Olink NextSeq 550 สำรวจลำดับ

บันทึกเอกสาร

คู่มือผู้ใช้ Olink® Explore เอกสาร nr 1153 ล้าสมัยและถูกแทนที่ด้วยเอกสารต่อไปนี้:

• Olink® สำรวจมากกว่าview คู่มือผู้ใช้ doc nr 1187
• คู่มือผู้ใช้ Olink® Explore 384, doc nr 1188
• คู่มือผู้ใช้ Olink® Explore 4 x 384, doc nr 1189
• คู่มือผู้ใช้ Olink® Explore 1536 & Expansion, doc nr 1190
• คู่มือผู้ใช้ Olink® Explore 3072, doc nr 1191
• Olink®สำรวจลำดับโดยใช้คู่มือผู้ใช้ NextSeq 550, doc nr 1192
• Olink®สำรวจลำดับโดยใช้คู่มือผู้ใช้ NextSeq 2000, doc nr 1193
• Olink®สำรวจลำดับโดยใช้คู่มือผู้ใช้ NovaSeq 6000, เอกสารหมายเลข 1194

การแนะนำ

จุดประสงค์การใช้

Olink® Explore เป็นแพลตฟอร์มอิมมูโนแอสเซย์แบบมัลติเพล็กซ์สำหรับการค้นพบไบโอมาร์คเกอร์โปรตีนของมนุษย์ ผลิตภัณฑ์นี้มีวัตถุประสงค์เพื่อใช้ในการวิจัยเท่านั้น ไม่ใช่สำหรับใช้ในขั้นตอนการวินิจฉัย งานในห้องปฏิบัติการจะต้องดำเนินการโดยเจ้าหน้าที่ห้องปฏิบัติการที่ได้รับการฝึกอบรมเท่านั้น การประมวลผลข้อมูลจะดำเนินการโดยเจ้าหน้าที่ที่ได้รับการฝึกอบรมเท่านั้น นักวิจัยจะใช้ผลลัพธ์นี้ร่วมกับผลการวิจัยทางคลินิกหรือห้องปฏิบัติการอื่นๆ

เกี่ยวกับคู่มือนี้

คู่มือผู้ใช้นี้มีคำแนะนำที่จำเป็นในการจัดลำดับ Olink® Explore Libraries บน Illumina® NextSeq™ 550 ต้องปฏิบัติตามคำแนะนำอย่างเคร่งครัดและชัดเจน การเบี่ยงเบนใด ๆ ตลอดขั้นตอนในห้องปฏิบัติการอาจส่งผลให้ข้อมูลบกพร่อง ก่อนเริ่มเวิร์กโฟลว์ในห้องปฏิบัติการ โปรดปรึกษา Olink® Explore Overview คู่มือผู้ใช้สำหรับคำแนะนำเบื้องต้นเกี่ยวกับแพลตฟอร์ม รวมถึงข้อมูลเกี่ยวกับน้ำยา อุปกรณ์ และเอกสารประกอบที่จำเป็น และอื่นๆview ของขั้นตอนการทำงานตลอดจนแนวทางห้องปฏิบัติการ สำหรับคำแนะนำเกี่ยวกับวิธีเรียกใช้ Olink® Explore Reagent Kits โปรดดูคู่มือผู้ใช้ Olink® Explore ที่เกี่ยวข้อง สำหรับการประมวลผลข้อมูลและการวิเคราะห์ผลลัพธ์ของลำดับ Olink® Explore โปรดดูที่คู่มือผู้ใช้ Olink® NPX Explore เครื่องหมายการค้าและลิขสิทธิ์ทั้งหมดที่มีอยู่ในเนื้อหานี้เป็นทรัพย์สินของ Olink® Proteomics AB เว้นแต่จะระบุไว้เป็นอย่างอื่น

การสนับสนุนด้านเทคนิค

สำหรับการสนับสนุนด้านเทคนิค โปรดติดต่อ Olink Proteomics ที่ support@olink.com.

คำแนะนำในห้องปฏิบัติการ

บทนี้ให้คำแนะนำเกี่ยวกับวิธีจัดลำดับ Olink Libraries บน NextSeq™ 550 โดยใช้ NextSeq™ 500/550 High Output Kit v2.5 (75 Cycles) โปรโตคอลที่ใช้สำหรับการจัดลำดับคือการปรับขั้นตอนการทำงาน NGS มาตรฐานของ Illumina® สำหรับ Illumina® NextSeq™ 550 ก่อนดำเนินการจัดลำดับ ตรวจสอบให้แน่ใจว่าคุณภาพของไลบรารีที่บริสุทธิ์ได้รับการตรวจสอบแล้ว โปรดดูคู่มือผู้ใช้ Olink Explore ที่เกี่ยวข้องสำหรับคำแนะนำเกี่ยวกับการควบคุมคุณภาพ

วางแผนการรันลำดับ

สามารถจัดลำดับ Olink Library หนึ่งรายการต่อ NextSeq™ 550 High Output flow cell และต่อการรัน จำนวนเซลล์การไหลเอาต์พุตสูงและการรันที่จำเป็นสำหรับการจัดลำดับชุดรีเอเจนต์ Olink Explore ต่างๆ มีอธิบายไว้ในตารางที่ 1 หากจำเป็นต้องดำเนินการมากกว่าหนึ่งครั้ง ให้ทำซ้ำคำแนะนำที่อธิบายไว้ในคู่มือนี้

ตารางที่ 1. การวางแผนการรันลำดับ

ชุดรีเอเจนต์สำรวจ Olink®	จำนวนห้องสมุด Olink	จำนวนโฟลว์เซลล์และรัน
ชุดรีเอเจนต์ Olink® Explore 384	1	1
Olink® Explore 4 x 384 ชุดรีเอเจนต์	4	4
ชุดรีเอเจนต์ Olink® Explore 1536	4	4
Olink® Explore ชุดรีเอเจนต์ส่วนขยาย	4	4
ชุดรีเอเจนต์ Olink® Explore 3072	8	8

ติดตั้งสูตรที่กำหนดเองของ Olink®

ในระหว่างขั้นตอนนี้ สูตรที่กำหนดเองของ Olink® จะถูกติดตั้งบน NextSeq™ 550 ขั้นตอนนี้จะต้องดำเนินการเพียงครั้งเดียว ก่อนที่จะดำเนินการลำดับ Olink เป็นครั้งแรก

บันทึก: สูตรเฉพาะของ Olink จะใช้ได้กับ NextSeq™ 500/550 High Output Kits และ NextSeq™ Control Software 4.0 เท่านั้น

1. แตกไฟล์และวางสูตรที่กำหนดเองของ Olink Olink_NSQ550_HighOutput_V1 ในโฟลเดอร์ต่อไปนี้ของเครื่องดนตรี NextSeq™ 550: C:\Program Files\Illumina\NextSeq ซอฟต์แวร์ควบคุม\สูตร\กำหนดเอง\สูง\.
2. ภายใต้การปรับแต่งระบบ > จัดการเครื่องมือ ให้เปิดใช้งานสูตรอาหารแบบกำหนดเอง หากไม่ได้เลือก ตัวเลือกสูตรอาหารแบบกำหนดเองจะไม่ปรากฏขึ้นระหว่างการตั้งค่าการรัน

บันทึก

• ในซอฟต์แวร์ NCS เวอร์ชัน 4.0 ตัวเลือกในการเลือกสูตรแบบกำหนดเองจะเกิดขึ้นหลังจากที่โหลดคาร์ทริดจ์รีเอเจนต์แล้วเท่านั้น ไม่ใช่ในหน้าการตั้งค่าก่อนหน้า
• การรันจะต้องตั้งค่าในโหมดแมนนวลเพื่อให้สามารถกำหนดสูตรเองได้

เตรียมน้ำยาลำดับ

ในระหว่างขั้นตอนนี้ รีเอเจนต์สำหรับการทำคลัสเตอร์และการจัดลำดับจะถูกละลายและเตรียมโฟลว์เซลล์

เตรียมตลับน้ำยา

คำเตือน: ตลับรีเอเจนต์มีสารเคมีที่อาจเป็นอันตราย สวมอุปกรณ์ป้องกันที่เหมาะสมและทิ้งรีเอเจนต์ที่ใช้แล้วตามมาตรฐานที่บังคับใช้ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดดูคู่มือระบบ Illumina NextSeq 550 (เอกสาร #15069765)

เตรียมม้านั่ง

• 1x คาร์ทริดจ์รีเอเจนต์เอาต์พุตสูง NextSeq™ 500/550 v2 (75 รอบ)

คำแนะนำ

1. วางตลับรีเอเจนต์แช่แข็งจุ่มลงในน้ำอุณหภูมิห้องแล้วปล่อยให้ละลายเป็นเวลา 1 ชั่วโมง ตรวจสอบให้แน่ใจว่าถังเก็บรีเอเจนต์ทั้งหมดของคาร์ทริดจ์ละลายหมดแล้ว
   • บันทึก: เพื่อความสะดวก ให้ละลายตลับหมึกหนึ่งวันก่อนและเก็บไว้ข้ามคืนที่อุณหภูมิ 4 °C ที่อุณหภูมินี้ รีเอเจนต์จะคงตัวได้นานถึงหนึ่งสัปดาห์
2. เช็ดฐานตลับหมึกให้แห้งด้วยผ้ากระดาษ และซับซีลฟอยล์ให้แห้งด้วยกระดาษทิชชู่ที่ไม่มีขุย หากจำเป็น
3. กลับด้านตลับหมึกสิบครั้งเพื่อผสมรีเอเจนต์ที่ละลายอยู่ภายในอย่างทั่วถึง
4. แตะตลับหมึกเบา ๆ บนม้านั่งเพื่อขจัดฟองอากาศ เก็บตลับหมึกไว้ที่อุณหภูมิห้องหากจะใช้ภายใน 4 ชั่วโมง

เตรียมโฟลว์เซลล์

เตรียมม้านั่ง

• 1x NextSeq™ 500/550 เซลล์ไหลเอาต์พุตสูง v2.5

คำแนะนำ

1. นำโฟลว์เซลล์แช่เย็นไปที่อุณหภูมิห้องเป็นเวลา 30 นาที
2. สวมถุงมือชนิดไม่มีแป้งใหม่ (เพื่อหลีกเลี่ยงการปนเปื้อนพื้นผิวกระจกของโฟลว์เซลล์)
3. เมื่อพร้อมที่จะบรรจุโฟลว์เซลล์ลงในเครื่องมือ ให้นำโฟลว์เซลล์ออกจากบรรจุภัณฑ์และฝาพับพลาสติก
4. ตรวจสอบโฟลว์เซลล์ หากมองเห็นอนุภาคหรือฝุ่นบนพื้นผิวกระจกใดๆ ให้ทำความสะอาดพื้นผิวที่เกี่ยวข้องด้วยผ้าเช็ดทำความสะอาดไอโซโพรพิลแอลกอฮอล์ที่ไม่เป็นขุย แล้วเช็ดให้แห้งด้วยกระดาษทิชชู่สำหรับห้องปฏิบัติการที่มีขุยต่ำ

เตรียม Olink® Library สำหรับการจัดลำดับ

ในระหว่างขั้นตอนนี้ จะมีการเตรียมการเจือจาง NaOH และ Tris-HCl และไลบรารี Olink ที่บริสุทธิ์และควบคุมคุณภาพจะถูกเจือจางและแปลงสภาพตามขั้นตอนตามลำดับ

เตรียมการเจือจาง NaOH

• การเจือจาง NaOH ใช้เพื่อทำลายห้องสมุด

เตรียมม้านั่ง

• 1 ไม่มีสต็อก NaOH
• น้ำมิลลิคิว
• 1x หลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ (1.5 มล.)
• ปิเปตแบบแมนนวล (10–100 μL)
• ปลายหลอดกรอง

ก่อนที่คุณจะเริ่มต้น

• ทำเครื่องหมายหลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ “0.2 N NaOH”

คำแนะนำ

1. เตรียมการเจือจาง 0.2 N NaOH ในท่อ 0.2 N NaOH ตามตารางที่ 2
2. หมุนท่อ NaOH 0.2 N ให้ละเอียดแล้วหมุนลง ใช้ภายใน 12 ชั่วโมง

ตารางที่ 2 การเจือจาง NaOH 0.2 N

สารเคมี	ปริมาตร (ไมโครลิตร)
น้ำมิลลิคิว	80
1 ไม่มีสต็อก NaOH	20

เตรียมการเจือจาง Tris-HCl

• การเจือจาง Tris-HCl ใช้ในการทำให้ไลบรารีที่สูญเสียสภาพเป็นกลาง

เตรียมม้านั่ง

• สต็อก 1 M Tris-HCl pH 7.0 (สารละลาย Trizma® ไฮโดรคลอไรด์)
• น้ำมิลลิคิว
• 1x หลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ (1.5 มล.)
• ปิเปตแบบแมนนวล (10–100 μL)
• ปลายหลอดกรอง

ก่อนที่คุณจะเริ่มต้น

• ทำเครื่องหมายหลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ “Tris-HCl”

คำแนะนำ

1. เตรียมการเจือจาง Tris-HCl 200 mM ในหลอด Tris-HCl ตามตารางที่ 3
2. หมุน Tris-HCl Tube ให้ละเอียดแล้วหมุนลง

ตารางที่ 3 การเจือจาง Tris-HCl 200 มิลลิโมลาร์

สารเคมี	ปริมาตร (ไมโครลิตร)
น้ำมิลลิคิว	80
1M Tris-HCl pH 7.0 สต็อก (สารละลาย Trizma® ไฮโดรคลอไรด์)	20

เจือจางไลบรารี Olink®

• ในระหว่างขั้นตอนนี้ Olink Library บริสุทธิ์และควบคุมคุณภาพจะถูกเจือจางในอัตราส่วน 1:33

เตรียมม้านั่ง

• Lib Tube จัดทำขึ้นตามคู่มือผู้ใช้ Olink Explore ที่เกี่ยวข้อง
• น้ำมิลลิคิว
• 1x หลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ (1.5 มล.)
• ปิเปตแบบแมนนวล (0.5–10 และ 100–1000 µL)
• ปลายหลอดกรอง

ก่อนที่คุณจะเริ่มต้น

• ละลาย Lib Tube หากแช่แข็ง
• ทำเครื่องหมายหลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ใหม่: “Dil”

คำแนะนำ

1. เติมน้ำ MilliQ 96 ไมโครลิตรลงใน Dil Tube
2. Vortex the Lib Tube แล้วหมุนลงชั่วครู่
3. ถ่าย 3 μL จาก Lib Tube ไปยัง Dil Tube
4. Vortex the Dil Tube แล้วหมุนลงชั่วครู่

บันทึก: เก็บ Lib Tube ไว้ที่อุณหภูมิ -20 °C ในกรณีที่มีโอกาสเกิดซ้ำ

เปลี่ยนสภาพและเจือจาง Olink® Library ให้เป็นความเข้มข้นในการโหลดขั้นสุดท้าย

ในระหว่างขั้นตอนนี้ ไลบรารี Olink ที่เจือจางจะถูกทำให้เสียสภาพและเจือจางเพิ่มเติมจนถึงความเข้มข้นในการโหลดขั้นสุดท้าย

เตรียมม้านั่ง

• Dil Tube ที่เตรียมไว้ในขั้นตอนก่อนหน้า
• การเจือจาง NaOH 0.2 N เตรียมใหม่ในขั้นตอนก่อนหน้า
• การเจือจาง Tris-HCl (pH 200) 7.0 มิลลิโมลาร์ เตรียมไว้ในขั้นตอนก่อนหน้า
• Hybridization buffer 1 (HT1) รวมอยู่ใน NextSeq™ Accessory Box v2
• 2x หลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ (1.5 มล. และ 2 มล.)
• ปิเปตแบบแมนนวล (0.5–10 และ 100–1000 µL)
• ปลายหลอดกรอง

ก่อนที่คุณจะเริ่มต้น

• ละลายบัฟเฟอร์ HT1 แช่แข็งที่อุณหภูมิห้อง เก็บที่อุณหภูมิ +4 °C จนกระทั่งใช้งาน
• ทำเครื่องหมายหลอดไมโครเซนติฟิวจ์ขนาด 1.5 มล. ใหม่: “Den” (สำหรับห้องสมุดที่สูญเสียสภาพแล้ว)
• ทำเครื่องหมายหลอดไมโครเซนตริฟิวจ์ขนาด 2 มล. ใหม่: “Seq” (สำหรับไลบรารีที่พร้อมโหลด)

คำแนะนำ

1. ถ่าย 5 μL จาก Dil Tube ไปยัง Den Tube
2. เติม NaOH 5 N 0.2 μL ลงใน Den Tube
3. หมุน Den Tube แล้วหมุนลงไปสั้นๆ
4. ฟักไข่ Den Tube เป็นเวลา 5 นาทีที่อุณหภูมิห้องเพื่อทำให้ห้องสมุดเสียหาย
5. เติม Tris-HCl (pH 5) 200 μL 7.0 mM ลงใน Den Tube เพื่อทำให้ปฏิกิริยาเป็นกลาง
6. หมุน Den Tube แล้วหมุนลงไปสั้นๆ
7. เติม HT985 แช่เย็นไว้ 1 μL ลงใน Den Tube
8. หมุน Den Tube แล้วหมุนลงไปสั้นๆ หลอดสามารถเก็บไว้ที่อุณหภูมิ +4 °C จนกว่าจะใช้งาน (วันเดียวกัน)
9. ถ่ายเท 205 ไมโครลิตรจาก Den Tube ไปยัง Seq Tube
10. เติม HT1095 แช่เย็นล่วงหน้า 1 μL ลงในหลอด Seq
11. กลับด้านท่อ Seq เพื่อผสมรีเอเจนต์และหมุนลงเป็นเวลาสั้นๆ ปริมาตรการเติมสุดท้ายคือ 1.3 มล.
12. ดำเนินการต่อไปที่ 2.5 ดำเนินการลำดับOlink®ทันที

ดำเนินการรันลำดับ Olink®

ในระหว่างขั้นตอนนี้ คาร์ทริดจ์บัฟเฟอร์ โฟลว์เซลล์ และคาร์ทริดจ์รีเอเจนต์ที่เตรียมไว้ซึ่งมีไลบรารี Olink จะถูกโหลดลงใน NextSeq 550 และการดำเนินการเรียงลำดับจะเริ่มขึ้นโดยใช้สูตรที่กำหนดเองของ Olink

เตรียมม้านั่ง

• Seq Tube (พร้อมไลบรารี่ที่พร้อมโหลด) จัดทำขึ้นในขั้นตอนก่อนหน้า
• 1x คาร์ทริดจ์รีเอเจนต์เอาต์พุตสูง NextSeq™ 500/550 v2 เตรียมไว้ในขั้นตอนก่อนหน้า
• 1x NextSeq™ 500/550 High Output Flow Cell v2.5 เตรียมไว้ในขั้นตอนก่อนหน้า
• 1x ตลับบัฟเฟอร์ NextSeq™ 500/550 v2 (75 รอบ) ที่อุณหภูมิห้อง

ตั้งค่าพารามิเตอร์การรันลำดับ

ในระหว่างขั้นตอนนี้ จะมีการเลือกพารามิเตอร์การรันลำดับบน NextSeq™ 550

1. บนหน้าจอหลักของ NextSeq™ 550 ให้เลือก การทดลอง
2. บนหน้าจอเลือกการทดสอบ เลือกลำดับ
3. ในหน้าการตั้งค่าการเรียกใช้ ให้เลือกโหมดการรันด้วยตนเอง จากนั้นเลือกถัดไป
4. ตั้งค่าพารามิเตอร์การรันดังนี้:
   • ในฟิลด์ชื่อการทดสอบ ให้ป้อนรหัสการทดสอบที่ไม่ซ้ำ
   • ในฟิลด์ ID ไลบรารี ให้ป้อน ID ของไลบรารีที่คุณใช้งานอยู่ (ไม่บังคับ)
   • ในฟิลด์ประเภทการอ่าน ให้เลือกตัวเลือกการอ่านครั้งเดียว
   • ใส่จำนวนรอบดังนี้
     • อ่าน 1: 24
     • ดัชนี 1: 0
     • ดัชนี 2: 0
     • อ่าน 2: 0
     • สำคัญ: สิ่งสำคัญคือต้องตั้งค่า Read 1 เป็น 24 มิฉะนั้นการรันทั้งหมดจะล้มเหลว
   • ไม่ต้องเลือกช่องทำเครื่องหมายสำหรับไพรเมอร์แบบกำหนดเอง
   • ตั้งค่าตำแหน่งโฟลเดอร์เอาท์พุตสำหรับข้อมูลดิบที่รันปัจจุบัน เลือกเรียกดูเพื่อเปลี่ยนตำแหน่งโฟลเดอร์เอาต์พุต
5. อย่าตั้งสampเลอชีท.
6. เลือก ล้างวัสดุสิ้นเปลืองสำหรับการรันนี้
7. เลือกถัดไป

โหลดโฟลว์เซลล์ลงใน NextSeq™ 550

1. ลบโฟลว์เซลล์ที่ใช้แล้วออกจากการทำงานครั้งก่อน
2. วางโฟลว์เซลล์ที่เตรียมไว้ใหม่ไว้บนtage.
3. เลือกโหลด ประตูปิดโดยอัตโนมัติ
4. เมื่อ ID โฟลว์เซลล์ปรากฏบนหน้าจอและเซ็นเซอร์ถูกตรวจสอบเป็นสีเขียว ให้เลือก ถัดไป

ล้างคอนเทนเนอร์รีเอเจนต์

คำเตือน: ชุดรีเอเจนต์นี้มีสารเคมีที่อาจเป็นอันตราย สวมอุปกรณ์ป้องกันที่เหมาะสมและทิ้งรีเอเจนต์ที่ใช้แล้วตามมาตรฐานที่บังคับใช้ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติม โปรดดูคู่มือระบบ Illumina NextSeq 550

1. เปิดประตูช่องบัฟเฟอร์ นำภาชนะรีเอเจนต์ที่ใช้แล้วออกจากช่องด้านล่าง และกำจัดเนื้อหาตามมาตรฐานที่บังคับใช้
2. เลื่อนคอนเทนเนอร์รีเอเจนต์เปล่ากลับเข้าไปในช่องบัฟเฟอร์ด้านล่าง เสียงคลิกบ่งบอกว่าวางคอนเทนเนอร์อย่างถูกต้อง

โหลดคาร์ทริดจ์บัฟเฟอร์

1. นำตลับบัฟเฟอร์ที่ใช้แล้วออกจากช่องบัฟเฟอร์ด้านบน และกำจัดเนื้อหาตามมาตรฐานที่บังคับใช้
2. เลื่อนคาร์ทริดจ์บัฟเฟอร์ใหม่เข้าไปในช่องบัฟเฟอร์ด้านบน เสียงคลิกบ่งบอกว่าใส่ตลับหมึกถูกต้องแล้ว ตรวจสอบให้แน่ใจว่า ID คาร์ทริดจ์บัฟเฟอร์ปรากฏบนหน้าจอ และเซ็นเซอร์ได้รับการตรวจสอบเป็นสีเขียว
3. ปิดประตูช่องบัฟเฟอร์ และเลือก ถัดไป

ใส่คาร์ทริดจ์รีเอเจนต์

1. เปิดประตูช่องบรรจุสารรีเอเจนต์ ถอดตลับรีเอเจนต์ที่ใช้แล้วออก และกำจัดสารที่ไม่ได้ใช้ตามมาตรฐานที่บังคับใช้ อ่างเก็บน้ำที่ตำแหน่ง 6 สามารถถอดออกได้เพื่อความสะดวกในการกำจัดทิ้งอย่างปลอดภัย
2. เจาะซีลของอ่างเก็บน้ำ #10 ที่มีป้ายกำกับว่า "โหลดห้องสมุดมาที่นี่" ด้วยปิเปตทิปที่สะอาดขนาด 1 มล.
3. บรรจุไลบรารี Olink 1.3 มล. จากท่อ Seq ลงในอ่างเก็บน้ำ #10 ที่มีป้ายกำกับว่า "โหลดไลบรารีที่นี่"
4. เลื่อนตลับรีเอเจนต์ใหม่เข้าไปในช่องใส่รีเอเจนต์ และปิดประตูช่องใส่รีเอเจนต์
5. เลือก โหลด และรอประมาณ 30 วินาทีจนกระทั่งรหัสคาร์ทริดจ์รีเอเจนต์ปรากฏขึ้นบนหน้าจอ และเซ็นเซอร์จะถูกทำเครื่องหมายเป็นสีเขียว
6. จากรายการแบบเลื่อนลงสูตรอาหาร ให้เลือกตัวเลือกสูตรอาหาร [กำหนดเอง] “Olink_NSQ550_HighOutput_V1”
   • สำคัญ: ตรวจสอบให้แน่ใจว่าได้ติดตั้งสูตรแบบกำหนดเองไว้ในเครื่องมือแล้ว ดูที่ 2.2 ติดตั้งสูตรที่กำหนดเองของOlink®
7. เลือกถัดไป

1. ยืนยันพารามิเตอร์การรันที่แสดงบน Review หน้าจอ. หากต้องการแก้ไขพารามิเตอร์ใดๆ ให้กด Back เพื่อกลับไปยังหน้าจอ Run Setup
2. เลือก ถัดไป การรันจะเริ่มต้นหลังจากการตรวจสอบก่อนการรันโดยอัตโนมัติ เวลาดำเนินการตามลำดับคือประมาณ 7 ชั่วโมง 30 นาที
3. สำคัญ: ตรวจสอบให้แน่ใจว่าการรันเริ่มต้นเมื่อการตรวจสอบก่อนการรันอัตโนมัติเสร็จสิ้น (~ 5 นาที)
   1. บันทึกสำหรับความล้มเหลวในการตรวจสอบก่อนรัน โปรดดูคำแนะนำจากผู้ผลิต
   2. บันทึก: ระวังอย่าชนหรือรบกวน NextSeq™ 550 ในระหว่างการรันลำดับ เครื่องมือมีความไวต่อการสั่นสะเทือน
4. ทำความสะอาดพื้นที่ทำงาน
   1. บันทึก: เมื่อการดำเนินการตามลำดับเสร็จสิ้น ซอฟต์แวร์จะเริ่มการล้างหลังการทำงานอัตโนมัติโดยใช้สารละลายการล้างที่ให้ไว้ในคาร์ทริดจ์บัฟเฟอร์และ NaOCl ที่ให้ไว้ในคาร์ทริดจ์รีเอเจนต์ การล้างครั้งนี้ใช้เวลาประมาณ 90 นาที ปุ่มโฮมจะทำงานเมื่อการซักเสร็จสิ้น คาร์ทริดจ์และโฟลว์เซลล์ที่ใช้แล้วสามารถปล่อยทิ้งไว้จนกว่าจะทำงานครั้งถัดไป

ติดตามความคืบหน้าการวิ่ง

Olink ใช้ NGS เป็นค่าที่อ่านได้เพื่อหาปริมาณของลำดับที่ทราบเพื่อประเมินความเข้มข้นของโปรตีนที่กำหนดใน samples (เทียบกับ s อื่น ๆampเลส). คุณภาพข้อมูลจากการรันลำดับ Explore แต่ละครั้งถูกกำหนดโดยพารามิเตอร์ QC เฉพาะของเทคโนโลยี Olink เป็นหลัก ดังนั้น เมตริกการควบคุมคุณภาพมาตรฐานที่ใช้ใน NGS ทั่วไป เช่น Q-score จึงมีความสำคัญน้อยกว่า

ประวัติการแก้ไข

เวอร์ชัน	วันที่	คำอธิบาย
1.2	2022-11-01	1.2 แทนที่ Olink® Mydata ด้วย Olink® NPX Explore 2.4 เพิ่ม 0.2 N ให้กับก่อนที่คุณจะเริ่ม
1.1	2021-12-13	การเปลี่ยนแปลงทางบรรณาธิการ
1.0	2021-12-01	ใหม่

www.olink.com

สำหรับใช้ในการวิจัยเท่านั้น ห้ามใช้ในขั้นตอนการวินิจฉัย

ผลิตภัณฑ์นี้รวมถึงใบอนุญาตสำหรับการใช้ผลิตภัณฑ์ Olink ที่ไม่ใช่เชิงพาณิชย์ ผู้ใช้เชิงพาณิชย์อาจต้องมีใบอนุญาตเพิ่มเติม โปรดติดต่อ Olink Proteomics AB เพื่อดูรายละเอียด ไม่มีการรับประกันทั้งโดยชัดแจ้งหรือโดยนัย ซึ่งครอบคลุมเกินกว่าคำอธิบายนี้ Olink Proteomics AB จะไม่รับผิดชอบต่อความเสียหายต่อทรัพย์สิน การบาดเจ็บส่วนบุคคล หรือการสูญเสียทางเศรษฐกิจที่เกิดจากผลิตภัณฑ์นี้ เครื่องหมายการค้าต่อไปนี้เป็นของ Olink Proteomics AB: Olink® ผลิตภัณฑ์นี้ได้รับการคุ้มครองโดยสิทธิบัตรและการยื่นขอรับสิทธิบัตรหลายฉบับที่ https://www.olink.com/patents/.

© ลิขสิทธิ์ 2021 Olink Proteomics AB เครื่องหมายการค้าของบุคคลที่สามทั้งหมดเป็นทรัพย์สินของเจ้าของที่เกี่ยวข้อง
Olink Proteomics, Dag Hammarskjölds väg 52B , SE-752 37 Uppsala, สวีเดน
1192, v1.2, 2022-11-01

เอกสาร / แหล่งข้อมูล

Olink NextSeq 550 สำรวจลำดับ [พีดีเอฟ] คู่มือการใช้งาน NextSeq 550 สำรวจลำดับ, NextSeq 550, สำรวจลำดับ, ลำดับ

อ้างอิง

• คู่มือการใช้งาน