iMed Manyèl Itilizatè
Entwodiksyon
1.1. Objektif
Objektif sa a web aplikasyon se pran enfòmasyon anvan tout koreksyon epi pèmèt manipile li nan yon fason ki bay rezilta itil nan pran desizyon. Sa a ka fòme yon modèl ak done anvan tout koreksyon oswa predi rezilta a lè l sèvi avèk modèl ak analiz.
1.2. Meni Navigasyon
Meni navigasyon ki anlè paj la gen tout lyen pou ale kote ou bezwen ye a. Si w janm pèdi, ou ka toujou klike sou flèch dèyè a pou w ale nan yon paj abitye, tounen lakay ou, oswa jwenn paj w ap chèche a nan meni navigasyon an.
1.3. Kont
Si ou poko gen yon kont, ou dwe anrejistre pou itilize aplikasyon an. Pou fè sa, klike sou bouton an kont anlè adwat epi klike sou anrejistre. Lè sa a, antre non itilizatè ou an, modpas, ak imel pou kontinye.
Si ou deja gen yon kont, konekte ak non itilizatè ou ak modpas ou.
Paj Kay
Lè w klike sou atik ki sou goch paj la, yon deskripsyon chak ap parèt nan mitan paj la pou ede w konprann sa chak fè.
iMedBot
Aplikasyon iMedBot prezante yon koòdone ki ankouraje entèraksyon itilizatè fasil ak ajan yo, sa ki pèmèt prediksyon pèsonalize ak fòmasyon modèl. Li sèvi kòm premye etap nan transfòme rezilta rechèch aprantisaj pwofon an yon zouti sou entènèt, ki gen potansyèl pou pwovoke rechèch adisyonèl nan domèn sa a. Ou ka jwenn manyèl itilizatè respektif li yo isit la.
Analiz done
4.1. Rekipere Subsets
Seksyon sa a pèmèt itilizatè a edite done yo. Ou ka chwazi swa telechaje yon nouvo seri done oswa itilize youn ki deja egziste nan meni ki dewoule a.
Yon fwa yo te telechaje dataset la, ou ka chwazi ki aksyon ou ta renmen pran lè w klike sou youn nan opsyon ki nan meni bò gòch la.
4.1.1. Rekipere sou-ansanm ki baze sou filtè
Seksyon sa a pèmèt jwenn yon pi piti sou-ansanm done orijinal la ki baze sou filtè yo bay yo. Chwazi valè ou vle nan sou-ansanm nan epi chwazi kolòn ou vle montre nan seri done final la.
4.1.2. Retounen rezilta Ranje
Sa a retounen dataset la nan yon fòm klase. Chwazi kolòn sib la, lòd klasman, kantite ranje yo retounen, ak kolòn yo montre nan pwodiksyon final la.
4.1.3. Elaji Dataset la
Sa a pèmèt itilizatè a elaji yon kolòn sengilye ki estoke kòm yon diksyonè nan yon tablo aktyèl ke itilizatè a ka manipile. Li pran yon seri done enbrike epi li deplase sa itilizatè a mande nan kouch ki pi wo a. Premyèman, telechaje yon seri done ki gen ladan yon kolòn ak yon seri done imbrike. Si yon kolòn ki bezwen elaji otomatikman detekte, chwazi ki kolòn pou elaji ak ki kolòn yo retire nan enfòmasyon ki enbrike yo. Klike sou soumèt epi ou kapab view enfòmasyon ou yo kòm kolòn nan yon tab olye de done enbrike.
4.2. Fizyone Files
Lè w chwazi ak telechaje plizyè seri done pa klike sou ctrl (kòmand pou mac), sa a pral rantre yo nan yon sèl done ki pi gwo pase yo dwe itilize pou yon lòt bagay.
Jis chwazi tout seri done epi ranpli enfòmasyon yo mande yo. Sa a pral sove nouvo dataset nan aplikasyon iMed la epi li disponib pou telechaje.
4.3. Fonksyon trase
Seksyon sa a pèmèt itilizatè a trase seri done yo. Chwazi youn nan opsyon ki nan meni bò goch la epi ranpli tout jaden obligatwa yo pou w ka jwenn trase w la. Anba a se kalite trase ou ka fè apati done ou yo:
4.4. Analiz estatistik
Seksyon sa a pèmèt nou fè tès estatistik sou seri done nou an. Chwazi yon tès pou kouri nan meni bò gòch la epi ranpli jaden yo pou kouri tès yo. Anba a se kalite tès ki disponib:
ODPAC
5.1. Aprann
Paj sa a gen ladann yon deskripsyon tou kout sou chak kalite resous ki disponib nan paj sa a. Klike sou bouton ki anlè chak seksyon ap mennen nan yon lòt paj ki pèmèt itilizatè a itilize oswa aprann plis sou sijè a.
5.1.1. Epistaz
Paj sa a pèmèt nou itilize MBS, yon algorithm rechèch pou aprann nan done yo. Espesyalman, li pèmèt nou etidye epistasis, entèraksyon ki genyen ant de oswa plis jèn ki afekte fenotip la. Sa itil pou profile maladi nan aspè jenetik la. Metòd konvansyonèl yo pa adapte pou okipe done ki gen gwo dimansyon yo jwenn nan etid asosyasyon genomic (GWAS). Algorithm Multiple Beam Search (MBS) pèmèt detekte jèn ki entèraksyon nan yon vitès pi rapid. Voye done ou vle itilize yo epi antre nan jaden ki nesesè yo. Pou plis enfòmasyon apwofondi, jwenn tout papye a isit la.
5.1.2. Faktè Risk
Paj sa a pèmèt nou itilize pake IGain pou aprann entèraksyon ant done yo. Li espesyalman aprann entèraksyon nan done ki gen gwo dimansyon lè l sèvi avèk yon rechèch euristik. Metòd sa a baze sou metòd Exhaustive_IGain ki te devlope deja pou aprann entèraksyon ak done ki genyen dimansyon ki ba yo. Voye done yo epi antre nan jaden ki nesesè yo. Ou ka jwenn plis enfòmasyon sou papòt IS yo ak iGain isit la.
5.1.3. Modèl Prediksyon
Seksyon sa a pèmèt itilize modèl prediksyon ki deja bati sou tèt modèl aprantisaj machin pou akselere itilizasyon li yo. Sa a pèmèt yo sèvi ak yo san yo pa itilize nan kodaj ak eksperyans anvan yo predi modèl lè l sèvi avèk pwòp dataset yo. Gen yon anpil modèl prediksyon ki disponib pou itilizatè a ki gen ladan lojistik, regresyon, machin vektè sipò (SVMs), pye bwa desizyon, ak anpil plis. Lis konplè metòd prediksyon yo jwenn sou bò dwat paj la isit la.
5.2. Prediksyon
Seksyon sa a pèmèt prediksyon nan yon modèl pataje deja telechaje. Premye telechaje yon modèl pataje si ou pa fè sa deja. Lè sa a, chwazi modèl la pou itilize pou prediksyon lè w klike sou non modèl la. Lè sa a, telechaje done yo pou modèl prediksyon yo itilize. Sa a ka fè swa manyèlman lè l sèvi avèk fòm ki anba a nan paj la oswa lè l sèvi avèk modèl ki disponib pou telechaje. Si w ap itilize modèl la, telechaje dataset la file epi klike sou soumèt pou resevwa prediksyon modèl la.
5.3. Sipò pou desizyon
Sipò pou desizyon bay klasifikasyon epi li ka gide chwa tretman apati enfòmasyon yo bay sistèm nan. Li te resevwa fòmasyon nan done yo rekòmande pwosedi a tretman optimal ki baze sou karakteristik yon pasyan an. Ou ka jwenn plis enfòmasyon konsènan Sistèm Sipò pou Desizyon Klinik (CDSS) isit la.
Rekòmandasyon Sistèm nan pran karakteristik yon pasyan ak rekòmande pwosedi tretman ak predi pwobabilite nan fiti nan metastaz 5 ane. Entèvansyon itilizatè a pran tou de karakteristik pasyan yo ak pwosedi tretman an pou predi pwobabilite nan fiti metastaz 5 ane ki baze sou tretman aktyèl olye pou yo tretman pi bon.
MBIL
Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) se yon algorithm ki aprann faktè risk sèl ak entèaktif ki gen yon enfliyans dirèk sou rezilta yon pasyan. Klike "ale nan MBIL" pou w redireksyon sou Python Package Index (PyPI) pou pake MBIL ki sitiye isit la. Ou ka jwenn plis enfòmasyon sou MBIL nan BMC Bioinformatics.
Ansanm done
Seksyon sa a pèmèt itilizatè a wè ak telechaje nouvo done ansanm nan web aplikasyon.
7.1. Gade tout ansanm done ki disponib
Pou wè tout seri done ki disponib, tou senpleman klike sou "Montre ansanm done ki disponib yo."
7.2. Voye yon seri done
Pou telechaje yon seri done, klike sou "Pataje seri done ou yo" epi ranpli enfòmasyon yo mande yo jan sa endike sou webpaj. Premyèman, telechaje dataset la epi ranpli jaden obligatwa yo.
Lè sa a, ranpli jaden ki anba yo oswa telechaje yon tèks file ak enfòmasyon yo ranpli. Yon ansyenampMen ki jan yo òganize enfòmasyon an pou aplikasyon an ka konprann li anba a.
Modèl
Seksyon sa a pèmèt itilizatè a wè modèl ki disponib pou yo epi pataje yon modèl.
8.1. Gade tout modèl ki disponib
Pou wè tout modèl ki disponib, klike sou "Montre modèl ki disponib yo."
8.2. Pataje yon modèl
Pou pataje yon modèl, klike sou "Share Your Models" epi telechaje yon modèl file antrene pa koule tensor oswa PyTorch.
8.2.1. Done ki gen rapò
Lè sa a, ou ta dwe telechaje done ki gen rapò a ki gen ladan tèt yo. Klas/etikèt pou dataset la ta dwe nan dènye kolòn nan.
8.2.2. Prediktè ak enfòmasyon sou klas yo
Si dataset la gen ladan tout karakteristik yo, yo ka sote fòm karakteristik la apre w fin telechaje dataset la. Sepandan, si yo pa enkli tout, yo dwe bay enfòmasyon sa yo nan deskripsyon an file oswa nan fòm nan karakteristik. Chwazi opsyon ki soti nan deroule ki endike kijan ou gen entansyon bay prediktè yo ak enfòmasyon sou klas la.
Si w ap itilize opsyon deskripsyon an, ou ka swa ranpli jaden yo oswa telechaje yon tèks file ak enfòmasyon yo ranpli. Yon ansyenampYo bay enfòmasyon ki pi ba sou fason pou òganize enfòmasyon yo.
Dokiman / Resous
 |
Aplikasyon iMed Web Aplikasyon [pdfManyèl Itilizatè iMed, iMed Web Aplikasyon, Web Aplikasyon |