Olink-lo0go

Olink NextSeq 550 រុករកតាមលំដាប់លំដោយ

Olink-NextSeq-550-Explore-Sequencing-ផលិតផល

កំណត់ចំណាំឯកសារ

សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់Olink® Explore doc nr 1153 គឺលែងប្រើហើយ ហើយត្រូវបានជំនួសដោយឯកសារដូចខាងក្រោម៖

  • Olink® រុករកview សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់, doc លេខ 1187
  • Olink® Explore 384 សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់, doc nr 1188
  • Olink® Explore 4 x 384 សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់, doc nr 1189
  • Olink® Explore 1536 & Expansion User Manual, doc nr 1190
  • Olink® Explore 3072 សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់, doc nr 1191
  • Olink® Explore Sequencing ដោយប្រើ NextSeq 550 User Manual, doc nr 1192
  • Olink® Explore Sequencing ដោយប្រើ NextSeq 2000 User Manual, doc nr 1193
  • Olink® Explore Sequencing ដោយប្រើ NovaSeq 6000 User Manual, doc nr 1194

សេចក្តីផ្តើម

ការប្រើប្រាស់ដែលមានបំណង

Olink® Explore គឺជាវេទិកា immunoassay multiplex សម្រាប់ការរកឃើញ biomarker ប្រូតេអ៊ីនរបស់មនុស្ស។ ផលិតផលនេះត្រូវបានបម្រុងទុកសម្រាប់ការប្រើប្រាស់ស្រាវជ្រាវតែប៉ុណ្ណោះ និងមិនមែនសម្រាប់ប្រើប្រាស់ក្នុងដំណើរការវិនិច្ឆ័យនោះទេ។ ការងារមន្ទីរពិសោធន៍ត្រូវដំណើរការដោយបុគ្គលិកមន្ទីរពិសោធន៍ដែលបានទទួលការបណ្តុះបណ្តាលតែប៉ុណ្ណោះ។ ដំណើរការទិន្នន័យត្រូវធ្វើដោយបុគ្គលិកដែលបានទទួលការបណ្តុះបណ្តាលតែប៉ុណ្ណោះ។ លទ្ធផល​ត្រូវ​បាន​ប្រើ​ដោយ​អ្នក​ស្រាវជ្រាវ​រួម​ជាមួយ​នឹង​ការ​រក​ឃើញ​គ្លីនិក​ឬ​មន្ទីរ​ពិសោធន៍​ផ្សេង​ទៀត។

អំពីសៀវភៅណែនាំនេះ។

សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់នេះផ្តល់នូវការណែនាំដែលត្រូវការដើម្បីរៀបចំ Olink® Explore Libraries នៅលើ Illumina® NextSeq™ 550។ ការណែនាំត្រូវតែអនុវត្តតាមយ៉ាងតឹងរ៉ឹង និងច្បាស់លាស់។ គម្លាតណាមួយនៅទូទាំងជំហានមន្ទីរពិសោធន៍អាចបណ្តាលឱ្យមានទិន្នន័យចុះខ្សោយ។ មុនពេលចាប់ផ្តើមដំណើរការការងាររបស់មន្ទីរពិសោធន៍ សូមពិគ្រោះជាមួយ Olink® Explore Overview សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់សម្រាប់ការណែនាំអំពីវេទិកា រួមទាំងព័ត៌មានអំពីសារធាតុប្រតិកម្ម ឧបករណ៍ និងឯកសារដែលត្រូវការview នៃដំណើរការការងារ ក៏ដូចជាការណែនាំពីមន្ទីរពិសោធន៍។ សម្រាប់ការណែនាំអំពីរបៀបដំណើរការOlink® Explore Reagent Kits សូមមើលសៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់Olink® Explore ដែលអាចអនុវត្តបាន។ សម្រាប់ដំណើរការទិន្នន័យ និងការវិភាគនៃលទ្ធផលលំដាប់ Olink® រុករក សូមមើលសៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់Olink® NPX Explore ។ ពាណិជ្ជសញ្ញា និងការរក្សាសិទ្ធិទាំងអស់ដែលមាននៅក្នុងសម្ភារៈនេះគឺជាកម្មសិទ្ធិរបស់ Olink® Proteomics AB លើកលែងតែមានការបញ្ជាក់ផ្សេងពីនេះ។

ជំនួយបច្ចេកទេស

សម្រាប់ជំនួយបច្ចេកទេស សូមទាក់ទង Olink Proteomics នៅ support@olink.com.

ការណែនាំមន្ទីរពិសោធន៍

ជំពូកនេះផ្តល់ការណែនាំអំពីរបៀបតម្រៀប Olink Libraries នៅលើ NextSeq™ 550 ដោយប្រើ NextSeq™ 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles)។ ពិធីការដែលប្រើសម្រាប់ការតម្រៀបគឺជាការសម្របតាមស្តង់ដារ Illumina® NGS workflow សម្រាប់ Illumina® NextSeq™ 550។ មុននឹងបន្តការបន្ត សូមប្រាកដថាគុណភាពនៃបណ្ណាល័យដែលបានបន្សុតត្រូវបានផ្ទៀងផ្ទាត់។ សូមមើលសៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់ Olink Explore សម្រាប់ការណែនាំអំពីការគ្រប់គ្រងគុណភាព។

រៀបចំផែនការដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយ

បណ្ណាល័យ Olink មួយ​អាច​ត្រូវ​បាន​តម្រៀប​តាម​ក្រឡា​លំហូរ​ទិន្នផល​ខ្ពស់ NextSeq™ 550 និង​ក្នុង​មួយ​ការ​រត់។ ចំនួននៃកោសិកាលំហូរទិន្នផលខ្ពស់ និងការរត់ដែលទាមទារដើម្បីតម្រៀបឧបករណ៍ Olink Explore Reagent ផ្សេងៗគ្នាត្រូវបានពិពណ៌នានៅក្នុងតារាងទី 1។ ប្រសិនបើការរត់ច្រើនជាងមួយត្រូវបានទាមទារ សូមធ្វើការណែនាំដែលបានពិពណ៌នានៅក្នុងសៀវភៅណែនាំនេះម្តងទៀត។

តារាងទី 1. ការធ្វើផែនការរត់តាមលំដាប់លំដោយ

Olink® Explore Reagent Kit ចំនួនបណ្ណាល័យ Olink ចំនួនក្រឡាលំហូរ និងដំណើរការ
Olink® Explore 384 Reagent Kit 1 1
Olink® Explore 4 x 384 Reagent Kit 4 4
Olink® Explore 1536 Reagent Kit 4 4
Olink® Explore Expansion Reagent Kit 4 4
Olink® Explore 3072 Reagent Kit 8 8

ដំឡើងរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួនOlink®

ក្នុងអំឡុងពេលជំហាននេះ រូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន Olink® ត្រូវបានដំឡើងនៅលើ NextSeq™ 550។ ជំហាននេះត្រូវធ្វើតែម្តងប៉ុណ្ណោះ មុនពេលដំណើរការលំដាប់ Olink ត្រូវបានអនុវត្តជាលើកដំបូង។

ចំណាំ៖ រូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន Olink នឹងដំណើរការតែជាមួយ NextSeq™ 500/550 High Output Kits និង NextSeq™ Control Software 4.0។

  1. ពន្លា ហើយដាក់រូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន Olink Olink_NSQ550_HighOutput_V1 នៅក្នុងថតខាងក្រោមនៃឧបករណ៍ NextSeq™ 550៖ C:\Program Files\Illumina\NextSeq Control Software\Recipe\Custom\High\.
  2. នៅក្រោមការប្ដូរតាមបំណងប្រព័ន្ធ > គ្រប់គ្រងឧបករណ៍ បើករូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន។ ប្រសិនបើមិនបានជ្រើសរើសទេ ជម្រើសរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួននឹងមិនលេចឡើងកំឡុងពេលដំឡើងដំណើរការទេ។

ចំណាំ

  • នៅក្នុងកំណែកម្មវិធី NCS 4.0 ជម្រើសដើម្បីជ្រើសរើសរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួននឹងកើតឡើងតែបន្ទាប់ពីប្រអប់ព្រីនធ័រត្រូវបានផ្ទុក មិនមែននៅក្នុងទំព័ររៀបចំមុននោះទេ។
  • ការរត់ត្រូវតែកំណត់ក្នុងរបៀបដោយដៃ ដើម្បីអនុញ្ញាតរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន។

រៀបចំភ្នាក់ងារបន្តបន្ទាប់បន្សំ

កំឡុងពេលជំហាននេះ ប្រអប់ព្រីនធ័រដែលមានសារធាតុចម្រាញ់ និងបន្តបន្ទាប់គ្នាត្រូវបានរលាយ ហើយក្រឡាលំហូរត្រូវបានរៀបចំ។

រៀបចំប្រអប់ព្រីនធ័រ

ព្រមាន៖ ប្រអប់ព្រីនធ័រមានផ្ទុកសារធាតុគីមីដែលអាចមានគ្រោះថ្នាក់។ ពាក់ឧបករណ៍ការពារឱ្យបានគ្រប់គ្រាន់ ហើយបោះចោលសារធាតុដែលប្រើរួច ស្របតាមស្តង់ដារដែលអាចអនុវត្តបាន។ សម្រាប់ព័ត៌មានបន្ថែម សូមមើលការណែនាំប្រព័ន្ធ Illumina NextSeq 550 (ឯកសារ #15069765)។

រៀបចំកៅអី

  • 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2 (75 វដ្ត)។

សេចក្តីណែនាំ

  1. ដាក់​ប្រអប់ព្រីន​ដែល​ដាក់​ទឹក​កក​ពាក់កណ្តាល​ដាក់​ក្នុង​ទឹក​ក្តៅ​ក្នុង​បន្ទប់ ហើយ​ទុក​ឱ្យ​វា​រលាយ​អស់​រយៈពេល 1 ម៉ោង។ ត្រូវប្រាកដថាអាងស្តុកទឹកទាំងអស់នៃប្រអប់ព្រីនត្រូវបានរលាយទាំងស្រុង។
    • ចំណាំ៖ ដើម្បីភាពងាយស្រួល ចូរបោះក្រដាសកាតុងធ្វើកេសមួយថ្ងៃមុន ហើយទុកវាពេញមួយយប់នៅសីតុណ្ហភាព 4°C។ នៅសីតុណ្ហភាពនេះ reagents មានស្ថេរភាពរហូតដល់មួយសប្តាហ៍។
  2. សម្ងួតមូលដ្ឋានព្រីនធឺរដោយកន្សែងក្រដាស ហើយបិតសំបកក្រដាសឱ្យស្ងួតដោយប្រើក្រដាស់ជូតមាត់ បើចាំបាច់។
  3. បង្វែរប្រអប់ព្រីនដប់ដង ដើម្បីលាយសារធាតុរលាយចូលគ្នាយ៉ាងហ្មត់ចត់។
  4. ប៉ះប្រអប់ព្រីនថ្នមៗនៅលើកៅអី ដើម្បីយកពពុះខ្យល់ចេញ។ ទុកប្រអប់ព្រីននៅសីតុណ្ហភាពបន្ទប់ ប្រសិនបើវានឹងត្រូវប្រើក្នុងរយៈពេល 4 ម៉ោង។
រៀបចំក្រឡាលំហូរ

រៀបចំកៅអី

  • 1x NextSeq™ 500/550 កោសិកាលំហូរទិន្នផលខ្ពស់ v2.5.

សេចក្តីណែនាំ

  1. នាំយកកោសិកាលំហូរនៃទូទឹកកកទៅសីតុណ្ហភាពក្នុងបន្ទប់រយៈពេល 30 នាទី។
  2. ដាក់ស្រោមដៃថ្មីដែលគ្មានម្សៅ (ដើម្បីជៀសវាងការបំពុលផ្ទៃកញ្ចក់នៃកោសិកាលំហូរ)។
  3. នៅពេលរួចរាល់ដើម្បីផ្ទុកក្រឡាលំហូរទៅក្នុងឧបករណ៍ យកក្រឡាលំហូរចេញពីកញ្ចប់ និងថង់ប្លាស្ទិក។
  4. ពិនិត្យក្រឡាលំហូរ។ ប្រសិនបើភាគល្អិត ឬធូលីអាចមើលឃើញលើផ្ទៃកញ្ចក់ណាមួយ សូមសម្អាតផ្ទៃដែលអាចប្រើប្រាស់បានដោយប្រើជាតិអាល់កុល isopropyl ដែលគ្មានជាតិសរសៃ ហើយជូតវាឱ្យស្ងួតដោយប្រើក្រដាសមន្ទីរពិសោធន៍ដែលមានស្រទាប់ទាប។

រៀបចំបណ្ណាល័យOlink®សម្រាប់ការតម្រៀប

ក្នុងអំឡុងពេលជំហាននេះ ការរំលាយ NaOH និង Tris-HCl ត្រូវបានរៀបចំ ហើយបណ្ណាល័យ Olink ដែលគ្រប់គ្រងដោយបន្សុត និងគុណភាពត្រូវបានពនឺ និងធ្វើឱ្យមានលក្ខណៈជាជំហានបន្តបន្ទាប់។

រៀបចំការរំលាយ NaOH

  • ការរំលាយ NaOH ត្រូវបានប្រើដើម្បីសម្គាល់បណ្ណាល័យ។

រៀបចំកៅអី

  • ភាគហ៊ុន 1N NaOH
  • ទឹក MilliQ
  • 1x បំពង់ Microcentrifuge (1.5 mL)
  • បំពង់បង្ហូរទឹកដោយដៃ (10-100 μL)
  • គន្លឹះត្រង pipette

មុនពេលអ្នកចាប់ផ្តើម

  • សម្គាល់បំពង់ microcentrifuge "0.2 N NaOH" ។

សេចក្តីណែនាំ

  1. រៀបចំការរំលាយ 0.2 N NaOH នៅក្នុងបំពង់ 0.2 N NaOH យោងតាមតារាងទី 2 ។
  2. Vortex បំពង់ 0.2 N NaOH យ៉ាងហ្មត់ចត់ ហើយបង្វិលចុះក្រោម។ ប្រើក្នុងរយៈពេល 12 ម៉ោង។

តារាង 2. 0.2 N NaOH dilution

សារធាតុប្រតិកម្ម បរិមាណ (μL)
ទឹក MilliQ 80
ភាគហ៊ុន 1N NaOH 20

រៀបចំការរំលាយ Tris-HCl

  • ការរំលាយ Tris-HCl ត្រូវបានប្រើដើម្បីបន្សាបបណ្ណាល័យ denaturated ។

រៀបចំកៅអី

  • 1 M Tris-HCl pH 7.0 stock (ដំណោះស្រាយ Trizma® hydrochloride)
  • ទឹក MilliQ
  • 1x បំពង់ Microcentrifuge (1.5 mL)
  • បំពង់បង្ហូរទឹកដោយដៃ (10-100 μL)
  • គន្លឹះត្រង pipette

មុនពេលអ្នកចាប់ផ្តើម

  • សម្គាល់បំពង់ microcentrifuge "Tris-HCl"

សេចក្តីណែនាំ

  1. រៀបចំការរំលាយ Tris-HCl 200 mM នៅក្នុងបំពង់ Tris-HCl យោងតាមតារាងទី 3 ។
  2. Vortex បំពង់ Tris-HCl យ៉ាងហ្មត់ចត់ហើយបង្វិលវាចុះក្រោម។

តារាង 3. 200 mM Tris-HCl dilution

សារធាតុប្រតិកម្ម បរិមាណ (μL)
ទឹក MilliQ 80
1M Tris-HCl pH 7.0 stock (ដំណោះស្រាយ Trizma® hydrochloride) 20
រំលាយបណ្ណាល័យOlink®
  • ក្នុងអំឡុងពេលជំហាននេះ បណ្ណាល័យ Olink ដែលគ្រប់គ្រងដោយភាពបរិសុទ្ធ និងគុណភាពត្រូវបានពនឺក្នុង 1:33 ។

រៀបចំកៅអី

  • Lib Tube រៀបចំដោយយោងតាមសៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់ Olink Explore ដែលអាចអនុវត្តបាន។
  • ទឹក MilliQ
  • 1x បំពង់ Microcentrifuge (1.5 mL)
  • បំពង់បង្ហូរទឹកដោយដៃ (0.5-10 និង 100-1000 μL)
  • គន្លឹះត្រង pipette

មុនពេលអ្នកចាប់ផ្តើម

  • បោះបំពង់ Lib ប្រសិនបើកក។
  • សម្គាល់បំពង់ microcentrifuge ថ្មី: "Dil" ។

សេចក្តីណែនាំ

  1. បន្ថែមទឹក 96 μLនៃ MilliQ ទៅក្នុងបំពង់ Dil ។
  2. Vortex the Lib Tube ហើយបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។
  3. ផ្ទេរ 3 μL ពី Lib Tube ទៅ Dil Tube ។
  4. Vortex the Dil Tube ហើយបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។

ចំណាំ៖ ទុក Lib Tube(s) នៅ -20 °C ក្នុងករណីមានសក្តានុពលឡើងវិញ។

Denature និងពនឺបណ្ណាល័យOlink®ទៅកំហាប់ការផ្ទុកចុងក្រោយ

ក្នុងអំឡុងពេលជំហាននេះ បណ្ណាល័យ Olink ដែលត្រូវបានពនឺត្រូវបានប្រែពណ៌ ហើយត្រូវបានពនឺបន្ថែមទៀតដល់កំហាប់ការផ្ទុកចុងក្រោយ។

រៀបចំកៅអី

  • បំពង់ Dil រៀបចំនៅជំហានមុន។
  • 0.2 N NaOH dilution រៀបចំថ្មីៗក្នុងជំហានមុន។
  • 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) dilution រៀបចំក្នុងជំហានមុន។
  • Hybridization buffer 1 (HT1) រួមបញ្ចូលក្នុងប្រអប់ NextSeq™ Accessory Box v2
  • 2x បំពង់ Microcentrifuge (1.5 mL និង 2 mL)
  • បំពង់បង្ហូរទឹកដោយដៃ (0.5-10 និង 100-1000 μL)
  • គន្លឹះត្រង pipette

មុនពេលអ្នកចាប់ផ្តើម

  • បោះចោលសតិបណ្ដោះអាសន្ន HT1 ដែលកកនៅសីតុណ្ហភាពបន្ទប់។ ទុកនៅ +4 អង្សាសេរហូតដល់ប្រើ។
  • សម្គាល់បំពង់ microcentrifuge 1.5 mL ថ្មី: "Den" (សម្រាប់បណ្ណាល័យ denaturated) ។
  • សម្គាល់បំពង់ microcentrifuge 2 mL ថ្មី៖ “Seq” (សម្រាប់ត្រៀមផ្ទុកបណ្ណាល័យ)។

សេចក្តីណែនាំ

  1. ផ្ទេរ 5 μL ពី Dil Tube ទៅ Den Tube ។
  2. បន្ថែម 5 μL នៃ 0.2 N NaOH ទៅ Den Tube ។
  3. Vortex the Den Tube ហើយបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។
  4. ដាំបំពង់ Den Tube រយៈពេល 5 នាទីនៅសីតុណ្ហភាពបន្ទប់ដើម្បីដាក់បណ្ណាល័យ។
  5. បន្ថែម 5 μL នៃ 200 mM Tris-HCl (pH 7.0) ទៅ Den Tube ដើម្បីបន្សាបប្រតិកម្ម។
  6. Vortex the Den Tube ហើយបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។
  7. បន្ថែម 985 μL នៃ HT1 ដែល prechilled ទៅ Den Tube ។
  8. Vortex the Den Tube ហើយបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។ បំពង់អាចត្រូវបានរក្សាទុកនៅ +4 ° C រហូតដល់ការប្រើប្រាស់ (ថ្ងៃតែមួយ) ។
  9. ផ្ទេរ 205 μL ពី Den Tube ទៅ Seq Tube ។
  10. បន្ថែម 1095 μL នៃ HT1 prechilled ទៅ Seq Tube ។
  11. បង្វែរបំពង់ Seq ដើម្បីលាយសារធាតុ និងបង្វិលវាចុះដោយខ្លី។ បរិមាណផ្ទុកចុងក្រោយគឺ 1.3 មីលីលីត្រ។
  12. បន្តភ្លាមៗទៅ 2.5 អនុវត្តការរត់តាមលំដាប់Olink®។

អនុវត្តការរត់តាមលំដាប់Olink®

ក្នុងអំឡុងពេលជំហាននេះ ប្រអប់ព្រីនធ័រ ក្រឡាលំហូរ និងប្រអប់ព្រីនធ័រដែលបានរៀបចំដែលមានបណ្ណាល័យ Olink ត្រូវបានផ្ទុកទៅក្នុង NextSeq 550 ហើយដំណើរការបន្តបន្ទាប់គ្នាត្រូវបានចាប់ផ្តើមដោយប្រើរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួន Olink ។

រៀបចំកៅអី

  • បំពង់ Seq (ជាមួយនឹងការត្រៀមរួចរាល់ដើម្បីផ្ទុកបណ្ណាល័យ) បានរៀបចំនៅក្នុងជំហានមុន។
  • 1x NextSeq™ 500/550 High Output Reagent Cartridge v2 បានរៀបចំក្នុងជំហានមុន
  • 1x NextSeq™ 500/550 High Output Flow Cell v2.5 បានរៀបចំក្នុងជំហានមុន
  • 1x NextSeq™ 500/550 Buffer Cartridge v2 (75 វដ្ត) នៅសីតុណ្ហភាពបន្ទប់

កំណត់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយ

ក្នុងដំណាក់កាលនេះ ប៉ារ៉ាម៉ែត្រដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយត្រូវបានជ្រើសរើសនៅលើ NextSeq™ 550។

  1. នៅលើអេក្រង់ដើម NextSeq™ 550 សូមជ្រើសរើសការពិសោធន៍។
  2. នៅលើអេក្រង់ Select Assay សូមជ្រើសរើស Sequence។
  3. នៅក្នុងទំព័រដំឡើងដំណើរការ ជ្រើសរើសរបៀបរត់ដោយដៃ ហើយបន្ទាប់មកបន្ទាប់។
  4. កំណត់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រដំណើរការដូចខាងក្រោមៈ
    • នៅក្នុងវាល Run Name បញ្ចូលលេខសម្គាល់ការពិសោធន៍តែមួយគត់។
    • នៅក្នុងវាល លេខសម្គាល់បណ្ណាល័យ សូមបញ្ចូលលេខសម្គាល់បណ្ណាល័យដែលអ្នកកំពុងដំណើរការ (ជាជម្រើស)។
    • នៅក្នុងវាល ប្រភេទអាន ជ្រើសរើសជម្រើស អានតែមួយ។
    • បញ្ចូលចំនួនវដ្តដូចខាងក្រោមៈ
      • អាន ១៖ 24
      • សន្ទស្សន៍ 1៖ 0
      • សន្ទស្សន៍ 2៖ 0
      • អាន ១៖ 0
      • សំខាន់៖ វាសំខាន់ណាស់ដែល Read 1 ត្រូវបានកំណត់ទៅ 24 បើមិនដូច្នេះទេការរត់ទាំងមូលនឹងបរាជ័យ។
    • រក្សាប្រអប់ធីកសម្រាប់ primers ផ្ទាល់ខ្លួនដែលមិនបានជ្រើសរើស។
    • កំណត់ទីតាំងថតលទ្ធផលសម្រាប់ទិន្នន័យឆៅដែលកំពុងដំណើរការបច្ចុប្បន្ន។ ជ្រើសរើស រកមើល ដើម្បីផ្លាស់ប្តូរទីតាំងថតលទ្ធផល។
  5. កុំដំឡើង Sampសន្លឹក។
  6. ជ្រើសរើស Purge consumables សម្រាប់ដំណើរការនេះ។
  7. ជ្រើសរើសបន្ទាប់។

ផ្ទុកក្រឡាលំហូរទៅក្នុង NextSeq™ 550

  1. យកក្រឡាលំហូរដែលបានប្រើចេញពីដំណើរការមុន។
  2. ដាក់ក្រឡាលំហូរដែលបានរៀបចំថ្មីនៅលើ stage.
  3. ជ្រើសរើស ផ្ទុក។ ទ្វារបិទដោយស្វ័យប្រវត្តិ។
  4. នៅពេលដែលលេខសម្គាល់ក្រឡាលំហូរលេចឡើងនៅលើអេក្រង់ ហើយឧបករណ៍ចាប់សញ្ញាត្រូវបានធីកជាពណ៌បៃតង សូមជ្រើសរើសបន្ទាប់។
សម្អាតធុងផ្ទុកសារធាតុប្រតិកម្ម

ព្រមាន៖ សំណុំនៃសារធាតុប្រតិកម្មនេះមានផ្ទុកសារធាតុគីមីដែលអាចមានគ្រោះថ្នាក់។ ពាក់ឧបករណ៍ការពារឱ្យបានគ្រប់គ្រាន់ ហើយបោះចោលសារធាតុដែលប្រើរួច ស្របតាមស្តង់ដារដែលអាចអនុវត្តបាន។ សម្រាប់ព័ត៌មានបន្ថែម សូមមើលការណែនាំប្រព័ន្ធ Illumina NextSeq 550 ។

  1. បើកទ្វារនៃបន្ទប់ផ្ទុក យកធុងផ្ទុកសារធាតុប្រតិកម្មដែលបានចំណាយចេញពីបន្ទប់ខាងក្រោម ហើយបោះចោលមាតិកាស្របតាមស្តង់ដារដែលអាចអនុវត្តបាន។
  2. រុញកុងតឺន័រ reagent ទទេ ត្រលប់ទៅក្នុង buffer compartment ខាងក្រោម។ ការចុចដែលអាចស្តាប់បានបង្ហាញថាធុងត្រូវបានដាក់ត្រឹមត្រូវ។

ផ្ទុកប្រអប់ព្រីនធ័រ

  1. យកប្រអប់ព្រីនធ័រដែលប្រើរួចចេញពីធុងផ្ទុកខាងលើ ហើយបោះចោលមាតិកាស្របតាមស្តង់ដារដែលអាចអនុវត្តបាន។
  2. រំកិលប្រអប់ព្រីនធ័រថ្មីទៅក្នុងប្រអប់ទ្រនាប់ខាងលើ។ ការចុចដែលអាចស្តាប់បានបង្ហាញថាប្រអប់ព្រីនត្រូវបានដាក់ត្រឹមត្រូវ។ ត្រូវប្រាកដថាលេខសម្គាល់ប្រអប់ព្រីនធ័រលេចឡើងនៅលើអេក្រង់ ហើយឧបករណ៍ចាប់សញ្ញាត្រូវបានពិនិត្យជាពណ៌បៃតង។
  3. បិទទ្វារនៃប្រអប់ទ្រនាប់ ហើយជ្រើសរើសបន្ទាប់។

ផ្ទុកប្រអប់ព្រីនធ័រ

  1. បើកទ្វារបន្ទប់ដាក់សារធាតុប្រតិកម្ម យកប្រអប់ព្រីនធ័រដែលប្រើរួចចេញ ហើយបោះចោលខ្លឹមសារដែលមិនប្រើ ស្របតាមស្តង់ដារដែលអាចអនុវត្តបាន។ អាងស្តុកទឹកនៅទីតាំងទី 6 គឺអាចដកចេញបានដើម្បីជួយសម្រួលដល់ការចោលប្រកបដោយសុវត្ថិភាព។
  2. ទម្លុះត្រានៃអាងស្តុកទឹកលេខ 10 ដែលមានស្លាកថា "ផ្ទុកបណ្ណាល័យនៅទីនេះ" ដោយប្រើចុងបំពង់ 1 មីលីលីត្រស្អាត។
  3. ផ្ទុក 1.3 mL បណ្ណាល័យ Olink ពី Seq Tube ទៅក្នុងអាងស្តុកទឹក #10 ដែលមានស្លាកថា "ផ្ទុកបណ្ណាល័យនៅទីនេះ" ។
  4. រុញប្រអប់ព្រីនធ័រថ្មីទៅក្នុងប្រអប់ដាក់សារធាតុប្រតិកម្ម ហើយបិទទ្វារបន្ទប់ផ្ទុកសារធាតុប្រតិកម្ម។
  5. ជ្រើសរើស ផ្ទុក ហើយរង់ចាំ ~ 30 វិនាទី រហូតដល់លេខសម្គាល់ប្រអប់ព្រីនធ័របង្ហាញនៅលើអេក្រង់ ហើយឧបករណ៍ចាប់សញ្ញាត្រូវបានពិនិត្យជាពណ៌បៃតង។
  6. ពីបញ្ជីទម្លាក់ចុះរូបមន្ត សូមជ្រើសរើសជម្រើសរូបមន្ត "Olink_NSQ550_HighOutput_V1" [ផ្ទាល់ខ្លួន] ។
    • សំខាន់៖ ត្រូវប្រាកដថារូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួនត្រូវបានដំឡើងពីមុននៅក្នុងឧបករណ៍។ យោងទៅ 2.2 ដំឡើងរូបមន្តផ្ទាល់ខ្លួនOlink®។
  7. ជ្រើសរើសបន្ទាប់។
ចាប់ផ្តើមដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយ
  1. បញ្ជាក់ប៉ារ៉ាម៉ែត្រដំណើរការដែលបង្ហាញនៅលើ Review អេក្រង់។ ដើម្បីកែសម្រួលប៉ារ៉ាម៉ែត្រណាមួយ សូមចុចថយក្រោយ ដើម្បីត្រឡប់ទៅអេក្រង់ដំឡើងដំណើរការ។
  2. ជ្រើសរើសបន្ទាប់។ ការរត់ចាប់ផ្តើមបន្ទាប់ពីការត្រួតពិនិត្យការរត់មុនដោយស្វ័យប្រវត្តិ។ ពេលវេលាដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយគឺប្រហែល 7h30 នាទី។
  3. សំខាន់៖ ត្រូវប្រាកដថាការរត់ចាប់ផ្តើមនៅពេលដែលការត្រួតពិនិត្យការរត់មុនដោយស្វ័យប្រវត្តិត្រូវបានបញ្ចប់ (~5 នាទី)។
    1. ចំណាំចំពោះការបរាជ័យក្នុងការត្រួតពិនិត្យជាមុន សូមមើលការណែនាំរបស់អ្នកផលិត។
    2. ចំណាំ៖ ប្រយ័ត្នកុំបុក ឬរំខាន NextSeq™ 550 កំឡុងពេលដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយ។ ឧបករណ៍ងាយនឹងរំញ័រ។
  4. សម្អាតកន្លែងធ្វើការ។
    1. ចំណាំ៖ នៅពេលដែលដំណើរការតាមលំដាប់លំដោយត្រូវបានបញ្ចប់ កម្មវិធីចាប់ផ្តើមការលាងក្រោយការរត់ដោយស្វ័យប្រវត្តិដោយប្រើដំណោះស្រាយលាងសម្អាតដែលបានផ្តល់នៅក្នុងប្រអប់ព្រីនធ័រ និង NaOCl ដែលបានផ្តល់ជូននៅក្នុងប្រអប់ព្រីនធ័រ។ ការលាងសម្អាតនេះចំណាយពេលប្រហែល 90 នាទី។ ប៊ូតុងដើមនឹងសកម្មនៅពេលដែលការលាងសម្អាតត្រូវបានបញ្ចប់។ ប្រអប់ព្រីនធឺដែលបានប្រើ និងក្រឡាលំហូរអាចត្រូវបានទុកនៅនឹងកន្លែងរហូតដល់ដំណើរការបន្ទាប់។

តាមដានដំណើរការដំណើរការ

Olink ប្រើ NGS ជាការអានដើម្បីកំណត់បរិមាណនៃលំដាប់ដែលគេស្គាល់ដើម្បីប៉ាន់ប្រមាណកំហាប់នៃប្រូតេអ៊ីនដែលបានផ្តល់ឱ្យក្នុង samples (ទាក់ទងទៅនឹង samples) គុណភាពទិន្នន័យពីការដំណើរការលំដាប់លំដោយរុករកនីមួយៗត្រូវបានកំណត់ជាចម្បងដោយប៉ារ៉ាម៉ែត្រ QC តែមួយគត់ចំពោះបច្ចេកវិទ្យា Olink ។ ដូច្នេះហើយ វិធានការត្រួតពិនិត្យគុណភាពស្តង់ដារដែលប្រើក្នុង NGS ធម្មតា ដូចជា Q-score គឺមិនសូវសំខាន់ទេ។

ប្រវត្តិនៃការពិនិត្យឡើងវិញ

កំណែ កាលបរិច្ឆេទ ការពិពណ៌នា
1.2 ៨៦៦-៤៤៧-២១៩៤ 1.2 បានជំនួសOlink® Mydata ជាមួយOlink® NPX Explore។

2.4 បានបន្ថែម 0.2 N ទៅ មុនពេលអ្នកចាប់ផ្តើម។

1.1 ៨៦៦-៤៤៧-២១៩៤ ការផ្លាស់ប្តូរវិចារណកថា
1.0 ៨៦៦-៤៤៧-២១៩៤ ថ្មី។

www.olink.com

សម្រាប់ការប្រើប្រាស់ស្រាវជ្រាវតែប៉ុណ្ណោះ។ មិនមែនសម្រាប់ប្រើក្នុងនីតិវិធីវិនិច្ឆ័យទេ។

ផលិតផលនេះរួមបញ្ចូលអាជ្ញាប័ណ្ណសម្រាប់ការប្រើប្រាស់មិនមែនពាណិជ្ជកម្មនៃផលិតផល Olink ។ អ្នកប្រើប្រាស់ពាណិជ្ជកម្មអាចទាមទារអាជ្ញាប័ណ្ណបន្ថែម។ សូមទាក់ទង Olink Proteomics AB សម្រាប់ព័ត៌មានលម្អិត។ មិនមានការធានា បង្ហាញ ឬបង្កប់ន័យ ដែលលើសពីការពិពណ៌នានេះទេ។ Olink Proteomics AB មិនទទួលខុសត្រូវចំពោះការខូចខាតទ្រព្យសម្បត្តិ របួសផ្ទាល់ខ្លួន ឬការបាត់បង់សេដ្ឋកិច្ចដែលបណ្តាលមកពីផលិតផលនេះទេ។ ពាណិជ្ជសញ្ញាខាងក្រោមត្រូវបានគ្រប់គ្រងដោយ Olink Proteomics AB: Olink®។ ផលិតផលនេះត្រូវបានគ្របដណ្តប់ដោយប៉ាតង់ និងកម្មវិធីប៉ាតង់ជាច្រើនដែលមាននៅ https://www.olink.com/patents/.

© រក្សាសិទ្ធិ 2021 Olink Proteomics AB ។ ពាណិជ្ជសញ្ញាភាគីទីបីទាំងអស់គឺជាកម្មសិទ្ធិរបស់ម្ចាស់រៀងៗខ្លួន។
Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B, SE-752 37 Uppsala, ស៊ុយអែត
1192, v1.2, 2022-11-01

ឯកសារ/ធនធាន

Olink NextSeq 550 រុករកតាមលំដាប់លំដោយ [pdf] សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់
NextSeq 550 Explore Sequencing, NextSeq 550, Explore Sequencing, Sequencing

ឯកសារយោង

ទុកមតិយោបល់

អាសយដ្ឋានអ៊ីមែលរបស់អ្នកនឹងមិនត្រូវបានផ្សព្វផ្សាយទេ។ វាលដែលត្រូវការត្រូវបានសម្គាល់ *