NextSeq 550 को प्रयोग गरेर Olink अन्वेषण अनुक्रम

परिचय

अभिप्रेत प्रयोग
Olink® अन्वेषण मानव प्रोटीन बायोमार्कर खोजको लागि मल्टिप्लेक्स इम्युनोसे प्लेटफर्म हो। उत्पादन अनुसन्धान प्रयोगको लागि मात्र हो, र निदान प्रक्रियाहरूमा प्रयोगको लागि होइन। प्रयोगशालाको काम प्रशिक्षित प्रयोगशाला कर्मचारीले मात्र सञ्चालन गर्नेछ। डाटा प्रशोधन केवल प्रशिक्षित कर्मचारी द्वारा प्रदर्शन गरिनेछ। परिणामहरू अन्वेषकहरूले अन्य क्लिनिकल वा प्रयोगशाला निष्कर्षहरूसँग संयोजनमा प्रयोग गर्नको लागि हो।

यस पुस्तिकाको बारेमा
यो प्रयोगकर्ता पुस्तिकाले Illumina® NextSeq™ 550 मा Olink® अन्वेषण पुस्तकालयहरू क्रमबद्ध गर्न आवश्यक निर्देशनहरू प्रदान गर्दछ। निर्देशनहरू कडाइका साथ र स्पष्ट रूपमा पालना गर्नुपर्छ। प्रयोगशाला चरणहरूमा कुनै पनि विचलनले डेटा बिग्रन सक्छ। प्रयोगशाला कार्यप्रवाह सुरु गर्नु अघि, Olink® Explore Over मा परामर्श लिनुहोस्view प्लेटफर्मको परिचयको लागि प्रयोगकर्ता पुस्तिका, अभिकर्मकहरू, उपकरणहरू र आवश्यक कागजातहरू, एक ओभरको बारेमा जानकारी सहितview कार्यप्रवाह, साथै प्रयोगशाला दिशानिर्देशहरूको रूपमा। Olink® अन्वेषण अभिकर्मक किटहरू कसरी चलाउने भन्ने बारे निर्देशनहरूको लागि, लागू हुने Olink® अन्वेषण प्रयोगकर्ता पुस्तिका हेर्नुहोस्। Olink® अन्वेषण अनुक्रम परिणामहरूको डेटा प्रशोधन र विश्लेषणको लागि, Olink® MyData क्लाउड प्रयोगकर्ता गाइडलाई सन्दर्भ गर्नुहोस्। यस सामाग्रीमा समावेश सबै ट्रेडमार्क र प्रतिलिपि अधिकार Olink® Proteomics AB को सम्पत्ति हो, अन्यथा उल्लेख नगरेसम्म।

प्राविधिक सहयोग
प्राविधिक सहयोगको लागि, Olink Proteomics मा सम्पर्क गर्नुहोस् support@olink.com.

प्रयोगशाला निर्देशनहरू

यस अध्यायले NextSeq™ 550/500 High Output Kit v550 (2.5 Cycles) को प्रयोग गरेर NextSeq™ 75 मा Olink लाइब्रेरीहरू कसरी क्रमबद्ध गर्ने भन्ने बारे निर्देशनहरू प्रदान गर्दछ। अनुक्रमणिका लागि प्रयोग गरिएको प्रोटोकल Illumina® NextSeq™ 550 को लागि Illumina® मानक NGS कार्यप्रवाहको रूपान्तरण हो। अनुक्रममा अगाडि बढ्नु अघि, शुद्ध पुस्तकालयको गुणस्तर प्रमाणित गरिएको छ भनी सुनिश्चित गर्नुहोस्। गुणस्तर नियन्त्रणको बारेमा निर्देशनहरूका लागि लागू हुने Olink Explore User Manual को सन्दर्भ गर्नुहोस्।

अनुक्रम चलाउने योजना बनाउनुहोस्
एउटा Olink पुस्तकालय प्रति NextSeq™ 550 उच्च आउटपुट प्रवाह सेल र प्रति रन अनुक्रमित गर्न सकिन्छ। विभिन्न Olink Explore Reagent Kits को क्रमबद्ध गर्न आवश्यक पर्ने उच्च आउटपुट फ्लो सेलहरू र रनहरूको संख्या तालिका 1 मा वर्णन गरिएको छ। यदि एक भन्दा बढी रन आवश्यक छ भने, यस पुस्तिकामा वर्णन गरिएका निर्देशनहरू दोहोर्याउनुहोस्।

तालिका 1. क्रमबद्ध रन योजना:

Olink® अन्वेषण अभिकर्मक किट	ओलिंक पुस्तकालयहरूको संख्या	प्रवाह कक्ष(हरू) र रन(हरू) को संख्या
Olink® अन्वेषण 384 अभिकर्मक किट	1	1
Olink® अन्वेषण 4 x 384 अभिकर्मक किट	4	4
Olink® अन्वेषण 1536 अभिकर्मक किट	4	4
Olink® अन्वेषण विस्तार अभिकर्मक किट	4	4
Olink® अन्वेषण 3072 अभिकर्मक किट	8	8

Olink® अनुकूलन नुस्खा स्थापना गर्नुहोस्
यस चरणको बखत, Olink® अनुकूलन रेसिपी NextSeq™ 550 मा स्थापना गरिएको छ। यो चरण एक पटक मात्र प्रदर्शन गर्न आवश्यक छ, Olink अनुक्रमण रन पहिलो पटक प्रदर्शन गर्नु अघि।
नोट: Olink अनुकूलन रेसिपीले NextSeq™ 500/550 उच्च आउटपुट किटहरू र NextSeq™ नियन्त्रण सफ्टवेयर 4.0 सँग मात्र काम गर्नेछ।

1. अनजिप गर्नुहोस् र Olink कस्टम रेसिपी Olink_NSQ550_HighOutput_V1 लाई NextSeq™ 550 इन्स्ट्रुमेन्टको निम्न फोल्डरमा राख्नुहोस्: C:\Program Files\Illumina\NextSeq नियन्त्रण सफ्टवेयर\Recipe\Custom\High\।
2. प्रणाली अनुकूलन अन्तर्गत> उपकरण व्यवस्थापन गर्नुहोस्, अनुकूलन व्यञ्जनहरू सक्षम गर्नुहोस्। यदि चयन गरिएको छैन भने, अनुकूलन नुस्खा विकल्प रन सेटअपको समयमा देखा पर्नेछैन।

नोट: NCS 4.0 सफ्टवेयर संस्करणमा, अनुकूलन नुस्खा चयन गर्ने विकल्प अभिकर्मक कार्ट्रिज लोड भएपछि मात्र हुनेछ, पहिलेको सेटअप पृष्ठमा होइन।
नोट: अनुकूलन व्यञ्जनहरू अनुमति दिनको लागि रन म्यानुअल मोडमा सेट हुनुपर्छ।

अनुक्रम अभिकर्मकहरू तयार गर्नुहोस्

यस चरणको बखत, क्लस्टरिङ र सिक्वेन्सिङ अभिकर्मकहरू भएको अभिकर्मक कारतूस पग्लिन्छ र प्रवाह कक्ष तयार हुन्छ।

अभिकर्मक कारतूस तयार गर्नुहोस्
चेतावनी: अभिकर्मक कार्ट्रिजमा सम्भावित खतरनाक रसायनहरू छन्। पर्याप्त सुरक्षात्मक उपकरणहरू लगाउनुहोस् र लागू मापदण्डहरू अनुसार प्रयोग गरिएका अभिकर्मकहरू त्याग्नुहोस्। थप जानकारीको लागि, Illumina NextSeq 550 System Guide (कागजात #15069765) हेर्नुहोस्।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• 1x NextSeq™ 500/550 उच्च आउटपुट अभिकर्मक कार्ट्रिज v2 (७५ चक्र)।

निर्देशनहरू

1. जमेको अभिकर्मक कार्ट्रिजलाई कोठाको टेम्पर्ड पानीमा आधा डुबाएर राख्नुहोस् र यसलाई १ घण्टाको लागि पग्लन दिनुहोस्। सुनिश्चित गर्नुहोस् कि कारतूसका सबै अभिकर्मक जलाशयहरू पूर्ण रूपमा पग्लिएका छन्।
   नोट: सुविधाको लागि, कारतूसलाई अघिल्लो दिन पगाल्नुहोस् र रातभरि 4 डिग्री सेल्सियसमा भण्डार गर्नुहोस्। यस तापमानमा, अभिकर्मकहरू एक हप्तासम्म स्थिर हुन्छन्।
2. कार्ट्रिज बेसलाई कागजको तौलियाले राम्ररी सुकाउनुहोस् र आवश्यक भएमा लिन्ट-फ्री टिस्युले पन्नी सीलहरू सुकाउनुहोस्।
3. भित्र पग्लिएको अभिकर्मकहरू राम्ररी मिलाउन कार्ट्रिजलाई दस पटक उल्टो गर्नुहोस्।
4. हावा बुलबुले हटाउन बेन्चमा बिस्तारै कारतूस ट्याप गर्नुहोस्। कार्ट्रिजलाई कोठाको तापक्रममा भण्डार गर्नुहोस् यदि यो 4 घण्टा भित्र प्रयोग हुनेछ।

प्रवाह सेल तयार गर्नुहोस्

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• 1x NextSeq™ 500/550 उच्च आउटपुट फ्लो सेल v2.5।

निर्देशनहरू

1.  30 मिनेटको लागि कोठाको तापक्रममा फ्रिज गरिएको फ्लो सेल ल्याउनुहोस्।
2.  नयाँ पाउडर फ्री ग्लोभ्स लगाउनुहोस् (फ्लो सेलको गिलास सतह दूषित हुनबाट बच्न)।
3.  इन्स्ट्रुमेन्टमा फ्लो सेल लोड गर्न तयार हुँदा, प्याकेज र प्लास्टिक क्ल्यामशेलबाट फ्लो सेल हटाउनुहोस्।
4.  प्रवाह सेल निरीक्षण गर्नुहोस्। यदि कुनै पनि काँचको सतहमा कण वा धुलो देखिन्छ भने, लागू हुने सतहलाई लिन्ट-फ्री आइसोप्रोपाइल अल्कोहल वाइपले सफा गर्नुहोस् र यसलाई कम-लिन्ट प्रयोगशाला टिस्युले सुकाउनुहोस्।

अनुक्रमको लागि Olink® पुस्तकालय तयार गर्नुहोस्

यस चरणमा, NaOH र Tris-HCl dilutions तयार गरिन्छ, र शुद्ध र गुणस्तर नियन्त्रित ओलिंक पुस्तकालयलाई क्रमिक चरणहरूमा पातलो र विकृत गरिन्छ।

NaOH dilution तयार गर्नुहोस्
NaOH dilution लाई पुस्तकालयहरूलाई denature गर्न प्रयोग गरिन्छ।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• १ एन NaOH स्टक
• मिलिक्यू पानी
• 1x माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 एमएल)
• म्यानुअल पिपेट (10-100 μL)
• पिपेट सुझावहरू फिल्टर गर्नुहोस्

तपाईंले सुरु गर्नु अघि
माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब "NaOH" चिन्ह लगाउनुहोस्।

निर्देशनहरू

1. तालिका २ अनुसार NaOH ट्युबमा ०.२ N NaOH dilution तयार गर्नुहोस्।
2. NaOH ट्यूबलाई राम्ररी घुमाउनुहोस् र तल घुमाउनुहोस्। 12 घण्टा भित्र प्रयोग गर्नुहोस्।

तालिका 2. 0.2 N NaOH dilution

अभिकर्मक	भोल्युम (μL)
मिलिक्यू पानी	80
१ एन NaOH स्टक	20

2.4.2 Tris-HCl dilution तयार गर्नुहोस्
Tris-HCl dilution लाई विकृत पुस्तकालयलाई बेअसर गर्न प्रयोग गरिन्छ।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• 1 M Tris-HCl pH 7.0 स्टक (Trizma® हाइड्रोक्लोराइड समाधान)
• मिलिक्यू पानी
• 1x माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 एमएल)
• म्यानुअल पिपेट (10-100 μL)
• पिपेट सुझावहरू फिल्टर गर्नुहोस्

तपाईंले सुरु गर्नु अघि

• माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब "Tris-HCl" चिन्ह लगाउनुहोस्

निर्देशनहरू

1. तालिका ३ अनुसार Tris-HCl ट्यूबमा 200 mM Tris-HCl dilution तयार गर्नुहोस्।
2. Tris-HCl ट्यूबलाई राम्ररी घुमाउनुहोस् र यसलाई तल घुमाउनुहोस्।

तालिका 3. 200 मिमी Tris-HCl dilution:

अभिकर्मक	भोल्युम (μL)
मिलिक्यू पानी	80
1M Tris-HCl pH 7.0 स्टक (Trizma® हाइड्रोक्लोराइड समाधान)	20

Olink® पुस्तकालयहरू पतला
यस चरणको बखत, शुद्ध र गुणस्तर नियन्त्रित Olink पुस्तकालय 1:33 पातलो छ।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• लिब ट्यूब, लागू Olink अन्वेषण प्रयोगकर्ता पुस्तिका अनुसार तयार
• मिलिक्यू पानी
• 1x माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूब (1.5 एमएल)
• म्यानुअल पिपेट्स (0.5-10 र 100-1000 μL)
• पिपेट सुझावहरू फिल्टर गर्नुहोस्

तपाईंले सुरु गर्नु अघि

• यदि जमेको छ भने लिब ट्यूबलाई पगाल्नुहोस्।
• नयाँ microcentrifuge ट्यूब चिन्ह लगाउनुहोस्: "Dil"।

निर्देशनहरू

1. Dil Tube मा 96 μL MilliQ पानी थप्नुहोस्।
2. लिब ट्यूब भोर्टेक्स र यसलाई छोटकरीमा तल घुमाउनुहोस्।
3. लिब ट्यूबबाट डिल ट्यूबमा 3 μL स्थानान्तरण गर्नुहोस्।
4. दिल ट्यूब भर्टेक्स र यसलाई छोटकरीमा तल घुमाउनुहोस्

अन्तिम लोडिङ एकाग्रतामा Olink® पुस्तकालयलाई डेन्चर र पातलो गर्नुहोस्
यस चरणको बखत, पातलो ओलिंक पुस्तकालयलाई विकृत गरिएको छ र अन्तिम लोडिङ एकाग्रतामा थप पतला पारिएको छ।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• Dil Tube, अघिल्लो चरणमा तयार
• 0.2 N NaOH कमजोरी, अघिल्लो चरणमा ताजा तयार
• 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) dilution, अघिल्लो चरणमा तयार
• हाइब्रिडाइजेशन बफर 1 (HT1) NextSeq™ एक्सेसरी बक्स v2 मा समावेश
• 2x माइक्रोसेन्ट्रीफ्यूज ट्यूबहरू (1.5 एमएल र 2 एमएल)
• म्यानुअल पिपेट्स (0.5-10 र 100-1000 μL)
• पिपेट सुझावहरू फिल्टर गर्नुहोस्

तपाईंले सुरु गर्नु अघि

• जमेको HT1 बफरलाई कोठाको तापक्रममा पगाल्नुहोस्। प्रयोग नभएसम्म +4 डिग्री सेल्सियसमा भण्डार गर्नुहोस्।
• नयाँ 1.5 एमएल माइक्रोसेन्ट्रिफ्यूज ट्यूब चिन्ह लगाउनुहोस्: "डेन" (विकृत पुस्तकालयको लागि)।
• नयाँ 2 एमएल माइक्रोसेन्ट्रिफ्यूज ट्यूबलाई चिन्ह लगाउनुहोस्: "सेक" (लाइब्रेरी लोड गर्नको लागि)।

निर्देशनहरू

1. डिल ट्यूबबाट डेन ट्यूबमा 5 μL स्थानान्तरण गर्नुहोस्।
2. डेन ट्यूबमा 5 N NaOH को 0.2 μL थप्नुहोस्।
3. भर्टेक्स द डेन ट्यूब र यसलाई छोटकरीमा घुमाउनुहोस्।
4. पुस्तकालयलाई डिनेचर गर्न कोठाको तापक्रममा डेन ट्यूबलाई ५ मिनेटसम्म इन्क्युब्याट गर्नुहोस्।
5. प्रतिक्रियालाई बेअसर गर्न डेन ट्यूबमा 5 mM Tris-HCl (pH 200) को 7.0 μL थप्नुहोस्।
6. भर्टेक्स द डेन ट्यूब र यसलाई छोटकरीमा घुमाउनुहोस्।
7. डेन ट्यूबमा प्रिचिल्ड HT985 को 1 μL थप्नुहोस्।
8. भर्टेक्स द डेन ट्यूब र यसलाई छोटकरीमा घुमाउनुहोस्। प्रयोग नभएसम्म (उही दिन) ट्यूब +4 °C मा भण्डारण गर्न सकिन्छ।
9. डेन ट्यूबबाट सेक ट्यूबमा 205 μL स्थानान्तरण गर्नुहोस्।
10. Seq Tube मा 1095 μL prechilled HT1 थप्नुहोस्।
11. अभिकर्मकहरू मिश्रण गर्न Seq ट्यूबलाई उल्टाउनुहोस् र यसलाई छोटो रूपमा घुमाउनुहोस्। अन्तिम लोडिङ भोल्युम 1.3 एमएल हो।
12. तुरुन्तै 2.5 Olink® अनुक्रमण चलाउन जारी राख्नुहोस्।

Olink® अनुक्रमण रन प्रदर्शन गर्नुहोस्

यस चरणको बखत, बफर कारतूस, प्रवाह कक्ष र ओलिंक पुस्तकालय समावेश गरीएको अभिकर्मक कारतूस NextSeq 550 मा लोड गरिन्छ, र Olink अनुकूलन नुस्खा प्रयोग गरेर अनुक्रम रन सुरु हुन्छ।

बेन्च तयार गर्नुहोस्

• Seq Tube (लाइब्रेरी लोड गर्न तयार छ), अघिल्लो चरणमा तयार
• 1x NextSeq™ 500/550 उच्च आउटपुट अभिकर्मक कार्ट्रिज v2, अघिल्लो चरणमा तयार
• 1x NextSeq™ 500/550 उच्च आउटपुट फ्लो सेल v2.5, अघिल्लो चरणमा तयार
• 1x NextSeq™ 500/550 Buffer Cartridge v2 (७५ चक्र), कोठाको तापक्रममा

अनुक्रम चलाउने प्यारामिटरहरू सेट अप गर्नुहोस्
यस चरणको बखत, नेक्स्टसेक™ 550 मा अनुक्रमण रन प्यारामिटरहरू चयन गरिन्छ।

1. NextSeq™ 550 गृह स्क्रिनमा, प्रयोग चयन गर्नुहोस्।
2. परख चयन गर्नुहोस् स्क्रिनमा, अनुक्रम चयन गर्नुहोस्।
3. रन सेटअप पृष्ठमा, म्यानुअल रन मोड चयन गर्नुहोस् र त्यसपछि अर्को।
4. निम्नानुसार रन प्यारामिटरहरू सेट अप गर्नुहोस्:
   • रन नाम फिल्डमा, एउटा अद्वितीय प्रयोग ID प्रविष्ट गर्नुहोस्।
   • लाइब्रेरी आईडी फिल्डमा, तपाईंले चलाइरहनुभएको पुस्तकालयको आईडी प्रविष्ट गर्नुहोस् (वैकल्पिक)।
   • पढ्ने प्रकार फिल्डमा, एकल पढ्ने विकल्प चयन गर्नुहोस्।
   • निम्नानुसार चक्र संख्या प्रविष्ट गर्नुहोस्:
     • १:२४ पढ्नुहोस्
     • अनुक्रमणिका 1: 0
     • अनुक्रमणिका 2: 0
     • १:२४ पढ्नुहोस्
   • आफू अनुकूल प्राइमरहरूको लागि चेकबक्सलाई चयन नगरी राख्नुहोस्।
   • हालको रन कच्चा डाटाको लागि आउटपुट फोल्डर स्थान सेट गर्नुहोस्। आउटपुट फोल्डर स्थान परिवर्तन गर्न ब्राउज चयन गर्नुहोस्।
5. एस सेटअप नगर्नुहोस्ampले पाना।
6. यस रनका लागि पर्ज उपभोग्य वस्तुहरू चयन गर्नुहोस्।
7. अर्को चयन गर्नुहोस्।

NextSeq™ 550 मा फ्लो सेल लोड गर्नुहोस्

1. अघिल्लो रनबाट प्रयोग गरिएको फ्लो सेल हटाउनुहोस्।
2. s मा नयाँ तयार फ्लो सेल राख्नुहोस्tage.
3. लोड चयन गर्नुहोस्। ढोका स्वतः बन्द हुन्छ।
4. जब फ्लो सेल ID स्क्रिनमा देखा पर्दछ र सेन्सरहरू हरियोमा जाँच गरिन्छ, अर्को चयन गर्नुहोस्

अभिकर्मक कन्टेनर खाली गर्नुहोस्
चेतावनी: अभिकर्मकहरूको यो सेटले सम्भावित रूपमा खतरनाक रसायनहरू समावेश गर्दछ। पर्याप्त सुरक्षात्मक उपकरणहरू लगाउनुहोस् र लागू मापदण्डहरू अनुसार प्रयोग गरिएका अभिकर्मकहरू त्याग्नुहोस्। थप जानकारीको लागि, Illumina NextSeq 550 System Guide हेर्नुहोस्।

1. बफर कम्पार्टमेन्टको ढोका खोल्नुहोस्, तल्लो डिब्बाबाट खर्च गरिएको अभिकर्मक कन्टेनर हटाउनुहोस्, र लागू मापदण्डहरू अनुसार सामग्रीको डिस्पोज गर्नुहोस्।
2. खाली रिएजेन्ट कन्टेनरलाई तल्लो बफर डिब्बामा फिर्ता स्लाइड गर्नुहोस्। एक श्रव्य क्लिकले कन्टेनर सही रूपमा राखिएको संकेत गर्दछ।

बफर कार्ट्रिज लोड गर्नुहोस्

1. माथिल्लो बफर डिब्बाबाट प्रयोग गरिएको बफर कार्ट्रिज हटाउनुहोस् र लागू मापदण्डहरू अनुसार सामग्रीको डिस्पोज गर्नुहोस्।
2. माथिल्लो बफर डिब्बामा नयाँ बफर कारतूस स्लाइड गर्नुहोस्। एक श्रव्य क्लिकले संकेत गर्दछ कि कारतूस सही रूपमा राखिएको छ। सुनिश्चित गर्नुहोस् कि बफर कार्ट्रिज ID स्क्रिनमा देखिन्छ र सेन्सरहरू हरियोमा जाँच गरिएको छ।
3. बफर कम्पार्टमेन्टको ढोका बन्द गर्नुहोस् र अर्को चयन गर्नुहोस्।

अभिकर्मक कारतूस लोड गर्नुहोस्

1. अभिकर्मक कम्पार्टमेन्टको ढोका खोल्नुहोस्, प्रयोग गरिएको अभिकर्मक कार्ट्रिज हटाउनुहोस्, र लागू मापदण्डहरू अनुसार प्रयोग नगरिएको सामग्रीलाई डिस्पोज गर्नुहोस्। स्थिति 6 मा जलाशय सुरक्षित निपटान को सुविधा को लागी हटाउन योग्य छ।
2. सफा 10 एमएल पिपेट टिपको साथ "यहाँ लोड लाइब्रेरी" भनेर लेबल गरिएको जलाशय #1 को सील छेड्नुहोस्।
3. Seq Tube बाट 1.3 mL Olink Library लाई "Load Library Here" भनेर लेबल गरिएको जलाशय #10 मा लोड गर्नुहोस्।
4. नयाँ अभिकर्मक कारतूसलाई अभिकर्मक डिब्बामा स्लाइड गर्नुहोस् र अभिकर्मक डिब्बाको ढोका बन्द गर्नुहोस्।
5. लोड चयन गर्नुहोस् र ~ 30 सेकेन्ड पर्खनुहोस् जब सम्म स्क्रिनमा अभिकर्मक कार्ट्रिज ID देखा पर्दैन र सेन्सरहरू हरियोमा जाँच गरिन्छ।
6. रेसिपी ड्रप-डाउन सूचीबाट, [कस्टम] "Olink_NSQ550_HighOutput_V1" रेसिपी विकल्प चयन गर्नुहोस्।
7. अर्को चयन गर्नुहोस्।

क्रमबद्ध दौड सुरु गर्नुहोस्

1. Re मा प्रदर्शित रन प्यारामिटरहरू पुष्टि गर्नुहोस्view पर्दा। कुनै पनि प्यारामिटरहरू सम्पादन गर्न, रन सेटअप स्क्रिनमा फर्कन पछाडि थिच्नुहोस्।
2. अर्को चयन गर्नुहोस्। रन एक स्वचालित पूर्व-रन जाँच पछि सुरु हुन्छ। अनुक्रम चलाउने समय लगभग 7h30 मिनेट हो।
3. कार्य क्षेत्र सफा गर्नुहोस्।

नोट: जब सिक्वेन्सिङ रन पूरा हुन्छ, सफ्टवेयरले बफर कार्ट्रिजमा प्रदान गरिएको वाश समाधानहरू र अभिकर्मक कार्ट्रिजमा प्रदान गरिएको NaOCl प्रयोग गरेर स्वचालित पोस्ट-रन वाश सुरु गर्छ। यो धुलाई लगभग 90 मिनेट लाग्छ। धुने कार्य पूरा भएपछि गृह बटन सक्रिय हुन्छ। प्रयोग गरिएको कारतूस र फ्लो सेल अर्को रन सम्म ठाउँमा छोड्न सकिन्छ।

रन प्रगति निगरानी
ओलिङ्कले s मा दिइएको प्रोटिनको एकाग्रता अनुमान गर्न ज्ञात अनुक्रमको मात्रा परिमाण गर्नको लागि रीडआउटको रूपमा NGS प्रयोग गर्दछ।amples (अन्य s को सापेक्षampलेस)। प्रत्येक अन्वेषण अनुक्रमण रनबाट डेटा गुणस्तर मुख्यतया Olink प्रविधिको लागि अद्वितीय QC प्यारामिटरहरू द्वारा निर्धारण गरिन्छ। तसर्थ, मानक गुणस्तर नियन्त्रण मेट्रिक्स पारंपरिक NGS मा प्रयोग गरिन्छ, जस्तै Q-score, कम महत्वपूर्ण छन्।

संशोधन इतिहास

संस्करण	मिति	विवरण
1.1	८००-५५५-०१९९	सम्पादकीय परिवर्तन
1.0	८००-५५५-०१९९	नयाँ

www.olink.com
अनुसन्धानको लागि मात्र प्रयोग गर्नुहोस्। डायग्नोस्टिक प्रक्रियाहरूमा प्रयोगको लागि होइन।
यो उत्पादनले Olink उत्पादनहरूको गैर-व्यावसायिक प्रयोगको लागि इजाजतपत्र समावेश गर्दछ। व्यापारिक प्रयोगकर्ताहरूलाई थप इजाजतपत्रहरू चाहिन्छ। कृपया Olink लाई सम्पर्क गर्नुहोस्
विवरणका लागि प्रोटोमिक्स एबी। त्यहाँ कुनै वारेन्टीहरू छैनन्, अभिव्यक्त वा निहित, जुन यस विवरणभन्दा बाहिर विस्तार हुन्छ। Olink Proteomics AB यस उत्पादनको कारणले सम्पत्ति क्षति, व्यक्तिगत चोट, वा आर्थिक क्षतिको लागि उत्तरदायी छैन।
निम्न ट्रेडमार्क Olink Proteomics AB को स्वामित्वमा छ: Olink®।
यो उत्पादन मा उपलब्ध धेरै पेटेन्ट र प्याटेन्ट अनुप्रयोगहरू द्वारा कभर गरिएको छ https://www.olink.com/patents/.
© प्रतिलिपि अधिकार 2021 Olink Proteomics AB। सबै तेस्रो पक्ष ट्रेडमार्कहरू तिनीहरूका सम्बन्धित मालिकहरूको सम्पत्ति हुन्। Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, Sweden
1192, v1.1, 2021-12-13

कागजातहरू / स्रोतहरू

NextSeq 550 को प्रयोग गरेर Olink अन्वेषण अनुक्रम [pdf] प्रयोगकर्ता पुस्तिका NextSeq 550 प्रयोग गरी अनुक्रम अन्वेषण गर्नुहोस्, अनुक्रमण अन्वेषण गर्नुहोस्, NextSeq 550, NextSeq 550 प्रयोग गरी

सन्दर्भहरू

• प्रयोगकर्ता पुस्तिका