និមិត្តសញ្ញា Opentronsកំណែឯកសារ 1 (04/12/24)
សន្លឹករៀបចំ
អាណានិគម PCR
ការបញ្ចាំងភាពយន្ត

OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ

និពន្ធដោយ Clay Wright, Ph.D.
Virginia Tech, នាយកដ្ឋានវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្ត
មគ្គុទ្ទេសក៍អ្នកអប់រំ ការពិនិត្យ PCR Colony

គោលបំណង

គោលដៅថ្ងៃនេះគឺសម្រាប់សិស្សានុសិស្សដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន plasmid DNA ដែលបានផ្គុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និង អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.
ដើម្បីធ្វើដូចនេះសិស្សនឹងត្រូវ៖

  • កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
  • ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
  • ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR

ទស្សនិកជនសិស្ស

មន្ទីរពិសោធន៍នេះត្រូវបានរចនាឡើងសម្រាប់និស្សិតថ្នាក់បរិញ្ញាបត្រកម្រិតមធ្យមដល់ថ្នាក់ខ្ពស់នៅក្នុងមហាវិទ្យាល័យវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្តនៅរដ្ឋ Virginia Tech (BSE 3984)។
បន្ទប់ពិសោធន៍អាចផ្ទុកបាននូវទំហំថ្នាក់ភាគច្រើន ដោយសារពិធីការ OT-2 នឹងត្រូវបានគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ ជាជាងសិស្សម្នាក់ៗ។

ចំណេះដឹងផ្ទៃខាងក្រោយ

សិស្សគួរតែមកមន្ទីរពិសោធន៍ជាមួយនឹងការយល់ដឹងអំពីគំនិតនៃការដាក់បំពង់ដោយដៃ ការត្រួតពិនិត្យអាណានិគម និង DNA ampការរំលាយ និងការរត់/ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ។

សមត្ថភាពស្នូល

ជំនាញមន្ទីរពិសោធន៍
បំពង់, សampការរៀបចំ និងការប្រើប្រាស់ឧបករណ៍ស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍
ការត្រិះរិះពិចារណា
ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ការដោះស្រាយបញ្ហា ការរចនាស្វ័យប្រវត្តិកម្មសម្រាប់ប្រសិទ្ធភាព ពិចារណាវិធីសាស្រ្តស្វ័យប្រវត្តិកម្ម

ការផ្គត់ផ្គង់

ឧបករណ៍ Opentrons

  • P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
  • P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
  • Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
  • Opentrons 96 Tip Rack 300 µL
  • ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
  • NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
  • Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL
    Safe-Lock Snapcap

សារធាតុប្រតិកម្ម

  • ទឹក DI
  • OneTaq® 2X PCR Master Mix ជាមួយ Standard Buffer
  • បន្តបន្ទាប់ Primer ១
  • ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
  • បន្តបន្ទាប់ Primer ១
  • ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2

រយៈពេលសាកល្បង

វគ្គថ្នាក់ដែលត្រូវការ 1
ពេលវេលាដំណើរការមន្ទីរពិសោធន៍
ពេលវេលាសរុបប៉ាន់ស្មាន: 2.5-3 ម៉ោង។

  • ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទី 10): XNUMX នាទី។
  • សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទី 35): XNUMX នាទី
  • បទបង្ហាញអំពីពិធីសារ ការសម្រេចលើពិធីសារឯកភាព៖ ១៥ នាទី។
  • ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី): 1.5 ម៉ោង។

ការដោះស្រាយបញ្ហាជាមូលដ្ឋាន

  1. ធ្វើការសាកល្បងមុនថ្នាក់; វិធីនេះ រាល់ការកើតឡើងដែលមិននឹកស្មានដល់អាចត្រូវបានដោះស្រាយ មុនពេលសិស្សមកដល់។
  2. បញ្ហា​ជាមួយ​នឹង​គន្លឹះ​ដែល​ធ្វើ​ឲ្យ​ស្លាក​ស្នាម​ត្រូវ​បាន​គេ​ប្រើ​ស្ទើរតែ​គ្រប់​ពេល​ដោយសារ​ការ​ប្រើ​ឧបករណ៍​ពិសោធន៍​ជំនួស​ឬ​ការ​ក្រិត​មនុស្ស​យន្ត។ ប្រសិនបើអ្នកជួបប្រទះបញ្ហានេះ ហើយបានបញ្ជាក់ពី labware ត្រឹមត្រូវ សូមព្យាយាមកែតំរូវមនុស្សយន្តឡើងវិញ។
  3. ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការទាក់ទងទៅផ្នែកជំនួយ Opentron សូមប្រាប់ពួកគេថាអ្នកគឺជាផ្នែកនៃកម្មវិធី Opentrons សម្រាប់ការអប់រំរបស់យើង និងកាលបរិច្ឆេទនៃថ្នាក់មន្ទីរពិសោធន៍បន្ទាប់របស់អ្នក។

សកម្មភាពមុនបន្ទប់ពិសោធន៍ដែលត្រូវការ

មុននឹងមកមន្ទីរពិសោធន៍នេះ សិស្សានុសិស្សត្រូវមានសមត្ថភាពបច្ចេកទេស និងចំណេះដឹងទ្រឹស្តីដូចខាងក្រោម៖

  • ផ្ទុកចុងបំពង់ដាក់លើបំពង់បង្ហូរដោយដៃ
  • ការលៃតម្រូវកម្រិតសំឡេងសម្រាប់ pipettes ដោយដៃ
  • ចំណេះដឹងទ្រឹស្តីនៃ DNA ampអេឡិចត្រិចនិងជែល

ការណែនាំអំពីនីតិវិធី

  1. ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទីមួយ) ~ 10 នាទី។
    សិស្ស​គួរ​តែ​អាន​នៅ​លើ​បន្ទប់​ពិសោធន៍​មុន​ពេល​មក​ថ្នាក់​រៀន ប៉ុន្តែ​មាន​គម្រោង​ចំណាយ​ពេល​មួយ​ភ្លែត​ដើម្បី​រៀប​រាប់​វគ្គ​ពិសោធន៍ ពន្យល់​ពី​គោលបំណង និង​ឆ្លើយ​សំណួរ​សិស្ស។
    សៀវភៅដៃ E. coli ពិនិត្យ PCR ពិធីការអាណានិគមសិស្សនឹងត្រូវបានដាក់បញ្ចូលស្វ័យប្រវត្តិកម្មទៅក្នុងមានដូចខាងក្រោម៖
    រៀបចំល្បាយមេ PCR៖
    1. គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីធ្វើជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
    2. ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
    3. Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
    Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ):
    4. យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
    5. ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
    6. បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។
  2. សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទីពីរ) ~ 35 នាទី
    សិស្សម្នាក់ៗនឹងប្រើ អ្នករចនាពិធីការ Opentrons ដើម្បីបង្កើតពិធីការរបស់ពួកគេ ដោយប្រើការណែនាំខាងក្រោម៖
    1. អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ថាតើឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។
    2. បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។
    3. ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "រចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
    ក្នុងអំឡុងពេលនៃផ្នែកនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ រៀបចំគម្រោងដើម្បីពិនិត្យចូលជាលក្ខណៈបុគ្គលជាមួយសិស្ស និងមើលពីរបៀបដែលពួកគេកំពុងចុះសម្រុងគ្នា។ រំលឹកពួកគេឱ្យគិតឱ្យបានច្បាស់លាស់ និងជៀសវាងការចម្លងរោគដែលអាចកើតមាន។
  3. Presenting Protocols ការសម្រេចចិត្តលើ Consensus Protocol ~ 15 នាទី។
    សិស្សគួរតែបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ រួមជាមួយនឹងហេតុផលរបស់ពួកគេ។ ជាថ្នាក់រៀន សិស្សនឹងកំណត់អត្តសញ្ញាណពិធីការឯកភាពមួយដែលត្រូវគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ។
    រៀបចំផែនការបង្កើតកន្លែងទំនេរខ្លះក្នុងអំឡុងពេលនេះសម្រាប់ការជជែកពិភាក្សាប្រកបដោយសុខភាពល្អ និងការគិតរិះគន់។
  4. ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី) ~ 1.5 ម៉ោង។
    នៅពេលដែលថ្នាក់បានសម្រេចចិត្តលើពិធីការរួមមួយ អ្នកនឹងដំណើរការពិធីការ ការទម្លាក់អាណានិគម និង PCR ។
    អ្នកអាចសម្រេចចិត្តធ្វើឱ្យផ្នែកនេះកាន់តែមានការចូលរួមដោយនាំយកអ្នកស្ម័គ្រចិត្តរបស់សិស្សមកធ្វើផ្នែកផ្សេងៗនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។
    ហើយខណៈពេលដែល PCR ដំណើរការ អ្នកអាចជ្រើសរើសពិភាក្សាពីគុណវិបត្តិ និងឱកាសនៃស្វ័យប្រវត្តិកម្មជាថ្នាក់ ឆ្លើយសំណួរ ឬអនុញ្ញាតឱ្យសិស្សធ្វើការលើរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ជាក្រុមតូចៗ។

របាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍

សេចក្តីណែនាំ
ចាត់តាំងសិស្សឱ្យរៀបចំរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ដ៏ទូលំទូលាយដែលជួយពួកគេឱ្យឆ្លុះបញ្ចាំងលើលទ្ធផលរបស់ពួកគេ និងនៅលើស្វ័យប្រវត្តិកម្ម OT-2 ។ គំនិតមួយចំនួនសម្រាប់ការរុករកត្រូវបានរួមបញ្ចូលដូចខាងក្រោម:

  1. សកម្មភាពផ្លាស់ប្តូរកូដ៖ ទំព័រទាំងអស់នៃកូដ Opentrons បានផ្ទុះឡើងលើតុរបស់អ្នកនៅពេលអ្នកបើកទ្វារ!
    រកមើលអ្វីដែលកំពុងកើតឡើងនៅលើទំព័រនីមួយៗនៃកូដ ហើយបន្ទាប់មកដាក់វាត្រឡប់មកវិញតាមលំដាប់ត្រឹមត្រូវ។
    a. ខៀវ
    b. បៃតង
    c. ក្រហម
  2. យោងត្រឡប់ទៅពិធីការ OT-2 ដែលអ្នកបានរៀបចំ។ តើអ្នកអាចកំណត់អត្តសញ្ញាណឱកាសណាមួយ ដើម្បីធ្វើឱ្យស្វ័យប្រវត្តិកម្មរបស់អ្នកកាន់តែមានប្រសិទ្ធភាព?
  3. កំណត់ចំណុចសំខាន់មួយចំនួននៅក្នុងពិធីការរបស់អ្នក ដែលអ្វីៗអាចខុសក្នុងអំឡុងពេលស្វ័យប្រវត្តិកម្ម (ឧទាហរណ៍៖ ការចម្លងរោគ ឬអស់សារធាតុប្រតិកម្ម)។ តើអ្នកអាចដោះស្រាយរឿងទាំងនេះដោយរបៀបណា?
  4. Review និងភ្ជាប់រូបភាពនៃលទ្ធផល electrophoresis ជែលទៅមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។ តើអ្នកបកស្រាយលទ្ធផលទាំងនេះដោយរបៀបណា?

ការណែនាំសិស្ស PCR Colony Screening

គោលបំណង
គោលដៅរបស់អ្នកនៅថ្ងៃនេះគឺដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន DNA plasmid ដែលបានប្រមូលផ្តុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និងពិធីសារ Opentrons
អ្នករចនា។
ដើម្បីធ្វើដូចនេះអ្នកនឹងត្រូវការ:

  • កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
  • ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
  • ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR

បរិក្ខារដែលត្រូវការ
Pipettes និងគន្លឹះ៖

  • P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
  • P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
  • Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
  • Opentrons 96 Tip Rack 300 µL

ម៉ូឌុល និង Labware៖

  • ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
  • NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
  • Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL Safe-Lock Snapcap

សារធាតុប្រតិកម្ម៖

  • ទឹក DI
  • ល្បាយមេ OneTaq® PCR
  • បន្តបន្ទាប់ Primer ១
  • ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
  • បន្តបន្ទាប់ Primer ១
  • ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2

នីតិវិធីពិសោធន៍
ផ្ទៃខាងក្រោយ
ដើម្បីធ្វើ PCR លើ DNA នៅក្នុង E. coli និងបាក់តេរីដទៃទៀត ក៏ដូចជាកោសិកាថនិកសត្វ យើងអាចដាក់កោសិកាមួយចំនួននៃសារពាង្គកាយទៅក្នុង PCR ហើយជំហានដំបូងនៃការប្រែពណ៌នឹងបញ្ចេញកោសិកាដែលបញ្ចេញ DNA ។ បញ្ហាទូទៅបំផុតដែលកើតឡើងជាមួយពិធីការនេះគឺថាអ្នកដាក់កោសិកាច្រើនពេកទៅក្នុងប្រតិកម្ម ហើយមាន DNA និងម៉ូលេគុលផ្សេងទៀតដែលមិនជាក់លាក់ច្រើនពេកដែលអាចរំខានដល់សារធាតុប៉ូលីមេរ៉េស។ សារពាង្គកាយផ្សេងទៀតដូចជាផ្សិត និងរុក្ខជាតិមានសារធាតុជ្រៀតជ្រែកច្រើនណាស់ ពោលគឺជញ្ជាំងកោសិការបស់ពួកគេ ដែលចាំបាច់ត្រូវការ លីហ្សីស តឹងរ៉ឹងជាងនេះ។ ជាធម្មតា យើងធ្វើវដ្តត្រជាក់ជាច្រើន សូដ្យូមអ៊ីដ្រូស៊ីតលីស ឬកិនជាមួយអាសូតរាវ ដើម្បីបញ្ចេញ DNA ពីសារពាង្គកាយដែលពិបាកជាងនេះ។
ទោះបីជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ចំណុចសំខាន់នៅទីនេះគឺថាអ្នកមិនត្រូវការកោសិកាជាច្រើនដើម្បីឱ្យមាន DNA ច្រើនក្នុងប្រតិកម្មមួយ។ ជាការពិតសម្រាប់ E. coli អ្នកមិនចង់ឱ្យដំណោះស្រាយកោសិកាដែលអ្នកគ្រោងនឹង lyse និងប្រើសម្រាប់ PCR មានពពក ឬ "turbid" នៅក្នុង microbiology jargon ។ អ្នកស្ទើរតែមិនអាចមើលឃើញកោសិកាដែលបែកខ្ញែកចូលទៅក្នុងដំណោះស្រាយ។
ជាធម្មតា មីក្រូជីវវិទូនឹងបង្កើតល្បាយប្រតិកម្ម PCR ជាល្បាយមេ (ជាមួយនឹងប្រតិកម្មទាំងអស់ដែលត្រូវការក្នុងបំពង់តែមួយ) ហើយបន្ទាប់មក បែងចែកល្បាយមេនេះទៅបំពង់នីមួយៗ។ អ្នកមិនត្រូវការបរិមាណច្រើនទេ ជាទូទៅ 20 µL គឺគ្រប់គ្រាន់ដើម្បីមើលក្រុមតន្រ្តី ជាពិសេសប្រសិនបើប្រើសិតសក់តូចចង្អៀតនៅពេលចាក់ជែលរបស់អ្នក។ បន្ទាប់មកអ្នកជ្រលក់ព័ត៌មានជំនួយជាមួយនឹងបរិមាណតូចមួយនៃអាណានិគមទៅក្នុងបំពង់ PCR នីមួយៗ ហើយផ្តល់ឱ្យវានូវចលនាទន់ភ្លន់។ (ពាក្យណែនាំ៖ ទុកព័ត៌មានជំនួយក្នុងដំណោះស្រាយរហូតដល់ការរើសអាណានិគមរួចរាល់ ដើម្បីកុំឱ្យបាត់បង់កន្លែងនៅក្នុងចាន ឬបន្ទះបំពង់។ )
ថ្ងៃនេះ យើងនឹងប្រើប្រាស់ឈុត primers ពីរផ្សេងគ្នា ដើម្បីរកមើលការផ្គុំត្រឹមត្រូវនៃ plasmids របស់យើងសម្រាប់ 15 អាណានិគមផ្សេងៗគ្នា ក៏ដូចជាការគ្រប់គ្រងអវិជ្ជមាន plasmid របស់យើងដែលយើងប្រើសម្រាប់ឆ្អឹងខ្នង។
នេះនឹងជា PCRs សរុបចំនួន 32 ផ្សេងគ្នា។ ខណៈពេលដែលវាមិនអាក្រក់ទេក្នុងការបង្កើត PCRs អាណានិគម អ្នកអាចចាប់ផ្តើមមើលពីរបៀបដែលទំហំនេះ ការបង្ហូរបំពង់មានភាពធុញទ្រាន់ ហើយការធ្វើខុសនឹងងាយស្រួល។ វិធីសាស្រ្តលាយមេពិតជាអាចជួយបាន ប៉ុន្តែសម្រាប់រឿងដដែលៗតិច Opentron ជួយបានច្រើន។ ការបង្កើតពិធីការនេះនៅក្នុង OT-2 នឹងសង្ឃឹមថាជាពិធីការដែលអាចសម្រេចបាន ប៉ុន្តែជាការបង្ហាញដើម្បីណែនាំអ្នកអំពីស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍។

ផ្នែកទី 1: Reviewសៀវភៅដៃ E. coli PCR Colony Screening Protocol
គោលដៅរបស់អ្នកនៅក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍នេះគឺដើម្បីបង្កើតពិធីការ Opentrons OT-2 ស្វ័យប្រវត្តិដែលនឹងចម្លងនូវពិធីការ E. coli colony PCR protocol ខាងក្រោម៖
រៀបចំល្បាយមេ PCR៖

  1. គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីបង្កើតជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
  2. ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
  3. Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
    Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ):
  4. យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
  5. ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
  6. បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។

ផ្នែកទីពីរ៖ បង្កើតពិធីសារ OT-2 របស់អ្នក។
ដើម្បីធ្វើពិធីការរបស់អ្នក សូមបើកកម្មវិធី អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.

  1. អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ
  2. បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។Opentrons OT-2 Liquid Handling Robot - ផលិត(ចំណាំថាអ្នកអាចប្រើប្រអប់ធីក 'Serialize' នៅក្នុងអ្នករចនាពិធីការដើម្បីបង្កើត primers ផ្សេងគ្នាទាំងនេះ។ សូមចំណាំផងដែរថានៅពេលបញ្ជាក់បរិមាណនេះគឺជាអ្វីដែលយើងអាចផ្លាស់ប្តូរនៅពេលក្រោយគ្រាន់តែធ្វើឱ្យប្រាកដថាបរិមាណដែលអ្នកដាក់សមហេតុផលហើយលើសពីអ្វីដែល។ អ្នកគិតថាអ្នកនឹងត្រូវការ។ )Opentrons OT-2 Liquid Handling Robot - សមហេតុផល
  3. ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "ការរចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
    នៅពេលបង្កើតពិធីការ OT-2 របស់អ្នក គិតអំពីរបៀបដែលអ្នកអាចធ្វើឱ្យវាមានប្រសិទ្ធភាពបំផុត។ ពិនិត្យមើលការកំណត់កម្រិតខ្ពស់នៅក្រោម "រូបតំណាងប្រអប់លេខ" ។ អ្នកក៏អាចប្រើផ្លូវផ្សេងគ្នាដើម្បីរក្សាទុកព័ត៌មានជំនួយផងដែរ។ គ្រាន់តែប្រយ័ត្ន ហើយត្រូវប្រាកដថាអ្នកមិនបំពុលសារធាតុប្រតិកម្ម ឬបំផ្លាញ
    ការពិសោធន៍របស់យើងជាមួយនឹងការចម្លងរោគ។ នៅតាមបណ្តោយបន្ទាត់ទាំងនេះ ក៏ព្យាយាមគិតអំពីអ្វីដែលអាចខុសដែរ ដូចជាអស់ពីសារធាតុប្រតិកម្ម ហើយត្រូវប្រាកដថាចងក្រងឯកសារទាំងនេះ ព្រោះវាអាចមានប្រយោជន៍ក្នុងការបំបាត់កំហុសពិធីការរបស់អ្នក និងធ្វើឱ្យប្រាកដថាអ្នកប្រើប្រាស់ចុងក្រោយដឹងពីចំណុចសំខាន់ៗនៅក្នុងរបស់អ្នក ពិធីការ។
    កម្មវិធីអាចចំណាយពេលខ្លះដើម្បីស៊ាំនឹង ប៉ុន្តែអ្នកអាចចុចជុំវិញ និងស៊ាំជាមួយវាបានយ៉ាងលឿន ហើយនៅទីបញ្ចប់វាពិតជាវិចារណញាណណាស់។ ដូចដែលអ្នកនឹងឃើញទោះបីជាវាទាមទារការចុចច្រើនដើម្បីបញ្ជាក់ពិធីការដែលប្រហែលជាមានប្រយោជន៍ជាងប្រសិនបើវាត្រូវបានសរសេរនៅក្នុង Python ហើយអាចត្រូវបានកែប្រែយ៉ាងងាយស្រួលដើម្បីបន្ថែម samples ឬ reagents ថ្មី។
    នៅពេលដែលអ្នកបានបញ្ចប់ពិធីការរបស់អ្នក សូមត្រលប់ទៅ "File"និងនាំចេញវា។ វានឹងអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកនាំចូលវានៅពេលក្រោយ ឬបង្ហោះវាទៅ OT-2។
  4. ក្នុងនាមជាថ្នាក់រៀន សិស្សម្នាក់ៗនឹងបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ ហើយរួមគ្នាយើងនឹងសម្រេចចិត្តលើពិធីការថ្នាក់ចុងក្រោយដើម្បីដំណើរការលើ OT-2 ។

ការចាប់ផ្តើម
មុននឹងបង្រៀនផែនការមេរៀន សូមបំពេញជំហានខាងក្រោមមុនពេលចូលរៀន។

ត្រូវការជំនួយបន្ថែម?

សម្រាប់ជំនួយបច្ចេកទេស សូមពិនិត្យមើលរបស់យើង។ មជ្ឈមណ្ឌលជំនួយ Opentrons សម្រាប់អត្ថបទពាក់ព័ន្ធ។ ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការជំនួយបន្ថែម សូមទាក់ទង support@opentrons.com.
ប្រសិនបើអ្នកមានសំណួរទាក់ទងនឹងផែនការមេរៀន សូមចូលទៅ
ចេញទៅអ្នកនិពន្ធ Clay Wright, Ph.D., at wrightrc@vt.edu.

និមិត្តសញ្ញា Opentrons

ឯកសារ/ធនធាន

Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ [pdf] ការណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់
OT-2, OT-2 Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, មនុស្សយន្ត

ឯកសារយោង

ទុកមតិយោបល់

អាសយដ្ឋានអ៊ីមែលរបស់អ្នកនឹងមិនត្រូវបានផ្សព្វផ្សាយទេ។ វាលដែលត្រូវការត្រូវបានសម្គាល់ *