Olink NextSeq 550ని ఉపయోగించి సీక్వెన్సింగ్‌ని అన్వేషించండి

పరిచయం

ఉద్దేశించిన ఉపయోగం
Olink® Explore అనేది మానవ ప్రోటీన్ బయోమార్కర్ ఆవిష్కరణ కోసం మల్టీప్లెక్స్ ఇమ్యునోఅస్సే ప్లాట్‌ఫారమ్. ఉత్పత్తి పరిశోధనా ఉపయోగం కోసం మాత్రమే ఉద్దేశించబడింది మరియు రోగనిర్ధారణ ప్రక్రియలలో ఉపయోగం కోసం కాదు. ప్రయోగశాల పనిని శిక్షణ పొందిన ప్రయోగశాల సిబ్బంది మాత్రమే నిర్వహిస్తారు. డేటా ప్రాసెసింగ్ శిక్షణ పొందిన సిబ్బంది ద్వారా మాత్రమే నిర్వహించబడుతుంది. ఫలితాలు ఇతర క్లినికల్ లేదా లేబొరేటరీ ఫలితాలతో కలిపి పరిశోధకులు ఉపయోగించాలి.

ఈ మాన్యువల్ గురించి
ఈ వినియోగదారు మాన్యువల్ Illumina® NextSeq™ 550లో Olink® అన్వేషణ లైబ్రరీలను క్రమం చేయడానికి అవసరమైన సూచనలను అందిస్తుంది. సూచనలను ఖచ్చితంగా మరియు స్పష్టంగా అనుసరించాలి. ప్రయోగశాల దశల్లో ఏవైనా వ్యత్యాసాలు బలహీనమైన డేటాకు దారితీయవచ్చు. ప్రయోగశాల వర్క్‌ఫ్లో ప్రారంభించే ముందు, Olink® Explore Overని సంప్రదించండిview ప్లాట్‌ఫారమ్‌కు పరిచయం కోసం వినియోగదారు మాన్యువల్, రియాజెంట్‌లు, పరికరాలు మరియు అవసరమైన డాక్యుమెంటేషన్ గురించి సమాచారం, ఒక ఓవర్view వర్క్‌ఫ్లో, అలాగే ప్రయోగశాల మార్గదర్శకాలు. Olink® ఎక్స్‌ప్లోర్ రీజెంట్ కిట్‌లను ఎలా అమలు చేయాలో సూచనల కోసం, వర్తించే Olink® ఎక్స్‌ప్లోర్ యూజర్ మాన్యువల్‌ని చూడండి. Olink® అన్వేషణ క్రమ ఫలితాల డేటా ప్రాసెసింగ్ మరియు విశ్లేషణ కోసం, Olink® MyData క్లౌడ్ యూజర్ గైడ్‌ని చూడండి. ఈ మెటీరియల్‌లో ఉన్న అన్ని ట్రేడ్‌మార్క్‌లు మరియు కాపీరైట్‌లు Olink® Proteomics ABకి చెందినవి, పేర్కొనకపోతే.

సాంకేతిక మద్దతు
సాంకేతిక మద్దతు కోసం, Olink Proteomics వద్ద సంప్రదించండి support@olink.com.

ప్రయోగశాల సూచనలు

ఈ అధ్యాయం NextSeq™ 550/500 హై అవుట్‌పుట్ కిట్ v550 (2.5 సైకిల్స్)ని ఉపయోగించి NextSeq™ 75లో ఒలింక్ లైబ్రరీలను ఎలా క్రమం చేయాలనే దానిపై సూచనలను అందిస్తుంది. సీక్వెన్సింగ్ కోసం ఉపయోగించే ప్రోటోకాల్ Illumina® NextSeq™ 550 కోసం Illumina® ప్రామాణిక NGS వర్క్‌ఫ్లో యొక్క అనుసరణ. నాణ్యత నియంత్రణ గురించి సూచనల కోసం వర్తించే Olink అన్వేషణ వినియోగదారు మాన్యువల్‌ని చూడండి.

సీక్వెన్సింగ్ రన్ ప్లాన్ చేయండి
ఒక Olink లైబ్రరీ ప్రతి NextSeq™ 550 అధిక అవుట్‌పుట్ ఫ్లో సెల్ మరియు ప్రతి పరుగుకు క్రమం చేయవచ్చు. వివిధ Olink ఎక్స్‌ప్లోర్ రీజెంట్ కిట్‌లను క్రమం చేయడానికి అవసరమైన అధిక అవుట్‌పుట్ ఫ్లో సెల్‌లు మరియు పరుగుల సంఖ్య టేబుల్ 1లో వివరించబడింది. ఒకటి కంటే ఎక్కువ పరుగులు అవసరమైతే, ఈ మాన్యువల్‌లో వివరించిన సూచనలను పునరావృతం చేయండి.

టేబుల్ 1. సీక్వెన్సింగ్ రన్ ప్లానింగ్:

Olink® రీజెంట్ కిట్ అన్వేషించండి	ఒలింక్ లైబ్రరీల సంఖ్య	ఫ్లో సెల్(లు) మరియు రన్(లు) సంఖ్య
Olink® అన్వేషించండి 384 రీజెంట్ కిట్	1	1
Olink® అన్వేషించండి 4 x 384 రీజెంట్ కిట్	4	4
Olink® అన్వేషించండి 1536 రీజెంట్ కిట్	4	4
Olink® ఎక్స్‌ప్లోర్ ఎక్స్‌పాన్షన్ రీజెంట్ కిట్	4	4
Olink® అన్వేషించండి 3072 రీజెంట్ కిట్	8	8

Olink® కస్టమ్ రెసిపీని ఇన్‌స్టాల్ చేయండి
ఈ దశలో, Olink® కస్టమ్ రెసిపీ NextSeq™ 550లో ఇన్‌స్టాల్ చేయబడింది. మొదటిసారిగా Olink సీక్వెన్సింగ్ రన్ చేయడానికి ముందు ఈ దశను ఒకసారి మాత్రమే నిర్వహించాలి.
గమనిక: Olink అనుకూల వంటకం NextSeq™ 500/550 హై అవుట్‌పుట్ కిట్‌లు మరియు NextSeq™ కంట్రోల్ సాఫ్ట్‌వేర్ 4.0తో మాత్రమే పని చేస్తుంది

1. Olink కస్టమ్ రెసిపీ Olink_NSQ550_HighOutput_V1ని అన్జిప్ చేసి, NextSeq™ 550 ఇన్స్ట్రుమెంట్ యొక్క క్రింది ఫోల్డర్‌లో ఉంచండి: C:\Program Files\Illumina\NextSeq కంట్రోల్ సాఫ్ట్‌వేర్\రెసిపీ\కస్టమ్\హై\.
2. సిస్టమ్ అనుకూలీకరణ > పరికరాన్ని నిర్వహించండి కింద, అనుకూల వంటకాలను ప్రారంభించండి. ఎంచుకోకపోతే, రన్ సెటప్ సమయంలో అనుకూల వంటకం ఎంపిక కనిపించదు.

గమనిక: NCS 4.0 సాఫ్ట్‌వేర్ వెర్షన్‌లో, కస్టమ్ రెసిపీని ఎంచుకునే ఎంపిక రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ లోడ్ అయిన తర్వాత మాత్రమే జరుగుతుంది, మునుపటి సెటప్ పేజీలో కాదు.
గమనిక: అనుకూల వంటకాలను అనుమతించడానికి రన్ తప్పనిసరిగా మాన్యువల్ మోడ్‌లో సెట్ చేయబడాలి.

సీక్వెన్సింగ్ రియాజెంట్‌లను సిద్ధం చేయండి

ఈ దశలో, క్లస్టరింగ్ మరియు సీక్వెన్సింగ్ రియాజెంట్‌లను కలిగి ఉన్న రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ కరిగించబడుతుంది మరియు ఫ్లో సెల్ తయారు చేయబడుతుంది.

రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్‌ని సిద్ధం చేయండి
హెచ్చరిక: రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ ప్రమాదకర రసాయనాలను కలిగి ఉంటుంది. తగిన రక్షణ పరికరాలను ధరించండి మరియు వర్తించే ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా ఉపయోగించిన రియాజెంట్‌లను విస్మరించండి. మరింత సమాచారం కోసం, Illumina NextSeq 550 సిస్టమ్ గైడ్ (పత్రం #15069765) చూడండి.

బెంచ్ సిద్ధం

• 1x NextSeq™ 500/550 హై అవుట్‌పుట్ రీజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ v2 (75 సైకిల్స్).

సూచనలు

1. స్తంభింపచేసిన రియాజెంట్ కాట్రిడ్జ్‌ను గది ఉష్ణోగ్రత నీటిలో సగం-మునిగి ఉంచండి మరియు దానిని 1 గంట పాటు కరిగించనివ్వండి. కాట్రిడ్జ్‌ల యొక్క అన్ని రియాజెంట్ రిజర్వాయర్‌లు పూర్తిగా కరిగిపోయాయని నిర్ధారించుకోండి.
   గమనిక: సౌలభ్యం కోసం, గుళికను ముందు రోజు కరిగించి, రాత్రిపూట 4 °C వద్ద నిల్వ చేయండి. ఈ ఉష్ణోగ్రత వద్ద, కారకాలు ఒక వారం వరకు స్థిరంగా ఉంటాయి.
2. కాట్రిడ్జ్ బేస్‌ను కాగితపు టవల్‌తో పూర్తిగా ఆరబెట్టండి మరియు అవసరమైతే మెత్తటి రహిత కణజాలంతో రేకు సీల్స్‌ను పొడిగా చేయండి.
3. లోపల కరిగించిన కారకాలను పూర్తిగా కలపడానికి గుళికను పదిసార్లు తిప్పండి.
4. గాలి బుడగలను తొలగించడానికి బెంచ్‌పై ఉన్న గుళికను సున్నితంగా నొక్కండి. అది 4 గంటలలోపు ఉపయోగించబడితే గది ఉష్ణోగ్రత వద్ద గుళికను నిల్వ చేయండి.

ఫ్లో సెల్‌ను సిద్ధం చేయండి

బెంచ్ సిద్ధం

• 1x NextSeq™ 500/550 హై అవుట్‌పుట్ ఫ్లో సెల్ v2.5.

సూచనలు

1.  రిఫ్రిజిరేటెడ్ ఫ్లో సెల్‌ను 30 నిమిషాల పాటు గది ఉష్ణోగ్రతకు తీసుకురండి.
2.  కొత్త పౌడర్ లేని చేతి తొడుగులు (ఫ్లో సెల్ యొక్క గాజు ఉపరితలం కలుషితం కాకుండా ఉండటానికి) ఉంచండి.
3.  పరికరంలోకి ఫ్లో సెల్‌ను లోడ్ చేయడానికి సిద్ధంగా ఉన్నప్పుడు, ప్యాకేజీ మరియు ప్లాస్టిక్ క్లామ్‌షెల్ నుండి ఫ్లో సెల్‌ను తీసివేయండి.
4.  ఫ్లో సెల్‌ను తనిఖీ చేయండి. ఏదైనా గాజు ఉపరితలాలపై నలుసు లేదా ధూళి కనిపించినట్లయితే, వర్తించే ఉపరితలాన్ని మెత్తటి రహిత ఐసోప్రొపైల్ ఆల్కహాల్ తుడవడం మరియు తక్కువ-లీంట్ ల్యాబ్ టిష్యూతో ఆరబెట్టండి.

సీక్వెన్సింగ్ కోసం Olink® లైబ్రరీని సిద్ధం చేయండి

ఈ దశలో, NaOH మరియు Tris-HCl డైల్యూషన్‌లు తయారు చేయబడతాయి మరియు శుద్ధి చేయబడిన మరియు నాణ్యతా నియంత్రణలో ఉన్న Olink లైబ్రరీ వరుస దశల్లో కరిగించబడుతుంది మరియు తగ్గించబడుతుంది.

NaOH పలుచనను సిద్ధం చేయండి
లైబ్రరీలను తగ్గించడానికి NaOH పలుచన ఉపయోగించబడుతుంది.

బెంచ్ సిద్ధం

• 1 N NaOH స్టాక్
• MilliQ నీరు
• 1x మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ (1.5 mL)
• మాన్యువల్ పైపెట్ (10-100 μL)
• పైపెట్ చిట్కాలను ఫిల్టర్ చేయండి

మీరు ప్రారంభించడానికి ముందు
మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ "NaOH"ని గుర్తించండి.

సూచనలు

1. టేబుల్ 0.2 ప్రకారం NaOH ట్యూబ్‌లో 2 N NaOH పలుచనను సిద్ధం చేయండి.
2. NaOH ట్యూబ్‌ను పూర్తిగా వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు క్రిందికి తిప్పండి. 12 గంటలలోపు ఉపయోగించండి.

పట్టిక 2. 0.2 N NaOH పలుచన

కారకం	వాల్యూమ్ (μL)
MilliQ నీరు	80
1 N NaOH స్టాక్	20

2.4.2 Tris-HCl పలుచనను సిద్ధం చేయండి
డీనాట్యురేటెడ్ లైబ్రరీని న్యూట్రలైజ్ చేయడానికి Tris-HCl డైల్యూషన్ ఉపయోగించబడుతుంది.

బెంచ్ సిద్ధం

• 1 M Tris-HCl pH 7.0 స్టాక్ (Trizma® హైడ్రోక్లోరైడ్ ద్రావణం)
• MilliQ నీరు
• 1x మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ (1.5 mL)
• మాన్యువల్ పైపెట్ (10-100 μL)
• పైపెట్ చిట్కాలను ఫిల్టర్ చేయండి

మీరు ప్రారంభించడానికి ముందు

• మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ "Tris-HCl"ని గుర్తించండి

సూచనలు

1. టేబుల్ 200 ప్రకారం Tris-HCl ట్యూబ్‌లో 3 mM Tris-HCl పలుచనను సిద్ధం చేయండి.
2. ట్రిస్-హెచ్‌సిఎల్ ట్యూబ్‌ను పూర్తిగా వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు దానిని క్రిందికి తిప్పండి.

పట్టిక 3. 200 mM Tris-HCl పలుచన:

కారకం	వాల్యూమ్ (μL)
MilliQ నీరు	80
1M Tris-HCl pH 7.0 స్టాక్ (Trizma® హైడ్రోక్లోరైడ్ ద్రావణం)	20

Olink® లైబ్రరీలను పలుచన చేయండి
ఈ దశలో, ప్యూరిఫైడ్ మరియు క్వాలిటీ కంట్రోల్డ్ ఒలింక్ లైబ్రరీ 1:33 కరిగించబడుతుంది.

బెంచ్ సిద్ధం

• Lib Tube, వర్తించే Olink అన్వేషణ వినియోగదారు మాన్యువల్ ప్రకారం తయారు చేయబడింది
• MilliQ నీరు
• 1x మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్ (1.5 mL)
• మాన్యువల్ పైపెట్‌లు (0.5-10 మరియు 100-1000 μL)
• పైపెట్ చిట్కాలను ఫిల్టర్ చేయండి

మీరు ప్రారంభించడానికి ముందు

• లిబ్ ట్యూబ్ స్తంభింపజేసినట్లయితే కరిగించండి.
• కొత్త మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్‌ను గుర్తించండి: "దిల్".

సూచనలు

1. దిల్ ట్యూబ్‌కు 96 μL మిల్లిక్యూ నీటిని జోడించండి.
2. లిబ్ ట్యూబ్‌ను వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు దానిని క్లుప్తంగా తిప్పండి.
3. 3 μLని లిబ్ ట్యూబ్ నుండి దిల్ ట్యూబ్‌కి బదిలీ చేయండి.
4. దిల్ ట్యూబ్‌ను వోర్టెక్స్ చేసి, దాన్ని క్లుప్తంగా తిప్పండి

చివరి లోడింగ్ ఏకాగ్రతకు Olink® లైబ్రరీని తగ్గించండి మరియు పలుచన చేయండి
ఈ దశలో, పలచబరిచిన ఒలింక్ లైబ్రరీ డీనాట్ చేయబడింది మరియు తుది లోడింగ్ ఏకాగ్రతకు మరింత పలచబడుతుంది.

బెంచ్ సిద్ధం

• దిల్ ట్యూబ్, మునుపటి దశలో సిద్ధం చేయబడింది
• 0.2 N NaOH పలుచన, మునుపటి దశలో తాజాగా తయారు చేయబడింది
• 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) పలుచన, మునుపటి దశలో తయారు చేయబడింది
• హైబ్రిడైజేషన్ బఫర్ 1 (HT1) NextSeq™ యాక్సెసరీ బాక్స్ v2లో చేర్చబడింది
• 2x మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్‌లు (1.5 mL మరియు 2 mL)
• మాన్యువల్ పైపెట్‌లు (0.5-10 మరియు 100-1000 μL)
• పైపెట్ చిట్కాలను ఫిల్టర్ చేయండి

మీరు ప్రారంభించడానికి ముందు

• గది ఉష్ణోగ్రత వద్ద స్తంభింపచేసిన HT1 బఫర్‌ను కరిగించండి. ఉపయోగం వరకు +4 °C వద్ద నిల్వ చేయండి.
• కొత్త 1.5 mL మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్‌ను గుర్తించండి: “డెన్” (డీనాట్యురేటెడ్ లైబ్రరీ కోసం).
• కొత్త 2 mL మైక్రోసెంట్రిఫ్యూజ్ ట్యూబ్‌ను గుర్తించండి: "Seq" (లైబ్రరీని లోడ్ చేయడానికి సిద్ధంగా ఉన్నందుకు).

సూచనలు

1. దిల్ ట్యూబ్ నుండి డెన్ ట్యూబ్‌కు 5 μLని బదిలీ చేయండి.
2. డెన్ ట్యూబ్‌కు 5 μL 0.2 N NaOHని జోడించండి.
3. డెన్ ట్యూబ్‌ను వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు దానిని క్లుప్తంగా తిప్పండి.
4. లైబ్రరీని తగ్గించడానికి గది ఉష్ణోగ్రత వద్ద 5 నిమిషాలు డెన్ ట్యూబ్‌ను పొదిగించండి.
5. ప్రతిచర్యను తటస్థీకరించడానికి డెన్ ట్యూబ్‌కు 5 μL 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) జోడించండి.
6. డెన్ ట్యూబ్‌ను వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు దానిని క్లుప్తంగా తిప్పండి.
7. డెన్ ట్యూబ్‌కు 985 μL ప్రీచిల్డ్ HT1ని జోడించండి.
8. డెన్ ట్యూబ్‌ను వోర్టెక్స్ చేయండి మరియు దానిని క్లుప్తంగా తిప్పండి. ట్యూబ్ ఉపయోగం వరకు (అదే రోజు) +4 °C వద్ద నిల్వ చేయబడుతుంది.
9. 205 μLని డెన్ ట్యూబ్ నుండి Seq ట్యూబ్‌కి బదిలీ చేయండి.
10. Seq ట్యూబ్‌కు 1095 μL ప్రీచిల్డ్ HT1ని జోడించండి.
11. రియాజెంట్‌లను కలపడానికి సీక్ ట్యూబ్‌ను విలోమం చేసి, దాన్ని క్లుప్తంగా తిప్పండి. చివరి లోడింగ్ వాల్యూమ్ 1.3 mL.
12. తక్షణమే 2.5 Olink® సీక్వెన్సింగ్ రన్‌ని కొనసాగించండి.

Olink® సీక్వెన్సింగ్ రన్ జరుపుము

ఈ దశలో, బఫర్ క్యాట్రిడ్జ్, ఫ్లో సెల్ మరియు ఒలింక్ లైబ్రరీని కలిగి ఉన్న సిద్ధమైన రియాజెంట్ క్యాట్రిడ్జ్ NextSeq 550లో లోడ్ చేయబడతాయి మరియు Olink కస్టమ్ రెసిపీని ఉపయోగించి సీక్వెన్సింగ్ రన్ ప్రారంభించబడుతుంది.

బెంచ్ సిద్ధం

• Seq ట్యూబ్ (లైబ్రరీని లోడ్ చేయడానికి సిద్ధంగా ఉంది), మునుపటి దశలో సిద్ధం చేయబడింది
• 1x NextSeq™ 500/550 హై అవుట్‌పుట్ రీజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ v2, మునుపటి దశలో సిద్ధం చేయబడింది
• 1x NextSeq™ 500/550 హై అవుట్‌పుట్ ఫ్లో సెల్ v2.5, మునుపటి దశలో సిద్ధం చేయబడింది
• 1x NextSeq™ 500/550 బఫర్ కాట్రిడ్జ్ v2 (75 సైకిల్స్), గది ఉష్ణోగ్రత వద్ద

సీక్వెన్సింగ్ రన్ పారామితులను సెటప్ చేయండి
ఈ దశలో, సీక్వెన్సింగ్ రన్ పారామితులు NextSeq™ 550లో ఎంపిక చేయబడతాయి.

1. NextSeq™ 550 హోమ్ స్క్రీన్‌లో, ప్రయోగం ఎంచుకోండి.
2. ఎంపిక పరీక్ష స్క్రీన్‌లో, సీక్వెన్స్‌ని ఎంచుకోండి.
3. రన్ సెటప్ పేజీలో, మాన్యువల్ రన్ మోడ్‌ను ఎంచుకుని, ఆపై తదుపరి.
4. రన్ పారామితులను ఈ క్రింది విధంగా సెటప్ చేయండి:
   • రన్ నేమ్ ఫీల్డ్‌లో, ప్రత్యేకమైన ప్రయోగ IDని నమోదు చేయండి.
   • లైబ్రరీ ID ఫీల్డ్‌లో, మీరు నడుపుతున్న లైబ్రరీ యొక్క IDని నమోదు చేయండి (ఐచ్ఛికం).
   • రీడ్ టైప్ ఫీల్డ్‌లో, సింగిల్ రీడ్ ఎంపికను ఎంచుకోండి.
   • ఈ క్రింది విధంగా చక్రాల సంఖ్యను నమోదు చేయండి:
     • 1:24 చదవండి
     • సూచిక 1: 0
     • సూచిక 2: 0
     • 2:0 చదవండి
   • అనుకూల ప్రైమర్‌ల కోసం చెక్‌బాక్స్‌ని ఎంపిక చేయకుండా ఉంచండి.
   • ప్రస్తుత రన్ రా డేటా కోసం అవుట్‌పుట్ ఫోల్డర్ స్థానాన్ని సెట్ చేయండి. అవుట్‌పుట్ ఫోల్డర్ స్థానాన్ని మార్చడానికి బ్రౌజ్‌ని ఎంచుకోండి.
5. S ఏర్పాటు చేయవద్దుample షీట్.
6. ఈ పరుగు కోసం ప్రక్షాళన వినియోగ వస్తువులను ఎంచుకోండి.
7. తదుపరి ఎంచుకోండి.

NextSeq™ 550లోకి ఫ్లో సెల్‌ను లోడ్ చేయండి

1. మునుపటి రన్ నుండి ఉపయోగించిన ఫ్లో సెల్‌ను తీసివేయండి.
2. కొత్త సిద్ధం చేసిన ఫ్లో సెల్‌ను sపై ఉంచండిtage.
3. లోడ్ ఎంచుకోండి. తలుపు స్వయంచాలకంగా మూసివేయబడుతుంది.
4. ఫ్లో సెల్ ID స్క్రీన్‌పై కనిపించినప్పుడు మరియు సెన్సార్‌లు ఆకుపచ్చ రంగులో తనిఖీ చేయబడినప్పుడు, తదుపరి ఎంచుకోండి

రియాజెంట్ కంటైనర్‌ను ఖాళీ చేయండి
హెచ్చరిక: ఈ కారకాల సమితిలో ప్రమాదకర రసాయనాలు ఉంటాయి. తగిన రక్షణ పరికరాలను ధరించండి మరియు వర్తించే ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా ఉపయోగించిన రియాజెంట్‌లను విస్మరించండి. మరింత సమాచారం కోసం, Illumina NextSeq 550 సిస్టమ్ గైడ్‌ని చూడండి.

1. బఫర్ కంపార్ట్‌మెంట్ తలుపు తెరిచి, దిగువ కంపార్ట్‌మెంట్ నుండి ఖర్చు చేసిన రియాజెంట్ కంటైనర్‌ను తీసివేసి, వర్తించే ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా కంటెంట్‌ను పారవేయండి.
2. ఖాళీ రియాజెంట్ కంటైనర్‌ను తిరిగి దిగువ బఫర్ కంపార్ట్‌మెంట్‌లోకి స్లైడ్ చేయండి. వినగల క్లిక్ కంటైనర్ సరిగ్గా ఉంచబడిందని సూచిస్తుంది.

లోడ్ బఫర్ గుళిక

1. ఎగువ బఫర్ కంపార్ట్‌మెంట్ నుండి ఉపయోగించిన బఫర్ క్యాట్రిడ్జ్‌ని తీసివేసి, వర్తించే ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా కంటెంట్‌ను పారవేయండి.
2. ఎగువ బఫర్ కంపార్ట్‌మెంట్‌లోకి కొత్త బఫర్ క్యాట్రిడ్జ్‌ని స్లైడ్ చేయండి. వినిపించే క్లిక్ గుళిక సరిగ్గా ఉంచబడిందని సూచిస్తుంది. స్క్రీన్‌పై బఫర్ కాట్రిడ్జ్ ID కనిపించేలా మరియు సెన్సార్‌లు ఆకుపచ్చ రంగులో ఉన్నాయని నిర్ధారించుకోండి.
3. బఫర్ కంపార్ట్మెంట్ యొక్క తలుపును మూసివేసి, తదుపరి ఎంచుకోండి.

లోడ్ రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్

1. రియాజెంట్ కంపార్ట్‌మెంట్ తలుపు తెరిచి, ఉపయోగించిన రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్‌ని తీసివేసి, వర్తించే ప్రమాణాలకు అనుగుణంగా ఉపయోగించని కంటెంట్‌ను పారవేయండి. 6వ స్థానంలో ఉన్న రిజర్వాయర్ సురక్షితంగా పారవేయడానికి వీలుగా తీసివేయబడుతుంది.
2. క్లీన్ 10 mL పైపెట్ చిట్కాతో "ఇక్కడ లైబ్రరీని లోడ్ చేయి" అని లేబుల్ చేయబడిన రిజర్వాయర్ #1 సీల్‌ను పియర్స్ చేయండి.
3. "ఇక్కడ లైబ్రరీని లోడ్ చేయి" అని లేబుల్ చేయబడిన రిజర్వాయర్ #1.3లోకి Seq ట్యూబ్ నుండి 10 mL ఒలింక్ లైబ్రరీని లోడ్ చేయండి.
4. కొత్త రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్‌ను రియాజెంట్ కంపార్ట్‌మెంట్‌లోకి జారండి మరియు రియాజెంట్ కంపార్ట్‌మెంట్ తలుపును మూసివేయండి.
5. లోడ్‌ని ఎంచుకుని, రియాజెంట్ కార్ట్రిడ్జ్ ID స్క్రీన్‌పై కనిపించే వరకు మరియు సెన్సార్‌లు ఆకుపచ్చ రంగులో తనిఖీ చేయబడే వరకు ~30 సెకన్లపాటు వేచి ఉండండి.
6. రెసిపీ డ్రాప్-డౌన్ జాబితా నుండి, [అనుకూల] “Olink_NSQ550_HighOutput_V1” రెసిపీ ఎంపికను ఎంచుకోండి.
7. తదుపరి ఎంచుకోండి.

సీక్వెన్సింగ్ రన్ ప్రారంభించండి

1. Reలో ప్రదర్శించబడిన రన్ పారామితులను నిర్ధారించండిview తెర. ఏదైనా పారామితులను సవరించడానికి, రన్ సెటప్ స్క్రీన్‌కి తిరిగి రావడానికి వెనుకకు నొక్కండి.
2. తదుపరి ఎంచుకోండి. ఆటోమేటిక్ ప్రీ-రన్ చెక్ తర్వాత రన్ ప్రారంభమవుతుంది. సీక్వెన్సింగ్ రన్ సమయం సుమారు 7h30 నిమిషాలు.
3. పని ప్రాంతాన్ని శుభ్రం చేయండి.

గమనిక: సీక్వెన్సింగ్ రన్ పూర్తయినప్పుడు, సాఫ్ట్‌వేర్ బఫర్ క్యాట్రిడ్జ్‌లో అందించిన వాష్ సొల్యూషన్‌లను మరియు రీజెంట్ క్యాట్రిడ్జ్‌లో అందించిన NaOClని ఉపయోగించి ఆటోమేటిక్ పోస్ట్-రన్ వాష్‌ను ప్రారంభిస్తుంది. ఈ వాష్ సుమారు 90 నిమిషాలు పడుతుంది. వాష్ పూర్తయిన తర్వాత హోమ్ బటన్ యాక్టివ్ అవుతుంది. ఉపయోగించిన కాట్రిడ్జ్‌లు మరియు ఫ్లో సెల్‌ను తదుపరి పరుగు వరకు ఉంచవచ్చు.

రన్ పురోగతిని పర్యవేక్షించండి
sలో ఇచ్చిన ప్రోటీన్ యొక్క గాఢతను అంచనా వేయడానికి తెలిసిన సీక్వెన్స్ మొత్తాన్ని లెక్కించడానికి ఒలింక్ NGSని రీడౌట్‌గా ఉపయోగిస్తుంది.amples (ఇతర లకు సంబంధించిampలెస్). ప్రతి ఎక్స్‌ప్లోర్ సీక్వెన్సింగ్ రన్ నుండి డేటా నాణ్యత ప్రధానంగా ఒలింక్ టెక్నాలజీకి ప్రత్యేకమైన QC పారామితుల ద్వారా నిర్ణయించబడుతుంది. అందువల్ల, Q-స్కోర్ వంటి సాంప్రదాయిక NGSలో ఉపయోగించే ప్రామాణిక నాణ్యత నియంత్రణ కొలమానాలు తక్కువ క్లిష్టమైనవి.

పునర్విమర్శ చరిత్ర

వెర్షన్	తేదీ	వివరణ
1.1	2021-12-13	సంపాదకీయ మార్పులు
1.0	2021-12-01	కొత్తది

www.olink.com
పరిశోధన ఉపయోగం కోసం మాత్రమే. రోగనిర్ధారణ విధానాలలో ఉపయోగం కోసం కాదు.
ఈ ఉత్పత్తి Olink ఉత్పత్తుల యొక్క వాణిజ్యేతర ఉపయోగం కోసం లైసెన్స్‌ని కలిగి ఉంటుంది. వాణిజ్య వినియోగదారులకు అదనపు లైసెన్స్‌లు అవసరం కావచ్చు. దయచేసి Olinkని సంప్రదించండి
వివరాల కోసం ప్రోటీమిక్స్ AB. ఈ వర్ణనకు మించిన వారెంటీలు ఏవీ లేవు, వ్యక్తీకరించబడ్డాయి లేదా సూచించబడ్డాయి. Olink Proteomics AB ఈ ఉత్పత్తి వల్ల ఆస్తి నష్టం, వ్యక్తిగత గాయం లేదా ఆర్థిక నష్టానికి బాధ్యత వహించదు.
కింది ట్రేడ్‌మార్క్ Olink Proteomics AB యాజమాన్యంలో ఉంది: Olink®.
ఈ ఉత్పత్తి అనేక పేటెంట్లు మరియు అందుబాటులో ఉన్న పేటెంట్ అప్లికేషన్ల ద్వారా కవర్ చేయబడింది https://www.olink.com/patents/.
© కాపీరైట్ 2021 ఒలింక్ ప్రోటీమిక్స్ AB. అన్ని మూడవ పార్టీ ట్రేడ్‌మార్క్‌లు వాటి సంబంధిత యజమానుల ఆస్తి. ఒలింక్ ప్రోటీమిక్స్, డాగ్ హమ్మర్స్క్‌జోల్డ్స్ väg 52B , SE-752 37 ఉప్ప్సల, స్వీడన్
1192, v1.1, 2021-12-13

పత్రాలు / వనరులు

Olink NextSeq 550ని ఉపయోగించి సీక్వెన్సింగ్‌ని అన్వేషించండి [pdf] యూజర్ మాన్యువల్ NextSeq 550, NextSeq 550 ఉపయోగించి సీక్వెన్సింగ్‌ని అన్వేషించండి, సీక్వెన్సింగ్‌ని అన్వేషించండి

సూచనలు

• వినియోగదారు మాన్యువల్