multichannel nga mga sistema IFB-C Interface Board Multiboot System User Manual

Ayaw pagbabag sa aparato o ibutang kini sa ibabaw sa ubang mga kagamitan nga nagpatunghag init.
Tugoti ang hustong sirkulasyon sa hangin palibot sa device.

Pag-instalar sa Software:

Sunda ang giya sa pag-install sa software nga gihatag sa tiggama.

Siguruha nga ang sistema nakab-ot ang minimum nga kinahanglanon alang sa pag-install sa software.
I-aktibo ang software gamit ang gihatag nga yawe sa lisensya o proseso sa pagpaaktibo.

Mga FAQ

P: Mahimo bang gamiton ang CMOS-MEA5000-System para sa medikal nga katuyoan?
- A: Dili, ang produkto wala gituyo alang sa medikal nga paggamit sa mga tawo. Gidisenyo kini alang sa panukiduki ug trabaho sa laboratoryo lamang.

P: Unsa ang akong buhaton kung makasugat ko og mga malfunction sa device?
- A: Kung makasinati ka og bisan unsang mga malfunction nga makaapekto sa kaluwasan, hunong dayon sa paggamit sa device ug kontaka ang mga kwalipikadong technician alang sa tabang.

P: Asa nako makit-an ang kasayuran sa garantiya ug responsibilidad alang sa produkto?
- A: Ang kinatibuk-ang kondisyon sa pagbaligya ug paghatod, ingon man ang garantiya ug liability nga impormasyon, makita online sa http://www.multichannelsystems.com/sites/multichannelsystems.com/files/documents/TermsandConditions.pdf

View Fullscreen

CMOS-MEA5000-System
MANUAL SA USER

CMOS-MEA5000-System · Publikasyon 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

IMPRINT
IMPRINT
Ang impormasyon niini nga dokumento mahimong mausab nga walay pahibalo. Walay bahin niini nga dokumento ang mahimong kopyahon o ipasa nga walay dayag nga sinulat nga pagtugot sa Multi Channel Systems MCS GmbH. Samtang ang matag pag-amping gihimo sa pag-andam niini nga dokumento, ang magmamantala ug ang tagsulat walay responsibilidad alang sa mga sayup o pagkawala, o alang sa mga kadaot nga resulta sa paggamit sa impormasyon nga anaa niini nga dokumento o gikan sa paggamit sa mga programa ug source code nga mahimong kuyog niini. Sa bisan unsa nga panghitabo ang magmamantala ug ang tagsulat mahimong manubag sa bisan unsang pagkawala sa ganansya o bisan unsang ubang komersyal nga kadaot nga gipahinabo o giingon nga direkta o dili direkta nga gipahinabo niini nga dokumento.
© 2022 Multi Channel Systems MCS GmbH. Tanang katungod gigahin.
Gipatik: 13.07.2022
Multi Channel Systems MCS GmbH Aspenhaustraße 21 72770 Reutlingen Germany Telepono +49-71 21-909 25 – 0 Fax +49-71 21-909 25 -11 sales@multichannelsystems.com www.multichannelsystems.com
Ang Microsoft ug Windows kay mga rehistradong marka sa pamatigayon sa Microsoft Corporation. Ang mga produkto nga gitumong niini nga dokumento mahimong mga marka sa pamatigayon ug/o mga rehistradong marka sa pamatigayon sa ilang tagsa-tagsa ka mga naghupot ug kinahanglan nga matikdan nga ingon niana. Ang magmamantala ug ang tagsulat walay pag-angkon niini nga mga marka sa pamatigayon.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

KALIGTASAN UG WARRANTY

IMPORTANTE NGA TAMBAG SA KALIGTASAN

Pasidaan: Siguroha nga basahon ang mosunod nga tambag sa dili pa i-install o gamiton ang device ug ang software. Kung dili nimo matuman ang tanan nga mga kinahanglanon nga gipahayag sa ubos, mahimo’g mosangput kini sa mga malfunction o pagkaguba sa konektado nga hardware, o bisan sa makamatay nga kadaot.
Pasidaan: Sunda kanunay ang mga lagda sa lokal nga mga regulasyon ug balaod. Ang mga kwalipikado nga kawani lamang ang kinahanglan nga tugutan sa paghimo sa mga buluhaton sa laboratoryo. Pagtrabaho sumala sa maayo nga praktis sa laboratoryo aron makuha ang labing kaayo nga mga sangputanan ug aron maminusan ang mga peligro.
Ang produkto gitukod sa state of the art ug subay sa giila nga safety engineering rules.
Ang aparato mahimo ra
gamiton alang sa gituyo nga katuyoan; gamiton kung naa sa hingpit nga kahimtang.
Ang dili husto nga paggamit mahimong mosangput sa grabe, bisan ang makamatay nga kadaot sa tiggamit o ikatulo nga partido ug kadaot sa aparato mismo o uban pang materyal nga kadaot.
Pasidaan: Ang device ug ang software wala gituyo alang sa medikal nga gamit ug kinahanglang dili gamiton sa mga tawo. Ang MCS walay responsibilidad sa bisan unsang kaso sa paglapas.
Ang mga malfunction nga makadaut sa kaluwasan kinahanglan nga tul-iron dayon.
Grounding
Kini nga produkto gi-ground pinaagi sa grounding conductor sa power cord. Aron malikayan ang electric shock, ang grounding conductor kinahanglan nga konektado sa yuta.
I-orient ang Equipment sa hustong paagi
Ayaw i-orient ang ekipo aron lisod ang pagdumala sa disconnection device.
Taas nga Voltage
Ang mga kable sa elektrisidad kinahanglan nga husto nga ibutang ug i-install. Ang gitas-on ug kalidad sa mga pisi kinahanglan nga nahiuyon sa lokal nga mga probisyon.
Ang mga kwalipikado nga teknisyan lamang ang mahimong magtrabaho sa sistema sa elektrisidad. Mahinungdanon nga ang mga regulasyon sa paglikay sa aksidente ug ang sa mga asosasyon sa liability sa mga tag-iya gisunod.
· Matag higayon sa dili pa magsugod, siguroha nga ang suplay sa kuryente nahiuyon sa mga detalye sa produkto. · Susiha ang kable sa kuryente kung adunay kadaot sa matag higayon nga mausab ang site. Ang nadaot nga mga kable sa kuryente kinahanglang ilisan dayon ug
mahimong dili na magamit pag-usab.
· Susiha ang mga lead alang sa kadaot. Ang nadaot nga mga tingga kinahanglang ilisan dayon ug dili na magamit pag-usab. · Ayaw pagsulay sa pagsal-ot sa bisan unsa nga mahait o metal ngadto sa mga buho o sa case. · Ang mga likido mahimong hinungdan sa mga short circuit o uban pang kadaot. Kanunay nga mamala ang aparato ug ang mga kable sa kuryente. Ayaw kini pagdumala sa basa
mga kamot.
Mga Kinahanglanon alang sa Pag-instalar
Siguruha nga ang aparato dili mahayag sa direkta nga adlaw. Ayaw ibutang ang bisan unsa sa ibabaw sa device, ug ayaw ibutang kini sa ibabaw sa laing device nga nagpatunghag kainit, aron ang hangin maka-circulate nga gawasnon.
Pagpatin-aw sa Simbolo nga gigamit

Pagbantay / Pasidaan

DC, direkta nga kasamtangan

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

KALIGTASAN UG WARRENTY
Garantiya ug Liability
Ang kinatibuk-ang kondisyon sa pagbaligya ug paghatud sa Multi Channel Systems MCS GmbH kanunay nga magamit.
Makita kini online sa http://www.multichannelsystems.com/sites/multichannelsystems.com/files/documents/Terms and Conditions.pdf Multi Channel Systems MCS GmbH walay garantiya sa pagkasibu sa bisan unsa ug sa tanang pagsulay ug datos nga namugna pinaagi sa paggamit sa device o sa software. Anaa sa tiggamit ang paggamit sa maayo nga praktis sa laboratoryo aron maestablisar ang pagkabalido sa iyang mga nahibal-an.
Ang mga pag-angkon sa garantiya ug liability kung adunay kadaot o materyal nga kadaot dili iapil kung kini resulta sa usa sa mga musunud:
· Dili husto nga paggamit sa aparato. · Dili husto nga pag-instalar, pag-commissioning, operasyon o pagmentinar sa device. · Pag-operate sa aparato kung ang kahilwasan ug proteksyon nga mga aparato adunay depekto ug/o dili magamit. · Ang dili pagsunod sa mga panudlo sa manwal bahin sa transportasyon, pagtipig, pag-instalar, pag-commissioning, operasyon
o pagmentinar sa device.
· Dili awtorisado nga mga pagbag-o sa istruktura sa aparato. · Dili awtorisado nga mga pagbag-o sa mga setting sa sistema. · Dili igo nga pag-monitor sa mga sangkap sa aparato nga gisul-ob. · Dili husto nga pagpatuman ug dili awtorisado nga pag-ayo. · Dili awtorisado nga pag-abli sa aparato o sa mga sangkap niini. · Makadaot nga mga panghitabo tungod sa epekto sa langyaw nga mga lawas o mga buhat sa Diyos.
Mga Obligasyon sa Operator
Obligado ang operator nga tugutan lamang ang mga tawo nga magtrabaho sa aparato, kinsa
· pamilyar sa kaluwasan sa trabaho ug mga regulasyon sa paglikay sa aksidente ug gitudloan unsaon paggamit ang device; · mga propesyonal nga kwalipikado o adunay espesyalista nga kahibalo ug pagbansay ug nakadawat mga panudlo sa paggamit sa aparato; · nakabasa ug nakasabut sa kapitulo sa kaluwasan ug sa mga instruksyon sa pasidaan niini nga manwal ug nagpamatuod niini uban sa ilang
pirma.
Kinahanglan nga bantayan kanunay nga ang mga operating personnel nagtrabaho nga luwas. Ang mga personahe nga nagpadayon sa pagbansay mahimo lamang nga magtrabaho sa aparato ubos sa pagdumala sa usa ka eksperyensiyado nga tawo.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

PASIUNA

PASIUNA Welcome sa CMOS-MEA5000-System
Ang Multi Channel Systems mapasigarbuhon nga ipresentar ang CMOS-MEA5000-System. Pinasukad sa komplementaryong metal-oxide semiconductor nga teknolohiya, kini nagbukas sa bag-ong mga posibilidad sa electrophysiological research. Uban sa labaw pa sa 4000 recording sites, matag usa kanila sampgipangulohan sa hangtod sa 25 kHz, ang chip nagtugot sa extracellular recording sa taas kaayo nga spatio-temporal nga resolusyon. Pinaagi sa paglakip amplification sa chip mismo, ang kasaba maminusan ug ang taas nga kalidad sa signal gigarantiyahan. Ang stimulation gihatag pinaagi sa 1024 stimulation sites nga gilakip sa chip ug ang stimulus generator sa mga ulo.tage. Ang CMOS-MEA5000-System naglangkob sa tulo ka mga sangkap, nga ang tanan gidisenyo aron mahimong episyente ug gamhanan, samtang nagmintinar og gamay nga footprint. CMOS-Chip Ang chip gibase sa complementary metal oxide semiconductor (CMOS) nga teknolohiya, nga nagpasayon sa paspas, taas nga resolusyon nga imaging sa electrical activity. Ang chip nasangkapan sa usa ka kultura o slice chamber aron ibutang ang imong sample, samtang gitugotan ang paggamit sa usa ka mikroskopyo. Mga ulotage Ang kinauyokan sa sistema mao ang mga ulotage. Kini samplets ang data gikan sa chip sa 25 kHz kada channel. Gawas sa pagkakabig sa A/D ug ampliification, ang mga ulotage usab adunay usa ka three-channel stimulator. Mahimo nimong gawasnon ang pagdesinyo sa mga pattern sa pagpadasig pinaagi sa software ug pagpili sa matag usa sa 1024 nga mga site sa pagpadasig. Interface Board Ang interface board IFB-C nagtanyag sa USB 3.0 interface aron ibalhin ang narekord nga datos ngadto sa kompyuter. Dugang pa, kini adunay analog ug digital in- ug mga output alang sa pag-synchronize sa ubang mga instrumento. Ikonektar ang mga ulotage pinaagi sa iX cable ngadto sa interface board. Ikonektar ang interface board pinaagi sa USB-C cable ngadto sa data acquisition computer. Ikonektar ang interface board sa power outlet. Ground ang interface board kon gikinahanglan. Palihug gamita ang ground socket sa likod nga panel sa IFB-C. Kompyuter nga adunay Software Ang software nga CMOS-MEA-Control ug CMOS-MEA-Tools espesipikong giprograma para sa CMOS-MEA5000-System. Gipadali niini ang usa ka real-time nga kalihokan nga mataposview sa kompleto nga chip nga adunay abilidad sa pag-zoom in ug lain-laing mga himan sa pag-analisar sa datos.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE

HARDWARE Ulotage
Adunay tulo ka mga sangkap sa hardware alang sa CMOS-MEA5000-System nga magamit, ang mga ulotage, ang interface board ug ang data acquisition computer. Kung gikinahanglan, mahimo nimong gamiton ang usa ka tigkontrol sa temperatura nga dugang. Para sa pag-set up ug pagkonektar sa CMOS-MEA5000-System, palihog basaha ang sunod nga kapitulo “Hardware Setup” sa pahina 14. Ang mga ulohantagesamples data gikan sa 4225 sensors sa chip sa 25 kHz kada channel. Gawas sa pagkakabig sa A/D ug ampliification, ang mga ulotage usab adunay usa ka three-channel stimulator. Mahimo nimong gawasnon nga magdesinyo ug tulo ka mga pattern sa pagpadasig pinaagi sa software ug pilion ang matag usa sa 1024 nga mga site sa pagpukaw. Ang pagbalhin sa datos gihatag pinaagi sa iX cable gikan sa mga ulotage sa interface board. Ang koneksyon sa USB-C cable naghan-ay sa paspas nga pagbalhin sa data gikan sa interface board ngadto sa data acquisition computer. Ikonektar ang usa ka tigkontrol sa temperatura nga TC sa mga ulotage, kung gikinahanglan. Isulod ang test model probe o ang CMOS-MEA-Chip sa saktong orientasyon sa gihatag nga lugar sa mga ulo.tage. Ang lingin nga ngilit sa probe o MEA kinahanglan nga naa sa atubangan sa wala nga bahin, kung direkta nga nagtan-aw sa bukas nga mga ulo.tage. Niining paagiha ang CMOS-Control software nagpakita sa mga electrodes sa mga kolum ug mga laray sama sa gipakita sa laraw sa ubos. Ang Electrode No 1 gibutang sa wala nga ubos nga round edge sa chip ug ang electrode No 4225 gibutang sa ibabaw nga tuo nga ngilit.
Orientasyon sa Chip sa sulod sa mga Ulotage Kung nagpukaw ka gamit ang kahayag o dugang nga mga electrodes gikan sa gawas sa chip, o kung ang orientasyon sa tisyu hinungdanon, palihug hinumdomi nga ang linya sa panan-aw gikan sa mga ulotage kilid diin nahimutang ang connector sa IFB.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE
CMOS-MEA Chip

Ang chip gibase sa complementary metal oxide semiconductor (CMOS) nga teknolohiya, nga nagpadali sa paspas, high-resolution nga imaging sa electrical activity. Ang chip nasangkapan sa usa ka lawak sa kultura aron ibutang ang imong sample, samtang gitugotan ang paggamit sa usa ka mikroskopyo.
Ang CMOS-MEA array kay usa ka aktibong device, sukwahi sa passive MEAs. Kinahanglan nga kini i-power up ug down sa hustong paagi, o kini madaot.
Pasidaan: Sa dili pa ablihan ang mga ulo sa CMOS-MEAtage alang sa pagtangtang sa CMOS-MEA chip, gikinahanglan nga paluyahon ang chip, kung dili ang chip malaglag!
Ang mga han-ay sa sensor sa CMOS sensitibo sa kahayag. Atol sa pagrekord ang mga sensor kinahanglan kanunay nga kahimtang sa kahayag. Kini dali nga makuha pinaagi sa pagtabon sa CMOS array sa usa ka angay nga mangitngit nga lawak "CMOS-DC".

CMOS-DC

CMOS-TH

Palihug gamita ang CMOS tissue holder nga "CMOS-TH" aron mapadayon ang mga acute slices sa lugar. Anaa alang sa CMOS-MEA chip SCG ug CCM.

Ang CMOS-MEA chip adunay 65 x 65 nga layout ug anaa sa 16 m o 32 m interelectrode nga distansiya (sentro ngadto sa sentro). Ang diametro sa electrode kanunay nga 8 m. Taliwala sa mga electrodes sa pagrekord, adunay usa ka grid nga 32 x 32 nga mas dako nga mga site sa pagpukaw. Sa pag-summarize, mahimo nimong irekord gikan sa 4225 nga mga electrodes ug pukawon ang imong sampsa 1024 nga mga site. Ang chip adunay sapaw sa usa ka planar oxide, susama sa bildo, pagpaayo
ang biocompatibility ug biostability. Palihug tan-awa ang electron micrograph sa CMOS-MEA chip surface (NMI Reutlingen, Germany) ug
ang schema sa chip sa ubos.

Ang 16 m interelectrode distance chip nagtanyag sa labing taas nga resolusyon. Uban sa taas nga gidaghanon sa mga electrodes, mahimo nimong irekord gikan sa usa ka dako nga nawong (1 mm² @ 16 m nga gilay-on, 4 mm² @ 32 m nga gilay-on). Sa ingon, mahimo nimong makita ang mga signal gikan sa matag usa nga cell ug bisan ang pagpalapad sa signal ubay sa usa ka axon, samtang nagtapos pa.view sa imong kompleto nga sample.
Ang imong datos kay sampnanguna hangtod sa 25 kHz matag channel. Sa ingon, walay signal nga nawala - bisan ang axonal spike gipakita ug girekord pag-ayo. Kauban sa pagkakabig sa A/D sa 14 bit, gisiguro sa sistema ang tukma ug tukma nga datos.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE
Sa pagkakaron duha ka klase sa culture chambers ang anaa para sa CMOS-MEAs: Usa para sa cell culture ug usa para sa acute slices. Sa duha ka matang sa mga chips usa ka ground electrode na ang integrated.
CCM Culture chamber alang sa cell culture nga adunay MEA-MEM lid.
SCG Slice chamber. Usa ka CMOS-MEA chip nga adunay SCG Slice chamber nga adunay advanced layout alang sa laminar flow. Ang garantiya sa usa ka CMOS-MEA chip unom ka bulan gikan sa petsa sa pagpadala.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE
Interface Board IFB-C
Ang multiboot interface board nga IFB-C nagpadali sa operasyon sa tanang MCS in vitro ug in vivo headstagsulod sa tibuok 2100 ampliifier solution suite. Kini nga suite naglakip sa: MEA2100-HS, Multiwell-MEA-HS, CMOS-MEA-HS, MEA2100-Beta- Screen-HS, W2100-HS ug ME2100-HS. Ang modular 2100 ampAng disenyo sa lifier solution suite nagpasayon sa pag-usab sa imong kagamitan sa lab sa kasagaran nga adunay kasarangan nga pagpamuhunan sa pag-upgrade sa hardware. Front Panel
SYNC Out / In Duha o daghan pa nga interface boards IFB-C mahimong daisy-chained pinaagi sa paggamit sa SYNC Out / SYNC In connectors. Ang tanan nga daisy-chained interface boards nagdagan sa parehas nga orasan aron tugutan ang hingpit nga pag-synchronize sa mga pagrekord sa dagkong mga setting. Analog Channels Hangtod sa walo ka Analog In channels magamit pinaagi sa 10-pin connector. Palihug basaha ang kapitulo 10-Pin Connector para sa Analog IN sa Apendise para sa dugang nga impormasyon mahitungod sa pin layout. Ang dugang nga mga analog input gituyo alang sa pagrekord sa dugang nga impormasyon gikan sa gawas nga mga himan, alang sa example, alang sa pagrekord sa patch clamp susama sa pagrekord sa MEA. Analog Channels 1 ug 2 Duha niining walo ka analog channels (Analog In No 1 ug No 2) gilain nga magamit pinaagi sa Lemo connectors sa front panel sa interface board IFB-C. Duha ka Status LED Ang status LEDs nagpaila sa link status sa HS 1 ug / o HS 2. Sila mosiga kon ang usa o ang duha ka ulotages konektado sa IFB-C interface board pinaagi sa iX-industrial cable.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE
Digital IN / OUT Usa ka Digital IN / OUT alang sa 16 digital in- ug output bits anaa (Honda-PCS-XE68LFD) sa likod nga panel sa interface board. Sa front panel upat ka Digital IN ug upat ka Digital OUT bits ang ma-access usab pinaagi sa Lemo connector (DIG IN bit 0 to bit 3 ug DIG OUT bit 0 to bit 3). Ang Digital OUT naghatag ug TTL pulses nga adunay 3.3 V o 5 V. Ang voltage mahimong ibalhin sa taliwala niining duha ka voltaguban sa software nga IFB-Control, palihug basaha ang kapitulo nga "IFB-Control" sa Appendix.

Kung gikinahanglan ang pag-access sa daghang mga piraso sa DIG IN / OUT channel, kinahanglan nga magkonektar sa usa ka Digital IN / OUT extension Di/o board nga adunay 68-pin standard cable. Kini nga Di/o board magamit isip opsyonal nga accessory. Ground Kung gikinahanglan ang dugang nga koneksyon sa yuta, mahimo nimong ikonektar kini nga plug sa usa ka eksternal nga yuta gamit ang standard common jack (4 mm).
Likod nga Panel
I-toggle ang Switch On / Off I-toggle ang switch para sa pagpa-on ug off sa device. Ang CMOS-MEA5000-System gibalhin sa status "ON" kung ang toggle switch gibalhin sa wala. Ang device kay “OFF” kon ang toggle switch ibalhin sa tuo. Kung ang sistema "ON", ug ang aparato konektado sa linya sa kuryente, ang Power LED sa atubangan nga panel sa interface board kinahanglan nga mosiga. Kung dili, palihog susiha ang tinubdan sa kuryente ug kable. Gahum Sumpaysumpaya ang power supply unit dinhi. Kini nga suplay sa kuryente naghatag gahum sa duha, ang mga ulotage ug ang interface board sa CMOS-MEA5000System. Ang device nagkinahanglan og 24 V ug 2.5 A / 65 W. Ground Kung gikinahanglan ang dugang nga koneksyon sa yuta, mahimo nimong ikonektar kini nga plug sa usa ka eksternal nga yuta gamit ang standard common jack (4 mm).

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE
Digital IN / OUT
Usa ka Digital IN / OUT alang sa 16 digital in- ug output bits anaa pinaagi sa Honda-PCS-XE68LFD connector. Palihug basaha ang kapitulo Digital IN / OUT Connector sa Apendise para sa dugang nga impormasyon bahin sa pin layout sa connector. Ang Digital IN / OUT nga koneksyon modawat o makamugna og standard TTL signal. Ang Digital OUT naghatag ug TTL pulses nga adunay 3.3 V o 5 V. Ang voltage mahimong ibalhin tali niining duha ka lebel gamit ang software nga IFB-Control, palihug basaha ang kapitulo "IFB-Control" sa Apendise.
Ang TTL mao ang Transistor-Transistor Logic. Ang pulso sa TTL gihubit nga usa ka digital signal alang sa komunikasyon tali sa duha ka mga aparato. Usa ka voltage tali sa 0 V ug 0.8 V giisip nga usa ka lohikal nga kahimtang sa 0 (LOW), ug usa ka voltage tali sa 2 V ug 3.3 V o 5 V nagpasabut nga 1 (TAAS).
Gitugotan sa Digital OUT ang paghimo og digital signal nga hangtod sa 16 ka bits ug basahon kini, pananglitanample, pinaagi sa paggamit sa usa ka Digital IN / OUT extension Di/o board. Mahimo nimong gamiton kini nga digital signal aron makontrol ug ma-synchronize ang ubang mga aparato sa MEA2100-Beta-Screen-System.
Ang bit 0 hangtod 3 sa Digital OUT gibulag ug magamit isip Lemo connector DIG OUT 0 hangtod 3 sa front panel sa interface board. Busa, ang Di/o extension gikinahanglan lamang kung labaw pa sa upat ka trigger inputs o outputs ang gikinahanglan.
Ang Digital IN mahimong magamit sa pagrekord sa dugang nga impormasyon gikan sa gawas nga mga himan ingon nga usa ka 16 bit nga naka-encode nga numero. Ang Digital IN kasagarang gigamit sa pag-trigger sa mga rekording gamit ang TTL signal. Ang 16 bit digital input channels usa ka stream sa 16 bit values. Ang kahimtang sa matag bit (0 hangtod 15) mahimong kontrolahon nga gilain. Gidawat ang mga standard nga signal sa TTL ingon mga signal sa input sa mga digital input.
Pasidaan: Usa ka voltage nga mas taas kay sa +3.3 Volts o +5 Volts o mas ubos kay sa 0 Volts, sa ato pa, usa ka negatibo nga voltage, gipadapat sa digital input makaguba sa electronics. Siguruha nga imong magamit ang mga TTL pulses (0 hangtod 3.3 V o 5 V) sa mga digital input.
Mga Auxiliary Channel
Duha ka reserba nga auxiliary channel ang magamit alang sa umaabot nga paggamit. Wala silay function sa pagkakaron.
Audio GIKAN
Ang "Audio OUT" function dili magamit alang sa CMOS-MEA5000-System.
DSP JTAG Konektor
Ang JTAG connector gigamit sa pagprograma sa digital signal processor DSP alang sa real-time nga bahin. Kini nga bahin wala gigamit sa CMOS-MEA5000Systems.
HS/SCU
Mga socket para sa pagkonektar hangtod sa duha ka ulo sa CMOS-MEA-Systemtagpinaagi sa iX-industrial cable(s), type B.
USB-C Konektor B ug A
Ang duha ka USB-C connectors gigamit sa pagbalhin sa ampgi-digitize ug gi-digitize ang datos gikan sa tanang data channels ug ang dugang digital ug analog channels ngadto sa bisan unsang konektado nga data acquisition computer pinaagi sa USB-C cable. Ang Konektor A katumbas sa konektor iX input 1, ug ang konektor B nga adunay iX input 2. Kon ang duha ka iX input gigamit, ang duha ka USB-C nga koneksyon kinahanglang gamiton. Ang duha ka USB cable kinahanglan nga konektado sa lain-laing USB-C port sa computer, ayaw gamita ang USB hub! Gamita lamang ang taas nga grado nga USB-C nga mga kable, ingon sa gihatag sa sistema.
Importante: Girekomenda nga ikonektar ang USB-C cable direkta sa USB 3.0 port sa computer. Ayaw gamita ang USB hub!
Kompyuter sa Pagkuha sa Data
Ang software nga CMOS-MEA-Control giprograma ilabina para sa CMOS-MEA5000-System. Gipadali niini ang usa ka real-time nga kalihokan nga mataposview sa kompleto nga chip nga adunay abilidad sa pag-zoom in ug lain-laing mga himan sa pag-analisar sa datos. Palihug basaha ang kapitulo nga "CMOS-MEA-Control" para sa impormasyon bahin sa software.
Ang data acquisition computer gihatag sa Multi Channel Systems MCS GmbH. Ang operating system nga Windows ® 10 o 8.1 gikinahanglan.
Tungod sa kadaghan sa natala nga datos, ang kompyuter nga adunay ubos nga pasundayag mahimong mosangput sa mga problema sa pasundayag; busa, Multi Channel Systems naghatag ug usa ka up-to-date nga computer uban sa USB 3.0 koneksyon ug Intel chip set. Gamit ug SSP hard drive para sa recording ug ikaduhang hard drive para backup. Sa bug-os nga frame sampling uban sa maximum sampling rate ang gigamit karon nga 1TB SSD drive maghupot ug mga usa ka oras nga padayon nga pagrekord lamang!

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE SETUP
HARDWARE SETUP Palihug sunda ang mga instruksyon: 1. Ikonektar ang CMOS-MEA5000 amplifier pinaagi sa iX-industrial cable, type B sa IFB-C interface board. Palihug gamita ang plug in nga gimarkahan
nga adunay "1" sa likod sa interface board. 2. Ikonektar ang IFB-C pinaagi sa power unit ngadto sa power outlet. 3. Ikonektar ang IFB-C pinaagi sa USB-C sa kompyuter. Gamita ang USB-C plug in nga adunay label nga "A" sa luyo nga bahin sa interface board.
4. Ikonektar ang IFB-C pinaagi sa USB-C cable ngadto sa likod nga bahin sa computer. Gikinahanglan nga gamiton ang gitudlo nga USB 3.0 port, palihug tan-awa ang hulagway sa ubos!
Importante: Kinahanglan nga ikonektar ang interface board IFB-C sa CMOS-MEA5000-System ngadto sa Intel ® USB 3.0 port. Kung dili, peligro ang pagkawala sa datos.
Palihug hunahunaa ang mensahe sa sayup sa pagsugod sa CMOS-MEA-Control software sa unang higayon. Importante: Siguruha nga ang tanan nga mga agianan alang sa pagrekord files adto sa SSD drive kon dili walay recording nga posible! 5. Ikonektar ang temperature controller TC pinaagi sa USB 2.0 high speed cable ngadto sa usa sa USB 2.0 port ug pinaagi sa power unit ngadto sa
outlet sa kuryente. 6. Ikonektar ang elemento sa pagpainit sa mga ulo sa CMOStage pinaagi sa gihatag nga cable sa temperatura controller.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

HARDWARE SETUP
Pag-instalar sa Software
Mga Kinahanglanon sa Sistema
Kung gipalit nimo ang CMOS-MEA5000-System nga adunay PC ang tanan na-preinstall ug gisulayan. Kung mopalit ka ug sistema nga walay PC palihog siguroha nga ang kompyuter nakatagbo sa among mga detalye nga may kalabutan sa processor, memorya, hard disk, ug uban pa. Palihog kontaka ang Multi Channel Systems MCS GmbH o sa imong lokal nga retailer.
Software: Usa sa mosunod nga Microsoft Windows ® operating system ang gikinahanglan: Windows 10 o 8.1, 64 Bit (English ug German nga mga bersyon gisuportahan) uban sa NT file sistema. Ang ubang mga bersyon sa lengguwahe mahimong mosangpot sa mga error sa software.
Tungod sa kadaghanon sa natala nga datos, ang kompyuter nga adunay ubos nga performance mahimong mosangpot sa mga problema sa performance; busa, ang Multi Channel Systems MCS GmbH nagrekomendar ug pinakabag-o nga kompyuter. Palihog kontaka ang MCS o ang imong lokal nga retailer alang sa dugang impormasyon sa girekomendar nga espesipikasyon sa hardware sa kompyuter.
Mahinungdanon: Tungod sa kadaghan sa nakuha nga datos (hangtod sa 220 MByte matag segundo), siguroha nga ang tanan nga mga agianan alang sa pagrekord files adto sa SSD drive, kon dili walay recording posible!
Palihug timan-i nga usahay adunay mga hardware incompatibilities sa data acquisition system ug computer components; o nga ang usa ka dili angay nga suplay sa kuryente sa kompyuter mahimong mosangput sa mga signal sa arte.
Girekomenda nga Mga Setting sa Operating System
Ang mosunod nga awtomatikong mga serbisyo sa Windows operating system makabalda sa data storage sa hard disk ug mahimong mosangpot sa grabeng performance limit sa CMOS-MEA-Control. Kini nga mga rutina gidisenyo alang sa paggamit sa mga kompyuter sa opisina, apan dili kaayo mapuslanon alang sa usa ka kompyuter sa pagkuha sa datos.
· Deselect “Windows Indexing Service” para sa data SSD ug HD disks, ang system hard drive wala giapil. · I-off ang sleep mode para sa mga display ug HD disks. · Mga Opsyon sa Gahum: Power scheme: Taas nga performance. Ayaw i-on ang system standby. · I-off ang "Optimize hard disk kung walay trabaho", ang awtomatik nga disk fragmentation. · I-off ang Screen Saver ug ayaw gamita ang virus scanner sa panahon sa eksperimento. · Dili usab girekomenda nga magpadagan sa bisan unsang aplikasyon sa background kung mogamit CMOS-MEA-Control. Kuhaa ang tanan nga mga aplikasyon
gikan sa "Autostart" folder.
Importante: Palihug siguroha nga adunay bug-os nga kontrol sa imong kompyuter isip usa ka tigdumala. Kung dili, posible nga ang na-install nga software dili molihok sa husto.
Doble click ang CMOS-MEA-Control.exe sa gidaghanon sa pag-install. Ang katabang sa pag-install magpakita ug mogiya kanimo pinaagi sa pamaagi sa pag-install. Sunda ang mga instruksyon sa katabang sa pag-install.
Mubo nga sulat: Atol sa pag-instalar, ang tanan nga mga drayber gi-install ug kung gikinahanglan, ang firmware sa CMOS-MEA5000 hardware gi-update. Palihug ayaw paghunong sa pag-update sa firmware.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

PAGSULAY SA CMOS-MEA5000-SYSTEM
Pagsulay sa CMOS-MEA5000-System Functional Tests sa CMOS-MEA5000-System gamit ang Test Model Probe
Palihug basaha usab ang datasheet nga “Test-CMOS-MEA” sa Apendise. Isulod ang "Test Model Probe" sa saktong orientasyon ug isira ang mga ulotage. Ang lingin nga ngilit sa Test-CMOS-MEA o ang CMOS-MEA chip kinahanglan nga naa sa atubangan sa wala nga bahin kung direkta nga nagtan-aw sa bukas. amptigpanalipod. Ang gihatag nga test model probe nagsundog sa usa ka CMOS-MEA chip nga adunay resistor nga 100 k ug usa ka 10 p capacitor tali sa yuta ug matag laray sa 65 x 65 electrodes sa grid. Mahimo kini gamiton alang sa pagsulay sa lebel sa kasaba sa usa ka CMOS-MEA5000-System, alang sa pagsulay sa pagkakalibrate ug alang sa pagsulay sa internal nga mga stimulator. Ang CMOS-MEA test model probes ug CMOS-MEA chips kay mga aktibong device ug kinahanglang i-on ug i-shot down sa hustong paagi, kay basin makaagom sila og kadaot.
Palihug i-klik ang MEA array icon sa “Data Source” window. Ang mga chip sa CMOS kinahanglan nga ma-calibrate sa dili pa gamiton. Ang pag-calibrate awtomatik nga modagan ug kasagarang mokabat ug duha ngadto sa tulo ka minuto. Palihug ayaw paghunong sa proseso, hangtod ang katapusang mensahe nga "Natapos ang awtomatikong pag-calibrate sa sistema" makita. Ang "Pagsulay sa CMOS-MEA" nagsundog sa pagkakalibrate sa chip. Ang ,,ODD" nga cable nagsuporta sa odd-numbered nga mga channel ug ang ,,EVEN" nga cable nagsuporta sa even-numbered nga mga channel. Para sa tuyo nga susihon ang lebel sa kasaba sa usa ka CMOS-MEA5000-System nga walay mga eksternal nga signal, palihug ikonektar ang cable nga gibaligya sa ,,ODD" connector sa input connector sa even-numbered nga mga channel ug ang cable nga gibaligya sa ,,EVEN. " connector sa ,, BATH" input. Konektado niining paagiha, ang signal input nagsuporta sa tanan nga 65 ka laray sa 65 x 65 nga layout sa CMOS-MEA chip sa usa ka higayon ug nag-simulate usab sa pagkakalibrate sa kaligoanan. Idiskonekta ang "ODD" connector aron makita ang "EVEN" numbered electrodes lamang ug vice versa aron makita ang "ODD" numbered electrodes lamang.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

PAGSULAY SA CMOS-MEA5000-SYSTEM
Pagsulay sa internal nga mga Stimulators Ang Test-CMOS-MEA nga probe nasangkapan sa tulo ka dugang nga mga konektor aron sulayan ang internal nga stimulation, ,,STG1″, ,,STG2″ ug ,,STG3″. Ang stimuli kay color coded sa CMOS-MEA-Control software: Stimulus 1 gipakita sa berde nga kolor, Stimulus 2 gipakita sa blue ug Stimulus 3 sa pula nga kolor.
Alang sa pagsulay sa usa ka stimulator, palihug ikonektar ang cable sa "ODD" connector sa "EVEN" connector ug ang open cable sa usa sa "STG" plug ins. Ipasabot ang tagsa-tagsa ka stimulus pattern sa "Stimulation" window, alang sa example aramp nga adunay 100 ms sa stimulator 1 (berde), ingon sa gipakita sa screenshot sa ibabaw. CMOS-MEA Chip
Palihug pun-a ang CMOS-MEA chip sa PBS. Ang mga sensor sa CMOS sensitibo sa kahayag. Aron marekord ang usa ka lig-on nga baseline ang CMOS-MEA array kinahanglan nga magpadayon ubos sa lig-on nga mga kondisyon sa kahayag, nga dali nga mahatag pinaagi sa pagtabon sa CMOS-MEA sa kombenyente nga madulom nga lawak nga "CMOS-DC". Kay kon dili, ang signal maanod gikan sa range pinaagi sa epekto sa kahayag.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

KINATIBUK-ANG SOFTWARE FEATURES

Kinatibuk-ang Software Features Ang kapitulo nga "General Software Features" naghulagway sa pipila sa CMOS-MEA-Control ug CMOS-MEA-Tools software features sa base sa examples. Numeric Up-Down Box
I-adjust ang bili sa numeric up-down box pinaagi sa pag-klik sa arrow button o pinaagi sa pag-klik sa bintana ug paglihok sa mouse wheel. Ibalik ang ligid sa unahan ug ang lebel nagdugang, ibalik ang ligid ug ang bili mokunhod sa paspas nga mga lakang. Gamita ang mga arrow nga buton para sa maayong pag-tune sa adjustment. Ang ikatulo nga posibilidad mao ang pag-ilis sa numero sa bintana pinaagi sa pag-overwrite niini, kung ang kantidad gitakda nang daan, para sa example. Zoom In ug Zoom Out Zoom Buttons
I-klik ang "Ipahiangay sa signal Min / Max" nga buton. Ang scaling sa y-axis gitakda sa minimum ug maximum sa tanang makita nga samples sa channel.
I-klik ang "Zoom" nga mga buton. Ang pag-zoom in magputol sa scaling sa tagsa-tagsa ka axis sa tunga ug ang pag-zoom out makadoble sa scaling.
Pag-zoom pinaagi sa Mouse-click Dugang pa, sa mga buton sa pag-zoom mahimo ka nga gawasnon nga mag-zoom ngadto sa usa ka rehiyon nga interesado pinaagi sa paglihok sa mouse sa sulod sa usa ka display gikan sa wala ngadto sa tuo samtang gipugos ang wala nga buton sa mouse. Ibalhin ang mouse gikan sa tuo ngadto sa wala para sa pag-zoom out.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

KINATIBUK-ANG SOFTWARE FEATURES
Ipakita ang Naglutaw
Idisenyo ang imong kaugalingon nga display gamit ang floating feature. Decouple ang usa ka dialog display nga imong gusto ug ibutang kini bisan asa nimo gusto.
I-dock ang bintana pag-usab pinaagi sa pag-klik gamit ang tuo nga buton sa mouse sa ibabaw sa bintana. Tagoa ang usa ka bintana nga adunay kapilian nga "Auto-Hide". Paghimo sa mga Rehiyon sa Interes nga ROI
Ang pagpili sa ROI nga mano-mano pinaagi sa pagdrowing og mga rektanggulo parehas bisan sa "Activity" o "Sensor Array Tool" nga bintana. Palihug pugngi ang wala nga buton sa mouse aron magdrowing og rectangle sa “Activity” window aron makahimo og rehiyon nga interesado. Ang usa ka dashed nga linya nga asul nagpaila sa mga utlanan sa ROI. Ang kolor sa rectangle nahimong itom ug ang ID sa ROI makita sa ibabaw nga tuo nga kilid. O paghimo og ROI pinaagi sa pag-klik sa usa sa maxima sa kalihokan. Usba ang usa ka rehiyon sa interes pinaagi sa pag-klik sa mga utlanan hangtod ang usa ka dobleng pana nga makita aron mapalihok ang utlanan. Pagtangtang sa usa ka ROI pinaagi sa pag-klik sa ROI pag-usab. Ang mga channel sa sensor nga gilakip sa usa ka rehiyon sa interes gipakita dayon sa "ROI" nga bintana sa tupad.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

CMOS-MEA-CONTROL Pasiuna Ang software alang sa pagkontrol sa CMOS-MEA5000-System naglakip sa duha ka bahin, CMOS-MEA-Control para sa online recording, CMOS-MEA-Tools para sa offline nga pagtuki. Ang CMOS-MEA-Control software klaro nga gidisenyo alang sa online data recording gamit ang CMOS-MEA5000-System. Gipadali niini ang usa ka real-time nga kalihokan nga mataposview sa kompleto nga chip nga adunay katakus sa pag-zoom sa hilaw nga datos ug lainlaing mga himan aron mahanduraw ang kalihokan. Ang CMOS-MEA-Control software nagkontrol sa CMOS-MEA5000-System, ang eksperimento nga pamaagi, ang pagpili sa datos alang sa pagrekord sa hard disk ug susama nga mga gimbuhaton sama sa pagkontrol sa stimulation, ang online spike detection, ang pagtipig sa mga spike nga adunay o walay hilaw nga datos. aron sa pagluwas sa disk space o sa pagpili sa mga rehiyon sa interes pagpili alang sa data reduction ug daghang dugang nga mga gimbuhaton.
Panguna nga Bintana

Ang default nga bintana sa main menu gibahin sa tulo ka parallel nga mga seksyon nga gi-frame sa menu bar sa ibabaw:
1. Wala: Control section para makontrol ang CMOS-MEA5000-System hardware, ang data acquisition, ang experimental procedure, ang recording sa data, ang streaming sa mga nakitang spikes ug usa ka section para mamonitor ang system load.
2. Tunga: Tools nga seksyon nga adunay mga himan sa pagtakda sa sensor array properties, sa pagmonitor sa nakuha nga data online, sa pag-detect sa mga spike, sa pag-stimulate ug sa pagkuha sa mga panghitabo gikan sa digital input signal.
3. Tuo: Data view seksyon nga adunay detalyado views sa hilaw nga datos o sa namatikdan nga mga spike. Mahimo nimong i-zoom ang datos sa usa ka rehiyon nga interesado sa ibabaw ug sa usa ka detalyado nga solo view sa usa ka recording electrode sa ubos.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Menu Bar File
Menu sa pag-abli ug sa pagluwas sa mga templates ug sa "Exit" sa programa. Mga setting
Menu aron ma-aktibo ang "Tools", "Activity Tool" ug "Spike Tool". I-switch ang mga himan pinaagi sa check box aron mahimo ang ilang tagsa-tagsa nga mga buluhaton o i-off aron makunhuran ang load sa sistema. Kung ang "Activity Tool" gipalong, walay hilaw nga datos nga ipakita, apan siyempre giproseso ug gitipigan. Kung ang "Spike Tool" gipalong, walay spike detection nga gihimo, ug walay spike nga gitipigan. Timan-i, nga ang pag-ila sa spike sa daghang mga sensor usa ka mahal nga buluhaton ug nanginahanglan usa ka angay nga kompyuter. Menu aron itakda ang "Default Paths", sa "Save as Defaults" ug sa "Reset Defaults". I-klik ang "Mga Setting sa Application" aron maablihan ang dialog nga "Mga Setting sa Application". Ipasabut ang mga agianan alang sa "Mga Default nga Dalan" alang sa "Hilaw nga Data", "Template" ug "Pagdasig Files" sa dialog nga "Mga Setting sa Aplikasyon".

Importante: Siguruha nga ang tanan nga mga agianan moadto sa SSD drive kung dili wala’y mahimo nga pagrekord!
I-klik ang check box nga "Save Sensor Calibration" sa seksyon nga "Diagnostics".
I-klik ang check box nga "Save Sensor Calibration" sa "Diagnostics" nga seksyon aron i-save ang calibration data sa "hdf5" file. Sa matag higayon nga ang usa ka calibration gihimo, a file nga adunay data sa pagkakalibrate gihimo sa folder nga "Raw Data", nga adunay sulud nga hilaw nga datos ug ang mga hinungdan sa pagkakabig nga gikalkula gikan sa kini nga datos.
Atol sa proseso sa pagkakalibrate sa sistema ang mga sensor gi-calibrate usab. Alang sa pagkakalibrate usa ka voltage gipadapat sa bath chamber. Ang mga signal nga gisukod sa mga sensor gipaangay sa stimulus sa pagkakalibrate. Kung ang duha nga mga signal mohaum pag-ayo, ang hinungdan sa pagkakabig kalkulado, ug ang mga kantidad sa ADC maluwas sa hilaw nga datos file.
Ang file Ang mga ngalan nagsugod sa "Pag-calibrate" nga gisundan sa petsa sa pagrekord ug ang extension: Calibration-2019.08.01-13.44.30.cmcr. Ang file format mao ang komon nga hilaw nga data file format aron makarga nimo kini alang sa pagsusi sa software nga "CMOS-MEA-Tools".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Libro sa Lab
Palihug gamita ang mga entry sa tulo ka tab sa lab book para sa ulahi nga pagtuki sa eksperimento. I-klik ang buton "Itakda ang Default" para sa pagtipig sa impormasyon isip template. Ang tanan nga mga nota ma-save sa hilaw nga datos file. Setup
I-klik ang "Device" aron usbon ang konektado nga device. Kung adunay hardware, pilia ang "MCS Device". Kung walay hardware nga magamit, palihug gamita ang "Simulator" o i-load ang "Data File” sa pagsulay sa software nga walay hardware nga gilakip. Sa diha nga replay sa usa ka data file, naa nimo ang advantagaron makita ang "tinuod" nga datos samtang ang datos sa "Simulator" virtual.
Para makapili ug data file gikan sa usa ka folder, palihug pilia ang "Data File” sa “Setup” menu. Ang "Data Source" nga bintana nagpakita sa "Simulation" tupad sa CMOS-MEA5000-System button. Dayon i-klik ang CMOS-MEA chip button aron mapili ang file gusto nimo i-replay gikan sa browser dialog. I-klik ang "CMOS System" aron maablihan ang dialog nga "Setup CMOS System".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Ang dialog nga "Setup CMOS System" naghatag sa manual nga kontrol alang sa offset ug mga setting sa pagkakalibrate alang sa CMOS chip. Adunay usa ka awtomatikong rutina alang sa pagsugod sa chip ug pag-calibrate, ang mga setting sa manual kasagaran dili kinahanglan. Palihug basaha ang kapitulo nga "Pag-opera sa CMOS-MEAControl Software" alang sa detalyadong impormasyon. Ablihi ang dialog nga "Filter sa Device" aron usbon ang mga setting sa filter.
I-adjust ang mga setting sa filter nga "High Pass" ug "Low Pass" sa lebel sa hardware sa panahon nga ang software nagdagan, apan dili pagrekord. Pilia ang "Bessel" o "Butterworth" filter nga "Pamilya" sa 1 o 2 nga "Order" gikan sa mga drop-down menu. Ang pagpalong sa "Off" sa "Cutoff Frequency" sa high pass filter makapahimo sa mga signal sa DC. Kung ang mga setting sa filter kinahanglan nga i-save para sa ulahi nga mga eksperimento, palihug i-klik ang "Set Permanent" nga buton. Kung gikinahanglan, palihog ibutang ang "High Pass" nga filter sa opsyon nga "Off", kana nagpasabot sa DC, direct voltage. Walay offset nga magamit, ang tanan nga hilaw nga datos gipakita nga walay bisan unsang filter. Tabang
Ang “Tabang” nga menu para sa pag-abli sa online nga tabang ug sa “Check for Update”, kon gikinahanglan. I-klik ang "About" nga kapilian alang sa software ug firmware nga impormasyon. I-klik ang “Online Help” para makita ang kataposang bersyon sa CMOS-MEA5000-System manual. I-klik ang "Check for Updates" aron makita kung ang software bag-o ba, o usa ka bag-ong bersyon ang anaa sa Multi Channel Systems website.
Sa pagsugod sa CMOS-MEA-Control software kini nga pop-up nga "Software Update Available" makita, kung adunay bag-ong bersyon sa software. Pag-klik sa nota aron maablihan ang dialog nga "Check for Updates" aron adunay direkta ug paspas nga pag-access sa MCS web site.

Kung ang software dili bag-o, i-klik ang buton nga "Bisita Web site” ug i-download ang pinakabag-o nga bersyon sa software.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
I-klik ang opsyon nga "About".
Palihug tan-awa ang teknikal nga mga detalye sa aparato ug ang numero sa bersyon sa CMOS-MEA-Control software. Seksyon sa Pagkontrol Ang "Seksyon sa Pagkontrol" naglakip sa tulo ka mga seksyon, ang "Gigikanan sa Data", ang "Recorder" ug ang kontrol sa "Load". Tinubdan sa Datos

Ang "Data Source" nga bintana nagtugot sa pagkontrol sa tinubdan sa datos ug sa CMOS chip. Ang chip usa ka aktibo nga aparato ug kinahanglan nga paandaron sa dili ka pa makasugod sa usa ka eksperimento gamit ang "Start" nga buton.

I-klik ang icon nga "Mga Setting".

alang sa dialog nga "Itakda ang Device". Kung mogamit ug CMOS-MEA5000-System sa unang higayon, palihog ipasabot kung asa

Ang CMOS-MEA nga "Device" gigamit karon ug gihubit ang "Sample Rate" gikan sa mga drop-down menu. Pagpili sa "Analog Channels" ug ang

digital "Digital Channel" makahimo sa pinili nga mga channels. Pagdesisyon sa bintana nga "Recorder" kung gusto nimo nga irekord gikan sa kini nga mga channel

o dili, palihog tan-awa ang sunod nga screenshot.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pagpili sa taas nga "Sample Rate” sa 50 kHz, 100 kHz o 200 kHz, kinahanglan nimong dawaton ang mosunod nga mga sangputanan: Palihug pagpili og usa ka rehiyon sa interes nga ROI lamang, aron tugotan ang pagrekord sa ingon ka dako nga kantidad sa datos sa usa ka piho nga rehiyon sa array sa electrode. Ang gamay nga bintana tapad sa "Sample Rate" nga drop-down menu nagtino sa pinili nga ROI dugang pa.

Recorder

Kontrola ang mga setting sa parameter nga "Recorder" sa kini nga bintana. Pagsugod ug paghunong sa recorder ug tan-awa ang mga tipo sa datos nga magamit. Pindota ang

Icon nga "Mga Setting".

aron usbon ang mga setting sa recorder. Palihug basaha ang kapitulo nga "Operating CMOS-MEA-Control" para sa detalyadong impormasyon bahin sa

pagprograma sa recorder.

Sugdi ug ihunong ang pagrekord nga mano-mano gamit ang "ON / OFF" nga icon.

Kung ang recorder nagdagan, ang oras sa pagrekord ug ang agianan kung diin ibutang ang datos file gipakita. Ipasabut kini nga agianan sa datos sa dialog nga "Mga Setting sa Recorder". Ipasabut dugang ang "File Ngalan" ug ang "Prefix" ug "Suffix".

Sugdi ug ihunong ang recorder sa tulo ka lain-laing mga mode: Sa "Manual" mode, pinaagi sa "Timer" o depende sa usa ka "Event". Gamita ang mga mode sa kombinasyon alang sa "Start" ug "Stop". Palihug basaha ang kapitulo nga "Operating CMOS-MEA-Control" para sa detalyadong impormasyon.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Spike Server
Ang "Spike Server" nagtugot sa pag-stream sa mga nakit-an nga mga spike ug mga panghitabo sa ubang mga aplikasyon sa parehas nga kompyuter o sa lain nga kompyuter sa network. Ang kliyente makadawat sa datos ug maproseso kini sa mga panginahanglan sa kustomer. Naghatag kami og source code alang sa ingon nga kliyente sa C #, Matlab ug Python. load

Pag-monitor sa kasamtangan nga kahimtang sa kapasidad sa data acquisition computer pinaagi sa "Load" window. Tan-awa ang load sa CPU sa "CPU Usage", ug ang labing importante ang anaa nga "Disk Space" sa drive nga gigamit sa pagrekord.
Timan-i nga ang CMOS-MEA5000-System makamugna hangtod sa 220 MB matag segundo kung magrekord nga adunay labing taas nga s.amprate nga!
Ang "Data Source" ug "Recorder", ang "Activity Tool", ang "Spike Tool" ug ang "Spike Server" nga bintana nagtugot nga makita kung unsang mga sangkap sa software ang nagpatungha kung unsang kantidad sa load sa processor sa pagkakaron. Ang matag himan adunay kaugalingon nga pila sa mga pakete sa datos nga iproseso. Kung ang load sa processor taas nga mga himan mahimong dili makaproseso sa datos niini ug ang data queue sa himan motubo. Kini nga kahimtang sa pila gipakita alang sa matag himan nga gilain.
Kasamtangang Sensor

Tan-awa ang "Sensor Current" sa CMOS chip. Ang sensor nga kasamtangan gisukod ingon nga kantidad sa tanan nga kasamtangan sa tanan nga 4225 nga mga sensor. Ang kinatibuk-ang kasamtangan dili kinahanglan nga mas dako pa kay sa mga 300 mA, kung dili ang chip madaot.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Log

Ang "Log" file Ang bintana nagpakita sa nagpadayon nga mga eksperimento sa online. Sa "Log" file tanan nga mga operasyon sa software sa panahon sa usa ka eksperimento

mga dokumentado. Ang "Log" mahimong i-save ug i-export isip "*.xml" file pinaagi sa pagpindot sa disc

icon.

Pagpakita sa Data
Kalihokan
Tungod sa kadaghan sa mga channel, imposible nga ipakita ang hilaw nga datos sa 4225 nga mga channel nga dungan. Busa, ang kalihokan makita diha sa mga bins sa oras sa usa ka bakak nga kodigo sa kolor. Gitugotan niini ang tiggamit nga mailhan ang mga aktibo nga lugar ug ipunting kini sa mga rehiyon nga interesado. Ipakita ang datos nga "Kalihokan" sa tulo ka mga mode: "Max Amplitude", “Mean Amplitude" ug "Spike Count".

Tan-awa ang kompletong CMOS-MEA electrode array sa “Activity” window. Ang laraw sa "Kalihokan" nagpakita sa tanang 65 x 65 nga mga sensor sa CMOS chip isip usa ka pixel matag usa. Pagpili og daghang "Mga Rehiyon sa Interes nga ROI" kung gikinahanglan aron ipakita ang labing kulbahinam nga mga rehiyon sa CMOS array lamang. Sa mga screenshot sa ubos ang mga rehiyon sa interes gipakita. Offset Correction Gamita ang checkbox nga "Offset Correction" aron ibutang ang tanang lebel sa electrode ngadto sa zero.
Paghimo sa mga Rehiyon sa Interes nga ROI
Palihug pugngi ang wala nga buton sa mouse aron magdrowing og rectangle sa “Activity” window aron makahimo og rehiyon nga interesado. Ang usa ka dashed nga linya nga asul nagpaila sa mga utlanan sa ROI. Ang kolor sa rectangle nahimong itom, ug ang gidaghanon sa ROI makita sa ibabaw nga tuo nga kilid. O paghimo og ROI pinaagi sa pag-klik sa usa sa maxima sa kalihokan. Usba ang usa ka rehiyon sa interes pinaagi sa pag-klik sa mga utlanan hangtod ang usa ka dobleng pana nga makita aron mapalihok ang utlanan. Pagtangtang sa usa ka ROI pinaagi sa pag-klik sa ROI pag-usab. Gipakita ang mga rehiyon sa interes sa bulag nga tabbed nga mga panid. Sa pagbalhin gikan sa usa ka ROI ngadto sa lain, palihog gamita ang mga tab ubos sa “Single View” sa “ROI” nga bintana. Importante: Dili gitugotan nga magsapaw sa mga rehiyon nga interesado! Ang mga channel sa sensor nga gilakip sa usa ka rehiyon sa interes gipakita dayon sa "ROI" data window sa tupad.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Ang toolbar sa "Kalihokan" gibahin sa duha ka bahin: Usa ka bahin sa ibabaw ug usa ka bahin sa ubos sa display nga "Kalihokan". Ibabaw nga Toolbar sa "Activity" Window

I-klik ang icon nga "Parameter Selection Icon" aron makadesisyon kung unsang parameter mode sa kalihokan sa sensor ang kinahanglan ipakita: Ang labing kataas nga "MaxAmplitude” o ang “MeanAmplitude o ang "SpikeCount". Sa dependency sa imong pagpili, ang toolbar sa tupad sa mga kausaban.
Ang gipili nga parameter ipakita sa window sa kalihokan ingon nga sayup nga laraw sa kolor sa mga bins sa oras. Ipasabut ang kolor sa mapa sa "Sensor Array View Mga setting" nga dialog.

"I-reset ang Offset"

Gamita ang checkbox nga "Offset Correction" aron ibutang ang tanang lebel sa electrode ngadto sa zero, kon gikinahanglan. I-klik ang buton aron ma-zero ang lebel sa elektrod human sa pag-anod pag-usab.

Importante: Ang "Offset Correction" dili mag-usab sa hilaw nga datos, nga natala! Kini nga bahin nag-impluwensya lamang sa datos nga gipakita!

Alang sa parameter nga "SpikeCount", ang mga spike matag usa nga makit-an alang sa matag channel pinaagi sa pagtabok sa threshold. Ang threshold gikalkulo isip standard deviation sa kasaba alang sa maong channel, isip usa ka user nga gihubit nga butang. Mahimong usbon ang butang gamit ang up-down nga kahon sunod sa icon sa pagpili sa parameter. Ang kalkulasyon sa standard deviation mahimong ma-update sa bisan unsang oras gamit ang icon nga "Update the Std.

Si Dev. Sukda”.

Ablihi ang dialog nga "Mga Setting sa Tool sa Aktibidad" pinaagi sa pag-klik sa icon. Ang mga sukaranan nga mga parameter, sama sa pag-update sa mga bins sa oras ug ang oras sa pagkakita sa patay nga oras mahimong mabag-o sa dialog nga "Mga Setting sa Tool sa Aktibidad".

Ang parameter nga "Update" naghubit sa gidak-on sa mga bins sa oras ug ang rate sa pag-refresh sa display. Importante ang "Accumulate" ug "Detection Dead Time" kung gipakita ang spike count. Ang ihap sa spike matigom alang sa piniling oras, ang mga panghitabo nga molapas sa detection threshold sulod sa pinili nga "Detection Dead Time" human ang usa ka miaging panghitabo dili tagdon. Kini nagpasabot nga sa pagtan-aw sa spike count, ang display magsugod sa pagpakita sa data nga adunay pipila ka segundos nga pagkalangan human sa pagsugod sa data acquisition, depende sa "Accumulate" setting.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Ubos nga Toolbar sa "Activity" Window

Kung ang mouse pointer nabutang sa mapa, ang mga coordinate sa lugar nga gipunting sa mouse gipakita sa wala nga bahin sa toolbar sa ilawom sa bintana sa laraw.

Ipasabut ang kolor sa "Mapa sa Aktibidad" pinaagi sa pag-klik sa ikaduha nga icon sa setting

sa toolbar sa ubos. Ang "Sensor Array View Mga setting”

dialog makita. I-enable ang check box nga “Invert” aron balit-aron ang mga kolor sa mapa sa kalihokan.

Sa kasagaran, usa ka rehiyon sa interes (ROI) ang gihubit sa display nga "Kalihokan". Ang hilaw nga datos sa tanan nga mga sensor sa sulod sa ROI gipakita sa detalye. Ang gidak-on ug posisyon sa ROI mahimong mausab pinaagi sa pag-drag gamit ang mouse. Posible ang paghubit sa labaw sa usa ka rehiyon sa interes. I-klik ang mga buton para sa pagdugang o pagtangtang sa dugang nga mga ROI. Palihug pagdrowing og rectangle gamit ang mouse ibabaw sa tagsa-tagsa ka sensor array aron matino ang dapit sa usa ka ROI. Kung adunay labaw sa usa ka rehiyon sa interes, kini independente nga gipakita sa mga tab nga panid. Palihug basaha usab ang kapitulo nga "Paghimo sa mga Rehiyon sa Interes nga ROI" sa ibabaw.
Opsyonal nga posible nga ipasabut ang lugar sa usa ka ROI gamit ang dialog nga "Itakda ang ROI Cursor". Ipasabut ang "Posisyon", "Gidak-on", ug "Kolor" sa ROI cursor. Ipakita o itago ang mga cross hair pinaagi sa "Show Cross Hairs" nga check box sa ubos ug "Enable" ang cursor pinaagi sa check box sa ibabaw.

Ipasabot ang bili sa color map sa microvolt gamit ang up-down box nga “Range” duol sa maximum amplitude o spike frequency sa gipaabot nga signal.

. Ang labing taas nga kantidad kinahanglan nga

Ang kolor naghulagway sa pinili nga parametro sa “Activity” display. Sama sa makita sa hulagway sa ubos, ang kalihokan gipakita isip mga kolor nga spots.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Himan sa Array sa Sensor

Ang "Sensor Array Tool" nag-apil sa tulo ka mga gimbuhaton nga may kalabutan sa pagkontrol sa CMOS-MEA chip.
Una sa tanan, mahimo nimo nga mano-mano ang pag-recalibrate sa imong mga sensor, kung gikinahanglan. Ikaduha, ang mga rehiyon sa mga sensor mahimong mapili nga mano-mano o awtomatiko nga magpunting lamang sa makapaikag nga mga rehiyon. Ikatulo, kung gikinahanglan, ang operating point sa mga sensor mahimong i-reset pinaagi sa pagbutang sa gitudlo nga gate voltage kausa o sa gibalikbalik nga paagi pag-usab. Sa katapusan sa sistema sa pag-calibrate dagan ang mga hinungdan sa pagkakabig sa tanan nga mga sensor nga gipakita aron masusi ang kalidad sa sensor chip. Palihug pagpili og usa sa tulo ka mga mode gikan sa drop down menu: "Calibration", "Sensor Selection" ug "Sensor Reset".
Pag-calibrate

Sama sa gihisgutan sa ibabaw, ang kahimtang sa sensor chip mahimong mabanabana sa mga hinungdan sa pagkakabig nga nakuha sa panahon sa pagkakalibrate sa sistema. Ang kantidad sa pagkakalibrate sa matag sensor girepresentahan sa usa ka color coded tuldok. Ang eksaktong mga bili nagdepende sa sensor chip. Ang sumbanan niini nga mga bili kinahanglan nga usa ka matang sa random noise pattern.

Ang bisan unsang mga istruktura sa sulod niining random nga pattern sa kasaba mahimong magpakita sa usa ka problema. Kay example, ang usa ka puti nga lugar mahimong magpunting sa usa ka grupo sa mga depekto nga sensor. O usa ka tul-id nga pinahigda nga linya sa tibuuk nga chip nagpaila sa usa ka dili maayo nga kontak sa sensor chip.

Palihug ihunong ang eksperimento ug limpyohi ang mga contact pin sa mga ulotage. Ang puti nga pixel nagpunting sa usa ka depekto nga sensor, diin ang pagkakalibrate

dili mahimo. Sulayi nga sublion ang proseso pinaagi sa pag-klik sa "Calibrate" icon nga sugo sama sa "CMOS-MEA Diagnose" dialog.

alang sa pag-calibrate sa mga sensor sa CMOS. Parehas kini

Alang sa pag-calibrate usa ka signal sa sine nga adunay 70 Hz ug 3 mV ang gibutang batok sa usa ka signal sa sine gikan sa internal nga stimulator.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pagpili sa Sensor
Ang "Sensor Selection" module nagtugot sa tiggamit sa pagpili sa mga rehiyon sa mga interes nga mano-mano o awtomatiko. Mapuslanon ang pagpakunhod sa gidaghanon sa datos nga gibalhin sa kompyuter ug sa hard disk kung ang kalihokan limitado sa usa o daghang mga lokasyon sa array sa sensor. Kuhaa ang pag-apud-apod sa kalihokan nga nakuha sa "Activity" o "Spike Tool" ug gamita kini aron mahibal-an ang mga rehiyon nga interesado.

Ibabaw nga Toolbar sa "Sensor Array Tool" Window
Palihug i-download ang imong pagpili sa mga rehiyon nga interesado gamit ang "I-download ang Pinili nga mga Sensor sa Pagkuha sa Data" nga buton sa kompyuter. Gamita ang “Fetch Spike Count from Spike Tool” nga buton para mag-import ug data gikan sa “Spike Tool” ug i-klik ang “Fetch Activity from Activity Tool” nga buton para mag-import ug data gikan sa “Activity” tool. Ubos nga Toolbar sa "Sensor Array Tool" Window
Pilia ang kompleto nga array gamit ang "Pilia ang kompleto nga Sensor Array" nga buton. Gamita ang buton nga "Awtomatikong Pagpili sa Sensor" kung dili nimo pilion ang mga rehiyon sa interes nga mano-mano. Ang awtomatik nga himan nagpili sa mga lugar sa palibot sa mga peak sa kalihokan. Palihug ipasabot ang dimensyon sa rehiyon sa interes gikan sa drop-down box, "Size 3 x 3" sensors o "Size 5 x 5" sensors. Pagtangtang sa pagpili sa tanan nga mga rehiyon sa interes gamit ang "Kuhaa ang pinili nga mga Sensor" nga buton. Dugang pa, sa awtomatik nga pagpili sa mga ROI makahimo ka sa pagdugang sa mga ROI o pag-usab o pagtangtang sa mga han-ay sa sensor nga mano-mano. Palihog basaha sa kapitulo nga “General Software Features” sa pahina 18 paragraph “Paghimo sa mga Rehiyon sa Interes nga ROIs”.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pag-reset sa Sensor
Para sa taas kaayo nga mga rekording o para sa eksperimento nga mga kondisyon nga maoy hinungdan sa kusog nga potensyal nga pag-anod sa mga sensor mahimong gikinahanglan nga i-reset ang mga sensor sa operating point. Ang pag-reset sa mga sensor mahimong kontrolado nga mano-mano o awtomatiko sa gitakda nga mga agwat sa tiggamit. Ang oras sa pag-reset nakuha ug gitipig ingon data sa channel ug ingon usab mga panghitabo kauban ang data sa sensor. Kini nga impormasyon mahimong gamiton aron dili iapil ang mga hugna sa pag-reset gikan sa pagtuki. Aron i-reset ang mga punto sa pag-operate sa mga sensor, pilia ang "Sensor Reset" module gikan sa "Sensor Array Tool" toolbar. Pindota ang buton sa pagsugod aron i-reset ang mga sensor. Ang gidugayon sa pag-reset mahimong itakda gamit ang numerical control. Susiha ang kontrol nga "Repeat" aron awtomatiko nga balikon ang pag-reset sa sensor nga adunay gihatag nga interval. Ang "Sensor Reset" nga himan nagpataas sa naglutaw nga mga signal balik sa operation point. Kining mubo nga panahon makita sa hilaw nga datos isip usa ka potensyal nga lakang. Ang eksakto nga oras sa pag-reset girekord kauban ang hilaw nga datos ingon data sa channel o ingon mga panghitabo. Example: "Sensor Reset" nga walay pagpugong

Ang exampAng sa ibabaw sa wala nagpakita sa pag-reset sa sensor nga adunay interval nga 1 ms ug walay pagpugong. Ang usa ka filter nga 10 Hz gipadapat.

Ang exampAng ibabaw sa tuo nagpakita sa usa ka pag-reset sa sensor nga adunay interval nga 1 ms ug walay pagpugong nga walay filter.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Example: "Sensor Reset" uban sa pagpugong

Ang exampAng sa ibabaw sa wala nagpakita sa usa ka pag-reset sa sensor nga adunay interval nga 1 ms, nga adunay 10 Hz filter ug adunay pagpugong. Ang exampAng sa ibabaw sa tuo nagpakita sa usa ka pag-reset sa sensor nga adunay gilay-on nga 1 ms, nga wala’y filter ug adunay pagpugong. Ang epekto sa pagsumpo ug sa 10 Hz high pass filter dayag nga makita kon itandi sa upat ka mga screenshot sa ibabaw. I-klik ang checkbox nga “Artefact Suppression” para masala ang mga artefact.
Tool sa Spike

Ang "Spike Tool" gigamit alang sa online nga pagdeterminar sa mga parameter sa spike aron tugotan ang pagrekord nga nagsalig sa kalihokan. Mapuslanon kini kung ang mga aktibo nga hugna gilakip sa taas nga dili aktibo nga mga hugna. Gigamit kini nga bahin nga ang agwat sa palibot sa mga aktibo nga hugna gitipigan sa disk.
Spike Tool ibabaw nga Toolbar

Ipasabot ang "Threshold" para sa spike detection gikan sa drop-down box: "Positibo", "Negatibo" o "Absolute". Pilia ang standard deviation "StdDev" gikan sa numeric up-down box. Gamita ang feature nga “Update StdDev Measure”, kon gikinahanglan.

Gamita ang checkbox nga "Offset Correction" aron ibutang ang tanang lebel sa electrode ngadto sa zero, kon gikinahanglan. I-klik ang buton nga "I-reset ang Offset" ang lebel sa elektrod pagkahuman sa pag-anod pag-usab.

hangtod sa zero

Importante: Ang "Offset Correction" dili mag-usab sa hilaw nga datos, nga natala! Kini nga bahin nag-impluwensya lamang sa datos nga gipakita!

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Example: Pagpakita sa datos nga "Spike Overlay" nga adunay "Offset Correction" sa wala ug walay "Offset Correction" sa tuo.

I-klik ang "Open Settings Dialog" nga buton

sa pag-abli sa "Spike Explorer Settings" dialog.

Pagsusi sa Spike
Palihog ipasabot ang lain-laing parameter para sa spike detection. Ang kasaba gigamit ingon nga sukaranan aron makalkulo ang threshold sa mga spike nga kinahanglan mahibal-an.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Seksyon sa Pagsukod sa Noise Parameter nga "Pagsukod sa Kasaba": Pilia kung gusto nimo itakda ang "Standard Deviation" o ang "Median / Absolute Deviation" para sa pagsukod sa ingay. "Timing": Tulo ka mga parameter ang magamit aron mahibal-an ang oras diin ang kasaba kinahanglan sukdon alang sa paggamit niini ingon usa ka sukaranan sa threshold. Ang "Padayon" nga pagsukod supak sa pagsukod sa agwat. Gamit ug "Single Interval" o "Repeat Interval". Ang padayon nga pagsukod sa kasaba isip base sa spike threshold gikinahanglan kung ang hilaw nga datos nag-anod. Niining paagiha, ang threshold alang sa mga spike ipahiangay. Ang pag-usab sa sukod sa kasaba sa mga agwat makatarunganon usab alang sa nagpadayon nga mga eksperimento. Palihug ipasabot ang gidaghanon sa “Repeat(s)” ug ang “Duration” sa interval sa milliseconds gikan sa up-down nga mga kahon.
Detection Section “Detection” parameter: Ipasabot ang “Threshold Type” gikan sa drop-down box, “Positive”, “Negative” o “Absolute”. Posible usab nga ipasabut kini nga parameter sa tool bar sa display nga "Spike Tool". Pilia ang "Threshold" gikan sa 0 hangtod 99 gikan sa up-down nga kahon. Ipasabut ang "Detection Dead Time" sa ms.
Spike Cutout Section “Spike Cutout” parameter: I-klik ang check box nga “Extract Waveform” kon gikinahanglan. Ipasabut ang "Waveform Alignment" gikan sa drop-down box, kung ang check box gipagana. Ipasabut ang "Pre ug Post Interval" sa milliseconds pinaagi sa up-down nga mga kahon. Spike Tool ubos nga Toolbar
Tan-awa ang mga coordinate sa courser sa display sama sa naandan. Awtomatikong pilia ang mga sensor gamit ang "Automatic Sensor Selection" nga buton o kuhaa ang sensor pinaagi sa pag-klik sa "Remove Sensors" button. Ipasabot ang “Minimum Spike” rate ug ang “Range” pinaagi sa up-down nga mga kahon. I-klik ang "Open Sensor Selection" nga buton aron maablihan ang dialog.
Palihog ipasabot ang "Paagi sa Pagkuha", ang "Pagpahapsay" ug ang "Minimum Spike".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
I-klik ang "Open Settings Dialog" nga buton aron maablihan ang dialog.
Ipasabut ang parameter alang sa array sa sensor: Ang "Update" sa array ug ang accumulation "Accumulate" sa ms ug ang kolor sa display sa "Color Map". Window sa Hitabo sa Spike Tool
Tan-awa ang spike rate sa dependency sa oras sa "Spike Tool Event" window ug i-adjust ang threshold aron ma-trigger ang mga panghitabo pinaagi sa paglihok sa pula nga bar gamit ang mouse. Kung ang spike rate molapas sa threshold sa positibo nga direksyon, usa ka piho nga positibo nga "Spike Rate Threshold" nga panghitabo gihimo ug gipadala. Kung ang spike rate molapas sa threshold sa negatibo nga direksyon usa ka piho nga negatibo nga "Spike Rate Threshold" nga panghitabo gihimo ug gipadala. Ang mga panghitabo gipakita isip mga triangles sa orange (pagsugod sa panghitabo) ug asul (paghunong sa panghitabo) sa ubos sa mga pagsubay sa "Spike Tool Event" view. Dugang pa, kini gipadala ngadto sa "Recorder" alang sa opsyonal nga paggamit. Ang spike rate gikalkulo bisan sa tanan nga mga sensor o alang sa usa ka subset sa mga sensor. Kung walay gipili nga mga sensor ang tanan nga mga sensor gigamit. Aron mas espesipiko ang pagtuki, pilia lang ang mga sensor nga nagpakita sa kinaiya nga gusto nimo. Ang pagpugong sa pagtuki sa pipila ka mga sensor sa lahi nga temporal nga spike pattern mahimo nimong pakunhuran ang "saba" nga naggikan sa tanan nga ubang mga sensor nga wala'y kalabutan nga kalihokan. Palihug basaha usab ang kapitulo nga "Pagrekord" sa "Pag-operate sa CMOS-MEA-Control Software".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pagdasig
Palihog basaha ang kapitulo nga “Stimulation” para sa detalyadong impormasyon. Ang sa mga ulotage sa CMOS-MEA5000-System integrated stimulator naghatag sa posibilidad sa pagpukaw pinaagi sa tulo ka lain-laing mga stimulation patterns sa user-definition stimulation electrodes. Analog Channels
Walo ka analog nga "Analog Channels" ang magamit sa pagrekord sa dugang nga mga analog signal. Pagsugod ug paghunong sa mga analog nga gipakita nga gilain. Gamita ang toolbar aron i-customize ang zoom factor ug ang timeframe para sa data. Palihug basaha usab ang kapitulo nga "Mga Kinatibuk-ang Display Features". Mga Panghitabo sa Digital Port

Ang mga digital nga panghitabo mahimong mabuhat sa TTL pulses nga moabut sa "Dig In" nga mga pantalan sa interface board. Sa kahon nga "Event", pilia ang numero sa panghitabo. Alang sa matag numero sa panghitabo, ang usa ka "TINUOD" nga kondisyon mahimong ipasabut. Ang kondisyon mahimong usa ka TTL sa bisan asa sa 16 ka digital input bits, bisan ang pagtaas o pagkahulog nga kilid. Mahimo usab kini nga kombinasyon sa lainlaing mga tipik, nga mahimong ikombinar sa kondisyon nga "UG o O". Sa exampAng gipakita sa ibabaw, usa ka panghitabo No 4 ang mamugna sa pagtaas sa kilid sa usa ka TTL nga moabut sa bit 2 o bit 3 sa digital channel.
Ang mga signal sa TTL lamang ang gidawat isip mga signal sa input sa mga digital input bits. Gamita ang drop-down menu sa tool bar sa ubos aron ipahiangay ang timeframe para sa gipakita nga datos. Hawani ang tanang panghitabo gamit ang “X” nga buton. Pagsugod ug paghunong sa display nga gilain.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Detalyado View: Rehiyon sa Interesado

Ipasabut ang usa o daghang mga rehiyon nga interesado sa "Kalihokan" nga gipakita sa wala nga bahin sa main menu. Kung labaw pa sa usa ka ROI ang magamit, palihug tan-awa ang mga tab nga panid sa detalyado view. Ayaw pagpili ug daghang mga sensor para sa detalyado view, tungod kay ang pagpakita sa usa ka sensor nanginahanglan kaayo nga pasundayag sa kompyuter.

Sa tuo nga bahin sa panguna nga bintana, adunay usa ka detalyado nga pagtan-aw sa mga electrodes sa gipili nga rehiyon nga interesado. Gamita ang toolbar aron i-customize ang zoom factor ug ang timeframe para sa gipakita nga data. Usa ka Sensor View

Pagpili og usa sa mga electrodes sa ROI para sa mas duol nga pagtan-aw.
Pagsugod ug paghunong sa "Single Sensor View” gilain aron makatipig sa pasundayag sa kompyuter o aron masusi pag-ayo. Gamita ang toolbar aron i-customize ang zoom factor ug ang timeframe para sa data. Palihug basaha usab ang kapitulo nga "Mga Kinatibuk-ang Display Features".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

OPERATING CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE Set Device

Kung ang usa ka aparato dili awtomatik nga mailhan pagkahuman magsugod sa CMOS-MEA-Control Software, palihug i-klik ang icon nga "Settings".

"Data Source" nga bintana alang sa "Set Device" dialog ug pilia ang konektado nga CMOS device. Mahimo kini mahitabo sa una nga paggamit sa usa ka piho

data acquisition computer, o human sa pag-upgrade.

Pilia ang "Sample Rate” gikan sa drop-down menu. Limitado ang rehiyon sa interes samtang nagrekord nga adunay taas nga sample rates, labaw pa sa 25 kHz. Pagpili og usa ngadto sa walo ka "Analog Channels" ug ang "Digital Channel", kon gikinahanglan.
Ang sunod nga lakang mao ang pagpakusog sa aktibo nga CMOS-MEA chip.

Palihug i-klik ang CMOS-MEA icon sa "Data Source" aron ma-power ang chip. Ang tipo sa chip, ang gilay-on gikan sa sentro hangtod sa sentro sa mga electrodes sa pagrekord ug ang serial number ID giila, alang sa exampug "nMOS16". Ang "n" nagpaila sa tipo sa chip, ang "n" nagpasabut nga negatibo, ang "p" usa ka positibo nga doped chip type.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pag-calibrate sa CMOS-MEA5000-System Ibutang ang CMOS-MEA chip sa mga ulotage ug taboni kini og ngitngit nga lawak aron mawala ang impluwensya sa kahayag. Matag higayon nga ang usa ka CMOS-MEA chip ibutang sa sulod sa amplifier ug ang chip gipaandar, kini kinahanglan nga ma-calibrate. Kasagaran, ang integrated automatic calibration protocol igo na. Sa talagsaon nga mga kaso, ang awtomatik nga pagkakalibrate mapakyas. Dayon posible usab nga i-calibrate ang CMOS-MEA chip nga mano-mano. Ang duha ka mga kapilian gihulagway sa mas detalyado sa ubos.
Awtomatikong Calibration CMOS-MEA chips mga aktibo nga mga himan ug kinahanglan nga i-on ug off sa hustong paagi, kon dili sila makasinati og kadaot. Palihog i-klik ang MEA array icon sa “Data Source” nga bintana aron ma-power ang chip pataas o paubos. Ang CMOS-MEA chips kinahanglang i-calibrate sa dili pa gamiton. Ang pag-calibrate awtomatikong modagan. Kasagaran, nagkinahanglan kini og duha o tulo ka minuto.

Human ang chip gipaandar ang awtomatikong sistema sa pag-calibrate dialog gipakita. Sugdi ang awtomatik nga pag-calibrate sa sistema o isira ang dialog aron ma-calibrate ang sistema sa mano-mano.

Ang mosunud nga hinungdanon nga mga lakang alang sa pagkakalibrate awtomatiko nga gihimo. Palihug tan-awa ang protocol log file aron mamonitor ang proseso.
Ang sistema sa pag-calibrate naglangkob sa upat ka sunod-sunod nga mga lakang:
1. Ibutang ang sensor operation point. 2. Paghulat hangtud nga ang mga signal mohunong sa pag-anod. 3. I-adjust ang ADC offset. 4. I-calibrate ang mga sensor.
Sugdi ug ihunong ang pag-calibrate pinaagi sa dialog nga "Automatic System Calibration" nga adunay tagsa-tagsa nga mga buton. Pindota ang double arrow icon nga buton aron laktawan ang usa sa mga lakang sa pag-calibrate. Sa natad sa ubos ang tanan nga mga lakang sa pagkakalibrate ma-log.
Pag-calibrate sa Lakang sa Lakang
1. Pag-optimize sa Sensor Operation Point

Ang "Operating Point" lahi sa dependency sa matang sa CMOS-MEA chip. Kini awtomatiko nga itakda.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
2. Pagkontrol sa Sensor Drift
Human ang CMOS-MEA chip gipaandar ug ang operation point natakda, ang mga signal sa sensor mahimong maanod sa makadiyot. Atol sa "Sensor Drift" nga lakang, ang mga signal sa tanan nga mga sensor gisukod, ug ang mga bakilid gikalkulo. Sa diha nga ang slope median sa tanan nga mga sensor moadto ubos sa usa ka predefined threshold ang mga signal giisip nga lig-on, ug ang sunod nga lakang mahimong magsugod. Ang mga signal sa sensor pagabantayan hangtod nga kini mo-stabilize. Kung ang pag-anod sa tanan nga mga sensor gamay, ang sunod nga lakang sa pagkakalibrate mahimong mahitabo. Ang gidugayon sa pag-stabilize sa sensor mahimong magkalainlain tali sa CMOS-MEA chips ug depende sa kahimtang sa chip. Kasagaran, kini nga lakang kinahanglan nga dili magdugay sa pipila ka minuto.
3. I-adjust ang ADC Offset Sa sunod nga lakang sa pag-calibrate ang ADC (Analog to Digital Converter) offset value gi-adjust aron makit-an ang labing maayo nga offset para sa tanan o kadaghanan sa mga signal sa sensor. Ang mga signal kinahanglan nga hapit sa zero. Kung ang median sa tanan nga mga sensor nahulog ubos sa gitakda nang daan, ang "Pag-adjust sa ADC Offset" mahuman.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
4. Pag-calibrate sa mga Sensor
Sa katapusang lakang sa pag-calibrate sa sensor, usa ka reference voltage signal (sine wave) gipadapat sa kaligoanan pinaagi sa reference electrode. Kung kini nga signal dili makit-an sa mga sensor, ug busa dili makita sa usa ka channel view, kini nagpasabot nga ang mga electrodes nadaot o nga ang bath reference electrode nabuak. Manual Calibration I-klik ang opsyon nga “Setup” sa main menu para maablihan ang “Setup CMOS System” dialog. Ang "Setup CMOS System" dialog nagtugot sa pagkontrolar sa matag lakang sa sensor calibration sama sa gihulagway sa ibabaw sa mano-mano.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Ulohan
Sugdi ang pagrekord pinaagi sa "Start" button. Pagpakita sa tipo sa CMOS-MEA chip. High Pass Filter Gamita ang high pass filter atol sa pagrekord. Importante: Alang sa mga katuyoan sa pagdayagnos, palihug i-deactivate ang high pass filter aron maobserbahan ang drift ug ang offset! Chip Power Window
Human sa gahum sa CMOS-MEA chip, kamo makakaplag impormasyon mahitungod sa voltage gipadapat sa chip, nga gipakita sa up-down nga mga kahon. Ang tiggamit dili gitugotan sa pag-usab niini nga voltage nga lebel. Ibutang ang Sensor Operating Point Window

Palihug ibutang ang sensor operating point sa mV. Ang sukaranan nga mga kantidad alang sa "Source-Drain" ug ang "Source-Gate" alang sa naandan nga mga chip mao ang -600 ug -650 mV. Para sa "Low Noise" CMOS-MEA chips ang standard values mao ang: "Source-Drain" -800mV, "Source-Gate" -950mV. I-klik ang "Set" nga buton aron ma-download ang mga setting sa device. Ibutang ang AD Converter Window
I-adjust ang voltage para sa ,,Input Offset" sa mV nga mano-mano nga adunay numerical up down box. I-klik ang "Adjust Offset" nga buton aron ma-download ang setting sa device. Update
I-klik ang buton "Pag-update" aron ma-update ang dialog. Isira ang dialog gamit ang "Close" button.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Ang offset alang sa matag usa nga sensor kinahanglan nga gibanabana sa zero. Ang voltagAng gikinahanglan alang niini nga ADC offset gipakita sa mV ug mahimong mamanipula sa "Input Offset" up-down nga kahon.

Mahimo nimong obserbahan ang proseso sa ROI display ug sa single view. Pagmenos sa Naglutaw nga Artefact Window

Ipasabot ang voltage sa "Source-Bulk" sa mV pinaagi sa up-down nga kahon. I-download ang mga setting sa amplifier nga adunay "Set". Alang sa pagrekord sa datos, kinahanglan nimo ang setting nga "Ganghaan naglutaw". "Naglutaw" nagpasabot nga ang sensor nagsukod sa kaligoanan lamang. “Ganghaan sa VOP” nagpasabot sa paggamit sa usa ka voltage sa ganghaan aron mahibal-an ang usa ka punto sa pagtrabaho. Ang "Ganghaan sa VOP" nagpasabut nga usa ka voltage gipadapat sa ganghaan aron sa pagtino sa usa ka working point. Window sa Pagpadasig sa Kaligoanan
Independent gikan sa stimulation sa electrodes kini mao ang posible nga sa stimulate sa bath sa iyang kaugalingon. Gamita kini nga bahin aron mapukaw ang kompleto nga tisyu o kultura sa CMOS-MEA chip. Ipasabut ang pulso sa sine wave pinaagi sa pataas nga mga kahon nga "PP Amplitude" sa mV ug "Frequency" sa Hz. I-klik ang buton nga "Stimulate" aron masugdan ug ihunong ang pagpadasig sa kaligoanan ug tan-awa ang epekto sa single view, alang sa example. Kung ang sine wave dili makita sa usa ka channel view, kini nagpasabot nga walay signal nga mamatikdan sa CMOS-MEA sensors. Kini nagpakita nga ang mga sensor nadaot o nga ang bath reference electrode nabuak.

Bintana sa Pag-calibrate sa Sensor

Ang input voltage sa matag transistor nga katumbas sa mga sensor lahi. Ang "Sensor Calibration" function nagtakda sa input voltages sa usa ka komon nga lebel. Ang pagpukaw sa kaligoanan mao ang unang lakang, dayon ang tubag nga signal gisukod ug gisusi.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pagrekord Ang CMOS chip naglakip sa 4225 recording electrodes ug 1024 stimulation sites. Ang 16 m interelectrode distance chip nagtanyag sa labing taas nga resolusyon. Uban sa taas nga gidaghanon sa mga electrodes, mahimo nimong irekord gikan sa usa ka dako nga nawong (1 mm² @ 16 m nga gilay-on, 4 mm² @ 32 m nga gilay-on). Sa ingon, mahimo nimong makita ang mga signal gikan sa matag usa nga cell ug bisan ang pagpalapad sa signal ubay sa usa ka axon, samtang nagtapos pa.view sa imong kompleto nga sample. Ang datos kay sampgipangulohan sa 25 kHz matag channel. Kauban sa pagkakabig sa A/D sa 14 bit, gisiguro sa sistema ang tukma ug tukma nga datos. Sa ingon, ang CMOS-MEA-Control naghimo og daghang mga datos sa sulod sa mubo nga mga bahin sa panahon. Ang Multi Channel Systems MCS GmbH nagrekomenda sa usa ka labing bag-o nga kompyuter nga adunay taas nga kapasidad sa memorya. Bisan pa, mapuslanon nga limitahan ang mga oras sa pagrekord sa hingpit, kung dili ang wanang sa disk sa kompyuter sa pagkuha sa datos moawas sa dili madugay. Ang CMOS-MEA-Control nagtanyag og daghang mga posibilidad nga limitahan ang gidaghanon sa datos ug itakda ang mga oras sa pagrekord sa tukma sa mga panahon sa interes.
1. Palihug pilia ang data streams nga irekord. 2. Ipasabut ang mga kapilian kung unsaon pagsugod ug paghunong sa pagrekord. 3. Mga Opsyon: Manwal, timer, mga panghitabo (stimulator: on/off/marker, digital event tool). 4. Examples
Palihug pilia ang mga stream sa datos nga imong irekord.

Ang "Set Device" dialog makita human sa pag-klik sa "Settings" button

sa "Data Source" nga bintana. Pilia ang "Device" ug

ang “Sample Rate” gikan sa drop-down menu. Pilia ang "Analog Channels" ug ang "Digital Channels" nga gihatag gikan sa hardware.

Kung nagrekord ka gikan sa kini nga mga channel o wala gihubit sa bintana nga "Recorder" pinaagi sa tagsa-tagsa nga check box. Palihug tan-awa sa ubos.

Pagsugod ug paghunong sa recorder nga independente sa pagsugod ug paghunong sa sistema. Palihug gamita ang drop-down menu aron mapili ang mode sa pagsugod sa recorder sa usa ka bahin ug paghunong sa recording sa pikas nga bahin. Ang kombinasyon sa lainlaing mga mode nagtanyag daghang mga posibilidad sa pagrekord sa datos nga nakapunting sa mga kritikal nga panahon.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Pagsugod ug Paghunong sa Pagrekord

“Manwal”.

Palihug i-klik ang "On" / "Off" nga buton

sa ibabaw sa "Recorder" dialog sa kamut.

Pagsugod ug Paghunong sa Pagrekord pinaagi sa

"Timer".

Pilia ang "Pagsugod" nga oras ug ang oras sa pagrekord sa mga segundo gikan sa up-down nga kahon. I-enable ang check box nga "Repeat" kung gikinahanglan. Sugdi ang recorder pinaagi sa pag-klik sa buton "Sa". Karon ang recorder kay "Armed". Niini nga mode ang recorder ilabay ug maghulat sa pagsugod pinaagi sa timer o panghitabo. Ang sama nga "Armed" nga sitwasyon sa recorder mahimong mahitabo kung ang mga break tali sa mga hugna sa pagrekord giprograma.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Pagsugod ug Paghunong sa Pagrekord pinaagi sa

“Hitabo”.

Ang paggamit sa usa ka "Event" ingon pagsugod ug paghunong sa mga postula sa pag-trigger aron matukod kini nga panghitabo kaniadto. Ang usa ka "Event" mahimong usa ka digital TTL trigger nga gikan sa gawas o usa ka internal nga TTL marker signal nga giprograma sa usa ka stimulation pattern.

Kung gikinahanglan ang pag-synchronize sa CMOS-MEA-System sa ubang mga device gikan sa gawas, palihug gamita ang "Digital In" nga mga port para sa pag-trigger gamit ang TTL pulse. Paghimo og digital nga panghitabo sa dialog nga "Digital Port Events".

Niining exampAng trigger nga "Event" makita, kung ang bit 2 o bit 3 mausab gikan sa ubos (0) ngadto sa taas (1).
Palihog basaha ang kapitulo nga “Stimulation” para sa detalyadong impormasyon bahin sa paghimo ug stimulus pattern. Programa ang TTL marker signal sa dialog nga "Itakda ang Marker Signal". Ang marker signal irekord ug tipigan sa datos file alang sa tukma nga pagtandi sa datos ug marker.

Ang stimulation pattern makita sama niini, alang sa example. Ang marker signal mao ang orange nga pagsubay, nga gipakita sa ubos nga display sa kompleto nga stimulus pattern. Palihug hatagi og kahulugan ang usa ka "Marker Port" alang sa paghatud sa TTL signal.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Ang Spike Rate nagpahinabog Pagrekord Ang pagpaandar sa "Spike Tool" ug ang "Recorder" nagtugot sa pagrekord nga nagsalig sa kalihokan. Mapuslanon kini kung ang mga aktibo nga hugna gilakip sa taas nga dili aktibo nga mga hugna, pananglitanample alang sa panukiduki sa epilepsy. Gigamit kini nga bahin nga ang agwat sa palibot sa mga aktibo nga hugna gitipigan sa disk.
Ang "Recorder" nakig-uban sa mga panghitabo nga gihimo ug gipadala sa "Spike Tool". Ang mga panghitabo gipakita isip gagmay nga mga trianggulo sa base sa axis sa oras sa "Spike Tool Event" view. Ang spike rate gikalkulo bisan sa tanan nga mga sensor o alang sa usa ka subset sa mga sensor. Kung walay gipili nga mga sensor ang tanan nga mga sensor gigamit.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Aron mas espesipiko ang pag-analisa, pilia lang ang mga sensor nga nagpakita sa pamatasan nga gusto nimo.
Ang pagpugong sa pag-analisa sa pipila ka mga sensor sa usa ka lahi nga temporal spike pattern mahimo nimong makunhuran ang kasaba nga naggikan sa tanan nga ubang mga sensor nga adunay wala’y kalabutan nga kalihokan. Ang threshold (pula nga linya) mahimong ibalhin pinaagi sa mouse. Kung ang spike rate molapas sa threshold sa positibo nga direksyon (magdako) usa ka piho nga "Spike Rate Threshold (pos)" nga panghitabo gihimo ug gipadala. Kung ang spike rate molapas sa threshold sa negatibo nga direksyon (gagmay nga mga kantidad) usa ka piho nga "Spike Rate Threshold (neg)" nga panghitabo gihimo ug gipadala. Example: Giunsa pagbuhat ang Spike Rate triggered Recording Aron masugdan ang usa ka recording pinaagi sa spike activity nga gisukod sa CMOS chip pilia lang ang "Start by Event" isip start mode ug pilia ang "Spike Rate Threshold (pos)" nga opsyon sa kaubang drop down kahon. Aron mabutang ang usa ka "Offset" nga kantidad sa milliseconds nga idugang sa oras stamp sa pagsugod nga panghitabo nanginahanglan sa kinahanglanon sa usa ka buffer, nga nagtipig sa tanan nga datos sa usa ka piho nga oras. Ang negatibo nga mga kantidad nagpasabut nga ang pagrekord magsugod sa wala pa ang oras sa panghitabo stamp (nga nagpasabot sa nangagi), ang positibo nga mga bili magsugod sa pagrekord human sa panahon sa panghitabo stamp. Kay ang usa ka bili sa zero recording magsugod sa tukma sa panahon sa panghitabo stamp. Aron mahunong ang usa ka recording pinaagi sa spike nga kalihokan nga gisukod sa CMOS chip pilia ang "Spike Rate Threshold (neg)" nga panghitabo isip stop mode event. Kung ang usa ka pagrekord gisugdan ug nagpadayon, ang usa ka dugang nga panghitabo sa spike dili tagdon hangtod ang pagrekord mahunong. Busa, ang usa ka overlap sa spike triggered recording dili mahimo. Ang uban nga mapuslanon nga mga kombinasyon mahimong usa ka pagsugod sa "Spike Rate Threshold" ug usa ka paghunong sa "Timer" o usa ka pagsugod sa "Stimulus Marker" ug usa ka paghunong sa "Spike Rate Threshold".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Pasidaan sa Pagdasig: Positibo lamang voltages kinahanglan i-apply sa CMOS arrays. Negatibo nga voltages makadaot sa chip. Pag-usab sa voltages makamugna og sulog. Ang default nga porma sa pulso mao ang usa ka positibo nga voltageramp. Pasidaan: Ayaw gamita ang voltagmas taas kay sa 3.4 V, o makadaut ka sa CMOS array. Mas kusgan voltages mosangpot sa pagkahugno sa isolation layer. Kini makita sa optically sa ibabaw sa CMOS chip. Palihug tan-awa ang laraw:
Importante: Ang resolusyon sa stimulator mao ang 10 µs sa time axis ug 105 µV sa voltage. Ang stimulus generator dili makahimo sa pagpagawas sa mga pulso nga mas mubu sa 10 µs o ubos sa 105 µV, busa ang maong mga pulso gilaktawan! Importante: Mga siyam ka stimulation pads (3×3) minimum ang gikinahanglan para sa epektibong stimulation. Kini nga empirical nga kantidad balido alang sa retina, wala pa magamit nga datos alang sa mga kultura sa cell. Sukwahi sa mga regular nga MEA, ang mga silingan nga mga sensor sa pagrekord kasagarang dili mabusog sa panahon sa pagpadasig, mao nga posible ang pagrekord sa duol kaayo sa lugar sa pagpadasig.
Window sa Pagdasig

Tool Bar

Ang tool bar sa "Stimulation" nga bintana gibahin ngadto sa tulo ka mga seksyon: Usa ka position indicator, mga kontrol alang sa single stimulus patterns, ug mga kontrol nga makaapekto sa tanang tulo ka stimulus patterns. Ang function sa tanan nga mga icon gipatin-aw pinaagi sa tip sa himan, kung imong ibalhin ang mouse sa ibabaw sa icon.
Unang seksyon: Ang position indicator makatabang sa pag-navigate sa CMOS-MEA electrodes. Gipakita niini ang eksaktong posisyon sa mouse.
Ang pag-numero sa CMOS-MEA electrodes sa 65 x 65 grid nagsunod sa standard numbering scheme para sa square grids: Ang unang digit mao ang column number ug ang ikaduhang digit mao ang row number. Kay example, ang electrode 23 nahimutang sa ikaduhang kolum ug sa ikatulo nga laray.

Ikaduha nga seksyon: I-klik ang usa sa tulo ka kolor nga gi-code nga "Select Stimulus" nga mga icon

sa pagpili sa tagsa-tagsa nga stimulus pattern

para sa dugang pagproseso. Mahimo nimong ipasabut ang lokasyon sa gipili nga stimulus pinaagi sa pag-klik sa mga electrodes sa panel sa electrode o pinaagi sa pagdrowing

rectangles sa ibabaw sa gusto nga lugar. Ang matag stimulation electrode modawat sa usa ka stimulus pattern matag higayon. Dili mahimo nga mag-overlap ang mga pattern,

apan sa pag-overwrite kanila sa usa ka bag-ong pagpili o sa paghawan sa mga site.

Pag-klik sa icon nga "Define Stimulus".

magbukas ug bag-ong diyalogo nga makapahimo sa kahulugan sa stimulus pattern sama sa gipatin-aw sa

mosunod nga mga panid. Aron masugdan ang stimulation sa napili nga pattern lamang, i-klik ang "Start" icon sa ikaduhang seksyon sa tool bar.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Aron matangtang ang gipili karon nga stimulus gikan sa tanan nga mga site, palihug gamita ang "Clear selected stimulus sites" sa pinili nga pattern nga tangtangon.

butones. Tanan nga gibuhat nga mga site

Para sa pag-download ug pagsugod sa stimulus, palihug i-klik ang sunod nga buton. Para tangtangon ang tanang stimulation sites, i-klik ang "Remove all

buton sa stimulation sites. Pag-download, kung kinahanglan ug sugdi ang tanan nga stimuli kauban ang "Pag-download ug sugdi ang tanan nga Stimuli" nga buton.

Para sa pagpakita sa “Activity Map” nga bintana, palihog gamita ang “Display Activity Map” nga buton.

Ikatulo nga seksyon: Aron malimpyohan ang tanan nga mga site, i-klik ang icon nga "Clear all stimulus sites". Sugdi ang tanang stimulus patterns dungan pinaagi sa "Start" icon niini nga seksyon.

Aron maablihan ang dialog nga "Define Stimulus 2", i-klik ang icon nga "Select Stimulus 2".

. Ang icon nga "Define Stimulus".

Ang bintana sa "Stimulation" magamit. Ang matag usa sa tulo ka mga stimulus patterns 1 (berde), 2 (asul) o 3 (pula) mahimong ipasabut nga independente.

Ang diyalogo alang sa mga setting sa mga sumbanan sa stimulus mao ang paghimo sa analog, palihug tan-awa, alang sa exampug, ang dialog nga "Define Stimulus 2".

Ang dialog nga "Define Stimulus" gibahin sa taas ug ubos nga seksyon. Ang ibabaw nga bahin naglakip sa "Primitives", nga nagpasabot, ang mga icon alang sa gihatag nga stimulus patterns, sama sa patag nga linya, ramp o mga balod sa sine. Ang katapusan nga icon nagrepresentar sa ASCII files namugna sa usa ka lain nga software, alang sa example MC_Stimulus II, nga mahimong ma-import sa CMOS-MEA-Control software. Ang ubos nga seksyon sa dialog nagpakita sa

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
"Kompleto nga Stimulus Pattern" ug usa ka tool bar. Ang mga setting sa tool bar nag-impluwensya sa kompleto nga han-ay sa mga pattern sa stimulus nga gipakita dayon sa bintana alang sa "Kumpleto nga Stimulus Pattern". Ang puti nga menu bar nga "Pagtukod og Stimulus" sa tunga-tunga sa dialogo alang sa paghimo sa gitinguha nga stimulus pattern gikan sa gihatag nga default stimulus patterns, nga gitawag og "Primitives" o alang sa pag-import sa external nga gimugna nga stimulus patterns. Mahimo nimong i-modulate ang matag pattern nga "Primitive" pinaagi sa indibidwal nga "Mga Setting sa Parameter" ug ang modulasyon ipakita dayon sa "Single Pattern" view ug usab sa view alang sa "Kompleto nga Stimulus Pattern".
Pagtukod og Sumbanan sa Stimulus
Sa wala nga bahin sa ibabaw nga seksyon, mahimo nimong pilion ang gihatag nga default stimulus pattern. Ibalhin ang karaan nga icon pinaagi sa pag-drag ug paghulog sa puti nga uma sa tunga-tunga sa dialogo alang sa paghimo sa usa ka sumbanan sa pagpadasig nga gipasabut sa gumagamit. Idugang ang daghang mga primitive kung gikinahanglan. Posible nga usbon ang pagkasunod-sunod sa mga primitive pinaagi sa pag-drag ug paghulog. Para sa pagtangtang sa usa sa pattern, palihog ihulog kini sa bin. Pagbutang ug Marker Signal

Dugang pa, posible nga magbutang usa ka signal sa marker. Ablihi ang dialog nga "Set Marker Signal" pinaagi sa pag-klik sa check box nga "Set Marker"

sa bintana alang sa mga setting sa parameter. I-klik ang check box nga "Set Marker" ug i-klik ang "Repeat" kung gusto nimong balikon ang marker signal sa matag cycle sa stimulation pattern. I-adjust ang "Offset" sa s ug ang "Duration" sa s sa marker signal pinaagi sa up-down nga mga kahon. Ang kolor nga orange nga marker signal ipakita sa bintana para sa "Complete Stimulus Pattern".

Modulasyon sa gihatag nga Stimulation Patterns

Sa sinugdan ang gihatag nga stimulation patterns kay default. Aron ma-adjust ang usa ka primitive sa imong mga kinahanglanon, palihug i-klik ang icon, nga i-highlight sa luspad nga asul. Sa ibabaw nga bahin sa dialog ang setting parameters alang niini nga pattern makita sa wala ug usa ka hulagway sa aktwal nga porma sa pattern sa tuo. Diha-diha dayon human sa pag-usab sa usa ka sumbanan, ang modulasyon makita sa "Single Pattern" view ug sa "Kompleto nga Stimulus Pattern" view. I-save ang stimulus pattern isip default pinaagi sa pag-klik

ang "Save Primitive as Default" nga icon

tupad sa check box nga "Marker".

Kadaghanan sa mga parameter kinahanglang i-adjust gamit ang up-down nga mga kahon. Palihug i-klik ang up-down nga kahon ug ibalhin ang ligid sa imong mouse para sa dali nga pag-adjust sa lapad nga mga lakang. Gamita ang mga udyong para sa maayong pag-tune. Ang modulasyon gipakita dayon sa usa ka sumbanan ug sa kompleto nga bintana sa sumbanan. I-overwrite ang letra sa up-down nga kahon, ang modulasyon ipakita human makumpirma ang kantidad gamit ang "Enter" o pagkahuman sa pag-klik sa lain nga kahon. Ang pagdula sa lainlaing mga posibilidad alang sa pag-adjust nagtugot sa paghimo sa matag porma sa pulso nga mahimong kinahanglanon. Dugang pa, posible nga i-modulate ang porma, kung gisubli ang mga pulso sa relasyon sa usag usa.

Multi Pattern Mode
Ang "Multi Pattern Mode" nagtugot sa automated nga aplikasyon sa usa ka lista sa predefined stimulation electrode patterns. Ang mga pattern gipadapat sa usag usa pagkahuman sa pagsugod nga signal. Ang lista sa pattern mahimong balik-balik nga magamit depende sa setting nga "Loop". Ang parehas nga pulso sa pagpadasig gigamit sa matag usa sa mga sumbanan.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

Ang ,,Multi Pattern Mode” mahimong i-toggle pinaagi sa ,,Enable Stimulator Multi Pattern Mode” check box sa ,,Tools” sa ,,Application Settings” dialog. Kung mahimo, ang usa ka panel makita sa tuo sa layout sa electrode.

Ang matag entry sa listahan naghubit sa usa ka pattern ug mahimong adunay usa o daghang pinili nga stimulation electrodes, para sa usa o daghan pang stimulators, nga gisimbolohan sa berde, asul, ug pula. Ang listahan nagpakita sa mga entri sa numero nga han-ay uban sa gidaghanon sa mga pinili nga electrodes alang sa matag stimulator sa parenthesis. Kung ang usa ka entry sa lista gipili ang pattern sa electrode alang sa tanan nga mga stimulator gipakita. Tungod sa mga pagdili sa internal nga panumduman, ang gidaghanon sa mga entry sa listahan limitado sa 256.

Ang mga gimbuhaton sa ,,Stimulator Multi Pattern Mode" interface mao ang mosunod:
· Clone: Pagdugang og entry sa lista nga adunay parehas nga pattern sa gipili karon. · Pagdugang Bag-o: Pagdugang usa ka bag-ong entry sa katapusan sa lista nga adunay walay sulod nga pattern sa electrode. · Pagtangtang: Pagtangtang sa gipili karon nga entry gikan sa lista. · I-save/Load: Gitipigan ang lista sa pattern sa a file o load gikan sa a file (*.lmp). Pattern lang files nga adunay parehas nga layout sa MEA mahimong ma-load.
Ang loading mo-overwrite sa kasamtangan nga mga entry sa listahan.
· Loop: Gitino ang pagbalhin sa sunod nga pattern sa lista. o gipalong: usa ra ka pattern ang gipadapat, hangtod nga ang sunod nga gatilyo mahitabo o 1: ang tanan nga mga pattern sa lista gigamit kausa, usa sa usa o 2,3: ang tanan nga mga pattern sa lista gipadapat sa usag usa, unya ang lista gisubli duha o tulo ka beses, sa tinagsa o walay katapusan: ang lista sa pattern gipadapat hangtod nahunong ang pagpadasig
· I-restart: I-reset ang kasamtangang pattern sa unang entry sa listahan.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Gi-deactivate/Gi-aktibo Ang daghang mga pattern awtomatik nga gi-download sa device, samtang ang buton ,,Na-deactivate” pula. Pag-klik sa buton ug ang aparato armado, ang buton nahimo nga berde,, Gi-aktibo". Sugdi ang stimulation pinaagi sa ,,Download ug Start” button sa predefined modes.
Kung ang ,,Loop” mapalong, ang stimulator mahunong pagkahuman sa pattern sa stimulation hangtod nga mahitabo ang sunod nga pagsugod. Ang sunod nga pattern sa electrode sa lista dayon gipili ug gipadapat sa sunod nga gatilyo. Kung ang ,,Loop” gi-on, ang mga pattern sa lista awtomatiko nga gipadapat sa usag usa (tan-awa sa ibabaw). Kinahanglan adunay labing menos usa ka electrode nga gipili, kung dili ang pagbalhin sa sunod nga pattern dili mahitabo. Kung ang stimulator gihunong sa mano-mano, nan walay switch sa sunod nga electrode pattern mahitabo. Ang pagdumala sa pattern sa stimulus wala mausab sa ,,Multi Pattern Mode", uban sa usa ka eksepsiyon: Usa ka stimulation pattern nga adunay ,,walay kinutuban" loop dili uyon sa ,,Multi Pattern Mode" function. Ang usa ka sumbanan nga adunay walay kinutuban nga gidugayon magdili sa pagbalhin sa mga pattern sa electrode.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Stimulus Pattern: Patag nga Linya

Ang una nga gihatag nga primitive mao ang usa ka flat line stimulus. Aron ma-adjust ang gidugayon, palihog gamita ang tagsa-tagsa nga up-down nga mga kahon: Oras, minuto, segundo, millisecond ug microsecond. Ipasabut ang bili sa sumbanan sa "Amplitude (mV)” up-down nga kahon.
Stimulus Pattern: Sine Wave Warning: Negative voltages makadaot sa CMOS arrays. Ang mga balud sa sine kinahanglan nga ibalhin sa usa ka offset sa positibo nga range! Modulate ang amplitud “PP Amp (mV)", ang panahon nga "Period (s), ang pagbalhin "Shift" ug ang hugna nga "Phase (') sa sine wave pattern pinaagi sa up-down nga mga kahon. Ang pagbutang sa gidaghanon sa mga cycle ngadto sa labaw sa usa makapahimo sa inter stimulus interval "ISI (s)" up-down box. Dugang pa, ang "Arrow" nga buton ma-enable.

Kung mogamit labaw pa sa usa ka siklo mahimo nimong i-klik ang simbolo sa arrow alang sa dugang nga mga kapilian: Ang usa ka gipasiugda nga field sa parameter makita aron mabag-o ang amplitude ug ang panahon sa mga sine wave sa relasyon sa usag usa. Niining example nagdugang sa amplitude sa matag sine wave sa 16 mV kon itandi sa sine wave kaniadto. Pagpili sa negatibo nga kantidad gikan sa up-down nga kahon, ang ampang litude mokunhod kon itandi sa balud kaniadto. Analogous mahimo nimong ipasibo ang bili sa panahon sa s kalabot sa mga han-ay sa balud. Ang bintana nga "Single Pattern" nagpakita sa mga sine wave sa usa ka overlay plot. Ang ubos nga bintana nga "Kompleto nga Stimulation Pattern" nagpakita sa hiniusa nga han-ay sa tanan nga stimulus pulses.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Sumbanan sa Pagdasig: Ramp Ang katumbas sa usa ka biphasic kasamtangan nga pulso mao ang usa ka triangular voltageramp. Mga 9 ka stimulation pads (3×3) minimum ang gikinahanglan para sa epektibong stimulation (balido alang sa retina, wala pay datos alang sa cell culture). Sukwahi sa mga regular nga MEA, ang silingan nga mga sensor sa pagrekord kasagaran DILI mabusog sa panahon sa pagpadasig, mao nga posible ang pagrekord sa duol kaayo sa lugar sa pagpadasig. Modulate ang amplitud "Amplitude (mV)” ug ang gidugayon nga “Duration (s)” sa ramp pulso pinaagi sa up-down nga mga kahon. Aron ma-adjust ang katig-a sa mga bukton sa pulso, palihug gamita ang tulo ka up-down nga mga kahon para sa nagsaka nga bahin, ang talampas ug ang paubos nga bukton nga independente sa usag usa. Ang pagbutang sa gidaghanon sa mga cycle ngadto sa labaw sa usa makapahimo sa inter stimulus interval "ISI (s)" up-down box. Dugang pa, ang "Arrow" nga buton ma-enable.

Kung mogamit labaw pa sa usa ka siklo mahimo nimong i-klik ang simbolo sa arrow alang sa dugang nga mga kapilian: Ang usa ka gipasiugda nga field sa parameter makita aron mabag-o ang amplitude ug ang gidugayon sa ramp pulso sa relasyon sa usag usa. Ang bintana nga "Single Pattern" nagpakita sa ramp pulso sa usa ka overlay plot. Ang ubos nga bintana nga "Kompleto nga Stimulation Pattern" nagpakita sa hiniusa nga han-ay sa tanan nga stimulus pulses.
Stimulus Pattern: Biological Pulse pinaagi sa ASCII Import Warning: Negative voltages makadaot sa CMOS arrays. Ang mga balud sa sine kinahanglan nga ibalhin sa usa ka offset sa positibo nga range! Importante: Ang resolusyon sa stimulator mao ang 10 µs sa time axis ug 105 µV sa voltage. Ang stimulus generator dili makahimo sa pagpagawas sa mga pulso nga mas mubu sa 10 µs o ubos sa 105 µV, busa ang maong mga pulso gilaktawan! Kung ganahan ka mugamit, for example, usa ka biological nga signal ingon nga stimulus pulse o gusto nimo nga maghimo usa ka arbitraryong sumbanan, mahimo nimong i-import ang mga signal pinaagi sa pag-klik sa buton nga "Import". Ang imported file kinahanglan nga kinahanglan adunay mosunod nga pormat:

Takdang panahonamp Voltage Panahon sa Biliamp Voltage Panahon sa Biliamp Voltage Bili…
Ang yunit sa orasamp mao ang "µs" ug ang kantidad sa oras kinahanglan nga naa sa pataas nga han-ay. Ang yunit sa voltage value kay “µV”. Ang mga yunit dili bahin sa file. Ang CMOS-MEA-Control software modawat lamang ug mga integer ug mga koma, mga tabulator o mga luna aron mabulag ang orasamp ug ang voltage bili. Palihug kuhaa ang posible nga header, likayi ang mga blanc nga linya ug gamita ang bag-ong linya para sa matag pares nga integer. I-save ang file walay extension o uban sa bisan unsa nga extension "*.dat", alang sa example, o “*.csv”, kon mogamit ug comma separated file.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Kung ang import file wala makatuman sa mga kinahanglanon, usa ka mensahe sa sayup ang gipakita. Stimulus Pattern: Biological Pulse Example: Import sa mosunod file ingon stimulation pattern:

Mubo nga sulat: Tungod kay ang bakilid sa signal nagtino sa kalig-on sa induced nga kasamtangan, palihug idugang ramps sa pagsugod ug paghunong sa biological signal aron malikayan ang stimulation artefacts.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE
Sumbanan sa Pagpukaw: Loop

Ibutang ang bisan unsang stimulus pattern tali sa usa ka "Loop" primitive ug ang mga pattern mahimong masubli sa kanunay kung gikinahanglan. Palihug pilia ang gidaghanon sa pag-loop nga "Mga Siklo" gikan sa up-down nga kahon. Ang "Loop" primitive dili mabalhin sa han-ay sa mga pattern sa stimulus. Ihulog kini sa bin ug pagsugod pag-usab aron usbon ang posisyon sa pattern nga "Loop". Posible nga makahimo og mga convoluted patterns.

Aron ibutang ang usa ka primitive tali sa "Start Loop"

ug "Stop Loop"

bracket, palihog i-drag ug ihulog una ang tagsa-tagsa ka primitive

atubangan o luyo sa mga braket ug dayon sa wala o sa tuo ibabaw sa usa sa mga buton sa bracket tali kanila.

Tool Bar
Ang mga setting sa kini nga tool bar nag-impluwensya sa kompleto nga pagkasunod-sunod sa mga pattern sa stimulus. Modulate ang "Amplitude (%)” ug ang “Offset (mV)” sa kompletong pattern pinaagi sa up-down nga mga kahon.

Ang pag-klik sa "Loop" nga buton makapahimo kanimo sa walay katapusan nga pagsubli sa gipiho nga stimulus pattern. I-load ang nauna nga nahimo nga stimulus pattern, i-save o tangtangon ang pattern. Kung mogamit mga signal sa marker, kinahanglan nimo nga ipasabut kung kinsa sa "Marker Port" (digital out) ang kinahanglan magpakita sa katugbang nga mga signal sa TTL. Pagpili og usa sa mga marker port gikan sa drop-down menu ug ikonektar ang TTL signal source ngadto sa port.

Sugdi ang stimulation sa kamut.
I-download ug sugdi ang gibuhat nga stimulus pattern pinaagi sa icon nga "Download". Kung dili kinahanglan ang pag-download, ang icon dili magamit. Niining paagiha aduna kay optical feedback para sa pag-download.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS

CMOS-MEA-TOOLS Pasiuna Ang software alang sa pagkontrol sa CMOS-MEA5000-System naglakip sa duha ka bahin, CMOS-MEA-Control para sa online recording ug CMOS-MEATools para sa offline nga pagtuki. Uban sa software nga Multi Channel DataManager mahimo nimong i-export ang data sa mga aplikasyon sa ikatulo nga partido. Panguna nga Bintana

Ang default nga bintana sa start menu gibahin sa duha ka nag-unang mga seksyon: Ang "Control Window" ug ang "Data Display o Settings Window". Ang wala nga bahin adunay mga function sa pagkontrol: Ang "Instrument Tree" view ug ang "Katingbanan sa Kalihokan" nga bintana. Tan-awa ang temporalview sa kompleto file sa duha ka tab nga panid: Ang tab nga "Explore Activity" nagpakita sa tanan nga mga spike, sa tab nga "Event" gilista ang mga stimulator nga mga panghitabo. Ang ikatulo nga bintana nagpakita sa "Spatial Distribution". Ang tuo nga bahin naglakip sa mga data display o setting windows ug adunay upat ka tab nga may kalabotan sa mga instrumento nga gilista sa kahoy view: "Filter Pipeline", "Raw Data Explorer", "Spike Explorer" ug "STA Explorer". Ang duha ka bintana gi-frame sa menu ug tool bar sa header ug sa file impormasyon sa footer. File
Menu sa pag-import sa hilaw nga datos alang sa pagtuki: "Open Raw Data File” nga may extension nga “*.cmcr” nga gihimo gamit ang “CMOS-MEA-Control” software para sa pagtuki ug sa “Exit” sa programa. Menu sa "Resulta sa Pag-load File” nga may extension nga “*.cmtr” para sa reanalysis ug sa pagluwas sa resulta files. Menu sa "Exit" sa programa.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Nagsunod file ang mga format anaa alang sa CMOS-MEA-Tools:
· *.cmcr: CMOS-MEA-Control Raw Data · *.cmct: CMOS-MEA-Control Templates · *.cmtr: CMOS-MEA-Tools Resulta · *.cmtt: CMOS-MEA-Tools Templates · *.cmte: CMOS-MEA-Mga Himan Export
Mubo nga sulat: I-double click ang "CMOS-MEA-Control Raw Data" o "CMOS-MEA-Tools Resulta" file aron ablihan kini direkta gikan sa usa ka folder nga wala magsugod sa CMOS-MEA-Tools software kaniadto. Analisaha
Menu alang sa pagtuki sa imported file. Sugdi ang pagtuki gamit ang "Process Segment" nga sugo alang sa usa ka bahin ug sa "Process File” sugo para sa kompleto file. I-klik ang "Batch Analysis" aron maanalisa ang labaw sa usa file sa usa ka batch. Mga setting
Menu aron itakda ang "Mga Setting sa Aplikasyon" ug i-load ug i-save ang mga template. Menu aron maablihan ang dialog nga "Labbook".

Dialog nga adunay tulo ka tab alang sa kinatibuk-ang impormasyon bahin sa eksperimento. Isulat ang datos nga nagtumong sa imong eksperimento sa tab nga "Pagtuon", "General" nga mga nota bahin sa siyentista ug institusyon ug tags ug libre nga teksto sa "Tags ug Notes” tab. Ang “Labbook Settings” itago sa “CMOS-MEA-Tools” nga resulta file “*.cmtr”. Tabang
Menu sa pag-abli sa "Online Tabang" ug sa "Check for Update" ug tan-awa ang impormasyon sa "About".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Ang opsyon nga “Check for Update” naghatag ug paspas nga access sa MCS website.

Kung ang software sa CMOS-MEA-Tools dili bag-o, i-klik ang buton nga "Bisita Website” ug i-download ang pinakabag-o nga bersyon sa software o gamita ang “Download” nga buton aron direktang i-download ang update.
I-klik ang "About" aron maablihan ang dialog.

Ang dialogo nagpakita sa batakang impormasyon mahitungod sa CMOS-MEA-Tools software version. Mubo nga sulat: Palihug hinumdumi nga ang impormasyon niini nga dialogo gikinahanglan sa kaso sa suporta!
Toolbar

Buksan ang Hilaw nga Data File
I-klik ang "Open Raw Data File"sa"File” nga menu o i-klik ang “Open Raw Data” icon Data File” makita.

sa toolbar. Ang dialog nga "Pilia ang CMOS-MEA-Raw

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
I-klik ang "Open Raw Data File” aron maablihan ang dialog nga “Pilia ang CMOS-MEA Raw Data File”.

Pilia ang agianan sa pag-input. Ang programa nag-scan sa folder alang sa analyzable files: “*.cmcr” CMOS-MEA-Control Raw data ug “*.cmtr” CMOS-MEA-Tools Resulta files. Kini nga pagpangita mahimo’g magdugay, palihug tan-awa ang bar sa dialog nga "Pag-scan sa Input Folder".

Anaa files gilista sa ibabaw nga bahin sa dialog. Pagpili og data file gikan sa lista ug pagpangita og impormasyon mahitungod sa "File Ngalan, Petsa, Gidugayon, Mga Hitabo, Gidak-on, Bersyon sa SW, Chip ID ug Impormasyon sa Chip”. Usa ka pinili file Gipasiugda sa asul ug ang mga entri sa lab nga libro sa tagsa-tagsa file gipakita sa ubos nga bahin sa dialog.

Bukas a file nga adunay doble nga pag-klik sa gipili file o pinaagi sa pagpindot sa “Open File” “Pangita balik-balik” sa ulohan sa dialog, kon gikinahanglan.

butones. “I-refresh” ang listahan o i-klik ang check box

Bukas nga Resulta File

I-klik ang "Load Result" nga buton aron maablihan ang resulta file

ug ang “Pilia ang CMOS-MEA-Results File” pagbukas sa dialogo. Resulta files adunay

extension nga “*.cmtr”. Usisaa liwat ang resulta file ug tipigi kini pag-usab ubos sa bag-ong ngalan.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS

Pagtuki sa Batch
Kini nga bahin nagtugot sa pag-analisar sa usa ka gidaghanon sa files tanan sa makausa, nga makatabang sa kaso sa usa ka dako nga kantidad sa data files.
Aron maproseso ang daghan files sa usa ka run mahimo nimong gamiton ang "Batch Analysis" built-in nga bahin sa CMOS-MEA-Tools. Ang pinili nga hilaw nga datos files giproseso sa usag usa gamit ang usa ka predefined set sa mga himan ug mga setting. Alang sa matag hilaw nga datos file, usa ka bulag nga resulta gitipigan sa usa ka gitakda nang daan nga lokasyon. Kini nagtugot sa pagdagan sa usa ka panahon nga nagaut-ut pagtuki sa daghan files walay kanunay nga pagdumala.

Pag-klik sa "Batch Analysis"

sa pag-abli sa dialog alang sa pagpili sa filepara sa usa ka batch.

Palihug pilia ang "Input Path" sa ulohan. Ang input path mao ang root directory nga gigamit alang sa pagpangita sa hilaw nga datos files. Kung gipili ang check box nga "Recursively Search", ang tanan nga mga subfolder sa agianan sa input gipangita. Ang files sa matag folder gipakita isip usa ka grupo. Pilia ang tanan files pinaagi sa pag-klik sa “Select/Deselect All” button o i-toggle ang pagpili sa a file pinaagi sa pagpindot sa “Select/Deselect” button sa unang kolum atubangan sa file ngalan. Ang output path naghubit sa root directory alang sa resulta files. Kung ang hilaw nga datos files nahimutang sa lainlaing mga folder, ang parehas nga istruktura sa folder gihimo alang sa resulta files. Sugdi ang "Batch Analysis" pinaagi sa pagpindot sa "Start" button. Ang gipili files giproseso gikan sa taas hangtod sa ubos ug ang kahimtang sa pagproseso gihulagway sa mga progress bar. Ang batch analysis mahimong mahunong pinaagi sa pagpindot sa "Stop" button.
Pag-analisar Girekomenda nga Trabaho
1. Summary 2. Pagsuhid 3. Proseso File 4. Batch Analysis Sa diha nga nagkarga sa usa ka hilaw nga datos file, ang software magsugod sa "Explore" mode. Gitugotan niini ang pagsusi sa mga bahin sa hilaw nga datos sa "Raw Data Explorer". Usa ka overview sa temporal ug spatial nga kalihokan sa spiking sa imong data set mahimong makuha gamit ang "Summary Tool". Gawas sa paghanduraw sa hilaw nga datos, ang nag-unang gamit sa "Explore" mode mao ang pagsulay ug pagpahiangay sa lain-laing mga setting, sama sa filter o spike detector parameters. Kung matagbaw ka, mahimo nimong analisahon ang tibuuk file uban niini nga mga setting gamit ang "Proseso File”. Sa katapusan, ang mode nga "Batch Analysis" mahimong magamit sa pag-analisar sa daghang hilaw nga datos files nga adunay usa o daghang mga set sa parameter sa pag-analisa.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Girekomenda nga Workflow alang sa mga Resulta Files Kung nag-load sa usa ka resulta file, ang software magsugod sa “Process File” mode ug ipakita ang mga resulta nga anaa sa file. Sama sa alang sa hilaw nga datos files, mahimo ka magbalhin sa mode nga "Explore" aron masulayan ang mga bag-ong set sa parameter sa mga bahin sa data ug sa view ang hilaw nga data sa sensor. Bisan pa, palihug hibaloi nga ang pagbalhin sa mode nga "Explore" isalikway ang karon nga mga resulta nga gipakita sa software sa CMOS-MEA-Tools. Pagpindot sa "Proseso File” mag-analisar pag-usab sa hilaw nga datos file nalangkit sa resulta file gamit ang kasamtangan nga set sa parameter. Ang pag-uswag sa pagtuki sa datos gipakita dayon sa instrument tree view. Impormasyon sa aktuwal nga gi-analisa file gipakita sa footer.

1. Sumaryo

Ang "Summary" nga himan naghatag og usa ka bagis nga temporal ug spatial sa ibabawview sa kalihokan sa file pinaagi sa pag-analisar sa kinatibuk-an file nga adunay usa ka yano nga pamaagi sa pag-ila sa spike. Mahimong mapuslanon kaayo ang pagdeterminar sa mga rehiyon sa interes para sa mas detalyado nga pagtuki gamit ang “Explore” mode.

Pindota ang buton nga "Open Settings Dialog"

aron ma-optimize ang spike detector ug ang mga setting sa visualization.

I-adjust ang mga setting para sa pagtuki. Mahimong kinahanglan nga magdula og gamay sa mga setting hangtod makit-an nimo ang labing kaayo nga mga setting.
2. Explore Mode
Ang "Explore" mode naglihok pinaagi sa pag-load sa usa ka bahin sa oras sa hilaw nga datos ngadto sa memorya nga mahimo unya nga makita sa "Raw Data Explorer" o gamiton sa pagsulay sa lain-laing mga parameter sa pagtuki.
Ang gi-load nga bahin sa oras gi-highlight sa light blue sa tab nga "Explore Activity". Ang gidugayon niini limitado sa labing taas nga 3 segundos aron dili molapas sa kapasidad sa memorya. Kung aktibo ang ubang mga himan sa pagtuki, analisa usab nila ang gikarga nga bahin sa datos. Tungod kay ang pagpadagan sa usa ka bug-os nga spike sorting analysis sa loaded data segment mahimong magdugay, ang "Spike Sorter" mohimo lang sa ROI detection sa "Explore" mode.
Palihug gamita ang "Proseso File” o “Batch Analysis” mode para magpadagan ug full spike sorting analysis.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
3. Proseso File Pagkahuman sa pagtakda sa mga parameter sa pag-analisar, alang sa example human ma-optimize kini pinaagi sa "Explore" mode, pindota ang "Process File” aron analisahon ang kompleto file. Alang sa pagtuki, ang datos gikarga sa mubo nga mga bahin sa oras ug giproseso sa tanan nga aktibo nga mga himan sa pagtuki. Ang pag-uswag sa pag-analisa makita sa "Pag-usisa nga Kalihokan" view. Kung ang "Spike Sorter" ug / o ang "STA Explorer" nga himan aktibo, kini magkinahanglan labaw pa sa usa ka pag-agi sa file aron mahuman ang pagtuki. Ang "Raw Data Explorer" gi-disable sa "Proseso File” mode, tungod kay dili posible nga ma-load ang tibuuk nga hilaw nga datos file sa memorya para sa paghanduraw. Ang gidaghanon sa oras nga gikinahanglan alang sa usa ka kompleto nga pagtuki sa a file depende sa gitas-on sa recording ug sa performance sa computer. Palihug hibaloi nga ang pagpadagan sa spike sorting analysis mahimong magkinahanglan ug daghang panahon.
4. Batch Analysis Ang "Batch Analysis" mode mahimong gamiton sa pag-analisar sa usa o daghan pa nga hilaw nga datos files nga adunay lainlaing mga set sa pagtuki. Palihug basaha ang kapitulo nga "Batch Analysis" sa ibabaw para sa dugang nga impormasyon. Ang gidugayon sa panahon alang sa batch analysis nagdepende sa gitas-on sa mga rekording ug sa performance sa kompyuter. Palihug hibaloi nga ang pagpadagan sa spike sorting analysis mahimong magkinahanglan ug daghang panahon.
Control Window

Ang "Control Section" sa wala nga bahin sa display naglangkob sa tulo ka mga bintana: Ang "Instrument Tree" sa anaa nga mga instrumento sa ibabaw, ang temporal nga "Activity Summary" nga bintana ug ang spatial distribution nga "Summary" nga bintana sa ubos.
Toolbar

I-klik ang kalkulasyon sa icon nga "Create Summary".

o gamita ang menu nga “Analyze” para sa pagkarga sa datos sa RAM. Karon ang hilaw nga datos magamit alang sa

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS

I-klik ang "Open Settings Dialog"

ug ang mosunod nga dialog makita. I-adjust ang mga setting para sa pagtuki.

Palihug ipasabot ang threshold. Pilia ang "Threshold Type" gikan sa drop-down menu, "Positibo", "Negatibo" o "Absolute". Pilia ang "Threshold" nga kantidad ug ang "Detection Dead Time" sa ms uban ang up-down nga mga kahon. Pilia ang "Laki sa Bin" sa ms nga adunay up-down nga kahon. Pilia ang kolor sa "Color Map". Aron balit-aron ang mga kolor, palihog i-klik ang check box nga “Invert”. Kahoy nga Instrumento
Ang kahoy View” nagpakita sa tanang magamit nga instrumento ug sa aktuwal nga kahimtang. Pag-klik sa bisan unsang mga instrumento sa kahoy view aron ma-adjust ang bisan unsang parameter. Ablihi ang tagsa-tagsa nga tab nga panid sa maong instrumento sa "Data Display o Settings" nga bintana, alang sa exampug "Spike Sorting" ingon sa gipakita sa screenshot sa ubos. Palihog basaha ang kapitulo,, Spike Sorter Tool” sa panid Fehler! Textmarke nicht definiert. para sa detalyadong impormasyon.

Kung gi-klik ang buton nga "Pag-usisa sa Mga Segment sa Data".

, tanan nga datos nga gipili sa kasamtangan nga bahin sa datos sa "Katingbanan sa Kalihokan"

gi-analisa ang bintana. O i-klik ang "Proseso File” butones

sa pagsugod sa pagtuki alang sa kompleto file. Atol sa mga proseso sa pagtuki kanimo

maobserbahan ang pag-uswag nga gipakita sa dagan sa datos, gipasiugda sa luspad nga asul.

Human sa malampuson nga pagtuki ang nalambigit nga mga instrumento nagpakita og marka sa tsek.

Sa mga kaso nga adunay daghang mga datos mahimo’g dili posible nga ma-load ang usa ka kompleto file ngadto sa RAM ug ang pagtuki kinahanglang balikon o kon ang pagtuki nahunong o nabalda sa bisan unsang rason, ang tagsa-tagsa nga instrumento walay marka sa tsek. Niining paagiha dali nga makontrol ang pagtuki.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Summary sa Kalihokan

Ang duha nga mga bintana nagpakita sa usa ka katingbanan sa nakita nga mga spike sa kompleto file. Ang dayagram sa ibabaw nagpakita sa temporal nga overview, ang mapa sa ubos nagpakita sa spatial overview.
Pag-usisa sa Kalihokan

Ang temporal nahumanview nagpakita sa gidaghanon sa namatikdan nga mga spike kada bin nga gidugang gikan sa tanan nga mga channel alang sa kompleto nga gidugayon sa panahon sa file. Mao nga makita nimo ang labing aktibo nga yugto sa panahon sa panahon sa pagrekord sa usa ka pagtan-aw.
Pagpili og gidugayon sa panahon nga gusto nimong analisahon sa diagram nga "Oras". I-klik ang icon nga "Pag-usisa sa manual nga gitakda nga agwat" aron mano-mano nga itakda ang gidugayon sa oras.
I-klik ang asul nga mga bar ug ibalhin kini pinaagi sa drag ug drop sa gusto nga mga posisyon. Ang oras tali sa asul nga mga bar, nga kalkulado gipasiugda sa asul. Ang mga spike kada bin gikalkula batok sa oras. Pag-zoom sa data pinaagi sa paglihok sa mouse gikan sa wala ngadto sa tuo ug sa pag-zoom out gikan sa tuo ngadto sa wala.
Mga panghitabo

Pag-klik sa "Katingbanan sa Kalihokan" nga bintana ang tab nga panid nga "Mga Panghitabo" aron ilista ang tanan nga mga digital nga panghitabo gikan sa stimulator, nga natala sa kana. file uban sa tagsa-tagsa nga oras stamp sa timbangan. Ang lainlaing mga panghitabo sa stimulator adunay kolor nga code. Pagpili og usa o labaw pa sa usa ka panghitabo nga gi-highlight sa berde ug gamita kini nga mga panghitabo alang sa nabigasyon pinaagi sa file sa tab nga "Explore Activity".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS

Ang buton nga "Pag-usisa base sa Panghitabo"

ug ang tool bar sa tupad anaa na karon.

Ang pinili nga mga panghitabo makita nga color code ubos sa data. Ambak pinaagi sa arrow buton "Adto sa sunod / miaging Hitabo" gikan sa panghitabo ngadto sa panghitabo, ang aktuwal nga bahin sa oras nga gipakita sa asul nga mga bar sama sa naandan. Palihug ipasabut ang bahin sa oras nga "Pre" ug "I-post" ang digital nga panghitabo sa ms nga adunay mga up-down nga kahon. Samtang naglukso-lukso gikan sa panghitabo ngadto sa panghitabo ang data nga gipakita sa "Raw Data Explorer" nga bintana sa tuo nga bahin gipasibo dayon.

Sa umaabot nga mga bersyon niini nga software, ang pagtuki nga gibase sa panghitabo mahimong magamit. Palihug tan-awa ang MCS web site alang sa balita.

Spatial nga Distribusyon
Nahuman ang spatialview nagpakita sa gidaghanon sa namatikdan nga mga spike kada channel para sa kompleto file color coded sa mapa. Sayon ang pag-obserbar sa labing aktibo nga mga lugar sa array.

Ang mga numero sa mga bracket mao ang mga coordinate sa mouse sa spike distribution map.
I-adjust ang "Range" gamit ang up-down nga kahon. Ang range gibase sa gidaghanon sa mga spike kada sensor. Ang ubos nga range, mas taas ang spatial distribution sa mga sensor nga adunay mga spike nga gidugang ngadto sa "Range" value. Ang kolor sa mapa nagpakita sa mga sentro sa kalihokan dugang pa.

Ipasabot ang kolor sa mapa sa “Summary Tool Settings”

dayalogo.

Data Display ug Settings Window Kini nga bintana adunay lima ka tabbed nga mga pahina nga may kalabutan sa mga instrumento sa "Instrument Tree". Pagsala

Tulo ka matang sa mga filter ang gihatag: "Time Filter" sama sa "Band-Pass", "High-Pass", "Notch" ug "Low-Pass", "Space Filter" ug "Artefact Filter". I-klik ang "Filter" nga icon sa "Instrument Tree" ug ang filter setting icon anaa.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Filter Pipeline Paghimo og filter pipeline sa "Filter" control window. Pag-klik sa gusto nga simbolo sa filter ug ibalhin kini pinaagi sa pag-drag ug paghulog sa pila sa ulohan.
Ang pinili nga filter gi-highlight sa asul ug ang tagsa-tagsa nga setting parameter o mga paghulagway anaa sa bintana. Pangita ug preview sa "Raw" ug "Nasala" nga datos sa gagmay nga mga bintana sa ubos, kung anaa.

Filter Toolbar

I-klik ang "Process Data" icon palihug i-klik ang bin.

alang sa loading sa pinili nga data sa RAM. Aron malimpyohan ang pila sa filter,

Tipigi ang kadena sa filter ug ablihi kini sa ulahi.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Raw Data Explorer Pagkarga ug hilaw nga datos file ug i-klik ang “Explore” button sa tool bar sa main menu.
Pilia ang tab nga "Raw Data Explorer" sa bintana nga "Data Display o Settings".

Ang tab nga "Raw Data Explorer" nagpakita sa kalihokan sa spike: Ang "Overview" alang sa tanan nga mga electrodes sa ibabaw ug ang "Single View” sa usa ka electrode sa ubos. Pag-zoom sa usa ka detalyado view sa "ROI nga Rehiyon sa Interes". Ang "Raw Data Explorer" nag-replay sa kalihokan sa hilaw nga datos file ingon man sa ibabawview ingon nga detalyado sa usa ka rehiyon sa interes o sa single view. Ang bintana sa "Kalihokan" nagpakita sa voltage values kada time bin isip sayop nga color image. Ang mga spike makita nga asul o pula nga mga tuldok, kasagaran sa daghang kasikbit nga pixel sa mapa nga dungan.
Hilaw nga Data Explorer Tool Bar

Ipasabot ang “Frame” para sa data sample uban sa up-down nga kahon. I-klik ang "Step Backward" ug ang "Step Forward" nga mga buton aron i-replay ang datos sa matag lakang sa matag direksyon. Alang sa padayon nga pag-replay sa data, i-klik ang "Start / Pause Movie" button. Aron "Paghinay" ang katulin sa salida sa datos, palihug gamita ang up-down nga kahon. Kon mas taas ang pinili nga digit mas hinay ang pagpadagan sa salida, tungod kay ang gisulod nga numero

idugang sa ms pagkahuman sa matag frame. Ibutang ang range sa salida gamit ang mga bar ug i-loop ang salida. Isangkap ang pagrekord sa video gamit ang

"Pagrekord sa Video" nga buton

ug ngalan ug i-save ang video sa "*.mp4" format. Usba ang mga setting sa video pinaagi sa pag-klik sa "Open Settings Dialog"

butones

sa dialog nga "Mga Setting sa Recorder sa Video".

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS

Pilia ang "Resolution" ug ang "Frame Rate" alang sa video gikan sa drop down menus. I-enable ang "Ilakip ang Orasamp” check box, kon gikinahanglan.

Pagsugod o paghunong sa video gamit ang "Start / Pause Movie"

butones. Ablihi ang video gamit ang media player.

Single View
Human sa pag-klik sa "Set Movie Range" nga buton, duha ka asul nga slider ang makita sa "Single View” sa ubos. Ibalhin sila gamit ang mouse pinaagi sa pag-drag ug drop aron mahibal-an ang bahin sa oras nga gusto nimong analisahon sa salida. Ang berdeng bar nagpaila sa aktuwal nga posisyon sa "Activity" display.

Palihog tan-awa usab ang kapitulo nga “General Software Features” para sa pag-adjust sa mga display.
Ang tool bar sa ubos sa "Activity" window nagpakita sa mga coordinate sa posisyon sa cursor sa wala nga bahin. Ibalhin ang kompleto nga ROI gamit ang wala nga buton sa mouse samtang ang simbolo sa usa ka kamot makita. Usba ang gidak-on sa ROI kung makita ang simbolo sa pana. O i-klik ang "Itakda ang ROI" nga buton
sa pag-abli sa mosunod nga dialog. Kung labaw pa sa usa ka ROI ang magamit, ang aktwal nga cursor i-adjust.

I-adjust ang “Posisyon (X/Y)” ug ang “Size (W/H) sa ROI nga adunay up-down nga mga kahon. Pilia ang kolor sa cross hair gikan sa color scale, kung ang check box nga "Show Cross Hairs" gi-activate.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Pilia ang "Threshold" para sa spike detection ug ang "Range" gikan sa up-down nga mga kahon. Ang pinakagamay nga yunit sa range mao ang "nV".
I-klik ang “Setting” button para sa color map sa “Activity” window.
Pilia ang mga kolor alang sa mapa gikan sa drop-down menu. Aron "Ibalik" ang mga kolor i-aktibo ang check box. Zoom Buttons sa "Detalyado View” ug “Single View” Windows
I-klik ang "Ipahiangay sa signal Min / Max" nga buton. Ang scaling sa y-axis gitakda sa minimum ug maximum sa tanang makita nga samples sa channel.
I-klik ang "Zoom" nga mga buton. Ang pag-zoom in magputol sa scaling sa tagsa-tagsa ka axis sa tunga ug ang pag-zoom out makadoble sa scaling. Export data gikan sa "Single View” isip hulagway (“*.bmp”, “*.jpg”, “*png”) o ingong ASCII sa “*.csv” nga pormat. Spike Explorer Window Pilia ang "Spike Explorer" nga tab sa "Data Display o Settings" nga bintana. Gamita ang "Spike Explorer" alang sa kahulugan sa spike parameter ug ang pagtan-aw sa mga nakita nga spike.

Ang "Spike Explorer" nga nag-unang bintana gibahin sa tulo ka mga seksyon, ang kalihokan sa spike nahuman naview, ug duha ka bintana alang sa mga rehiyon sa interes nga mga ROI. Ang usa ka rehiyon sa interes nagpakita sa mga overlay nga laraw, ang lain ang temporal nga pag-apod-apod sa mga spike. Pagpili gikan sa "Spike Activity Overview” sa wala nga bahin usa o daghang mga rehiyon nga interesado. Ang mga overlay nga laraw sa namatikdan nga mga spike gipakita sa tuo nga bahin. Ang bintana sa ubos nagpakita sa temporal nga pag-apod-apod sa oras stamps alang sa matag pinili nga ROI.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Spike Explorer Toolbar

I-klik ang "Process Data" icon

alang sa pagsugod sa pagtuki pinaagi sa pagproseso sa datos nga gikarga sa RAM.

I-klik ang "Export Data" nga buton

. Pilia kung i-export ang mga spike nga "Kompleto" o "Napili" pinaagi sa drop down menu. Ang datos mahimong

gi-eksport sa “HDF5” o “CSV” nga format.

I-klik ang "Spike Explorer Settings" button Detection" windows.

aron ipasabut ang "Spike Detection" sa "Detection", "Spike Cutout" ug "Activity Peak

Pagsusi sa Spike
Palihug ibutang ang parameter nga "Detection" gikan sa taas nga bintana: Ang "Threshold Type" ug ang "Noise Measure" gikan sa drop-down menus, ang "Threshold" ug ang "Detection Dead Time" sa ms gikan sa up-down nga mga kahon. Ipasabut ang "Spike Cutout" parameter gikan sa ubos nga bintana: Ang "Waveform Alignment" gikan sa drop-down box, ang "Pre and Post Intervals" gikan sa up-down nga mga kahon.
Activity Peaks Detection
I-klik ang check box nga "Auto Extract while process File"sa dialog nga "Spike Explorer Settings" kung dili nimo i-set ang parameter sa pagkuha sa mano-mano.

CMOS-MEA5000-System · 20231220 · www.multichannelsystems.com

CMOS-MEA-TOOLS
Natapos ang Kalihokan sa Spikeview

Ang coordi

Mga Dokumento / Mga Kapanguhaan

multichannel nga sistema IFB-C Interface Board Multiboot System [pdf] Manwal sa Gumagamit
IFB-C Interface Board Multiboot System, IFB-C, Interface Board Multiboot System, Board Multiboot System, Multiboot System, System

Mga pakisayran

Manwal sa Gumagamit

multichannel nga sistema IFB-C Interface Board Multiboot System

Mga detalye

Mga Instruksyon sa Paggamit sa Produkto

Mga FAQ

IMPORTANTE NGA TAMBAG SA KALIGTASAN

PASIUNA

HARDWARE

KINATIBUK-ANG SOFTWARE FEATURES

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

CMOS-MEA-TOOLS

Mga Dokumento / Mga Kapanguhaan

Mga pakisayran

Pagbilin ug komento

Cancel reply

multichannel nga sistema IFB-C ​​Interface Board Multiboot System

Mga detalye

Mga Instruksyon sa Paggamit sa Produkto

Mga FAQ

IMPORTANTE NGA TAMBAG SA KALIGTASAN

PASIUNA

HARDWARE

KINATIBUK-ANG SOFTWARE FEATURES

CMOS-MEA-CONTROL SOFTWARE

CMOS-MEA-TOOLS

Mga Dokumento / Mga Kapanguhaan

Mga pakisayran

Pagbilin ug komento

Cancel reply

multichannel nga sistema IFB-C Interface Board Multiboot System