បណ្ណាល័យ TELL-Seq លំដាប់ជាសកល
លក្ខណៈបច្ចេកទេស
- ឈ្មោះផលិតផល៖ TELL-SeqTM Library Sequncing Kit
- ក្រុមហ៊ុនផលិត: Universal Sequencing Technology Corporation
- ភាពឆបគ្នា៖ ប្រព័ន្ធលំដាប់ Illumina ទាំងអស់ លើកលែងតែ iSeq 100
- ការប្រើប្រាស់ដោយចេតនា៖ ប្រើសម្រាប់ការស្រាវជ្រាវតែប៉ុណ្ណោះ មិនមែនសម្រាប់ដំណើរការរោគវិនិច្ឆ័យទេ។
- ប្រវត្តិកែប្រែ៖ កំណែ ៧.០ ខែសីហា ឆ្នាំ ២០២៤
សេចក្តីណែនាំអំពីការប្រើប្រាស់ផលិតផល៖
សេចក្តីផ្តើម
បណ្ណាល័យ TELL-SeqTM តម្រូវឱ្យមានការបឋមតាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់ប្រព័ន្ធលំដាប់ Illumina ណាមួយ និងមានសន្ទស្សន៍ 18-base 1 sequence ប្រើជាលេខកូដម៉ូលេគុលសម្រាប់ការអានដែលបានភ្ជាប់ ដែលត្រូវតែធ្វើតាមលំដាប់លំដោយទាំងស្រុង។
មាតិកាកញ្ចប់
| ឈ្មោះសមាសធាតុ | ពណ៌មួក | ការប្រមូលផ្តុំ | បរិមាណ (µL) |
|---|---|---|---|
| អាន 1 Primer | CAP ខ្មៅ | 100 ម | 50 |
| អាន 2 Primer | CAP ពណ៌ស | 100 ម | 50 |
| សន្ទស្សន៍ 1 Primer | CAP ក្រហម | 100 ម | 50 |
| សន្ទស្សន៍ 2 Primer | CAP ពណ៌លឿង | 100 ម | 50 |
រចនាសម្ព័ន្ធបណ្ណាល័យ TELL-SeqTM និងគ្រោងការណ៍លំដាប់លំដោយ
- សន្ទស្សន៍ 1 (សន្ទស្សន៍ I7) មាន 18-base TELL Bead sequences ដែលត្រូវតែធ្វើតាមលំដាប់លំដោយទាំងស្រុង។
- សន្ទស្សន៍ 2 (សន្ទស្សន៍ I5) មាន sample index primer sequences ប្រើក្នុងបណ្ណាល័យ ampការធ្វើត្រាប់តាម។
- ការតម្រៀបចុងដែលបានផ្គូផ្គងត្រូវបានពេញចិត្តជាមួយនឹងតម្រូវការប្រវែងអានអប្បបរមា 2 × 96 និងតម្រូវការប្រវែងអានអតិបរមា 2 × 150 ។
- បណ្ណាល័យអាចត្រូវបានរួមបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ការតម្រៀបគ្នានៅពេលដែល primer multiplex ផ្សេងគ្នាត្រូវបានប្រើក្នុងបណ្ណាល័យ ampជំហាន lification ។
បឋមតាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួន
ថ្នាំបឋមតាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួនគឺត្រូវបានទាមទារដើម្បីតម្រៀបបណ្ណាល័យ TELL-SeqTM ហើយត្រូវបានផ្តល់ជូននៅក្នុង TELL-SeqTM Illumina Sequencing Primer Kit។
សន្ទស្សន៍ផ្ទាល់ខ្លួន 2 Primer
ត្រូវការ primer Index 2 ផ្ទាល់ខ្លួន នៅពេលដែលបណ្ណាល័យ TELL-SeqTM ជាច្រើនដែលមាន primer multiplex ផ្សេងគ្នាត្រូវបានបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ sequencer ហើយនៅពេលដែល sequencer ត្រូវការ primer លំដាប់ i5 index ។ បច្ចុប្បន្ននេះសម្រាប់តែ MiSeq ប៉ុណ្ណោះ សន្ទស្សន៍ផ្ទាល់ខ្លួន 2 Primer មិនត្រូវបានទាមទារទេ។
សំណួរដែលសួរញឹកញាប់ (FAQ)
- សំណួរ៖ តើឧបករណ៍ TELL-SeqTM អាចប្រើសម្រាប់ដំណើរការវិនិច្ឆ័យបានទេ?
ចម្លើយ៖ ទេ ឧបករណ៍ TELL-SeqTM គឺសម្រាប់តែការស្រាវជ្រាវប៉ុណ្ណោះ ហើយមិនគួរប្រើសម្រាប់នីតិវិធីវិនិច្ឆ័យទេ។ - សំណួរ៖ តើអ្វីជាតម្រូវការប្រវែងអានអប្បបរមា និងអតិបរមាសម្រាប់ការបញ្ចប់ជាគូ?
ចម្លើយ៖ តម្រូវការប្រវែងអានអប្បបរមាគឺ 2 × 96 ហើយតម្រូវការប្រវែងអានអតិបរមាគឺ 2 × 150 សម្រាប់ការដាក់ជាគូ។
TELL-Seq™ សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់តាមលំដាប់លំដោយ
សម្រាប់ប្រព័ន្ធលំដាប់ Illumina@ ទាំងអស់ លើកលែងតែ iSeq 100
សម្រាប់ការស្រាវជ្រាវប្រើតែប៉ុណ្ណោះ។ មិនមែនសម្រាប់ប្រើក្នុងនីតិវិធីធ្វើរោគវិនិច្ឆ័យទេ។
ឯកសារលេខ 100018 v7.0
ខែសីហា ឆ្នាំ 2024
ឯកសារនេះមានកម្មសិទ្ធិរបស់ក្រុមហ៊ុន Universal Sequencing Technology Corporation ហើយត្រូវបានបម្រុងទុកសម្រាប់តែការប្រើប្រាស់របស់អតិថិជនរបស់ខ្លួនទាក់ទងនឹងការប្រើប្រាស់ផលិតផលដែលបានពិពណ៌នានៅទីនេះ និងមិនមានគោលបំណងផ្សេងទៀតទេ។
ការណែនាំនៅក្នុងឯកសារនេះត្រូវតែអនុវត្តតាមយ៉ាងជាក់លាក់ដោយបុគ្គលិកដែលបានទទួលការបណ្តុះបណ្តាលត្រឹមត្រូវ ដើម្បីធានាបាននូវការប្រើប្រាស់ឧបករណ៍ TELL-Seq™ ឱ្យបានត្រឹមត្រូវ និងប្រកបដោយសុវត្ថិភាព។
បច្ចេកវិជ្ជា SEQUENCING ជាសកលមិនទទួលខុសត្រូវណាមួយដែលកើតឡើងបន្ទាប់ពីការប្រើប្រាស់មិនត្រឹមត្រូវនៃ TELL-SEQ™ KIT។
© 2022 សាជីវកម្មបច្ចេកវិទ្យាលំដាប់សកល។ រក្សាសិទ្ធិគ្រប់យ៉ាង។
TELL-Seq™ គឺជាពាណិជ្ជសញ្ញារបស់សាជីវកម្មបច្ចេកវិទ្យាលំដាប់សកល។ ឈ្មោះ និមិត្តសញ្ញា និងពាណិជ្ជសញ្ញាផ្សេងទៀតទាំងអស់ គឺជាកម្មសិទ្ធិរបស់ម្ចាស់រៀងៗខ្លួន។
ប្រវត្តិកែប្រែ
| ឯកសារ # | កំណែ | ឯកសារយោង និងមតិយោបល់របស់ DCR |
| C01K002 Rev. A | ខែមករា ឆ្នាំ 2020 | ការចេញផ្សាយដំបូង |
| C01K002 Rev. B | ថ្ងៃទី 2020 ខែមីនា | បន្ថែមឧបសម្ព័ន្ធ |
| 100018-USG | 3.0 | បន្ថែមការណែនាំសម្រាប់ NovaSeq v1.5 reagent |
| 100018-USG | 4.0 | បន្ថែមការណែនាំលម្អិតសម្រាប់ NovaSeq ចុងក្រោយបង្អស់
សារធាតុប្រតិកម្ម |
| 100018-USG | 5.0 | បន្ថែមការណែនាំសម្រាប់ប្រព័ន្ធ NextSeq 1000/2000 |
| 100018-USG | 6.0 | បន្ថែមព័ត៌មាន 96 Multiplex primers (C-series) |
| 100018-USG | 7.0 | បន្ថែម 384 ថ្នាំ primers ចម្រុះ (C, D, E, F-series)
ព័ត៌មាន។ ធ្វើបច្ចុប្បន្នភាពព័ត៌មានសន្ទស្សន៍ 2 Primer |
សេចក្តីផ្តើម
ពិធីការនេះពន្យល់ពីរបៀបដំណើរការបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ដែលត្រូវបានផ្គូផ្គងចុងណាមួយនៅលើប្រព័ន្ធលំដាប់ Illumina®។
បណ្ណាល័យ TELL-Seq™† ត្រូវការបឋមតាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់ប្រព័ន្ធលំដាប់ Illumina ណាមួយ ហើយមាន 18-base index 1 sequence ប្រើជាលេខកូដម៉ូលេគុលសម្រាប់ការអានដែលបានភ្ជាប់ ដែលត្រូវតែធ្វើតាមលំដាប់លំដោយទាំងស្រុង។
មាតិកាកញ្ចប់
TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primer Kit (PN 100004)
TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primer Kit, HT (PN 100013)
TELL-Seq™ រចនាសម្ព័ន្ធបណ្ណាល័យ និងគ្រោងការណ៍លំដាប់លំដោយ
លិបិក្រម 1 (ឧ. I7 index) មាន 18-base TELL Bead sequences ដែលត្រូវតែតាមលំដាប់លំដោយទាំងស្រុង។ សន្ទស្សន៍ 2 (ឧ, សន្ទស្សន៍ I5) មាន 8-base (T-series) ឬ 10-base (C-series) sample index primer sequences ប្រើក្នុងបណ្ណាល័យ ampការបញ្ជាក់។ ការតម្រៀបចុងជាគូគឺពេញចិត្ត។ តម្រូវការអានអប្បបរមាគឺ 2 × 96; តម្រូវការអានអតិបរមាគឺ 2 × 150 ។
Example នៃ Illumina® Sequencing % Base by Cycle Chart
ការណែនាំអំពីលំដាប់លំដោយ Illumina®
- រំលាយបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ យោងទៅតាមកម្មវិធីលំដាប់លំដោយ Illumina® ការផ្តោតអារម្មណ៍ និងកម្រិតសំឡេងជាក់លាក់។
- បណ្ណាល័យអាចត្រូវបានរួមបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ការតម្រៀបគ្នានៅពេលដែល primer multiplex ផ្សេងគ្នាត្រូវបានប្រើក្នុងបណ្ណាល័យ ampជំហាន lification ។
- ថ្នាំ primer តាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួនគឺត្រូវបានទាមទារដើម្បីតម្រៀបបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ និងផ្តល់ជូននៅក្នុង TELL-Seq™ Illumina Sequencing Primer Kit។
- ថ្នាំ primers លំដាប់ផ្ទាល់ខ្លួនទាំងនេះអាចត្រូវបានផ្ទុកទៅក្នុងអណ្តូងដែលបានបញ្ជាក់សម្រាប់ primers ផ្ទាល់ខ្លួន។ ម៉្យាងទៀតពួកវាក៏អាចត្រូវបានផ្ទុកទៅក្នុងអណ្តូង primer លំដាប់ Illumina® ស្តង់ដារដែលត្រូវគ្នា នៅពេលដែលបណ្ណាល័យគ្រប់គ្រងIllumina® PhiX ត្រូវបានកើនឡើងនៅក្នុងការដំណើរការលំដាប់។
- Custom Index 2 primer គឺត្រូវការតែនៅពេលដែលបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ជាច្រើនដែលមាន primer multiplex ផ្សេងគ្នាត្រូវបានបញ្ចូលគ្នាសម្រាប់ sequencer ហើយនៅពេលដែល sequencer ត្រូវការ primer លំដាប់ i5 index។ បច្ចុប្បន្នសម្រាប់តែ MiSeq ប៉ុណ្ណោះ សន្ទស្សន៍ផ្ទាល់ខ្លួន 2 Primer មិនត្រូវបានទាមទារទេ។ ដូចគ្នានេះផងដែរសម្រាប់ប្រព័ន្ធដែលមិនគាំទ្រដូចជា HiSeq 2000/2500 និង NovaSeq v1 reagents, Custom Index 2 primer មិនត្រូវបានទាមទារទេ។
- ចំនួនអប្បបរមានៃការរត់តាមលំដាប់អាចត្រូវបានអនុវត្តដោយប្រើចំនួននៃ primers លំដាប់ដែលបានផ្តល់ឱ្យគឺប្រែប្រួលដោយផ្អែកលើប្រព័ន្ធលំដាប់។
| ប្រព័ន្ធលំដាប់ | តើតម្រូវឱ្យមាន Index 2 Primer ផ្ទាល់ខ្លួនទេ? |
| NovaSeq X/X Plus | បាទ |
| NovaSeq 6000 | បាទ |
| HiSeq 3000/4000 | បាទ |
| វគ្គបន្ទាប់ | បាទ |
| MiSeq | ទេ |
| មីនីសេក | បាទ |
Exampលេអេសample សន្លឹកសម្រាប់ប្រព័ន្ធ MiSeq
ខាងក្រោមនេះគឺជាអតីតamps បានample សន្លឹកសម្រាប់ការដំណើរការ 2 × 146 PE ជាមួយ 18-cycle index 1 (ឧ. I7 index) និង 8-cycle or 10-base (C-series) index 2 (ie, I5 index) ដោយប្រើ primers លំដាប់ផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់ការអាន 1 , Index 1 និង Read 2 ដែលនឹងត្រូវបានផ្ទុកទៅក្នុងអណ្តូង primer លំដាប់ផ្ទាល់ខ្លួន។ ដោយសារតែ MiSeq ប្រើ primer P5 នៅលើផ្ទៃក្រឡាលំហូរជា primer លំដាប់សម្រាប់ Index 2 អាន នោះ TELL-Seq™ custom Index 2 primer មិនត្រូវបានទាមទារសម្រាប់ប្រព័ន្ធ MiSeq ទេ។ ការ demultiplexing នៃបណ្ណាល័យដែលរួមបញ្ចូលគ្នាណាមួយនឹងផ្អែកលើ sample index (ឧ. លិបិក្រម 2) ។ វានឹងត្រូវបានដំណើរការដោយ TELL-read analysis pipeline ដាច់ដោយឡែក បន្ទាប់ពីដំណើរការលំដាប់លំដោយបានបញ្ចប់។
ការណែនាំអំពីប្រវែងអានលំដាប់លំដោយ Illumina®
- ការតម្រៀបចុងគូត្រូវបានណែនាំ។
- បណ្ណាល័យ TELL-Seq™ Index 1 គឺ 18-base សន្ទស្សន៍ 2 គឺ 8-base (T-series) ឬ 10-base (C-series)។ មាន 26-base (T-series) ឬ 28-base (C-series) សម្រាប់លិបិក្រមទាំងពីរ បើប្រៀបធៀបទៅនឹង 16-base សរុបសម្រាប់ស្តង់ដារ Illumina dual index។
- វដ្ដ 10 បន្ថែមដែលទាមទារសម្រាប់ការបង្កើតលិបិក្រមបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ចាំបាច់ត្រូវកាត់ចេញពីការអាន 1 និងអាន 2 វដ្តលំដាប់លំដោយស្មើៗគ្នា។ ដោយសារ Illumina sequencing reagent ធានា 2 វដ្តបន្ថែម 4-cycle for read 1 និង 4-cycle for read 2 ចាំបាច់ត្រូវកាត់ចេញរៀងៗខ្លួន។
- ប្រវែងលំដាប់ដែលបានណែនាំគឺ 2 × 96 PE ទៅ 2 × 146 PE សម្រាប់ដំណើរការសន្ទស្សន៍ពីរ។ 2 × 100 PE ទៅ 2 × 150 PE សម្រាប់ s តែមួយample run ដោយមិនចាំបាច់ប្រើ Index 2 អាន។
ការពិចារណាស៊ីជម្រៅតាមលំដាប់លំដោយ
- ជម្រៅនៃលំដាប់លំដោយគ្រប់គ្រាន់គឺត្រូវបានទាមទារដើម្បីទទួលបានការគ្របដណ្តប់ TELL Bead គ្រប់គ្រាន់។ TELL Beads កាន់តែច្រើនត្រូវបានប្រើប្រាស់នៅក្នុងបណ្ណាល័យ amplification ដើម្បីបង្កើតបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ការអានតាមលំដាប់លំដោយកាន់តែច្រើននឹងត្រូវបានទាមទារដើម្បីទទួលបានជម្រៅនៃលំដាប់ដែលចង់បាន។ ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយ TELL Beads តិចជាងប្រើសម្រាប់បណ្ណាល័យ amplification ភាពស្មុគស្មាញនៃបណ្ណាល័យនឹងកាន់តែទាប ដែលអាចនាំឱ្យមានអត្រាស្ទួនខ្ពស់នៃការអានតាមលំដាប់លំដោយ។ តុល្យភាពរវាង TELL Beads ដែលប្រើ និងភាពស្មុគស្មាញបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ដែលត្រូវការអាចអាស្រ័យលើទំហំហ្សែន និងកម្មវិធី។
- សម្រាប់កម្មវិធី de novo assembly យ៉ាងហោចណាស់ 60x genome coverage នៃ sampឡេត្រូវបានណែនាំជាទូទៅ។ ទោះជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ការគ្របដណ្តប់តាមលំដាប់ទាបក៏អាចគ្រប់គ្រាន់ផងដែរ អាស្រ័យលើបរិមាណ TELL Beads ដែលប្រើសម្រាប់បណ្ណាល័យ amplification និង TELL-Seq™ ភាពស្មុគស្មាញនៃបណ្ណាល័យ។
- សម្រាប់ ph របស់មនុស្សasing យ៉ាងហោចណាស់ 500 លានការអានចង្កោមក្នុងមួយវិនាទីampឡេដែលមានជម្រៅ ~ 40x ត្រូវបានណែនាំ។
- សម្រាប់ការកំណត់គោលដៅ ការគ្របដណ្តប់អប្បបរមា 100x ត្រូវបានណែនាំ។
Library Multiplex Primer Index Sequences (ឧ, Index 2 Read): T-series (8-base)
| Library Multiplex
ថ្នាំ primer (ស៊េរី T) |
សម្រាប់អេសample Sheet MiSeq | សម្រាប់អេសample Sheet NovaSeq,
NovaSeq X, NextSeq, MiniSeq |
| T501 | TGAACCTT | AAGGTTCA |
| T502 | TGCTAAGT | ACTTAGCA |
| T503 | TGTTTCTCT | អាហ្គាហ្គាកា |
| T504 | TAAGACAC | GTGTCTTA |
| T505 | CTAATCGA | TCGATTAG |
| T506 | CTAGAACA | TGTTCTAG |
| T507 | TAAGTTCC | ហ្គាកាតា |
| T508 | TAGACCTA | TAGGTCTA |
| T509 | CATCCGAA | TTCGGATG |
| T510 | TTATGAGT | អេកកាតា |
| T511 | AGAGGCGC | GCGCCTCT |
| T512 | TAGCCGCG | CGCGGCTA |
| T513 | ACGAATAA | TTATTCGT |
| T514 | TTCGTAGG | CCTACGAA |
| T515 | GATCTGCT | AGCAGATC |
| T516 | CGCTCCGC | ជីជីជីជីជីជី |
| T517 | AGGCTATA | TATAGCCT |
| T518 | GCCTCAT | ATAGAGGC |
| T519 | អាជីហ្គាTAGG | CCTATCCT |
| T520 | TCAGAGCC | GGCTCTGA |
| T521 | CTCGCCT | AGGCGAGAG |
| T522 | តាកាតា | តាតកតា |
| T523 | AGTAAGTA | TACTTACT |
| T524 | GACTTCCT | AGGAAGTC |
Library Multiplex Primer Index Sequences (ឧទាហរណ៍ Index 2 Read): C,D,E,F-series (10-base)
| Library Multiplex Primer (ស៊េរី C) | សម្រាប់អេសample Sheet MiSeq | សម្រាប់អេសample Sheet NovaSeq, NovaSeq X, NextSeq, MiniSeq |
| C501 | ACGTACGTAC | GTACGTACGT |
| C502 | CATGCATGCA | TGCATGCATG |
| C503 | GTACGTACGT | ACGTACGTAC |
| C504 | TGCATGCATG | CATGCATGCA |
| C505 | ATGCTGATCA | TGATCAGCAT |
| C506 | CACAGCTGTG | CACAGCTGTG |
| C507 | GCTGATCAGC | GCTGATCAGC |
| C508 | TGATCAGCAT | ATGCTGATCA |
| C509 | ភាពទាក់ទាញ | AGTATTGAAT |
| C510 | CTAGCGCTAG | CTAGCGCTAG |
| C511 | GCTAGTAGTA | TACTACTAGC |
| C512 | TCCAATCAAG | CTTGATTGGA |
| C513 | AATATTGCTG | CAGCAATATT |
| C514 | CGTCGTTACG | CGTAACGACG |
| C515 | GATTGATTCC | GGAATCAATC |
| C516 | TCTACAATG | CATTGTTAGA |
| C517 | AGAATTGTCA | TGACAATTTCT |
| C518 | CTCAGCAATT | AATTGCTGAG |
| C519 | GGTCCTTGTC | GACAAGGACC |
| C520 | AGCGCTGACA | TGTCAGGCCT |
| C521 | CTCCTAGTGG | CCACTAGGAG |
| C522 | GTTAAGCT | AGCTGTAACC |
| C523 | CTGATTGGCG | CGCCAATCAG |
| C524 | ATTGGTTAGA | TCTAACCAAT |
| C525 | ស៊ីខាធីខេក | AGTTGAATGG |
| C526 | CAGTATTGAC | GTCAATACTG |
| C527 | GAGTCCTCAA | TTGAGGACTC |
| C528 | AGCTACTACT | AGTAGTAGCT |
| C529 | TAGCTAGCGC | GCGCTAGCTA |
| C530 | GATGCAACAC | GTGTTGCATC |
| C531 | CCTCAGTACA | TGTACTGAGG |
| C532 | CGGTAATTCA | TGAATTACCG |
| C533 | CGCAATGGCT | AGCCATGCG |
| C534 | GTACGTTGAA | TTCAACGTAC |
| C535 | TTGATAGTA | TACTGATCAA |
| C536 | GGCCTAACAA | TTGTTAGGCC |
| C537 | GTTGTTGGAA | TTCCAACAAC |
| C538 | TACGTTGGAC | GTCCAACGTA |
| C539 | ACACCATGCA | TGCATGGTGT |
| C540 | GCAATAGតាក់ស៊ី | GTACTATTTGC |
| C541 | ACGCAGCCAG | CTGGCTCGGT |
| C542 | CGAGTTGACG | CGTCAACTCG |
| C543 | CGGGCTGAA | TTAGCCACG |
| C544 | TCCAAGGAC | GTCCTTGAGA |
| C545 | CCTAGGCACT | AGGCCTAGG |
| C546 | CTCGGTAAT | ATTACCGCAG |
| C547 | GGCACTACCA | TGGTAGTGCC |
| C548 | GCTCAATCAA | TTGATTGAGC |
| C549 | AGGCACACAC | GTGTGTGCCT |
| C550 | CCTGGCAAGA | TCTTGCCAGG |
| C551 | TAATTGGTAG | កាតាកាតាតា |
| C552 | GCCAAACAAGT | ACTGTTGGC |
| C553 | អេកជីជីតាតា | TATAAGCCAT |
| C554 | GCATGGCCTT | AAGGCCATGC |
| C555 | ACAATACTGG | CCAGTATTGT |
| C556 | GGATTGGACT | AGTCCAATCC |
| C557 | ACTGTACTAT | ATAGTACAGT |
| C558 | CAGCTGTGAG | CTCACAGCTG |
| C559 | CTTGAGGACC | GGTCCTCCAAG |
| C560 | GGTACAATAG | CTATTGTACC |
| C561 | CTGACTACTA | TAGTAGTCAG |
| C562 | TCAACCATGG | CCATGTTGA |
| C563 | អាតតាតាកស៊ីជី | CGGTTATAAT |
| C564 | ACTAGTCCTT | AAGGACTAGT |
| C565 | ACTGGACGT | ACGTCCAAGT |
| C566 | ATGGTTAGGA | TCCTAACCAT |
| C567 | អេតជីតាកាកា | TTGGTACCAT |
| C568 | GATTGACTC | GAGTCAATTC |
| C569 | AGCAACCAGG | CCTGTGTTGCT |
| C570 | TACTGTGCTG | កាកាកាកាតា |
| C571 | CAACAACGTC | GACGTTGTTG |
| C572 | CAGTAGCGCT | AGCGCTACTG |
| C573 | ATTACCAATC | GATTGGTAAT |
| C574 | TAAGGACCGC | GCGGTCTTTA |
| C575 | ACACGTACCG | CGGTACGTGT |
| C576 | CACGTTGTT | AAAACGTTG |
| C577 | ATTGTGCTGA | TCAGCACAAT |
| C578 | GTACCAACAG | CTGTTGGTAC |
| C579 | TTGTCAAGGA | TCCTTGACAA |
| C580 | CTTGTTAGTA | TACGTACAAG |
| C581 | TGCCTTGTAA | TACAAGGCA |
| C582 | TAGTAGCTTA | TAAGCTACTA |
| C583 | GACCGCAATG | CATTCGGTC |
| C584 | CTACTAGស៊ីធីធី | AAGCTAGTAG |
| C585 | AGCACACGTT | AACGTGTGCT |
| C586 | TGTTATAAGC | ជីកាតាតាកា |
| C587 | GTTGCCAAGT | ACTGGCAAC |
| C588 | CTGGCAACCG | CGGTTGCCAG |
| C589 | TTAGGCCTTA | TAAGGCCTAA |
| C590 | CGCAGCACAG | CTGTGCTGCG |
| C591 | CTAGGCACAA | TTGTGCCTAG |
| C592 | TGTTGTTAAG | CTGTACAACA |
| C593 | CTAACGTGGC | GCCACGTTAG |
| C594 | GTACTACTGGT | ACCAGTACGC |
| C595 | GGCCCTGAATT | AATTCAGGCC |
| C596 | CATGCTCGAG | CTCGAGCATG |
| Library Multiplex Primer (ស៊េរី D) | សម្រាប់អេសample Sheet MiSeq | សម្រាប់អេសample Sheet NovaSeq, NovaSeq X, NextSeq, MiniSeq |
| D501 | AGCACTGTAA | TTACGTGCT |
| D502 | CCGAAGTACT | AGTACTTCGG |
| D503 | GTTACAAGTA | TACTTGTAAC |
| D504 | TGATTCGGTG | CACGCAATCA |
| D505 | ATCTTAGGCA | TGCCTAAGAT |
| D506 | CACGCAAGTT | AACTTTCGGTG |
| D507 | GAGCTTAGGA | TCCTAAGCTC |
| D508 | TATTGCTCGA | TCGAGCAATA |
| D509 | AACATCTGAG | CTAGATGTT |
| D510 | CAACTCAGCA | TGCTGAGTTG |
| D511 | GAACTATATG | កាតាTAGTTC |
| D512 | TAATAGTCTA | TAGអាកាតាតា |
| D513 | អេហ្គាអេតហ្គាជីជី | CGTCAATCTT |
| D514 | CACGTAGស៊ី.ស៊ី.ជី | CGGCTACGTG |
| D515 | GACTCGATCA | TGATCGAGTC |
| D516 | TAATCCTCCGC | ជីជីហ្គាហ្គាតា |
| D517 | AAGCTCCTGG | CCAGGACGTT |
| D518 | CAGATTGTTG | CAACATCTG |
| D519 | GATGCTATTC | GAATAGCATC |
| D520 | TAATCCTCCGC | ជីជីហ្គាហ្គាតា |
| D521 | AAGTATACCT | AGGTATACTT |
| D522 | CAGTAGCCAA | TTGGCTACTG |
| D523 | GCAAGGACTC | GAGTCCTTGC |
| D524 | TACTACTGTA | តាកាកTAGTA |
| D525 | AATCCTAGCT | AGCTAGហ្គាត |
| D526 | CATTGGCAAG | CTTGCCAATG |
| D527 | GCCTGAGAAT | ATTCTCAGGC |
| D528 | តាក់ស៊ីTAGCAAG | CTTGCTAGTA |
| D529 | ACAGCTAGTC | GACTAGCTGT |
| D530 | CAACCAGTA | TACTGGTTGG |
| D531 | GCGCTCAATT | AATTGAGCGC |
| D532 | TAGCGCGGAC | GTCCGCGCTA |
| D533 | ACCTATAGTT | អេកតាTAGGT |
| D534 | CCACGTCAGG | CCTGACGGG |
| D535 | GCTACGCAAT | ATTGCGTAGC |
| D536 | TAGTTGCTGC | កាកកាកាតា |
| D537 | ACGGTACAAC | GTTGTACCGT |
| D538 | CCGAACTTCG | CGAGTTCGG |
| D539 | GCTCCTAATT | AATTAGGAGC |
| D540 | TATCCTCGAT | អេតជីហ្គាហ្គាតា |
| D541 | ACTCGATTTCT | AGAATCGAGT |
| D542 | CCTGGTAATT | AATTACCAGG |
| D543 | TCGTAGTTGG | CCAACTAGC |
| D544 | TCAGCAAGGA | TCCTTGCTGA |
| D545 | ACTGGTAGCA | TGCTACCAGT |
| D546 | CGATCAACCT | AGGTTGATCG |
| D547 | GGAAGTAGCA | TGCTACTTCCC |
| D548 | TCAGCTGCGG | CCGCGCTGA |
| D549 | ACTGGTAGCA | TGCTACCAGT |
| D550 | CGATCAACCT | AGGTTGATCG |
| D551 | GGCAAGATGA | TCTCTTGCC |
| D552 | TCCGCCCAATG | កាធីជីជីជីហ្គា |
| D553 | អេហ្កាតាតតាត | ATAAGATTCT |
| D554 | CGCTAGCAAC | GTTGCTAGCG |
| D555 | ជីកាស៊ីតតាត | ATAAGGCC |
| D556 | TCGAATACTA | TAGTATTCGA |
| D557 | AGCAATGGTA | TACCATTGCT |
| D558 | CGGTCTGATC | ហ្គាតាកាកាស៊ីជី |
| D559 | GTCCCGCCAT | ATGCGGGACC |
| D560 | TCGAATACTA | TAGTATTCGA |
| D561 | AGCACTGTAA | TTACGTGCT |
| D562 | CGTACTACCG | CGGTAGTACG |
| D563 | GGTTCATCGG | CCGATGAACC |
| D564 | TCGGAGCTGC | GCAGCTCCGA |
| D565 | AGGACGTTAG | CTAACGTCCT |
| D566 | CGTTGACAAT | ATTGTCAACG |
| D567 | GTACTGACAC | GTGTCAGTAC |
| D568 | TCTAAGATAG | CTATCTTAGA |
| D569 | AGTGCTCAAC | GTTGAGCACT |
| D570 | CTAAGAACCT | AGGTTTCTTAG |
| D571 | ជីតាតាតាក | ជីតាតាតាក |
| D572 | TGATTCGGTG | CACGCAATCA |
| D573 | ATATTCGACG | CGTCGAATAT |
| D574 | CTATAACGAC | GTCGTTATAG |
| D575 | GTCGTTAGGT | ACCTAACGAC |
| D576 | TGCCACTGAT | ATCAGTGGCA |
| D577 | ATCGGCTAG | CTTAGCCGAT |
| D578 | CTCAAGTTGC | GCAACTGAG |
| D579 | GTGTGTTCGA | TCGAACACAC |
| D580 | TGCTATAGTC | GACTATAGCA |
| D581 | អេកហ្កាកតាត | AATAGCTCAT |
| D582 | CTCACAACGA | TCGTTGTGAG |
| D583 | TGCTCGATG | CAATCGAGCA |
| D584 | ATGTTGGACT | AGTCCAACAT |
| D585 | CTGATGTTAG | CTAACATCAG |
| D586 | TGGTAACCAG | CTGTGTTACCA |
| D587 | អេធីជីហ្គាតា | TACTTCGAAT |
| D588 | CTTAGCTCCT | AGGAGCTAG |
| D589 | TGTAATCGAT | ACGATTACA |
| D590 | CTTGGACTTC | GAAGTCCAAG |
| D591 | TGTACTTGAA | TTCAAGTACA |
| D592 | TAAGCTCAG | CTGAGCTTAA |
| D593 | TTACAACCAG | CTGTGTTGTAA |
| D594 | TTTCAGCCCA | TGGCTGAGAA |
| D595 | TTGCATGGCT | AGCCATGCAA |
| D596 | TTGCGGGTAC | GTACCGCCAA |
| Library Multiplex Primer (ស៊េរី E) | សម្រាប់អេសample Sheet MiSeq | សម្រាប់អេសample Sheet NovaSeq, NovaSeq X, NextSeq, MiniSeq |
| អ៊ី២៦ | AGCCACGTC | GACCGTGGCT |
| អ៊ី២៦ | CCCCCTGAGT | ACTCAGCGGG |
| អ៊ី២៦ | ជីតាតាតាស៊ីស៊ី | ហ្គេតតាតាក |
| អ៊ី២៦ | CTTCCTGGCA | TGCCAGGAAG |
| អ៊ី២៦ | ACGAATTGC | GCAATTCGAT |
| អ៊ី២៦ | CACGTGTTGT | ACAACACGTG |
| អ៊ី២៦ | GAGCTGTGTT | AACACAGTCTC |
| អ៊ី២៦ | តាតតាកាកាត | អេធីធីជីតាតា |
| អ៊ី២៦ | AACAATGCGG | CGCCATGTT |
| អ៊ី២៦ | CAACTCGCTA | TAGCGAGTTG |
| អ៊ី២៦ | GATTGCTCA | TGAGCAATTC |
| អ៊ី២៦ | GTGTGTTCGA | TCGAACACAC |
| អ៊ី២៦ | CGATTCGAGC | GCTCGAATCG |
| អ៊ី២៦ | GTCAACTTA | TAAGTTGAC |
| អ៊ី២៦ | GACAATCCTA | TAGGATTGTC |
| អ៊ី២៦ | TAATTAGACT | AGCTGATTA |
| អ៊ី២៦ | អេក កាតាតាត | អាតាតាកត |
| អ៊ី២៦ | CATATTGTAA | TTACAATATG |
| អ៊ី២៦ | GATAGGACTT | AAGTCCTATC |
| អ៊ី២៦ | ATGCTAGជីធីធី | AACCTAGឆ្មា |
| អ៊ី២៦ | GCAAGATTAG | CTAATCTTGC |
| អ៊ី២៦ | CAGCTGTATA | TATACAGCTG |
| អ៊ី២៦ | GCAAGTCTAA | TTAGACTTGC |
| អ៊ី២៦ | តាក់ស៊ីTAGCAAG | CTTGCTAGTA |
| អ៊ី២៦ | AATACTGTTA | TAACAGTATT |
| អ៊ី២៦ | កាតាតធីក | GTAGATATG |
| អ៊ី២៦ | GCCACTAGG | CCTTAGTGGC |
| អ៊ី២៦ | CTGGCAATTC | GATTGCCAG |
| អ៊ី២៦ | ACAATAGGCG | CGCCTATTGT |
| អ៊ី២៦ | CATGCTAG | CTTAGCATGG |
| អ៊ី២៦ | GCGAGCGATC | GATCGCTCGC |
| អ៊ី២៦ | TAGGTAGTTC | GAACTACTA |
| អ៊ី២៦ | ACCTTGGACC | GTTCCAAGGT |
| អ៊ី២៦ | TGACTAATAC | GTATTAGTCA |
| អ៊ី២៦ | GCTATATCTG | កាកាតាTAGC |
| អ៊ី២៦ | TCTAGTTCAG | CTGAACTAGA |
| អ៊ី២៦ | ACGGTTGAGA | TCTCAACCGT |
| អ៊ី២៦ | CTGATTCCGG | CCGGAATCAG |
| អ៊ី២៦ | TGGTAACCAG | CTGTGTTACCA |
| អ៊ី២៦ | កាកាកាកាកា | TTCTCGAGTC |
| អ៊ី២៦ | TTAGCCAATA | TATTGGCTAA |
| អ៊ី២៦ | CCTAAGGCG | CGCCTTAGG |
| អ៊ី២៦ | CGTAGCAATC | GATTGCTACG |
| អ៊ី២៦ | CATGGCTAAT | ATTAGCCATG |
| អ៊ី២៦ | ACTCGACAAT | ATTGTCGAGT |
| អ៊ី២៦ | CGAGTCTAGG | CCTAGACTCG |
| អ៊ី២៦ | GGACTCAGCT | AGCTGAGTCC |
| អ៊ី២៦ | TCAGCAAGGA | TCCTTGCTGA |
| អ៊ី២៦ | CGATTCCTTA | TAAGGAATCG |
| អ៊ី២៦ | ATTAGGCAAT | ATTGCCTAAT |
| អ៊ី២៦ | TTGTGAAGG | CCTTCGACAA |
| អ៊ី២៦ | TCCAAGTAGC | GCTACTTGGA |
| អ៊ី២៦ | AGATAGTCCG | CGGACTATCT |
| អ៊ី២៦ | ស៊ីជីកាតាកាតា | TATGTTAGCG |
| អ៊ី២៦ | GGCTAATTGT | ACAATTAGCC |
| អ៊ី២៦ | AGGTACGTCA | TGAGTACCT |
| អ៊ី២៦ | TTCCAAGTTC | GAACTTGGAA |
| អ៊ី២៦ | CGGAGCTCCG | CGGAGCTCCG |
| អ៊ី២៦ | ហ្គីតាតាតា | តាតTAGTACC |
| អ៊ី២៦ | TCGAAGGCAA | TTGCCTTTCGA |
| អ៊ី២៦ | CTCCTTGATG | CATCAAGGAG |
| អ៊ី២៦ | GCAATTCCGG | CCGGAATTGC |
| អ៊ី២៦ | ACTACGCAGC | GCTGCGTAGT |
| អ៊ី២៦ | AGGAATGGCC | GGCCATTCCT |
| អ៊ី២៦ | AGGTTAGឆ្មា | ATGCTACCT |
| អ៊ី២៦ | CGTCCTAGAC | GTCTAGGACG |
| អ៊ី២៦ | CGGTGGCAAT | ATTGCCACGC |
| អ៊ី២៦ | TCTTGATCGAC | GTCGATCAGA |
| អ៊ី២៦ | AGTTGTCAGG | CCTGACAACT |
| អ៊ី២៦ | CTACCCCAAT | ATTGGCGTAG |
| អ៊ី២៦ | GTAGTTCGGT | ACGCAACTAC |
| អ៊ី២៦ | TGAAGCGCTAT | ATAGCGCTCA |
| អ៊ី២៦ | ATACCTTAGT | អេកតាកហ្កាតា |
| អ៊ី២៦ | GCACACCATT | AATGGTGTGC |
| អ៊ី២៦ | GTTAAGGAG | CTCCTTAGAC |
| អ៊ី២៦ | CATTCCGCGG | CCGCGGAATG |
| អ៊ី២៦ | GCGTACCTAG | CTAGGTCGC |
| អ៊ី២៦ | CTCAATAGCA | TGCTATTTGAG |
| អ៊ី២៦ | GTGCTAGCC | GGCTTAGCAC |
| អ៊ី២៦ | TGCCACTATC | GATAGTGGCA |
| អ៊ី២៦ | GCTGTTGAAT | ATTCAACAGC |
| អ៊ី២៦ | CGGCTAATCC | GGATTAGស៊ី.ស៊ី.ជី |
| អ៊ី២៦ | AACTACCGCA | TGCGGTAGTT |
| អ៊ី២៦ | ATGCATCAAG | CTTGATGCAT |
| អ៊ី២៦ | CTGACTTGCA | TGCAAGTCAG |
| អ៊ី២៦ | TGGTACCTAT | ATAGGTACCA |
| អ៊ី២៦ | ATTAGCTAAC | GTTAGCTAAT |
| អ៊ី២៦ | TGGTACCTAT | ATAGGTACCA |
| អ៊ី២៦ | TGTTGCTACC | GGTAGCAACA |
| អ៊ី២៦ | CTTATATAG | CTTATATAG |
| អ៊ី២៦ | TCAGACTGT | ACAGACTTGA |
| អ៊ី២៦ | TGAAGCGCTAT | ATAGCGCTCA |
| អ៊ី២៦ | TTAGជីជីតាក់ | GTACGCCTAA |
| អ៊ី២៦ | TTCTCATCAG | CTGATGAGAA |
| អ៊ី២៦ | CTAGGTATTG | CAATACCTAG |
| អ៊ី២៦ | TTGCTGACTA | TAGTCAGCAA |
| Library Multiplex Primer (ស៊េរី F) | សម្រាប់អេសample Sheet MiSeq | សម្រាប់អេសample Sheet NovaSeq, NovaSeq X, Next Seq, MiniSeq |
| F501 | AGCCAGTAGC | GCTACTGGCT |
| F502 | ស៊ីជីហ្គាហ្គាតធី | AACTCATCGG |
| F503 | GTTCAACTTC | GAAGTTGAAC |
| F504 | TTGAGCATCA | TGATGCTCAA |
| F505 | ATCAACAGTG | CACTGTTGAT |
| F506 | CACACGGTAG | CTACCGTGTG |
| F507 | GAGGATTGCT | AGCAATCCTC |
| F508 | TATTTGGCC | ជីកាកាកាតា |
| F509 | AACTAGTGGC | GCCACTAGTT |
| F510 | CAATCTGGT | ACCAGGATTG |
| F511 | GAAGGTTACG | CGTAACCTTC |
| F512 | CTAAGAACCT | AGGTTTCTTAG |
| F513 | CACACGGTAG | CTACCGTGTG |
| F514 | AATTAGTCTG | CAGACTAATT |
| F515 | GACCGTGTTA | TAACCGGTC |
| F516 | TATTCGAGG | CCTCGAATTA |
| F517 | អេហ្គាអេតហ្គាជីជី | CGTCAATCTT |
| F518 | CAACTCGCTA | TAGCGAGTTG |
| F519 | ហ្គាតធីជីអេក | AGTTCGAATC |
| F520 | GCCTTGAGTT | AACTCAAGGC |
| F521 | កាកាកាតTAG | CTATCTGTG |
| F522 | CAGCTAGGCC | GGCCTAGCTG |
| F523 | GCAAGGTATA | TATACCTTGC |
| F524 | TACCTAGGTA | TACCTAGGTA |
| F525 | AATCCTTGAA | TTCAAGGATT |
| F526 | កាតាកកាក | AGTTCGATG |
| F527 | GCCTGCGTAA | TACGCAGGC |
| F528 | កាតាកកាក | AGTTCGATG |
| F529 | ACAGTGCCAT | ATGGCACTGT |
| F530 | CCAACTATG | ស៊ីអេអេTAGTTGG |
| F531 | GCGTACCGCA | TGCGGTACGC |
| F532 | TAGGAGCGAT | ATCGCTCCTA |
| F533 | ACCAATTGGT | ACCAATTGGT |
| F534 | AATACTGTTA | TAACAGTATT |
| F535 | GCTGTTGAAT | ATTCAACAGC |
| F536 | TTACAACCAG | CTGTGTTGTAA |
| F537 | ACGTCAAGTC | GACTTGACTT |
| F538 | CATTCAATG | CATTGAATTG |
| F539 | TGAATTCAGC | GCTGAATTCA |
| F540 | ACGTACAGCT | AGCTGTACGT |
| F541 | TGACTACCAT | អេធីជីTAGTCA |
| F542 | CCTGGTGTGA | TCACACAGG |
| F543 | GACTAATCGC | GCGATTAGTC |
| F544 | ACGTTAGTGC | GCACTAACTT |
| F545 | ACTCGATTTCT | AGAATCGAGT |
| F546 | CGACAAGATT | AATCTTGTCG |
| F547 | GGAATTGGCT | AGCCAATTCC |
| F548 | TCACAGCCGA | TCGGCTGTGA |
| F549 | CTGTACTGTA | TACAGTACAG |
| F550 | TCGCTCGAGG | CCCGAGCGA |
| F551 | ACCTTAGស៊ីអេអេ | TTGCTAGGT |
| F552 | TCCGGACTAC | GTAGTCCGGA |
| F553 | AGAACTTGCA | TGCAAGTTCT |
| F554 | CGCAGGACTT | AAGTCCTGCG |
| F555 | GGCAAGATGA | TCTCTTGCC |
| F556 | GCCTAGCGCG | CGCGCTAGGC |
| F557 | កាកាស៊ីជីកាតា | TAGCGATGTC |
| F558 | CGGCTAATCC | GGATTAGស៊ី.ស៊ី.ជី |
| F559 | GGTTGAGCTTT | AAGCTCAACC |
| F560 | TCCGCTAGGC | GCCTGAGCGA |
| F561 | GCTGATTATA | តាតាតាតាកស៊ី |
| F562 | GCGCTAGTCC | GGACTAGCGC |
| F563 | TATGTCTGAA | ធីតាកាកាតា |
| F564 | អេក កាតាតាត | អាតាតាកត |
| F565 | AGGAATGGCC | GGCCATTCCT |
| F566 | CGTAGCGCGC | GCGCGCTACG |
| F567 | GCCTGCGTAA | TACGCAGGC |
| F568 | TCTTAGCGAT | ATCGCTAAGA |
| F569 | AGTTCTAAGA | TCTTAGអេក |
| F570 | CTAGGTATTG | CAATACCTAG |
| F571 | GTAGTACTAC | GTAGTACTAC |
| F572 | TGACAAGTAG | CTACTTGTCA |
| F573 | ATAGTCCGAG | CTCAGACTAT |
| F574 | CTGTGTTACA | TGTAACACAG |
| F575 | GTCTAGCCAC | GTGGCTAGAC |
| F576 | AATCAAGGTT | AACCTTGATT |
| F577 | កាតាតាតាត | កាតាតាតាត |
| F578 | CTCGAGCTAT | ATAGCTCGAG |
| F579 | GTGCCTGATG | CATCAGGCAC |
| F580 | TGCTCGATG | CAATCGAGCA |
| F581 | ហ្គាតធីជីអេក | AGTTCGAATC |
| F582 | TCGTTGAGGA | TCCTCAACGA |
| F583 | AGCCAGCGGT | ACCGCTGGCT |
| F584 | ATGTCAGATT | AATCTGACAT |
| F585 | CTGTATATAC | ជីតាតាតាក |
| F586 | TGGTGTCAAC | GTTGACACCA |
| F587 | ATTGCATGCT | AGCATGCAAT |
| F588 | AGTATTCATA | តាកកាតាក |
| F589 | TGTAATTCCG | CGGAATTACA |
| F590 | CTTCCTGGCA | TGCCAGGAAG |
| F591 | TCCGCGCGGA | TCCGCGCGGA |
| F592 | CACTGTTTCGG | CCGAACAGTG |
| F593 | TTAGCCAATA | TATTGGCTAA |
| F594 | TTCGAGCTGA | TCAGCTCGAA |
| F595 | GTACCGCGCG | CGCGCGGTAC |
| F596 | TTGAGCATCA | TGATGCTCAA |
ឧបសម្ព័ន្ធ
Spiking TELL-Seq™ Custom Primers ចូលទៅក្នុង Illumina® Sequencing Primers
បណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ត្រូវការបឋមតាមលំដាប់លំដោយផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់វេទិកាលំដាប់ Illumina ។ Spiking (ឬរួមបញ្ចូលគ្នា) ការតម្រៀបតាមលំដាប់ TELL-Seq™ Illumina ផ្ទាល់ខ្លួនទៅក្នុង primers លំដាប់ Illumina ស្តង់ដារគឺចាំបាច់នៅពេលរួមបញ្ចូលបណ្ណាល័យវត្ថុបញ្ជា PhiX ឬបណ្ណាល័យ Illumina ស្តង់ដារផ្សេងទៀតជាមួយបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ក្នុងការដំណើរការបន្តបន្ទាប់គ្នា។
ចំណាំ៖ TELL-Seq™ Index 1 read មាន 18-base ហើយត្រូវការ 18-cycle sequencing; Index 2 read មាន 8-base សម្រាប់ T-series primer និង 10-base សម្រាប់ primer ស៊េរី C ។
នីតិវិធីសម្រាប់ការពន្លិច primers ផ្ទាល់ខ្លួនចូលទៅក្នុង primers Illumina
- ទីតាំងប្រអប់ព្រីន បរិមាណសរុប និងការប្រមូលផ្តុំចុងក្រោយនៃ primers ផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់វេទិកានីមួយៗត្រូវបានផ្តល់ជូននៅក្នុងតារាងខាងក្រោម។
- គណនាបរិមាណនៃ primer ផ្ទាល់ខ្លួនដើម្បីបន្ថែមទៅទីតាំងប្រអប់ព្រីន Illumina primer ដោយផ្អែកលើការប្រមូលផ្តុំចុងក្រោយនៃ primer ផ្ទាល់ខ្លួននៅក្នុង cartridge។*
- បនា្ទាប់ពីស្អំក្នុងព្រែផ្ទាល់ខ្លួន សូមកែបំពង់ទៅពាក់កណា្តាលនៃបរិមាណសរុប ហើយដាក់បំពង់ថ្នមៗឡើងលើ និងចុះក្រោមចំនួនប្រាំដង ដើម្បីលាយចូលគ្នាឱ្យបានហ្មត់ចត់។
- សម្រាប់វេទិកា MiSeq, MiniSeq, NextSeq និង NovaSeq សូមកុំពិនិត្យទីតាំងប្រអប់ "បឋមផ្ទាល់ខ្លួន" នៅក្នុង sample សន្លឹក ឬកំឡុងពេលដំឡើងដំណើរការ។
* ដើម្បីគណនាចំនួន primer ផ្ទាល់ខ្លួនដើម្បីកើនឡើងចូលទៅក្នុងអណ្តូង សូមប្រើសមីការ (C1)*(V1) = (C2)*(V2) ដែល៖
- C1 = 100μM (នៅពេលប្រើភាគហ៊ុន primer កំហាប់ខ្ពស់ 100μM បរិមាណបន្ថែមតូចទៅភាគចុងក្រោយគឺមានភាពធ្វេសប្រហែស)។
- V1 = ដោះស្រាយសម្រាប់កម្រិតសំឡេងនៃ primer ផ្ទាល់ខ្លួនដែលត្រូវកើនឡើង
- C2 = ការផ្តោតអារម្មណ៍ចុងក្រោយរបស់ primer ផ្ទាល់ខ្លួនដែលបានណែនាំពីតារាងខាងក្រោម V2 = បរិមាណសរុបនៃ primer Illumina នៅក្នុងតារាងខាងក្រោម
Example សម្រាប់វេទិកា MiSeq
100μM * V1 = 0.5μM * 680μL V1 = 3.4 µl
ចំណាំសំខាន់៖ គោលការណ៍ណែនាំខាងក្រោមគឺផ្អែកលើបរិមាណបឋមបច្ចុប្បន្ន។ ដើម្បីធានាបាននូវភាពត្រឹមត្រូវ វាស់បរិមាណ primer សរុបនៅក្នុង cartridge ជាមួយនឹង pipette មុនពេលបន្តការដំឡើង។
លំដាប់ Illumina® នីមួយៗមានកំហាប់ចុងក្រោយ និងបរិមាណសរុបខុសៗគ្នា ដូច្នេះសូមមើលឯកសារខាងក្រោម ដើម្បីធានាថាចំនួនសមស្របនៃ TELL-Seq™ Illumina® Sequencing Primers កំពុងត្រូវបានបន្ថែមដោយផ្ទាល់។
*ចំណាំ៖ Index 1 និង Index 2 រួមជាមួយនឹង Read 1 និង Read 2 primers ជារឿយៗត្រូវបានបញ្ចូលគ្នានៅក្នុងប្រអប់ព្រីនធ័រល្អ។ សូមប្រាកដថា primer ផ្ទាល់ខ្លួននៃការប្រមូលផ្តុំចុងក្រោយសម្រាប់អណ្តូងគឺជា primer នីមួយៗ (ឧ. 0.3μM នៃ Index 1 និង Index 2 សម្រាប់សរុប 0.6μM)
<https://knowledge.illumina.com/library-preparation/general/library-preparation-general-reference_material-list/000001542>
ខាងក្រោម
iSeq100
ដោយសារតែការសាងសង់ប្រអប់ព្រីន iSeq100 វាមិនអាចផ្ទុក និងប្រើ primers ផ្ទាល់ខ្លួនបានទេ។
មីនីសេក
វគ្គបន្ទាប់
MiSeq
* មិនមានជម្រើសសម្រាប់ primer Index 2 (i5) ផ្ទាល់ខ្លួនទេ ចាប់តាំងពីគំរូប្រើ primer P5 ដែលលាបលើផ្ទៃនៃក្រឡាលំហូរ។
HiSeq 1000/2000 - 1500/2300 
* មិនមានជម្រើសសម្រាប់ primer Index 2 (i5) ផ្ទាល់ខ្លួនទេ ចាប់តាំងពីគំរូប្រើ primer P5 ដែលលាបលើផ្ទៃនៃក្រឡាលំហូរ។
HiSeq 3000/4000
NovaSeq v1.0 សម្ភារៈប្រើប្រាស់
| កំណែកញ្ចប់ | ថ្នាំ primer Illumina (ឈ្មោះ) | ទីតាំងប្រអប់ព្រីន | សរុប កម្រិតសំឡេង (មីលីលីត្រ) | ផ្ទាល់ខ្លួន ថ្នាំ primer ការផ្តោតអារម្មណ៍ចុងក្រោយ (µM) |
|
SP 100/200/300/500 វដ្ត |
អាន 1 (BP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (BP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S1 និង S2 100/200/300 វដ្ត |
អាន 1 (BP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (BP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S4 200/300 វដ្ត |
អាន 1 (BP10) | 24 | 7.3 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) (BP14)* | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (BP11) | 13 | 3.5 | 0.3 |
* មិនមានជម្រើសសម្រាប់ primer Index 2 (i5) ផ្ទាល់ខ្លួនទេ ចាប់តាំងពីគំរូប្រើ primer P5 ដែលលាបលើផ្ទៃនៃក្រឡាលំហូរ។
NovaSeq v1.5 សម្ភារៈប្រើប្រាស់
| កំណែកញ្ចប់ | Illumina Primer (ឈ្មោះ) | ទីតាំងប្រអប់ព្រីន | សរុប កម្រិតសំឡេង (មីលីលីត្រ) | ផ្ទាល់ខ្លួន ថ្នាំ primer ការផ្តោតអារម្មណ៍ចុងក្រោយ (µM) |
|
SP 100/200/300/500 វដ្ត |
អាន 1 (VP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) និង សន្ទស្សន៍ 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (VP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S1 និង S2 100/200/300 វដ្ត |
អាន 1 (VP10) | 24 | 4 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) និង សន្ទស្សន៍ 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (VP11) | 13 | 2 | 0.3 | |
|
S4 200/300 វដ្ត |
អាន 1 (VP10) | 24 | 7.3 | 0.3 |
| សន្ទស្សន៍ 1 (i7) និង សន្ទស្សន៍ 2 (i5) (VP14) | 23 | 5 | 0.3 | |
| អាន 2 (VP11) | 13 | 3.5 | 0.3 |
NovaSeq X/X Plus
ការដំឡើង TELL-Seq™ ដំណើរការលើប្រព័ន្ធ NextSeq™ 1000/2000
ប្រអប់ព្រីនធ័រ NextSeq™ 1000/2000 មានអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួនចំនួនពីរ (1 និង 2 ទាំងពីរទទេ) ដែលត្រូវប្រើនៅពេលដែលបណ្ណាល័យត្រូវការ primer ផ្ទាល់ខ្លួនយ៉ាងហោចណាស់មួយ។ វាគាំទ្ររហូតដល់ទៅពីរ primer ផ្ទាល់ខ្លួន (អាង) សម្រាប់អណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗ។ វាចាំបាច់ណាស់ដែល Read primer និង Index primer ស្ថិតនៅក្នុងអណ្តូងផ្សេងៗគ្នា។
បណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ត្រូវការបឋមផ្ទាល់ខ្លួនសម្រាប់ការអានទាំងអស់ (អាន 1 អាន 2 លិបិក្រម 1 និងលិបិក្រម 2) ។ នៅពេលដែលមានតែបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ ប៉ុណ្ណោះដែលត្រូវបានដំណើរការជាបន្តបន្ទាប់
- ផ្សំ TELL-Seq™ អាន 1 និងអាន 2 primers: ប្រើ HT1 ដើម្បីពនឺលាយថ្នាំ primer អានផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗ ដើម្បីផ្តល់ទិន្នផល 600 µl នៅកំហាប់ចុងក្រោយ 0.3 µM ពោលគឺ 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន primer 1 និង 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន 2 primer ចូលទៅក្នុង 597 µl HT1. ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ១.
- ផ្សំ TELL-Seq™ index 1 និង index 2 primers៖ ប្រើ HT1 ដើម្បីពនលាយល្បាយ primer index ផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗ ដើម្បីទទួលបានទិន្នផល 600 µl នៅកំហាប់ចុងក្រោយ 0.6 µM ពោលគឺ 3.6 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ index 1 primer និង 3.6 µl នៃ 100 µl µM TELL-Seq™ index 2 primer ចូល 593 µl HT1។ ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ២.
- ជ្រើសរើស primer ផ្ទាល់ខ្លួនឱ្យបានត្រឹមត្រូវនៅពេលរៀបចំដំណើរការលំដាប់ដូចខាងក្រោម:
- អាន 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
- សន្ទស្សន៍ 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- សន្ទស្សន៍ 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- អាន 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
នៅពេលដែលបណ្ណាល័យ PhiX ត្រូវបានប្រើជាមួយបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ សម្រាប់ដំណើរការលំដាប់លំដោយ
- ទទួលបាន NextSeq 1000/2000 Read Primer Kit (Catalog # 20046117)
ផ្សំ TELL-Seq™ អាន 1 និងអាន 2 primer ទៅក្នុង HP21៖ បន្ថែមល្បាយបឋមអានផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗទៅ 600 µl HP21 សម្រាប់កំហាប់ចុងក្រោយ 0.3 µM ពោលគឺ 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន 1 primer និង 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន primer 2 ចូលទៅក្នុង 597 µl HP21. ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ១.- ផ្សំ TELL-Seq™ index 1 និង index 2 primers៖ ប្រើ HT1 ដើម្បីពនលាយល្បាយ primer index ផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗ ដើម្បីទទួលបានទិន្នផល 600 µl នៅកំហាប់ចុងក្រោយ 0.6 µM ពោលគឺ 3.6 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ index 1 primer និង 3.6 µl នៃ 100 µl µM TELL-Seq™ index 2 primer ចូល 593 µl HT1។ ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ២.
- ជ្រើសរើស primer ផ្ទាល់ខ្លួនឱ្យបានត្រឹមត្រូវនៅពេលរៀបចំដំណើរការលំដាប់ដូចខាងក្រោមៈ
- អាន 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
- សន្ទស្សន៍ 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- សន្ទស្សន៍ 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- អាន 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
នៅពេលដែលបណ្ណាល័យ Illumina លិបិក្រមពីរត្រូវបានតម្រៀបជាមួយបណ្ណាល័យ TELL-Seq™ រួមគ្នាក្នុងការដំណើរការ
- ទទួលបាន NextSeq 1000/2000 Read & Index Primer Kit (Catalog# 20046115)
- ផ្សំ TELL-Seq™ អាន 1 និងអាន 2 primer ទៅក្នុង HP21៖ បន្ថែមល្បាយបឋមអានផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗទៅ 600 µl HP21 សម្រាប់កំហាប់ចុងក្រោយ 0.3 µM ពោលគឺ 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន 1 primer និង 1.8 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ អាន primer 2 ចូលទៅក្នុង 597 µl HP21. ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ១.
- ផ្សំ TELL-Seq™ index 1 និង index 2 primers ទៅក្នុង BP14៖ បន្ថែមល្បាយ primer index ផ្ទាល់ខ្លួននីមួយៗទៅ 600 µl BP14 សម្រាប់កំហាប់ចុងក្រោយ 0.6 µM ពោលគឺ 3.6 µl នៃ 100 µM TELL-Seq™ index 1 primer និង 3.6 µl នៃ primer µM TELL-Seq™ index 100 primer ចូល 2 µl BP593. ផ្ទុកវាទៅក្នុងអណ្តូងផ្ទាល់ខ្លួន ២.
- ជ្រើសរើស primer ផ្ទាល់ខ្លួនឱ្យបានត្រឹមត្រូវនៅពេលរៀបចំដំណើរការលំដាប់ដូចខាងក្រោមៈ
- អាន 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
- សន្ទស្សន៍ 1: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- សន្ទស្សន៍ 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 2
- អាន 2: ផ្ទាល់ខ្លួន 1
ឯកសារ/ធនធាន
 |
បណ្ណាល័យ TELL-Seq លំដាប់ជាសកល [pdf] ការណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់ បណ្ណាល័យ TELL-Seq, TELL-Seq, បណ្ណាល័យ |
