illumina ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ CF 139-Variant 2.0 Analysis Module Software

ഈ ഡോക്യുമെന്റും അതിലെ ഉള്ളടക്കങ്ങളും Illumina, Inc., അതിന്റെ അഫിലിയേറ്റുകൾ ("Illumina") എന്നിവയുടെ ഉടമസ്ഥതയിലുള്ളതാണ്, മാത്രമല്ല ഇവിടെ വിവരിച്ചിരിക്കുന്ന ഉൽപ്പന്നത്തിന്റെ(കളുടെ) ഉപയോഗവുമായി ബന്ധപ്പെട്ട് അതിന്റെ ഉപഭോക്താവിന്റെ കരാർ ഉപയോഗത്തിന് വേണ്ടി മാത്രമുള്ളതാണ്, മറ്റ് ഉദ്ദേശ്യങ്ങൾ ഒന്നുമില്ല. . ഈ ഡോക്യുമെന്റും അതിലെ ഉള്ളടക്കങ്ങളും മറ്റേതെങ്കിലും ആവശ്യത്തിനായി ഉപയോഗിക്കാനോ വിതരണം ചെയ്യാനോ പാടില്ല കൂടാതെ/അല്ലെങ്കിൽ ഇല്ലുമിനയുടെ മുൻകൂർ രേഖാമൂലമുള്ള സമ്മതമില്ലാതെ ഏതെങ്കിലും വിധത്തിൽ ആശയവിനിമയം നടത്തുകയോ വെളിപ്പെടുത്തുകയോ പുനർനിർമ്മിക്കുകയോ ചെയ്യരുത്. Illumina അതിന്റെ പേറ്റന്റ്, വ്യാപാരമുദ്ര, പകർപ്പവകാശം അല്ലെങ്കിൽ പൊതു-നിയമ അവകാശങ്ങൾ അല്ലെങ്കിൽ ഏതെങ്കിലും മൂന്നാം കക്ഷികളുടെ സമാന അവകാശങ്ങൾ എന്നിവയ്ക്ക് കീഴിലുള്ള ഒരു ലൈസൻസും ഈ പ്രമാണത്തിലൂടെ അറിയിക്കുന്നില്ല.
ഇവിടെ വിവരിച്ചിരിക്കുന്ന ഉൽപ്പന്നത്തിന്റെ(കളുടെ) ശരിയായതും സുരക്ഷിതവുമായ ഉപയോഗം ഉറപ്പാക്കുന്നതിന്, ഈ പ്രമാണത്തിലെ നിർദ്ദേശങ്ങൾ യോഗ്യരും ശരിയായ പരിശീലനം ലഭിച്ചവരുമായ ഉദ്യോഗസ്ഥർ കർശനമായും വ്യക്തമായും പാലിക്കേണ്ടതാണ്. അത്തരം ഉൽപ്പന്നങ്ങൾ ഉപയോഗിക്കുന്നതിന് മുമ്പ് ഈ പ്രമാണത്തിലെ എല്ലാ ഉള്ളടക്കങ്ങളും പൂർണ്ണമായി വായിക്കുകയും മനസ്സിലാക്കുകയും വേണം.
ഇവിടെ അടങ്ങിയിരിക്കുന്ന എല്ലാ നിർദ്ദേശങ്ങളും പൂർണ്ണമായി വായിക്കുന്നതിലും വ്യക്തമായി പാലിക്കുന്നതിലും പരാജയപ്പെടുന്നത് മറ്റ് ഉൽപ്പന്നങ്ങൾക്ക് (ഉൽപ്പന്നങ്ങൾക്ക്) കേടുപാടുകൾക്ക് കാരണമായേക്കാം, മറ്റുള്ളവർക്ക് (ഉപയോക്താക്കൾ, ഉപയോക്താക്കൾ ഉൾപ്പെടെയുള്ളവർ, ഉൽപന്നങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെയുള്ളവർ) എസ്).
ഇവിടെ വിവരിച്ചിരിക്കുന്ന ഉൽപ്പന്നങ്ങളുടെ (അതിന്റെയോ സോഫ്‌റ്റ്‌വെയറിന്റെയോ ഭാഗങ്ങൾ ഉൾപ്പെടെ) അനുചിതമായ ഉപയോഗത്തിൽ നിന്ന് ഉണ്ടാകുന്ന ഒരു ബാധ്യതയും ILLumina ഏറ്റെടുക്കുന്നില്ല.
© 2021 Illumina, Inc. എല്ലാ അവകാശങ്ങളും നിക്ഷിപ്തം.
എല്ലാ വ്യാപാരമുദ്രകളും Illumina, Inc. അല്ലെങ്കിൽ അവരുടെ ഉടമസ്ഥരുടെ സ്വത്താണ്. നിർദ്ദിഷ്ട വ്യാപാരമുദ്ര വിവരങ്ങൾക്ക്, കാണുക
www.illumina.com/company/legal.html.

ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ CF 139-വേരിയന്റ് 2.0 അനാലിസിസ് മൊഡ്യൂൾ വർക്ക്ഫ്ലോ ഗൈഡ്

കഴിഞ്ഞുview

ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് 139-വേരിയന്റ് അസ്സെയ്‌ക്കൊപ്പം ഉപയോഗിക്കുന്നതിനുള്ളതാണ് ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ CF 2.0-Variant 139 വിശകലന ഘടകം. സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് രോഗത്തിന് കാരണമാകുന്ന 139 മ്യൂട്ടേഷനുകളും സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് ട്രാൻസ്‌മെംബ്രേൻ കണ്ടക്‌ടൻസ് റെഗുലേറ്ററിന്റെ (സിഎഫ്‌ടിആർ) ജീനിന്റെ വകഭേദങ്ങളും മനുഷ്യ പെരിഫറൽ ഹോൾ ബ്ലഡ് സ്‌പെസിമെൻസിൽ നിന്ന് വേർപെടുത്തിയ ജനിതക ഡിഎൻഎയിൽ ഈ പഠനം കണ്ടെത്തുന്നു. ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് ഉപയോഗിക്കുന്ന സീക്വൻസിംഗ് റണ്ണുകളിൽ നിന്ന് വിശകലന മൊഡ്യൂൾ ദ്വിതീയ വിശകലനവും റിപ്പോർട്ട് സൃഷ്ടിക്കലും നടത്തുന്നു. ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് കിറ്റ് (പ്രമാണം # 1000000097720) പാക്കേജ് ഉൾപ്പെടുത്തൽ കാണുക.
വിശകലന മൊഡ്യൂൾ ഹ്രസ്വ പ്രദേശങ്ങളെ വിലയിരുത്തുന്നു ampലിഫൈഡ് ഡിഎൻഎ, അല്ലെങ്കിൽ ampലൈക്കണുകൾ, വേരിയന്റുകൾക്ക്. ഫോക്കസ്ഡ് സീക്വൻസിങ് ampലൈക്കണുകൾ ഒരു വലിയ സംഖ്യയിലുടനീളം പ്രത്യേക പ്രദേശങ്ങളുടെ ഉയർന്ന കവറേജ് സാധ്യമാക്കുന്നുampലെസ്.
ഈ ഗൈഡിനെക്കുറിച്ച്
CF 139-Variant 2.0 അനാലിസിസ് മൊഡ്യൂളിനായി സീക്വൻസിംഗിനും വിശകലനത്തിനുമായി റൺ പാരാമീറ്ററുകൾ സജ്ജീകരിക്കുന്നതിനുള്ള നിർദ്ദേശങ്ങൾ ഈ ഗൈഡ് നൽകുന്നു. സോഫ്റ്റ്‌വെയറിന്റെ ഉപയോഗത്തിന് നിലവിലെ വിൻഡോസ് ഓപ്പറേറ്റിംഗ് സിസ്റ്റത്തെക്കുറിച്ചും അടിസ്ഥാനപരമായ അറിവും ആവശ്യമാണ് web ബ്രൗസർ അടിസ്ഥാനമാക്കിയുള്ള ഉപയോക്തൃ ഇന്റർഫേസ്. ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ ഡാഷ്‌ബോർഡിനെയും സിസ്റ്റം ക്രമീകരണങ്ങളെയും കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾക്ക്, MiSeqDx-നുള്ള ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ റഫറൻസ് ഗൈഡ് കാണുക
(പ്രമാണം # 1000000011880).
റൺ വിവരങ്ങൾ നൽകുക

പാരാമീറ്ററുകൾ സജ്ജമാക്കുക

1. ലോക്കൽ റൺ മാനേജറിലേക്ക് ലോഗിൻ ചെയ്യുക.
2. റൺ സൃഷ്‌ടിക്കുക തിരഞ്ഞെടുക്കുക, തുടർന്ന് CF 139-Variant 2.0 തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
3. വിശകലനത്തിലൂടെ സീക്വൻസിംഗിൽ നിന്ന് റൺ തിരിച്ചറിയുന്ന ഒരു റൺ നാമം നൽകുക.
   ആൽഫാന്യൂമെറിക് പ്രതീകങ്ങൾ, സ്‌പെയ്‌സുകൾ, അടിവരകൾ അല്ലെങ്കിൽ ഡാഷുകൾ (40 പ്രതീകങ്ങളോ അതിൽ കുറവോ) ഉപയോഗിക്കുക.
4. [ഓപ്ഷണൽ] ഒരു റൺ വിവരണം നൽകുക.
   ആൽഫാന്യൂമെറിക് പ്രതീകങ്ങൾ, സ്‌പെയ്‌സുകൾ, അടിവരകൾ അല്ലെങ്കിൽ ഡാഷുകൾ (150 പ്രതീകങ്ങളോ അതിൽ കുറവോ) ഉപയോഗിക്കുക.
5. ലൈബ്രറി പ്രെപ്പ് കിറ്റിനുള്ള ലോട്ട് നമ്പറും കാലഹരണപ്പെടുന്ന തീയതിയും നൽകുക.
   എസ് വ്യക്തമാക്കുകampറണ്ണിനായി ലെസ്
   കൾ വ്യക്തമാക്കുകampഇനിപ്പറയുന്ന ഓപ്ഷനുകളിലൊന്ന് ഉപയോഗിച്ച് റണ്ണിനായി les.
   •  എസ് നൽകുകamples സ്വമേധയാ-ക്രിയേറ്റ് റൺ സ്ക്രീനിൽ ശൂന്യമായ പട്ടിക ഉപയോഗിക്കുക. നിർദ്ദേശിച്ച എസ്ample കിണറുകൾ ഹൈലൈറ്റ് ചെയ്യുന്നു.
   • ഇറക്കുമതി sampലെസ് - ഒരു ബാഹ്യഭാഗത്തേക്ക് നാവിഗേറ്റ് ചെയ്യുക file കോമയാൽ വേർതിരിച്ച മൂല്യങ്ങൾ (*.csv) ഫോർമാറ്റിൽ. ക്രിയേറ്റ് റൺ സ്ക്രീനിൽ ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാൻ ഒരു ടെംപ്ലേറ്റ് ലഭ്യമാണ്.

എസ് നൽകുകampലെസ് സ്വമേധയാ

1. ഒരു അദ്വിതീയ എസ് നൽകുകampഎസ് ലെ പേര്ample പേര് ഫീൽഡ്.
   ആൽഫാന്യൂമെറിക് പ്രതീകങ്ങൾ, ഡാഷുകൾ അല്ലെങ്കിൽ അടിവരകൾ (40 പ്രതീകങ്ങളോ അതിൽ കുറവോ) ഉപയോഗിക്കുക.
2. വലത്-ക്ലിക്കുചെയ്ത് പോസിറ്റീവ്, നെഗറ്റീവ് നിയന്ത്രണങ്ങൾ തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലെസ്.
   ഒരു റൺ ലാഭിക്കുന്നതിന്, അതിന് കുറഞ്ഞത് ഒരു പോസിറ്റീവ്, ഒരു നെഗറ്റീവ് നിയന്ത്രണമെങ്കിലും ഉണ്ടായിരിക്കണം.
3.  [ഓപ്ഷണൽ] എന്ന് നൽകുകamps ലെ വിവരണംample വിവരണം ടാബ്.
   ആൽഫാന്യൂമെറിക് പ്രതീകങ്ങൾ, ഡാഷുകൾ അല്ലെങ്കിൽ അടിവരകൾ (50 പ്രതീകങ്ങളോ അതിൽ കുറവോ) ഉപയോഗിക്കുക.
4.  [ഓപ്ഷണൽ] ഇൻഡക്സ് 1 (i1) ഡ്രോപ്പ്-ഡൗൺ ലിസ്റ്റിൽ നിന്ന് ഒരു ഇൻഡക്സ് 7 അഡാപ്റ്റർ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
   ഈ ഘട്ടം ഓപ്ഷണൽ ആണ്, കാരണം i7, i5 സൂചിക കോമ്പിനേഷനുകൾ ഒരു ഡിഫോൾട്ട് ലേഔട്ടിനൊപ്പം സ്വയമേവ പോപ്പുലേറ്റ് ചെയ്യുന്നു.
5.  [ഓപ്ഷണൽ] ഇൻഡക്സ് 2 (i2) ഡ്രോപ്പ്-ഡൗൺ ലിസ്റ്റിൽ നിന്ന് ഒരു ഇൻഡക്സ് 5 അഡാപ്റ്റർ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
   ഈ ഘട്ടം ഓപ്ഷണൽ ആണ്, കാരണം i7, i5 സൂചിക കോമ്പിനേഷനുകൾ ഒരു ഡിഫോൾട്ട് ലേഔട്ടിനൊപ്പം സ്വയമേവ പോപ്പുലേറ്റ് ചെയ്യുന്നു.
6. പ്ലേറ്റ് ലേഔട്ട് പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നതിന് പ്രിന്റ് ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
7. ലൈബ്രറികൾ തയ്യാറാക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു റഫറൻസായി പ്ലേറ്റ് ലേഔട്ട് പ്രിന്റ് ചെയ്യാൻ പ്രിന്റ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
8. [ഓപ്ഷണൽ] കൾ കയറ്റുമതി ചെയ്യാൻ കയറ്റുമതി തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലെ വിവരങ്ങൾ file.
9. സേവ് റൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
   24 സെക്കൻഡിൽ കുറവാണെങ്കിൽampലെസ് നൽകിയിട്ടുണ്ട്, അപര്യാപ്തമായ എസ്ample വിൻഡോ പ്രദർശിപ്പിക്കും. തുടരാൻ തുടരുക തിരഞ്ഞെടുക്കുക, അല്ലെങ്കിൽ s എഡിറ്റ് ചെയ്യാൻ റദ്ദാക്കുക തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലെസ്.

ജാഗ്രത
24 സെക്കൻഡിൽ താഴെയായി തുടരുന്നുampലെസ് ഇല്ലുമിന സാധൂകരിക്കുന്നില്ല. കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് പാക്കേജ് ഇൻസേർട്ട് (പ്രമാണം # 1000000097720) കാണുക.

ഇറക്കുമതി എസ്ampലെസ്
Sample വിവരങ്ങൾ രണ്ട് തരത്തിൽ നിന്ന് ഇറക്കുമതി ചെയ്യാൻ കഴിയും files:

• എ എസ്ampലെ വിവരങ്ങൾ file എക്‌സ്‌പോർട്ട് ഫീച്ചർ ഉപയോഗിച്ച് CF 139-Variant 2.0 മൊഡ്യൂളിൽ നിന്ന് മുമ്പ് എക്‌സ്‌പോർട്ട് ചെയ്‌തതാണ്.
• ഒരു ടെംപ്ലേറ്റ് file, സൃഷ്‌ടിക്കുക റൺ സ്‌ക്രീനിൽ ടെംപ്ലേറ്റ് തിരഞ്ഞെടുത്ത് സൃഷ്‌ടിക്കാനാകും. ടെംപ്ലേറ്റ് file ഓരോ നിരയിലും പ്ലെയ്‌സ്‌ഹോൾഡർ വിവരങ്ങൾക്കൊപ്പം, ഇമ്പോർട്ടിനുള്ള ശരിയായ കോളം തലക്കെട്ടുകൾ അടങ്ങിയിരിക്കുന്നു. ടെംപ്ലേറ്റ് ഇഷ്ടാനുസൃതമാക്കാൻ ഒരു ബാഹ്യ എഡിറ്റർ ഉപയോഗിക്കുക file:
• കൾ ചേർക്കുകampഓരോന്നിനും വേണ്ടിയുള്ള വിവരങ്ങൾample ഓട്ടത്തിൽ.
• ഒരിക്കൽ എല്ലാം എസ്ample വിവരങ്ങൾ ചേർത്തു, ഉപയോഗിക്കാത്ത സെല്ലുകളിൽ അവശേഷിക്കുന്ന പ്ലെയ്‌സ്‌ഹോൾഡർ വിവരങ്ങൾ ഇല്ലാതാക്കുക.
• ടെംപ്ലേറ്റ് സംരക്ഷിക്കുക file.

കൾ ഇറക്കുമതി ചെയ്യാൻampലെ വിവരങ്ങൾ:

1. ഇമ്പോർട്ട് എസ് തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലെസ്, തുടർന്ന് ബ്രൗസ് ചെയ്യുക file അത് തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
2. പ്ലേറ്റ് ലേഔട്ട് പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നതിന് പ്രിന്റ് ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
3. ലൈബ്രറികൾ തയ്യാറാക്കുന്നതിനുള്ള ഒരു റഫറൻസായി പ്ലേറ്റ് ലേഔട്ട് പ്രിന്റ് ചെയ്യാൻ പ്രിന്റ് തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
4. [ഓപ്ഷണൽ] കൾ കയറ്റുമതി ചെയ്യാൻ കയറ്റുമതി തിരഞ്ഞെടുക്കുകample വിവരങ്ങൾ ഒരു ബാഹ്യഭാഗത്തേക്ക് file.
5. സേവ് റൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
   24 സെക്കൻഡിൽ കുറവാണെങ്കിൽampലെസ് നൽകിയിട്ടുണ്ട്, അപര്യാപ്തമായ എസ്ample വിൻഡോ പ്രദർശിപ്പിക്കും. തുടരാൻ തുടരുക തിരഞ്ഞെടുക്കുക, അല്ലെങ്കിൽ s എഡിറ്റ് ചെയ്യാൻ റദ്ദാക്കുക തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലെസ്.

ജാഗ്രത
24 സെക്കൻഡിൽ താഴെയായി തുടരുന്നുampലെസ് ഇല്ലുമിന സാധൂകരിക്കുന്നില്ല. കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക് ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് പാക്കേജ് ഇൻസേർട്ട് (പ്രമാണം # 1000000097720) കാണുക.

ഒരു റൺ എഡിറ്റ് ചെയ്യുക

ക്രമപ്പെടുത്തുന്നതിന് മുമ്പ് നിങ്ങളുടെ റണ്ണിലെ വിവരങ്ങൾ എഡിറ്റുചെയ്യുന്നതിനുള്ള നിർദ്ദേശങ്ങൾക്ക്, ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ കാണുക
MiSeqDx-നുള്ള സോഫ്റ്റ്‌വെയർ റഫറൻസ് ഗൈഡ് (പ്രമാണം # 1000000011880).
വിശകലന രീതികൾ
ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസിനായുള്ള വിശകലന രീതികളുടെ വിവരണത്തിന്, പാക്കേജ് ഇൻസേർട്ട് ട്രൂസൈറ്റ് സിസ്റ്റിക് ഫൈബ്രോസിസ് കിറ്റ് കാണുക (പ്രമാണം # 1000000097720).
View റൺ, ഫലങ്ങൾ

1. ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ പ്രധാന സ്ക്രീനിൽ നിന്ന്, റൺ നെയിം ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
2. റൺ ഓവറിൽ നിന്ന്view ടാബ്, വീണ്ടുംview സീക്വൻസിംഗ് റൺ മെട്രിക്കുകൾ.
3. [ഓപ്ഷണൽ] ഔട്ട്പുട്ട് റൺ ഫോൾഡർ പാത്ത് പകർത്താൻ ക്ലിപ്പ്ബോർഡിലേക്ക് പകർത്തുക ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
4. പുനഃക്രമീകരിക്കാൻ സീക്വൻസിങ് ഇൻഫർമേഷൻ ടാബ് തിരഞ്ഞെടുക്കുകview പാരാമീറ്ററുകളും ഉപഭോഗ വിവരങ്ങളും പ്രവർത്തിപ്പിക്കുക.
5. എസ് തിരഞ്ഞെടുക്കുകampലേക്കുള്ള ഫലങ്ങൾ ടാബ് view വിശകലന ഫലങ്ങൾ.
   ടാബ് ഇപ്രകാരം നൽകുന്നുampകോൾ നിരക്ക്, പ്രകടനം, നിയന്ത്രണങ്ങളെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ എന്നിവ സംഗ്രഹിക്കുന്ന ലിസ്റ്റ്.
   വിശകലനം ആവർത്തിക്കുകയാണെങ്കിൽ, വിശകലനം തിരഞ്ഞെടുക്കുക ഡ്രോപ്പ്-ഡൗൺ ലിസ്റ്റ് വിപുലീകരിച്ച് ഉചിതമായ വിശകലനം തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
6. [ഓപ്ഷണൽ] എന്നതിനെക്കുറിച്ചുള്ള ഒരു അഭിപ്രായം നൽകുന്നതിന് കമന്റ് ഫീൽഡിൽ ഡബിൾ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുകampപട്ടികയിൽ le. മാറ്റങ്ങൾ സംരക്ഷിക്കുക ക്ലിക്കുചെയ്യുക.
7. S തിരഞ്ഞെടുക്കുകampവിശദമായ വേരിയന്റ് വിവരങ്ങൾ പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നതിന് പട്ടികയിൽ les. എസ്ampലെ വേരിയന്റ് വിവരങ്ങൾ s-ന് താഴെ പ്രദർശിപ്പിക്കുന്നുampലിസ്റ്റ്.
   കുറിപ്പ് ഓരോ തവണയും മാറ്റങ്ങൾ സംരക്ഷിക്കപ്പെടുന്നു, ഒരു വിശകലനം ഫലം നൽകുന്നു file അലൈൻമെന്റ് ഫോൾഡറിൽ ജനറേറ്റ് ചെയ്യും. ഈ file ഒരു സമയം st ഉൾപ്പെടുന്നുamp എന്നതിലേക്ക് ചേർത്തു file പേര്, YYMMDD_HHMMSS ഫോർമാറ്റിനൊപ്പം.

റൺ ഓവറിനെക്കുറിച്ചുള്ള കൂടുതൽ വിവരങ്ങൾക്ക്view സീക്വൻസിങ് ഇൻഫർമേഷൻ ടാബുകൾ, വിശകലനം എങ്ങനെ റിക്യൂ ചെയ്യാം, MiSeqDx-നുള്ള ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ റഫറൻസ് ഗൈഡ് കാണുക (പ്രമാണം #
1000000011880).

ധാരാളം ട്രാക്കിംഗ് ഡാറ്റ File
വിശകലനം പൂർത്തിയായിക്കഴിഞ്ഞാൽ, ഇനിപ്പറയുന്ന ഓപ്ഷനുകളിലൊന്ന് തിരഞ്ഞെടുക്കുക view LotTracking.txt file.

• എസ്സിൽ നിന്ന്ample, ഫലങ്ങൾ ടാബ്, ലോട്ട് ട്രാക്കിംഗ് ഡാറ്റ എക്സ്പോർട്ട് ചെയ്യുക ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
• തുറക്കുക file വിന്യാസ ഫോൾഡറിൽ.
  അലൈൻമെന്റ് ഫോൾഡറിലേക്കുള്ള പാത എസ്-ൽ പ്രദർശിപ്പിക്കുംampവിശകലന ഫോൾഡർ ഫീൽഡിലെ les, ഫലങ്ങൾ ടാബ്.
• [ഓപ്ഷണൽ] വിശകലന ഫോൾഡർ പാത്ത് പകർത്താൻ ക്ലിപ്പ്ബോർഡിലേക്ക് പകർത്തുക ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.

വിശകലനം പൂർത്തിയാകുമ്പോൾ, ലോട്ട് ട്രാക്കിംഗ് ഡാറ്റ file റണ്ണിനായി അലൈൻമെന്റ് ഫോൾഡറിലേക്ക് എഴുതിയിരിക്കുന്നു. ഉദാampലെ: മിസെക് അനാലിസിസ്\ \Alinment_N\YYMMDD_HHMMSS. N എന്നത് ഒരു അനുക്രമ സംഖ്യയാണ്, അത് വിശകലനം ആവശ്യപ്പെടുകയാണെങ്കിൽ വർദ്ധിക്കുന്നു. YYMMDD_HHMMSS സമയമാണ്amp ഓട്ടത്തിന്റെ.

ഫല റിപ്പോർട്ട്

ദ്വിതീയ വിശകലനം പൂർത്തിയായ ശേഷം, വിശകലന ഫലങ്ങൾ എസ്-ൽ സംഗ്രഹിക്കുന്നുampലെസും ഫലങ്ങളും ടാബ്. ഒരു വിശകലന ഫലങ്ങൾ (ഔട്ട്പുട്ട്) file ഒരു ടാബ്-ഡിലിമിറ്റഡ് ടെക്‌സ്‌റ്റിലേക്ക് അസെ ഫലങ്ങൾ സംഗ്രഹിക്കുന്നു file TruSightCF139VariantAssay.txt എന്ന് വിളിക്കുന്നു.
വിശകലന ഫലങ്ങളിലെ ഫലങ്ങൾ file എസ്-ൽ കണ്ടെത്തിയ വിവരങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുത്തുകample, ഫലങ്ങൾ ടാബ്. ഇനിപ്പറയുന്ന ഓപ്ഷനുകളിലൊന്ന് തിരഞ്ഞെടുക്കുക view വിശകലന ഫലങ്ങൾ file TruSightCF139VariantAssay.txt:

• എസ്സിൽ നിന്ന്ample, ഫലങ്ങൾ ടാബ്, എക്‌സ്‌പോർട്ട് ഡാറ്റ ക്ലിക്ക് ചെയ്യുക.
• തുറക്കുക file വിന്യാസ ഫോൾഡറിൽ.
  എസ് ന്റെ അനാലിസിസ് ഫോൾഡർ ഫീൽഡിൽ അലൈൻമെന്റ് ഫോൾഡറിലേക്കുള്ള പാത പ്രദർശിപ്പിക്കുംampലെസും ഫലങ്ങളും ടാബ്.

കുറിപ്പ്
വിശകലന ഫോൾഡർ പാത്ത് പകർത്താൻ ക്ലിപ്പ്ബോർഡിലേക്ക് പകർത്തുക ഐക്കൺ തിരഞ്ഞെടുക്കുക.
വിശകലനം fileഓരോ സീക്വൻസിംഗ് റണ്ണിനുമുള്ള s ഇൻസ്ട്രുമെന്റിൽ സംഭരിച്ചിരിക്കുന്നു fileലേക്ക് സംരക്ഷിച്ചു
മിസെക് അനാലിസിസ്\ \ഡാറ്റ\തീവ്രത\ബേസ് കോളുകളും മിസെക് അനാലിസിസും\
പേര്>\അലൈൻമെന്റ്_N\YYMMDD_HHMMSS. N എന്നത് വിശകലനം ആവശ്യപ്പെടുകയാണെങ്കിൽ വർദ്ധിക്കുന്ന ഒരു തുടർച്ചയായ സംഖ്യയാണ്. YYMMDD_HHMMSS സമയമാണ്amp ഓട്ടത്തിന്റെ.

വിശകലന ഫലം File വിവരങ്ങൾ
വിശകലന ഫലങ്ങൾ file TruSightCF139VariantAssay.txt-ൽ മൂന്ന് വിഭാഗങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്നു: file തലക്കെട്ട്, എസ്ampലെ വിവരങ്ങൾ, കൂടാതെ എസ്ample വകഭേദങ്ങളുടെ വിവരങ്ങൾ. ദി file തലക്കെട്ട് ആദ്യം ലിസ്‌റ്റ് ചെയ്‌തിരിക്കുന്നു, കൂടാതെ റണ്ണിനെക്കുറിച്ചുള്ള പൊതുവായ വിവരങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്നു. ഒന്ന് മാത്രമേ ഉള്ളൂ എന്നത് ശ്രദ്ധിക്കുക file ഓരോ റണ്ണിനും ഹെഡ്ഡർ. വിപരീതമായി, എസ്ample വിവരങ്ങളും എസ്ample വകഭേദങ്ങളുടെ വിവരങ്ങൾ ഓരോ സെവിനും ഉൾപ്പെടുത്തിയിട്ടുണ്ട്ampവിശകലനത്തിൽ ഉപയോഗിച്ച le. ഈ വിഭാഗങ്ങൾ ഓരോ സെവിനും ഒരുമിച്ച് ജോടിയാക്കിയിരിക്കുന്നുample.
ഇനിപ്പറയുന്ന പട്ടിക ഓരോ വരിയുടെയും ഒരു വിവരണം നൽകുന്നു file റണ്ണിനെക്കുറിച്ചുള്ള വിവരങ്ങൾ ഉൾപ്പെടുന്ന തലക്കെട്ട്:
പട്ടിക 1 File തലക്കെട്ട് (റൺ ഇൻഫർമേഷൻ)

• നടത്തിയ പരിശോധനയെ ടെസ്റ്റ് വിവരിക്കുന്നു. റൺ ഐഡി റൺ ഐഡി സീക്വൻസിംഗ് റണ്ണിന്റെ തുടക്കത്തിൽ MiSeq ഓപ്പറേറ്റിംഗ് സോഫ്റ്റ്‌വെയർ (MOS) സൃഷ്ടിച്ചതാണ്.
• MOS-ൽ സീക്വൻസിങ് റൺ ആരംഭിച്ച റൺ തീയതി തീയതി (YYMMDD).
• വിശകലനത്തിനായി ഉപയോഗിച്ച അനാലിസിസ് പതിപ്പ് സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ പതിപ്പ്.

ഇനിപ്പറയുന്ന പട്ടിക s-ലെ ഓരോ വരിയുടെയും വിവരണം നൽകുന്നുampലെ വിവര വിഭാഗങ്ങൾ: പട്ടിക 2 എസ്ampലെ വിവരങ്ങൾ

• Sampലെ ഐഡി എസ്ampലോക്കൽ റൺ മാനേജർ സോഫ്‌റ്റ്‌വെയർ അസൈൻ ചെയ്‌ത വിശകലന ഐഡിയുമായി സംയോജിപ്പിച്ച് റൺ സൃഷ്‌ടിച്ചപ്പോൾ നൽകിയ പേര്. നിങ്ങൾ ഒരു റൺ ആവശ്യപ്പെടുകയാണെങ്കിൽ, എസ്ampഎസ് ന്റെ പേര്ampവിശകലന ഐഡി മാറുമ്പോൾ le ഐഡി അതേപടി നിലനിൽക്കും.
• ഈ ഫീൽഡ് *.txt-ലാണ് file മാത്രം.
  Sampലെ പേര് ദി എസ്ampറൺ സൃഷ്ടിച്ചപ്പോൾ നൽകിയ പേര്.

s ലെ ഓരോ നിരയുടെയും വിവരണം ഇനിപ്പറയുന്ന പട്ടിക നൽകുന്നുample വകഭേദങ്ങൾ വിഭാഗങ്ങൾ: പട്ടിക 3 എസ്ample വകഭേദങ്ങൾ വിവരങ്ങൾ

റിവിഷൻ ചരിത്രം

• മാറ്റത്തിന്റെ പ്രമാണ തീയതി വിവരണം
• പ്രമാണം # 1000000100945 v01 ഓഗസ്റ്റ് 2021 അപ്‌ഡേറ്റ് ചെയ്‌ത EU അംഗീകൃത പ്രതിനിധി വിലാസം.
• പ്രമാണം # 1000000100945 v00 ഡിസംബർ 2019 പ്രാരംഭ റിലീസ്.

സാങ്കേതിക സഹായം

സാങ്കേതിക സഹായത്തിന്, ഇല്ലുമിന ടെക്നിക്കൽ സപ്പോർട്ടുമായി ബന്ധപ്പെടുക.

• Webസൈറ്റ്: www.illumina.com
• ഇമെയിൽ: techsupport@illumina.com

ഇല്ലുമിന കസ്റ്റമർ സപ്പോർട്ട് ടെലിഫോൺ നമ്പറുകൾ

മേഖല	ടോൾ ഫ്രീ	പ്രാദേശിക
വടക്കേ അമേരിക്ക	+1.800.809.4566
ഓസ്ട്രേലിയ	+1.800.775.688
ഓസ്ട്രിയ	+43 800006249	+43 19286540
ബെൽജിയം	+32 80077160	+32 34002973
ചൈന	400.066.5835
ഡെൻമാർക്ക്	+45 80820183	+45 89871156
ഫിൻലാൻഡ്	+358 800918363	+358 974790110
ഫ്രാൻസ്	+33 805102193	+33 170770446
ജർമ്മനി	+49 8001014940	+49 8938035677
ഹോങ്കോംഗ്, ചൈന	800960230
അയർലൻഡ്	+353 1800936608	+353 016950506
ഇറ്റലി	+39 800985513	+39 236003759
ജപ്പാൻ	0800.111.5011
നെതർലാൻഡ്സ്	+31 8000222493	+31 207132960
ന്യൂസിലാന്റ്	0800.451.650
നോർവേ	+47 800 16836	+47 21939693
സിംഗപ്പൂർ	+1.800.579.2745
ദക്ഷിണ കൊറിയ	+82 80 234 5300
സ്പെയിൻ	+34 911899417	+34 800300143
സ്വീഡൻ	+46 850619671	+46 200883979
സ്വിറ്റ്സർലൻഡ്	+41 565800000	+41 800200442
തായ്‌വാൻ, ചൈന	00806651752
യുണൈറ്റഡ് കിംഗ്ഡം	+44 8000126019	+44 2073057197
മറ്റ് രാജ്യങ്ങൾ	+44.1799.534000

സുരക്ഷാ ഡാറ്റ ഷീറ്റുകൾ (SDS)-ഇല്ലുമിനയിൽ ലഭ്യമാണ് webസൈറ്റ് support.illumina.com/sds.html. ഉൽപ്പന്ന ഡോക്യുമെന്റേഷൻ-ഇതിൽ നിന്ന് ഡൗൺലോഡ് ചെയ്യാൻ ലഭ്യമാണ് support.illumina.com.

പ്രമാണങ്ങൾ / വിഭവങ്ങൾ

illumina ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ CF 139-Variant 2.0 Analysis Module Software [pdf] ഉപയോക്തൃ ഗൈഡ് ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ സിഎഫ് 139-വേരിയന്റ് 2.0 അനാലിസിസ് മൊഡ്യൂൾ, സോഫ്റ്റ്‌വെയർ, ലോക്കൽ റൺ മാനേജർ സിഎഫ് 139-വേരിയന്റ് 2.0 അനാലിസിസ് മൊഡ്യൂൾ സോഫ്റ്റ്‌വെയർ

റഫറൻസുകൾ

• ഉപയോക്തൃ മാനുവൽ