កំណែឯកសារ 1 (04/12/24)
សន្លឹករៀបចំ
អាណានិគម PCR
ការបញ្ចាំងភាពយន្ត
OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ
និពន្ធដោយ Clay Wright, Ph.D.
Virginia Tech, នាយកដ្ឋានវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្ត
មគ្គុទ្ទេសក៍អ្នកអប់រំ ការពិនិត្យ PCR Colony
គោលបំណង
គោលដៅថ្ងៃនេះគឺសម្រាប់សិស្សានុសិស្សដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន plasmid DNA ដែលបានផ្គុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និង អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.
ដើម្បីធ្វើដូចនេះសិស្សនឹងត្រូវ៖
- កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
- ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
- ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR
ទស្សនិកជនសិស្ស
មន្ទីរពិសោធន៍នេះត្រូវបានរចនាឡើងសម្រាប់និស្សិតថ្នាក់បរិញ្ញាបត្រកម្រិតមធ្យមដល់ថ្នាក់ខ្ពស់នៅក្នុងមហាវិទ្យាល័យវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្តនៅរដ្ឋ Virginia Tech (BSE 3984)។
បន្ទប់ពិសោធន៍អាចផ្ទុកបាននូវទំហំថ្នាក់ភាគច្រើន ដោយសារពិធីការ OT-2 នឹងត្រូវបានគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ ជាជាងសិស្សម្នាក់ៗ។
ចំណេះដឹងផ្ទៃខាងក្រោយ
សិស្សគួរតែមកមន្ទីរពិសោធន៍ជាមួយនឹងការយល់ដឹងអំពីគំនិតនៃការដាក់បំពង់ដោយដៃ ការត្រួតពិនិត្យអាណានិគម និង DNA ampការរំលាយ និងការរត់/ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ។
សមត្ថភាពស្នូល
ជំនាញមន្ទីរពិសោធន៍
បំពង់, សampការរៀបចំ និងការប្រើប្រាស់ឧបករណ៍ស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍
ការត្រិះរិះពិចារណា
ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ការដោះស្រាយបញ្ហា ការរចនាស្វ័យប្រវត្តិកម្មសម្រាប់ប្រសិទ្ធភាព ពិចារណាវិធីសាស្រ្តស្វ័យប្រវត្តិកម្ម
ការផ្គត់ផ្គង់
ឧបករណ៍ Opentrons
- P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
- P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
- Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
- Opentrons 96 Tip Rack 300 µL
- ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
- NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
- Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL
Safe-Lock Snapcap
សារធាតុប្រតិកម្ម
- ទឹក DI
- OneTaq® 2X PCR Master Mix ជាមួយ Standard Buffer
- បន្តបន្ទាប់ Primer ១
- ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
- បន្តបន្ទាប់ Primer ១
- ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2
រយៈពេលសាកល្បង
វគ្គថ្នាក់ដែលត្រូវការ 1
ពេលវេលាដំណើរការមន្ទីរពិសោធន៍
ពេលវេលាសរុបប៉ាន់ស្មាន: 2.5-3 ម៉ោង។
- ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទី 10): XNUMX នាទី។
- សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទី 35): XNUMX នាទី
- បទបង្ហាញអំពីពិធីសារ ការសម្រេចលើពិធីសារឯកភាព៖ ១៥ នាទី។
- ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី): 1.5 ម៉ោង។
ការដោះស្រាយបញ្ហាជាមូលដ្ឋាន
- ធ្វើការសាកល្បងមុនថ្នាក់; វិធីនេះ រាល់ការកើតឡើងដែលមិននឹកស្មានដល់អាចត្រូវបានដោះស្រាយ មុនពេលសិស្សមកដល់។
- បញ្ហាជាមួយនឹងគន្លឹះដែលធ្វើឲ្យស្លាកស្នាមត្រូវបានគេប្រើស្ទើរតែគ្រប់ពេលដោយសារការប្រើឧបករណ៍ពិសោធន៍ជំនួសឬការក្រិតមនុស្សយន្ត។ ប្រសិនបើអ្នកជួបប្រទះបញ្ហានេះ ហើយបានបញ្ជាក់ពី labware ត្រឹមត្រូវ សូមព្យាយាមកែតំរូវមនុស្សយន្តឡើងវិញ។
- ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការទាក់ទងទៅផ្នែកជំនួយ Opentron សូមប្រាប់ពួកគេថាអ្នកគឺជាផ្នែកនៃកម្មវិធី Opentrons សម្រាប់ការអប់រំរបស់យើង និងកាលបរិច្ឆេទនៃថ្នាក់មន្ទីរពិសោធន៍បន្ទាប់របស់អ្នក។
សកម្មភាពមុនបន្ទប់ពិសោធន៍ដែលត្រូវការ
មុននឹងមកមន្ទីរពិសោធន៍នេះ សិស្សានុសិស្សត្រូវមានសមត្ថភាពបច្ចេកទេស និងចំណេះដឹងទ្រឹស្តីដូចខាងក្រោម៖
- ផ្ទុកចុងបំពង់ដាក់លើបំពង់បង្ហូរដោយដៃ
- ការលៃតម្រូវកម្រិតសំឡេងសម្រាប់ pipettes ដោយដៃ
- ចំណេះដឹងទ្រឹស្តីនៃ DNA ampអេឡិចត្រិចនិងជែល
ការណែនាំអំពីនីតិវិធី
- ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទីមួយ) ~ 10 នាទី។
សិស្សគួរតែអាននៅលើបន្ទប់ពិសោធន៍មុនពេលមកថ្នាក់រៀន ប៉ុន្តែមានគម្រោងចំណាយពេលមួយភ្លែតដើម្បីរៀបរាប់វគ្គពិសោធន៍ ពន្យល់ពីគោលបំណង និងឆ្លើយសំណួរសិស្ស។
សៀវភៅដៃ E. coli ពិនិត្យ PCR ពិធីការអាណានិគមសិស្សនឹងត្រូវបានដាក់បញ្ចូលស្វ័យប្រវត្តិកម្មទៅក្នុងមានដូចខាងក្រោម៖
រៀបចំល្បាយមេ PCR៖
1. គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីធ្វើជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
2. ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
3. Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ):
4. យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
5. ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
6. បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។ - សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទីពីរ) ~ 35 នាទី
សិស្សម្នាក់ៗនឹងប្រើ អ្នករចនាពិធីការ Opentrons ដើម្បីបង្កើតពិធីការរបស់ពួកគេ ដោយប្រើការណែនាំខាងក្រោម៖
1. អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ថាតើឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។
2. បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។
3. ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "រចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
ក្នុងអំឡុងពេលនៃផ្នែកនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ រៀបចំគម្រោងដើម្បីពិនិត្យចូលជាលក្ខណៈបុគ្គលជាមួយសិស្ស និងមើលពីរបៀបដែលពួកគេកំពុងចុះសម្រុងគ្នា។ រំលឹកពួកគេឱ្យគិតឱ្យបានច្បាស់លាស់ និងជៀសវាងការចម្លងរោគដែលអាចកើតមាន។ - Presenting Protocols ការសម្រេចចិត្តលើ Consensus Protocol ~ 15 នាទី។
សិស្សគួរតែបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ រួមជាមួយនឹងហេតុផលរបស់ពួកគេ។ ជាថ្នាក់រៀន សិស្សនឹងកំណត់អត្តសញ្ញាណពិធីការឯកភាពមួយដែលត្រូវគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ។
រៀបចំផែនការបង្កើតកន្លែងទំនេរខ្លះក្នុងអំឡុងពេលនេះសម្រាប់ការជជែកពិភាក្សាប្រកបដោយសុខភាពល្អ និងការគិតរិះគន់។ - ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី) ~ 1.5 ម៉ោង។
នៅពេលដែលថ្នាក់បានសម្រេចចិត្តលើពិធីការរួមមួយ អ្នកនឹងដំណើរការពិធីការ ការទម្លាក់អាណានិគម និង PCR ។
អ្នកអាចសម្រេចចិត្តធ្វើឱ្យផ្នែកនេះកាន់តែមានការចូលរួមដោយនាំយកអ្នកស្ម័គ្រចិត្តរបស់សិស្សមកធ្វើផ្នែកផ្សេងៗនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។
ហើយខណៈពេលដែល PCR ដំណើរការ អ្នកអាចជ្រើសរើសពិភាក្សាពីគុណវិបត្តិ និងឱកាសនៃស្វ័យប្រវត្តិកម្មជាថ្នាក់ ឆ្លើយសំណួរ ឬអនុញ្ញាតឱ្យសិស្សធ្វើការលើរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ជាក្រុមតូចៗ។
របាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍
សេចក្តីណែនាំ
ចាត់តាំងសិស្សឱ្យរៀបចំរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ដ៏ទូលំទូលាយដែលជួយពួកគេឱ្យឆ្លុះបញ្ចាំងលើលទ្ធផលរបស់ពួកគេ និងនៅលើស្វ័យប្រវត្តិកម្ម OT-2 ។ គំនិតមួយចំនួនសម្រាប់ការរុករកត្រូវបានរួមបញ្ចូលដូចខាងក្រោម:
- សកម្មភាពផ្លាស់ប្តូរកូដ៖ ទំព័រទាំងអស់នៃកូដ Opentrons បានផ្ទុះឡើងលើតុរបស់អ្នកនៅពេលអ្នកបើកទ្វារ!
រកមើលអ្វីដែលកំពុងកើតឡើងនៅលើទំព័រនីមួយៗនៃកូដ ហើយបន្ទាប់មកដាក់វាត្រឡប់មកវិញតាមលំដាប់ត្រឹមត្រូវ។
a. ខៀវ
b. បៃតង
c. ក្រហម - យោងត្រឡប់ទៅពិធីការ OT-2 ដែលអ្នកបានរៀបចំ។ តើអ្នកអាចកំណត់អត្តសញ្ញាណឱកាសណាមួយ ដើម្បីធ្វើឱ្យស្វ័យប្រវត្តិកម្មរបស់អ្នកកាន់តែមានប្រសិទ្ធភាព?
- កំណត់ចំណុចសំខាន់មួយចំនួននៅក្នុងពិធីការរបស់អ្នក ដែលអ្វីៗអាចខុសក្នុងអំឡុងពេលស្វ័យប្រវត្តិកម្ម (ឧទាហរណ៍៖ ការចម្លងរោគ ឬអស់សារធាតុប្រតិកម្ម)។ តើអ្នកអាចដោះស្រាយរឿងទាំងនេះដោយរបៀបណា?
- Review និងភ្ជាប់រូបភាពនៃលទ្ធផល electrophoresis ជែលទៅមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។ តើអ្នកបកស្រាយលទ្ធផលទាំងនេះដោយរបៀបណា?
ការណែនាំសិស្ស PCR Colony Screening
គោលបំណង
គោលដៅរបស់អ្នកនៅថ្ងៃនេះគឺដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន DNA plasmid ដែលបានប្រមូលផ្តុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និងពិធីសារ Opentrons
អ្នករចនា។
ដើម្បីធ្វើដូចនេះអ្នកនឹងត្រូវការ:
- កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
- ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
- ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR
បរិក្ខារដែលត្រូវការ
Pipettes និងគន្លឹះ៖
- P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
- P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
- Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
- Opentrons 96 Tip Rack 300 µL
ម៉ូឌុល និង Labware៖
- ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
- NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
- Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL Safe-Lock Snapcap
សារធាតុប្រតិកម្ម៖
- ទឹក DI
- ល្បាយមេ OneTaq® PCR
- បន្តបន្ទាប់ Primer ១
- ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
- បន្តបន្ទាប់ Primer ១
- ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2
នីតិវិធីពិសោធន៍
ផ្ទៃខាងក្រោយ
ដើម្បីធ្វើ PCR លើ DNA នៅក្នុង E. coli និងបាក់តេរីដទៃទៀត ក៏ដូចជាកោសិកាថនិកសត្វ យើងអាចដាក់កោសិកាមួយចំនួននៃសារពាង្គកាយទៅក្នុង PCR ហើយជំហានដំបូងនៃការប្រែពណ៌នឹងបញ្ចេញកោសិកាដែលបញ្ចេញ DNA ។ បញ្ហាទូទៅបំផុតដែលកើតឡើងជាមួយពិធីការនេះគឺថាអ្នកដាក់កោសិកាច្រើនពេកទៅក្នុងប្រតិកម្ម ហើយមាន DNA និងម៉ូលេគុលផ្សេងទៀតដែលមិនជាក់លាក់ច្រើនពេកដែលអាចរំខានដល់សារធាតុប៉ូលីមេរ៉េស។ សារពាង្គកាយផ្សេងទៀតដូចជាផ្សិត និងរុក្ខជាតិមានសារធាតុជ្រៀតជ្រែកច្រើនណាស់ ពោលគឺជញ្ជាំងកោសិការបស់ពួកគេ ដែលចាំបាច់ត្រូវការ លីហ្សីស តឹងរ៉ឹងជាងនេះ។ ជាធម្មតា យើងធ្វើវដ្តត្រជាក់ជាច្រើន សូដ្យូមអ៊ីដ្រូស៊ីតលីស ឬកិនជាមួយអាសូតរាវ ដើម្បីបញ្ចេញ DNA ពីសារពាង្គកាយដែលពិបាកជាងនេះ។
ទោះបីជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ចំណុចសំខាន់នៅទីនេះគឺថាអ្នកមិនត្រូវការកោសិកាជាច្រើនដើម្បីឱ្យមាន DNA ច្រើនក្នុងប្រតិកម្មមួយ។ ជាការពិតសម្រាប់ E. coli អ្នកមិនចង់ឱ្យដំណោះស្រាយកោសិកាដែលអ្នកគ្រោងនឹង lyse និងប្រើសម្រាប់ PCR មានពពក ឬ "turbid" នៅក្នុង microbiology jargon ។ អ្នកស្ទើរតែមិនអាចមើលឃើញកោសិកាដែលបែកខ្ញែកចូលទៅក្នុងដំណោះស្រាយ។
ជាធម្មតា មីក្រូជីវវិទូនឹងបង្កើតល្បាយប្រតិកម្ម PCR ជាល្បាយមេ (ជាមួយនឹងប្រតិកម្មទាំងអស់ដែលត្រូវការក្នុងបំពង់តែមួយ) ហើយបន្ទាប់មក បែងចែកល្បាយមេនេះទៅបំពង់នីមួយៗ។ អ្នកមិនត្រូវការបរិមាណច្រើនទេ ជាទូទៅ 20 µL គឺគ្រប់គ្រាន់ដើម្បីមើលក្រុមតន្រ្តី ជាពិសេសប្រសិនបើប្រើសិតសក់តូចចង្អៀតនៅពេលចាក់ជែលរបស់អ្នក។ បន្ទាប់មកអ្នកជ្រលក់ព័ត៌មានជំនួយជាមួយនឹងបរិមាណតូចមួយនៃអាណានិគមទៅក្នុងបំពង់ PCR នីមួយៗ ហើយផ្តល់ឱ្យវានូវចលនាទន់ភ្លន់។ (ពាក្យណែនាំ៖ ទុកព័ត៌មានជំនួយក្នុងដំណោះស្រាយរហូតដល់ការរើសអាណានិគមរួចរាល់ ដើម្បីកុំឱ្យបាត់បង់កន្លែងនៅក្នុងចាន ឬបន្ទះបំពង់។ )
ថ្ងៃនេះ យើងនឹងប្រើប្រាស់ឈុត primers ពីរផ្សេងគ្នា ដើម្បីរកមើលការផ្គុំត្រឹមត្រូវនៃ plasmids របស់យើងសម្រាប់ 15 អាណានិគមផ្សេងៗគ្នា ក៏ដូចជាការគ្រប់គ្រងអវិជ្ជមាន plasmid របស់យើងដែលយើងប្រើសម្រាប់ឆ្អឹងខ្នង។
នេះនឹងជា PCRs សរុបចំនួន 32 ផ្សេងគ្នា។ ខណៈពេលដែលវាមិនអាក្រក់ទេក្នុងការបង្កើត PCRs អាណានិគម អ្នកអាចចាប់ផ្តើមមើលពីរបៀបដែលទំហំនេះ ការបង្ហូរបំពង់មានភាពធុញទ្រាន់ ហើយការធ្វើខុសនឹងងាយស្រួល។ វិធីសាស្រ្តលាយមេពិតជាអាចជួយបាន ប៉ុន្តែសម្រាប់រឿងដដែលៗតិច Opentron ជួយបានច្រើន។ ការបង្កើតពិធីការនេះនៅក្នុង OT-2 នឹងសង្ឃឹមថាជាពិធីការដែលអាចសម្រេចបាន ប៉ុន្តែជាការបង្ហាញដើម្បីណែនាំអ្នកអំពីស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍។
ផ្នែកទី 1: Reviewសៀវភៅដៃ E. coli PCR Colony Screening Protocol
គោលដៅរបស់អ្នកនៅក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍នេះគឺដើម្បីបង្កើតពិធីការ Opentrons OT-2 ស្វ័យប្រវត្តិដែលនឹងចម្លងនូវពិធីការ E. coli colony PCR protocol ខាងក្រោម៖
រៀបចំល្បាយមេ PCR៖
- គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីបង្កើតជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
- ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
- Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ): - យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
- ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
- បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។
ផ្នែកទីពីរ៖ បង្កើតពិធីសារ OT-2 របស់អ្នក។
ដើម្បីធ្វើពិធីការរបស់អ្នក សូមបើកកម្មវិធី អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.
- អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។
- បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។
(ចំណាំថាអ្នកអាចប្រើប្រអប់ធីក 'Serialize' នៅក្នុងអ្នករចនាពិធីការដើម្បីបង្កើត primers ផ្សេងគ្នាទាំងនេះ។ សូមចំណាំផងដែរថានៅពេលបញ្ជាក់បរិមាណនេះគឺជាអ្វីដែលយើងអាចផ្លាស់ប្តូរនៅពេលក្រោយគ្រាន់តែធ្វើឱ្យប្រាកដថាបរិមាណដែលអ្នកដាក់សមហេតុផលហើយលើសពីអ្វីដែល។ អ្នកគិតថាអ្នកនឹងត្រូវការ។ )
- ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "ការរចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
នៅពេលបង្កើតពិធីការ OT-2 របស់អ្នក គិតអំពីរបៀបដែលអ្នកអាចធ្វើឱ្យវាមានប្រសិទ្ធភាពបំផុត។ ពិនិត្យមើលការកំណត់កម្រិតខ្ពស់នៅក្រោម "រូបតំណាងប្រអប់លេខ" ។ អ្នកក៏អាចប្រើផ្លូវផ្សេងគ្នាដើម្បីរក្សាទុកព័ត៌មានជំនួយផងដែរ។ គ្រាន់តែប្រយ័ត្ន ហើយត្រូវប្រាកដថាអ្នកមិនបំពុលសារធាតុប្រតិកម្ម ឬបំផ្លាញ
ការពិសោធន៍របស់យើងជាមួយនឹងការចម្លងរោគ។ នៅតាមបណ្តោយបន្ទាត់ទាំងនេះ ក៏ព្យាយាមគិតអំពីអ្វីដែលអាចខុសដែរ ដូចជាអស់ពីសារធាតុប្រតិកម្ម ហើយត្រូវប្រាកដថាចងក្រងឯកសារទាំងនេះ ព្រោះវាអាចមានប្រយោជន៍ក្នុងការបំបាត់កំហុសពិធីការរបស់អ្នក និងធ្វើឱ្យប្រាកដថាអ្នកប្រើប្រាស់ចុងក្រោយដឹងពីចំណុចសំខាន់ៗនៅក្នុងរបស់អ្នក ពិធីការ។
កម្មវិធីអាចចំណាយពេលខ្លះដើម្បីស៊ាំនឹង ប៉ុន្តែអ្នកអាចចុចជុំវិញ និងស៊ាំជាមួយវាបានយ៉ាងលឿន ហើយនៅទីបញ្ចប់វាពិតជាវិចារណញាណណាស់។ ដូចដែលអ្នកនឹងឃើញទោះបីជាវាទាមទារការចុចច្រើនដើម្បីបញ្ជាក់ពិធីការដែលប្រហែលជាមានប្រយោជន៍ជាងប្រសិនបើវាត្រូវបានសរសេរនៅក្នុង Python ហើយអាចត្រូវបានកែប្រែយ៉ាងងាយស្រួលដើម្បីបន្ថែម samples ឬ reagents ថ្មី។
នៅពេលដែលអ្នកបានបញ្ចប់ពិធីការរបស់អ្នក សូមត្រលប់ទៅ "File"និងនាំចេញវា។ វានឹងអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកនាំចូលវានៅពេលក្រោយ ឬបង្ហោះវាទៅ OT-2។ - ក្នុងនាមជាថ្នាក់រៀន សិស្សម្នាក់ៗនឹងបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ ហើយរួមគ្នាយើងនឹងសម្រេចចិត្តលើពិធីការថ្នាក់ចុងក្រោយដើម្បីដំណើរការលើ OT-2 ។
ការចាប់ផ្តើម
មុននឹងបង្រៀនផែនការមេរៀន សូមបំពេញជំហានខាងក្រោមមុនពេលចូលរៀន។
- ដោះប្រអប់ OT-2
- ដំឡើងកម្មវិធី Opentrons
- ភ្ជាប់បំពង់
- ក្រិតតាមខ្នាត
- ក្រិតតាមខ្នាតប្រវែងចុង & ឈុតបំពង់
- នាំចូលពិធីការដែលពាក់ព័ន្ធទៅកម្មវិធី
- សាកល្បងដំណើរការពិធីការនៅលើ OT-2
ត្រូវការជំនួយបន្ថែម?
សម្រាប់ជំនួយបច្ចេកទេស សូមពិនិត្យមើលរបស់យើង។ មជ្ឈមណ្ឌលជំនួយ Opentrons សម្រាប់អត្ថបទពាក់ព័ន្ធ។ ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការជំនួយបន្ថែម សូមទាក់ទង support@opentrons.com.
ប្រសិនបើអ្នកមានសំណួរទាក់ទងនឹងផែនការមេរៀន សូមចូលទៅ
ចេញទៅអ្នកនិពន្ធ Clay Wright, Ph.D., at wrightrc@vt.edu.
ឯកសារ/ធនធាន
![]() |
Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ [pdf] ការណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់ OT-2, OT-2 Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, មនុស្សយន្ត |