កំណែឯកសារ 1 (04/12/24)
សន្លឹករៀបចំ
អាណានិគម PCR
ការបញ្ចាំងភាពយន្ត

OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ

និពន្ធដោយ Clay Wright, Ph.D.
Virginia Tech, នាយកដ្ឋានវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្ត
មគ្គុទ្ទេសក៍អ្នកអប់រំ ការពិនិត្យ PCR Colony

គោលបំណង

គោលដៅថ្ងៃនេះគឺសម្រាប់សិស្សានុសិស្សដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន plasmid DNA ដែលបានផ្គុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និង អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.
ដើម្បីធ្វើដូចនេះសិស្សនឹងត្រូវ៖

• កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
• ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
• ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR

ទស្សនិកជនសិស្ស

មន្ទីរពិសោធន៍នេះត្រូវបានរចនាឡើងសម្រាប់និស្សិតថ្នាក់បរិញ្ញាបត្រកម្រិតមធ្យមដល់ថ្នាក់ខ្ពស់នៅក្នុងមហាវិទ្យាល័យវិស្វកម្មប្រព័ន្ធជីវសាស្រ្តនៅរដ្ឋ Virginia Tech (BSE 3984)។
បន្ទប់ពិសោធន៍អាចផ្ទុកបាននូវទំហំថ្នាក់ភាគច្រើន ដោយសារពិធីការ OT-2 នឹងត្រូវបានគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ ជាជាងសិស្សម្នាក់ៗ។

ចំណេះដឹងផ្ទៃខាងក្រោយ

សិស្សគួរតែមកមន្ទីរពិសោធន៍ជាមួយនឹងការយល់ដឹងអំពីគំនិតនៃការដាក់បំពង់ដោយដៃ ការត្រួតពិនិត្យអាណានិគម និង DNA ampការរំលាយ និងការរត់/ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ។

សមត្ថភាពស្នូល

ជំនាញមន្ទីរពិសោធន៍
បំពង់, សampការរៀបចំ និងការប្រើប្រាស់ឧបករណ៍ស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍
ការត្រិះរិះពិចារណា
ការបកស្រាយលទ្ធផល gel electrophoresis ការដោះស្រាយបញ្ហា ការរចនាស្វ័យប្រវត្តិកម្មសម្រាប់ប្រសិទ្ធភាព ពិចារណាវិធីសាស្រ្តស្វ័យប្រវត្តិកម្ម

ការផ្គត់ផ្គង់

ឧបករណ៍ Opentrons

• P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
• P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
• Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
• Opentrons 96 Tip Rack 300 µL
• ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
• NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
• Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL
  Safe-Lock Snapcap

សារធាតុប្រតិកម្ម

• ទឹក DI
• OneTaq® 2X PCR Master Mix ជាមួយ Standard Buffer
• បន្តបន្ទាប់ Primer ១
• ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
• បន្តបន្ទាប់ Primer ១
• ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2

រយៈពេលសាកល្បង

វគ្គថ្នាក់ដែលត្រូវការ 1
ពេលវេលាដំណើរការមន្ទីរពិសោធន៍
ពេលវេលាសរុបប៉ាន់ស្មាន: 2.5-3 ម៉ោង។

• ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទី 10): XNUMX នាទី។
• សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទី 35): XNUMX នាទី
• បទបង្ហាញអំពីពិធីសារ ការសម្រេចលើពិធីសារឯកភាព៖ ១៥ នាទី។
• ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី): 1.5 ម៉ោង។

ការដោះស្រាយបញ្ហាជាមូលដ្ឋាន

1. ធ្វើការសាកល្បងមុនថ្នាក់; វិធីនេះ រាល់ការកើតឡើងដែលមិននឹកស្មានដល់អាចត្រូវបានដោះស្រាយ មុនពេលសិស្សមកដល់។
2. បញ្ហា​ជាមួយ​នឹង​គន្លឹះ​ដែល​ធ្វើ​ឲ្យ​ស្លាក​ស្នាម​ត្រូវ​បាន​គេ​ប្រើ​ស្ទើរតែ​គ្រប់​ពេល​ដោយសារ​ការ​ប្រើ​ឧបករណ៍​ពិសោធន៍​ជំនួស​ឬ​ការ​ក្រិត​មនុស្ស​យន្ត។ ប្រសិនបើអ្នកជួបប្រទះបញ្ហានេះ ហើយបានបញ្ជាក់ពី labware ត្រឹមត្រូវ សូមព្យាយាមកែតំរូវមនុស្សយន្តឡើងវិញ។
3. ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការទាក់ទងទៅផ្នែកជំនួយ Opentron សូមប្រាប់ពួកគេថាអ្នកគឺជាផ្នែកនៃកម្មវិធី Opentrons សម្រាប់ការអប់រំរបស់យើង និងកាលបរិច្ឆេទនៃថ្នាក់មន្ទីរពិសោធន៍បន្ទាប់របស់អ្នក។

សកម្មភាពមុនបន្ទប់ពិសោធន៍ដែលត្រូវការ

មុននឹងមកមន្ទីរពិសោធន៍នេះ សិស្សានុសិស្សត្រូវមានសមត្ថភាពបច្ចេកទេស និងចំណេះដឹងទ្រឹស្តីដូចខាងក្រោម៖

• ផ្ទុកចុងបំពង់ដាក់លើបំពង់បង្ហូរដោយដៃ
• ការលៃតម្រូវកម្រិតសំឡេងសម្រាប់ pipettes ដោយដៃ
• ចំណេះដឹងទ្រឹស្តីនៃ DNA ampអេឡិចត្រិចនិងជែល

ការណែនាំអំពីនីតិវិធី

1. ជាងview និង Review នៃពិធីសារដោយដៃ (ផ្នែកទីមួយ) ~ 10 នាទី។
   សិស្ស​គួរ​តែ​អាន​នៅ​លើ​បន្ទប់​ពិសោធន៍​មុន​ពេល​មក​ថ្នាក់​រៀន ប៉ុន្តែ​មាន​គម្រោង​ចំណាយ​ពេល​មួយ​ភ្លែត​ដើម្បី​រៀប​រាប់​វគ្គ​ពិសោធន៍ ពន្យល់​ពី​គោលបំណង និង​ឆ្លើយ​សំណួរ​សិស្ស។
   សៀវភៅដៃ E. coli ពិនិត្យ PCR ពិធីការអាណានិគមសិស្សនឹងត្រូវបានដាក់បញ្ចូលស្វ័យប្រវត្តិកម្មទៅក្នុងមានដូចខាងក្រោម៖
   រៀបចំល្បាយមេ PCR៖
   1. គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីធ្វើជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
   2. ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
   3. Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
   Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ):
   4. យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
   5. ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
   6. បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។
2. សេចក្តីព្រាងពិធីសារ OT-2 លើអ្នករចនាពិធីការ Opentrons (ផ្នែកទីពីរ) ~ 35 នាទី
   សិស្សម្នាក់ៗនឹងប្រើ អ្នករចនាពិធីការ Opentrons ដើម្បីបង្កើតពិធីការរបស់ពួកគេ ដោយប្រើការណែនាំខាងក្រោម៖
   1. អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ថាតើឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។
   2. បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។
   3. ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "រចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
   ក្នុងអំឡុងពេលនៃផ្នែកនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ រៀបចំគម្រោងដើម្បីពិនិត្យចូលជាលក្ខណៈបុគ្គលជាមួយសិស្ស និងមើលពីរបៀបដែលពួកគេកំពុងចុះសម្រុងគ្នា។ រំលឹកពួកគេឱ្យគិតឱ្យបានច្បាស់លាស់ និងជៀសវាងការចម្លងរោគដែលអាចកើតមាន។
3. Presenting Protocols ការសម្រេចចិត្តលើ Consensus Protocol ~ 15 នាទី។
   សិស្សគួរតែបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ រួមជាមួយនឹងហេតុផលរបស់ពួកគេ។ ជាថ្នាក់រៀន សិស្សនឹងកំណត់អត្តសញ្ញាណពិធីការឯកភាពមួយដែលត្រូវគ្រប់គ្រងដោយគ្រូ។
   រៀបចំផែនការបង្កើតកន្លែងទំនេរខ្លះក្នុងអំឡុងពេលនេះសម្រាប់ការជជែកពិភាក្សាប្រកបដោយសុខភាពល្អ និងការគិតរិះគន់។
4. ដំណើរការពិធីការ, Colony Dip, PCR ជាថ្នាក់ (ផ្នែកទីបី) ~ 1.5 ម៉ោង។
   នៅពេលដែលថ្នាក់បានសម្រេចចិត្តលើពិធីការរួមមួយ អ្នកនឹងដំណើរការពិធីការ ការទម្លាក់អាណានិគម និង PCR ។
   អ្នកអាចសម្រេចចិត្តធ្វើឱ្យផ្នែកនេះកាន់តែមានការចូលរួមដោយនាំយកអ្នកស្ម័គ្រចិត្តរបស់សិស្សមកធ្វើផ្នែកផ្សេងៗនៃមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។
   ហើយខណៈពេលដែល PCR ដំណើរការ អ្នកអាចជ្រើសរើសពិភាក្សាពីគុណវិបត្តិ និងឱកាសនៃស្វ័យប្រវត្តិកម្មជាថ្នាក់ ឆ្លើយសំណួរ ឬអនុញ្ញាតឱ្យសិស្សធ្វើការលើរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ជាក្រុមតូចៗ។

របាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍

សេចក្តីណែនាំ
ចាត់តាំងសិស្សឱ្យរៀបចំរបាយការណ៍មន្ទីរពិសោធន៍ដ៏ទូលំទូលាយដែលជួយពួកគេឱ្យឆ្លុះបញ្ចាំងលើលទ្ធផលរបស់ពួកគេ និងនៅលើស្វ័យប្រវត្តិកម្ម OT-2 ។ គំនិតមួយចំនួនសម្រាប់ការរុករកត្រូវបានរួមបញ្ចូលដូចខាងក្រោម:

1. សកម្មភាពផ្លាស់ប្តូរកូដ៖ ទំព័រទាំងអស់នៃកូដ Opentrons បានផ្ទុះឡើងលើតុរបស់អ្នកនៅពេលអ្នកបើកទ្វារ!
   រកមើលអ្វីដែលកំពុងកើតឡើងនៅលើទំព័រនីមួយៗនៃកូដ ហើយបន្ទាប់មកដាក់វាត្រឡប់មកវិញតាមលំដាប់ត្រឹមត្រូវ។
   a. ខៀវ
   b. បៃតង
   c. ក្រហម
2. យោងត្រឡប់ទៅពិធីការ OT-2 ដែលអ្នកបានរៀបចំ។ តើអ្នកអាចកំណត់អត្តសញ្ញាណឱកាសណាមួយ ដើម្បីធ្វើឱ្យស្វ័យប្រវត្តិកម្មរបស់អ្នកកាន់តែមានប្រសិទ្ធភាព?
3. កំណត់ចំណុចសំខាន់មួយចំនួននៅក្នុងពិធីការរបស់អ្នក ដែលអ្វីៗអាចខុសក្នុងអំឡុងពេលស្វ័យប្រវត្តិកម្ម (ឧទាហរណ៍៖ ការចម្លងរោគ ឬអស់សារធាតុប្រតិកម្ម)។ តើអ្នកអាចដោះស្រាយរឿងទាំងនេះដោយរបៀបណា?
4. Review និងភ្ជាប់រូបភាពនៃលទ្ធផល electrophoresis ជែលទៅមន្ទីរពិសោធន៍នេះ។ តើអ្នកបកស្រាយលទ្ធផលទាំងនេះដោយរបៀបណា?

ការណែនាំសិស្ស PCR Colony Screening

គោលបំណង
គោលដៅរបស់អ្នកនៅថ្ងៃនេះគឺដើម្បីកំណត់អាណានិគមដែលមាន DNA plasmid ដែលបានប្រមូលផ្តុំយ៉ាងត្រឹមត្រូវដោយប្រើ PCR ដែលត្រូវបានអនុវត្តនៅក្នុងមនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ OT-2 និងពិធីសារ Opentrons
អ្នករចនា។
ដើម្បីធ្វើដូចនេះអ្នកនឹងត្រូវការ:

• កំណត់អត្តសញ្ញាណ primers ដែលនឹង ampបង្កើតបំណែកដែលលាតសន្ធឹងលើប្រសព្វរវាងឆ្អឹងខ្នងវ៉ិចទ័រ និងបញ្ចូល
• ស្វែងយល់ពីពិធីការពិនិត្យអាណានិគម E. coli PCR ដោយដៃ
• ប្រើ Protocol Designer ដើម្បីបង្កើតពិធីការពិនិត្យអាណានិគម OT-2 E. coli PCR

បរិក្ខារដែលត្រូវការ
Pipettes និងគន្លឹះ៖

• P20 ឆានែលតែមួយ GEN2
• P300 ឆានែលតែមួយ GEN2
• Opentrons 96 Tip Rack 20 µL
• Opentrons 96 Tip Rack 300 µL

ម៉ូឌុល និង Labware៖

• ម៉ាស៊ីនកំដៅ-ទឹកក្រឡុក GEN1
• NEST 96 Well Plate 100 µL PCR សំពត់ពេញ
• Opentrons 24 Tube Rack ជាមួយ Eppendorf 1.5 mL Safe-Lock Snapcap

សារធាតុប្រតិកម្ម៖

• ទឹក DI
• ល្បាយមេ OneTaq® PCR
• បន្តបន្ទាប់ Primer ១
• ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 1
• បន្តបន្ទាប់ Primer ១
• ថ្នាំ primer បញ្ច្រាស 2

នីតិវិធីពិសោធន៍
ផ្ទៃខាងក្រោយ
To do PCR on DNA within E. coli and most other bacteria, as well as mammalian cells, we can just put a few cells of the organism into a PCR and the initial denaturation step will lyse the cells releasing the DNA. The most common problem that occurs with this protocol is that you put too many cells into the reaction and there is too much nonspecific DNA and other molecules that may interfere with the polymerase. Other organisms like fungi and plants contain so much interfering material, namely their cell walls, that more rigorous lysis is needed. We typically do either several freeze-thaw cycles, sodium hydroxide lysis, or grinding with liquid nitrogen to release the DNA from these more difficult organisms.
ទោះបីជាយ៉ាងណាក៏ដោយ ចំណុចសំខាន់នៅទីនេះគឺថាអ្នកមិនត្រូវការកោសិកាជាច្រើនដើម្បីឱ្យមាន DNA ច្រើនក្នុងប្រតិកម្មមួយ។ ជាការពិតសម្រាប់ E. coli អ្នកមិនចង់ឱ្យដំណោះស្រាយកោសិកាដែលអ្នកគ្រោងនឹង lyse និងប្រើសម្រាប់ PCR មានពពក ឬ "turbid" នៅក្នុង microbiology jargon ។ អ្នកស្ទើរតែមិនអាចមើលឃើញកោសិកាដែលបែកខ្ញែកចូលទៅក្នុងដំណោះស្រាយ។
ជាធម្មតា មីក្រូជីវវិទូនឹងបង្កើតល្បាយប្រតិកម្ម PCR ជាល្បាយមេ (ជាមួយនឹងប្រតិកម្មទាំងអស់ដែលត្រូវការក្នុងបំពង់តែមួយ) ហើយបន្ទាប់មក បែងចែកល្បាយមេនេះទៅបំពង់នីមួយៗ។ អ្នកមិនត្រូវការបរិមាណច្រើនទេ ជាទូទៅ 20 µL គឺគ្រប់គ្រាន់ដើម្បីមើលក្រុមតន្រ្តី ជាពិសេសប្រសិនបើប្រើសិតសក់តូចចង្អៀតនៅពេលចាក់ជែលរបស់អ្នក។ បន្ទាប់មកអ្នកជ្រលក់ព័ត៌មានជំនួយជាមួយនឹងបរិមាណតូចមួយនៃអាណានិគមទៅក្នុងបំពង់ PCR នីមួយៗ ហើយផ្តល់ឱ្យវានូវចលនាទន់ភ្លន់។ (ពាក្យណែនាំ៖ ទុកព័ត៌មានជំនួយក្នុងដំណោះស្រាយរហូតដល់ការរើសអាណានិគមរួចរាល់ ដើម្បីកុំឱ្យបាត់បង់កន្លែងនៅក្នុងចាន ឬបន្ទះបំពង់។ )
ថ្ងៃនេះ យើងនឹងប្រើប្រាស់ឈុត primers ពីរផ្សេងគ្នា ដើម្បីរកមើលការផ្គុំត្រឹមត្រូវនៃ plasmids របស់យើងសម្រាប់ 15 អាណានិគមផ្សេងៗគ្នា ក៏ដូចជាការគ្រប់គ្រងអវិជ្ជមាន plasmid របស់យើងដែលយើងប្រើសម្រាប់ឆ្អឹងខ្នង។
នេះនឹងជា PCRs សរុបចំនួន 32 ផ្សេងគ្នា។ ខណៈពេលដែលវាមិនអាក្រក់ទេក្នុងការបង្កើត PCRs អាណានិគម អ្នកអាចចាប់ផ្តើមមើលពីរបៀបដែលទំហំនេះ ការបង្ហូរបំពង់មានភាពធុញទ្រាន់ ហើយការធ្វើខុសនឹងងាយស្រួល។ វិធីសាស្រ្តលាយមេពិតជាអាចជួយបាន ប៉ុន្តែសម្រាប់រឿងដដែលៗតិច Opentron ជួយបានច្រើន។ ការបង្កើតពិធីការនេះនៅក្នុង OT-2 នឹងសង្ឃឹមថាជាពិធីការដែលអាចសម្រេចបាន ប៉ុន្តែជាការបង្ហាញដើម្បីណែនាំអ្នកអំពីស្វ័យប្រវត្តិកម្មមន្ទីរពិសោធន៍។

ផ្នែកទី 1: Reviewសៀវភៅដៃ E. coli PCR Colony Screening Protocol
គោលដៅរបស់អ្នកនៅក្នុងមន្ទីរពិសោធន៍នេះគឺដើម្បីបង្កើតពិធីការ Opentrons OT-2 ស្វ័យប្រវត្តិដែលនឹងចម្លងនូវពិធីការ E. coli colony PCR protocol ខាងក្រោម៖
រៀបចំល្បាយមេ PCR៖

1. គណនាបរិមាណនៃ mastermix នីមួយៗដើម្បីបង្កើតជាមួយ E. coli អាណានិគម PCR គណនា.
2. ដោយប្រើជួរឈរ "uL សម្រាប់ល្បាយមេ" បន្ថែមបរិមាណដែលបានគណនានៃសារធាតុនីមួយៗទៅល្បាយមេនីមួយៗក្នុងបំពង់ 1.5 មីលីលីត្រ។
3. Aliquot 20 µL នៃល្បាយមេទៅអណ្តូងនីមួយៗនៃបន្ទះឬចាន។
   Colony dip និងដំណើរការ PCR (ចំណាំមិនមានវិធីដើម្បីធ្វើស្វ័យប្រវត្តិកម្មជំហានទាំងនេះនៅក្នុង OT-2 បច្ចុប្បន្នរបស់យើងទេ):
4. យកអាណានិគមតូចមួយពីចានមួយ ហើយជ្រលក់វាទៅក្នុងបំពង់ PCR ដំបូង។
5. ធ្វើម្តងទៀតសម្រាប់បំពង់ PCR នីមួយៗដែលនៅសេសសល់ ដោយប្រើព័ត៌មានជំនួយថ្មីសម្រាប់អាណានិគមនីមួយៗ។
6. បិទបំពង់ PCR ផ្លាស់ទីពួកវាទៅម៉ាស៊ីនកំដៅ ហើយដំណើរការពិធីការសមស្រប។

ផ្នែកទីពីរ៖ បង្កើតពិធីសារ OT-2 របស់អ្នក។
ដើម្បីធ្វើពិធីការរបស់អ្នក សូមបើកកម្មវិធី អ្នករចនាពិធីការ Opentrons.

1. អ្នកនឹងត្រូវបានណែនាំឱ្យពិពណ៌នាអំពីការដំឡើងដែលចង់បានសម្រាប់មនុស្សយន្ត ឧបករណ៍ និងផ្នែកអ្វីខ្លះដែលអ្នកនឹងត្រូវការ និងកន្លែងដែលពួកវាទៅ។ នេះគឺជា "File"ផ្ទាំងនៅខាងឆ្វេង។
2. បន្ទាប់មកអ្នកនឹងត្រូវបានសួរឱ្យពណ៌នាអំពីវត្ថុរាវដែលពាក់ព័ន្ធនៅក្នុងពិធីការ។ ទាំងនេះគ្រាន់តែត្រូវការជាវត្ថុរាវចាប់ផ្តើមប៉ុណ្ណោះ មិនមែនជារបស់ដែលអ្នកនឹងធ្វើនោះទេ។(ចំណាំថាអ្នកអាចប្រើប្រអប់ធីក 'Serialize' នៅក្នុងអ្នករចនាពិធីការដើម្បីបង្កើត primers ផ្សេងគ្នាទាំងនេះ។ សូមចំណាំផងដែរថានៅពេលបញ្ជាក់បរិមាណនេះគឺជាអ្វីដែលយើងអាចផ្លាស់ប្តូរនៅពេលក្រោយគ្រាន់តែធ្វើឱ្យប្រាកដថាបរិមាណដែលអ្នកដាក់សមហេតុផលហើយលើសពីអ្វីដែល។ អ្នកគិតថាអ្នកនឹងត្រូវការ។ )
3. ជាចុងក្រោយ អ្នកនឹងត្រូវបញ្ជាក់កន្លែងដែលវត្ថុរាវទាំងអស់នឹងត្រូវផ្លាស់ទីទៅកន្លែង ដើម្បីអនុវត្តពិធីការដែលអ្នកចង់បាន "ការរចនា" ពិធីការរបស់អ្នក។
   នៅពេលបង្កើតពិធីការ OT-2 របស់អ្នក គិតអំពីរបៀបដែលអ្នកអាចធ្វើឱ្យវាមានប្រសិទ្ធភាពបំផុត។ ពិនិត្យមើលការកំណត់កម្រិតខ្ពស់នៅក្រោម "រូបតំណាងប្រអប់លេខ" ។ អ្នកក៏អាចប្រើផ្លូវផ្សេងគ្នាដើម្បីរក្សាទុកព័ត៌មានជំនួយផងដែរ។ គ្រាន់តែប្រយ័ត្ន ហើយត្រូវប្រាកដថាអ្នកមិនបំពុលសារធាតុប្រតិកម្ម ឬបំផ្លាញ
   ការពិសោធន៍របស់យើងជាមួយនឹងការចម្លងរោគ។ នៅតាមបណ្តោយបន្ទាត់ទាំងនេះ ក៏ព្យាយាមគិតអំពីអ្វីដែលអាចខុសដែរ ដូចជាអស់ពីសារធាតុប្រតិកម្ម ហើយត្រូវប្រាកដថាចងក្រងឯកសារទាំងនេះ ព្រោះវាអាចមានប្រយោជន៍ក្នុងការបំបាត់កំហុសពិធីការរបស់អ្នក និងធ្វើឱ្យប្រាកដថាអ្នកប្រើប្រាស់ចុងក្រោយដឹងពីចំណុចសំខាន់ៗនៅក្នុងរបស់អ្នក ពិធីការ។
   កម្មវិធីអាចចំណាយពេលខ្លះដើម្បីស៊ាំនឹង ប៉ុន្តែអ្នកអាចចុចជុំវិញ និងស៊ាំជាមួយវាបានយ៉ាងលឿន ហើយនៅទីបញ្ចប់វាពិតជាវិចារណញាណណាស់។ ដូចដែលអ្នកនឹងឃើញទោះបីជាវាទាមទារការចុចច្រើនដើម្បីបញ្ជាក់ពិធីការដែលប្រហែលជាមានប្រយោជន៍ជាងប្រសិនបើវាត្រូវបានសរសេរនៅក្នុង Python ហើយអាចត្រូវបានកែប្រែយ៉ាងងាយស្រួលដើម្បីបន្ថែម samples ឬ reagents ថ្មី។
   នៅពេលដែលអ្នកបានបញ្ចប់ពិធីការរបស់អ្នក សូមត្រលប់ទៅ "File"និងនាំចេញវា។ វានឹងអនុញ្ញាតឱ្យអ្នកនាំចូលវានៅពេលក្រោយ ឬបង្ហោះវាទៅ OT-2។
4. ក្នុងនាមជាថ្នាក់រៀន សិស្សម្នាក់ៗនឹងបង្ហាញយ៉ាងខ្លីនូវពិធីការរបស់ពួកគេ ហើយរួមគ្នាយើងនឹងសម្រេចចិត្តលើពិធីការថ្នាក់ចុងក្រោយដើម្បីដំណើរការលើ OT-2 ។

ការចាប់ផ្តើម
មុននឹងបង្រៀនផែនការមេរៀន សូមបំពេញជំហានខាងក្រោមមុនពេលចូលរៀន។

• ដោះប្រអប់ OT-2
• ដំឡើងកម្មវិធី Opentrons
• ភ្ជាប់បំពង់
• ក្រិតតាមខ្នាត
• ក្រិតតាមខ្នាតប្រវែងចុង & ឈុតបំពង់
• នាំចូលពិធីការដែលពាក់ព័ន្ធទៅកម្មវិធី
• សាកល្បងដំណើរការពិធីការនៅលើ OT-2

ត្រូវការជំនួយបន្ថែម?

សម្រាប់ជំនួយបច្ចេកទេស សូមពិនិត្យមើលរបស់យើង។ មជ្ឈមណ្ឌលជំនួយ Opentrons សម្រាប់អត្ថបទពាក់ព័ន្ធ។ ប្រសិនបើអ្នកត្រូវការជំនួយបន្ថែម សូមទាក់ទង support@opentrons.com.
ប្រសិនបើអ្នកមានសំណួរទាក់ទងនឹងផែនការមេរៀន សូមចូលទៅ
ចេញទៅអ្នកនិពន្ធ Clay Wright, Ph.D., at wrightrc@vt.edu.

ឯកសារ/ធនធាន

	Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ [pdf] ការណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់ OT-2, OT-2 Liquid Handling Robot, Liquid Handling Robot, Handling Robot, មនុស្សយន្ត
	Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ [pdf] សៀវភៅណែនាំ OT-2 Liquid Handling Robot, OT-2, Liquid Handling Robot, Handling Robot, Robot
	Opentrons OT-2 មនុស្សយន្តគ្រប់គ្រងរាវ [pdf] សៀវភៅណែនាំ OT-2 Liquid Handling Robot, OT-2, Liquid Handling Robot, Handling Robot, Robot

ឯកសារយោង

• សៀវភៅណែនាំអ្នកប្រើប្រាស់