အချိန်အထိ ချန်ထားနိုင်သည်။

လည်ပတ်မှုတိုးတက်မှုကို စောင့်ကြည့်ပါ။
Olink သည် s တွင်ပေးထားသောပရိုတိန်း၏အာရုံစူးစိုက်မှုကိုခန့်မှန်းရန်အတွက်လူသိများသော sequence ပမာဏကိုတွက်ချက်ရန် NGS ကိုအသုံးပြုသည်amples (အခြား s နှင့်ဆက်စပ်amples)။ Explore sequencing run တစ်ခုစီမှ ဒေတာအရည်အသွေးကို Olink နည်းပညာ၏ သီးခြား QC ကန့်သတ်ဘောင်များဖြင့် ဆုံးဖြတ်သည်။ ထို့ကြောင့် Q-score ကဲ့သို့သော သမားရိုးကျ NGS တွင်အသုံးပြုသည့် စံအရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုမက်ထရစ်များသည် အရေးပါမှုနည်းပါးသည်။

ပြန်လည်ပြင်ဆင်မှုမှတ်တမ်း

ဗားရှင်း	ရက်စွဲ	ဖော်ပြချက်
1.1	၇၃၆-၇၈၄-၆၀၉၄	အယ်ဒီတာ့အာဘော် အပြောင်းအလဲများ
1.0	၇၃၆-၇၈၄-၆၀၉၄	အသစ်

www.olink.com
သုတေသနအတွက်သာ အသုံးပြုရန်။ ရောဂါရှာဖွေရေးလုပ်ထုံးလုပ်နည်းများတွင် အသုံးပြုရန်မဟုတ်ပါ။
ဤထုတ်ကုန်တွင် Olink ထုတ်ကုန်များကို စီးပွားဖြစ်မဟုတ်သော အသုံးပြုမှုအတွက် လိုင်စင်တစ်ခု ပါဝင်သည်။ ကူးသန်းရောင်းဝယ်ရေးအသုံးပြုသူများသည် နောက်ထပ်လိုင်စင်များ လိုအပ်နိုင်ပါသည်။ Olink ကိုဆက်သွယ်ပါ။
အသေးစိတ်အတွက် Proteomics AB ဤဖော်ပြချက်ထက် ကျော်လွန်သော အာမခံချက်များ၊ ဖော်ပြခြင်း သို့မဟုတ် အဓိပ္ပာယ်ဖွင့်ဆိုခြင်း မရှိပါ။ Olink Proteomics AB သည် ဤထုတ်ကုန်ကြောင့် ဖြစ်ပေါ်လာသော ပစ္စည်းပျက်စီးမှု၊ ကိုယ်ရေးကိုယ်တာ ထိခိုက်ဒဏ်ရာရမှု သို့မဟုတ် စီးပွားရေးဆုံးရှုံးမှုများအတွက် တာဝန်မကင်းပါ။
အောက်ပါကုန်အမှတ်တံဆိပ်ကို Olink Proteomics AB: Olink® မှပိုင်ဆိုင်သည်။
ဤထုတ်ကုန်တွင် ရရှိနိုင်သော မူပိုင်ခွင့်များနှင့် မူပိုင်ခွင့်လျှောက်လွှာများစွာဖြင့် အကျုံးဝင်ပါသည်။ https://www.olink.com/patents/.
© မူပိုင်ခွင့် 2021 Olink Proteomics AB တတိယအဖွဲ့အစည်း အမှတ်တံဆိပ်များအားလုံးသည် ၎င်းတို့၏ သက်ဆိုင်ရာပိုင်ရှင်များ၏ ပိုင်ဆိုင်မှုဖြစ်သည်။ Olink Proteomics၊ Dag Hammarskjölds väg 52B ၊ SE-752 37 Uppsala၊ ဆွီဒင်
1192, v1.1, 2021-12-13

စာရွက်စာတမ်းများ / အရင်းအမြစ်များ

NextSeq 550 ကို အသုံးပြု၍ Olink Explore Sequencing [pdf] အသုံးပြုသူလက်စွဲ NextSeq 550 ကိုအသုံးပြု၍ Sequencing ကိုစူးစမ်းပါ၊ NextSeq 550၊ NextSeq 550 ကိုအသုံးပြု၍ စူးစမ်းလေ့လာပါ

ကိုးကား

• အသုံးပြုသူလက်စွဲ