د Olink NextSeq 2000 سپړنه د کارن لارښود ترتیب

منځپانګې پټول

1 Olink NextSeq 2000 سپړنه ترتیب

2 پیژندنه

3 د لابراتوار لارښوونې

Olink NextSeq 2000 سپړنه ترتیب

د سند یادښت
د Olink® سپړنې کارن لارښود، doc nr 1153، متروک دی، او د لاندې اسنادو په واسطه بدل شوی دی:

Olink® سپړنهview د کارن لارښود، سند نمبر 1187
Olink® سپړنه 384 کارن لارښود، doc nr 1188
Olink® سپړنه 4 x 384 کارن لارښود، سند nr 1189
Olink® سپړنه 1536 او د توسع کارونکي لارښود، سند nr 1190

Olink® سپړنه 3072 کارن لارښود، doc nr 1191
Olink® د NextSeq 550 کارن لارښود په کارولو سره ترتیب وپلټئ، doc nr 1192
Olink® د NextSeq 2000 کارن لارښود په کارولو سره ترتیب وپلټئ، doc nr 1193

Olink® د NovaSeq 6000 کارن لارښود په کارولو سره ترتیب وپلټئ، سند nr 1194

پیژندنه

اراده کارول
Olink® سپړنه د انسان پروټین بایومارکر کشف لپاره ملټي پلیکس امیونوسای پلیټ فارم دی. محصول یوازې د څیړنې کارولو لپاره دی ، نه د تشخیصي پروسیجرونو کې د کارولو لپاره. د لابراتوار کار یوازې د روزل شوي لابراتوار کارمندانو لخوا پرمخ وړل کیږي. د معلوماتو پروسس کول باید یوازې د روزل شوي کارمندانو لخوا ترسره شي. پایلې د نورو کلینیکي یا لابراتوار موندنو سره په ګډه د څیړونکو لخوا کارول کیږي.
د دې لارښود په اړه
دا کارن لارښود په Illumina® NextSeq™ 2000 کې د Olink® سپړنې کتابتونونو ترتیب کولو لپاره اړین لارښوونې چمتو کوي. لارښوونې باید په کلکه او واضح ډول تعقیب شي. د لابراتوار په ټولو مرحلو کې هر ډول انحراف ممکن د معلوماتو خرابیدو لامل شي. د لابراتوار کاري فلو پیل کولو دمخه، د Olink® Explore Over سره مشوره وکړئview د پلیټ فارم د پیژندنې لپاره د کارونکي لارښود ، پشمول د ریجنټونو ، تجهیزاتو او اړین اسنادو په اړه معلومات ، اوورview د کار جریان، او همدارنګه د لابراتوار لارښوونې. د Olink® Explore Reagent Kits چلولو څرنګوالي په اړه د لارښوونو لپاره، د تطبیق وړ Olink® سپړنې کارن لارښود ته مراجعه وکړئ. د معلوماتو پروسس کولو او د Olink® سپړنې ترتیب پایلو تحلیل لپاره، د Olink® NPX سپړنې کارن لارښود ته مراجعه وکړئ. په دې موادو کې موجود ټول سوداګریزې نښې او کاپي حقونه د Olink® Proteomics AB ملکیت دي، پرته لدې چې بل ډول ویل شوي.
تخنیکي ملاتړ
د تخنیکي ملاتړ لپاره، د Olink Proteomics سره اړیکه ونیسئ support@olink.com.

د لابراتوار لارښوونې

دا څپرکی د NextSeq™ 2000/1000 P2000 Reagents (2 Cycles) v100 په کارولو سره په NextSeq™ 3 کې د Olink کتابتونونو د ترتیب کولو څرنګوالي په اړه لارښوونې وړاندې کوي. د ترتیب کولو لپاره کارول شوی پروتوکول د Illumina® NextSeq™ 2000 لپاره د Illumina® معیاري NGS کاري فلو موافقت دی.
د ترتیب کولو ته د تګ دمخه، ډاډ ترلاسه کړئ چې د پاک شوي اولینک کتابتون کیفیت تایید شوی. د کیفیت کنټرول په اړه د لارښوونو لپاره د تطبیق وړ اولینک سپړنې کارن لارښود ته مراجعه وکړئ.
د لړۍ ترتیب پلان کړئ
یو اولینک کتابتون په هر NextSeq™ 2000 P2 فلو سیل او هر چل کې ترتیب کیدی شي. د P2 جریان حجرو شمیر او د مختلف Olink Explore Reagent Kits ترتیب کولو لپاره اړین دي په جدول 1 کې تشریح شوي.
که چیرې له یو څخه ډیرو منډو ته اړتیا وي، په دې لارښود کې تشریح شوي لارښوونې تکرار کړئ.
جدول 1. د چلولو پلان ترتیب کول

Olink® سپړنه Reagent Kit	د اولینک کتابتونونو شمیر	د جریان حجرو او چلولو شمیر
Olink® سپړنه 384 Reagent Kit	1	1
Olink® سپړنه 4 x 384 Reagent Kit	4	4
Olink® سپړنه 1536 Reagent Kit	4	4
Olink® Explore Expansion Reagent Kit	4	4
Olink® سپړنه 3072 Reagent Kit	8	8

د Olink® دودیز ترکیب چمتو کړئ
د دې مرحلې په جریان کې، د Olink® دودیز ترکیب په NextSeq™ 2000 کې چمتو شوی دی. دا مرحله یوازې یو ځل ترسره کولو ته اړتیا لري، مخکې له دې چې د لومړي ځل لپاره د Olink تسلسل چلول ترسره شي.
د اولینک دودیز ترکیب XML- خلاص او خوندي کړئfile Olink_NSQ2K_P2_V1 په مناسب وسیله فولډر کې.
یادونه: د Olink دودیز ترکیب به یوازې د NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagents (100 Cycles) v3 kit او NextSeq™ 1000/2000 کنټرول سافټویر v1.2 یا v1.4 سره کار وکړي.

د ترتیب کولو ریجنټونه چمتو کړئ
د دې مرحلې په جریان کې، د ریجنټ کارتریج چې کلسترینګ او د ترتیب کولو ریجنټونه لري پړسیدل کیږي او د جریان حجره چمتو کیږي.

خبرداری: د ریجنټ کارتریج احتمالي خطرناک کیمیاوي توکي لري. کافي محافظتي تجهیزات واغوندئ او د تطبیق شوي معیارونو سره سم کارول شوي ریجنټونه پریږدئ. د لا زیاتو معلوماتو لپاره، د Illumina NextSeq 1000 او 2000 سیسټم لارښود (سند #1000000109376) ته مراجعه وکړئ.

د ریجنټ کارتریج چمتو کړئ
د نه خلاص شوي کارتریج غوړول د دریو مختلف میتودونو په کارولو سره ترسره کیدی شي: د خونې په حرارت کې ، د کنټرول شوي اوبو حمام کې ، یا په یخچال کې.

بنچ چمتو کړئ

1x NextSeq™ 1000/2000 P2 ریجنټ کارتریج (100 چکرونه)

لارښوونې
لکه څنګه چې په 2 جدول کې تشریح شوي د ریجنټ کارتریج غوړ کړئ.
جدول 2. د ریجنټ کارتریج د پړسوب طریقې

د غوړولو طریقه	لارښوونې
د خونې د حرارت درجه	• پرته له دې چې د سپینو زرو د ورق کڅوړه خلاص کړئ، کنګل شوي ریجینټ کارتریج په بنچ کې واچوئ او د 9 ساعتونو لپاره یې د خونې په حرارت درجه کې وخورئ. د 16 ساعتونو څخه زیات مه کوئ. • ډاډ ترلاسه کړئ چې د کڅوړې لیبل مخ دی او هوا کولی شي د کارتریج شاوخوا حرکت وکړي.
د اوبو په حمام کې	• پرته له دې چې د سپینو زرو د ورق کڅوړه خلاص کړئ، منجمد ریجنټ کارتریج نیمه ډوب شوي د 25 ° C د اوبو حمام کې ځای په ځای کړئ او د 6 ساعتونو لپاره یې پریږدئ. د 8 ساعتونو څخه زیات مه کوئ. • ډاډ ترلاسه کړئ چې د کڅوړې لیبل مخ ته ځي او دا چې کارتریج د تودوخې په وخت کې نه وګرځي. • کارتریج د کاغذ تولیه په ښه توګه وچ کړئ.
په یخچال کې	• پرته له دې چې د سپینو زرو ورق کڅوړه خلاص کړئ، کارتریج په بنچ کې کېږدئ او د خونې په حرارت درجه کې یې د 6 ساعتونو لپاره وخورئ. • ډاډ ترلاسه کړئ چې د کڅوړې لیبل مخ دی او هوا کولی شي د کارتریج شاوخوا حرکت وکړي. • کارتریج د 12 ساعتونو لپاره په یخچال کې پریږدئ. د 72 ساعتونو څخه زیات مه کوئ. • د چلولو دمخه، له یخچال څخه نه خلاص شوی کارتریج لرې کړئ او اجازه ورکړئ چې لږترلږه د 15 دقیقو په جریان کې د خونې تودوخې ته ورسیږي، مګر د 1 ساعت څخه زیات نه.

یادونه: تاو شوي کارتوس نشي منجمد کیدی او باید په 4 ° C کې زیرمه شي، د 72 ساعتونو لپاره د اعظمي وخت لپاره.

د جریان سیل چمتو کړئ بنچ چمتو کړئ

1x NextSeq™ 1000/2000 P2 فلو سیل

لارښوونې

د یخچال شوي جریان سیل د 10-15 دقیقو لپاره د خونې تودوخې ته راوړو.

د ترتیب کولو لپاره د Olink® کتابتون چمتو کړئ

د دې مرحلې په جریان کې، پاک او د کیفیت کنټرول اولینک کتابتون د وروستي بارولو غلظت ته کم شوی. په یاد ولرئ چې د کتابتون تخریب په اتوماتيک ډول په وسیله کې ترسره کیږي.
بنچ چمتو کړئ

لیب ټیوب، د تطبیق وړ اولینک سپړنې کارونکي لارښود سره سم چمتو شوی

1x RSB د Tween 20 سره
ملی کیو اوبه
2x مایکرو سینټرفیوج ټیوب (1.5 ملی لیتر)
لاسي پایپټ (10، 100 او 1000 μL)
د فلټر پایپټ لارښوونې

مخکې له دې چې تاسو پیل کړئ

د لیب ټیوب وخورئ که منجمد وي.
منجمد RSB د 20 سره د خونې په حرارت درجه کې د 10 دقیقو لپاره وغورځوئ. تر استعمال پورې په +4 °C کې ذخیره کړئ.
دوه نوي 1.5 ملی لیتر مایکروسینټریفوج ټیوبونه په لاندې ډول نښه کړئ:
- یو ټیوب "دل" په نښه کړئ (د 1:100 کم شوي کتابتون لپاره)
- یو ټیوب "Seq" په نښه کړئ (د کتابتون بارولو ته چمتو لپاره)

لارښوونې

د ډیل ټیوب ته 495 μL ملی کیو اوبه اضافه کړئ.

د لیب ټیوب ورټیکس کړئ او په لنډ ډول یې وخورئ.
په لاسي ډول 5 μL د لیب ټیوب څخه ډیل ټیوب ته انتقال کړئ.
د ډیل ټیوب ورټیس کړئ او په لنډ ډول یې وخورئ.
په Seq ټیوب کې 20 μL د Tween 20 سره RBS اضافه کړئ.

په لاسي ډول 20 μL د ډیل ټیوب څخه سیق ټیوب ته انتقال کړئ.
د سیق ټیوب ورټیس کړئ او په لنډ ډول یې وخورئ.
سمدلاسه 2.5 ته دوام ورکړئ فلو سیل او اولینک کتابتون په ریجنټ کارټریج کې بار کړئ. نوټ: د احتمالي بیا پیلیدو په صورت کې د لیب ټیوب په -20 °C کې ذخیره کړئ.

د جریان سیل او اولینک کتابتون په ریجنټ کارټریج کې بار کړئ
د دې مرحلې په جریان کې ، د جریان حجره او ضعیف شوي اولینک کتابتون په غوړ شوي ریجنټ کارټریج کې بار شوي.
بنچ چمتو کړئ

1x تودوخه NextSeq™ 1000/2000 P2 ریجنټ کارتریج (100 سایکلونه)، په تیر مرحله کې چمتو شوي

1x NextSeq™ 1000/2000 P2 فلو سیل، په تیر پړاو کې چمتو شوی
د سیکس ټیوب (د بار کولو لپاره چمتو شوي اولینک کتابتون سره) ، په تیر مرحله کې چمتو شوی

لاسي پایپټ (100 μL)
د پایپ ټپ (1 ملی لیتر)

کارتوس چمتو کړئ

کارتوس د سپینو زرو ورق کڅوړې څخه لرې کړئ.
کارتریج لس ځله وګرځوئ ترڅو پړسیدلي ریجنټونه په ښه توګه سره ګډ کړئ.

یادونه: دا عادي خبره ده چې د داخلي اجزاوو غږ واورئ.

د جریان حجره په کارتوس کې بار کړئ

کله چې په کارتریج کې د جریان سیل بار کولو ته چمتو وي ، د جریان سیل له کڅوړې څخه لرې کړئ. د فلو حجره د خړ ټب په واسطه ونیسئ، په ټب کې لیبل سره مخ دی. د نوي پوډر وړیا دستکشې وکاروئ ترڅو د جریان حجرې د شیشې سطحې ککړتیا مخه ونیسي.
د فلو حجره د کارتریج په مخ کې د فلو سیل سلاټ کې دننه کړئ. د اوریدلو وړ کلیک ښیي چې د جریان حجره په سمه توګه ځای پرځای شوي.
خړ ټب د هغې په ایستلو سره لرې کړئ.

د Olink® کتابتون کارتریج ته پورته کړئ

د کتابتون ذخیرې د پاک 1 ملی لیتر پایپټ سره سوراخ کړئ.
د اولینک کتابتون 20 μL د سیق ټیوب څخه د کتابتون زیرمې لاندې ته پورته کړئ.

د Olink® تسلسل چلول ترسره کړئ
د دې مرحلې په جریان کې ، د بار شوي جریان سیل او اولینک کتابتون سره بفر کارټریج په NextSeq ™ 2000 کې بار شوی ، او د ترتیب کولو لړۍ د اولینک ترکیب په کارولو سره پیل کیږي.
بنچ چمتو کړئ

1x NextSeq™ 1000/2000 P2 Reagent Cartridge (100 cycles) د NextSeq™ 1000/2000 P2 فلو سیل او کم شوي اولینک کتابتون سره بار شوی، په تیرو مرحلو کې چمتو شوی.

د چلولو حالت تنظیم کړئ

د کنټرول سافټویر مینو څخه، ترتیبات غوره کړئ.
د BaseSpace Sequence Hub Services & Proactive Support لاندې، د Local Run Setup غوره کړئ.
یوازې د اضافي ترتیباتو په توګه فعال ملاتړ غوره کړئ. دا فنکشن د انټرنیټ پیوستون ته اړتیا لري.
ستاسو د معلوماتو لپاره د کوربه توب ځای وټاکئ. د کوربه توب ځای باید ستاسو په سیمه کې یا نږدې وي.
د اوسني چلولو خام ډیټا لپاره د محصول فولډر موقعیت تنظیم کړئ. د نیویګ کولو لپاره غوره کړئ او د محصول فولډر غوره کړئ.
د ډینیچر او ډیلیوټ آن بورډ چیک باکس غوره کړئ ترڅو په اوتومات ډول د وسیلې په آنبورډ کې کتابتون رد او ضعیف کړئ.
د پاکولو ریجنټ کارتیج چیک باکس غوره کړئ ترڅو په اتوماتيک ډول د کارتریج مصرف شوي ریجنټونو برخې ته غیر کارول شوي ریجنټونه پاک کړئ.
د سافټویر تازه معلوماتو چیک باکس غوره کړئ ترڅو په اتوماتيک ډول د سافټویر تازه معلومات چیک کړئ (اختیاري). دا فنکشن د انټرنیټ پیوستون ته اړتیا لري.
خوندي کول غوره کړئ.

د چلولو پیرامیټونه تنظیم کړئ

یادونه: دا لارښوونه د NextSeq™ 1.4/1000 کنټرول سافټویر 2000 نسخه کې پلي کیږي. لاندې تشریح شوي ځینې مرحلې ممکن توپیر ولري کله چې نسخه v1.2 کاروي

د کنټرول سافټویر مینو څخه، پیل غوره کړئ.
په لاسي ډول د نوي چلول تنظیم کول غوره کړئ او سیټ اپ فشار ورکړئ.
د چلولو ترتیب پاڼې کې، د چلولو پیرامیټونه په لاندې ډول تنظیم کړئ:

د چلولو نوم ساحه کې، یو ځانګړی تجربه ID داخل کړئ.
د لوستلو ډول ډراپ ډاون لیست کې ، د واحد لوستلو اختیار غوره کړئ.

د سایکلونو شمیر په لاندې ډول دننه کړئ:

- 1 ولولئ: 24
- شاخص 1: 0
- شاخص 2: 0
- 2 ولولئ: 0

یادونه: دا مهمه ده چې لوستل 1 24 ته ټاکل شوی وي، که نه نو ټوله منډې به ناکام شي.
یادونه: د خبرتیا پیغامونه له پامه غورځول کله چې د چکرونو شمیر ته ننوځي.

د ګمرک پریمر ویلز ډراپ-ډاون لیست کې، نمبر غوره کړئ.
د ګمرک ترکیب (اختیاري) ډګر کې، غوره کړئ غوره کړئ د نیویګیټ لپاره او د دودیز ترکیب XML غوره کړئ file Olink_NSQ2K_P2_V1. خلاص انتخاب کړئ.

ایس وارد مه کوئample شیټ
ډاډ ترلاسه کړئ چې د محصول فولډر موقعیت سم دی. که نه نو، د نیویګ کولو لپاره غوره کړئ او د مطلوب محصول فولډر ځای غوره کړئ.
د ډینیچر او ډیلیټ آن بورډ ساحه کې ، د ډراپ-ډاون لیست څخه فعال غوره کړئ.
تیاری غوره کړئ.

بار شوي کارتوس پورته کړئ

بار غوره کړئ. د وسیلې ویزر خلاصیږي او ټری ایستل کیږي.

بار شوي کارتریج په ټری کې ځای په ځای کړئ چې لیبل یې مخ ته وي او د وسیلې دننه د جریان سیل.
بند غوره کړئ.
یوځل چې کارتریج په سمه توګه بار شي ، د چلولو پیرامیټونه تایید کړئ او ترتیب غوره کړئ. وسیله د وسیلې او مایعاتو لپاره د چلولو دمخه چیکونه ترسره کوي.
یادونه: د فلوډیکس چک په جریان کې، تمه کیږي چې د ډیری پاپینګ غږونه واوري.
ډاډ ترلاسه کړئ چې منډې وروسته له هغه پیل کیږي چې د اتوماتیک پری رن چیک بشپړ شي (~ 15 دقیقې). د ترتیب کولو وخت نږدې 10h30 دقیقې دی.
یادونه: د هر ډول پری چلولو چک ناکامیو لپاره، د جوړونکي لارښوونو ته مراجعه وکړئ.
یادونه: پام وکړئ چې د تسلسل چلولو پرمهال د NextSeq™ 2000 سره ټکر مه کوئ یا بل ډول ګډوډ کړئ. وسیله د کمپنونو سره حساسه ده.

د کار ساحه پاکه کړئ.

د چلولو پرمختګ څارنه وکړئ
اولینک NGS د لوستلو په توګه کاروي ترڅو د پیژندل شوي ترتیب مقدار اندازه کړي ترڅو په s کې د ورکړل شوي پروټین غلظت اټکل کړي.amples (د نورو په پرتلهamples). د هر سپړنې ترتیب کولو چلولو څخه د ډیټا کیفیت په عمده ډول د QC پیرامیټونو لخوا ټاکل کیږي چې د Olink ټیکنالوژۍ لپاره ځانګړي دي. له همدې امله، د کیفیت کنټرول معیاري معیارونه چې په دودیز NGS کې کارول کیږي، لکه Q-score، لږ مهم دي.
د چلولو وروسته کارتریج وباسئ او پریږدئ

خبرداری: د ریجنټونو دا ټولګه احتمالي خطرناک کیمیاوي توکي لري. کافي محافظتي تجهیزات واغوندئ او د تطبیق شوي معیارونو سره سم کارول شوي ریجنټونه پریږدئ. د لا زیاتو معلوماتو لپاره، د Illumina NextSeq 1000 او 2000 سیسټم لارښود (سند #1000000109376) ته مراجعه وکړئ.

کله چې چلول بشپړ شي، غوره کړئ کارتریج Eject کړئ.
یادونه: کارول شوي کارتریج د فلو سیل په شمول د راتلونکي چلولو پورې په ځای کې پاتې کیدی شي ، مګر له 3 ورځو څخه ډیر نه.

کارتریج له ټری څخه لرې کړئ.
د تطبیق شوي معیارونو سره سم د ریجنټونو ضایع کول.
د دروازې تړل غوره کړئ. ټری بیا بار شوی.
د کور سکرین ته د راستنیدو لپاره کور غوره کړئ.
یادونه: څرنګه چې کارتریج د سیسټم چلولو لپاره ټول میکانیزمونه لري، په بیله بیا د کارول شوي ریجنټونو راټولولو لپاره زیرمه لري، د چلولو وروسته د وسیله مینځلو ته اړتیا نشته.

د بیاکتنې تاریخ

نسخه	نیټه	تفصیل
1.1	2022-11-01	1.2 Olink® Mydata د Olink® NPX سپړنې سره بدل شو. 2.2 ایډیټ شوی.
1.0	2021-12-01	نوی

www.olink.com
یوازې د څیړنې لپاره کارول. د تشخیص پروسیجرونو کې د کارولو لپاره ندي.
پدې محصول کې د Olink محصولاتو غیر تجارتي کارونې جواز شامل دی. سوداګریز کارونکي ممکن اضافي جوازونو ته اړتیا ولري. مهرباني وکړئ د جزیاتو لپاره د Olink Proteomics AB سره اړیکه ونیسئ. هیڅ تضمین شتون نلري، څرګند یا ضمیمه شوی، کوم چې د دې توضیح څخه بهر پراخیږي. Olink Proteomics AB د دې محصول له امله رامینځته شوي د ملکیت زیان ، شخصي زیان یا اقتصادي زیان لپاره مسؤل ندي.

لاندې سوداګریز نښه د Olink Proteomics AB ملکیت دی: Olink®.
دا محصول د ډیری پیټینټونو او پیټینټ غوښتنلیکونو لخوا پوښل شوی چې شتون لري https://www.olink.com/patents/.