Olink Explore Sequencing χρησιμοποιώντας το NextSeq 550
Εισαγωγή
Προβλεπόμενη χρήση
Το Olink® Explore είναι μια πλατφόρμα πολλαπλών ανοσοδοκιμών για την ανακάλυψη βιοδεικτών ανθρώπινης πρωτεΐνης. Το προϊόν προορίζεται μόνο για ερευνητική χρήση και όχι για χρήση σε διαγνωστικές διαδικασίες. Οι εργαστηριακές εργασίες θα εκτελούνται μόνο από εκπαιδευμένο εργαστηριακό προσωπικό. Η επεξεργασία δεδομένων θα πραγματοποιείται μόνο από εκπαιδευμένο προσωπικό. Τα αποτελέσματα προορίζονται να χρησιμοποιηθούν από ερευνητές σε συνδυασμό με άλλα κλινικά ή εργαστηριακά ευρήματα.
Σχετικά με αυτό το εγχειρίδιο
Αυτό το εγχειρίδιο χρήστη παρέχει τις οδηγίες που απαιτούνται για την αλληλουχία των βιβλιοθηκών Olink® Explore στο Illumina® NextSeq™ 550. Οι οδηγίες πρέπει να ακολουθούνται αυστηρά και ρητά. Οποιεσδήποτε αποκλίσεις στα εργαστηριακά στάδια μπορεί να οδηγήσουν σε εξασθενημένα δεδομένα. Πριν από την έναρξη της εργαστηριακής ροής εργασιών, συμβουλευτείτε το Olink® Explore Overview Εγχειρίδιο χρήστη για μια εισαγωγή στην πλατφόρμα, συμπεριλαμβανομένων πληροφοριών σχετικά με αντιδραστήρια, εξοπλισμό και τεκμηρίωση που απαιτείται,view της ροής εργασιών, καθώς και εργαστηριακές οδηγίες. Για οδηγίες σχετικά με τον τρόπο εκτέλεσης των κιτ αντιδραστηρίων Olink® Explore, ανατρέξτε στο ισχύον Εγχειρίδιο χρήστη Olink® Explore. Για επεξεργασία δεδομένων και ανάλυση των αποτελεσμάτων της ακολουθίας του Olink® Explore, ανατρέξτε στον Οδηγό χρήστη Olink® MyData Cloud. Όλα τα εμπορικά σήματα και τα πνευματικά δικαιώματα που περιέχονται σε αυτό το υλικό αποτελούν ιδιοκτησία της Olink® Proteomics AB, εκτός εάν αναφέρεται διαφορετικά.
Τεχνική υποστήριξη
Για τεχνική υποστήριξη, επικοινωνήστε με την Olink Proteomics στη διεύθυνση support@olink.com.
Οδηγίες εργαστηρίου
Αυτό το κεφάλαιο παρέχει οδηγίες σχετικά με τον τρόπο αλληλουχίας των Βιβλιοθηκών Olink στο NextSeq™ 550 χρησιμοποιώντας το NextSeq™ 500/550 High Output Kit v2.5 (75 κύκλοι). Το πρωτόκολλο που χρησιμοποιείται για την αλληλουχία είναι μια προσαρμογή της τυπικής ροής εργασιών NGS Illumina® για το Illumina® NextSeq™ 550. Πριν προχωρήσετε στην αλληλούχιση, βεβαιωθείτε ότι η ποιότητα της καθαρισμένης Βιβλιοθήκης έχει επαληθευτεί. Ανατρέξτε στο ισχύον εγχειρίδιο χρήστη Olink Explore για οδηγίες σχετικά με τον ποιοτικό έλεγχο.
Σχεδιάστε τη σειρά ακολουθίας
Μια βιβλιοθήκη Olink μπορεί να προσδιοριστεί ακολουθία ανά κελί ροής NextSeq™ 550 High Output και ανά εκτέλεση. Ο αριθμός των κυψελών ροής υψηλής εξόδου και των εκτελέσεων που απαιτούνται για την αλληλουχία των διαφορετικών κιτ αντιδραστηρίων Olink Explore περιγράφεται στον Πίνακα 1. Εάν απαιτούνται περισσότερες από μία εκτελέσεις, επαναλάβετε τις οδηγίες που περιγράφονται σε αυτό το εγχειρίδιο.
Πίνακας 1. Σχεδιασμός εκτέλεσης ακολουθίας:
| Olink® Explore Reagent Kit | Αριθμός Βιβλιοθηκών Olink | Αριθμός κυψελών ροής και εκτέλεσης |
| Olink® Explore 384 Reagent Kit | 1 | 1 |
| Olink® Explore 4 x 384 Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Explore 1536 Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Explore Expansion Reagent Kit | 4 | 4 |
| Olink® Explore 3072 Reagent Kit | 8 | 8 |
Εγκαταστήστε την προσαρμοσμένη συνταγή Olink®
Κατά τη διάρκεια αυτού του βήματος, η προσαρμοσμένη συνταγή Olink® εγκαθίσταται στο NextSeq™ 550. Αυτό το βήμα πρέπει να εκτελεστεί μόνο μία φορά, πριν εκτελεστεί για πρώτη φορά μια εκτέλεση αλληλουχίας Olink.
ΣΗΜΕΙΩΜΑ: Η προσαρμοσμένη συνταγή Olink θα λειτουργεί μόνο με τα κιτ υψηλής εξόδου NextSeq™ 500/550 και το λογισμικό ελέγχου NextSeq™ 4.0
- Αποσυμπιέστε και τοποθετήστε την προσαρμοσμένη συνταγή Olink Olink_NSQ550_HighOutput_V1 στον ακόλουθο φάκελο του οργάνου NextSeq™ 550: C:\Program Files\Illumina\NextSeq Control Software\Recipe\Custom\High\.
- Στην περιοχή Προσαρμογή συστήματος > Διαχείριση οργάνου, ενεργοποιήστε τις Προσαρμοσμένες συνταγές. Εάν δεν είναι επιλεγμένο, η επιλογή προσαρμοσμένης συνταγής δεν θα εμφανιστεί κατά τη ρύθμιση εκτέλεσης.
ΣΗΜΕΙΩΜΑ: Στην έκδοση λογισμικού NCS 4.0, η επιλογή επιλογής προσαρμοσμένης συνταγής θα εμφανίζεται μόνο μετά τη φόρτωση του φυσιγγίου αντιδραστηρίου και όχι στην προηγούμενη σελίδα εγκατάστασης.
ΣΗΜΕΙΩΜΑ: Η εκτέλεση πρέπει να ρυθμιστεί σε χειροκίνητη λειτουργία για να επιτρέπονται προσαρμοσμένες συνταγές.
Προετοιμάστε αντιδραστήρια αλληλούχισης
Κατά τη διάρκεια αυτού του σταδίου, το φυσίγγιο αντιδραστηρίου που περιέχει αντιδραστήρια ομαδοποίησης και προσδιορισμού αλληλουχίας αποψύχεται και προετοιμάζεται η κυψέλη ροής.
Προετοιμάστε το φυσίγγιο αντιδραστηρίου
ΠΡΟΕΙΔΟΠΟΙΗΣΗ: Το φυσίγγιο αντιδραστηρίου περιέχει δυνητικά επικίνδυνες χημικές ουσίες. Να φοράτε επαρκή προστατευτικό εξοπλισμό και να απορρίπτετε τα χρησιμοποιημένα αντιδραστήρια σύμφωνα με τα ισχύοντα πρότυπα. Για περισσότερες πληροφορίες, ανατρέξτε στον Οδηγό συστήματος Illumina NextSeq 550 (έγγραφο #15069765).
Ετοιμάστε τον πάγκο
- 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2 (75 κύκλοι).
Οδηγίες
- Τοποθετήστε το κατεψυγμένο φυσίγγιο αντιδραστηρίου μισοβυθισμένο σε νερό με θερμοκρασία δωματίου και αφήστε το να ξεπαγώσει για 1 ώρα. Βεβαιωθείτε ότι όλα τα δοχεία αντιδραστηρίων των φυσιγγίων έχουν αποψυχθεί πλήρως.
ΣΗΜΕΙΩΜΑ: Για ευκολία, ξεπαγώστε το φυσίγγιο την προηγούμενη μέρα και αποθηκεύστε το όλη τη νύχτα στους 4 °C. Σε αυτή τη θερμοκρασία, τα αντιδραστήρια είναι σταθερά έως και μία εβδομάδα. - Στεγνώστε καλά τη βάση του φυσιγγίου με μια χαρτοπετσέτα και σκουπίστε τις σφραγίδες του φύλλου να στεγνώσουν με ένα χαρτομάντιλο που δεν αφήνει χνούδι, εάν χρειάζεται.
- Αναποδογυρίστε το φυσίγγιο δέκα φορές για να αναμειχθούν καλά τα αποψυγμένα αντιδραστήρια μέσα.
- Χτυπήστε απαλά την κασέτα στον πάγκο για να αφαιρέσετε τις φυσαλίδες αέρα. Φυλάξτε το φυσίγγιο σε θερμοκρασία δωματίου εάν θα χρησιμοποιηθεί εντός 4 ωρών.
Προετοιμάστε το κελί ροής
Ετοιμάστε τον πάγκο
- 1x NextSeq™ 500/550 High Output Flow Cell v2.5.
Οδηγίες
- Φέρτε την ψυγμένη κυψέλη ροής σε θερμοκρασία δωματίου για 30 λεπτά.
- Φορέστε νέα γάντια χωρίς πούδρα (για να αποφύγετε τη μόλυνση της γυάλινης επιφάνειας της κυψέλης ροής).
- Όταν είστε έτοιμοι να τοποθετήσετε την κυψέλη ροής στο όργανο, αφαιρέστε την κυψέλη ροής από τη συσκευασία και το πλαστικό κέλυφος.
- Επιθεωρήστε την κυψέλη ροής. Εάν σε οποιαδήποτε από τις γυάλινες επιφάνειες είναι ορατά σωματίδια ή σκόνη, καθαρίστε την επιφάνεια που εφαρμόζεται με ένα μαντηλάκι ισοπροπυλικής αλκοόλης που δεν αφήνει χνούδι και στεγνώστε το με εργαστηριακό χαρτομάντιλο με χαμηλό χνούδι.
Προετοιμάστε τη βιβλιοθήκη Olink® για αλληλουχία
Κατά τη διάρκεια αυτού του σταδίου, παρασκευάζονται αραιώσεις NaOH και Tris-HCl και η καθαρισμένη και ελεγχόμενη ποιότητα Olink Library αραιώνεται και μετουσιώνεται σε διαδοχικά βήματα.
Παρασκευάστε αραίωση NaOH
Η αραίωση NaOH χρησιμοποιείται για τη μετουσίωση των Βιβλιοθηκών.
Ετοιμάστε τον πάγκο
- 1 Ν απόθεμα NaOH
- Νερό MilliQ
- 1x σωληνάριο μικροφυγόκεντρου (1.5 mL)
- Χειροκίνητη πιπέτα (10-100 μL)
- Ρύγχος πιπέτας φίλτρου
Πριν ξεκινήσετε
Σημειώστε το σωληνάριο μικροφυγοκέντρησης "NaOH".
Οδηγίες
- Προετοιμάστε μια αραίωση NaOH 0.2 N στο Σωληνάριο NaOH σύμφωνα με τον Πίνακα 2.
- Αναδεύστε καλά τον σωλήνα NaOH και περιστρέψτε προς τα κάτω. Χρήση εντός 12 ωρών.
Πίνακας 2. Αραίωση NaOH 0.2 Ν
| Αντιδραστήριο | Όγκος (μL) |
| Νερό MilliQ | 80 |
| 1 Ν απόθεμα NaOH | 20 |
2.4.2 Παρασκευάστε την αραίωση Tris-HCl
Η αραίωση Tris-HCl χρησιμοποιείται για την εξουδετέρωση της μετουσιωμένης Βιβλιοθήκης.
Ετοιμάστε τον πάγκο
- Στοκ 1 M Tris-HCl pH 7.0 (υδροχλωρικό διάλυμα Trizma®)
- Νερό MilliQ
- 1x σωληνάριο μικροφυγόκεντρου (1.5 mL)
- Χειροκίνητη πιπέτα (10-100 μL)
- Ρύγχος πιπέτας φίλτρου
Πριν ξεκινήσετε
- Σημειώστε το σωλήνα μικροφυγοκέντρησης "Tris-HCl"
Οδηγίες
- Προετοιμάστε μια αραίωση 200 mM Tris-HCl στο Σωληνάριο Tris-HCl σύμφωνα με τον Πίνακα 3.
- Αναδεύστε καλά τον σωλήνα Tris-HCl και περιστρέψτε τον προς τα κάτω.
Πίνακας 3. 200 mM Tris-HCl αραίωση:
| Αντιδραστήριο | Όγκος (μL) |
| Νερό MilliQ | 80 |
| 1M στοκ Tris-HCl pH 7.0 (υδροχλωρικό διάλυμα Trizma®) | 20 |
Αραιώστε τις βιβλιοθήκες Olink®
Κατά τη διάρκεια αυτού του βήματος, η καθαρισμένη και ελεγχόμενη ποιότητα Olink Library αραιώνεται 1:33.
Ετοιμάστε τον πάγκο
- Lib Tube, παρασκευασμένο σύμφωνα με το ισχύον Εγχειρίδιο χρήστη Olink Explore
- Νερό MilliQ
- 1x σωληνάριο μικροφυγόκεντρου (1.5 mL)
- Χειροκίνητες πιπέτες (0.5-10 και 100-1000 μL)
- Ρύγχος πιπέτας φίλτρου
Πριν ξεκινήσετε
- Ξεπαγώστε το Lib Tube εάν είναι παγωμένο.
- Σημειώστε το νέο σωλήνα μικροφυγοκέντρησης: "Dil".
Οδηγίες
- Προσθέστε 96 μL νερού MilliQ στο Dil Tube.
- Αναδεύστε τον σωλήνα Lib και περιστρέψτε τον προς τα κάτω για λίγο.
- Μεταφέρετε 3 μL από το Lib Tube στο Dil Tube.
- Αναδεύστε τον σωλήνα Dil και περιστρέψτε τον προς τα κάτω για λίγο
Μετουσιώστε και αραιώστε το Olink® Library μέχρι την τελική συγκέντρωση φόρτωσης
Κατά τη διάρκεια αυτού του σταδίου, η αραιωμένη βιβλιοθήκη Olink μετουσιώνεται και αραιώνεται περαιτέρω στην τελική συγκέντρωση φόρτωσης.
Ετοιμάστε τον πάγκο
- Dil Tube, προετοιμασμένος στο προηγούμενο βήμα
- Αραίωση NaOH 0.2 N, πρόσφατα παρασκευασμένη στο προηγούμενο στάδιο
- 200 mM Tris-HCl (ρΗ 7.0) αραίωση, που παρασκευάστηκε στο προηγούμενο στάδιο
- Το buffer υβριδοποίησης 1 (HT1) περιλαμβάνεται στο NextSeq™ Accessory Box v2
- 2 x σωλήνες μικροφυγοκέντρησης (1.5 mL και 2 mL)
- Χειροκίνητες πιπέτες (0.5-10 και 100-1000 μL)
- Ρύγχος πιπέτας φίλτρου
Πριν ξεκινήσετε
- Αποψύξτε το κατεψυγμένο ρυθμιστικό διάλυμα HT1 σε θερμοκρασία δωματίου. Φυλάσσετε στους +4 °C μέχρι τη χρήση.
- Σημειώστε το νέο σωληνάριο μικροφυγόκεντρου 1.5 mL: "Den" (για τη μετουσιωμένη βιβλιοθήκη).
- Σημειώστε το νέο σωληνάριο μικροφυγόκεντρου 2 mL: "Seq" (για τη βιβλιοθήκη έτοιμη προς φόρτωση).
Οδηγίες
- Μεταφέρετε 5 μL από το Dil Tube στο Den Tube.
- Προσθέστε 5 μL NaOH 0.2 N στο Den Tube.
- Αναδεύστε το Den Tube και περιστρέψτε το προς τα κάτω για λίγο.
- Επωάστε το Den Tube για 5 λεπτά σε θερμοκρασία δωματίου για να μετουσιωθεί η Βιβλιοθήκη.
- Προσθέστε 5 μL Tris-HCl 200 mM (pH 7.0) στο Den Tube για να εξουδετερώσετε την αντίδραση.
- Αναδεύστε το Den Tube και περιστρέψτε το προς τα κάτω για λίγο.
- Προσθέστε 985 μL προψυγμένου HT1 στο Den Tube.
- Αναδεύστε το Den Tube και περιστρέψτε το προς τα κάτω για λίγο. Το σωληνάριο μπορεί να αποθηκευτεί στους +4 °C μέχρι τη χρήση (την ίδια ημέρα).
- Μεταφέρετε 205 μL από το Den Tube στο Seq Tube.
- Προσθέστε 1095 μL προψυγμένου HT1 στο Seq Tube.
- Αναστρέψτε το Seq Tube για να αναμειχθούν τα αντιδραστήρια και περιστρέψτε το προς τα κάτω για λίγο. Ο τελικός όγκος φόρτωσης είναι 1.3 mL.
- Συνεχίστε αμέσως στο 2.5 Εκτελέστε την εκτέλεση ακολουθίας Olink®.
Εκτελέστε την εκτέλεση ακολουθίας Olink®
Κατά τη διάρκεια αυτού του βήματος, η κασέτα προσωρινής αποθήκευσης, η κυψέλη ροής και η προετοιμασμένη κασέτα αντιδραστηρίου που περιέχει τη βιβλιοθήκη Olink φορτώνονται στο NextSeq 550 και η εκτέλεση της αλληλουχίας ξεκινά χρησιμοποιώντας την προσαρμοσμένη συνταγή Olink.
Ετοιμάστε τον πάγκο
- Seq Tube (με τη βιβλιοθήκη έτοιμη για φόρτωση), που προετοιμάστηκε στο προηγούμενο βήμα
- 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2, προετοιμασμένο στο προηγούμενο βήμα
- 1x NextSeq™ 500/550 High Output Flow Cell v2.5, προετοιμασμένο στο προηγούμενο βήμα
- 1x NextSeq™ 500/550 Buffer Cartridge v2 (75 κύκλοι), σε θερμοκρασία δωματίου
Ρυθμίστε τις παραμέτρους εκτέλεσης ακολουθίας
Κατά τη διάρκεια αυτού του βήματος, επιλέγονται οι παράμετροι εκτέλεσης ακολουθίας στο NextSeq™ 550.
- Στην αρχική οθόνη του NextSeq™ 550, επιλέξτε Πείραμα.
- Στην οθόνη Select Assay, επιλέξτε Sequence.
- Στη σελίδα Run Setup, επιλέξτε Manual run mode και μετά Next.
- Ρυθμίστε τις παραμέτρους εκτέλεσης ως εξής:
- Στο πεδίο Όνομα εκτέλεσης, εισαγάγετε ένα μοναδικό αναγνωριστικό πειράματος.
- Στο πεδίο Αναγνωριστικό βιβλιοθήκης, εισαγάγετε το αναγνωριστικό της βιβλιοθήκης που εκτελείτε (προαιρετικό).
- Στο πεδίο Τύπος ανάγνωσης, ορίστε την επιλογή Ενιαία ανάγνωση.
- Εισαγάγετε τον αριθμό των κύκλων ως εξής:
- Διαβάστε 1:24
- Ευρετήριο 1: 0
- Ευρετήριο 2: 0
- Διαβάστε 2:0
- Διατηρήστε μη επιλεγμένο το πλαίσιο ελέγχου για προσαρμοσμένους εκκινητές.
- Ορίστε τη θέση του φακέλου εξόδου για τα τρέχοντα μη επεξεργασμένα δεδομένα. Επιλέξτε Αναζήτηση για να αλλάξετε τη θέση του φακέλου εξόδου.
- Μην δημιουργήσετε ένα Sample Φύλλο.
- Επιλέξτε Εκκαθάριση αναλώσιμων για αυτήν την εκτέλεση.
- Επιλέξτε Επόμενο.
Φορτώστε το κελί ροής στο NextSeq™ 550
- Αφαιρέστε το χρησιμοποιημένο κελί ροής από την προηγούμενη εκτέλεση.
- Τοποθετήστε τη νέα προετοιμασμένη κυψέλη ροής στο stage.
- Επιλέξτε Φόρτωση. Η πόρτα κλείνει αυτόματα.
- Όταν το αναγνωριστικό κυψέλης ροής εμφανιστεί στην οθόνη και οι αισθητήρες είναι επιλεγμένοι με πράσινο χρώμα, επιλέξτε Επόμενο
Αδειάστε το δοχείο του αντιδραστηρίου
ΠΡΟΕΙΔΟΠΟΙΗΣΗ: Αυτό το σετ αντιδραστηρίων περιέχει δυνητικά επικίνδυνες χημικές ουσίες. Να φοράτε επαρκή προστατευτικό εξοπλισμό και να απορρίπτετε τα χρησιμοποιημένα αντιδραστήρια σύμφωνα με τα ισχύοντα πρότυπα. Για περισσότερες πληροφορίες, ανατρέξτε στον Οδηγό συστήματος Illumina NextSeq 550.
- Ανοίξτε την πόρτα του θαλάμου αποθήκευσης, αφαιρέστε το δοχείο χρησιμοποιημένων αντιδραστηρίων από το κάτω διαμέρισμα και απορρίψτε το περιεχόμενο σύμφωνα με τα ισχύοντα πρότυπα.
- Σπρώξτε ξανά το άδειο δοχείο αντιδραστηρίου στο κάτω τμήμα αποθήκευσης. Ένα ηχητικό κλικ υποδεικνύει ότι το δοχείο έχει τοποθετηθεί σωστά.
Φόρτωση κασέτα buffer
- Αφαιρέστε τη χρησιμοποιημένη κασέτα προσωρινής αποθήκευσης από την επάνω θήκη αποθήκευσης και απορρίψτε το περιεχόμενο σύμφωνα με τα ισχύοντα πρότυπα.
- Σύρετε μια νέα κασέτα προσωρινής αποθήκευσης στην επάνω θήκη προσωρινής αποθήκευσης. Ένα ηχητικό κλικ υποδεικνύει ότι η κασέτα έχει τοποθετηθεί σωστά. Βεβαιωθείτε ότι το αναγνωριστικό δοχείου προσωρινής αποθήκευσης εμφανίζεται στην οθόνη και ότι οι αισθητήρες είναι ελεγμένοι με πράσινο χρώμα.
- Κλείστε την πόρτα του χώρου αποθήκευσης και επιλέξτε Επόμενο.
Φορτώστε το φυσίγγιο αντιδραστηρίου
- Ανοίξτε την πόρτα του διαμερίσματος αντιδραστηρίου, αφαιρέστε το χρησιμοποιημένο φυσίγγιο αντιδραστηρίου και απορρίψτε το αχρησιμοποίητο περιεχόμενο σύμφωνα με τα ισχύοντα πρότυπα. Η δεξαμενή στη θέση 6 είναι αφαιρούμενη για να διευκολύνει την ασφαλή απόρριψη.
- Τρυπήστε τη σφράγιση της δεξαμενής #10 με την ένδειξη «Load Library Here» με ένα καθαρό άκρο πιπέτας 1 mL.
- Φορτώστε 1.3 mL της βιβλιοθήκης Olink από το Seq Tube στη δεξαμενή #10 με την ένδειξη "Load Library Here".
- Σύρετε το νέο φυσίγγιο αντιδραστηρίου μέσα στο διαμέρισμα αντιδραστηρίου και κλείστε τη θύρα του διαμερίσματος αντιδραστηρίου.
- Επιλέξτε Φόρτωση και περιμένετε ~30 δευτερόλεπτα μέχρι να εμφανιστεί στην οθόνη το αναγνωριστικό φυσιγγίου αντιδραστηρίου και οι αισθητήρες να ελεγχθούν με πράσινο χρώμα.
- Από την αναπτυσσόμενη λίστα Συνταγή, επιλέξτε την επιλογή συνταγής [Προσαρμοσμένη] "Olink_NSQ550_HighOutput_V1".
- Επιλέξτε Επόμενο.
Έναρξη εκτέλεσης ακολουθίας
- Επιβεβαιώστε τις παραμέτρους εκτέλεσης που εμφανίζονται στο Review οθόνη. Για να επεξεργαστείτε τυχόν παραμέτρους, πατήστε Πίσω για να επιστρέψετε στην οθόνη Run Setup.
- Επιλέξτε Επόμενο. Η εκτέλεση ξεκινά μετά από έναν αυτόματο έλεγχο πριν από την εκτέλεση. Ο χρόνος εκτέλεσης της αλληλουχίας είναι περίπου 7h30 λεπτά.
- Καθαρίστε την περιοχή εργασίας.
ΣΗΜΕΙΩΜΑ: Όταν ολοκληρωθεί η διαδικασία προσδιορισμού αλληλουχίας, το λογισμικό ξεκινά μια αυτόματη πλύση μετά την εκτέλεση χρησιμοποιώντας τα διαλύματα πλύσης που παρέχονται στο φυσίγγιο ρυθμιστικού διαλύματος και το NaOCl που παρέχεται στο φυσίγγιο αντιδραστηρίου. Αυτό το πλύσιμο διαρκεί περίπου 90 λεπτά. Το κουμπί Home ενεργοποιείται μόλις ολοκληρωθεί η πλύση. Τα χρησιμοποιημένα φυσίγγια και η κυψέλη ροής μπορούν να μείνουν στη θέση τους μέχρι την επόμενη εκτέλεση.
Παρακολουθήστε την πρόοδο της εκτέλεσης
Ο Olink χρησιμοποιεί το NGS ως ανάγνωση για να ποσοτικοποιήσει την ποσότητα μιας γνωστής αλληλουχίας προκειμένου να εκτιμήσει τη συγκέντρωση μιας δεδομένης πρωτεΐνης σε samples (σε σχέση με άλλα samples). Η ποιότητα των δεδομένων από κάθε εκτέλεση ακολουθίας εξερεύνησης καθορίζεται κυρίως από παραμέτρους QC μοναδικές για την τεχνολογία Olink. Ως εκ τούτου, οι τυπικές μετρήσεις ελέγχου ποιότητας που χρησιμοποιούνται στα συμβατικά NGS, όπως το Q-score, είναι λιγότερο κρίσιμες.
Ιστορικό αναθεωρήσεων
| Εκδοχή | Ημερομηνία | Περιγραφή |
| 1.1 | 2021-12-13 | Συντακτικές αλλαγές |
| 1.0 | 2021-12-01 | Νέος |
www.olink.com
Μόνο για ερευνητική χρήση. Δεν προορίζεται για χρήση σε διαγνωστικές διαδικασίες.
Αυτό το προϊόν περιλαμβάνει άδεια για μη εμπορική χρήση των προϊόντων Olink. Οι εμπορικοί χρήστες ενδέχεται να απαιτούν πρόσθετες άδειες. Επικοινωνήστε με την Olink
Proteomics AB για λεπτομέρειες. Δεν υπάρχουν εγγυήσεις, ρητές ή σιωπηρές, που να εκτείνονται πέρα από αυτήν την περιγραφή. Η Olink Proteomics AB δεν φέρει ευθύνη για υλικές ζημιές, σωματικές βλάβες ή οικονομικές ζημιές που προκαλούνται από αυτό το προϊόν.
Το ακόλουθο εμπορικό σήμα ανήκει στην Olink Proteomics AB: Olink®.
Αυτό το προϊόν καλύπτεται από πολλά διπλώματα ευρεσιτεχνίας και αιτήσεις διπλωμάτων ευρεσιτεχνίας που διατίθενται στη διεύθυνση https://www.olink.com/patents/.
© Πνευματικά δικαιώματα 2021 Olink Proteomics AB. Όλα τα εμπορικά σήματα τρίτων είναι ιδιοκτησία των αντίστοιχων κατόχων τους. Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, Σουηδία
1192, v1.1, 2021-12-13
Έγγραφα / Πόροι
 |
Olink Explore Sequencing χρησιμοποιώντας το NextSeq 550 [pdf] Εγχειρίδιο χρήστη Εξερεύνηση αλληλουχίας χρησιμοποιώντας NextSeq 550, Εξερεύνηση αλληλουχίας, χρησιμοποιώντας NextSeq 550, NextSeq 550 |
