નેક્સ્ટસેક 550 નો ઉપયોગ કરીને ઓલિંક એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ

પરિચય

હેતુપૂર્વક ઉપયોગ
ઓલિંક® એક્સપ્લોર એ માનવ પ્રોટીન બાયોમાર્કરની શોધ માટે મલ્ટિપ્લેક્સ ઇમ્યુનોસે પ્લેટફોર્મ છે. ઉત્પાદનનો હેતુ માત્ર સંશોધનના ઉપયોગ માટે છે, અને ડાયગ્નોસ્ટિક પ્રક્રિયાઓમાં ઉપયોગ માટે નથી. લેબોરેટરીનું કામ માત્ર પ્રશિક્ષિત લેબોરેટરી સ્ટાફ દ્વારા જ ચલાવવામાં આવશે. ડેટા પ્રોસેસિંગ માત્ર પ્રશિક્ષિત સ્ટાફ દ્વારા જ કરવામાં આવશે. પરિણામો સંશોધકો દ્વારા અન્ય ક્લિનિકલ અથવા લેબોરેટરી તારણો સાથે ઉપયોગમાં લેવાના છે.

આ માર્ગદર્શિકા વિશે
આ વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા Illumina® NextSeq™ 550 પર Olink® એક્સપ્લોર લાઇબ્રેરીઓને અનુક્રમિત કરવા માટે જરૂરી સૂચનાઓ પ્રદાન કરે છે. સૂચનાઓનું સખત અને સ્પષ્ટપણે પાલન કરવું આવશ્યક છે. પ્રયોગશાળાના તમામ પગલાઓમાં કોઈપણ વિચલનો ક્ષતિગ્રસ્ત ડેટામાં પરિણમી શકે છે. લેબોરેટરી વર્કફ્લો શરૂ કરતા પહેલા, ઓલિંક® એક્સપ્લોર ઓવરની સલાહ લોview પ્લેટફોર્મના પરિચય માટે વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા, જેમાં રીએજન્ટ્સ, સાધનો અને જરૂરી દસ્તાવેજો વિશેની માહિતીનો સમાવેશ થાય છે.view વર્કફ્લો, તેમજ લેબોરેટરી માર્ગદર્શિકા તરીકે. Olink® એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ્સ કેવી રીતે ચલાવવી તે અંગેની સૂચનાઓ માટે, લાગુ પડતા Olink® એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલનો સંદર્ભ લો. ઓલિંક® એક્સપ્લોર સિક્વન્સ પરિણામોના ડેટા પ્રોસેસિંગ અને વિશ્લેષણ માટે, ઓલિંક® માયડેટા ક્લાઉડ વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકાનો સંદર્ભ લો. આ સામગ્રીમાં સમાવિષ્ટ તમામ ટ્રેડમાર્ક્સ અને કૉપિરાઇટ્સ Olink® Proteomics AB ની મિલકત છે, સિવાય કે અન્યથા જણાવ્યું હોય.

ટેકનિકલ સપોર્ટ
તકનીકી સપોર્ટ માટે, ઓલિંક પ્રોટીઓમિક્સનો અહીં સંપર્ક કરો support@olink.com.

લેબોરેટરી સૂચનાઓ

આ પ્રકરણ NextSeq™ 550/500 હાઇ આઉટપુટ કિટ v550 (2.5 સાયકલ) નો ઉપયોગ કરીને NextSeq™ 75 પર ઓલિંક લાઇબ્રેરીઓને કેવી રીતે અનુક્રમિત કરવી તે અંગેની સૂચનાઓ પ્રદાન કરે છે. સિક્વન્સિંગ માટે વપરાતો પ્રોટોકોલ એ Illumina® NextSeq™ 550 માટે Illumina® સ્ટાન્ડર્ડ NGS વર્કફ્લોનું અનુકૂલન છે. સિક્વન્સિંગમાં આગળ વધતા પહેલા, ખાતરી કરો કે શુદ્ધ લાઇબ્રેરીની ગુણવત્તા ચકાસવામાં આવી છે. ગુણવત્તા નિયંત્રણ વિશેની સૂચનાઓ માટે લાગુ ઓલિંક એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલનો સંદર્ભ લો.

સિક્વન્સિંગ રનની યોજના બનાવો
એક ઓલિંક લાઇબ્રેરી નેક્સ્ટસેક™ 550 હાઇ આઉટપુટ ફ્લો સેલ અને રન દીઠ અનુક્રમિત કરી શકાય છે. વિવિધ ઓલિંક એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ્સને અનુક્રમિત કરવા માટે જરૂરી ઉચ્ચ આઉટપુટ ફ્લો સેલ અને રનની સંખ્યા કોષ્ટક 1 માં વર્ણવેલ છે. જો એક કરતા વધુ રનની જરૂર હોય, તો આ માર્ગદર્શિકામાં વર્ણવેલ સૂચનાઓનું પુનરાવર્તન કરો.

કોષ્ટક 1. સિક્વન્સિંગ રન પ્લાનિંગ:

ઓલિંક® એક્સપ્લોર રીએજન્ટ કિટ	ઓલિંક પુસ્તકાલયોની સંખ્યા	ફ્લો સેલ(કો) અને રન(ઓ) ની સંખ્યા
Olink® એક્સપ્લોર 384 રીએજન્ટ કિટ	1	1
ઓલિંક® એક્સપ્લોર 4 x 384 રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સપ્લોર 1536 રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સ્પ્લોર એક્સ્પાન્સન રીએજન્ટ કિટ	4	4
Olink® એક્સપ્લોર 3072 રીએજન્ટ કિટ	8	8

Olink® કસ્ટમ રેસીપી ઇન્સ્ટોલ કરો
આ પગલા દરમિયાન, Olink® કસ્ટમ રેસીપી નેક્સ્ટસેક™ 550 પર ઇન્સ્ટોલ કરેલ છે. પ્રથમ વખત Olink સિક્વન્સિંગ રન કરવામાં આવે તે પહેલાં આ પગલું માત્ર એક જ વાર કરવાની જરૂર છે.
નોંધ: ઓલિંક કસ્ટમ રેસીપી ફક્ત NextSeq™ 500/550 હાઇ આઉટપુટ કિટ્સ અને NextSeq™ કંટ્રોલ સોફ્ટવેર 4.0 સાથે કામ કરશે.

1. નેક્સ્ટસેક™ 550 ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટના નીચેના ફોલ્ડરમાં Olink કસ્ટમ રેસીપી Olink_NSQ1_HighOutput_V550 અનઝિપ કરો અને મૂકો: C:\Program Files\Illumina\NextSeq કંટ્રોલ સોફ્ટવેર\રેસીપી\Custom\High\.
2. સિસ્ટમ કસ્ટમાઇઝેશન > મેનેજ ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટ હેઠળ, કસ્ટમ રેસિપી સક્ષમ કરો. જો પસંદ કરેલ ન હોય, તો કસ્ટમ રેસીપી વિકલ્પ રન સેટઅપ દરમિયાન દેખાશે નહીં.

નોંધ: NCS 4.0 સોફ્ટવેર વર્ઝનમાં, કસ્ટમ રેસીપી પસંદ કરવાનો વિકલ્પ રીએજન્ટ કારતૂસ લોડ થયા પછી જ આવશે, અગાઉના સેટઅપ પેજમાં નહીં.
નોંધ: કસ્ટમ રેસિપીને મંજૂરી આપવા માટે રનને મેન્યુઅલ મોડમાં સેટ કરવું આવશ્યક છે.

સિક્વન્સિંગ રીએજન્ટ્સ તૈયાર કરો

આ પગલા દરમિયાન, ક્લસ્ટરિંગ અને સિક્વન્સિંગ રીએજન્ટ્સ ધરાવતા રીએજન્ટ કારતૂસને પીગળવામાં આવે છે અને ફ્લો સેલ તૈયાર કરવામાં આવે છે.

રીએજન્ટ કારતૂસ તૈયાર કરો
ચેતવણી: રીએજન્ટ કારતૂસમાં સંભવિત જોખમી રસાયણો હોય છે. પર્યાપ્ત રક્ષણાત્મક સાધનો પહેરો અને લાગુ ધોરણો અનુસાર વપરાયેલ રીએજન્ટ્સનો ત્યાગ કરો. વધુ માહિતી માટે, Illumina NextSeq 550 સિસ્ટમ માર્ગદર્શિકા (દસ્તાવેજ #15069765) નો સંદર્ભ લો.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x NextSeq™ 500/550 ઉચ્ચ આઉટપુટ રીએજન્ટ કારતૂસ v2 (75 ચક્ર).

સૂચનાઓ

1. ફ્રોઝન રીએજન્ટ કારતૂસને રૂમ ટેમ્પર્ડ પાણીમાં અડધા ડૂબીને મૂકો અને તેને 1 કલાક માટે ઓગળવા દો. ખાતરી કરો કે કારતુસના તમામ રીએજન્ટ જળાશયો સંપૂર્ણપણે ઓગળેલા છે.
   નોંધ: અનુકૂળતા માટે, કારતૂસને એક દિવસ પહેલા પીગળી દો અને તેને 4 °C પર રાતભર સ્ટોર કરો. આ તાપમાને, રીએજન્ટ એક અઠવાડિયા સુધી સ્થિર હોય છે.
2. કારતૂસના આધારને કાગળના ટુવાલ વડે સારી રીતે સૂકવી દો અને જો જરૂરી હોય તો લિન્ટ-ફ્રી ટિશ્યુ વડે ફોઈલ સીલને સૂકવી દો.
3. અંદર ઓગળેલા રીએજન્ટ્સને સારી રીતે મિશ્રિત કરવા માટે કારતૂસને દસ વખત ઉલટાવો.
4. હવાના પરપોટા દૂર કરવા માટે બેન્ચ પર ધીમેધીમે કારતૂસને ટેપ કરો. કારતૂસને ઓરડાના તાપમાને સ્ટોર કરો જો તેનો ઉપયોગ 4 કલાકની અંદર કરવામાં આવશે.

ફ્લો સેલ તૈયાર કરો

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1x NextSeq™ 500/550 ઉચ્ચ આઉટપુટ ફ્લો સેલ v2.5.

સૂચનાઓ

1.  રેફ્રિજરેટેડ ફ્લો સેલને ઓરડાના તાપમાને 30 મિનિટ માટે લાવો.
2.  નવા પાવડર મુક્ત મોજા પહેરો (ફ્લો સેલની કાચની સપાટીને દૂષિત ન કરવા માટે).
3.  જ્યારે ઇન્સ્ટ્રુમેન્ટમાં ફ્લો સેલ લોડ કરવા માટે તૈયાર હોય, ત્યારે પેકેજમાંથી ફ્લો સેલ અને પ્લાસ્ટિક ક્લેમશેલ દૂર કરો.
4.  ફ્લો સેલનું નિરીક્ષણ કરો. જો કાચની કોઈપણ સપાટી પર કણો અથવા ધૂળ દેખાય છે, તો લાગુ પડતી સપાટીને લિન્ટ-ફ્રી આઇસોપ્રોપીલ આલ્કોહોલ વાઇપ વડે સાફ કરો અને લો-લિન્ટ લેબ ટિશ્યુ વડે તેને સૂકવો.

સિક્વન્સિંગ માટે ઓલિંક® લાઇબ્રેરી તૈયાર કરો

આ પગલા દરમિયાન, NaOH અને Tris-HCl ડિલ્યુશન તૈયાર કરવામાં આવે છે, અને શુદ્ધ અને ગુણવત્તા નિયંત્રિત ઓલિંક લાઇબ્રેરીને ક્રમિક પગલાઓમાં પાતળું અને વિકૃત કરવામાં આવે છે.

NaOH મંદન તૈયાર કરો
NaOH મંદનનો ઉપયોગ લાઇબ્રેરીઓને ડિનેચર કરવા માટે થાય છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1 એન NaOH સ્ટોક
• MilliQ પાણી
• 1x માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (1.5 એમએલ)
• મેન્યુઅલ પીપેટ (10-100 μL)
• ફિલ્ટર પીપેટ ટીપ્સ

તમે શરૂ કરો તે પહેલાં
માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ "NaOH" ને ચિહ્નિત કરો.

સૂચનાઓ

1. કોષ્ટક 0.2 મુજબ NaOH ટ્યુબમાં 2 N NaOH મંદન તૈયાર કરો.
2. NaOH ટ્યુબને સારી રીતે વમળ કરો અને નીચે સ્પિન કરો. 12 કલાકની અંદર ઉપયોગ કરો.

કોષ્ટક 2. 0.2 N NaOH મંદન

રીએજન્ટ	વોલ્યુમ (μL)
MilliQ પાણી	80
1 એન NaOH સ્ટોક	20

2.4.2 Tris-HCl મંદન તૈયાર કરો
Tris-HCl મંદનનો ઉપયોગ વિકૃત લાઇબ્રેરીને નિષ્ક્રિય કરવા માટે થાય છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• 1 M Tris-HCl pH 7.0 સ્ટોક (Trizma® હાઇડ્રોક્લોરાઇડ સોલ્યુશન)
• MilliQ પાણી
• 1x માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (1.5 એમએલ)
• મેન્યુઅલ પીપેટ (10-100 μL)
• ફિલ્ટર પીપેટ ટીપ્સ

તમે શરૂ કરો તે પહેલાં

• માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ "Tris-HCl" ને ચિહ્નિત કરો

સૂચનાઓ

1. કોષ્ટક 200 અનુસાર ટ્રિસ-એચસીએલ ટ્યુબમાં 3 એમએમ ટ્રિસ-એચસીએલ મંદન તૈયાર કરો.
2. Tris-HCl ટ્યુબને સારી રીતે વમળ કરો અને તેને નીચે ફેરવો.

કોષ્ટક 3. 200 એમએમ ટ્રિસ-એચસીએલ મંદન:

રીએજન્ટ	વોલ્યુમ (μL)
MilliQ પાણી	80
1M Tris-HCl pH 7.0 સ્ટોક (Trizma® હાઇડ્રોક્લોરાઇડ સોલ્યુશન)	20

ઓલિંક® લાઇબ્રેરીઓને પાતળું કરો
આ પગલા દરમિયાન, શુદ્ધ અને ગુણવત્તા નિયંત્રિત ઓલિંક લાઇબ્રેરી 1:33 પાતળું કરવામાં આવે છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• લિબ ટ્યુબ, લાગુ ઓલિંક એક્સપ્લોર યુઝર મેન્યુઅલ અનુસાર તૈયાર
• MilliQ પાણી
• 1x માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (1.5 એમએલ)
• મેન્યુઅલ પિપેટ્સ (0.5-10 અને 100-1000 μL)
• ફિલ્ટર પીપેટ ટીપ્સ

તમે શરૂ કરો તે પહેલાં

• લિબ ટ્યુબ થીજી જાય તો પીગળી લો.
• નવી માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબને ચિહ્નિત કરો: "દિલ".

સૂચનાઓ

1. દિલ ટ્યુબમાં 96 μL MilliQ પાણી ઉમેરો.
2. લિબ ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
3. લિબ ટ્યુબમાંથી 3 μL ને દિલ ટ્યુબમાં સ્થાનાંતરિત કરો.
4. દિલ ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો

ઓલિંક® લાઇબ્રેરીને અંતિમ લોડિંગ એકાગ્રતામાં ડેનેચર અને પાતળું કરો
આ પગલા દરમિયાન, ઓલિંક લાઇબ્રેરીને વિકૃત કરવામાં આવે છે અને અંતિમ લોડિંગ સાંદ્રતામાં વધુ પાતળું કરવામાં આવે છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• દિલ ટ્યુબ, અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• 0.2 N NaOH મંદન, અગાઉના પગલામાં તાજી રીતે તૈયાર
• 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) મંદન, અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• હાઇબ્રિડાઇઝેશન બફર 1 (HT1) NextSeq™ એક્સેસરી બોક્સ v2 માં સમાયેલ છે
• 2x માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબ (1.5 એમએલ અને 2 એમએલ)
• મેન્યુઅલ પિપેટ્સ (0.5-10 અને 100-1000 μL)
• ફિલ્ટર પીપેટ ટીપ્સ

તમે શરૂ કરો તે પહેલાં

• ઓરડાના તાપમાને સ્થિર HT1 બફરને પીગળી દો. ઉપયોગ થાય ત્યાં સુધી +4 °C પર સ્ટોર કરો.
• નવી 1.5 એમએલ માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબને ચિહ્નિત કરો: "ડેન" (ડિનેચ્યુરેટેડ લાઇબ્રેરી માટે).
• નવી 2 mL માઇક્રોસેન્ટ્રીફ્યુજ ટ્યુબને ચિહ્નિત કરો: “Seq” (લાઇબ્રેરી લોડ કરવા માટે તૈયાર છે).

સૂચનાઓ

1. દિલ ટ્યુબમાંથી ડેન ટ્યુબમાં 5 μL સ્થાનાંતરિત કરો.
2. ડેન ટ્યુબમાં 5 N NaOH ના 0.2 μL ઉમેરો.
3. ડેન ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
4. લાઇબ્રેરીને ડિનેચર કરવા માટે ડેન ટ્યુબને ઓરડાના તાપમાને 5 મિનિટ માટે ઉકાળો.
5. પ્રતિક્રિયાને નિષ્ક્રિય કરવા માટે ડેન ટ્યુબમાં 5 mM Tris-HCl (pH 200) ના 7.0 μL ઉમેરો.
6. ડેન ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો.
7. ડેન ટ્યુબમાં 985 μL પ્રિચિલ્ડ HT1 ઉમેરો.
8. ડેન ટ્યુબને વોર્ટેક્સ કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો. ઉપયોગ ન થાય ત્યાં સુધી ટ્યુબને +4 °C પર સંગ્રહિત કરી શકાય છે (તે જ દિવસે).
9. ડેન ટ્યુબમાંથી સેક ટ્યુબમાં 205 μL સ્થાનાંતરિત કરો.
10. Seq ટ્યુબમાં 1095 μL પ્રિચિલ્ડ HT1 ઉમેરો.
11. રીએજન્ટને મિશ્રિત કરવા માટે સેક ટ્યુબને ઊંધી કરો અને તેને થોડા સમય માટે નીચે ફેરવો. અંતિમ લોડિંગ વોલ્યુમ 1.3 એમએલ છે.
12. તરત જ 2.5 Olink® સિક્વન્સિંગ રન કરવાનું ચાલુ રાખો.

Olink® સિક્વન્સિંગ રન કરો

આ પગલા દરમિયાન, ઓલિંક લાઇબ્રેરી ધરાવતું બફર કારતૂસ, ફ્લો સેલ અને તૈયાર રીએજન્ટ કારતૂસ નેક્સ્ટસેક 550 માં લોડ કરવામાં આવે છે, અને ઓલિંક કસ્ટમ રેસીપીનો ઉપયોગ કરીને સિક્વન્સિંગ રન શરૂ થાય છે.

બેન્ચ તૈયાર કરો

• સેક ટ્યુબ (લાયબ્રેરી લોડ કરવા માટે તૈયાર સાથે), અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• 1x NextSeq™ 500/550 ઉચ્ચ આઉટપુટ રીએજન્ટ કારતૂસ v2, અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• 1x NextSeq™ 500/550 ઉચ્ચ આઉટપુટ ફ્લો સેલ v2.5, અગાઉના પગલામાં તૈયાર
• 1x NextSeq™ 500/550 બફર કારતૂસ v2 (75 ચક્ર), ઓરડાના તાપમાને

સિક્વન્સિંગ રન પેરામીટર્સ સેટ કરો
આ પગલા દરમિયાન, નેક્સ્ટસેક™ 550 પર સિક્વન્સિંગ રન પેરામીટર પસંદ કરવામાં આવ્યા છે.

1. NextSeq™ 550 હોમ સ્ક્રીન પર, પ્રયોગ પસંદ કરો.
2. સિલેક્ટ એસેસ સ્ક્રીન પર, સિક્વન્સ પસંદ કરો.
3. રન સેટઅપ પેજમાં, મેન્યુઅલ રન મોડ અને પછી નેક્સ્ટ પસંદ કરો.
4. નીચે પ્રમાણે રન પરિમાણો સેટ કરો:
   • Run Name ફીલ્ડમાં, એક અનન્ય પ્રયોગ ID દાખલ કરો.
   • લાઇબ્રેરી ID ફીલ્ડમાં, તમે ચલાવી રહ્યા છો તે લાઇબ્રેરીનું ID દાખલ કરો (વૈકલ્પિક).
   • રીડ ટાઈપ ફીલ્ડમાં, સિંગલ રીડ વિકલ્પ પસંદ કરો.
   • નીચે પ્રમાણે ચક્રની સંખ્યા દાખલ કરો:
     • 1:24 વાંચો
     • અનુક્રમણિકા 1: 0
     • અનુક્રમણિકા 2: 0
     • 2:0 વાંચો
   • કસ્ટમ પ્રાઇમર્સ માટેના ચેકબોક્સને પસંદ કર્યા વિના રાખો.
   • વર્તમાન રન કાચા ડેટા માટે આઉટપુટ ફોલ્ડર સ્થાન સેટ કરો. આઉટપુટ ફોલ્ડર સ્થાન બદલવા માટે બ્રાઉઝ પસંદ કરો.
5. એસ સેટ કરશો નહીંampલે શીટ.
6. આ રન માટે પર્જ ઉપભોક્તા પસંદ કરો.
7. આગળ પસંદ કરો.

NextSeq™ 550 માં ફ્લો સેલ લોડ કરો

1. અગાઉના રનમાંથી વપરાયેલ ફ્લો સેલને દૂર કરો.
2. નવા તૈયાર ફ્લો સેલને s પર મૂકોtage.
3. લોડ પસંદ કરો. દરવાજો આપોઆપ બંધ થઈ જાય છે.
4. જ્યારે ફ્લો સેલ ID સ્ક્રીન પર દેખાય અને સેન્સર્સ લીલા રંગમાં ચેક કરવામાં આવે, ત્યારે આગળ પસંદ કરો

રીએજન્ટ કન્ટેનર ખાલી કરો
ચેતવણી: રીએજન્ટ્સના આ સમૂહમાં સંભવિત જોખમી રસાયણો હોય છે. પર્યાપ્ત રક્ષણાત્મક સાધનો પહેરો અને લાગુ ધોરણો અનુસાર વપરાયેલ રીએજન્ટ્સનો ત્યાગ કરો. વધુ માહિતી માટે, Illumina NextSeq 550 સિસ્ટમ માર્ગદર્શિકાનો સંદર્ભ લો.

1. બફર કમ્પાર્ટમેન્ટનો દરવાજો ખોલો, નીચેના કમ્પાર્ટમેન્ટમાંથી ખર્ચાયેલા રીએજન્ટ કન્ટેનરને દૂર કરો અને લાગુ પડતા ધોરણો અનુસાર સામગ્રીનો નિકાલ કરો.
2. ખાલી રીએજન્ટ કન્ટેનરને નીચલા બફર કમ્પાર્ટમેન્ટમાં પાછું સ્લાઇડ કરો. એક શ્રાવ્ય ક્લિક સૂચવે છે કે કન્ટેનર યોગ્ય રીતે મૂકવામાં આવ્યું છે.

લોડ બફર કારતૂસ

1. ઉપલા બફર કમ્પાર્ટમેન્ટમાંથી વપરાયેલ બફર કારતૂસને દૂર કરો અને લાગુ પડતા ધોરણો અનુસાર સામગ્રીનો નિકાલ કરો.
2. નવા બફર કારતૂસને ઉપલા બફર કમ્પાર્ટમેન્ટમાં સ્લાઇડ કરો. એક શ્રાવ્ય ક્લિક સૂચવે છે કે કારતૂસ યોગ્ય રીતે મૂકવામાં આવ્યું છે. ખાતરી કરો કે બફર કારતૂસ ID સ્ક્રીન પર દેખાય છે અને સેન્સર્સ લીલા રંગમાં ચેક કરેલ છે.
3. બફર કમ્પાર્ટમેન્ટનો દરવાજો બંધ કરો અને આગળ પસંદ કરો.

લોડ રીએજન્ટ કારતૂસ

1. રીએજન્ટ કમ્પાર્ટમેન્ટનો દરવાજો ખોલો, વપરાયેલ રીએજન્ટ કારતૂસને દૂર કરો અને લાગુ પડતા ધોરણો અનુસાર બિનઉપયોગી સામગ્રીનો નિકાલ કરો. સ્થાન 6 પરનું જળાશય સુરક્ષિત નિકાલની સુવિધા માટે દૂર કરી શકાય તેવું છે.
2. "અહીં લોડ લાઇબ્રેરી" તરીકે લેબલ થયેલ જળાશય #10 ની સીલને સ્વચ્છ 1 એમએલ પીપેટ ટીપ સાથે વીંધો.
3. 1.3 એમએલ ઓલિંક લાઇબ્રેરીને Seq ટ્યુબમાંથી "લોડ લાઇબ્રેરી અહીં" તરીકે લેબલ કરેલ જળાશય #10 માં લોડ કરો.
4. નવા રીએજન્ટ કારતૂસને રીએજન્ટ કમ્પાર્ટમેન્ટમાં સ્લાઇડ કરો અને રીએજન્ટ કમ્પાર્ટમેન્ટનો દરવાજો બંધ કરો.
5. લોડ પસંદ કરો અને રીએજન્ટ કારતૂસ ID સ્ક્રીન પર દેખાય અને સેન્સર્સ લીલા રંગમાં ચેક ન થાય ત્યાં સુધી ~30 સેકન્ડ રાહ જુઓ.
6. રેસીપી ડ્રોપ-ડાઉન સૂચિમાંથી, [કસ્ટમ] “Olink_NSQ550_HighOutput_V1” રેસીપી વિકલ્પ પસંદ કરો.
7. આગળ પસંદ કરો.

રન ક્રમ શરૂ કરો

1. Re પર પ્રદર્શિત રન પરિમાણોની પુષ્ટિ કરોview સ્ક્રીન કોઈપણ પરિમાણોને સંપાદિત કરવા માટે, રન સેટઅપ સ્ક્રીન પર પાછા આવવા માટે પાછા દબાવો.
2. આગળ પસંદ કરો. ઑટોમેટિક પ્રી-રન ચેક પછી રન શરૂ થાય છે. સિક્વન્સિંગ રન ટાઈમ આશરે 7 કલાક 30 મિનિટ છે.
3. કાર્યક્ષેત્રને સાફ કરો.

નોંધ: જ્યારે સિક્વન્સિંગ રન પૂર્ણ થાય છે, ત્યારે સોફ્ટવેર બફર કારતૂસમાં પૂરા પાડવામાં આવેલ વોશ સોલ્યુશન્સ અને રીએજન્ટ કારતૂસમાં પૂરા પાડવામાં આવેલ NaOCl નો ઉપયોગ કરીને ઑટોમેટિક પોસ્ટ-રન વૉશ શરૂ કરે છે. આ ધોવામાં લગભગ 90 મિનિટનો સમય લાગે છે. એકવાર ધોવાનું પૂર્ણ થઈ જાય પછી હોમ બટન સક્રિય થઈ જાય છે. વપરાયેલ કારતુસ અને ફ્લો સેલ આગામી રન સુધી જગ્યાએ છોડી શકાય છે.

રનની પ્રગતિનું નિરીક્ષણ કરો
ઓલિંક s માં આપેલ પ્રોટીનની સાંદ્રતાનો અંદાજ કાઢવા માટે જાણીતા ક્રમની માત્રાને માપવા માટે રીડઆઉટ તરીકે NGS નો ઉપયોગ કરે છે.ampલેસ (અન્ય s સાથે સંબંધિતampલેસ). દરેક એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ રનમાંથી ડેટા ગુણવત્તા મુખ્યત્વે ઓલિંક ટેક્નોલોજી માટે વિશિષ્ટ QC પરિમાણો દ્વારા નક્કી કરવામાં આવે છે. તેથી, પરંપરાગત NGS માં વપરાતા પ્રમાણભૂત ગુણવત્તા નિયંત્રણ મેટ્રિક્સ, જેમ કે Q-સ્કોર, ઓછા મહત્વપૂર્ણ છે.

પુનરાવર્તન ઇતિહાસ

સંસ્કરણ	તારીખ	વર્ણન
1.1	2021-12-13	સંપાદકીય ફેરફારો
1.0	2021-12-01	નવી

www.olink.com
સંશોધન ઉપયોગ માટે જ. ડાયગ્નોસ્ટિક પ્રક્રિયાઓમાં ઉપયોગ માટે નથી.
આ ઉત્પાદનમાં ઓલિંક ઉત્પાદનોના બિન-વ્યવસાયિક ઉપયોગ માટેનું લાઇસન્સ શામેલ છે. વાણિજ્યિક વપરાશકર્તાઓને વધારાના લાઇસન્સની જરૂર પડી શકે છે. કૃપા કરીને ઓલિંકનો સંપર્ક કરો
વિગતો માટે પ્રોટીઓમિક્સ AB. ત્યાં કોઈ વોરંટી નથી, વ્યક્ત અથવા ગર્ભિત, જે આ વર્ણનની બહાર વિસ્તરે છે. Olink Proteomics AB આ ઉત્પાદનને કારણે મિલકતના નુકસાન, વ્યક્તિગત ઈજા અથવા આર્થિક નુકસાન માટે જવાબદાર નથી.
નીચેના ટ્રેડમાર્કની માલિકી Olink Proteomics AB છે: Olink®.
આ પ્રોડક્ટ પર ઉપલબ્ધ અનેક પેટન્ટ અને પેટન્ટ એપ્લિકેશન્સ દ્વારા આવરી લેવામાં આવે છે https://www.olink.com/patents/.
© કૉપિરાઇટ 2021 Olink Proteomics AB. બધા તૃતીય પક્ષ ટ્રેડમાર્ક્સ તેમના સંબંધિત માલિકોની મિલકત છે. Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, Sweden
1192, v1.1, 2021-12-13

દસ્તાવેજો / સંસાધનો

નેક્સ્ટસેક 550 નો ઉપયોગ કરીને ઓલિંક એક્સપ્લોર સિક્વન્સિંગ [પીડીએફ] વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા NextSeq 550 નો ઉપયોગ કરીને ક્રમનું અન્વેષણ કરો, નેક્સ્ટસેક 550, NextSeq 550 નો ઉપયોગ કરીને ક્રમનું અન્વેષણ કરો

સંદર્ભો

• વપરાશકર્તા માર્ગદર્શિકા