illumina Local Run Manager CF 139-Variant 2.0 ຊອບແວໂມດູນການວິເຄາະ

ເອກະສານນີ້ ແລະເນື້ອໃນຂອງມັນແມ່ນເປັນເຈົ້າຂອງຂອງ Illumina, Inc. ແລະສາຂາຂອງມັນ (“Illumina”), ແລະມີຈຸດປະສົງພຽງຢ່າງດຽວສໍາລັບການນໍາໃຊ້ຕາມສັນຍາຂອງລູກຄ້າທີ່ກ່ຽວຂ້ອງກັບການນໍາໃຊ້ຜະລິດຕະພັນທີ່ໄດ້ອະທິບາຍຢູ່ທີ່ນີ້ແລະບໍ່ມີຈຸດປະສົງອື່ນ. . ເອກະສານນີ້ແລະເນື້ອໃນຂອງມັນຈະບໍ່ຖືກນໍາໃຊ້ຫຼືແຈກຢາຍສໍາລັບຈຸດປະສົງອື່ນໆແລະ / ຫຼືການສື່ສານ, ເປີດເຜີຍ, ຫຼືການຜະລິດໃຫມ່ໃນທາງໃດກໍ່ຕາມໂດຍບໍ່ມີການຍິນຍອມເຫັນດີເປັນລາຍລັກອັກສອນຈາກ Illumina. Illumina ບໍ່ໄດ້ຖ່າຍທອດໃບອະນຸຍາດໃດໆພາຍໃຕ້ສິດທິບັດ, ເຄື່ອງໝາຍການຄ້າ, ລິຂະສິດ, ຫຼືສິດທິໃນກົດໝາຍທົ່ວໄປ ຫຼືສິດທີ່ຄ້າຍຄືກັນຂອງພາກສ່ວນທີສາມໂດຍເອກະສານນີ້.
ຄໍາແນະນໍາໃນເອກະສານນີ້ຕ້ອງໄດ້ຮັບການປະຕິບັດຕາມຢ່າງເຂັ້ມງວດແລະຊັດເຈນໂດຍບຸກຄະລາກອນທີ່ມີຄຸນວຸດທິແລະການຝຶກອົບຮົມຢ່າງຖືກຕ້ອງເພື່ອຮັບປະກັນການນໍາໃຊ້ທີ່ເຫມາະສົມແລະປອດໄພຂອງຜະລິດຕະພັນທີ່ໄດ້ອະທິບາຍຢູ່ທີ່ນີ້. ເນື້ອໃນທັງຫມົດຂອງເອກະສານນີ້ຕ້ອງໄດ້ຮັບການອ່ານແລະເຂົ້າໃຈຢ່າງເຕັມສ່ວນກ່ອນທີ່ຈະນໍາໃຊ້ຜະລິດຕະພັນດັ່ງກ່າວ.
ການບໍ່ອ່ານຢ່າງຄົບຖ້ວນ ແລະປະຕິບັດຕາມຄໍາແນະນໍາທັງໝົດທີ່ມີຢູ່ໃນນີ້ຢ່າງຈະແຈ້ງ ອາດສົ່ງຜົນໃຫ້ຜະລິດຕະພັນເສຍຫາຍ, ບາດເຈັບ, ລວມທັງຜູ້ໃຊ້ ຫຼືຜູ້ອື່ນ, ແລະຄວາມເສຍຫາຍຕໍ່ຄວາມເສຍຫາຍ. ສາມາດກັບຜະລິດຕະພັນ( S).
ILLUMINA ບໍ່ຖືວ່າມີຄວາມຮັບຜິດຊອບໃດໆທີ່ເກີດຂື້ນຈາກການໃຊ້ຜະລິດຕະພັນທີ່ບໍ່ເໝາະສົມທີ່ໄດ້ອະທິບາຍໄວ້ໃນນີ້ (ລວມທັງສ່ວນຂອງ ຫຼື ຊອບແວ).
© 2021 Illumina, Inc. ສະຫງວນລິຂະສິດທັງໝົດ.
ເຄື່ອງຫມາຍການຄ້າທັງຫມົດແມ່ນຊັບສິນຂອງ Illumina, Inc. ຫຼືເຈົ້າຂອງຂອງເຂົາເຈົ້າ. ສໍາລັບຂໍ້ມູນເຄື່ອງຫມາຍການຄ້າສະເພາະ, ເບິ່ງ
www.illumina.com/company/legal.html.

Local Run Manager CF 139-Variant 2.0 ຄູ່ມືການວິເຄາະການເຮັດວຽກຂອງໂມດູນ

ເກີນview

ໂມດູນການວິເຄາະຂອງຜູ້ຈັດການແລ່ນທ້ອງຖິ່ນ CF 139-Variant 2.0 ແມ່ນໃຊ້ກັບ TruSight Cystic Fibrosis 139-Variant Assay. ການວິເຄາະກວດພົບ 139 ທີ່ກ່ຽວຂ້ອງທາງດ້ານຄລີນິກ ການກາຍພັນທີ່ເຮັດໃຫ້ເກີດການກາຍພັນທີ່ເຮັດໃຫ້ເກີດພະຍາດ cystic fibrosis ແລະຕົວແປຂອງ genes cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) ໃນ DNA genomic ທີ່ແຍກອອກຈາກຕົວຢ່າງເລືອດທັງຫມົດ peripheral ຂອງມະນຸດ. ໂມດູນການວິເຄາະປະຕິບັດການວິເຄາະຂັ້ນສອງແລະການສ້າງບົດລາຍງານຈາກການແລ່ນລໍາດັບທີ່ໃຊ້ TruSight Cystic Fibrosis. ເບິ່ງຊຸດໃສ່ຊຸດ TruSight Cystic Fibrosis (ເອກະສານ # 1000000097720).
ໂມດູນການວິເຄາະປະເມີນພາກພື້ນສັ້ນຂອງ ampDNA lified, ຫຼື amplicons, ສໍາລັບ variants. ສຸມໃສ່ການຈັດລໍາດັບຂອງ amplicons ເຮັດໃຫ້ການຄຸ້ມຄອງສູງຂອງພາກພື້ນໂດຍສະເພາະໃນທົ່ວຈໍານວນຂະຫນາດໃຫຍ່ຂອງ samples.
ກ່ຽວກັບຄູ່ມືນີ້
ຄູ່ມືນີ້ໃຫ້ຄໍາແນະນໍາສໍາລັບການຕັ້ງຄ່າຕົວກໍານົດການແລ່ນສໍາລັບລໍາດັບແລະການວິເຄາະສໍາລັບໂມດູນການວິເຄາະ CF 139-Variant 2.0. ການ​ນໍາ​ໃຊ້​ຊອບ​ແວ​ຮຽກ​ຮ້ອງ​ໃຫ້​ມີ​ຄວາມ​ຮູ້​ພື້ນ​ຖານ​ຂອງ​ລະ​ບົບ​ປະ​ຕິ​ບັດ​ການ Windows ໃນ​ປະ​ຈຸ​ບັນ​ແລະ​ web ການໂຕ້ຕອບຜູ້ໃຊ້ທີ່ອີງໃສ່ຕົວທ່ອງເວັບ. ສໍາລັບຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບ dashboard Local Run Manager ແລະການຕັ້ງຄ່າລະບົບ, ເບິ່ງ Local Run Manager Software Reference Guide ສໍາລັບ MiSeqDx
(ເອກະສານ #1000000011880).
ໃສ່ຂໍ້ມູນການດໍາເນີນການ

ກໍານົດພາລາມິເຕີ

1. ເຂົ້າສູ່ລະບົບ Local Run Manager.
2. ເລືອກ Create Run, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນເລືອກ CF 139-Variant 2.0.
3. ໃສ່ຊື່ແລ່ນທີ່ລະບຸການແລ່ນຈາກການຈັດລໍາດັບຜ່ານການວິເຄາະ.
   ໃຊ້ຕົວອັກສອນທີ່ເປັນຕົວເລກ, ຍະຫວ່າງ, ຂີດກ້ອງ ຫຼື ຂີດຕໍ່ (40 ຕົວອັກສອນ ຫຼືໜ້ອຍກວ່າ).
4. [ທາງເລືອກ] ໃສ່ຄຳອະທິບາຍການແລ່ນ.
   ໃຊ້ຕົວອັກສອນທີ່ເປັນຕົວເລກ, ຍະຫວ່າງ, ຂີດກ້ອງ ຫຼື ຂີດຕໍ່ (150 ຕົວອັກສອນ ຫຼືໜ້ອຍກວ່າ).
5. ໃສ່ຈໍານວນ lots ແລະວັນຫມົດອາຍຸສໍາລັບຊຸດການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ.
   ລະບຸ Samples ສໍາລັບການດໍາເນີນງານ
   ລະບຸ samples ສໍາລັບການແລ່ນໂດຍໃຊ້ຫນຶ່ງໃນທາງເລືອກຕໍ່ໄປນີ້.
   •  ໃສ່ samples ດ້ວຍຕົນເອງ—ໃຊ້ຕາຕະລາງເປົ່າຢູ່ໃນໜ້າຈໍ Create Run. ແນະນໍາ sample wells ແມ່ນເນັ້ນໃສ່.
   • ນໍາເຂົ້າ samples—ນຳທາງໄປຫາພາຍນອກ file ໃນຮູບແບບຄ່າທີ່ຂັ້ນດ້ວຍເຄື່ອງໝາຍຈຸດ (*.csv). ແມ່ແບບມີໃຫ້ດາວໂຫຼດຢູ່ໃນໜ້າຈໍສ້າງການແລ່ນ.

ເຂົ້າ Samples ດ້ວຍຕົນເອງ

1. ກະລຸນາໃສ່ s ເປັນເອກະລັກample ຊື່ Sample ຊື່ພາກສະຫນາມ.
   ໃຊ້ຕົວອັກສອນທີ່ເປັນຕົວເລກ, ຂີດຕໍ່ ຫຼື ຂີດກ້ອງ (40 ຕົວອັກສອນ ຫຼືໜ້ອຍກວ່າ).
2. ຄລິກຂວາແລະເລືອກການຄວບຄຸມທາງບວກແລະລົບ samples.
   ເພື່ອຊ່ວຍປະຢັດການແລ່ນ, ມັນຕ້ອງມີການຄວບຄຸມທາງບວກແລະທາງລົບຢ່າງຫນ້ອຍຫນຶ່ງອັນ.
3.  [ທາງເລືອກ] ກະລຸນາໃສ່ເປັນample ລາຍ​ລະ​ອຽດ​ໃນ sample ແຖບຄໍາອະທິບາຍ.
   ໃຊ້ຕົວອັກສອນທີ່ເປັນຕົວເລກ, ຂີດຕໍ່ ຫຼື ຂີດກ້ອງ (50 ຕົວອັກສອນ ຫຼືໜ້ອຍກວ່າ).
4.  [ທາງເລືອກ] ເລືອກອະແດບເຕີ Index 1 ຈາກລາຍການແບບເລື່ອນລົງ Index 1 (i7).
   ຂັ້ນ​ຕອນ​ນີ້​ເປັນ​ທາງ​ເລືອກ​ເພາະ​ວ່າ i7 ແລະ i5 ດັດ​ຊະ​ນີ​ປະ​ສົມ​ອັດ​ຕະ​ໂນ​ມັດ​ທີ່​ມີ​ຮູບ​ແບບ​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​.
5.  [ທາງເລືອກ] ເລືອກອະແດບເຕີ Index 2 ຈາກລາຍການແບບເລື່ອນລົງ Index 2 (i5).
   ຂັ້ນ​ຕອນ​ນີ້​ເປັນ​ທາງ​ເລືອກ​ເພາະ​ວ່າ i7 ແລະ i5 ດັດ​ຊະ​ນີ​ປະ​ສົມ​ອັດ​ຕະ​ໂນ​ມັດ​ທີ່​ມີ​ຮູບ​ແບບ​ເລີ່ມ​ຕົ້ນ​.
6. ເລືອກໄອຄອນພິມເພື່ອສະແດງຮູບແບບແຜ່ນ.
7. ເລືອກພິມເພື່ອພິມຮູບແບບແຜ່ນເປັນເອກະສານອ້າງອີງສໍາລັບການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ.
8. [ທາງເລືອກ] ເລືອກສົ່ງອອກເພື່ອສົ່ງອອກ sample ຂໍ້​ມູນ file.
9. ເລືອກ Save Run.
   ຖ້າຫນ້ອຍກວ່າ 24 samples ໄດ້​ເຂົ້າ​ໄປ​, ບໍ່​ພຽງ​ພໍ S​ampປ່ອງຢ້ຽມຈະສະແດງ. ເລືອກດໍາເນີນການເພື່ອສືບຕໍ່, ຫຼືເລືອກຍົກເລີກເພື່ອແກ້ໄຂ samples.

ຂໍ້ຄວນລະວັງ
ດໍາເນີນການກັບຫນ້ອຍກວ່າ 24 samples ບໍ່ໄດ້ຖືກກວດສອບໂດຍ Illumina. ເບິ່ງ TruSight Cystic Fibrosis Package Insert (ເອກະສານ #1000000097720) ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ.

ນໍາເຂົ້າ Samples
Sample ຂໍ້ມູນຂ່າວສານສາມາດໄດ້ຮັບການນໍາເຂົ້າຈາກສອງປະເພດຂອງ files:

• A sample ຂໍ້​ມູນ file ທີ່ຖືກສົ່ງອອກໃນເມື່ອກ່ອນຈາກໂມດູນ CF 139-Variant 2.0 ໂດຍໃຊ້ຄຸນສົມບັດການສົ່ງອອກ.
• ແມ່ແບບ file, ເຊິ່ງສາມາດສ້າງໄດ້ໂດຍການເລືອກ Template ໃນຫນ້າຈໍ Create Run. ແມ່ແບບ file ປະກອບມີຫົວຂໍ້ຖັນທີ່ຖືກຕ້ອງສໍາລັບການນໍາເຂົ້າ, ດ້ວຍຂໍ້ມູນຕົວຍຶດໃນແຕ່ລະຖັນ. ໃຊ້ຕົວແກ້ໄຂພາຍນອກເພື່ອປັບແຕ່ງແມ່ແບບ file:
• ຕື່ມ sample ຂໍ້​ມູນ​ສໍາ​ລັບ​ແຕ່​ລະ s​ample ໃນການແລ່ນ.
• ເມື່ອທັງຫມົດ sample ຂໍ້​ມູນ​ໄດ້​ຮັບ​ການ​ເພີ່ມ​, ລຶບ​ຂໍ້​ມູນ​ຕົວ​ຍຶດ​ທີ່​ຍັງ​ເຫຼືອ​ໃນ​ຈຸ​ລັງ​ທີ່​ບໍ່​ໄດ້​ນໍາ​ໃຊ້​.
• ບັນທຶກແມ່ແບບ file.

ການ​ນໍາ​ເຂົ້າ sampຂໍ້​ມູນ​:

1. ເລືອກການນໍາເຂົ້າ Samples, ແລະຫຼັງຈາກນັ້ນທ່ອງໄປຫາ file ແລະເລືອກມັນ.
2. ເລືອກໄອຄອນພິມເພື່ອສະແດງຮູບແບບແຜ່ນ.
3. ເລືອກພິມເພື່ອພິມຮູບແບບແຜ່ນເປັນເອກະສານອ້າງອີງສໍາລັບການກະກຽມຫ້ອງສະຫມຸດ.
4. [ທາງເລືອກ] ເລືອກສົ່ງອອກເພື່ອສົ່ງອອກ sampຂໍ້ມູນຂ່າວສານໄປສູ່ພາຍນອກ file.
5. ເລືອກ Save Run.
   ຖ້າຫນ້ອຍກວ່າ 24 samples ໄດ້​ເຂົ້າ​ໄປ​, ບໍ່​ພຽງ​ພໍ S​ampປ່ອງຢ້ຽມຈະສະແດງ. ເລືອກດໍາເນີນການເພື່ອສືບຕໍ່, ຫຼືເລືອກຍົກເລີກເພື່ອແກ້ໄຂ samples.

ຂໍ້ຄວນລະວັງ
ດໍາເນີນການກັບຫນ້ອຍກວ່າ 24 samples ບໍ່ໄດ້ຖືກກວດສອບໂດຍ Illumina. ເບິ່ງ TruSight Cystic Fibrosis Package Insert (ເອກະສານ #1000000097720) ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມ.

ແກ້ໄຂການແລ່ນ

ສໍາລັບຄໍາແນະນໍາກ່ຽວກັບການດັດແກ້ຂໍ້ມູນໃນການແລ່ນຂອງທ່ານກ່ອນທີ່ຈະຈັດລໍາດັບ, ເບິ່ງ Local Run Manager
ຄູ່ມືການອ້າງອິງຊອບແວສໍາລັບ MiSeqDx (ເອກະສານ # 1000000011880).
ວິທີການວິເຄາະ
ສໍາລັບລາຍລະອຽດຂອງວິທີການວິເຄາະ TruSight Cystic Fibrosis, ເບິ່ງຊຸດໃສ່ຊຸດ TruSight Cystic Fibrosis (ເອກະສານ # 1000000097720).
View ແລ່ນແລະຜົນໄດ້ຮັບ

1. ຈາກໜ້າຈໍຫຼັກຂອງ Local Run Manager, ຄລິກທີ່ຊື່ແລ່ນ.
2. ຈາກ Run Overview ແຖບ, review metrics ການແລ່ນລໍາດັບ.
3. [ທາງເລືອກ] ເລືອກໄອຄອນ Copy to Clipboard ເພື່ອສຳເນົາເສັ້ນທາງໂຟເດີທີ່ເຮັດວຽກອອກ.
4. ເລືອກແຖບຂໍ້ມູນການຈັດລໍາດັບເພື່ອ review ແລ່ນພາລາມິເຕີແລະຂໍ້ມູນການບໍລິໂພກ.
5. ເລືອກ Samples ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບໄປຫາ view ຜົນ​ການ​ວິ​ເຄາະ​.
   ແຖບສະຫນອງເປັນample ບັນຊີລາຍຊື່ທີ່ສະຫຼຸບອັດຕາການໂທ, ການປະຕິບັດ, ແລະຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບການຄວບຄຸມ.
   ຖ້າການວິເຄາະແມ່ນຊ້ໍາກັນ, ຂະຫຍາຍລາຍການແບບເລື່ອນລົງ Select Analysis ແລະເລືອກການວິເຄາະທີ່ເຫມາະສົມ.
6. [ທາງເລືອກ] Double-click the comment field to enter a comment about asample ໃນບັນຊີລາຍຊື່. ກົດບັນທຶກການປ່ຽນແປງ.
7. ເລືອກ samples ໃນບັນຊີລາຍຊື່ເພື່ອສະແດງຂໍ້ມູນຕົວແປລາຍລະອຽດ. ສample variant ຂໍ້​ມູນ​ສະ​ແດງ​ຂ້າງ​ລຸ່ມ​ນີ້ s​ampບັນຊີລາຍຊື່.
   ໝາຍເຫດ ແຕ່ລະຄັ້ງທີ່ມີການປ່ຽນແປງ, ຜົນໄດ້ຮັບການວິເຄາະ file ຈະຖືກສ້າງຂື້ນໃນໂຟນເດີການຈັດຮຽງ. ນີ້ file ປະກອບມີເວລາ stamp ຕື່ມໃສ່ກັບ file ຊື່, ດ້ວຍຮູບແບບ YYMMDD_HHMMSS.

ສໍາລັບຂໍ້ມູນເພີ່ມເຕີມກ່ຽວກັບ Run Overview ແລະການຈັດລໍາດັບແຖບຂໍ້ມູນ, ແລະວິທີການວິເຄາະຄິວຄືນ, ເບິ່ງຄູ່ມືການອ້າງອິງຊອບແວຜູ້ຈັດການແລ່ນທ້ອງຖິ່ນສໍາລັບ MiSeqDx (ເອກະສານ #
1000000011880).

ຂໍ້ມູນການຕິດຕາມຫຼາຍ File
ເມື່ອການວິເຄາະສໍາເລັດ, ເລືອກຫນຶ່ງໃນທາງເລືອກຕໍ່ໄປນີ້ເພື່ອ view LotTracking.txt file.

• ຈາກ Sample ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບ, ໃຫ້ຄລິກໃສ່ສົ່ງອອກຂໍ້ມູນການຕິດຕາມຈໍານວນຫລາຍ.
• ເປີດ file ຢູ່ໃນໂຟນເດີການຈັດຮຽງ.
  ເສັ້ນທາງໄປຫາໂຟເດີ Alignment ແມ່ນສະແດງຢູ່ໃນ Samples ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບໃນ Folder ການວິເຄາະ.
• [ທາງເລືອກ] ເລືອກໄອຄອນ Copy to Clipboard ເພື່ອສຳເນົາເສັ້ນທາງໂຟນເດີການວິເຄາະ.

ເມື່ອການວິເຄາະສໍາເລັດ, ຂໍ້ມູນການຕິດຕາມຈໍານວນຫລາຍ file ຖືກຂຽນໃສ່ໂຟເດີ Alignment ສໍາລັບການແລ່ນ. ຕົວຢ່າງample: MiSeqAnalysis\ \Alignment_N\YYMMDD_HHMMSS. N ແມ່ນຕົວເລກຕາມລໍາດັບທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນຖ້າການວິເຄາະຖືກຖາມຄືນ. YYMMDD_HHMMSS ແມ່ນເວລາທີ່ສຸດamp ຂອງການແລ່ນ.

ລາຍງານຜົນໄດ້ຮັບ

ຫຼັງຈາກການວິເຄາະຂັ້ນສອງສໍາເລັດ, ຜົນໄດ້ຮັບການວິເຄາະແມ່ນສະຫຼຸບກ່ຽວກັບ Samples ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບ. ຜົນ​ການ​ວິ​ເຄາະ (ຜົນ​ຜະ​ລິດ​) file ສໍາລັບການວິເຄາະຍັງສະຫຼຸບຜົນໄດ້ຮັບໃນຂໍ້ຄວາມທີ່ຂັ້ນດ້ວຍແຖບດຽວ file ເອີ້ນວ່າ TruSightCF139VariantAssay.txt.
ຜົນໄດ້ຮັບໃນການວິເຄາະຜົນໄດ້ຮັບ file ລວມ​ເຖິງ​ຂໍ້​ມູນ​ທີ່​ພົບ​ເຫັນ​ຢູ່​ໃນ S ໄດ້​ample ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບ. ເລືອກຫນຶ່ງໃນທາງເລືອກຕໍ່ໄປນີ້ເພື່ອ view ຜົນ​ການ​ວິ​ເຄາະ​ file TruSightCF139VariantAssay.txt:

• ຈາກ Sample ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບ, ຄລິກ Export Data.
• ເປີດ file ຢູ່ໃນໂຟນເດີການຈັດຮຽງ.
  ເສັ້ນທາງໄປຫາໂຟເດີ Alignment ແມ່ນສະແດງຢູ່ໃນ Folder ການວິເຄາະຂອງ Samples ແລະແຖບຜົນໄດ້ຮັບ.

ໝາຍເຫດ
ເລືອກໄອຄອນ Copy to Clipboard ເພື່ອສຳເນົາເສັ້ນທາງໂຟນເດີການວິເຄາະ.
ການວິເຄາະ files ສໍາລັບແຕ່ລະໄລຍະ sequencing ຖືກເກັບໄວ້ໃນເຄື່ອງມື, ມີ files ບັນ​ທຶກ​ໄວ້​
MiSeqAnalysis\ \Data\Intensities\BaseCalls ແລະ MiSeqAnalysis\
ຊື່>\Alignment_N\YYMMDD_HHMMSS. N ແມ່ນຕົວເລກຕາມລໍາດັບທີ່ເພີ່ມຂຶ້ນຖ້າການວິເຄາະຖືກຖາມຄືນ. YYMMDD_HHMMSS ແມ່ນເວລາທີ່ສຸດamp ຂອງການແລ່ນ.

ຜົນການວິເຄາະ File ຂໍ້ມູນ
ຜົນການວິເຄາະ file TruSightCF139VariantAssay.txt ປະກອບມີສາມພາກ: the file ສ່ວນຫົວ, sample ຂໍ້​ມູນ, ແລະ sample variants ຂໍ້ມູນ. ໄດ້ file header ແມ່ນລາຍຊື່ທໍາອິດ, ແລະປະກອບມີຂໍ້ມູນທົ່ວໄປກ່ຽວກັບການແລ່ນ. ໃຫ້ສັງເກດວ່າມີພຽງແຕ່ຫນຶ່ງ file ຫົວຕໍ່ແລ່ນ. ໃນທາງກົງກັນຂ້າມ, sample ຂໍ້​ມູນ​ແລະ sampຂໍ້ມູນ variants ແມ່ນລວມສໍາລັບທຸກໆ sampນໍາໃຊ້ໃນການວິເຄາະ. ພາກສ່ວນເຫຼົ່ານີ້ຖືກຈັບຄູ່ກັນສໍາລັບແຕ່ລະ sampເລ.
ຕາຕະລາງຕໍ່ໄປນີ້ໃຫ້ລາຍລະອຽດຂອງແຕ່ລະແຖວໃນ file header, ເຊິ່ງລວມມີຂໍ້ມູນກ່ຽວກັບການແລ່ນ:
ຕາຕະລາງ 1 File ສ່ວນຫົວ (ຂໍ້ມູນການແລ່ນ)

• ການທົດສອບອະທິບາຍການທົດສອບທີ່ໄດ້ປະຕິບັດ. ແລ່ນ ID ແລ່ນ ID ທີ່ຖືກສ້າງຂື້ນໂດຍ MiSeq Operating Software (MOS) ໃນຕອນເລີ່ມຕົ້ນຂອງການແລ່ນລໍາດັບ.
• Run Date Date (YYMMDD) ທີ່ການແລ່ນຕາມລຳດັບແມ່ນເລີ່ມຕົ້ນໃນ MOS.
• ເວີຊັ່ນການວິເຄາະຊອບແວທີ່ໃຊ້ໃນການວິເຄາະ.

ຕາຕະລາງຕໍ່ໄປນີ້ໃຫ້ລາຍລະອຽດຂອງແຕ່ລະແຖວໃນ sample ພາກສ່ວນຂໍ້ມູນ: ຕາຕະລາງ 2 Sample ຂໍ້​ມູນ

• Sample ID The sample ຊື່ທີ່ສະຫນອງໃຫ້ໃນເວລາທີ່ການແລ່ນໄດ້ຖືກສ້າງຂື້ນ, ສົມທົບກັບ ID ການວິເຄາະທີ່ຖືກມອບຫມາຍໂດຍຊອບແວ Local Run Manager. ຖ້າ​ຫາກ​ວ່າ​ທ່ານ​ຮຽກ​ຮ້ອງ​ໃຫ້​ການ​ແລ່ນ​, s​ample ຊື່ສ່ວນຫນຶ່ງຂອງ Sample ID ຢູ່ຄືກັນ, ໃນຂະນະທີ່ ID ການວິເຄາະປ່ຽນແປງ.
• ຊ່ອງຂໍ້ມູນນີ້ແມ່ນຢູ່ໃນ *.txt file ເທົ່ານັ້ນ.
  Sample ຊື່ The sample ຊື່ສະຫນອງໃຫ້ໃນເວລາທີ່ແລ່ນໄດ້ຖືກສ້າງຂຶ້ນ.

ຕາຕະລາງຕໍ່ໄປນີ້ໃຫ້ລາຍລະອຽດຂອງແຕ່ລະຖັນໃນ sample variants sections: ຕາຕະລາງ 3 Sample ຂໍ້ມູນຕົວແປ

ປະຫວັດການແກ້ໄຂ

• ເອກະສານວັນທີລາຍລະອຽດຂອງການປ່ຽນແປງ
• ເອກະສານ #1000000100945 v01 ສິງຫາ 2021 ອັບເດດທີ່ຢູ່ຜູ້ຕາງຫນ້າທີ່ໄດ້ຮັບອະນຸຍາດ EU.
• ເອກະສານ #1000000100945 v00 ທັນວາ 2019 ເປີດຕົວຄັ້ງທຳອິດ.

ການຊ່ວຍເຫຼືອດ້ານວິຊາການ

ສໍາລັບການຊ່ວຍເຫຼືອດ້ານວິຊາການ, ຕິດຕໍ່ Illumina Technical Support.

• Webເວັບໄຊ: www.illumina.com
• ອີເມວ: techsupport@illumina.com

ເບີໂທລະສັບຊ່ວຍເຫຼືອລູກຄ້າ Illumina

ພາກພື້ນ	ໂທຟຣີ	ພາກພື້ນ
ອາເມລິກາເຫນືອ	+1.800.809.4566
ອອສເຕຣເລຍ	+1.800.775.688
ອອສເຕຣຍ	+43 800006249	+43 19286540
ປະເທດແບນຊິກ	+32 80077160	+32 34002973
ຈີນ	400.066.5835
ເດນມາກ	+45 80820183	+45 89871156
ຟິນແລນ	+358 800918363	+358 974790110
ປະເທດຝຣັ່ງ	+33 805102193	+33 170770446
ເຢຍລະມັນ	+49 8001014940	+49 8938035677
ຮົງກົງ, ຈີນ	800960230
ໄອແລນ	+353 1800936608	+353 016950506
ອີຕາລີ	+39 800985513	+39 236003759
ຍີ່ປຸ່ນ	0800.111.5011
ເນເທີແລນ	+31 8000222493	+31 207132960
ນິວຊີແລນ	0800.451.650
ນໍເວ	+47 800 16836	+47 21939693
ສິງກະໂປ	+1.800.579.2745
ເກົາຫຼີ	+82 80 234 5300
ສະເປນ	+34 911899417	+34 800300143
ສວີເດນ	+46 850619671	+46 200883979
ສະວິດເຊີແລນ	+41 565800000	+41 800200442
ໄຕ້ຫວັນ, ຈີນ	00806651752
ສະຫະລາຊະອານາຈັກ	+44 8000126019	+44 2073057197
ປະເທດອື່ນໆ	+44.1799.534000

ແຜ່ນຂໍ້ມູນຄວາມປອດໄພ (SDSs)—ມີຢູ່ໃນ Illumina webສະຖານທີ່ຢູ່ support.illumina.com/sds.html. ເອກະສານຜະລິດຕະພັນ—ມີໃຫ້ດາວໂຫຼດຈາກ support.illumina.com.

ເອກະສານ / ຊັບພະຍາກອນ

illumina Local Run Manager CF 139-Variant 2.0 ຊອບແວໂມດູນການວິເຄາະ [pdf] ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້ Local Run Manager CF 139-Variant 2.0 Analysis Module, Software, Local Run Manager CF 139-Variant 2.0 Analysis Module Software

ເອກະສານອ້າງອີງ

• ຄູ່ມືຜູ້ໃຊ້