NextSeq 550 ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಓಲಿಂಕ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ
ಪರಿಚಯ
ಉದ್ದೇಶಿತ ಬಳಕೆ
ಒಲಿಂಕ್ ® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಎನ್ನುವುದು ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಅನ್ವೇಷಣೆಗಾಗಿ ಮಲ್ಟಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಇಮ್ಯುನೊಅಸೇ ಪ್ಲಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್ ಆಗಿದೆ. ಉತ್ಪನ್ನವು ಸಂಶೋಧನಾ ಬಳಕೆಗೆ ಮಾತ್ರ ಉದ್ದೇಶಿಸಲಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ರೋಗನಿರ್ಣಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಕೆಗೆ ಅಲ್ಲ. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಕೆಲಸವನ್ನು ತರಬೇತಿ ಪಡೆದ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಸಿಬ್ಬಂದಿ ಮಾತ್ರ ನಡೆಸಬೇಕು. ಡೇಟಾ ಸಂಸ್ಕರಣೆಯನ್ನು ತರಬೇತಿ ಪಡೆದ ಸಿಬ್ಬಂದಿ ಮಾತ್ರ ನಿರ್ವಹಿಸಬೇಕು. ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಇತರ ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಅಥವಾ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಸಂಶೋಧನೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಶೋಧಕರು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ.
ಈ ಕೈಪಿಡಿ ಬಗ್ಗೆ
Illumina® NextSeq™ 550 ನಲ್ಲಿ Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಈ ಬಳಕೆದಾರರ ಕೈಪಿಡಿ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾಗಿ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ಅನುಸರಿಸಬೇಕು. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ವಿಚಲನಗಳು ದುರ್ಬಲ ಡೇಟಾಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಕೆಲಸದ ಹರಿವನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು, Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಓವರ್ ಅನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿview ಪ್ಲ್ಯಾಟ್‌ಫಾರ್ಮ್‌ಗೆ ಪರಿಚಯಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಕೆದಾರರ ಕೈಪಿಡಿ, ಕಾರಕಗಳು, ಉಪಕರಣಗಳು ಮತ್ತು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ದಾಖಲಾತಿಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿ ಸೇರಿದಂತೆ, ಒಂದು ಓವರ್view ಕೆಲಸದ ಹರಿವು, ಹಾಗೆಯೇ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಮಾರ್ಗಸೂಚಿಗಳು. Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ರಿಯಾಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್‌ಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಚಲಾಯಿಸಬೇಕು ಎಂಬುದರ ಕುರಿತು ಸೂಚನೆಗಳಿಗಾಗಿ, ಅನ್ವಯವಾಗುವ Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಬಳಕೆದಾರರ ಕೈಪಿಡಿಯನ್ನು ನೋಡಿ. Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಅನುಕ್ರಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಡೇಟಾ ಸಂಸ್ಕರಣೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ, Olink® MyData ಕ್ಲೌಡ್ ಬಳಕೆದಾರ ಮಾರ್ಗದರ್ಶಿಯನ್ನು ನೋಡಿ. ಈ ವಸ್ತುವಿನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಟ್ರೇಡ್‌ಮಾರ್ಕ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಹಕ್ಕುಸ್ವಾಮ್ಯಗಳು Olink® Proteomics AB ನ ಆಸ್ತಿಯಾಗಿದೆ, ಇಲ್ಲದಿದ್ದರೆ ಹೇಳದ ಹೊರತು.
ತಾಂತ್ರಿಕ ಬೆಂಬಲ
ತಾಂತ್ರಿಕ ಬೆಂಬಲಕ್ಕಾಗಿ, Olink Proteomics ನಲ್ಲಿ ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ support@olink.com.
ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಸೂಚನೆಗಳು
ಈ ಅಧ್ಯಾಯವು NextSeq™ 550 ನಲ್ಲಿ NextSeq™ 500/550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ಕಿಟ್ v2.5 (75 ಸೈಕಲ್‌ಗಳು) ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ಹೇಗೆ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸುವುದು ಎಂಬುದರ ಕುರಿತು ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಪ್ರೋಟೋಕಾಲ್ Illumina® NextSeq™ 550 ಗಾಗಿ Illumina® ಪ್ರಮಾಣಿತ NGS ವರ್ಕ್‌ಫ್ಲೋನ ರೂಪಾಂತರವಾಗಿದೆ. ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಮುಂದುವರಿಯುವ ಮೊದಲು, ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿದ ಲೈಬ್ರರಿಯ ಗುಣಮಟ್ಟವನ್ನು ಪರಿಶೀಲಿಸಲಾಗಿದೆಯೇ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಿ. ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣದ ಕುರಿತು ಸೂಚನೆಗಳಿಗಾಗಿ ಅನ್ವಯವಾಗುವ Olink ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಬಳಕೆದಾರ ಕೈಪಿಡಿಯನ್ನು ನೋಡಿ.
ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಅನ್ನು ಯೋಜಿಸಿ
ಒಂದು Olink ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು NextSeq™ 550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ ರನ್‌ಗೆ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಬಹುದು. ವಿವಿಧ ಒಲಿಂಕ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ರಿಯಾಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್‌ಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್‌ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ ಮತ್ತು ರನ್‌ಗಳನ್ನು ಟೇಬಲ್ 1 ರಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಒಂದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ರನ್ ಅಗತ್ಯವಿದ್ದರೆ, ಈ ಕೈಪಿಡಿಯಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಿದ ಸೂಚನೆಗಳನ್ನು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಿ.
ಕೋಷ್ಟಕ 1. ಅನುಕ್ರಮ ರನ್ ಯೋಜನೆ:
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ರಿಯಾಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆ | ಹರಿವಿನ ಕೋಶ(ಗಳು) ಮತ್ತು ರನ್(ಗಳು) ಸಂಖ್ಯೆ |
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ 384 ರೀಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | 1 | 1 |
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ 4 x 384 ರೀಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | 4 | 4 |
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ 1536 ರೀಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | 4 | 4 |
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪಾನ್ಶನ್ ರಿಯಾಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | 4 | 4 |
| Olink® ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ 3072 ರೀಜೆಂಟ್ ಕಿಟ್ | 8 | 8 |
Olink® ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನವನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, Olink® ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನವನ್ನು NextSeq™ 550 ನಲ್ಲಿ ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ Olink ಅನುಕ್ರಮ ರನ್ ಮಾಡುವ ಮೊದಲು ಈ ಹಂತವನ್ನು ಒಮ್ಮೆ ಮಾತ್ರ ನಿರ್ವಹಿಸಬೇಕಾಗುತ್ತದೆ.
ಸೂಚನೆ: Olink ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನವು NextSeq™ 500/550 ಹೆಚ್ಚಿನ ಔಟ್ಪುಟ್ ಕಿಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು NextSeq™ ಕಂಟ್ರೋಲ್ ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ 4.0 ನೊಂದಿಗೆ ಮಾತ್ರ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ
- ಅನ್ಜಿಪ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು Olink ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನ Olink_NSQ550_HighOutput_V1 ಅನ್ನು NextSeq™ 550 ಉಪಕರಣದ ಕೆಳಗಿನ ಫೋಲ್ಡರ್‌ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿ: C:\Program Files\Illumina\NextSeq ಕಂಟ್ರೋಲ್ ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್\ರೆಸಿಪಿ\ಕಸ್ಟಮ್\ಹೈ\.
- ಸಿಸ್ಟಂ ಗ್ರಾಹಕೀಕರಣದ ಅಡಿಯಲ್ಲಿ > ಉಪಕರಣವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಿ, ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿ. ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡದಿದ್ದರೆ, ರನ್ ಸೆಟಪ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನ ಆಯ್ಕೆಯು ಕಾಣಿಸುವುದಿಲ್ಲ.
ಸೂಚನೆ: NCS 4.0 ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ ಆವೃತ್ತಿಯಲ್ಲಿ, ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನವನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡುವ ಆಯ್ಕೆಯು ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಿದ ನಂತರ ಮಾತ್ರ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ಹಿಂದಿನ ಸೆಟಪ್ ಪುಟದಲ್ಲಿ ಅಲ್ಲ.
ಸೂಚನೆ: ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸಲು ರನ್ ಅನ್ನು ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಮೋಡ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೊಂದಿಸಬೇಕು.
ಅನುಕ್ರಮ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ಕ್ಲಸ್ಟರಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಕರಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ತಯಾರಿಸಿ
ಎಚ್ಚರಿಕೆ: ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅಪಾಯಕಾರಿ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಕಷ್ಟು ರಕ್ಷಣಾ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಧರಿಸಿ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯಿಸುವ ಮಾನದಂಡಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಳಸಿದ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ತ್ಯಜಿಸಿ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, Illumina NextSeq 550 ಸಿಸ್ಟಮ್ ಗೈಡ್ ಅನ್ನು ನೋಡಿ (ಡಾಕ್ಯುಮೆಂಟ್ #15069765).
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- 1x NextSeq™ 500/550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ರೀಜೆಂಟ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ v2 (75 ಚಕ್ರಗಳು).
ಸೂಚನೆಗಳು
- ಘನೀಕೃತ ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಕೋಣೆಯ ಹದಗೊಳಿಸಿದ ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಅರ್ಧ-ಮುಳುಗಿಸಿ ಮತ್ತು 1 ಗಂಟೆ ಕರಗಲು ಬಿಡಿ. ಕಾರ್ಟ್ರಿಜ್ಗಳ ಎಲ್ಲಾ ಕಾರಕ ಜಲಾಶಯಗಳು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಕರಗುತ್ತವೆ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಿ.
ಸೂಚನೆ: ಅನುಕೂಲಕ್ಕಾಗಿ, ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಹಿಂದಿನ ದಿನ ಕರಗಿಸಿ ಮತ್ತು ರಾತ್ರಿಯಲ್ಲಿ ಅದನ್ನು 4 °C ನಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ. ಈ ತಾಪಮಾನದಲ್ಲಿ, ಕಾರಕಗಳು ಒಂದು ವಾರದವರೆಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತವೆ. - ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಕಾಗದದ ಟವಲ್‌ನಿಂದ ಚೆನ್ನಾಗಿ ಒಣಗಿಸಿ ಮತ್ತು ಅಗತ್ಯವಿದ್ದಲ್ಲಿ ಫಾಯಿಲ್ ಸೀಲ್‌ಗಳನ್ನು ಲಿಂಟ್-ಫ್ರೀ ಟಿಶ್ಯೂನಿಂದ ಒಣಗಿಸಿ.
- ಕರಗಿದ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಮಿಶ್ರಣ ಮಾಡಲು ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಹತ್ತು ಬಾರಿ ತಿರುಗಿಸಿ.
- ಗಾಳಿಯ ಗುಳ್ಳೆಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲು ಬೆಂಚ್ ಮೇಲೆ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ನಿಧಾನವಾಗಿ ಟ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಿ. ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು 4 ಗಂಟೆಗಳ ಒಳಗೆ ಬಳಸಿದರೆ ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ.
ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- 1x NextSeq™ 500/550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ v2.5.
ಸೂಚನೆಗಳು
- ರೆಫ್ರಿಜರೇಟೆಡ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಅನ್ನು 30 ನಿಮಿಷಗಳ ಕಾಲ ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶಕ್ಕೆ ತನ್ನಿ.
- ಹೊಸ ಪುಡಿ ಮುಕ್ತ ಕೈಗವಸುಗಳನ್ನು ಹಾಕಿ (ಹರಿವಿನ ಕೋಶದ ಗಾಜಿನ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಕಲುಷಿತಗೊಳಿಸುವುದನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಲು).
- ಉಪಕರಣಕ್ಕೆ ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಿದ್ಧವಾದಾಗ, ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಟಿಕ್ ಕ್ಲಾಮ್‌ಶೆಲ್‌ನಿಂದ ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿ.
- ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಿ. ಗಾಜಿನ ಮೇಲ್ಮೈಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಕಣಗಳು ಅಥವಾ ಧೂಳು ಗೋಚರಿಸಿದರೆ, ಅನ್ವಯಿಸುವ ಮೇಲ್ಮೈಯನ್ನು ಲಿಂಟ್-ಫ್ರೀ ಐಸೊಪ್ರೊಪಿಲ್ ಆಲ್ಕೋಹಾಲ್ ಒರೆಸುವ ಮೂಲಕ ಸ್ವಚ್ಛಗೊಳಿಸಿ ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆ-ಲಿಂಟ್ ಲ್ಯಾಬ್ ಅಂಗಾಂಶದಿಂದ ಒಣಗಿಸಿ.
ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ Olink® ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, NaOH ಮತ್ತು Tris-HCl ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿದ ಮತ್ತು ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಿತ ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಅನುಕ್ರಮ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಿರಾಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
NaOH ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ
NaOH ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಗ್ರಂಥಾಲಯಗಳನ್ನು ನಿರಾಕರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- 1 N NaOH ಸ್ಟಾಕ್
- ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರು
- 1x ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (1.5 mL)
- ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಪೈಪೆಟ್ (10-100 μL)
- ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೈಪೆಟ್ ಸಲಹೆಗಳು
ನೀವು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು
ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ "NaOH" ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿ.
ಸೂಚನೆಗಳು
- ಟೇಬಲ್ 0.2 ರ ಪ್ರಕಾರ NaOH ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ 2 N NaOH ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ.
- NaOH ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಕೆಳಗೆ ತಿರುಗಿಸಿ. 12 ಗಂಟೆಗಳ ಒಳಗೆ ಬಳಸಿ.
ಕೋಷ್ಟಕ 2. 0.2 N NaOH ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆ
| ಕಾರಕ | ಪರಿಮಾಣ (μL) |
| ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರು | 80 |
| 1 N NaOH ಸ್ಟಾಕ್ | 20 |
2.4.2 Tris-HCl ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ
ಡಿನಾಚುರೇಟೆಡ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸಲು Tris-HCl ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- 1 M Tris-HCl pH 7.0 ಸ್ಟಾಕ್ (Trizma® ಹೈಡ್ರೋಕ್ಲೋರೈಡ್ ಪರಿಹಾರ)
- ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರು
- 1x ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (1.5 mL)
- ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಪೈಪೆಟ್ (10-100 μL)
- ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೈಪೆಟ್ ಸಲಹೆಗಳು
ನೀವು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು
- ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ "Tris-HCl" ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿ
ಸೂಚನೆಗಳು
- ಕೋಷ್ಟಕ 200 ರ ಪ್ರಕಾರ Tris-HCl ಟ್ಯೂಬ್‌ನಲ್ಲಿ 3 mM Tris-HCl ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತಯಾರಿಸಿ.
- Tris-HCl ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ತಿರುಗಿಸಿ.
ಕೋಷ್ಟಕ 3. 200 mM Tris-HCl ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆ:
| ಕಾರಕ | ಪರಿಮಾಣ (μL) |
| ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರು | 80 |
| 1M Tris-HCl pH 7.0 ಸ್ಟಾಕ್ (Trizma® ಹೈಡ್ರೋಕ್ಲೋರೈಡ್ ಪರಿಹಾರ) | 20 |
Olink® ಲೈಬ್ರರಿಗಳನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿದ ಮತ್ತು ಗುಣಮಟ್ಟ ನಿಯಂತ್ರಿತ ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು 1:33 ರಷ್ಟು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- ಲಿಬ್ ಟ್ಯೂಬ್, ಅನ್ವಯವಾಗುವ ಒಲಿಂಕ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಬಳಕೆದಾರರ ಕೈಪಿಡಿಯ ಪ್ರಕಾರ ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ
- ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರು
- 1x ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ (1.5 mL)
- ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಪೈಪೆಟ್‌ಗಳು (0.5-10 ಮತ್ತು 100-1000 μL)
- ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೈಪೆಟ್ ಸಲಹೆಗಳು
ನೀವು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು
- ಲಿಬ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಫ್ರೀಜ್ ಆಗಿದ್ದರೆ ಕರಗಿಸಿ.
- ಹೊಸ ಮೈಕ್ರೊಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿ: "ದಿಲ್".
ಸೂಚನೆಗಳು
- ದಿಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ 96 μL ಮಿಲಿಕ್ಯೂ ನೀರನ್ನು ಸೇರಿಸಿ.
- ಲಿಬ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ.
- 3 μL ಅನ್ನು ಲಿಬ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಿಂದ ದಿಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಿ.
- ದಿಲ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ
ಅಂತಿಮ ಲೋಡಿಂಗ್ ಸಾಂದ್ರತೆಗೆ ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಿ ಮತ್ತು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಿದ ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಡಿನೇಚರ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅಂತಿಮ ಲೋಡಿಂಗ್ ಸಾಂದ್ರತೆಗೆ ಮತ್ತಷ್ಟು ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- ದಿಲ್ ಟ್ಯೂಬ್, ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ
- 0.2 N NaOH ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಹೊಸದಾಗಿ ತಯಾರಿಸಲಾಗಿದೆ
- 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) ದುರ್ಬಲಗೊಳಿಸುವಿಕೆ, ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ
- ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್ ಬಫರ್ 1 (HT1) ಅನ್ನು NextSeq™ ಆಕ್ಸೆಸರಿ ಬಾಕ್ಸ್ v2 ನಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ
- 2x ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗಳು (1.5 mL ಮತ್ತು 2 mL)
- ಹಸ್ತಚಾಲಿತ ಪೈಪೆಟ್‌ಗಳು (0.5-10 ಮತ್ತು 100-1000 μL)
- ಫಿಲ್ಟರ್ ಪೈಪೆಟ್ ಸಲಹೆಗಳು
ನೀವು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವ ಮೊದಲು
- ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟಿದ HT1 ಬಫರ್ ಅನ್ನು ಕರಗಿಸಿ. ಬಳಕೆಯವರೆಗೆ +4 ° C ನಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಿ.
- ಹೊಸ 1.5 mL ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿ: "ಡೆನ್" (ಡಿನಾಚುರೇಟೆಡ್ ಲೈಬ್ರರಿಗಾಗಿ).
- ಹೊಸ 2 mL ಮೈಕ್ರೋಸೆಂಟ್ರಿಫ್ಯೂಜ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಿ: "Seq" (ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಿದ್ಧವಾಗಿದೆ).
ಸೂಚನೆಗಳು
- 5 μL ಅನ್ನು ದಿಲ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಿಂದ ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಿ.
- ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ 5 N NaOH ನ 0.2 μL ಸೇರಿಸಿ.
- ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ.
- ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಡಿನೇಚರ್ ಮಾಡಲು ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ 5 ನಿಮಿಷಗಳ ಕಾಲ ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಕಾವುಕೊಡಿ.
- ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸಲು 5 μL 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) ಅನ್ನು ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ ಸೇರಿಸಿ.
- ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ.
- ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ 985 μL ಪ್ರಿಶಿಲ್ಡ್ HT1 ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಿ.
- ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ಸುಳಿಯಿರಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ. ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು +4 °C ನಲ್ಲಿ ಬಳಸುವವರೆಗೆ (ಅದೇ ದಿನ) ಸಂಗ್ರಹಿಸಬಹುದು.
- 205 μL ಅನ್ನು ಡೆನ್ ಟ್ಯೂಬ್‌ನಿಂದ Seq ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸಿ.
- Seq ಟ್ಯೂಬ್‌ಗೆ 1095 μL ಪ್ರಿಶಿಲ್ಡ್ HT1 ಅನ್ನು ಸೇರಿಸಿ.
- ಕಾರಕಗಳನ್ನು ಮಿಶ್ರಣ ಮಾಡಲು Seq ಟ್ಯೂಬ್ ಅನ್ನು ತಿರುಗಿಸಿ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತವಾಗಿ ತಿರುಗಿಸಿ. ಅಂತಿಮ ಲೋಡಿಂಗ್ ಪರಿಮಾಣವು 1.3 ಮಿಲಿ.
- ತಕ್ಷಣವೇ 2.5 ಓಲಿಂಕ್ ® ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಅನ್ನು ಮುಂದುವರಿಸಿ.
Olink® ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಮಾಡಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್, ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಮತ್ತು ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ತಯಾರಾದ ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು NextSeq 550 ಗೆ ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಓಲಿಂಕ್ ಕಸ್ಟಮ್ ಪಾಕವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅನುಕ್ರಮ ರನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಬೆಂಚ್ ತಯಾರು
- Seq ಟ್ಯೂಬ್ (ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಲು ಸಿದ್ಧವಾಗಿದೆ), ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ
- 1x NextSeq™ 500/550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ರೀಜೆಂಟ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ v2, ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ
- 1x NextSeq™ 500/550 ಹೈ ಔಟ್ಪುಟ್ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ v2.5, ಹಿಂದಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ
- 1x NextSeq™ 500/550 ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ v2 (75 ಚಕ್ರಗಳು), ಕೋಣೆಯ ಉಷ್ಣಾಂಶದಲ್ಲಿ
ಅನುಕ್ರಮ ರನ್ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿಸಿ
ಈ ಹಂತದಲ್ಲಿ, ಅನುಕ್ರಮ ರನ್ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು NextSeq™ 550 ನಲ್ಲಿ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
- NextSeq™ 550 ಮುಖಪುಟ ಪರದೆಯಲ್ಲಿ, ಪ್ರಯೋಗವನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
- ಆಯ್ಕೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಪರದೆಯಲ್ಲಿ, ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
- ರನ್ ಸೆಟಪ್ ಪುಟದಲ್ಲಿ, ಮ್ಯಾನುಯಲ್ ರನ್ ಮೋಡ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ನಂತರ ಮುಂದೆ.
- ರನ್ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನಂತೆ ಹೊಂದಿಸಿ:
- ರನ್ ನೇಮ್ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ, ಅನನ್ಯ ಪ್ರಯೋಗ ID ಅನ್ನು ನಮೂದಿಸಿ.
- ಲೈಬ್ರರಿ ID ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ, ನೀವು ಚಾಲನೆಯಲ್ಲಿರುವ ಲೈಬ್ರರಿಯ ID ಅನ್ನು ನಮೂದಿಸಿ (ಐಚ್ಛಿಕ).
- ರೀಡ್ ಟೈಪ್ ಕ್ಷೇತ್ರದಲ್ಲಿ, ಸಿಂಗಲ್ ರೀಡ್ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಆರಿಸಿ.
- ಚಕ್ರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಈ ಕೆಳಗಿನಂತೆ ನಮೂದಿಸಿ:
- 1:24 ಓದಿ
- ಸೂಚ್ಯಂಕ 1: 0
- ಸೂಚ್ಯಂಕ 2: 0
- 2:0 ಓದಿ
- ಕಸ್ಟಮ್ ಪ್ರೈಮರ್‌ಗಳಿಗಾಗಿ ಚೆಕ್‌ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡದೆ ಇರಿಸಿ.
- ಪ್ರಸ್ತುತ ರನ್ ಕಚ್ಚಾ ಡೇಟಾಕ್ಕಾಗಿ ಔಟ್ಪುಟ್ ಫೋಲ್ಡರ್ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಹೊಂದಿಸಿ. ಔಟ್ಪುಟ್ ಫೋಲ್ಡರ್ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು ಬ್ರೌಸ್ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
- ಎಸ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿಸಬೇಡಿampಲೆ ಶೀಟ್.
- ಈ ಓಟಕ್ಕಾಗಿ ಪರ್ಜ್ ಉಪಭೋಗ್ಯಗಳನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
- ಮುಂದೆ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
NextSeq™ 550 ಗೆ ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಅನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ
- ಹಿಂದಿನ ಓಟದಿಂದ ಬಳಸಿದ ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿ.
- ಹೊಸ ಸಿದ್ಧಪಡಿಸಿದ ಹರಿವಿನ ಕೋಶವನ್ನು s ನಲ್ಲಿ ಇರಿಸಿtage.
- ಲೋಡ್ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ. ಬಾಗಿಲು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತವಾಗಿ ಮುಚ್ಚಲ್ಪಡುತ್ತದೆ.
- ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಐಡಿ ಪರದೆಯ ಮೇಲೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಾಗ ಮತ್ತು ಸಂವೇದಕಗಳನ್ನು ಹಸಿರು ಬಣ್ಣದಲ್ಲಿ ಪರಿಶೀಲಿಸಿದಾಗ, ಮುಂದೆ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ
ಕಾರಕ ಧಾರಕವನ್ನು ಖಾಲಿ ಮಾಡಿ
ಎಚ್ಚರಿಕೆ: ಈ ಕಾರಕಗಳ ಸೆಟ್ ಸಂಭಾವ್ಯ ಅಪಾಯಕಾರಿ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಕಷ್ಟು ರಕ್ಷಣಾ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಧರಿಸಿ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯಿಸುವ ಮಾನದಂಡಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಳಸಿದ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ತ್ಯಜಿಸಿ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, Illumina NextSeq 550 ಸಿಸ್ಟಮ್ ಗೈಡ್ ಅನ್ನು ನೋಡಿ.
- ಬಫರ್ ಕಂಪಾರ್ಟ್‌ಮೆಂಟ್‌ನ ಬಾಗಿಲು ತೆರೆಯಿರಿ, ಕೆಳಗಿನ ವಿಭಾಗದಿಂದ ಖರ್ಚು ಮಾಡಿದ ಕಾರಕಗಳ ಧಾರಕವನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯವಾಗುವ ಮಾನದಂಡಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ವಿಷಯವನ್ನು ವಿಲೇವಾರಿ ಮಾಡಿ.
- ಖಾಲಿ ಕಾರಕ ಧಾರಕವನ್ನು ಮತ್ತೆ ಕೆಳಗಿನ ಬಫರ್ ಕಂಪಾರ್ಟ್‌ಮೆಂಟ್‌ಗೆ ಸ್ಲೈಡ್ ಮಾಡಿ. ಧಾರಕವನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಶ್ರವ್ಯ ಕ್ಲಿಕ್ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.
ಲೋಡ್ ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್
- ಮೇಲಿನ ಬಫರ್ ವಿಭಾಗದಿಂದ ಬಳಸಿದ ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯವಾಗುವ ಮಾನದಂಡಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ವಿಷಯವನ್ನು ವಿಲೇವಾರಿ ಮಾಡಿ.
- ಮೇಲಿನ ಬಫರ್ ಕಂಪಾರ್ಟ್‌ಮೆಂಟ್‌ಗೆ ಹೊಸ ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಸ್ಲೈಡ್ ಮಾಡಿ. ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಶ್ರವ್ಯ ಕ್ಲಿಕ್ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಪರದೆಯ ಮೇಲೆ ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಐಡಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಂವೇದಕಗಳನ್ನು ಹಸಿರು ಬಣ್ಣದಲ್ಲಿ ಪರಿಶೀಲಿಸಲಾಗಿದೆಯೇ ಎಂದು ಖಚಿತಪಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಿ.
- ಬಫರ್ ಕಂಪಾರ್ಟ್‌ಮೆಂಟ್‌ನ ಬಾಗಿಲನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ ಮತ್ತು ಮುಂದೆ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ
- ಕಾರಕ ವಿಭಾಗದ ಬಾಗಿಲು ತೆರೆಯಿರಿ, ಬಳಸಿದ ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಿ ಮತ್ತು ಅನ್ವಯವಾಗುವ ಮಾನದಂಡಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಳಕೆಯಾಗದ ವಿಷಯವನ್ನು ವಿಲೇವಾರಿ ಮಾಡಿ. 6 ನೇ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿರುವ ಜಲಾಶಯವನ್ನು ಸುರಕ್ಷಿತವಾಗಿ ವಿಲೇವಾರಿ ಮಾಡಲು ಅನುಕೂಲವಾಗುವಂತೆ ತೆಗೆಯಬಹುದಾಗಿದೆ.
- "ಇಲ್ಲಿ ಲೋಡ್ ಲೈಬ್ರರಿ" ಎಂದು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ #10 ಜಲಾಶಯದ ಸೀಲ್ ಅನ್ನು ಕ್ಲೀನ್ 1 mL ಪೈಪೆಟ್ ತುದಿಯೊಂದಿಗೆ ಚುಚ್ಚಿ.
- Seq ಟ್ಯೂಬ್‌ನಿಂದ 1.3 mL ಒಲಿಂಕ್ ಲೈಬ್ರರಿಯನ್ನು "ಇಲ್ಲಿ ಲೈಬ್ರರಿ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ" ಎಂದು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ #10 ಜಲಾಶಯಕ್ಕೆ ಲೋಡ್ ಮಾಡಿ.
- ಹೊಸ ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ಅನ್ನು ಕಾರಕ ವಿಭಾಗಕ್ಕೆ ಸ್ಲೈಡ್ ಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಕಾರಕ ವಿಭಾಗದ ಬಾಗಿಲನ್ನು ಮುಚ್ಚಿ.
- ಲೋಡ್ ಅನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ ಮತ್ತು ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್ ID ಪರದೆಯ ಮೇಲೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುವವರೆಗೆ ಮತ್ತು ಸಂವೇದಕಗಳನ್ನು ಹಸಿರು ಬಣ್ಣದಲ್ಲಿ ಪರಿಶೀಲಿಸುವವರೆಗೆ ~30 ಸೆಕೆಂಡುಗಳ ಕಾಲ ನಿರೀಕ್ಷಿಸಿ.
- ರೆಸಿಪಿ ಡ್ರಾಪ್-ಡೌನ್ ಪಟ್ಟಿಯಿಂದ, [ಕಸ್ಟಮ್] “Olink_NSQ550_HighOutput_V1” ಪಾಕವಿಧಾನ ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
- ಮುಂದೆ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ.
ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸಿ
- Re ನಲ್ಲಿ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾದ ರನ್ ನಿಯತಾಂಕಗಳನ್ನು ದೃಢೀಕರಿಸಿview ಪರದೆಯ. ಯಾವುದೇ ಪ್ಯಾರಾಮೀಟರ್‌ಗಳನ್ನು ಸಂಪಾದಿಸಲು, ರನ್ ಸೆಟಪ್ ಪರದೆಗೆ ಹಿಂತಿರುಗಲು ಹಿಂದಕ್ಕೆ ಒತ್ತಿರಿ.
- ಮುಂದೆ ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿ. ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಪೂರ್ವ-ರನ್ ಪರಿಶೀಲನೆಯ ನಂತರ ರನ್ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗುತ್ತದೆ. ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಸಮಯವು ಸರಿಸುಮಾರು 7h30 ನಿಮಿಷಗಳು.
- ಕೆಲಸದ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಸ್ವಚ್ಛಗೊಳಿಸಿ.
ಸೂಚನೆ: ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್ ಪೂರ್ಣಗೊಂಡಾಗ, ಬಫರ್ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್‌ನಲ್ಲಿ ಒದಗಿಸಲಾದ ವಾಶ್ ಪರಿಹಾರಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕಾರಕ ಕಾರ್ಟ್ರಿಡ್ಜ್‌ನಲ್ಲಿ ಒದಗಿಸಲಾದ NaOCl ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಸಾಫ್ಟ್‌ವೇರ್ ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತ ಪೋಸ್ಟ್-ರನ್ ವಾಶ್ ಅನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ತೊಳೆಯುವಿಕೆಯು ಸುಮಾರು 90 ನಿಮಿಷಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ತೊಳೆಯುವಿಕೆಯು ಪೂರ್ಣಗೊಂಡ ನಂತರ ಹೋಮ್ ಬಟನ್ ಸಕ್ರಿಯವಾಗುತ್ತದೆ. ಬಳಸಿದ ಕಾರ್ಟ್ರಿಜ್ಗಳು ಮತ್ತು ಫ್ಲೋ ಸೆಲ್ ಅನ್ನು ಮುಂದಿನ ರನ್ ತನಕ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ಬಿಡಬಹುದು.
ರನ್ ಪ್ರಗತಿಯನ್ನು ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆ ಮಾಡಿ
s ನಲ್ಲಿ ಕೊಟ್ಟಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ನ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಅಂದಾಜು ಮಾಡಲು ತಿಳಿದಿರುವ ಅನುಕ್ರಮದ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲು ಒಲಿಂಕ್ NGS ಅನ್ನು ಓದುವಿಕೆಯಾಗಿ ಬಳಸುತ್ತದೆ.ampಲೆಸ್ (ಇತರ s ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆampಲೆಸ್). ಪ್ರತಿ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ಲೋರ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ರನ್‌ನಿಂದ ಡೇಟಾ ಗುಣಮಟ್ಟವನ್ನು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಒಲಿಂಕ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಕ್ಕೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ QC ನಿಯತಾಂಕಗಳಿಂದ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, Q-ಸ್ಕೋರ್‌ನಂತಹ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ NGS ನಲ್ಲಿ ಬಳಸುವ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಗುಣಮಟ್ಟದ ನಿಯಂತ್ರಣ ಮೆಟ್ರಿಕ್‌ಗಳು ಕಡಿಮೆ ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿವೆ.
ಪರಿಷ್ಕರಣೆ ಇತಿಹಾಸ
| ಆವೃತ್ತಿ | ದಿನಾಂಕ | ವಿವರಣೆ |
| 1.1 | 2021-12-13 | ಸಂಪಾದಕೀಯ ಬದಲಾವಣೆಗಳು |
| 1.0 | 2021-12-01 | ಹೊಸದು |
www.olink.com
ಸಂಶೋಧನಾ ಬಳಕೆಗೆ ಮಾತ್ರ. ರೋಗನಿರ್ಣಯ ವಿಧಾನಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಕೆಗೆ ಅಲ್ಲ.
ಈ ಉತ್ಪನ್ನವು Olink ಉತ್ಪನ್ನಗಳ ವಾಣಿಜ್ಯೇತರ ಬಳಕೆಗಾಗಿ ಪರವಾನಗಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ವಾಣಿಜ್ಯ ಬಳಕೆದಾರರಿಗೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಪರವಾನಗಿಗಳು ಬೇಕಾಗಬಹುದು. ದಯವಿಟ್ಟು ಒಲಿಂಕ್ ಅನ್ನು ಸಂಪರ್ಕಿಸಿ
ವಿವರಗಳಿಗಾಗಿ ಪ್ರೋಟಿಯೊಮಿಕ್ಸ್ AB. ಈ ವಿವರಣೆಯನ್ನು ಮೀರಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿರುವ ಯಾವುದೇ ವಾರಂಟಿಗಳು, ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ ಅಥವಾ ಸೂಚಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿಲ್ಲ. Olink Proteomics AB ಈ ಉತ್ಪನ್ನದಿಂದ ಉಂಟಾದ ಆಸ್ತಿ ಹಾನಿ, ವೈಯಕ್ತಿಕ ಗಾಯ ಅಥವಾ ಆರ್ಥಿಕ ನಷ್ಟಕ್ಕೆ ಜವಾಬ್ದಾರನಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ.
ಕೆಳಗಿನ ಟ್ರೇಡ್‌ಮಾರ್ಕ್ ಒಲಿಂಕ್ ಪ್ರೋಟಿಯೊಮಿಕ್ಸ್ ಎಬಿ ಒಡೆತನದಲ್ಲಿದೆ: ಒಲಿಂಕ್®.
ಈ ಉತ್ಪನ್ನವು ಹಲವಾರು ಪೇಟೆಂಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಪೇಟೆಂಟ್ ಅಪ್ಲಿಕೇಶನ್‌ಗಳಿಂದ ಲಭ್ಯವಿದೆ https://www.olink.com/patents/.
© ಕೃತಿಸ್ವಾಮ್ಯ 2021 ಒಲಿಂಕ್ ಪ್ರೋಟಿಯೊಮಿಕ್ಸ್ ಎಬಿ. ಎಲ್ಲಾ ಮೂರನೇ ವ್ಯಕ್ತಿಯ ಟ್ರೇಡ್‌ಮಾರ್ಕ್‌ಗಳು ಆಯಾ ಮಾಲೀಕರ ಆಸ್ತಿಯಾಗಿದೆ. ಒಲಿಂಕ್ ಪ್ರೋಟಿಯೊಮಿಕ್ಸ್, ಡಾಗ್ ಹ್ಯಾಮರ್ಸ್ಕ್‌ಜಾಲ್ಡ್ಸ್ väg 52B , SE-752 37 ಉಪ್ಸಲಾ, ಸ್ವೀಡನ್
1192, v1.1, 2021-12-13
ದಾಖಲೆಗಳು / ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳು
 |
NextSeq 550 ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಓಲಿಂಕ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ [ಪಿಡಿಎಫ್] ಬಳಕೆದಾರರ ಕೈಪಿಡಿ NextSeq 550, NextSeq 550 ಬಳಸಿ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ, ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅನ್ವೇಷಿಸಿ |
